View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6910_high_4 (Length: 591)

Name: NF6910_high_4
Description: NF6910
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6910_high_4
NF6910_high_4
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (18-572)||(6365402-6365952)
chr1 (193-362)||(30754952-30755123)
chr1 (162-363)||(26093300-26093502)
chr1 (163-362)||(24991664-24991865)
chr1 (192-362)||(39864047-39864218)
chr1 (187-363)||(49223996-49224173)
chr1 (182-363)||(8896342-8896524)
chr1 (187-363)||(16395057-16395232)
chr1 (187-363)||(20209850-20210027)
chr1 (179-363)||(23169003-23169186)
chr1 (192-364)||(7759151-7759324)
chr1 (180-362)||(9379156-9379339)
chr1 (234-362)||(36701898-36702028)
chr1 (234-362)||(36718002-36718132)
chr1 (163-362)||(12038989-12039189)
chr1 (152-362)||(31042693-31042904)
chr1 (181-362)||(37506049-37506234)
chr1 (274-373)||(6160460-6160558)
chr1 (145-302)||(6785145-6785303)
chr1 (193-302)||(13579692-13579801)
chr1 (161-321)||(52429246-52429410)
chr1 (151-354)||(7351538-7351735)
chr1 (229-362)||(9307599-9307734)
chr1 (179-362)||(41121836-41122018)
chr1 (192-363)||(40144857-40145029)
chr1 (163-357)||(14757610-14757804)
chr1 (290-392)||(35538678-35538780)
chr1 (217-362)||(44707771-44707917)
chr1 (267-369)||(15699134-15699236)
chr1 (195-283)||(21910095-21910187)
chr1 (192-362)||(28748927-28749098)
chr1 (187-302)||(35367733-35367849)
chr1 (287-371)||(3312143-3312227)
chr1 (237-362)||(37276441-37276568)
chr1 (309-363)||(32970577-32970631)
chr1 (161-362)||(38787243-38787448)
chr1 (239-364)||(41080582-41080707)
chr1 (244-364)||(44761540-44761662)
chr1 (265-362)||(917034-917131)
chr1 (265-362)||(3260601-3260693)
chr1 (290-358)||(51028508-51028576)
chr1 (208-361)||(2572420-2572574)
chr1 (274-357)||(12151195-12151278)
chr1 (275-322)||(15904771-15904818)
chr1 (237-362)||(34031538-34031665)
chr1 (265-362)||(6023660-6023757)
chr1 (237-326)||(25089132-25089224)
chr1 (288-332)||(29778437-29778481)
chr1 (233-363)||(31154104-31154236)
chr1 (279-359)||(17988572-17988654)
chr1 (265-364)||(29074894-29074993)
chr1 (161-240)||(43500874-43500953)
chr1 (265-363)||(5179409-5179507)
chr1 (312-358)||(35682820-35682866)
chr1 (208-343)||(22856267-22856403)
chr1 (193-362)||(24880809-24880983)
chr1 (232-311)||(28436615-28436696)
chr1 (253-305)||(37539124-37539177)
chr1 (287-363)||(978867-978943)
chr1 (163-227)||(4659684-4659748)
chr1 (192-252)||(12151124-12151183)
chr1 (312-364)||(27687298-27687350)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (146-362)||(45235468-45235688)
chr2 (163-362)||(35313794-35313994)
chr2 (161-362)||(14523378-14523580)
chr2 (187-363)||(34120444-34120619)
chr2 (212-362)||(8947058-8947208)
chr2 (187-369)||(37322360-37322542)
chr2 (187-362)||(16463618-16463796)
chr2 (193-362)||(43410363-43410533)
chr2 (201-362)||(16805827-16805988)
chr2 (201-362)||(16845108-16845269)
chr2 (187-362)||(36794215-36794391)
chr2 (161-362)||(36354449-36354650)
chr2 (182-362)||(5789654-5789834)
chr2 (161-297)||(7494909-7495047)
chr2 (275-373)||(41220942-41221039)
chr2 (147-362)||(25637371-25637588)
chr2 (161-372)||(34451331-34451540)
chr2 (187-362)||(17695259-17695437)
chr2 (152-356)||(35242309-35242514)
chr2 (223-363)||(39691457-39691598)
chr2 (187-360)||(15359095-15359271)
chr2 (295-402)||(10005091-10005197)
chr2 (163-302)||(3323338-3323478)
chr2 (187-325)||(11742571-11742711)
chr2 (290-373)||(1206698-1206781)
chr2 (201-362)||(43115808-43115970)
chr2 (187-302)||(9458332-9458447)
chr2 (309-363)||(43699604-43699658)
chr2 (274-362)||(19426474-19426563)
chr2 (265-357)||(17346373-17346465)
chr2 (161-253)||(34120638-34120729)
chr2 (193-362)||(34225527-34225697)
chr2 (277-362)||(16377662-16377747)
chr2 (193-332)||(19444083-19444223)
chr2 (193-302)||(5272205-5272314)
chr2 (192-260)||(25904723-25904791)
chr2 (193-305)||(18202041-18202155)
chr2 (187-362)||(39785516-39785695)
chr2 (309-362)||(19937731-19937784)
chr2 (290-363)||(33729922-33729994)
chr2 (324-364)||(3323290-3323330)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (161-407)||(4428316-4428560)
chr8 (161-363)||(32476193-32476395)
chr8 (161-362)||(39405667-39405869)
chr8 (179-359)||(22771847-22772028)
chr8 (265-363)||(34057626-34057724)
chr8 (187-362)||(34948696-34948870)
chr8 (194-364)||(17719265-17719436)
chr8 (266-362)||(31331419-31331515)
chr8 (193-362)||(396620-396790)
chr8 (163-363)||(45425674-45425876)
chr8 (193-363)||(10179955-10180126)
chr8 (163-362)||(21216110-21216309)
chr8 (187-362)||(13335148-13335323)
chr8 (151-362)||(26626121-26626333)
chr8 (187-362)||(44761503-44761677)
chr8 (161-362)||(40996374-40996572)
chr8 (231-362)||(7172886-7173021)
chr8 (192-357)||(36006901-36007069)
chr8 (192-325)||(29226574-29226707)
chr8 (237-359)||(42886980-42887104)
chr8 (265-356)||(17823931-17824022)
chr8 (265-364)||(40028522-40028625)
chr8 (278-362)||(1875601-1875685)
chr8 (212-332)||(4924106-4924228)
chr8 (187-363)||(10097999-10098177)
chr8 (265-362)||(31082629-31082726)
chr8 (187-363)||(39482543-39482723)
chr8 (192-332)||(39466076-39466217)
chr8 (151-358)||(41091894-41092097)
chr8 (163-293)||(10953813-10953941)
chr8 (163-293)||(10961818-10961946)
chr8 (193-362)||(11976945-11977115)
chr8 (231-363)||(31270995-31271129)
chr8 (309-362)||(9839835-9839888)
chr8 (265-357)||(27294073-27294165)
chr8 (287-362)||(2767300-2767375)
chr8 (193-302)||(31231667-31231777)
chr8 (308-362)||(12559646-12559700)
chr8 (265-327)||(32678413-32678475)
chr8 (288-362)||(45034500-45034574)
chr8 (297-357)||(463484-463544)
chr8 (309-373)||(39329073-39329136)
chr8 (287-363)||(42972516-42972592)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (161-361)||(16821346-16821548)
chr4 (192-364)||(49746896-49747070)
chr4 (187-363)||(35380346-35380524)
chr4 (152-363)||(54506684-54506896)
chr4 (161-362)||(7061678-7061882)
chr4 (218-362)||(43237203-43237350)
chr4 (161-362)||(2066696-2066896)
chr4 (163-351)||(22129949-22130139)
chr4 (192-373)||(49175938-49176120)
chr4 (187-362)||(38405116-38405293)
chr4 (161-362)||(49428356-49428557)
chr4 (193-373)||(53412044-53412225)
chr4 (187-362)||(42616917-42617093)
chr4 (187-362)||(52859813-52859984)
chr4 (163-362)||(6643674-6643873)
chr4 (147-363)||(19265702-19265916)
chr4 (163-302)||(35311297-35311438)
chr4 (163-362)||(47464379-47464581)
chr4 (193-364)||(2653357-2653529)
chr4 (187-362)||(47773033-47773209)
chr4 (218-362)||(6609722-6609868)
chr4 (161-356)||(26147635-26147834)
chr4 (187-362)||(11907613-11907789)
chr4 (187-362)||(5841441-5841618)
chr4 (151-363)||(42517651-42517872)
chr4 (163-362)||(40122868-40123069)
chr4 (161-363)||(33790744-33790951)
chr4 (238-364)||(35998793-35998920)
chr4 (253-402)||(36985783-36985933)
chr4 (187-362)||(25233113-25233288)
chr4 (265-363)||(52247441-52247539)
chr4 (259-408)||(32469916-32470065)
chr4 (163-362)||(34360562-34360762)
chr4 (151-362)||(41711470-41711683)
chr4 (193-362)||(44536210-44536381)
chr4 (237-363)||(17237309-17237437)
chr4 (192-362)||(28500905-28501070)
chr4 (274-373)||(461977-462075)
chr4 (161-364)||(30682208-30682410)
chr4 (238-362)||(21240718-21240844)
chr4 (288-373)||(30192238-30192322)
chr4 (265-392)||(11288614-11288740)
chr4 (237-363)||(32884781-32884909)
chr4 (232-354)||(50264102-50264226)
chr4 (192-364)||(5618484-5618651)
chr4 (265-332)||(18741518-18741585)
chr4 (194-355)||(7986914-7987074)
chr4 (161-280)||(35251803-35251924)
chr4 (182-298)||(51624712-51624829)
chr4 (277-362)||(17114462-17114547)
chr4 (212-283)||(28911249-28911321)
chr4 (274-362)||(2942659-2942746)
chr4 (187-235)||(3098413-3098461)
chr4 (290-362)||(52869107-52869179)
chr4 (309-364)||(8175592-8175647)
chr4 (294-364)||(3098757-3098827)
chr4 (219-362)||(3689525-3689669)
chr4 (179-241)||(30471778-30471840)
chr4 (327-392)||(16411351-16411416)
chr4 (275-364)||(20612183-20612272)
chr4 (290-363)||(29575143-29575216)
chr4 (265-362)||(38502496-38502593)
chr4 (265-321)||(44526389-44526445)
chr4 (311-363)||(51625139-51625191)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (187-362)||(6315783-6315959)
chr5 (193-363)||(7827931-7828102)
chr5 (161-363)||(6753664-6753866)
chr5 (161-363)||(19929851-19930054)
chr5 (163-364)||(41495989-41496189)
chr5 (187-362)||(1248610-1248786)
chr5 (187-362)||(6615886-6616062)
chr5 (161-362)||(40899823-40900025)
chr5 (265-363)||(11796172-11796270)
chr5 (163-362)||(4818457-4818658)
chr5 (192-363)||(40530229-40530402)
chr5 (246-372)||(4441010-4441138)
chr5 (161-362)||(27580511-27580707)
chr5 (161-363)||(6753934-6754136)
chr5 (197-362)||(29570332-29570499)
chr5 (194-362)||(21060569-21060737)
chr5 (187-362)||(8698239-8698416)
chr5 (218-362)||(15439325-15439469)
chr5 (187-362)||(27542726-27542902)
chr5 (197-373)||(18841420-18841596)
chr5 (187-362)||(8725015-8725191)
chr5 (192-362)||(31654988-31655160)
chr5 (181-363)||(41062165-41062347)
chr5 (187-362)||(42803626-42803802)
chr5 (161-324)||(3348174-3348339)
chr5 (253-358)||(22848394-22848500)
chr5 (289-402)||(38508153-38508266)
chr5 (163-363)||(2232078-2232278)
chr5 (237-363)||(29374322-29374450)
chr5 (265-373)||(37184075-37184182)
chr5 (321-363)||(3076656-3076698)
chr5 (288-362)||(32440174-32440248)
chr5 (253-373)||(41478824-41478944)
chr5 (293-361)||(9515784-9515852)
chr5 (253-359)||(11904202-11904310)
chr5 (285-363)||(5731806-5731884)
chr5 (212-283)||(41478739-41478813)
chr5 (212-283)||(41480105-41480179)
chr5 (253-373)||(41492299-41492419)
chr5 (267-372)||(5282354-5282458)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (163-363)||(34100561-34100762)
chr7 (187-362)||(34947438-34947614)
chr7 (161-362)||(83296-83499)
chr7 (161-362)||(759106-759308)
chr7 (163-357)||(21350645-21350841)
chr7 (161-362)||(21390206-21390409)
chr7 (151-327)||(25571322-25571498)
chr7 (187-364)||(19271746-19271923)
chr7 (161-363)||(21759998-21760201)
chr7 (265-356)||(35333060-35333151)
chr7 (212-362)||(22738665-22738815)
chr7 (187-363)||(28103668-28103848)
chr7 (161-363)||(38391664-38391863)
chr7 (192-362)||(41506080-41506251)
chr7 (163-362)||(8592455-8592656)
chr7 (161-362)||(9785900-9786102)
chr7 (187-363)||(28202323-28202500)
chr7 (163-362)||(11373443-11373643)
chr7 (207-362)||(46478308-46478465)
chr7 (179-373)||(37245620-37245813)
chr7 (187-363)||(27920924-27921103)
chr7 (218-362)||(7463182-7463327)
chr7 (265-363)||(24516303-24516401)
chr7 (192-362)||(2459414-2459583)
chr7 (265-362)||(13961976-13962073)
chr7 (161-362)||(40076230-40076429)
chr7 (180-302)||(44424076-44424198)
chr7 (172-362)||(19060416-19060603)
chr7 (192-364)||(7457434-7457606)
chr7 (229-373)||(16904357-16904503)
chr7 (139-221)||(31665874-31665959)
chr7 (163-362)||(33819125-33819328)
chr7 (165-362)||(48608783-48608976)
chr7 (193-362)||(3178219-3178391)
chr7 (288-362)||(12631345-12631419)
chr7 (187-302)||(36790676-36790794)
chr7 (187-362)||(32346067-32346243)
chr7 (161-300)||(17828428-17828568)
chr7 (287-362)||(2850896-2850971)
chr7 (265-363)||(5524397-5524495)
chr7 (161-362)||(31930512-31930721)
chr7 (187-362)||(43873861-43874037)
chr7 (187-332)||(6494979-6495124)
chr7 (187-363)||(42935596-42935776)
chr7 (311-363)||(44180268-44180320)
chr7 (237-362)||(30865954-30866081)
chr7 (203-242)||(37490329-37490368)
chr7 (268-362)||(16560585-16560679)
chr7 (268-362)||(16604983-16605077)
chr7 (182-228)||(21760320-21760366)
chr7 (265-325)||(17610919-17610979)
chr7 (265-357)||(23670503-23670595)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (161-363)||(29363209-29363414)
chr6 (163-357)||(181464-181658)
chr6 (212-363)||(31894216-31894366)
chr6 (161-359)||(13087440-13087634)
chr6 (181-373)||(1063600-1063791)
chr6 (203-369)||(1955980-1956146)
chr6 (187-363)||(11655952-11656130)
chr6 (161-362)||(32440652-32440856)
chr6 (193-352)||(34299931-34300092)
chr6 (244-362)||(1225035-1225154)
chr6 (187-362)||(7920172-7920345)
chr6 (217-362)||(13909384-13909531)
chr6 (181-363)||(23142593-23142775)
chr6 (187-363)||(6801861-6802039)
chr6 (193-363)||(15058055-15058225)
chr6 (230-361)||(15582256-15582389)
chr6 (187-332)||(30716830-30716977)
chr6 (265-362)||(3291775-3291872)
chr6 (265-362)||(17828950-17829047)
chr6 (187-358)||(11143597-11143769)
chr6 (187-363)||(5302282-5302459)
chr6 (265-362)||(3720248-3720345)
chr6 (161-363)||(21010076-21010285)
chr6 (294-362)||(27448163-27448231)
chr6 (203-365)||(17835333-17835494)
chr6 (192-291)||(21425635-21425737)
chr6 (253-362)||(24983456-24983566)
chr6 (161-227)||(31283538-31283604)
chr6 (246-400)||(1781793-1781947)
chr6 (187-243)||(21478222-21478278)
chr6 (318-357)||(16406798-16406837)
chr6 (287-362)||(21804536-21804610)
chr6 (187-250)||(27367220-27367282)
chr6 (187-250)||(27457567-27457629)
chr6 (166-302)||(34657629-34657769)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (203-362)||(37695674-37695835)
chr3 (192-401)||(37497427-37497638)
chr3 (187-363)||(10366649-10366833)
chr3 (180-356)||(44301485-44301663)
chr3 (163-362)||(43253871-43254072)
chr3 (193-362)||(37311886-37312057)
chr3 (151-362)||(19822906-19823118)
chr3 (161-362)||(30190668-30190870)
chr3 (166-363)||(36476494-36476692)
chr3 (159-362)||(51837967-51838168)
chr3 (194-352)||(39043772-39043932)
chr3 (231-362)||(8679062-8679196)
chr3 (145-362)||(28690790-28691004)
chr3 (231-364)||(11632055-11632190)
chr3 (265-363)||(24569107-24569205)
chr3 (187-363)||(36460423-36460600)
chr3 (288-369)||(49830162-49830243)
chr3 (265-373)||(19611919-19612025)
chr3 (187-362)||(34957435-34957610)
chr3 (161-362)||(37772972-37773176)
chr3 (212-363)||(3901156-3901308)
chr3 (237-364)||(5322943-5323072)
chr3 (237-363)||(12904844-12904973)
chr3 (237-364)||(29023972-29024100)
chr3 (236-362)||(1778622-1778749)
chr3 (169-362)||(30710987-30711180)
chr3 (212-363)||(11905779-11905930)
chr3 (231-362)||(12736580-12736714)
chr3 (253-362)||(23004390-23004500)
chr3 (277-355)||(24245109-24245186)
chr3 (242-408)||(14194541-14194708)
chr3 (237-363)||(19609279-19609407)
chr3 (266-362)||(34750507-34750603)
chr3 (193-302)||(41038461-41038571)
chr3 (288-363)||(50035224-50035299)
chr3 (192-302)||(3313188-3313301)
chr3 (161-362)||(17652658-17652855)
chr3 (265-363)||(26467119-26467218)
chr3 (164-253)||(43715214-43715302)
chr3 (180-363)||(45710773-45710958)
chr3 (265-362)||(54477467-54477564)
chr3 (267-363)||(54726497-54726593)
chr3 (192-242)||(30710585-30710635)
chr3 (212-363)||(52290850-52291001)
chr3 (308-373)||(29595725-29595789)
chr3 (265-362)||(38795354-38795451)
chr3 (265-362)||(48541008-48541105)
chr3 (288-328)||(33459080-33459120)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (161-362)||(50109-50311)
scaffold0095 (192-332)||(22284-22425)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (167-363)||(5303-5498)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (182-362)||(34027-34207)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (193-359)||(1963-2129)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (164-362)||(20361-20561)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (179-327)||(252848-252995)
scaffold0003 (294-362)||(39127-39195)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (187-362)||(7989-8166)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (265-362)||(6748-6844)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (265-362)||(136045-136142)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (265-362)||(105694-105791)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (253-362)||(16095-16205)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (314-363)||(17094-17143)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (192-357)||(697-862)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 572
Target Start/End: Original strand, 6365402 - 6365952
Alignment:
Q  18 agtaccatacacctcaatttgtaagtgtaccgtataagttatctgtcaaaattacttaaacat------------cttttggtaatttcaatacactcac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  6365402 agtaccatacacctcaatttgtaagtgtaccgtataagttctctatcaaaattacttaaacatgtatgaatgcatcttttggtaatttcaatacactcac 6365501  T
Q  106 ggactcacataccacatttaagatggataaatgatatatctccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  6365502 ggactcacataccacatttaagatggataaatgatatatctccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatattttttttctttca--aaataattgtca 6365599  T
Q  206 ccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaa 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6365600 ccttaaaataccaatgcgacatctattattattttttcattatta------------------catcaaacttaactaattcactaactacaattaacaa 6365681  T
Q  306 tgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttctt--------aaaaatggacataaatcttaaacgagtgtt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6365682 tgatattttaataaataatactaatttgattattgaaatcaacacaattaatcatttatcattttcctaaaaaaatggacataaatcttaaacaactgtt 6365781  T
Q  398 atttttagatagagagtcttacgaatatgaatattaatggaatgattaataatattaactttaatcgtaaatgagtcatttaatcgtgagtctcactcac 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  6365782 atttttagatagagagtcttacaaatatgaatattaatggaatgattaataatattaactttaatcgtaaatgagtcatttaatcgtgagt----ctcac 6365877  T
Q  498 aaacatcattgtttttagtccgataataaaattgattttgtcaaagaaaatgccgttacagaggcttaaagggag 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6365878 aaacatcattgtttttagtccgataataaaattgattttgtcaaagaaaatgccgttacagaggcttaaagggag 6365952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30755123 - 30754952
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  30755123 aaaataattatcactttagaataccaatgcatcatgtattttttttctttcattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactatttcact 30755024  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |   || ||||||||||||||||||||||    
T  30755023 aactataattaataatgatattttagtaaataatataaattttacccttaaaatcaacacaattaatcattt 30754952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 363
Target Start/End: Original strand, 26093300 - 26093502
Alignment:
Q  162 aattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatt 260  Q
    ||||||||||||||  | |||| | |||| ||||| |||| |||| |||  |||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  26093300 aattgtctctttaaccttttttctttttctcaaaacaattgtcactttagtatactaatgtaacatttattat-atttttccattattatacccttattt 26093398  T
Q  261 attgat-ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
    |||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26093399 attgaacttcatctaacttaattacttcactaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatca 26093498  T
Q  360 tttt 363  Q
    ||||    
T  26093499 tttt 26093502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24991865 - 24991664
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| |||    
T  24991865 attgtctctttagcattttttttccttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatttttttcccactattatacctttattta 24991766  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | || || |||||| || |||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  24991765 ttgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataaaggtgttgtagtaaatactattaattttaccgttgaaatcaacacaattaatcat 24991666  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  24991665 tt 24991664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 39864047 - 39864218
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  39864047 caaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatt-tttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 39864145  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39864146 taactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 39864218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49224173 - 49223996
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||     
T  49224173 tttctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatt-ttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 49224075  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  49224074 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttt 49223996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8896524 - 8896342
Alignment:
Q  182 ttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaactta 279  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8896524 ttttttttctcaaaaaaattat-accttagaatatcaatgcaacatttattatttttttcccatgattatacctttatttattgaatttcatccaactta 8896426  T
Q  280 actaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || | | |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8896425 accactccactaactacaattaataaatatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttt 8896342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16395232 - 16395057
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |  || |||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  16395232 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgtaggatttattatt--tttttcattattatatcattatttattgaatttcatctaacttaactac 16395135  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16395134 tccactaactacaattaaaaagg-tattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaattaatcatttt 16395057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20210027 - 20209850
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||     
T  20210027 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 20209929  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  20209928 tccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacataattaatcatttt 20209850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23169186 - 23169003
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaac 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   |||||| |||| || |||||||| |||| ||||||| ||||| |  ||    
T  23169186 attttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacat---ttattacttttccactattatactcttatttattgaatttcacctcac 23169090  T
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23169089 ttaactatttaactaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttt 23169003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 364
Target Start/End: Original strand, 7759151 - 7759324
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||    
T  7759151 caaaataattgtcactttacaataataatgcatcatttattatt-tttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccac 7759249  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7759250 taactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattgaaatcaacacaattaattattttt 7759324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 362
Target Start/End: Original strand, 9379156 - 9379339
Alignment:
Q  180 ttttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacct-taattattga-tttcatcaaact 277  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  9379156 ttttttctttcttaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaatatttatt--tatttttccattattatacctatatttattaaatttcatcaaact 9379253  T
Q  278 taactaattc-actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9379254 taactactcccactaactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcattaaaatcattacaattaatcattt 9379339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 36701898 - 36702028
Alignment:
Q  234 ttattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatt 331  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||    
T  36701898 ttatttttccattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaatt 36701997  T
Q  332 taattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36701998 ttaccattgaaatcaacataattaatcattt 36702028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 36718002 - 36718132
Alignment:
Q  234 ttattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatt 331  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||    
T  36718002 ttatttttccattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaatt 36718101  T
Q  332 taattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36718102 ttaccattgaaatcaacataattaatcattt 36718132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 12038989 - 12039189
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaatta 261  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||||| |||    
T  12038989 attgtctctttagtatttttttattttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatta-ttttccactattatacccttattta 12039087  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    ||| ||| |||| ||||||| || | || ||||||||||||| ||   | | ||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12039088 ttgaattacatccaacttaaatactccattaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcat 12039187  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  12039188 tt 12039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 362
Target Start/End: Original strand, 31042693 - 31042904
Alignment:
Q  152 gtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattat 251  Q
    |||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||| || ||| ||||||| ||||| || ||| ||    
T  31042693 gtcttacaataattgtctctttatcattttttctctttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatacatcatttattatt-tttttccactatgat 31042791  T
Q  252 accttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaaca 349  Q
    | ||| ||| ||||| ||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||| || | ||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||    
T  31042792 atctttatttattgaatttcattcaacttaattacttcactacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaaca 31042891  T
Q  350 caattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||    
T  31042892 caattaatcattt 31042904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 37506049 - 37506234
Alignment:
Q  181 tttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaactt 278  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||  |||||    
T  37506049 tttttctttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatt-tttttccattataatacccttatttattgaatttcattcaactt 37506147  T
Q  279 aactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataa---ataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| |||   ||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  37506148 aactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcattt 37506234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6160558 - 6160460
Alignment:
Q  274 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6160558 aacttaactattccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatca-ttttcttaaaaat 6160460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 302
Target Start/End: Original strand, 6785145 - 6785303
Alignment:
Q  145 ctccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttca 244  Q
    |||| |||||| | ||| ||||| ||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  6785145 ctccctcgtctcacagttattgtttctttagaattttttctttttctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattatt-tttttcca 6785243  T
Q  245 ttattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaa 302  Q
     ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6785244 ctattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaa 6785303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13579801 - 13579692
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||||    
T  13579801 aaaataattgtcactttaaaataccgatgcaatatttattattattttt--attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccact 13579704  T
Q  291 aactacaattaa 302  Q
    ||||||||||||    
T  13579703 aactacaattaa 13579692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 321
Target Start/End: Original strand, 52429246 - 52429410
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttt-tcattattatacc-tta 257  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| | ||||  ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  52429246 taattgtctttttagtatttttttctttttcttaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattattttttttctcattattataccctta 52429345  T
Q  258 attattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaat 321  Q
     ||| ||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  52429346 tttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttaataaat 52429410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Original strand, 7351538 - 7351735
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    |||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||     |||| |||||||||||||||    
T  7351538 cgtctaaaaataactgtgtctttaatatattttttct----caaaataattgtcattttagaatactaatgcaac----tttatcattttttcattatta 7351629  T
Q  251 tac-cttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaac 348  Q
    ||| |||| |||||| ||||  || ||||||| || | ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  7351630 tactcttatttattgaattttgtccaacttaattattccactaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaac 7351729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 362
Target Start/End: Original strand, 9307599 - 9307734
Alignment:
Q  229 tattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatac 326  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||     
T  9307599 tattatttttttcccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaacaagggtgttttagtaaatgctat 9307698  T
Q  327 taatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9307699 taattttatcattgaaatcaacacagttaatcattt 9307734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41122018 - 41121836
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattgatttcatcaaactt 278  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||  ||   |       
T  41122018 attttttttttctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatacaacatttattatt-ttttttcattattatacccttataatttattaaatttcatca 41121920  T
Q  279 aactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| || ||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  41121919 aactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 41121836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40145029 - 40144857
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||| | ||     
T  40145029 caaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatt-ttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccat 40144931  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40144930 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttt 40144857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14757804 - 14757610
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| || | ||| ||||| ||||||  || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  14757804 attgtctctttaacattttttctttttctcaaaataattgtc-ctttacaatacaaatgcagaatttataatt-tttttccactattatacccttattta 14757707  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    || | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14757706 ttaaatttcatcgaacttaactacttcactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgttactaattttatcgttgaaatcaacacaattaat 14757610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Original strand, 35538678 - 35538780
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaa-tggacataaatcttaa 388  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||    
T  35538678 taactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaat-aattttcttaaaaattgtaaataaatcttaa 35538776  T
Q  389 acga 392  Q
    ||||    
T  35538777 acga 35538780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44707917 - 44707771
Alignment:
Q  217 caatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatatttt 314  Q
    |||||||| || ||||||| | ||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||   | ||||    
T  44707917 caatgcaatatttattatt-tgtttccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgtttt 44707819  T
Q  315 aataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44707818 agtaaatactactaattttatcattgaaatcaatataattaatcattt 44707771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 15699134 - 15699236
Alignment:
Q  267 ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttct 366  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15699134 ttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttttct 15699233  T
Q  367 taa 369  Q
    |||    
T  15699234 taa 15699236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21910187 - 21910095
Alignment:
Q  195 aataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttt---tcattattataccttaattattg-atttcatcaaacttaacta 283  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  21910187 aataattgtcactttaaaatatcaatgccacatttattattatttttttctcattattataccttatttattgaattccatcaaacttaacta 21910095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 28748927 - 28749098
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattc-a 288  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||| |    
T  28748927 caaaataattatcactttataatagcaatgcagcatttattatt-ttttcccactattatacccttatttataaaatttcatccaacttaac-aattcta 28749024  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||| ||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28749025 ctaattacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 28749098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Original strand, 35367733 - 35367849
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  35367733 tttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgaaacatttattagtcttttt-cactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactac 35367831  T
Q  285 ttcactaactacaattaa 302  Q
    | ||||||||||||||||    
T  35367832 tccactaactacaattaa 35367849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 371
Target Start/End: Original strand, 3312143 - 3312227
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaa 371  Q
    |||||||||||||||| |   ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3312143 cactaactacaattaatatcaatattatagtaaatgatactaatttaatcattaaaatcaacacaattaatcatttcttttaaaa 3312227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Original strand, 37276441 - 37276568
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||  |||||||||| |    
T  37276441 ttttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactattccactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgatactaatttta 37276540  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
      ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  37276541 ccatcaaaatcaacacagttaatcattt 37276568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32970631 - 32970577
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32970631 tattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttt 32970577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 38787243 - 38787448
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattata-cctta 257  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| || | |||||||| || |||| || ||||||  |||||||||| |||||    
T  38787243 taattgtctctttaccattttttatttttctcaaaataattgtcactttagaaaagcaatgcaaaatttattttttttttttcccattattataccctta 38787342  T
Q  258 attattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
     |||||| |||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||| || ||| ||||   |||| |||||| ||| |  ||  ||||||||||||| ||    
T  38787343 tttattgaatttcatccaatttaactactccactaactataattaataaggatgttttggcaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaatcaa 38787442  T
Q  357 tcattt 362  Q
    ||||||    
T  38787443 tcattt 38787448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 364
Target Start/End: Original strand, 41080582 - 41080707
Alignment:
Q  239 ttttcattattataccttaatt-attgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaatta 337  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||  | |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |||  ||||| | ||    
T  41080582 ttttcactatcatacctttatttattgaattcatccaacttacctc-tccactaattacaattaataaagatatttcaataaatgatataaattttacta 41080680  T
Q  338 ttgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  41080681 ttaaaatcaacacaattaatcattttt 41080707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44761662 - 44761540
Alignment:
Q  244 attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattga 341  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| | | ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||| |    
T  44761662 attattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccactaactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaa 44761563  T
Q  342 aatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    
T  44761562 aattaacataattaatcattttt 44761540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 917034 - 917131
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  917034 atttcatgcaacttaactaatctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacataattaatcattt 917131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 3260601 - 3260693
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |     ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3260601 atttcatcaaacttaacttctccactaactacaattaataagg-----ttagtaattaatactacttttattattgaaatcaacacaactaatcattt 3260693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51028576 - 51028508
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  51028576 taactacaattaataaaaatattttaataaatgctactaactttattattaaaatcaacacaattaatc 51028508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 361
Target Start/End: Original strand, 2572420 - 2572574
Alignment:
Q  208 ttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaa 305  Q
    |||||||| |||||||| || ||||  | ||||| ||||||||||  || ||| ||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  2572420 ttaaaatatcaatgcaatatttatttatttttttccattattatatttttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataa 2572519  T
Q  306 tgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatt 361  Q
    |  || |||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  2572520 ttgta-tttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatt 2572574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 357
Target Start/End: Original strand, 12151195 - 12151278
Alignment:
Q  274 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  12151195 aacttaactgctccactaactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaat 12151278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Original strand, 15904771 - 15904818
Alignment:
Q  275 acttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaata 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15904771 acttaactacttcactaactacaattaataaggatattttaataaata 15904818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34031665 - 34031538
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||| | |||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  34031665 tttttccattattatactcttatttattgaatttcattcaaccttactattacactaactacaattaataacggtattttagtaaatgatattaatttta 34031566  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||    
T  34031565 ccattggaatcaacacaagtaatcattt 34031538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6023757 - 6023660
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || | ||||||| ||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  6023757 atttcatccaacttaactactccaataactacaattaataaaggtattttagtaaaagctactaaatttaccattgaaatcaacacaattaaacattt 6023660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25089224 - 25089132
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaa-caatgatattttaataaataatac 326  Q
    ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||    
T  25089224 tttttccattagtatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggatgttttagtaaataatac 25089132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29778481 - 29778437
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29778481 actaactacaattaataatgatattttagtaaatgatactaattt 29778437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 363
Target Start/End: Original strand, 31154104 - 31154236
Alignment:
Q  233 attattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaat 330  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||  | |  || |||||||||||| ||    | |||| || |||||||||||    
T  31154104 attattttttcaatactatacacttatttactgaatttcatcaaacttaagcactctaccaactacaattaataaatgcaatttagtagataatactaat 31154203  T
Q  331 ttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31154204 tttatcattaaaatcaacacaattaatcatttt 31154236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17988654 - 17988572
Alignment:
Q  279 aactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataata--ctaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  17988654 aactacttcattaactacaattaataagagtattttagtaaataatatactaattttaacattgaaatcaacacaattaatca 17988572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 364
Target Start/End: Original strand, 29074894 - 29074993
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||||||| |||||||||| | |  |||| |||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29074894 atttcatccaacttaactattacgttaacaacaattaatatggatgttttaataaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaactaatcattttt 29074993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43500953 - 43500874
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttt 240  Q
    ||||||||||||||  || ||| || |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  43500953 taattgtctctttaccatttttattttttctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattattatttt 43500874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5179507 - 5179409
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| |   | | |||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5179507 atttcatccaatttatctactccactaactacaattaatatgaaaactttagtaaatgatactcattttgctattgaaatcaacacaattaatcatttt 5179409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35682866 - 35682820
Alignment:
Q  312 tttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  35682866 tttaataaatgatactaatgttatcattgaaatcaacacaattaatc 35682820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22856403 - 22856267
Alignment:
Q  208 ttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaa 305  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||  |    
T  22856403 ttaaaatatcaattcaacatttattatt-tttttgcactattatacttttatttattgaatttcatccagcttaactactccactaactacaattaatta 22856305  T
Q  306 tgatattttaataaataatactaatttaattattgaaa 343  Q
     | ||||||| |||||  || |||||| || |||||||    
T  22856304 gggtattttagtaaatggtattaattttatgattgaaa 22856267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 24880809 - 24880983
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-attattataccttaatt-attga-tttcatcaaactta---actaatt 286  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| || | ||| |||||||  |||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||   |||| |     
T  24880809 aaaataattgtcactttagaatacca-tgtagcatttattatttctttttccattattatatcctaatttattgaatttcatccaacttactaactactc 24880907  T
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24880908 cactaactacaattaataaaagtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataatcaatcattt 24880983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28436696 - 28436615
Alignment:
Q  232 tattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatat 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |  |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28436696 tattattttttcactattatatcgttatttatttaacttcatcgaatttaactaattcattaactacaattaataatgatat 28436615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 37539124 - 37539177
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaa 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  37539124 ccttatttattgaatttcatcaaacttaactactctactaactacaattaacaa 37539177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 978943 - 978867
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| | ||||| | ||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  978943 cactaactactattaataaggatatttcattaaatgaaacacattttatcattgaaatcaacacaactaatcatttt 978867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Original strand, 4659684 - 4659748
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacat 227  Q
    |||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  4659684 attgtctcttcagcatattttatttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacat 4659748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Original strand, 12151124 - 12151183
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata 252  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12151124 caaaataattgtcactttataatatcaatgcagcatttattatta-tttttcattattata 12151183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 27687298 - 27687350
Alignment:
Q  312 tttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27687298 tttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaactaatcattttt 27687350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 362
Target Start/End: Original strand, 45235468 - 45235688
Alignment:
Q  146 tccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatat-tttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-c 243  Q
    |||||||||| | | || |||||||||||| || | ||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  45235468 tccttcgtctcacaatatttgtctctttaaaatttgtttttctatctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattatttttttc 45235567  T
Q  244 attattata-ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattga 341  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  |||||    
T  45235568 attactatatccttatttattgaatttcatcaaacttaactatttcattaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattga 45235667  T
Q  342 aatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  45235668 aatcaacacaatcaatcattt 45235688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 35313794 - 35313994
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaatta 261  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||| || |||||||| |||| |||    
T  35313794 attgtctctttaacattttttctttttctcaaaataattgtcactttacaataataatgcaacatttattact-tttttccactattatactcttattta 35313892  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |  ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35313893 ttgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcat 35313992  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  35313993 tt 35313994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14523580 - 14523378
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  14523580 taattgtctctttaacactttttctttttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttc-cattattatatccttatt 14523482  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
     ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||  ||||    
T  14523481 aattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaaaaaatc 14523382  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  14523381 attt 14523378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34120619 - 34120444
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||     
T  34120619 tttctcaaaataattgtcactttaaaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattattatactcttacttattgaatttcatccaacttaactat 34120521  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  34120520 tccactaactacaattaataa--atattttagtaaataatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttt 34120444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8947208 - 8947058
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| || |||    
T  8947208 aataccaatgcaatatttattatt--tttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataaggat 8947111  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8947110 gttttagtaaatattactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattt 8947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 37322360 - 37322542
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  37322360 tttctcaaaataattgtcactttagaatacctatgtagcatttattatt--ttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactac 37322457  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaa 369  Q
    | |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37322458 tccactaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcattttccttaa 37322542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 16463618 - 16463796
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatacc-ttaattatt-gatttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  16463618 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattttaccattatttattaaatttcatcaaactttacta 16463717  T
Q  284 attcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  16463718 ctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 16463796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 43410363 - 43410533
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||  |||||||||| | || |    
T  43410363 aaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatt-tttttccattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccatt 43410461  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43410462 aactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatcaacacaattaataattt 43410533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 362
Target Start/End: Original strand, 16805827 - 16805988
Alignment:
Q  201 tatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaat 299  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  16805827 tatcactttagaatatcaatgcatcatttattatc-ttttttcattattatcccttatctattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaat 16805925  T
Q  300 taacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||| || ||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16805926 taataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcattt 16805988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 362
Target Start/End: Original strand, 16845108 - 16845269
Alignment:
Q  201 tatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaat 299  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  16845108 tatcactttagaatatcaatgcatcatttattatc-ttttttcattattatcccttatctattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaat 16845206  T
Q  300 taacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||| || ||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16845207 taataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcattt 16845269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 36794215 - 36794391
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||     
T  36794215 tttctcaaaataattatcactttaaaataccaatgcagcatttattatt-ttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 36794313  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | ||||||||||| |||| || |   ||||| ||||  |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  36794314 tccactaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 36794391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36354650 - 36354449
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |    
T  36354650 taattgtctctttatcattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagaatttattat--tttttccattattataccattatt 36354553  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||| |||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| || ||    
T  36354552 tattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaactagtc 36354453  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  36354452 attt 36354449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5789834 - 5789654
Alignment:
Q  182 ttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaactta 279  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  5789834 ttttttttctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt--ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaactta 5789737  T
Q  280 actaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | | ||||| |||||   |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5789736 actatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcattt 5789654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7495047 - 7494909
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  7495047 taattgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttttcattattatacccttatt 7494948  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactaca 297  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  7494947 tattgaatttcatccaacttaactactccgctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41221039 - 41220942
Alignment:
Q  275 acttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41221039 acttaactacttcattaactacaattaataaaaatattttaataaatgatactaattttataattgaaatcaacacaattaatcatgttt-ttaaaaat 41220942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 362
