View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6900_low_40 (Length: 311)

Name: NF6900_low_40
Description: NF6900
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6900_low_40
NF6900_low_40
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (3-301)||(11504279-11504577)
chr5 (3-301)||(11511673-11511971)
chr5 (3-301)||(11519049-11519347)
chr5 (3-301)||(11526454-11526752)
chr5 (3-301)||(11533864-11534162)
chr5 (3-301)||(11496952-11497250)
chr5 (3-301)||(11541281-11541579)
[»] scaffold1005 (1 HSPs)
scaffold1005 (3-301)||(2424-2722)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (3-256)||(41556215-41556468)
chr1 (3-187)||(44179778-44179962)
chr1 (3-187)||(44206909-44207093)
chr1 (195-301)||(44180824-44180940)
chr1 (193-256)||(44208046-44208109)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (49-188)||(4860380-4860519)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (39-170)||(14927142-14927273)
chr6 (195-256)||(14929190-14929251)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (206-256)||(45048279-45048329)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11504279 - 11504577
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11504279 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccatattggtttttgaacagaaaga 11504378  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11504379 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11504478  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11504479 gggtttgaggcactactggggcctttgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11504577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11511673 - 11511971
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11511673 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccatattggtttttgaacagaaaga 11511772  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11511773 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11511872  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511873 gggtttgaggcactactggggcctttgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11511971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11519049 - 11519347
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11519049 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccatattggtttttgaacagaaaga 11519148  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11519149 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11519248  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11519249 gggtttgaggcactactggggcctttgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11519347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11526454 - 11526752
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11526454 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccatattggtttttgaacagaaaga 11526553  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11526554 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11526653  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11526654 gggtttgaggcactactggggcctttgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11526752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11533864 - 11534162
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11533864 agggctggtaaattgagtgctgcagaattggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccatattggtttttgaacagaaaga 11533963  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11533964 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacaggaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11534063  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11534064 gggtttgaggcactactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11534162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11496952 - 11497250
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11496952 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccagattggtttttgaacagaaaga 11497051  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11497052 aagattacaaggatggcaaattctctcaacttgtatccaatcaacttgacatgaagctgagggatgatcctgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 11497151  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497152 gggtttgaggcactactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactataggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11497250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 11541281 - 11541579
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11541281 agggctggtaaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccagattggtttttgaacagaaaga 11541380  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11541381 aagattacaaggatggcaaattttctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaaattcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcatcg 11541480  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11541481 gggtttgaggcacaactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 11541579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1005 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1005
Description:

Target: scaffold1005; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 2424 - 2722
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2424 agggctggtaaattgagtgctgcagaattggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccaaattggtttttgaacagaaaga 2523  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2524 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaaattcagggatgatcttgagagactcaagaaaatccgtaatcaccg 2623  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2624 gggtttgaggcactactggggcctttgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggctgactgttggtgtctcaaagaagcgttaagccgtgatgtcc 2722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 41556215 - 41556468
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41556215 agggctggtgaattaagtgctgcagagttggataatattatgatagtggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccagattggtttttgaacagaaaga 41556314  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaaattcgtaatcaccg 202  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  41556315 aggattacaaggatgggaaattctctcaagttgtatccaatcaatttgacatgaagctgagggatgatttggagagactcgagaagatccgtaatcatcg 41556414  T
Q  203 gggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactac 256  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41556415 tggattgaggcactactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccaagactac 41556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 44179778 - 44179962
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44179778 agggctggtgaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaatttaaggttccagattggtttttgaacagaaaga 44179877  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaa 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  44179878 aggattacaaggatgggaaattctctcaggttgtctccaatcaactcgacatgaagttgagagatgatttggagagactcaagaa 44179962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 44206909 - 44207093
Alignment:
Q  3 agggctggtaaattgagtgctgcagagttgagtaatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaaga 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44206909 agggctggtgaattgagtgctgcagagttggataatattatgacagtggttgcgaatcctcgtcaatttaaggttccagattggtttttgaacagaaaga 44207008  T
Q  103 aagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaacttgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaa 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||    
T  44207009 aggattacaaggatgggaaattctctcaggttgtctccaatcaactcgacatgaagttgagagatgatttggagagactcaagaa 44207093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 301
Target Start/End: Original strand, 44180824 - 44180940
Alignment:
Q  195 aatcaccggggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactacaggc----------tgactgttggtgtctcaaagaagc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||| |||||||||||||||||||    
T  44180824 aatcaccggggtttgaggcactactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccaagactacaggccgcaggggaaagaccgttggtgtctcaaagaagc 44180923  T
Q  285 gttaagccgtgatgtcc 301  Q
    |||||||||||||||||    
T  44180924 gttaagccgtgatgtcc 44180940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 44208046 - 44208109
Alignment:
Q  193 gtaatcaccggggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactac 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44208046 gtaatcatcgtggtttgaggcactactggggccttcgtgttcgtggtcagcataccaagactac 44208109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4860519 - 4860380
Alignment:
Q  49 tggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaagaaagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtatccaatcaact 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  4860519 tggttgcgaatcctcgtcaattcaaggttccagattggtttttgaataggaagaaggattacaaggatggaaaattttctcaagttgtctccaaccaact 4860420  T
Q  149 tgacatgaagctcagggatgatcttgagagactcaagaaa 188  Q
    |||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||    
T  4860419 tgacatgaagttgagagataatttggagagactcaagaaa 4860380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Original strand, 14927142 - 14927273
Alignment:
Q  39 attatgacagtggttgcgaatcctcgtcaattcaagcttccagattggtttttgaacagaaagaaagattacaaggatggcaaattctctcaagttgtat 138  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  14927142 attatgactgtggttgccaaccctaggcaattcaaggtccctgattggtttttgaacagaaagaaggattacaaggatggcaagttttctcaagttgttt 14927241  T
Q  139 ccaatcaacttgacatgaagctcagggatgat 170  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  14927242 caaatcaactggacatgaagttgagggatgat 14927273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 14929190 - 14929251
Alignment:
Q  195 aatcaccggggtttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactac 256  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14929190 aatcaccgaggtttgagacattactggggtcttcgtgttcgtggacagcataccaagactac 14929251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45048329 - 45048279
Alignment:
Q  206 tttgaggcactactggcgccttcgtgttcgtggtcagcataccacgactac 256  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45048329 tttgaggcactactgtggccttcgtgctcgtggtcagcataccaagactac 45048279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University