View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6899_low_31 (Length: 244)

Name: NF6899_low_31
Description: NF6899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6899_low_31
NF6899_low_31
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (28-244)||(26999834-27000050)
chr6 (28-244)||(26918141-26918357)
chr6 (28-244)||(16749615-16749831)
chr6 (32-244)||(26988762-26988974)
chr6 (32-244)||(15424540-15424752)
chr6 (37-244)||(24304846-24305053)
chr6 (32-244)||(13299174-13299386)
chr6 (28-244)||(24863478-24863694)
chr6 (28-244)||(3695824-3696040)
chr6 (28-244)||(29572774-29572990)
chr6 (28-244)||(34463580-34463796)
chr6 (28-244)||(16944246-16944462)
chr6 (28-244)||(17025023-17025239)
chr6 (28-244)||(22935096-22935312)
chr6 (28-244)||(23857541-23857757)
chr6 (28-244)||(27007473-27007689)
chr6 (28-244)||(26777846-26778062)
chr6 (28-244)||(27360229-27360445)
chr6 (28-244)||(27450572-27450788)
chr6 (28-244)||(4546003-4546219)
chr6 (28-244)||(4724362-4724578)
chr6 (28-244)||(4757522-4757738)
chr6 (28-244)||(4772758-4772974)
chr6 (28-244)||(27484878-27485094)
chr6 (28-244)||(28207203-28207419)
chr6 (28-244)||(30558235-30558451)
chr6 (28-244)||(16673888-16674104)
chr6 (28-244)||(26116638-26116854)
chr6 (49-244)||(27044151-27044346)
chr6 (49-244)||(29549239-29549434)
chr6 (62-244)||(29501167-29501349)
chr6 (49-244)||(4525050-4525245)
chr6 (37-208)||(22477501-22477672)
chr6 (56-138)||(20160571-20160653)
chr6 (56-138)||(22172178-22172260)
chr6 (62-138)||(13522323-13522399)
chr6 (62-138)||(28162527-28162603)
chr6 (62-138)||(33374506-33374582)
chr6 (62-138)||(8892560-8892636)
chr6 (62-138)||(8903795-8903871)
chr6 (48-141)||(27629948-27630041)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (28-244)||(4796970-4797186)
chr3 (28-244)||(28116274-28116490)
chr3 (32-244)||(4721356-4721568)
chr3 (32-244)||(35880491-35880703)
chr3 (32-244)||(6192041-6192253)
chr3 (28-244)||(7072937-7073153)
chr3 (32-244)||(18050987-18051199)
chr3 (49-244)||(15741420-15741615)
chr3 (28-244)||(7996287-7996503)
chr3 (28-244)||(10642795-10643011)
chr3 (32-244)||(8295700-8295912)
chr3 (28-244)||(29149072-29149288)
chr3 (32-244)||(18330399-18330606)
chr3 (28-244)||(47023178-47023394)
chr3 (28-243)||(11110678-11110893)
chr3 (28-244)||(15893023-15893239)
chr3 (32-244)||(21674418-21674630)
chr3 (28-244)||(20577179-20577395)
chr3 (28-244)||(6542791-6543007)
chr3 (32-244)||(8301585-8301797)
chr3 (28-244)||(24327884-24328100)
chr3 (28-244)||(29665302-29665518)
chr3 (28-244)||(36997406-36997622)
chr3 (28-244)||(17985273-17985489)
chr3 (28-244)||(28339027-28339243)
chr3 (28-244)||(31964790-31965006)
chr3 (28-244)||(50134388-50134604)
chr3 (28-244)||(4416641-4416857)
chr3 (28-244)||(5013437-5013653)
chr3 (28-244)||(5609639-5609855)
chr3 (28-244)||(18224916-18225132)
chr3 (28-244)||(22871191-22871407)
chr3 (28-244)||(22886250-22886466)
chr3 (28-244)||(51781736-51781952)
chr3 (28-244)||(51796825-51797041)
chr3 (49-240)||(20065775-20065966)
chr3 (28-244)||(48465640-48465856)
chr3 (28-244)||(18242452-18242668)
chr3 (49-244)||(10395861-10396056)
chr3 (49-244)||(8211466-8211661)
chr3 (49-244)||(4347022-4347217)
chr3 (49-243)||(28021004-28021198)
chr3 (28-244)||(18277369-18277585)
chr3 (28-244)||(18292670-18292886)
chr3 (28-244)||(18307971-18308187)
chr3 (49-244)||(5466710-5466905)
chr3 (62-244)||(5596717-5596899)
chr3 (28-138)||(5713058-5713168)
chr3 (28-138)||(5723968-5724078)
chr3 (28-138)||(5757399-5757509)
chr3 (28-138)||(5768290-5768400)
chr3 (62-244)||(16626854-16627036)
chr3 (62-244)||(18530122-18530304)
chr3 (49-205)||(4892977-4893133)
chr3 (49-205)||(22387913-22388069)
chr3 (49-205)||(32438921-32439077)
chr3 (62-138)||(17994132-17994208)
chr3 (63-138)||(4625778-4625853)
chr3 (62-138)||(5652221-5652297)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (28-244)||(406-622)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (28-244)||(5127757-5127973)
chr7 (28-244)||(16736622-16736838)
chr7 (28-244)||(16751676-16751892)
chr7 (28-244)||(17523297-17523513)
chr7 (28-244)||(17529702-17529918)
chr7 (28-244)||(2154338-2154554)
chr7 (32-244)||(11424942-11425154)
chr7 (28-244)||(45387108-45387324)
chr7 (32-244)||(10917031-10917243)
chr7 (28-244)||(11441325-11441541)
chr7 (31-244)||(5147505-5147718)
chr7 (28-244)||(24592703-24592919)
chr7 (28-244)||(26275256-26275472)
chr7 (32-244)||(26435022-26435234)
chr7 (28-244)||(16503542-16503758)
chr7 (28-244)||(16518578-16518794)
chr7 (28-244)||(26320031-26320247)
chr7 (28-244)||(31124676-31124892)
chr7 (28-244)||(3445059-3445275)
chr7 (28-244)||(9618416-9618632)
chr7 (28-244)||(31564561-31564777)
chr7 (32-244)||(26485910-26486122)
chr7 (28-244)||(26538035-26538251)
chr7 (28-244)||(26670076-26670292)
chr7 (49-244)||(4145306-4145501)
chr7 (68-244)||(16041091-16041267)
chr7 (70-236)||(16450199-16450365)
chr7 (49-205)||(5159326-5159482)
chr7 (62-138)||(31088657-31088733)
chr7 (62-138)||(45733334-45733410)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (32-244)||(23718165-23718377)
chr5 (32-244)||(23752627-23752839)
chr5 (28-244)||(33777260-33777476)
chr5 (28-244)||(41674482-41674698)
chr5 (31-244)||(9548719-9548932)
chr5 (32-244)||(11549127-11549339)
chr5 (32-244)||(22999291-22999503)
chr5 (28-244)||(8665648-8665864)
chr5 (28-244)||(15658933-15659149)
chr5 (32-244)||(24688334-24688546)
chr5 (28-244)||(18500921-18501137)
chr5 (28-244)||(24681210-24681426)
chr5 (28-244)||(24723737-24723953)
chr5 (32-244)||(30934409-30934621)
chr5 (28-244)||(31431201-31431417)
chr5 (28-244)||(5637683-5637899)
chr5 (28-244)||(9317224-9317440)
chr5 (28-244)||(12131928-12132144)
chr5 (28-244)||(26480165-26480381)
chr5 (28-244)||(29967239-29967455)
chr5 (28-244)||(30029188-30029404)
chr5 (28-244)||(31826592-31826808)
chr5 (28-244)||(37358828-37359044)
chr5 (28-244)||(43078022-43078238)
chr5 (28-244)||(2510824-2511040)
chr5 (28-244)||(6874075-6874291)
chr5 (28-244)||(28648999-28649215)
chr5 (28-244)||(30168242-30168458)
chr5 (28-244)||(37671665-37671881)
chr5 (28-244)||(3789299-3789515)
chr5 (28-244)||(13325017-13325233)
chr5 (28-244)||(15759030-15759246)
chr5 (28-244)||(18375585-18375801)
chr5 (28-244)||(30151791-30152007)
chr5 (28-244)||(37754741-37754957)
chr5 (28-244)||(33516129-33516345)
chr5 (32-244)||(28959975-28960187)
chr5 (28-244)||(37771172-37771388)
chr5 (28-244)||(40473725-40473941)
chr5 (62-243)||(32599676-32599857)
chr5 (62-244)||(23891979-23892161)
chr5 (49-244)||(34616294-34616489)
chr5 (28-174)||(24969867-24970013)
chr5 (72-243)||(25198806-25198977)
chr5 (62-203)||(22888287-22888428)
chr5 (176-244)||(24951883-24951951)
chr5 (49-205)||(33292340-33292496)
chr5 (62-138)||(13184852-13184928)
chr5 (62-138)||(13440698-13440774)
chr5 (62-138)||(33877129-33877205)
chr5 (62-138)||(11325676-11325752)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (32-244)||(16277318-16277530)
chr8 (28-244)||(19674202-19674418)
chr8 (32-244)||(2137498-2137710)
chr8 (32-244)||(27609144-27609356)
chr8 (32-244)||(14557391-14557603)
chr8 (28-244)||(19687862-19688078)
chr8 (28-244)||(19518378-19518594)
chr8 (28-244)||(19208595-19208811)
chr8 (28-244)||(3329754-3329970)
chr8 (28-244)||(33258487-33258703)
chr8 (28-244)||(29829077-29829293)
chr8 (28-244)||(31489985-31490201)
chr8 (28-244)||(28362190-28362406)
chr8 (28-244)||(16283213-16283429)
chr8 (28-244)||(18710350-18710566)
chr8 (28-244)||(12092968-12093184)
chr8 (49-244)||(19286229-19286424)
chr8 (49-244)||(31354288-31354483)
chr8 (62-164)||(19659305-19659407)
chr8 (62-164)||(44562948-44563050)
chr8 (62-138)||(9354495-9354571)
chr8 (56-237)||(22081135-22081316)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (28-244)||(24592587-24592803)
chr4 (28-244)||(5005649-5005865)
chr4 (32-244)||(17013779-17013991)
chr4 (32-244)||(6569632-6569844)
chr4 (28-244)||(27163593-27163809)
chr4 (28-244)||(30753521-30753737)
chr4 (32-244)||(14664797-14665009)
chr4 (28-244)||(21969480-21969696)
chr4 (28-244)||(18800898-18801114)
chr4 (28-244)||(14098320-14098536)
chr4 (28-244)||(33674086-33674302)
chr4 (28-244)||(40105914-40106130)
chr4 (28-244)||(31126794-31127010)
chr4 (28-244)||(39850402-39850618)
chr4 (49-244)||(54833169-54833364)
chr4 (28-244)||(14763580-14763796)
chr4 (82-244)||(19373040-19373202)
chr4 (49-244)||(36344809-36345004)
chr4 (62-244)||(1900039-1900221)
chr4 (62-244)||(15227652-15227834)
chr4 (62-244)||(15285235-15285417)
chr4 (49-205)||(24112483-24112639)
chr4 (49-205)||(34189254-34189410)
chr4 (37-138)||(14235810-14235911)
chr4 (62-138)||(24460912-24460988)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (28-244)||(13936809-13937025)
chr2 (32-244)||(23128835-23129047)
chr2 (32-244)||(28881974-28882186)
chr2 (28-244)||(11635454-11635670)
chr2 (28-244)||(11641643-11641859)
chr2 (28-244)||(34279209-34279425)
chr2 (28-244)||(21677447-21677663)
chr2 (28-244)||(32049558-32049774)
chr2 (28-244)||(34286114-34286330)
chr2 (28-244)||(34291174-34291390)
chr2 (32-244)||(12655302-12655514)
chr2 (28-244)||(12716870-12717086)
chr2 (28-244)||(37925253-37925469)
chr2 (32-244)||(261034-261246)
chr2 (32-244)||(20837678-20837890)
chr2 (28-244)||(27434709-27434925)
chr2 (28-244)||(12586561-12586777)
chr2 (28-244)||(27803452-27803668)
chr2 (28-244)||(31876041-31876257)
chr2 (28-244)||(34861440-34861656)
chr2 (28-244)||(37686174-37686390)
chr2 (28-244)||(37701439-37701655)
chr2 (28-244)||(39889822-39890038)
chr2 (28-244)||(40233259-40233475)
chr2 (28-244)||(9350259-9350475)
chr2 (28-244)||(19416764-19416980)
chr2 (28-244)||(22926293-22926509)
chr2 (28-244)||(27776967-27777183)
chr2 (28-244)||(27816734-27816950)
chr2 (28-244)||(16829603-16829819)
chr2 (28-244)||(16891662-16891878)
chr2 (28-244)||(39052093-39052309)
chr2 (63-244)||(37374921-37375102)
chr2 (62-244)||(21703460-21703642)
chr2 (62-244)||(19456717-19456899)
chr2 (62-164)||(31891624-31891726)
chr2 (62-138)||(3784523-3784599)
chr2 (62-138)||(27118557-27118633)
chr2 (62-138)||(34156880-34156956)
chr2 (63-138)||(34303600-34303675)
chr2 (37-138)||(27392859-27392960)
chr2 (62-138)||(16163468-16163544)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (32-244)||(27056-27268)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (32-244)||(30217-30429)
scaffold0124 (62-244)||(20176-20358)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (32-244)||(47265-47477)
scaffold0089 (28-244)||(40345-40561)
scaffold0089 (28-244)||(29527-29743)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (28-244)||(41793584-41793800)
chr1 (28-244)||(10962433-10962649)
chr1 (28-244)||(51637981-51638197)
chr1 (28-244)||(28584744-28584960)
chr1 (62-237)||(20460878-20461053)
chr1 (62-138)||(20340642-20340718)
chr1 (170-244)||(16208443-16208517)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (28-244)||(7515-7731)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (28-244)||(9342-9558)
scaffold0159 (28-216)||(19807-19995)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (28-244)||(15206-15422)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (28-244)||(26478-26694)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-244)||(7701-7917)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (28-244)||(5753-5971)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (28-223)||(9-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (49-244)||(7996-8191)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (62-138)||(2965-3041)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (37-138)||(21437-21538)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27000050 - 26999834
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27000050 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 26999951  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26999950 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 26999851  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  26999850 tccctacttccgtttct 26999834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26918357 - 26918141
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26918357 aaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 26918258  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26918257 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 26918158  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  26918157 tccctacttccgtttct 26918141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16749831 - 16749615
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16749831 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 16749732  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16749731 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16749632  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  16749631 tccctacttccgtttct 16749615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26988974 - 26988762
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988974 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 26988875  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26988874 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 26988775  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  26988774 tacttccgtttct 26988762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 15424540 - 15424752
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424540 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 15424639  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424640 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 15424739  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  15424740 tacttccgtttct 15424752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 24304846 - 24305053
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24304846 ctgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctga 24304945  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24304946 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctactt 24305045  T
Q  237 ccgtttct 244  Q
    ||||||||    
T  24305046 ccgtttct 24305053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 13299174 - 13299386
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299174 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 13299273  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  13299274 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 13299373  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  13299374 tacttccgtttct 13299386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24863694 - 24863478
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24863694 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaa 24863595  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24863594 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacca 24863495  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  24863494 tccctacttccgtttct 24863478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3696040 - 3695824
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  3696040 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 3695941  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3695940 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3695841  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3695840 tccccacttccgtttct 3695824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29572990 - 29572774
