View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6914_low_4 (Length: 656)

Name: NF6914_low_4
Description: NF6914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6914_low_4
NF6914_low_4
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (1-656)||(16382058-16382713)
chr6 (3-656)||(23996191-23996844)
chr6 (3-656)||(18837593-18838246)
chr6 (3-656)||(16097993-16098646)
chr6 (4-656)||(25742773-25743424)
chr6 (3-656)||(18571594-18572247)
chr6 (3-656)||(15078051-15078702)
chr6 (1-407)||(1648718-1649124)
chr6 (14-457)||(21412822-21413265)
chr6 (3-521)||(25655426-25655943)
chr6 (3-329)||(16233152-16233478)
chr6 (282-556)||(14625023-14625297)
chr6 (433-656)||(1648499-1648722)
chr6 (377-656)||(21927522-21927801)
chr6 (3-394)||(17813671-17814060)
chr6 (444-656)||(23027401-23027613)
chr6 (511-656)||(16233479-16233624)
chr6 (18-556)||(24312953-24313491)
chr6 (15-331)||(23078424-23078740)
chr6 (17-556)||(5839004-5839543)
chr6 (15-538)||(14381270-14381793)
chr6 (15-556)||(18407727-18408269)
chr6 (18-591)||(1542834-1543407)
chr6 (31-556)||(25609646-25610171)
chr6 (15-538)||(10468652-10469175)
chr6 (15-538)||(21471556-21472079)
chr6 (15-535)||(19864642-19865162)
chr6 (15-556)||(34645371-34645912)
chr6 (118-556)||(22433927-22434365)
chr6 (253-350)||(1652266-1652363)
chr6 (15-340)||(12497981-12498306)
chr6 (15-340)||(12510595-12510920)
chr6 (15-556)||(16927425-16927966)
chr6 (15-556)||(16963152-16963693)
chr6 (15-556)||(27331218-27331759)
chr6 (15-556)||(27391958-27392499)
chr6 (74-546)||(27560412-27560884)
chr6 (116-555)||(27187492-27187931)
chr6 (116-555)||(27261309-27261748)
chr6 (18-544)||(29591717-29592243)
chr6 (69-538)||(25768200-25768669)
chr6 (74-546)||(28282608-28283080)
chr6 (116-556)||(28262982-28263422)
chr6 (116-556)||(28341731-28342171)
chr6 (15-322)||(15459291-15459598)
chr6 (18-556)||(16626502-16627040)
chr6 (91-556)||(2874588-2875053)
chr6 (31-556)||(25112523-25113048)
chr6 (14-342)||(22796631-22796959)
chr6 (14-538)||(24364366-24364890)
chr6 (15-340)||(12505310-12505635)
chr6 (15-556)||(19879253-19879794)
chr6 (18-253)||(26276888-26277124)
chr6 (69-556)||(11280290-11280777)
chr6 (14-303)||(22078726-22079015)
chr6 (238-546)||(5297001-5297308)
chr6 (15-538)||(17415441-17415964)
chr6 (116-555)||(28292158-28292597)
chr6 (69-342)||(18800951-18801224)
chr6 (15-342)||(8766147-8766474)
chr6 (15-342)||(18794645-18794972)
chr6 (220-538)||(19453580-19453898)
chr6 (91-313)||(25765318-25765540)
chr6 (33-342)||(1640745-1641054)
chr6 (18-337)||(22762459-22762778)
chr6 (17-159)||(14131361-14131503)
chr6 (252-546)||(27559783-27560077)
chr6 (74-282)||(18197606-18197814)
chr6 (15-342)||(21564131-21564458)
chr6 (412-538)||(8762736-8762862)
chr6 (462-516)||(17814092-17814146)
chr6 (69-157)||(11287782-11287870)
chr6 (266-546)||(17032589-17032869)
chr6 (444-538)||(22796435-22796529)
chr6 (15-151)||(25750764-25750900)
chr6 (3-49)||(14129403-14129449)
chr6 (375-556)||(22762240-22762421)
chr6 (459-535)||(18197534-18197610)
chr6 (459-591)||(21836947-21837079)
chr6 (411-538)||(21563935-21564062)
chr6 (411-538)||(21569794-21569921)
chr6 (15-138)||(25750901-25751024)
chr6 (426-555)||(18795056-18795185)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (1-656)||(8274178-8274833)
chr3 (1-656)||(15576456-15577111)
chr3 (3-656)||(16742482-16743135)
chr3 (3-656)||(18748373-18749026)
chr3 (6-656)||(6152630-6153268)
chr3 (1-656)||(17192800-17193454)
chr3 (3-656)||(6712188-6712832)
chr3 (1-341)||(13975140-13975479)
chr3 (335-656)||(13967119-13967440)
chr3 (3-607)||(267085-267690)
chr3 (3-415)||(21686653-21687064)
chr3 (15-567)||(16691870-16692426)
chr3 (15-322)||(15247857-15248164)
chr3 (15-567)||(14876367-14876919)
chr3 (15-337)||(15208601-15208923)
chr3 (15-556)||(12497958-12498499)
chr3 (15-556)||(17489560-17490101)
chr3 (16-546)||(16806815-16807345)
chr3 (15-555)||(16371123-16371663)
chr3 (15-546)||(8758960-8759491)
chr3 (18-555)||(20061934-20062471)
chr3 (18-556)||(16635486-16636024)
chr3 (18-556)||(43162810-43163348)
chr3 (15-556)||(9522429-9522970)
chr3 (15-556)||(14086393-14086934)
chr3 (18-555)||(15589272-15589809)
chr3 (74-546)||(41177301-41177773)
chr3 (45-337)||(15015842-15016134)
chr3 (18-556)||(10005313-10005851)
chr3 (18-556)||(10905923-10906461)
chr3 (74-546)||(13941803-13942275)
chr3 (15-556)||(13971988-13972529)
chr3 (15-556)||(16492060-16492601)
chr3 (116-556)||(5424809-5425249)
chr3 (18-556)||(15348124-15348662)
chr3 (15-520)||(16836414-16836919)
chr3 (18-591)||(48425160-48425733)
chr3 (66-342)||(11961116-11961392)
chr3 (31-555)||(53384898-53385422)
chr3 (116-555)||(16756465-16756904)
chr3 (15-342)||(18134428-18134755)
chr3 (18-556)||(13252403-13252941)
chr3 (15-322)||(10420147-10420454)
chr3 (231-546)||(28754254-28754569)
chr3 (91-556)||(26792278-26792743)
chr3 (15-538)||(11303659-11304182)
chr3 (15-538)||(15952854-15953377)
chr3 (69-538)||(12360428-12360897)
chr3 (133-546)||(16380806-16381221)
chr3 (15-538)||(13322538-13323061)
chr3 (14-539)||(10383688-10384213)
chr3 (74-546)||(44777026-44777498)
chr3 (14-546)||(47123663-47124195)
chr3 (33-340)||(15227387-15227694)
chr3 (220-546)||(4678363-4678689)
chr3 (154-394)||(14182953-14183193)
chr3 (15-538)||(16329547-16330068)
chr3 (18-556)||(16412161-16412699)
chr3 (231-556)||(15724813-15725138)
chr3 (204-520)||(17492539-17492855)
chr3 (116-339)||(6600558-6600781)
chr3 (285-556)||(14126473-14126744)
chr3 (18-556)||(15402389-15402927)
chr3 (220-344)||(13001834-13001958)
chr3 (361-555)||(15061812-15062006)
chr3 (253-538)||(14573887-14574172)
chr3 (225-342)||(26009075-26009192)
chr3 (264-340)||(11564776-11564852)
chr3 (604-656)||(30138115-30138167)
chr3 (604-656)||(30147666-30147718)
chr3 (405-538)||(16338398-16338531)
chr3 (411-538)||(16828088-16828215)
chr3 (405-555)||(6600836-6600986)
chr3 (18-556)||(15338982-15339520)
chr3 (15-339)||(12850364-12850688)
chr3 (14-160)||(14571567-14571713)
chr3 (426-538)||(18134232-18134344)
chr3 (444-520)||(14182845-14182921)
chr3 (93-173)||(15725195-15725275)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (3-656)||(7353-8006)
scaffold0124 (15-342)||(256-583)
scaffold0124 (15-538)||(11010-11533)
scaffold0124 (411-538)||(65-192)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (1-656)||(21850320-21850975)
chr8 (3-656)||(16877078-16877731)
chr8 (3-656)||(20652316-20652969)
chr8 (1-656)||(21196485-21197140)
chr8 (6-656)||(22982584-22983231)
chr8 (3-627)||(22315336-22315960)
chr8 (97-656)||(23156995-23157553)
chr8 (1-656)||(25282274-25282928)
chr8 (61-656)||(22283199-22283802)
chr8 (400-646)||(23900818-23901063)
chr8 (18-567)||(32600304-32600853)
chr8 (15-546)||(22377547-22378077)
chr8 (15-546)||(22383722-22384252)
chr8 (15-546)||(15533537-15534068)
chr8 (15-529)||(21166647-21167161)
chr8 (15-556)||(16408128-16408669)
chr8 (70-546)||(22051075-22051551)
chr8 (15-538)||(31416575-31417098)
chr8 (15-559)||(22133121-22133665)
chr8 (18-556)||(17674106-17674644)
chr8 (15-520)||(19978124-19978629)
chr8 (31-535)||(20396229-20396733)
chr8 (18-556)||(19112850-19113388)
chr8 (14-538)||(6679267-6679791)
chr8 (15-538)||(22061534-22062057)
chr8 (15-567)||(30313216-30313768)
chr8 (14-538)||(6603814-6604338)
chr8 (120-520)||(20017869-20018269)
chr8 (15-538)||(23655084-23655607)
chr8 (14-535)||(12304914-12305435)
chr8 (18-207)||(24818048-24818237)
chr8 (14-538)||(803774-804298)
chr8 (14-546)||(14565298-14565830)
chr8 (15-559)||(22164272-22164815)
chr8 (15-546)||(31570935-31571466)
chr8 (18-556)||(22120257-22120795)
chr8 (69-259)||(24094353-24094543)
chr8 (15-556)||(21921818-21922359)
chr8 (15-556)||(23650198-23650739)
chr8 (15-546)||(29303519-29304050)
chr8 (220-538)||(20975752-20976070)
chr8 (15-342)||(20010197-20010524)
chr8 (31-529)||(22046546-22047044)
chr8 (31-556)||(19863230-19863754)
chr8 (31-556)||(19867867-19868391)
chr8 (15-556)||(21251099-21251639)
chr8 (15-556)||(21788442-21788982)
chr8 (96-340)||(23949158-23949401)
chr8 (231-556)||(19851784-19852109)
chr8 (231-556)||(19857820-19858145)
chr8 (15-535)||(1266396-1266915)
chr8 (204-535)||(16271328-16271659)
chr8 (116-535)||(19484974-19485393)
chr8 (15-556)||(21393948-21394489)
chr8 (16-322)||(22987359-22987665)
chr8 (78-339)||(21840637-21840898)
chr8 (261-556)||(18856980-18857275)
chr8 (234-511)||(22040235-22040512)
chr8 (231-535)||(20388472-20388776)
chr8 (15-247)||(21681862-21682094)
chr8 (31-163)||(22032205-22032337)
chr8 (384-538)||(27355074-27355228)
chr8 (18-163)||(20388259-20388404)
chr8 (309-357)||(24094557-24094605)
chr8 (450-556)||(22129023-22129129)
chr8 (444-538)||(22371526-22371620)
chr8 (14-136)||(28982513-28982635)
chr8 (14-136)||(28987733-28987855)
chr8 (15-160)||(21324888-21325033)
chr8 (446-538)||(21841005-21841097)
chr8 (3-64)||(23151093-23151154)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (1-656)||(20831004-20831659)
chr1 (3-574)||(20914304-20914875)
chr1 (70-656)||(22135169-22135756)
chr1 (18-656)||(21201901-21202537)
chr1 (3-570)||(20184275-20184842)
chr1 (1-208)||(46518813-46519020)
chr1 (18-567)||(17044716-17045265)
chr1 (15-557)||(50619955-50620497)
chr1 (18-556)||(16350311-16350849)
chr1 (105-535)||(16078385-16078815)
chr1 (18-556)||(19106476-19107014)
chr1 (18-556)||(51333205-51333743)
chr1 (15-538)||(19854420-19854942)
chr1 (18-556)||(33390741-33391279)
chr1 (17-546)||(16369405-16369934)
chr1 (14-337)||(20294517-20294840)
chr1 (15-342)||(20856687-20857014)
chr1 (18-556)||(21837059-21837597)
chr1 (15-337)||(20136884-20137206)
chr1 (15-313)||(20249956-20250254)
chr1 (15-340)||(19760794-19761119)
chr1 (15-555)||(22432829-22433369)
chr1 (14-546)||(37677184-37677717)
chr1 (15-342)||(20939989-20940316)
chr1 (18-556)||(21830412-21830950)
chr1 (361-538)||(24099333-24099510)
chr1 (116-535)||(41354202-41354621)
chr1 (31-308)||(21747657-21747933)
chr1 (120-342)||(20835814-20836036)
chr1 (14-301)||(31550148-31550435)
chr1 (14-247)||(19664897-19665130)
chr1 (411-538)||(19662871-19662998)
chr1 (14-160)||(11382699-11382845)
chr1 (375-556)||(21749407-21749588)
chr1 (3-76)||(22142233-22142306)
chr1 (232-492)||(41308148-41308408)
chr1 (259-342)||(19663062-19663145)
chr1 (432-591)||(20856438-20856597)
chr1 (384-538)||(20294887-20295041)
chr1 (375-556)||(22361956-22362137)
chr1 (432-535)||(20835621-20835724)
chr1 (481-538)||(20939793-20939850)
chr1 (361-546)||(31539719-31539904)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-656)||(40366-41021)
scaffold0076 (15-556)||(33320-33861)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (1-656)||(27107323-27107978)
chr7 (1-656)||(7823966-7824621)
chr7 (6-654)||(15364011-15364659)
chr7 (6-654)||(14936418-14937066)
chr7 (3-654)||(4439996-4440647)
chr7 (3-656)||(21674082-21674735)
chr7 (9-592)||(12368189-12368772)
chr7 (3-656)||(45146624-45147273)
chr7 (3-656)||(17923748-17924372)
chr7 (3-656)||(13353219-13353871)
chr7 (3-535)||(12193624-12194156)
chr7 (18-655)||(17144810-17145445)
chr7 (31-475)||(20466878-20467321)
chr7 (355-656)||(23641868-23642169)
chr7 (276-656)||(15171513-15171893)
chr7 (16-546)||(16975-17505)
chr7 (3-211)||(13378766-13378974)
chr7 (93-591)||(12687659-12688157)
chr7 (66-538)||(13021489-13021961)
chr7 (89-288)||(5432516-5432712)
chr7 (72-546)||(14130011-14130485)
chr7 (72-546)||(14433829-14434303)
chr7 (14-546)||(8211765-8212297)
chr7 (15-546)||(18053590-18054121)
chr7 (18-591)||(11552716-11553289)
chr7 (31-556)||(18551407-18551932)
chr7 (18-275)||(23641600-23641857)
chr7 (116-555)||(10871176-10871615)
chr7 (15-546)||(23505507-23506038)
chr7 (18-556)||(8707688-8708226)
chr7 (14-546)||(49152381-49152913)
chr7 (116-544)||(9596238-9596666)
chr7 (14-538)||(11305908-11306432)
chr7 (18-590)||(14954703-14955275)
chr7 (18-556)||(8198711-8199249)
chr7 (73-555)||(11771891-11772373)
chr7 (15-521)||(23199405-23199911)
chr7 (31-556)||(44791000-44791525)
chr7 (15-538)||(16950116-16950639)
chr7 (15-538)||(1052-1575)
chr7 (15-342)||(19147292-19147619)
chr7 (15-342)||(20746691-20747018)
chr7 (15-536)||(15102250-15102769)
chr7 (15-556)||(14263871-14264412)
chr7 (15-535)||(15624632-15625152)
chr7 (15-538)||(6413592-6414115)
chr7 (19-538)||(12455787-12456306)
chr7 (54-337)||(35964718-35965001)
chr7 (18-556)||(14332480-14333018)
chr7 (18-556)||(15160706-15161244)
chr7 (18-567)||(11236851-11237400)
chr7 (14-538)||(26118250-26118774)
chr7 (33-340)||(12206643-12206950)
chr7 (18-556)||(13686147-13686685)
chr7 (93-546)||(15340590-15341043)
chr7 (72-340)||(15204016-15204284)
chr7 (15-538)||(16071939-16072462)
chr7 (93-535)||(18177900-18178342)
chr7 (15-556)||(11388055-11388595)
chr7 (15-538)||(14286021-14286544)
chr7 (91-538)||(21662117-21662564)
chr7 (15-538)||(13665629-13666141)
chr7 (204-538)||(13968313-13968647)
chr7 (18-211)||(14037890-14038083)
chr7 (18-211)||(14347920-14348113)
chr7 (15-337)||(15154525-15154842)
chr7 (117-555)||(40796-41234)
chr7 (220-342)||(12457065-12457187)
chr7 (220-556)||(14039981-14040317)
chr7 (220-556)||(14350011-14350347)
chr7 (18-340)||(23516634-23516956)
chr7 (609-656)||(13455422-13455469)
chr7 (448-555)||(23203263-23203370)
chr7 (448-555)||(23509390-23509497)
chr7 (405-538)||(19147682-19147815)
chr7 (405-538)||(20747081-20747214)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (1-656)||(21936910-21937565)
chr5 (1-656)||(24581202-24581856)
chr5 (3-656)||(27011077-27011730)
chr5 (3-655)||(23503436-23504087)
chr5 (3-349)||(11210723-11211069)
chr5 (61-656)||(25244072-25244669)
chr5 (61-656)||(25308224-25308821)
chr5 (28-549)||(16065521-16066040)
chr5 (215-654)||(19566413-19566852)
chr5 (15-520)||(23573765-23574270)
chr5 (15-556)||(25423212-25423753)
chr5 (69-556)||(21339108-21339595)
chr5 (15-547)||(20798783-20799315)
chr5 (15-567)||(23516564-23517116)
chr5 (16-535)||(20467939-20468458)
chr5 (18-556)||(16356528-16357066)
chr5 (18-556)||(19769986-19770524)
chr5 (15-313)||(21498101-21498399)
chr5 (18-556)||(27668312-27668850)
chr5 (18-567)||(40708806-40709355)
chr5 (15-337)||(21984346-21984668)
chr5 (15-529)||(23440248-23440762)
chr5 (18-556)||(34566520-34567058)
chr5 (15-546)||(18775800-18776324)
chr5 (15-342)||(22461957-22462284)
chr5 (15-538)||(24749394-24749917)
chr5 (18-556)||(41770868-41771406)
chr5 (17-546)||(23471254-23471783)
chr5 (15-468)||(26738615-26739068)
chr5 (18-655)||(27610380-27611017)
chr5 (15-538)||(22235760-22236283)
chr5 (15-546)||(22381204-22381735)
chr5 (116-655)||(27518531-27519070)
chr5 (74-342)||(17269369-17269637)
chr5 (31-556)||(37291318-37291843)
chr5 (14-546)||(14886823-14887355)
chr5 (18-556)||(27685222-27685760)
chr5 (14-535)||(22502683-22503204)
chr5 (15-331)||(24735658-24735974)
chr5 (93-589)||(29475862-29476358)
chr5 (15-322)||(20821458-20821765)
chr5 (14-337)||(25848079-25848402)
chr5 (18-556)||(14999561-15000099)
chr5 (18-556)||(22134694-22135232)
chr5 (106-538)||(23079929-23080361)
chr5 (14-546)||(24798229-24798761)
chr5 (123-342)||(21831779-21831998)
chr5 (15-538)||(21890599-21891122)
chr5 (18-556)||(22332709-22333247)
chr5 (14-547)||(37545327-37545861)
chr5 (14-538)||(20342286-20342810)
chr5 (15-591)||(28923555-28924131)
chr5 (15-322)||(28894998-28895305)
chr5 (120-322)||(20773870-20774072)
chr5 (232-342)||(21564009-21564119)
chr5 (40-136)||(8814243-8814339)
chr5 (116-556)||(22348547-22348987)
chr5 (411-538)||(24716366-24716493)
chr5 (411-538)||(24620135-24620262)
chr5 (15-160)||(23442511-23442656)
chr5 (258-342)||(1064-1148)
chr5 (15-151)||(24737012-24737148)
chr5 (422-591)||(22462364-22462533)
chr5 (116-337)||(21404944-21405167)
chr5 (411-591)||(28916200-28916380)
chr5 (486-546)||(17269166-17269226)
chr5 (411-591)||(28894729-28894909)
chr5 (444-538)||(21496592-21496686)
chr5 (438-535)||(21831604-21831701)
chr5 (17-97)||(20573546-20573626)
chr5 (411-591)||(20774160-20774340)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (3-656)||(23504-24157)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (3-656)||(46264-46917)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (3-656)||(15292698-15293350)
chr4 (3-656)||(14997395-14998048)
chr4 (3-656)||(9290914-9291567)
chr4 (3-656)||(13247724-13248377)
chr4 (18-656)||(12342403-12343041)
chr4 (3-377)||(55375177-55375551)
chr4 (1-541)||(16685331-16685870)
chr4 (3-233)||(16445175-16445405)
chr4 (3-315)||(12132291-12132602)
chr4 (18-594)||(9849081-9849656)
chr4 (16-544)||(18226838-18227366)
chr4 (31-546)||(14850756-14851271)
chr4 (93-591)||(14680736-14681234)
chr4 (15-591)||(16251790-16252366)
chr4 (17-340)||(14652401-14652724)
chr4 (18-556)||(12476694-12477232)
chr4 (18-556)||(19778173-19778711)
chr4 (69-556)||(1639805-1640292)
chr4 (33-340)||(15414882-15415189)
chr4 (15-546)||(16354835-16355366)
chr4 (18-556)||(27711430-27711968)
chr4 (18-556)||(29038784-29039322)
chr4 (18-556)||(12523770-12524308)
chr4 (18-556)||(18297299-18297837)
chr4 (78-331)||(14159646-14159899)
chr4 (18-591)||(8386506-8387079)
chr4 (18-556)||(23955841-23956379)
chr4 (14-538)||(44661524-44662048)
chr4 (14-538)||(3264452-3264976)
chr4 (116-556)||(8053003-8053443)
chr4 (74-342)||(15358944-15359212)
chr4 (225-556)||(15147264-15147595)
chr4 (18-556)||(14303358-14303896)
chr4 (231-535)||(8706225-8706529)
chr4 (14-538)||(20891072-20891596)
chr4 (17-538)||(1648935-1649456)
chr4 (18-556)||(40473134-40473672)
chr4 (66-342)||(27900528-27900804)
chr4 (74-342)||(51606035-51606303)
chr4 (14-538)||(29453195-29453719)
chr4 (15-342)||(16146003-16146330)
chr4 (17-342)||(15070506-15070831)
chr4 (120-538)||(15077831-15078249)
chr4 (16-178)||(15149764-15149926)
chr4 (14-342)||(15003218-15003546)
chr4 (14-333)||(11207094-11207413)
chr4 (15-538)||(15246015-15246538)
chr4 (15-313)||(7090523-7090821)
chr4 (238-574)||(18549682-18550018)
chr4 (18-274)||(33223012-33223268)
chr4 (412-538)||(33223411-33223537)
chr4 (93-340)||(14266495-14266742)
chr4 (375-546)||(14691353-14691524)
chr4 (426-535)||(15319653-15319762)
chr4 (93-178)||(16676461-16676546)
chr4 (411-538)||(15358748-15358875)
chr4 (69-181)||(16752738-16752850)
chr4 (384-538)||(11206889-11207043)
chr4 (407-556)||(7090915-7091064)
chr4 (426-511)||(14159972-14160057)
chr4 (405-538)||(15003022-15003155)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (3-656)||(24831267-24831920)
chr2 (3-656)||(22275989-22276641)
chr2 (3-656)||(24569748-24570401)
chr2 (7-656)||(22761649-22762298)
chr2 (3-656)||(25128357-25129010)
chr2 (70-656)||(23817123-23817719)
chr2 (3-392)||(12640263-12640652)
chr2 (264-462)||(23890753-23890951)
chr2 (370-654)||(21906251-21906535)
chr2 (14-556)||(24707662-24708204)
chr2 (15-556)||(23063799-23064340)
chr2 (18-555)||(10868575-10869112)
chr2 (18-556)||(24709758-24710296)
chr2 (15-547)||(24825471-24826003)
chr2 (18-556)||(9609861-9610399)
chr2 (18-556)||(16998725-16999263)
chr2 (15-529)||(21325473-21325987)
chr2 (18-591)||(16981877-16982450)
chr2 (18-591)||(17063442-17064015)
chr2 (18-591)||(17067100-17067673)
chr2 (15-556)||(27365259-27365800)
chr2 (14-546)||(11358064-11358596)
chr2 (15-591)||(24675211-24675787)
chr2 (116-556)||(44385749-44386189)
chr2 (15-546)||(23188730-23189260)
chr2 (69-556)||(27371045-27371532)
chr2 (74-546)||(12574134-12574606)
chr2 (31-556)||(22325036-22325561)
chr2 (15-538)||(23293680-23294203)
chr2 (15-591)||(22756610-22757184)
chr2 (69-538)||(23276552-23277021)
chr2 (18-556)||(24262095-24262633)
chr2 (18-556)||(27217741-27218279)
chr2 (18-340)||(16924985-16925307)
chr2 (207-538)||(19652250-19652578)
chr2 (74-546)||(27787522-27787994)
chr2 (14-546)||(1063472-1064004)
chr2 (6-109)||(23817720-23817823)
chr2 (95-538)||(45529313-45529756)
chr2 (14-546)||(31830379-31830911)
chr2 (18-340)||(24878391-24878713)
chr2 (72-538)||(30211115-30211581)
chr2 (3-247)||(21908782-21909024)
chr2 (33-339)||(23087190-23087496)
chr2 (14-538)||(20832706-20833230)
chr2 (74-211)||(14708868-14709005)
chr2 (231-556)||(41608565-41608890)
chr2 (404-592)||(21145185-21145373)
chr2 (93-340)||(21145426-21145673)
chr2 (3-102)||(28144673-28144772)
chr2 (426-546)||(20442703-20442823)
chr2 (384-538)||(21125355-21125509)
chr2 (253-339)||(21906549-21906635)
chr2 (426-591)||(16923022-16923187)
chr2 (411-538)||(24948707-24948834)
chr2 (384-538)||(20828350-20828504)
chr2 (14-160)||(23138758-23138904)
chr2 (14-160)||(23550548-23550694)
chr2 (411-556)||(24876929-24877074)
chr2 (116-177)||(27368391-27368452)
chr2 (412-556)||(16925479-16925623)
chr2 (15-135)||(24654067-24654187)
chr2 (15-111)||(27377096-27377192)
chr2 (268-342)||(24948564-24948638)
chr2 (426-518)||(24641875-24641967)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (3-656)||(3418-4071)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (3-656)||(3487-4140)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (3-656)||(106116-106769)
scaffold0028 (18-591)||(43279-43852)
scaffold0028 (15-342)||(50371-50698)
scaffold0028 (18-340)||(8610-8932)
scaffold0028 (404-556)||(15447-15599)
scaffold0028 (426-556)||(50157-50287)
scaffold0028 (231-340)||(15285-15394)
scaffold0028 (404-556)||(8985-9137)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (3-583)||(2-582)
scaffold0761 (363-591)||(4707-4935)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (3-656)||(32540-33191)
scaffold0012 (15-546)||(219070-219601)
scaffold0012 (15-337)||(229165-229487)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (3-656)||(27809-28462)
scaffold0077 (103-242)||(7117-7256)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (9-656)||(14280-14927)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (78-656)||(25991-26569)
scaffold0235 (31-538)||(21332-21839)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (3-656)||(14767-15419)
scaffold0132 (3-656)||(43648-44301)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (3-656)||(3269-3921)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (3-652)||(8437-9087)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (3-656)||(13018-13671)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (3-656)||(597-1250)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (1-498)||(98123-98620)
scaffold0037 (15-120)||(23545-23650)
scaffold0037 (15-535)||(116569-117089)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (5-656)||(23992-24643)
scaffold0008 (3-656)||(231668-232318)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (1-656)||(14238-14901)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (111-656)||(180142-180687)
scaffold0011 (3-353)||(121796-122146)
scaffold0011 (15-555)||(26177-26717)
scaffold0011 (15-538)||(195365-195886)
scaffold0011 (204-538)||(148881-149215)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (89-656)||(967-1534)
scaffold0117 (1-76)||(10432-10507)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (3-655)||(9097-9748)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (3-645)||(7278-7920)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (116-599)||(71442-71925)
scaffold0021 (305-652)||(32960-33307)
scaffold0021 (251-656)||(24332-24726)
scaffold0021 (2-256)||(13360-13614)
scaffold0021 (1-109)||(6418-6526)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-653)||(10764-11416)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (3-548)||(5-529)
scaffold0507 (15-337)||(9092-9414)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (165-656)||(2828-3305)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (252-649)||(8-405)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (294-656)||(5576-5938)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (249-656)||(18407-18810)
scaffold0207 (111-182)||(18327-18398)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (305-656)||(9404-9755)
scaffold0266 (15-160)||(14207-14352)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (78-399)||(25957-26278)
scaffold0244 (411-538)||(17877-18004)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (3-284)||(22804-23085)
scaffold0120 (15-556)||(6145-6686)
scaffold0120 (15-522)||(1201-1708)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (3-338)||(14633-14968)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (3-512)||(74010-74519)
scaffold0058 (15-538)||(19242-19765)
scaffold0058 (69-160)||(58445-58536)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (3-257)||(8205-8458)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (439-656)||(45043-45260)
scaffold0091 (15-566)||(7912-8463)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (3-244)||(78584-78825)
scaffold0001 (72-340)||(448238-448506)
scaffold0001 (17-538)||(90593-91114)
scaffold0001 (426-520)||(114713-114807)
scaffold0001 (258-342)||(114545-114629)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (432-656)||(1-225)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (86-583)||(424-915)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (61-367)||(21776-22072)
scaffold0017 (273-546)||(197131-197404)
scaffold0017 (3-49)||(14070-14116)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (3-169)||(940-1106)
scaffold1710 (207-342)||(203-338)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (369-643)||(3475-3749)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (3-165)||(10465-10627)
scaffold0447 (3-165)||(5851-6013)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (509-656)||(7881-8028)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (15-546)||(65527-66058)
scaffold0042 (116-556)||(39463-39902)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (15-546)||(14999-15530)
scaffold0040 (414-556)||(113130-113272)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (3-165)||(8460-8622)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (15-546)||(14482-15013)
scaffold0044 (18-556)||(745-1283)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (3-159)||(16211-16367)
scaffold0234 (33-556)||(24714-25237)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (15-322)||(127076-127383)
scaffold0022 (374-556)||(80137-80319)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (15-538)||(41994-42517)
scaffold0010 (15-538)||(47060-47583)
scaffold0010 (375-546)||(2403-2574)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (15-556)||(6136-6677)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (17-340)||(164568-164891)
scaffold0005 (69-546)||(260484-260961)
scaffold0005 (54-556)||(278473-278975)
scaffold0005 (31-173)||(308797-308939)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (15-535)||(21989-22509)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (15-546)||(48860-49391)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (15-538)||(117690-118213)
scaffold0004 (15-535)||(112143-112663)
scaffold0004 (15-538)||(322826-323349)
scaffold0004 (15-538)||(385941-386464)
scaffold0004 (220-535)||(203132-203447)
scaffold0004 (3-125)||(370214-370336)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (17-520)||(63710-64213)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (14-538)||(47245-47769)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-538)||(248735-249258)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (15-337)||(798-1120)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (15-520)||(220-725)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (45-538)||(5252-5744)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (15-556)||(6494-7035)
scaffold0403 (253-538)||(3151-3436)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (31-567)||(4037-4573)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (31-567)||(8734-9270)
scaffold0109 (15-567)||(33205-33757)
scaffold0109 (3-67)||(44578-44642)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (15-538)||(42905-43428)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (502-656)||(55443-55602)
scaffold0023 (93-546)||(4107-4560)
scaffold0023 (375-538)||(59236-59399)
scaffold0023 (404-546)||(130659-130801)
scaffold0023 (119-322)||(58980-59183)
scaffold0023 (426-556)||(29023-29152)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (15-340)||(180339-180664)
scaffold0020 (412-538)||(101213-101339)
scaffold0020 (450-591)||(180756-180897)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (116-556)||(637-1077)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (15-546)||(4154-4684)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (15-313)||(1261-1559)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (462-656)||(9610-9804)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-289)||(16375-16648)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (15-556)||(25508-26049)
scaffold0113 (14-160)||(16797-16943)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (15-591)||(431-1006)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (17-337)||(32614-32934)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (31-538)||(20121-20628)
scaffold0298 (15-538)||(13022-13545)
scaffold0298 (15-538)||(16792-17315)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (232-546)||(12826-13140)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (15-337)||(5343-5665)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (15-340)||(17109-17434)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (18-555)||(109455-109992)
scaffold0029 (15-342)||(112681-113008)
scaffold0029 (15-322)||(95879-96186)
scaffold0029 (411-555)||(113077-113221)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (15-546)||(10891-11422)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (15-342)||(9940-10267)
scaffold0483 (459-546)||(12060-12147)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (16-340)||(14938-15262)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (31-535)||(25383-25887)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (17-340)||(12836-13159)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (15-342)||(14108-14435)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (550-656)||(9951-10057)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (15-556)||(3997-4538)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (18-546)||(16069-16597)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (14-538)||(26382-26906)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-538)||(16374-16898)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (15-342)||(4810-5137)
scaffold0034 (31-538)||(13562-14069)
scaffold0034 (411-538)||(4614-4741)
scaffold0034 (426-556)||(67903-68033)
[»] scaffold0742 (2 HSPs)
scaffold0742 (15-342)||(5335-5662)
scaffold0742 (433-546)||(5753-5866)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-556)||(3264-3803)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (15-342)||(37324-37651)
scaffold0026 (16-190)||(38183-38357)
scaffold0026 (16-160)||(27376-27520)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (14-556)||(9464-10006)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (15-264)||(195-444)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (15-340)||(124-449)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (225-538)||(27557-27870)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (106-538)||(5113-5545)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (15-546)||(43627-44158)
scaffold0114 (15-546)||(44639-45170)
scaffold0114 (15-277)||(20244-20506)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (106-546)||(17655-18094)
scaffold0106 (31-313)||(14177-14459)
scaffold0106 (15-538)||(31532-32055)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (15-591)||(2873-3449)
scaffold0035 (31-334)||(13060-13363)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (15-538)||(27641-28164)
scaffold0139 (15-538)||(810-1333)
scaffold0139 (411-538)||(34290-34417)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (117-538)||(3016-3437)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (93-342)||(1091-1340)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (91-556)||(7137-7602)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (91-556)||(337-802)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (69-538)||(12446-12911)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (15-546)||(51833-52363)
scaffold0067 (15-546)||(60867-61397)
scaffold0067 (15-546)||(67255-67785)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (15-342)||(5771-6098)
[»] scaffold0192 (3 HSPs)
scaffold0192 (15-342)||(26264-26591)
scaffold0192 (225-538)||(26856-27169)
scaffold0192 (361-538)||(26610-26787)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (15-342)||(57674-58000)
scaffold0053 (231-342)||(48890-49001)
scaffold0053 (382-536)||(57480-57634)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (15-342)||(51720-52047)
scaffold0049 (438-538)||(51524-51624)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (33-535)||(1048-1550)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (566-656)||(163-253)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (220-538)||(40066-40383)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (31-556)||(8-532)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (18-546)||(7522-8050)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (15-538)||(9920-10438)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (231-556)||(34-359)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (15-322)||(6305-6613)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (14-342)||(18394-18722)
scaffold0326 (426-538)||(18198-18310)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (411-538)||(870-997)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (220-538)||(2121-2439)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (18-340)||(7502-7824)
scaffold0431 (404-556)||(7877-8029)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (33-339)||(10600-10905)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (69-538)||(704-1173)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (14-328)||(38758-39072)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (220-546)||(5988-6316)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (361-538)||(6898-7075)
scaffold0149 (361-538)||(11329-11506)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (14-322)||(49614-49922)
scaffold0081 (412-591)||(19121-19300)
scaffold0081 (471-591)||(34604-34724)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (15-342)||(4872-5199)
scaffold0404 (405-538)||(5262-5395)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (15-337)||(1127-1443)
scaffold0413 (414-556)||(1520-1662)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (14-264)||(1104-1354)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (15-538)||(6899-7422)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (15-331)||(18971-19287)
scaffold0090 (15-331)||(23133-23449)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (15-342)||(28625-28953)
scaffold0064 (15-342)||(40616-40944)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (95-340)||(639-884)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (234-337)||(8190-8293)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (234-289)||(261-316)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (383-546)||(25464-25627)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (234-556)||(6390-6712)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (252-342)||(136269-136359)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (405-538)||(4959-5092)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (231-340)||(46566-46675)
scaffold0007 (39-337)||(86366-86664)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (375-591)||(3422-3638)
scaffold0375 (116-178)||(3740-3802)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (14-277)||(4012-4275)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (16-151)||(30-165)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (14-201)||(15613-15800)
scaffold0333 (70-509)||(15832-16271)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (15-157)||(7078-7220)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (363-556)||(19645-19838)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-37)||(5189-5225)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (450-546)||(4428-4524)
scaffold0270 (450-546)||(11558-11654)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (426-538)||(1633-1745)
scaffold0249 (15-289)||(4912-5186)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (14-157)||(28088-28231)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (411-522)||(32996-33107)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (231-337)||(1603-1709)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (438-538)||(81493-81593)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (283-343)||(146177-146237)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (234-313)||(12-91)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (375-546)||(18858-19029)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (411-538)||(2536-2663)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (405-516)||(4942-5053)
scaffold0165 (15-101)||(1299-1385)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (93-163)||(391-461)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16382713 - 16382058
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16382713 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 16382614  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382613 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 16382514  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16382513 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 16382414  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382413 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 16382314  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382313 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 16382214  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16382213 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 16382114  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16382113 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 16382058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 23996191 - 23996844
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23996191 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaa 23996290  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996291 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 23996390  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23996391 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatacta 23996490  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996491 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 23996590  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23996591 tctgaatagtcctctccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaactt 23996690  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |    
T  23996691 agaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcaaccaacttcgctaccgac 23996790  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  23996791 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgatgacttcgtcaaccggtcaacaatc 23996844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18838246 - 18837593
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18838246 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 18838147  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18838146 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 18838047  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18838046 ttccggtgctaacatagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatacta 18837947  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18837946 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaac 18837847  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18837846 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaatt 18837747  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |    
T  18837746 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaacctcgctatagac 18837647  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18837646 atactagtcttaataggaacaaaatgcgttgacttcgtcaaccgatcaacaatc 18837593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 16097993 - 16098646
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16097993 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 16098092  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  16098093 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaac 16098192  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16098193 ttccggtcctaacaaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatacta 16098292  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16098293 gaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaac 16098392  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098393 tctgaatagtcctctttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 16098492  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16098493 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggtataccatgcaacctcactatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagac 16098592  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  16098593 atacccatcttaataggaacaaaatgtgtcgacttcgtcaaccgatcaacaatc 16098646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 25743424 - 25742773
Alignment:
Q  4 caacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  25743424 caacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaat 25743325  T
Q  104 atccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaact 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25743324 atcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaact 25743225  T
Q  204 tccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25743224 tccggtccta-caaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactag 25743126  T
Q  304 catgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 403  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25743125 aatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 25743026  T
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25743025 ctagatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgta 25742926  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtca 603  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  25742925 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatttgctcaatgtatatctcagccaacttcgctacagaca 25742826  T
Q  604 tacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||    
T  25742825 taccaattttgataggaacaaaatgtgccgacttcatcaaccgattaacaatc 25742773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 18571594 - 18572247
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18571594 ccaacaaaacgaggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 18571693  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18571694 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtttcttgcataac 18571793  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18571794 ttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcattccgatacta 18571893  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18571894 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 18571993  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    | || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18571994 tttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 18572093  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  18572094 agaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatgcaatctaaaaatctgctcaatgtagatcttagccaacttcgctacagac 18572193  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18572194 atgtcagtcttgataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 18572247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15078702 - 15078051
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15078702 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcga 15078603  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15078602 tatcctttctcttcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 15078503  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15078502 ttccggtcctaacaaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatacta 15078403  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15078402 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaa-acaagctctcaacaaatcttccaaac 15078304  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15078303 tctgaatagtcctcccggtctgcccatcggtatg-ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaagctt 15078205  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15078204 aggagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcaccacagac 15078105  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  15078104 ataccagtctaaataggaacaaaatgtgccgacttcgttaaccgatcaacaatc 15078051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1649124 - 1648718
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1649124 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 1649025  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649024 aatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 1648925  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648924 acttccggtcctaataaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 1648825  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1648824 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaacttgctccaaaactcaagctctcaacaaatcctccaa 1648725  T
Q  401 actctga 407  Q
    |||||||    
T  1648724 actctga 1648718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21413265 - 21412822
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21413265 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 21413166  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21413165 ctcttatcatgataactcttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtccta 21413066  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  21413065 acaatgcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaact 21412966  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  21412965 gttattgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaataacaccttgctccaaaacacaagctctgaacaaatcttccaaattctgaatagtc 21412866  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaa 457  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21412865 ctctctgtttgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaa 21412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 521
Target Start/End: Original strand, 25655426 - 25655943
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |   ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25655426 ccaacaaaacggggagttaacttccgacagttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 25655525  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||    
T  25655526 tgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctcttgcacaac 25655625  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| | ||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||    
T  25655626 ttctgatcctaacaaagcactttcactg-actcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatacta 25655724  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25655725 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactccatcaacagtaagcattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttagcaaatcctccaaac 25655824  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25655825 tctgaatagtcctctctgtctgcccattgttctagggatgatacacagaactcaaccttaacttagttcccagagcggcttgcaaactttcccaaaactt 25655924  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcc 521  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  25655925 agaagtaaaccttggatcc 25655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 329
Target Start/End: Original strand, 16233152 - 16233478
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16233152 ccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 16233251  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16233252 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 16233351  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233352 ttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 16233451  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaac 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16233452 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaac 16233478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 282 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14625297 - 14625023
Alignment:
Q  282 aacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaag 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625297 aacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaag 14625198  T
Q  382 ctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14625197 ctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagc 14625098  T
Q  482 ttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14625097 ttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggattccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 14625023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 433 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648499
Alignment:
Q  433 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacac 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  533 aatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgct 632  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatgcaatctaacaatccgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgacataccagtcttgataggaacaaaatgcgct 1648523  T
Q  633 gactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  1648522 gacttcgtcaaccgatcaacaatc 1648499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 377 - 656
Target Start/End: Original strand, 21927522 - 21927801
Alignment:
Q  377 acaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaa 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21927522 acaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatattcctctttgtctgcccattagtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaat 21927621  T
Q  477 gcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgt 576  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  21927622 gcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctgacaatctgctaaatgt 21927721  T
Q  577 agatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21927722 agatctcagaaaacttcgccacagacatactagtctttataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 21927801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 394
Target Start/End: Original strand, 17813671 - 17814060
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| |  || ||||| ||||| ||| ||||||| || || |  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17813671 ccaacaaaacgaggtgttaacttctgacatttcaaagtgcgtccaacaccggttacatgattcactcttaagatcacatgatcaccaacctgaaattcaa 17813770  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17813771 tatccttcctcctcttatcatggtaccttttctgcctactctgagacgc--tcatcttctcttgaatcaacttaacctttttcgtcgtctcttgcacaac 17813868  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  17813869 ctccggtcctaacaaagcactttatcctgactcataccaacacaacgtcgtcctgcaccttcgaccataaaaagcttcaaactgtgccatctcgatacta 17813968  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatc 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17813969 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaaccaaaggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatc 17814060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 444 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23027613 - 23027401
Alignment:
Q  444 taagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaag 543  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23027613 taagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaatactaggag 23027514  T
Q  544 gaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaa 643  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23027513 gaatactatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatttcagccaacctcgccacagacataccggtcttgataggaacaaaatgcgatgacttcgtcaa 23027414  T
Q  644 ccgatcaacaatc 656  Q
    ||| |||||||||    
T  23027413 ccggtcaacaatc 23027401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 511 - 656
Target Start/End: Original strand, 16233479 - 16233624
Alignment:
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgt 610  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16233479 acctcggatcccgatcccacacaatactagaaggaataccgtgcaacctcactatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctacagtcatacccgt 16233578  T
Q  611 cttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16233579 cttaataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 16233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24313491 - 24312953
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| |||||   ||    
T  24313491 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgct 24313392  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24313391 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24313292  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  24313291 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 24313192  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24313191 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24313092  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  24313091 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24312992  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  24312991 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24312953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 23078424 - 23078740
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  23078424 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctac 23078523  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  23078524 gcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 23078623  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  23078624 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 23078723  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactc 331  Q
    || ||||| || |||||    
T  23078724 ttattgtacgtgaactc 23078740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5839543 - 5839004
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||    || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  5839543 agtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgc 5839444  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |    
T  5839443 ttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaaga 5839344  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       | || ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||| ||    
T  5839343 ccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactatt 5839244  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
     || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | || ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||    
T  5839243 attatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctc 5839144  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||| | | |||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 5839004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14381793 - 14381270
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  14381793 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 14381694  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||| ||| ||    
T  14381693 gcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaa 14381594  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  14381593 cacgacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 14381494  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||       ||||||| |  |||||||||  |  |||||  |||||||||||||||||||    |  || ||||    
T  14381493 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcc 14381394  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  14381393 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 14381294  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||  |||||||||||    
T  14381293 cggatctctattcgacacaatact 14381270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18408269 - 18407727
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18408269 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctac 18408170  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || || || |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  18408169 gcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 18408070  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact- 313  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  18408069 taccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 18407970  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||  ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| |||    
T  18407969 gtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtc 18407870  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||| |||||||    
T  18407869 ctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaacc 18407770  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  18407769 ttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18407727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 1543407 - 1542834
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  1543407 gtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgct 1543308  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  1543307 tatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 1543208  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| ||  | || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  1543207 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 1543108  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  1543107 ttgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctct 1543008  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  1543007 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 1542908  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  1542907 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaact 1542834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25610171 - 25609646
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | || |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  25610171 acttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaact 25610072  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  25610071 cttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 25609972  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  25609971 gactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaact 25609872  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
      ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| ||||| || | ||| |||||    
T  25609871 ttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatc 25609772  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  25609771 tgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 25609672  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||  | ||||||| | |||||||    
T  25609671 acaatggtcgaaggaacaccatgcaa 25609646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 10469175 - 10468652
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| || |    
T  10469175 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 10469076  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  10469075 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10468976  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | |||    
T  10468975 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 10468876  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    || || ||||    
T  10468875 ttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcc 10468776  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  10468775 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacct 10468676  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  10468675 cggatccctatccgacacaatact 10468652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 21471556 - 21472079
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |    
T  21471556 ggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 21471655  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    || | ||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  21471656 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 21471755  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  21471756 cactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 21471855  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||| |  || ||||| ||   ||||||||| |    
T  21471856 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttc 21471955  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    ||||   ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  21471956 tctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 21472055  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  21472056 cggatctctatccgacacaatact 21472079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 19864642 - 19865162
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| || ||||||||| | || || ||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  19864642 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgc 19864741  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  ||  |||  || ||||||||    
T  19864742 acttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcctaa 19864841  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||     
T  19864842 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaatgataacta 19864941  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    || || || || |||||||||||||| | |  | | | ||||  |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||    
T  19864942 ttattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactag-cccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtc 19865040  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    || || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |    
T  19865041 ctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatc 19865140  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    | ||||| | |||||| |||||    
T  19865141 ttggatctctatctgatacaat 19865162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34645912 - 34645371
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  34645912 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 34645813  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||    |||| |||||||||||| ||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  34645812 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 34645713  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  34645712 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 34645613  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||       |||||     |||||||||| |  |||||  | || | ||||||||| |||   || || ||||    
T  34645612 ttgttataagtaaattctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcc 34645513  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  34645512 tctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacct 34645413  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||||| |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  34645412 tggatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 34645371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 556
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434365
Alignment:
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22434026  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  22434027 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgtta 22434126  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  |||||| | ||||||||||| || ||   || ||| |||||||    
T  22434127 ttgtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctct 22434226  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||   |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||   ||||||||| || ||    
T  22434227 ccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttgg 22434326  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  22434327 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22434365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 350
Target Start/End: Original strand, 1652266 - 1652363
Alignment:
Q  253 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1652266 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggcaaacattcg 1652363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 12497981 - 12498306
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  12497981 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12498080  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  12498081 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 12498180  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |     || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||     
T  12498181 gaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataacta 12498280  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12498281 ttattgtatgtgaactcgatcaacgg 12498306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12510920 - 12510595
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  12510920 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12510821  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  12510820 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 12510721  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |     || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||     
T  12510720 gaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataacta 12510621  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12510620 ttattgtatgtgaactcgatcaacgg 12510595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16927966 - 16927425
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |  |||||| || | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16927966 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 16927867  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| | || |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16927866 gcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16927767  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  16927766 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 16927667  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| || || ||||| || ||||| | |     ||||||| |  || ||||||| |  ||||||   |||||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  16927666 ttgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcc 16927567  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  16927566 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16927467  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| || | || ||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  16927466 cgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaa 16927425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16963693 - 16963152
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16963693 ggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 16963594  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16963593 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16963494  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| | ||     
T  16963493 gaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgatagcta 16963394  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||  | || ||||| || ||||| | |     ||||||| |  |||||||||| |  ||||||   || ||||||| ||| ||   |||||| ||||    
T  16963393 ttgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcc 16963294  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  16963293 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16963194  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| || | |||||| | ||| || ||||||| | |||||||    
T  16963193 cgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaa 16963152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27331759 - 27331218
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||  || || || |    
T  27331759 ggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctac 27331660  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||   || ||||||||    
T  27331659 gcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaa 27331560  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  27331559 aaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 27331460  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || |||||  | ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||| ||||| |    |||||| ||||    
T  27331459 ttattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcc 27331360  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  27331359 tctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 27331260  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||| |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  27331259 tggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaa 27331218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27392499 - 27391958
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||  || || || |    
T  27392499 ggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctac 27392400  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||   || ||||||||    
T  27392399 gcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaa 27392300  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  27392299 aaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 27392200  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || |||||  | ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||| ||||| |    |||||| ||||    
T  27392199 ttattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcc 27392100  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  27392099 tctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 27392000  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||| |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  27391999 tggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaa 27391958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27560884 - 27560412
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||   ||||||    
T  27560884 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatc 27560785  T
Q  174 ttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccataca 273  Q
    || || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |||| | |||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  27560784 ttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccataca 27560685  T
Q  274 aagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaa 373  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||| || || |     
T  27560684 aagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaag 27560585  T
Q  374 aacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 473  Q
     |||||  |||||||||| || |||||    || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  |||    
T  27560584 cacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaaccc 27560485  T
Q  474 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27560484 aaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 27560412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 555
Target Start/End: Original strand, 27187492 - 27187931
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  27187492 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 27187591  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  27187592 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctat 27187691  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  27187692 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 27187791  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  27187792 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 27187891  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  27187892 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27187931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27261748 - 27261309
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  27261748 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 27261649  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  27261648 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctat 27261549  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  27261548 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 27261449  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  27261448 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 27261349  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  27261348 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27261309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29592243 - 29591717
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  29592243 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 29592144  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  29592143 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 29592044  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  29592043 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 29591944  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  29591943 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 29591844  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  29591843 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 29591744  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaagg 544  Q
    ||| | |||||||||||| || |||||    
T  29591743 atctctatctgacacaatgctcgaagg 29591717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 538
Target Start/End: Original strand, 25768200 - 25768669
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |    
T  25768200 ctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 25768299  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||  || || |  |||||||| || |   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  25768300 tcaacttgaccttctccgtagtttgatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgacc 25768399  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    | ||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    ||||||||    
T  25768400 acacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgc 25768499  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||  |||| | ||||||||| ||   |||||| ||  |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25768500 tcaagcacacacactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttg 25768599  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
      ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25768600 aacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatact 25768669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28283080 - 28282608
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  28283080 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcat 28282982  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| | || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28282981 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 28282882  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |    
T  28282881 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaa 28282782  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| || |||||    || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||    
T  28282781 gcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacc 28282682  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28282681 caaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 28282608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28263422 - 28262982
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  28263422 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 28263323  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  28263322 accactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 28263223  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||    
T  28263222 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcct 28263123  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  28263122 ctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 28263023  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  28263022 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 28262982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28342171 - 28341731
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  28342171 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 28342072  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  28342071 accactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 28341972  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||    
T  28341971 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcct 28341872  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  28341871 ctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 28341772  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  28341771 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 28341731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 15459291 - 15459598
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15459291 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctac 15459390  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||   ||||||| | || || |||||||| || || || |  |||||||| ||    
T  15459391 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaa 15459490  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||| |||||    
T  15459491 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 15459590  T
Q  315 ttgttgta 322  Q
    || |||||    
T  15459591 ttattgta 15459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16627040 - 16626502
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16627040 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16626941  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16626940 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16626841  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  16626840 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 16626741  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  | ||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16626740 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16626641  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16626640 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16626541  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  16626540 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16626502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 2875053 - 2874588
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||| || || |||||    
T  2875053 cttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagt 2874954  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
    ||  || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  2874953 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 2874854  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 390  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  2874853 attccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 2874754  T
Q  391 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 490  Q
    ||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  2874753 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 2874654  T
Q  491 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  2874653 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 2874588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Original strand, 25112523 - 25113048
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||||||||||||  |    
T  25112523 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagt 25112622  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||| || || |||||||  || || |   | |||||||| |   | || || ||     
T  25112623 cttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacct 25112722  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  25112723 gactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 25112822  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  25112823 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 25112922  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  25112923 tgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 25113022  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||    
T  25113023 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 25113048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22796959 - 22796631
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||     
T  22796959 aggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 22796860  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || ||||| |||  ||| || ||||| |||||||| |||   |||||||||||||| || ||||| |  || || |  |||||||  |    
T  22796859 cgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcgca 22796760  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  22796759 acactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 22796660  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22796659 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 22796631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 24364366 - 24364890
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| |||    
T  24364366 aggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 24364465  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  24364466 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 24364565  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  24364566 acacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccataccaatactcgagtgatagct 24364665  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  24364666 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtc 24364765  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  24364766 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24364865  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||    
T  24364866 tcggatctctattcgacacaatact 24364890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 12505310 - 12505635
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  12505310 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12505409  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  12505410 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctcgggtcctaa 12505509  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |     || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||     
T  12505510 gaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataacta 12505609  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12505610 ttattgtatgtgaactcgatcaacgg 12505635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 19879253 - 19879794
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| || || || | || |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  19879253 ggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 19879352  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||    || | |||||||||||| ||||||| ||| || |  || || || ||    
T  19879353 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggccccaa 19879452  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  19879453 catcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 19879552  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || ||||    
T  19879553 ttgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcc 19879652  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  19879653 tctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacct 19879752  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| | |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  19879753 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 19879794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Original strand, 26276888 - 26277124
