View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6900_low_1 (Length: 1585)

Name: NF6900_low_1
Description: NF6900
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6900_low_1
NF6900_low_1
[»] chr5 (129 HSPs)
chr5 (101-1585)||(37704626-37706110)
chr5 (102-587)||(25904053-25904538)
chr5 (102-585)||(10474168-10474652)
chr5 (103-581)||(17818338-17818817)
chr5 (136-586)||(18511055-18511507)
chr5 (102-588)||(24126806-24127294)
chr5 (102-586)||(40221472-40221964)
chr5 (102-586)||(17072833-17073322)
chr5 (102-579)||(21947977-21948462)
chr5 (136-585)||(16092045-16092495)
chr5 (102-585)||(1189454-1189943)
chr5 (102-585)||(39854434-39854921)
chr5 (102-585)||(10528937-10529428)
chr5 (102-568)||(2818193-2818665)
chr5 (102-546)||(26097683-26098127)
chr5 (128-584)||(6756470-6756926)
chr5 (174-585)||(658204-658610)
chr5 (102-586)||(36402169-36402657)
chr5 (136-586)||(25804009-25804464)
chr5 (102-586)||(31465832-31466307)
chr5 (136-586)||(6745053-6745508)
chr5 (102-545)||(18509201-18509648)
chr5 (102-586)||(25921314-25921802)
chr5 (104-585)||(2954368-2954849)
chr5 (102-584)||(12555757-12556252)
chr5 (102-588)||(18596597-18597082)
chr5 (129-567)||(16776135-16776577)
chr5 (136-585)||(2174903-2175341)
chr5 (136-586)||(6747290-6747744)
chr5 (136-586)||(18466668-18467124)
chr5 (102-585)||(38882055-38882525)
chr5 (214-586)||(2723964-2724329)
chr5 (102-585)||(695839-696310)
chr5 (136-583)||(27912520-27912973)
chr5 (102-437)||(31472606-31472942)
chr5 (136-585)||(18468995-18469448)
chr5 (103-579)||(21288715-21289187)
chr5 (102-585)||(4236579-4237065)
chr5 (102-585)||(31179213-31179700)
chr5 (136-586)||(34476893-34477349)
chr5 (219-586)||(41585579-41585956)
chr5 (230-586)||(20505686-20506042)
chr5 (102-437)||(39397987-39398321)
chr5 (136-585)||(21684294-21684746)
chr5 (136-568)||(34479274-34479714)
chr5 (136-586)||(27910435-27910873)
chr5 (105-366)||(34530731-34530992)
chr5 (102-434)||(31545030-31545362)
chr5 (102-434)||(31542685-31543016)
chr5 (102-584)||(6661038-6661511)
chr5 (136-434)||(15552229-15552527)
chr5 (194-585)||(10586873-10587252)
chr5 (129-310)||(20043027-20043208)
chr5 (102-314)||(20044960-20045172)
chr5 (102-586)||(36208530-36209008)
chr5 (231-586)||(39798126-39798469)
chr5 (102-300)||(26098382-26098580)
chr5 (340-586)||(26098128-26098380)
chr5 (219-594)||(4410090-4410467)
chr5 (1393-1581)||(37699152-37699349)
chr5 (248-586)||(10749796-10750138)
chr5 (797-999)||(37437914-37438116)
chr5 (139-585)||(20053834-20054266)
chr5 (126-366)||(9020197-9020432)
chr5 (248-586)||(10757273-10757614)
chr5 (248-585)||(3372977-3373320)
chr5 (368-586)||(20043206-20043425)
chr5 (248-586)||(15354413-15354757)
chr5 (248-586)||(23665140-23665485)
chr5 (248-586)||(23793102-23793447)
chr5 (1453-1581)||(37437696-37437823)
chr5 (248-585)||(38959972-38960314)
chr5 (248-586)||(15356689-15357033)
chr5 (194-366)||(17413232-17413402)
chr5 (234-459)||(15143547-15143776)
chr5 (592-791)||(37438187-37438386)
chr5 (255-435)||(23741855-23742034)
chr5 (102-234)||(20507659-20507791)
chr5 (799-906)||(37700646-37700753)
chr5 (460-585)||(34530559-34530683)
chr5 (597-787)||(37700838-37701026)
chr5 (296-367)||(42770954-42771025)
chr5 (1509-1567)||(37698806-37698864)
chr5 (203-366)||(34033632-34033797)
chr5 (1125-1267)||(34599459-34599603)
chr5 (322-567)||(15445135-15445376)
chr5 (464-559)||(20045300-20045395)
chr5 (127-320)||(42770748-42770934)
chr5 (182-311)||(4754188-4754312)
chr5 (1125-1273)||(2143247-2143394)
chr5 (466-585)||(23741697-23741813)
chr5 (182-290)||(2144706-2144811)
chr5 (136-192)||(4410045-4410101)
chr5 (252-366)||(4897828-4897943)
chr5 (1022-1245)||(13953394-13953616)
chr5 (171-290)||(29748370-29748485)
chr5 (531-585)||(1171089-1171142)
chr5 (1018-1095)||(1629760-1629837)
chr5 (504-585)||(15552605-15552685)
chr5 (1001-1117)||(1629683-1629799)
chr5 (102-146)||(2723917-2723961)
chr5 (1001-1117)||(29532047-29532161)
chr5 (1170-1273)||(26325678-26325781)
chr5 (121-191)||(41585946-41586016)
chr5 (1074-1115)||(2143379-2143420)
chr5 (203-290)||(15224911-15224997)
chr5 (1022-1107)||(30384213-30384297)
chr5 (505-562)||(31543094-31543150)
chr5 (531-583)||(28786677-28786728)
chr5 (203-311)||(31782578-31782690)
chr5 (1222-1270)||(38458771-38458819)
chr5 (531-586)||(10627641-10627696)
chr5 (542-585)||(11962287-11962330)
chr5 (234-311)||(35430259-35430338)
chr5 (1020-1107)||(37704830-37704917)
chr5 (1053-1116)||(41232901-41232964)
chr5 (249-287)||(1170811-1170849)
chr5 (531-585)||(1240707-1240760)
chr5 (249-287)||(2298145-2298183)
chr5 (389-431)||(8565946-8565988)
chr5 (389-431)||(19806489-19806531)
chr5 (1293-1335)||(30384256-30384298)
chr5 (389-431)||(32636950-32636992)
chr5 (249-287)||(35385596-35385634)
chr5 (249-290)||(10627364-10627405)
chr5 (389-468)||(28786543-28786623)
chr5 (1192-1252)||(29531914-29531975)
chr5 (1021-1117)||(38458805-38458899)
chr5 (453-518)||(39397916-39397981)
[»] chr1 (144 HSPs)
chr1 (102-579)||(11457328-11457806)
chr1 (101-585)||(18307058-18307543)
chr1 (102-585)||(13215031-13215518)
chr1 (104-585)||(2949079-2949560)
chr1 (102-587)||(18839537-18840024)
chr1 (102-586)||(41646870-41647356)
chr1 (102-583)||(25251123-25251606)
chr1 (102-567)||(12302368-12302841)
chr1 (127-586)||(50307388-50307853)
chr1 (103-586)||(6995539-6996030)
chr1 (102-590)||(50248412-50248903)
chr1 (102-586)||(14097814-14098301)
chr1 (136-585)||(47906254-47906704)
chr1 (121-586)||(31424861-31425331)
chr1 (102-585)||(39462469-39462956)
chr1 (102-582)||(9240937-9241417)
chr1 (102-586)||(31489865-31490346)
chr1 (102-540)||(50076564-50077003)
chr1 (102-586)||(38925327-38925809)
chr1 (102-586)||(28206911-28207397)
chr1 (103-586)||(17185978-17186458)
chr1 (102-581)||(17324482-17324967)
chr1 (127-585)||(17318868-17319321)
chr1 (102-567)||(51749989-51750460)
chr1 (102-586)||(28998093-28998584)
chr1 (102-586)||(29003809-29004300)
chr1 (103-560)||(17324016-17324484)
chr1 (122-585)||(4131221-4131692)
chr1 (102-585)||(10399669-10400159)
chr1 (102-540)||(16428603-16429040)
chr1 (136-585)||(27336782-27337235)
chr1 (102-585)||(31422706-31423205)
chr1 (102-567)||(15823496-15823967)
chr1 (136-568)||(15294693-15295131)
chr1 (136-586)||(27338972-27339427)
chr1 (101-499)||(6756476-6756875)
chr1 (145-585)||(40133937-40134378)
chr1 (102-471)||(50078779-50079152)
chr1 (105-460)||(3579588-3579946)
chr1 (102-585)||(13761787-13762275)
chr1 (102-586)||(47451598-47452066)
chr1 (136-585)||(2510184-2510621)
chr1 (102-586)||(2617466-2617956)
chr1 (103-585)||(20302410-20302879)
chr1 (136-585)||(39932057-39932514)
chr1 (136-557)||(25127856-25128280)
chr1 (135-585)||(31735365-31735819)
chr1 (108-437)||(6822971-6823299)
chr1 (136-585)||(24325648-24326101)
chr1 (144-586)||(46431547-46431996)
chr1 (136-586)||(28842479-28842932)
chr1 (102-437)||(28840628-28840964)
chr1 (219-585)||(25248398-25248766)
chr1 (134-586)||(20291439-20291895)
chr1 (102-586)||(16226117-16226608)
chr1 (237-586)||(16429042-16429388)
chr1 (136-585)||(9463104-9463541)
chr1 (136-585)||(9459277-9459714)
chr1 (136-585)||(47179697-47180152)
chr1 (136-377)||(21948244-21948484)
chr1 (102-434)||(14183589-14183917)
chr1 (102-377)||(48665121-48665403)
chr1 (102-437)||(51752315-51752648)
chr1 (136-586)||(47177346-47177802)
chr1 (198-577)||(16432440-16432813)
chr1 (102-478)||(42922184-42922557)
chr1 (102-582)||(18800426-18800900)
chr1 (102-437)||(49495206-49495530)
chr1 (108-351)||(6823840-6824091)
chr1 (126-478)||(8347227-8347576)
chr1 (129-586)||(8348904-8349352)
chr1 (296-585)||(23816030-23816323)
chr1 (183-407)||(15669419-15669641)
chr1 (232-585)||(6114953-6115304)
chr1 (248-585)||(23785935-23786278)
chr1 (244-586)||(51757623-51757974)
chr1 (219-433)||(16231630-16231843)
chr1 (454-586)||(50078634-50078766)
chr1 (324-585)||(15916562-15916821)
chr1 (121-478)||(13125411-13125768)
chr1 (102-585)||(30790250-30790725)
chr1 (102-341)||(26520205-26520449)
chr1 (442-585)||(3579431-3579572)
chr1 (234-368)||(30738695-30738830)
chr1 (231-478)||(16561545-16561794)
chr1 (234-459)||(26613211-26613440)
chr1 (182-434)||(27916529-27916780)
chr1 (1022-1258)||(363615-363853)
chr1 (234-409)||(155788-155963)
chr1 (464-586)||(25860251-25860369)
chr1 (1023-1258)||(47726457-47726693)
chr1 (1023-1258)||(47747763-47747999)
chr1 (464-585)||(13447117-13447233)
chr1 (1021-1114)||(16554303-16554396)
chr1 (106-191)||(25248756-25248841)
chr1 (194-366)||(28279309-28279480)
chr1 (1127-1257)||(29954870-29955000)
chr1 (465-585)||(30780361-30780482)
chr1 (1022-1111)||(18470189-18470279)
chr1 (194-276)||(26332719-26332798)
chr1 (389-437)||(13358810-13358858)
chr1 (1022-1117)||(802251-802346)
chr1 (1003-1110)||(12656368-12656474)
chr1 (234-290)||(26332632-26332688)
chr1 (504-586)||(14183454-14183534)
chr1 (464-585)||(16231884-16232002)
chr1 (531-586)||(21353196-21353251)
chr1 (1022-1108)||(16026108-16026194)
chr1 (102-192)||(16231551-16231641)
chr1 (470-586)||(51752696-51752806)
chr1 (234-379)||(14353047-14353192)
chr1 (531-586)||(9522003-9522057)
chr1 (1001-1197)||(11016877-11017075)
chr1 (102-276)||(13127790-13127959)
chr1 (1192-1258)||(26706207-26706274)
chr1 (1022-1117)||(46530163-46530258)
chr1 (234-343)||(49959129-49959240)
chr1 (1053-1110)||(48130213-48130268)
chr1 (1016-1105)||(48130428-48130516)
chr1 (1003-1102)||(363806-363906)
chr1 (531-590)||(2232872-2232931)
chr1 (128-168)||(6115344-6115384)
chr1 (1038-1117)||(26706353-26706432)
chr1 (1003-1105)||(46530411-46530517)
chr1 (915-981)||(2125101-2125168)
chr1 (389-468)||(4144644-4144726)
chr1 (249-288)||(4144826-4144865)
chr1 (323-366)||(43104332-43104375)
chr1 (389-431)||(834167-834209)
chr1 (249-287)||(2232597-2232635)
chr1 (1212-1258)||(18470384-18470430)
chr1 (389-431)||(28220226-28220268)
chr1 (389-431)||(28265554-28265596)
chr1 (464-549)||(28841000-28841083)
chr1 (389-431)||(40122196-40122238)
chr1 (389-431)||(45644354-45644396)
chr1 (389-431)||(49918476-49918518)
chr1 (389-431)||(50167175-50167217)
chr1 (464-586)||(13358894-13359012)
chr1 (249-290)||(14997040-14997081)
chr1 (1053-1114)||(16026346-16026406)
chr1 (1053-1110)||(18470439-18470495)
chr1 (391-486)||(26520066-26520162)
chr1 (1125-1273)||(47600499-47600648)
[»] chr2 (125 HSPs)
chr2 (102-585)||(19007566-19008051)
chr2 (121-586)||(28196582-28197046)
chr2 (102-586)||(6263992-6264474)
chr2 (136-586)||(21520533-21520988)
chr2 (102-586)||(22287180-22287665)
chr2 (102-586)||(42923350-42923840)
chr2 (102-585)||(17849043-17849528)
chr2 (105-585)||(14837202-14837679)
chr2 (102-581)||(6258666-6259144)
chr2 (102-587)||(3022089-3022584)
chr2 (102-579)||(27104725-27105206)
chr2 (104-582)||(34979437-34979906)
chr2 (102-579)||(45279848-45280314)
chr2 (102-513)||(40031968-40032387)
chr2 (127-549)||(17848394-17848814)
chr2 (102-585)||(43623423-43623897)
chr2 (102-562)||(13909908-13910373)
chr2 (129-514)||(44288982-44289370)
chr2 (102-437)||(11739553-11739889)
chr2 (136-568)||(23452093-23452532)
chr2 (102-437)||(19502005-19502340)
chr2 (102-437)||(19504340-19504674)
chr2 (102-585)||(31732631-31733094)
chr2 (102-549)||(42064441-42064878)
chr2 (102-585)||(11577957-11578433)
chr2 (103-437)||(42452710-42453041)
chr2 (102-408)||(45239000-45239310)
chr2 (186-585)||(28459038-28459435)
chr2 (102-585)||(24162063-24162541)
chr2 (226-556)||(5375218-5375550)
chr2 (136-567)||(35215450-35215881)
chr2 (102-353)||(15539553-15539804)
chr2 (136-567)||(35217827-35218258)
chr2 (312-586)||(22707594-22707872)
chr2 (302-522)||(22407361-22407583)
chr2 (102-478)||(18800266-18800631)
chr2 (171-557)||(17897125-17897502)
chr2 (129-454)||(22874095-22874411)
chr2 (248-586)||(36560980-36561324)
chr2 (311-578)||(23870951-23871222)
chr2 (171-499)||(20146540-20146866)
chr2 (102-273)||(22163106-22163276)
chr2 (302-585)||(7462789-7463077)
chr2 (136-276)||(38020162-38020302)
chr2 (248-585)||(36558721-36559047)
chr2 (345-585)||(22162869-22163108)
chr2 (1022-1258)||(4558769-4559007)
chr2 (248-433)||(45332179-45332364)
chr2 (102-249)||(22407591-22407738)
chr2 (1003-1254)||(8198509-8198759)
chr2 (1003-1254)||(8203269-8203519)
chr2 (102-434)||(37962938-37963256)
chr2 (232-459)||(40699429-40699660)
chr2 (407-562)||(15539397-15539553)
chr2 (171-469)||(35107294-35107590)
chr2 (186-361)||(27136195-27136368)
chr2 (136-231)||(5377629-5377724)
chr2 (462-567)||(38020368-38020473)
chr2 (219-318)||(38414194-38414291)
chr2 (249-366)||(20589763-20589881)
chr2 (389-585)||(20592291-20592484)
chr2 (102-190)||(38020069-38020157)
chr2 (194-286)||(43139395-43139484)
chr2 (1003-1086)||(45385838-45385921)
chr2 (194-290)||(27583480-27583573)
chr2 (233-366)||(15693958-15694094)
chr2 (468-586)||(19504177-19504291)
chr2 (504-585)||(22874439-22874519)
chr2 (505-586)||(45332019-45332098)
chr2 (531-587)||(17462714-17462769)
chr2 (234-311)||(17921754-17921833)
chr2 (466-586)||(19501842-19501958)
chr2 (1003-1117)||(4923428-4923542)
chr2 (504-586)||(11739420-11739501)
chr2 (102-160)||(12342681-12342739)
chr2 (531-585)||(17943813-17943867)
chr2 (233-290)||(26345661-26345718)
chr2 (510-586)||(42453818-42453891)
chr2 (915-982)||(8265959-8266027)
chr2 (194-290)||(35028595-35028688)
chr2 (530-586)||(42923292-42923347)
chr2 (455-586)||(38414027-38414156)
chr2 (1022-1117)||(42053964-42054059)
chr2 (1177-1258)||(6739472-6739554)
chr2 (389-431)||(17057369-17057411)
chr2 (389-431)||(17085352-17085394)
chr2 (1022-1111)||(3289442-3289531)
chr2 (440-586)||(45238841-45238986)
chr2 (531-586)||(20054609-20054665)
chr2 (1213-1273)||(42054042-42054102)
chr2 (531-585)||(20049866-20049921)
chr2 (531-585)||(22712374-22712426)
chr2 (531-585)||(27517491-27517543)
chr2 (542-585)||(33670817-33670859)
chr2 (234-276)||(34575265-34575308)
chr2 (389-431)||(723744-723786)
chr2 (249-287)||(2736205-2736243)
chr2 (552-586)||(2736503-2736537)
chr2 (249-287)||(2740941-2740979)
chr2 (1005-1071)||(4558680-4558745)
chr2 (1192-1245)||(4923553-4923607)
chr2 (1022-1080)||(8198419-8198477)
chr2 (1022-1080)||(8203179-8203237)
chr2 (389-431)||(11067431-11067473)
chr2 (389-431)||(11151591-11151633)
chr2 (249-287)||(17462436-17462474)
chr2 (249-287)||(20054909-20054947)
chr2 (249-287)||(22712660-22712698)
chr2 (552-586)||(22717082-22717116)
chr2 (249-287)||(22717369-22717407)
chr2 (249-311)||(28458949-28459011)
chr2 (234-360)||(30720684-30720811)
chr2 (389-431)||(33162450-33162492)
chr2 (389-431)||(34139770-34139812)
chr2 (534-588)||(37962788-37962841)
chr2 (389-431)||(39284962-39285004)
chr2 (249-287)||(39680045-39680083)
chr2 (249-287)||(39686983-39687021)
chr2 (249-287)||(45567409-45567447)
chr2 (389-438)||(1345592-1345641)
chr2 (389-438)||(2838081-2838130)
chr2 (234-290)||(7502975-7503032)
chr2 (533-586)||(22405769-22405821)
chr2 (1001-1076)||(32546464-32546538)
chr2 (296-333)||(38020312-38020349)
[»] chr3 (168 HSPs)
chr3 (102-585)||(1626525-1627010)
chr3 (102-586)||(3314614-3315101)
chr3 (102-586)||(43421259-43421742)
chr3 (102-586)||(43423307-43423790)
chr3 (102-585)||(1313340-1313822)
chr3 (102-583)||(5926611-5927091)
chr3 (102-586)||(53917505-53917991)
chr3 (102-578)||(880302-880779)
chr3 (127-586)||(28101847-28102304)
chr3 (102-585)||(4308122-4308608)
chr3 (102-555)||(51943301-51943758)
chr3 (102-578)||(53468302-53468782)
chr3 (102-585)||(53915338-53915823)
chr3 (102-578)||(45882869-45883350)
chr3 (102-585)||(24979637-24980126)
chr3 (102-586)||(43226016-43226496)
chr3 (136-581)||(27101026-27101474)
chr3 (101-585)||(39715399-39715883)
chr3 (102-585)||(51674608-51675082)
chr3 (136-586)||(18099009-18099463)
chr3 (136-585)||(18096740-18097193)
chr3 (102-576)||(43228221-43228696)
chr3 (136-585)||(47148745-47149188)
chr3 (102-585)||(12267819-12268293)
chr3 (102-585)||(10955867-10956354)
chr3 (136-586)||(42990268-42990718)
chr3 (134-585)||(32263881-32264334)
chr3 (102-585)||(36011757-36012243)
chr3 (185-585)||(6484372-6484773)
chr3 (136-585)||(9604447-9604899)
chr3 (102-586)||(54691416-54691900)
chr3 (102-586)||(51726846-51727333)
chr3 (102-586)||(10958162-10958650)
chr3 (102-586)||(18162594-18163081)
chr3 (136-562)||(38890004-38890437)
chr3 (102-583)||(48361511-48361997)
chr3 (103-586)||(32219026-32219504)
chr3 (176-587)||(1321483-1321899)
chr3 (136-568)||(5191617-5192053)
chr3 (136-586)||(25533406-25533843)
chr3 (102-437)||(11170334-11170669)
chr3 (102-586)||(53591125-53591598)
chr3 (148-586)||(25388882-25389327)
chr3 (136-568)||(10084244-10084682)
chr3 (102-585)||(28761287-28761755)
chr3 (136-478)||(30005805-30006151)
chr3 (102-585)||(15780790-15781293)
chr3 (102-587)||(3859458-3859932)
chr3 (136-585)||(746721-747177)
chr3 (102-421)||(889781-890098)
chr3 (136-437)||(4103888-4104188)
chr3 (106-578)||(27635504-27635950)
chr3 (136-585)||(50493963-50494417)
chr3 (102-366)||(6561740-6562005)
chr3 (102-437)||(22114297-22114632)
chr3 (223-578)||(25688005-25688367)
chr3 (102-437)||(26720478-26720812)
chr3 (136-568)||(10191167-10191602)
chr3 (102-586)||(458210-458703)
chr3 (136-585)||(38210334-38210789)
chr3 (102-586)||(455833-456326)
chr3 (102-586)||(31151277-31151755)
chr3 (136-434)||(10621525-10621823)
chr3 (102-434)||(6065791-6066124)
chr3 (102-586)||(23633390-23633863)
chr3 (193-567)||(4666535-4666911)
chr3 (136-434)||(6063441-6063739)
chr3 (220-586)||(6231849-6232209)
chr3 (162-434)||(28413027-28413299)
chr3 (102-337)||(35777351-35777587)
chr3 (250-585)||(3306839-3307176)
chr3 (121-327)||(28100143-28100349)
chr3 (136-377)||(29956650-29956891)
chr3 (102-332)||(28180954-28181182)
chr3 (102-568)||(5522481-5522942)
chr3 (190-585)||(17795280-17795669)
chr3 (190-585)||(19103720-19104109)
chr3 (134-421)||(35917952-35918244)
chr3 (233-586)||(5886261-5886619)
chr3 (233-585)||(5899734-5900091)
chr3 (194-437)||(7606580-7606822)
chr3 (236-586)||(11168165-11168520)
chr3 (302-579)||(47701526-47701798)
chr3 (136-484)||(42992250-42992586)
chr3 (182-568)||(561639-562021)
chr3 (103-349)||(23636958-23637200)
chr3 (182-363)||(13420252-13420429)
chr3 (104-366)||(54884089-54884348)
chr3 (102-366)||(53597171-53597430)
chr3 (121-320)||(28137415-28137603)
chr3 (182-586)||(25635394-25635789)
chr3 (137-264)||(41849117-41849244)
chr3 (144-586)||(36871148-36871583)
chr3 (356-585)||(41849243-41849470)
chr3 (172-360)||(1673975-1674160)
chr3 (102-225)||(6231379-6231502)
chr3 (410-585)||(28181242-28181417)
chr3 (315-586)||(25634030-25634295)
chr3 (104-240)||(11163082-11163218)
chr3 (102-226)||(47701798-47701922)
chr3 (103-276)||(24177210-24177380)
chr3 (296-457)||(24181504-24181668)
chr3 (389-585)||(53893893-53894097)
chr3 (102-208)||(3306729-3306835)
chr3 (216-312)||(4560401-4560497)
chr3 (418-579)||(880090-880251)
chr3 (204-367)||(14634504-14634665)
chr3 (182-276)||(25633933-25634024)
chr3 (171-290)||(13419883-13419997)
chr3 (1026-1261)||(30534432-30534666)
chr3 (1022-1258)||(51265744-51265984)
chr3 (234-432)||(1620457-1620657)
chr3 (532-586)||(29897526-29897580)
chr3 (464-586)||(11170671-11170789)
chr3 (1053-1210)||(44291025-44291182)
chr3 (211-293)||(31021281-31021362)
chr3 (389-437)||(35919107-35919155)
chr3 (1021-1117)||(44291413-44291509)
chr3 (507-586)||(28412869-28412946)
chr3 (101-154)||(6484314-6484367)
chr3 (510-586)||(10621365-10621439)
chr3 (1003-1107)||(48200367-48200471)
chr3 (531-586)||(22625828-22625882)
chr3 (504-586)||(42992720-42992800)
chr3 (532-586)||(29913804-29913857)
chr3 (216-261)||(7606828-7606873)
chr3 (409-522)||(8183041-8183154)
chr3 (389-438)||(30236251-30236300)
chr3 (510-586)||(6065632-6065706)
chr3 (234-274)||(7768632-7768672)
chr3 (542-585)||(3330178-3330221)
chr3 (531-586)||(6303589-6303643)
chr3 (531-586)||(10099923-10099977)
chr3 (534-585)||(10594883-10594933)
chr3 (102-168)||(1321371-1321437)
chr3 (466-546)||(26720850-26720928)
chr3 (389-438)||(46173483-46173532)
chr3 (1053-1114)||(51265679-51265739)
chr3 (542-586)||(10897294-10897337)
chr3 (510-585)||(22114143-22114215)
chr3 (393-437)||(42992607-42992651)
chr3 (542-585)||(10093923-10093965)
chr3 (542-585)||(10200805-10200847)
chr3 (531-586)||(10612626-10612680)
chr3 (234-311)||(11066652-11066731)
chr3 (1291-1334)||(44291420-44291463)
chr3 (1192-1258)||(50898882-50898948)
chr3 (528-585)||(4103736-4103791)
chr3 (249-287)||(6303310-6303348)
chr3 (249-287)||(10094218-10094256)
chr3 (249-287)||(10100235-10100273)
chr3 (249-287)||(10201098-10201136)
chr3 (389-431)||(16264354-16264396)
chr3 (249-287)||(16462203-16462241)
chr3 (531-585)||(16997156-16997209)
chr3 (249-287)||(22626128-22626166)
chr3 (504-585)||(24181670-24181749)
chr3 (389-431)||(25795785-25795827)
chr3 (249-287)||(27544273-27544311)
chr3 (389-431)||(32143325-32143367)
chr3 (389-431)||(40913419-40913461)
chr3 (389-431)||(44331671-44331713)
chr3 (249-287)||(47883026-47883064)
chr3 (389-431)||(51398940-51398982)
chr3 (507-583)||(1620313-1620386)
chr3 (1003-1104)||(1662257-1662357)
chr3 (127-180)||(4560514-4560567)
chr3 (552-585)||(27544586-27544619)
[»] chr7 (151 HSPs)
chr7 (102-586)||(21678026-21678507)
chr7 (102-586)||(44724539-44725023)
chr7 (102-586)||(443555-444045)
chr7 (102-586)||(13099316-13099805)
chr7 (102-578)||(4295788-4296265)
chr7 (102-586)||(11355218-11355706)
chr7 (102-585)||(21679987-21680472)
chr7 (102-585)||(31434892-31435376)
chr7 (102-585)||(42330846-42331328)
chr7 (102-585)||(27306076-27306558)
chr7 (121-585)||(21591989-21592453)
chr7 (103-586)||(24748555-24749036)
chr7 (136-576)||(9679053-9679495)
chr7 (102-586)||(37411964-37412457)
chr7 (102-559)||(39145856-39146316)
chr7 (102-559)||(21990111-21990570)
chr7 (136-586)||(38393980-38394435)
chr7 (102-586)||(42223116-42223601)
chr7 (102-586)||(9680774-9681266)
chr7 (121-479)||(20137061-20137419)
chr7 (102-585)||(44524-45012)
chr7 (136-585)||(48457647-48458100)
chr7 (136-586)||(18345535-18345990)
chr7 (136-586)||(20297356-20297811)
chr7 (136-586)||(7471820-7472275)
chr7 (102-587)||(40836581-40837071)
chr7 (136-585)||(20626032-20626481)
chr7 (136-585)||(20629923-20630372)
chr7 (136-585)||(20642342-20642791)
chr7 (102-562)||(35589-36055)
chr7 (136-585)||(20299452-20299908)
chr7 (129-586)||(27832487-27832936)
chr7 (136-584)||(28487547-28488000)
chr7 (136-562)||(1849975-1850407)
chr7 (136-586)||(7469863-7470317)
chr7 (136-586)||(28485560-28486014)
chr7 (136-583)||(3035715-3036170)
chr7 (141-585)||(40946327-40946777)
chr7 (102-585)||(25542491-25542976)
chr7 (102-437)||(1049290-1049624)
chr7 (136-437)||(1046919-1047219)
chr7 (136-437)||(3878571-3878872)
chr7 (102-586)||(7188503-7188980)
chr7 (211-568)||(7092069-7092432)
chr7 (121-432)||(24258442-24258757)
chr7 (136-586)||(7351490-7351947)
chr7 (211-586)||(7094300-7094679)
chr7 (129-366)||(25276128-25276365)
chr7 (129-434)||(31155908-31156213)
chr7 (146-585)||(43253358-43253801)
chr7 (136-372)||(11757222-11757460)
chr7 (136-419)||(7349285-7349568)
chr7 (171-478)||(24813450-24813755)
chr7 (102-586)||(24465508-24465976)
chr7 (102-376)||(22828687-22828962)
chr7 (127-335)||(26804554-26804765)
chr7 (103-421)||(24817362-24817677)
chr7 (102-367)||(20091609-20091870)
chr7 (102-366)||(22251611-22251871)
chr7 (248-585)||(1606486-1606827)
chr7 (293-585)||(22393873-22394161)
chr7 (296-598)||(26295601-26295898)
chr7 (220-568)||(38396713-38397071)
chr7 (248-585)||(2935374-2935716)
chr7 (102-260)||(18567573-18567731)
chr7 (411-562)||(22251452-22251605)
chr7 (102-299)||(22392433-22392618)
chr7 (248-435)||(22137184-22137370)
chr7 (394-586)||(26804762-26804956)
chr7 (248-435)||(40552211-40552397)
chr7 (171-473)||(11081540-11081842)
chr7 (1003-1273)||(41331168-41331439)
chr7 (248-586)||(40549933-40550278)
chr7 (248-435)||(22108173-22108359)
chr7 (248-434)||(9027191-9027376)
chr7 (204-434)||(6332283-6332514)
chr7 (389-586)||(11759374-11759576)
chr7 (171-366)||(6048903-6049094)
chr7 (1003-1258)||(18128375-18128632)
chr7 (1021-1114)||(30551947-30552040)
chr7 (1021-1114)||(6589558-6589651)
chr7 (203-290)||(11084438-11084523)
chr7 (1018-1097)||(12422044-12422123)
chr7 (1001-1108)||(32804629-32804736)
chr7 (296-366)||(6348936-6349006)
chr7 (1022-1110)||(1532197-1532285)
chr7 (464-585)||(9027034-9027151)
chr7 (234-290)||(16297166-16297222)
chr7 (1011-1199)||(20389633-20389822)
chr7 (531-586)||(25357324-25357379)
chr7 (1022-1117)||(28003341-28003434)
chr7 (504-586)||(7349116-7349197)
chr7 (142-203)||(38396316-38396377)
chr7 (1172-1258)||(48447315-48447402)
chr7 (1022-1115)||(5755594-5755685)
chr7 (210-290)||(12310157-12310236)
chr7 (1169-1258)||(12264801-12264890)
chr7 (466-585)||(22137411-22137527)
chr7 (466-585)||(40552438-40552554)
chr7 (510-586)||(1046756-1046831)
chr7 (531-587)||(7464363-7464418)
chr7 (1179-1258)||(12422262-12422342)
chr7 (1001-1105)||(12422352-12422455)
chr7 (510-586)||(20136990-20137066)
chr7 (1001-1201)||(21920965-21921164)
chr7 (391-477)||(20091109-20091196)
chr7 (531-586)||(25351630-25351684)
chr7 (531-586)||(25405692-25405746)
chr7 (203-290)||(26210603-26210688)
chr7 (1207-1258)||(28002279-28002330)
chr7 (542-585)||(30247260-30247303)
chr7 (101-219)||(30906264-30906380)
chr7 (531-586)||(44016513-44016568)
chr7 (531-586)||(44512362-44512417)
chr7 (466-586)||(3878911-3879028)
chr7 (389-431)||(12097867-12097909)
chr7 (1036-1101)||(32918529-32918595)
chr7 (237-484)||(40281329-40281572)
chr7 (1053-1114)||(1532441-1532501)
chr7 (233-287)||(2120881-2120937)
chr7 (316-419)||(6046668-6046772)
chr7 (249-290)||(21369642-21369683)
chr7 (510-586)||(1049128-1049203)
chr7 (440-538)||(6349098-6349191)
chr7 (1021-1097)||(6586862-6586938)
chr7 (1212-1252)||(32857850-32857890)
chr7 (136-191)||(7094662-7094717)
chr7 (915-950)||(21595127-21595162)
chr7 (1023-1102)||(48447283-48447362)
chr7 (249-287)||(3320194-3320232)
chr7 (249-287)||(3324942-3324980)
chr7 (249-287)||(7069780-7069818)
chr7 (249-287)||(7074787-7074825)
chr7 (389-431)||(9190059-9190101)
chr7 (1296-1334)||(12422352-12422390)
chr7 (249-287)||(15541139-15541177)
chr7 (512-585)||(24813348-24813419)
chr7 (249-287)||(25351353-25351391)
chr7 (249-287)||(25357047-25357085)
chr7 (249-287)||(25405393-25405431)
chr7 (249-287)||(25410130-25410168)
chr7 (389-431)||(27347943-27347985)
chr7 (389-431)||(36146408-36146450)
chr7 (389-431)||(41317434-41317476)
chr7 (249-287)||(42006663-42006701)
chr7 (389-430)||(4253529-4253570)
chr7 (1059-1116)||(5762696-5762753)
chr7 (182-227)||(6348859-6348903)
chr7 (531-587)||(15540842-15540898)
chr7 (466-549)||(22108401-22108483)
chr7 (393-486)||(25276381-25276474)
[»] chr8 (117 HSPs)
chr8 (102-586)||(14419034-14419520)
chr8 (102-579)||(30480353-30480832)
chr8 (102-577)||(14807757-14808244)
chr8 (102-578)||(27106754-27107226)
chr8 (102-590)||(15072716-15073207)
chr8 (102-585)||(13858334-13858813)
chr8 (102-578)||(36865543-36866023)
chr8 (102-582)||(1225172-1225644)
chr8 (102-585)||(28251410-28251896)
chr8 (128-586)||(15068013-15068473)
chr8 (129-588)||(25952554-25953013)
chr8 (102-585)||(33541255-33541717)
chr8 (102-586)||(41382679-41383155)
chr8 (102-586)||(4424024-4424513)
chr8 (136-586)||(32339349-32339804)
chr8 (136-586)||(3874050-3874488)
chr8 (104-437)||(27911023-27911354)
chr8 (104-437)||(27957442-27957773)
chr8 (102-585)||(27829303-27829790)
chr8 (102-588)||(41384751-41385236)
chr8 (102-586)||(27826992-27827480)
chr8 (136-585)||(15809259-15809711)
chr8 (136-585)||(608774-609230)
chr8 (136-586)||(28283061-28283514)
chr8 (102-585)||(5372025-5372506)
chr8 (136-586)||(22684490-22684951)
chr8 (102-585)||(15185564-15186039)
chr8 (102-586)||(18810714-18811203)
chr8 (102-562)||(44720849-44721315)
chr8 (194-587)||(43530213-43530611)
chr8 (144-434)||(43079650-43079940)
chr8 (102-585)||(21482328-21482798)
chr8 (102-342)||(14477282-14477522)
chr8 (136-434)||(43082013-43082311)
chr8 (186-586)||(15956051-15956444)
chr8 (127-586)||(21480545-21480991)
chr8 (136-434)||(24873178-24873476)
chr8 (102-585)||(18812899-18813376)
chr8 (102-568)||(31162219-31162684)
chr8 (126-585)||(3005486-3005932)
chr8 (128-290)||(5622879-5623041)
chr8 (102-259)||(35872555-35872707)
chr8 (393-586)||(37214108-37214302)
chr8 (102-273)||(26775207-26775378)
chr8 (301-586)||(2467978-2468260)
chr8 (318-586)||(35872300-35872553)
chr8 (219-396)||(181622-181799)
chr8 (231-499)||(31035252-31035522)
chr8 (393-586)||(14477547-14477741)
chr8 (234-478)||(31578234-31578476)
chr8 (194-363)||(31573794-31573961)
chr8 (124-314)||(37214317-37214517)
chr8 (1022-1108)||(2277209-2277295)
chr8 (171-268)||(31035144-31035238)
chr8 (1021-1101)||(27532989-27533069)
chr8 (136-207)||(12517248-12517319)
chr8 (1038-1117)||(37064689-37064768)
chr8 (192-276)||(2468261-2468341)
chr8 (464-585)||(3883436-3883553)
chr8 (102-196)||(3886153-3886247)
chr8 (1003-1105)||(15907689-15907790)
chr8 (1003-1117)||(15907944-15908058)
chr8 (1021-1273)||(2510015-2510263)
chr8 (529-585)||(183255-183310)
chr8 (415-518)||(181798-181901)
chr8 (1003-1085)||(12807666-12807748)
chr8 (1143-1273)||(3806871-3807000)
chr8 (504-585)||(24873039-24873119)
chr8 (102-191)||(181543-181632)
chr8 (1288-1333)||(18080600-18080645)
chr8 (454-587)||(27911439-27911569)
chr8 (454-587)||(27957858-27957988)
chr8 (464-567)||(43082350-43082450)
chr8 (249-334)||(13985176-13985262)
chr8 (531-585)||(25684919-25684972)
chr8 (534-586)||(4823550-4823600)
chr8 (389-438)||(10930192-10930241)
chr8 (537-586)||(17799277-17799325)
chr8 (389-475)||(31566514-31566600)
chr8 (1018-1114)||(32566875-32566969)
chr8 (249-293)||(2267161-2267205)
chr8 (1020-1108)||(2967707-2967794)
chr8 (1022-1117)||(3806998-3807091)
chr8 (531-586)||(28895780-28895833)
chr8 (531-582)||(4812336-4812386)
chr8 (101-144)||(14419784-14419827)
chr8 (234-353)||(17847661-17847782)
chr8 (234-276)||(33839077-33839120)
chr8 (504-567)||(43080017-43080079)
chr8 (389-431)||(1345371-1345413)
chr8 (249-287)||(9021251-9021289)
chr8 (1126-1258)||(12189869-12190002)
chr8 (1126-1258)||(12434297-12434430)
chr8 (389-431)||(15212912-15212954)
chr8 (249-287)||(16752666-16752704)
chr8 (249-287)||(16757411-16757449)
chr8 (249-287)||(17799568-17799606)
chr8 (389-431)||(19175805-19175847)
chr8 (389-431)||(19752445-19752487)
chr8 (531-585)||(26268084-26268138)
chr8 (389-431)||(27811404-27811446)
chr8 (249-287)||(28327908-28327946)
chr8 (249-287)||(28332631-28332669)
chr8 (552-586)||(28891062-28891096)
chr8 (249-287)||(28895502-28895540)
chr8 (249-311)||(30423212-30423274)
chr8 (389-431)||(33352276-33352318)
chr8 (389-431)||(40321206-40321248)
chr8 (1038-1108)||(45445141-45445210)
chr8 (999-1091)||(41123-41216)
chr8 (552-585)||(591093-591126)
chr8 (389-430)||(4733832-4733873)
chr8 (1208-1272)||(8453098-8453163)
chr8 (234-290)||(13985954-13986011)
chr8 (552-585)||(29554705-29554738)
chr8 (1050-1095)||(32566724-32566769)
chr8 (136-177)||(43530168-43530209)
[»] chr6 (122 HSPs)
chr6 (102-585)||(3629711-3630193)
chr6 (102-586)||(3631783-3632267)
chr6 (102-586)||(11982871-11983358)
chr6 (102-585)||(13057179-13057659)
chr6 (102-585)||(9019911-9020398)
chr6 (102-586)||(24338294-24338777)
chr6 (102-567)||(30728686-30729157)
chr6 (102-585)||(32279982-32280463)
chr6 (102-586)||(28241162-28241650)
chr6 (102-437)||(3390364-3390700)
chr6 (102-478)||(13039739-13040117)
chr6 (102-562)||(14507039-14507504)
chr6 (103-587)||(14458605-14459093)
chr6 (102-585)||(3233567-3234059)
chr6 (105-437)||(25477262-25477602)
chr6 (102-567)||(1230106-1230578)
chr6 (136-567)||(4816088-4816526)
chr6 (102-586)||(15540989-15541469)
chr6 (136-567)||(20915214-20915651)
chr6 (136-568)||(30967220-30967658)
chr6 (105-486)||(12161501-12161880)
chr6 (136-585)||(19704403-19704864)
chr6 (102-437)||(15532676-15533010)
chr6 (136-586)||(2628726-2629179)
chr6 (136-586)||(26065005-26065458)
chr6 (136-586)||(26084974-26085427)
chr6 (102-377)||(15530177-15530451)
chr6 (237-585)||(1069563-1069913)
chr6 (183-587)||(15367101-15367500)
chr6 (136-437)||(30034597-30034898)
chr6 (102-431)||(12195515-12195844)
chr6 (194-581)||(14466399-14466787)
chr6 (104-366)||(22490626-22490889)
chr6 (136-434)||(26932559-26932857)
chr6 (305-587)||(15346535-15346815)
chr6 (102-585)||(3027703-3028179)
chr6 (128-478)||(15719665-15720005)
chr6 (102-586)||(17012029-17012503)
chr6 (216-585)||(5273055-5273431)
chr6 (102-325)||(19227514-19227737)
chr6 (248-585)||(33311257-33311598)
chr6 (248-585)||(29754549-29754892)
chr6 (248-585)||(26065961-26066307)
chr6 (248-586)||(33308988-33309330)
chr6 (182-434)||(16455421-16455672)
chr6 (248-586)||(26068234-26068578)
chr6 (233-499)||(12186003-12186271)
chr6 (102-244)||(32447502-32447645)
chr6 (232-567)||(26945258-26945593)
chr6 (129-478)||(19696453-19696803)
chr6 (1016-1258)||(16419591-16419837)
chr6 (103-245)||(13870608-13870749)
chr6 (102-241)||(1072067-1072206)
chr6 (443-586)||(3394695-3394838)
chr6 (203-478)||(22857906-22858181)
chr6 (102-225)||(17852527-17852650)
chr6 (102-262)||(15346376-15346524)
chr6 (312-586)||(25465443-25465710)
chr6 (349-467)||(10584227-10584348)
chr6 (128-474)||(25078514-25078856)
chr6 (102-209)||(10584111-10584213)
chr6 (102-208)||(8995464-8995570)
chr6 (529-586)||(10584357-10584414)
chr6 (425-585)||(15530003-15530167)
chr6 (194-366)||(20526885-20527054)
chr6 (1130-1257)||(196111-196238)
chr6 (1003-1114)||(12458392-12458504)
chr6 (235-434)||(28037722-28037927)
chr6 (504-586)||(26932402-26932482)
chr6 (1022-1160)||(33547750-33547889)
chr6 (1125-1273)||(17411121-17411270)
chr6 (510-586)||(8717194-8717268)
chr6 (234-362)||(7542452-7542581)
chr6 (419-583)||(22490917-22491077)
chr6 (504-585)||(18322487-18322566)
chr6 (1131-1255)||(28477384-28477509)
chr6 (1131-1255)||(29789836-29789961)
chr6 (510-585)||(12195354-12195427)
chr6 (531-586)||(17694700-17694754)
chr6 (1084-1273)||(7004200-7004390)
chr6 (531-585)||(13883752-13883806)
chr6 (1291-1333)||(17411089-17411131)
chr6 (1021-1117)||(10544282-10544376)
chr6 (1143-1239)||(32548138-32548235)
chr6 (1053-1109)||(7202300-7202356)
chr6 (234-289)||(11138423-11138479)
chr6 (316-407)||(30445723-30445815)
chr6 (1169-1252)||(33547849-33547933)
chr6 (531-586)||(26887076-26887130)
chr6 (531-585)||(3577338-3577391)
chr6 (1125-1230)||(7202313-7202419)
chr6 (1177-1250)||(10544136-10544210)
chr6 (531-585)||(25465754-25465807)
chr6 (456-586)||(25480219-25480347)
chr6 (316-567)||(28078064-28078310)
chr6 (531-585)||(31248544-31248597)
chr6 (1131-1231)||(29693282-29693383)
chr6 (1020-1117)||(31314513-31314609)
chr6 (542-586)||(19701756-19701800)
chr6 (542-586)||(25941958-25942001)
chr6 (531-587)||(35201155-35201210)
chr6 (1291-1334)||(196244-196287)
chr6 (1148-1242)||(9405267-9405362)
chr6 (249-287)||(3577658-3577696)
chr6 (170-227)||(4595048-4595102)
chr6 (531-585)||(13040179-13040232)
chr6 (249-287)||(13878727-13878765)
chr6 (249-287)||(13883475-13883513)
chr6 (119-153)||(15367045-15367079)
chr6 (531-585)||(16455280-16455333)
chr6 (249-287)||(16785919-16785957)
chr6 (249-287)||(26887368-26887406)
chr6 (389-431)||(26954286-26954328)
chr6 (249-287)||(31248858-31248896)
chr6 (389-431)||(31936591-31936633)
chr6 (389-431)||(33211185-33211227)
chr6 (249-287)||(35201470-35201508)
chr6 (1022-1095)||(196063-196135)
chr6 (504-568)||(6610377-6610439)
chr6 (205-276)||(6843217-6843287)
chr6 (203-263)||(30445602-30445661)
chr6 (1076-1117)||(33547744-33547785)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (136-586)||(14230-14677)
scaffold0131 (102-478)||(14978-15352)
scaffold0131 (531-585)||(17771-17824)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (102-585)||(38928024-38928507)
chr4 (102-586)||(22802576-22803063)
chr4 (102-587)||(40091257-40091744)
chr4 (102-578)||(12395697-12396174)
chr4 (104-586)||(36921337-36921822)
chr4 (102-578)||(12400659-12401136)
chr4 (102-585)||(40637078-40637566)
chr4 (121-585)||(33415334-33415797)
chr4 (102-579)||(48486323-48486803)
chr4 (102-579)||(36919435-36919916)
chr4 (102-585)||(22800705-22801191)
chr4 (102-585)||(24888800-24889286)
chr4 (136-585)||(14787274-14787726)
chr4 (102-585)||(24878993-24879471)
chr4 (101-586)||(16453312-16453797)
chr4 (102-585)||(24880455-24880935)
chr4 (102-585)||(47274731-47275212)
chr4 (102-586)||(36378296-36378778)
chr4 (102-579)||(14633324-14633804)
chr4 (102-478)||(19095886-19096268)
chr4 (136-585)||(37089212-37089666)
chr4 (136-586)||(8631259-8631714)
chr4 (136-586)||(22046525-22046980)
chr4 (127-585)||(37312924-37313370)
chr4 (102-585)||(5198424-5198895)
chr4 (102-586)||(51015250-51015739)
chr4 (102-576)||(11434959-11435438)
chr4 (136-586)||(24348256-24348693)
chr4 (136-585)||(9148291-9148727)
chr4 (102-478)||(619400-619776)
chr4 (102-561)||(22044255-22044719)
chr4 (240-585)||(2891433-2891780)
chr4 (136-586)||(11006093-11006532)
chr4 (136-586)||(11008407-11008861)
chr4 (182-585)||(27499129-27499536)
chr4 (102-585)||(2484715-2485202)
chr4 (102-585)||(6764843-6765335)
chr4 (136-585)||(38409243-38409696)
chr4 (102-586)||(47868405-47868895)
chr4 (102-586)||(41997496-41997976)
chr4 (136-568)||(17662107-17662529)
chr4 (129-586)||(44599679-44600140)
chr4 (212-585)||(16455355-16455714)
chr4 (129-586)||(16931630-16932091)
chr4 (102-585)||(19322701-19323177)
chr4 (136-585)||(7941359-7941814)
chr4 (102-568)||(9176330-9176803)
chr4 (136-585)||(31849440-31849894)
chr4 (102-586)||(9173986-9174475)
chr4 (129-567)||(18847184-18847627)
chr4 (174-585)||(36380425-36380834)
chr4 (136-585)||(18709003-18709458)
chr4 (102-427)||(56030448-56030770)
chr4 (136-411)||(13543997-13544272)
chr4 (102-586)||(16933987-16934472)
chr4 (171-585)||(26085818-26086236)
chr4 (102-586)||(18409191-18409675)
chr4 (102-586)||(18537324-18537800)
chr4 (136-372)||(5637524-5637760)
chr4 (246-586)||(13547302-13547644)
chr4 (122-562)||(18534704-18535138)
chr4 (136-434)||(22132389-22132684)
chr4 (136-433)||(22780371-22780668)
chr4 (136-433)||(22782736-22783033)
chr4 (136-372)||(3824629-3824863)
chr4 (302-586)||(4215510-4215793)
chr4 (136-434)||(22134615-22134909)
chr4 (346-585)||(47563009-47563248)
chr4 (182-586)||(38890071-38890472)
chr4 (102-586)||(8756102-8756579)
chr4 (102-326)||(3937314-3937537)
chr4 (136-421)||(47210762-47211035)
chr4 (102-353)||(52942537-52942776)
chr4 (136-586)||(53405169-53405627)
chr4 (102-316)||(6132877-6133090)
chr4 (296-585)||(5635318-5635611)
chr4 (302-586)||(5101133-5101405)
chr4 (186-486)||(30136640-30136939)
chr4 (102-259)||(38270158-38270315)
chr4 (389-586)||(14789272-14789470)
chr4 (102-259)||(24446756-24446908)
chr4 (233-585)||(12102221-12102566)
chr4 (366-584)||(6133105-6133326)
chr4 (296-587)||(11437561-11437857)
chr4 (102-568)||(15032409-15032865)
chr4 (318-586)||(24446501-24446754)
chr4 (195-585)||(28453782-28454167)
chr4 (1393-1581)||(16840857-16841060)
chr4 (102-234)||(5101001-5101133)
chr4 (192-459)||(47150863-47151131)
chr4 (320-586)||(49088791-49089045)
chr4 (628-791)||(16840376-16840535)
chr4 (807-980)||(16840622-16840796)
chr4 (102-208)||(2891320-2891427)
chr4 (589-704)||(16840263-16840378)
chr4 (234-583)||(25357772-25358122)
chr4 (1142-1273)||(22519386-22519518)
chr4 (392-578)||(52942336-52942527)
chr4 (388-586)||(3937125-3937317)
chr4 (103-310)||(10112876-10113080)
chr4 (182-478)||(9863795-9864092)
chr4 (171-364)||(40999017-40999208)
chr4 (203-431)||(3982175-3982411)
chr4 (1022-1273)||(31095124-31095377)
chr4 (411-585)||(3824447-3824630)
chr4 (1003-1117)||(22519807-22519921)
chr4 (249-478)||(16185787-16186018)
chr4 (1022-1111)||(48194394-48194483)
chr4 (233-366)||(31983593-31983727)
chr4 (204-290)||(10114435-10114519)
chr4 (464-562)||(47210659-47210754)
chr4 (1143-1273)||(49291205-49291335)
chr4 (1003-1095)||(33617920-33618010)
chr4 (471-562)||(22134479-22134567)
chr4 (456-585)||(56030820-56030945)
chr4 (471-562)||(22132251-22132340)
chr4 (530-586)||(18311214-18311270)
chr4 (531-586)||(4558585-4558640)
chr4 (531-586)||(11853843-11853898)
chr4 (531-586)||(15312595-15312650)
chr4 (507-586)||(38269994-38270071)
chr4 (504-585)||(5664643-5664722)
chr4 (531-585)||(16489628-16489681)
chr4 (1022-1258)||(20141745-20141983)
chr4 (510-586)||(22780211-22780285)
chr4 (1022-1110)||(22889586-22889674)
chr4 (1022-1110)||(22941250-22941338)
chr4 (1293-1333)||(31095092-31095132)
chr4 (203-290)||(38208825-38208911)
chr4 (531-586)||(8529547-8529601)
chr4 (171-290)||(9022380-9022495)
chr4 (542-585)||(15317247-15317290)
chr4 (531-586)||(16688793-16688847)
chr4 (531-586)||(18587245-18587299)
chr4 (1022-1097)||(53769786-53769861)
chr4 (1001-1107)||(2323266-2323372)
chr4 (531-585)||(15831425-15831478)
chr4 (1016-1090)||(42676809-42676883)
chr4 (1208-1273)||(51580077-51580140)
chr4 (531-592)||(55822538-55822598)
chr4 (389-459)||(10114608-10114680)
chr4 (1024-1107)||(34013780-34013861)
chr4 (542-586)||(47566778-47566822)
chr4 (504-586)||(10113273-10113352)
chr4 (1027-1102)||(22519373-22519448)
chr4 (1021-1116)||(34717567-34717660)
chr4 (1066-1117)||(40070309-40070360)
chr4 (512-586)||(619297-619370)
chr4 (389-431)||(5143263-5143305)
chr4 (389-431)||(5269242-5269284)
chr4 (249-311)||(5336903-5336964)
chr4 (249-287)||(7050401-7050439)
chr4 (249-287)||(11853549-11853587)
chr4 (389-431)||(12739550-12739592)
chr4 (505-586)||(22782576-22782656)
chr4 (389-431)||(26175636-26175678)
chr4 (1053-1107)||(31095078-31095131)
chr4 (389-431)||(36463389-36463431)
chr4 (389-431)||(48893638-48893680)
chr4 (1216-1258)||(53769786-53769828)
chr4 (249-287)||(55822265-55822303)
chr4 (389-499)||(22295456-22295565)
chr4 (1076-1117)||(22519313-22519354)
chr4 (1053-1114)||(48194179-48194239)
chr4 (234-290)||(54906722-54906779)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (136-585)||(52004-52456)
scaffold0005 (102-579)||(183488-183968)
scaffold0005 (389-586)||(50260-50458)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (102-585)||(79144-79631)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (121-586)||(79837-80306)
scaffold0004 (249-287)||(188386-188424)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (102-585)||(3956-4437)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (102-586)||(41324-41812)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (136-585)||(69133-69586)
scaffold0025 (136-247)||(73207-73318)
scaffold0025 (215-258)||(73160-73203)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (102-584)||(11315-11802)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (102-579)||(85190-85667)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (102-586)||(6158-6647)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (136-585)||(29164-29616)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (136-585)||(34-473)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (102-432)||(2839-3168)
scaffold0250 (504-582)||(3248-3322)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (212-567)||(1310-1671)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (105-586)||(1492-1958)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (102-478)||(15774-16147)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (137-374)||(2036-2272)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (103-559)||(16525-16975)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (102-323)||(35599-35819)
scaffold0011 (397-579)||(35848-36033)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (102-483)||(4773-5148)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (248-586)||(24496-24840)
scaffold0140 (248-435)||(22221-22407)
scaffold0140 (510-586)||(22491-22565)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (102-264)||(993-1160)
[»] scaffold0591 (1 HSPs)
scaffold0591 (1001-1139)||(3866-4003)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (464-583)||(1294-1409)
scaffold1674 (397-437)||(1445-1485)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (504-586)||(12714-12794)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (389-435)||(4675-4721)
scaffold0891 (464-567)||(4535-4635)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (531-586)||(2918-2972)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (542-586)||(16884-16927)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (531-585)||(231393-231445)
scaffold0006 (249-287)||(224819-224857)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (389-431)||(20415-20457)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 1316; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 1316; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 1585
Target Start/End: Complemental strand, 37706110 - 37704626
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37706110 gctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactt 37706011  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706010 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 37705911  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  37705910 atagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagac 37705811  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37705810 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttttaattattcca 37705711  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagtttgattaaaaca 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705710 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagtttgattaaaaca 37705611  T
Q  601 acggaaaataacccaagattacttcggtaagacgaaagtgatctcttacagcttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaagaatgcaataatg 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705610 acggaaaataacccaagattacttcggtaagacgaaagtgatctcttacaacttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaagaatgcaataatg 37705511  T
Q  701 ttaaatatcatgggggagaatgtaatttgttttgtagcttgcactgaacaaacatcaatcaagtcacccacttagtcgtaaatataagaaatgtggtcca 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705510 ttaaatatcatgggggagaatgtaatttgttttgtagcttgcactgaacaaacatcaatcaagtcacccacttagtcgtaaatataagaaatgtggtcca 37705411  T
Q  801 tgatgaaccaattataaaggtggtctaccgtagaactcacgagtagagtatcgatatccgatgacatctgatactttttctttttatatgctcaatgcat 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705410 tgatgaaccaattataaaggtggtctaccgtagaacccacgagttgagtatcgatatccgatggcatctgatactttttctttttatatgctcaatgcat 37705311  T
Q  901 tttcttttgtgctgtaacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaatttttgtagtttagttaagaaccatacaaaaaacacgtacataaaataaat 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705310 tttcttttgtgctgtaacaaactttgaagaaattataaatttaaagaaatttttgtagtttagttaagaaccatacaaaaaacacgtacataaaataaat 37705211  T
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705210 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattggtcatttaagatttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 37705111  T
Q  1101 acaagttggtcctttaannnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattc 1200  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705110 acaagttggtcctttaatttttttcgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaacaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattc 37705011  T
Q  1201 gggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgttttttgagcaactacataactaacttgt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705010 gggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttacgaaaaatacttacataactaacttgttttttgagcaactacataactaacttgt 37704911  T
Q  1301 tataattaaataacttaaatgacgtaagtgatacgnnnnnnnnnnnnnnnnccgatttgttataattaaataacttaaaagtatcgtaatttgctcttta 1400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37704910 tataattaaataacttaaatgacgcaagtgatacgaaaaaatcttaaaaaaccgatttgttataattaaataacttaaaagtctcgtaatttgctcttta 37704811  T
Q  1401 aagtatgtacatttgaagaagtctaagtctccgattctaaatacaattaatgttattttcttcatttcaggtgtatttttaagcacattactcactgtga 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704810 aagtatgtacatttgaagaagtctaagtctccgattctaaatacaattaatgttattttcttcatttcaggtgtatttttaagcacattactcactgtga 37704711  T
Q  1501 ttgctacttaaatgaatttgttatcttatcacaacttgaaataagattccaactttcgtgctaattacgttcaaaaagtctggtc 1585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704710 ttgctacttaaatgaatttgttatcttatcacaacttgaaataagattccaactttcgtgctaattacgttcaaaaagtctggtc 37704626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Original strand, 25904053 - 25904538
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25904053 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagttt 25904152  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||      
T  25904153 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgag 25904252  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  25904253 tataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccagact 25904352  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  25904353 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggtttgtgtttataattgttcc 25904452  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
     || ||||||||||  |||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904453 atacactttgttttcattgcttgactatcccttgcaccacacatcaaatttatta-tggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaag 25904538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10474652 - 10474168
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474652 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 10474553  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  ||||      
T  10474552 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgag 10474453  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||    
T  10474452 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatact 10474353  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  10474352 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctaatttctacttttcgcttgtgtttataattgttcc 10474253  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||| |||||||    
T  10474252 atacactttgttttggttacttgattattccttgctccacacatcaagtttattattgatgtaatttt-tcatcgaatacacaaca 10474168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 103 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818338
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||  | | |  || ||||||||| ||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggc--ttctctcccccaaacta 17818521  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt--tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  17818520 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctcttttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttc 17818421  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 581  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818420 catacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 17818338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18511507 - 18511055
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511507 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 18511408  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18511407 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccg 18511308  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511307 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 18511208  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| || | || |||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  18511207 ttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctactttttgcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttagttgcttgactatccctt 18511108  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  18511107 gctccacacatcaagtttgttattgatgt-gatttatcatcgaattcgcaacaa 18511055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 102 - 588
Target Start/End: Original strand, 24126806 - 24127294
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24126806 ctataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24126905  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  24126906 gtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 24127005  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  24127006 tagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 24127105  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || |    
T  24127106 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctctcgttgttttctacttttgacttatgtttataattgtttc 24127205  T
Q  500 ttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 588  Q
     || |||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24127206 atacactttgttttttgttgtctgattatcccttgctccacacattaagtttgttatttgtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaagt 24127294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 40221472 - 40221964
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40221472 ctataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 40221571  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| |     
T  40221572 gtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttgg 40221671  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  40221672 tagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 40221771  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctt------tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| | ||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40221772 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttcctttctctctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataa 40221871  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  40221872 ttgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcaaatttacaacaa 40221964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 17072833 - 17073322
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17072833 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 17072932  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||    
T  17072933 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcga 17073032  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  17073033 tagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagac 17073132  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||  ||| |||||   || ||||||||||||||| ||||||| | |||||     
T  17073133 tcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctctttatttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgtttataattg 17073232  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| || |||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  17073233 ttccatacactttgttttagttgcttgatcatcacttgctccacacatcaaatttattattggtgt-attttcggatcgaattcacaacaa 17073322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Original strand, 21947977 - 21948462
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21947977 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 21948075  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  |||||     
T  21948076 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttggg 21948175  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  21948176 tggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 21948275  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt------tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21948276 aggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctccctctctctcgctattttctacttttggcttgtgtttataat 21948375  T
Q  494 tattccttatactt--tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    | |||| || ||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948376 tgttccatacactttattttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattc 21948462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092045
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || | ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaatt 16092196  T
Q  435 c--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| | ||    
T  16092195 cttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgcgtttacaattgttccatatactttg-tttggttgcttgactatccatt 16092097  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16092096 gctccacatatcaagtttgttattggtg-cgttttctcatcgaattcacaaca 16092045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1189943 - 1189454
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 196  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1189943 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatag 1189844  T
Q  197 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |  |    
T  1189843 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagact 1189744  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc-c 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |  || | ||||| |    
T  1189743 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctc 1189644  T
Q  395 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||    
T  1189643 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgcagttttctacttttggcttgtgtttataa 1189544  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  1189543 ttgttccatacattttgttttggtggcttgattattccttgctccacacatcaagtttgatattggtgtg---ttttcatcgaattcacaaca 1189454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 39854434 - 39854921
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39854434 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 39854532  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||     
T  39854533 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttggg 39854632  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  39854633 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 39854732  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||   || |||||| |||||||||||||||| | ||||| |    
T  39854733 agatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctcgctgttgttttttacttttggcttgtgtttataattgt 39854832  T
Q  497 tccttatacttt-gttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  39854833 tccatacactttatttttggttgcttaactatcccttgctccacatatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 39854921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10529428 - 10528937
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10529428 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagttt 10529329  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  10529328 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 10529229  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||||    
T  10529228 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagact 10529129  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc---ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattt 490  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  10529128 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattt 10529032  T
Q  491 aattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||| || |||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10529031 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgcttcacacatcaag-ttgttattggtgtgattttctcatcgaattcacaaca 10528937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 2818665 - 2818193
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2818665 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagttt 2818566  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  |||||    
T  2818565 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgg 2818466  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  2818465 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagac 2818366  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  2818365 taggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 2818266  T
Q  497 tccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||| || |||||| |||||| ||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2818265 tccatacactttgattttggatgcctgattatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgtttttc 2818193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 102 - 546
Target Start/End: Original strand, 26097683 - 26098127
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26097683 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagttt 26097782  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |   | ||  |||||     
T  26097783 gtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttggg 26097881  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||| | ||||| |||||||    
T  26097882 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaac-agaggctgctctctcctccagact 26097980  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  26097981 aggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctatctcgctgttttctacttttggctagtgtttataattgttcc 26098080  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaa 546  Q
     || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  26098081 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaa 26098127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 128 - 584
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756926
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6756470 taaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 6756569  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756570 tgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 6756669  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 426  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  6756670 gtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaacg-agggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtc 6756766  T
Q  427 aacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
    |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||||||||||| |||| || |    
T  6756767 aacaaaatcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttgattgcctgat 6756866  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaag-tttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6756867 tatcacttgctccacacatcaagttttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaac 6756926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 174 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658204
Alignment:
Q  174 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  274 ggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtga 373  Q
    ||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  374 aacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttct 471  Q
    |||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc--ttttctcttgctgttttct 658316  T
Q  472 acttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctca 571  Q
    ||||||||||| ||| | | ||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  658315 acttttggcttatgtttattattgttccgtacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgattt--tca 658218  T
Q  572 tcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| |||||    
T  658217 tcgaattcgcaaca 658204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36402657 - 36402169
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||  || || ||||||||||||||||||||    
T  36402657 ctataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagttt 36402558  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |   |||||     
T  36402557 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttggg 36402458  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||    
T  36402457 taaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagact 36402358  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||    
T  36402357 aggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttagcttgtgtttataattgtt 36402258  T
Q  498 ccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |  || |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  36402257 ctatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 36402169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804464
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 25804307  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| | ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  25804308 ttttgtgttcttgtcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 25804404  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||    
T  25804405 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaatacgcaacaa 25804464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31466307 - 31465832
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31466307 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagttt 31466208  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  31466207 gtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttggg 31466108  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||          | ||| | || ||||||||||    
T  31466107 tagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag----------ggctgctctcacccccagact 31466019  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  31466018 agttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 31465919  T
Q  500 ttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  31465918 atacactttgattttggttgcttaattattccttgttccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt-tcatcaaattcgcaacaa 31465832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745508
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6745351  T
Q  436 tt--gcgttctctc-ttcctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtttt---ggttgcttggttatt 528  Q
    ||  | |||||||  ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||   || ||||||  |||     
T  6745352 ttttgtgttctcttattcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttttggctgcttgactatc 6745451  T
Q  529 ccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6745452 tcttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaa 6745508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18509648 - 18509201
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| | || |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18509648 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18509549  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||    
T  18509548 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgg 18509449  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||| ||||    
T  18509448 gtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagac 18509349  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  18509348 taggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 18509249  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatca 545  Q
     | || ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||    
T  18509248 tcatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatca 18509201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25921802 - 25921314
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25921802 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 25921703  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  | |||     
T  25921702 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctggg 25921603  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| | |||||||||||||    
T  25921602 tagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagact 25921503  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25921502 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 25921406  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||    
T  25921405 attgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg--attctcaacgaattcaaaacaa 25921314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 585
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954849
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  204 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||| |    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || | |  || | ||||||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtg-tatttaattattcc 499  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgttacataattgttcc 2954764  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || |||||||||||||||  || ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2954765 atacactttgttttggttgtctgattatcacttactccacacatcaaatttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcagaaca 2954849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12556252 - 12555757
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12556252 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 12556153  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||     
T  12556152 gtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattggagttttgg- 12556054  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||| || || |||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  12556053 tagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatac 12555954  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc----------tctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtat 488  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||          ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  12555953 tagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttctcttctcttcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgatt 12555854  T
Q  489 ttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaac 584  Q
     ||||| || | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12555853 ataattgtttcatacactttattttggttgcttgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgagttttctcatcgaattcacaac 12555757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 588
Target Start/End: Original strand, 18596597 - 18597082
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18596597 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaagac--aacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18596694  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||      
T  18596695 gtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 18596794  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||| ||||||    
T  18596795 tagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagac 18596894  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttct-ctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  18596895 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttcgactcttcttttctctc--gctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtt 18596992  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 588  Q
    || || ||||| |||||| ||  || ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  18596993 ccatacactttattttggatgtctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaatttgcaacaagt 18597082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 129 - 567
Target Start/End: Original strand, 16776135 - 16776577
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16776135 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggttt 16776234  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16776235 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 16776334  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 428  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  16776335 taa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaa 16776433  T
Q  429 caaattc--ttgcgttctctct-tcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttg 522  Q
    |||||||  ||| |||||| || | |||| |||||   || ||||||||||||||||||||| | | ||||| || | || ||||||||||| |||| ||    
T  16776434 caaattcttttgtgttctcgctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtat-tataattgtttcatacactttgttttgattgcctg 16776532  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16776533 attattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 16776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 2174903 - 2175341
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2174903 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 2175002  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175003 gattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 2175102  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2175103 ttgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 2175201  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2175202 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 2175291  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  2175292 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgacttttttgatcgaattcacaaca 2175341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747744
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||| | || | | ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6747489 ttgat-ttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6747587  T
Q  436 --ttgcgttctc-tcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg---ttttggttgcttggttatt 528  Q
      ||| |||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||   ||||||||||||| ||||     
T  6747588 ttttgtgttctcttcttcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtgtttttggttgcttgattatc 6747687  T
Q  529 ccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  6747688 tcttgctctacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatccaattcgcaacaa 6747744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 18466668 - 18467124
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18466668 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 18466767  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466768 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18466867  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18466868 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 18466967  T
Q  436 ttgcgtt---ctctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    ||  |||    ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  18466968 ttttgttttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacactttgttttgattgcttgatt 18467064  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18467065 atcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 18467124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 38882055 - 38882525
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882055 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 38882154  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||    
T  38882155 tgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 38882254  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||| ||||||    
T  38882255 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagac 38882353  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  38882354 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttcca 38882443  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  38882444 tacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 38882525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 214 - 586
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724329
Alignment:
Q  214 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  314 ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgg 413  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  414 accgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtt 511  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctttcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtt 2724254  T
Q  512 ttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  2724255 ttggttgcttgattatcccttgctatacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcaaattcgcaacaa 2724329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 695839 - 696310
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||           
T  695839 ctatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat------- 695931  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
        ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  695932 ----ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 696026  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  696027 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 696126  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||   || |||||||||||||| | |||||| | ||| | |||    
T  696127 aaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttctttctc---tgttgttttctactttt-gtttgtgtttataactgttc 696222  T
Q  499 cttatactttgttttgg-ttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || ||||| |||||| || |||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  696223 catacactttattttggttttcttgattatctcttgctccacacatcaagtctgttattggtatgattttctcatcgaattcacaaca 696310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 583
Target Start/End: Original strand, 27912520 - 27912973
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||    
T  27912520 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggtt 27912619  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912620 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27912719  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||  |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27912720 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27912819  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   |||||||||||||| |||  ||||||||    |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  27912820 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttagct--tgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 27912916  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  27912917 atcccttactccacacatcaagtttgttattggtg-ggatttttcatcgaattcacaa 27912973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 31472942 - 31472606
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31472942 ctataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 31472843  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| |     
T  31472842 gtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttgg 31472743  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  || | ||||||||| ||    
T  31472742 tagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatac 31472643  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472642 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 31472606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 18468995 - 18469448
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||   |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctg--ctctctcccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattc 18469292  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      |||||||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  18469293 ttttgcgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 18469389  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  18469390 atcccttgctccacacatcaagtttgttattggtatgatttt-tcatcgaattcacaaca 18469448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 103 - 579
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289187
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtt------tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    |||||| | ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||| |    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttttgttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttattattct 21289105  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  21289106 tccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgatattggtgtgatttt-tcatcgaattc 21289187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 4236579 - 4237065
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4236579 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 4236678  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  4236679 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 4236778  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| |||    
T  4236779 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaact 4236878  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||  ||    ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4236879 aggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcaccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 4236975  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  4236976 ttgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcaacgaattcacaaca 4237065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31179700 - 31179213
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31179700 ctataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 31179601  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  31179600 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 31179501  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  31179500 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 31179402  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctgtt----ttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||| |    |||| ||| || |||    ||||||||||||||||||  ||||    
T  31179401 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttcttctacttttggcttgtg--ttta 31179305  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31179304 attattccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccatacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 31179213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34476893
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T
Q  434 --tcttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
      ||||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  34477050 tctcttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttg 34476954  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  34476953 attatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 34476893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 219 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585579
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  319 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 418  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  419 actaggtcaacaaattc--ttgcgttctc---------tcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactt 507  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||         ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctgttctatcttcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactt 41585657  T
Q  508 tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41585656 tgttttggttgcttgattatctcttgccccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 41585579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 230 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505686
Alignment:
Q  230 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  330 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  430 aaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg---ttttggttgcttggt 524  Q
    ||||||  ||| ||||||||||  ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||   |||||||||| || |    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctcttattttctctc--gttgttttctagttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttttggttgcctgat 20505747  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20505746 tattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaattcacaacaa 20505686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39398321 - 39397987
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39398321 ctataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 39398223  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |   |||||    
T  39398222 gtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgg 39398124  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  || ||||||| ||||| ||| ||| | |||||| |||||    
T  39398123 gtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagac 39398024  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39398023 taggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattctt 39397987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684294
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684546 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 21684448  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct-------ttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||  |       |||||||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  21684447 gtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctctc-cgttgttttctacttttggct--tttatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgatt 21684351  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  21684350 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 21684294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479274
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T
Q  434 tc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    ||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  || |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  34479415 tcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgcatttaattgttccatacactttgattttggttgcttg 34479319  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  34479318 attatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 34479274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 27910435 - 27910873