Target Start/End: Original strand, 25637371 - 25637588
Alignment:
Q  147 ccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcatt 246  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||  || |||  | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  25637371 ccttcgtctcacaataattgtctctttaccatttttactttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccatt 25637470  T
Q  247 attata-ccttaattatt-gatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaat 344  Q
    |||| | ||||| |||||  |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||| || | | ||||| ||||| | |||||||| |  ||  ||||    
T  25637471 attacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactcctataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaat 25637570  T
Q  345 caacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25637571 caacacaattaatcattt 25637588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34451540 - 34451331
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| || |    ||||  || |||||| |||| |||    
T  34451540 taattgtctctttagtattttttttctatctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttaat----ttttcccagtattatgcctttatt 34451445  T
Q  261 -attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||     
T  34451444 tattgaatttcatccaactaaactatttcaataactagaattaatgaaaatattttagtaaataatactaattttctcatcgaaatcaacataattaata 34451345  T
Q  359 atttttcttaaaaa 372  Q
    |||||| |||||||    
T  34451344 attttttttaaaaa 34451331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 17695259 - 17695437
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17695259 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaacta 17695358  T
Q  284 attcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     |  |||||||| |||||| ||  |||||||  ||||| |||  ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17695359 ctctactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaatcaatacaattaatcattt 17695437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35242514 - 35242309
Alignment:
Q  152 gtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattat 251  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | ||  |||||| |||| || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||    
T  35242514 gtcttaaaataattgtgtctttaatattttttctatgtctgaaaatagttataactttagaataccaatgcaatatttattattagtttt-cactattat 35242416  T
Q  252 accttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaaca 349  Q
    || || ||| ||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  ||||| || ||||| || ||||||| |  ||| |||||||||    
T  35242415 acttttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactacaattaataaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaatcaaca 35242316  T
Q  350 caattaa 356  Q
    |||||||    
T  35242315 caattaa 35242309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 363
Target Start/End: Original strand, 39691457 - 39691598
Alignment:
Q  223 aacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaa 320  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||| ||   ||||||| ||||    
T  39691457 aacatttattattattttc-cattattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaa 39691555  T
Q  321 taatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39691556 tgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttt 39691598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15359271 - 15359095
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| |||||||||| | || ||| |||| |||||||  || ||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  15359271 tttctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcagtatttattagtatttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaacta 15359172  T
Q  284 attcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
     | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  15359171 ctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcat 15359095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10005197 - 10005091
Alignment:
Q  295 acaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaatggacataaatcttaaacgagt 394  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |    
T  10005197 acaattaataaagatattttagtaaatgatactaattttattgctgaaatcaacacaattgatca-ttttcttataaatgtgcacaaaccttaaacgact 10005099  T
Q  395 gttatttt 402  Q
    ||||||||    
T  10005098 gttatttt 10005091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3323478 - 3323338
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||  || ||||| || |||| |||    
T  3323478 attgtctctttagcattttttctttttctcaaaataattctcactttacaataccaatgcagcatttattatt-ttttcccactattacactcttactta 3323380  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaa 302  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3323379 ttgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaa 3323338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11742711 - 11742571
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||| |  ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||     
T  11742711 tttctcaaaataattgtcactttagaatacgaatgaaacatttattattttttttccatgacaatacccttatttattgaacttcatcaaacttaactac 11742612  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataata 325  Q
    | || ||||||||||||| || | | |||||||||||||||    
T  11742611 tccattaactacaattaataagggtgttttaataaataata 11742571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1206781 - 1206698
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1206781 taactacaattaataaggatattttagtaaatgttactaattttaccactgaaatcaacataattaatcatttttcttacaaat 1206698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43115970 - 43115808
Alignment:
Q  201 tatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatta-ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaa 298  Q
    |||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||  |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  43115970 tatcactttacaatatcaatgtagcatttattatt-tttttccattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaa 43115872  T
Q  299 ttaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | || ||   ||||||| |||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43115871 taaataagagtattttagtaaatgctactaactttatcattgaaatcaacacaattaatcattt 43115808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9458447 - 9458332
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattatt-gatttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| ||||     
T  9458447 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattat--tttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactac 9458350  T
Q  285 ttcactaactacaattaa 302  Q
    | ||||||||||||||||    
T  9458349 tccactaactacaattaa 9458332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43699658 - 43699604
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43699658 tattttaataaatgatactaattttactattgaaatcaacacagttaatcatttt 43699604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Original strand, 19426474 - 19426563
Alignment:
Q  274 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattg-aaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19426474 aacttaactactcgacttactacaattaataatgatattttagtaaatgttgctaattttatcattgaaaatcaacacaattaatcattt 19426563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17346465 - 17346373
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| | | |||||||||| | |||||||    
T  17346465 atttcttccaacttaactactccactaactacaattaataaaaatattttaataaatgatattaattttacttttgaaatcaaaataattaat 17346373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34120729 - 34120638
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac 253  Q
    |||||| |||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  34120729 taattgcctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattattatac 34120638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 34225527 - 34225697
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||  ||||||| || | || |    
T  34225527 aaaataattgtcactttggaataccaatgcagtatttattatt-ttttttcattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccatt 34225625  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||| || |  ||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  34225626 aactacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccattaaaatcaatataattattcattt 34225697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16377747 - 16377662
Alignment:
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||  ||||| ||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  16377747 ttaactactccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttaccattgtaatcaacacaattaatcattt 16377662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 19444083 - 19444223
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||| | || ||| | |||||||| |  |||    
T  19444083 aaaataattgtcacttcaaaatatcaatgcaacatttattatt-tttttacattattatacccttgtttattgaaatttatccatcttaactactcgact 19444181  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    || ||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  19444182 aattacaattaataataacattttagtaaataatattaattt 19444223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5272314 - 5272205
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||| || | ||||    
T  5272314 aaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattatt--tttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaattactccact 5272217  T
Q  291 aactacaattaa 302  Q
    ||||||||||||    
T  5272216 aactacaattaa 5272205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Original strand, 25904723 - 25904791
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25904723 caaaataattgtcactttaaaatattaatgcatcatttattattatttttccactattataccctaatt 25904791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 18202041 - 18202155
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||| |||| || ||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  18202041 aaaataattgtcactttcgaataccaatgcagcatttgttatttttttcccattataatacatttatttattaaatttcatccaacttaactacttcact 18202140  T
Q  291 aactacaattaacaa 305  Q
    ||||||| |||||||    
T  18202141 aactacatttaacaa 18202155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 39785516 - 39785695
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| || |||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||     
T  39785516 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttactatt-ttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 39785614  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataa---ataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | || ||||||||||||| ||   | ||||| |||   ||| ||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  39785615 tccattaactacaattaataagagtgttttagtaaatgatagtactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 39785695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Original strand, 19937731 - 19937784
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19937731 tattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 19937784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33729994 - 33729922
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  33729994 taactataattaataaggatattttaataaataa-acatattttatgattgaaatcaacactaataatcatttt 33729922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3323330 - 3323290
Alignment:
Q  324 tactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323330 tactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttt 3323290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4428560 - 4428316
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | |  | |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||   |||||||||||| || |||||||| || |||    
T  4428560 taattgtctttttaatattttttctatgcctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaaca---attattatttttccactattatacttttatt 4428464  T
Q  261 -attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||    
T  4428463 tattgaatttcatctaacttaactaattcactaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaatcaacacaaataatc 4428364  T
Q  359 atttttcttaaaaatggacataaatcttaaacgagtgttatttttagat 407  Q
    | |||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  4428363 a-ttttcttaaaaatatacataaaccttaaacgactattattttgagat 4428316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 32476193 - 32476395
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    |||| |||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |    
T  32476193 taatagtctctttagcattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcgtatattatt--tttttcattgttatacccttatt 32476290  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||    
T  32476291 tattgaatttcatcaaacttaactacttcattaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattgaaatcaacagaatcaatc 32476390  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  32476391 atttt 32476395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 39405667 - 39405869
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  39405667 taattgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttt-cactattatacccttatt 39405765  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||| | ||||||  ||||||| || | ||||||||  |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  39405766 tatttaatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatc 39405865  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  39405866 attt 39405869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22772028 - 22771847
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaac 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  22772028 attttttttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatta-cttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaac 22771930  T
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
     ||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||| | |||||||| |  ||  |||||||| ||||||||||    
T  22771929 ataattacttcactaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatcaaaatcaacccaattaatca 22771847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34057724 - 34057626
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34057724 atttcatccaacttaactatttcactaactacaaataacaacgatattttagtaaataatactagttttattattgaaatcaacataattaattatttt 34057626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34948870 - 34948696
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattga-tttcatcaaacttaactaat 285  Q
    |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  34948870 tttctcaaaataattgttactttagaataccaatgcaatatttattatt--tttttcattgttataccttatttattgaatttcatccaacttaactact 34948773  T
Q  286 tcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     |||||||||||||||| ||   | |||   ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34948772 ccactaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaattaatcattt 34948696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17719436 - 17719265
Alignment:
Q  194 aaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcacta 291  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| | |||||    
T  17719436 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatc-tttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactccacta 17719338  T
Q  292 actacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |  ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17719337 actataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccattaaaatcattacaattaatcattttt 17719265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Original strand, 31331419 - 31331515
Alignment:
Q  266 tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31331419 tttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcattt 31331515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 396790 - 396620
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatta-ttga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| ||| ||  |||||| |||| |    
T  396790 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttt-cattattatacccttattaattgaattttatccaatataactacttcatt 396692  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||    
T  396691 aactacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttgaaatcaacataattaatcattt 396620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 45425876 - 45425674
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||  |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  45425876 attgtctctttgatatttttttattttttcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattattttttttccactattatacccttattta 45425777  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| ||||||  ||||||| || | |||||||||||||||| ||  || |||||||||||  || |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  45425776 ttgaatttcatacaacttaattactccactaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaatcaacacaattaatcat 45425677  T
Q  361 ttt 363  Q
    |||    
T  45425676 ttt 45425674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10180126 - 10179955
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||| ||||||  |||||||||| | ||||    
T  10180126 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttct-attattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccact 10180028  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||| || |||||||    
T  10180027 aactacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaatacaactactcatttt 10179955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21216309 - 21216110
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattat 262  Q
    ||||||||||||  || |||| | ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||  | |||||  | ||||||||| |  ||||    
T  21216309 attgtctctttagcattttttctttttctgaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatttatttttttctactattataccatt-ttat 21216211  T
Q  263 tga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatt 361  Q
    ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||   |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21216210 tgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatt 21216111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 13335148 - 13335323
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||     
T  13335148 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattat--tttttccattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactac 13335245  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |  ||||||| ||||||| ||   | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||| |||||    
T  13335246 tctactaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaaccattt 13335323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26626333 - 26626121
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatt 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||    
T  26626333 cgtctcaaaataattgtctcttta-tccatttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattatt-ttttcccattatt 26626236  T
Q  250 atacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaa 347  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||  |||   |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||  || ||||    
T  26626235 atacccttatttattgaatttcattcaaccggactactccactaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatcaaattcaa 26626136  T
Q  348 cacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||    
T  26626135 cacaattaatcattt 26626121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44761677 - 44761503
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| || ||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||     
T  44761677 tttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagca--tattagt-tttttccactattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactac 44761581  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44761580 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 44761503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40996572 - 40996374
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||||| ||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||    ||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40996572 taattgtttctttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacattcatt----ttttttcattagtaccccttattt 40996477  T
Q  261 attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || | | ||||| ||||| | |||||||| |   |  |||||||||||||||||||    
T  40996476 attgaatttcatccaacttaaccatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaattttacattcaaaatcaacacaattaatca 40996377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 362
Target Start/End: Original strand, 7172886 - 7173021
Alignment:
Q  231 ttattatttttt--cattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatac 326  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||  || ||||| |||||  |||    
T  7172886 ttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgctac 7172985  T
Q  327 taatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7172986 taattttatcattgaaatcaacacaattaatcattt 7173021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36007069 - 36006901
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| || |||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| ||   ||    
T  36007069 caaaataattgtcactttagaatactaatgcaacaattatttttatttttttcactattatgctcttatttattgaatttcatcaaacttaattacccca 36006970  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  36006969 ctaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcattaaaatcaacacaactaat 36006901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29226707 - 29226574
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  29226707 caaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattata--tttttcattattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccac 29226610  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataata 325  Q
    ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||    
T  29226609 taactacaattaataagagtgttttaataaataata 29226574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 359
Target Start/End: Original strand, 42886980 - 42887104
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||      
T  42886980 tttttccatgattatactcttatttattgaattttatccaacttaactacgccactaactacaattaataaaggtattttagtaaatgatactaattttg 42887079  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  42887080 ctattgaaatcaacacaattaatca 42887104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Original strand, 17823931 - 17824022
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| || ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17823931 atttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggtattctagtaaaagatactaattttatcattgaaatcaacacgattaa 17824022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 364
Target Start/End: Original strand, 40028522 - 40028625
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaacta----caattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40028522 atttcatctaacttaattacttcactaactaaatacaattaataatgatattttaataaatgctattaattttaccattgaaatcaacataattaatcat 40028621  T
Q  361 tttt 364  Q
    ||||    
T  40028622 tttt 40028625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1875685 - 1875601
Alignment:
Q  278 taactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1875685 taactatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 1875601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4924228 - 4924106
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||| || |||    
T  4924228 aataccaatacattatttattattattttttcactaatatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagat 4924129  T
Q  310 attttaataaataatactaattt 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  4924128 attttagtaaataatactaattt 4924106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10098177 - 10097999
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| | || ||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||     
T  10098177 tttctcaaaataattgttactttagaataccaatacatcatttattattttttttccattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactac 10098078  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || | | || || ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10098077 tccactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcatttt 10097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 31082629 - 31082726
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| || | | ||||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31082629 atttcatccaacttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaaatcaagacaattaatcattt 31082726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 39482543 - 39482723
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-----attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaactta 279  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||   |||||||||||||     ||||||||||| ||| ||||||| ||||||   |||||    
T  39482543 tttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtat---ttattattttttcccactattattatacccttatttattgaatttcattccactta 39482639  T
Q  280 actaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||| | ||||||||| |||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  39482640 actagtccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttgaaatcaacacaattaatcatttt 39482723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39466217 - 39466076
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcat-caaacttaactaattca 288  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| || |||  ||||||| | ||    
T  39466217 caaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattat--ttttttcactattatatccttatttattgaattttatccaattttaactactgca 39466120  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39466119 ctaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattt 39466076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 358
Target Start/End: Original strand, 41091894 - 41092097
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | |||  | ||||||  ||  ||| |||| ||||||| |||   |||||  ||||||| |||||    
T  41091894 cgtcttaaaataattgtctctttagtattttttttgtctca--acataattgccaatttagaatatcaatgcagcat---ttatttatttttcactatta 41091988  T