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29572990 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29572891  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29572890 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29572791  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29572790 tccccacttccgtttct 29572774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 34463580 - 34463796
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  34463580 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 34463679  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34463680 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 34463779  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34463780 tccccacttccgtttct 34463796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16944246 - 16944462
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16944246 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16944345  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16944346 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 16944445  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16944446 tccccacttccgtttct 16944462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17025239 - 17025023
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  17025239 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 17025140  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17025139 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 17025040  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  17025039 ttcccacttccgtttct 17025023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 22935096 - 22935312
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||     
T  22935096 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaag 22935195  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22935196 ggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacca 22935295  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||| ||||||||||    
T  22935296 tccctatttccgtttct 22935312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 23857541 - 23857757
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||     
T  23857541 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaag 23857640  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  23857641 ggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacca 23857740  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||| ||||||||||    
T  23857741 tccctatttccgtttct 23857757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27007689 - 27007473
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27007689 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaat 27007590  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27007589 ggatgctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 27007490  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27007489 tccccacttccgtttct 27007473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26777846 - 26778062
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  26777846 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 26777945  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26777946 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 26778045  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26778046 tccccacttccgtttct 26778062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 27360229 - 27360445
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27360229 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27360328  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27360329 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 27360428  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27360429 tccccacttccgtttct 27360445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 27450572 - 27450788
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27450572 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27450671  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27450672 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 27450771  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27450772 tccccacttccgtttct 27450788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 4546003 - 4546219
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4546003 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4546102  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4546103 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 4546202  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  4546203 ttcccacttccgtttct 4546219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 4724362 - 4724578
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4724362 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4724461  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4724462 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 4724561  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  4724562 ttcccacttccgtttct 4724578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4757738 - 4757522
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4757738 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4757639  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4757638 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacacca 4757539  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4757538 tccccacttccgtttct 4757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4772974 - 4772758
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4772974 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4772875  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4772874 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacca 4772775  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4772774 tccccacttccgtttct 4772758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27485094 - 27484878
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27485094 aaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27484995  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27484994 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 27484895  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27484894 tccccacttccgtttct 27484878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28207419 - 28207203
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28207419 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28207320  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  28207319 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 28207220  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  28207219 ttcccacttccgtttct 28207203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 30558235 - 30558451
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30558235 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30558334  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30558335 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 30558434  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  30558435 tccccacttcagtttct 30558451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16674104 - 16673888
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  16674104 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 16674005  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  16674004 ggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 16673905  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  16673904 ttcccacttccgtttct 16673888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26116638 - 26116854
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26116638 aaccggcaactgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26116737  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  26116738 gaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacacca 26116837  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26116838 tccccacttccgtttct 26116854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27044346 - 27044151
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 27044247  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27044246 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27044151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29549434 - 29549239
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29549239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29501349 - 29501167
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29501349 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 29501250  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29501249 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29501167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4525245 - 4525050
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4525146  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4525145 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 4525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Original strand, 22477501 - 22477672
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  22477501 ctgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 22477600  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattga 208  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||  | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22477601 gagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattga 22477672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20160653 - 20160571
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20160653 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 20160571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 22172178 - 22172260
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  22172178 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 22172260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 13522323 - 13522399
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13522323 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13522399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28162603 - 28162527
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28162603 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaga 28162527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 33374506 - 33374582
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33374506 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 8892560 - 8892636
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8892560 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 8892636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 8903795 - 8903871
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8903795 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgaga 8903871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 141
Target Start/End: Original strand, 27629948 - 27630041
Alignment:
Q  48 tctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaata 141  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27629948 tctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaata 27630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 4796970 - 4797186
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4796970 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 4797069  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4797070 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 4797169  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  4797170 tccctacttccgtttct 4797186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 28116274 - 28116490
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28116274 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 28116373  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28116374 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 28116473  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28116474 tccccacttccgtttct 28116490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4721568 - 4721356
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4721568 ggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagat 4721469  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4721468 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 4721369  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  4721368 tacttccgtttct 4721356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35880703 - 35880491
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880703 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 35880604  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35880603 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 35880504  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  35880503 tacttccgtttct 35880491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6192253 - 6192041
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6192253 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggat 6192154  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  6192153 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatcca 6192054  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  6192053 tacttccgtttct 6192041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7073153 - 7072937
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7073153 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 7073054  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7073053 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacacca 7072954  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7072953 tccccacttccgtttct 7072937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18051199 - 18050987
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18051199 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 18051100  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18051099 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18051000  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  18050999 tacttccgtttct 18050987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 15741420 - 15741615
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741420 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15741519  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741520 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 15741615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7996503 - 7996287
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7996503 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 7996404  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7996403 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 7996304  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7996303 tccccacttccgtttct 7996287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10643011 - 10642795
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10643011 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 10642912  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10642911 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 10642812  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10642811 tccccacttccgtttct 10642795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8295912 - 8295700