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27910733  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | |||||| ||||||| |||  ||||||||    |||| || ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  27910734 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttatacttttagct--tgtatttataacttccatacactttattttggttgattgattatcccttgct 27910823  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27910824 ccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 27910873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 105 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34530992 - 34530731
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtc 204  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34530992 taaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 34530893  T
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||    
T  34530892 tcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtag 34530793  T
Q  305 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34530792 aattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Original strand, 31545030 - 31545362
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31545030 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 31545129  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||    
T  31545130 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgg 31545229  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  31545230 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 31545328  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31545329 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Original strand, 31542685 - 31543016
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31542685 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 31542784  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  31542785 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 31542884  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  31542885 gtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 31542982  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31542983 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6661511 - 6661038
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||   |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  6661511 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagttt 6661413  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  | ||||||     
T  6661412 gt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttggg 6661316  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||    
T  6661315 tacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagac 6661216  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | |||   |||    
T  6661215 taggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct-ttcttttctctc--gttgttttctactttt-gcttgtgtttataa--cttc 6661122  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    | || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  6661121 catacactttattttggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatatttaattggtgtgattt--tcatcgaattcacaac 6661038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552527
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15552429 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 585
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587252
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 292  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||      
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  293 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct- 391  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||     
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10587071  T
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  10587072 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttgact--tgtattta 10587161  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
        |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  10587162 taacttccatacactttgttttggttgcttgatta-tccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 10587252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 310
Target Start/End: Original strand, 20043027 - 20043208
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20043027 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 20043126  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  20043127 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 314
Target Start/End: Original strand, 20044960 - 20045172
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20044960 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20045059  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||     
T  20045060 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttggg 20045159  T
Q  302 tagaattaggcgg 314  Q
    |||||||||||||    
T  20045160 tagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 36208530 - 36209008
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||| |    
T  36208530 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tagagagat 36208626  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    | |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||    
T  36208627 t-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgg 36208723  T
Q  301 atagaattaggcggg-agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
     ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||   | ||| | | ||||| |     
T  36208724 gtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttcccc-at 36208822  T
Q  399 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgtt-ctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  36208823 actaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtttctctctttctttctctcgt--tgttttctacttttggcttgtgattataattgtt 36208920  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |  || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36208921 ctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctctacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 36209008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 586
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798469
Alignment:
Q  231 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgta 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  331 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    |||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  431 aattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcc 530  Q
    |||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39798326 aattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatccc 39798415  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  39798416 ttgctccacacatcaa-attgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 39798469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26098580 - 26098382
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26098580 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagttt 26098481  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  26098480 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggggttttgg 26098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 340 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098128
Alignment:
Q  340 tatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  439 c--gttctctcttcctttctctctt--gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
       |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26098280 tatgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgc 26098181  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26098180 tccacacatcaagtttgatattggtgtgagttttctcatcgaattcgcaacaa 26098128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 219 - 594
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410467
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  319 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 418  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  419 actaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg 509  Q
    ||| |||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||   |||||      ||||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || || ||     
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctactttgtgctcttttcgccgctgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacacctt- 4410385  T
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagtttgatt 594  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4410386 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcaacgaattcgcaacaagtttgatt 4410467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1393 - 1581
Target Start/End: Complemental strand, 37699349 - 37699152
Alignment:
Q  1393 gctctttaaagtatgtacatttgaagaagtctaagtctccgattctaaatacaattaatgtt------attttcttcatttcaggtgtatttttaagcac 1486  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37699349 gctctttaaagtctgttcagttgaagaagtctaagtctccgttgctaaatacaattaatgttgttattattttcttcattttaggtgtatttttaagcaa 37699250  T
Q  1487 attactcactgtgattgctacttaaatgaatttgttatc---ttatcacaacttgaaataagattccaactttcgtgctaattacgttcaaaaagtct 1581  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37699249 attactcattctgattgctacttaaatgaatttgttatcttattatcacaacttgcaataagattccaactttagtgctaattacgttcgaaaagtct 37699152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 111; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10750138
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttct- 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||     
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctt 10749994  T
Q  445 -ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 537  Q
      ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  10749995 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctcc 10750092  T
Q  538 acatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  10750093 acacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tgatcgaattcacaacaa 10750138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 797 - 999
Target Start/End: Complemental strand, 37438116 - 37437914
Alignment:
Q  797 tccatgatgaaccaattataaaggtggtctaccgtagaactcacgagtagagtatcgatatccgatgacatctgatactttttctttttatatgctcaat 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  37438116 tccatgatgaaccgcttataaaggtggtttacagtagaactcaatagtagagtatcgatatcatatgacacttaatactttttctttttatatgctcagt 37438017  T
Q  897 gcattttcttttgtgctgtaacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaatttttgtagtttagttaagaaccatacaaaaaacacgtacataaaat 996  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||    
T  37438016 gcattttcttatgtgctataataagctttgaggaaattataaatttaaagaaatttttgtagtttagttaagaaccatagaaaaaaaaaacacataaaat 37437917  T
Q  997 aaa 999  Q
    |||    
T  37437916 aaa 37437914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 585
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054266
Alignment:
Q  139 atagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 238  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||  ||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  239 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt---tg--gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  339 atatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattc- 435  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | | ||| | ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||     
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T
Q  436 -ttgcgttctctc-ttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttg 533  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||||| | |||   || | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20054122 tttgtgttctctctttcttttctctctt--cgttttctactttt-gtttgtgtttataa--ctttcatacactttgttttggttgcttgattattacttg 20054216  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| ||| ||||||| | ||||| ||||| |||  | |||||||||||||||    
T  20054217 ctctacacatcaagtattttattagtgtgattt--ttatcgaattcacaaca 20054266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 366
Target Start/End: Original strand, 9020197 - 9020432
Alignment:
Q  126 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||| || |  | |||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9020197 tgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaaca-caaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactaggg 9020293  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9020294 ttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattc 9020391  T
Q  326 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9020392 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 9020432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757614
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttct- 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||     
T  10757371 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctt 10757470  T
Q  445 -ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 537  Q
      ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  10757471 cttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctcc 10757568  T
Q  538 acatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  10757569 acacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tgatcgaattcacaacaa 10757614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3372977
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | |  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T
Q  445 ctcttc--ctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
     |||||  ||||  |||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  3373121 -tcttcttcttttgctcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgct 3373025  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3373024 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 3372977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 368 - 586
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043425
Alignment:
Q  368 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctg 465  Q
    ||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgctg 20043304  T
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttg-gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  20043305 ttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggctgcttgatttatcacttgctccacaaatcaagtttgttattgatgt-gt 20043403  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  20043404 tttctcattgaatccacaacaa 20043425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354413
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    || |||| ||||||||| | |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T
Q  445 ctcttc--ctttctctctt------gctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
     |||||  ||||   ||||      | || ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  15354559 -tcttcttcttttgttcttctcacagttgtttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgc 15354463  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15354462 tccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 15354413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665485
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |     
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23665237  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  23665238 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T
Q  445 --ctcttccttt----ctctc----ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttg 533  Q
       ||||| |||     ||||    ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  23665338 tcttcttcttttgttcttctcacagttg-ttttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttg 23665434  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  23665435 ctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 23665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793102
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |     
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23793350  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  23793349 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T
Q  445 --ctcttccttt----ctctc----ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttg 533  Q
       ||||| |||     ||||    ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  23793249 tcttcttcttttgttcttctcacagttg-ttttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttg 23793153  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  23793152 ctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 23793102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1453 - 1581
Target Start/End: Complemental strand, 37437823 - 37437696
Alignment:
Q  1453 ttattttcttcatttcaggtgtatttttaagcacattactcactgtgattgctacttaaatgaatttgttatc---ttatcacaacttgaaataagattc 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  37437823 ttattttcttcatttcaggtgtatttttaagcaaattactcattctgattgctacttaaatgaatttgttatcttattatcacaacttgcaataagattc 37437724  T
Q  1550 caactttcgtgctaattacgttcaaaaagtct 1581  Q
    |||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  37437723 caact----tgctaattacgttcgaaaagtct 37437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38959972
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T
Q  445 --ctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       | || ||||   ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38960116 tcttttttcttttgttcttcttgtcgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctc 38960019  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  38960018 cacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 38959972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356689
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |     
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15356936  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| | || | | ||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  15356935 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T
Q  445 ctcttc--ctttctctctt------gctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
     |||||  ||||   ||||      | || ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  15356835 -tcttcttcttttgttcttctcacagttgtttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgc 15356739  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15356738 tccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 15356689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413232
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  294 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
      ||| | ||||||||||   | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17413232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 459
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143776
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     ||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||||| | ||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  431 aa-ttcttgcgttctctcttcctttctctc 459  Q
    || ||| || ||||||||| | ||||||||    
T  15143747 aatttcgtgtgttctctctacttttctctc 15143776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 592 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 37438386 - 37438187
Alignment:
Q  592 attaaaacaacggaaaataacccaagattacttcggtaagacgaaagtgatctcttacagcttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaagaat 691  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |  |||  ||||    
T  37438386 attaaaacaacataaaataacccaagattagttgggtaagatgaaagtgacctcttccagcctaatcagatgtcgtgagtttgaatccaactctgggaat 37438287  T
Q  692 gcaataatgttaaatatcatgggggagaatgtaatttgttttgtagcttgcactgaacaaacatcaatcaagtcacccacttagtcgtaaatataagaaa 791  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||  |  ||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  37438286 gtaacaatgttaaatctcatgtgggagaatgtaaaattattattagctcgcactgaacatacaccaatcaagtcaccgtcttagtcgcaaatataggaaa 37438187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741855
Alignment:
Q  255 tattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 353  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  354 ggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
     ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23741855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20507791 - 20507659
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  20507791 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagttt 20507692  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507691 gtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 799 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 37700753 - 37700646
Alignment:
Q  799 catgatgaaccaattataaaggtggtctaccgtagaactcacgagtagagtatcgatatccgatgacatctgatactttttctttttatatgctcaatgc 898  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||  |||||||||||| |||||| |||    
T  37700753 catgatgaaccacttataaaagtggtctacggtagaactcacgagtagagtatcaatatccgatgacacttaatatgttttctttttatgtgctcagtgc 37700654  T
Q  899 attttctt 906  Q
    ||||||||    
T  37700653 attttctt 37700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 460 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 34530683 - 34530559
Alignment:
Q  460 ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggt 559  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34530683 ttgctgttgtctacttttgacttgtgtttataattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcacttgctcgacacatcaagtttgttattggt 34530584  T
Q  560 gtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||    
T  34530583 gtgatttt-tcatcgaattcacaaca 34530559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 37701026 - 37700838
Alignment:
Q  597 aacaacggaaaataacccaa-gattacttcggtaagacgaaagtgatctcttacagcttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaagaatgcaa 695  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||    
T  37701026 aacaagggaaaataacccaaagattatttgagtaagatgaaagtgatatcttccagcttaaccggatgtcgtgagtttgaattcagttatgggaatgcaa 37700927  T
Q  696 taatgttaaatatcatgggggagaatgtaatttgttttgtagcttgcactgaacaaacatcaatcaagtcacccacttagtcgtaaatataa 787  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||| |  ||    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  37700926 ccatgttaaattttatgggggagaatgtaaaattatttgtagctcgttct---taaacatcaatcaagtcaccatcttaatcgtaaatataa 37700838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 367
Target Start/End: Original strand, 42770954 - 42771025
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 367  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42770954 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1509 - 1567
Target Start/End: Complemental strand, 37698864 - 37698806
Alignment:
Q  1509 taaatgaatttgttatcttatcacaacttgaaataagattccaactttcgtgctaatta 1567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37698864 taaatgaatttgttatcttatcacaacttgcaataagattccaactttagtgctaatta 37698806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033632
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  301 atagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccatt-gatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
     ||||||| ||   | |||||| || | ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcat 34033632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1267
Target Start/End: Complemental strand, 34599603 - 34599459
Alignment:
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgaggg-atttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaa 1222  Q
    ||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||| || ||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34599603 cgtactaattaggtcatttaagttatttaaccgtaacaatttttgggtattttagatcttaaaaatgtaagttattctggacctaaaagttacaattaaa 34599504  T
Q  1223 taacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaa 1267  Q
     |||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  34599503 caacttaaaggacttaagcattaagaaaaatacttaaataactaa 34599459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445135
Alignment:
Q  322 attcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 419  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||| | |||  |||||||||||||| | |||||| |||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  420 ctaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttg 518  Q
    || ||| |||||| ||| || ||| |||||| |||||||||  | |||||||||  ||| |||||||| | ||||  || | |  || |||||||| |||    
T  15445277 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttctttctctc--gatgttttctatcttttgcttgtgtttataat--tttcatccacgttgttttgattg 15445182  T
Q  519 cttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15445181 cttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattggtgtgttttt 15445135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 559
Target Start/End: Original strand, 20045300 - 20045395
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggt 559  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20045300 tgttttttacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcatttgcttcacacatcaagtttgttattggt 20045395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 320
Target Start/End: Original strand, 42770748 - 42770934
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || | || ||||| |||||  || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  42770748 gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaaggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggt 42770844  T
Q  227 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    |   ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||| || ||||||    
T  42770845 t--ggggttcattcaccatgggaa--actattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Original strand, 4754188 - 4754312
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||      
T  4754188 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactg 4754282  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  4754283 gaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1273
Target Start/End: Original strand, 2143247 - 2143394
Alignment:
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaat 1223  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || || ||  ||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  2143247 cgtactaattaggtcctttaagttatttaact--aacaatttaggggattttatatcttaaacatgtaagttattcggggcctcaaagtttcaattaaat 2143344  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  2143345 aacttaaaaaacctaaatgttacgaaaaatactgaaaggactaacttgtt 2143394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23741813 - 23741697
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  23741813 ttttctacttttggctcgt--attttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgat 23741717  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  23741716 ttt-tcgtcgaattcacaaca 23741697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2144811 - 2144706
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttac 279  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2144811 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgc 2144717  T
Q  280 gtgaagagatt 290  Q
    | |||||||||    
T  2144716 gggaagagatt 2144706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 4410045 - 4410101
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 192  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4410045 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  252 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttg 350  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||  |||||||| || |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  351 taaggttactcatcat 366  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1245
Target Start/End: Complemental strand, 13953616 - 13953394
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannnn 1121  Q
    |||||||| |||| || ||| |||||| |  |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||        
T  13953616 tttaagttgtttaattataataaattggttttttaagtttttt-cataccgcttaagtcatttaagttaattaattgtaacaagtttgtcttttaagttt 13953518  T
Q  1122 nnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattc-gggacctaaagttacaatta 1220  Q
       ||||||||||| ||| | |||| |||||||  |||| || || |||||||||||| | ||||| || |||||||||  || |  ||||||||| |||    
T  13953517 ttccgtaccaattacgtcttttaagttatttaatcgtaaaaatttaagggatttcaga-cctaaaaatgtaagttattcaaggtctaaaagttacagtta 13953419  T
Q  1221 aataacttaaacgacctaagtgtta 1245  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  13953418 aataatttaaaggacttaaatgtta 13953394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748485
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 269  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtc 29748464  T
Q  270 tcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  29748465 tcttggtcacgggaatagatt 29748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 1171089 - 1171142
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1171089 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 1171142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1095
Target Start/End: Original strand, 1629760 - 1629837
Alignment:
Q  1018 gtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaa 1095  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  1629760 gtcttttaagttaattaattgtaacaaatcgatcctttaagttttttccgtagcaattaagtcctttaagttatttaa 1629837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Original strand, 15552605 - 15552685
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||| || |||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15552605 actttgttttagttgcttgattatcccttacttcacgcatcaagtt-gttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 15552685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1117
Target Start/End: Original strand, 1629683 - 1629799
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |  |||||   ||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1629683 gttaaattacaccaaaagtcctttaagttatttaattgtaataaattcgttctttaaaaattttctgtacaaattaggtcttttaagttaattaattgta 1629782  T
Q  1101 acaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||| | | ||||||||    
T  1629783 acaaatcgatcctttaa 1629799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 146
Target Start/End: Original strand, 2723917 - 2723961
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggg 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2723917 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 29532161 - 29532047
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||| | ||    
T  29532161 gttaaattacatcatatgtcttt-aagttattcaattgtaacaaattgaacctttaaatttttt-cgtatcacttagcttctttatgttaattaactgta 29532064  T
Q  1101 acaagttggtcctttaa 1117  Q
    | ||||||||| |||||    
T  29532063 aaaagttggtcatttaa 29532047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1170 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 26325781 - 26325678
Alignment:
Q  1170 ggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaact 1269  Q
    |||||||| || |||||| |  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| || |||||||    
T  26325781 ggatttcaaatattaaaaatataagttattcaggatctaaagttataattaaataatttaaaggatttaagtgttacaataaatacttaaatgactaact 26325682  T
Q  1270 tgtt 1273  Q
    ||||    
T  26325681 tgtt 26325678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41586016 - 41585946
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 191  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||   ||| |||||| ||||||||||    
T  41586016 atcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1074 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 2143420 - 2143379
Alignment:
Q  1074 ttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtccttt 1115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2143420 ttaggtcctttaagttaattaattgtaacaagttagtccttt 2143379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224911
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | | |||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagatt 15224911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1107
Target Start/End: Original strand, 30384213 - 30384297
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagtt 1107  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  30384213 tttaagttatttaattgtaacaaatttgtcttttaagtttttt-cgtattacttacgtcttttaagttatttaattgtaacaagtt 30384297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 562
Target Start/End: Original strand, 31543094 - 31543150
Alignment:
Q  505 ctttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31543094 ctttgttttggttgcttgattaacccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 31543150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 583
Target Start/End: Original strand, 28786677 - 28786728
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28786677 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaa 28786728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31782690 - 31782578
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |    
T  31782690 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggaat 31782592  T
Q  298 tggatagaattagg 311  Q
    ||| ||||||||||    
T  31782591 tgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1222 - 1270
Target Start/End: Original strand, 38458771 - 38458819
Alignment:
Q  1222 ataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaactt 1270  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38458771 ataacttaaaggacccaagtgttatgaaaaatacttaaatgactaactt 38458819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 10627641 - 10627696
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10627641 ttgctccacgcatcaagtttattattggtgtggttttcacaatgaattcacaacaa 10627696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11962330 - 11962287
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11962330 atcaagttttttattggtgtggttttcacaacgaattcacaaca 11962287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1020 - 1107
Target Start/End: Original strand, 37704830 - 37704917
Alignment:
Q  1020 cttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagtt 1107  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| | |  |||||| ||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37704830 cttttaagttatttaattataacaaatcggttttttaagattttttcgtatcacttgcgtcatttaagttatttaattataacaagtt 37704917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1116
Target Start/End: Original strand, 41232901 - 41232964
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtccttta 1116  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  41232901 tttaagtttttttgataccacttagatcctttaagtcaattaattgtaataagttggtctttta 41232964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170849
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 1170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 1240707 - 1240760
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1240707 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggtttcctcaacgaattcacaaca 1240760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298145
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8565988 - 8565946
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8565988 tctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 8565946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 19806489 - 19806531
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806489 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1293 - 1335
Target Start/End: Complemental strand, 30384298 - 30384256
Alignment:
Q  1293 taacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgatacg 1335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30384298 taacttgttacaattaaataacttaaaagacgtaagtaatacg 30384256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 32636950 - 32636992
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32636950 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627405
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 10627405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Original strand, 28786543 - 28786623
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcc-tttctctcttgctgttt 468  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  28786543 tctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctc-cttccttttatctcttgctgttt 28786623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1252
Target Start/End: Complemental strand, 29531975 - 29531914
Alignment:
Q  1192 aagttattcgggacctaaag-ttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaa 1252  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||    
T  29531975 aagttattcgggacctaaaaattacaattaaataacttaaatgacgtaaatgatacgaaaaa 29531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 38458899 - 38458805
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |  |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |||||    
T  38458899 ttttaagttatttaattgtaataaattagt--tttaagtttttttcgtaccacttatatcttttaagttattttattgtaataagttagtcatttaa 38458805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39397981 - 39397916
Alignment:
Q  453 ttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttg 518  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||| || | || |||||||||||||||    
T  39397981 ttctctctcactgttttctacttttggcttgagtttataattgtttcatacactttgttttggttg 39397916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-173; HSPs: 144)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 11457806 - 11457328
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457806 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11457707  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  11457706 gattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttggg 11457607  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  11457606 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagact 11457507  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    
T  11457506 aggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttaaaattgttcc 11457407  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11457406 atatactttgttttggttgcctgattatcacttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattc 11457328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 101 - 585
Target Start/End: Original strand, 18307058 - 18307543
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18307058 gctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtt 18307157  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18307158 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgg 18307257  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||    
T  18307258 gtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccaga 18307356  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  18307357 ctaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 18307456  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || |||||||||||||||| |  ||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  18307457 ccatacactttgttttggttgcctaattatcatttgctccacacatcaagtttgttattgatgt-attttctcatcgaattcgcaaca 18307543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 13215031 - 13215518
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13215031 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 13215130  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  13215131 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 13215230  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||    
T  13215231 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 13215330  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  13215331 agactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 13215430  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13215431 tccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgt-gttttctcaacgaattcacaaca 13215518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 104 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 2949560 - 2949079
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    ||||||||||| |||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2949560 ataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgt 2949461  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||    
T  2949460 ctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggta 2949361  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactag 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||||| ||||||    
T  2949360 gaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactag 2949262  T
Q  404 gtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  2949261 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccat 2949162  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2949161 acactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 2949079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Original strand, 18839537 - 18840024
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839537 ctataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18839636  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  |||||     
T  18839637 atctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttggg 18839736  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| | | ||||||| ||    
T  18839737 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatac 18839836  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||    
T  18839837 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctagttttggcttgtgtttataattgttc 18839936  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    | || ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18839937 catacactttgtttcgattacttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaag 18840024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 41646870 - 41647356
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41646870 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 41646969  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  41646970 gtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttggg 41647069  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||  ||||||    
T  41647070 tagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagact 41647169  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  41647170 atgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttgacttgtgtttataattatttc 41647269  T
Q  500 ttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||| |||||||||  || ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41647270 atacactttgattttggttgtctgattatcacttgctccgcacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 41647356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 102 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 25251606 - 25251123
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  25251606 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgttt 25251507  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  25251506 gtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttggg 25251407  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |  || | ||||||| | ||    
T  25251406 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatac 25251307  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||     
T  25251306 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttt 25251207  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25251206 catacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaa 25251123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 12302841 - 12302368
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 196  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12302841 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 12302742  T
Q  197 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  12302741 agtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 12302642  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  12302641 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 12302542  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  12302541 agattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataatt 12302442  T
Q  495 attccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
     |||| || |||||| |||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12302441 gttccatacactttgattttggtttcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttt 12302368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 127 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 50307853 - 50307388
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 225  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307853 gtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 50307754  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50307753 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 50307654  T
Q  326 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50307653 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 50307554  T
Q  426 caacaaattc---ttgcgttctctctt-cctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgc 519  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  50307553 caacaaattctttttgtgttctctcttatttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgc 50307454  T
Q  520 ttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  50307453 ctgattatcccttgctccagacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcccaacaa 50307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 103 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6996030 - 6995539
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6996030 tataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 6995931  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  6995930 tctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggt 6995831  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||| ||||||||    
T  6995830 agaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagacta 6995731  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc----ctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    |||| |||||   || ||||||||||||||||||||||| | || |    
T  6995730 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttatagt 6995631  T
Q  494 tattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6995630 tgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 6995539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 102 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 50248903 - 50248412
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  50248903 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagttt 50248804  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |  |||||     
T  50248803 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttggg 50248704  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgt--tttctcccccaga 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||  | ||||||| |||    
T  50248703 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccctaga 50248604  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||    
T  50248603 ctaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttcaacttttggcttgtggttataattgtt 50248504  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagttt 590  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50248503 ccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaaatttgttattggtgt-gatttatcatcgaattcacaacaggttt 50248412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14098301 - 14097814
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||   ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098301 ctataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagttt 14098202  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||     
T  14098201 gtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttggg 14098102  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| || ||    
T  14098101 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaac 14098002  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  14098001 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttc 14097902  T
Q  499 cttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  14097901 catacactttgattttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaagtttgttattggtgt-gttttttcttcgaattcgcaacaa 14097814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 47906254 - 47906704
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  47906254 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 47906353  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906354 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47906453  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47906454 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 47906553  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||  |||    
T  47906554 ttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttggtttggttgcttgattatctctt 47906653  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  47906654 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 47906704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 121 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31425331 - 31424861
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaaca 219  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31425331 atcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaaca 31425232  T
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  31425231 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 31425132  T
Q  317 gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggac 415  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31425131 ggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctcccc-atactaggtcaatttggac 31425033  T
Q  416 cgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtttt 513  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | || || | |||||| |    
T  31425032 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtcccatacattttgttat 31424933  T
Q  514 ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  31424932 ggttgcttgagtattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcattgaattcgcaacaa 31424861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 39462469 - 39462956
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39462469 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 39462568  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  39462569 gtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 39462668  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||    
T  39462669 tagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagact 39462768  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  39462769 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctaattttggcttgtgtttataattgtt 39462868  T
Q  498 ccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || |||||| ||||| |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  39462869 ccatacactttgattttgattgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 39462956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 102 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 9241417 - 9240937
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9241417 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 9241319  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  9241318 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgg 9241219  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||| |    
T  9241218 gtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccata 9241119  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||    
T  9241118 ctaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctttctttctctc--gctgttttctacttttggtttgtatttataattgtt 9241021  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  9241020 tcatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacttcaagtttgttattggtgtgatttt-ttatcgaattcaca 9240937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 31489865 - 31490346
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  31489865 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--ttt 31489962  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |  ||||||    
T  31489963 gtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttgga 31490062  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| | || ||||||||||    
T  31490063 tagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagact 31490161  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||| || |    
T  31490162 aggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttattttctctctccctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttc 31490261  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31490262 atacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttg-tattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 31490346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 102 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 50077003 - 50076564
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  50077003 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 50076904  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  50076903 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttggg 50076804  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  50076803 tagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagac 50076705  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||    
T  50076704 tatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgttgttttctacttttaacttgtgtttataattgttc 50076606  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccaca 540  Q
    | || |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  50076605 catacactttgttttagttgctttattattcattgctccaca 50076564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38925809 - 38925327
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38925809 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 38925710  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  38925709 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 38925610  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | | ||| | ||| |||||||||    
T  38925609 tagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctct-ccccagact 38925513  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  38925512 aggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcat--tgttttctacttttggcttgtgtttataaatgttcc 38925415  T
Q  500 ttatactttg--ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||||||  |||||||||| || ||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38925414 atacactttgatttttggttgcctgattatcacttactccacacatcaagtttattattggtgt-gttttctcatcaaattcacaacaa 38925327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28207397 - 28206911
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28207397 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagttt 28207298  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |    
T  28207297 gtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaa 28207198  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  28207197 tataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 28207100  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  28207099 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 28207000  T
Q  498 ccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || || |||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28206999 ccatacactttgattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 28206911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 103 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17185978
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 17186359  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| |    
T  17186358 tctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggt 17186259  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |   ||| | |||||||||||||    
T  17186258 agaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagact 17186159  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||  | |||   ||||    
T  17186158 aggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctactttt-gtttgtgattataa--cttcc 17186064  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  17186063 atacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacatatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcaaattcacaacaa 17185978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 102 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 17324967 - 17324482
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17324967 ctataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagttt 17324868  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  17324867 gtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 17324768  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  17324767 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 17324668  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttt-tggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||| |||||| ||  | |||||     
T  17324667 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctactttctggcttatgattataattg 17324568  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 581  Q
    |||  |  |||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  17324567 ttctattcactttgttatggctgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaattcac 17324482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 127 - 585
Target Start/End: Original strand, 17318868 - 17319321
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318868 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 17318967  T
Q  227 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 326  Q
    | || ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17318968 tggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattct 17319061  T
Q  327 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| | | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17319062 tgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccct-agactaggtcaatttggaccgaactgggt 17319160  T
Q  426 caacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||| |||     
T  17319161 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctattttctacttttggcttgtgtttataactattccatacactttgttttggttgtttga 17319260  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17319261 ttattccttactccacacatcaaatttgttattggtgcgatttt-tcatcgaattcacaaca 17319321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 102 - 567
Target Start/End: Original strand, 51749989 - 51750460
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51749989 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 51750088  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  51750089 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 51750188  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  51750189 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 51750288  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51750289 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 51750385  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  51750386 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 51750460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28998584 - 28998093
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28998584 ctataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28998485  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||     
T  28998484 gtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttggg 28998385  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||  | |  |||| |||||||||||||    
T  28998384 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagact 28998285  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||   |||   ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  28998284 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttttcttcttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 28998185  T
Q  497 tccttatactttg---ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || ||||||    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28998184 tccatacactttgattctttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgtcattggtgt-gttttctcttcgaattcacaacaa 28998093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29004300 - 29003809
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29004300 ctataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 29004201  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||     
T  29004200 gtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttggg 29004101  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||  | |  |||| |||||||||||||    
T  29004100 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagact 29004001  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||   |||   ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  29004000 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttttcttcttttctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 29003901  T
Q  497 tccttatactttg---ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || ||||||    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29003900 tccatacactttgattctttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgtcattggtgt-gttttctcttcgaattcacaacaa 29003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 103 - 560
Target Start/End: Original strand, 17324016 - 17324484
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| || |||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  17324016 tataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttg 17324113  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |   ||||| |    
T  17324114 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggt 17324213  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||  ||||    
T  17324214 aaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgact 17324313  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctt------------tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||  |||||||||||||||||||||||| |     
T  17324314 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgtgttctctcttcctttctctctctctctctctctcactgttttctacttttggcttgtgttta 17324413  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtg 560  Q
    ||||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324414 taattttttcatacactttgttatggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtg 17324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 122 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131221
Alignment:
Q  122 tcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaaca 219  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| |||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  320 ttattcttgtaacccattgatatcc----cttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgga 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  415 ccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttt 512  Q
    | |||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctctgttcttttctctctcgttgttttctatttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttt 4131294  T
Q  513 tggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  4131293 tggttgcttgattatctcttgctccgcacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaattcgcaaca 4131221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10400159 - 10399669
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10400159 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 10400060  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |     
T  10400059 gtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcgg 10399960  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  10399959 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 10399860  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10399859 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 10399763  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  10399762 attgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 10399669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 540
Target Start/End: Original strand, 16428603 - 16429040
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||   ||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16428603 ctataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 16428702  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  16428703 gtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 16428802  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  16428803 tagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaac 16428902  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||   |||    
T  16428903 taggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gatgttttctacttttggtttgtgtttataa--cttc 16428998  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccaca 540  Q
      || |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  16428999 tatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccaca 16429040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27337235 - 27336782
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337036 ttgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27336938  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattcc 530  Q
      ||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||| || |||| ||    
T  27336937 ttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccc 27336838  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27336837 ttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttctcaacgaattcacaaca 27336782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31423205 - 31422706
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31423205 ctataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagttt 31423106  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  31423105 gtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 31423006  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata------------gtgaaacgaatgactgtt 387  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||            |||||||  | | ||| |    
T  31423005 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgct 31422906  T
Q  388 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtg 485  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31422905 ctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtgatatctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtg 31422806  T
Q  486 tatt-taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    | || |||||||||| || ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  31422805 ttttataattattccgtacactttattttagttgattgattattccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt-tcatcgaattcgcaac 31422707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 567
Target Start/End: Original strand, 15823496 - 15823967
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15823496 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 15823595  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  15823596 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 15823695  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | |||||||||||||    
T  15823696 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagact 15823795  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc---ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  15823796 aggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttttctcttgttgttgttttctacttttgccttgtgattataattgt 15823895  T
Q  497 tccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||| || |||||| |||||||||| || |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15823896 tccatacactttgattttggttgcctgattaccccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 15823967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294693
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 15294832  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  15294831 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 15294735  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15294734 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 15294693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27339427 - 27338972
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27339427 gagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27339328  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27339327 gattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaaccca 27339228  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339227 ttgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 27339129  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattcc 530  Q
      ||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||| || |||| ||    
T  27339128 ttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccc 27339029  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27339028 ttgttccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttctcaacgaattcacaacaa 27338972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 101 - 499
Target Start/End: Original strand, 6756476 - 6756875
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6756476 gctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6756575  T
Q  201 tgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||  ||||    
T  6756576 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattgggactttg 6756673  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct-ccccca 397  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||    
T  6756674 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctcccccca 6756773  T
Q  398 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||     
T  6756774 gactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttctttcctctc--gctgttttctacttttgacttgtgtttataattg 6756871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 145 - 585
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134378
Alignment:
Q  145 ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 244  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  245 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc 344  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  345 cttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgt 441  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgt 40134236  T
Q  442 tctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttat-tc-cttgctccac 539  Q
    ||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  | |||   |||| || |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  40134237 tctctatt-ctttttctctcgttgttttctacttttggcttgagattataa--cttccatacactttgttttggttgcctgattatatcacttgctccac 40134333  T
Q  540 atatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  40134334 acatcaagtttgttattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 40134378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50079152 - 50078779
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50079152 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagttt 50079053  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  50079052 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttggg 50078953  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  50078952 tagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagac 50078853  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctcttgctgttttct 471  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  50078852 taggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctctcgttgttttct 50078779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 105 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 3579946 - 3579588
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3579946 taaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttg 3579847  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||| |    
T  3579846 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggt 3579747  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| ||||||    
T  3579746 aaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagacta 3579648  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct 460  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  3579647 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttctctct 3579588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 13761787 - 13762275
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13761787 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagttt 13761886  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  13761887 gtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttggg 13761986  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||  | |||||||||||||    
T  13761987 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagact 13762085  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13762086 aggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 13762182  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13762183 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatccctttctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttctcatcgaattcgcaaca 13762275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 47451598 - 47452066
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47451598 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 47451697  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  47451698 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 47451791  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  47451792 taaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatact 47451891  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |           ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  47451892 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacca-----------ctctcttccttttctctcgttgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 47451980  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  47451981 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcgacacatcaaatttgttattgatgtgatttt-tcattgaattcacaacaa 47452066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 2510621 - 2510184
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  2510621 gagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 2510522  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2510521 gattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaaccca 2510423  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2510422 ttgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 2510323  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  2510322 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctatttttgact--tgtttttaattgttccatacactttgttttcgttgcttgattatctcttgct 2510233  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2510232 tcacatatcaag-ttgttattggtgtgattttcacaacgaattcacaaca 2510184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 2617466 - 2617956
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2617466 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 2617565  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  2617566 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 2617665  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| ||||||    
T  2617666 tagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagact 2617765  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcg---ttctctcttc------ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |   || |||||||       ||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2617766 aggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttctcttcattgtgttttctctcgctgttgttttctacttttggct--tgtattta 2617863  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  2617864 attgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgcttcacacatcaag-ttgttattggtgtggttt--tcatcgaattcgcaacaa 2617956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 103 - 585
Target Start/End: Original strand, 20302410 - 20302879
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20302410 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 20302509  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |    
T  20302510 tctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggt 20302609  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||| |||||| | || | ||||  | ||||||||||||||    
T  20302610 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagacta 20302708  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctta 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  20302709 ggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccata 20302798  T
Q  503 tactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  20302799 caccttgattttggttacttgattatctcttgctccagacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 20302879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 39932057 - 39932514
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39932057 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 39932156  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932157 gattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 39932256  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttc-tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| | | ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39932257 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 39932356  T
Q  435 c--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    |  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||||    |||| || |||||||||||||||||||     
T  39932357 cttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttga 39932453  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39932454 ttatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 39932514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 557
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128280
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  434 tc--ttgcgttctctcttcctttc--tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct-tatactttg-ttttggttgcttggttat 527  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||  || ||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttcctttctttctctcgctgttttctactttt-atttgtg-att--ataattgctatccactttgattttggttgcttgattat 25128250  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattg 557  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25128251 tccttgctctacacatcaagtttgttattg 25128280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 135 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31735819 - 31735365
Alignment:
Q  135 tgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  31735819 tgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 31735720  T
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31735719 tgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcc 31735620  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735619 attgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 31735520  T
Q  435 c--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
    |  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |    
T  31735519 cttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttcta-ttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgat 31735424  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  31735423 tatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-aatttctcatcgaattcgcaaca 31735365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 108 - 437
Target Start/End: Original strand, 6822971 - 6823299
Alignment:
Q  108 atatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctct 207  Q
    |||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6822971 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 6823070  T
Q  208 tggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaat 307  Q
    | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  6823071 taggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaat 6823169  T
Q  308 taggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||    
T  6823170 taggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca 6823269  T
Q  408 atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6823270 atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6823299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 24325648 - 24326101
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24325648 gagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 24325846  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24325847 ttgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattc 24325946  T
Q  436 ttgcgttctctcttc--ctttctct-ctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
    ||  ||   || |||  |||| | | |||      | |||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||| || |||||  |||||||||||| |||    
T  24325947 ttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctcaccgttgttttttacctttgacttgt--atttaattgttccatacactttactttggttgcttgatta 24326044  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24326045 tcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 24326101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 144 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431547
Alignment:
Q  144 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 243  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  244 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  344 ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct--cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgc 439  Q
     | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||     
T  46431796 tc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 46431698  T
Q  440 gttc-tctcttcctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
    |||| ||||||| ||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||  ||    
T  46431697 gttcttctcttcttttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatctct 46431600  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  46431599 tgctccaaacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 46431547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 28842479 - 28842932
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  28842479 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 28842578  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842579 gattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28842678  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28842679 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattc 28842777  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| ||    
T  28842778 tattgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgatt 28842874  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  28842875 atcccttactccacacatcaag-ttgttattagtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 28842932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 183; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Original strand, 28840628 - 28840964
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840628 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagt 28840727  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||    
T  28840728 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 28840827  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||    
T  28840828 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 28840926  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840927 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28840964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 219 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248398
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattaggcgggag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggag 25248668  T
Q  318 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggacc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  417 gaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttg 514  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||| | ||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || | || |||||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttttatcttccggtgtctctcgctgttttctacttttgacttttgtttataattgtttcatacactttgttttg 25248468  T