Q  251 tacc-ttaattattgattt-catcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaac 348  Q
    |||| ||| ||||||| || ||| |||||||| || ||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||    
T  41091989 tacccttatttattgaattacat-aaacttaaatatttttctaactacaattaataagagtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaac 41092087  T
Q  349 acaattaatc 358  Q
    ||||||||||    
T  41092088 acaattaatc 41092097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10953941 - 10953813
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaatta 261  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||| |||||  ||    
T  10953941 attgtctctttaacattttttctttttctcaaaataattgtcactttacgataccaatgcaacatttatta----tttttcattattatacccttatata 10953846  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaac 293  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  10953845 ttgaatttgatctaacttaactactccactaac 10953813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10961946 - 10961818
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaatta 261  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||| |||||  ||    
T  10961946 attgtctctttaacattttttctttttctcaaaataattgtcactttacgataccaatgcaacatttatta----tttttcattattatacccttatata 10961851  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaac 293  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  10961850 ttgaatttgatctaacttaactactccactaac 10961818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11977115 - 11976945
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| |  |||    
T  11977115 aaaataattgtcattttacaatactaatgtagcatttattatt-tttttccgctattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactactctact 11977017  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| || | ||||||| |||||  |||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11977016 aactacaattaataagggtattttagtaaatgctactgattataccattgaaatcaacacaattaatgattt 11976945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 363
Target Start/End: Original strand, 31270995 - 31271129
Alignment:
Q  231 ttattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatacta 328  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||   ||||||| || || ||| ||    
T  31270995 ttattatttttttattactatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttagtatatgatatta 31271094  T
Q  329 atttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31271095 attttaccattaaaatcaacacaatcaatcatttt 31271129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9839888 - 9839835
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  9839888 tattttaataaataatactaattttatcgttgaaatcaaaacatttaatcattt 9839835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27294165 - 27294073
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  27294165 atttcatccaacttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaatgaacacaattaat 27294073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2767375 - 2767300
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  2767375 cactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattt 2767300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 31231667 - 31231777
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||  || ||| |||||||||| | ||||    
T  31231667 aaaataattgtcattttataataccaatgcatcatttattatt-tttttccattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccact 31231765  T
Q  291 aactacaattaa 302  Q
    ||||||||||||    
T  31231766 aactacaattaa 31231777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 362
Target Start/End: Original strand, 12559646 - 12559700
Alignment:
Q  308 atattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12559646 atattttagtaaatggtattaattttattattaaaatcaacacaattaatcattt 12559700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 327
Target Start/End: Original strand, 32678413 - 32678475
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||    
T  32678413 atttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatact 32678475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Original strand, 45034500 - 45034574
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  45034500 actaattataattaataataatattttaataaataaaacatattttactattgaaatcaacaacattaatcattt 45034574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Original strand, 463484 - 463544
Alignment:
Q  297 aattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  463484 aattaataataatattttaataaatgatacgtatttaactattaaaatcaacactattaat 463544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 373
Target Start/End: Original strand, 39329073 - 39329136
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    |||||||| |||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39329073 tattttaaaaaacgatactaattttatcattaaaattaacacaattaatca-ttttcttaaaaat 39329136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42972592 - 42972516
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||  ||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42972592 cactaactataattaataagggtattttagtaaacgatattaattttaccattgaaatcaaaacaattaatcatttt 42972516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16821548 - 16821346
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  16821548 taattgtctctttaacattttttctctttgttaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattatttttgcactattatacccttatt 16821449  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| ||||||  ||||||| || | ||||||||| |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16821448 tattgaatttcattcaacttaaatactccactaactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatc 16821349  T
Q  359 att 361  Q
    |||    
T  16821348 att 16821346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 364
Target Start/End: Original strand, 49746896 - 49747070
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  ||    
T  49746896 caaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattatttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaac 49746995  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||||| ||||||  | | ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49746996 taactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaacacaattaattattttt 49747070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35380524 - 35380346
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |     
T  35380524 tttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccac 35380425  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35380424 tccactaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaatcaacataattaatcatttt 35380346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 363
Target Start/End: Original strand, 54506684 - 54506896
Alignment:
Q  152 gtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattat 251  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| |  |||| | ||||  |||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54506684 gtcttataataattgtctttttaacactttttctttttcttaaaataattatcgctttataatatcgatgcaacatttattattattttt-cattattat 54506782  T
Q  252 ac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaaca 349  Q
    |  |||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||    
T  54506783 attcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaaca 54506882  T
Q  350 caattaatcatttt 363  Q
    || |||||||||||    
T  54506883 cagttaatcatttt 54506896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7061882 - 7061678
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttct--ttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-tta 257  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| | || |||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  7061882 taattgtttctttagcatattttttctctttctcaaaataattgttactttaaaatatcaatacaacatttattatt-tattttcactattataccctta 7061784  T
Q  258 attattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
     ||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  7061783 tttattgaatttcattcaacttaattaatccactaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaa 7061684  T
Q  357 tcattt 362  Q
    ||||||    
T  7061683 tcattt 7061678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Original strand, 43237203 - 43237350
Alignment:
Q  218 aatgcaacatctattattatttttt-cattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatatttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  43237203 aatgcaacatttattattatttttttcactattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgatttttt 43237302  T
Q  315 aataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  43237303 agtaaatattactaattttaccattgaaataaacacaattaatcattt 43237350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 2066696 - 2066896
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2066696 taattatctctttactattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcat---ttattattttttcattattatacctttatt 2066792  T
Q  261 -attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||||    
T  2066793 tattgaatttcatctaacttaactaccccactaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatcaaaatcaacacaattaatc 2066892  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  2066893 attt 2066896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 22129949 - 22130139
Alignment:
Q  163 attgtctctttaa-tatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatt 260  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  22129949 attgtctctttaactatttttttt-tttctcaaaataattgtcattttacaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacctttattt 22130047  T
Q  261 attg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    |||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| || ||| ||||  ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  22130048 attgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattgaaatcaacaca 22130139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49176120 - 49175938
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| | | |    
T  49176120 caaaataattgtcactttagaataccaatgcaacaattattatttttttcccactattatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccgc 49176021  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  49176020 taactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatctccacaattaatca-ttttcttaaaaat 49175938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38405293 - 38405116
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  38405293 tttctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcaacatttattactttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactac 38405194  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
      |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38405193 accactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacagaattaatcattt 38405116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49428557 - 49428356
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| || | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  49428557 taattgtctctttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaa-atcaatgcaacatttattact-tttttccattattatacccttatt 49428460  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  49428459 tattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattgaaatcaacacaaataatc 49428360  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  49428359 attt 49428356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 373
Target Start/End: Original strand, 53412044 - 53412225
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  53412044 aaaataattgtcattttagaataccaatgtaacatctattatttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccaca 53412143  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53412144 aactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaataaaattaatc-gttttcttaaaaat 53412225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42617093 - 42616917
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||   |||||||||     
T  42617093 tttctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattattttc-cattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactac 42616995  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42616994 tccacttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacagttaatcattt 42616917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 52859984 - 52859813
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattgatttcatcaaacttaactaatt 286  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| || | |   |||||||  |||||||||| |     
T  52859984 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttcccattattataccctattga---atttcattcaacttaactactc 52859889  T
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  52859888 cactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 52859813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6643873 - 6643674
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||  ||||||| | || | |||||||||| |||| ||| |||  ||| ||| ||| ||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  6643873 attgtctctttagcatattttcttttcctcaaaataattgtcactttacaatttcaacgcagcatttatt--tatttttccactattatacccttattta 6643776  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6643775 ttgaatttcatccaacttaactataccactaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcat 6643676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 363
Target Start/End: Original strand, 19265702 - 19265916
Alignment:
Q  147 ccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcatt 246  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||| ||     |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  19265702 ccttcgtctcacactaattgtctctttaacattttttttttt-----aaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttagtatt-tttttccatt 19265795  T
Q  247 attatac---cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaa 342  Q
    ||  |||   |||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  19265796 atattacacccttaattattgaatttcattcaacttaactactccactaactataattaataaggttattttaataaataacattaattttattattgaa 19265895  T
Q  343 atcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19265896 ataaatataattaatcatttt 19265916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35311438 - 35311297
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatacc-ttaatt 260  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  35311438 attgtctctttagcatgtttttt-tttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattattttttccaatattatacctttattt 35311340  T
Q  261 attg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaa 302  Q
    |||| |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  35311339 attgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaa 35311297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47464581 - 47464379
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatt 260  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||    
T  47464581 attgtctctttaacatttttttctttttcttaaaataattatcgttttacaataccaatgcattatttattattttttttccactattatacccttattt 47464482  T
Q  261 attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  47464481 attgaatttcatccaacttaactactccaccaactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatca 47464382  T
Q  360 ttt 362  Q
    |||    
T  47464381 ttt 47464379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 364
Target Start/End: Original strand, 2653357 - 2653529
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||| | |  |    
T  2653357 aaaatagttgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatc-tttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactccttt 2653455  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653456 aactacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattgaaatcaacacaattaatcattttt 2653529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47773209 - 47773033
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||     
T  47773209 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 47773111  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  47773110 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattt 47773033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Original strand, 6609722 - 6609868
Alignment:
Q  218 aatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatatttta 315  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||| || ||| ||||     
T  6609722 aatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgagtttcatccaacttaactactccaataattacaattaataaagatgttttt 6609821  T
Q  316 ataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  6609822 gtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 6609868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26147834 - 26147635
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattata-cctta 257  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  26147834 taattgtctctttatcattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatacaacatttatt-ttatttttttccattattataccctta 26147736  T
Q  258 attattg--atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaatta 355  Q
     ||||||  | |||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||  || ||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  26147735 tttattgaaaattcatccaacttaattactccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 26147636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11907789 - 11907613
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| || ||| |||||  |||||| ||||||||||     
T  11907789 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattataatacatttatttattgaacttcatccaacttaactac 11907691  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | || ||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11907690 tccaataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 11907613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5841618 - 5841441
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaa-cta 283  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  5841618 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttattattaatttc-cattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaacta 5841520  T
Q  284 attcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  5841519 ctccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacgcaatcaatcattt 5841441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42517872 - 42517651
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttt----tcatt 246  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||  || |||| | ||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||    |||||    
T  42517872 cgtcttacaataattgtttctttatcattttttctttttctaaaaataattgtcactttaaaatacaaatgcagcatttattattattattactttcatt 42517773  T
Q  247 attatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaat---tcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattga 341  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |   |||||||||| |||||| || | ||||||| ||||| ||  |||||| |  |||||    
T  42517772 attatactgttatttattgaatttcatctaactttactagtatttcactaactataattaataagggtattttagtaaatgatcttaattttaccattga 42517673  T
Q  342 aatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42517672 aatcaacacaattaatcatttt 42517651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40123069 - 40122868
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || |||| | ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  ||| || ||||| |||    
T  40123069 attgtctctttagcattttttatttttcttaaaataattatcactttacaataccaatgcaacatttattatttttttcccaccattgtacccttattta 40122970  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    ||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||||| || || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||    
T  40122969 ttgaatttcgtcgaacttaactgctccactaactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaattaatcat 40122870  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  40122869 tt 40122868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33790951 - 33790744
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttcttt--cacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-attattatacc-tt 256  Q
    |||||||||| |||  || ||||||||||  | |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||| |||| || || |||| ||||||||||| ||    
T  33790951 taattgtctccttaccattttttttctttttctcaaaataattgtcactttagaattccaacgcagcatttattttttttctttccattattataccctt 33790852  T
Q  257 aattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaatta 355  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | |||||  |||| | |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  33790851 atttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatcaaaatcaacacaatta 33790752  T
Q  356 atcatttt 363  Q
    ||||||||    
T  33790751 atcatttt 33790744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 364
Target Start/End: Original strand, 35998793 - 35998920
Alignment:
Q  238 tttttcattattataccttaatt-attgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaatt 336  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  35998793 tttttcactattatatctttatttattgaattcatccaacttaactactccatcaactacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttact 35998892  T
Q  337 attgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
     || ||||||||| || |||| ||||||    
T  35998893 gttaaaatcaacataaataataattttt 35998920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 402
Target Start/End: Original strand, 36985783 - 36985933
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36985783 ccttatttattgaatttcatccaacttaattattctactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacaca 36985882  T
Q  352 attaatcatttttcttaaaaatgg-acataaatcttaaacgagtgttatttt 402  Q
    |||||||||||  || |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||    
T  36985883 attaatcatttc-ctgaaaaatcgtataaaaatcttaaacgagtattatttt 36985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 25233113 - 25233288
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||| ||||||||||     
T  25233113 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattat--ttttttcattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactac 25233210  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||| |||||| | |  | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||| |||||||||||| ||||    
T  25233211 ttcactaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaattattt 25233288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 52247539 - 52247441
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||||  || |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52247539 atttcattcaacttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaattaacacaattaatcatttt 52247441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32470065 - 32469916
Alignment:
Q  259 ttattgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||||| || |||||||||||  | || | |||||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  32470065 ttattgaatttatcaaacttaaaaactttattaactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaattaatc 32469966  T
Q  359 atttttcttaaaaatggacataaatcttaaacgagtgttatttttagata 408  Q
    |||||  |||||| |   |||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  32469965 attttctttaaaattatgcataaatcttaaacaaatattattttgagata 32469916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 34360562 - 34360762
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||| | || || ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  34360562 attgtctctttagcatctttttttttttaaaaaataattgtcactttacaataccaatttaacattttttttt-tttttccactattatacccttattta 34360660  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  34360661 ttgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaatacaattaatcat 34360760  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  34360761 tt 34360762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41711683 - 41711470
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||  ||| ||||  |||  | ||| ||||||| ||||| || ||||     
T  41711683 cgtctcaaaataattgtctatttagtattttttatttttctcaaaataattgtcatattagaatataaatagagcatttattattttttttccactattg 41711584  T
Q  251 ta-ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaac 348  Q
    || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | | |||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||| ||||||||    
T  41711583 tatccttatttattgaatttcataaaacttaacaactccgctaaataaaattaaaaatgatattttaaaaaatgatattaattttaccattaaaatcaac 41711484  T
Q  349 acaattaatcattt 362  Q
    | ||||||||||||    
T  41711483 ataattaatcattt 41711470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44536381 - 44536210
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattataccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |||| ||||| |||  || ||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||| ||| | |||    
T  44536381 aaaataattgtcactttacaatactaatgcagcatttatt-ttattcttttccactattatacccttatttttgaatttcatctaacttagctactccac 44536283  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||| || | | |||||||||||  | ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44536282 taactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattt 44536210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17237437 - 17237309
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |    
T  17237437 tttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgttactaatttta 17237338  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
      |||| |||||||||||||||| |||||    
T  17237337 ccattgcaatcaacacaattaattatttt 17237309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28501070 - 28500905
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||            
T  28501070 caaaataattgtctctttagaataccaatacaacatttattattttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaa-------- 28500979  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28500978 ctaactgcaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcattt 28500905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 461977 - 462075
Alignment:
Q  274 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  461977 aacttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattgaaatcaatacaattaatca-ttttcttaaaaat 462075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30682410 - 30682208