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||||| | ||| ||  | || || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  26276888 gtcaacttcttagacttcaaagcacaaccaacactggttacgaggttaactctaaaaaacacaagatctccaacttgaaactcaatattcttcctctgtt 26276987  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgcc-ttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| | ||    
T  26276988 tatcatgataactcttctgcctactcagtgatgcctttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttctgtaatctgctgaacagcttccggtccaatca 26277087  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgt 253  Q
     ||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||    
T  26277088 tagcactctcttttgactcataccaacacaacggtgt 26277124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11280777 - 11280290
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||    |    
T  11280777 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctctta 11280678  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||| || |  || ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||| |    
T  11280677 ttaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatc 11280578  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||        ||||||    ||||||||    
T  11280577 atacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgc 11280478  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |    
T  11280477 tcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcg 11280378  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||| || ||||||||||| | |||||| |||||||| || | |||| |||||||    
T  11280377 agcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaa 11280290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22079015 - 22078726
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| || || ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| |||||     
T  22079015 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttccta 22078916  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
      |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||  ||  ||||||    
T  22078915 agcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctctagtccta 22078816  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    | |   |  | || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  22078815 agaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactag 22078726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5297001
Alignment:
Q  238 accaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || || || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  338 cggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctga 437  Q
    |||||        ||||| ||  |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  5297208 cggtaggtgactatcccagctc-caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  438 ggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 537  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  538 tagaaggaa 546  Q
    | |||||||    
T  5297009 tcgaaggaa 5297001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 17415441 - 17415964
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  17415441 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 17415540  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||  |||| || |||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  17415541 gcttgccatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 17415640  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||  | ||||| | |||  |||||    
T  17415641 cacaacactttcttctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactg 17415740  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  || ||| ||||||||||||    || || ||||    
T  17415741 ttgttgtatgtgaactctatcgacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcc 17415840  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||  | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  17415841 tcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacct 17415940  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  17415941 cggatccctatccgacacaatact 17415964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 28292597 - 28292158
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  28292597 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 28292498  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  28292497 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 28292398  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || | |     |||| || |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||    
T  28292397 tattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcct 28292298  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    |||   ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  28292297 ctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 28292198  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  28292197 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 28292158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Original strand, 18800951 - 18801224
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| | ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||   ||    
T  18800951 ctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaa 18801050  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18801051 tcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacc 18801150  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||  ||||| || ||||| | |||  |||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  18801151 atacaaagcttcgaacgaggccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggta 18801224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8766474 - 8766147
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| || | | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  8766474 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 8766375  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  ||||||||      
T  8766374 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccc 8766276  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  8766275 acacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 8766176  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  8766175 gttattgtatgtgaactctatcaacggta 8766147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 18794645 - 18794972
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || |||||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||| ||  || ||||| |    
T  18794645 ggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctac 18794744  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |  || || || ||    
T  18794745 gattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaa 18794844  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| |||||  ||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  18794845 catcacactttctcctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaacta 18794944  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794945 ttgttgtaggtaaactctatcaacggta 18794972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 538
Target Start/End: Original strand, 19453580 - 19453898
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  || |||||||    
T  19453580 cactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgtt 19453679  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| |  ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||   |||||||||||    |  || ||||||||     
T  19453680 gtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctcc 19453779  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||    
T  19453780 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggat 19453879  T
Q  520 cccgatctgacacaatact 538  Q
    ||| ||| |||| ||||||    
T  19453880 ccctatccgacataatact 19453898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25765540 - 25765318
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||    
T  25765540 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagt 25765441  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
     |  || ||||  || |||||||| |   |  | || || |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25765440 ctgctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 25765341  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||    
T  25765340 attccaatactagaatgataact 25765318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Original strand, 1640745 - 1641054
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | || || | ||| |||||||||||  | | ||| ||||  ||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  1640745 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactct 1640844  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||  || |||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||||   |||| || || ||    
T  1640845 tctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 1640944  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    || ||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || |||||     
T  1640945 cttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactct 1641044  T
Q  333 atcaacggta 342  Q
    ||||| ||||    
T  1641045 atcaatggta 1641054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22762778 - 22762459
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || |||||  |||||||||||| |||  |||| | ||    
T  22762778 gtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgct 22762679  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    ||||||  || ||||  |||| |||||  ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  22762678 tatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagac 22762579  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  22762578 tactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 22762479  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  22762478 ttgtacgtgaactctatcaa 22762459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14131503 - 14131361
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| |  |||||||| | |    
T  14131503 agtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgc 14131404  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatct 159  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  14131403 ttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 14131361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27560077 - 27559783
Alignment:
Q  252 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||        |    
T  27560077 gtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactat 27559978  T
Q  352 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaga 451  Q
    |||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27559977 cccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccga 27559878  T
Q  452 actcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||  |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27559877 actcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 27559783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18197814 - 18197606
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||  || ||||  | |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  18197814 aaatacatgatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatc 18197715  T
Q  174 ttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccataca 273  Q
    || ||||| || ||||| | ||  ||||   | |||||||| |   || |||| || |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18197714 tttaccttctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccataca 18197615  T
Q  274 aagcctcaa 282  Q
    |||||||||    
T  18197614 aagcctcaa 18197606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21564458 - 21564131
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  21564458 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 21564359  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||    |||| |||||||||||   |||| |  || || |  || ||||| ||    
T  21564358 gtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtctgctgaactatgtctggtcccaa 21564259  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||  |||| || ||||| | |||  ||||     
T  21564258 catcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccataccaatactcgaatggtaacta 21564159  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  21564158 ttgatgtaggtgaactctatcaacggta 21564131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762736
Alignment:
Q  412 tcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  512 cctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatact 8762736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Original strand, 17814092 - 17814146
Alignment:
Q  462 aacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17814092 aacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaatcatagaagtaaacctcg 17814146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11287870 - 11287782
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcat 157  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11287870 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 546
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032869
Alignment:
Q  266 accatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 365  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 17032688  T
Q  366 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 465  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17032689 tgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaact 17032788  T
Q  466 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  17032789 tcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 17032869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22796529 - 22796435
Alignment:
Q  444 taagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22796529 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 22796435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 25750764 - 25750900
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  || || |||||| || | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |    
T  25750764 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25750863  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgc 151  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  25750864 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 14129403 - 14129449
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  14129403 ccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgaccaac 14129449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22762421 - 22762240
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| | ||  ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||   || |    
T  22762421 acacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataaccta 22762322  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||  || ||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  22762321 aagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22762240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 459 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197534
Alignment:
Q  459 ctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaat 18197534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 459 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836947
Alignment:
Q  459 ctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatc 558  Q
    ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||      
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  559 taacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    | ||||||| ||  || || |||||||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgatataaatctcagccaact 21836947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21564062 - 21563935
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  21564062 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 21563963  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  21563962 acctcgaatctctatcctacacaatact 21563935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21569921 - 21569794
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  21569921 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 21569822  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| ||| | |||  ||||||||||    
T  21569821 acctcgaatctctatcctacacaatact 21569794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 25750901 - 25751024
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||| ||||| || | ||||| ||||| || || || ||||||||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |    
T  25750901 ggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25751000  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtc 138  Q
     ||| ||||| || ||||||||||    
T  25751001 gcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 555
Target Start/End: Original strand, 18795056 - 18795185
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| || |||||||| |||||  ||||||  ||||| || |  ||||||||| ||||||||| || ||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  18795056 ccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctat 18795155  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    |||||||| |||| || |||| | ||||||    
T  18795156 ctgacacagtactcgacggaacaccatgca 18795185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8274833 - 8274178
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8274833 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 8274734  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274733 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 8274634  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274633 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 8274534  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274533 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 8274434  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8274433 actttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaac 8274334  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8274333 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctactg 8274234  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8274233 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgttgacttcgtcaaccgatcaacaatc 8274178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 15576456 - 15577111
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  15576456 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 15576555  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15576556 aatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcaca 15576655  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576656 acttccggtccaaacaaagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 15576755  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576756 tagcatgcaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 15576855  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576856 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 15576955  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15576956 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccataaaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 15577055  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15577056 acataccagttttgataggagcaaaatgcgcagacttcgtcaaccgatcaacaatc 15577111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16743135 - 16742482
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  16743135 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaa 16743036  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16743035 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 16742936  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16742935 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 16742836  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16742835 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaac 16742736  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16742735 tctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 16742636  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || | |    
T  16742635 agaagtaaacctgggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgttcaatgtagacctccgccaatttcgctactgac 16742536  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16742535 atactagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccggtcaacaatc 16742482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 18748373 - 18749026
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18748373 ccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 18748472  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18748473 tgttcttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaac 18748572  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18748573 ctccggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatacta 18748672  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18748673 gaatgaaaattgttgttgtaactaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaac 18748772  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18748773 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaactt 18748872  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||      
T  18748873 agaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaaccttgccacagat 18748972  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| || |||| ||||||||||    
T  18748973 atactagtcttgataggaacaaattgtgccgacttcgttaaccaatcaacaatc 18749026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6153268 - 6152630
Alignment:
Q  6 acaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatat 105  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6153268 acaaaacgaggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatat 6153169  T
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6153168 cctttctcctcttatcatgataactctt------------agacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttc 6153081  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
    ||  ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |    
T  6153080 cgaccctaacacaacactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaa 6152981  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6152980 tgaaaattgttgttgtatgtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgttccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactct 6152881  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6152880 gaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttata 6152781  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcata 605  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6152780 agtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatataacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagacata 6152681  T
Q  606 cccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  6152680 ctagtcttgataggaacaaaatgtgctgacttcatcaaccgatcaacaatc 6152630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 17192800 - 17193454
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||  |||||   ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17192800 gcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcagagaacatccaacattggttacaagattcactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 17192899  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17192900 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcaca 17192999  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||||| ||||| | |||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17193000 acttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 17193099  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17193100 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaat-tcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccatgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaa 17193198  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  17193199 actctaaatagtcctctctatttgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaac 17193298  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17193299 ttagaagtaaaccttggatcccgattcgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacac 17193398  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  17193399 acataccagtcttcataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccaatcaacaatc 17193454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6712832 - 6712188
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          || | ||||||||| |||||||| |||||| | | | | ||||||||||    
T  6712832 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgt---------gttataggattcactctcaaaaacacatgaacacaaccctgaaactcaa 6712742  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  6712741 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgtacaac 6712642  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712641 ctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 6712542  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6712541 gaaggaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaactataaacattcgacccaattgacaccttgctccaaaacacaagctctcgacaaatcttccaaac 6712442  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6712441 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcagtctggggatgatacgcagaactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcacactctcctaaaactt 6712342  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6712341 agaagtgaacctcagatcccgatccgacacaatactataaggaataccatgtaacctaaaaatttgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagac 6712242  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  6712241 atattgatcttgataggaagaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 6712188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13975479 - 13975140
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13975479 gcccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 13975380  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13975379 aatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccaca 13975280  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975279 acttccggccctaacaaaggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 13975180  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13975179 tagcatgaaaactgttgttgtaagt-aactcaatcaacggt 13975140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 335 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 13967440 - 13967119
Alignment:
Q  335 caacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtc 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  13967440 caacggtaagcattcgtcccaactgacaccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtc 13967341  T
Q  435 tgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaa 534  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13967340 tgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaa 13967241  T
Q  535 tactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctga 634  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13967240 tgctagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctacagacataccagtcttgatatgaacaaaatgcgctga 13967141  T
Q  635 ctttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  13967140 cttcgtcaaccgatcaacaatc 13967119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 267690 - 267085
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||  || || ||| |||||||||||||  || |  |||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  267690 ccaacaaaacacggtgttaacctcctacacttcaaatcatgttcaacaccgattactggattaaccctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaa 267591  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  267590 tatccttcctcctcttatcatgataaatctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaatcatcttaaccttttttgtagtctcttgcacaac 267491  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| | |||||| |||| | | || || |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  || || |||||     
T  267490 ttctgatcctaaaaaagtattttcccctgactcataccaacacaacggattcctacacctcctcccatataaagcttcaaacggtgttatcccaatactc 267391  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaac-tgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaa 401  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  267390 gaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaatcaacactaaacattcaaaccaacttaaaaccttgttccaaaacacaatctctcaacaaatcatcaaaa 267291  T
Q  402 ctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaact 501  Q
       ||||||||||||||  | || ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  267290 gattgaatagtcctctccatttgaccatcagcttgaggatgataagcagaactcaacttcagcttagttcccaaagctacttgcaaactctcccaaaaca 267191  T
Q  502 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagt 601  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| || | |||| || ||||||     
T  267190 ttgaagtaaacctcgaatctctatctaacacaatgctagatggaataccatgcaatctgacaacctactcaatgtagatatctggcaacctcaccacaga 267091  T
Q  602 catacc 607  Q
    ||||||    
T  267090 catacc 267085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 415
Target Start/End: Original strand, 21686653 - 21687064
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||  |||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21686653 ccaacaaaacaaggtgtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaa 21686752  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||| || |||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21686753 tatcttttctcctcttataatgataactcttcttcttactttgagactctttcatcttttcctgaaacatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaat 21686852  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||| || |||||| || |||| || ||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  21686853 ttctggtcctaacagagcactctcccctgacccataccaacacaatggtgtcatataccttcgtccataaaaagcctcaaac-gtgtcatactgatacta 21686951  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  21686952 gaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcagcgtaacttacaccctattccaaaacataagctctcaacagatcttccaaag 21687051  T
Q  403 tctgaatagtcct 415  Q
      |||||||||||    
T  21687052 attgaatagtcct 21687064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Original strand, 16691870 - 16692426
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||||||| | |    
T  16691870 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgc 16691969  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16691970 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 16692069  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  16692070 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16692169  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  16692170 ttgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 16692269  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagc----agcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  16692270 tctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 16692369  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    | ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||| || |||||||    
T  16692370 atcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatct 16692426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 15247857 - 15248164
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  ||||| |    
T  15247857 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgtttttcctac 15247956  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15247957 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 15248056  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  15248057 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 15248156  T
Q  315 ttgttgta 322  Q
    || |||||    
T  15248157 ttattgta 15248164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 14876919 - 14876367
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  ||||||||||||  || || || |    
T  14876919 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctac 14876820  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  14876819 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 14876720  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |  || || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  14876719 gaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 14876620  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  14876619 ttattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 14876520  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  14876519 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 14876420  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14876419 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatct 14876367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 15208601 - 15208923
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| |    
T  15208601 ggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctac 15208700  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15208701 gcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 15208800  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  15208801 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 15208900  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  15208901 ttattgtacgtgaactctatcaa 15208923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 12497958 - 12498499
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  12497958 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 12498057  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  12498058 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 12498157  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  12498158 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 12498257  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  12498258 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 12498357  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  12498358 tctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 12498457  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | || ||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  12498458 tggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12498499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 17489560 - 17490101
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  17489560 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 17489659  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  17489660 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 17489759  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  17489760 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 17489859  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||| ||| || ||   ||||||  |||    
T  17489860 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcc 17489959  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  17489960 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 17490059  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||||| | |||||||    
T  17490060 tggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 17490101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16807345 - 16806815
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| |||||| || |     
T  16807345 gagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcg 16807246  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  16807245 cttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 16807146  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |    
T  16807145 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactat 16807046  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  16807045 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 16806946  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||     
T  16806945 ctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatctt 16806846  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  16806845 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 16806815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 555
Target Start/End: Original strand, 16371123 - 16371663
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| || ||||||||| | || |||||||| || |  ||| |  ||||||| |||| ||| ||||| |    
T  16371123 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctac 16371222  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16371223 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16371322  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  16371323 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16371422  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||||||||| |  | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  16371423 ttattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16371522  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  16371523 tttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16371622  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  16371623 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 16371663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8759491 - 8758960
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| |||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  8759491 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 8759392  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |    
T  8759391 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccca 8759293  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  8759292 acacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataact 8759193  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || |||    
T  8759192 gttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtc 8759093  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  8759092 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 8758993  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  8758992 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 8758960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20062471 - 20061934
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  20062471 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 20062372  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  20062371 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 20062272  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  20062271 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 20062172  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  20062171 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 20062072  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  20062071 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 20061972  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  20061971 atctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgca 20061934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 16635486 - 16636024
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16635486 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16635585  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16635586 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16635685  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16635686 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16635785  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16635786 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16635885  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16635886 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16635985  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  16635986 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16636024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 43162810 - 43163348
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  43162810 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 43162909  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  43162910 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 43163009  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  43163010 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 43163109  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  43163110 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 43163209  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  43163210 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 43163309  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  43163310 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 43163348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 9522429 - 9522970
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  ||||||| |||| ||| || || |    
T  9522429 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctac 9522528  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  9522529 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 9522628  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | ||||| || |||||||||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| || |     
T  9522629 gaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataaata 9522728  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||  ||||    
T  9522729 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcc 9522828  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  9522829 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 9522928  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  9522929 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 9522970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 14086393 - 14086934
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  14086393 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 14086492  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatc--ttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || |||||     
T  14086493 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtccc 14086590  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||    
T  14086591 aacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 14086690  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || ||    
T  14086691 tattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgt 14086790  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
     ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  14086791 tctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaac 14086890  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  14086891 ctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 14086934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15589809 - 15589272
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  15589809 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 15589710  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15589709 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15589610  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  15589609 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 15589510  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15589509 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15589410  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15589409 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15589310  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  15589309 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 15589272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Original strand, 41177301 - 41177773
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  41177301 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcat 41177399  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| | || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41177400 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 41177499  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |    
T  41177500 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaa 41177599  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| ||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||    
T  41177600 gcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacc 41177699  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  41177700 caaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 41177773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15016134 - 15015842
Alignment:
Q  45 ccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactct 144  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15016134 ccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactct 15016035  T
Q  145 gagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaaca 244  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||  |   || |||| ||||| ||| |||||||    
T  15016034 gagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaaca 15015935  T
Q  245 taacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
     || || || || || |||||| ||||||| || || |||||||||||||| || |||| |||  ||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  15015934 caatggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaa 15015842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 10005313 - 10005851
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  10005313 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 10005412  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10005413 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10005512  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  10005513 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 10005612  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  10005613 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10005712  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  10005713 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10005812  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  10005813 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10005851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 10905923 - 10906461
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  ||||||| |||| ||| || || | ||    
T  10905923 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgct 10906022  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10906023 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10906122  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  10906123 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 10906222  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | ||| | || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  10906223 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10906322  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  10906323 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10906422  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  10906423 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10906461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Original strand, 13941803 - 13942275
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  13941803 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcat 13941901  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |||| | |||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  13941902 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 13942001  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |    
T  13942002 aaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaa 13942101  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| |||||||     || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||    
T  13942102 gcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacc 13942201  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  13942202 caaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 13942275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 13972529 - 13971988
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  13972529 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 13972430  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatc--ttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || |||||     
T  13972429 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtccc 13972332  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||    
T  13972331 aacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 13972232  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || ||    
T  13972231 tattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgt 13972132  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  13972131 cctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaac 13972032  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  13972031 ctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 13971988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16492601 - 16492060
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  |||| || || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16492601 ggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 16492502  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  16492501 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 16492402  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || ||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  16492401 gaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 16492302  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  16492301 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 16492202  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||||| ||  | |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||    
T  16492201 tctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatct 16492102  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  16492101 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16492060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5425249 - 5424809
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  5425249 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 5425150  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |  || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  5425149 accgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 5425050  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  5425049 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 5424950  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  5424949 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 5424850  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  5424849 ggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 5424809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15348662 - 15348124
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  15348662 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 15348563  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  15348562 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 15348463  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  15348462 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 15348363  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15348362 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15348263  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15348262 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15348163  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  15348162 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15348124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16836919 - 16836414
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  16836919 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 16836820  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| || || || || || || |  || ||||| ||    
T  16836819 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaa 16836720  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  16836719 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 16836620  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||        ||||||    ||||||| || |  ||||   |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  16836619 ttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcc 16836520  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  16836519 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacct 16836420  T
Q  515 cggatc 520  Q
    ||||||    
T  16836419 cggatc 16836414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 48425160 - 48425733
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | ||    
T  48425160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 48425259  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |     
T  48425260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcctaagac 48425359  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  48425360 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 48425459  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  48425460 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 48425559  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  48425560 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 48425659  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  48425660 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 48425733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11961392 - 11961116
Alignment:
Q  66 accctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 165  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | ||||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||     
T  11961392 accctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttccc 11961293  T
Q  166 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccg 265  Q
      ||||| || |||||||| || || || || || || |||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  11961292 ttatcattttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccg 11961193  T
Q  266 accatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11961192 accatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggta 11961116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 53385422 - 53384898
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  53385422 acttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 53385323  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  53385322 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 53385223  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  53385222 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 53385123  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  53385122 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 53385023  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  53385022 cgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 53384923  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||    
T  53384922 acaatgctcgaaggaacaccatgca 53384898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16756904 - 16756465
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  16756904 cttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 16756805  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || ||  | |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  16756804 accactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagctat 16756705  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  16756704 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 16756605  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  16756604 ctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 16756505  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  16756504 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 16756465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18134755 - 18134428
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||||| |||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  18134755 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 18134656  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||| || || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  18134655 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 18134556  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  18134555 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 18134456  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18134455 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 18134428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 13252403 - 13252941
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  13252403 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 13252502  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  13252503 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 13252602  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  13252603 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 13252702  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13252703 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 13252802  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  13252803 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 13252902  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  13252903 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 13252941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10420454 - 10420147
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||| ||||  || ||||| |    
T  10420454 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 10420355  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||   ||||||| | || || ||||| || || || || |  |||||||| ||    
T  10420354 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10420255  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||| |||||    
T  10420254 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 10420155  T
Q  315 ttgttgta 322  Q
    ||||||||    
T  10420154 ttgttgta 10420147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 546
Target Start/End: Original strand, 28754254 - 28754569
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||||    
T  28754254 gactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaact 28754353  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    ||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  28754354 caatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatc 28754453  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28754454 tgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatctgac 28754553  T
Q  531 acaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||||| ||||    
T  28754554 acaatactagacggaa 28754569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26792743 - 26792278
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||    
T  26792743 cttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 26792644  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
    ||  || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26792643 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 26792544  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 390  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||    
T  26792543 attccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaaca 26792444  T
Q  391 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 490  Q
    ||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  26792443 aatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaact 26792344  T
Q  491 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  26792343 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaa 26792278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11304182 - 11303659
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||    || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| | |    
T  11304182 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatac 11304083  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgca-caacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||  |  || | ||| ||| ||||| |    
T  11304082 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattc-ggtccca 11303984  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| | |||  ||||    
T  11303983 acacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccttaccaatactcgaatggtaact 11303884  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||        ||||||    || ||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||    || || |||    
T  11303883 gttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtc 11303784  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||  | |||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  11303783 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11303684  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11303683 tcggatccctatccgacacaatact 11303659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15953377 - 15952854
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  || || |||| |||| | |  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  15953377 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15953278  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  15953277 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15953178  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  15953177 cacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggcaactg 15953078  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||| ||||| ||    || || ||||    
T  15953077 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcc 15952978  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  15952977 tctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15952878  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  15952877 cggatctctatccgacacaatact 15952854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12360897 - 12360428
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||   |    
T  12360897 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttccctta 12360798  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||||||| || || || |||||    || || |  || ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12360797 tcatcttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgacc 12360698  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||        ||| ||    ||||||||    
T  12360697 atacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgc 12360598  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||  || |||| ||||||||||||   || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  12360597 tcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12360498  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
      ||||| ||| |||| || |||| ||| ||  |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12360497 aacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatact 12360428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16381221 - 16380806
Alignment:
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa--caaagcactctctcc 229  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| || || || |  ||||||||  |  || | ||||||||||    
T  16381221 tctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtccccaaccataacactctctcc 16381123  T
Q  230 ggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaac 329  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| | |||  ||||||||||||| || |||    
T  16381122 ggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaac 16381023  T
Q  330 tcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccat 429  Q
    || ||||| ||||     |  ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||| |||||||||    || ||  ||||||| | ||| ||||    
T  16381022 tctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccat 16380923  T
Q  430 cggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 529  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| |||| || ||| ||||||||| ||| ||    
T  16380922 ctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccga 16380823  T
Q  530 cacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| |||||||    
T  16380822 cacaatacttgaaggaa 16380806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13323061 - 13322538
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||  | |||||| ||| ||| ||||| |    
T  13323061 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctac 13322962  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  13322961 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 13322862  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || ||||||||  || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| | |||  || ||    
T  13322861 cacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaattg 13322762  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||| |  |||||||| ||    ||||| ||||    
T  13322761 ttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcc 13322662  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | |  |||||| || |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  13322661 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacct 13322562  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | |||||| |||||||||||||||    
T  13322561 cagatccctatctgacacaatact 13322538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Original strand, 10383688 - 10384213
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  10383688 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 10383787  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  10383788 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtccca 10383887  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  10383888 acacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 10383987  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  10383988 gttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 10384087  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | |||||||  | ||| ||| ||||||| ||||    
T  10384088 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacc 10384187  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatacta 539  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  10384188 tcggatctctatccgacacaatacta 10384213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Original strand, 44777026 - 44777498
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  44777026 aaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctg-atcat 44777124  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  || ||||| |||| | |||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||     
T  44777125 cttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatat 44777224  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    || || || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || |        ||||||    |||| || || |    
T  44777225 aatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaa 44777324  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| || |||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||    
T  44777325 gcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcc 44777424  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  44777425 caaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 44777498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 47123663 - 47124195
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||     
T  47123663 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 47123762  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||| | |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  47123763 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 47123862  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  47123863 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 47123962  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  47123963 gttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 47124062  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  47124063 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 47124162  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  47124163 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 47124195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Original strand, 15227387 - 15227694
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  15227387 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactct 15227486  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||    ||||  || |||||||  ||||| |  || || |  || ||||| ||||   |||  || |  ||    
T  15227487 tctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcga 15227586  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| | || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || |||||     
T  15227587 ctcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactct 15227686  T
Q  333 atcaacgg 340  Q
    ||||||||    
T  15227687 atcaacgg 15227694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 546
Target Start/End: Original strand, 4678363 - 4678689
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  4678363 cactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgtt 4678462  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || ||||||||     
T  4678463 gtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctcc 4678562  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  4678563 gactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggat 4678662  T
Q  520 cccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4678663 ccctatccgacacaatactcgaaggaa 4678689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14183193 - 14182953
Alignment:
Q  154 tcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgt 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |  || |||| ||||| ||| |||| | |||| || |  |||||| ||||||| || |||||    
T  14183193 tcatcttttcctgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgt 14183094  T
Q  254 cctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 353  Q
     ||||| ||||   |||||||||| || || || ||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  14183093 tctacatctcctctcatacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacaaacatcc 14182994  T
Q  354 caactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatc 394  Q
    ||| | || ||||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  14182993 caaatcactccttgcttcaaaatacacgccctcaacaaatc 14182953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16330068 - 16329547
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||      
T  16330068 ggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttt 16329969  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  16329968 gcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 16329869  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | |||    
T  16329868 cacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 16329769  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||        ||||||    |||||||||  |||  |||  | ||||||||||| |||||    ||||| ||||    
T  16329768 ttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgct--aaagtacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcc 16329671  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||| ||||||| ||| ||| ||||| | |||||    
T  16329670 tctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacct 16329571  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  16329570 cggatccctatccgacacaatact 16329547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16412699 - 16412161
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | ||||||||||  || ||||| | ||    
T  16412699 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgct 16412600  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || |  |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16412599 tatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16412500  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  16412499 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 16412400  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16412399 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16412300  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    ||| ||| ||||| || || || || ||  | |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16412299 ctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16412200  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  16412199 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16412161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15725138 - 15724813
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| || ||||| || ||||    
T  15725138 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaact 15725039  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  15725038 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatc 15724939  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  || ||||||| || ||||| | |||||||    
T  15724938 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgac 15724839  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| |  ||||||| | |||||||    
T  15724838 acaatgcctgaaggaacaccatgcaa 15724813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 520
Target Start/End: Original strand, 17492539 - 17492855
Alignment:
Q  204 tccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| | |    
T  17492539 tccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcg 17492638  T
Q  304 catgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 403  Q
     |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||       
T  17492639 aatgataactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatga 17492738  T
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
     || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||    
T  17492739 ttggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcta 17492838  T
Q  504 gaagtaaacctcggatc 520  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17492839 gaagtgaacctcggatc 17492855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Original strand, 6600558 - 6600781
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  6600558 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 6600657  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||||||||||||| ||| | || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  6600658 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctat 6600757  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacg 339  Q
    | || ||||| ||||| |||||||    
T  6600758 tattataagtgaactcgatcaacg 6600781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126473
Alignment:
Q  285 ggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctc 384  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  385 tcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttg 484  Q
    ||||||||||||| |    ||||||  ||||| | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  485 caaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14126473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15402927 - 15402389
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  15402927 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgct 15402828  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15402827 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15402728  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  15402727 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 15402628  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15402627 ttatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15402528  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||| | ||||  ||||| || || ||||||||||||| ||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15402527 ccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15402428  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  15402427 atctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaa 15402389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 344
Target Start/End: Original strand, 13001834 - 13001958
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||    
T  13001834 cactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgtt 13001933  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaa 344  Q
    ||| || ||||| || |||||||||    
T  13001934 gtacgtgaactctattaacggtaaa 13001958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 555
Target Start/End: Original strand, 15061812 - 15062006
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || || |||||||||||    
T  15061812 caccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatct 15061911  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  15061912 caacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 15062006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 538
Target Start/End: Original strand, 14573887 - 14574172
Alignment:
Q  253 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtc 352  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |      ||    
T  14573887 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatc 14573986  T
Q  353 ccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaa 452  Q
    ||||    |||||||||| |  | |||  |  ||| ||||||||| ||   |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14573987 ccaagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 14574086  T
Q  453 ctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||    
T  14574087 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatact 14574172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26009192 - 26009075
Alignment:
Q  225 tctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaag 324  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||| ||||||||||    
T  26009192 tctcctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaag 26009093  T
Q  325 taaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||  |||||||||    
T  26009092 taaactctctcaacggta 26009075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564776
Alignment:
Q  264 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacgg 11564776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 604 - 656
Target Start/End: Original strand, 30138115 - 30138167
Alignment:
Q  604 tacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30138115 taccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 30138167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 604 - 656
Target Start/End: Original strand, 30147666 - 30147718
Alignment:
Q  604 tacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30147666 taccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 30147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16338531 - 16338398
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| |||    
T  16338531 tgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctag 16338432  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || | ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16338431 aactgaacctcggatccctatccgacacaatact 16338398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828088
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatact 16828088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 555
Target Start/End: Original strand, 6600836 - 6600986
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||    
T  6600836 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctag 6600935  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  6600936 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 6600986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 15338982 - 15339520
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | | |||||||| ||| || || | ||    
T  15338982 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgct 15339081  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15339082 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcctaagac 15339181  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  15339182 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 15339281  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15339282 ttatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15339381  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
      | ||| ||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| ||  |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15339382 tcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15339481  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  15339482 atctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaa 15339520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12850688 - 12850364
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |  || ||||||||| | || |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||   ||||  | |    
T  12850688 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattc 12850589  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||    ||||  || || ||||  |||||||  || || |  || ||||| ||    
T  12850588 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaa 12850489  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| | |||  || ||    
T  12850488 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattg 12850389  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacg 339  Q
    |||||||| || ||||| |||||||    
T  12850388 ttgttgtacgtgaactctatcaacg 12850364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 14571567 - 14571713
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||     
T  14571567 aggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 14571666  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    | ||| ||| | || |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  14571667 cgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatctt 14571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18134344 - 18134232
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |  |||||||   | |||||||||| ||| ||  || |||| ||||||||||||| ||    
T  18134344 ccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctat 18134245  T
Q  526 ctgacacaatact 538  Q
    | |||||||||||    
T  18134244 ccgacacaatact 18134232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14182921 - 14182845
Alignment:
Q  444 taagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatc 520  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||| ||| || || ||||| |||||    
T  14182921 taagtagaactcaacctcaacttacttcctaaagcttcttgcaaactctccaaaatcttcgatgtgaaccttggatc 14182845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15725275 - 15725195
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 15725195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 582; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8006 - 7353
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8006 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 7907  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7906 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaac 7807  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7806 ttctggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 7707  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 7607  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 7507  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  7506 agaagtaaacctcggatctcgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgac 7407  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7406 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 256
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  583 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 484  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
      || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| |    
T  483 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtccca 385  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  ||||    
T  384 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaact 285  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  284 gttgttgtatgtgaactctatcaacggta 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 11010 - 11533