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295912 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 8295813  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  8295812 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 8295713  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  8295712 tacttccgtttct 8295700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 29149072 - 29149288
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  29149072 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 29149171  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29149172 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 29149271  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  29149272 tccctacttccgtttct 29149288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18330606 - 18330399
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18330606 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg-----atgataaaatggtggaaagaaaggat 18330512  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18330511 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18330412  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  18330411 tacttccgtttct 18330399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47023394 - 47023178
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  47023394 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 47023295  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47023294 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 47023195  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  47023194 tccccacttccgtttct 47023178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Original strand, 11110678 - 11110893
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  11110678 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 11110777  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11110778 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 11110877  T
Q  228 tccctacttccgtttc 243  Q
    |||| |||||||||||    
T  11110878 tccccacttccgtttc 11110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 15893023 - 15893239
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15893023 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaa 15893122  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15893123 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 15893222  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  15893223 tccctacttccgtttct 15893239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21674630 - 21674418
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21674630 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggat 21674531  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21674530 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 21674431  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  21674430 cacttccgtttct 21674418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 20577179 - 20577395
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  20577179 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 20577278  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20577279 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 20577378  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20577379 tccccacttccgtttct 20577395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 6542791 - 6543007
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  6542791 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 6542890  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6542891 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 6542990  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6542991 tccccacttccgtttct 6543007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 8301585 - 8301797
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8301585 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 8301684  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||     
T  8301685 gctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatcca 8301784  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  8301785 tacttccgtttct 8301797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24328100 - 24327884
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  24328100 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 24328001  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24328000 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 24327901  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24327900 tccccacttccgtttct 24327884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 29665302 - 29665518
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29665302 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29665401  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29665402 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29665501  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29665502 tccccacttccgtttct 29665518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 36997406 - 36997622
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  36997406 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 36997505  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36997506 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 36997605  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  36997606 tccccacttccgtttct 36997622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 17985273 - 17985489
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  17985273 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 17985372  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17985373 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 17985472  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  17985473 tccccacttccgtttct 17985489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28339243 - 28339027
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28339243 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28339144  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28339143 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 28339044  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28339043 tccccacttccgtttct 28339027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 31964790 - 31965006
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31964790 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31964889  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31964890 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 31964989  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31964990 tccccacttccgtttct 31965006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 50134388 - 50134604
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  50134388 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 50134487  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50134488 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 50134587  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  50134588 tccccacttccgtttct 50134604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4416857 - 4416641
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||||     
T  4416857 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaac 4416758  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4416757 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 4416658  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4416657 tccccacttccgtttct 4416641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5013653 - 5013437
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5013653 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5013554  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5013553 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 5013454  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5013453 tccccacttccgtttct 5013437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 5609639 - 5609855
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5609639 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5609738  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5609739 ggatgctgagaatacgtcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 5609838  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5609839 tccccacttccgtttct 5609855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18225132 - 18224916
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18225132 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18225033  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18225032 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 18224933  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18224932 tccccacttccgtttct 18224916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 22871191 - 22871407
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22871191 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22871290  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22871291 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacca 22871390  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22871391 tccccacttccgtttct 22871407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 22886250 - 22886466
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22886250 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22886349  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22886350 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacca 22886449  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22886450 tccccacttccgtttct 22886466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51781952 - 51781736
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  51781952 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 51781853  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51781852 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51781753  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  51781752 tccccacttccgtttct 51781736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51797041 - 51796825
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  51797041 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 51796942  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51796941 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51796842  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  51796841 tccccacttccgtttct 51796825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20065966 - 20065775
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065966 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 20065867  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgt 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20065866 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgt 20065775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48465856 - 48465640
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  48465856 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 48465757  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  48465756 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 48465657  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  48465656 ttcccacttccgtttct 48465640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18242668 - 18242452
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || || |||||     
T  18242668 aaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaac 18242569  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  18242568 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacacca 18242469  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18242468 tccccacttccgtttct 18242452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10396056 - 10395861
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10396056 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 10395957  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10395956 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 10395861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8211661 - 8211466
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 8211466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 4347022 - 4347217
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4347121  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4347122 catgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 4347217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28021198 - 28021004
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28021099  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28021098 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttc 28021004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18277369 - 18277585
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18277369 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18277468  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18277469 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18277568  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18277569 tccccacttccgtttct 18277585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18292670 - 18292886
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18292670 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18292769  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18292770 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18292869  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18292870 tccccacttccgtttct 18292886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18307971 - 18308187
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18307971 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18308070  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18308071 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18308170  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18308171 tccccacttccgtttct 18308187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5466905 - 5466710
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5466905 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5466806  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5466805 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 5466710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 5596717 - 5596899
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5596717 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 5596816  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5596817 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 5596899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5713168 - 5713058
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5713168 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5713069  T
Q  128 ggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||    
T  5713068 ggatgctgaga 5713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5724078 - 5723968
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5724078 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5723979  T
Q  128 ggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||    
T  5723978 ggatgctgaga 5723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 5757399 - 5757509