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaat 259  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| |   ||||||| |||| ||| || | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  30682410 taattatctctttaatatatattttttttta---aataattgtcactttagaaaatcaatgtagcatttattattattttttcattattatgcttttatt 30682314  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||  || ||||||| |  ||||||||||| ||| || |||||| || ||||| ||| |||||| |  | | |||| |||||||||||||    
T  30682313 tattgaatttcattcaaattaactactctactaactacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaataaaattaacacaattaatc 30682214  T
Q  359 attttt 364  Q
    ||||||    
T  30682213 attttt 30682208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21240844 - 21240718
Alignment:
Q  238 tttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaat 335  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| | ||| ||||| |||||||||| |     
T  21240844 ttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttac 21240745  T
Q  336 tattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21240744 catcaaaatcaacacagttaatcattt 21240718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Original strand, 30192238 - 30192322
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||| | | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30192238 actaactacaattaataagaatattttagcaaatgacattaattttataattgaaatcaacacaattaatca-ttttcttaaaaat 30192322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11288740 - 11288614
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11288740 attttatccaacttaactactccaccaactacaattaataa-gatattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaattaatca-tttt 11288643  T
Q  365 cttaaaaat-ggacataaatcttaaacga 392  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  11288642 cttaataatcgtacataaaccttaaacga 11288614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 32884781 - 32884909
Alignment:
Q  237 ttttttcattattata-ccttaattattgatttc-atcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||  |    
T  32884781 tttttccactattatatccttatttattgaattccatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattcta 32884880  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
      |||||||||||||||||||||||||||    
T  32884881 ccattgaaatcaacacaattaatcatttt 32884909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50264226 - 50264102
Alignment:
Q  232 tattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaa 329  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||  |||    
T  50264226 tattttttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatatttcactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatgttaa 50264127  T
Q  330 tttaattattgaaatcaacacaatt 354  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  50264126 ttttaacattgaaatcaacacaatt 50264102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 364
Target Start/End: Original strand, 5618484 - 5618651
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattat-accttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||  ||||| ||     |||    
T  5618484 caaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttatt--tattttttcattattataactttttttattgaatttcattcaactttac-----cac 5618576  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| |  ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  5618577 tcacaacaattaataaggatattttaataaataattttaattttaccattaaaatcaacacaactcatcattttt 5618651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18741585 - 18741518
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  18741585 atttcatccaacttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaattt 18741518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Original strand, 7986914 - 7987074
Alignment:
Q  194 aaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatta--ttgatttcatcaaacttaactaattcacta 291  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    ||||||| |||||  |||||||| || |||   || ||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  7986914 aaataattatcactttaaaatatcaatgtaacac---ttattatattttccctattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctacta 7987010  T
Q  292 actacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaatta 355  Q
    || | |||||| ||| |||||||| || || |||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  7987011 acaataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcattaaaatcaacactatta 7987074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 35251803 - 35251924
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaa 258  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  35251803 taattgtctttttaacatttttttctctgtctccaaataattatcaatttagaataccaaaacaacatttattatta-tttttcattattatatccttat 35251901  T
Q  259 ttattg-atttcatcaaacttaa 280  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  35251902 ttattgaatttcatctaacttaa 35251924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 298
Target Start/End: Original strand, 51624712 - 51624829
Alignment:
Q  182 ttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaactta 279  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  51624712 ttttttttctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattatt-tttttccactatcatacccttatttattgaatttcatccaactta 51624810  T
Q  280 actaattcactaactacaa 298  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  51624811 actactccactaactacaa 51624829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 362
Target Start/End: Original strand, 17114462 - 17114547
Alignment:
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  17114462 ttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 17114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28911321 - 28911249
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28911321 aatatcaatgcaacatttattatt-tttttccattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 28911249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2942746 - 2942659
Alignment:
Q  274 aacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  2942746 aacttaaccactccactaactacaattaataagg-tgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaatcattt 2942659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 3098413 - 3098461
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattatt 235  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3098413 tttctcaaaataattatcacgttaaaatatcaatgcaacatttattatt 3098461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 362
Target Start/End: Original strand, 52869107 - 52869179
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52869107 taactacaattaataaaggtattttaataaacgatattaatcttactattgaaatcaacacaattaattattt 52869179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8175647 - 8175592
Alignment:
Q  309 tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8175647 tattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattattcattttt 8175592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 3098757 - 3098827
Alignment:
Q  294 tacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3098757 tacaattaataaagatattttagtaaatgatatcaattttatcattgaaatcaatataattaatcattttt 3098827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 3689525 - 3689669
Alignment:
Q  219 atgcaacatctattattattttttcattattataccttaatta--ttgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaa 316  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||  || |||||||| |||||||| | |  |||||||| |||||| ||   | |||||     
T  3689525 atgcaacatttattatta-ttttccattattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttag 3689623  T
Q  317 taaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3689624 taaatgatactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattt 3689669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Original strand, 30471778 - 30471840
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttt 241  Q
    |||||||||||  || ||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30471778 attttttctttttcagaataattgtctctttaaaatatcaatgcaacatttattattattttt 30471840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16411416 - 16411351
Alignment:
Q  327 taatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaatggacataaatcttaaacga 392  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||| || |||||||||||||    
T  16411416 taattttatcattgaaatcaacataattaattattttctttaaaactgggcacaaatcttaaacga 16411351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20612272 - 20612183
Alignment:
Q  275 acttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| || |  | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  20612272 acttaactacttcattatctacaattaataatggtgttttagtaaattatactaactttagcaatgaaatcaactcaactaatcattttt 20612183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Original strand, 29575143 - 29575216
Alignment:
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  || |||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  29575143 taactacaattaacaagagtattttaataaatgttattaattttatcatttaaattaacataattaatcatttt 29575216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38502593 - 38502496
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||| ||| |||||||||| | || |||||| |||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38502593 attttatccaacttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattt 38502496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Original strand, 44526389 - 44526445
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaat 321  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  44526389 atttcatccaacttcactattccactaactacaattaataaggatgttttaataaat 44526445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 51625139 - 51625191
Alignment:
Q  311 ttttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51625139 ttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 51625191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6315959 - 6315783
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  6315959 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttc-cattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactac 6315861  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  6315860 ttcactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaatcaatcattt 6315783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7828102 - 7827931
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| | ||||    
T  7828102 aaaaaaattatcattttaaaatatcaatgcaatatttattatc-ttttttcattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccact 7828004  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7828003 aactacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttt 7827931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6753866 - 6753664
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    |||||||| |||||  || |||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |    
T  6753866 taattgtcactttagcattttttttttttttcaaaataattatcactttagaataccaatgcaacatttattatc-tttttccattattatacccttatt 6753768  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||| || | ||||||||    
T  6753767 tattaaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaattaata-aattaatc 6753669  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  6753668 atttt 6753664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 19929851 - 19930054
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||| ||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |    
T  19929851 taattgtctatttaccatcttttctttttcgcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatta-ttttccattattatacccttatt 19929949  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |  ||| ||| |  ||  ||||||||| ||||||||    
T  19929950 tattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatcaaaatcaacaaaattaatc 19930049  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  19930050 atttt 19930054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 364
Target Start/End: Original strand, 41495989 - 41496189
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-a 261  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |    
T  41495989 attgtctctttaacatttttttt--ttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattcttttc-cactattatacctttattta 41496085  T
Q  262 ttg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    ||| |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  41496086 ttgcatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaattat 41496185  T
Q  361 tttt 364  Q
    ||||    
T  41496186 tttt 41496189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1248786 - 1248610
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatta-ttga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| ||  ||||||||||     
T  1248786 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactac 1248688  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1248687 ttcactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataattaataattt 1248610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6616062 - 6615886
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgatttcatcaaacttaactaat 285  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  6616062 tttctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaattcatccaacttaaccact 6615963  T
Q  286 tcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     ||||||||| |||||| || ||| ||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6615962 ccactaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 6615886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 40899823 - 40900025
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  40899823 taattgtctctttatcaaattttctttttctcaaaataattgtcactttagaataacattgcagcatttattattattttc-cattattatacccttatt 40899921  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||||||||||    ||  ||||||||||||||||||    
T  40899922 tattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatcaaaatcaacacaattaatc 40900021  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  40900022 attt 40900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11796270 - 11796172
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11796270 atttcatctaacttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaacacaattaaccatttt 11796172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 4818457 - 4818658
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| |||    
T  4818457 attgtctctttaacaatttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgtagcatttattatttttttcccactattatacccttattta 4818556  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| ||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  4818557 ttgaatttcatctaacttaatcactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaatcaacacaattaattat 4818656  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  4818657 tt 4818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40530402 - 40530229
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||  |||  || ||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||| | | |||    
T  40530402 caaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattatttatttcccactattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactccac 40530303  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40530302 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 40530229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 4441010 - 4441138
Alignment:
Q  246 tattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaa 343  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||    
T  4441010 tattataccgttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaataatattaattttatcattaaaa 4441109  T
Q  344 tcaacacaattaatcatttttcttaaaaa 372  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4441110 tcaacacaattaattattttttttaaaaa 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 27580511 - 27580707
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| |       ||||  ||||||||||| || |||    
T  27580511 taattgtctttttaatattttttctttttctcaaaataattgtcactttacataaccaatgcaacattt-------ttttcccattattatacatttatt 27580603  T
Q  261 --attgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
      ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27580604 taattaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatc 27580703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 6753934 - 6754136
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    |||||||||||||   || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||| | |||| ||||| |    
T  6753934 taattgtctcttttcaattttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacat-tttttttttttttccatcaatatacccttatt 6754032  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||| | | |||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  6754033 tattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttagtaaatgacattaattttactattgaaatcaaca-aattaatc 6754131  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  6754132 atttt 6754136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 362
Target Start/End: Original strand, 29570332 - 29570499
Alignment:
Q  197 taattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaact 294  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| || | |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||    
T  29570332 taattatcactttacaataccaatacaacgtttatttttttcttttcactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactattccattaact 29570431  T
Q  295 acaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| || | | |||||  ||||| || |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29570432 acaattaataaaggtgttttagcaaatactaataattttaacattaaaatcaacacaattaatcattt 29570499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 362
Target Start/End: Original strand, 21060569 - 21060737
Alignment:
Q  194 aaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcacta 291  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||    
T  21060569 aaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttatt-ttattttc-cattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccacta 21060666  T
Q  292 actacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21060667 actacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatcaaaataaacacaattaatcattt 21060737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 8698239 - 8698416
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| |  || ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |     
T  8698239 tttctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtagtatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccac 8698338  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||  |||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8698339 tccactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 8698416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15439469 - 15439325
Alignment:
Q  218 aatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaa 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||   |||||||     
T  15439469 aatgcaacatttattattattttta-attattatacccttatttattaaattaatcaaacttaactactactctaaatacaattaataaaagtattttag 15439371  T
Q  317 taaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||    
T  15439370 taaatgatactaattttaccattgaaattaatacaattaatcattt 15439325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 27542726 - 27542902
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  27542726 tttctcaaaataattgtgactttagaatactaatgcagcatgtattact-tttttccattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactac 27542824  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| ||   ||||||| |||||  || |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27542825 tccactaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcattt 27542902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 373
Target Start/End: Original strand, 18841420 - 18841596
Alignment:
Q  197 taattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaact 294  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| | |||||  || ||| ||||| ||||| | || |||| || ||||||||||    
T  18841420 taattatcaccttagaatatcaatgtaatatttattattattttttcact-ttatatttttatttattgaatttcacccaatttaattatttcactaact 18841518  T
Q  295 acaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  18841519 acaattaataacggtattttattaaatgatattaattttaccatttaaatcaatataattaatcattttt-ttaaaaat 18841596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8725191 - 8725015
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| |||| ||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||||     
T  8725191 tttctcaaaataattgtcattttagaataacaatgcagcagtttttattattttt-cattattatactattatttattgaatttcattcaagttaactac 8725093  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8725092 tccactaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 8725015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 31654988 - 31655160
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaa-taccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||| | ||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||| || | ||    
T  31654988 caaaataattgtcactttaaaaataccaatacaataattattatt-tatttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactcca 31655086  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||| || |||||| || ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31655087 ctaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 31655160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41062347 - 41062165
Alignment:
Q  181 tttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaactt 278  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||| | | |||| | |||    
T  41062347 tttttttttctcaaaataattataactttagaataccaatgcaacatttattat--tttttccattataatacccttatttattgaactccatccagctt 41062250  T
Q  279 aactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || || |  ||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  41062249 aattattctactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaacataattaattatttt 41062165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42803802 - 42803626
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| | ||| |||||| ||| ||||||| | |||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |     
T  42803802 tttctcaaaataattgtcattttacagtactaatgcatcatttattattttcttttaat-attatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccac 42803704  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | || ||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  42803703 tccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatactactaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 42803626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3348339 - 3348174
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaa 258  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| | |||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||     
T  3348339 taattgtcttttttatctatttttctttttctcaaaataattgtcattttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattataatatccttat 3348241  T
Q  259 ttattgat-ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataat 324  Q
    |||||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||| || | | ||||||||||||||    
T  3348240 ttattgaacttcatccaacttaattacttcaccaactacatttaataagggtgttttaataaataat 3348174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22848500 - 22848394
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||| | || ||||||||||||| || | | |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  22848500 ccttatttattgaatttcatccaatctaactactccattaactacaattaataagggtgttttaataaatactattaattttactattgaaatcaacaca 22848401  T
Q  352 attaatc 358  Q
    |||||||    
T  22848400 attaatc 22848394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38508266 - 38508153
Alignment:
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaatgga-cataaatctta 387  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||| | | |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  38508266 ctaactacaattaataagagtattttaatgagtgatactaattttaccattgaaattaacacaattaatca-ttttcttaaaaatcgagcacaaatctta 38508168  T
Q  388 aacgagtgttatttt 402  Q
    ||||| | |||||||    
T  38508167 aacgactattatttt 38508153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2232278 - 2232078
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcat--tattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||| || |||| | | || | |||||||| |||  ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |  ||||||||| ||| |    
T  2232278 attgtctctttaacattttttctttatctctaaataattgtcattttacaataccaatgtagcatttattattatttttttctactattatacccttatt 2232179  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    |||||| ||   | |||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  2232178 tattgaatttcatccaacttaactactccactaa----aattaataagagttttttaataaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattattc 2232083  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  2232082 atttt 2232078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 29374322 - 29374450
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||  || ||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  || |||||| |    
T  29374322 ttttttcactattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaatttta 29374421  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29374422 tcattgaaatcaacataattaatcatttt 29374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37184182 - 37184075
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||||||||||  | |  | |||||||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37184182 atttcatcaaacttaatcagtctattaactacaatgaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaactcaattaatcattttt 37184083  T
Q  365 cttaaaaat 373  Q
     ||||||||    
T  37184082 -ttaaaaat 37184075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 363
Target Start/End: Original strand, 3076656 - 3076698
Alignment:
Q  321 taatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3076656 taatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttt 3076698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Original strand, 32440174 - 32440248