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  11010 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 11109  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
      || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| |    
T  11110 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtccca 11208  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||   ||||    
T  11209 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 11308  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || |||    
T  11309 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtc 11408  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    | ||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |   |||| ||| |||| || |||| |||||| |||||| | ||||    
T  11409 cgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacc 11508  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11509 tcggatccctatccgacacaatact 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 65
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||| || |    
T  192 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 93  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  92 acctcggatccctatccgacacaatact 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 580; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21850975 - 21850320
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21850975 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 21850876  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850875 aatatccttcatcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 21850776  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21850775 acttccggccctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatac 21850676  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850675 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 21850576  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850575 actctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 21850476  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21850475 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctccgccaaattcgctacag 21850376  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21850375 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 21850320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16877731 - 16877078
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16877731 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaa 16877632  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877631 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 16877532  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877531 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 16877432  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877431 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 16877332  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16877331 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaactt 16877232  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16877231 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctactgac 16877132  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16877131 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 16877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 20652969 - 20652316
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20652969 ccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcta 20652870  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20652869 tatcctttctcctcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccac 20652770  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20652769 ctccggtcctaacaaggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 20652670  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20652669 gaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 20652570  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20652569 tctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgagaatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaatcagcttgcaaactctcccaaaactt 20652470  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20652469 agaagttaacctcggatcctgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctacagac 20652370  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20652369 ataccagtcttaataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 20652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21197140 - 21196485
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21197140 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactc 21197041  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  21197040 aatatcctttctcctcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcaca 21196941  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21196940 acttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatac 21196841  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21196840 tagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaa 21196741  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21196740 actctaaatagtcctctatgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaac 21196641  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21196640 gtagaagtaaacctcggattccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagctagcttcgccacag 21196541  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21196540 acatatcagtcttgataggaacaaaatgtaccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 21196485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 656
Target Start/End: Original strand, 22982584 - 22983231
Alignment:
Q  6 acaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatat 105  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||| || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22982584 acaaaacgaggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatat 22982683  T
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    | || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22982684 cttttcaccttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttc 22982783  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
    |||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  22982784 cggttctaacaaagcactcactt--gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaa 22982881  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22982882 tgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 22982981  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22982982 gaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttaga 22983080  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcata 605  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22983081 agtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcgatgtagatctcagtcaacttcgccacagacata 22983180  T
Q  606 cccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  22983181 ccagtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaatc 22983231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 627
Target Start/End: Original strand, 22315336 - 22315960
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22315336 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 22315435  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22315436 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaac 22315535  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||| | ||| ||| || || |||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22315536 ttccggtcctacccaagaactttcacctgactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 22315635  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22315636 gaatgaaaactgttgttataagtaaactcaatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaac 22315735  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22315736 tctaaatagtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacct 22315835  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  22315836 aaaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaactttgccacaaac 22315935  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaat 627  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  22315936 atatcggtcttgataggaacaaaat 22315960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23157553 - 23156995
Alignment:
Q  97 actcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23157553 actcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttg 23157454  T
Q  197 cacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccg 296  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  23157453 cacaacttttggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccg 23157354  T
Q  297 atactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcct 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23157353 atactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcc-aaacacaagttctcaacaaatcct 23157255  T
Q  397 ccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctccca 496  Q
    | |||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23157254 ctaaactctgaataatcttctccgtcggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttccca 23157155  T
Q  497 aaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgcc 596  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23157154 aaacttagaagtaaacctcgaatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctcacaatctactccatgtagatctcaggcaacttcgcc 23157055  T
Q  597 acagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23157054 acagacataccggtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatccacaatc 23156995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 25282274 - 25282928
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||  |||| |||| | ||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25282274 gcccaacaaaacacgctgtcaacttctaacacatcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 25282373  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
     || |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||    
T  25282374 gatgtccttcctcctcttattatgataactcttctgcctactccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttctctgtcgtcttttgcaca 25282473  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |    
T  25282474 atttccggtcctaacaa-gcactctctcctgactcaaaccaacacaacaacgttttatacctccgtccatacaaagcctcaaacggcgccatactaatgc 25282572  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25282573 tagaatgaaatctgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacacaattgacaccttgttccaaaacacatgctctcaacaaatcctccaa 25282672  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  25282673 actctaaatagtcctctctgtctgtccatcagtttggggatgataagtagaactaaatcttaacttggttcctaaagccacttacaaactctcccaaaac 25282772  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||    
T  25282773 tttgaagtaaacctcagatcctgatccgatacaatactagaaggaatatcatgcaatctgacaatctgctcaatgtatatctccaccaacctcgtcacag 25282872  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  25282873 acatacatgtcttgataggaacgaaatgtgccgacttcgtcaaccaatcaacaatc 25282928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 61 - 656
Target Start/End: Original strand, 22283199 - 22283802
Alignment:
Q  61 gattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |  |||| ||    
T  22283199 gattcactcttaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcatttt 22283298  T
Q  161 ctcctgaatcatcttaaccttttccgt--------agtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtg 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||| |||| ||    
T  22283299 ctcctgaatcatcttaacctattccgttattccgtagtctcttgcacaactttcggtcctaacaaaacactctttcctgattcataccaacacaacgatg 22283398  T
Q  253 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtc 352  Q
    | |||||||| | |||||||||||  || ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22283399 ttctacaccttctaccatacaaagtttccaacggtgccatactgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcagc 22283498  T
Q  353 ccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaa 452  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  22283499 ccaacttacaccttgttccaaaacacatgctctcaaaaaatcttccaaactctggatagtcttctctgtctgcccaacagtcggaggatgataagcagaa 22283598  T
Q  453 ctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcat 552  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || | | |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  22283599 ctcaatctcaagttagttcctaaagctgcttgcaaactctccaaaaacttcgaagtaaatctcagacctctatctgacacaatactaaaatgaataccat 22283698  T
Q  553 gcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaac 652  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||||  |||| | ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  22283699 gcaatctgacaaccttttcaatgtaggtctccgccaacatcgtcacaaacatatcggtcttgataggaagaaaatgtgccgacttcgtcaaacgatcaac 22283798  T
Q  653 aatc 656  Q
    ||||    
T  22283799 aatc 22283802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 646
Target Start/End: Original strand, 23900818 - 23901063
Alignment:
Q  400 aactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23900818 aactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaa 23900917  T
Q  500 cttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccaca 599  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23900918 catagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatgcaacctgacaattagctcaatgtagatctcagccaacttcgccaca 23901017  T
Q  600 gtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccg 646  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23901018 gacata-ccgtcttgataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccg 23901063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 567
Target Start/End: Original strand, 32600304 - 32600853
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||||||||| | ||    
T  32600304 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgct 32600403  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  32600404 tatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcctaagac 32600503  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||  ||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  32600504 cactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 32600603  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||    ||||| |||||||    
T  32600604 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctataacgattgaattgtcctct 32600703  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  32600704 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttgg 32600803  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||| || || |||||||    
T  32600804 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatct 32600853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22378077 - 22377547
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||| |    
T  22378077 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22377978  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  22377977 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaa 22377878  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  22377877 aaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataacta 22377779  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| || |    
T  22377778 ttgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttc 22377679  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22377678 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 22377579  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  22377578 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 22377547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 22384252 - 22383722
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||| |    
T  22384252 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22384153  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  22384152 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaa 22384053  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  22384052 aaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataacta 22383954  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| || |    
T  22383953 ttgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttc 22383854  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22383853 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 22383754  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  22383753 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 22383722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 15533537 - 15534068
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || | ||||||| | || |||||||| |  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  15533537 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctac 15533636  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  15533637 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 15533736  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  15533737 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 15533836  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  15533837 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 15533936  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    ||||   ||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  15533937 tctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 15534036  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  15534037 tggatctctatctgatacaatactcgaaggaa 15534068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21167161 - 21166647
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21167161 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 21167062  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21167061 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21166962  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | ||  | || || ||||||||||| ||  | || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  21166961 gaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 21166862  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  21166861 ttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 21166762  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  21166761 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21166662  T
Q  515 cggatcccgatctga 529  Q
     ||||| | ||||||    
T  21166661 tggatctctatctga 21166647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16408669 - 16408128
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || ||||| ||||| || |||||  |||| |||| || ||| ||||| |    
T  16408669 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgc 16408570  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  |||||||||||    
T  16408569 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaa 16408470  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  16408469 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16408370  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  16408369 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16408270  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  || ||||||| ||    
T  16408269 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatct 16408170  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     || || | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  16408169 tgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16408128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 546
Target Start/End: Original strand, 22051075 - 22051551
Alignment:
Q  70 tcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 169  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   ||    
T  22051075 tcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttat 22051174  T
Q  170 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacca 269  Q
    |||||| ||||| || || || | ||| || |  || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22051175 catcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgacca 22051274  T
Q  270 tacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 369  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| || || ||||        ||||||    ||||||| |    
T  22051275 tacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgtt 22051374  T
Q  370 ccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 469  Q
    | |  |||||  ||||||||| |||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  22051375 caagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttgga 22051474  T
Q  470 tcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||||||  | |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22051475 acccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 22051551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31417098 - 31416575
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| | || | || |||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   ||||  |||    
T  31417098 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatcc 31416999  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||   |||||||| || || || ||||| |  ||||| |  |||||||| ||    
T  31416998 gcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaa 31416899  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||  |||||    
T  31416898 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactg 31416799  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  31416798 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 31416699  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  31416698 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 31416599  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  31416598 cggatccctatccgacacaatact 31416575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 22133665 - 22133121
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || |  | |||||||| |||   |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22133665 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 22133566  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  22133565 acttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtcctaa 22133466  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || |  ||||||||||  || ||||| || || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  22133465 gaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 22133366  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  22133365 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 22133266  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  22133265 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 22133166  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 559  Q
     ||||| | || ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  22133165 tggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 22133121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17674644 - 17674106
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  17674644 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 17674545  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17674544 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17674445  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
     || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  17674444 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 17674345  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  17674344 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctct 17674245  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  17674244 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17674145  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  17674144 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 17674106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 19978124 - 19978629
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| |||||| || |    
T  19978124 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctac 19978223  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  19978224 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 19978323  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| || ||    
T  19978324 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccattccaatactagaatgataattg 19978423  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||| |  ||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  19978424 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 19978523  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  || ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  19978524 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 19978623  T
Q  515 cggatc 520  Q
     |||||    
T  19978624 tggatc 19978629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 20396733 - 20396229
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||| | || || ||||||||||| |||||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||| |     
T  20396733 acttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataaca 20396634  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||||| ||| || |  ||  |||| || |   ||||||| ||     
T  20396633 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcct 20396534  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| || ||||    
T  20396533 gactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaact 20396434  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| || || || | ||| |||||    
T  20396433 ctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatc 20396334  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     |||||  |||| || || |||||||| | || |||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20396333 tgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgac 20396234  T
Q  531 acaat 535  Q
    |||||    
T  20396233 acaat 20396229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 19112850 - 19113388
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  19112850 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19112949  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || | ||  || |||||||| |     
T  19112950 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcctaagac 19113049  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  19113050 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 19113149  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | || ||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  19113150 ttataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19113249  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  19113250 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19113349  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  19113350 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19113388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 6679267 - 6679791
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  6679267 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 6679366  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6679367 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6679466  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  6679467 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 6679566  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  6679567 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 6679666  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  6679667 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 6679766  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  6679767 tcggatctctatccgacacaatact 6679791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22062057 - 22061534
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||||    
T  22062057 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctcc 22061958  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  22061957 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtccca 22061859  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  22061858 acacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 22061759  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||| ||| |  |||||  |||||||||||| ||||||    || || |||    
T  22061758 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtc 22061659  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  22061658 ctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaacc 22061559  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  22061558 ttggatccctatccgacacaatact 22061534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 30313768 - 30313216
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  30313768 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 30313669  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  ||  | |||||    
T  30313668 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgagccctaa 30313569  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||     
T  30313568 gaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaatgataacta 30313469  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |    |||||| ||||    
T  30313468 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcc 30313369  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    ||||   ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  30313368 tctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 30313269  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||| || || |||||||    
T  30313268 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatct 30313216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 6603814 - 6604338
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  6603814 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 6603913  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6603914 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6604013  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  6604014 acacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 6604113  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  6604114 gttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 6604213  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  6604214 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 6604313  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  6604314 tcggatctctatccgacacaatact 6604338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20018269 - 20017869
Alignment:
Q  120 tcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaag 219  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |       
T  20018269 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagacca 20018170  T
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||    
T  20018169 ctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattatt 20018070  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
     ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||     
T  20018069 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctctcc 20017970  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||    
T  20017969 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 20017870  T
Q  520 c 520  Q
    |    
T  20017869 c 20017869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 23655084 - 23655607
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  23655084 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctcc 23655183  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  23655184 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23655283  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| || || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||| |||||    
T  23655284 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactg 23655383  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||       ||||||     |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || ||||    
T  23655384 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcc 23655483  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||  |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  23655484 tctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 23655583  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  23655584 cggatctctatccgacacaatact 23655607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 12304914 - 12305435
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||     
T  12304914 aggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 12305013  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  12305014 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 12305113  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || |  ||| | ||    
T  12305114 acacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatgctcgagtgatagct 12305213  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  12305214 gttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 12305313  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |   | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  12305314 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacc 12305413  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  12305414 tcggatccctatctgacacaat 12305435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818048
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccg 207  Q
     |||||| || |||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaacttccg 24818048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 804298 - 803774
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||| | |||||| ||     
T  804298 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttctt 804199  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || || ||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || |  ||||| || || || |  |||||||| |    
T  804198 cgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtctcgtgaaccaaatccggtccca 804099  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  804098 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 803999  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||       ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  803998 gttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 803899  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  803898 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 803799  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  803798 tcggatctctatccgacacaatact 803774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 14565298 - 14565830
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||| | |||||| ||     
T  14565298 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttctt 14565397  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || || ||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  14565398 cgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtccca 14565497  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| |  ||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  14565498 acacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 14565597  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  14565598 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 14565697  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    || || | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 14565830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 22164815 - 22164272
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||  ||||||| |||   |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22164815 ggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 22164716  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || ||||| ||    
T  22164715 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtccgaa 22164616  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || |  ||||||||||  || ||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  22164615 gaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 22164516  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||    |||||| ||||    
T  22164515 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaat-cttcagcgactgaattgtcc 22164417  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||  ||||| |||||  | || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  22164416 tctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 22164317  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 559  Q
     ||||| | |||| | ||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  22164316 tggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 22164272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31571466 - 31570935
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  31571466 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 31571367  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |    
T  31571366 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccca 31571268  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     || | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  31571267 gcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataact 31571168  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || ||     
T  31571167 attgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtt 31571068  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  31571067 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 31570968  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  31570967 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 31570935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22120795 - 22120257
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  22120795 gtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 22120696  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||| || || ||||| |  || ||||  || | |||||| |     
T  22120695 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagac 22120596  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || ||  |||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  22120595 cactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 22120496  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22120495 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 22120396  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    |   ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||    
T  22120395 ccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttgg 22120296  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  22120295 atctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaa 22120257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 24094353 - 24094543
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  24094353 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcatctaattatcatgataaatcttcttcctactctgagatgctttcatcttctccataa 24094452  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctaca 259  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||| | ||||||||| | |||| ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24094453 tcatcttaaccttgtatgtagtgtgctgcacaactttcagtcctaacataacactttctcccgattcctaccaacacaacggtgtcctaca 24094543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21922359 - 21921818
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||  | ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21922359 ggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 21922260  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21922259 gcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21922160  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | ||  | || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| ||||     
T  21922159 gaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgataacta 21922060  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |     ||||| ||||    
T  21922059 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcc 21921960  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||  | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  21921959 tctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21921860  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  21921859 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21921818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 23650198 - 23650739
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  23650198 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 23650297  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  23650298 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 23650397  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| |||| ||||     
T  23650398 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattccaatactagaatgataacta 23650497  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  || ||| |||||||||| ||||| |    |||||| || |    
T  23650498 ttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttc 23650597  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| |  || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  23650598 tctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 23650697  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  23650698 tggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaa 23650739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29304050 - 29303519
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| || |    
T  29304050 ggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 29303951  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||   |||||  | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  29303950 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 29303851  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||| |  ||    
T  29303850 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatacctatactcgaatgatagttg 29303751  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | || |||||||| |||||    || || ||||    
T  29303750 ttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcc 29303651  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  29303650 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 29303551  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  29303550 cggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 29303519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20976070 - 20975752
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||    
T  20976070 cactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgtt 20975971  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||  |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || ||||||||     
T  20975970 gtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctcc 20975871  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  20975870 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 20975771  T
Q  520 cccgatctgacacaatact 538  Q
    | | |||||||||||||||    
T  20975770 ctccatctgacacaatact 20975752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20010524 - 20010197
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || ||||  ||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||| | |    
T  20010524 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttac 20010425  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||  ||||| ||  |||| |  || || |  || ||||| ||    
T  20010424 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtcccaa 20010325  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    |||  |||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  20010324 caacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactg 20010225  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20010224 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 20010197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 529
Target Start/End: Original strand, 22046546 - 22047044
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || |||||||| || || |||||  | | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22046546 acttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataact 22046645  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| ||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||  |   | || || ||     
T  22046646 cttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacct 22046745  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    || |||||||| || ||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  || ||||| || ||||    
T  22046746 gattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaact 22046845  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |     ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  22046846 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatc 22046945  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 529  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  22046946 tgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 22047044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Original strand, 19863230 - 19863754
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | |||||||| |     ||||| || ||||||||||||||    
T  19863230 acttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcatgatagct 19863329  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    |||||||||||| || || || |||||  ||||  ||||||| || |||||||| || || |  || ||||  |||||||| ||||  ||| |||| ||     
T  19863330 cttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaatctcgcca 19863429  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||  ||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19863430 gactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgttgttataagtaaact 19863529  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    |||| || || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||    ||||| || || || ||||| |||||    
T  19863530 caattaatggcaagtaagcatcccaact-cccccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcggtctgaccatc 19863628  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
      | || || || || |||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||| | || || ||||| ||||| | ||| ||     
T  19863629 aatttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaa 19863728  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||    
T  19863729 acaatactcgaaggaacaccatgcaa 19863754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Original strand, 19867867 - 19868391
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | |||||||| |     ||||| || ||||||||||||||    
T  19867867 acttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcatgatagct 19867966  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    |||||||||||| || || || |||||  ||||  ||||||| || |||||||| || || |  || ||||  |||||||| ||||  ||| |||| ||     
T  19867967 cttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaatctcgcca 19868066  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||  ||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19868067 gactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgttgttataagtaaact 19868166  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    |||| || || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||    ||||| || || || ||||| |||||    
T  19868167 caattaatggcaagtaagcatcccaact-cccccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcggtctgaccatc 19868265  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
      | || || || || |||||||||| | | |||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||| | || || ||||| ||||| | ||| ||     
T  19868266 aatttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaa 19868365  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||    
T  19868366 acaatactcgaaggaacaccatgcaa 19868391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 21251099 - 21251639
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||   ||||||||||| ||| ||||| |    
T  21251099 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctac 21251198  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21251199 gcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatc-tctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21251297  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| | | | |||| |||  | ||||||| |||| |||||    
T  21251298 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaatgataactg 21251397  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||   |||||| ||||    
T  21251398 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 21251497  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| | ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  21251498 tctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21251597  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  21251598 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21251639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21788982 - 21788442
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| | ||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||| | |    
T  21788982 ggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgc 21788883  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||  || ||||||||    
T  21788882 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaa 21788783  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || | ||||||||| ||||| || || || |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  21788782 gaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 21788684  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||    ||||| ||||    
T  21788683 ttattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcc 21788584  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||   || |||||  |||||||||| | ||||||  | |||||||| ||    
T  21788583 tctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatct 21788484  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  21788483 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 340
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949401
Alignment:
Q  96 aactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttctt 195  Q
    |||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||  |    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  196 gcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcc 295  Q
      || | ||| ||||| || |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||    
T  23949258 a-acgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  296 gatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
     ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgg 23949401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Original strand, 19851784 - 19852109
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||| |||  ||||||||||||| || ||||    
T  19851784 gactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaact 19851883  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||||| |      | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   |||||| || ||||| | ||| |||||    
T  19851884 ctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatc 19851983  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  19851984 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgac 19852083  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || |||| | |||||||    
T  19852084 acaatactcgatggaacaccatgcaa 19852109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Original strand, 19857820 - 19858145
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||| |||  ||||||||||||| || ||||    
T  19857820 gactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaact 19857919  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||||| |      | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   |||||| || ||||| | ||| |||||    
T  19857920 ctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatc 19858019  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  19858020 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgac 19858119  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || |||| | |||||||    
T  19858120 acaatactcgatggaacaccatgcaa 19858145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 1266396 - 1266915
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | || |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  1266396 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1266495  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||   ||||||||| |||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  1266496 gcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatctta-ccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1266594  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||| | || || || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  1266595 cacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1266694  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||| |||   || || ||||    
T  1266695 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcc 1266794  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | | | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  1266795 tctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacct 1266894  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaat 535  Q
    |||||| | ||| ||||||||    
T  1266895 cggatctctatccgacacaat 1266915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16271659 - 16271328
Alignment:
Q  204 tccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  16271659 tccggtcccaacacaacactctcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcg 16271560  T
Q  304 catgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 403  Q
      ||| | |||||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||       
T  16271559 agtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatga 16271460  T
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||    
T  16271459 ttgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataaccta 16271360  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16271359 gaagtgaacctcggatccctatccgacacaat 16271328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19485393 - 19484974
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || ||||||||     
T  19485393 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaag 19485294  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  19485293 accactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctat 19485194  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  19485193 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 19485094  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  19485093 ctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatctt 19484994  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  19484993 ggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21394489 - 21393948
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| | ||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||| | |    
T  21394489 ggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgc 21394390  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||  || ||||||||    
T  21394389 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaa 21394290  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccga-ccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     |   | || || || || | ||||||||| ||||| || || || |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  21394289 gaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 21394191  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||    ||||| |||    
T  21394190 attattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtc 21394091  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||   || |||||  |||||||||| | ||||||  | |||||||| |    
T  21394090 ctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatc 21393991  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  21393990 ttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21393948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 22987359 - 22987665
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||  | ||||| ||| | || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |     
T  22987359 gagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacg 22987458  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || ||  |||||| ||| |||| ||  | ||||||     
T  22987459 cttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaa 22987558  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   ||||||| ||  |||| |||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| || |||    
T  22987559 accacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataattgt 22987658  T
Q  316 tgttgta 322  Q
    | |||||    
T  22987659 tattgta 22987665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 339
Target Start/End: Original strand, 21840637 - 21840898
Alignment:
Q  78 acatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 177  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| | ||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||    |||||||| |    
T  21840637 acatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttga 21840736  T
Q  178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    |||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21840737 ccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagc 21840836  T
Q  278 ctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacg 339  Q
     || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || || || |||||||    
T  21840837 ttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacg 21840898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 556
Target Start/End: Original strand, 18856980 - 18857275
Alignment:
Q  261 ctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactga 360  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |      
T  18856980 ctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 18857079  T
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||    
T  18857080 ctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatct 18857179  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  18857180 caacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18857275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 511
Target Start/End: Original strand, 22040235 - 22040512
Alignment:
Q  234 tcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 333  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||  | ||||| || ||||| |    
T  22040235 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcga 22040334  T
Q  334 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggt 433  Q
    ||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |     ||||| ||||||||   ||| ||||| ||    
T  22040335 tcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgt 22040434  T
Q  434 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22040435 ctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 22040512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 535
Target Start/End: Original strand, 20388472 - 20388776
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||||||||||  | ||||    
T  20388472 gactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaact 20388571  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||||  | ||||| | ||| |||||    
T  20388572 ctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatc 20388671  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  20388672 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 20388771  T
Q  531 acaat 535  Q
    |||||    
T  20388772 acaat 20388776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21682094 - 21681862
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  21682094 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 21681995  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  21681994 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 21681895  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataa 247  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21681894 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataa 21681862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Original strand, 22032205 - 22032337
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||| | | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22032205 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataact 22032304  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctc 163  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  22032305 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 22032337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Original strand, 27355074 - 27355228
Alignment:
Q  384 ctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagctt 483  Q
    ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |    
T  27355074 ctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcct 27355173  T
Q  484 gcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27355174 gtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 27355228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 20388259 - 20388404
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||  || | || |||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||  ||||| || | ||    
T  20388259 gtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgct 20388358  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc 163  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  20388359 tgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctc 20388404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 357
Target Start/End: Original strand, 24094557 - 24094605
Alignment:
Q  309 aaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaac 357  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24094557 aaactattgttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaac 24094605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22129129 - 22129023
Alignment:
Q  450 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatat 549  Q
    |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||||| | |||||||||||| || |||||||||     
T  22129129 gaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaatac 22129030  T
Q  550 catgcaa 556  Q
    |||||||    
T  22129029 catgcaa 22129023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 538
Target Start/End: Original strand, 22371526 - 22371620
Alignment:
Q  444 taagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  22371526 taagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatact 22371620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 28982513 - 28982635
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  28982513 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 28982612  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctg 136  Q
    | ||| ||||| || ||||||||    
T  28982613 cgcttgtcatggtaactcttctg 28982635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 28987733 - 28987855
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  28987733 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 28987832  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctg 136  Q
    | ||| ||||| || ||||||||    
T  28987833 cgcttgtcatggtaactcttctg 28987855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21325033 - 21324888
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| || |    
T  21325033 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctac 21324934  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||    
T  21324933 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatctt 21324888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 538
Target Start/End: Original strand, 21841005 - 21841097
Alignment:
Q  446 agcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  ||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21841005 agccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatact 21841097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 23151093 - 23151154
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggatt 64  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  23151093 ccaacaaaatgaggagtcgacttcctacactttaaagcacgcccaacaccagttacaggatt 23151154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 580; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 20831659 - 20831004
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20831659 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 20831560  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831559 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 20831460  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20831459 acttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 20831360  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831359 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 20831260  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831259 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 20831160  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20831159 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 20831060  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20831059 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 20831004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 574
Target Start/End: Original strand, 20914304 - 20914875
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20914304 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 20914403  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20914404 tatcctttctccatttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 20914503  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20914504 ttccggttctaacatagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 20914603  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20914604 gtatgaaaattgtttttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 20914703  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20914704 tctaaatagtcctctcagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaactt 20914803  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaat 574  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20914804 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaat 20914875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135169
Alignment:
Q  70 tcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 169  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  170 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacca 269  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  270 tacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaaatcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 22135457  T
Q  370 ccaaaacacaagctctca-acaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22135456 ccaacacgcaagctctcttacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttag 22135357  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctg 568  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22135356 ttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacatagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatgcaatctcacaatctg 22135257  T
Q  569 ctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135256 ctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgacataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 22135169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21202537 - 21201901
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  21202537 gtcaacttccgacacttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctct 21202438  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||    
T  21202437 tatcatgataactcttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctctatagtcccttgcacaactctcggttctaacaa 21202338  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
    |||||| || |  |||||| || |||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21202337 agcactttcacgtgactcatacgaacacaacgatgtcctacaccgcgaaccatacaaagcttaaaacggcgccatcccgatactagaatgaaaactgttg 21202238  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21202237 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgataccttgttccagaacacaagctcctagaaaatcctccaaa--ctgaatagtcctct 21202140  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
      ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21202139 tcgtctgtccatcagtatggggatgataagcagaactaaatcgtaactttgttcctaaagtagcttgcaaactctcccaaaactttgaagtaaaccttgg 21202040  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgata 617  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||  |||||| |||||||||    
T  21202039 atcccgatccgacacattactagaaggaaaaccatgcaatctgacaatctgctcaatgtagatctccgccaaccttaccacaaacataccagtcttgata 21201940  T
Q  618 ggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21201939 ggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 21201901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 570
Target Start/End: Original strand, 20184275 - 20184842
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaat-acatgatctccaacttgaaactca 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||| | | | ||||| || |||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  20184275 ccaacaaaacgtggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgaccagcactggttaaaaggttcactctaaaaaaacacatgatcacccacttgaaactca 20184374  T
Q  102 atatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||| || |||||||| || || | | |||| ||||| || |    
T  20184375 atatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttcttcatagtctcttgtacca 20184474  T
Q  202 cttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatact 301  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||  || || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||    
T  20184475 ctttcggtcctaacaaatcactttctccttacacataccaacacaacggcgtcctacacatccgtccatacaaaaccaaaaacggtgtcataccgatact 20184574  T
Q  302 agcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaa 401  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| | |||| | |||||| ||||||    
T  20184575 agaatgaaaactgttgttgttagtaaactcaatcaacagtaaacattcaacctaactgaaaccttgttccaaaacac-atctcttagcaaatcttccaaa 20184673  T
Q  402 ctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaact 501  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  20184674 ctcttaatagtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaaca 20184773  T
Q  502 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgct 570  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20184774 tagaagtaaatctcggatcatgatctgacaaaatattggaaggaatatcatgcaatctgacaatatgct 20184842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 46518813 - 46519020
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46518813 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 46518912  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46518913 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 46519012  T
Q  201 acttccgg 208  Q
    ||||||||    
T  46519013 acttccgg 46519020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 17045265 - 17044716
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  | |||||||||| ||||||||| | ||    
T  17045265 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgct 17045166  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  17045165 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 17045066  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  17045065 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 17044966  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  17044965 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 17044866  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  17044865 ccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttgg 17044766  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||| |  ||||| ||||| || ||||||| | |||| || || |||||||    
T  17044765 atctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatct 17044716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 50620497 - 50619955
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||  || ||||| |    
T  50620497 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctac 50620398  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  50620397 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctcaggtcctaa 50620298  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   |||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||     
T  50620297 aaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaatgataacta 50620198  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||   |||||| || |    
T  50620197 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttc 50620098  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  50620097 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 50619998  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaat 557  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||||    
T  50619997 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaat 50619955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16350849 - 16350311
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16350849 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16350750  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  16350749 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 16350650  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16350649 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16350550  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16350549 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16350450  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16350449 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16350350  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  16350349 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16350311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16078815 - 16078385
Alignment:
Q  105 tccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactt 204  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  |    
T  16078815 tccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 16078716  T
Q  205 ccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagc 304  Q
    | |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  16078715 ctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccattccaatactaga 16078616  T
Q  305 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 404  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    |    
T  16078615 atgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccagcgac 16078516  T
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||||| ||||||  |||    
T  16078515 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctag 16078416  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||||| || ||||| | |||||| |||||    
T  16078415 aagtaaatcttggatctctatctgatacaat 16078385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 19106476 - 19107014
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| || |||| ||    
T  19106476 gtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgct 19106575  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19106576 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19106675  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  19106676 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 19106775  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  19106776 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19106875  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||  | ||    
T  19106876 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattgg 19106975  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  19106976 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19107014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 51333743 - 51333205
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||   ||| ||||||| ||| || || | ||    
T  51333743 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgct 51333644  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  51333643 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 51333544  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  51333543 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 51333444  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  51333443 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 51333344  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  51333343 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 51333244  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  51333243 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 51333205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 19854420 - 19854942
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || ||||| || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  19854420 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 19854519  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |    
T  19854520 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtccca 19854618  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  19854619 acacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccataccaatactcgaatggtaact 19854718  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||        ||||||    ||||||| || |  || ||  ||||||  ||||||||||     || || |||    
T  19854719 gttgttgtatgtgaactca-tcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatcctccagtgattggatcgtc 19854817  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  19854818 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 19854917  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  19854918 tcggatccctatccgacacaatact 19854942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 33391279 - 33390741
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  33391279 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 33391180  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  33391179 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 33391080  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  33391079 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 33390980  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  33390979 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 33390880  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  33390879 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 33390780  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  33390779 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 33390741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Original strand, 16369405 - 16369934
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  || ||||| | |    
T  16369405 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgc 16369504  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||  || |||||||| |    
T  16369505 ttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcctaaaa 16369604  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       || |||| ||  ||||||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  16369605 ccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcattccaatactagaatgataactgtt 16369704  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
     || || || ||||| ||||| || | |      |||||  |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| || |||    
T  16369705 attatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctc 16369804  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||   || |||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 16369934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 20294517 - 20294840
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||     
T  20294517 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttcctt 20294616  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||||  | ||||| || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20294617 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 20294716  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  20294717 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20294816  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  20294817 gttgttataagtgaactcaatcaa 20294840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20857014 - 20856687
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| || ||  | |||||| |||  |||||||| |    
T  20857014 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctac 20856915  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| || ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||| || || | |||| | || ||    
T  20856914 gcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtttcatgaaccaattccagccccaa 20856815  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| | |||  |||||    
T  20856814 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 20856715  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20856714 ttgttgtatgtaaattctatcaatggta 20856687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 21837059 - 21837597
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  21837059 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 21837158  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| |||  | || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  21837159 gatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagac 21837258  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  21837259 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 21837358  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  21837359 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 21837458  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21837459 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 21837558  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  21837559 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 21837597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 20136884 - 20137206
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||  | |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20136884 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 20136983  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  20136984 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 20137083  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || ||  ||||||||||||| ||||  || || || ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| |||| ||||     
T  20137084 gaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattcctatactagaatgataacta 20137183  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  20137184 ttattgtacgtgaactctatcaa 20137206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 20249956 - 20250254
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20249956 ggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 20250055  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| || |  || ||||||||    
T  20250056 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcctaa 20250155  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     |   | || || |  |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20250156 gaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 20250254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19761119 - 19760794
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||  ||||| || | || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  19761119 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctac 19761020  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||  || || |  || ||||| ||    
T  19761019 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaa 19760920  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  19760919 aactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 19760820  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || |||||  | ||||| ||||||||    
T  19760819 ttattgtacatgaactctatcaacgg 19760794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22433369 - 22432829