Q  515 gttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  25248467 gttgcttgactattccttactccacacatcaagtttgttattgttgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 25248398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 586
Target Start/End: Original strand, 20291439 - 20291895
Alignment:
Q  134 ttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg 233  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  20291439 ttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgaggg 20291538  T
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291539 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20291638  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| || | ||||||| | | |||||||||||||| | || | |  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20291639 cattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20291737  T
Q  434 tc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    ||  ||  |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||    
T  20291738 tcttttttgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacaccttgattttggttacttg 20291834  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  20291835 attatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 20291895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 173; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 16226117 - 16226608
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16226117 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 16226216  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  16226217 gtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 16226316  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  16226317 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 16226415  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-tc-ttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  16226416 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatt 16226512  T
Q  490 taattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||    || | || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16226513 tataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 16226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429388
Alignment:
Q  237 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  337 tgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttg 533  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||   |||| || |||||||||||||||| || ||||  ||||    
T  16429242 ttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttc-acttttggtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttg 16429336  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16429337 ctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 16429388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9463541 - 9463104
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9463541 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9463442  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463441 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9463342  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9463341 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9463243  T
Q  435 --cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
       ||| ||||         ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9463242 tctttgtgttc---------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatccctt 9463155  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9463154 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 9463104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 167; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9459714 - 9459277
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9459714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9459615  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459614 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9459515  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9459514 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9459416  T
Q  435 --cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
       ||| ||||         ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9459415 tctttgtgttc---------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatccctt 9459328  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9459327 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 9459277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47180152
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  47179897 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 47179994  T
Q  434 tc-ttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    || ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||     
T  47179995 tctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgattttgattgctta 47180091  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  47180092 attatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tgatcgaattcacaaca 47180152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21948484 - 21948244
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21948484 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 21948385  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948384 gattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 21948286  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 377  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21948285 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 21948244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 156; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14183917 - 14183589
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  14183917 ctataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaat-gcaaca-caaa-ctagggtttgtatagaggtt 14183821  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  14183820 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttggg 14183724  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  14183723 tagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 14183624  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14183623 taggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Original strand, 48665121 - 48665403
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggc------tgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 195  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||       ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48665121 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 48665220  T
Q  196 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgtgaagagattaggg 294  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||     
T  48665221 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctggga 48665320  T
Q  295 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 377  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48665321 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 48665403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 156; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Original strand, 51752315 - 51752648
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  51752315 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagttt 51752414  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  51752415 gtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 51752513  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||    
T  51752514 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 51752612  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51752613 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 51752648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177802
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||     
T  47177546 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaata 47177643  T
Q  434 tc-ttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    || ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||     
T  47177644 tctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgattttggttgctta 47177740  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  47177741 attatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tgatcgaattcacaacaa 47177802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 198 - 577
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432813
Alignment:
Q  198 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttt 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||     ||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  298 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||    
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  397 -agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |       |||||||||||||| || ||| | |||     
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctgt-------ttttctacttttggtttatgtttataa- 16432731  T
Q  494 tattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaat 577  Q
      || | || ||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16432732 -ctttcatacactgtgttttgattgcctgattattacttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt-tcatcgaat 16432813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 42922184 - 42922557
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42922184 ctataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 42922282  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||     
T  42922283 g-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttggg 42922379  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||| | ||| |||| |||    
T  42922380 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgac 42922479  T
Q  401 taggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| | || ||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  42922480 taggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctccc--gttgttttctacttttg 42922557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18800900 - 18800426
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18800900 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaagt-caacaagaaaactacggtttgtatagagttt 18800802  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |   |||||     
T  18800801 g-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttggg 18800705  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |  |||| | ||||||||| ||    
T  18800704 tagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaac 18800605  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||| |  |||||||| |||  ||| |||||| ||| || ||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||   |||    
T  18800604 taggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttgttt-tctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataa--cttc 18800508  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    | || ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||| ||||||| | || |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18800507 catacactttgttttgattgcttgattattatttgctctacacatcaagtattttgttggtgtgattt--tcatcgaattcaca 18800426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 133; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 49495530 - 49495206
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||| |||||||||| ||| |||||    
T  49495530 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caaa-ctagggtttgcatatagttt 49495439  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||  |||||||| ||| |||||     
T  49495438 g-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttggg 49495343  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||    
T  49495342 tagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagac 49495243  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    || |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  49495242 tatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 351
Target Start/End: Original strand, 6823840 - 6824091
Alignment:
Q  108 atatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctc 206  Q
    |||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6823840 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 6823939  T
Q  207 ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6823940 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttg 6824039  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt 351  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6824040 ggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 126 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 8347576 - 8347227
Alignment:
Q  126 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8347576 tgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaagg 8347479  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||  |  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8347478 tt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattc 8347381  T
Q  326 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactag 423  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | |  || | | ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||    
T  8347380 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaag 8347281  T
Q  424 gtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |  |||||| ||| || |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8347280 ggaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctatc--gctgttttctacttttg 8347227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8349352 - 8348904
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8349352 aaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg 8349255  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8349254 g--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttg 8349157  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 426  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||   | |  |||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| |||     
T  8349156 taactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggta 8349057  T
Q  427 aacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||| | |||||| | |||   |||| || |||||| |||||||||||| ||    
T  8349056 aacaaattttgtgtgttctctctttctttctctaat--tgttttctactttt-gtttgtgtttataa--cttccatacactttg-tttggttgcttgatt 8348963  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8348962 attacttgttccacacgtcaagttt-ttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 8348904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 296 - 585
Target Start/End: Original strand, 23816030 - 23816323
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || | || | |  || | |||||||    
T  23816030 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctcccc 23816129  T
Q  396 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctctt---cctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||  |     
T  23816130 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttcttttctctcgctgttgttttctacttttgacttgtgatta 23816229  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23816230 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 23816323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15669641 - 15669419
Alignment:
Q  183 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 282  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15669641 tagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 15669545  T
Q  283 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatg 381  Q
    ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15669544 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatg 15669445  T
Q  382 actgttttctcccccagactaggtca 407  Q
     ||| | ||||||| |||||||||||    
T  15669444 gctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6114953
Alignment:
Q  232 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 331  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac-gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 429  Q
    || ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatg-ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  430 aaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttat 527  Q
    ||||  | ||| ||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||| ||  ||||||||    |||| || | ||| ||||||||||||| ||||    
T  6115105 aaattattttgtgttctctcttcttttctctc--gttgtcttctacttttgact--tgtatttataacttccatacattttattttggttgcttgattat 6115010  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      ||| ||||||| ||||||| | |||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  6115009 cactttctccacacatcaagtatattaccggtgtgatttt-tcattgaattcataaca 6114953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 115; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786278
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 23786133  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23786134 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctactttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctc 23786231  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23786232 cacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 23786278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 586
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757974
Alignment:
Q  244 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  344 ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgt 441  Q
     |||| |||| | |||||| ||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  51757723 tcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  442 tct-ctcttcctt-------tctctc--ttgctgttttc--tacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattc 529  Q
    ||| |||||| ||       |||| |  ||| | |||||  ||||||||||||||  ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |    
T  51757822 tcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttttccctacttttggcttgt--attcaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcc 51757919  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  51757920 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtcatttt-tcatcgaattcacaacaa 51757974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggag 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  318 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  418 aactaggtcaacaaat 433  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 50078766 - 50078634
Alignment:
Q  454 tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgtt 553  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50078766 tctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgtt 50078667  T
Q  554 attggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50078666 attggtgtgattttctcatcgaattcgcaacaa 50078634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 585
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916821
Alignment:
Q  324 tcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaact 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  422 aggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgtttt-ctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgc 519  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  ||| || ||||||||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttttctc--gctgtttttctacttttggcttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgc 15916757  T
Q  520 ttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15916758 ttgattgttacttgctccacacatcaagtat-ttattggtgtgacttt-tcatcgaattcacaaca 15916821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13125768 - 13125411
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg-tatagagtttgtctcttggcaacaaaca 219  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| |||| | ||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13125768 atcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaaca 13125671  T
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-ga 318  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   || ||    
T  13125670 ctagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaga 13125573  T
Q  319 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggacc 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |    || | || |||||  ||||||||| | | |||||    
T  13125572 cttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggacc 13125473  T
Q  417 gaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctc-ttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||    
T  13125472 gaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctcttttctttctctc--gttgttttctacttttg 13125411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 30790725 - 30790250
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||   ||||| |    
T  30790725 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---tagagat 30790631  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    | |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |  ||||     
T  30790630 t-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgt 30790535  T
Q  301 atagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||| | |||  |||||    
T  30790534 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccag 30790436  T
Q  399 actaggtca-atttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | | ||| |||||| || || ||||||| |||||||||  ||||| ||| |||  |||| | |||||| | |||     
T  30790435 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc--gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa- 30790339  T
Q  494 tattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      |||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| || | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  30790338 -cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 30790250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520205
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaa-ggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| ||||||||| ||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  294 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 341  Q
      ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 442 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3579572 - 3579431
Alignment:
Q  442 tctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacat 541  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||||||||| || ||||  |||||||||||     
T  3579572 tctctctccctctctctctctctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcctgattatcacttgctccacac 3579473  T
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3579472 atcaagtttgttattggtgtg--tttttcatcgaattcacaaca 3579431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| || |||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatat 368  Q
    || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 478
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561794
Alignment:
Q  231 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||||  |  ||||| ||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  330 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || |  || | ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  428 acaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||| ||| || |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  16561745 acaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gccgttttctacttttg 16561794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613211
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    || |||||||| |||||| || |||||| |||| ||||||| |||  |   ||  | ||||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  431 aattct-tgcgttctctcttcctttctctc 459  Q
    |||| | || |||||||||| |||||||||    
T  26613240 aattttgtgtgttctctctttctttctctc 26613211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 434
Target Start/End: Original strand, 27916529 - 27916780
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  27916529 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacat 27916623  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacg 377  Q
    |||||||||  |  ||||| | ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  27916624 gaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacg 27916722  T
Q  378 aatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
     | | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||    
T  27916723 gagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1258
Target Start/End: Original strand, 363615 - 363853
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagt-tttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannn 1120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | |  ||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||       
T  363615 tttaagttatttaattgtaataaataggttctttaagtctttttttgtatcacttaggttctttatgttaattaattgtaacaagttggtc-tttaagtt 363713  T
Q  1121 nnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgaggg-atttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaat 1218  Q
        ||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||| || ||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  363714 ttttcgtactaattaggtcatttaagttatttaaccgtaacaatttttgggtattttagatcttaaaaatgtaagttattctgggcctaaaagttacaat 363813  T
Q  1219 taaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||| |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  363814 taaacaacttaaatgacttaagcattacgaaaaatactta 363853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat 409  Q
    |  ||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 464 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25860369 - 25860251
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  |    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25860369 tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgact----atcccttgctccacacatcaagtttgatattggtgtgg 25860274  T
Q  564 ttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  25860273 ttttcacaacgaattcacaacaa 25860251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1023 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 47726693 - 47726457
Alignment:
Q  1023 ttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannnnn 1122  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| |||||||||||         
T  47726693 ttaagttattttattgtaataaattggt-atttaagtttttttcatatcacttaggtcatttaagttaattagctcgaacaagatggtcctttaagtttt 47726595  T
Q  1123 nnc-gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaatta 1220  Q
        |||||||  ||||||| |  | ||||| ||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47726594 tcttgtaccaacaaggtcctttgtgttattttaccttaacaatttgaggaatttcatatcttaaaaatgcaagttattcgggatctaaaagttacaatta 47726495  T
Q  1221 aataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  47726494 aataacttaaagcacctaagtgttacaaacaatactta 47726457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1023 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 47747999 - 47747763
Alignment:
Q  1023 ttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannnnn 1122  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| |||||||||||         
T  47747999 ttaagttattttattgtaataaattggt-atttaagtttttttcatatcacttaggtcatttaagttaattagctcgaacaagatggtcctttaagtttt 47747901  T
Q  1123 nnc-gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaatta 1220  Q
        |||||||  ||||||| |  | ||||| ||  ||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47747900 tcttgtaccaacaaggtcctttgtgttattttaccttaacaatttgaggaatttcatatcttaaaaatgcaagttattcgggatctaaaagttacaatta 47747801  T
Q  1221 aataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  47747800 aataacttaaagcacctaagtgttacaaacaatactta 47747763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 13447233 - 13447117
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  13447233 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 13447137  T
Q  564 ttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||  ||||||||||| |||||    
T  13447136 ttt--tcatcgaattcgcaaca 13447117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1114
Target Start/End: Original strand, 16554303 - 16554396
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16554303 ttttaagttatttaattgtaataaattggtcctttaagtttttttggtaccacttaagtcatttaagttaatcaattgtaacaagttggtcctt 16554396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25248841 - 25248756
Alignment:
Q  106 aaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 191  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248841 aaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279480
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 292  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |    
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  293 ggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |  ||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1127 - 1257
Target Start/End: Original strand, 29954870 - 29955000
Alignment:
Q  1127 taccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattc-gggacctaaagttacaattaaataa 1225  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || |||  | |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  29954870 taccaattaggtcctttaagttatttaaccgtaataatttggagaatttcatatcttaaaaatgtaagttattctgggactaaaagttacaattaaataa 29954969  T
Q  1226 cttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactt 1257  Q
    |||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  29954970 cttaaa-gacctaagtggtacggaaaatactt 29955000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 585
Target Start/End: Original strand, 30780361 - 30780482
Alignment:
Q  465 gttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc--cacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  30780361 gttttctacttttgatttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattattccttactccacacacatcaagtttgttattggtgtg 30780460  T
Q  563 gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      ||| |||||||||||||||||    
T  30780461 agttt-tcatcgaattcacaaca 30780482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1111
Target Start/End: Original strand, 18470189 - 18470279
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagtttttta-cgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtc 1111  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  18470189 tttaagttatttaattgtaataagttgatcatttacgttttttttcgtacctcttaggtcctttaagttatttaactgtaacaagttggtc 18470279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332719
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 13358810 - 13358858
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13358810 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 13358858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 802346 - 802251
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| || |||||  ||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  802346 tttaagttatttaaatgtaataaattggtcctttaaacttttttcgtaccacttatatcctttgaattaattaattgtaacaagttggtcctttaa 802251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 12656474 - 12656368
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||     
T  12656474 taaattacaccgaaagtcctttaagttatttaattgtaacatattgattttttaaatttttt-cgtaccacttaaaccctttaagttaattaattgtaat 12656376  T
Q  1103 aagttggt 1110  Q
    ||||||||    
T  12656375 aagttggt 12656368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332632
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagatt 26332632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14183534 - 14183454
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  14183534 actttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaagtattttattggtgtgattt--ttatcgaattcacaacaa 14183454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 585
Target Start/End: Original strand, 16231884 - 16232002
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | |  | || |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16231884 tgttttctacttttggcttgtatttataacttt--catacactttgattttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 16231980  T
Q  563 gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  16231981 atttt-tcatcgaattcacaaca 16232002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21353251 - 21353196
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21353251 ttgctccacgcatcaagtttgttattggtgtggttttctcaacgaattcataacaa 21353196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1108
Target Start/End: Original strand, 16026108 - 16026194
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttg 1108  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  16026108 tttaagttatttaattgtaataagttaatcatttacatttttttcgtacctcttaggtcctttaagttatttaactgtaataagttg 16026194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 192
Target Start/End: Original strand, 16231551 - 16231641
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 192  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16231551 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Original strand, 51752696 - 51752806
Alignment:
Q  470 ctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttct 569  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||  |    
T  51752696 ctacttttggcttgt--attcaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacat-aag-ttattattggtgtgattt--t 51752789  T
Q  570 catcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||||    
T  51752790 catcgaattcacaacaa 51752806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353192
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag-ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | |  ||||| ||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaa 379  Q
    ||| |||| ||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  14353146 ccctttgaaat--cttttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaa 14353192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 9522003 - 9522057
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522003 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 9522057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1197
Target Start/End: Complemental strand, 11017075 - 11016877
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcat-ttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattat 1099  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||| | |||  |||||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  11017075 gttaaattacactatatgtcctttaagttatttaattataataaattaatcttcttattttttttgcatatcacttaggtgttttaagttatttaattgt 11016976  T
Q  1100 aacaagttggtcctttaa--nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagtta 1197  Q
    ||||||||| | ||||||         ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||    
T  11016975 aacaagttgat-ctttaagttgtttttcgttccaattaggtcctttaaactatttaaccgtaacaatttgagagatttaaaatcttaaaaatgtaagtta 11016877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| || ||  ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
      || ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 c-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 26706274 - 26706207
Alignment:
Q  1192 aagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  26706274 aagttattcgaggcctaaaagttacaattaaataacttaaagaacctaagtgttacgaaaactactta 26706207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1117
Target Start/End: Original strand, 46530163 - 46530258
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| || |  ||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  46530163 tttaagttatttaattgtcacaaactggttctttaattctttttcgcaccacttaggtcttttaagttaattaattgtaacaagtttgccctttaa 46530258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959240
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag-ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| | |  |||||||| |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  332 cccattgatatc 343  Q
    ||| ||||||||    
T  49959229 ccctttgatatc 49959240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1110
Target Start/End: Original strand, 48130213 - 48130268
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggt 1110  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48130213 tttaagtttttt--gtaccacttagatcatttaagttaattaattgtaacaagttggt 48130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1016 - 1105
Target Start/End: Complemental strand, 48130516 - 48130428
Alignment:
Q  1016 aagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaag 1105  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  48130516 aagtcctttaaattatttaattgtaataaattgattatttaagttttct-tttaccatttaggtcttttaagttaattacttgtaacaag 48130428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1102
Target Start/End: Complemental strand, 363906 - 363806
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagt-cttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||   |||| ||| ||||||||  |||||| |||    
T  363906 taaattacaccagatgttcttttaagttatttaattgtaagaaatttgtcatttaagtatttttcgtaatgcttaagtcatttaagttgtttaattgtaa 363807  T
Q  1102 c 1102  Q
    |    
T  363806 c 363806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 590
Target Start/End: Original strand, 2232872 - 2232931
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt-ctcatcgaattcacaacaagttt 590  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  2232872 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggtttttctcaacgaattcacaacaggttt 2232931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1038 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 26706432 - 26706353
Alignment:
Q  1038 gtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtccttt-aagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26706432 gtaataaattgattctttaagtttttt-cgtatcatttaagtccttttaagttaattaattattacaagtttgtcctttaa 26706353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1105
Target Start/End: Complemental strand, 46530517 - 46530411
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatc-atttaag---ttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaatta 1098  Q
    |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||   |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  46530517 taaattacaccagatgtcattttagttatttatttgtaacaaattgctctttttaagttttttttttcgtaccactcacgtcatttaagttaattaattg 46530418  T
Q  1099 taacaag 1105  Q
    |||||||    
T  46530417 taacaag 46530411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 915 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 2125168 - 2125101
Alignment:
Q  915 taacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaatttttgt-agtttagttaagaaccatacaaaaa 981  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | || | |||||||||||||||||| ||||    
T  2125168 taacaaactttgagaaaattataaatttaaaaaaatcatggtgaatttagttaagaaccatacgaaaa 2125101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4144726 - 4144644
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctc--tcttcctttctctcttgctgttt 468  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  4144726 tctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgtgttctccttcttcctttatctcttgctgttt 4144644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144826
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 4144826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 366
Target Start/End: Original strand, 43104332 - 43104375
Alignment:
Q  323 ttcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43104332 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 43104375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 834209 - 834167
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  834209 tctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1212 - 1258
Target Start/End: Original strand, 18470384 - 18470430
Alignment:
Q  1212 ttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  18470384 ttacaattaaataacttaaaggatctaagttgtatgaaaaatactta 18470430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28220268 - 28220226
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28220268 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28265596 - 28265554
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28265596 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 549
Target Start/End: Original strand, 28841000 - 28841083
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | |  | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  28841000 tgttttctacttttggcttgtatttataacttt--catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccactcatcaagtt 28841083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 40122238 - 40122196
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122238 tctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 40122196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 49918476 - 49918518
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49918476 tctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 50167217 - 50167175
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167217 tctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaacaa 50167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 586
Target Start/End: Original strand, 13358894 - 13359012
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | |  | || |||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13358894 tgttttctacttttggcttgtatttataacttt--catacactttgattttggttgcttgactatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtg 13358990  T
Q  563 gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||  ||||||||||| ||||||    
T  13358991 attt--tcatcgaattcgcaacaa 13359012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997081
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagatt 14997081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 16026406 - 16026346
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16026406 tttaagtttttt-cgtacaacttacgctctttaagttacttaattgtaacaagttggtcctt 16026346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 18470495 - 18470439
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggt 1110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18470495 tttaagtttttt-cgtaccacttacgctctttaagttacttaattgtaacaagttggt 18470439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26520162 - 26520066
Alignment:
Q  391 tcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactaggtcaacaaat-tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26520162 tcccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttagcttgtgt 26520066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 47600648 - 47600499
Alignment:
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaat 1223  Q
    |||||||||| |||| | |||| |||||||  |||| |  ||| || ||||||||| |||||| |  |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||     
T  47600648 cgtaccaatttggtcatttaagttatttaatcgtaaaagtttgtggtatttcagatgttaaaaattgaagtaatttgggtcctaaaagttacaattaaac 47600549  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||  || ||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  47600548 aactcgaaagacctaagcattacgaaaaatacttaaatgactaatttgtt 47600499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 125)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 19007566 - 19008051
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19007566 ctataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagttt 19007665  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||     
T  19007666 gtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttggg 19007765  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  19007766 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagact 19007865  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  19007866 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctattcatttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 19007965  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19007966 atacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 19008051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 121 - 586
Target Start/End: Original strand, 28196582 - 28197046
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28196582 atcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacat 28196681  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  28196682 tagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatt 28196781  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28196782 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaac 28196879  T
Q  421 taggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttg 518  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||||||||||||    
T  28196880 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttg 28196979  T
Q  519 cttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  28196980 ctggactatcccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt-tcatcgaactcacaacaa 28197046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6264474 - 6263992
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||    
T  6264474 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagttt 6264379  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||    
T  6264378 gtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttgga 6264279  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  6264278 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 6264179  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||   ||||| |||    
T  6264178 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttcggcttgtgttaataattgttc 6264079  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||||| || |  |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6264078 catacactttgttttggttgcctgatagtcacttgctccacacatcaagtttgttattagtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 6263992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21520988 - 21520533
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21520988 gagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 21520889  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21520888 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 21520789  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21520788 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattc 21520689  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacttt-gttttggttgcttggttattc 529  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||  |||||||||| || ||||      
T  21520688 ttttgtgttctctcttcgtttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttaattttggttgcctgattatca 21520589  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21520588 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaa 21520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22287665 - 22287180
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22287665 ctataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtct 22287566  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     || ||     
T  22287565 gtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcggg 22287466  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | ||||||| |||||    
T  22287465 tagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagact 22287366  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||||    
T  22287365 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacgtttgacttgtttttataattgttcc 22287266  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22287265 atacactatgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 22287180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42923840 - 42923350
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42923840 ctataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagt 42923741  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  42923740 ttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttg 42923641  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||| | ||||||| | |    
T  42923640 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctata 42923541  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt--tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||||     
T  42923540 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattg 42923441  T
Q  496 ttccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || | || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  42923440 tttcatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttcacaacgaattcacaacaa 42923350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 17849043 - 17849528
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  17849043 ctataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagttt 17849142  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||     
T  17849143 gcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttggg 17849242  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| | |||||| || ||    
T  17849243 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg-ggggctgctctctcccacatac 17849341  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  17849342 taggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctcccgttgttttctacttttggcttgtgtttaaaattgttc 17849441  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17849442 catacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 17849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 105 - 585
Target Start/End: Original strand, 14837202 - 14837679
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtc 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  14837202 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtc 14837301  T
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 304  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||  |  |||   |||    
T  14837302 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtag 14837395  T
Q  305 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactag 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || | |||||||||||||||    
T  14837396 aattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactag 14837495  T
Q  404 gtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||  |    
T  14837496 gtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttatacttttggcttgtgtttataattgttctat 14837595  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagt-ttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  14837596 acactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtattgttattgatgt-gatttctcatcgaattcacaaca 14837679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 102 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 6259144 - 6258666
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  || ||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6259144 ctataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagttt 6259045  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||     
T  6259044 gtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggctttggg 6258947  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||| ||||| ||    
T  6258946 tagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatac 6258848  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  6258847 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttagcttgtgtttataattgttc 6258748  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 581  Q
    |  | |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6258747 cagacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtat-gttttctcatcgaattcac 6258666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Original strand, 3022089 - 3022584
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3022089 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 3022188  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |     
T  3022189 gtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttagg 3022288  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----------tatagtgaaacgaatgactgttttct 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||          |||| ||||||  ||| ||| | |||    
T  3022289 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctct 3022387  T
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |     
T  3022388 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctcgttgttttctgcttttggcttgtgttta 3022487  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  3022488 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttatttgtgt-gatctctcaccgaattcacaacaag 3022584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Original strand, 27104725 - 27105206
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27104725 ctataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 27104824  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  27104825 gtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 27104923  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  27104924 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 27105022  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  || |||||    
T  27105023 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgcattta 27105119  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27105120 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattc 27105206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 104 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979437
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | ||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact-gttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||  | | | |||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||          ||   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||| |    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt----------ttgtgttctctctcgctgttttctacttttgacttatgtttataattgttccat 34979517  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34979516 acactttattttggttgctttattattccttactccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaattcaca 34979437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 45280314 - 45279848
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaac-gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45280314 ctataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 45280215  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||    
T  45280214 tgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 45280115  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||    
T  45280114 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 45280015  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  45280014 taggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttcca 45279925  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45279924 tacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaattc 45279848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40032387 - 40031968
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40032387 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 40032288  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||     
T  40032287 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttggg 40032188  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc----cttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||||||||| ||||||||||| | | | | | |||||| |    
T  40032187 tagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctc 40032088  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |||||||| | |||    
T  40032087 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttccttttctctcgctgttgttttctacattt-gcttgtgtttataa 40031989  T
Q  493 ttattccttatactttgtttt 513  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  40031988 ttgttccatatactttgtttt 40031968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 127 - 549
Target Start/End: Original strand, 17848394 - 17848814
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17848394 gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttggg 17848493  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  17848494 tttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattc 17848590  T
Q  326 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17848591 ttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggt 17848689  T
Q  426 caacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||| || | ||||| || | || |||  | |||||||||||||    
T  17848690 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctactttttgtttgcgtttataattgtttcatacactgcgattttggttgcttg 17848787  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtt 549  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  17848788 attatcacttgctccacacatcaagtt 17848814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 43623897 - 43623423
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43623897 ctataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 43623798  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  43623797 gtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 43623710  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||| |||    
T  43623709 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaact 43623610  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||    
T  43623609 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttatgattataattgttc 43623510  T
Q  499 cttatacttt-gttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || |||||  |||||||||| || ||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  43623509 catacactttaattttggttgcctgattatctattgctccacacatcaagttagttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 43623423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13910373 - 13909908
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13910373 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 13910274  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |||||     
T  13910273 gtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttggg 13910174  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | |  ||| ||| | |||||||||||||    
T  13910173 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagact 13910075  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13910074 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 13909978  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13909977 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtg 13909908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 44289370 - 44288982
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289370 aaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggttt 44289271  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  || || |||||||| | || | |||||||||||    
T  44289270 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttg 44289171  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||  || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44289170 taacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtca 44289071  T
Q  428 acaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttg 514  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || | || |||||||||||    
T  44289070 acaaattcttttgtgttctctcttcatttctctctcgctgttttctactgttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttg 44288982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11739889 - 11739553
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  11739889 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagttt 11739790  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||  |||||     
T  11739789 gtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttggg 11739690  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  11739689 tagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagac 11739590  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11739589 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11739553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 23452532 - 23452093
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  23452532 gagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 23452433  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452432 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 23452333  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23452332 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 23452233  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |    
T  23452232 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttagct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgat 23452136  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  23452135 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 23452093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19502340 - 19502005
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19502340 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagttt 19502241  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  19502240 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 19502141  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||||||    
T  19502140 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagact 19502041  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19502040 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 19502005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19504674 - 19504340
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19504674 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 19504575  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  19504574 gtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggactttggg 19504476  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  19504475 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagact 19504376  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19504375 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 19504340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31733094 - 31732631
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31733094 ctataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 31732995  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||            || ||  |||||     
T  31732994 gtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttggg 31732907  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  31732906 tagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagac 31732807  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||   ||||     
T  31732806 taggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattcgtgtgttctctat--cttt-tctctcgctgttttctacttttggtttgtgattataa--cttcca 31732712  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||     ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31732711 tacactctgttttggttgcttgattataacttgcttcacacatcaa----attattcgtgtgattttttcatcgaattcacaaca 31732631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 549
Target Start/End: Original strand, 42064441 - 42064878
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064441 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 42064540  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||||    
T  42064541 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgga 42064640  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  42064641 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 42064739  T
Q  402 aggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||           ||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||    
T  42064740 aggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct-----------tcttgccgttgttttctactttttgcttgt--atttaattgtt 42064826  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtt 549  Q
    || || |||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  42064827 ccatacactttgttttagttgcttgatcatcccttgctccacacatcaagtt 42064878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11578433 - 11577957
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11578433 ctataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtatagaattt 11578335  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||     
T  11578334 ttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttggg 11578239  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| | | ||| | | ||||||||||    
T  11578238 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagac 11578139  T
Q  401 taggtcaatttg-gaccgaactaggtcaacaaatt-cttgcgttctctcttc-ctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||   ||    
T  11578138 tagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctcttttctttctctcgt--tgttttctacttttggcttgtg--tttaa-actt 11578044  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  11578043 ccatatactttattttggttgcttgattattacttgttccacacatcaagttt-ttattaatgtgattttttcatcgaattcacaaca 11577957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 103 - 437
Target Start/End: Original strand, 42452710 - 42453041
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  42452710 tataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttg 42452809  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| |    
T  42452810 tctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 42452907  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||    
T  42452908 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagacta 42453006  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42453007 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42453041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45239310 - 45239000
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 196  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || | ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  45239310 ctataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 45239211  T
Q  197 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45239210 actttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtt 45239112  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||    
T  45239111 tttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 45239012  T
Q  397 agactaggtcaa 408  Q
    ||||||||||||    
T  45239011 agactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 186 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459038
Alignment:
Q  186 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  286 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 384  Q
    || || ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  385 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggctt 482  Q
      | |||  || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--cctgttttctacttttggttt 28459139  T
Q  483 gtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    |||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  28459138 gtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtgttttattggtgtgattt--tcatcgaattcaca 28459041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24162541 - 24162063
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24162541 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24162442  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          | ||  |||||     
T  24162441 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttggg 24162352  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||| | |||||||| ||||    
T  24162351 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggact 24162253  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctt---tctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||   | | ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24162252 aggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtttttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 24162155  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || | || ||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  24162154 ttgtttcatacacttttttttggttgcttgattatctctttctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgtattcacaaca 24162063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 226 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375218
Alignment:
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  326 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  426 caacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttg 522  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctgtttttttacttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttgattgcttg 5375252  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttatt 556  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5375251 attatcccttactccacacatcaagtttgttatt 5375218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215450
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 35215682  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  35215681 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 35215583  T
Q  434 tc-ttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattc 529  Q
    || ||| ||||| ||||   |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||| |    
T  35215582 tctttgtgttct-tcttttgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattatttcatatgctttgttttggttgcttaattatcc 35215487  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35215486 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 35215450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15539804 - 15539553
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15539804 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 15539705  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  15539704 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttggg 15539605  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15539604 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217827
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
     ||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  35218058 gttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 35217960  T
Q  434 tc-ttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattc 529  Q
    || ||| ||||| ||||   |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||      
T  35217959 tctttgtgttct-tcttttgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatct 35217864  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35217863 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 35217827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 312 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707594
Alignment:
Q  312 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc--cagactaggtcaat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||| ||  ||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  410 ttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactt 507  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||| || ||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttctgccttgtgtttataattgttccatacactt 22707673  T
Q  508 tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22707672 tgttttggttgcttgattgttccttactccacacatcaaatttgttattggtgtggttttctcatcgaattcgcaacaa 22707594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 302 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22407583 - 22407361
Alignment:
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  22407583 tagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 22407484  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22407483 aggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgatgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 22407384  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttg 522  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  22407383 atacactttgttttggttgcttg 22407361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18800631 - 18800266
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||          || ||||||||||||||||| ||    
T  18800631 ctataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggtt 18800540  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||     
T  18800539 g-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttggg 18800444  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | | ||  | ||| ||||||||    
T  18800443 tagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct-ccccagac 18800345  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
     ||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18800344 caggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct-tc-tgctgttttctacttttg 18800266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 171 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897125
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 17897407  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 369  Q
    |||||| | | ||| |||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17897406 cttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattata 17897307  T
Q  370 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgtt 467  Q
    ||  |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  | ||||    
T  17897306 gtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgtt 17897210  T
Q  468 ttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattg 557  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| | |  | |  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  17897209 ttctactttt-gcttgtgtttataactgt--catcaactttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattg 17897125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 454
Target Start/End: Original strand, 22874095 - 22874411
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  22874095 aaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt- 22874184  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  || ||| | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  22874185 --gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttg 22874282  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |   ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22874283 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaa 22874382  T
Q  428 acaaat--tcttgcgttctctcttccttt 454  Q
    ||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  22874383 acaaattctcttgtgttctctctttcttt 22874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36560980
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36561125 tcttcttcttttgttcttctcgcagttgttttctactttttggct--cgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattattccttgctc 36561028  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36561027 cacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 36560980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 311 - 578
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871222
Alignment:
Q  311 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  || | ||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat--tattccttatact 506  Q
    |||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  | || | || |||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttcatttctctcccgctgttttctacttttgccttgtgtttataattgtttttcatacact 23871150  T
Q  507 ttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    |||||||||||  ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23871151 ttgttttggttatttaattgttccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtagttttctcatcgaatt 23871222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146540
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtct 20146770  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 369  Q
    |||||| ||| ||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20146769 cttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20146670  T
Q  370 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgtt 467  Q
    ||| |||| | | ||| | |||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || ||| || | |||||||| |||| ||||| | ||||    
T  20146669 gtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctctttcttt-tctctcgttgtt 20146571  T
Q  468 ttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  20146570 ttctactttt-gcttgtgtttataattgttcc 20146540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22163276 - 22163106
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22163276 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagttt 22163177  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 273  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163176 gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 302 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462789
Alignment:
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  402 aggtcaattt-ggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||     ||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttctctttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgt 7462878  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | | || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7462877 ttcatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttatcgatgtggttttctcaacgaattcgcaaca 7462789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558721
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||     
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc- 36558850  T
Q  445 ctcttcctttctctcttgctgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatat 543  Q
            ||||| |  | |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  36558849 --------ttctcgc-agttgttttctactttttggct--cgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacat 36558761  T
Q  544 caagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36558760 caag-ttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 36558721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 345 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22163108 - 22162869
Alignment:
Q  345 cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgtt 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||    
T  22163108 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 22163009  T
Q  443 ctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacata 542  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||| | |||| || | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  22163008 ctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgcttataactgttccatacaatttgttttggttgcttgattatcccttgcttcacaca 22162911  T
Q  543 tcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22162910 tcaaaattgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaaca 22162869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 4559007 - 4558769
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacg-taccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannn 1120  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||       
T  4559007 tttaagttatttaattgtaataaattgatc-tttaagttttttttggtacaacttaggtactttatgttaattaattgtaacaagttgttcctttaagtt 4558909  T
Q  1121 nnnnc-gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaat 1218  Q
        | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4558908 ttgtctgtaccaattaggtcctttaagctatttaaccgtaactatttgaggtattttagatcttaaaaatgcaagttattcatggcctaaaagttacaat 4558809  T
Q  1219 taaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4558808 taaataaattaaaagacctaagtgttacgaaaaatactta 4558769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 248 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22407738 - 22407591
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22407738 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 22407639  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407638 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1254
Target Start/End: Complemental strand, 8198759 - 8198509
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  8198759 taaattataccagaaatcctttaagttagttaattgtaacaaattggtc-tttaagttttttccgtaccacttaggtcctttaagataattaattgtaat 8198661  T
Q  1103 aagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcg 1201  Q
    ||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  8198660 aagttggccctttaagttttttccgtaccaattaggtcctttaagttatttaaccgtaacaatttaggggatttcagatcttaaaaatgtaagttagttg 8198561  T
Q  1202 ggacct-aaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaata 1254  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  8198560 gagcctaaaagtttcaattaaataacttaaa--acctaagtgttaagaaaaata 8198509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1254
Target Start/End: Complemental strand, 8203519 - 8203269
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  8203519 taaattataccagaaatcctttaagttagttaattgtaacaaattggtc-tttaagttttttccgtaccacttaggtcctttaagataattaattgtaat 8203421  T
Q  1103 aagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcg 1201  Q
    ||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  8203420 aagttggccctttaagttttttccgtaccaattaggtcctttaagttatttaaccgtaacaatttaggggatttcagatcttaaaaatgtaagttagttg 8203321  T
Q  1202 ggacct-aaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaata 1254  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  8203320 gagcctaaaagtttcaattaaataacttaaa--acctaagtgttaagaaaaata 8203269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37963256 - 37962938
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||| || |||||    
T  37963256 ctataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtgtatagttt 37963165  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||     
T  37963164 g-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttggg 37963069  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||| |||| |||||| |||||||||||    ||||| | |||| |||| ||    
T  37963068 tagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacac 37962972  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37962971 taggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 459
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699660
Alignment:
Q  232 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  331 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 428  Q
    | || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  | |  || | | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  429 caaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctc 459  Q
    |||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  40699629 caaatttcgtgtgttctctctttctttctctc 40699660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 407 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539397
Alignment:
Q  407 aatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttata 504  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||  || |    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctactttttgcttgtgtttataattgttcaataca 15539454  T
Q  505 ctttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15539453 ctttgttttgattgctt-gataatccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 15539397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 469
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107590
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg--ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-ta 367  Q
    |||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||     | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaacct-ttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T
Q  368 tagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa--attcttgcgttctctcttcctttctctcttgct 464  Q
    ||||| |||| |||  |||| |||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||    
T  35107487 tagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctttcttt-tctctcgct 35107585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  186 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 285  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  286 agattagggttttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactc 361  Q
    | ||| ||  ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377629
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 231  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 462 - 567
Target Start/End: Original strand, 38020368 - 38020473
Alignment:
Q  462 gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgt 561  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  38020368 gctgttttctacttttagcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccatacatcaaatttgttattggtgt 38020467  T