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  32440174 actaagtacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaattaatcattt 32440248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 41478824 - 41478944
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatg-atattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacac 350  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||| |  |||||||| | |||    
T  41478824 ccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactgcaattaacaagggatattttagtaaatgacactaattttaccattgaaataagcac 41478922  T
Q  351 aattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  41478923 aattaatca-ttttcttaaaaat 41478944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 9515784 - 9515852
Alignment:
Q  293 ctacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatt 361  Q
    |||| ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9515784 ctactattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatt 9515852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 359
Target Start/End: Original strand, 11904202 - 11904310
Alignment:
Q  253 ccttaattattgatttc-atcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatga-tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacac 350  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||||||| | ||| ||||||||||||  | || ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  11904202 ccttaattattgatttttatcgaatttaactactccaccaactacaattaaataagagtattttagtaaatgatattaattttattattgaactcaatac 11904301  T
Q  351 aattaatca 359  Q
    |||||||||    
T  11904302 aattaatca 11904310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 363
Target Start/End: Original strand, 5731806 - 5731884
Alignment:
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5731806 ttcactaactacgattaataaggatgttttagtaaatgatacacattttgttattaaaatgaacacaattaatcatttt 5731884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Original strand, 41478739 - 41478813
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttc-attattatacc-ttaattattg-atttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  41478739 aatatcaatgcaacatttattattattttttctactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaacta 41478813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Original strand, 41480105 - 41480179
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattatta-ttttttcattattatacc-ttaattattg-atttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  41480105 aatatcaatgcaacatttattattatttttttcactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaacta 41480179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 41492299 - 41492419
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatg-atattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacac 350  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||| | |||||||| |||||   |||||||| |  |||||||| | |||    
T  41492299 ccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactacatttaacaagggatattttagtaaatgtcactaattttaccattgaaataagcac 41492397  T
Q  351 aattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  41492398 aattaatca-ttttcttaaaaat 41492419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 372
Target Start/End: Original strand, 5282354 - 5282458
Alignment:
Q  267 ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttct 366  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| || |||||| || || |||||| ||||| ||| | |||| || ||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  5282354 ttcatcaaacttaacttcttaactaattataattaataaagaaattttagtaaattatatttattttatcattaaaattagcacaattaatca-ttttct 5282452  T
Q  367 taaaaa 372  Q
    ||||||    
T  5282453 taaaaa 5282458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34100762 - 34100561
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    |||||| |||||| || |||| | ||||  ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||    
T  34100762 attgtcactttaacattttttatttttcttaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatg-ttttttcactattatacccttattta 34100664  T
Q  262 ttgatt-tcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34100663 ttgaatgtcatccaacttaactacttcagtaactacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaatcaacacaattaatcat 34100564  T
Q  361 ttt 363  Q
    |||    
T  34100563 ttt 34100561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 34947438 - 34947614
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  34947438 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-tttttccattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactac 34947536  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34947537 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 34947614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 83296 - 83499
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaat 259  Q
    |||||||||| |||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||| |    
T  83296 taattgtctcattaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattatcatactcttatt 83395  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||  || ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  83396 tattgaatttcatcaaacttaactactccgctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatc 83495  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  83496 attt 83499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 759308 - 759106
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  759308 taattgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttccattattatacccttatt 759210  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||| ||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  759209 tattgaatttcatccaacttaactactccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatc 759110  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  759109 attt 759106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21350841 - 21350645
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||| ||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  21350841 attgtctttttaacattttttctttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattttttttccactattatacccttattta 21350742  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  21350741 ttgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatacaactatttttaccattgaaatcaacacaattaat 21350645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 21390206 - 21390409
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  21390206 taattgtctctttagcatcttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacgtttattattttttttccattattatacccttatt 21390305  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || || ||| ||||| ||||| ||| || ||| |  ||  |||| |||||||||||||    
T  21390306 tattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatcaaaattaacacaattaatc 21390405  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  21390406 attt 21390409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 327
Target Start/End: Original strand, 25571322 - 25571498
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  25571322 cgtctcaaaataattgtctctttactattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattat--ttttttaattatta 25571419  T
Q  251 ta-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    || ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| |||||    
T  25571420 tacccttatttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaactaataagggtattttagtaaatgatact 25571498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19271923 - 19271746
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgattt-catcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||     
T  19271923 tttctcaaaataattgttactttacaataccaatgcaacatttattatt--ttttccaatattatacccttatttattaattttcatccaacttaactac 19271826  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    | |||||||||||||||| ||   ||||||| | |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19271825 tccactaactacaattaataaaagtattttagtcaatgccactaatttgatcattgaaatcaacacaattaatcattttt 19271746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21760201 - 21759998
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacctt-aat 259  Q
    ||||||||||||||  |  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| | |||    
T  21760201 taattgtctctttaccagtttttctttttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattat-atttttcctttattataccctcaat 21760103  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  || | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  21760102 tattgaatttcatccaacttaactactccattaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatc 21760003  T
Q  359 atttt 363  Q
    |||||    
T  21760002 atttt 21759998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Original strand, 35333060 - 35333151
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  35333060 atttcatctaacttaactactccactaactacaattaataataatattttaataaataatattaattatataattgaaatcaacacaattaa 35333151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 362
Target Start/End: Original strand, 22738665 - 22738815
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||| || ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  | |||    
T  22738665 aataccaatggaacatttattatt--ttttccactattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggat 22738762  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22738763 attttagtaaatgatactaattttaccattgaaatctacacaattaatcattt 22738815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 28103668 - 28103848
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaact 282  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||  || |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  28103668 tttctcaaaataattgtcactttacaatacaattgcaacatttattattttttttttccactattatacgcttatttattgaatttcatccaacttaacc 28103767  T
Q  283 aattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||||| || | | ||||  |||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28103768 acttcactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgctgctaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 28103848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 38391664 - 38391863
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||     || ||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  38391664 taattgtctctttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttataatatcaat-----atttattatttttttttcattattatacttttatt 38391758  T
Q  261 -attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
     ||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  38391759 tattgaatttcatccaacttaattattccactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatc 38391858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41506251 - 41506080
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  41506251 caaaataattatcactttacaatatcaatgcaatatttattaat-ttttttcaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 41506153  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  41506152 taactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaattaacacaattaatcattt 41506080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8592656 - 8592455
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcat--tattatac-cttaa 258  Q
    ||||||||||||  || ||||| | |||| |||||||||| |||  ||| |||| ||||||| |||   ||||||||||||| |  |||||||| ||||     
T  8592656 attgtctctttagcatttttttctttttctcaaaataattttcattttacaatatcaatgcagcat---ttattattttttcctactattatactcttat 8592560  T
Q  259 ttattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||| | ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8592559 ttattaaatttcatctaactttactactccactaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaatcaacacaattaat 8592460  T
Q  358 cattt 362  Q
    |||||    
T  8592459 cattt 8592455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 9785900 - 9786102
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    |||||| |||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  9785900 taattgcctctttatcattttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagcatttattatta-tttttctttattatacccttatt 9785998  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||| ||||| | | |||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  9785999 tattgaattttatccaacttaactacttcactaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatc 9786098  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  9786099 attt 9786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28202500 - 28202323
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||     
T  28202500 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatacagcatttattatt-tttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactac 28202402  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| | | |||||| |  ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28202401 tccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttt 28202323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11373643 - 11373443
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| | || ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||| |||| |||    
T  11373643 attgtctctttaccattttttctttttctcaaaataattgttactttacaatatcaatgcagcatttattatt-ttttcccactattatactcttattta 11373545  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||    
T  11373544 ttgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaatcaacacaattaaacat 11373445  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  11373444 tt 11373443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46478465 - 46478308
Alignment:
Q  207 cttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaaca 304  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||| |    
T  46478465 cttacaataccgatgcaacatttattattttttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcaattaactacaattaata 46478366  T
Q  305 atgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | | ||||||| |||||  |||||| || | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  46478365 agggtattttagtaaatgctactaactttactattaaaattaacacaattaatcattt 46478308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 373
Target Start/End: Original strand, 37245620 - 37245813
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaac 276  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  37245620 attttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattatt-ttttctcactattatacccttatttattgaatttcatccaac 37245718  T
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||| | | |||| | ||||||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  37245719 ttaaccactccacttattacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattt-accattgaaatcaacagaattaatc-tttttcttataaat 37245813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 27920924 - 27921103
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc-attattatac-cttaattattgat-ttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||  | ||||| |||| |||| | |||||  |||||| ||||||||||    
T  27920924 tttctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcaacatttattatttttttccccattataatactcttattgattgaacttcatccaacttaacta 27921023  T
Q  284 attcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || |||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27921024 atgcactaactacaattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacataattaatcatttt 27921103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Original strand, 7463182 - 7463327
Alignment:
Q  218 aatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatatttta 315  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||| || ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  | | ||||| |    
T  7463182 aatgcatcatttattattattttt-cactattctatctttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaatgagggtatttaa 7463280  T
Q  316 ataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
     |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7463281 gtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattt 7463327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24516401 - 24516303
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24516401 atttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 24516303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 362
Target Start/End: Original strand, 2459414 - 2459583
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | |||    
T  2459414 caaaataattgacactttacaataccaatgcagcatttattatt-ttttttcactattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccac 2459512  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||| || | | || || |||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  2459513 taactacaattaataagggtgttgtagtaaat--gactaattttaccgttgaaatcaacacaattaatcattt 2459583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 13961976 - 13962073
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13961976 atttcatccaacttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaattaatcattt 13962073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 40076230 - 40076429
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaat 259  Q
    |||| |||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| | | ||||| |    
T  40076230 taatagtctctttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcagcatttattatt-tttttccattatcacacccttatt 40076328  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||| |||  | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||| |||||||||||||    
T  40076329 tattgaatttcatccaacttaactaat---ctaagtacaattaataatagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaatc 40076425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 302
Target Start/End: Original strand, 44424076 - 44424198
Alignment:
Q  180 ttttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaact 277  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||    
T  44424076 ttttttttttctcaaaataattatcactttaaaatatcaatgcagcatttattat--ttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaact 44424173  T
Q  278 taactaattcactaactacaattaa 302  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||    
T  44424174 taattactccactaactacatttaa 44424198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19060603 - 19060416
Alignment:
Q  172 ttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattga-tttc 269  Q
    ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  19060603 ttaatattttttctctatcctaaaataattgtcactttagaatataaatgtaatatttattattatttctttattattatatccttatttgttgaatttc 19060504  T
Q  270 atcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| |     | | |||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19060503 atccaagttgacaaattcactaactacaattaata-----agtataataaataatattaattttacaatttaaatcaacacaattaatcattt 19060416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7457606 - 7457434
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||  ||||||| || | | |    
T  7457606 caaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttattat--tttttccactattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgc 7457509  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||||||| |||| || | | ||||| |||||   |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7457508 taactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaatcaacataattaatcattttt 7457434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 373
Target Start/End: Original strand, 16904357 - 16904503
Alignment:
Q  229 tattattattttttc-attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataata 325  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |    |||||||  || | |||    
T  16904357 tattattattttttccactattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattatttcactaactataattaatacgagtattttagaaagtgata 16904456  T
Q  326 ctaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16904457 ataattttactattgaaatcaacacaattaatca-ttttcttaaaaat 16904503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31665959 - 31665874
Alignment:
Q  139 atatatctccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatata---ttttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatg 221  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31665959 atatatttcatttgtcttaaaataattgtctctttaatatatatttttttttgtctcaaaataattatcaccttaaaatatcaatg 31665874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Original strand, 33819125 - 33819328
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattt-tttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatt-ttttcattattata-ccttaat 259  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  33819125 attgtctctttaacatttttctttttttttcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattattattttcactattatacccttatt 33819224  T
Q  260 tattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    || || |||||||  ||||| |||| | ||| ||| |||||||| ||   |  |||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  33819225 taatgaatttcattcaacttcactactccacaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatc 33819324  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  33819325 attt 33819328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 362
Target Start/End: Original strand, 48608783 - 48608976
Alignment:
Q  165 tgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattatt 263  Q
    ||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||  || |||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  48608783 tgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagtatttattatt--ttttccattattatactcttatttatt 48608880  T
Q  264 ga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    || ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||| ||||    | |||||||| ||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48608881 gaatttcatccaacttaactacatcactaactacgattaataaggatgtttt----agtaatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 48608976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3178391 - 3178219
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc--attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  3178391 aaaataattgttactttagaatactaatgcaacatat-ttattatgttttcccattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 3178293  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3178292 ctaactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaatcaatcattt 3178219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Original strand, 12631345 - 12631419
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12631345 actaactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattattt 12631419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Original strand, 36790676 - 36790794
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaacta 283  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  || ||||||    
T  36790676 tttctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcagcatttattattattttttccattattatacccttatttattgaatttcatccgacataacta 36790775  T
Q  284 attcactaactacaattaa 302  Q
     |  |||||||||||||||    
T  36790776 ctcaactaactacaattaa 36790794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32346243 - 32346067
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||     
T  32346243 tttctcaaaataattatcattttagaatactaatgcagcatttattatc-tttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactac 32346145  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||| || |||||| ||   ||||||| || || ||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32346144 tccactaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaattattt 32346067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17828568 - 17828428
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |||| ||  |||||| |||  ||  ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| |    
T  17828568 taattgtctctttaacattttttctttttctcagcataattgtcattttcgaataccaatgttgcatttattatttttttttcattattatatcattatt 17828469  T
Q  260 tattgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaatt 300  Q
    |||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||    
T  17828468 tattgaattcatccaacttaattactccactaactacaatt 17828428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2850971 - 2850896
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2850971 cactaactataattaatgagggtattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacataattaatcattt 2850896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Original strand, 5524397 - 5524495
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||| ||   | ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5524397 atttcatccaacttaactactcaactaactataattaataaaagtgttttattaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 5524495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31930721 - 31930512
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttcttt--cacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac---ct 255  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||  | |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||| ||   ||    
T  31930721 taatagtctctttagcattttttttctttttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgaaacatttattatttttttccctttattaaacactct 31930622  T
Q  256 taattattga-tttcatcaaacttaactaa--ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaa 352  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || | |||||||| |||| | | || ||| |  ||| |||||||||||     
T  31930621 tatttattgaatttcatcaaacttaactatactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaacacag 31930522  T
Q  353 ttaatcattt 362  Q
    | ||||||||    
T  31930521 tcaatcattt 31930512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 43873861 - 43874037
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| |||| || ||| ||| |  |||||| ||||||||||     
T  43873861 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatt-ttttcccattataatacatttatttattaaacttcatccaacttaactac 43873959  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | ||||||||||| |||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43873960 tccactaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattt 43874037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6495124 - 6494979
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| | ||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||     