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | |||||||  || |||||||| ||  | ||||||||||    ||| ||||    
T  22433369 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctcc 22433270  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| || || || |  | |||||| |    
T  22433269 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtccca 22433171  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   ||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  22433170 acaccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccatacctatactcgaatggtaact 22433071  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| || || ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    || || |||    
T  22433070 gttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtc 22432971  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| || |||| ||||    
T  22432970 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacc 22432871  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22432870 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgca 22432829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 37677184 - 37677717
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaa-aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcct 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | |||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||| | |||||| ||    
T  37677184 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttct 37677283  T
Q  113 cctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  ||||||||     
T  37677284 tcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccc 37677383  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | |    
T  37677384 aacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagc 37677483  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  || ||  ||||||||||||| |||||    ||||| ||    
T  37677484 tgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgt 37677583  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
    |||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  37677584 cctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaac 37677683  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  37677684 ctcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 37677717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20940316 - 20939989
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  20940316 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 20940217  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| || |||| ||||||| || || ||  ||||||  || || |  |||||||| |    
T  20940216 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtccca 20940118  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| | |||  ||||    
T  20940117 acacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataacaatactcgaatggtaact 20940018  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20940017 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 20939989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 21830412 - 21830950
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || |  | ||    
T  21830412 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgct 21830511  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  21830512 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 21830611  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  21830612 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 21830711  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  21830712 ttatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctct 21830811  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21830812 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 21830911  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  21830912 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21830950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24099510 - 24099333
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  24099510 caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacct 24099411  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24099410 caacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 24099333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41354621 - 41354202
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || ||||||||     
T  41354621 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaag 41354522  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || |    
T  41354521 accactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctat 41354422  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||| ||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  41354421 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 41354322  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  41354321 ctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatctt 41354222  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  41354221 ggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 21747657 - 21747933
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||| |||  || |||||  || ||||||||| ||| ||| | | ||||| ||| || ||    
T  21747657 acttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatctttc-tacgcttattatggtaact 21747755  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  21747756 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcct 21747855  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 308  Q
     ||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21747856 aactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatga 21747933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20836036 - 20835814
Alignment:
Q  120 tcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaa 218  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || || |  || ||||| || | |    
T  20836036 tcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaaca 20835938  T
Q  219 gcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgt 318  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | |||  |||||||||    
T  20835937 acactctctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgt 20835838  T
Q  319 tgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||| || ||||| ||||||||||    
T  20835837 tgtacgtgaactctatcaacggta 20835814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31550435 - 31550148
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  31550435 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 31550336  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| ||    |||| | | || || |||||||| || || || |  |||||||| |    
T  31550335 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtctcatgaactaaatccggtccca 31550236  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatact 301  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  31550235 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatact 31550148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19665130 - 19664897
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   | |||||     
T  19665130 aggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttccta 19665031  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||| |||     
T  19665030 cgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctg-atcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatccc 19664932  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataa 247  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19664931 aacacaacactctctcctgactcaaaccaacataa 19664897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19662998 - 19662871
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||| || |    
T  19662998 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 19662899  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19662898 acctcggatccctatccgacacaatact 19662871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 11382699 - 11382845
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||||||     
T  11382699 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttcctt 11382798  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  11382799 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatctt 11382845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 556
Target Start/End: Original strand, 21749407 - 21749588
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |    
T  21749407 acacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccta 21749506  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  21749507 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21749588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22142306 - 22142233
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaa 76  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  22142306 ccaacaaaatgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaa 22142233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 492
Target Start/End: Original strand, 41308148 - 41308408
Alignment:
Q  232 actcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 331  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  || |||||||||| || |||||    
T  41308148 actcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactc 41308247  T
Q  332 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcg 431  Q
     ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || |||||||| | ||| |||||     
T  41308248 tatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatct 41308347  T
Q  432 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  41308348 gtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 41308408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19663145 - 19663062
Alignment:
Q  259 acctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19663145 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 19663062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 20856597 - 20856438
Alignment:
Q  432 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgaca 531  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||    
T  20856597 gtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgaca 20856498  T
Q  532 caatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    | ||||| || |||| | |||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  20856497 ctatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaact 20856438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Original strand, 20294887 - 20295041
Alignment:
Q  384 ctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagctt 483  Q
    ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | |    
T  20294887 ctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcct 20294986  T
Q  484 gcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20294987 gtagactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 20295041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22362137 - 22361956
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||   || ||| |||||||| | ||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||| ||  |    
T  22362137 acacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatctta 22362038  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || || || | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  22362037 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22361956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 20835724 - 20835621
Alignment:
Q  432 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgaca 531  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||  | |||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  20835724 gtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgaca 20835625  T
Q  532 caat 535  Q
    ||||    
T  20835624 caat 20835621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20939850 - 20939793
Alignment:
Q  481 cttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  20939850 cttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 20939793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31539904 - 31539719
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  31539904 caccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaactt 31539805  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||  || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  31539804 cattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 31539719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 40366 - 41021
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40366 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 40465  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 40565  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40566 acttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 40665  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40666 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 40765  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40766 actctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 40865  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40866 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 40965  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40966 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 41021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 33861 - 33320
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  33861 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 33762  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatc--ttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || |||||     
T  33761 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtccc 33664  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||    
T  33663 aacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 33564  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || ||    
T  33563 tattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgt 33464  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
     ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  33463 tctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaac 33364  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  33363 ctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 33320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27107978 - 27107323
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27107978 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 27107879  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107878 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 27107779  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27107778 acttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 27107679  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107678 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 27107579  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107578 actctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 27107479  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27107478 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 27107379  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27107378 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 27107323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 7823966 - 7824621
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7823966 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 7824065  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824066 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 7824165  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7824166 acttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 7824265  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824266 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 7824365  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7824366 actctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaat 7824465  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7824466 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 7824565  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7824566 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 7824621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 654
Target Start/End: Original strand, 15364011 - 15364659
Alignment:
Q  6 acaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  15364011 acaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgt 15364110  T
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  15364111 cctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttc 15364210  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
    ||||| ||||| | |||| |||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15364211 cggtcttaacatatcactttctccttattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagca 15364310  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15364311 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactct 15364410  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364411 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 15364510  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcata 605  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  15364511 agtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgacata 15364610  T
Q  606 cccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    || |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||    
T  15364611 ccagtcttgataggaacaaaatgtgtcgacttcgtcaaccgataaacaa 15364659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 654
Target Start/End: Original strand, 14936418 - 14937066
Alignment:
Q  6 acaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14936418 acaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgt 14936517  T
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14936518 cctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttc 14936617  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
    |||||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14936618 cggtcctaacaaagcaccttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaa 14936717  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14936718 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactct 14936817  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936818 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 14936917  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcata 605  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14936918 agtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagacata 14937017  T
Q  606 cccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    || |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||    
T  14937018 ccggtcttgataggaacaaaatgtgtcgacttcgtcaaccgataaacaa 14937066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 654
Target Start/End: Original strand, 4439996 - 4440647
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4439996 ccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 4440095  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4440096 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 4440195  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| ||||   | |||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  4440196 ttccggccctaacaaagcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccataccggtacta 4440295  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4440296 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaac 4440395  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4440396 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaactt 4440495  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  4440496 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaaccttgccacagac 4440595  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  4440596 atactggtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaa 4440647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21674735 - 21674082
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||  ||  ||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21674735 ccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaa 21674636  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  21674635 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaac 21674536  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21674535 ttccggtcctaacaaagcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 21674436  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21674435 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacattcgatccaactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaac 21674336  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21674335 tctgaatagtcctctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaactt 21674236  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  21674235 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatttcagccaactttgccacagac 21674136  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || |  || ||||||||||||||||||    
T  21674135 ataccggtcttgatagaaacaaaatgtgccgttttcgtcaaccgatcaacaatc 21674082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 12368772 - 12368189
Alignment:
Q  9 aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatcct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12368772 aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcct 12368673  T
Q  109 tcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccgg 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12368672 ttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccgg 12368573  T
Q  209 tcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 308  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||    
T  12368572 tccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T
Q  309 aaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaa 408  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12368472 aattttttgttgtaagtaaactcaatcaaagttaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcatcaaaactctgaa 12368373  T
Q  409 tagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagt 508  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12368372 tagtccactctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagattgtaaactctcccagaacttagaagt 12368273  T
Q  509 aaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaactt 592  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12368272 aaaccttggatcccgatccaatacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaactt 12368189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 45146624 - 45147273
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  45146624 ccaacaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaa 45146722  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  45146723 tgtccttcctactcttataatgataactcttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtctcttgcataac 45146822  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     | |||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  45146823 cttcggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatacta 45146922  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45146923 gaatgcaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 45147022  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45147023 tctgaatagtcctctctgtctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaactt 45147122  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||     |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45147123 agaagtaaacctcgg---gagatccgacataatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaactttgccacagac 45147219  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  45147220 ataccggtcttaataggaacaaaatgtaccgacttcgtcaatcgatcaacaatc 45147273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 17923748 - 17924372
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaat-acatgatctccaacttgaaactca 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| || |||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  17923748 ccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactca 17923847  T
Q  102 atatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 201  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17923848 atgtccatcctcctcttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaa 17923947  T
Q  202 cttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatact 301  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || |||||                  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17923948 cctccggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaa------------------acacctccgaccatacagagcctcaaacggtgccataccgatact 17924029  T
Q  302 agcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaa 401  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17924030 agaatgaaaactgttgttgtaagtaaacttaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaa 17924129  T
Q  402 ctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaact 501  Q
    |||||||||||||||||            |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  17924130 ctctgaatagtcctctc------------ggtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaact 17924217  T
Q  502 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagt 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17924218 tagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaacctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacaga 17924317  T
Q  602 catacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  17924318 cataccggtcttgataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccgataaacaatc 17924372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 13353219 - 13353871
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||||    
T  13353219 ccaacaaaacgaggagtcaactttcaacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaa 13353318  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||  || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13353319 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaac 13353418  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  13353419 ctccggtcctaacaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaata 13353518  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  13353519 gaatgaaaactcttattataagtaaactcaatcgacggtaaacattcgacccaactgacaccttgcttcaaaacacaagctcttaacaaatcttctaaac 13353618  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||| |||||||  |||  |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||   ||| |||||||    
T  13353619 tctgaataatcctctccatctaaccatcggtctggagatgacaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagttccttgcaaatcttcctaaaactt 13353718  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13353719 agaagtaaaccttggatcccgatccgacac-atactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctggtcaatgtagatctcagccaacttcgccacatac 13353817  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13353818 ataccggtcttgaaaggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatccacaatc 13353871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 535
Target Start/End: Original strand, 12193624 - 12194156
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12193624 ccaacaaaacgaggagtcaacttccggcatttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaaatcaa 12193723  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12193724 tgtcattcctcctcttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaac 12193823  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     | |||||||||||||||| | || || |||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||     
T  12193824 cttcggtcctaacaaagcattttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgtcatactgatactt 12193923  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  12193924 taatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacataagctcttaacaaatcttccaaac 12194023  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  12194024 tctgaatagtcatcttcgtcttcccattggtctaaggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcaacttgccaactctcccaaatatt 12194123  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194124 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 12194156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 17145445 - 17144810
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||| ||||| |||  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17145445 gtcaacttccgacactccaaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctct 17145346  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  17145345 tatcatgataactcttctgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatcttcaccttttctatggtctcttgaacaactaccggtcctaacaa 17145246  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
    | || | |||||  ||||| ||||||| ||||    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| ||  ||||||| |||||    
T  17145245 atcaatttctcctaactcataccaacacaacgacaacctacacctccttccatacaaagcttcaaa-ggtgtcataccaatattaaaatgaaaattgttg 17145147  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||    
T  17145146 ttgtaagtaaattcaatcaacgacaaacactcagcccaattcacattttgttctaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaagattaaatagtcctct 17145047  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | || | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17145046 ccgttttccgatcagtctgaggatgataagcagaactcaacctc-acatagttcccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcgg 17144948  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgata 617  Q
    ||| | |||||||| |||  ||||   |||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  17144947 atctctatctgacagaatggtagacaaaataccatgaaatctgacaacctgctcattgtacatctccgccaacctcgccacagacataacggtcttgata 17144848  T
Q  618 ggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaat 655  Q
    |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  17144847 ggaataaaatgtggcgacttcgtcaaccgatcaacaat 17144810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 475
Target Start/End: Original strand, 20466878 - 20467321
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20466878 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataact 20466977  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
     ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |  |   ||||||| ||||| | |||| ||||||||||     
T  20466978 attctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataaccttt-ctgtagtctgctaagcaacttctggtccaatcaaaacactctctcct 20467076  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||| || |||| || || |||| | |||| |  |||| ||| || ||||| || |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| || ||||    
T  20467077 gactcatacaaacacaatggcgtccgataccttcttccatgcaatgcttcaaaaggcgccatttcaatactcgaatgaaaactgttgttgtaggtgaact 20467176  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||| || |||   ||||||||||||||||  || || ||    
T  20467177 caatcaacggtaaacattcaatccaacttacaccttgttcaaaaatacaagctctcgacaaatcttctaaatattgaatagtcctctctgattgaccgtc 20467276  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaa 475  Q
     || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20467277 cgtatgaggataataagcggaactcaacctcaacttagttcccaa 20467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 23641868 - 23642169
Alignment:
Q  355 aactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaact 454  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||   | ||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  23641868 aacttacaccttgttccaaaacacaagccctcaatagatcttccaaagattaaatagtcttctctgtctgtccatcagattgaggatgataagcagaact 23641967  T
Q  455 caatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgc 554  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23641968 caaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgctagaaggaatatcatgc 23642067  T
Q  555 aatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  23642068 aatctgacaacctgctcaatgtagatctcatccaacttcgccacaaatataccggtcttgataggaataaaatatgtcgactttgtcaaccgatcaacaa 23642167  T
Q  655 tc 656  Q
    ||    
T  23642168 tc 23642169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 276 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15171893 - 15171513
Alignment:
Q  276 gcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaa 375  Q
    |||||||||| || ||| || ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |   ||||||| ||| |||  |||||||    
T  15171893 gcctcaaacgatgtcataccaatactagaatgaaaattgttgttttaggtaaactcaatcagcggcaaacacttaacccaacttacatcttattccaaaa 15171794  T
Q  376 cacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaa 475  Q
    || ||||| |||||||||| |||||    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15171793 cataagctttcaacaaatcttccaaggattgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaa 15171694  T
Q  476 agcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatg 575  Q
    ||| ||||| ||||| | || |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||| ||  | || |||||| |||| ||| | ||||  |||||||||    
T  15171693 agccgcttgaaaacttttccgaaacatagaagtaaacctcagatctctatcttacacgatgttggatggaataccatgtaatttgacaacatgctcaatg 15171594  T
Q  576 tagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15171593 tagatctccgccaacctcgccacaaacataccggtcttgataggaataatatgcgctgactttgttaaccaatcaacaatc 15171513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17505 - 16975
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||| |     
T  17505 gagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcg 17406  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| || || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || |||| ||| ||||||||     
T  17405 cttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttcgggtcctaag 17306  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||| |||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  17305 accactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 17206  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc-gtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||   |  |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  17205 tattgtatgtgaactcgatcaacgg-aaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 17107  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    ||||   ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  17106 tctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 17007  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  17006 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 16975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 13378766 - 13378974
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13378766 ccaacaaaacaaggagtcaacttccgacaattcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 13378865  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13378866 ttttctttctcctcttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 13378965  T
Q  203 ttccggtcc 211  Q
    |||||||||    
T  13378966 ttccggtcc 13378974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 591
Target Start/End: Original strand, 12687659 - 12688157
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
     ||| ||||  || |||||||| |     || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12687858  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
    ||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  12687859 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 12687958  T
Q  393 tcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    ||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  12687959 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12688058  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  12688059 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaact 12688157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 538
Target Start/End: Original strand, 13021489 - 13021961
Alignment:
Q  66 accctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 165  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||| |   ||||  ||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||     
T  13021489 accctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttccc 13021588  T
Q  166 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccg 265  Q
      |||||||| ||||| || ||||| || || || |  |||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  13021589 ttatcatcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccg 13021688  T
Q  266 accatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||| | |||||||| ||||| ||||| |||||| |||     |  ||||||    |||||    
T  13021689 accatacaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccacct 13021788  T
Q  366 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 465  Q
    ||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || ||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13021789 tgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaact 13021888  T
Q  466 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | | |||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13021889 tcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatact 13021961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5432712 - 5432516
Alignment:
Q  89 aacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||   |||||| || ||||| |  |||    
T  5432712 aacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatcttctc---aatcatattcaccttctatgta 5432616  T
Q  189 gtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 288  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5432615 gtctattgcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctaactcataccaacacaacggtgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtg 5432516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 546
Target Start/End: Original strand, 14130011 - 14130485
Alignment:
Q  72 aaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 171  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   ||||    
T  14130011 aaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatca 14130110  T
Q  172 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccata 271  Q
    |||| ||||| || ||  | || || || |  |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14130111 tcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccata 14130210  T
Q  272 caaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcc 371  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    ||||||| ||     
T  14130211 caaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttca 14130310  T
Q  372 aaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttc 471  Q
    |  |||||  ||||||||| |||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  14130311 agcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaac 14130410  T
Q  472 ccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14130411 tcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaa 14130485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 546
Target Start/End: Original strand, 14433829 - 14434303
Alignment:
Q  72 aaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 171  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   ||||    
T  14433829 aaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatca 14433928  T
Q  172 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccata 271  Q
    |||| ||||| || ||  | || || || |  |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14433929 tcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccata 14434028  T
Q  272 caaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcc 371  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    ||||||| ||     
T  14434029 caaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttca 14434128  T
Q  372 aaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttc 471  Q
    |  |||||  ||||||||| |||||||||    || || |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  14434129 agcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaac 14434228  T
Q  472 ccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14434229 tcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaa 14434303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8212297 - 8211765
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  8212297 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 8212198  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  8212197 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 8212098  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  8212097 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccataccaatactcgagtgatagct 8211998  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  8211997 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 8211898  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  8211897 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 8211798  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  8211797 tcggatctctatctgacacaatgctagacggaa 8211765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18054121 - 18053590
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||    
T  18054121 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctcc 18054022  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |    
T  18054021 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtccca 18053923  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  18053922 acacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataact 18053823  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || |||    
T  18053822 gttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtc 18053723  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  18053722 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 18053623  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18053622 tcggatccctatctgacacaatactcgaaggaa 18053590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 11553289 - 11552716
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  11553289 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgct 11553190  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  11553189 tatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 11553090  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  11553089 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 11552990  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||     |||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  11552989 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctct 11552890  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||| || ||    
T  11552889 ccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttgg 11552790  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  11552789 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaact 11552716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18551932 - 18551407
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  18551932 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataact 18551833  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | || |||||     
T  18551832 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcct 18551733  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || || ||||| ||||    
T  18551732 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaact 18551633  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    |||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18551632 caatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 18551533  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||    
T  18551532 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 18551433  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    || || || ||||||| | |||||||    
T  18551432 acgatgctcgaaggaacaccatgcaa 18551407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 23641600 - 23641857
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||| | |||||| || | ||| ||||| ||||| | | ||||||| || ||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23641600 gtcaactttcgacacttaaaagaacgtccaacaccggttatatgattcactctgaaaaacatatgattatcaacttgaaactcaatatccttcctccttt 23641699  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    ||||||||||  |||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || | |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  23641700 tatcatgataagtcttctgcttattctgagacgctttcatcttatcctgaatcatctgaactttcttcgtagtctcgtgcacaactttcggtcctaacaa 23641799  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaa 275  Q
    | ||||||||||  ||||| | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23641800 aacactctctcctaactcatatcaagacaacggtgtcctacacctctgtccatacaaa 23641857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 555
Target Start/End: Original strand, 10871176 - 10871615
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  10871176 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 10871275  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  10871276 accactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 10871375  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  10871376 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 10871475  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  10871476 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 10871575  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10871576 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgca 10871615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23506038 - 23505507
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| |||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  23506038 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 23505939  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  23505938 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaa 23505839  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  23505838 cacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 23505739  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || | ||||||  |||||||||| || |||||    || || ||||    
T  23505738 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 23505639  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  23505638 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 23505539  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  23505538 cggatccctatccgacacaatacacgaaggaa 23505507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 8707688 - 8708226
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  8707688 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 8707787  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  8707788 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagac 8707887  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  8707888 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 8707987  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  8707988 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8708087  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  8708088 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8708187  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  8708188 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 8708226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 49152381 - 49152913
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || || ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||||||     
T  49152381 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttcctt 49152480  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  49152481 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 49152580  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  49152581 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 49152680  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  49152681 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 49152780  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  49152781 ctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 49152880  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  49152881 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 49152913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 544
Target Start/End: Original strand, 9596238 - 9596666
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  9596238 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 9596337  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||  ||| |    
T  9596338 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgactat 9596437  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  9596438 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 9596537  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  9596538 ctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 9596637  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaagg 544  Q
    ||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  9596638 ggatctctatctgatacaatgctcgaagg 9596666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11306432 - 11305908
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  11306432 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 11306333  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11306332 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtccca 11306233  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| |  ||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  11306232 acacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11306133  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  11306132 gttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 11306033  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    || || | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatact 11305908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 590
Target Start/End: Original strand, 14954703 - 14955275
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  14954703 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgct 14954802  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14954803 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagac 14954902  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  14954903 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactatta 14955002  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14955003 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 14955102  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||   ||||||||| |   ||| | |||||||||| || ||    
T  14955103 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttgg 14955202  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 590  Q
    ||| | |||  | ||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  14955203 atctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 8198711 - 8199249
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | ||    
T  8198711 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 8198810  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8198811 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 8198910  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  8198911 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 8199010  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  8199011 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8199110  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  8199111 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8199210  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  8199211 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 8199249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11772373 - 11771891
Alignment:
Q  73 aaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcat 172  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||  |||||| | || ||||||||    
T  11772373 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcat 11772274  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||| |   ||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || ||||| |  ||| ||    
T  11772273 cttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacac 11772174  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |    
T  11772173 aaagccttaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaa 11772074  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||  | || | ||  ||||| |||||  |||| || || |||||||| ||||||||||  ||    
T  11772073 gtacacaaactctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacc 11771974  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
     |||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  11771973 taaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 11771891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 23199911 - 23199405
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| |||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  23199911 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 23199812  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  23199811 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaa 23199712  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  23199711 cacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 23199612  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || | ||||||  |||||||||| || |||||    || || ||||    
T  23199611 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 23199512  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  23199511 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 23199412  T
Q  515 cggatcc 521  Q
    |||||||    
T  23199411 cggatcc 23199405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 44791525 - 44791000
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  44791525 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 44791426  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | || |||||     
T  44791425 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcct 44791326  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || || || ||||    
T  44791325 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaact 44791226  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  44791225 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 44791126  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  44791125 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 44791026  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||    
T  44791025 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 44791000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16950639 - 16950116
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | |||||||||    |||| ||||    
T  16950639 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctcc 16950540  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  ||| |||| ||    
T  16950539 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaa 16950440  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  16950439 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16950340  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaac-attcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||    | |  |||  |||  |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||    
T  16950339 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactc-caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtc 16950241  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  16950240 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacc 16950141  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||| ||| | ||| |||||||||||    
T  16950140 tcgaatctctatccgacacaatact 16950116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1052
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| || | | ||  ||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  1575 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1476  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
    |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  1475 tcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1376  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  1375 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1276  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||     
T  1275 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtct 1176  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
     | ||||| ||| |||||||||||    
T  1075 tgtatccctatccgacacaatact 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 19147292 - 19147619
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |    
T  19147292 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctac 19147391  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  19147392 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 19147491  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  19147492 cactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 19147591  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19147592 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 19147619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 20746691 - 20747018
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |    
T  20746691 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctac 20746790  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  20746791 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 20746890  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  20746891 cactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 20746990  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20746991 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 20747018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 15102769 - 15102250
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  15102769 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15102670  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||    |||||||| || || || ||||| |  || |  |  |||||||| ||    
T  15102669 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaa 15102570  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    |||  |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  15102569 caa--cactctctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 15102472  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || ||||    
T  15102471 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcc 15102372  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  15102371 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15102272  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaata 536  Q
    |||||| | ||| |||||||||    
T  15102271 cggatctctatccgacacaata 15102250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14264412 - 14263871
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  14264412 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctac 14264313  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || | |||||| |  || || |  | |||||| ||    
T  14264312 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 14264213  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  14264212 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14264113  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||| |      ||||||    |||||||||| |  ||| |  |||||| ||||||||| ||    ||||| || |    
T  14264112 ttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttc 14264013  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  14264012 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 14263913  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||  | ||| ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  14263912 cggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 14263871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 15624632 - 15625152
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||  || |||||      
T  15624632 ggagtcaatttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaa 15624731  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |  |||||||  || || | ||| ||||| ||    
T  15624732 gcttatcatgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaa 15624831  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||  || || || |||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  15624832 aattacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactg 15624931  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||| | | |      |||||| |  | || ||||| |  ||| || |||||||||| ||||||||   ||| || || |    
T  15624932 ttattgtacgtgaactctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttc 15625031  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15625032 tttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 15625131  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaat 535  Q
     ||||| | ||||||||||||    
T  15625132 tggatctctatctgacacaat 15625152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 6413592 - 6414115
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  6413592 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctcc 6413691  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  ||| | || ||    
T  6413692 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccagacccaa 6413791  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  6413792 cacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 6413891  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  6413892 ttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 6413991  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || |||||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  6413992 tctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 6414091  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | |||||| ||| |||||||||||    
T  6414092 cagatccctatccgacacaatact 6414115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 538
Target Start/End: Original strand, 12455787 - 12456306
Alignment:
Q  19 tcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||| |   |||| |||| |||    
T  12455787 tcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgctt 12455886  T
Q  119 atcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaa 218  Q
     ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||| ||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||||      
T  12455887 gtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtctcatgtaccaagtccggtcccaacacc 12455986  T
Q  219 gcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgt 318  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||||| | |||  ||||||| |    
T  12455987 acactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccatacctatactcgaatggtaactgttat 12456086  T
Q  319 tgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctc 418  Q
    |||| || ||||| |||| |||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  || ||||||| ||||||||    || || ||||||||    
T  12456087 tgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattggatcgtcctctc 12456186  T
Q  419 tgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgga 518  Q
     | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  12456187 cgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcgga 12456286  T
Q  519 tcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  12456287 tccctatccgacacaatact 12456306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35965001 - 35964718
Alignment:
Q  54 gtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgcct 153  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  35965001 gtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgcct 35964902  T
Q  154 tcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgt 253  Q
    ||||||| ||   ||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||| |  |   |||| || || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  35964901 tcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcataccaacacaacggagt 35964802  T
Q  254 cctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
     || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  35964801 tctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaa 35964718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 14332480 - 14333018
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  14332480 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 14332579  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  14332580 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 14332679  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || |||||  | ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  14332680 cactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 14332779  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||    
T  14332780 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctct 14332879  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14332880 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14332979  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  14332980 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 14333018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15161244 - 15160706
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  15161244 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 15161145  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||  |||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15161144 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15161045  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  15161044 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 15160945  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15160944 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15160845  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15160844 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15160745  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  15160744 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15160706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 11237400 - 11236851
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  11237400 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 11237301  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||  |||| || ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  11237300 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 11237201  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||  |||| ||     
T  11237200 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaactatta 11237101  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  11237100 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 11237001  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  11237000 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 11236901  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | ||||||| || |||||||    
T  11236900 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatct 11236851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 26118774 - 26118250
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||     
T  26118774 aggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttcctt 26118675  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||| | ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  26118674 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 26118575  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  26118574 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 26118475  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  26118474 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 26118375  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || |||| || ||| ||| ||||||| ||||    
T  26118374 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacc 26118275  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  26118274 tcggatctctatccgacacaatact 26118250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12206950 - 12206643
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  12206950 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactct 12206851  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||||  || |||||||| ||||| |  || || |  |||||||| ||||   |||| || || ||    
T  12206850 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccga 12206751  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || ||||| | |||  |||| |||||||| || |||||     
T  12206750 ctcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactct 12206651  T
Q  333 atcaacgg 340  Q
    ||||||||    
T  12206650 atcaacgg 12206643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 13686147 - 13686685
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  13686147 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 13686246  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||  |||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  13686247 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 13686346  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  13686347 cactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 13686446  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13686447 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 13686546  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  13686547 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 13686646  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  13686647 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 13686685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 546
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15341043
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    ||||||||||   |||| |||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||| ||| ||||| || || || |    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcgtct 15340689  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
      || || |  |||||||| || | | |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  15340690 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccat 15340789  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
     || ||||| | |||  || |||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||    
T  15340790 acctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 15340889  T
Q  393 tcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    ||||||||    |  || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  | ||||||||||    
T  15340890 tcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 15340989  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15340990 tccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaa 15341043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 15204016 - 15204284
Alignment:
Q  72 aaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 171  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  15204016 aaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatca 15204115  T
Q  172 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccata 271  Q
     ||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||| || |   |||| || ||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15204116 acttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccata 15204215  T
Q  272 caaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||  || ||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  15204216 cagcgcttcaaatggttccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgg 15204284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16072462 - 16071939
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  16072462 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttc 16072363  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| ||| |||| |   | || |  || ||||| ||    
T  16072362 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaa 16072263  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  | | |||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  16072262 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16072163  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  ||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    ||||| ||||    
T  16072162 ttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgtcc 16072063  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| | |||||    
T  16072062 tctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacct 16071963  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  16071962 cggatctctatccgacacaatact 16071939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 535
Target Start/End: Original strand, 18177900 - 18178342
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||| || || |||||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
      || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 18178099  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
    ||| ||||||| |||| | || || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||| |    
T  18178100 tccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaga 18178199  T
Q  393 tcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    ||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| |    
T  18178200 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18178299  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
     ||||||  || ||||||| || ||||| | |||||| |||||    
T  18178300 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 18178342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11388595 - 11388055
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  |||||||||||   |||||||| |    
T  11388595 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-cttgaaactcatggtccttcctac 11388497  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  11388496 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 11388397  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  11388396 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaacta 11388297  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  | |||||| |||   || || ||||    
T  11388296 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcc 11388197  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  11388196 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 11388097  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  11388096 cggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaa 11388055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14286544 - 14286021
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  || || || ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    ||| ||||    
T  14286544 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctcc 14286445  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  14286444 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 14286345  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||||   ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  14286344 cacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14286245  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| |||||||| |||   || || ||||    
T  14286244 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcc 14286145  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||| |||| || |||  |||| || |||||    
T  14286144 tcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacct 14286045  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  14286044 cggatctctatccgacacaatact 14286021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 538
Target Start/End: Original strand, 21662117 - 21662564
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||| |||||| |||||  ||||    
T  21662117 cttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagt 21662216  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
     | ||| ||||  || ||||| |  |   ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  21662217 ctgttgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgcc 21662316  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 390  Q
    ||||| || |||| |||  |||| || |||||||| ||||| || || || | |      ||||||    | |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  21662317 attccaatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaaca 21662416  T
Q  391 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 490  Q
    | ||||||||   |||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| ||||||||||  ||||| ||  | | ||||||    
T  21662417 agtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaact 21662516  T
Q  491 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || ||||||  |||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||    
T  21662517 cttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatact 21662564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 13665629 - 13666141
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || ||||| || || |||| |||| | || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| |    
T  13665629 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctac 13665728  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || |||||||  || ||           | |    
T  13665729 gcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtttgatgaac-----------cca 13665816  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  13665817 acacaaaactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 13665916  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||| ||    || || |||    
T  13665917 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaatgattggatcgtc 13666016  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  13666017 ctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacc 13666116  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  13666117 tcggatccctatccgacacaatact 13666141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13968647 - 13968313
Alignment:
Q  204 tccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  13968647 tccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcg 13968548  T
Q  304 catgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 403  Q
      ||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  | ||||||||||| |||||       
T  13968547 agtgatagctgttgttataagtgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatga 13968448  T
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||    
T  13968447 ttgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaaccta 13968348  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13968347 gaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 13968313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 14037890 - 14038083
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  || ||||| | ||    
T  14037890 gtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgct 14037989  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcc 211  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  14037990 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14038083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 14347920 - 14348113
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  || ||||| | ||    
T  14347920 gtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgct 14348019  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcc 211  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  14348020 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14348113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15154842 - 15154525
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||| || || |    
T  15154842 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctac 15154743  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| | |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  ||   ||||||    
T  15154742 gcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaa--tc---tcctaa 15154648  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||| ||||     
T  15154647 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccatcccaatactagaatgataacta 15154548  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  15154547 ttattgtacgtgaactctatcaa 15154525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 41234 - 40796
Alignment:
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| | |||| ||||| | || ||||| || || || |  || ||||  || ||||| ||||    
T  41234 ttatcatgatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaaca 41135  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
      ||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||||||    
T  41134 ctgcaatctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgtt 41035  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    ||||| || ||     
T  41034 gttataagtaaactcaattaatgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctt 40935  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    ||  |||| ||||| || || || || || |||||||||| | | |||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||| | || || ||||| |    
T  40934 tcgatctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttg 40835  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    |||| | ||| || |||||||| ||||||| | ||||||    
T  40834 gatctctatccgaaacaatactcgaaggaagaccatgca 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 342
Target Start/End: Original strand, 12457065 - 12457187
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||||||||    
T  12457065 cactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgtt 12457164  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
     || || ||||||||||||||||    
T  12457165 atatgtgaactcaatcaacggta 12457187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 556
Target Start/End: Original strand, 14039981 - 14040317
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||    
T  14039981 cactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttatt 14040080  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| ||    ||||| || |||||     
T  14040081 gtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctcc 14040180  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || | |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||| || ||||    
T  14040181 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggat 14040280  T
Q  520 cccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  14040281 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14040317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 556
Target Start/End: Original strand, 14350011 - 14350347
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||    
T  14350011 cactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttatt 14350110  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| ||    ||||| || |||||     
T  14350111 gtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctcc 14350210  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || | |||  |||||||| | | ||||||  |||||||||| || ||||    
T  14350211 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggat 14350310  T
Q  520 cccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  14350311 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14350347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23516956 - 23516634
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  23516956 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 23516857  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||  | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |     
T  23516856 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcctaagac 23516757  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||  || ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  23516756 cactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 23516657  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  23516656 ttataagtgaactcgatcaacgg 23516634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 609 - 656
Target Start/End: Original strand, 13455422 - 13455469
Alignment:
Q  609 gtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13455422 gtcttgataggaacaaaatgtgttgacttcgtcaaccgatcaacaatc 13455469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23203370 - 23203263
Alignment:
Q  448 cagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaat 547  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||||     
T  23203370 cagaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 23203271  T
Q  548 atcatgca 555  Q
    | ||||||    
T  23203270 accatgca 23203263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23509497 - 23509390
Alignment:
Q  448 cagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaat 547  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||||     
T  23509497 cagaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 23509398  T
Q  548 atcatgca 555  Q
    | ||||||    
T  23509397 accatgca 23509390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Original strand, 19147682 - 19147815
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| |||| |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | |    
T  19147682 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 19147781  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  19147782 aagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 19147815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Original strand, 20747081 - 20747214
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| |||| |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | |    
T  20747081 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 20747180  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  20747181 aagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 20747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21937565 - 21936910
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21937565 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 21937466  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937465 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 21937366  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21937365 acttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatac 21937266  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937265 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 21937166  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937165 actctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 21937066  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21937065 ttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 21936966  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21936965 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 21936910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 24581202 - 24581856
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24581202 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactc 24581301  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24581302 aatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcaca 24581401  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24581402 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 24581501  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24581502 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaa 24581601  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24581602 actctgaatagtcctctctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaac 24581700  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24581701 ttagaagtaaacctcggatcccaatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccg 24581800  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24581801 acataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 24581856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 27011077 - 27011730
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27011077 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 27011176  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011177 tatccttcctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 27011276  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27011277 ttccggtcctaacaaagcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatacta 27011376  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27011377 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaac 27011476  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27011477 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaactt 27011576  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27011577 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcgacctcactatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctacagac 27011676  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27011677 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccaatcaacaatc 27011730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 655
Target Start/End: Original strand, 23503436 - 23504087
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  23503436 ccaacaaaacgaggattcaacttcctacacttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaa 23503535  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23503536 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcaccac 23503635  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  23503636 ttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccataccgacacta 23503735  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23503736 gaatgaaaattgttgttgttagtaaactcaatcaacggtaaacatttgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaac 23503835  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23503836 tctgaatagtcctctccgtctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtt-ccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 23503934  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  23503935 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggtataccatgcaacctcactatctgctcaatgtagatctcaaccaacttagctacagac 23504034  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaat 655  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23504035 ataccagtcttaataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaat 23504087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11211069 - 11210723
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11211069 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 11210970  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11210969 tatctttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaac 11210870  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11210869 ttccggtcctaacaaaacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatacta 11210770  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc 349  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11210769 gaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc 11210723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 61 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 25244669 - 25244072
Alignment:
Q  61 gattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||  || ||||| | |  ||| ||||||||    
T  25244669 gattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatctt 25244570  T
Q  161 ctcctgaatcatcttaaccttttccg--tagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctac 258  Q
    || ||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   || ||||||| |||||||  ||||    
T  25244569 cttctgaatcatcttaacattctccgcgtagtctctttcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctggtacataccaacacaacggtgctctac 25244470  T
Q  259 acctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaact 358  Q
    |||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  25244469 acctcgtaccatacatagcctctaacggtgacatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcattcaacggtaaacactcaacccaact 25244370  T
Q  359 gacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaat 458  Q
     |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||     
T  25244369 tacaccttgttctaaaacacaaaccctcaacagatcttccaaagattgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaac 25244270  T
Q  459 ctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatc 558  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  25244269 ctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttagaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatgcaatt 25244170  T
Q  559 taacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25244169 tgacaacctgctcaatgtagctctctaccaacctcgccatagacataccgatcttgataggaataaaatgctccgactttgtcaatcgatcaacaatc 25244072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 61 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 25308821 - 25308224
Alignment:
Q  61 gattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||  || ||||| | |  ||| ||||||||    
T  25308821 gattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatctt 25308722  T
Q  161 ctcctgaatcatcttaaccttttccg--tagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctac 258  Q
    || ||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   || ||||||| |||||||  ||||    
T  25308721 cttctgaatcatcttaacattctccgcgtagtctctttcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctggtacataccaacacaacggtgctctac 25308622  T
Q  259 acctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaact 358  Q
    |||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  25308621 acctcgtaccatacatagcctctaacggtgacatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcattcaacggtaaacactcaacccaact 25308522  T
Q  359 gacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaat 458  Q
     |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||     
T  25308521 tacaccttgttctaaaacacaaaccctcaacagatcttccaaagattgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaac 25308422  T
Q  459 ctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatc 558  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  25308421 ctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttagaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatgcaatt 25308322  T
Q  559 taacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25308321 tgacaacctgctcaatgtagctctctaccaacctcgccatagacataccgatcttgataggaataaaatgctccgactttgtcaatcgatcaacaatc 25308224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 16066040 - 16065521
Alignment:
Q  28 tacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgata 127  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066040 tacacatcaaagcacgcccaacaccagtcacgggattaactctaaaaaatacatgatcaccaacttggaattcaatatccttcctcctcttatcatgata 16065941  T
Q  128 gctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctct 227  Q
     |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||||    
T  16065940 actcttctccctagtctgagatgccttcatcttc--ctgaatcatcttaactttccctgtagtttgttgcaaaactttctgtcataacatagcattctct 16065843  T
Q  228 ccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 327  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||   | ||  |  |||  |||| ||| || ||||| |||||||| | ||||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  16065842 cctaactcataccaacacaacgactttctgaatttccttccatgcaacgcttcaaaaggtgccatcctgatactccaatgaaaattgttgttgtaagtaa 16065743  T
Q  328 actcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgccc 427  Q
    | |||||||||  |||||| ||   |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||| || ||||| |  || ||    
T  16065742 attcaatcaacaataaacagtcagtccaacttacaccttgttccaacacataagctcttaacaaatcttccaaagattgaattgttctctccgcatgacc 16065643  T
Q  428 atcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatct 527  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  ||||| | ||||| | ||||    
T  16065642 atcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaacttatttcccaaagctgcctgcaaactctccaaaaacttaaatataaacgttggatctctatct 16065543  T
Q  528 gacacaatactagaaggaatat 549  Q
    ||||||||  |||| |||||||    
T  16065542 gacacaatgttagatggaatat 16065521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 19566852 - 19566413
Alignment:
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  || ||||| ||||  | |||||| || ||| | |  | ||| || ||||| | ||||||| ||    
T  19566852 caaagcactctctcctgactcataccaacacaacgacgttctacatctcctcctatacaacgcttcagaagacgtcatcccaatactcgaatgaaaattg 19566753  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||| |    
T  19566752 tttttgtaagtaaattcaatcaatgttaagcattcgacccaacttacatcttgctccaaaacacaagctcttagcaaatcttccaaagattgaatagttc 19566653  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    ||||||  || || ||  | |||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  19566652 tctctgaatgaccgtccatttgaggatgataagcaaaaatcaaccttaacttagttcccaaagctgcttgcaaactctcgcaaaacttatatgtaaacct 19566553  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttg 614  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||  ||| || || | | |||||     
T  19566552 cggatctctatctgacacaatgctagatggaacattgtgcaatctgacaacctgctcaatgtagatctccgctaactttaccatagacaaatcggtctta 19566453  T
Q  615 ataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    ||||||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||    
T  19566452 ataggaataaaatgtgtcgacttcgtcaactgatcaacaa 19566413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 23573765 - 23574270
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  23573765 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 23573864  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  23573865 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 23573964  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  23573965 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 23574064  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  23574065 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 23574164  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  23574165 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 23574264  T
Q  515 cggatc 520  Q
     |||||    
T  23574265 tggatc 23574270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 25423212 - 25423753
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25423212 ggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 25423311  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |  ||||||||    
T  25423312 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaa 25423411  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  25423412 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 25423511  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||| | |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| |||     
T  25423512 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtct 25423611  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  25423612 tctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacct 25423711  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  25423712 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 25423753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21339595 - 21339108
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||||||||| || ||||   ||||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||| || ||||    
T  21339595 ctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgaa 21339496  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  21339495 tcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 21339396  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || || || |||||||| | |      |||||| |  | ||||||    
T  21339395 atacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 21339296  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||| |||||||||| | ||| ||   |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  21339295 tcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttag 21339196  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
      || ||| |  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  21339195 aacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21339108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 547
Target Start/End: Original strand, 20798783 - 20799315
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20798783 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 20798882  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  |  ||||||||    
T  20798883 gcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctttggtcctaa 20798982  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  20798983 gacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 20799082  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |    |||||| ||||    
T  20799083 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 20799182  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| | ||||||  || ||||||| ||    
T  20799183 tctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatct 20799282  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaat 547  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||||    
T  20799283 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaat 20799315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Original strand, 23516564 - 23517116
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || |||||  ||||||||||||  || || || |    
T  23516564 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctac 23516663  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  23516664 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 23516763  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  23516764 gaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 23516863  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  23516864 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 23516963  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||  |||||  |||||||||| ||    
T  23516964 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatct 23517063  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  23517064 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatct 23517116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 20468458 - 20467939
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||  || ||||| |     
T  20468458 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacg 20468359  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
     ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| || || |||||||  || || | ||  ||||| ||     
T  20468358 tttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaa 20468259  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  20468258 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgt 20468159  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||  ||||    
T  20468158 tattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcct 20468059  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
     || | ||| ||||| ||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  20468058 ttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctc 20467959  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  20467958 ggatctctatctgatacaat 20467939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 16356528 - 16357066
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16356528 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16356627  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16356628 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16356727  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16356728 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16356827  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16356828 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16356927  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16356928 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16357027  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  16357028 atccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 19769986 - 19770524
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  19769986 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19770085  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19770086 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19770185  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  19770186 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 19770285  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  19770286 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19770385  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  19770386 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19770485  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  19770486 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 19770524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21498399 - 21498101
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||  |||| |    
T  21498399 ggagtcaacttctttgacttcaattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctac 21498300  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21498299 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 21498200  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     |   |||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  21498199 aaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 21498101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27668850 - 27668312
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  27668850 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27668751  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27668750 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27668651  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  27668650 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27668551  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27668550 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27668451  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27668450 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27668351  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  27668350 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27668312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 567
Target Start/End: Original strand, 40708806 - 40709355
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| ||  | |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  40708806 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 40708905  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  40708906 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 40709005  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  40709006 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 40709105  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  40709106 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 40709205  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40709206 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 40709305  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||  |||||||||    
T  40709306 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatct 40709355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21984668 - 21984346
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21984668 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctac 21984569  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21984568 gcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 21984469  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||  |||     
T  21984468 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgattacta 21984369  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  21984368 ttattgtacgtgaactctatcaa 21984346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 529
Target Start/End: Original strand, 23440248 - 23440762
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || |||||  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  23440248 ggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgc 23440347  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||  || ||||  || |||  |||    
T  23440348 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggttttaa 23440447  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || |||||  |||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  23440448 gaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 23440547  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| |||||||||||||| || | |      |||||| |  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    ||||||  | |    
T  23440548 ttattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttc 23440647  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  23440648 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatct 23440747  T
Q  515 cggatcccgatctga 529  Q
     ||||| | ||||||    
T  23440748 tggatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 34566520 - 34567058
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  34566520 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 34566619  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  34566620 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 34566719  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  34566720 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 34566819  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  34566820 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 34566919  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  34566920 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 34567019  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  34567020 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 34567058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 18775800 - 18776324
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||||||||| |    
T  18775800 ggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgc 18775899  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  18775900 gcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 18775999  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||     
T  18776000 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataacta 18776099  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |   |       |||||| |  | |||||||| | |||||||  | ||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  18776100 ttattgtatgtgaactcgatcaatgacta-------tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 18776192  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  18776193 tctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 18776292  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  18776293 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 18776324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 22461957 - 22462284
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| || ||  | ||||||||||  |||||||| |    
T  22461957 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctac 22462056  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| || || || |||||||| || || | |||||| || ||    
T  22462057 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaa 22462156  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| | |||  |||||    
T  22462157 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 22462256  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  22462257 ttgttgtatgtaaattctatcaatggta 22462284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24749917 - 24749394
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  24749917 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24749818  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  24749817 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 24749718  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  24749717 catcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 24749618  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||| ||    || || ||||    
T  24749617 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcc 24749518  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||    
T  24749517 tctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacct 24749418  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || ||| | ||| |||||||||||    
T  24749417 cgaatctctatccgacacaatact 24749394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 41770868 - 41771406
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  41770868 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 41770967  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  41770968 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 41771067  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
     || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  41771068 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 41771167  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| | ||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  41771168 ttataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 41771267  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  41771268 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 41771367  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  41771368 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 41771406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Original strand, 23471254 - 23471783
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||  || | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || | ||| | |    
T  23471254 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgc 23471353  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||  ||||| || | |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||  || || || |    
T  23471354 ttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaa 23471453  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  23471454 ctacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgtt 23471553  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
     ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   ||||||  | |||    
T  23471554 attgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctc 23471653  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||| ||||  ||||| || ||  |||| || ||||||||||  || |||||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaa 23471783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 26739068 - 26738615
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||  || || || |    
T  26739068 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctac 26738969  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  26738968 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcctaa 26738869  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| || || || || || |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| | || | |||||    
T  26738868 aaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccattccattactggaataataactg 26738769  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||   |||||| || |    
T  26738768 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttc 26738669  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26738668 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttag 26738615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 655
Target Start/End: Original strand, 27610380 - 27611017
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  27610380 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27610479  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27610480 tatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27610579  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  27610580 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27610679  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27610680 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27610779  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27610780 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27610879  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgata 617  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  || || ||||| |||||||  || ||||  | ||   | || |||    
T  27610880 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaata 27610979  T
Q  618 ggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaat 655  Q
    || | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27610980 ggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaat 27611017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22236283 - 22235760
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  22236283 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 22236184  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |    
T  22236183 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctg-accatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtccca 22236085  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| | |||  ||||    
T  22236084 acacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaact 22235985  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||   || ||  ||    
T  22235984 gttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatc 22235885  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  22235884 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacc 22235785  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  22235784 ttggatccctatccgacacaatact 22235760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 22381204 - 22381735
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| || |    
T  22381204 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 22381303  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   ||||| || ||||| || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  22381304 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 22381403  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || ||||| |  ||| | |||    
T  22381404 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccatacctatactcgagtgatagctg 22381503  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    || || ||||    
T  22381504 ttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcc 22381603  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| | || |||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| || |||||    
T  22381604 tctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 22381703  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22381704 cggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 22381735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 655
Target Start/End: Original strand, 27518531 - 27519070
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  27518531 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 27518630  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  27518631 accactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 27518730  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  27518731 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 27518830  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  27518831 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 27518930  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttga 615  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | |||||||  |  ||||| ||||| |||||||  || ||||  | ||   | || |    
T  27518931 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 27519030  T
Q  616 taggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaat 655  Q
    |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27519031 taggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaat 27519070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17269637 - 17269369
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17269637 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcat 17269539  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  17269538 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 17269439  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  17269438 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggta 17269369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37291843 - 37291318
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  37291843 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataact 37291744  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  37291743 cttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 37291644  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  37291643 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 37291544  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  37291543 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatc 37291444  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||    
T  37291443 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 37291344  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||    
T  37291343 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 37291318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14887355 - 14886823
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  14887355 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 14887256  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  14887255 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 14887156  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  14887155 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 14887056  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  14887055 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 14886956  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  14886955 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 14886856  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  14886855 tcggatctctatctgacacaatgctagacggaa 14886823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27685760 - 27685222
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  27685760 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 27685661  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||  |||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27685660 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27685561  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  27685560 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataactatta 27685461  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27685460 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27685361  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27685360 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27685261  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  27685260 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27685222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 535
Target Start/End: Original strand, 22502683 - 22503204
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||     
T  22502683 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 22502782  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||  || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  22502783 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtccca 22502882  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  22502883 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatgccaatactcgagtgatagct 22502982  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  22502983 gttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 22503082  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  22503083 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 22503182  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  22503183 tcggatccctatccgacacaat 22503204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24735974 - 24735658
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  24735974 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24735875  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  24735874 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 24735775  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  24735774 catcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 24735675  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactc 331  Q
    |||||||| || |||||    
T  24735674 ttgttgtatgtgaactc 24735658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29476358 - 29475862
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| |    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtct 29476259  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
     ||| ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  29476258 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 29476159  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
    ||| ||||| | |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||    
T  29476158 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaa 29476059  T
Q  393 tcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    ||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||| ||||  |||||||||| |    
T  29476058 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttt 29475959  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaa 589  Q
     ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | ||||||| || || |||| || ||| || ||||| |||||    
T  29475958 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaa 29475862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 20821458 - 20821765
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||| ||||  || ||| | |    
T  20821458 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttac 20821557  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| || || ||||| || || || |  ||||| || |    
T  20821558 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggcccca 20821656  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||| ||||    
T  20821657 acacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataact 20821756  T
Q  314 gttgttgta 322  Q
    |||||||||    
T  20821757 gttgttgta 20821765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Original strand, 25848079 - 25848402
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || |||||||| |||||||| ||  | |||||||||| ||||||  ||    
T  25848079 aggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttc 25848178  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  25848179 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 25848278  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  25848279 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 25848378  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  25848379 gttgttataagtaaactcaatcaa 25848402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15000099 - 14999561
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  15000099 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacact 15000000  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14999999 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 14999900  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  14999899 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 14999800  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14999799 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 14999700  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||  || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||||| |  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14999699 ccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14999600  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  14999599 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14999561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 22134694 - 22135232
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  22134694 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgct 22134793  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22134794 tatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22134893  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||| | || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  22134894 cactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 22134993  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||| ||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  22134994 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaattctctagcgactgaattgtcctct 22135093  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22135094 ccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 22135193  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  22135194 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22135232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 23080361 - 23079929
Alignment:
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| || ||||| |  ||    
T  23080361 cctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtc 23080262  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
     ||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |      
T  23080261 tggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcgag 23080162  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    ||| | |||||||| || || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    |    
T  23080161 tgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgatt 23080062  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    | || |||||||| | ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||    
T  23080061 ggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctaga 23079962  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
     || ||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  23079961 ggtgaacctcgaatccctatccgatacaatact 23079929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24798761 - 24798229
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  |  ||||||||| |||||||||     
T  24798761 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttcctt 24798662  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||  ||||||| |||   |||||  | || || || ||||| || || || |  ||| |||| |    
T  24798661 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccagtccca 24798562  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  24798561 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 24798462  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    | |||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  24798461 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 24798362  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    || || | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||  || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaa 24798229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831779
Alignment:
Q  123 tgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcac 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    || | |||||||||||  ||||| |  || ||||  |||||||| ||||   |||    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  223 tctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgta 322  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| | |  |||||||||||||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  323 agtaaactcaatcaacggta 342  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  21831798 cgtgaactctatcaacggta 21831779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21891122 - 21890599
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  || || || |||| |||  | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  21891122 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 21891023  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  || | ||| ||    
T  21891022 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaa 21890923  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  21890922 cactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 21890823  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||| |||||| |   ||||   ||||| ||||||||| ||   |||||| || |    
T  21890822 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttc 21890723  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  21890722 tctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 21890623  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  21890622 cggatctctatccgacacaatact 21890599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22333247 - 22332709
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  22333247 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 22333148  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22333147 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22333048  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  22333047 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 22332948  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||  || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22332947 ttgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 22332848  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| |||||  |||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22332847 ccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 22332748  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  22332747 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22332709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 37545861 - 37545327
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctca-aaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcct 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||    
T  37545861 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttct 37545762  T
Q  113 cctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     | ||| ||||| || || ||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  ||||||||     
T  37545761 tcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtccc 37545662  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    |||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |  ||| | |    
T  37545661 aacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgccataccaatactcgagtgatagc 37545562  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| ||    
T  37545561 tgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgt 37545462  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
    |||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||  | || ||| | | ||| ||| ||||||| |||    
T  37545461 cctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaac 37545362  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaat 547  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||    
T  37545361 ctcggatctctatccgacacaatgctagacggaat 37545327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 20342286 - 20342810
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||  | || |||| ||| |||||||| |   | |||||||||| |||||| ||     
T  20342286 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttctt 20342385  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20342386 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 20342485  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  20342486 acacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20342585  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  20342586 gttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 20342685  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  20342686 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 20342785  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  20342786 tcggatctctatccgacacaatact 20342810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 28924131 - 28923555
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||||| || ||  | ||||| ||||  || ||||| |    
T  28924131 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 28924032  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||| || || || |  |||||||| |    
T  28924031 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtccca 28923933  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | |||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  28923932 aaacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaact 28923833  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || || || ||||| |||| |      ||||||    |||| ||||| |  |||||  | || | ||||||||| |||   || || |||    
T  28923832 gttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtc 28923733  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||| |||| |||||   ||||||| | ||||||||||    
T  28923732 ctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaacc 28923633  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    | || || | ||||||||| ||||| || |||||  |||||||  | ||||| | || ||||||||| || |||||||    
T  28923632 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaact 28923555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28895305 - 28894998
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||||| || ||  | ||||| ||||  || ||||| |    
T  28895305 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 28895206  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||| || || || |  |||||||| |    
T  28895205 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtccca 28895107  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | |||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  28895106 aaacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaact 28895007  T
Q  314 gttgttgta 322  Q
    |||||||||    
T  28895006 gttgttgta 28894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 322
Target Start/End: Original strand, 20773870 - 20774072
Alignment:
Q  120 tcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaag 219  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| || || || ||||| || || || | ||||||||| || | |     
T  20773870 tcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaa 20773969  T
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    || | ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||  ||||||||||    
T  20773970 cattttctcccgactcgaaccaacataaaggagtcttacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgtt 20774069  T
Q  320 gta 322  Q
    |||    
T  20774070 gta 20774072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21564119 - 21564009
Alignment:
Q  232 actcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 331  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || |||||    
T  21564119 actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactc 21564020  T
Q  332 aatcaacggta 342  Q
     ||||||||||    
T  21564019 tatcaacggta 21564009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8814339 - 8814243
Alignment:
Q  40 cacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctg 136  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  8814339 cacgtccaacaccgattacaggattcactctcaaaaatatatgatcttcaacctgaaactcaatatcctttctcttcttatcatggtaactcttctg 8814243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Original strand, 22348547 - 22348987
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| | |||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  22348547 cttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 22348646  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  22348647 actactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 22348746  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   | ||||||||| |  |    |||||| |||||    
T  22348747 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcct 22348846  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  22348847 ctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 22348946  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| || || || ||||||| | |||||||    
T  22348947 ggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 22348987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24716493 - 24716366
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||| |    
T  24716493 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtga 24716394  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24716393 acctcgaatctctatccgacacaatact 24716366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24620262 - 24620135
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||| |    
T  24620262 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtga 24620163  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  24620162 acctcgaatctctatccgacacaatact 24620135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23442656 - 23442511
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||| || || |||||||  |||| || || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  23442656 ggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctac 23442557  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23442556 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 23442511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1148 - 1064
Alignment:
Q  258 cacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1148 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggta 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24737148 - 24737012
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  24737148 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24737049  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgc 151  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24737048 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 591
Target Start/End: Original strand, 22462364 - 22462533
Alignment:
Q  422 ctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcc 521  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||     
T  22462364 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 22462463  T
Q  522 cgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    | ||||||||| ||||| || ||||   |||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  22462464 ctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaact 22462533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 337
Target Start/End: Original strand, 21404944 - 21405167
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||   ||||| ||||||||| || ||||| | ||| ||||  || ||||| |      
T  21404944 cttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctggtcccagt 21405043  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaa--gcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |   || |||| ||||||||| ||||||| ||||  || || || ||||||||||||||   || || |||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  21405044 atcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaact 21405143  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||    
T  21405144 gttattataagtgaactcgatcaa 21405167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 28916380 - 28916200
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || | |||||| ||| |||| |||||   ||||||| | |||||||    
T  28916380 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaa 28916281  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    |||| || || | ||||||||| ||||| || |||||  |||||||  | ||||| | || ||||||||| || |||||||    
T  28916280 accttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaact 28916200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 17269226 - 17269166
Alignment:
Q  486 aaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  17269226 aaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 17269166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 28894909 - 28894729
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||||||  || |||| |||||   ||||||| | |||||||    
T  28894909 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaa 28894810  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    |||| || || | ||||||||| ||||| || |||||  |||||||  | ||||| | || ||||||||| || |||||||    
T  28894809 accttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaact 28894729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 538
Target Start/End: Original strand, 21496592 - 21496686
Alignment:
Q  444 taagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| |||||||| || |||||||  ||||  |||  ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21496592 taagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 21496686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21831701 - 21831604
Alignment:
Q  438 ggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 535  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||||||||||||    
T  21831701 ggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctctatctgacacaat 21831604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Original strand, 20573546 - 20573626
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaa 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20573546 agtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 591
Target Start/End: Original strand, 20774160 - 20774340
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |  ||||| ||| |||| |||||   ||||||  | |||||||    
T  20774160 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaa 20774259  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    |||| || || |  |||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  20774260 accttgggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 20774340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 562; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 23504 - 24157
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  23504 ccaacaaaacgagcagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaa 23603  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23604 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 23703  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704 ctccggtcctaacaaagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 23803  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23804 gcatgaaaaatgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaac 23903  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23904 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 24003  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  24004 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgac 24103  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24104 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 24157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 46264 - 46917
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46264 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 46363  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46364 tatcctttctcctcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 46463  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46464 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 46563  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46564 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 46663  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46664 tctgaatagtcctctctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaatt 46763  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  46764 agaaataaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctcacaatctgcttaatgtagatctctgtcaacttcgccacagac 46863  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46864 ataccaatcttaataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 46917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15293350 - 15292698
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15293350 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 15293251  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15293250 tatccttcctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaac 15293151  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15293150 ttccggtcctaacaaagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 15293051  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15293050 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacactttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaac 15292951  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15292950 tctgaatagtcctctatgtctgcccatcgatctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacat 15292851  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  15292850 agaagtaaacctc-gatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatttgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgac 15292752  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15292751 ataccggtcttgataggaacaaaatgtgctgacttagtcaaccgatcaataatc 15292698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 14997395 - 14998048
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14997395 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 14997494  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997495 tatcctttctcctcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 14997594  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14997595 tttcggtcctaacaaagcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatacta 14997694  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997695 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 14997794  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997795 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 14997894  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  14997895 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaacctcactatctgctcaatgtagatctcagccaacttcggtacaatc 14997994  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14997995 atacccgtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 14998048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 9290914 - 9291567
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9290914 ccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaa 9291013  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291014 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 9291113  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9291114 ttccggtcctaacaaagcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 9291213  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9291214 gaatgaaaactgctgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaac 9291313  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291314 tctaaatagtcctctccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 9291413  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  9291414 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatgcaatcttacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctactgac 9291513  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9291514 ataccagtctttataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 9291567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 13247724 - 13248377
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13247724 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 13247823  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247824 tatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 13247923  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  13247924 ttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccatcctaatacta 13248023  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248024 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 13248123  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13248124 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaactt 13248223  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13248224 agaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaatatcattcaatataacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacaaac 13248323  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13248324 ataccagtcttaataggaacaaaatgtgttgacttcgtcaaccgatcaacaatc 13248377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12343041 - 12342403
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| | |||  |||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12343041 gtcaacttccgacacttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcaatattcttcctcctct 12342942  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||    
T  12342941 tatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacctccggtcctagtaa 12342842  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
    |||||| || || |||||| ||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  12342841 agcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgccatcccaatactagaatgaaaattgttg 12342742  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  12342741 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctct 12342642  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12342641 ccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcag 12342542  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgata 617  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  12342541 atcttgatctgacacaatactagatggaattccatgcaaccagacaatcttctcaatgtagatctcaaccaacctcgccacagacataccggtcttgata 12342442  T
Q  618 ggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||| |  |||||  |||||||||||| ||||    
T  12342441 ggaacaaaatgtgtcgacttcatcaaccgatcaaaaatc 12342403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55375551 - 55375177
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  55375551 ccaacaaaacgagaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 55375452  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55375451 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaac 55375352  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55375351 ttctggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 55375252  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 377  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55375251 gaatgtaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgcttcaaaaca 55375177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 541
Target Start/End: Original strand, 16685331 - 16685870
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |     
T  16685331 gcccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaatta 16685430  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  16685431 aatatccttcatcctcttatcatgataaattttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtctcttgcaca 16685530  T
Q  201 -acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgata 299  Q
     |  |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16685531 taaat--ggtcctaacaaagcactctatcctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaata 16685628  T
Q  300 ctagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctcca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16685629 ctagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaactcaacttaaaccttgctccaaaacacaagctttcaacagatcttcca 16685728  T
Q  400 aactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaa 499  Q
    ||   |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  16685729 aagattgaataggtctctccatctgcccatcggtctgaggatgatacgcataactcaacctcaacttagttcccaaagctacttgcaggctctcccaaaa 16685828  T
Q  500 cttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactaga 541  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||    
T  16685829 cttcgaagtaaacctcggatctctatccaacacaatgctaga 16685870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16445405 - 16445175
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16445405 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 16445306  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16445305 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttatgtagtttcttgcacaac 16445206  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggac 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16445205 ttccagtcctaacaaagcactctctccggac 16445175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12132602 - 12132291
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12132602 ccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 12132503  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12132502 tgtccttcctcctcttatcatgacaactcttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 12132403  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| || ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| ||||  || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12132402 ttctggacctaacaaaacactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatacta 12132304  T
Q  303 gcatgaaaactgt 315  Q
    | |||||||||||    
T  12132303 gaatgaaaactgt 12132291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9849656 - 9849081
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||  | |  || |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |    
T  9849656 gtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgacttgaaattcaatatccttcctctgtt 9849557  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| | ||||| | ||     
T  9849556 tatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtctgctgaacaactcctggtccaatcat 9849457  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||  | | ||| | ||||  || |||||  | ||||| |||||||| |  ||||| | ||||||| |||||    
T  9849456 agcactttctcctgactcataccaacacaacattattctatatctccttccgtacaacacttcaaaaggtgccatactaatactcgaatgaaaattgttg 9849357  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||   |||||| || || |||||| |||||||  | || |||||||| || |||  ||| || || ||||    
T  9849356 ttgtaagtgaattcaatcaacggtaagcattcactccaactcactccctgctcctaaacacacacccttaacaaatcttctaaagactggatggttctct 9849257  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | ||||| | |||  | ||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  9849256 ccgtctgactatc-atttgaggttgttaagtagaactcaacctcaacttcgttcccaacgcttcttgcaaactctcccaaaactttgatttaaacctcag 9849158  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcg 594  Q
    ||  | ||||| ||||||  |||| |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  9849157 atatctatctggcacaatgatagatggaataccatgcaatatgataatcttctcaatgtagatctctgcaaacttcg 9849081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18227366 - 18226838
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| || |||||| |     
T  18227366 gagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcg 18227267  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  18227266 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctcgggtcctaag 18227167  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | || || || |||| |||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  18227166 accactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 18227067  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  18227066 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 18226967  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||     
T  18226966 ctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatctt 18226867  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaagg 544  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18226866 ggatctcgatctgatacaatgctcgaagg 18226838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14851271 - 14850756
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || | || || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||| ||    
T  14851271 acttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataact 14851172  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||| |||||||| |   ||||||| ||     
T  14851171 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacct 14851072  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||| | |||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| || ||||    
T  14851071 gactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaact 14850972  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   ||||||  | || || | ||| |||||    
T  14850971 ctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatc 14850872  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||     
T  14850871 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgat 14850772  T
Q  531 acaatactagaaggaa 546  Q
    ||||| || |||||||    
T  14850771 acaatgctcgaaggaa 14850756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 591
Target Start/End: Original strand, 14680736 - 14681234
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
      || ||||  || |||||||| |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14680935  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
    ||| ||||||| |||| |||| || |||||  | ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14680936 tccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 14681035  T
Q  393 tcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 492  Q
    ||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  14681036 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14681135  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  14681136 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaact 14681234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 16252366 - 16251790
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  16252366 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgc 16252267  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || | ||  || ||||||||    
T  16252266 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcctaa 16252167  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||     
T  16252166 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaatgataacta 16252067  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||  |||||||||||| |    |||||| ||||    
T  16252066 ttattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcc 16251967  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  16251966 tctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16251867  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||| || || ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  16251866 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaact 16251790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Original strand, 14652401 - 14652724
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  14652401 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgc 14652500  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||| || |    
T  14652501 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaa 14652600  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
    |  ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||||||    
T  14652601 atacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgtt 14652700  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
     ||||| || || || ||||||||    
T  14652701 attgtacgtgaattctatcaacgg 14652724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 12476694 - 12477232
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  12476694 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgct 12476793  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |  || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12476794 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 12476893  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  12476894 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 12476993  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||      |||||| |||||||    
T  12476994 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctct 12477093  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  12477094 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 12477193  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  12477194 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12477232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19778711 - 19778173
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  19778711 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19778612  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19778611 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19778512  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
     || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  19778511 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 19778412  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  19778411 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctct 19778312  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  19778311 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19778212  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  19778211 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 19778173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1640292 - 1639805
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  || |||||   |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||    
T  1640292 ctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttgaa 1640193  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |   | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  1640192 tcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatcttcgacc 1640093  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| || | || |||||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | ||||||    
T  1640092 atacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgc 1639993  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||| |||||||||| |||||||    |||||| || || || | ||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||||| | |||||||| |    
T  1639992 tcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcg 1639893  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  1639892 aacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 1639805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15415189 - 15414882
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| || | || |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||  || ||||| | |||||||||||| ||||    
T  15415189 ttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactct 15415090  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||||||||||   ||||  || |||||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||   |||| || || ||    
T  15415089 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatcaatttgaccttttccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 15414990  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || |||||     
T  15414989 ctcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactct 15414890  T
Q  333 atcaacgg 340  Q
    ||||||||    
T  15414889 atcaacgg 15414882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16355366 - 16354835
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || | |||  ||||||| |||| ||| ||||| |    
T  16355366 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgc 16355267  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||||||  | || |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16355266 gcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16355167  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||     
T  16355166 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaatgataacta 16355067  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  16355066 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16354967  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  16354966 tctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 16354867  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||  | |||||| ||||| || |||||||    
T  16354866 tggatatctatctgatacaatgctcgaaggaa 16354835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 27711430 - 27711968
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  27711430 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 27711529  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27711530 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27711629  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  27711630 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27711729  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27711730 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27711829  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27711830 ccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27711929  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  27711930 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 27711968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29039322 - 29038784