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5757399 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5757498  T
Q  128 ggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||    
T  5757499 ggatgctgaga 5757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 5768290 - 5768400
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5768290 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5768389  T
Q  128 ggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||    
T  5768390 ggatgctgaga 5768400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 16626854 - 16627036
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||    
T  16626854 gcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacg 16626953  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  16626954 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 16627036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18530304 - 18530122
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
T  18530304 gcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 18530205  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  18530204 gaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttct 18530122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4893133 - 4892977
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  4893133 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 4893034  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4893033 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 22387913 - 22388069
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  22387913 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgca 22388012  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22388013 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32439077 - 32438921
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  32439077 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 32438978  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32438977 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 32438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 17994132 - 17994208
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17994132 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 17994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625778
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 4625778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5652297 - 5652221
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5652297 gcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5652221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 406 - 622
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  406 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 505  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  506 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacacca 605  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  606 tccctacttccgtttct 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5127973 - 5127757
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5127973 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaa 5127874  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5127873 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 5127774  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  5127773 tccctacttccgtttct 5127757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16736622 - 16736838
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736622 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 16736721  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16736722 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 16736821  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  16736822 tccccacttcagtttct 16736838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16751676 - 16751892
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751676 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 16751775  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16751776 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 16751875  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  16751876 tccccacttcagtttct 16751892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17523513 - 17523297
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523513 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 17523414  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17523413 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 17523314  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  17523313 tccccacttcagtttct 17523297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 17529702 - 17529918
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529702 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 17529801  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17529802 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 17529901  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  17529902 tccccacttcagtttct 17529918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2154554 - 2154338
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154554 aaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 2154455  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2154454 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 2154355  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  2154354 tccctacttccgtttct 2154338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 11424942 - 11425154
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424942 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 11425041  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11425042 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11425141  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  11425142 tacttccgtttct 11425154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45387324 - 45387108
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45387324 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 45387225  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  45387224 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 45387125  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  45387124 tccccacttcagtttct 45387108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 10917031 - 10917243
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10917031 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggat 10917130  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10917131 gctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 10917230  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  10917231 tacttccgtttct 10917243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11441541 - 11441325
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  11441541 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 11441442  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11441441 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 11441342  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  11441341 tccccacttccgtttct 11441325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 5147505 - 5147718
Alignment:
Q  31 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaagga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  5147505 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgga 5147604  T
Q  131 tgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatcc 230  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5147605 tgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 5147704  T
Q  231 ctacttccgtttct 244  Q
    | ||||||||||||    
T  5147705 ccacttccgtttct 5147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 24592703 - 24592919
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  24592703 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 24592802  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24592803 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 24592902  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24592903 tccccacttccgtttct 24592919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26275256 - 26275472
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26275256 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26275355  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26275356 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26275455  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26275456 tccccacttccgtttct 26275472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26435234 - 26435022
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26435234 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26435135  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26435134 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccc 26435035  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  26435034 cacttccgtttct 26435022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16503542 - 16503758
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  16503542 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 16503641  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16503642 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16503741  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  16503742 tccctacttccgtttct 16503758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16518578 - 16518794
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  16518578 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 16518677  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16518678 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16518777  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  16518778 tccctacttccgtttct 16518794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26320031 - 26320247
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26320031 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26320130  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26320131 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26320230  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26320231 tccccacttccgtttct 26320247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31124892 - 31124676
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31124892 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31124793  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31124792 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31124693  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  31124692 tccctacttccgtttct 31124676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3445275 - 3445059
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  3445275 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 3445176  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3445175 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3445076  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3445075 tccccacttccgtttct 3445059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9618632 - 9618416
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9618632 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9618533  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  9618532 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 9618433  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  9618432 tccccacttcagtttct 9618416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 31564561 - 31564777
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31564561 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31564660  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31564661 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 31564760  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31564761 tccccacttccgtttct 31564777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 26485910 - 26486122
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  26485910 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 26486009  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486010 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26486109  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  26486110 cacttccgtttct 26486122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26538035 - 26538251
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  26538035 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 26538134  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  26538135 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 26538234  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  26538235 ttcccacttccgtttct 26538251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26670076 - 26670292
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26670076 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26670175  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  26670176 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 26670275  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26670276 tccccacttccgtttct 26670292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 4145306 - 4145501
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4145306 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4145405  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  4145406 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 4145501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041091
Alignment:
Q  68 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagaca 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||  |    
T  16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
Q  168 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 16041091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450365
Alignment:
Q  70 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatt 169  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||  |      
T  16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
Q  170 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 236  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctactt 16450365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5159482 - 5159326
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  5159482 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 5159383  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5159382 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 31088657 - 31088733
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31088657 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 31088733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 45733410 - 45733334
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45733410 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 45733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 23718165 - 23718377
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718165 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23718264  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23718265 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23718364  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  23718365 tacttccgtttct 23718377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 23752627 - 23752839