Q  562 ggtttt 567  Q
    | ||||    
T  38020468 gatttt 38020473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 366
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatccctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  348 ttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Original strand, 20592291 - 20592484
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt-cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| | | | |||||||| | || |||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||| ||||||     
T  20592291 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctct--tgatattttctacttttg-cttgtga 20592387  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     | ||| |  ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20592388 ttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctctacacatcacgtattttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 20592484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Original strand, 38020069 - 38020157
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 190  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38020069 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 286
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139484
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 43139484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1086
Target Start/End: Original strand, 45385838 - 45385921
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaa 1086  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45385838 taaattacaccataggtcctttaagttatttaattgtaacaaattggccctttaagtttttttcgtaccacttacgtcctttaa 45385921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583480
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 27583480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 366
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tttggatagaattaggcggga-gacttattcttgt 329  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  330 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19504291 - 19504177
Alignment:
Q  468 ttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttt 566  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |  ||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  19504291 ttctacttttggcttgtatttataact--tccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt 19504195  T
Q  567 tctcatcgaattcacaacaa 586  Q
      ||||||||||||||||||    
T  19504194 --tcatcgaattcacaacaa 19504177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Original strand, 22874439 - 22874519
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22874439 actttgttttagttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 22874519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45332098 - 45332019
Alignment:
Q  505 ctttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45332098 ctttgttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 45332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 587
Target Start/End: Original strand, 17462714 - 17462769
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462714 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaag 17462769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19501958 - 19501842
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| |  ||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  19501958 ttttctacttttggcttgtatttataact--tccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgat 19501862  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||  ||||||||||| ||||||    
T  19501861 tt--tcatcgaattcgcaacaa 19501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1117
Target Start/End: Original strand, 4923428 - 4923542
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||     
T  4923428 taaattacaccggatgtctcttaagttttttaattataataaattgatcatttatgttttttccgtaccatttaggttttttacgttaataaattgtaat 4923527  T
Q  1103 aagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||  ||||||||    
T  4923528 aagttaatcctttaa 4923542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11739501 - 11739420
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||  || ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11739501 actttgtttttatttcttgactatcccttgctctacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 11739420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12342739 - 12342681
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg 160  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12342739 ctataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagg 12342681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 17943813 - 17943867
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17943813 ttgctccacgcatcaagtttgttattggtgtgtttttctcaacgaattcacaaca 17943867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 290
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345718
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatt 26345718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Original strand, 42453818 - 42453891
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  42453818 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 42453891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 915 - 982
Target Start/End: Original strand, 8265959 - 8266027
Alignment:
Q  915 taacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaatt-tttgtagtttagttaagaaccatacaaaaaa 982  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  8265959 taacaaaatttgagaaaattataaatttaaagaaattgtatgtagttaagttaagaatcatacgaaaaa 8266027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028688
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagatt 35028688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 42923347 - 42923292
Alignment:
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  42923347 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttcacaacgaattcacaacaa 42923292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38414156 - 38414027
Alignment:
Q  455 ctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgtta 554  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||| |  ||||  | ||||||||| | ||| ||||||     
T  38414156 ctctctcgttgttttctacttttaccttgtgtttataattattccatacactttgttttcgttgcctaattatcacgtgctccacacaccaattttgtt- 38414058  T
Q  555 ttggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  38414057 ttggtgtgatttt-tcatggaattcacaacaa 38414027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1117
Target Start/End: Original strand, 42053964 - 42054059
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||| |   || ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  42053964 tttaagttatttagttataataagttaatcctttaagttttgtttatatcacttaggttctttaagttgtttaattttaacaagttagtcctttaa 42054059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1177 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 6739554 - 6739472
Alignment:
Q  1177 agatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaagtt-acaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    ||||||||||| || |||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  6739554 agatcttaaaaatgtaagttattagaggcttaaagtttacaattaaataacttaaatgacctaaatgttacaaaaaatactta 6739472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17057411 - 17057369
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057411 tctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17085394 - 17085352
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085394 tctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1111
Target Start/End: Complemental strand, 3289531 - 3289442
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtc 1111  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||  ||| ||||||  || ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  3289531 tttaaattatttaattgtaataaattggtcttttaagttttttttgtatcacttaaatcttttaattgaattaattgtaacaagttggtc 3289442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45238986 - 45238841
Alignment:
Q  440 gttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct-tatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctcc 537  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||  | |  |||| | |||||||||||||  |||  |||| |||    
T  45238986 gttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgattataactgttgatatccacttcgattttggttgcttgactatcgcttggtcc 45238889  T
Q  538 acatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  45238888 acacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 45238841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20054665 - 20054609
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgtt-attggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20054665 ttgctccacgcatcaagtttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 20054609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1213 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 42054102 - 42054042
Alignment:
Q  1213 tacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||    
T  42054102 tacaattaaataacttaaagaacctaagtgataggaaaaatacttaaaggactaacttgtt 42054042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 20049921 - 20049866
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgtt-attggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20049921 ttgctccacgcatcaagtttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 20049866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22712426 - 22712374
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22712426 ttgctccacgcatcaagttt--tattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 22712374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27517543 - 27517491
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27517543 ttgctccacgcatcaagttt--tattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 27517491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 33670859 - 33670817
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33670859 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 33670817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575265
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 34575265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 723786 - 723744
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  723786 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736243
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2736243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 586
Target Start/End: Original strand, 2736503 - 2736537
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2736503 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 2736537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2740979
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2740979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1005 - 1071
Target Start/End: Original strand, 4558680 - 4558745
Alignment:
Q  1005 aattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtacc 1071  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  4558680 aattacacgataattctcttaagttatttaattgtaataaattggtc-tttaagtttttttcgtacc 4558745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1245
Target Start/End: Complemental strand, 4923607 - 4923553
Alignment:
Q  1192 aagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgtta 1245  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4923607 aagttattcggaacctaaaagttgcaattaaataacttaaagtacctaagtgtta 4923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1080
Target Start/End: Original strand, 8198419 - 8198477
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtc 1080  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8198419 tttaagttatttaattgtaataaattggttctttaaatttttttcgtaccacttaggtc 8198477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1080
Target Start/End: Original strand, 8203179 - 8203237
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtc 1080  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8203179 tttaagttatttaattgtaataaattggttctttaaatttttttcgtaccacttaggtc 8203237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 11067431 - 11067473
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067431 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11151633 - 11151591
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11151633 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462474
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17462474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054909
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22717116 - 22717082
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22717116 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 22717082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720684
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag-ggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 330  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  331 acccattgatatcccttttgtaaggttact 360  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| ||||||    
T  30720711 accctttgaaat--cttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33162492 - 33162450
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33162492 tctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 34139812 - 34139770
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34139812 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37962841 - 37962788
Alignment:
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 588  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37962841 ctccacacatcaagtttattattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaagt 37962788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 39284962 - 39285004
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39284962 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680083
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687021
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 39687021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 1345592 - 1345641
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1345592 tctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 1345641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 2838081 - 2838130
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2838081 tctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 2838130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503032
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatt 7503032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 533 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22405821 - 22405769
Alignment:
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  22405821 gctccacacatcaagtttgttattgatgt-gttttctcgttgaattcacaacaa 22405769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1076
Target Start/End: Complemental strand, 32546538 - 32546464
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagtt-ttttacgtaccactta 1076  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32546538 gttaaattacaccagaggt--tttaagttttttaatcgtaataaattgatcatttaagttatttttcgtaccactta 32546464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 38020312 - 38020349
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020312 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 168)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1627010 - 1626525
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1627010 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1626911  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||     
T  1626910 atctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttggg 1626811  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||| ||||||||    
T  1626810 tagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagact 1626711  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  1626710 aggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgtttttcacttttgacttgtgtttataattgttcc 1626611  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  1626610 atacactttgtttttgttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttcttatggaattcgcaaca 1626525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 3314614 - 3315101
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3314614 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3314713  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||     
T  3314714 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttggg 3314813  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  3314814 taaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaac 3314913  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  3314914 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacgtttggcttgtgtttataattgttc 3315013  T
Q  499 cttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3315014 catacactttgcttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaa 3315101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43421742 - 43421259
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43421742 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgttt 43421643  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||     
T  43421642 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttggg 43421543  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||    
T  43421542 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagact 43421443  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  43421442 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttatacttttggcttgtgtttataattgttcc 43421345  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  43421344 atacactttgttttggttgcttgactatatcttgctccacacatcaactttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 43421259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43423790 - 43423307
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423790 ctataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 43423691  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  43423690 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 43423591  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||| | ||||||  |||||    
T  43423590 tagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagact 43423491  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  43423490 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 43423393  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  43423392 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaactttgttattggtgtaatttt-tcatcgaattcgcaacaa 43423307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 1313340 - 1313822
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1313340 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1313438  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||     
T  1313439 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttggg 1313538  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  1313539 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 1313638  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  1313639 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttcc 1313736  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  1313737 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaattcgcaaca 1313822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 102 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5927091 - 5926611
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5927091 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 5926992  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |     
T  5926991 gtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttgg 5926892  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  5926891 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagact 5926792  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  5926791 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctcttttcctttctctctcgttgttttctactttt-gcttgtgtttataattgttcct 5926693  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  5926692 tacactttgttttggttacttgattattccttacttcacacatgaagtttgttattggtgtgagttt-tcatcgaattcacaa 5926611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53917991 - 53917505
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53917991 ctataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 53917892  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||     
T  53917891 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttggg 53917792  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  53917791 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 53917692  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  53917691 aggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttt 53917592  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||    
T  53917591 catacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttt-tcatcgatttcgcaacaa 53917505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 880779 - 880302
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  880779 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttc 880680  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  880679 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgg 880580  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | ||| | ||||||| ||||    
T  880579 gtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagac 880480  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||  | ||| | |||    
T  880479 taggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggtttgtgattataactgttc 880382  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  880381 catacactttgttttggttgcttgattaatccttgctccacacatcaagtttgttatgggtgtgattttttcatcgaatt 880302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 127 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28102304 - 28101847
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28102304 gtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 28102205  T
Q  227 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28102204 ttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 28102105  T
Q  327 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28102104 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtc 28102005  T
Q  427 aacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttgg 523  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |  |  |||||| |||||||||||||     
T  28102004 aacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgggttgtg--tttaat--tgctatccactttgattttggttgcttga 28101909  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28101908 ttatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtaatttt-tcatcgaattcacaacaa 28101847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4308608 - 4308122
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308608 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 4308509  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||     
T  4308508 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttggg 4308409  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| |||||    
T  4308408 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagact 4308309  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  4308308 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgtt 4308209  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4308208 ccatacactttgttttggttgttggattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 4308122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 555
Target Start/End: Original strand, 51943301 - 51943758
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51943301 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 51943400  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |     
T  51943401 gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttagg 51943500  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||    
T  51943501 tagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatact 51943599  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  51943600 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 51943699  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttat 555  Q
    |||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51943700 tccaaacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttat 51943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 53468782 - 53468302
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  53468782 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagttt 53468684  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||  |||||     
T  53468683 gtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttggg 53468584  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag-- 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |  |||||||      
T  53468583 taaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagac 53468484  T
Q  399 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  53468483 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctattttctacttttgacttgtgtttataattgt 53468384  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    ||| || |||||||||||| ||||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468383 tccatacactttgttttggctgctccattattcattgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 53468302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 53915823 - 53915338
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  53915823 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagatttt 53915724  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  53915723 gtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 53915624  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  53915623 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 53915524  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  53915523 aggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttt 53915424  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  53915423 catacacttggttttggttgcttgactatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 53915338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Original strand, 45882869 - 45883350
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  45882869 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagatttt 45882968  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||     
T  45882969 gtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttggg 45883068  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||| ||||    
T  45883069 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctagac 45883168  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||     
T  45883169 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctcttgctgttttctacttctggcttgtgattataattg 45883268  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    |||| || ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45883269 ttccatacactttgttttggttgcttaactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaatt 45883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 24979637 - 24980126
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24979637 ctataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24979736  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||     
T  24979737 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttggg 24979836  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||    
T  24979837 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaac 24979936  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  24979937 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgttgttgtttttctacttttggcttgtgtttataattg 24980036  T
Q  496 ttccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| || |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24980037 ttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaaca 24980126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 43226016 - 43226496
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  43226016 ctataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagttt 43226114  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  43226115 gtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 43226214  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| |||||    
T  43226215 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagact 43226314  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgt--tttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  43226315 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttctctcttccttt-tctctcgctgttgtttctacttttggcttgtat-tttaattgttcc 43226412  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  43226413 atacac-ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaattcgcaacaa 43226496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 136 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101026
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 27101175  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcc 530  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||     
T  27101174 ttttgtgttctctcttccttt-tctcttgctgttgttttctactttttgcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattca 27101076  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 581  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  27101075 ttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcac 27101026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 101 - 585
Target Start/End: Original strand, 39715399 - 39715883
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39715399 gctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtt 39715497  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  39715498 tgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 39715597  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||  ||   ||||||||| ||    
T  39715598 gtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatac 39715693  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctc-ttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  39715694 tagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 39715793  T
Q  498 ccttatactt--tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||  | |||| ||| || |  ||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39715794 ccatacactttatttttttgttactagactatcccttactgtacacatcaagtttgttattggtgcggttttctcatcgaattcacaaca 39715883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 51675082 - 51674608
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||             
T  51675082 ctataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt--------- 51674992  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
      | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  51674991 --ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttgga 51674894  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | | ||| | ||||||||| ||     
T  51674893 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccatacc 51674794  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||    
T  51674793 aggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttatatttgttcc 51674694  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     ||  |  |  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51674693 atacccacttgtttggttgcttgattattccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaattcacaaca 51674608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18099463 - 18099009
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18099463 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18099364  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099363 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18099264  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18099263 ttgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattc 18099164  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattc 529  Q
      ||| ||||||| || ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| || |||||| |||| |||||||| |||| |    
T  18099163 ttttgtgttctct-tttctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttacaattgttccatacactttgatttttgttgcttgattatcc 18099065  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18099064 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcccaacaa 18099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 18097193 - 18096740
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18097193 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18097094  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18097093 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccta 18096994  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18096993 ttgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattc 18096894  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattc 529  Q
      ||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||| || |||| |    
T  18096893 ttttgtgttctctctt-ctttctctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcc 18096795  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  18096794 cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtaatttt-tcatcgaattcgcaaca 18096740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 576
Target Start/End: Original strand, 43228221 - 43228696
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43228221 ctataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagttt 43228320  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  43228321 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 43228420  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  43228421 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 43228520  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttccttt-ctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||    
T  43228521 aggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttactctcgctgttgttttctaattttggcttgtat-tttaattgtt 43228619  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaa 576  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43228620 ccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaa 43228696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148745
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149088 tgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47148990  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47148989 attgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T
Q  435 ct--tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
     |  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||         
T  47148889 attctgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgattat----- 47148795  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  47148794 --cccacacatcaagtttgttattggtgtgagttt-tcatcaaattcacaaca 47148745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12268293 - 12267819
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaat-ctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12268293 ctataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtt 12268194  T
Q  201 tgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  12268193 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttg 12268094  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| |    
T  12268093 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaa 12268005  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  12268004 ctagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 12267906  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  12267905 ccatacactttgttttggttgcttgactattccctgctccacacatcaaatttgttattggtgtaatttt-tcatcgagttcacaaca 12267819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10956354 - 10955867
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10956354 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 10956255  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  10956254 gtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 10956155  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||| |||||||    
T  10956154 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagact 10956055  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10956054 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 10955958  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  10955957 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 10955867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990718
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 42990567  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcc 530  Q
      ||| ||||||||| | ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || |||||||||||||||| || |||| ||    
T  42990568 ttttgtgttctctctccttttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataacttacatacactttgttttggttgcctgattatccc 42990664  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  42990665 ttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 42990718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 134 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 32264334 - 32263881
Alignment:
Q  134 ttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32264334 ttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 32264235  T
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32264234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacc 32264135  T
Q  334 cattgatatccctttt-gtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| | | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  32264134 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T
Q  432 at-tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcc 530  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  || ||||  |    
T  32264034 ttcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtctgattatcac 32263935  T
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  32263934 ttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgatttt-tcttcgaattcacaaca 32263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 36011757 - 36012243
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  36011757 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagttt 36011856  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  36011857 gtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttggg 36011956  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | ||| |  ||||||    
T  36011957 tagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagact 36012056  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||    
T  36012057 aggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttcgcttgtgtttataattgtt 36012156  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  36012157 ccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 36012243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 185 - 585
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484773
Alignment:
Q  185 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  284 agagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgac 383  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  384 tgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggct 481  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt--attctctctcgctgttttctacttttgact 6484669  T
Q  482 tgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattca 580  Q
    ||||| | ||||| |||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | || |||||||    
T  6484670 tgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgatttt-ttattgaattca 6484768  T
Q  581 caaca 585  Q
    |||||    
T  6484769 caaca 6484773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604447
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattc 9604601  T
Q  436 --ttgcgttctc---tcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattc 529  Q
      ||| ||||||   ||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||  | ||||| || | || |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  9604600 ttttgtgttctctcttcttcttttctctcgctgttgttttctatttttggcctgtgattataattgtttcatacactttggtttggttacttgattattc 9604501  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  9604500 cttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 9604447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 54691900 - 54691416
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54691900 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagttt 54691802  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||| ||||      
T  54691801 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgag 54691702  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||| |||||    
T  54691701 ttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccctagact 54691602  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    | ||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  54691601 atgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttcctttctctctcggttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttt 54691502  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54691501 catacattttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacat-aaatttgttattgatgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 54691416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 51727333 - 51726846
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51727333 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagttt 51727234  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |  |  |||||     
T  51727233 gtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttggg 51727135  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  51727134 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagact 51727035  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51727034 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 51726938  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  51726937 attgttccatacactttgattttggttgcctgattatt-cttgccccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 51726846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10958650 - 10958162
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10958650 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 10958551  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |     |||||     
T  10958550 gtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttggg 10958451  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  10958450 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 10958351  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10958350 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 10958254  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  10958253 attgttctatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 10958162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 18162594 - 18163081
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | |||||| | |||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18162594 ctataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18162691  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  18162692 tgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 18162791  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||    
T  18162792 gtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 18162891  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||     
T  18162892 ctaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttctttttctctcgctgcagttttctacttttggcttgtgtttataattg 18162990  T
Q  496 ttccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| || |||||| |||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  18162991 ttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttactccacacatcaaatttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcataacaa 18163081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 136 - 562
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890437
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38890303  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| |    
T  38890304 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttgat 38890400  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38890401 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 38890437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 48361997 - 48361511
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48361997 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 48361899  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |     
T  48361898 gtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttgg 48361799  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |   ||| | |||||||||||||    
T  48361798 tagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagact 48361699  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||| | ||||||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  48361698 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgttgttttctacttttgacttgtgattataattgt 48361599  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgt-ggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | || ||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||    
T  48361598 tccatacactttgttttggttgcttgattattcattgttccatacattaagtttgttattgatgtaagtttttccatcgaattcacaa 48361511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 103 - 586
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219504
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||      
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagact 32219314  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  32219315 atgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 32219414  T
Q  498 ccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32219415 ccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 32219504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 176 - 587
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321899
Alignment:
Q  176 acaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 275  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  276 ttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaa 375  Q
    ||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  376 cgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tg 465  Q
    || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttg 1321781  T
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtt 565  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1321782 ttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatt 1321879  T
Q  566 ttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    |  ||||||||||| |||||||    
T  1321880 t--tcatcgaattcgcaacaag 1321899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Original strand, 5191617 - 5192053
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  5191617 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 5191716  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5191717 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaaccca 5191816  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | |  | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5191817 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 5191914  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  5191915 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 5192011  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5192012 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 5192053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533843
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25533606 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattc 25533705  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  25533706 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgctt-gatatctcttgct 25533794  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25533795 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 25533843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Original strand, 11170334 - 11170669
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11170334 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11170433  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  ||| |     
T  11170434 gtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttagg 11170533  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  11170534 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 11170633  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11170634 aggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattctt 11170669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 53591125 - 53591598
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||               
T  53591125 ctataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----------- 53591213  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||     
T  53591214 gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttggg 53591313  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||    
T  53591314 tagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccccagact 53591412  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa----attcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||     || |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||| | ||||| ||    
T  53591413 aggtcaatttggatcgaactaggtcaacaattttttttttgtattctctcttcttttctctc--gctgttttctgcttttgacttatgtttataattgtt 53591510  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || || | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  53591511 ccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgttccacacatcaaatttgttattgatgt-gttttctcattgaattcacaacaa 53591598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 148 - 586
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389327
Alignment:
Q  148 gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 247  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-g 25388980  T
Q  248 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc- 25389079  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttc- 443  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||     
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T
Q  444 tctcttcctttct-ctctt------gctgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||||||| ||| |  ||||      | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25389180 tctcttcttttgtattcttctcgccgttgttttctactttttggct--tgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 25389277  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  25389278 ccacacatcaag-ttgttattggtatgattttttcatcgaattcacaacaa 25389327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084244
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-- 433  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  10084482 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 10084383  T
Q  434 tcttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    | ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||    
T  10084382 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtcccatacactttgttttggttgcttgatt 10084286  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10084285 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 10084244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28761755 - 28761287
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28761755 ctataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagttt 28761656  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |  ||| |     
T  28761655 g-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttagg 28761557  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  28761556 tagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagac 28761457  T
Q  401 taggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||          ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||  | ||||  ||||    
T  28761456 taggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattctt----------ttgttttctctc--gttgttttctactttt-gcttgtgattataat--ttcc 28761372  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28761371 atacactttattttggttgtttgattatcacttgctccacacatcaagattattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 28761287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 478
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006151
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30006104  T
Q  436 --ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttg 478  Q
      ||| |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||    
T  30006105 ttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttg 30006151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 15780790 - 15781293
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15780790 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 15780889  T
Q  202 gt-----------ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||           ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  15780890 gtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggct 15780989  T
Q  291 agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat----cccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgac-- 383  Q
      |  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| | |      
T  15780990 gagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgc 15781089  T
Q  384 -tgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgtt--ctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggc 480  Q
     || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  15781090 ctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttgac 15781189  T
Q  481 ttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattca 580  Q
    |||||| | ||| | |||| || ||||| |||||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15781190 ttgtgtttataactgttccatacactttattttgcctgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttc-catcgaattca 15781288  T
Q  581 caaca 585  Q
    |||||    
T  15781289 caaca 15781293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Original strand, 3859458 - 3859932
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3859458 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3859557  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  3859558 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 3859657  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  3859658 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccccagact 3859756  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |    
T  3859757 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggcttgtat-tttaattgtttcat 3859847  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    | ||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  3859848 acactttgttttggttgcttaactatcccttattccacacatcaag-ttgttattggtgtgacttttcgatcgaattcacaacaag 3859932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 746721 - 747177
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  746721 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 746820  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746821 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 746920  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  746921 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 747019  T
Q  435 --cttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
       ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || |||||| |||||||||||||    
T  747020 tctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgcagttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttg 747116  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  747117 attatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 747177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 890098 - 889781
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  890098 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagttt 890001  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||    
T  890000 gtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgg 889902  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||    
T  889901 gtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagac 889802  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaact 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  889801 taggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4104188 - 4103888
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4104188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4104089  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104088 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4103989  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4103988 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 4103890  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  4103889 tt 4103888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 106 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27635950 - 27635504
Alignment:
Q  106 aaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtct 205  Q
    |||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27635950 aaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 27635851  T
Q  206 cttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggataga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||            || ||||| || |    
T  27635850 cttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacg------------ggctttgggtaaa 27635782  T
Q  306 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggt 405  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||    
T  27635781 attaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggt 27635682  T
Q  406 caatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  27635681 caatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcca 27635582  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27635581 tacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaatt 27635504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 50493963 - 50494417
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  50493963 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 50494062  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50494063 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 50494162  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  50494163 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 50494261  T
Q  434 tc-ttgcgttct--ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    || ||| |||||   ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||    
T  50494262 tctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaatt 50494359  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50494360 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 50494417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 366
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562005
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcat 6562005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22114632 - 22114297
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22114632 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 22114533  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||     
T  22114532 gtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttggg 22114433  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |  || | ||||||||| ||     
T  22114432 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaaca 22114333  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22114332 aagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 22114297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 223 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688005
Alignment:
Q  223 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagactta 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  323 ttcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 421  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  422 aggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggt 516  Q
     |||||| || |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| || |||||| |||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttccttttctctcgttgatgttttctacttttggcttgtgtttacaattgttccatacactttgattttggt 25688068  T
Q  517 tgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaatt 578  Q
    ||  || ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25688067 tgtctgattatcacttgctccacacataaagtttgttattggtgtgagttttctcatcgaatt 25688005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Original strand, 26720478 - 26720812
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26720478 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 26720577  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  26720578 gtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttggg 26720676  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |    
T  26720677 tagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagatt 26720776  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26720777 aggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattctt 26720812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10191602 - 10191167
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10191602 gagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10191503  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10191502 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10191404  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    || || || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10191403 ttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 10191304  T
Q  436 ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttat 527  Q
    ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  10191303 ttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtcccatacactttgttttggttgcttgattat 10191207  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10191206 cccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 10191167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 458210 - 458703
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtataga 197  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  458210 ctataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 458309  T
Q  198 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  458310 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 458409  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||    
T  458410 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 458508  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-tc-ttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtg 485  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||    
T  458509 agactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tg 458605  T
Q  486 tatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||    || | ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  458606 tatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 458702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 169; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210789
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat- 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | |   ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||     
T  38210534 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 38210632  T
Q  434 tc-ttgcgttct--ctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    || ||| |||||  |||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||     
T  38210633 tctttgtgttcttcctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgttttgtttgtttga 38210729  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38210730 taatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 38210789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 168; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 455833 - 456326
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtataga 197  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  455833 ctataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 455932  T
Q  198 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  455933 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 456032  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||    
T  456033 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 456131  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-tc-ttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtg 485  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||    
T  456132 agactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tg 456228  T
Q  486 tatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||    || | ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  456229 tatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 31151277 - 31151755
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31151277 ctataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagt 31151375  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||    
T  31151376 ttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttg 31151472  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactca-tcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||    
T  31151473 ggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccag 31151570  T
Q  399 actaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctctcttcctttctctcttgctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaatt 494  Q
    |||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||| | |||      
T  31151571 actaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttctctc--gctgtttttctactctt-acttgtgtttataa-- 31151665  T
Q  495 attccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31151666 cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtat-ttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 31151755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621525
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10621623 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6066124 - 6065791
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6066124 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattt 6066025  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  6066024 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 6065925  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | ||| ||| | ||||||| |||    
T  6065924 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctaga 6065826  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  6065825 ctaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 23633390 - 23633863
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23633390 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagtgttt 23633488  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||     
T  23633489 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 23633583  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| | | | ||| | ||| ||||||||    
T  23633584 tagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-ccccagac 23633681  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||  ||||    
T  23633682 taggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gatgttttctacttgtggcttgtgtttataa--attc 23633777  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || ||||||||||||||||||| || |  |||||| |||| ||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23633778 catacactttgttttggttgcttgattttcacttgcttcacacatctagtat-ttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 23633863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 567
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666911
Alignment:
Q  193 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||      
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  293 ggttttggatagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 389  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  390 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgta 487  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |     
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttatacttttggtttgtttt 4666831  T
Q  488 tttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||||||| || | ||  ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4666832 tataattgtttcatacactttattttggttgcatgataatcacttactccacacatcaaatttattattggtgtgatttt 4666911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6063739 - 6063441
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||    
T  6063739 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 6063640  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063639 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6063540  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  6063539 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 159; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 220 - 586
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232209
Alignment:
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagatt-gggatttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  320 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| |||| | | ||| | |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  419 actaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggt 516  Q
    ||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| | ||||| |||| || ||||| |||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttctctctcgctgttttttatttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggt 6232145  T
Q  517 tgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||    || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  6232146 tgcttgatta----ttactccacacatcaaatttgttattagtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 6232209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 154; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413027
Alignment:
Q  162 ttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 261  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  262 attg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttact 360  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  361 catcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 102 - 337
Target Start/End: Original strand, 35777351 - 35777587
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35777351 ctataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 35777450  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  35777451 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 35777550  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777551 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 151; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 250 - 585
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307176
Alignment:
Q  250 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  350 gtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctct 446  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||  || | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctct 3307036  T
Q  447 cttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatca 545  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||| || | ||||    
T  3307037 cttcctttctctttcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgtttttgattgtttgattatcccttgcttcatacatca 3307136  T
Q  546 ag-tttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3307137 agttttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaaca 3307176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 151; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28100349 - 28100143
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28100349 atcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacac 28100250  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28100249 tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagact 28100150  T
Q  321 tattctt 327  Q
    |||||||    
T  28100149 tattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 136 - 377
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956891
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 377  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 29956891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 28180954 - 28181182
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28180954 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28181051  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  28181052 gtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttgga 28181151  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181152 tagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 147; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5522942 - 5522481
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||             
T  5522942 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt--------- 5522852  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
      ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  5522851 --ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 5522754  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| ||||||    
T  5522753 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagact 5522655  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5522654 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 5522558  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
        || |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5522557 taactttcttacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 5522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 585
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795669
Alignment:
Q  190 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 289  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  290 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 388  Q
    |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | ||| |     
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| | |||||     
T  17795476 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctactttt-gtttgtga 17795573  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     | |||   |||| || | ||| |||||||||||||  |||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17795574 ttataa--cttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 17795669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 585
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19104109
Alignment:
Q  190 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 289  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  290 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttt 388  Q
    |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | ||| |     
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| | |||||     
T  19103916 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctactttt-gtttgtga 19104013  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     | |||   |||| || | ||| |||||||||||||  |||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19104014 ttataa--cttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 19104109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35918244 - 35917952
Alignment:
Q  134 ttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||      ||| |||    
T  35918244 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtt 35918145  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  35918144 tgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattctt 35918045  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 421  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |   ||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  35918044 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 141; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 586
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886619
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
    |||||||| |  | |||| || |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  433 ttc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgc------tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
    |||  ||| ||||||| ||| |||   ||||||      ||||||||||||||||||||||  | ||| | |||| || |||||| |||||||||||| |    
T  5886459 ttcttttgtgttctctattctttttcttcttgctgttgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttg-tttggttgcttgtt 5886557  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  5886558 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcgtcgaattcgcaacaa 5886619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 585
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5900091
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
    |||||||| || | |||| || |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  433 ttc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgc------tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
    |||  ||| ||||||| ||| |||   ||||||      ||||||||||||||||||||||  | ||| | |||| || |||||| |||||||||||| |    
T  5899932 ttcttttgtgttctctattctttttcttcttgctgctgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttg-tttggttgcttgtt 5900030  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  5900031 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcgtcgaattcgcaaca 5900091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 194 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606580
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  294 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 393  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||| ||||||| |||||||||| | || | | ||| | |||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgat-ttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  394 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7606580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 137; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168520
Alignment:
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||||||| || |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |||   ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  11168365 ttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgatt 11168462  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  11168463 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 11168520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 136; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 302 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 47701798 - 47701526
Alignment:
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| |    
T  47701798 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagatt 47701699  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  47701698 aggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct-ttcctttctctcat--tgttttctacttttggcttgtgttcataattgttcc 47701602  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
     || |||||||||| |||||||| ||||| |||| |   || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47701601 atacactttgttttcgttgcttgattattacttgat---cacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattc 47701526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 484
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992586
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||| |||               ||||||||||||| ||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--t 433  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 42992533  T
Q  434 tcttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgt 484  Q
    | ||| ||||||||| | ||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  42992534 ttttgtgttctctctccttttct-tctcgccgttgttttctacttttggcttgt 42992586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 129; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 562021 - 561639
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  562021 ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgt 561925  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 380  Q
    |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||     
T  561924 gaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaag 561825  T
Q  381 gactgttttctccc-ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctactttt 477  Q
    | ||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| |||  | |||||||||| || | ||||| | ||||||||||||||    
T  561824 ggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttctctctttctct-tctctcgatgttttctactttt 561726  T
Q  478 ggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
     |||||||| | |||   |||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  561725 -gcttgtgtttataa--cttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttactccacacatcaagtattttattggtgtgattttc 561639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 124; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 103 - 349
Target Start/End: Original strand, 23636958 - 23637200
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  23636958 tataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg 23637056  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||  ||||| |    
T  23637057 -ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggt 23637153  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23637154 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13420429 - 13420252
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13420429 ctagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 13420334  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcat 363  Q
    |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13420333 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcat 13420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Original strand, 54884089 - 54884348
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||    
T  54884089 ataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgt 54884186  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
     |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     |||| |||    
T  54884187 ttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaata 54884286  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54884287 gaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 366
Target Start/End: Original strand, 53597171 - 53597430
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  53597171 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactaggggttgtatagagttt 53597268  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||  | |||||      
T  53597269 -tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgag 53597365  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  53597366 tagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcat 53597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 106; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28137603 - 28137415
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||    
T  28137603 atcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacac 28137515  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  28137514 tagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 586
Target Start/End: Original strand, 25635394 - 25635789
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  25635394 ctagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgg 25635490  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 380  Q
    |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |     
T  25635491 gaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagag 25635590  T
Q  381 gactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctc-tcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |  || | |||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||| || |||||| |||| ||||| |||  | ||||||||||||||     
T  25635591 ggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctcttctttctttcactc--gttgttttctactttt- 25635687  T