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  29039322 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 29039223  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  29039222 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 29039123  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  29039122 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 29039023  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  29039022 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 29038923  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  29038922 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 29038823  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  29038822 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 29038784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 12523770 - 12524308
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |  |    
T  12523770 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggt 12523869  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12523870 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaaac 12523969  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  12523970 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 12524069  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  12524070 ttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 12524169  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||    
T  12524170 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgg 12524269  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  12524270 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12524308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 18297299 - 18297837
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  18297299 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 18297398  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  18297399 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 18297498  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  18297499 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 18297598  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  18297599 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 18297698  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | || |||  |||||||||| || ||    
T  18297699 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttgg 18297798  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  18297799 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18297837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 331
Target Start/End: Original strand, 14159646 - 14159899
Alignment:
Q  78 acatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 177  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14159646 acatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaa 14159745  T
Q  178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||  |||||||| || |   || |||| || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  14159746 ccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagc 14159845  T
Q  278 ctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || |||||    
T  14159846 ctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactc 14159899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 8386506 - 8387079
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  8386506 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 8386605  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8386606 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 8386705  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  8386706 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataactatta 8386805  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  8386806 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8386905  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  8386906 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8387005  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  8387006 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 8387079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 23955841 - 23956379
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  23955841 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 23955940  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23955941 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 23956040  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||     
T  23956041 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 23956140  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     |||| || |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  23956141 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 23956240  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  23956241 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 23956340  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  23956341 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 23956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 44662048 - 44661524
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| |||    
T  44662048 aggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 44661949  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||| | || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  44661948 cgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 44661849  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  44661848 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 44661749  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaa-acattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagt 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  || | | | |||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| ||    
T  44661748 gttgttataagtaaactcaatcaaagacaagagact-gtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgt 44661650  T
Q  413 cctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaac 512  Q
    |||||  | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  44661649 cctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaac 44661550  T
Q  513 ctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||    
T  44661549 ctcggatctctatccgacacaatact 44661524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3264976 - 3264452
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  3264976 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 3264877  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  3264876 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 3264777  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  3264776 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 3264677  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  3264676 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 3264577  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  3264576 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 3264477  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  3264476 tcggatctctatccgacacaatact 3264452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8053443 - 8053003
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| ||||||||     
T  8053443 cttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaag 8053344  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   | |||||||| || ||||||||||| ||| | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  8053343 accactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 8053244  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  8053243 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 8053144  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  8053143 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8053044  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||    
T  8053043 ggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 8053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15359212 - 15358944
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||   |||| || | ||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    ||||||    
T  15359212 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15359113  T
Q  174 ttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccataca 273  Q
    || ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  15359112 tttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccataca 15359013  T
Q  274 aagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||  | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15359012 aagcttcgaacggtgccataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 15358944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15147595 - 15147264
Alignment:
Q  225 tctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaag 324  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || || || |    
T  15147595 tctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacg 15147496  T
Q  325 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg 424  Q
    | |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | |||    
T  15147495 tgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactg 15147396  T
Q  425 cccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccga 524  Q
     ||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||||| | |    
T  15147395 accatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctcta 15147296  T
Q  525 tctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  15147295 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15147264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14303896 - 14303358
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  14303896 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 14303797  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14303796 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 14303697  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  14303696 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactatta 14303597  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  14303596 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctct 14303497  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14303496 ccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14303397  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  14303396 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 535
Target Start/End: Original strand, 8706225 - 8706529
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| || || |||| |||||  ||||||| |||  ||||||||||||| || ||||    
T  8706225 gactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaact 8706324  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||||| |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  8706325 ctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatc 8706424  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||    
T  8706425 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 8706524  T
Q  531 acaat 535  Q
    |||||    
T  8706525 acaat 8706529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 20891072 - 20891596
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||     
T  20891072 aggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 20891171  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | | || || || ||||| || || || |  | |||||| |    
T  20891172 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtccca 20891271  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||| | ||    
T  20891272 acacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagct 20891371  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     ||||| || || ||||||||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    || || |||    
T  20891372 attgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtc 20891471  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  20891472 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 20891571  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||   ||| |||||||||||    
T  20891572 tcggatctttatccgacacaatact 20891596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1649456 - 1648935
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || || | |||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||||| |    
T  1649456 agtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgc 1649357  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    || || || || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| | ||||| || || | |||||| || || || |  |||||||| |||    
T  1649356 ttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatt-atcttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaac 1649258  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   |||||||||  ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||||    
T  1649257 accacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaactgt 1649158  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    || || |||||    
T  1649157 tgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcct 1649058  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| | ||||  | ||||| ||||||    
T  1649057 ctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctc 1648958  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| | ||| |||||||||||    
T  1648957 ggatctctatccgacacaatact 1648935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 40473134 - 40473672
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  40473134 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 40473233  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  40473234 tatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcctaagac 40473333  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || | |||| ||     
T  40473334 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataactatta 40473433  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  40473434 ttgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 40473533  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40473534 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 40473633  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  40473634 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 40473672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 342
Target Start/End: Original strand, 27900528 - 27900804
Alignment:
Q  66 accctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-c 164  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |    
T  27900528 accctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctc 27900627  T
Q  165 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctcc 264  Q
    ||| ||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  27900628 tga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctcc 27900726  T
Q  265 gaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  27900727 gaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggta 27900804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51606303 - 51606035
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||  || ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  51606303 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcat 51606205  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| | || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  51606204 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 51606105  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  51606104 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggta 51606035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 29453719 - 29453195
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  29453719 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 29453620  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  ||| |||| |    
T  29453619 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtccca 29453520  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  29453519 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 29453420  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  29453419 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 29453320  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  29453319 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 29453220  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  29453219 tcggatctctatccgacacaatact 29453195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 16146003 - 16146330
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||   ||||||| |    
T  16146003 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 16146102  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||| ||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  16146103 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 16146202  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  16146203 cacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16146302  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    || ||||| || || || ||||||||||    
T  16146303 ttattgtatgtgaattctatcaacggta 16146330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Original strand, 15070506 - 15070831
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || | |    
T  15070506 agtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgc 15070605  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    || ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||    
T  15070606 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaaca 15070705  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       |||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||||    
T  15070706 ctacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 15070805  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  15070806 gttgtacgtgaactctatcaacggta 15070831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 538
Target Start/End: Original strand, 15077831 - 15078249
Alignment:
Q  120 tcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaag 219  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||       
T  15077831 tcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacta 15077930  T
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||    
T  15077931 cactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgtt 15078030  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   |||||| || ||||      
T  15078031 gtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctcttc 15078130  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  15078131 gactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcggat 15078230  T
Q  520 cccgatctgacacaatact 538  Q
    | | ||| |||||||||||    
T  15078231 ctctatccgacacaatact 15078249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15149926 - 15149764
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |     
T  15149926 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcg 15149827  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 178  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15149826 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 15149764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15003546 - 15003218
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||     || ||     
T  15003546 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttcta 15003447  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |    
T  15003446 cgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15003347  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  15003346 acaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15003247  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15003246 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 15003218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11207413 - 11207094
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  11207413 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 11207314  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11207313 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 11207214  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  11207213 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11207114  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaa 333  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  11207113 gttgttataagtgaactcaa 11207094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 15246015 - 15246538
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||  | || |||| |||||||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  15246015 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctac 15246114  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| | |||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  15246115 gtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15246214  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||| |  |||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||   ||||    
T  15246215 cacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtgactg 15246314  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        |||||||   |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || || |    
T  15246315 ttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttc 15246414  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  15246415 tctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15246514  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || ||| | ||| || ||||||||    
T  15246515 cgaatctctatccgatacaatact 15246538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 7090523 - 7090821
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || |  ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  7090523 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 7090622  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  7090623 gcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 7090722  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  7090723 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccattctaatactagaatgataact 7090821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 18550018 - 18549682
Alignment:
Q  238 accaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  18550018 accaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaattgttgttataagtaaactcaattaa 18549919  T
Q  338 cggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctga 437  Q
     || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |||||    || || || || || ||||| ||||| || ||     
T  18549918 tggcaagtaagcatcccaactccctccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattggatggttctttcggtctgaccatcagtttgt 18549819  T
Q  438 ggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 537  Q
    || || || |||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| | || || ||||| ||||| | ||| || |||||||    
T  18549818 gggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatac 18549719  T
Q  538 tagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaat 574  Q
    | ||||||| | |||||||  | || |||||||||||    
T  18549718 tcgaaggaacaccatgcaacttcactatctgctcaat 18549682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 33223012 - 33223268
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||  ||||| || | ||    
T  33223012 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgct 33223111  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| ||| || || || |||||||| || || |  || ||||| ||||     
T  33223112 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacac 33223211  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaa 274  Q
      |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  33223212 cacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaa 33223268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 538
Target Start/End: Original strand, 33223411 - 33223537
Alignment:
Q  412 tcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  33223411 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 33223510  T
Q  512 cctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  33223511 cctcggatctctatccgacacaatact 33223537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14266742 - 14266495
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    ||||||| |||||| || |||||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
      || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14266543  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||| ||||| | |||| | || || ||||| || ||||| ||||||||    
T  14266542 tccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacgg 14266495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 546
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691524
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||   |||||| || || || | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 14691524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 535
Target Start/End: Original strand, 15319653 - 15319762
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||    
T  15319653 ccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctat 15319752  T
Q  526 ctgacacaat 535  Q
    ||||||||||    
T  15319753 ctgacacaat 15319762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16676546 - 16676461
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 178  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16676546 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttaaatcatcttaac 16676461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15358875 - 15358748
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct-cccaaaacttagaagta 509  Q
    |||||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||     
T  15358875 gtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatctt-gaagtg 15358777  T
Q  510 aacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  15358776 aacctcggatctctatccgacacaatact 15358748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 16752738 - 16752850
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| |||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |    
T  16752738 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttccctta 16752837  T
Q  169 tcatcttaacctt 181  Q
    ||||||| |||||    
T  16752838 tcatcttgacctt 16752850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11207043 - 11206889
Alignment:
Q  384 ctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagctt 483  Q
    ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | |    
T  11207043 ctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcct 11206944  T
Q  484 gcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||||| | | ||| ||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  11206943 gtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 11206889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 556
Target Start/End: Original strand, 7090915 - 7091064
Alignment:
Q  407 aatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaa 506  Q
    ||| |||||||| | ||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | | ||||  |||||    
T  7090915 aatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaa 7091014  T
Q  507 gtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||  | ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  7091015 gtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7091064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 511
Target Start/End: Original strand, 14159972 - 14160057
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14159972 ccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 14160057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 15003155 - 15003022
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | |    
T  15003155 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 15003056  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| |||||||| || |  || |||||||||||    
T  15003055 aagtgaacctcgggtctctttccgacacaatact 15003022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24831920 - 24831267
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24831920 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 24831821  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831820 tatccttcgttctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 24831721  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831720 ttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 24831621  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831620 acatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 24831521  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24831520 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaactt 24831421  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  24831420 agaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgac 24831321  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24831320 ataccagtcttgataggaataaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 24831267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 22275989 - 22276641
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22275989 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 22276088  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276089 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 22276188  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22276189 ttccagtcctaacaaggcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 22276288  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276289 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 22276388  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276389 tctgaatagtcctctccgtctacccatcagtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 22276488  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  22276489 agaagtaaacctcggatcccgatc-gacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacctcgctacagac 22276587  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22276588 ataccagtcttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 22276641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24570401 - 24569748
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24570401 ccaacaaaacgaggagtcaacttccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaa 24570302  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24570301 tatcctttctcctcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaac 24570202  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24570201 ttccggtcctaacaaaacactttctcctaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatacta 24570102  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24570101 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacactcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaac 24570002  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24570001 tctgaatagtcctttctgtttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaactt 24569902  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24569901 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcgatgtagatctcacccaacttcgccacagac 24569802  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24569801 ataccagtcctgataggaacaaaatgcgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 24569748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 22762298 - 22761649
Alignment:
Q  7 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatc 106  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22762298 caaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatc 22762199  T
Q  107 cttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttcc 206  Q
     ||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22762198 tttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttcc 22762099  T
Q  207 ggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcat 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22762098 ggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaat 22761999  T
Q  307 gaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22761998 gaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttg 22761899  T
Q  407 aatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaa 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22761898 aagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaa 22761799  T
Q  507 gtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatac 606  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  22761798 gtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatgcaacctaacaatatgctcaatgtagatctcagccaacttcgacccagacatac 22761699  T
Q  607 ccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||    
T  22761698 cagtcttgataggaacaaaatgtgccaagttcgtcaaccgatcaacaatc 22761649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 25128357 - 25129010
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25128357 ccaacaaaaagaggagtaaactttcgacaattcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 25128456  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  25128457 tgtccttcctcctttcatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaac 25128556  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  25128557 ctccgatcctaacaaaacactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatactt 25128656  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  25128657 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaatcctctaaac 25128756  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25128757 tctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaactt 25128856  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  25128857 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaacttcaccatagac 25128956  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||    
T  25128957 ataccggtcttgataggaacaaaatgtgtcgacttcatcaaccgatcaacaatc 25129010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817123
Alignment:
Q  70 tcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 169  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  170 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacca 269  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  270 tacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  370 ccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  470 tcccaaagcagcttgca----------aactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 559  Q
    |||||||||||||||||          |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaactttcccaaaacttataagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacct 23817220  T
Q  560 aacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23817219 cacaatctgttcaatgtagatctcaaccaacttcgccatagacataccagacttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaatc 23817123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12640652 - 12640263
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  12640652 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaa 12640553  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640552 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 12640453  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12640452 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 12640353  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640352 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 12640263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 264 - 462
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890951
Alignment:
Q  264 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacac 23890852  T
Q  364 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23890853 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcatccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 23890951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 370 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 21906535 - 21906251
Alignment:
Q  370 ccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 469  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21906535 ccaaaacacatgctctcaacaaatcttccaaagtttgaatagtcctctatgtctgcccatcagtctgaggatgataagcagaactcaaccttaacttagt 21906436  T
Q  470 tcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgc 569  Q
    ||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  21906435 tcccagagccacttgcaaaatttcccaaaacttagaagtaaaccttggatccctatttgacccaatactataaggaatatcatgcaatatgacaacatgc 21906336  T
Q  570 tcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaa 654  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||| || |||||| |  ||||| ||||| ||||||||||    
T  21906335 tcaatatagatctctgccaacctcgccacaaacataccggtcttgatagaaataaaatgtgtcgacttcgtcaaacgatcaacaa 21906251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24708204 - 24707662
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| |||||||||     
T  24708204 aggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctg 24708105  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || |||| ||| |||||||    
T  24708104 cgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtccta 24708005  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24708004 agaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataact 24707905  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||| ||||| || |    |||||| |||    
T  24707904 attattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtc 24707805  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||| |    
T  24707804 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatc 24707705  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  24707704 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24707662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 23063799 - 23064340
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  23063799 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 23063898  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||  || ||||||||    
T  23063899 gcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcctaa 23063998  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   |||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||| ||||     
T  23063999 gaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatacttgaatgataacta 23064098  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |||  ||||||  |||    
T  23064099 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaaaagactgaatcatcc 23064198  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  23064199 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaact 23064298  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  23064299 tggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 23064340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 555
Target Start/End: Original strand, 10868575 - 10869112
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  10868575 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgct 10868674  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10868675 tatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10868774  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  10868775 caccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattg 10868874  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  10868875 ttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10868974  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  10868975 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10869074  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  10869075 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 10869112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 24709758 - 24710296
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  24709758 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 24709857  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24709858 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24709957  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
     || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  24709958 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataactatta 24710057  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24710058 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24710157  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  24710158 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24710257  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  24710258 atctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 24710296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24826003 - 24825471
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || || |||||||||| ||||||  | | ||||||||  || ||||| |    
T  24826003 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctac 24825904  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||  || |||| ||| ||||| ||    
T  24825903 gcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaa 24825804  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||     
T  24825803 aactacactctcacctgactcaacccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaacta 24825704  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||| || ||||    |||||| || |    
T  24825703 ttattatacgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttc 24825604  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24825603 tttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 24825504  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaat 547  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||||    
T  24825503 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaat 24825471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 9609861 - 9610399
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||||||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  9609861 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 9609960  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9609961 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 9610060  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  9610061 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 9610160  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  9610161 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 9610260  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  9610261 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 9610360  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  9610361 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 9610399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 16998725 - 16999263
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16998725 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16998824  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16998825 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16998924  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16998925 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16999024  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16999025 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16999124  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16999125 ccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16999224  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  16999225 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16999263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21325987 - 21325473
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21325987 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 21325888  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21325887 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaa 21325788  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||     
T  21325787 gaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaataataacta 21325688  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  21325687 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 21325588  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  21325587 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21325488  T
Q  515 cggatcccgatctga 529  Q
     ||||| | ||||||    
T  21325487 tggatctctatctga 21325473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 16981877 - 16982450
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | ||    
T  16981877 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 16981976  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16981977 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16982076  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16982077 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16982176  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  16982177 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 16982276  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16982277 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16982376  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  16982377 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 16982450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 17063442 - 17064015
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | ||    
T  17063442 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 17063541  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17063542 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17063641  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  17063642 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 17063741  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  17063742 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 17063841  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  17063842 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17063941  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  17063942 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 17064015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 17067100 - 17067673
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| || |||| ||| || || | ||    
T  17067100 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 17067199  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17067200 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17067299  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  17067300 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 17067399  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || ||||    
T  17067400 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 17067499  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  17067500 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17067599  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  17067600 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 17067673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27365800 - 27365259
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  27365800 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 27365701  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  27365700 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 27365601  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  27365600 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 27365501  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || ||||    
T  27365500 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcc 27365401  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  27365400 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 27365301  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| | |||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  27365300 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 27365259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11358596 - 11358064
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| |||    
T  11358596 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 11358497  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11358496 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 11358397  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  11358396 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11358297  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  11358296 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 11358197  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  11358196 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 11358097  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  11358096 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaa 11358064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Original strand, 24675211 - 24675787
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  24675211 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 24675310  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  24675311 gcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 24675410  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  24675411 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 24675510  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||||||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| |    ||||||  |||    
T  24675511 ttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaatcctctagcgactgaatcatcc 24675610  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  24675611 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 24675710  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||| | || ||| ||||| || ||| ||| | |||||||  | ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  24675711 tggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaact 24675787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 44386189 - 44385749
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  44386189 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 44386090  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |  || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  44386089 accgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 44385990  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  44385989 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 44385890  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  44385889 ctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 44385790  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  44385789 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 44385749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 23188730 - 23189260
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| |  || |||||  | ||| |||||| ||| ||||| |    
T  23188730 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgc 23188829  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  23188830 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 23188929  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||     
T  23188930 gaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcctaaactagaatgataacta 23189028  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    |||||  ||||    
T  23189029 ttgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcc 23189128  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  23189129 tctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 23189228  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  23189229 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 23189260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 556
Target Start/End: Original strand, 27371045 - 27371532
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  27371045 ctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgga 27371144  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    |||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   | || ||||| || ||||||||||| |||   || || || ||||||||    
T  27371145 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgacc 27371244  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | ||||||    
T  27371245 atacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 27371344  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  27371345 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcg 27371444  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
      ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  27371445 aacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27371532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Original strand, 12574134 - 12574606
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  12574134 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcat 12574232  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |||| | |||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12574233 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 12574332  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||       |||||||    |||| || || |    
T  12574333 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaa 12574432  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| || |||||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||    
T  12574433 gcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacc 12574532  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  12574533 caaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaa 12574606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22325561 - 22325036
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  22325561 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 22325462  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |  || || |||||     
T  22325461 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcct 22325362  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    || |||||||||||  |||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| ||||    
T  22325361 gattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaact 22325262  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  22325261 cgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 22325162  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||    
T  22325161 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 22325062  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    || || || ||||||| | |||||||    
T  22325061 acgatgctcgaaggaacaccatgcaa 22325036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 23293680 - 23294203
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  23293680 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 23293779  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| || || ||  |||| |  || || |  |||||||| |    
T  23293780 gcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtccca 23293878  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  23293879 acacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 23293978  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||| ||||||||   || || |||    
T  23293979 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtc 23294078  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  23294079 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacc 23294178  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  23294179 tcggatctctatccgacacaatact 23294203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 22757184 - 22756610
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || ||||   |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22757184 ggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgc 22757085  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  22757084 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcctaa 22756985  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |  |||||    
T  22756984 gaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccattccaatactagaacggtaactg 22756887  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || || || |||||||| | |      ||| || |  | |||| ||| |  |||||| | |||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  22756886 ttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 22756787  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| | ||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||    
T  22756786 tctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatct 22756687  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  22756686 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaact 22756610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 538
Target Start/End: Original strand, 23276552 - 23277021
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctga 167  Q
    |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23276552 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 23276651  T
Q  168 atcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgac 267  Q
     ||||| | || || |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  23276652 -tcatcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgac 23276750  T
Q  268 catacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttg 367  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||    
T  23276751 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttg 23276850  T
Q  368 ctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactta 467  Q
    ||| |  ||| |  || ||| ||||||||| ||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  23276851 ctcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttc 23276950  T
Q  468 gttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  23276951 gaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatact 23277021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 24262095 - 24262633
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  24262095 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 24262194  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24262195 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24262294  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||     
T  24262295 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 24262394  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| ||  |||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24262395 ttgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24262494  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    ||| ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  24262495 ctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24262594  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  24262595 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24262633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 27217741 - 27218279
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  27217741 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27217840  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || | ||  || |||||||| |     
T  27217841 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcctaagac 27217940  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  27217941 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27218040  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| || || |    
T  27218041 ttataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgt 27218140  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27218141 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27218240  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  27218241 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27218279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Original strand, 16924985 - 16925307
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  16924985 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16925084  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16925085 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16925184  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  16925185 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16925284  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  16925285 ttataagtgaactcgatcaacgg 16925307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 19652578 - 19652250
Alignment:
Q  207 ggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcat 306  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||    
T  19652578 ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaat 19652479  T
Q  307 gaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctg 406  Q
    |  |||||||||   | || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||   ||    
T  19652478 ggtaactgttgt---atgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattg 19652382  T
Q  407 aatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaa 506  Q
     || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||  | |||    
T  19652381 tatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaa 19652282  T
Q  507 gtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  19652281 gtgaacctcggatccttatccgacacaatact 19652250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 546
Target Start/End: Original strand, 27787522 - 27787994
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcat 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||     
T  27787522 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctga-tcac 27787620  T
Q  173 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatac 272  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| | || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27787621 cttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatac 27787720  T
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |    
T  27787721 aaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaa 27787820  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||  |||||||||| || |||||    || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||    
T  27787821 gcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacc 27787920  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27787921 caaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 27787994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 1063472 - 1064004
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  1063472 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 1063571  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||  ||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  1063572 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtccca 1063671  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||| | ||    
T  1063672 acacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagct 1063771  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| ||| |    ||||| |||    
T  1063772 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtc 1063871  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  1063872 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 1063971  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  1063972 tcggatctctatccgacacaatactagacggaa 1064004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23817823 - 23817720
Alignment:
Q  6 acaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23817823 acaaaactaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatat 23817724  T
Q  106 cctt 109  Q
    ||||    
T  23817723 cctt 23817720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 538
Target Start/End: Original strand, 45529313 - 45529756
Alignment:
Q  95 aaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttct 194  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   ||||| ||||||||| |  ||||| | |    
T  45529313 aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgt 45529412  T
Q  195 tgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattc 294  Q
    || ||||  |||||||| || |   ||||||| ||||||||| ||||||| || || ||  | || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  45529413 tgaacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattc 45529512  T
Q  295 cgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatc 394  Q
    | || |||  |||  ||||||| || ||| | ||||| ||||| || | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||    
T  45529513 caatgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtc 45529612  T
Q  395 ctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcc 494  Q
    ||||||   |||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||| |    
T  45529613 ctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttc 45529712  T
Q  495 caaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  45529713 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatact 45529756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 546
Target Start/End: Original strand, 31830379 - 31830911
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||     
T  31830379 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 31830478  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||| | |||||| || || |||||||| ||    |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  31830479 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 31830578  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  31830579 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 31830678  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  31830679 gttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 31830778  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  31830779 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 31830878  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  31830879 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaa 31830911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24878713 - 24878391
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  24878713 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 24878614  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24878613 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24878514  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||  |||| |||| ||     
T  24878513 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcattccaatactataatgataactatta 24878414  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  24878413 ttgtatgtgaactcgatcaacgg 24878391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 30211581 - 30211115
Alignment:
Q  72 aaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 171  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||    
T  30211581 aaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatca 30211482  T
Q  172 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccata 271  Q
     ||||||||| || ||||| | ||| | ||  |  |||| ||  |   |||||||   ||||||| ||||||| ||| | || || || |||||||||||    
T  30211481 acttaaccttctcagtagtctgttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccata 30211382  T
Q  272 caaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcc 371  Q
    ||| |  || |||||||||||||| || |||| |||  ||||||| |||||||| ||||| | ||| || | |      |||||| |  | ||||||||     
T  30211381 caacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctca 30211282  T
Q  372 aaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttc 471  Q
    |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||  |    
T  30211281 agtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaac 30211182  T
Q  472 ccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||  | |||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  30211181 ccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatact 30211115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21909024 - 21908782
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||| | || ||||||||||  ||||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  21909024 ccaacaaaatgcggtgtcaacttccggcacttcaaatcacgtccaacaccagttacgtgattcactctaaaaaacacatgatcatcaacttgaaaatcaa 21908925  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||   |||||||| ||||||| ||  ||||  |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  21908924 tatcctctatcctcttaccatgataact--tctgcatactctgagacgctatcatattctcgtgaatcatcttcaccttctctatagtctcttgcacaac 21908827  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataa 247  Q
    ||||  || || ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  21908826 ttccattcttatcaaagcactttctcctgacttataccaacataa 21908782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Original strand, 23087190 - 23087496
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || | || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||   |||| || | ||| |||||||| ||||    
T  23087190 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactct 23087289  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||    ||||  |||||||||||  |||| |   | ||||  || ||||| ||||   |||| || || ||    
T  23087290 tctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccga 23087389  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | | |||  ||||||||||||| || |||||     
T  23087390 ctcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactct 23087489  T
Q  333 atcaacg 339  Q
    |||||||    
T  23087490 atcaacg 23087496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 20832706 - 20833230
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  20832706 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 20832805  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||  || || |||||||| ||    ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20832806 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 20832905  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  20832906 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20833005  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  20833006 gttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 20833105  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  20833106 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 20833205  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  20833206 tcggatctctatccgacacaatact 20833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Original strand, 14708868 - 14709005
Alignment:
Q  74 aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   || || |||||||||| ||| ||||||    
T  14708868 aaatacataatcttcaacttgaaattaaatacctttcctccgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatc 14708967  T
Q  174 ttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcc 211  Q
    ||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||    
T  14708968 ttaaccttttatctagtttgctgaacaacttccggtcc 14709005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41608890 - 41608565
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| || ||||| || ||||    
T  41608890 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaact 41608791  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  41608790 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 41608691  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||  ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| |  ||||||    
T  41608690 tgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgac 41608591  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||    
T  41608590 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 41608565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 404 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 21145373 - 21145185
Alignment:
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| | ||||||  ||    
T  21145373 ctgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatcta 21145274  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaactt 592  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||  | ||||||| || |||||| || || ||||||||    
T  21145273 gaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaactt 21145185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21145673 - 21145426
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||    
T  21145673 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 21145574  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
      || ||||  |  |||||||| |   | || || ||  |||||||||| || ||||| ||  | || ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21145573 gctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21145474  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21145473 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacgg 21145426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 28144673 - 28144772
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  28144673 ccaacaaaacgatgagttaacttcctacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaatctcaa 28144772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20442823 - 20442703
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  20442823 ccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 20442724  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||| ||||| || |||||||    
T  20442723 ctgatacaatgctcgaaggaa 20442703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125355
Alignment:
Q  384 ctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagctt 483  Q
    |||||||||||||| ||    ||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  484 gcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatact 21125355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21906635 - 21906549
Alignment:
Q  253 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacg 339  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21906635 tcctacacctccatcaatacaaagccttaaacggttcaataccgatattagaatgaaaactattgttccaagtaaactcaatcaacg 21906549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 591
Target Start/End: Original strand, 16923022 - 16923187
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  16923022 ccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 16923121  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    |||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  16923122 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaact 16923187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Original strand, 24948707 - 24948834
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |   |||| ||| |||||||||||| ||| ||  || |||| |    
T  24948707 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtga 24948806  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24948807 acctcggatccctatctgatacaatact 24948834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 538
Target Start/End: Original strand, 20828350 - 20828504
Alignment:
Q  384 ctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagctt 483  Q
    ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | |    
T  20828350 ctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcct 20828449  T
Q  484 gcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  20828450 gtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 20828504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 23138758 - 23138904
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || |||||  |||||||||| |  || ||| |     
T  23138758 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgta 23138857  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23138858 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 23138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 23550548 - 23550694
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || |||||  |||||||||| |  || ||| |     
T  23550548 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgta 23550647  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23550648 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctt 23550694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24877074 - 24876929
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  24877074 gtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaa 24876975  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | || ||||| | |||||| || || || ||||||| | |||||||    
T  24876974 atcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 24876929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 177  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 556
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925623
Alignment:
Q  412 tcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  512 cctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16925623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 24654067 - 24654187
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  24654067 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 24654166  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttct 135  Q
     |||||||||||| |||||||    
T  24654167 gcttatcatgataactcttct 24654187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27377192 - 27377096
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcc 111  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||||||||    
T  27377192 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcc 27377096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Original strand, 24948564 - 24948638
Alignment:
Q  268 catacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24948564 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 24948638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 426 - 518
Target Start/End: Original strand, 24641875 - 24641967
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgga 518  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||  || |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||    
T  24641875 ccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgga 24641967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4071 - 3418
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  4071 ccaactaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaa 3972  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3971 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 3872  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3871 ttccaggcctaacaaagcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 3772  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3771 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 3672  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3671 tctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattt 3572  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3571 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctaccgac 3472  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3471 ataccagtcttgataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 3418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4140 - 3487
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4140 ccaacaaaacgaggagtcaaattcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 4041  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4040 tatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaac 3941  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3940 ttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagccatgccgatacta 3841  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3840 gaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 3741  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3740 tctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaactt 3641  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3640 agaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatgcaatctaccaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagac 3541  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3540 ataccagtcttaataggaacaaaatgcgctgacttcgtcaaccgatccacaatc 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 106769 - 106116
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  106769 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 106670  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  106669 tatcctttctcctcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaac 106570  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  106569 ttccggtcctaacaaagcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatacta 106470  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  106469 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 106370  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  106369 tctggatagtcctcttcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaactt 106270  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  106269 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataacatgcaatctaacaacctgctcgatctagatctcagccaacttcgccacagac 106170  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||  ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  106169 atactagtcttaataggaatgaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 106116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 591
Target Start/End: Original strand, 43279 - 43852
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  43279 gtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcact 43378  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  43379 tatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 43478  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  43479 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 43578  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  43579 ttgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctct 43678  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  43679 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 43778  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||| | |||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  43779 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaact 43852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50698 - 50371
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  50698 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 50599  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatc--ttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 212  Q
     ||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| |  || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || |||||     
T  50598 gcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtccc 50501  T
Q  213 aacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaac 312  Q
    ||||   |||| || || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||    
T  50500 aacatcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaac 50401  T
Q  313 tgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50400 tattgttgtaagtaaactctatcaacggta 50371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Original strand, 8610 - 8932
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | | |||||||| ||| || || |  |    
T  8610 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtt 8709  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||||||||||| |     
T  8710 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagac 8809  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || ||  |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  8810 cactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 8909  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  8910 ttgtatgtgaactcgatcaacgg 8932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 556
Target Start/End: Original strand, 15447 - 15599
Alignment:
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  15447 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 15546  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| || || || ||||||| | |||||||    
T  15547 gaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 15599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 50287 - 50157
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||    