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752627 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23752726  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23752727 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23752826  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  23752827 tacttccgtttct 23752839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33777476 - 33777260
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33777476 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 33777377  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33777376 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacacca 33777277  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  33777276 tccctacttccgtttct 33777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41674698 - 41674482
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41674698 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 41674599  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41674598 ggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 41674499  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  41674498 tccccacttccgtttct 41674482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 9548719 - 9548932
Alignment:
Q  31 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaagga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9548719 cggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaagga 9548818  T
Q  131 tgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatcc 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9548819 tgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 9548918  T
Q  231 ctacttccgtttct 244  Q
    | ||||||||||||    
T  9548919 ccacttccgtttct 9548932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11549339 - 11549127
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11549339 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggat 11549240  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11549239 gctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11549140  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  11549139 tacttccgtttct 11549127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 22999291 - 22999503
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999291 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 22999390  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22999391 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 22999490  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    || ||||||||||    
T  22999491 tatttccgtttct 22999503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 8665648 - 8665864
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8665648 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 8665747  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  8665748 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 8665847  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  8665848 tccccacttcagtttct 8665864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 15658933 - 15659149
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  15658933 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaa 15659032  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15659033 ggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 15659132  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15659133 tccccacttccgtttct 15659149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 24688334 - 24688546
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24688334 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 24688433  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24688434 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 24688533  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  24688534 tacttccgtttct 24688546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18500921 - 18501137
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  18500921 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 18501020  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18501021 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 18501120  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18501121 tccccacttccgtttct 18501137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24681426 - 24681210
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24681426 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 24681327  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24681326 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24681227  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24681226 tccccacttccgtttct 24681210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24723953 - 24723737
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24723953 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 24723854  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24723853 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24723754  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24723753 tccccacttccgtttct 24723737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30934621 - 30934409
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30934621 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30934522  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  |||||||||||    
T  30934521 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccc 30934422  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  30934421 tacttccgtttct 30934409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31431417 - 31431201
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31431417 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31431318  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31431317 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgatacca 31431218  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31431217 tccccacttccgtttct 31431201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5637899 - 5637683
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5637899 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5637800  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5637799 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 5637700  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5637699 tccccacttccgtttct 5637683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9317440 - 9317224
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9317440 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9317341  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9317340 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 9317241  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  9317240 tccccacttccgtttct 9317224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12132144 - 12131928
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  12132144 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 12132045  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12132044 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 12131945  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  12131944 tccccacttccgtttct 12131928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26480381 - 26480165
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26480381 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26480282  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26480281 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26480182  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  26480181 tccccacttcagtttct 26480165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 29967239 - 29967455
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29967239 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29967338  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  29967339 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 29967438  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29967439 tccccacttccgtttct 29967455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30029404 - 30029188
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30029404 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30029305  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  30029304 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 30029205  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30029204 tccccacttccgtttct 30029188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 31826592 - 31826808
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31826592 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31826691  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31826692 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31826791  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31826792 tccccacttccgtttct 31826808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 37358828 - 37359044
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37358828 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37358927  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37358928 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 37359027  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37359028 tccccacttccgtttct 37359044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43078238 - 43078022
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  43078238 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 43078139  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  43078138 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacacca 43078039  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  43078038 tccccacttccgtttct 43078022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2511040 - 2510824
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  2511040 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 2510941  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2510940 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 2510841  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  2510840 ttcccacttccgtttct 2510824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6874291 - 6874075
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  6874291 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 6874192  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6874191 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 6874092  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6874091 tccccacttccgtttct 6874075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28649215 - 28648999
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28649215 aaccggaaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 28649116  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  28649115 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 28649016  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28649015 tccccacttccgtttct 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30168458 - 30168242
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30168458 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30168359  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30168358 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgatacca 30168259  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  30168258 tccccacttcagtttct 30168242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 37671665 - 37671881
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37671665 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37671764  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  37671765 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacca 37671864  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37671865 tccccacttccgtttct 37671881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3789515 - 3789299
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  3789515 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 3789416  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3789415 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3789316  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3789315 tccccacttccgtttct 3789299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 13325017 - 13325233
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  13325017 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 13325116  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13325117 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacacca 13325216  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  13325217 tccccacttccgtttct 13325233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 15759030 - 15759246
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  15759030 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 15759129  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15759130 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacacca 15759229  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  15759230 tccccacttcagtttct 15759246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18375585 - 18375801
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18375585 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18375684  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18375685 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 18375784  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18375785 tccccacttccgtttct 18375801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30152007 - 30151791
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30152007 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30151908  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30151907 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 30151808  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30151807 tccccacttccgtttct 30151791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37754957 - 37754741
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37754957 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37754858  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37754857 ggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37754758  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37754757 tccccacttccgtttct 37754741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33516345 - 33516129
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  33516345 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 33516246  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33516245 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 33516146  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  33516145 tccccacttcagtttct 33516129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 28959975 - 28960187
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28959975 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28960074  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28960075 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccc 28960174  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  28960175 cacttccgtttct 28960187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 37771172 - 37771388