Q  479 gcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    |||||||| | ||| | || |  |    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  25635688 gcttgtgtttataactgttaccca---cttgtattggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtat-ttattagtgtgattt--tcatcgaatt 25635781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  137 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 236  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  237 attcaccttgggaaacactattaggatt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871148
Alignment:
Q  144 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 243  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  244 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatat 342  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  343 cccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgc 439  Q
    | | ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| || ||| ||     
T  36871387 ctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgt 36871289  T
Q  440 gttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccac 539  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||| | ||| | |  |  |    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36871288 gttctctctttattt-tctctcgctgttttctatcttttgcttgtgtttataactgtcaccca---cttgttttggttgcttgattatt-cttgctccac 36871194  T
Q  540 atatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | ||||||| | |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  36871193 acatcaagtat-ttatcggtgtgattttttcaacgaattcacaacaa 36871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 356 - 585
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849470
Alignment:
Q  356 ttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ct 452  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  |    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttt 41849342  T
Q  453 ttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgt 552  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  41849343 ttctctctcgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgt 41849439  T
Q  553 tattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  41849440 tattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 41849470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 90; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  172 aacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 271  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  272 ttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttact 360  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 6231379 - 6231502
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6231379 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6231478  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6231479 gtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 410 - 585
Target Start/End: Original strand, 28181242 - 28181417
Alignment:
Q  410 ttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||    
T  28181242 ttggaccgaactaggtcaacaaattctcctgtgttctctcttcttttctctgtcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactt 28181341  T
Q  508 tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  28181342 tgttttggttgtttgatt-gtccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tgttcgaattcacaaca 28181417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 586
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634295
Alignment:
Q  315 gagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgg 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  414 accgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttct--ctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtt 511  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| || |  |    ||||     
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctc-tcctttcttactcttgttgttttctactttt-gcttgtgtttataattgttaccca---cttgta 25634223  T
Q  512 ttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25634224 ttggttgcttgattattacttgctccccacattaagtat-ttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 25634295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 11163082 - 11163218
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    |||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11163082 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 11163181  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 240  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163182 ctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47701922 - 47701798
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701922 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 47701823  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    |||| || | ||||||||| |||||    
T  47701822 gtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Original strand, 24177210 - 24177380
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24177210 tataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 24177308  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177309 g-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 457
Target Start/End: Original strand, 24181504 - 24181668
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 394  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||     
T  24181504 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcct 24181603  T
Q  395 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctc 457  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| | ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  24181604 ccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctc 24181668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 389 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 53894097 - 53893893
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctc--tcttcctt----tctctcttgctgtt----ttctacttt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||   ||||| ||    ||| ||| || |||    |||||||||    
T  53894097 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttt 53893999  T
Q  477 tggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaa 576  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  53893998 tggctt-tgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc-gatcgaa 53893902  T
Q  577 ttcacaaca 585  Q
    || ||||||    
T  53893901 tttacaaca 53893893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Original strand, 3306729 - 3306835
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  3306729 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagttt 3306828  T
Q  202 gtctctt 208  Q
    |||||||    
T  3306829 gtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  216 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 418 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 880251 - 880090
Alignment:
Q  418 aactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttgg 515  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||  | ||| | || | || ||||||||||      
T  880251 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgt--tgttttctacttttggtttgtgattataactgtttcatacactttgttttct 880154  T
Q  516 ttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  880153 ttgcttgattattccttactccacacatcaagtttattattggtgtgactttttcatcgaattc 880090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634504
Alignment:
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||  |  ||||| ||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  304 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 367  Q
    | ||||||   | ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 276
Target Start/End: Original strand, 25633933 - 25634024
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633933 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419997
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  271 cttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagatt 13419997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1026 - 1261
Target Start/End: Original strand, 30534432 - 30534666
Alignment:
Q  1026 agttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttac-gtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannnnnnn 1124  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||   ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || || |            
T  30534432 agttatttaattgtaa-aaattggtcttttaagtttttttttgtaccgcttaggtc-tttatgttaattaattgtaaaaagttgctctttaagttttttc 30534529  T
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggaccta-aagttacaattaaat 1223  Q
    |||||||| ||| || | |||| ||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  30534530 cgtaccaactagctctt-taagttatttaactgtaacaatttgagatgttttagatcttaaaaatgtaagttatttggggcctacaagttacaattaaat 30534628  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacat 1261  Q
    || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30534629 aatttaaaagacctaagtcttacgaaaaatacttacat 30534666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 51265984 - 51265744
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagtttttta-cgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa--- 1117  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||       
T  51265984 tttaagttatttaattgtaataagttgatcatttacgttttttttcgtacctcttagatcctttaagttatttaactataacaagttggtctgttaagtt 51265885  T
Q  1118 nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttaca 1216  Q
           |||| || ||| ||| | |||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||  | | | ||| |||||    
T  51265884 tttttcccgtatcactta-gtcttttaagttatttaaccgtaacaatttgagagatttcagatcttaaaaatttaagtttttcaaggcttgaaatttaca 51265786  T
Q  1217 attaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  51265785 attaaataacttaaaggatctaagttgtatgaaaaatactta 51265744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    || |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  431 aa 432  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 532 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29897580 - 29897526
Alignment:
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29897580 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 29897526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 586
Target Start/End: Original strand, 11170671 - 11170789
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||    
T  11170671 tgttttctacttttggcttgt--atttaattattccatacactttgattttggttgcttgattatcccttactccacacatcaag-ttgttattaatgtg 11170767  T
Q  563 gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||  ||||||||||| ||||||    
T  11170768 attt--tcatcgaattcgcaacaa 11170789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1210
Target Start/End: Original strand, 44291025 - 44291182
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatt 1151  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||        ||||||||  |||| || |||| ||||    
T  44291025 tttaagtttttttcgtaccacttaagtcatttaagttaattagttgtaacaagttggccttttaagttttttccgtaccaacaaggt-ctttaagttatt 44291123  T
Q  1152 taactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa 1210  Q
    |||| |||| || ||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44291124 taaccgtaacaattttggggattttagatcttaaaaatgtaagttattcgggacctaaa 44291182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021281
Alignment:
Q  211 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttgatcacatgaagagattagg 31021281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 35919155 - 35919107
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35919155 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 35919107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 44291509 - 44291413
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || | ||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44291509 ttttaagttatttaattgtaacaaattggtcctctaaatttttttagtatcacttatgtcctttaagttatttaattgtaacaagttagtcctttaa 44291413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28412946 - 28412869
Alignment:
Q  507 ttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28412946 ttgttttggttacttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gttttttcatcgaattcacaacaa 28412869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Original strand, 6484314 - 6484367
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484314 gctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6484367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10621439 - 10621365
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10621439 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 10621365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1107
Target Start/End: Complemental strand, 48200471 - 48200367
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |||     
T  48200471 taaattacactagaaatcttttaacttatttaattgtaaagaattgatcatttaattttttttcgtaccgcttaagtcttttaaattaattgattgtaat 48200372  T
Q  1103 aagtt 1107  Q
    |||||    
T  48200371 aagtt 48200367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22625882 - 22625828
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22625882 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 22625828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Original strand, 42992720 - 42992800
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  42992720 actttgttttggttgtctgattatcccttgctctacacatcaagtttgttattagtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 42992800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29913857 - 29913804
Alignment:
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29913857 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcaac-aattcacaacaa 29913804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  216 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 261  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8183154 - 8183041
Alignment:
Q  409 tttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatact 506  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||     
T  8183154 tttgggccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt--tttttctcttgcagttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacacc 8183057  T
Q  507 ttgttttggttgcttg 522  Q
    || |||||||||||||    
T  8183056 ttattttggttgcttg 8183041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 30236251 - 30236300
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30236251 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttg 30236300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6065706 - 6065632
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6065706 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 6065632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Original strand, 3330178 - 3330221
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3330178 atcaagtttgttattggtgtggttttcacaacgaattcacaaca 3330221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 6303589 - 6303643
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6303589 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 6303643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10099977 - 10099923
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10099977 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 10099923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10594933 - 10594883
Alignment:
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10594933 ctccacgtatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 10594883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Original strand, 1321371 - 1321437
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 168  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1321371 ctataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Original strand, 26720850 - 26720928
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaa 546  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| |  ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  26720850 ttttctacttttggcttgtatttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaa 26720928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 46173483 - 46173532
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46173483 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaatttcttg 46173532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1114
Target Start/End: Original strand, 51265679 - 51265739
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51265679 tttaagtttttt-cgtaccacttacgctctttaagttacttaattgtaacaagttggtcctt 51265739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Original strand, 10897294 - 10897337
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10897294 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 10897337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 510 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22114215 - 22114143
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  22114215 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgctattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 22114143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 437
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992651
Alignment:
Q  393 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattctt 42992651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10093965 - 10093923
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10093965 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 10093923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10200847 - 10200805
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10200847 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 10200805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10612680 - 10612626
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10612680 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcataacaa 10612626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1291 - 1334
Target Start/End: Original strand, 44291420 - 44291463
Alignment:
Q  1291 actaacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgatac 1334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44291420 actaacttgttacaattaaataacttaaaggacataagtgatac 44291463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 50898948 - 50898882
Alignment:
Q  1192 aagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50898948 aagttattcgagacgtaaaagttacaattaaacaacttaaat-acctaagtgttacgaaaaatactta 50898882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 528 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4103791 - 4103736
Alignment:
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  4103791 tccttgctccacgcatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 4103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094218
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10094218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100235
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201098
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16264396 - 16264354
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16264396 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 16997156 - 16997209
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  16997156 ttgctccacatatcaagtat-ttattggtgtgattttctcaccgaatttacaaca 16997209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626128
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22626128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Original strand, 24181670 - 24181749
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  24181670 actttattttggttgcttgattattaatttctccacacatcaagtattttattagtgtgattttct--tcgaattcacaaca 24181749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25795827 - 25795785
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795827 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32143367 - 32143325
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32143367 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 40913419 - 40913461
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40913419 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 44331671 - 44331713
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44331671 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 51398940 - 51398982
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398940 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 507 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1620386 - 1620313
Alignment:
Q  507 ttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    |||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  1620386 ttgttttggttgcttgattaat--tttctccacatatcaagttt-ttattggtgtgatttttttaacgaattcacaa 1620313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1104
Target Start/End: Complemental strand, 1662357 - 1662257
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    ||||||||| || | ||| |||||  |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1662357 taaattacatcagaggtcctttaaagtatttaattgcaataaattgatcttttaagtttttt-tataccacttagatccattatgttaattaattgtaac 1662259  T
Q  1103 aa 1104  Q
    ||    
T  1662258 aa 1662257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4560567 - 4560514
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaa 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||    
T  4560567 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaa 4560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 585
Target Start/End: Original strand, 27544586 - 27544619
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27544586 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 27544619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 151)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 21678026 - 21678507
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21678026 ctataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagttt 21678125  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||     
T  21678126 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttggg 21678225  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||| | ||||||| |||||    
T  21678226 tagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagact 21678325  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21678326 aggttaatttggaccgaactgggacaacaaattcttgtgttctctcttcttttctccc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcctt 21678423  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21678424 acactttgttttggttgcttgattattccttgctccacaaatcaagtttgttatcggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 21678507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 44724539 - 44725023
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724539 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 44724638  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  44724639 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttggg 44724738  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  44724739 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 44724838  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat-tattc 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||    
T  44724839 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcatttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataatatgttc 44724936  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  44724937 catacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttcccatcgaattcgcaacaa 44725023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 443555 - 444045
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  443555 ctataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 443654  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||     
T  443655 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttggg 443754  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttct-cccccagac 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| |||    
T  443755 tagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgac 443854  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt--tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  443855 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgattataattgt 443954  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  443955 tcaatacactttgttttggttgcttgactattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgagttttctcatcgaattcacaacaa 444045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13099805 - 13099316
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13099805 ctataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 13099706  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  13099705 gtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 13099606  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||||||    
T  13099605 tagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 13099506  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  13099505 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattg 13099406  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13099405 ttccatacactttgttttggttgtttgacgatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 13099316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 4296265 - 4295788
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattac-atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4296265 ctataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 4296166  T
Q  201 tgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  4296165 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 4296066  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| |    
T  4296065 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccata 4295966  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | | ||| ||    
T  4295965 ctaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gccattttctacttttggcttgtgtttattattgtt 4295868  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    |  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4295867 ctatacactttgttttggttgcttgatgattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaatt 4295788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 11355218 - 11355706
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11355218 ctataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11355317  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  |||||     
T  11355318 gtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttggg 11355417  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||  |   ||| | ||||||| |||||    
T  11355418 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagact 11355517  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt-tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  11355518 atgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctcttacttctctctcttgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttc 11355617  T
Q  499 cttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  11355618 catacactttgtttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttattattggtgtgattttttcatcgaattcccaacaa 11355706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 21679987 - 21680472
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21679987 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 21680086  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||     
T  21680087 gtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttggg 21680186  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||| | |||||||||||||    
T  21680187 tagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagact 21680286  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaa---ctaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  21680287 aggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 21680384  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21680385 tccatacactttgtttttgttgcatgattattccttgcttcacacatcaagcttgttattggtgtgggttt-tcatcgaattcacaaca 21680472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31435376 - 31434892
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31435376 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 31435277  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |   |||||     
T  31435276 gtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttggg 31435177  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  31435176 tagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaac 31435077  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  31435076 taggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgt--tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttc 31434979  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31434978 cttacactttattttgattgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttctcatcgaattcgcaaca 31434892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 42331328 - 42330846
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42331328 ctataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagttt 42331229  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgtgaagagattagggttttg 299  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |  ||||    
T  42331228 gtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttg 42331129  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || || |||||||||||    
T  42331128 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccaga 42331029  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  42331028 ttaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct--ctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 42330931  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  42330930 atacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtttattattggcgt-gatttctcatcgaattcgcaaca 42330846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27306558 - 27306076
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27306558 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagttt 27306460  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  27306459 gtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 27306360  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| |||||    
T  27306359 taaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagact 27306260  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||     
T  27306259 aggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttcttcttttggcttgtgattataattgttcca 27306160  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  27306159 tacactttgttttggttgcttgactatcccttgttccacacatcaagtttgttattggtgt-gatctctcatcgaattcgcaaca 27306076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 121 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21591989
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 420  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 21592154  T
Q  421 taggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttg 518  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  21592153 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacacttt-ttttggttg 21592055  T
Q  519 cttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||    
T  21592054 tctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttatagccgt-gttttctcatcgaattcgcaaca 21591989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 103 - 586
Target Start/End: Original strand, 24748555 - 24749036
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24748555 tataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttg 24748654  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |    
T  24748655 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 24748754  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||| ||||| |    
T  24748755 agaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagatt 24748854  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| | |||||  | |||   ||||    
T  24748855 aggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctttatttctctc--gttgttttctactttt-gtttgtgattataa--cttcc 24748949  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748950 atacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 24749036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 136 - 576
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679495
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9679251  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  9679252 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaatt 9679351  T
Q  435 c--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattcct 531  Q
    |  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||| || ||||  ||    
T  9679352 cttttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcact 9679451  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaa 576  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9679452 tgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaa 9679495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37412457 - 37411964
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37412457 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 37412358  T
Q  202 gtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||    
T  37412357 gtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgg 37412258  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  37412257 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctag 37412158  T
Q  399 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttc---tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||| ||||  |||   ||||| | ||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  37412157 actgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctcccttctcttcttttctctcgttgttttctagttttggcttgtgattataat 37412058  T
Q  494 tattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37412057 tgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgagttttctcatcaaattcacaacaa 37411964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 102 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39146316 - 39145856
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39146316 ctataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 39146217  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||     
T  39146216 gtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttggg 39146117  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| | | | ||| | ||    
T  39146116 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaac 39146017  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||     
T  39146016 taggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggtttgtgtttataattgttt 39145917  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggt 559  Q
      || | ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39145916 aatacaatttgttttggttgcttgattatcacttactccacacatcaagtttgttattggt 39145856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 102 - 559
Target Start/End: Original strand, 21990111 - 21990570
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21990111 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagttt 21990209  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||      
T  21990210 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgag 21990309  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | ||||||| |||||    
T  21990310 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagact 21990409  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21990410 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgtttgctacttttggcttgtgtttataattgttcc 21990509  T
Q  500 ttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggt 559  Q
     || |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21990510 atacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggt 21990570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 38393980 - 38394435
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38393980 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38394079  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38394179  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38394180 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38394279  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  38394280 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 38394376  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38394377 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 38394435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 42223116 - 42223601
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagg-gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42223116 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 42223215  T
Q  201 tgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  42223216 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttg 42223315  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||| |    
T  42223316 gatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccata 42223415  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  42223416 ctaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttctctcat--tgttttctacttttgccttgtgtttataattgtt 42223513  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
       || ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  42223514 ttatacactttattttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgt-gtttttttatcgaattcgcaacaa 42223601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 9680774 - 9681266
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 196  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9680774 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatag 9680873  T
Q  197 agtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  9680874 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 9680973  T
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 395  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | |||||||    
T  9680974 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccc 9681073  T
Q  396 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9681074 cagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttcctttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtttataat 9681173  T
Q  494 tattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||| || |||||| |||||||||  |  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9681174 tgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaatgcacaacaa 9681266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 121 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20137419 - 20137061
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137419 atcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 20137320  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  20137319 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 20137220  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 419  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20137219 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaa 20137121  T
Q  420 ctaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttgg 479  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20137120 ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttgg 20137061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 44524 - 45012
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44524 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagttt 44623  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||  |||||     
T  44624 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttggg 44723  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  44724 tagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagact 44823  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  44824 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctactttttgct--tgtattta 44920  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  44921 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaattcgcaaca 45012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 48457647 - 48458100
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48457647 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48457746  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457747 cattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 48457846  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48457847 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 48457946  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  48457947 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 48458043  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  48458044 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 48458100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 18345535 - 18345990
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  18345535 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggtt 18345634  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345635 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18345734  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18345735 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattc 18345834  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  |    
T  18345835 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgact 18345931  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  18345932 atcccttgctccacacatcaag-ttgttgttggtgt-gttttcacaacgaattcacaacaa 18345990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297811
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaaccca 20297555  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20297556 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 20297655  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| |||| || |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  20297656 ttttgtgttcttctcctctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 20297752  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20297753 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 20297811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7472275 - 7471820
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7471976  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||| ||||||  ||    ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  7471975 ttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcaccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatta 7471878  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  7471877 tcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcattgaattcgcaacaa 7471820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40837071 - 40836581
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||  | ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40837071 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 40836972  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  40836971 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 40836872  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  40836871 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 40836773  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||   ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40836772 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 40836675  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    || |||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||    
T  40836674 ttgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgatcgaattcgcaacaag 40836581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626481
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20626231  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626232 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20626331  T
Q  436 --ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
      ||| |||||||| ||  ||||||||  || ||||||||||||||||||  | ||||||    |||| || ||||| ||||||||||||| ||||  ||    
T  20626332 ttttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggct--tatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctct 20626429  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20626430 tgctccacacatc-aggttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 20626481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630372
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20630122  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20630123 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20630222  T
Q  436 --ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
      ||| |||||||| ||  ||||||||  || ||||||||||||||||||  | ||||||    |||| || ||||| ||||||||||||| ||||  ||    
T  20630223 ttttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggct--tatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctct 20630320  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20630321 tgctccacacatc-aggttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 20630372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642791
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20642541  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642542 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 20642641  T
Q  436 --ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
      ||| |||||||| ||  ||||||||  || ||||||||||||||||||  | ||||||    |||| || ||||| ||||||||||||| ||||  ||    
T  20642642 ttttgtgttctctcatctttttctctcgctgttgttttctacttttggct--tatatttataacttccatacactttattttggttgcttgattatctct 20642739  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20642740 tgctccacacatc-aggttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 20642791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Original strand, 35589 - 36055
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35589 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagttt 35688  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  35689 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 35788  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |   ||| ||||||||| |||||    
T  35789 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagact 35888  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  35889 aggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttgg--tttgtattta 35985  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35986 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 20299452 - 20299908
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gaggg 233  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20299452 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 20299551  T
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20299651  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20299652 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20299751  T
Q  434 tc--ttgcgttc-tctcttcctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    ||  ||| |||| |||| |||||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  20299752 tcttttgtgttcttctc-tcctttgtgttcttctcgcagttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttga 20299848  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20299849 ttatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcaaattcacaaca 20299908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27832936 - 27832487
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832936 aaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtt 27832837  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27832836 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattctt 27832737  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 426  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | | | ||  | |||||||||||||||||||||||     ||||| |||     
T  27832736 gtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggta 27832642  T
Q  427 aacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||  | |||   |||| || |||||||||||||| |||| |||    
T  27832641 aacaaattcttgtgttatctctttctttctctc--actgttttctacttttggtttgtgattataa--cttccatacactttgttttggttacttgatta 27832546  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  27832545 tttcctgctccacacattaagtttgttattggtatgatttt-tcatcgaattcacaacaa 27832487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 584
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28488000
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 28487846  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||| ||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  28487847 ttttgtgttcttcttttctttgtgttct-tctagccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 28487943  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  28487944 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaac 28488000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 562
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850407
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1850274  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctct------tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||| ||||||| ||    |||      || ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||| |||    
T  1850275 ttttgtgttcttctcttctttgtgttcttttcactgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgatta 1850372  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1850373 tcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 1850407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7470317 - 7469863
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7470317 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7470218  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470217 gattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7470118  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7470117 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7470018  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||| ||||||  ||    ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| |||    
T  7470017 ttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcaccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttagttgcttgatta 7469920  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7469919 -tccctgctccacacatcaa-attgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 7469863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 28485560 - 28486014
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  28485560 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggtt 28485659  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28485660 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatcca 28485759  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |  | |  || | ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28485760 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 28485858  T
Q  436 --ttgcgtt-ctctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||  ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||    
T  28485859 ttttgtgttattctcttctttgtgttcttctatccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacattttgttttggttgcttgatta 28485956  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28485957 tcccttgctccacatatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 28486014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 136 - 583
Target Start/End: Original strand, 3035715 - 3036170
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg---tgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
    |||||||| || |||||| || | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T
Q  433 ttc--ttgcgtt-ctctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttg 522  Q
    |||  ||| ||| |||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  3036015 ttcttttgtgttcctctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttg 3036111  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
     ||||  ||||||||| | |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3036112 attatctcttgctccaaacatcaa-attgttattggtgt-gatttctcatcgaattcacaa 3036170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 141 - 585
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946777
Alignment:
Q  141 agagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 240  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  241 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 340  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  341 atcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttg 438  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40946626  T
Q  439 cgttc-tctcttcct----ttctctcttgc-----tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttatt 528  Q
     |||| ||| ||| |    |||| ||| ||     | ||||||| ||||||||  ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||     
T  40946627 tgttcttcttttctttgtgttct-tctcgccgtttttttttctatttttggct--tgtatttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatc 40946723  T
Q  529 ccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  40946724 ccttgctccacacatcaag-ttgttattgatgtg--attctcatcgaattcacaaca 40946777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 25542491 - 25542976
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25542491 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 25542589  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||     
T  25542590 gtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttggg 25542688  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | ||||||| |||||    
T  25542689 tagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagact 25542787  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcg---ttctctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |   || ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25542788 aggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttctcttctttgtgttcttctcaccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 25542885  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||| || | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25542886 ttgttccatacattttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 25542976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1049624 - 1049290
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1049624 ctataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1049525  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  1049524 gtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 1049425  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||    
T  1049424 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 1049326  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1049325 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1049290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 136 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046919
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1046921  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  1046920 tt 1046919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 437
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878872
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878771 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3878870  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  3878871 tt 3878872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 7188503 - 7188980
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  7188503 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaataaaaatagggtttgtatagggttt 7188601  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |  |||||     
T  7188602 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttggg 7188698  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | | ||| | ||| |||||| |    
T  7188699 tagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtc 7188798  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    || ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||   ||||    
T  7188799 tatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt-ttgcgtgttctctttcttt-tctctcgctgttttctactttt-gcttgtgtttataa--cttcc 7188893  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7188894 atacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattttttgatcgaattcacaacaa 7188980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 211 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092069
Alignment:
Q  211 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  311 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||     
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttgact--tatatttaattgttcca 7092137  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
     | ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7092136 cacactttattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttc 7092069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 121 - 432
Target Start/End: Original strand, 24258442 - 24258757
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258442 atcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 24258541  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |  ||||||||||||||||||| | |||    
T  24258542 tatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaact 24258641  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggacc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||| |||| | | ||| | ||||   |||||||||||||||||||||    
T  24258642 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggacc 24258741  T
Q  417 gaactaggtcaacaaa 432  Q
    ||| ||| | ||||||    
T  24258742 gaattagatgaacaaa 24258757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351490
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  7351747 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 7351649  T
Q  435 --cttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
       ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||      
T  7351648 tctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttaa 7351552  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7351551 ttatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 7351490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 211 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094300
Alignment:
Q  211 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattag 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  311 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||     
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattgttcca 7094384  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     | ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  7094383 cacactttattttggttgcttgactatgccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 7094300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 129 - 366
Target Start/End: Original strand, 25276128 - 25276365
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276128 aaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 25276227  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25276228 gagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 25276327  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25276328 taaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25276365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31156213 - 31155908
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  31156213 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggattt 31156114  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31156113 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 31156014  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| | |||||||| ||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  31156013 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 31155915  T
Q  428 acaaatt 434  Q
    |||||||    
T  31155914 acaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253358
Alignment:
Q  146 gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 245  Q
    ||||||||| || | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  246 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  43253702 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 43253603  T
Q  346 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||    
T  43253602 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttc 43253503  T
Q  444 -tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
     ||||||| |    |||| ||| ||||    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  43253502 ttctcttctttgtgttct-tctcgctgttgtttttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgc 43253406  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  43253405 tccacacatcaa-attgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 43253358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 372
Target Start/End: Original strand, 11757222 - 11757460
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gaggg 233  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11757222 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 11757321  T
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757322 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 11757421  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 372  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757422 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 136 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7349568 - 7349285
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7349568 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7349469  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349468 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7349369  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 419  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349368 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 171 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813450
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tata 369  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  370 gtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgtt 467  Q
    ||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttccttt-tctctcgttgtt 24813461  T
Q  468 ttctacttttg 478  Q
    |||||||||||    
T  24813460 ttctacttttg 24813450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 24465508 - 24465976
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||| |||    
T  24465508 ctatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatagcgtt 24465599  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  |||||    
T  24465600 tg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgg 24465695  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  24465696 gtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccaga 24465794  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||| ||||| || ||||||||  || |||||||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||   ||||    
T  24465795 ctagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt-tcgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttggtttgtgattataa--cttcc 24465890  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |||||||||||||||||||  |||  |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24465891 atacactttgttttggttgcttgaatatcacttgttccacacatcaaatttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 24465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22828962 - 22828687
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22828962 ctataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagttt 22828863  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |  |||||     
T  22828862 atctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttggg 22828763  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  22828762 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaac 22828687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 134; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 335
Target Start/End: Original strand, 26804554 - 26804765
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac---tag 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  26804554 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtag 26804653  T
Q  224 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804654 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 26804753  T
Q  324 tcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||    
T  26804754 tcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24817677 - 24817362
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24817677 tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatagagttt 24817580  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||     
T  24817579 g-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 24817484  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||    
T  24817483 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatac 24817384  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaact 421  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  24817383 taggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20091870 - 20091609
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20091870 ctataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcggaggcaaca-caaaactagggtttgtatagagttt 20091772  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | || ||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||  |  |||||     
T  20091771 g-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 20091675  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcata 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20091674 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 20091609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22251871 - 22251611
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22251871 ctataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 22251772  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||     
T  22251771 gtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttggg 22251680  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||    
T  22251679 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606827
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 1606683  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctcc 537  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1606684 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctcc 1606781  T
Q  538 acatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1606782 acacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 1606827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 293 - 585
Target Start/End: Original strand, 22393873 - 22394161
Alignment:
Q  293 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||    
T  22393873 ggttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctct 22393972  T
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| |||||  |     
T  22393973 cccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttggtttgtgatta 22394070  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  22394071 taa--cttccatacactttgttttggttgtttgactatcacttgctccac--atcaagtttattattggtg-gaatttttcatcgaattcacaaca 22394161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 296 - 598
Target Start/End: Original strand, 26295601 - 26295898
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccc 394  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||     
T  26295601 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcct 26295700  T
Q  395 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatt 494  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  26295701 ccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattcttgtgttatctctttctttctttc--gttgttttctacttttggcttgtgtttataat- 26295797  T
Q  495 attccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagtttgatt 594  Q
     || | || ||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||  |||    
T  26295798 -tttcatacactttgttttgattgcttgattatcacgtgctccatacatcaagtat-ttattggtgtgatttt-tcatcaatttcacaacatgttccatt 26295894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 220 - 568
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38397071
Alignment:
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 319  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  320 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 419  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||| | || | | ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  420 ctaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct-------ttctctc--ttg--ctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatac 505  Q
    || |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |       ||||| |  |||   | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||  || ||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttttttctacttttggct--tgtatttaattgttctatacac 38397009  T
Q  506 tttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  38397010 tttgttttggttgctttattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 38397071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935716
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 2935572  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||     
T  2935573 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctactttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctt 2935670  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2935671 cacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 2935716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 18567573 - 18567731
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567573 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18567672  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 260  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567673 gtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251452
Alignment:
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacttt 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacacttt 22251506  T
Q  509 gttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22251505 gttttggttgtttgattatcccttgctcaacacatcaagtttgttattggtgtg 22251452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 299
Target Start/End: Original strand, 22392433 - 22392618
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||| |||||||||||||||| |||    
T  22392433 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caaa-ctagggtttgtatagaattt 22392524  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    | || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  22392525 g-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatgagggttttg 22392618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137370
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 394 - 586
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804956
Alignment:
Q  394 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtattt 490  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| | |    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgatgttgttttctacttttgacttgtgtttat 26804861  T
Q  491 aattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  26804862 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaaatttgttattggtgt-gatttctcatcaaattcgcaacaa 26804956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552397
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40552397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 473
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081842
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatcccttttgtaaggttactcatc-at 366  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||  || |||||||   | ||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |    
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatcttt 11081734  T
Q  367 atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgct 464  Q
    | | || |||| |||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||  |||| |||| |||    
T  11081735 aaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttttttc-ctctcgct 11081833  T
Q  465 gttttctac 473  Q
    |||||||||    
T  11081834 gttttctac 11081842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 41331439 - 41331168
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  41331439 taaattatatcataagtcatttaagttatttaattgtaataaattgatcatttaagtttttctcgtaccacctagctcatttaagttaataaattataac 41331340  T
Q  1103 aagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcg 1201  Q
    |||||||| ||||||         |||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| || ||  ||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  41331339 aagttggttctttaagtttttcatgtaccaatgaggtcatttaagttatttaaccgtaacaattttggggattctagatcctaaaaattgaagttattcg 41331240  T
Q  1202 ggacct-aaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
      |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  41331239 atacctaaaagttataattaaataacttaaa-gacctaagtgctatgaaaaatatttaaactactaacttgtt 41331168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550278
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T
Q  445 --ctcttccttt----ctctc----ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttg 533  Q
       ||||| |||     ||||    ||| | ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  40550131 tcttcttcttttgttcttctcacagttg-ttttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttg 40550227  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  40550228 ctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 40550278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108359
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22108359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 434
Target Start/End: Original strand, 6332283 - 6332514
Alignment:
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| | ||    
T  6332283 ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggta 6332380  T
Q  304 gaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  6332381 gaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagact 6332480  T
Q  402 aggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6332481 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 11759374 - 11759576
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctct-tcctttctct----cttgc---tgttttctacttttg 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| | |    || ||   |||||||||||||||    
T  11759374 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct-tctctcctttgtgttcttctcgccgttgttttctacttttg 11759472  T
Q  479 gcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    ||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11759473 gcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaatt 11759568  T
Q  579 cacaacaa 586  Q
    | ||||||    
T  11759569 cgcaacaa 11759576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 366
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049094
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 269  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatc 6048997  T
Q  270 tcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||||||| ||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6048998 tcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccc-tttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 18128632 - 18128375
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcattt-aagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18128632 taaattacaccataggtcctttaaattatttaaatgtaataaattggtccttttaagtttttt-cgtactacttaggttctttaagttaattaattgtaa 18128534  T
Q  1102 caagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattc 1200  Q
     |||||||| ||||||        ||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||| || |||  | |||||||||||||||| || |||||||||    
T  18128533 taagttggtgctttaattttttttcgtacgaattagatcctttaagttatttaaccataacaatttggcgaatttcagatcttaaaaatgtaagttattc 18128434  T
Q  1201 -gggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
      ||    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  18128433 aaggtttaaaagttacaattaaaaaatttaaaggatctaagtgttacgaagaatactta 18128375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 30552040 - 30551947
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30552040 ttttaagttatttaattgtaataaattggtcctttaagtttttttggtaccacttaggtcatttaagttaatcaattgtaacaagttggtcctt 30551947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 6589651 - 6589558
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  6589651 ttttaagtaatttaattgtaataaattgatcctttaagtttttttggtaccacttaggtcatttaagttaatcaattgtaataagttggtcctt 6589558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084523
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1097
Target Start/End: Original strand, 12422044 - 12422123
Alignment:
Q  1018 gtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaatt 1097  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12422044 gtcttttaagttattaaattgtaataaattggtcatttaagtttttttcataccacttaggtcctttaagtaaattaatt 12422123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1108
Target Start/End: Complemental strand, 32804736 - 32804629
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  32804736 gttaaattacaccacaagtcttttaggatatttaattgtaataaattgatcttttaggtttttttcatacaacttaagtcatttaagttaattaattgca 32804637  T
Q  1101 acaagttg 1108  Q
    ||||||||    
T  32804636 acaagttg 32804629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 6348936 - 6349006
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6348936 tttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1110
Target Start/End: Original strand, 1532197 - 1532285
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggt 1110  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1532197 tttaagttatttaattgtaataagttgatcatttacattttttttgtacctcttaggtcctttaagttatttaactataacaagttggt 1532285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9027151 - 9027034
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | |  | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  9027151 tgttttctacttttggcttgtatttataacttt--catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 9027055  T
Q  564 ttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  9027054 tttt-tcatcgaattcgcaaca 9027034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297166
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 16297166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1011 - 1199
Target Start/End: Original strand, 20389633 - 20389822
Alignment:
Q  1011 accataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagtttttta-cgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttgg 1109  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |  |  ||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20389633 accataggtcttttaagttatttaaatgtaacaaagtagttctttaagttttttttcgtactacttagatgctttaagttaattaattgtaacaagttgg 20389732  T
Q  1110 tcctttaannnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttatt 1199  Q
    || || |        ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||  | |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20389733 tctttaagtttttttcgtacgaattagatcctttaagttatttaactgtaacaatttggcgaattttagatcttaaaaatgtaagttatt 20389822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 25357324 - 25357379
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25357324 ttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcaacgaattgacaacaa 25357379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 28003434 - 28003341
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  28003434 tttaaattatttaattgtaacaagttgatcgtt-aagtttttt-cgtaccaattaggtcctttaagttaattaaatgtaacaagttgatcctttaa 28003341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7349197 - 7349116
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7349197 actttattttggttgcttaattatcccttactccacacatcaagtt-gttattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 7349116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  142 gagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1172 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 48447402 - 48447315
Alignment:
Q  1172 atttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  48447402 attttagatcttaaaaatgtaagttattttgggcataaaagttacaattaaataacttaaaggacctaagcgttacgaaaaatactta 48447315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1115
Target Start/End: Original strand, 5755594 - 5755685
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtccttt 1115  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5755594 tttaagttatttaattgtaacaaattggccctttaatttttt--cgtaccacttaaatcatttatgttaattaattgtaacaagttggtccttt 5755685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  210 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1169 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 12264890 - 12264801
Alignment:
Q  1169 gggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||  | || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  12264890 gggatttcaaatctttaaaatgtaagttattcatggccaaaagttacacttaaataacttgaaagacctaagtggtacgaaaaatactta 12264801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 585
Target Start/End: Original strand, 22137411 - 22137527
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  22137411 ttttctacttttggctcgt--attttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgat 22137507  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  22137508 ttt-tcgtcgaattcacaaca 22137527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 585
Target Start/End: Original strand, 40552438 - 40552554
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  40552438 ttttctacttttggctcgt--attttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgat 40552534  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  40552535 ttt-tcgtcgaattcacaaca 40552554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1046831 - 1046756
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  1046831 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcttcgaattcgcaacaa 1046756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 7464418 - 7464363
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7464418 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaag 7464363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1179 - 1258
Target Start/End: Original strand, 12422262 - 12422342
Alignment:
Q  1179 atcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  || ||||||||    
T  12422262 atcttaaaagtataagttattcgggacctaaaagttacaattaaataacttaaaggatttaagtgttacaaacaatactta 12422342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1105
Target Start/End: Complemental strand, 12422455 - 12422352
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    |||||||||||||  || |  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||    
T  12422455 gttaaattacaccggaatttctttaagttatttaattgtaacaaattcatcctttaagtttttt-tgtatcacttacgtcttttaagttatttaatttta 12422357  T
Q  1101 acaag 1105  Q
    |||||    
T  12422356 acaag 12422352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 20137066 - 20136990
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  20137066 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaaatttattattcgtatgattttttcatcgaattcacaacaa 20136990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1201
Target Start/End: Complemental strand, 21921164 - 21920965
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||  ||||  |||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||| | ||    
T  21921164 gttaaattacatcataagtcatttaagttatttaactataactaatttgtcatttaagtttttt-tttaccacttatgt-ctttaagttaattaactgta 21921067  T
Q  1101 acaagttggtcctttaa-nnnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttatt 1199  Q
    |||||||| |  |||||        ||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||| || ||| || |||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  21921066 acaagttgtttatttaagttttttccgtactaattaggtcctttaagttatttaaccataaaaatttggggaattttagaccttaaaaatgtaagttatt 21920967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20091196 - 20091109
Alignment:
Q  391 tcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctactttt 477  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| | | || |||||| || |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  20091196 tcccccagactaggtcagtattggaccgaactggataaataaattcgtgtgttctctctttctttttctctcgttgttttctactttt 20091109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 25351630 - 25351684
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25351630 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 25351684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 25405692 - 25405746
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25405692 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 25405746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Original strand, 26210603 - 26210688
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26210603 tctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagatt 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1207 - 1258
Target Start/End: Complemental strand, 28002330 - 28002279
Alignment:
Q  1207 taaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  28002330 taaagttacaattaaacaacttaaaggacctaagtggtatgaaaagtactta 28002279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Original strand, 30247260 - 30247303
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30247260 atcaagttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 30247303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30906380 - 30906264
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    ||||||||||||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||    
T  30906380 gctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaac-aaataacaaa-ctagagtttgtatagagt 30906283  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaaca 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  30906282 ttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44016568 - 44016513
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44016568 ttgctccacgcatcaagtttattattggtgtggttttcacaacgaattcacaacaa 44016513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44512417 - 44512362
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44512417 ttgctccacgcatcaagttttttattggtgtgtttttctcaacgaattcacaacaa 44512362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 586
Target Start/End: Original strand, 3878911 - 3879028
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacttt-gttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggt 564  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| || | ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||||| ||| |     
T  3878911 ttttctacttttggtttgt--atttaattgttccatacatttttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttattattgatgt-ga 3879006  T
Q  565 tttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  3879007 tttctcatcgaattcgcaacaa 3879028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12097909 - 12097867
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097909 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1036 - 1101
Target Start/End: Original strand, 32918529 - 32918595
Alignment:
Q  1036 ttgtaagaaattgatcatttaagtttt-ttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32918529 ttgtaataaattgatcttttgagttttatttcgtatcacttagctcctttaagttaattaattataa 32918595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281329
Alignment:
Q  237 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||| | ||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttgg-tggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
     ||||       ||||||| ||||||||||  | | ||| |||||| |  || | ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||  || ||||||    
T  40281473 tttga-------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaa 40281381  T
Q  433 ttct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgt 484  Q
    || | || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  40281380 ttttgtgtgttctctctttcttt-tctctagctgttttctaatttttgcttgt 40281329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 1532501 - 1532441
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1532501 tttaagtttttt-cgtaccacttacgctctttaagttacttaattgtaacaagttggtcctt 1532441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120937
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 419
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046772
Alignment:
Q  316 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttgg 413  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||   ||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattgg 6046766  T
Q  414 accgaa 419  Q
    ||||||    
T  6046767 accgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369683
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 21369683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1049203 - 1049128
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  1049203 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgaatttttcttcgaattcgcaacaa 1049128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 440 - 538
Target Start/End: Original strand, 6349098 - 6349191
Alignment:
Q  440 gttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctcca 538  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6349098 gttctctctttctttctctc--gctattttctacttttg-cttgtgtttataact--tccgtacactttgttttggttgcttgattattacttgctcca 6349191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1097
Target Start/End: Original strand, 6586862 - 6586938
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaatt 1097  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6586862 ttttaagtaatttaattgtaataaattgatctcttaaatttttttggtactacttaggtcatttaagttaatcaatt 6586938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1212 - 1252
Target Start/End: Complemental strand, 32857890 - 32857850
Alignment:
Q  1212 ttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaa 1252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32857890 ttacaattaaataacttaaaagacctaagtgttacgaaaaa 32857850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7094717 - 7094662
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 191  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 915 - 950
Target Start/End: Original strand, 21595127 - 21595162
Alignment:
Q  915 taacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaat 950  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21595127 taacaaactttgaaaaaattatgaatttaaagaaat 21595162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1023 - 1102
Target Start/End: Original strand, 48447283 - 48447362
Alignment:
Q  1023 ttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  |  ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48447283 ttaagttatttaattgtaacaaattagtactttaagtatttttcgtaacgcttaggtcctttaagttatttaattgtaac 48447362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320194
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3320194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324942
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069818
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7069818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074825
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 9190059 - 9190101
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190059 tctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1296 - 1334
Target Start/End: Original strand, 12422352 - 12422390
Alignment:
Q  1296 cttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgatac 1334  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12422352 cttgttaaaattaaataacttaaaagacgtaagtgatac 12422390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24813419 - 24813348
Alignment:
Q  512 ttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||  |||||||| ||||||||    
T  24813419 ttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattt--tcatcgaactcacaaca 24813348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351391
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25351391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357085
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25357085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405431
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410168
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25410168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 27347943 - 27347985
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27347943 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36146450 - 36146408
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146450 tctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 36146408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41317476 - 41317434
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41317476 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006701
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4253570 - 4253529
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4253570 tctcccacagagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1059 - 1116
Target Start/End: Original strand, 5762696 - 5762753
Alignment:
Q  1059 ttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtccttta 1116  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5762696 ttttttccgtaccacttaggtaatatatgttaattaattgtaacaagttggttcttta 5762753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Original strand, 6348859 - 6348903
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348859 ctagggtttgtatcgagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 15540898 - 15540842
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt-ctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15540898 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggtttttctcaacgaattcacaacaag 15540842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 549
Target Start/End: Original strand, 22108401 - 22108483
Alignment:
Q  466 ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtt 549  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22108401 ttttctacttttggctcgt--attttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagtt 22108483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 486
Target Start/End: Original strand, 25276381 - 25276474
Alignment:
Q  393 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||  ||| ||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  25276381 ccccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt--tttttctctcgttgttttctactttttacttgtgt 25276474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 117)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14419520 - 14419034
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14419520 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagttt 14419421  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  14419420 gtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 14419321  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  14419320 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagac 14419221  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  14419220 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttc 14419121  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||| | || ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14419120 catacactttgttttggtttcctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 14419034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 30480832 - 30480353
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30480832 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagttt 30480733  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||     
T  30480732 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttggg 30480633  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||    
T  30480632 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagact 30480533  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  30480532 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgttttctacttttggcttgtatttataattgttcc 30480433  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  30480432 atacactttgttttggttgcttgattattccttactccacacatcaaatttgttattggtgtcattttctcattgaattc 30480353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 102 - 577
Target Start/End: Original strand, 14807757 - 14808244
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14807757 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 14807856  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  14807857 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 14807956  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg----------ttttct 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||           | |||    
T  14807957 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctctct 14808056  T
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     
T  14808057 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgttta 14808156  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaat 577  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14808157 taattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttttcatcgaat 14808244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27107226 - 27106754
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107226 ctataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 27107127  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  27107126 gtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggg 27107027  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||| |||||||    
T  27107026 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagact 27106927  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||||| | ||||  | |||   ||||    
T  27106926 aggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctctttctttctctc--gttgttttctacttttgtc-tgtgattataa--cttcc 27106832  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
     || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27106831 atacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaatt 27106754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 102 - 590
Target Start/End: Original strand, 15072716 - 15073207
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15072716 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagttt 15072815  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga-gattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||  |||||    
T  15072816 gtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgg 15072915  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | | ||| | ||||||||||||    
T  15072916 gtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagac 15073015  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  15073016 taggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtt 15073115  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagttt 590  Q
    || || ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15073116 ccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacatgttt 15073207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 13858813 - 13858334
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13858813 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 13858714  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  13858713 gtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttggg 13858614  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | ||| | ||||||||||||    
T  13858613 tagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 13858515  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc-ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||   ||||    
T  13858514 taggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattctttgtgttctccctttctttctctc--actgttttctacttttggcttgtgtttataa--cttcc 13858419  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  13858418 atacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttcttattggtgtgatttt-tcatcgaatttacaaca 13858334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Original strand, 36865543 - 36866023
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36865543 ctataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 36865642  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||| |   |||||    
T  36865643 tgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaactttgg 36865739  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacg-aatgactgttttctccccca- 397  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||||     
T  36865740 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatg-ctgctctctcccccaa 36865838  T
Q  398 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct--tgcgttctctcttcctttct--ctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||  |||||  |||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  36865839 gactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctttttttctttctctcgttgttttctacttttggcttttgtttataat 36865938  T
Q  494 tattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  36865939 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattgatgtggttttcacaacgaatt 36866023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 102 - 582
Target Start/End: Original strand, 1225172 - 1225644
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1225172 ctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagttt 1225271  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  1225272 gtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 1225371  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||| || ||    
T  1225372 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatac 1225471  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||        
T  1225472 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttgacttgtgtttataatt---- 1225565  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtt-ttctcatcgaattcaca 582  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||    
T  1225566 ------gtttgttttggttgcttgattattccttgttccacacatcaagtatgttattggcgtgattattttcatccaattcaca 1225644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 28251896 - 28251410
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28251896 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28251797  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  28251796 gtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 28251697  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| |||    
T  28251696 taaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatact 28251597  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||    
T  28251596 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttgtggcttgtgattataattgtt 28251497  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28251496 ccatacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 28251410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 128 - 586
Target Start/End: Original strand, 15068013 - 15068473
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15068013 taaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 15068112  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15068113 tgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15068212  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15068213 gtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggcca 15068312  T
Q  428 acaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
    ||||||||  ||| |||| | |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||      
T  15068313 acaaattcttttgtgttcacccttcttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttgtaattgttccatacactttgttttggttgcttgac 15068412  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  15068413 tatcccttgttccacacatcaagtttgttgttggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 15068473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 588
Target Start/End: Original strand, 25952554 - 25953013
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952554 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 25952652  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |   |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  25952653 gagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttg 25952752  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952753 taactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtca 25952852  T
Q  428 acaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| | |||||  | | || ||||| ||||||||||||| ||    
T  25952853 acaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgccgttttctacttttggattgtgtttataattgcttcatacactttattttggttgcttgatt 25952951  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 588  Q
    ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25952952 atcactttctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaagt 25953013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 33541717 - 33541255
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33541717 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 33541618  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |     
T  33541617 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttgg 33541518  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||                      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||    
T  33541517 tagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagact 33541440  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  33541439 aggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgatttctacttttggcttgtgtttataattgttcc 33541340  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33541339 atacactttattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tgatcgaattcacaaca 33541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 41382679 - 41383155
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  41382679 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaattt 41382778  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  41382779 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 41382867  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||||||||||    
T  41382868 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 41382967  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||    
T  41382968 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttctggcttgtgtttataattgtt 41383067  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || || ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  41383068 ccataaactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggtttt-tcatcgaactcgcaacaa 41383155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 4424024 - 4424513
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4424024 ctataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 4424123  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||    
T  4424124 gtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgga 4424223  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| | |  | | ||| | |||||||||||||    
T  4424224 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 4424323  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4424324 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 4424420  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  4424421 attgttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacaccaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 4424513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 32339349 - 32339804
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  32339349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 32339448  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339449 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 32339548  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32339549 ttgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattc 32339648  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   | ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |    
T  32339649 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttattttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgat 32339745  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  32339746 tatcccttgccccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 32339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 3874050 - 3874488
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3874249  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874250 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3874349  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3874350 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttggttatctcttgct 3874439  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  3874440 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcaacgaattcacaacaa 3874488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 104 - 437
Target Start/End: Original strand, 27911023 - 27911354
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27911023 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27911121  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||    
T  27911122 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 27911221  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactag 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || | ||| ||||||||||     
T  27911222 gaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaa 27911320  T
Q  404 gtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27911321 gtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27911354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 104 - 437
Target Start/End: Original strand, 27957442 - 27957773
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27957442 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27957540  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||    
T  27957541 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 27957640  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactag 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || | ||| ||||||||||     
T  27957641 gaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaa 27957739  T
Q  404 gtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27957740 gtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27957773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 27829303 - 27829790
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27829303 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 27829402  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||   ||||     
T  27829403 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttggg 27829502  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  27829503 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 27829601  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  27829602 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tatattta 27829698  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  27829699 attgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 27829790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 588
Target Start/End: Original strand, 41384751 - 41385236
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41384751 ctataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 41384849  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |     
T  41384850 gtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttagg 41384949  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| |||    
T  41384950 tagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatact 41385049  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||    
T  41385050 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctcttccatttctctcgctgttgttttatacttttggcttgtgtttataattgtt 41385149  T
Q  498 ccttatac-tttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagt 588  Q
    || || || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  41385150 ccatacacttttgttttggttgtttgattatcccttgctccac----caagtttgttatttgtgtgatttt-tcatggaattcgcaacaagt 41385236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 27826992 - 27827480
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27826992 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 27827091  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||   ||||     
T  27827092 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttggg 27827191  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  27827192 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 27827290  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  27827291 aagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtattta 27827387  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  27827388 attgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 27827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 15809259 - 15809711
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15809259 gagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggtt 15809357  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809358 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 15809457  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15809458 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 15809557  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||| ||||| ||  ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||| ||    
T  15809558 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctatttttgcct--tgtatttaattgtttcatacactttgttttggttgcttgatt 15809654  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  15809655 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 15809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 608774 - 609230
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  608974 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 609073  T
Q  436 ---ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg--ttttggttgcttg 522  Q
       ||| |||| ||||||| |    |||| ||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | || ||||||  |||||||||||||    
T  609074 tttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tcttgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgtttcatacactttgttttttggttgcttg 609170  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  609171 attatctcttgctccacgcatcaag-ttgttattggtgcgattt--tcatcgaattcacaaca 609230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28283514 - 28283061
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28283514 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggtt 28283415  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28283414 gattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccca 28283315  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28283314 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 28283217  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||| || || | || ||||||||||||||||||| ||    
T  28283216 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttatttttttcatacactttgttttggttgcttgatt 28283120  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  28283119 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 28283061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5372506 - 5372025
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  5372506 ctataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagttt 5372408  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||      
T  5372407 gtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgag 5372308  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct-cccccaga 399  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |  | ||| ||||||||    
T  5372307 tataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccaga 5372208  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttct-ctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||   ||||  |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||| | |||    
T  5372207 ctaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatt---ttctgttctttctttctctcat--tgttttctacttttggcttgagtttataactgttc 5372113  T
Q  499 cttatacttt-gttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || | |||  |||| ||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||    
T  5372112 catacattttaattttagttgcttgaatatccattgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttttatcgaattcaaaaca 5372025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684490
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  335 --attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
      |||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22684652  T
Q  433 ttc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgctt 521  Q
    |||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |    
T  22684651 ttcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccataaactttgattttggttgcct 22684555  T
Q  522 ggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttct-catcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  22684554 gattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttccatcgaattcgcaacaa 22684490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15186039 - 15185564
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||   || |||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  15186039 ctataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagttt 15185940  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||        
T  15185939 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatttgggt---- 15185844  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||    
T  15185843 ---agaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctag 15185747  T
Q  399 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | || ||  | |||   |    
T  15185746 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctttctttctctc--gttgttttctactttt-gtttatgattataa--ct 15185652  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  15185651 tccatacactttgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt-tcaccgaattcacaaca 15185564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 18810714 - 18811203
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18810714 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18810813  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  ||| |     
T  18810814 gtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttagg 18810913  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||| |    
T  18810914 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagatt 18811012  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgct---gttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18811013 aggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgctgtcgttttctacttttggct--tgtattta 18811109  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18811110 attgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 18811203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Original strand, 44720849 - 44721315
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  44720849 ctataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtct 44720948  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||    
T  44720949 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 44721048  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||| |||||    
T  44721049 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagac 44721147  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattt 490  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  44721148 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtattt 44721244  T
Q  491 aattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44721245 aattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtg 44721315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 194 - 587
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530611
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  294 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcc 393  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||     
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  394 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||||||   ||||||||||||||||||      
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tcttgccattgttttctacttttggct-- 43530509  T
Q  484 tgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||    
T  43530510 tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcattgaattcgcaa 43530607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 144 - 434
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079940
Alignment:
Q  144 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 243  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  244 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  343 cccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    | | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43079850 ctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 21482328 - 21482798
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||        |||| |||||||||||||| |||||    
T  21482328 ctataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtataaagttt 21482419  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||     
T  21482420 g-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttggg 21482515  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  21482516 tagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaac 21482615  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||  | |||   ||||    
T  21482616 taggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctactttt-gtttgtgattataa--cttcc 21482711  T
Q  500 ttatactt--tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     || ||||  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21482712 atacactttattttttggttgcttcattatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 21482798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 14477282 - 14477522
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14477282 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 14477381  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  14477382 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 14477481  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477482 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082311
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43082213 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 186 - 586
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956444
Alignment:
Q  186 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  286 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 384  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  385 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggctt 482  Q
      | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||| | ||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttctctc--gttgttttctac-tttcgttt 15956343  T
Q  483 gtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    |||  | |||   || | || ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  15956344 gtgattataa--ctttcatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt-tcatcgaattcaca 15956440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 127 - 586
Target Start/End: Original strand, 21480545 - 21480991
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21480545 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtt 21480635  T
Q  227 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 326  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21480636 t---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattct 21480732  T
Q  327 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21480733 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T
Q  426 -caacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg--ttttggttgcttg 522  Q
      || |||||| || |||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||| | |||||  | |||   |||| || ||||||  ||||||||| |||    
T  21480833 aaaaaaaattcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttcttctttt-gtttgtgattataa--cttccatacactttgttttttggttgtttg 21480928  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || |  ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  21480929 attgtcacttactccacacatcaagtttattattggtgttatttt-tcatcgaattcacaacaa 21480991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24873476 - 24873178
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  24873476 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggtt 24873377  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24873376 gattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccg 24873277  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  24873276 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 18812899 - 18813376
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||           |||||    
T  18812899 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agttt 18812987  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  |  |||||     
T  18812988 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttggg 18813087  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||| | |    
T  18813088 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatatt 18813186  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18813187 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgtcgttttctacttttggct--tgtattta 18813283  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  18813284 attgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctctacatatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 18813376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Original strand, 31162219 - 31162684
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  31162219 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaaca-agcaacaaat-tagtgtttgtataaagtt 31162316  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||  |||||    
T  31162317 tg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgg 31162413  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct--ccccca 397  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||  | | ||| | |||  ||||||    
T  31162414 gtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccccca 31162513  T
Q  398 gactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||| ||   || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||        
T  31162514 gactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctcttttttcttttctctcgttgttttctacttttggct--tgtatttataac 31162611  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    |||| || |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  31162612 ttccatacactttgttttggttacttaattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattttc 31162684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005486
Alignment:
Q  126 tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaaca-aataacaaa-ctagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  225 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttatt 324  Q
    ||| ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  325 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaacta 422  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| | |  || | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactg 3005639  T
Q  423 ggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttg 522  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||| | || ||| ||| |||   |  ||||||||    |||| || |||||| |||||||| |||    
T  3005638 ggtaaacaaattcttgtgttctccctttct---tctctcgttg-tttgtaccttt---tcttgtatttataacttccatacactttg-tttggttgtttg 3005547  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  3005546 attattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 3005486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5623041 - 5622879
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5623041 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtt 5622942  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5622941 tgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagatt 5622879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35872707 - 35872555
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||    
T  35872707 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagttt 35872613  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 259  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872612 gtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37214302 - 37214108
Alignment:
Q  393 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtattt 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |    
T  37214302 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttat 37214203  T
Q  491 aattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37214202 aattgttctatacactttgttttggttgcttgcttatctcttactccatacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcaaattcacaacaa 37214108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 273
Target Start/End: Original strand, 26775207 - 26775378
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26775207 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagttt 26775306  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 273  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775307 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 301 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2468260 - 2467978
Alignment:
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | ||| | |||| ||||||    
T  2468260 atagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccaga 2468161  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||  |||||  | |||   |||    
T  2468160 ttaggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctaattttgttttgtgattataa--cttc 2468064  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  2468063 cctacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 2467978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872300
Alignment:
Q  318 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 417  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||             ||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 35872467  T
Q  418 aactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttgg 515  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttg---ttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 35872370  T
Q  516 ttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35872369 ttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 35872300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  219 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacgtg--aagagattagggttttggatagaattaggcggg 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||| | ||  ||||| |||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  316 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 231 - 499
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035522
Alignment:
Q  231 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-gacttattcttgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| | ||||||||||   || |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  330 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac--taggtcaat-ttggaccgaactaggt 425  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  426 caacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
     |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  31035451 aaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctagtttt-gcttgtgtttttaattgttcc 31035522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 14477547 - 14477741
Alignment:
Q  393 ccccagactaggtcaatttggaccgaacta-ggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||| |     
T  14477547 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttcttttctctctcgcttttttttt-ttttggcttgtgttta 14477645  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | ||| || | || |||||||||||||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14477646 tgattgtttcatacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 14477741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578234
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  333 ccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||| | ||||||| ||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  431 aattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |||| ||| || ||||||  |||||||||  | |||||||||||||||    
T  31578276 aatt-ttgtgtgctctct--ctttctctc--gttgttttctacttttg 31578234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  294 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcat 363  Q
      ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37214517 - 37214317
Alignment:
Q  124 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatct-------------------agggtttgtatagagtttgtc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||                   |||||||||||||||||||||    
T  37214517 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtc 37214418  T
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 304  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| |||    
T  37214417 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtag 37214327  T
Q  305 aattaggcgg 314  Q
    ||||||||||    
T  37214326 aattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1108
Target Start/End: Complemental strand, 2277295 - 2277209
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttg 1108  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2277295 tttaagttatttaattgtaacaaattgatcctttaagttttttttgtaccacttaggtcctttaagttaattaattgtaacaagttg 2277209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 268  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1101
Target Start/End: Original strand, 27532989 - 27533069
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27532989 ttttaagttatttaattgtaataaattgatcttttaagttttttatgtaccacttacgtcctttaagttatttaattataa 27533069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12517319 - 12517248
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctct 207  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12517319 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1038 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 37064768 - 37064689
Alignment:
Q  1038 gtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37064768 gtaataaattaatcaattaagtttttttcgcaccacttaagtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 37064689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  192 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3883553 - 3883436
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  3883553 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaag-ttgttattgatgtga 3883457  T
Q  564 ttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  3883456 tttt-tcatcgaattcgcaaca 3883436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3886247 - 3886153
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 196  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3886247 ctataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1105
Target Start/End: Original strand, 15907689 - 15907790
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15907689 taaattacaccagaaatcctttaagttatttacttgtgataaattggtc-tttaagtttttttcgtaccacttatattctttaagttaattaattataac 15907787  T
Q  1103 aag 1105  Q
    |||    
T  15907788 aag 15907790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 15908058 - 15907944
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15908058 taaattacaccaaaaatcctttaagatatttaactgtaataaattagttatttaagtttttttcataccacttaggttttttaggttaattaattataac 15907959  T
Q  1103 aagttggtcctttaa 1117  Q
    |||||| ||||||||    
T  15907958 aagttgatcctttaa 15907944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1273
Target Start/End: Original strand, 2510015 - 2510263
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaag-ttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaann 1119  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |  |||| | |||||| | |||||||||||||    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||      
T  2510015 ttttaagttatttaattgtaataaattggt--tttatgttttttttcataccacttaggtc----aagttaattaattgcaacaaattgttcctttaagt 2510108  T
Q  1120 nnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcg-ggacctaaagttacaat 1218  Q
         ||||| |||||| |||| |||| || |||| || || || ||||| ||||||| || |||||| || |||||||||| || |  ||| ||||| |    
T  2510109 ttttccgtacaaattagatcctttaagttacttaattgcaacaatttgagagatttcatattttaaaaatgtaagttattcgtggtctaaaaattacact 2510208  T
Q  1219 taaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  2510209 taaataacttaaaggagctaagtgttacaaaaaataattaaagaactaacttgtt 2510263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 529 - 585
Target Start/End: Original strand, 183255 - 183310
Alignment:
Q  529 ccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  183255 ccttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaaca 183310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 518
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181901
Alignment:
Q  415 ccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttt 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgt--tgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttt 181895  T
Q  513 tggttg 518  Q
    ||||||    
T  181896 tggttg 181901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1085
Target Start/End: Complemental strand, 12807748 - 12807666
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtccttta 1085  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12807748 taaattacaccagagatcttttaagttatttaattgttataaattgattttttaaattttttacataccacttaggtccttta 12807666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 3807000 - 3806871
Alignment:
Q  1143 taagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtg 1242  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| || |||||| || || |  ||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  3807000 taagttatttaactgtaacaa-ttgagatatttcatatcttaaaaatgtaagttactcagggctaaaaattataattaaataattaaaaggacctaagtg 3806902  T
Q  1243 ttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
     || |||||||||||| || |||||||||||    
T  3806901 ctacgaaaaatacttaaatgactaacttgtt 3806871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24873119 - 24873039
Alignment:
Q  504 actttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24873119 actttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 24873039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 181543 - 181632
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 191  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  181543 ctataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1288 - 1333
Target Start/End: Complemental strand, 18080645 - 18080600
Alignment:
Q  1288 ataactaacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgata 1333  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18080645 ataactaacttattacaattaaataacttaaatgacgtaagtgata 18080600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 587
Target Start/End: Original strand, 27911439 - 27911569
Alignment:
Q  454 tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgtt 553  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||||| ||| ||   ||||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27911439 tctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcca-acactttgttttagtttctaa-ttatcacttgctccacacatcaagtttttt 27911536  T
Q  554 attggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  27911537 attggtgtgatttt-tcaacaaattcacaacaag 27911569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 587
Target Start/End: Original strand, 27957858 - 27957988
Alignment:
Q  454 tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgtt 553  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  | |||||||||| ||| ||   ||||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27957858 tctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttcca-acactttgttttagtttctaa-ttatcacttgctccacacatcaagtttttt 27957955  T
Q  554 attggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  27957956 attggtgtgatttt-tcaacaaattcacaacaag 27957988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 567
Target Start/End: Original strand, 43082350 - 43082450
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| | |  | || ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  43082350 tgttttctacttttggcttgtatttataacttt--catacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 43082446  T
Q  564 tttt 567  Q
    ||||    
T  43082447 tttt 43082450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 25684919 - 25684972
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25684919 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 25684972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4823600 - 4823550
Alignment:
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4823600 ctccacacatcaagttt--tattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 4823550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10930241 - 10930192
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 438  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10930241 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttg 10930192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17799325 - 17799277
Alignment:
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17799325 cacatatcaagttt-ttattggtgtggttttcacaacgaattcacaacaa 17799277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31566600 - 31566514
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctactt 475  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  31566600 tctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctctttctttctctc--gctgttttctactt 31566514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1018 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 32566969 - 32566875
Alignment:
Q  1018 gtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |  ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  32566969 gtcttttaagttattttattataagaaattgatcctttagg--ttttatgtactatttaggtcatttaagtttattaattgtaacaagctagtcctt 32566875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267161
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattagg 2267161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1020 - 1108
Target Start/End: Complemental strand, 2967794 - 2967707
Alignment:
Q  1020 cttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttg 1108  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||| |  |||||||||||| | | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2967794 cttttaagttatttaatcctaacaaattgttt-tttaagtttttttccttctacttagatcctttaaattaattaattataacaagttg 2967707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 3807091 - 3806998
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||| || | |||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  3807091 tttaaattatttaatagtaacaaattggtcctctaagtttttta--tacaacttatgtcttttaagttaattaattttaacaagttagtactttaa 3806998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 28895780 - 28895833
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28895780 ttgctccacgcatcaagttt--tattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 28895833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 4812386 - 4812336
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4812386 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcaca 4812336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14419827 - 14419784
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag 144  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  14419827 gctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 353
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847782
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 330  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  331 acccattgatatcccttttgtaa 353  Q
    | || |||||||| |||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa 17847782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 567
Target Start/End: Original strand, 43080017 - 43080079
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  43080017 actttgttttggttgcttaattatccattgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 43080079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1345413 - 1345371
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1345413 tctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaa 1345371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021251
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1126 - 1258
Target Start/End: Original strand, 12189869 - 12190002
Alignment:
Q  1126 gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattga-gggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaat 1223  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||||||| |||  | ||| |||| |||  || ||||||||||||||||    
T  12189869 gtaccaattaggtcatttaagttatttaactgt-acaaattaacggaatttcagatcttgaaaacgtaagatattaggggtctaaaagttacaattaaat 12189967  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    || |||||  ||||||||||||   ||||||||||    
T  12189968 aaattaaagaacctaagtgttacagaaaatactta 12190002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1126 - 1258
Target Start/End: Original strand, 12434297 - 12434430
Alignment:
Q  1126 gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattga-gggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaat 1223  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||||||| |||  | ||| |||| |||  || ||||||||||||||||    
T  12434297 gtaccaattaggtcatttaagttatttaactgt-acaaattaacggaatttcagatcttgaaaacgtaagatattaggggtctaaaagttacaattaaat 12434395  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    || |||||  ||||||||||||   ||||||||||    
T  12434396 aaattaaagaacctaagtgttacagaaaatactta 12434430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 15212912 - 15212954
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15212912 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757411
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 19175805 - 19175847
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19175805 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 19752445 - 19752487
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19752445 tctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26268138 - 26268084
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26268138 ttgctccacgcatcaagtttattattggtgtggttttcagaacgaattcacaaca 26268084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 27811404 - 27811446
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27811404 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327946
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332669
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 28332669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 586
Target Start/End: Original strand, 28891062 - 28891096
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28891062 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 28891096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 33352276 - 33352318
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33352276 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 40321206 - 40321248
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40321206 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1038 - 1108
Target Start/End: Complemental strand, 45445210 - 45445141
Alignment:
Q  1038 gtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttg 1108  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  45445210 gtaataaattggtcgtttaagtttttt-cgtaccaattaggtcctgtaaattatttaatcataacaagttg 45445141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 999 - 1091
Target Start/End: Complemental strand, 41216 - 41123
Alignment:
Q  999 atgttaaattacaccataag-tcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaa 1091  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  41216 atgttaaattacaccaagagatcctttaaattatttaattgtaacaaattagtcctttaagttttttgtgtaccacttatgttatttaagttaa 41123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 585
Target Start/End: Original strand, 591093 - 591126
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  591093 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 591126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 430
Target Start/End: Original strand, 4733832 - 4733873
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4733832 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1208 - 1272
Target Start/End: Complemental strand, 8453163 - 8453098
Alignment:
Q  1208 aaagttacaattaaataacttaaacg-acctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgt 1272  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  8453163 aaagttacaatcaaataacttaaaaggatgtaagtgttatgagaaatacttaaatgactaacttgt 8453098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985954
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagatt 13985954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 29554738 - 29554705
Alignment:
Q  552 ttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29554738 ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 29554705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1050 - 1095
Target Start/End: Original strand, 32566724 - 32566769
Alignment:
Q  1050 tcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaa 1095  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32566724 tcatttaagtttttttcgtgccacttaagtcctttaagttatttaa 32566769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Original strand, 43530168 - 43530209
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaac 177  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  43530168 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac 43530209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 122)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3630193 - 3629711
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630193 ctataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3630094  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  3630093 gtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttggg 3629994  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||  | | ||| | ||| ||||| |||    
T  3629993 tagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccccatact 3629895  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||    
T  3629894 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctactttttggcttgtgtttataattgttc 3629797  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3629796 catacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaaca 3629711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3632267 - 3631783
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3632267 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3632168  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||     
T  3632167 gtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttggg 3632068  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||   |||  |||||||    
T  3632067 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctgtcccagac 3631970  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  3631969 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttttctctcgatgttttctacttttggcttgtgtttataattgttc 3631870  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3631869 catacactttgttttggttgcctaattatcacttgctccacacgtcaagtttgttattggtgt-gttttttcatcgaattcacaacaa 3631783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11983358 - 11982871
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11983358 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11983259  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  11983258 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 11983159  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||    
T  11983158 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 11983059  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||   || ||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  11983058 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattgtaattgt 11982959  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11982958 tccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 11982871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 13057179 - 13057659
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057179 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagttt 13057278  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  13057279 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 13057378  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||  | ||||||||| ||    
T  13057379 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaac 13057478  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||     
T  13057479 taggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctatctgttttctactttt-gtttgtgattataattgttg 13057576  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |    ||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  13057577 c--ccacttt-tattggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 13057659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 9019911 - 9020398
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9019911 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 9020010  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||||     
T  9020011 gtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttggg 9020110  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||||||| |||    
T  9020111 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaact 9020210  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |    
T  9020211 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtatttataattgt 9020310  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || |||||||||||||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  9020311 tccatacactttgttttggttgtctgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 9020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24338777 - 24338294
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  24338777 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagttt 24338678  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  |||||    
T  24338677 gtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgg 24338578  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||   |||||||||||    
T  24338577 gtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccaga 24338480  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa--attcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  24338479 ctatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttcttttctctc--gttgttttctacttttggtttgtgtttataattgtt 24338382  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24338381 ccatacactttgttttggttgcttgactatctcttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 24338294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 102 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 30729157 - 30728686
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30729157 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagttt 30729058  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||     
T  30729057 gtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttggg 30728958  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc----cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccca 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     ||||||||| |||||||||  ||||||| |||| | | ||| | |||||| ||    
T  30728957 tagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcccgca 30728858  T
Q  398 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaatta 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||     
T  30728857 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtatttataattg 30728758  T
Q  496 ttccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30728757 ttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 30728686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 32279982 - 32280463
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||  |||||| | |||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32279982 ctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 32280080  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  |     
T  32280081 gtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcagg 32280180  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  32280181 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagac 32280280  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||| ||     
T  32280281 taggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttcctttctctcatgttattttctacttttggcttgtatttataattgtta 32280380  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |  |    |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  32280381 ccca---cttgtattggttgcttgattatcacttactccatacatcaagtttgttatttgtgtgatttt-ttatcgaattcacaaca 32280463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28241650 - 28241162
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28241650 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 28241551  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||| |     
T  28241550 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcgg 28241451  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||||    
T  28241450 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagact 28241351  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28241350 aggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttttcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 28241253  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  28241252 ttgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 28241162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Original strand, 3390364 - 3390700
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3390364 ctataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3390463  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||     
T  3390464 ttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttggg 3390563  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  3390564 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatac 3390663  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  3390664 taggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattctt 3390700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 13039739 - 13040117
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  13039739 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagttt 13039838  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||      
T  13039839 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcg 13039938  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||| ||||    
T  13039939 tagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 13040038  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  13040039 taggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctcgttgttttctacttttg 13040117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14507504 - 14507039
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14507504 ctataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 14507405  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  14507404 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 14507305  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||| ||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||||    
T  14507304 tagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagact 14507206  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14507205 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 14507109  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14507108 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 14507039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 103 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458605
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |  | | ||| | ||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  403 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttc-tctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    ||| |||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgtcgttgttttctacttttggct--tgtatttaat 14458698  T
Q  494 tattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    | |||| || |||||| |||||||||| || |||| | || ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  14458697 tgttccatacactttgattttggttgcctgattatccattactccacacatcaag-ctattattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaag 14458605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3234059 - 3233567
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  3234059 ctataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagttt 3233961  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  3233960 gtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgg 3233861  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||    
T  3233860 gtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacac 3233761  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaacta-----ggtcaacaaattctt--gcgttctctcttccttt-ctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    ||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3233760 taggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggtttgtgtttata 3233661  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || | |  |||||| |||||||||| || ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  3233660 attgtttcatgcactttgattttggttgcctgattatcacttactccacacatcaaatttgttattgatgtg-ttttctcatcgaattcgcaaca 3233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 105 - 437
Target Start/End: Original strand, 25477262 - 25477602
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtc 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25477262 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtc 25477361  T
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||| |||    
T  25477362 tcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtag 25477461  T
Q  305 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa-------ggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||| |||||||||||  | | ||| | ||||||||    
T  25477462 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctccccc 25477561  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25477562 atactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattctt 25477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 102 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 1230578 - 1230106
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1230578 ctataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1230479  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  | ||  |||||     
T  1230478 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttggg 1230379  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  1230378 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagact 1230279  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1230278 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcattgtgttct-tctcgccgttgttttatacttttggctt-tgtattta 1230181  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||| || | || ||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  1230180 attgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgatccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 1230106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816088
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 4816227  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |    
T  4816226 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgat 4816130  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  4816129 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 4816088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15541469 - 15540989
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15541469 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 15541370  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||     
T  15541369 gtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttggg 15541270  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaac-gaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||    
T  15541269 taggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaag-ctgctctctcctccagac 15541171  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||| | |||||  | ||| | ||     
T  15541170 taggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ttttctctctcgttgttttctaatttt-gtttgtgattataactgtta 15541073  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |    |  ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||    
T  15541072 c---caacttgttttggtttcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtttgatttt-tcatcgaagtcgcaacaa 15540989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915214
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20915451 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20915353  T
Q  435 ct-tgcgttc-tctcttcct----ttc-tctc-ttgctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    || || |||| ||||||| |    ||| |||| | | || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||    
T  20915352 ctctgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgtcgttgtttttctacttttggct--tgtatttaattatttcatacactttgttttggttgcttgatt 20915255  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    |  |||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  20915254 accccttgccccacacatcaag-ttattattggtgtgatttt 20915214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967658
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 30967419  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30967420 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30967519  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||    
T  30967520 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttgact--tgtatttaattattccatgcactttgttttggttacttgatt 30967616  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30967617 atctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 30967658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 105 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12161880 - 12161501
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtc 204  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12161880 taaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 12161782  T
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 304  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  |  ||| | ||     
T  12161781 tctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtat 12161684  T
Q  305 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactagg 404  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||| ||| | ||||||    
T  12161683 aattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactagg 12161585  T
Q  405 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12161584 ttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgtcttgtgt 12161501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 19704864 - 19704403
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||||    
T  19704864 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggtt 19704765  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704764 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19704665  T
Q  335 attgatatccct-tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19704664 attgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19704565  T
Q  434 --tcttgcgttc-tctcttcct-------ttctctc--ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg--ttttggttgc 519  Q
      | ||| |||| ||||||| |       ||||| |  ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||    
T  19704564 tattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttg-ttttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgatttttggttgc 19704468  T