T  6495124 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtagcatttattttt--tttttcattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactac 6495027  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  6495026 tccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaataacactaattt 6494979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 42935596 - 42935776
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc--attattatac-cttaattattgat-ttcatcaaacttaact 282  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||    
T  42935596 tttctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacat---ttattattttttccaattataatactcttatttattgaacttcatccaacttaact 42935692  T
Q  283 aattc---actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
      | |   ||||||||||||||| || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  42935693 cctcctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttt 42935776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 44180268 - 44180320
Alignment:
Q  311 ttttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44180268 ttttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 44180320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 362
Target Start/End: Original strand, 30865954 - 30866081
Alignment:
Q  237 ttttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||||| || |||||| ||   ||||||| ||||| ||| |||||  |    
T  30865954 ttttctcattattatatctttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaattataattaataagagtattttagtaaatgatattaattata 30866053  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||    
T  30866054 ccattgaaattaacacaattaatcattt 30866081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 242
Target Start/End: Original strand, 37490329 - 37490368
Alignment:
Q  203 tcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37490329 tcactttaaaataccaatgcaacatttattattatttttt 37490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16560679 - 16560585
Alignment:
Q  268 tcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||| ||| |  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  16560679 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcattt 16560585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 362
Target Start/End: Original strand, 16604983 - 16605077
Alignment:
Q  268 tcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||| ||| |  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  16604983 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcattt 16605077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21760366 - 21760320
Alignment:
Q  182 ttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatc 228  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21760366 ttttttttctcaaaataattgtcacgttaaaataccaatgcaacatc 21760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 325
Target Start/End: Original strand, 17610919 - 17610979
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataata 325  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |   |||||||| |||||||||    
T  17610919 atttcatccaacttaactatttcaataactacaattaatacaaatattttagtaaataata 17610979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 357
Target Start/End: Original strand, 23670503 - 23670595
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||   | ||||| |||||  || |||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  23670503 atttcatcaaacttaactactccactaactaccattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttaccatggaaatcaacacaattaat 23670595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 29363209 - 29363414
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatac-cttaa 258  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  29363209 taattgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcacttcagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattatactcttat 29363308  T
Q  259 ttattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||| ||| |  ||  |||||||||||||||||    
T  29363309 ttattgaatttcatccaacttaactaatccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaat 29363408  T
Q  358 catttt 363  Q
    ||||||    
T  29363409 catttt 29363414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 357
Target Start/End: Original strand, 181464 - 181658
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||| || |||| | || | |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  181464 attgtctctttaacattttttcttttcctcaaaataattgtcactttacaatac-aatgcaacatttattattattttt-cactattatacccttattta 181561  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  181562 ttgaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaat 181658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31894366 - 31894216
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  31894366 aatatcaatgcaacat---ttattattttttcactattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataatgac 31894270  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
     ||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31894269 gttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 31894216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 359
Target Start/End: Original strand, 13087440 - 13087634
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttt-tctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaa 258  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      || ||||||||||||||||  ||||     
T  13087440 taattgtctctttatt-tatttttgtttttctcaaaataattatcattttaaaataccaatgaaacat------tttttttttcattattatattcttat 13087532  T
Q  259 ttattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13087533 ttattgaatttcatccaacttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaat 13087632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1063791 - 1063600
Alignment:
Q  181 tttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaactt 278  Q
    ||||||| || |||||||||| |||  |||||||||| ||| | ||| |||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||    
T  1063791 tttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaataccgatgtagcatttattatt--ttttccatcattatacccttacttattaaatttcatttaactt 1063694  T
Q  279 aactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    ||||| | |||||||||||||||   |   ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1063693 aactactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatca-ttttcttaaaaat 1063600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1956146 - 1955980
Alignment:
Q  203 tcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaatta 301  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  | ||| |||||||||||||||||    
T  1956146 tcactttataataacaatgcaacatttattatttttttctcattattataccttatttattgaattttatcgaacacagctacttcactaactacaatta 1956047  T
Q  302 acaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaa 369  Q
    | ||   ||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1956046 ataagagtatattagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaatacaattaatc-tttttcttaa 1955980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11656130 - 11655952
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||     
T  11656130 tttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactac 11656031  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| | |||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  11656030 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttt 11655952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32440856 - 32440652
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcacctta--aaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaa 258  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |    
T  32440856 taattgtctctttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttagaaaatatcaatgcagcatttattattattttc-cattattgtaccttta 32440758  T
Q  259 tt-attg-atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
    || |||  |||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  32440757 tttattacatttcatccaacttaactactctactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaa 32440658  T
Q  357 tcattt 362  Q
    ||||||    
T  32440657 tcattt 32440652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 352
Target Start/End: Original strand, 34299931 - 34300092
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattgatttc-atcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||| ||||||| | ||| || || |||| ||||| ||||||| | | ||| |||||||||| ||||||    
T  34299931 aaaataattgtcactttagaatatcaatacaacatttattattttctttccactaatatatccttatttattgaataccatccaacttaactacttcact 34300030  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaa 352  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  34300031 aaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaattttatcattcaaatcaaaacaa 34300092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 362
Target Start/End: Original strand, 1225035 - 1225154
Alignment:
Q  244 attattatacc-ttaattattgatttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaa 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | || ||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||    
T  1225035 attattatacccttatttattcaatttatccaacttaacttcttcactaactaaaattaataagaatattttagtaaataatattaattttactatttaa 1225134  T
Q  343 atcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1225135 atcaacacaattaatcattt 1225154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 7920172 - 7920345
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||  || |||| ||     
T  7920172 tttctcaaaataattatcactttagaatatcaatgcaacat---ttatttatttttcactattataccattatttattgaatttcattcaaattaaatac 7920268  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  |  |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7920269 ttcactaactacaattaataa-gatattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaacaaaattaatcattt 7920345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 362
Target Start/End: Original strand, 13909384 - 13909531
Alignment:
Q  217 caatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatatttt 314  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| || | ||||||    
T  13909384 caatacaacatttattatttttttctcattattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccactaactacaattaataagggtatttt 13909483  T
Q  315 aataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||   |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13909484 agtaaatgtcactaattttaccattgaaatcaacacatttaatcattt 13909531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Original strand, 23142593 - 23142775
Alignment:
Q  181 tttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaattattga-tttcatcaaactta 279  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||  || ||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||    
T  23142593 tttttttttctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttatcgtt-ttttcccattattataccttctttattgaatttcatctagctta 23142691  T
Q  280 actaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||| | ||||| |||||||||| || | | ||||| |||||   |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23142692 actactccactacctacaattaataagggtgttttagtaaatgccactatttttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 23142775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 6801861 - 6802039
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| | | |||||| ||||||||||     
T  6801861 tttctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattattttttttccattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactac 6801960  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||| || |   ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  6801961 tccactaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataattaatcatttt 6802039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Original strand, 15058055 - 15058225
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| | |  ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  15058055 aaaataattgtcactttataataccgatgcaacatttattattttttgtac--tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcact 15058152  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||| || | ||||||| |||||   |||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||    
T  15058153 aactacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaattaacttaattaatcatttt 15058225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 361
Target Start/End: Original strand, 15582256 - 15582389
Alignment:
Q  230 attattattttttcattattata-ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||   ||||||||||||| |||||    
T  15582256 attattattttttcactatcatatccttatttattgaatttcattaaacttaaccacttcactaactacaacaagtaaatgtattttaataaatgatact 15582355  T
Q  328 aatttaattattgaaatcaacacaattaatcatt 361  Q
     |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15582356 gattttaccattgaaatcaacacaattaatcatt 15582389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 332
Target Start/End: Original strand, 30716830 - 30716977
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||     
T  30716830 tttctcaaaataattgtcactttagaataccagtgcaacatttattattttttttccattataatactcttatttattgaattttatccaactttactac 30716929  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||| | ||||| ||||||||||    
T  30716930 tccactaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaattt 30716977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3291872 - 3291775
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| | |  ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3291872 attttatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccattaaaatcgatacaattaatcattt 3291775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 17828950 - 17829047
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| | | ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17828950 atttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttactgttgaaattaacactattaataattt 17829047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11143769 - 11143597
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| ||||| |||| |||| ||| | |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||     
T  11143769 tttctcaaaaaaattgtcactttagactaccaatgcagcatttattatt--tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactac 11143672  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaaca-caattaatc 358  Q
    ||||||||||| |||||| || | |  |||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  11143671 ttcactaactataattaataagggtgatttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaacatcaattaatc 11143597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Original strand, 5302282 - 5302459
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacct-taattattgat-ttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||  || |||||||  |||||| ||||||||||     
T  5302282 tttctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattatt-tttttccattataatacccgtatttattgaacttcatccaacttaactac 5302380  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | || ||||||||||||| || ||| ||||  ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  5302381 tccattaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaacacatttaatcatttt 5302459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3720345 - 3720248
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3720345 atttcattcaacttaactattccactaactacaattaataagagtgtttttgtaaatactacaaattttataattgaaatcaacacaattaatcattt 3720248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 21010076 - 21010285
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattatac-cttaa 258  Q
    ||||||||| ||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||||  |||     
T  21010076 taattgtctttttaccattttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcagcatttataatttttttttccattattatactgttat 21010175  T
Q  259 ttattg-atttcatcaaacttaactaattcac----taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaat 353  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | |||    ||||||||||| | || | | ||||| ||||| ||||||||||    ||  |||| ||||||||    
T  21010176 ttattgaatttcatccaacttaactactccactaattaactacaatttataagggtgttttagtaaatgatactaatttttccatcaaaattaacacaat 21010275  T
Q  354 taatcatttt 363  Q
    ||||||||||    
T  21010276 taatcatttt 21010285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27448231 - 27448163
Alignment:
Q  294 tacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27448231 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcattt 27448163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 365
Target Start/End: Original strand, 17835333 - 17835494
Alignment:
Q  203 tcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcat-tattataccttaattattgatt-tcatcaaacttaactaattcactaactacaatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||||| |  || ||||||||||    
T  17835333 tcacgttagaataccaatgcaacat---ttgttattttttcctatattataccattattaatgaatatcatccaacttaactactaaacaaactacaatt 17835429  T
Q  301 aacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttc 365  Q
    || ||   ||||||| ||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  17835430 aataaatgtattttagtaaatgagattaattttattattaaaatcaatacaattaattatttttc 17835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21425737 - 21425635
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt-cattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    |||||||||| | || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  21425737 caaaataattgttactttacaatatcaatgcaacatttattattattttttccaccattatatccttatttattgaatttcatccaacttaactacttca 21425638  T
Q  289 cta 291  Q
    |||    
T  21425637 cta 21425635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24983566 - 24983456
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| | |||||||| |  |||||||||||| ||    
T  24983566 ccttatttattgaatttcacccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccattgaaatcaactca 24983467  T
Q  352 attaatcattt 362  Q
    | |||||||||    
T  24983466 actaatcattt 24983456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31283604 - 31283538
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacat 227  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31283604 taattgtctctttaccattttttatttttctcaaaataattatcactttaaaataacaatgcaacat 31283538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Original strand, 1781793 - 1781947
Alignment:
Q  246 tattataccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaat 344  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||| ||    
T  1781793 tattataccttttttattgaatttcattcaacttaac-actccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgagat 1781891  T
Q  345 caacacaattaatcatttttcttaaaaat-ggacataaatcttaaacgagtgttatt 400  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||| ||||    
T  1781892 caacataattaatca-ttttcttaacaatcgtgcataaaccttaaacgagtgatatt 1781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21478278 - 21478222
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttc 243  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21478278 tttctcaaaataattgtcactttacaataccaatacaacatttattattattttttc 21478222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16406837 - 16406798
Alignment:
Q  318 aaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16406837 aaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaat 16406798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21804610 - 21804536
Alignment:
Q  287 cactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||    
T  21804610 cactaactacaattaataa-gatatttaagtaaatgatactaattttacaattgaaattaatacaattaatcattt 21804536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27367282 - 27367220
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27367282 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattat-ttttcattatta 27367220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27457629 - 27457567
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattatta 250  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27457629 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattat-ttttcattatta 27457567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34657769 - 34657629
Alignment:
Q  166 gtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattataccttaatt-at 262  Q
    |||||||||| || || | | |||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||  || ||||||  ||||||  || |||||||| || ||| ||    
T  34657769 gtctctttaacattttctctttttctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcagaatttattatattttttttccactattatacatttatttat 34657670  T
Q  263 tga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaa 302  Q
    ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34657669 tgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaa 34657629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37695835 - 37695674
Alignment:
Q  203 tcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaatt 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  37695835 tcactttagaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaatt 37695736  T
Q  301 aacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    || || | | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37695735 aataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 37695674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 401
Target Start/End: Original strand, 37497427 - 37497638
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  37497427 caaaataattgtcactttataataccaatacaacatttattattattttttcattattatacgtttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 37497526  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaatgga-cataaatcttaa 388  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  37497527 taactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaataaatcatttc-cttaataatcgtgcataaatcttaa 37497625  T
Q  389 acgagtgttattt 401  Q
    |||| | ||||||    
T  37497626 acgattattattt 37497638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10366833 - 10366649
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  10366833 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactac 10366735  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatga-------tattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||| |       | ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10366734 ttcactaactacaattaataattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 10366649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 356
Target Start/End: Original strand, 44301485 - 44301663
Alignment:
Q  180 ttttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaact 277  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  44301485 ttttctctttctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattaatatttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaact 44301584  T
Q  278 taactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
    |||||| | |||||| ||||||| | || | ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  44301585 taactactccactaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaa 44301663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43254072 - 43253871
Alignment:
Q  163 attgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaatta 261  Q
    ||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| ||| |||    
T  43254072 attgtctctttagcattttttctatttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattagtttttttccactattatacccttattta 43253973  T
Q  262 ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcat 360  Q
     ||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  43253972 atgaatttcatcccacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcat 43253873  T
Q  361 tt 362  Q
    ||    
T  43253872 tt 43253871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 37311886 - 37312057
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||    
T  37311886 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcagcatttattattatttttctattattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccact 37311985  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||| || | | ||||| |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37311986 aactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 37312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 362
Target Start/End: Original strand, 19822906 - 19823118
Alignment:
Q  151 cgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaa-aataccaatgcaacatctattattattttttcattatt 249  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| || | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |    
T  19822906 cgtcttacaataattgtctctttacaattttttctttttctcaaaataattgtcacttttagaataccaatgcagcatttattatt--tttttcattaat 19823003  T
Q  250 atacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaa 347  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| ||||| |||||||||  |  ||  |||||||    
T  19823004 atacccttatttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatcaaaatcaa 19823103  T
Q  348 cacaattaatcattt 362  Q
    |||||||||||||||    
T  19823104 cacaattaatcattt 19823118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30190870 - 30190668
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt 260  Q
    ||||||||||||||  |  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||| ||||| |||||||| |||  ||||||| |||| | |||    
T  30190870 taattgtctctttagcactttttctttttctcaaaataattgtcactttagaataaaaatgtaacatttattattaatttc-cattattttacccttatt 30190772  T
Q  261 a-ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    | |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  30190771 aattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatc 30190672  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  30190671 attt 30190668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 363
Target Start/End: Original strand, 36476494 - 36476692
Alignment:
Q  166 gtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattg 264  Q
    |||||||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  36476494 gtctctttaacattttttatttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattacttttttct-attattatacccttatttattg 36476592  T