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37771172 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37771271  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  37771272 ggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 37771371  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37771372 tccccacttccgtttct 37771388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 40473725 - 40473941
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  40473725 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 40473824  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40473825 ggatgctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40473924  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40473925 tccccacttccgtttct 40473941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 32599676 - 32599857
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32599676 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 32599775  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32599776 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttc 32599857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23892161 - 23891979
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23892161 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacg 23892062  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  23892061 gaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttct 23891979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34616489 - 34616294
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34616390  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34616389 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 34616294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24970013 - 24969867
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  24970013 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 24969914  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggc 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24969913 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggc 24969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198806
Alignment:
Q  72 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttg 171  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
Q  172 ggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 243  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttc 25198806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22888428 - 22888287
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  22888428 gcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 22888329  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 203  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22888328 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951883
Alignment:
Q  176 gcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 24951883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33292496 - 33292340
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  33292496 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 33292397  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33292396 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 13184852 - 13184928
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13184852 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13184928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 13440698 - 13440774
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13440698 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13440774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33877205 - 33877129
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33877205 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33877129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11325752 - 11325676
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11325752 gcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 11325676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16277530 - 16277318
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277530 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16277431  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16277430 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16277331  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  16277330 tacttccgtttct 16277318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19674418 - 19674202
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674418 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 19674319  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19674318 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacacca 19674219  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| || |||||||||    
T  19674218 tccccacgtccgtttct 19674202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 2137498 - 2137710
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137498 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggat 2137597  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2137598 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 2137697  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  2137698 tacttccgtttct 2137710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 27609144 - 27609356
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609144 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27609243  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27609244 gctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27609343  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    || ||||||||||    
T  27609344 tatttccgtttct 27609356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14557603 - 14557391
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14557603 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 14557504  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14557503 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 14557404  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  14557403 tacttccgtttct 14557391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19688078 - 19687862
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19688078 aaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaa 19687979  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19687978 ggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacca 19687879  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  19687878 tccctacttccgtttct 19687862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 19518378 - 19518594
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19518378 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 19518477  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19518478 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 19518577  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19518578 tccccacttccgtttct 19518594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 19208595 - 19208811
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19208595 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19208694  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19208695 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 19208794  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19208795 tccccacttccgtttct 19208811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 3329754 - 3329970
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  3329754 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaat 3329853  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3329854 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacacca 3329953  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3329954 tccccacttccgtttct 3329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33258703 - 33258487
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  33258703 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 33258604  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  33258603 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 33258504  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33258503 tccccacttccgtttct 33258487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29829293 - 29829077
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29829293 aaccgacaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29829194  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29829193 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29829094  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29829093 tccccacttccgtttct 29829077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 31489985 - 31490201
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31489985 aaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31490084  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31490085 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31490184  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  31490185 tccccacttcagtttct 31490201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 28362190 - 28362406
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28362190 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28362289  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28362290 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 28362389  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  28362390 tccccacttcagtttct 28362406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16283429 - 16283213
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  16283429 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaa 16283330  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16283329 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16283230  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  16283229 tccctacttccgtttct 16283213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18710566 - 18710350
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18710566 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18710467  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18710466 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 18710367  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  18710366 ttcccacttccgtttct 18710350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 12092968 - 12093184
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  12092968 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 12093067  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  12093068 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacacca 12093167  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  12093168 ttcccacttccgtttct 12093184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286229
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 19286229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31354483 - 31354288
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31354483 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31354384  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31354383 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 31354288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 19659305 - 19659407
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  19659305 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 19659404  T
Q  162 gag 164  Q
    |||    
T  19659405 gag 19659407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44563050 - 44562948
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  44563050 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 44562951  T
Q  162 gag 164  Q
    |||    
T  44562950 gag 44562948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9354571 - 9354495
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9354571 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 9354495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 237
Target Start/End: Original strand, 22081135 - 22081316
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 155  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||  | |    
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 22081234  T
Q  156 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttc 237  Q
    | | |||||  |  || || |||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||    
T  22081235 acggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttc 22081316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 24592587 - 24592803
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24592587 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 24592686  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24592687 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24592786  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24592787 tccctatttccgtttct 24592803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5005865 - 5005649
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5005865 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 5005766  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5005765 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 5005666  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5005665 tccccacttccgtttct 5005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17013991 - 17013779
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013991 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 17013892  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17013891 gctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccc 17013792  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  17013791 tacttccgtttct 17013779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6569844 - 6569632
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6569844 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 6569745  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6569744 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 6569645  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  6569644 cacttccgtttct 6569632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 27163593 - 27163809
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27163593 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 27163692  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  27163693 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 27163792  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27163793 tccccacttccgtttct 27163809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30753737 - 30753521
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30753737 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 30753638  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30753637 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatca 30753538  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30753537 tccccacttccgtttct 30753521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14665009 - 14664797