Q  520 ttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctc-atcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  19704467 ttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcgatcgaattcacaaca 19704403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15533010 - 15532676
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15533010 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 15532911  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||| |     
T  15532910 gtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttgg 15532811  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | | | ||| |||||    
T  15532810 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagact 15532712  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15532711 aggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctt 15532676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2629179 - 2628726
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  2629179 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaaccca 2628981  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2628980 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 2628882  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || |||||| ||||||||||||| |    
T  2628881 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacactttgattttggttgcttgat 2628785  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  2628784 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 2628726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065458
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-- 433  Q
    ||||  || | ||||||| ||||||| | |||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26065202 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 26065299  T
Q  434 tcttgcgttctctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttat 527  Q
    | ||| ||||||| ||| ||| |   ||||||   ||||||||||||||||| ||||  | ||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||  |||    
T  26065300 ttttgtgttctctattcttttgttcttcttgctgttgttttctacttttggcatgtgattataactgttccatacgctttgattttggttgcttgactat 26065399  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26065400 cccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaacaa 26065458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085427
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat-- 433  Q
    ||||  || | ||||||| ||||||| | |||||||| | || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  26085171 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 26085268  T
Q  434 tcttgcgttctctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttat 527  Q
    | ||| ||||||| ||| ||| |   ||||||   ||||||||||||||||| ||||  | ||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||  |||    
T  26085269 ttttgtgttctctattcttttgttcttcttgctgttgttttctacttttggcatgtgattataactgttccatacgctttgattttggttgcttgactat 26085368  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26085369 cccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaacaa 26085427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15530451 - 15530177
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15530451 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 15530352  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||     
T  15530351 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttggg 15530252  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacg 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15530251 ttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacg 15530177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 237 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069563
Alignment:
Q  237 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  337 tgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttg 533  Q
      ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| || ||||||||||| |||||||  ||| |||||    
T  1069713 ttttatgttctctcttcttttctctctcgctgttttctactttttgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttg 1069614  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| | ||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1069613 ctccatacatcgaatttgttattggtat-attttctcatcgaattcacaaca 1069563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 183 - 587
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367500
Alignment:
Q  183 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 282  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  283 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatga 382  Q
    ||||||||     ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| | |     
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  383 ctgttttctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggc 480  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgtatt--tttctacttttggc 15367394  T
Q  481 ttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattca 580  Q
    |||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15367395 ttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacatgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattca 15367493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30034898 - 30034597
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30034898 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 30034799  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034798 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 30034699  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | | || | | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30034698 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30034599  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  30034598 tt 30034597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12195844 - 12195515
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12195844 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 12195745  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||     
T  12195744 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 12195645  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  12195644 gtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 12195546  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12195545 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 581
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466787
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  293 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttct 391  Q
    |  ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| | | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtat 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctttctttctctcgctgctgttttctactttt-gtttgtgatt 14466697  T
Q  489 ttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcac 581  Q
     |||   || | || | |||||||||||||||||  |||  |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14466698 ataa--ctttcatacattttgttttggttgcttgactatcacttgctgcacacatcaaatttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcac 14466787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Original strand, 22490626 - 22490889
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggttta-gaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22490626 ataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg 22490725  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| |    
T  22490726 cctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggt 22490825  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22490826 agaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26932857 - 26932559
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  26932857 gagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggtt 26932758  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932757 gattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26932658  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | |  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932657 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 305 - 587
Target Start/End: Original strand, 15346535 - 15346815
Alignment:
Q  305 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |   ||| | ||||||||||||||||    
T  15346535 aattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactagg 15346634  T
Q  405 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt-cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttat 503  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  15346635 tcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctct--tgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatat 15346732  T
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  15346733 actttgttttggttgcttgattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaatttacaacaag 15346815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3028179 - 3027703
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||  |||| || | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3028179 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggcaaca-caaaactagggtttgtatagagttt 3028081  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||      
T  3028080 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgag 3027984  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactg-ttttctcccccaga 399  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||  ||||||||    
T  3027983 tagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccaga 3027884  T
Q  400 ctaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| | | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||  ||||||||    ||    
T  3027883 ctaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctacttttgact--tgtatttataactt 3027788  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  3027787 ccatacacttt-atttggttgctcgattattacttgctccacacatcaaatat-ttatcggtgtgatttt-tcattgaattcacaaca 3027703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 478
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15720005
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  228 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaac---gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactag 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||   || |  || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctcttt--ccccccatactaggtcaatttggaccgaacttg 15719950  T
Q  424 gtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    || |||||| ||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15719951 gtaaacaaatttcatgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctatttttg 15720005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012503
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc-atatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||   |  || |  | ||||||||||    
T  17012224 g-tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagggaacatagaga-tcatctctcccccag 17012321  T
Q  399 actaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||    |    
T  17012322 actaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt-tcatattctctctttctttctctc--actattttctacttttggcttgtgt-tttaa--cgt 17012415  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     | || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17012416 tcatacactttgttttggttgcttgattattatttgctccacacatcaagtattttattgttgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 17012503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 216 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273055
Alignment:
Q  216 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgg 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  315 gagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttgga 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||| ||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  415 ccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttct--ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatac 505  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  | |||||   ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | || ||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatttctcagtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaaaaattacatacac 5273135  T
Q  506 tttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5273134 tttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttttcatcgaattcacaaca 5273055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19227737 - 19227514
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19227737 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 19227638  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  19227637 gtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 19227538  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19227537 tagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311598
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  33311356 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33311455 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctc 33311552  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  33311553 cacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 33311598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754549
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29754693 tcttcttcttttgttcttctcgcagttgttttctactttttggct--cgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctc 29754596  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29754595 cacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 29754549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 248 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26065961
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T
Q  445 --ctcttc--ctttctctctt------gctgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttg 533  Q
       |||||  ||||   ||||      | |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  |||| |||||    
T  26066108 tcttcttcttcttttgttcttctcgcagttgttttctactttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttg 26066011  T
Q  534 ctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26066010 ctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 26065961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309330
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33309186 tcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctc 33309283  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  33309284 cacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 33309330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16455672 - 16455421
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||     
T  16455672 ctagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacgg 16455576  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 380  Q
     |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |     
T  16455575 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggag 16455476  T
Q  381 gactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    | ||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  16455475 ggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068234
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct 444  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T
Q  445 --ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
       ||||| ||| |   ||| ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  26068379 tcttcttcttttgttcttctcgcagttgttttctactttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctc 26068282  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26068281 cacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 26068234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186003
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |  ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 430  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  431 aat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||  | ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctactttttccttgtgtttataattgttcc 12186003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32447645 - 32447502
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32447645 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 32447546  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447545 gtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 567
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945593
Alignment:
Q  232 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggg-agacttattcttgta 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  331 acccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaa 428  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| | | | | || |||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  429 caaatt-cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttat 527  Q
    |||||| | ||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||| |||||| |||| ||  ||| ||||    
T  26945458 caaatttcgtgtcttctctctttcttt-tctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataa--cttccttacactttg-tttgattctttgattat 26945553  T
Q  528 tccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    | |||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  26945554 tacttgtttcacatatcaagtgttttattggtgtgatttt 26945593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 478
Target Start/End: Original strand, 19696453 - 19696803
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagaggg--ggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19696453 aaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactaggg 19696549  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-gacttatt 324  Q
    ||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||  |  ||||| ||||||||||   || ||||||||    
T  19696550 ttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttatt 19696647  T
Q  325 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacta 422  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  ||  ||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||     
T  19696648 cttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactg 19696747  T
Q  423 ggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctg-ttttctacttttg 478  Q
    ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19696748 ggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgtttttctacttttg 19696803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1016 - 1258
Target Start/End: Original strand, 16419591 - 16419837
Alignment:
Q  1016 aagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttac---gtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcc 1112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||     |||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16419591 aagtcctttaagttatttaattgtaacaaattgatcattgaagtattttcttttgtaccaattagatcatttaagttaattaattgtaacaagttggtca 16419690  T
Q  1113 tttaannnnnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-g 1211  Q
    |||||       |||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||| |    
T  16419691 tttaagttttttcgtaccaatttgatcctttaagttatttaaccgtaacaatttgagggattttagatcttagaaatgtaagttatttggggcctaaaag 16419790  T
Q  1212 ttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  16419791 tttcaattaaataacttaaaagacctaagtgttacgacaaatactta 16419837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1072206 - 1072067
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1072206 ctataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagttt 1072107  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 241  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072106 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 443 - 586
Target Start/End: Original strand, 3394695 - 3394838
Alignment:
Q  443 ctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacat 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||     
T  3394695 ctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatccatttctccacac 3394794  T
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3394795 atcaagatttttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaa 3394838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857906
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| | |    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  303 agaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
    ||| |||||   | ||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  400 ctaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttgtacttttg 22857906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 17852527 - 17852650
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17852527 ctataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 17852626  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    |||||||   ||||||||||||||    
T  17852627 gtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 262
Target Start/End: Original strand, 15346376 - 15346524
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||         |||| |||||||||||||| | |||    
T  15346376 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaatt-------caaa-ctagggtttgtataaaattt 15346467  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346468 g-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465443
Alignment:
Q  312 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat- 409  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| | |||| |||| |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  410 ttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatacttt 508  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||    || ||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctc--gctgttttctactttt-gcttgagtttataattgttcc---cacgtt 25465518  T
Q  509 g-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | | ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25465517 gatattggttgcttgattatt--ttgctccatacatcaagtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 25465443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 349 - 467
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584348
Alignment:
Q  349 tgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttctc 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  446 tcttcctttctctcttgctgtt 467  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  10584327 tcttcctttctctctcgctgtt 10584348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25078856 - 25078514
Alignment:
Q  128 taaaccttgagatagag-ggggctgaaat-aaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 225  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  25078856 taaaccttgagagagagaggggccgaaaacaaaggtttagaaacata-caacaa-tctagggtttgta--gagttta-ctcttggcaacaaacattaggg 25078762  T
Q  226 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-gacttatt 324  Q
    ||  |   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  | |||  | ||||||||||   || ||||||||    
T  25078761 ttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttatt 25078665  T
Q  325 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaacta 422  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | ||||| |||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||     
T  25078664 cttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactg 25078566  T
Q  423 ggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctact 474  Q
    ||| |||||||| | || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25078565 ggtaaacaaattttgtgtgttctctctt-ctttttctctaactgttttctact 25078514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 10584111 - 10584213
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10584111 ctataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 10584205  T
Q  202 gtctcttg 209  Q
    ||||||||    
T  10584206 gtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Original strand, 8995464 - 8995570
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8995464 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 8995563  T
Q  202 gtctctt 208  Q
    |||||||    
T  8995564 gtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 529 - 586
Target Start/End: Original strand, 10584357 - 10584414
Alignment:
Q  529 ccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584357 ccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 10584414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 15530167 - 15530003
Alignment:
Q  425 tcaacaaattcttgcgttctctcttccttt-ctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttg 522  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| || ||||   ||||| |||  ||    
T  15530167 tcaataaattcttgtgttctctcttctttttctctgctgttgttttctacttttggcttgtatttataattgttccatacacttaaattttgattgtctg 15530068  T
Q  523 gttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgt--ggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15530067 attattccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttctcatcgaattcacaaca 15530003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527054
Alignment:
Q  194 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 293  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag 20526981  T
Q  294 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
      ||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  20526982 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcat 20527054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1130 - 1257
Target Start/End: Original strand, 196111 - 196238
Alignment:
Q  1130 caattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaataactt 1228  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  196111 caattaggtcctttaagttacttaaccgtaacaatttgaggtatttcatatcttaaaaatgtaagttattcagggcttaaaagttacaattaaataactt 196210  T
Q  1229 aaacgacctaagtgttatgaaaaatactt 1257  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  196211 aaa-gacctaagtgtttcgaaatatactt 196238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1114
Target Start/End: Complemental strand, 12458504 - 12458392
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttac-gtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| || ||| |  |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12458504 taaattacactagaagtcctttaagttatttaattgtaacaatttggtactttaagttttttcccgtacttcttaggtcctttaagttaataaattaaaa 12458405  T
Q  1102 caagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||||    
T  12458404 caagttggtcctt 12458392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  || |||||  |  ||||| ||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaa---acgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 428  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||| | ||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||| || ||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  429 caaatt 434  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26932482 - 26932402
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  26932482 actttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcaaattcacaacaa 26932402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1160
Target Start/End: Original strand, 33547750 - 33547889
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttt-tttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannn 1120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||       
T  33547750 tttaagttatttaattgtaacaaattggtcctttaagtttatttttgttccacttatgtcctttaagttaattaattgtaacaagtttgtcttttaagtt 33547849  T
Q  1121 nnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaa 1160  Q
        | ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  33547850 ttttcataccatttaggtcctttaagttatttaattgtaa 33547889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 17411270 - 17411121
Alignment:
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgg-gacctaaagttacaattaaat 1223  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  17411270 cgtaccaattatgtactttaagttatttaatcgtaataatttgggggatttcagatcttaaaaatgtaagttattcggagactaaacgttacaattaaat 17411171  T
Q  1224 aacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    |||| ||| ||| || || ||| |||||||| ||| |  |||||||||||    
T  17411170 aactcaaaagacttatgtattacgaaaaatatttaaaagactaacttgtt 17411121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8717268 - 8717194
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8717268 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 8717194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 331  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactca 362  Q
    ||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctc-tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 583
Target Start/End: Original strand, 22490917 - 22491077
Alignment:
Q  419 actaggtcaacaaattcttgcgt--tctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggt 516  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| | ||||| || |  |    ||||||||||    
T  22490917 actaggtcaacaaattcttttgtgctctctctttctttctctcgt--tgttttctacttttggcctatgtttataattgttacccac---ttgttttggt 22491011  T
Q  517 tgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    |||||| |||| | | |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22491012 tgcttgattatccttagctccacacattaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaa 22491077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Original strand, 18322487 - 18322566
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  18322487 actttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatagaattcgcaaca 18322566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1255
Target Start/End: Original strand, 28477384 - 28477509
Alignment:
Q  1131 aattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaataactta 1229  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  28477384 aattaggttctttaagttattgaactgtaataatttaggcgattttagatcttaaaaatgtaagttattcggggcctaaaaattacgattaaataattta 28477483  T
Q  1230 aacgacctaagtgttatgaaaaatac 1255  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28477484 aagaacctaactgttatgaaaaatac 28477509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1255
Target Start/End: Original strand, 29789836 - 29789961
Alignment:
Q  1131 aattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaataactta 1229  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  29789836 aattaggttctttaagttattgaactgtaataatttaggcgattttagatcttaaaattgtaagttattcggggcctaaaaattacgattaaataattta 29789935  T
Q  1230 aacgacctaagtgttatgaaaaatac 1255  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||    
T  29789936 aagaacctaactgttatgaaaaatac 29789961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12195427 - 12195354
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12195427 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 12195354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 17694754 - 17694700
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17694754 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 17694700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1084 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 7004390 - 7004200
Alignment:
Q  1084 taagttaattaattataacaagttggtcctttaannnnnnnc-gtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatct 1182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||        | ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| || |||||  |||| ||||||    
T  7004390 taagtttattaattataacaagttgatcctttatgttttctctgtaccaattaggttctttaagttatttaaccgtaacaatttgagaaattttagatct 7004291  T
Q  1183 taaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||| |  ||||||||| ||   |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||    
T  7004290 taaaagtataagttattcagggtttaaatgttgcaattaaataacttaaa-gacataagtgatacaaaaaatacttaaaggactaacttgtt 7004200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 13883752 - 13883806
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13883752 ttgctccacgcatcaagttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 13883806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1291 - 1333
Target Start/End: Complemental strand, 17411131 - 17411089
Alignment:
Q  1291 actaacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgata 1333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17411131 actaacttgttacaattaaataacttaaatgacgtaagtgata 17411089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 10544376 - 10544282
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||   |||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  10544376 ttttaagttatttatctgtaacaaattgac--tttaagtttttttcgtactagttagatccattaagttaattaattataataagttgatcatttaa 10544282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1239
Target Start/End: Original strand, 32548138 - 32548235
Alignment:
Q  1143 taagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaa 1239  Q
    |||| |||||||| |||| || ||| || |||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32548138 taagttatttaaccgtaacaatttgcggtattttaaatcttaaaaatgtaagctattcgggatctaaaagttacaattaaataacttaaaggacctaa 32548235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1109
Target Start/End: Original strand, 7202300 - 7202356
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttgg 1109  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  7202300 tttaagtttttttcgtaccatttaggtcctttatgttaattaattgtaacatgttgg 7202356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 289
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138479
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagat 11138479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 407
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  316 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca 407  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1169 - 1252
Target Start/End: Complemental strand, 33547933 - 33547849
Alignment:
Q  1169 gggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaa 1252  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  33547933 gggatttcagaccttaaaaatttaagttattcgaaacttaaaagttacaattaaataacttaaaggacctaaatggtatgaaaaa 33547849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26887130 - 26887076
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26887130 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcgacgaattcacaacaa 26887076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3577391 - 3577338
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3577391 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 3577338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1125 - 1230
Target Start/End: Original strand, 7202313 - 7202419
Alignment:
Q  1125 cgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaat 1223  Q
    ||||||| ||||||||| || | || |||| ||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7202313 cgtaccatttaggtcctttatgttaattaattgtaacatgttgggagattttagatcttaaaaatttaagttattcggggcctaaaagttacaattaaat 7202412  T
Q  1224 aacttaa 1230  Q
    |||||||    
T  7202413 aacttaa 7202419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1177 - 1250
Target Start/End: Complemental strand, 10544210 - 10544136
Alignment:
Q  1177 agatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaa 1250  Q
    ||||||||||| || || ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10544210 agatcttaaaaatgtaaattattcaagacctaaaagttacaattaactaacttaaatgacctaagtgttacgaaa 10544136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 25465807 - 25465754
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465807 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 25465754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 586
Target Start/End: Original strand, 25480219 - 25480347
Alignment:
Q  456 tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttat 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||| || | || ||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||| ||| ||||| | | ||||    
T  25480219 tctctcgctgttttctacttttgacttgtgattataattgtttcatacactttattttggttgctcgactatcccttactctacacatcaaatat-ttat 25480317  T
Q  556 tggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25480318 tggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 25480347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078064
Alignment:
Q  316 agacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaa-tttgg 413  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |    | ||||| | |||||| || |||||||||| ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  414 accgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-tt 511  Q
    |||||||  ||| |||||| ||| || ||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    || ||| |     
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttctttctctc--gctg-tttctactttt-gcttgtgtttataattcttcc---cacgttgata 28078119  T
Q  512 ttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  28078118 ttggttgcttgattatt-tttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 28078064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31248597 - 31248544
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31248597 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 31248544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1131 - 1231
Target Start/End: Original strand, 29693282 - 29693383
Alignment:
Q  1131 aattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaattaaataactta 1229  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  29693282 aattaggttctttaagttattgaactgtaataatttaggcgattttagatcttaaaaatgtaagttattcgggtcctaaaagttacgattaaataattta 29693381  T
Q  1230 aa 1231  Q
    ||    
T  29693382 aa 29693383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1020 - 1117
Target Start/End: Original strand, 31314513 - 31314609
Alignment:
Q  1020 cttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  31314513 cttttgagttatttaattataacaagttgatcatttaagttttttcagtatcacttatgt-ttttaagttatttaattataacaaattagtcatttaa 31314609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19701800 - 19701756
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19701800 atcaagtttattattggtgtggttttcacaacgaattcacaacaa 19701756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Original strand, 25941958 - 25942001
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25941958 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 25942001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 35201210 - 35201155
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201210 ttgctccacgcatcaagttt-ttattagtgtggttttctcaacgaattcacaacaag 35201155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1291 - 1334
Target Start/End: Original strand, 196244 - 196287
Alignment:
Q  1291 actaacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgatac 1334  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  196244 actaaattattacaattaaataacttaaatgacgtaagtgatac 196287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1148 - 1242
Target Start/End: Original strand, 9405267 - 9405362
Alignment:
Q  1148 tatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggaccta-aagttacaattaaataacttaaacgacctaagtg 1242  Q
    |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| |  || || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9405267 tatttaaccgtaacaatttgaggaatttcagatcttaaaaattttagttattcggcatttataaattacaattaaataacttaaaggatctaagtg 9405362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 4595048 - 4595102
Alignment:
Q  170 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595048 gcaacaacaaaactagggtttgta--gagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 13040179 - 13040232
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  13040179 ttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 13040232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878765
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883513
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13883513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 153
Target Start/End: Original strand, 15367045 - 15367079
Alignment:
Q  119 acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367045 acatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 15367079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16455333 - 16455280
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  16455333 ttgctccacatatcaagtattttattggtttgatttt-tcatcgaattcacaaca 16455280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785957
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16785957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26954328 - 26954286
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26954328 tctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248858
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31936633 - 31936591
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31936633 tctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33211227 - 33211185
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33211227 tctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1095
Target Start/End: Original strand, 196063 - 196135
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaa 1095  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  196063 tttaaattaattaattgtaacaaattgat-atttaagttttttcagtatcaattaggtcctttaagttacttaa 196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 504 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6610439 - 6610377
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||    
T  6610439 actttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacattaagtattttattggtgtgattttc 6610377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 6843217 - 6843287
Alignment:
Q  205 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6843217 tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtctcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Original strand, 30445602 - 30445661
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 263  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445602 tctcttggcaacaaacactacgg-ttga-gattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1076 - 1117
Target Start/End: Original strand, 33547744 - 33547785
Alignment:
Q  1076 aggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  33547744 aggtcctttaagttatttaattgtaacaaattggtcctttaa 33547785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14230
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 14378  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14377 ttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 14278  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  14277 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 14978 - 15352
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  14978 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagttt 15077  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||     
T  15078 gtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttggg 15177  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||  ||    
T  15178 tagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgct 15277  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||  || | || || |||||||||||||||    
T  15278 aggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattcttgtgttctctcttc--ttttatcatgttgttttctacttttg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 17771 - 17824
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17771 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 17824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 38928507 - 38928024
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38928507 ctataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 38928408  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  38928407 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgg 38928308  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  38928307 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagac 38928208  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||| | |||    
T  38928207 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttatctc--gttgttttctacttttggcttgtgattataactgttc 38928110  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  38928109 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 38928024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22803063 - 22802576
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22803063 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 22802964  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  22802963 gtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 22802864  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  |  | |||||||||||||    
T  22802863 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagact 22802764  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgt---tttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22802763 aggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatctt-ctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgt 22802665  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22802664 tccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 22802576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 102 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40091744 - 40091257
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40091744 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagttt 40091645  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  40091644 gtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 40091545  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||| | ||||||||| |||    
T  40091544 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatact 40091445  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40091444 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctattttctacttttggcttgtgtttataattattcc 40091345  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaag 587  Q
     || ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  40091344 atacactttattttggttgcttgattatcttttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgaatttttcatcgaattcgcaacaag 40091257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12396174 - 12395697
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396174 ctataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 12396075  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  12396074 gtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggg 12395975  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||    
T  12395974 tagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagact 12395875  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||     
T  12395874 aggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctacttttggcatgtgtttataatttttcg 12395775  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
     ||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12395774 atactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaatt 12395697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 104 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36921822 - 36921337
Alignment:
Q  104 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36921822 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagttt 36921724  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||    
T  36921723 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 36921624  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  36921623 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 36921524  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||     
T  36921523 tagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttt 36921424  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  36921423 catacactttattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 36921337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 102 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12401136 - 12400659
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12401136 ctataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 12401037  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  12401036 gtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggg 12400937  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||    
T  12400936 tagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagact 12400837  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||     
T  12400836 aggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtcttctacttttggcatgtgtttataatttttcg 12400737  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
     ||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12400736 atactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaatt 12400659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 40637078 - 40637566
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40637078 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 40637177  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  40637178 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 40637277  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  40637278 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagact 40637377  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  40637378 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgtt 40637477  T
Q  498 ccttatactttg--ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  40637478 ccatacactttgttttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattctcaacgaattcgcaaca 40637566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 121 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 33415797 - 33415334
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33415797 atcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacac 33415699  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33415698 taaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagact 33415599  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33415598 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaac 33415499  T
Q  421 taggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggtt 517  Q
    | |||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || || |||||| ||||||||    
T  33415498 tgggtcaataaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtcccatacactttgattttggtt 33415401  T
Q  518 gcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||    
T  33415400 gcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgt-gatttctcatcggattcgcaaca 33415334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Original strand, 48486323 - 48486803
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48486323 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 48486422  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  48486423 atctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 48486522  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  48486523 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagact 48486622  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctct---tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||| ||| ||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  48486623 aggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctcttccttt-tctcttgatgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 48486721  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| |  |||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48486722 tccattcactttgttttagttgcttgattatcgcttgttccacgcatcaaatttgttattggtgt-gttttctcatcgaattc 48486803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 36919916 - 36919435
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttga--gatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  36919916 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagt 36919817  T
Q  200 ttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtttt 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||    
T  36919816 ttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 36919717  T
Q  299 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||   ||| ||| | ||||||| ||    
T  36919716 tggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctag 36919617  T
Q  399 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  36919616 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgt 36919517  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| || ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36919516 tccatacactttattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattc 36919435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22801191 - 22800705
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22801191 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 22801092  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |  |||||     
T  22801091 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttggg 22800992  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||| | |||||||||||||    
T  22800991 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagact 22800892  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgt---tttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22800891 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt-ctttttctctcgctgttgctttctacttttggcttgtgtttataattgt 22800793  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  22800792 tccatatactttgttttggttgcttgactatcccttgctccccacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 22800705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 24888800 - 24889286
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24888800 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagttt 24888899  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||     
T  24888900 gtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttggg 24888999  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  24889000 tagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 24889099  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  24889100 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgtt 24889199  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  24889200 ccatacactttgttttggttgttagattattccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaaca 24889286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 14787726 - 14787274
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||    
T  14787726 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggatt 14787627  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  14787626 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactca 14787527  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg--ttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14787526 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 14787427  T
Q  434 tcttgcgttc-tctcttc-ctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
    ||||| |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14787426 tcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccct 14787327  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  14787326 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 14787274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 24878993 - 24879471
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24878993 ctataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24879092  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  24879093 gtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 24879192  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  24879193 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 24879292  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  24879293 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 24879392  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||          || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24879393 tccatacactttgttttggttgcttgattatt----------cacatcaagtttgttattggtgtggttttttcatcgaattcacaaca 24879471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 101 - 586
Target Start/End: Original strand, 16453312 - 16453797
Alignment:
Q  101 gctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  16453312 gctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtt 16453411  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  16453412 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgg 16453511  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  || | |||||||||||    
T  16453512 gtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccaga 16453611  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||  | ||| | ||    
T  16453612 ctaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--actgttttctacttttggcttgtgattataactgtt 16453709  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     | || |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16453710 tcatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 16453797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 24880455 - 24880935
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24880455 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24880554  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  24880555 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 24880654  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt-aaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  24880655 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 24880754  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  24880755 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgt 24880854  T
Q  497 tccttatactt--tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||| |||||          || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24880855 tccgtacactttgtgttttggttgcttgattatt----------cacatcaagtttgttattggtgtggttttttcatcgaattcacaaca 24880935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 47274731 - 47275212
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47274731 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agttt 47274829  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||  |||||     
T  47274830 gtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttggg 47274929  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||| |||||||||    
T  47274930 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagact 47275028  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47275029 aggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttgatttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattattc 47275126  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      || ||||  ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||    
T  47275127 tatacacttcattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattgatgt-gttttcacaacgaattcacaaca 47275212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 36378296 - 36378778
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36378296 ctataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 36378395  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||     
T  36378396 gtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttggg 36378495  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||    
T  36378496 tagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagac 36378595  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||     
T  36378596 taggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttc--ttttctcctgctgttttctacttttcgtttgtgtttataattgttt 36378693  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  36378694 catacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccacatatcaagtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 36378778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Original strand, 14633324 - 14633804
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14633324 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 14633422  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  14633423 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttggg 14633521  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||||||    
T  14633522 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagact 14633621  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14633622 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 14633718  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14633719 attgttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaattc 14633804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 19095886 - 19096268
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19095886 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 19095985  T
Q  202 gtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  19095986 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgg 19096085  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||| | ||||||||||||    
T  19096086 gtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagac 19096185  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcct---ttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||   || ||||| | |||||||||||||||    
T  19096186 taggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttctttattttctctcgttgttttctacttttg 19096268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37089666 - 37089212
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37089666 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 37089567  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089566 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 37089467  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37089466 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 37089368  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  37089367 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatt 37089271  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  37089270 atccattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 37089212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631259
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8631514 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 8631415  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| |    
T  8631414 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttagttgcttgat 8631318  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  8631317 tatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 8631259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22046980 - 22046525
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  22046980 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 22046881  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046880 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22046781  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22046780 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 22046682  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||| ||||||| |||   ||||      | ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  22046681 ttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgtcgttgttttctacttttgact--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatta 22046584  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  22046583 tcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttttcgatcgaattcacaacaa 22046525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 127 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37313370 - 37312924
Alignment:
Q  127 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313370 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 37313271  T
Q  227 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 326  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37313270 ttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattct 37313171  T
Q  327 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 425  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | | |||||||||||| ||||||||||||| || | | |    
T  37313170 tgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggat 37313071  T
Q  426 caacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
    ||||||||||||          ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || | || |||||||||||||||||||  |    
T  37313070 caacaaattctt----------ttgttttctctc--gctgttttctacttttggcttatgattataattgtttcatacactttgttttggttgcttgact 37312983  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  37312982 atcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcaaattcgcaaca 37312924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 5198424 - 5198895
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5198424 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagttt 5198523  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||      
T  5198524 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtg 5198623  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||    
T  5198624 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 5198723  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||     || | | ||| | || |  |||   ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |    
T  5198724 aggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattc-----ttttgtgttcttctcgccgttg--tttttctacttttggct--tgtatttaattgttccat 5198814  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  5198815 acactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaag-ttattattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 5198895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 51015250 - 51015739
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51015250 ctataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgttt 51015349  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  51015350 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 51015449  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| ||||||    
T  51015450 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagact 51015548  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51015549 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 51015645  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  51015646 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgttttttcgaacgaattcacaacaa 51015739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 576
Target Start/End: Original strand, 11434959 - 11435438
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11434959 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11435058  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||  |||||     
T  11435059 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttggg 11435158  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||| |||||    
T  11435159 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagact 11435257  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11435258 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttggct--tgtattta 11435354  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaa 576  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11435355 attgttccatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaa 11435438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 24348256 - 24348693
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24348256 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggtt 24348355  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24348356 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaaccca 24348455  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24348456 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 24348555  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24348556 ttttgtgttc-------ttctcgc-cgttgttttctatttttggct--tgtatttagttgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgct 24348645  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  24348646 ccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 24348693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 9148291 - 9148727
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9148291 gagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 9148390  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148391 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9148490  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9148491 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 9148589  T
Q  436 ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgct 535  Q
    ||  ||  ||       ||||| |  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  9148590 ttttgtgttc-------ttctcac-cgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgtt 9148679  T
Q  536 ccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9148680 ccacacatcaag-ttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaaca 9148727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 619776 - 619400
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  619776 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagttt 619677  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||  |||||     
T  619676 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttggg 619577  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||    
T  619576 tagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-act 619478  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||    
T  619477 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttc-ttctctgctgttgttttctacttttg 619400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 102 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22044719 - 22044255
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22044719 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 22044620  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  22044619 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 22044520  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||| ||||||    
T  22044519 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagact 22044421  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||   ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22044420 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 22044323  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgt 561  Q
    || || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22044322 ttgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt 22044255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 240 - 585
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891780
Alignment:
Q  240 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  340 tatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--t 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  437 tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctc 536  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2891633 tgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattattctttgctc 2891732  T
Q  537 cacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2891733 cacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 2891780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006093
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11006332 attgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaatt 11006234  T
Q  435 cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
    |     || | | ||| | || |  |||   |||||||||||| |||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11006233 c-----ttttgtgttcttctcgccgttg--tttttctactttttgct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgc 11006143  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11006142 tccacacatcaag-ttgttattggtgtgtttttc-gatcgaattcacaacaa 11006093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008407
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008661 attgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 11008565  T
Q  435 c--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    |  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    |||||||||||| |||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  11008564 cttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctactttttgct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttga 11008468  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11008467 ttatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgtttttc-gatcgaattcacaacaa 11008407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 182 - 585
Target Start/End: Original strand, 27499129 - 27499536
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27499129 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacga 27499228  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 380  Q
     ||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  27499229 taagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaag 27499325  T
Q  381 gactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctt------tctctcttgctgttttcta 472  Q
    | ||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||      ||||||| | |||||||||    
T  27499326 ggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctctctcgttgttttcta 27499424  T
Q  473 cttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcat 572  Q
    |||||| ||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27499425 cttttgacttgtgtttataattgttccataaactttgttttggttgcttggttattcattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcat 27499523  T
Q  573 cgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| ||||    
T  27499524 cgaattcagaaca 27499536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 2485202 - 2484715
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagataga-gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2485202 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2485103  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||    
T  2485102 tgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 2485003  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||    
T  2485002 gtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 2484904  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattt 490  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  2484903 taggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattt 2484807  T
Q  491 aattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2484806 aattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 2484715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 6764843 - 6765335
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6764843 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6764942  T
Q  202 gtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 296  Q
    |||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  |    
T  6764943 gtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 6765042  T
Q  297 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||    
T  6765043 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 6765142  T
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   |||||||||| |||||||  |||    
T  6765143 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttggtgttct-tctcgccgttgttttctac-tttggct--tgt 6765238  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6765239 attt-ataattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 6765335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 38409243 - 38409696
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38409243 gagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38409342  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38409343 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaaccca 38409442  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38409443 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38409541  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtta 526  Q
      ||| |||| ||||||| |||   ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||| |||    
T  38409542 ttttgagttcttctcttctttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacaatttgttttagttgcttgatta 38409639  T
Q  527 ttccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  38409640 tcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgtttttc-gattgaattcacaaca 38409696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 47868405 - 47868895
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868405 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 47868504  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  47868505 gtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 47868604  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| |||    
T  47868605 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatact 47868704  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgtt-ctctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||  ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  47868705 aggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtgttcttctcaccgttgttttctacttttggct--tgtatttta 47868802  T
Q  493 ttattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| || |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  47868803 ttgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 47868895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 41997496 - 41997976
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41997496 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 41997595  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  | ||||||     
T  41997596 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttggg 41997695  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | | | | ||| ||||||||    
T  41997696 tagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccagac 41997794  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||| |  |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| | |||||  | |||   ||||    
T  41997795 taggttaatttggaccgaactggataaacaaatttcataagttctctctttcttt-gctctcgctgttttctactttt-gtttgtgattataa--cttcc 41997890  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  41997891 atacactttgttttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtttattattggtgt-gttttttcatcaaattaacaacaa 41997976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 136 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 17662529 - 17662107
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||           ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  17662529 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 17662441  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662440 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 17662341  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17662340 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 17662241  T
Q  436 --ttgcgttctctcttcctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcctt 532  Q
      ||| |||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| || |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  17662240 ttttgtgttctctctt-ctttttctcgctgttgttttctacttttggcatgtgattataattgttccatacactttggtttgattgcttgattatccctt 17662142  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  17662141 gctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 17662107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44600140 - 44599679
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44600140 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 44600041  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44600040 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 44599941  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  44599940 gtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 44599842  T
Q  428 acaaat-tc-ttgcgttct--ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttg 518  Q
    |||||| || ||| |||||   ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  44599841 acaaatatctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttgcct--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttg 44599744  T
Q  519 cttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44599743 cttaatta-tccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 44599679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 212 - 585
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455714
Alignment:
Q  212 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  312 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgt 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||              ||||||||||| |||| |||| ||  | ||| | |||| || |||||||    
T  16455555 tggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttctctc--------------gctgttttctagttttagcttatgattataactgttccatacactttgt 16455640  T
Q  511 tttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16455641 tttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaaca 16455714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16932091 - 16931630
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||    
T  16932091 aaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggttt 16931992  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16931991 gtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 16931892  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16931891 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 16931793  T
Q  428 acaaatt--cttgcgttc-tctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgc 519  Q
    |||||||   ||| |||| ||||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16931792 acaaatttctttgtgttcttctcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaattattccatacgctttgttttggttgc 16931695  T
Q  520 ttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||  |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16931694 ttaattatcccttgctccacacattaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 16931630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323177
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||     
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |  || | ||||||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  401 taggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||  | |||||||||| |||  ||||  | |||||| ||||||| ||| |||| | |||   ||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctctttctt--tctccaggtgttttatactttt-gctcgtgtttataa--ctt 19323091  T
Q  498 ccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19323092 ccatacactttattttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 19323177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 7941359 - 7941814
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgaggg 233  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| |||    
T  7941359 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtggg 7941458  T
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7941558  T
Q  334 cattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7941559 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 7941658  T
Q  434 tc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    ||  ||| |||| | ||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||      
T  7941659 tcttttgtgttcttttcttctttgtgttct-tctcgccattgttttctacttttgcct--tgtatttcattgttccatacactttgttttggttgcttaa 7941755  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  7941756 ttatcccttgctccacacatcaag-ttgttgttggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 7941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9176803 - 9176330
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9176803 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 9176704  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  9176703 gtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 9176604  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  9176603 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 9176505  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgtt-ctctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||   ||| |||  ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||    
T  9176504 taggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatt 9176408  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  9176407 taattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattttc 9176330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849440