Q  265 a-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  36476593 aatttcatcaaacttaactactctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgcaatcaacacaatcaattatttt 36476692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 51838168 - 51837967
Alignment:
Q  159 agtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-tta 257  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    |||||||||| |||| ||| |||   |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||    
T  51838168 agtaattgtctctttatcatattttttct----caaaataattgtcactttacaattataatgcaacatttattattttttttccactattataccctta 51838073  T
Q  258 attattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
     ||| ||| ||||||  ||| |||||| | ||||| |||||| ||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  51838072 tttaatgaatttcattcaacgtaactactccactagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaa 51837973  T
Q  357 tcattt 362  Q
    ||||||    
T  51837972 tcattt 51837967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39043932 - 39043772
Alignment:
Q  194 aaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcacta 291  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||    
T  39043932 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacat---ttattattttttcattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccacta 39043836  T
Q  292 actacaattaacaatgatattttaataaataatac---taatttaattattgaaatcaacacaa 352  Q
    ||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||   |||||| |  ||||||||||||||||    
T  39043835 actacaattaataaaggtattttagtaaatgatactattaattttaccattgaaatcaacacaa 39043772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8679196 - 8679062
Alignment:
Q  231 ttattattttttc-attattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||  ||||    
T  8679196 ttattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttagtaaatgctact 8679097  T
Q  328 aatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8679096 aattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 8679062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28691004 - 28690790
Alignment:
Q  145 ctccttcgtcttaaagtaattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttca 244  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||| | |||  ||| |||| ||||||||||| | ||    |||||| |    
T  28691004 ctccttcgtcttacaataatagtctctttagtatttttttt-tctcataaaataactgtcattttacaatatcaatgcaacatttttt----ttttttta 28690910  T
Q  245 ttattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaa 342  Q
    | ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |   |||||    
T  28690909 tcattatacatttatttattgaatttcatccaacttaactatctcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccgttgaa 28690810  T
Q  343 atcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28690809 atcaacacaattaatcattt 28690790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Original strand, 11632055 - 11632190
Alignment:
Q  231 ttattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatacta 328  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| || | | ||||| |||||| |||||    
T  11632055 ttattattttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaacttttccactaactacaattaataaaggtgttttagtaaatactacta 11632154  T
Q  329 atttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    |||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11632155 attttaccgttgaaatcaacacaattaatcattttt 11632190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24569205 - 24569107
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24569205 atttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 24569107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 36460600 - 36460423
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  ||| |||||||| || ||||||| | ||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||     
T  36460600 tttctcaaaataattgtcactttacgatatcaatgcaatatttattatt-tgtttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattac 36460502  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    | || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36460501 tccattaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaattttactattgaaattaacacaattaataatttt 36460423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Original strand, 49830162 - 49830243
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaa 369  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49830162 actaactacaattaataatggtattttagtaaatgatattaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttttttaa 49830243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 19611919 - 19612025
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||    
T  19611919 atttcatcaaacttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaacacaattaatca-cttt 19612016  T
Q  365 cttaaaaat 373  Q
    |||||||||    
T  19612017 cttaaaaat 19612025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Original strand, 34957435 - 34957610
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | ||| |||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||||     
T  34957435 tttctcaaaataattatcactttaaaataccaatgtaacatttattat--tttttccgttactatatccttatttattgaatttcatttaactgaactac 34957532  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||| |||| ||||| |  ||  || |||||||||||||||||||    
T  34957533 tccactaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcattt 34957610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37773176 - 37772972
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt--cattattatacc-tta 257  Q
    ||||||||||||||  |  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  37773176 taattgtctctttagcaatttttctttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttatt-ttatttttttccattattataccctta 37773078  T
Q  258 attattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaa 356  Q
     ||| ||| ||||||  |||||||||| | |||| |||| |||||| || | ||||||| ||||| ||| |||||| |  |||| |||||| ||||||||    
T  37773077 tttaatgaatttcattcaacttaactattccactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgtaatcaatacaattaa 37772978  T
Q  357 tcattt 362  Q
    ||||||    
T  37772977 tcattt 37772972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3901308 - 3901156
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||| ||| ||  ||    
T  3901308 aataccaatgtaacatttattatt-tttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtaccccactaactacaactaataagaat 3901210  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
     ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  3901209 gttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaatacaattaatcatttt 3901156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5323072 - 5322943
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||   ||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  5323072 tttttccattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactttactaattataattaataagtgtattttagtaaatgatattaatttta 5322973  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5322972 tcactgaaatcaacataattaatcattttt 5322943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 12904844 - 12904973
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaat-gatattttaataaataatactaattta 333  Q
    ||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||     
T  12904844 tttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaatttt 12904943  T
Q  334 attattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12904944 ataattgaaatcaacataattaattatttt 12904973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29024100 - 29023972
Alignment:
Q  237 ttttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| |    
T  29024100 tttttccattattataccattatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaatttta 29024002  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcattttt 364  Q
      ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29024001 ccatcaaaatcaacacaattaatcattttt 29023972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 362
Target Start/End: Original strand, 1778622 - 1778749
Alignment:
Q  236 attttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattta 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| || || ||| ||||| |||||   | ||||||     
T  1778622 attttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttatctactccactaactacaat-aataaggatgttttagtaaatgtcattaatttt 1778720  T
Q  334 attattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1778721 atcattgaaatcaacacaattaatcattt 1778749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 362
Target Start/End: Original strand, 30710987 - 30711180
Alignment:
Q  169 tctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattga-t 266  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||  ||| |||| |||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||| |    
T  30710987 tctttaatatttttttcctgtctcaacataattgtcattttagaatatcaatacaacatttattatt--tttttcactattataatcttatttattgaat 30711084  T
Q  267 ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||| ||||||| |  | || ||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  30711085 ttcatctaacttaattgctccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacataattaattattt 30711180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 363
Target Start/End: Original strand, 11905779 - 11905930
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| || | |    
T  11905779 aatatcaatgcaacatttattatt--ttttccattattatatctttatttattgaatttcatccaacttaacaactccattaactacaattaataagggt 11905876  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
      |||| ||||| |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11905877 gctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaattaatcatttt 11905930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12736714 - 12736580
Alignment:
Q  231 ttattatt-ttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||| || ||||||| | |||||| ||||||||| || | |||| || ||||| |||||    
T  12736714 ttattattgttttcactattatacccttatttattgaattttatccaaattaactactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatact 12736615  T
Q  328 aatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  12736614 aattttatcattagaatcaacacaattaatcattt 12736580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23004500 - 23004390
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| || | | ||||| || ||| ||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  23004500 ccttatttattgaatttcatacaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacaca 23004401  T
Q  352 attaatcattt 362  Q
    |||||||||||    
T  23004400 attaatcattt 23004390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24245186 - 24245109
Alignment:
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaatta 355  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24245186 ttaactactttactaagtacaattaataat-atgttttagtaaataatactaattttattattgaaatcaacataatta 24245109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 408
Target Start/End: Original strand, 14194541 - 14194708
Alignment:
Q  242 tcattattataccttaatta-ttga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattatt 339  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| || | ||||||| |||||| | ||   ||||||| |||||  ||||||||| || |||    
T  14194541 tcattattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaattttatcatt 14194639  T
Q  340 gaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat-ggacataaatcttaaacgagtgttatttttagata 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  14194640 gaaatcaacacaattgatcatttct-ttaaaaatcgtgcacaaaccttaaacgactgttattttaagata 14194708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 19609279 - 19609407
Alignment:
Q  237 ttttttcattattataccttaatt-attga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaa 334  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||  |||||||  ||||| ||| |||||| |    
T  19609279 ttttttcattattatacatttatttattgaattttatcaaacttatctactccactaacaacaagtaataagaatatttttgtaaatgatattaatttta 19609378  T
Q  335 ttattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19609379 cgattgaaatcaacacaaataatcatttt 19609407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Original strand, 34750507 - 34750603
Alignment:
Q  266 tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34750507 tttcatccaagttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaatcaatcattt 34750603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41038571 - 41038461
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattgat-ttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||| |||| |    
T  41038571 aaaataattgtcactttaaaatacaaatgcagcatttattatt-tttttccattataatatccttatttattgaacttcaaccaacttaactacttcatt 41038473  T
Q  291 aactacaattaa 302  Q
    ||||||||||||    
T  41038472 aactacaattaa 41038461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 50035299 - 50035224
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  50035299 actaactacaattaacaacggtgttttggtaaatgctactaattttattattgaaatcaacataattattcatttt 50035224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Original strand, 3313188 - 3313301
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatt-ttttcattattatac-cttaattattga-tttcatcaaacttaactaattca 288  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| || | ||    
T  3313188 caaaataattgtcactttacaatataaatgcagcatttattattattattttcattattataatcttatttattgaatttcatccaacttaaatactcca 3313287  T
Q  289 ctaactacaattaa 302  Q
     |||||||||||||    
T  3313288 ttaactacaattaa 3313301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 17652658 - 17652855
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttca-ttattatacc-ttaa 258  Q
    ||||||||||||||  || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||  ||||||  ||   |||| ||||||||| |||||||||| |||     
T  17652658 taattgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcagtat---ttataattttttcaattattatacccttat 17652754  T
Q  259 ttattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||    | |||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||||    
T  17652755 ttattaaatttcatccaacttaactacctcactaactacaattaataaggatgtttt----agtaatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaat 17652850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Original strand, 26467119 - 26467218
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcacta--actacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26467119 atttcatctaacttaactacttcattataactacaattaataaacatattttaataaatgatattaactt-atcattaaaatcaacacaatcaatcattt 26467217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 253
Target Start/End: Original strand, 43715214 - 43715302
Alignment:
Q  164 ttgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac 253  Q
    |||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  43715214 ttgtctctttaacattttttatttttctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacatttattatt-tttttccattattatac 43715302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 363
Target Start/End: Original strand, 45710773 - 45710958
Alignment:
Q  180 ttttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattgat-ttcatcaaact 277  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| || | |  || ||||||||| || | ||| ||| |||||||  |||||| ||||    
T  45710773 ttttttttttctcaaaataattgtcactttataataccaatacaatatttttattttttttttcataataacacccttatttattgaacttcatccaact 45710872  T
Q  278 taactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45710873 taactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataattaatcatttt 45710958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 54477564 - 54477467
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||  |||||||||| | || ||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  54477564 atttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaattaaccattt 54477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Original strand, 54726497 - 54726593
Alignment:
Q  267 ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    |||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| |  ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  54726497 ttcatctaacttaactactccattaactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacatttaatcatttt 54726593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 242
Target Start/End: Original strand, 30710585 - 30710635
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattatttttt 242  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30710585 caaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattatttttt 30710635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 363
Target Start/End: Original strand, 52290850 - 52291001
Alignment:
Q  212 aataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattgat-ttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgat 309  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||| ||| ||||| |||||||  || ||  |||||||||| | ||||||||| |||||| || | |    
T  52290850 aataccaatgcagcatttattatt--ttttacattataatatccttatttattgaactttattcaacttaactactccactaactataattaataaggct 52290947  T
Q  310 attttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  52290948 gttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcatttt 52291001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29595789 - 29595725
Alignment:
Q  308 atattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttttcttaaaaat 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  29595789 atattttaataaataatattaattttactattaaaatcaatataattaacca-ttttcttaaaaat 29595725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 38795354 - 38795451
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||| || |  ||||   ||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  38795354 atttcatccaacttaacaactccaccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaatcattt 38795451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48541105 - 48541008
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||    
T  48541105 atttcattcaacttaactactcaactaattacaattaataagaatattttaataaatgatattaattttattatagaaattgacataattagtcattt 48541008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Original strand, 33459080 - 33459120
Alignment:
Q  288 actaactacaattaacaatgatattttaataaataatacta 328  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  33459080 actaactacaattaataaagatattttaataaatgatacta 33459120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 50109 - 50311
Alignment:
Q  161 taattgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaat 259  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  50109 taattgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttt-cactattatacccttatt 50207  T
Q  260 tattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatc 358  Q
    |||| | ||||||  ||||||| || | ||||||||  |||||| || |||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  50208 tatttaatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatc 50307  T
Q  359 attt 362  Q
    ||||    
T  50308 attt 50311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Original strand, 22284 - 22425
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcat-caaacttaactaattca 288  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| || |||  ||||||| | ||    
T  22284 caaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattat--ttttttcactattatatccttatttattgaattttatccaattttaactactgca 22381  T
Q  289 ctaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaattt 332  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22382 ctaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattt 22425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 363
Target Start/End: Original strand, 5303 - 5498
Alignment:
Q  167 tctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-attga 265  Q
    |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| | || ||| ||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  5303 tctctttaatattttttctttttctcaaaataattgttactttagaatgccaatacaacatttattatt--ttttccattat-atacctttatttattga 5399  T
Q  266 -tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
     ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5400 atttcatccaacttaactactccactaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaattcaacacagttaatcatttt 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34207 - 34027
Alignment:
Q  182 ttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaactta 279  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  34207 ttttttttctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt--ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaactta 34110  T
Q  280 actaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | | ||||| |||||   |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34109 actatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcattt 34027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Original strand, 1963 - 2129
Alignment:
Q  193 aaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcact 290  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| | ||| |||||||  |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||    
T  1963 aaaataattatcactttaaaacatcaatgaagcatttattatt--tttaccattattatacccttatttattgaatttcatcgaatgtaattaatccact 2060  T
Q  291 aactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatca 359  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  2061 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaattaatca 2129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20561 - 20361
Alignment:
Q  164 ttgtctctttaatatattttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattataccttaatt-at 262  Q
    |||||||||||  || |||| | ||||  ||| ||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||||| | ||||| | |||||||||| | ||| ||    
T  20561 ttgtctctttaccattttttctttttctaaaattaattgtcaccttgcattatcaatggaacatttattaatttttttcctttattataccctcatttat 20462  T
Q  263 tga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatt 361  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||    
T  20461 tgaatttcatccaacttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaaatcaacacaattaatcatt 20362  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  20361 t 20361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 252995 - 252848
Alignment:
Q  179 attttttctttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatac-cttaattattg-atttcatcaaac 276  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||    
T  252995 attttttttttctcaaaaaaattgtcactttataataccaatgcaacatttattat--ttttttcattattatactcttatttattgaatttcattcaac 252898  T
Q  277 ttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatact 327  Q
    ||||||| | || | ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  252897 ttaactactccaat-actacaattaataacgatattttagtaaatgatact 252848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 362
Target Start/End: Original strand, 39127 - 39195
Alignment:
Q  294 tacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  39127 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcattt 39195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 7989
Alignment:
Q  187 tttcacaaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattata-ccttaattattg-atttcatcaaacttaactaa 284  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||||| ||     
T  8166 tttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattac 8067  T
Q  285 ttcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    | |||||||||||||||| || | | ||||  ||||||||| |||||| |  ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8066 tccactaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatccaaatcaacaaaattaatcattt 7989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 6748 - 6844
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||||| || || |||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  6748 atttcatcatacttaactattctagtaacta-aattaataaagacattttagtaaataatactaattttatcattgaaattaaaacaattaatcattt 6844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 136142 - 136045
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | | ||||| |||||  || |||||| |  |||||||||||||  |||||||||||    
T  136142 atttcatcaaacttaactacttcactaactataattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacattattaatcattt 136045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 105694 - 105791
Alignment:
Q  265 atttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcattt 362  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||| ||||   || |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  105694 atttcattcaacttaactacttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgctattaattttaccattgaaataaacacaattaatcattt 105791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16205
Alignment:
Q  253 ccttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacaca 351  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||| ||   | ||||| |||||  || |||||| || ||| |||||||||||    
T  16095 ccttatttattgaatttcatccatcttaactgcttcattaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgctattaattttatcattaaaatcaacaca 16194  T
Q  352 attaatcattt 362  Q
    |||||||||||    
T  16195 attaatcattt 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 17094 - 17143
Alignment:
Q  314 taataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaatcatttt 363  Q
    ||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17094 taataaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttt 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 697
Alignment:
Q  192 caaaataattatcaccttaaaataccaatgcaacatctattattattttttcattattatacc-ttaattattga-tttcatcaaacttaactaattcac 289  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||  |||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||  | | |||    
T  862 caaaataattgtcactttacaataccattgcaacattgaatatt--ttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaatttaaacactccac 765  T
Q  290 taactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttaattattgaaatcaacacaattaat 357  Q
    |||||||||| || || | | ||||| |||||  || |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  764 taactacaatcaataaaggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacacaattaat 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University