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665009 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 14664910  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  14664909 gctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 14664810  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  14664809 tacttccgtttct 14664797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21969696 - 21969480
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21969696 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaa 21969597  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21969596 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 21969497  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21969496 tccccacttccgtttct 21969480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 18800898 - 18801114
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18800898 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 18800997  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  18800998 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 18801097  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  18801098 tccccacttctgtttct 18801114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14098536 - 14098320
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  14098536 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 14098437  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14098436 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 14098337  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  14098336 tccccacttccgtttct 14098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 33674086 - 33674302
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  33674086 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaac 33674185  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33674186 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 33674285  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33674286 tccccacttccgtttct 33674302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 40105914 - 40106130
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  40105914 aaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 40106013  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40106014 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40106113  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40106114 tccccacttccgtttct 40106130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 31126794 - 31127010
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31126794 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31126893  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31126894 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 31126993  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  31126994 tccccacttcagtttct 31127010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39850618 - 39850402
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  39850618 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 39850519  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39850518 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 39850419  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  39850418 ttcccacttccgtttct 39850402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833169
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 54833169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 14763580 - 14763796
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  14763580 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 14763679  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14763680 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 14763779  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  14763780 tccccacttccgtttct 14763796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373040
Alignment:
Q  82 ttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattg 181  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  182 ataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 19373040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 36344809 - 36345004
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcaca 36344908  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36344909 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 36345004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1900221 - 1900039
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  1900221 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 1900122  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  1900121 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 1900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15227834 - 15227652
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  15227834 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 15227735  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  15227734 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttct 15227652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 15285235 - 15285417
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | |    
T  15285235 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatg 15285334  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||| |||||| ||||||    
T  15285335 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttct 15285417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24112639 - 24112483
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  24112639 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 24112540  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24112539 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 34189254 - 34189410
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  34189254 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 34189353  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 205  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34189354 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 14235810 - 14235911
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14235810 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 14235909  T
Q  137 ga 138  Q
    ||    
T  14235910 ga 14235911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 24460912 - 24460988
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24460912 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 24460988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 13936809 - 13937025
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13936809 aaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 13936908  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13936909 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 13937008  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  13937009 tccccacttccgtttct 13937025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 23128835 - 23129047
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128835 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23128934  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23128935 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23129034  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  23129035 tacttccgtttct 23129047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28882186 - 28881974
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882186 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 28882087  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28882086 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 28881987  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    || ||||||||||    
T  28881986 tatttccgtttct 28881974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 11635454 - 11635670
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11635454 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 11635553  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11635554 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacca 11635653  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  11635654 tccccacttccgcttct 11635670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 11641643 - 11641859
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11641643 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 11641742  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11641743 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacca 11641842  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  11641843 tccccacttccgcttct 11641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34279425 - 34279209
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34279425 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34279326  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34279325 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 34279226  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34279225 tccccacttccgtttct 34279209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 21677447 - 21677663
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21677447 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 21677546  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21677547 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 21677646  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  21677647 tccccacttcagtttct 21677663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32049774 - 32049558
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32049774 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 32049675  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32049674 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 32049575  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  32049574 tccccacttccgtttct 32049558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34286330 - 34286114
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34286330 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34286231  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34286230 ggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacca 34286131  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  34286130 tccctacttccgtttct 34286114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34291390 - 34291174
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34291390 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34291291  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34291290 ggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacca 34291191  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  34291190 tccctacttccgtttct 34291174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12655514 - 12655302
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655514 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 12655415  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  12655414 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 12655315  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  12655314 tacttccgtttct 12655302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 12716870 - 12717086
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12716870 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 12716969  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12716970 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 12717069  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  12717070 tccccacttccgtttct 12717086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37925469 - 37925253
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37925469 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37925370  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37925369 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37925270  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37925269 tccccacttccgtttct 37925253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 261034 - 261246
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  261034 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 261133  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  261134 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 261233  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
     ||||||||||||    
T  261234 cacttccgtttct 261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20837890 - 20837678
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837890 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 20837791  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  20837790 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 20837691  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  20837690 tacttccgtttct 20837678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 27434709 - 27434925
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  27434709 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaa 27434808  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  27434809 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 27434908  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  27434909 tccctacttccgtttct 27434925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12586777 - 12586561
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  12586777 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 12586678  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12586677 ggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacacca 12586578  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  12586577 tccccacttccgtttct 12586561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27803668 - 27803452
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27803668 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27803569  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27803568 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27803469  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27803468 tccccacttccgtttct 27803452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31876257 - 31876041
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31876257 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31876158  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31876157 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31876058  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31876057 tccccacttccgtttct 31876041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34861656 - 34861440
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  34861656 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 34861557  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34861556 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 34861457  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34861456 tccccacttccgtttct 34861440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 37686174 - 37686390
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37686174 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37686273  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37686274 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37686373  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37686374 tccccacttccgtttct 37686390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 37701439 - 37701655