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact-agggtttgagggt 234  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccc 31849695  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31849694 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaatt 31849596  T
Q  435 c--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttgg 523  Q
    |  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  31849595 cttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttga 31849499  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  31849498 ttatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 31849440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9174475 - 9173986
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9174475 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 9174376  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  9174375 gtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 9174276  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||||| ||| ||||||||    
T  9174275 gtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagac 9174177  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||| |    |||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||    
T  9174176 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatt 9174080  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  9174079 taattatttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattagtgtgattt--tcatcgaattcgcaacaa 9173986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 129 - 567
Target Start/End: Original strand, 18847184 - 18847627
Alignment:
Q  129 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 228  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  18847184 aaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagttt 18847283  T
Q  229 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18847284 gtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 18847383  T
Q  328 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18847384 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 18847481  T
Q  428 acaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctac-ttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggt 516  Q
    ||||||||  ||| |||| ||| ||| |    |||| ||| ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  18847482 acaaattcttttgtgttcttctgttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctactttttggct--tgtatttaattattccatacactttg-tttggt 18847577  T
Q  517 tgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  18847578 tgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 18847627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 174 - 585
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380834
Alignment:
Q  174 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  274 ggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat-atagtg 372  Q
    ||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  373 aaac-gaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgtttt 469  Q
     ||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  36380625 gaactgagtg-ctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctc-ctt-ctgtttt 36380721  T
Q  470 ctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttct 569  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || | || |||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| |||  |    
T  36380722 ctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttg-tttgattgcttgatcattacttactccacacatcaaatattttattggtgtgattt--t 36380818  T
Q  570 catcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||||||    
T  36380819 catcgaattgacaaca 36380834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709003
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt- 434  Q
    ||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  18709258 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 18709160  T
Q  435 -cttgcgttctctcttc--ctttct-ctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggt 524  Q
      ||| ||||| |||||  |||| |  ||||      | ||||||||||| ||||||  ||||||||    || | || ||||||||||||||||||| |    
T  18709159 ctttgtgttct-tcttcttctttgtgttcttctcgccgttgttttctactattggct--tgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgat 18709063  T
Q  525 tattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18709062 tatgccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtggttttttcatcaaattcacaaca 18709003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 102 - 427
Target Start/End: Original strand, 56030448 - 56030770
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  56030448 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 56030547  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||     
T  56030548 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttggg 56030647  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||   ||||||| | | ||| | ||||||| |||||    
T  56030648 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagact 56030744  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtca 427  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  56030745 aggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 173; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 411
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544272
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  235 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 13544195  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaattt 411  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  13544196 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16934472 - 16933987
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16934472 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 16934373  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  16934372 gtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 16934273  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||||||||    
T  16934272 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagac 16934174  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttc-tctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16934173 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 16934076  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||  |  | |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16934075 ttattccatacgc-ttgttttggttgcttaat--tcccttgctccacacattaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 16933987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 171 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085818
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatag 370  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  371 tgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctt---tctctcttgc- 463  Q
    || | || | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||   | | ||| ||     
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtttttctcgcc 26085938  T
Q  464 --tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtg 560  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||||    || | || |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26085937 gttgttttctacttttggct--tgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtg 26085841  T
Q  561 tggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||   |||||||||||||| |||||    
T  26085840 tg--attctcatcgaattcgcaaca 26085818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18409675 - 18409191
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18409675 ctataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 18409577  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttgg 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||  ||||||    
T  18409576 gtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttgg 18409477  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccaga 399  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    || | |||||| ||||    
T  18409476 -tagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcaga 18409379  T
Q  400 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttg--cgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||| ||    || | | ||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||  | |||   |    
T  18409378 ctaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatttcgtgttttttttttttttttttttctctcgctattttctacttttgtcttgtgattataa--ct 18409281  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18409280 tccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 18409191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 166; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18537800 - 18537324
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537800 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtt 18537703  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttg 299  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||    
T  18537702 tg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttg 18537606  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | |||||||||     
T  18537605 g-tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccat 18537507  T
Q  399 actaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    | |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||| | |||||| | |||   |    
T  18537506 aataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttctctc--gttgttttatactttt-gtttgtgtttataa--ct 18537412  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  18537411 tccatacactttgttttgattgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttataggtgtgaact--tcatcgaattcacaacaa 18537324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5637760 - 5637524
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5637760 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 5637661  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637660 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 5637561  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 372  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637560 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 161; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 246 - 586
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547644
Alignment:
Q  246 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  346 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa--ttcttgcgttc 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| ||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  444 tctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacata 542  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||  |  ||||  |||| |||||| |    
T  13547502 tctcttcctttctctctcgatcttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacaca 13547601  T
Q  543 tcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13547602 tcaagtttgttattggtgt-gttttctcattgaatgcacaacaa 13547644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18535138 - 18534704
Alignment:
Q  122 tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18535138 tcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacac 18535042  T
Q  221 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 320  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18535041 tagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 18534944  T
Q  321 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||| |||| | |  || | || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  18534943 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccga 18534844  T
Q  419 actaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggtt 517  Q
    ||  ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| | |||   |||| || ||||||||||||||    
T  18534843 acagggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gctattttctactttt-gtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggtt 18534749  T
Q  518 gcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  18534748 gcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtg 18534704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22132684 - 22132389
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  22132684 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggtt 22132587  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132586 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22132487  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132486 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 159; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780371
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782736
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    |||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824629
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtg 372  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3824665 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 302 - 586
Target Start/End: Original strand, 4215510 - 4215793
Alignment:
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  4215510 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagact 4215609  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| || | |    
T  4215610 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctttcttt-tctctcgcagttttctacttttggcttgtgattataattgtttcat 4215708  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4215709 acactttgtttttgttgcttgattattccttgcttcacacatcaag-ttgttatttgtgtgagttttctcatcgaattcgcaacaa 4215793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 136 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134615
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 434  Q
    ||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  | | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134711 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 144; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 346 - 585
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563248
Alignment:
Q  346 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttc 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  444 tctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatat 543  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  47563109 tctcttcctttctctc--gctgttttctacttttggcttatgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacat 47563206  T
Q  544 caagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47563207 caagtttgttattggtgtggttttctcatcaaattcacaaca 47563248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38890472 - 38890071
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  38890472 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg 38890376  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaat 380  Q
    |||||||||  |  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |     
T  38890375 gaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagag 38890276  T
Q  381 gactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    | ||| | ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  38890275 ggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcgctgttttctaattttg 38890177  T
Q  479 gcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaat 577  Q
     ||||||| | |||   |||| || |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| | |||||||    
T  38890176 ccttgtgtttataa--cttccatacactttg-tttggttgctagattattccttgctccacatatcaaatattttattggtgtgattttttttatcgaat 38890080  T
Q  578 tcacaacaa 586  Q
    |||||||||    
T  38890079 tcacaacaa 38890071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8756579 - 8756102
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||   |||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  8756579 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgtatagagtt 8756481  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |  ||||    
T  8756480 tg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttg 8756384  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccag 398  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||  || | ||||| ||||    
T  8756383 agtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccag 8756284  T
Q  399 actaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| | ||| | |    
T  8756283 actaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctc--gttgttttttactttt-gcttgtgtttataactgt 8756187  T
Q  497 tccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
      |  |    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8756186 caccca---cttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 8756102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3937537 - 3937314
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  3937537 ctataaatatagactttt-atcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagttt 3937439  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||     
T  3937438 gtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttggg 3937339  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattct 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  3937338 tagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 133; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47211035 - 47210762
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |        
T  47211035 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg---- 47210940  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210939 --------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47210848  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 421  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47210847 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 102 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52942776 - 52942537
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacatt--acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52942776 ctataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 52942678  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             || ||||    
T  52942677 ttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------------gggtttg 52942591  T
Q  300 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 353  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52942590 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 586
Target Start/End: Original strand, 53405169 - 53405627
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||    
T  53405169 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggtt 53405266  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga------cttattcttgt 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |  |  ||| | |||||||| ||||||||      |||||||||||    
T  53405267 gattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgt 53405366  T
Q  330 aacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 429  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||| |||  |   |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  53405367 aacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaac 53405464  T
Q  430 aaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgct 520  Q
    ||||||  ||  |||| ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || | |||||||||||||||    
T  53405465 aaattcttttttgttcttctcttctttgtgttcttttcgccgatgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacattttgttttggttgct 53405562  T
Q  521 tggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  53405563 tgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 53405627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 127; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Original strand, 6132877 - 6133090
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  || |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6132877 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaac-aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagttt 6132975  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||     
T  6132976 gtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 6133075  T
Q  302 tagaattaggcggga 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6133076 tagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 116; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 296 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5635611 - 5635318
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||    
T  5635611 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 5635512  T
Q  396 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||    
T  5635511 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tg 5635415  T
Q  486 tatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  5635414 tatttaattgttccatacactttgttttggttgattgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 5635318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 302 - 586
Target Start/End: Original strand, 5101133 - 5101405
Alignment:
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| | | ||| | ||| |||||||||    
T  5101133 tagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccagact 5101231  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcctt 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||   |||||||| | |||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| |    
T  5101232 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt----------ttgtgttctctctcggtgttttctccctttggcttgtgtttataattgttccat 5101321  T
Q  502 atactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5101322 acactttgttttggttgcttgactatcccttgatccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 5101405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 486
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136939
Alignment:
Q  186 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 285  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  286 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgact 384  Q
    | |||  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| ||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  385 gttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggctt 482  Q
    | | ||||| | | ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctcttgttgttttctacttttggttt 30136935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38270315 - 38270158
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38270315 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagttt 38270216  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270215 gtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14789470 - 14789272
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttct-ctcttccttt-ctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14789470 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgt 14789371  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     | ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  14789370 ttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 14789272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 110; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24446908 - 24446756
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||    
T  24446908 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagttt 24446814  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 259  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446813 gtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 585
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102566
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| |   ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac 429  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  430 aaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattc 529  Q
    ||||| | |  | ||||||  |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| | |||   |||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  12102421 aaatt-tcgtatgctctct--ctttctctc--actgttttttactttt-gcttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgctcggttatta 12102512  T
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  12102513 cttgctccacacatcaagtagtttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 12102566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 584
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133326
Alignment:
Q  366 tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgc 463  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |     
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgt 6133204  T
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| || | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  6133205 tgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttcggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtaa 6133304  T
Q  564 ttttct-catcgaattcacaac 584  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  6133305 ttttttccatcgaattcacaac 6133326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 296 - 587
Target Start/End: Original strand, 11437561 - 11437857
Alignment:
Q  296 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||    
T  11437561 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 11437659  T
Q  396 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtg 485  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||    
T  11437660 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tg 11437756  T
Q  486 tatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11437757 tatttaattgttccatacactttgtttttggctgcttgattatctcttgctccatacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaac 11437854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15032865 - 15032409
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15032865 ctataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 15032767  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||||| ||||||||          ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||  ||| |     
T  15032766 g-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttgg 15032679  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||   ||| | ||||||||| ||    
T  15032678 tagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaac 15032579  T
Q  401 taggtcaat-ttggaccgaacta-ggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttc--tctcttgctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaatt 494  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| ||| || ||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | || ||| | |||      
T  15032578 taggtcagtattggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgttctttctttctttctttctctcgctgtttttctactttt-gtttatgtttataa-- 15032482  T
Q  495 attccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttc 568  Q
     |||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15032481 cttccatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccgcacatcaagtattttattggtgtgattttc 15032409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446501
Alignment:
Q  318 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccg 417  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||             ||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 24446668  T
Q  418 aactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttgg 515  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttg---ttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttattttgg 24446571  T
Q  516 ttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24446570 ttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcacaacaa 24446501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 585
Target Start/End: Original strand, 28453782 - 28454167
Alignment:
Q  195 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 294  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  295 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcc 393  Q
      |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  |||  | |||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  394 cccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttc--tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatt 489  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||| |||||||| |     
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctttctccggttgttttctactttt-gcttgtgttta 28454077  T
Q  490 taattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||| |  | |  |||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||||    |||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  28454078 taattgt--catccactttgttttggtttcttgattatt--ttgcttcacacatcaagtaatatattggtgtgattt--tcaacgaattcacaaca 28454167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1393 - 1581
Target Start/End: Original strand, 16840857 - 16841060
Alignment:
Q  1393 gctctttaaagtatgtacatttgaagaagtctaagtctccgattctaaatacaattaatgtt------attttcttcatttcaggtgtat----ttttaa 1482  Q
    ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  16840857 gctctttaaagtatggatagttgacgaagtctaagtctccgcttctaaatacatttaatgttgttattattttcttcatttcaggtgtatatatttttaa 16840956  T
Q  1483 gcacattactcactgtgattgctacttaaatgaatttgttatct------tatcacaacttgaaataagattccaactttcgtgctaattacgttcaaaa 1576  Q
    ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16840957 gcaaattattcattgtgattggtacttaaatgaatttgttatcttattaatatcacaacttgcaataagattccaac-ttagtgctaattacgttcaaaa 16841055  T
Q  1577 agtct 1581  Q
    |||||    
T  16841056 agtct 16841060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 234
Target Start/End: Original strand, 5101001 - 5101133
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5101001 ctataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 5101100  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 234  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101101 gtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 47151131 - 47150863
Alignment:
Q  192 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 291  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  47151131 tatagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattg 47151035  T
Q  292 gggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgtttt 389  Q
     |  ||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||  ||   |||| |    
T  47151034 agaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttat 47150935  T
Q  390 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctctcttcctttctctc 459  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  47150934 ctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctctttctttctctc 47150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 586
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49089045
Alignment:
Q  320 ttattcttgtaacccattgatatcc-cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctccccc-agactaggtcaatttggaccg 417  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  418 aactaggtcaacaaattctt-gcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggt 516  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |              ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattctttgcgttctctcgt--------------tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggt 49088976  T
Q  517 tgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  49088977 tgcttgactatcccttactcaacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 49089045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 628 - 791
Target Start/End: Original strand, 16840376 - 16840535
Alignment:
Q  628 taagacgaaagtgatctcttacagcttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaagaatgcaataatgttaaatatcatgggggagaatgtaatt 727  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||      
T  16840376 taagatgaaagtgatctcttccagcttaaccagatgccgtgagtttgaatccggttctgagaatgcaacaatgttaaatgtcacgggggagaatgtaaaa 16840475  T
Q  728 tgttttgtagcttgcactgaacaaacatcaatcaagtcacccacttagtcgtaaatataagaaa 791  Q
    |  |||||||||    | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16840476 ttatttgtagct----ccgaacaaacatcaatcaagtcatcgtcttagtcgtaaatataagaaa 16840535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 807 - 980
Target Start/End: Original strand, 16840622 - 16840796
Alignment:
Q  807 accaattataaaggtggtctaccgtagaactcacgagtagagtatcga-tatccgatgacatctgatactttttctttttatatgctcaatgcattttct 905  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  16840622 accacttataaaagtggtttactttagaactcacgagtagagtatcaaatatcttatgacacttaatactttttctttttatatgcttagtacattttct 16840721  T
Q  906 tttgtgctgtaacaaactttgaaaaaattataaatttaaagaaatttttgtagtttagttaagaaccatacaaaa 980  Q
    | | || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16840722 tatttgttataacaaactttgaataaattatagatttaaagaaatttttgtagtttagttaaaaactataaaaaa 16840796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Original strand, 2891320 - 2891427
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattaca-tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2891320 ctataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2891419  T
Q  201 tgtctctt 208  Q
    ||||||||    
T  2891420 tgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 704
Target Start/End: Original strand, 16840263 - 16840378
Alignment:
Q  589 ttgattaaaacaacggaaaataacccaagattacttcggtaagacgaaagtgatctcttacagcttaactagatgtcgtgagtttgaatctagttctaag 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |  |    
T  16840263 ttgattaaaacaacggaaaataacccatgattacttgggtaagatgaaagtgatctcttccagcttaaccagatgtcgtgagtttgaatccggttatggg 16840362  T
Q  689 aatgcaataatgttaa 704  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16840363 aatgcaacaatgttaa 16840378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 583
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25358122
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata----gaattaggcggga-gacttattcttg 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||||||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  329 taacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 426  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  427 aacaaattct--tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtt-ttggttgcttgg 523  Q
    |||||||| |  || |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||    || ||||| |||||||||||     
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctctt-ctttctctc--gttgttttctactttt-gcttgtgtttataattgttcc---cacgttgttattggttgcttga 25358064  T
Q  524 ttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    |  | | || ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  25358065 t--tgctttcctccacacatcaagtattttattggtgtgattttttcaacgaattcacaa 25358122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1142 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 22519518 - 22519386
Alignment:
Q  1142 ctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaattaaataacttaaacgacctaag 1240  Q
    ||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22519518 ctaagttatttaaccgtagcaatttgggggatttcagatcttaaaaatgtaagttatttgggacctaaaagttacaattaaataacttaaaggacctaag 22519419  T
Q  1241 tgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  22519418 tgttacgaaaaatacttaaaggactaacttgtt 22519386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942336
Alignment:
Q  392 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttccttt-ctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgta 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||     
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttcctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtt 52942428  T
Q  488 tttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaatt 578  Q
    | ||||| |||| || |||||| ||||| |||| || ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  52942427 tataattgttccatacactttgattttgattgcctgattatctcttactccacacatcaaatttgttatttgtgtgattttttcatcgaatt 52942336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3937317 - 3937125
Alignment:
Q  388 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtg 485  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | |||||    
T  3937317 ttctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctttctttctctc--gttgttttctactttt-gtttgtg 3937221  T
Q  486 tatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      ||||  | |||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3937220 atttta--tcttccatacactttg-tttggttgcttgattatcccttgctcctcacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 3937126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 310
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113080
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||  |||| ||||||| | |||||  ||| ||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  201 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gtgaagagattagggttttg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  300 gatagaattag 310  Q
    | |||||||||    
T  10113070 ggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 478
Target Start/End: Original strand, 9863795 - 9864092
Alignment:
Q  182 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 281  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||     
T  9863795 ctagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgg 9863889  T
Q  282 gaagagattagggttttggatagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca----tatagtgaaac 376  Q
    |||||||||  |  ||||| ||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||    ||||||| |||    
T  9863890 gaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaac 9863988  T
Q  377 gaatgactgttttct--cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttcta 472  Q
    | |   ||| | |||  ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  9863989 ggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctc--gttgttttcta 9864086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999017
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 270  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtct 40999112  T
Q  271 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatc 364  Q
    |||||| ||| ||||||||   |  ||||| ||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40999111 cttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982175
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||    
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  298 tggatagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccc 395  Q
    ||| |||||||| |   || |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||     
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccct 3982212  T
Q  396 cagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  3982211 catactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1273
Target Start/End: Complemental strand, 31095377 - 31095124
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatc-atttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannn 1120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  || | |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| |||       
T  31095377 tttaagttatttaattgtaataaatttgtccacttaaattattttcgtaccatttaggtcttttaagttaattagttgtaacaagttaatcctataagtt 31095278  T
Q  1121 nnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaa-gttacaatt 1219  Q
        | ||||||| ||||| | |||||||||| ||  ||  || ||   |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||||    
T  31095277 ttttcctaccaataaggtcatttaagctattttaccatatcaatttttaggatttcagatcttaaaaatgtaagttattcaagacctaaaagttacaatt 31095178  T
Q  1220 aaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||| || | |||||||||    
T  31095177 aaataacttaaagaacctaagtgttacaaacaatacttaaatgattaacttgtt 31095124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 411 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824447
Alignment:
Q  411 tggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctcttgctg----ttttctactttt-ggcttgtgtatttaattattccttat 503  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||   ||||||||    |||||||||||| ||||||||| | ||| | |||| ||     
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctattctttttcttcttgctgctgtttttctactttttggcttgtgtttataactgttccatac 3824531  T
Q  504 actttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg-gttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    | |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3824530 attttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttctcatcgaattcacaaca 3824447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 22519921 - 22519807
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttac-gtaccacttaggtcctttaagttaattaattataa 1101  Q
    |||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22519921 taaattacaccagaggtctttaaa-ttatttaattgtaacaaattggtccttaaagtttttttccgtaccacttaggtcttttaagttaattaattataa 22519823  T
Q  1102 caagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22519822 caagttgatcctttaa 22519807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185787
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatccctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||||  | |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  348 ttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttct 444  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||  | | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 16185820  T
Q  445 ctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    |||||  ||| | ||| | |||||||||||||||    
T  16185819 ctctt-ttttgtttctcgttgttttctacttttg 16185787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1111
Target Start/End: Complemental strand, 48194483 - 48194394
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtc 1111  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  48194483 tttaagttatttaattgtaataagttgatcatttacgtttttttcgtacctcttaggtcctttaagttatttaactgtaacaagttggtc 48194394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983593
Alignment:
Q  233 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||  |  ||||| ||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  332 cccattgatatcccttttgtaaggttactcatcat 366  Q
    ||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcat 31983593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114519
Alignment:
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagatt 10114519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 47210754 - 47210659
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  47210754 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgctttattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 47210659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1143 - 1273
Target Start/End: Original strand, 49291205 - 49291335
Alignment:
Q  1143 taagctatttaactgtaagaaattgagggatttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacctaaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtg 1242  Q
    |||| |||||||  |||| || || ||| |||||||||||| ||| || |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  49291205 taagttatttaatcgtaacaatttcaggaatttcagatcttcaaaatgtaagttactcgggtttaaaagttacaattaaataacttaaaagacttaaatg 49291304  T
Q  1243 ttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  49291305 ttataaaaaatacttaaatgactaacttgtt 49291335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1003 - 1095
Target Start/End: Complemental strand, 33618010 - 33617920
Alignment:
Q  1003 taaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaa 1095  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33618010 taaattacacaagaggtcatttaagttatttaattgtaataaattggtcctttaagttttt--cgtaccgcttaggtcctttaagttaattaa 33617920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22134567 - 22134479
Alignment:
Q  471 tacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22134567 tacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 22134479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 585
Target Start/End: Original strand, 56030820 - 56030945
Alignment:
Q  456 tctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttat 555  Q
    ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  56030820 tctctcgctgttttctacttttg---tttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcgtgactatctcttgctccacatatcaagtttattat 56030916  T
Q  556 tggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  56030917 tggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 56030945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22132340 - 22132251
Alignment:
Q  471 tacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtg 562  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22132340 tacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtg 22132251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18311270 - 18311214
Alignment:
Q  530 cttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18311270 cttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattttttcatcgaattcacaacaa 18311214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 4558585 - 4558640
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4558585 ttgctccacgcatcaagtttattattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 4558640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 11853843 - 11853898
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11853843 ttgctccacccatcaagttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 11853898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 15312595 - 15312650
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15312595 ttgctccacgcatcaagttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 15312650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 507 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38270071 - 38269994
Alignment:
Q  507 ttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38270071 ttgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttct-atcgaattcccaacaa 38269994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Original strand, 5664643 - 5664722
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  5664643 actttgttttggttgcttgattattaccttctccacacatcaagtattttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 5664722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 16489628 - 16489681
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16489628 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 16489681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1258
Target Start/End: Original strand, 20141745 - 20141983
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagt-tttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaannn 1120  Q
    ||||||||||||| |||||| || | | |  ||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |        
T  20141745 tttaagttatttaattgtaataagtaggttctttaagtctttttttgtatcacttaggttctttatgttaattaattgtaacaagttggtctttaagttt 20141844  T
Q  1121 nnnncgtaccaattaggtcctctaagctatttaactgtaagaaattgaggg-atttcagatcttaaaactgcaagttattcgggacct-aaagttacaat 1218  Q
        ||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||| || ||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||  || ||| ||| |||||||    
T  20141845 tattcgtactaattaggtcatttaagttatttaaccgtaataatttttgggtattttagatcttaaaaatgtaagttattatgggcctaaaaattacaat 20141944  T
Q  1219 taaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||| |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  20141945 taaacaacttaaa-gacttaagcattacgaaaaatactta 20141983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22780285 - 22780211
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22780285 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 22780211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1110
Target Start/End: Original strand, 22889586 - 22889674
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggt 1110  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| || || |||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22889586 tttaagttatttaattataataaattggtccttaaagttttttttgtaccgctttgatcctttaagttaataaattgtaacaagttggt 22889674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1110
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941338
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggt 1110  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| || || |||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22941250 tttaagttatttaattataataaattggtccttaaagttttttttgtaccgctttgatcctttaagttaataaattgtaacaagttggt 22941338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1293 - 1333
Target Start/End: Complemental strand, 31095132 - 31095092
Alignment:
Q  1293 taacttgttataattaaataacttaaatgacgtaagtgata 1333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31095132 taacttgttataattaaataacttaaaggacgtaagtgata 31095092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 8529547 - 8529601
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8529547 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 8529601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022495
Alignment:
Q  171 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 269  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |     
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  270 tcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  9022475 tcttggtcacgggaagagatt 9022495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 585
Target Start/End: Original strand, 15317247 - 15317290
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15317247 atcaagttttttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 15317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16688847 - 16688793
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16688847 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 16688793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Original strand, 18587245 - 18587299
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587245 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 18587299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1022 - 1097
Target Start/End: Complemental strand, 53769861 - 53769786
Alignment:
Q  1022 tttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaatt 1097  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  53769861 tttaaattatttaattgtaataaattaatcatttaagtatttttcataccacttaggtcttttaaattatttaatt 53769786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1107
Target Start/End: Original strand, 2323266 - 2323372
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||   | ||||||||||||  ||||||  ||| || || ||||||||||||| ||    
T  2323266 gttaaattacatcaaaagtcctttaaattatttaattgtaacaaattagccctttaagtttttttggtaccatgtagttctttcaagttaattaattgta 2323365  T
Q  1101 acaagtt 1107  Q
    |||||||    
T  2323366 acaagtt 2323372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 15831425 - 15831478
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15831425 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 15831478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1016 - 1090
Target Start/End: Complemental strand, 42676883 - 42676809
Alignment:
Q  1016 aagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagtta 1090  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  42676883 aagtcttttaagttaattaattgtaacaagttaatcctttatgtttttttcgtatcacttaggtcatttaagtta 42676809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1208 - 1273
Target Start/End: Original strand, 51580077 - 51580140
Alignment:
Q  1208 aaagttacaattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatacttacataactaacttgtt 1273  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  51580077 aaagttacaattaaataacgtaaa-gacctaaatgttacgaaaaatactta-agaactaacttgtt 51580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 592
Target Start/End: Original strand, 55822538 - 55822598
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaagtttga 592  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55822538 ttgctccacacatcaagttt-ttattggtatagttttctcaacgaattcacaacaagattga 55822598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 459
Target Start/End: Original strand, 10114608 - 10114680
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctc 459  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  10114608 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctctttctttctctc 10114680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1024 - 1107
Target Start/End: Complemental strand, 34013861 - 34013780
Alignment:
Q  1024 taagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagtt 1107  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34013861 taagttatttaattgtaacaaattaatcatttaa--ttttttcatactacttaagtcctttaaattaattaaatataataagtt 34013780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Original strand, 47566778 - 47566822
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47566778 atcaagtttattattggtgtggttttctcaaagaattcacaacaa 47566822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Original strand, 10113273 - 10113352
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  10113273 actttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaaatattttattggtgtgatttt-tcaacgacttcacaacaa 10113352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1027 - 1102
Target Start/End: Original strand, 22519373 - 22519448
Alignment:
Q  1027 gttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataac 1102  Q
    |||||||| |||||| || ||  || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22519373 gttatttaattgtaacaagttagtcctttaagtatttttcgtaacacttaggtcctttaagttatttaattgtaac 22519448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1021 - 1116
Target Start/End: Complemental strand, 34717660 - 34717567
Alignment:
Q  1021 ttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtccttta 1116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  34717660 ttttaagttatttaattgtaataaatttgt-atttaagtttttt-cgtatcacctaagtcttttaagttaattaattgaaacaagtttgtctttta 34717567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1117
Target Start/End: Complemental strand, 40070360 - 40070309
Alignment:
Q  1066 cgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40070360 cgtatcacttagatcatttaagttaattaaatataacaagttgatcctttaa 40070309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 619370 - 619297
Alignment:
Q  512 ttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  619370 ttggttgcttgactatcccttactccacacatcaaatttattattggtgt-gttttctcatcgaatccgcaacaa 619297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5143305 - 5143263
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5143305 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Original strand, 5269242 - 5269284
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5269242 tctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggacttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050401
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7050401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853587
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11853587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12739592 - 12739550
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12739592 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22782656 - 22782576
Alignment:
Q  505 ctttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  22782656 ctttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcgcaacaa 22782576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26175678 - 26175636
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26175678 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1107
Target Start/End: Original strand, 31095078 - 31095131
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagtt 1107  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31095078 tttaagtttttt-catatcacttacgtcctttaagttatttaattataacaagtt 31095131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36463431 - 36463389
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36463431 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48893680 - 48893638
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48893680 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1216 - 1258
Target Start/End: Original strand, 53769786 - 53769828
Alignment:
Q  1216 aattaaataacttaaacgacctaagtgttatgaaaaatactta 1258  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  53769786 aattaaataatttaaaagacctaagtggtatgaaaaatactta 53769828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822303
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 499
Target Start/End: Original strand, 22295456 - 22295565
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt-cttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  22295456 tctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgttctctcttcctttctctc--gctgttttctaccttt-gcttgtgt 22295552  T
Q  487 atttaattattcc 499  Q
     | ||||| ||||    
T  22295553 ttataattgttcc 22295565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1076 - 1117
Target Start/End: Original strand, 22519313 - 22519354
Alignment:
Q  1076 aggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctttaa 1117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22519313 aggtcctttaagttagttaattataacatgctggtcctttaa 22519354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1053 - 1114
Target Start/End: Original strand, 48194179 - 48194239
Alignment:
Q  1053 tttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattataacaagttggtcctt 1114  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  48194179 tttaagtttttt-cgtaccacttacgctctttaagttacttaactgtaacaagttggtcctt 48194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906779
Alignment:
Q  234 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 290  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagatt 54906779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 52004 - 52456
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||    
T  52004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggatt 52103  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  52104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactca 52203  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactg--ttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 433  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  52204 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 52303  T
Q  434 tcttgcgttc-tctcttc-ctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattcct 531  Q
    ||||| |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  52304 tcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccct 52403  T
Q  532 tgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52404 tgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaaca 52456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 183968 - 183488
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  183968 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 183870  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  183869 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttggg 183771  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||||||    
T  183770 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagact 183671  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  183670 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattta 183574  T
Q  492 attattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    ||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  183573 attgttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcatcgaattc 183488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 50260 - 50458
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttct-ctcttccttt-ctctcttgctgttttctacttttggcttgtgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50260 tctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgt 50359  T
Q  487 atttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
     | ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  50360 ttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcgcaacaa 50458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 79144 - 79631
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79144 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 79243  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  79244 gtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttggg 79343  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||| | |||||||||||||    
T  79344 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagact 79443  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgcgttctctcttcctttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattat 496  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| |||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  79444 aggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt-ctttttctcttgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgt 79542  T
Q  497 tccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    ||| || |||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  79543 tccatacactttgattttggttgcctaattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt-tcattgaattcgcaaca 79631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 121 - 586
Target Start/End: Original strand, 79837 - 80306
Alignment:
Q  121 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  79837 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaa 79936  T
Q  220 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  79937 ttagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagac 80035  T
Q  320 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 419  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  80036 ttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaa 80135  T
Q  420 ctaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcc-tttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttg 514  Q
    || |||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| ||||     
T  80136 ctgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttccttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttgattttc 80235  T
Q  515 gttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  80236 gttgcctgattattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgt-gttttctcatcgaattcgcaacaa 80306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 237; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 102 - 585
Target Start/End: Original strand, 3956 - 4437
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3956 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agttt 4054  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||  |||||     
T  4055 gtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttggg 4154  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||| |||||||||    
T  4155 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagact 4253  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4254 aggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttgatttctctc--gctgttttctacttttggcttgtgtttataattattc 4351  T
Q  499 cttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
      || ||||  ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||    
T  4352 tatacacttcattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattgatgt-gttttcacaacgaattcacaaca 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 222; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41812 - 41324
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41812 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 41713  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||| |     
T  41712 gtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcgg 41613  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||| | |||||||||||||    
T  41612 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagact 41513  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctttctctctt------gctgttttctacttttggcttgtgtatttaa 492  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||    ||||      | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41512 aggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttttcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttaa 41415  T
Q  493 ttattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||| || ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  41414 ttgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaacaa 41324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 69586 - 69133
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  69586 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 69487  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69486 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 69387  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || |   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  69386 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 69288  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct----ttctctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||| |    |||| ||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    |||| || | |||||||||||||| || ||    
T  69287 ttttgtgttcttctcttctttgtgttct-tctcgccgttgttttctacttttggct--tgtatttataacttccatacattttgttttggttgcctgatt 69191  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  69190 atcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcacaaca 69133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 73318 - 73207
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  73318 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 73219  T
Q  236 gattcaccttgg 247  Q
    ||||||||||||    
T  73218 gattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  215 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 11802 - 11315
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11802 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 11703  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  11702 gtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 11603  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |  | |   ||| | |||||||||||||    
T  11602 tagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagact 11503  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttc-ctttctctc-ttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattatt 497  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  11502 aggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgttgttttctacttttggcttgtgattataattgtt 11403  T
Q  498 ccttatactt--tgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaac 584  Q
    || || ||||  | |||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  11402 ccatacactttattttttcgttgcttaattattccttactccacacatcaag-ttgttattggtgtgatattttcatcgaattcgcaac 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 192; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 579
Target Start/End: Original strand, 85190 - 85667
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||| | ||  ||||  ||||||||||||||||| | ||  |||| || | |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85190 ctataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 85288  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |  ||||      
T  85289 gtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgag 85388  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  85389 tagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagac 85488  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattc 498  Q
    |||||||||||| || |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  85489 taggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctc--gttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttc 85586  T
Q  499 cttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    | || |||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  85587 catacactttgattttggttgtttgattatctcttgctccacacattaagattgttattggtgtgatttt-tcatcgaattc 85667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 586
Target Start/End: Original strand, 6158 - 6647
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6158 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagttt 6257  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  6258 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 6357  T
Q  301 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | ||||||||||||    
T  6358 gtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 6456  T
Q  401 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt--cttgcgttct--ctcttcctttct--ctcttgc---tgttttctacttttggcttgtgtattta 491  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||   ||||| ||| |   ||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||     
T  6457 taggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctacttttggct--tgtattt- 6553  T
Q  492 attattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6554 attattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcatcgaattcacaacaa 6647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 181; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29616
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  336 ttgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||| || | |||||||   |||||||||||||||| | || | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29364 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 29462  T
Q  436 --ttgcgttc-tctcttcct-------ttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggtt 525  Q
      ||| |||| ||||||  |       |||||||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||    
T  29463 gtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctctc-cgttgttttctacttttggct--tttatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgatt 29559  T
Q  526 attccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  29560 atcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcgcaaca 29616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 176; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 585
Target Start/End: Original strand, 34 - 473
Alignment:
Q  136 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  236 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  335 attgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-t 433  Q
    |||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |    
T  234 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 332  T
Q  434 tcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattcctt 532  Q
    ||||      | | ||| | || |  |||   ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  333 tctt------tgtgttcttctcgccgttg--tttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgattttggttgcttgattatccctt 422  T
Q  533 gctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  423 gctccacacatcaag-ttgttattggtgt-gatttctcaacgaattcacaaca 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 167; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 432
Target Start/End: Original strand, 2839 - 3168
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2839 ctataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 2938  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  |||||     
T  2939 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttggg 3038  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | | ||| | ||||||| |||||    
T  3039 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagact 3137  T
Q  402 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3138 aggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 582
Target Start/End: Original strand, 3248 - 3322
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcaca 582  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  3248 actttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgattt--tcatcgaattcaca 3322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 147; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1310
Alignment:
Q  212 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  312 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaattt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 1473  T
Q  412 ggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttc-tctcttcctt----tctctcttgctg----ttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||    ||| ||| || |    ||||||||||||||||  ||||||||||| || |     
T  1472 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgatct-tctcgccgttgtttttctacttttggct--tgtatttaattgttaca 1376  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggtttt 567  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  1375 tacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 145; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1492
Alignment:
Q  105 taaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 203  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  204 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 303  Q
           |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  304 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagacta 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | | ||| | ||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  403 ggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaa-ttcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcct 500  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| | |||   ||||     
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttt-tctctcattgttttctacttttggcttgtgtttataa--cttcca 1574  T
Q  501 tatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  1573 tacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatat-ttattggtgtgattt--tcattgaattcacaacaa 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 145; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16147 - 15774
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16147 ctataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 16049  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||     
T  16048 g-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttggg 15952  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagac 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||| | ||| |||| |||    
T  15951 tagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgac 15852  T
Q  401 taggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttg 478  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| | || ||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  15851 taggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctccc--gttgttttctacttttg 15774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 134; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 137 - 374
Target Start/End: Original strand, 2036 - 2272
Alignment:
Q  137 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 236  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  2036 agatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttg 2134  T
Q  237 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccat 2234  T
Q  337 tgatatcccttttgtaaggttactcatcatatagtgaa 374  Q
    | || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2235 taatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaa 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 130; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16975 - 16525
Alignment:
Q  103 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 202  Q
    |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16975 tataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg 16877  T
Q  203 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 302  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |  ||||| |    
T  16876 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggt 16780  T
Q  303 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagact 401  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || || |  |  | ||||||||||||     
T  16779 agaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagacc 16680  T
Q  402 aggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct-tgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtatttaattattcc 499  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| |||| |||  ||||||||    ||||    
T  16679 aggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctctttcttt-tctctcgttgttttcta-tttttgct--tgtatttataacttcc 16584  T
Q  500 ttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggt 559  Q
     |  |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  16583 atgcactttg-tttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggt 16525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 118; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Original strand, 35599 - 35819
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  |||||  | |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35599 ctataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 35697  T
Q  202 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  35698 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 35797  T
Q  302 tagaattaggcgggagacttat 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35798 tagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 397 - 579
Target Start/End: Original strand, 35848 - 36033
Alignment:
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt--gcgttctctcttcctttctctct-tgctgttttctacttttggcttgtgtatttaat 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||  || ||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  35848 agactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgttgttttcgagttttggcttgtgtttataat 35947  T
Q  494 tattccttatactttgtttt-ggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattc 579  Q
    | || | || |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  35948 tgtttcatacactttgtttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtaatttt-tcatcgaattc 36033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 95; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 483
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5148
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaa-caacaaatctagggtttgtatagagt 199  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa--gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgt 4869  T
Q  200 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggtttt 298  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||    
T  4870 tt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagctttt 4966  T
Q  299 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgttttctccccc 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||| |||  |  |||| | ||| ||||    
T  4967 gg-tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgcccc 5065  T
Q  397 agactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttgcgttctctcttcctttctctcttgctgttttctacttttggcttg 483  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||| || |||   ||| |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5066 agactaggtcagtattggaccgaattgggtaaaaaaa--attgtgttctctctttcttcctctc--gctgtttt-tacttttggcttg 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 84; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 248 - 586
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24840
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgcgttct 444  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T
Q  445 ctcttc--ctttctctctt------gctg-ttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttg-ttttggttgcttggttattccttgc 534  Q
     |||||  ||||   ||||      | || ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  24694 -tcttcttcttttgttcttctcacagttgtttttctacttttggct--cgtattttattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgc 24790  T
Q  535 tccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  24791 tccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 24840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22407
Alignment:
Q  248 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  347 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatgactgttttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| | || | | ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 586
Target Start/End: Original strand, 22491 - 22565
Alignment:
Q  510 ttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22491 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtgatttt-tcgtcgaattcacaacaa 22565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 68; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 993
Alignment:
Q  102 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 201  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1160 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 1061  T
Q  202 gtctc-----ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 264  Q
    |||||     || | ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1060 gtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 66; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1001 - 1139
Target Start/End: Complemental strand, 4003 - 3866
Alignment:
Q  1001 gttaaattacaccataagtcttttaagttatttagttgtaagaaattgatcatttaagttttttacgtaccacttaggtcctttaagttaattaattata 1100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||    
T  4003 gttaaattacaccagaagtcatttatgttatttaattgtaataaattgatcatttaagttattttcctaccactgaggt-ctttaagttaattgattgta 3905  T
Q  1101 acaagttggtcctttaannnnnnncgtaccaattaggtc 1139  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  3904 acaagttggtcctttaagttttttcgtaccaattaggtc 3866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 53; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1409 - 1294
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||   || ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  1409 tgttttctacttttggcttgt--atttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctttttctccacacatcaag-ttgttattggtgtga 1313  T
Q  564 ttttctcatcgaattcacaa 583  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1312 tttt-tcatcgaattcacaa 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1445
Alignment:
Q  397 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 47; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 504 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12794 - 12714
Alignment:
Q  504 actttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  12794 actttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaag-ttgttattggtgtcatttt-tcatcgaattcacaacaa 12714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4721 - 4675
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4721 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4535
Alignment:
Q  464 tgttttctacttttggcttgtgtatttaattattccttatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacatatcaagtttgttattggtgtgg 563  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||  || |||||||| |||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||     
T  4635 tgttttctacttttggct--tgtatttaattgttccatacgctttgactttgttgcttgattatcccttactccacacatcaa-attgttattggtgtga 4539  T
Q  564 tttt 567  Q
    ||||    
T  4538 tttt 4535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2972 - 2918
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2972 ttgctccacgcatcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 2918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16927 - 16884
Alignment:
Q  542 atcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaacaa 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16927 atcaagttt-ttattggtgtggttttctcaacgaattcacaacaa 16884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 585
Target Start/End: Original strand, 231393 - 231445
Alignment:
Q  531 ttgctccacatatcaagtttgttattggtgtggttttctcatcgaattcacaaca 585  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  231393 ttgctccacgcatcaagttt--tattggtgtggttttctcaacgaattcacaaca 231445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 287
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  249 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20457 - 20415
Alignment:
Q  389 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 431  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20457 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University