T  50287 ccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 50188  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  50187 ttgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 50157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 15285 - 15394
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  15285 gactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 15384  T
Q  331 caatcaacgg 340  Q
    | ||||||||    
T  15385 cgatcaacgg 15394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 556
Target Start/End: Original strand, 8985 - 9137
Alignment:
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  8985 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 9084  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| || || || ||||||| | |||||||    
T  9085 gaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 9137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 2
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  582 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaa 483  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  482 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaac 383  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  382 ttccggtcctaacaaagcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaa 283  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  282 gaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaac 183  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 83  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctc 583  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82 agaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctc 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 363 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 4935 - 4707
Alignment:
Q  363 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 462  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||    
T  4935 ccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatccca 4836  T
Q  463 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaac 562  Q
    ||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||    
T  4835 acttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 4736  T
Q  563 aatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    ||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  4735 aatctccttaatataaatctctgccaact 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 487; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33191 - 32540
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33191 ccaacaaaacgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 33092  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 32992  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32991 ttctgggcctaacaaagcactctc--cggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatacta 32894  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32893 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaacaaatcttccaaac 32794  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32793 tttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 32694  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  32693 agaagtaaacctcggatcccgatctgacataatactagaaggtataccatgcaacctcactatctgctcaatatagatctcagccaacttagccacagac 32594  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32593 ataccagtcttaataggaacgaaatgcgcggactttgtcaaccaatcaacaatc 32540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 219601 - 219070
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||  || ||||| |    
T  219601 ggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctac 219502  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  219501 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcctaa 219402  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||  |||||||| ||||| || || ||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  219401 aaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactg 219302  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || || || || ||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||| ||    ||||| || |    
T  219301 ttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttc 219202  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||  | ||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  219201 tcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 219102  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | || ||| ||||| || |||||||    
T  219101 tggatctctatttgatacaatgctcgaaggaa 219070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 229165 - 229487
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || || | |||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || || |    
T  229165 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctac 229264  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  229265 gtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 229364  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   |||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  229365 aaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 229464  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  229465 ttattgtacgtgaactctatcaa 229487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28462 - 27809
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28462 ccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaa 28363  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 28263  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28262 tttcggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatacta 28163  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162 gcatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 28063  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28062 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaactt 27963  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  27962 agaagtaaacatcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgctactgac 27863  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27862 ataccagtctttataggaacataatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatc 27809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Original strand, 7117 - 7256
Alignment:
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||||||||||   ||||||||||| || ||||  ||||| |||||  | ||||| |||| || | |||||| ||| | ||| ||||| | ||| |||||    
T  7117 tatccttcctctgtttatcatgataacttttctacctactttgagattctttcatgttctactaattcatctgaacatcttctgtagtatgttgaacaac 7216  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaa 242  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7217 ttccggttcaatcaaagcactctctcctgactcataccaa 7256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 480; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14927 - 14280
Alignment:
Q  9 aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatcct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14927 aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcct 14828  T
Q  109 tcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccgg 208  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14827 ttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccgg 14728  T
Q  209 tcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 308  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  14727 tcctaacaaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatga 14628  T
Q  309 aaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaa 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627 aaactgttgttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaa 14528  T
Q  409 tagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagt 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14527 tagtcctctccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagt 14428  T
Q  509 aaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcataccc 608  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||      
T  14427 aaacctcggatcacgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtaaatctcaaccaactttgccgcagacatacta 14328  T
Q  609 gtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  14327 gtcttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 14280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 656
Target Start/End: Original strand, 25991 - 26569
Alignment:
Q  78 acatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25991 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 26090  T
Q  178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 26190  T
Q  278 ctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  26191 ctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacggtaaacattcgtcccaacagacatcttgttccaacaca 26290  T
Q  378 caagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaag 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26291 caagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaag 26390  T
Q  478 cagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgta 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26391 cagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcctgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgta 26490  T
Q  578 gatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  26491 gatctcagccaacttcgctacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaactgatcaacaatc 26569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 21839 - 21332
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || ||    
T  21839 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaact 21740  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |||| | ||| | ||||     
T  21739 cttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcct 21640  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||    
T  21639 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 21540  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||||||||||   || || ||| |||| | ||| || ||    
T  21539 ctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtc 21440  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  21439 tgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgac 21340  T
Q  531 acaatact 538  Q
    ||||||||    
T  21339 acaatact 21332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 14767 - 15419
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14767 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 14866  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14867 tatcctttctcctcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 14966  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14967 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaacca-cacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgctatatcgatacta 15065  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||    
T  15066 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaacaaatcttctaaac 15165  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15166 tctgaatagtcctctccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaactctcccaaaactt 15265  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |    
T  15266 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaagaaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaacctcactacagac 15365  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15366 ataccattcttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 15419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 43648 - 44301
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  43648 ccaacaaaacgaggagtcaatttcctacactttaaagcacgaccaactacggttacaggattcaccgtcaaaaacacatgatcaccaagttgaaactcaa 43747  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43748 tatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 43847  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43848 ttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccatactgatacta 43947  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43948 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttctaaac 44047  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44048 tctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 44147  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  44148 agaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctcacaatctactcaatgtagatctcagccaacttcaccacagac 44247  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  44248 ataccagtcttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaaccgttcaacaatc 44301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 3269 - 3921
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  3269 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcga 3368  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3369 tgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaac 3468  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3469 ttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 3568  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3569 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaac 3668  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669 tcggaatagtcctctctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 3767  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3768 agaagtaaacctcggatcccgatcttacacaatactagaaggaataccatgcaacctgacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagac 3867  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  3868 ataccagtcttgataggaacaatatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 3921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9087 - 8437
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  9087 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaa 8988  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8987 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 8888  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  8887 ttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtcattccgatatta 8788  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8787 gtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaaaacattcgtcccatatgacaccctgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttctaaac 8688  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggt-aagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaact 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8687 tctgaatagtcctctctgtgtgcccatcggtctgaggatggtaaagcagaacccaacctcaacgtagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaact 8588  T
Q  502 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  8587 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactataaggaataccatgcaatctaacaatttgctcaatgtagatctcagccaaattctccacaga 8488  T
Q  602 catacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaac 652  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8487 cataccagtcttgatgggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaac 8437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 13018 - 13671
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13018 ccaaaaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 13117  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13118 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 13217  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13218 ttccggtcctaacaaggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacta 13317  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318 gaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaac 13417  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13418 tctgaatagtcctctccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 13517  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13518 agaagtaaatctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcactatctgctcaatgtagatcttagccaacctcgctacagtc 13617  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13618 atacccgtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaacgatccacaatc 13671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 597
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  1250 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaa 1151  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1150 tatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 1051  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1050 ttccggtcctaacaaagcactttcacctaactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatactt 951  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  950 gtatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacattcgtcccaactgacactttgctccaaaacgtaagctcttaacaaatcttccaaac 851  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  850 tctaaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 751  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  750 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaagaaataccatgaaacctcacagtctgctcgatgtagatctcagccaacttcgccacagac 651  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  650 ataccaatctttataggaacaaaatgtgccgacttcatcaaccgatcaacaatc 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 98123 - 98620
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  98123 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactc 98222  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98223 aatatccttactcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 98322  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  98323 acttctggtcctaacaaaacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatac 98422  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98423 tagcatgaaaactgttgttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 98522  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98523 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaa 98620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23545
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacatgaaactcaatatcctttctcc 23551  T
Q  115 tcttat 120  Q
    ||||||    
T  23550 tcttat 23545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 117089 - 116569
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |   ||||| || | || ||||||||||| || ||||   ||||||||||||  || ||||| |    
T  117089 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctac 116990  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||  || || | ||  ||||| ||    
T  116989 gtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaa 116890  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  116889 aactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcattccaatactagaatgataactg 116790  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   | |||| || |    
T  116789 ttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgacggaatcgttc 116690  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | |  | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  116689 ttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 116590  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaat 535  Q
    |||||| | |||||| |||||    
T  116589 cggatctctatctgatacaat 116569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 656
Target Start/End: Original strand, 23992 - 24643
Alignment:
Q  5 aacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaata 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23992 aacaaaacaaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaata 24091  T
Q  105 tccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  24092 tcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaactt 24191  T
Q  205 ccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagc 304  Q
    | |||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24192 ctggtcctaacaaagcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactaga 24291  T
Q  305 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 404  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24292 atgaaaattattgttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactc 24391  T
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24392 tggatagtcctctccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgag 24491  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcat 604  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24492 aagtgaaccttggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatggaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagacat 24591  T
Q  605 acccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24592 tccagtcttgataggaacaaaatatgccgacttcgtcaaccaatcgacaatc 24643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 656
Target Start/End: Original strand, 231668 - 232318
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  || ||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  231668 ccaacaaaacgaggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacacatgttacatgattcactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 231767  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |   ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  231768 tgtccttccgcctcttatcatgataactcttctgcttactctaagacactcccatcttcccttgaatcatcttaaccttatccttagtctcttgcacaac 231867  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
     |||||||||| ||| ||||| || || |||||| ||||||| || ||  |  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  231868 ctccggtcctagcaatgcactttcacctgactcataccaacaaaa-ggaattttacaccttctaccatacaaaaccttaaacggtgccatcccgatacta 231966  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||||    
T  231967 gaatgaaaactattattataattaaactcaatccacggtaaaaattcgacccaactgacaccttactccaaaatacaagctctcaaaaaatatttcaaac 232066  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  232067 tctgaatagtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcagaactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaactcttgcaaaatat 232166  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| |    
T  232167 agaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagatggaataccatgcagcctgacaatttgctcaatgtatatctcagccaacctcaccacagac 232266  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||| |||||||||||   |||||| || |||||  |||| ||||||||||||    
T  232267 ataccggtcttgatagg--gaaaatgtgccgacttcttcaaacgatcaacaatc 232318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 656
Target Start/End: Original strand, 14238 - 14901
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14238 gcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgactgactccagttataggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactc 14337  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatag-------ctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 193  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14338 aatgtccttcctcctcttatcatggtaagtggtaactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaacttttttcgtagtttc 14437  T
Q  194 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccatt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  14438 ttgcacgacttccggtcctaacaaagaactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccata 14537  T
Q  294 ccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14538 ccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaat 14637  T
Q  394 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc-aaagcagcttgcaaactct 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14638 cctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgtcttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaacttt 14737  T
Q  493 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaactt 592  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738 cccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacacaatactagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaactt 14837  T
Q  593 cgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14838 tgccacagacataccagtcttgataggaacaaaatgtgccgactttgtcaaccgatcaacaatc 14901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 656
Target Start/End: Original strand, 180142 - 180687
Alignment:
Q  111 ctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  180142 ctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtc 180241  T
Q  211 ctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaa 310  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  180242 ctaacaaaacactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaa 180341  T
Q  311 actgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  180342 actgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaata 180441  T
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  180442 gtcctcttcctctgcccatcggtctgaggatggtaagcataactcatcctcaacttagttcccaaagcagcttttaaactctcccagaacttagaagtaa 180541  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgt 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  180542 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatctgatcaatgtagatctcagccaacttagccacagacataccagt 180641  T
Q  611 cttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  180642 cttaataggaacaaaatgtgttgacttcgtcaactgatcaacaatc 180687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 122146 - 121796
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  122146 ccaacaaaatgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 122047  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  122046 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaac 121947  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  121946 ttccgttcctaacaaaacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatacta 121847  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 353  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121846 gaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 121796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26717 - 26177
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| | |||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||  | || |||||||  || ||||| |    
T  26717 ggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctac 26618  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||   |||||||    
T  26617 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttattgtcctaa 26518  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| ||  |||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||||    
T  26517 aaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactg 26418  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| ||      
T  26417 ttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttt 26318  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 195886 - 195365
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  195886 ggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 195788  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  195787 gcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaa 195688  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  195687 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcggatggtaactg 195588  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||||||    |||||  ||||||  ||||||| ||||   || || ||||    
T  195587 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcc 195488  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||  ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  195487 tctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 195389  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  195388 cggatctctatccgacacaatact 195365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 538
Target Start/End: Original strand, 148881 - 149215
Alignment:
Q  204 tccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactag 303  Q
    |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| |    
T  148881 tccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccataccaatactcg 148980  T
Q  304 catgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaact 403  Q
     |||  ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||        |||||||   ||||||| || |  |||||  ||||||  |||||||||||       
T  148981 aatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatga 149080  T
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
     || || ||||| || | ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||    
T  149081 ttggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatcta 149180  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  149181 gaagtgaacctcggatccctatccgacataatact 149215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 967
Alignment:
Q  89 aacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgta 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1534 aacttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgta 1435  T
Q  189 gtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 288  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1434 gtctcttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtg 1335  T
Q  289 ccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaa 388  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1334 tcattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtgaacttaatcaatggttaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaa 1235  T
Q  389 caaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1234 caaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagctttcaaa 1135  T
Q  489 ctctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagcca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 ctctcccaaaacttagaagtaaacctcggattccgatttgacacaatactagaagaaataccatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagcca 1035  T
Q  589 acttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1034 acttcgccacagacatacccgtcttgataggaacaaaatgtgtcgacttcgtcaaccgatcgacaatc 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10507 - 10432
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaa 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10507 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaa 10432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 655
Target Start/End: Original strand, 9097 - 9748
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9097 ccaacaaaacgaggagtcaaattccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaa 9196  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9197 tatcctttctcatcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaac 9296  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9297 ttcctgtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatacta 9396  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || |||||||    
T  9397 gaatgaaaactgttgttataagtaaactaaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacactttgctctaacacacaagctctcaaaaagtcttccaaac 9496  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  9497 tctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacatagtt-ccaaagaagcttgcaaactttcccaaaacat 9595  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9596 agaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatgcaacctcacaatctgttcaatgtagatctcagccaacttcgccacagac 9695  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaat 655  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  9696 atatcagtcttgataggaataaaatgtgcctacttcgtcaaccgatcgacaat 9748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 645
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7920
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  7278 ccaacaaaacggggagtcaacttcctacgcttcagagcacgaccaacaccggtcacatgattcgctctcaagaacacatgatcaccaacctgaaattcaa 7377  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  7378 tgtccttcctcctcttatcatgataacttttctacgtactctaagacactttcatcttctcttgaatcatcttctctttttccgtagtttcttgcacaac 7477  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7478 ttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatacta 7577  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7578 gaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaac 7677  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7678 tctgaatagtcctctcggtctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacat 7777  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtc 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  7778 agaagtaaacctcggatccggatccgacacaatactagaaggaataccatggaacctaacaatctgctcaatgtagatctcaactaacttcgccacagac 7877  T
Q  603 atacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaacc 645  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  7878 ataccggtcttgataggaataaaatgtgtcgactttgtcaacc 7920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 599
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71925
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaac 71541  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    | | |||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  71542 acaacactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgt 71641  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  71642 tgttgtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcgacaaatcttccaaactctgaatagttct 71741  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  71742 ctccgtctgcccatccgtctgaggatggtaagtagaacccaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaaattagaagtaaacctt 71841  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccaca 599  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  71842 agatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaactttgccaca 71925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 305 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 33307 - 32960
Alignment:
Q  305 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33307 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaacagacaccttgctcagaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactc 33208  T
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33207 tgaatagtcctctttgtctgcccatcgatctagggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttag 33108  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcat 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33107 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaactttgccacagacat 33008  T
Q  605 acccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaac 652  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  33007 accggtcttgataggaacaaaatgtgccgacttggtcaactgatcaac 32960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 251 - 656
Target Start/End: Original strand, 24332 - 24726
Alignment:
Q  251 tgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24332 tgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacgaagacaatccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaccatttg 24431  T
Q  351 tcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcag 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  24432 tcccaactgacacattgctccaaaatgcaaactctcaacaaatcttccaaactatgagtagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggt------ 24525  T
Q  451 aactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatc 550  Q
         || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24526 -----aacctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaatacc 24620  T
Q  551 atgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatca 650  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| |||    
T  24621 atgcaatctaacaacctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacaggcataccggtcttgatagaaataaaatgtgccgacttcgtcaaccgttca 24720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 13360 - 13614
Alignment:
Q  2 cccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  13360 cccaacaaaacgaggagtcaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactca 13459  T
Q  102 atatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13460 atatcctttctccttttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaa 13559  T
Q  202 cttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcct 256  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13560 cctccggtcctaacaaggcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcct 13614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 6418 - 6526
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6418 gcccaacaaaacgtggagttaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactc 6517  T
Q  101 aatatcctt 109  Q
    |||||||||    
T  6518 aatatcctt 6526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 653
Target Start/End: Original strand, 10764 - 11416
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10764 gcccaacaaaacgaggtgtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 10863  T
Q  101 aatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||    
T  10864 aatgtccttcctcctcttatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaacattttttgtagcctcttgcaca 10963  T
Q  201 acttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatac 300  Q
    || | |||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10964 acctacggtcctaacaacgcactttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatac 11063  T
Q  301 tagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaa 400  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11064 tagaatgaaaattgttgttgtaagtaatctcaatcagcggtaaacattcaacccaactgagaccttgctccaaaacacaagctctcaacaagtcttccaa 11163  T
Q  401 actctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaac 500  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11164 actctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaac 11263  T
Q  501 ttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacag 600  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  11264 ttagaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaatagtatgcaacttgacaatctgctcaatatagatctcagtcaacctcgccacag 11363  T
Q  601 tcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaaca 653  Q
     |||||| |||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11364 acataccggtcttgatattaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaaca 11416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 529 - 5
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  529 ccaacaaaacggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 430  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||                      
T  429 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttc------------------ 348  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
       |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  347 ---cggtcctaacaaagcactttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatacta 251  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||    
T  250 gaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctttcaacaaatctttcaaac 151  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150 tctaaatagtcctctcggtctgcctatcggtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 51  T
Q  503 agaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaata 548  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50 agaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaata 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 9092 - 9414
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  9092 ggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctac 9191  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | ||||| ||| |||| ||| ||| ||||    
T  9192 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaa 9291  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |    |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  9292 aaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 9391  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  9392 ttattgtatgtgaactctatcaa 9414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 165 - 656
Target Start/End: Original strand, 2828 - 3305
Alignment:
Q  165 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctcc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2828 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcc 2927  T
Q  265 gaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacc 364  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||  |||||    
T  2928 taccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaac--------------ccaacaaacacc 3013  T
Q  365 ttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaac 464  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3014 ttgctccaacacacaagctctaaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgccgatcggtctgagaatggtaagcagaactcagtctcaac 3113  T
Q  465 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaa 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3114 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaa 3213  T
Q  565 tctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  3214 tctgctcaatgtaaatctcaaacaactatgccacagacatacaagtcttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 3305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 252 - 649
Target Start/End: Original strand, 8 - 405
Alignment:
Q  252 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8 gtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 107  T
Q  352 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaga 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  108 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctcgaaactcttaatagtcctctatgtcttcccatcggtctggcgatgataagcaga 207  T
Q  452 actcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatca 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  208 actcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactttccaaaaacttagaactaaacctcggatcccgatctgacacaagactagaaggaatacca 307  T
Q  552 tgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatc 649  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  308 tgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaacttcgctacagacataccggtcttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatc 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 294 - 656
Target Start/End: Original strand, 5576 - 5938
Alignment:
Q  294 ccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5576 ccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcgcaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaat 5675  T
Q  394 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 493  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5676 cctccaaactctgaaaagtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 5775  T
Q  494 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttc 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5776 ccaaaacatagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatggaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacctc 5875  T
Q  594 gccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    || | || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5876 gctataggcataccagtcttaataggaacaaaatacgctgacttcgtcagccgatcaacaatc 5938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 249 - 656
Target Start/End: Original strand, 18407 - 18810
Alignment:
Q  249 ggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatt 348  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407 ggtgtcctacacctctgtccatacaaagcctcaaacggtgccatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatt 18506  T
Q  349 cgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagc 448  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18507 tgtcccagctgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagc 18606  T
Q  449 agaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaata 548  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18607 agaactcaatctcaacttagttccgaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaata 18706  T
Q  549 tcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgat 648  Q
     ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |    
T  18707 ccatgcaacctcactatctgctcaatgtagatctcagcca----cgctacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaacgtt 18802  T
Q  649 caacaatc 656  Q
    | ||||||    
T  18803 ccacaatc 18810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Original strand, 18327 - 18398
Alignment:
Q  111 ctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18327 ctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttt 18398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 305 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 9755 - 9404
Alignment:
Q  305 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9755 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 9656  T
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655 tgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctcaactttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 9556  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcat 604  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  9555 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgctacctaacaatctgctcaatgtaaatctcagctaacttcgccacagacat 9456  T
Q  605 acccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9455 accagtcttaataggaacaaaatgctctgacttcgtcaaccgatccacaatc 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 14207 - 14352
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||      
T  14207 ggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctat 14306  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  14307 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatctt 14352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26278 - 25957
Alignment:
Q  78 acatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26278 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 26179  T
Q  178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagc 26079  T
Q  278 ctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26078 ctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacaca 25979  T
Q  378 caagctctcaacaaatcctcca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25978 caagctctcaacaaatcctcca 25957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Original strand, 17877 - 18004
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  | ||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | |||||||| | |||  ||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatcccacacaatact 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Original strand, 22804 - 23085
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22804 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 22903  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22904 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 23003  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaac 284  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23004 ttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagccttaaac 23085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 6145 - 6686
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||  | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  6145 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 6244  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |  ||||||||    
T  6245 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaa 6344  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  6345 gaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataacta 6444  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||| |    |||||| ||||    
T  6445 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcc 6544  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  | |||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  6545 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacct 6644  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  6645 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1708 - 1201
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||  ||||||||||||| | || ||||||||||   ||||||| |    
T  1708 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacctgaaactcaagggccttcctac 1609  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || ||  |||| |  || || |  |||||||| ||    
T  1608 acttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1509  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     | | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||  |||||    
T  1508 tacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactcgaatggtaactg 1409  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||   || || || |    
T  1408 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttc 1309  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |  ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  1308 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacct 1209  T
Q  515 cggatccc 522  Q
    ||||||||    
T  1208 cggatccc 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Original strand, 14633 - 14968
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14633 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaa 14732  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  14733 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaac 14832  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14833 ttccggtcctaacaaaacactttcacctgactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaa 14932  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaac 338  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14933 gaatgaaaactgttgttgtaactaaactcaatcaac 14968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 512
Target Start/End: Original strand, 74010 - 74519
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  74010 ccaacaaaacgtggtgtcaacttccaacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaa 74109  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||||||   |||||||||||||||| || || || || |||| |||    
T  74110 tatctttcctgctcttatcatgatagctcttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctctgtcgtctcgtgcataac 74209  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatacta 302  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||| |||||||||    
T  74210 ttctagccctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggcatcctacacctccgaccatacaaagccacaaacaattgcataccgatacta 74309  T
Q  303 gcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaac 402  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||| || || | |||| | |||||||    
T  74310 gaatgaaaaatgtttttgtaagtaaactcaatcaacggtaaatattcaagtcaactgacaccttgctctaaaacacatgcccttagcaaaacatccaaac 74409  T
Q  403 tctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactt 502  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||  |||| | ||||||||| |||| || ||||     
T  74410 tctgaatagtcatctctttttgcccatcattttgaagatgataagcataactcaatctcaattttgttatcaaatctgcttgcaaaatctcgcataacta 74509  T
Q  503 agaagtaaac 512  Q
     |||||||||    
T  74510 cgaagtaaac 74519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 19242 - 19765
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||    
T  19242 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctcc 19341  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  19342 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 19441  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     | | |||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||| |||||    
T  19442 tacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactg 19541  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||     
T  19542 ttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcg 19641  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  19642 tctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacct 19741  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  19742 cggatccctatcagacacaatact 19765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 58536 - 58445
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  58536 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttgtctactatgcgacgctttcatctt 58445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 8205 - 8458
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8205 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaa 8304  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8305 tatcctttctcctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaac 8404  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtccta 257  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8405 ttccggccctaacaaagcact-tctctggattcaaaccaacacaatggtgtccta 8458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 439 - 656
Target Start/End: Original strand, 45043 - 45260
Alignment:
Q  439 gatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45043 gatggtaagcagaattcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctctcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 45142  T
Q  539 agaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgacttt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  45143 agaaggaatatcatgcaatctaataatttgctcaatgtagatctcagccaacttcgccatagacatacccgtcttgataggaacaaaatgtgttgacttc 45242  T
Q  639 gtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45243 gtcaaccgatcaacaatc 45260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 566
Target Start/End: Original strand, 7912 - 8463
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||| | | | || |||||||| || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  7912 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcaccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 8011  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  8012 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 8111  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || |  |||||||||||||| ||||| || || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  8112 gaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 8211  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  8212 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 8311  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  8312 tctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatct 8411  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatc 566  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| || || ||||||    
T  8412 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatc 8463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 78825 - 78584
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  78825 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 78726  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  78725 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagtctcttgcacaac 78626  T
Q  203 ttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaaca 244  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  78625 tttcgatcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaaca 78584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 448238 - 448506
Alignment:
Q  72 aaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatca 171  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| || |||||||    
T  448238 aaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatca 448337  T
Q  172 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccata 271  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||  || |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  |||||    
T  448338 tcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccata 448437  T
Q  272 caaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  448438 caaagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgg 448506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 91114 - 90593
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||  |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| | |    
T  91114 agtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgc 91015  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    || ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |||     
T  91014 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacg 90915  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       |||| ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||||    
T  90914 ctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 90815  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||| |      ||||||    |||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| ||    ||||| ||||||    
T  90814 gttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctc 90715  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||  || |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| | ||| || ||||||||    
T  90614 gatctctatccgatacaatact 90593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 520
Target Start/End: Original strand, 114713 - 114807
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatc 520  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  114713 ccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 114807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 342
Target Start/End: Original strand, 114545 - 114629
Alignment:
Q  258 cacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||  || |||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  114545 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggta 114629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 432 - 656
Target Start/End: Original strand, 1 - 225
Alignment:
Q  432 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgaca 531  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 gtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 100  T
Q  532 caatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgc 631  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  101 caatactagaaggaatatcgtgcaacctcactatctactcaatgtagatctcagccaacttcgctatagtcatacccgtcttgataggaacaaaatctgc 200  T
Q  632 tgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  201 cgacttcgtcaaccgatcaacaatc 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 915 - 424
Alignment:
Q  86 tccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  915 tccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttttttc 816  T
Q  186 gtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacg 285  Q
     ||||||  || |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||     |  | |    
T  815 atagtttgctgaacaaattttggtcctatcaaagcactctctcccgactcataccaacacaacggcgtcatacacctccttccatacaa-----cgtaag 721  T
Q  286 gtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctct 385  Q
    |  ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  720 gatccattccaatactcgaatgaaaactgtt-ttgtaagtaagttcaatgaacggtaaacattcactccaacttacaacttgttccaaagcacaagctct 622  T
Q  386 caacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc 485  Q
     | |||||| || |||  || ||||| | ||||    |  ||||| || | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  621 tagcaaatcttctaaagactaaatagccatctccaattaaccatccgttttagcatgataagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagctgcttgc 522  T
Q  486 aaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctc 583  Q
    ||||||||| ||||| |||| || |||||| |||| | ||| |||||| | ||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  521 aaactctcctaaaacatagatgtgaacctcagatctctatcagacacattgctagatggaacaccatgcaatctgacaacctgctcaatgtagatctc 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 367
Target Start/End: Original strand, 21776 - 22072
Alignment:
Q  61 gattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21776 gattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctccttctatcatgataactcttctgtctacactgagacgcctacatctt 21875  T
Q  161 ctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacac 260  Q
    |||          ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||  | ||||||    
T  21876 ctc----------ttaaccttttccgtagtctcttgcacaacctctggtcctaacaaagcactttcacctgactcataccaacacaatggcattctacac 21965  T
Q  261 ctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactga 360  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21966 cccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttataagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactga 22065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197131
Alignment:
Q  273 aaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  373 aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcc 472  Q
      |||||| |||||| ||||||||| |    |||||| |||||||| | | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  473 caaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | || ||| ||||| || |||||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaa 197131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 14070 - 14116
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  14070 ccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaac 14116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1106 - 940
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1106 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 1007  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1006 tatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 342
Target Start/End: Original strand, 203 - 338
Alignment:
Q  207 ggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcat 306  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| | ||    
T  203 ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccatacaaatactcgaat 302  T
Q  307 gaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  303 ggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggta 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 369 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 3749 - 3475
Alignment:
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||  || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  3749 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttag 3650  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctg 568  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||     
T  3649 ttcccaaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatgcaatctgacaagctt 3550  T
Q  569 ctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaa 643  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  3549 ctcaatatagatctctgtcaacctcgccacagacataccattcttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaa 3475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 10465 - 10627
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10465 ccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 10564  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10565 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcct 10627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 5851 - 6013
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  5851 ccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaa 5950  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5951 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcct 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 509 - 656
Target Start/End: Original strand, 7881 - 8028
Alignment:
Q  509 aaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcataccc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  7881 aaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatttcagccaacttcgccacagacatacct 7980  T
Q  609 gtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7981 gtcttgataggaacaaaatgtgctgacttcgtcaatcgatcaacaatc 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 65527 - 66058
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  65527 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 65626  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  65627 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 65726  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  65727 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 65826  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  65827 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 65926  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  65927 tttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 66026  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  66027 tggatccctatctgatacaatactcgaaggaa 66058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 39902 - 39463
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  39902 cttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 39803  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   |  | || || || |||||||||||  |||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  39802 accactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataactgt 39703  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | ||||| || || || |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  39702 tattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcct 39603  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||  |||||||||| ||     
T  39602 ctccgactg-acatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatctt 39504  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  39503 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 39463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 14999 - 15530
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||  |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||  || |||||      
T  14999 ggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaa 15098  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15099 gcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 15198  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || ||||| |||||||| || || || || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  15199 aaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaatgataactg 15298  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| |||| |||   |||||| || |    
T  15299 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttc 15398  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15399 tctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 15498  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  15499 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 15530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 113272 - 113130
Alignment:
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||| |    
T  113272 ctctctgactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatc 113173  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  113172 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 113130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 8460 - 8622
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  8460 ccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaa 8559  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcct 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8560 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcct 8622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 14482 - 15013
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || | |||  | |||||||||| ||||||||| |    
T  14482 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgc 14581  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  14582 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 14681  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || |  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||     
T  14682 gaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatgacta 14781  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  14782 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 14881  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  14882 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 14981  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
     ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  14982 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 15013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 556
Target Start/End: Original strand, 745 - 1283
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  745 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 844  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||  ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  845 tatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 944  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||   |||| |||| ||     
T  945 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataactatta 1044  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      ||| || |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  1045 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 1144  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  1145 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 1244  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  1245 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16367 - 16211
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  16367 ccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaagtcta 16268  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatct 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16267 tatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatct 16211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 25237 - 24714
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || || | ||| ||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||| |  || || |||||  |||    
T  25237 ttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtct 25138  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||    || | |||||||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| ||||   |||| || || ||    
T  25137 tctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccga 25038  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| || || |||| ||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||     
T  25037 ctcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcatccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactct 24938  T
Q  333 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcgg 432  Q
    |||||||||| |      |||||| |  |||||||||  |  |||||| |||||||||||||||| ||   ||||||  | ||||| | ||| ||||| |    
T  24937 atcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctg 24838  T
Q  433 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacac 532  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  24837 tttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacac 24738  T
Q  533 aatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||| || || |||| | |||||||    
T  24737 aatgctcgacggaacaccatgcaa 24714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 127383 - 127076
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || ||||||||  |||| |||||||  || ||||| |    
T  127383 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctac 127284  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  127283 gcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 127184  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  127183 aaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 127084  T
Q  315 ttgttgta 322  Q
    || |||||    
T  127083 ttattgta 127076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80137
Alignment:
Q  374 aacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  || ||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||||||||  |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  474 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||  ||| |||||||| ||||||  |  ||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||  |||||| | |||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaa 80137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 42517 - 41994
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  42517 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 42418  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || |||| ||||||| || || || ||||| |  || || |  | |||||| |    
T  42417 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtccca 42319  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  42318 acacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 42219  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||    
T  42218 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtc 42119  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  42118 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacc 42019  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  42018 tcggatctctatccgacacaatact 41994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 47583 - 47060
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||   || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  47583 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 47484  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || |||| ||||||| || || || ||||| |  || || |  | |||||| |    
T  47483 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtccca 47385  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  47384 acacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 47285  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||  ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||| |||   || || |||    
T  47284 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtc 47185  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  47184 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacc 47085  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||    
T  47084 ttggatccctatccgacacaatact 47060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 546
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2574
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||||   || |    
T  2403 acacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaaccta 2502  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | |||||| ||| | || |||||||    
T  2503 aagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaa 2574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6677
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| | || || ||||| || || |||||  |||||||||||| ||||| ||| |    
T  6136 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgc 6235  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  6236 gcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcctaa 6335  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||    
T  6336 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatg 6435  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||||||||| || | |      |||||| |  | ||||| || | |||| || |||||||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  6436 ttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcc 6535  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||  ||||| ||||  ||||| || || |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||   |||||||||| ||    
T  6536 tctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatct 6635  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  6636 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 6677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 164891 - 164568
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  164891 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgc 164792  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||| || |    
T  164791 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaa 164692  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
    |  ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||| |||| |||||||    
T  164691 atacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgtt 164592  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
     ||||| || || || ||||||||    
T  164591 attgtacgtgaattctatcaacgg 164568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 546
Target Start/End: Original strand, 260484 - 260961
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| |||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |    
T  260484 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttccctta 260583  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| || | | |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  260584 tcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgacc 260683  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||||       |||||||    |||||||     
T  260684 atacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgt 260783  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||  |||||||||||||||||||    |  || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  260784 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 260883  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
      ||||||||  | |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  260884 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaa 260961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 278975 - 278473
Alignment:
Q  54 gtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgcct 153  Q
    ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |    
T  278975 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 278876  T
Q  154 tcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgt 253  Q
    |||| || || |||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||  |   | || ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  278875 tcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagt 278776  T
Q  254 cctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 353  Q
     || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| |  ||||||||||| || | |      |||    
T  278775 tctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcc 278676  T
Q  354 caactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaac 453  Q
    ||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  278675 caagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaac 278576  T
Q  454 tcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatg 553  Q
    |||||||||| ||||  || || ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | ||||    
T  278575 tcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 278476  T
Q  554 caa 556  Q
    |||    
T  278475 caa 278473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 308797 - 308939
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  308797 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 308896  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatc 173  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  308897 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 308939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 21989 - 22509
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  21989 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcgcaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgc 22088  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||  |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  22089 acttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaa 22188  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  22189 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 22288  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||| |||||||||||| |    |||||| ||||    
T  22289 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 22388  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  22389 actccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 22488  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaat 535  Q
     ||||| | |||||| |||||    
T  22489 tggatctctatctgatacaat 22509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 49391 - 48860
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  49391 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 49292  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||| ||||| || || || |  || ||||| |    
T  49291 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtccca 49193  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  49192 acaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 49093  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| |||||||| |||   || || |||    
T  49092 gttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtc 48993  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  48992 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 48893  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  48892 tcggattcctatccgacacaatactcgaaggaa 48860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 117690 - 118213
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  117690 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 117789  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| |    
T  117790 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtccca 117888  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  117889 acacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 117988  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||        | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    ||||| ||     
T  117989 attgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtt 118088  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| ||||    
T  118089 ctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacc 118188  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  118189 tcggatctctatccgacacaatact 118213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 535
Target Start/End: Original strand, 112143 - 112663
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||  |||||| | |    
T  112143 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttac 112242  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || || |||| ||||||||| ||  |||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  112243 gcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaa 112342  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| | ||||||| |||| |||||    
T  112343 aactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcatttcaatactagaatgataactg 112442  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||| | || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| ||||    
T  112443 ttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtcc 112542  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | |  | ||| ||||| ||||  ||||| || || ||||||||  |||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  112543 ttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 112642  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaat 535  Q
    | |||| | |||||| |||||    
T  112643 cagatctctatctgatacaat 112663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 322826 - 323349
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  322826 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 322925  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||| |  || || |  ||||| || |    
T  322926 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggaccca 323024  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  323025 acacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactggaatggtaact 323124  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||   || || |||    
T  323125 gttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtc 323224  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  323225 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacc 323324  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  323325 tcggatccctatccgacaaaatact 323349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 385941 - 386464
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| ||| || || |||  |||| | || |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    ||| || |    
T  385941 ggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttc 386040  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  386041 gcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaa 386140  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  386141 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccataccaatactcgaatggtaactg 386240  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   |||||| ||      
T  386241 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtta 386340  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  386341 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 386440  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  386441 cggatctctatccgacacaatact 386464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 203447 - 203132