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37701439 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37701538  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37701539 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37701638  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  37701639 tccccacttccgtttct 37701655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39890038 - 39889822
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  39890038 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 39889939  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39889938 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 39889839  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  39889838 tccccacttccgtttct 39889822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40233475 - 40233259
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  40233475 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 40233376  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40233375 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40233276  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40233275 tccccacttccgtttct 40233259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 9350259 - 9350475
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  9350259 aaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 9350358  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9350359 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 9350458  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  9350459 tccccacttccgtttct 9350475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 19416764 - 19416980
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19416764 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19416863  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  19416864 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 19416963  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19416964 tccccacttccgtttct 19416980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 22926293 - 22926509
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22926293 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22926392  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22926393 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 22926492  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22926493 tccccacttccgtttct 22926509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27777183 - 27776967
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27777183 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27777084  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27777083 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27776984  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27776983 tccccacttccgtttct 27776967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27816950 - 27816734
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27816950 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27816851  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27816850 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27816751  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27816750 tccccacttccgtttct 27816734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 16829603 - 16829819
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16829603 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16829702  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16829703 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16829802  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  16829803 tccccacttcagtttct 16829819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16891878 - 16891662
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16891878 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16891779  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16891778 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16891679  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  16891678 tccccacttcagtttct 16891662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 39052093 - 39052309
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  39052093 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 39052192  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  39052193 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacacca 39052292  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  39052293 ttcccacttccgtttct 39052309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37375102 - 37374921
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 162  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375102 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 37375003  T
Q  163 agacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37375002 aggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37374921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 21703460 - 21703642
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  21703460 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 21703559  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  21703560 gaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 21703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 19456717 - 19456899
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| ||||    
T  19456717 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacg 19456816  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  19456817 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttct 19456899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 31891624 - 31891726
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  31891624 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 31891723  T
Q  162 gag 164  Q
    |||    
T  31891724 gag 31891726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3784599 - 3784523
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3784599 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27118633 - 27118557
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27118633 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 27118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34156956 - 34156880
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34156956 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34156880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303675
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34303675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27392960 - 27392859
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27392960 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 27392861  T
Q  137 ga 138  Q
    ||    
T  27392860 ga 27392859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16163544 - 16163468
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16163544 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 16163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27056
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27268 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27169  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27168 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27069  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||    
T  27068 tacttccgtttct 27056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30429 - 30217
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30429 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30330  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30329 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 30230  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    || ||||||||||    
T  30229 tatttccgtttct 30217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20176
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 20176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 244
Target Start/End: Original strand, 47265 - 47477
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47265 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 47364  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47365 gctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 47464  T
Q  232 tacttccgtttct 244  Q
    || ||||||||||    
T  47465 tatttccgtttct 47477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 40345 - 40561
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  40345 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaa 40444  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  40445 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 40544  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  40545 tccctacttccgtttct 40561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29743 - 29527
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29743 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaa 29644  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  29643 ggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 29544  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||||    
T  29543 tccctacttccgtttct 29527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 41793584 - 41793800
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41793584 aaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 41793683  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41793684 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 41793783  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  41793784 ttcccacttccgtttct 41793800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10962649 - 10962433
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  10962649 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 10962550  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10962549 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 10962450  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10962449 tccccacttccgtttct 10962433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51638197 - 51637981
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  51638197 aaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 51638098  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51638097 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51637998  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  51637997 tccccacttccgtttct 51637981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28584960 - 28584744
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28584960 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28584861  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28584860 ggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 28584761  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  28584760 tccccacttccgtttct 28584744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460878
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| | ||    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  162 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttc 237  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttc 20460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 20340642 - 20340718
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20340642 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 20340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Original strand, 16208443 - 16208517
Alignment:
Q  170 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||||    
T  16208443 tgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttct 16208517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 7515 - 7731
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  7515 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 7614  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7615 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 7714  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7715 tccccacttccgtttct 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 9342 - 9558
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9342 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9441  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9442 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 9541  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  9542 tccccacttccgtttct 9558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19995 - 19807
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19995 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19896  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  19895 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 15206 - 15422
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  15206 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 15305  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15306 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 15405  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15406 tccccacttccgtttct 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 26478 - 26694
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26478 aaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26577  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26578 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26677  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26678 tccccacttccgtttct 26694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7917 - 7701
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  7917 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 7818  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  7817 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 7718  T
Q  228 tccctacttccgtttct 244  Q
    | || ||||||||||||    
T  7717 ttcccacttccgtttct 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5971 - 5753
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa-ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaat-ggcggaaaga 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||    
T  5971 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaaga 5872  T
Q  126 aaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca-tggattgatcggctccagctgaca 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  5871 aaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgaca 5772  T
Q  225 ccatccctacttccgtttct 244  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5771 ccatccc-acttccgtttct 5753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 9 - 204
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 108  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgac 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  109 ggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7996
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8191 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 8092  T
Q  149 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8091 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3041
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2965 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21538 - 21437
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21538 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 21439  T
Q  137 ga 138  Q
    ||    
T  21438 ga 21437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University