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||| |||  |||| |||||    
T  203447 cactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccattcctatactagaatggtaacttttgtt 203348  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| |||| ||||| |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||     
T  203347 gtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcctctcc 203248  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  || ||||||| || ||||    
T  203247 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 203148  T
Q  520 cccgatctgacacaat 535  Q
    | | || |||||||||    
T  203147 ctctatttgacacaat 203132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 370336 - 370214
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaa 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || |  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  370336 ccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagctcatccaacaccggttacagaattcactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 370237  T
Q  103 tatccttcctcctcttatcatga 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  370236 tatcctttctcctcttatcatga 370214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 64213 - 63710
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| ||||| | |    
T  64213 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgc 64114  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |    
T  64113 ttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaaga 64014  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       | || |||||  ||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || ||||    
T  64013 ccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgtt 63914  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
     ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | | |||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||||    
T  63913 attgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 63814  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  517 gatc 520  Q
    ||||    
T  63713 gatc 63710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 47245 - 47769
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || || | |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||     
T  47245 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 47344  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| |    
T  47345 cgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtccca 47444  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||    
T  47445 acacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaact 47544  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    ||||| ||     
T  47545 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtt 47644  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  47645 ctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 47744  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| || | ||| |||||||||||    
T  47745 tcgggtctctatccgacacaatact 47769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 248735 - 249258
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||| |    ||| ||||    
T  248735 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 248834  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || |  ||||| || || || |  | |||||| ||    
T  248835 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaa 248934  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  248935 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 249034  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| |||| |||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  249035 ttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgtcc 249134  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  249135 tctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacct 249234  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  249235 cggatccctatctgacacaatact 249258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 798 - 1120
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| || ||      
T  798 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctat 897  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  898 gcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 997  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   |||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  998 aaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 1097  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  1098 ttattgtacgtgaactctatcaa 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 520
Target Start/End: Original strand, 220 - 725
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   || | || |    
T  220 ggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctac 319  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||  || || |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  320 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 419  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||  |||||    
T  420 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccatacgaatactcgaatggtaactg 519  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||||   || ||  |||    
T  520 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcc 619  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  620 tctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacct 719  T
Q  515 cggatc 520  Q
    ||||||    
T  720 cggatc 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5744 - 5252
Alignment:
Q  45 ccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactct 144  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5744 ccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactct 5646  T
Q  145 gagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaaca 244  Q
    | ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| || || |||| ||| |||| ||| |||||||  |   || |||| ||||||||| |||||||    
T  5645 gcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaaca 5546  T
Q  245 taacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaa 344  Q
     ||||| || || || ||||||||| |||| || || ||||||| |||||| || |||| |||  ||||||| || || || ||||||||||| || | |    
T  5545 caacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaaga 5446  T
Q  345 cattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggt 444  Q
          |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  5445 ttactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgat 5346  T
Q  445 aagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | |  |||||||| |||| |||||  ||||| ||  | ||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  5345 acgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatact 5252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 6494 - 7035
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  6494 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 6593  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  6594 gtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 6693  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  6694 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 6793  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||   |||||| ||||    
T  6794 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 6893  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  6894 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 6993  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  6994 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 538
Target Start/End: Original strand, 3151 - 3436
Alignment:
Q  253 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtc 352  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||        ||    
T  3151 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatc 3250  T
Q  353 ccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaa 452  Q
    ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  3251 ccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaa 3350  T
Q  453 ctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  3351 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4573 - 4037
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||  |||| || || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  4573 acttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataact 4474  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  4473 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 4374  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  4373 gactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 4274  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  || | || | ||| |||||    
T  4273 cgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatc 4174  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  4173 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 4074  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4073 acaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatct 4037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 567
Target Start/End: Original strand, 8734 - 9270
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||  |||| || || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  8734 acttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataact 8833  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  || |||||||| |   | || || ||     
T  8834 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 8933  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  8934 gactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 9033  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  || | || | ||| |||||    
T  9034 cgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatc 9133  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  9134 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 9233  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  9234 acaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatct 9270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 33757 - 33205
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||  |||| || || || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  33757 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 33658  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  || ||||||||    
T  33657 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaa 33558  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || ||||||||||| || || || || || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  33557 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 33458  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  ||     
T  33457 ttattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcg 33358  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    | || | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatct 567  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatct 33205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 44642 - 44578
Alignment:
Q  3 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcac 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44642 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcac 44578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 42905 - 43428
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||| ||  | |||||||| |    ||| ||||    
T  42905 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 43004  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || |  ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  43005 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 43104  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  43105 caccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 43204  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  43205 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 43304  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  43305 tctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacct 43404  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  43405 cggatccctatctgatacaatact 43428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 502 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 55602 - 55443
Alignment:
Q  502 tagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaa-----cttcgcc 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||| |||    
T  55602 tagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatctaacaatatgctcaatgtagatctcagccaacttagcttagcc 55503  T
Q  597 acagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  55502 acagacataccagtcttaataggagcaaaatgtgccgacttcgtcaaacgatccacaatc 55443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4107
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
     ||| |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4460 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgccat 4361  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg-taaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaa 391  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||  ||||| || | |  | | | ||||| | || |||||||  |  | |||| ||||||||||    
T  4360 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactag-cccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaa 4262  T
Q  392 atcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactc 491  Q
    |||||| ||   |||||| || |||||   ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||    
T  4261 atcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 4162  T
Q  492 tcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    | ||||||  || ||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  4161 ttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 4107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 538
Target Start/End: Original strand, 59236 - 59399
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||    
T  59236 acacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaaccca 59335  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    | ||  | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  59336 acgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatact 59399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 546
Target Start/End: Original strand, 130659 - 130801
Alignment:
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  130659 ctgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 130758  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  130759 gaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 130801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 322
Target Start/End: Original strand, 58980 - 59183
Alignment:
Q  119 atcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaa 218  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||||||| ||  |||| |||||||||||  |      
T  58980 atcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtcctagtacc 59079  T
Q  219 gcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgt 318  Q
     || |||  ||||| ||| ||||||| || || || || || |||||||||||||| || || || |||||||| || || |||| |||  ||||||| |    
T  59080 acattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggtaactgttat 59179  T
Q  319 tgta 322  Q
    ||||    
T  59180 tgta 59183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29152 - 29023
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||| ||| || ||||| | ||    
T  29152 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttggatctctat 29054  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||| ||||| ||  |||||| | |||||||    
T  29053 ctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaa 29023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 180339 - 180664
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  180339 ggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctac 180438  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  180439 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcctaa 180538  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  180539 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 180638  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  180639 ttattgtacgtgaactctatcaacgg 180664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 101339 - 101213
Alignment:
Q  412 tcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||| ||    
T  101339 tcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaa 101240  T
Q  512 cctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  101239 cctcggatccctatccgacacaatact 101213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 450 - 591
Target Start/End: Original strand, 180756 - 180897
Alignment:
Q  450 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatat 549  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| |     
T  180756 gaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacac 180855  T
Q  550 catgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    |||||||  | ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  180856 catgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaact 180897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 556
Target Start/End: Original strand, 637 - 1077
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  637 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 736  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |  || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |    
T  737 accgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataactat 836  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||    
T  837 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 936  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  937 ctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 1036  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  1037 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 4154 - 4684
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  || ||||| |    
T  4154 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctac 4253  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  4254 gcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcctaa 4353  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   ||||||| || || || |||||||| ||||  || || || || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||    
T  4354 aactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgataattg 4452  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  | |||| ||||||| || |||| |||   |||||| ||||    
T  4453 ttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcc 4552  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | | | ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||   || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  4553 tctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 4652  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  4653 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 313
Target Start/End: Original strand, 1261 - 1559
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | ||| || ||||||||| | || || |||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1261 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 1360  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || || || |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  ||  |||||||    
T  1361 acttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctagtcctaa 1460  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
     |   | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  1461 gaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccatttcaatactagaatgataact 1559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 462 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 9804 - 9610
Alignment:
Q  462 aacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaa 561  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||||| || ||  ||||| |||||||||| |    
T  9804 aacttagttctcaaagtcgctagcaaactctcctaaaacttcaaagtaaacctcaaatcccgatccaacacaatgctcgacagaataccatgcaatctga 9705  T
Q  562 caatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  9704 aaatcttctcaatgtagatctctgccaacctcgccacagacttaccggtcttgataggaacaaaatgttccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 9610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16375
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |  || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||| |     
T  16648 gagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacg 16549  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||  ||||||||     
T  16548 cttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaa 16449  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 289  Q
    |   ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16448 accacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25508
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  26049 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctac 25950  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| |     
T  25949 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcccag 25850  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | ||||||||||  |||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  25849 cacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 25750  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||||||    || ||  ||||||  |||||||||||    || ||  |||    
T  25749 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcc 25650  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  25649 tctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacct 25550  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  25549 cggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaa 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 16797 - 16943
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||     
T  16797 aggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 16896  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    | ||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||||||    
T  16897 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatctt 16943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 431
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||  |||| ||||||| ||| || || |    
T  1006 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctac 908  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  907 gcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 808  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| || ||    
T  807 gatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaatgataattg 708  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    || ||||| || ||||| ||| | || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  707 ttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcc 608  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| |||||  |||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  607 tctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 508  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  507 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaact 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32934 - 32614
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| | |    
T  32934 agtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgc 32835  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || ||  || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |    
T  32834 ttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctggccctaaaa 32735  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       ||||| | || |||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  32734 ccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccattccaatactagaatgataactgtt 32635  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
     ||||| || ||||| |||||    
T  32634 attgtacgtgaactctatcaa 32614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 538
Target Start/End: Original strand, 20121 - 20628
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   |||| || | ||| |||||||| ||    
T  20121 acttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataact 20220  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| |  || ||  |||| |  || || |  |||||||| || | | ||||||||||     
T  20221 cttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaagacaacactctctcct 20320  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  20321 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaact 20420  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||||||||        ||||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    || || |||||||| | ||   ||||    
T  20421 ctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatc 20520  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  20521 tgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgac 20620  T
Q  531 acaatact 538  Q
    ||||||||    
T  20621 acaatact 20628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 13545 - 13022
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || || | |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  13545 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 13446  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
      || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| |    
T  13445 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtccca 13347  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||   ||||    
T  13346 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 13247  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || |||    
T  13246 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtc 13147  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |   |||| ||| |||| || |||| |||||| |||||| | ||||    
T  13146 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacc 13047  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  13046 tcggatccctatccgacacaatact 13022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 16792
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  17315 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 17216  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
      || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| |    
T  17215 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtccca 17117  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||   ||||    
T  17116 acacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaact 17017  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || |||    
T  17016 gttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtc 16917  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    | ||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |   |||| ||| |||| || |||| |||||| |||||| | ||||    
T  16916 cgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacc 16817  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16816 tcggatccctatccgacacaatact 16792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 546
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13140
Alignment:
Q  232 actcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 331  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || |||||    
T  12826 actcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactc 12925  T
Q  332 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcg 431  Q
    ||||||||| | |  |   |||||| |  | |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| |    || ||| |||||||| | ||| |||||     
T  12926 aatcaacggaagatgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatct 13025  T
Q  432 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgaca 531  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| |    
T  13026 gtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 13125  T
Q  532 caatactagaaggaa 546  Q
    |||| || |||||||    
T  13126 caatgctcgaaggaa 13140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 5343 - 5665
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||| |||||||  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||  || |||||  ||| |||||||| ||| ||||| |    
T  5343 ggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgc 5442  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      ||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  5443 gtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 5542  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || || || || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||     
T  5543 gaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatactggaatgataacta 5642  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  5643 ttattgtacgtgaactctatcaa 5665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 17109 - 17434
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |   ||||| || | || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  17109 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctac 17208  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  | ||| ||||| ||    
T  17209 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtttgttgaatgatttctggtcccaa 17308  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   || |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  17309 aactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccattccaatgctagaatgataactg 17408  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || || || ||||||||    
T  17409 ttattgtacgtgaattctatcaacgg 17434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 109992 - 109455
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  109992 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 109893  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  109892 tatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 109793  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| |||| ||     
T  109792 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataactatta 109693  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  109692 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 109593  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  109592 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 109493  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
     || | |||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  109492 ttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 109455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 112681 - 113008
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  112681 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctac 112780  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    ||||  || |||||||  ||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  112781 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 112880  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  112881 catcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 112980  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  112981 ttgttgtaagtaaactctatcaacggta 113008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 96186 - 95879
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||  || ||||| |    
T  96186 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 96087  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||   |||| | |||| || |||||||| || || || |  ||||| || ||    
T  96086 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaa 95987  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  95986 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 95887  T
Q  315 ttgttgta 322  Q
    ||||||||    
T  95886 ttgttgta 95879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 555
Target Start/End: Original strand, 113077 - 113221
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||||  ||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||| || |    
T  113077 gtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtga 113176  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgca 555  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||| || |||| | ||||||    
T  113177 acctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgca 113221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11422
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| || | | ||||| | ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  10891 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 10990  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  10991 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtccca 11089  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  || |    
T  11090 acaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaat 11189  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || |||    
T  11190 gttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtc 11289  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| | ||||| ||||    
T  11290 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacc 11389  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  11390 tcggatctccatccgacacaatactcgaaggaa 11422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 9940
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||  || ||||| |    
T  10267 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 10168  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  10167 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtccca 10069  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  10068 acacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaact 9969  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  9968 gttgttgtatgtgaactctatcaacggta 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 459 - 546
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12147
Alignment:
Q  459 ctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15262 - 14938
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||  || ||||| |     
T  15262 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacg 15163  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||| ||| || |  || ||||| ||     
T  15162 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaa 15063  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |    
T  15062 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactat 14963  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||    
T  14962 tattgtacgtgaactctatcaacgg 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25887 - 25383
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || || ||||||||||| | |||  | ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||  |    
T  25887 acttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataatt 25788  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || || | ||||||||| || |||||||  || || |  || ||||| || |   ||||||| ||     
T  25787 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacct 25688  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  25687 gactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaact 25588  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  |||||||||  |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| || || || | ||| |||||    
T  25587 ctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatc 25488  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| | | |||||||    
T  25487 tgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgac 25388  T
Q  531 acaat 535  Q
    |||||    
T  25387 acaat 25383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13159 - 12836
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| || ||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||| | |    
T  13159 agtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgc 13060  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||| || || |||||||  || | || ||| ||||| || |    
T  13059 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctggtcccaaaa 12960  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
      |||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  12959 ctgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgtt 12860  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
     || || || ||||| ||||||||    
T  12859 attatatgtgaactctatcaacgg 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14435 - 14108
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||   ||||||| |    
T  14435 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctac 14336  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||  | ||  |||| |  |  || |  |||||||| ||    
T  14335 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaa 14236  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  14235 cacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14136  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14135 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 14108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 550 - 656
Target Start/End: Original strand, 9951 - 10057
Alignment:
Q  550 catgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatc 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  9951 catgcaatctcacaatctgctcaatgtagatttcagccaacttcgccacagacataccagtcttgataggaacaaaatgtgatgacttcgtcaatcgatc 10050  T
Q  650 aacaatc 656  Q
    |||||||    
T  10051 aacaatc 10057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 556
Target Start/End: Original strand, 3997 - 4538
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   | ||||| |    
T  3997 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctac 4096  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| | |||  ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  4097 gcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 4196  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||   |||  |||||    
T  4197 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactg 4296  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  || ||||||||||||| ||    ||||| || |    
T  4297 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttc 4396  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  4397 tctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 4496  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||| |  || ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  4497 cggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 16597 - 16069
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||   || ||||| ||| | ||    
T  16597 gtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgct 16498  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| | || ||| |     
T  16497 tatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctgttcttaaaac 16398  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | ||||||   ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||| |||| ||     
T  16397 cacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaatgataactatta 16298  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || || || || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  || ||| |||||||||| ||||||||   |||||| || ||||    
T  16297 ttgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctct 16198  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  || |||||   ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16197 ccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcgg 16098  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  16097 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 16069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Original strand, 26382 - 26906
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| | |||| ||     
T  26382 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 26481  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||   |||| | |||| || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  26482 cacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtccca 26581  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | || | || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| || ||||| |  ||| | ||    
T  26582 acacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccatcccaatactcgagtgatagct 26681  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  26682 gttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 26781  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  26782 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 26881  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    || |||||| ||| |||||||||||    
T  26882 tcagatccctatccgacacaatact 26906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 16898 - 16374
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||     
T  16898 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 16799  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||    ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  16798 cgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 16699  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  16698 acacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 16599  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    ||||| |||    
T  16598 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 16499  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  16498 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 16399  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  16398 tcggatctctatccgacacaatact 16374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5137 - 4810
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||||||||||  |  | ||||||||||   ||||||| |    
T  5137 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 5038  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |    
T  5037 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtccca 4939  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||   |||  ||||    
T  4938 acacaacactctctcttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaact 4839  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4838 gttgttgtatgtgaactctatcaacggta 4810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14069 - 13562
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||| || ||    
T  14069 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaact 13970  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |||| | ||||||||||     
T  13969 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcct 13870  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||    
T  13869 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaact 13770  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||||||||        ||||||    ||| |||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || || ||||| | ||| |||||    
T  13769 ctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatc 13670  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||| ||| || ||| |||    
T  13669 tgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgac 13570  T
Q  531 acaatact 538  Q
    ||||||||    
T  13569 acaatact 13562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4741 - 4614
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||  || |||| |    
T  4741 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtga 4642  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4641 acctcggatccctatccgacataatact 4614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 556
Target Start/End: Original strand, 67903 - 68033
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||| || | ||    
T  67903 ccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctat 68002  T
Q  526 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| ||||| || |||| | |||||||    
T  68003 ccgacactatactcgacggaacaccatgcaa 68033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 5335 - 5662
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  5335 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 5434  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| | |   |||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  5435 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 5534  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||| | |||  |||||    
T  5535 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccattactcgaatggtaactg 5634  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5635 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 546
Target Start/End: Original strand, 5753 - 5866
Alignment:
Q  433 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacac 532  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  |  |||| |||| | | ||| |||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  5753 tctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaagctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacac 5852  T
Q  533 aatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||||||||    
T  5853 aatactagaaggaa 5866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 556
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3803
Alignment:
Q  17 agtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctc 116  Q
    |||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||| | |    
T  3264 agtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgc 3363  T
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || ||      
T  3364 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgttgcacgatttctggccccaaat 3463  T
Q  217 aagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgtt 316  Q
       ||||||| |  ||||||||| |||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  3464 ttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgtt 3563  T
Q  317 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctc 416  Q
     |||||  | ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| || |||||||||| || | |||   || ||| || ||     
T  3564 attgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctt 3663  T
Q  417 tctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcg 516  Q
    || | ||| ||||  |||||  |||| || || |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  3664 tccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 3763  T
Q  517 gatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  3764 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 3803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 37324 - 37651
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||  | || || | ||| ||||||||||   |||||||||||||  ||||||| |    
T  37324 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctac 37423  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    ||||||||||| || |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  37424 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 37523  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| | |||  || ||    
T  37524 cacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgataccaatactcgaatggtaattg 37623  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  37624 ttgttgtacgtgaactccatcaacggta 37651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38357 - 38183
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |     
T  38357 gagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacg 38258  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    ||| || || || |||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||   ||||||||| || || ||||||||    
T  38257 cttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27520 - 27376
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |     
T  27520 gagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacg 27421  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatctt 160  Q
    ||| || || || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  27420 cttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatctt 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 556
Target Start/End: Original strand, 9464 - 10006
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||| |||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| || |||||  ||||||||||||  || |||||     
T  9464 aggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttccta 9563  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||  || |||||||    
T  9564 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtccta 9663  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | |   | || || || |||||||||||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  9664 aaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgcccttccaatactagaatgataact 9763  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
     |  ||||| || ||||  ||||| |||| |   |   ||| | |  | |||||||| |  ||||||||||||||||| || || |    |||||| |||    
T  9764 atcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtc 9863  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | |||  |||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||  |  |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |    
T  9864 ctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatc 9963  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    | ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  9964 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 444 - 195
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  444 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctac 345  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| ||| | || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||  || |||| ||| ||||| ||    
T  344 gcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctggtcccaa 245  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctcc 264  Q
     |  |||||||| || || || |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  244 aactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagtcctacacctcc 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 124 - 449
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  124 ggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctcttgaaactcaagatcctttctac 223  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
      ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||  |||| |  || ||||  ||  |||||||    
T  224 ggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctagtcctaa 323  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | || ||    
T  324 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaattataattg 423  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  424 ttattgtatgtgaactctatcaacgg 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 538
Target Start/End: Original strand, 27557 - 27870
Alignment:
Q  225 tctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaag 324  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| |    
T  27557 tctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatg 27656  T
Q  325 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg 424  Q
    | ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||||||    || ||||||||||| | |||    
T  27657 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaatgattgtatagtcctctccgactg 27756  T
Q  425 cccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccga 524  Q
     ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | |    
T  27757 accatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctcta 27856  T
Q  525 tctgacacaatact 538  Q
    || |||||||||||    
T  27857 tccgacacaatact 27870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5545 - 5113
Alignment:
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactt 204  Q
    |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| || || ||  |||| || || || |  |    
T  5545 cctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaat 5447  T
Q  205 ccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagc 304  Q
    ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  5446 ccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcga 5347  T
Q  305 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 404  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||        
T  5346 atggtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgat 5247  T
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    || || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||| || | |||||||||| ||| ||| |||    
T  5246 tggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctag 5147  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  5146 aagtgaacctcaaatccctatccgacacaatact 5113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 43627 - 44158
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  43627 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 43726  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||  | ||||||| || |||||  ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| || || || |  |||| ||| |    
T  43727 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctga-tcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttccca 43825  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  43826 acaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 43925  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||| ||||| |  ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || |   ||    
T  43926 gttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatc 44025  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||   |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  44026 ctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 44125  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  44126 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 44158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Original strand, 44639 - 45170
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  44639 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 44738  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||  | ||||||| || |||||  ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| || || || |  |||| ||| |    
T  44739 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctga-tcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttccca 44837  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  44838 acaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 44937  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||| ||||| |  ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || |   ||    
T  44938 gttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatc 45037  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||   |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  45038 ctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 45137  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  45138 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 45170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 20244 - 20506
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| | || | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  20244 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 20343  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| || |||| |||||| || || || |  |||||||| ||    
T  20344 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 20443  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20444 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagc 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 546
Target Start/End: Original strand, 17655 - 18094
Alignment:
Q  106 ccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 205  Q
    ||||||| | |||||||| ||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| |  || ||||  ||    
T  17655 ccttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctc 17754  T
Q  206 cggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagca 305  Q
     |||||||| |   | || || || ||||||| |||||| ||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  17755 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 17853  T
Q  306 tgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactct 405  Q
    ||| |||| || || || || ||||| ||||  || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    ||    
T  17854 tgataactattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgact 17953  T
Q  406 gaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttaga 505  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||    
T  17954 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaga 18053  T
Q  506 agtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  18054 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 18094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 14177 - 14459
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | ||  ||||||| |  || |||||  |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||| ||    
T  14177 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataact 14276  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||  |  |||||||| |   | || || ||     
T  14277 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacct 14376  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14377 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 14459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 31532 - 32055
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| || | | || |||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  31532 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctac 31631  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| || || |  |||||||  || || |  |||| ||| |    
T  31632 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatccca 31730  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | | || |||||  |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| | |||  ||||    
T  31731 acacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaact 31830  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||| |||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    || || |||    
T  31831 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtc 31930  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| | ||| || || ||||| ||||| |||||||| | |||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  31931 ctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 32030  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  32031 tcggatctctatccgacacaatact 32055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 591
Target Start/End: Original strand, 2873 - 3449
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||   |||| || |    
T  2873 ggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctac 2972  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || | |||||||| |||||| ||| | |||||||| |||   |||||||| || || || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  2973 gcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 3072  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  3073 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 3172  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || ||||    
T  3173 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcc 3272  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||  ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  3273 tcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacct 3372  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
    | |||| | ||| ||||||||||| || |||| | |||||||  | ||||| |  | |||||||||||| |||||||    
T  3373 cagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaact 3449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13363 - 13060
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||| |     ||||| |  ||||||||||||||    
T  13363 acttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggattgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaatgatttccttcgtttatcatgatagct 13264  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    |||||||||||| || || || |||||  ||||  ||||||| || |||||||| || ||||  || ||||  ||| |||| ||||  ||| |||| ||     
T  13263 cttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaatctccagtcccaacactgcaatctcgcca 13164  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||  ||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13163 gactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgtcatcccaatactagaatggaaactgttgttataagtaaact 13064  T
Q  331 caat 334  Q
    ||||    
T  13063 caat 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 27641 - 28164
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||| | ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  27641 ggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctac 27740  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| || || || ||||| |  || ||    || ||||| ||    
T  27741 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaa 27840  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  27841 cacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 27940  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || || || ||||||||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||  |||||||||||    || || ||||    
T  27941 ttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 28040  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  28041 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacct 28140  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  28141 cggatctctatctgacacaatact 28164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 810
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | |  |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  1333 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 1234  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || | |||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  1233 gcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 1134  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   || | ||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| | |||  ||||     
T  1133 caccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactcgaatggtaacta 1034  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| || |||||| ||    ||||| || |    
T  1033 ttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacgattgaatcgttc 934  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  933 tctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 834  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  833 cggatctctatccgacacaatact 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34417
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||||||  || |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaatact 34417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3016
Alignment:
Q  117 ttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 215  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||| |  || || |  |||| ||| |||    
T  3437 ttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga-tcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttcccaac 3339  T
Q  216 aaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgt 315  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||    
T  3338 acaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgt 3239  T
Q  316 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcct 415  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||   || || || |     
T  3238 tgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatcgtgcc 3139  T
Q  416 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 515  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  || |||| ||||||    
T  3138 ctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctc 3039  T
Q  516 ggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  3038 ggatccctatccgacacaatact 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1340 - 1091
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 192  Q
    ||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| || || |||||||| |    
T  1340 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtct 1241  T
Q  193 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 292  Q
    | || || |  ||||| || |||| | |||| ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1240 catgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1141  T
Q  293 tccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
     || ||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  1140 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggta 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 556
Target Start/End: Original strand, 7137 - 7602
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    |||||||||||| ||| || |  | |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||| || |||||    
T  7137 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagt 7236  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
    ||  || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  7237 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 7336  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 390  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| || || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||    
T  7337 attccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaaca 7436  T
Q  391 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 490  Q
    |||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  7437 aatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 7536  T
Q  491 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  7537 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 337
Alignment:
Q  91 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 190  Q
    ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  802 cttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 703  T
Q  191 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 290  Q
    || ||| ||||  || |||||||| |   | || || || |||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  702 ttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtc 603  T
Q  291 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || || || || ||||| ||||| || | |   |  || ||| |  |  ||||||| | ||||||| | |||||||    
T  602 attccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaaca 503  T
Q  391 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 490  Q
    |||| || ||   ||||||  ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||| |||||  || |||||  ||||||||||    
T  502 aatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaact 403  T
Q  491 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
     | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  ||||||| || ||||||||| |||||||    
T  402 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaa 337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12911 - 12446
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaa 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| |||| ||||||||| || || |||| || |||||  ||||| |||||||| |||   |    
T  12911 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttccctta 12812  T
Q  169 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacc 268  Q
    ||||||| ||||| || || || |  || || |  || |||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||    
T  12811 tcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgacc 12712  T
Q  269 atacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 368  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||   |     | |||    |||| ||     
T  12711 atacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggta----gcacaagctccaccatgt 12616  T
Q  369 tccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag 468  Q
    || |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  12615 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12516  T
Q  469 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
      ||||||||  | |||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12515 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatact 12446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 52363 - 51833
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  52363 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 52264  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| || |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| |    
T  52263 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatccca 52165  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  52164 acaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 52065  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||  ||||||||||    || || |||    
T  52064 gttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taatcctccaatgattggatcgtc 51966  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  51965 ctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacc 51866  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  51865 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 51833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 61397 - 60867
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  61397 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 61298  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| || |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| |    
T  61297 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatccca 61199  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  61198 acaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 61099  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||  ||||||||||    || || |||    
T  61098 gttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taatcctccaatgattggatcgtc 61000  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  60999 ctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacc 60900  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  60899 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 60867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 67785 - 67255
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  67785 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 67686  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| || |||| ||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| |    
T  67685 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatccca 67587  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||   | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  67586 acaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaact 67487  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||  ||||||||||    || || |||    
T  67486 gttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taatcctccaatgattggatcgtc 67388  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  67387 ctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacc 67288  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  67287 tcggatccctatccgacacaatactcgaaggaa 67255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6098 - 5771
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  6098 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctac 5999  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||    |||| ||| |||||||| |||||||   | || |  || ||||| ||    
T  5998 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgacgaactaaatctggtcccaa 5899  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  5898 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 5799  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5798 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 5771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 26264 - 26591
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  26264 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 26363  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||| ||| ||    
T  26364 gcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaa 26463  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   || | ||||| |||||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||  |||||    
T  26464 cactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactagaatggtaactg 26563  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  26564 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 26591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 538
Target Start/End: Original strand, 26856 - 27169
Alignment:
Q  225 tctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaag 324  Q
    ||||| |||||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| |    
T  26856 tctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacg 26955  T
Q  325 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg 424  Q
    | ||||| |||||||||| |      ||  ||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   || ||| || ||||| | |||    
T  26956 tgaactctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactg 27055  T
Q  425 cccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccga 524  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||| || |||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| | |    
T  27056 accatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctcta 27155  T
Q  525 tctgacacaatact 538  Q
    || |||||||||||    
T  27156 tccgacacaatact 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 538
Target Start/End: Original strand, 26610 - 26787
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||   || ||| || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  26610 caccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 26709  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||| || |||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  26710 caactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatact 26787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 58000 - 57674
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || ||||  ||| | || ||||||||||||||||| ||    ||||||||||   |||| ||||    
T  58000 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctcc 57901  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||||||||| || || || |||| |||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| ||| | || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  57900 gcttatcatggtaactttt-tgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 57802  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  57801 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 57702  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  57701 ttgttgtaggtgaactctatcaatggta 57674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49001 - 48890
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||    
T  49001 gactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 48902  T
Q  331 caatcaacggta 342  Q
    | ||||||||||    
T  48901 ctatcaacggta 48890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 57634 - 57480
Alignment:
Q  382 ctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagc 481  Q
    |||||||||||||||||||    || || ||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||||||       
T  57634 ctctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtt 57535  T
Q  482 ttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaata 536  Q
     |||||||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||| |||  ||||||||    
T  57534 ctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcagatccctatccaacacaata 57480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52047 - 51720
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| | || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  52047 ggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 51948  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||  || || |||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||||  || || |  |||||||| ||    
T  51947 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaa 51848  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  |||||    
T  51847 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactg 51748  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51747 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 51720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 438 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 51624 - 51524
Alignment:
Q  438 ggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 537  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  || |||| |||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  51624 ggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatac 51525  T
Q  538 t 538  Q
    |    
T  51524 t 51524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 535
Target Start/End: Original strand, 1048 - 1550
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| |||||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||    
T  1048 ttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactct 1147  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    | |||| | |||| ||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| || |||||||  || || |  || ||||| || |   ||||||| || ||    
T  1148 tttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctga 1247  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    |||||||||||| ||| | || || ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||| || |||||     
T  1248 ctcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactct 1347  T
Q  333 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcgg 432  Q
    |||||||| | |      || ||| |  ||||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||   |||||| || || |  | ||  ||||| |    
T  1348 atcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctg 1447  T
Q  433 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacac 532  Q
    |||| ||||| ||  | ||||||||  |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  1448 tctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacac 1547  T
Q  533 aat 535  Q
    |||    
T  1548 aat 1550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 656
Target Start/End: Original strand, 163 - 253
Alignment:
Q  566 ctgctcaatgtagatctcagccaacttcgccacagtcatacccgtcttgataggaacaaaatgcgctgactttgtcaaccgatcaacaatc 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  163 ctgctcaatgtagatctcagccaactttgccacagacatactagtcttgataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatc 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 538
Target Start/End: Original strand, 40066 - 40383
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| || ||||| | |||  ||||||||||    
T  40066 cactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtc-tgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcataccaatactcgaatggtaactgttgtt 40164  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| ||||| |||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||     
T  40165 gtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactgaatcgtcctctcc 40264  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| |||||  | || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40265 gactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 40364  T
Q  520 cccgatctgacacaatact 538  Q
    | | ||| |||||||||||    
T  40365 ctctatccgacacaatact 40383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 556
Target Start/End: Original strand, 8 - 532
Alignment:
Q  31 acttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagct 130  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   ||||||| | ||| ||||| || ||    
T  8 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaact 107  T
Q  131 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccg 230  Q
    |||||| | |||||  ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||||   |||| |||||     
T  108 cttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcct 207  T
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||  | ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||    
T  208 gactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaac-gttccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 306  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | |||| ||||| |      ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||| ||||||||| |    |||||| || ||||| | ||| |||||    
T  307 ctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgactgaccatc 406  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  407 tgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgac 506  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || || | |||||||||    
T  507 acaatactcgatggtacatcatgcaa 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 546
Target Start/End: Original strand, 7522 - 8050
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 7721  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || ||  |||||||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  7722 cactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7821  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |     ||||| || ||||    
T  7822 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttctct 7921  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  7922 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8021  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  8022 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 8050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Original strand, 9920 - 10438
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || | || |||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||     | |||| |    
T  9920 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctac 10014  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  10015 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 10114  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| | ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  10115 caccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 10214  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcc 414  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    ||||||| || |  | |||  |||||| ||||||||| ||    ||||| || |    
T  10215 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttc 10314  T
Q  415 tctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacct 514  Q
    |||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  10315 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 10414  T
Q  515 cggatcccgatctgacacaatact 538  Q
     ||||| | ||| |||||||||||    
T  10415 tggatctctatccgacacaatact 10438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 556
Target Start/End: Original strand, 34 - 359
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  34 gactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaact 133  T
Q  331 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 430  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || | |  |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  134 ctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactgaatcgtcctctccgactgaccatc 233  T
Q  431 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgac 530  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  || ||||   |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||     
T  234 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 333  T
Q  531 acaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||    
T  334 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6613
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaa-aaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | |||||||  ||| ||||| || ||  | ||||||||||  || |||||     
T  6305 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttccta 6404  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6405 cgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6504  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | |||| |||||  |||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  6505 acacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaact 6604  T
Q  314 gttgttgta 322  Q
     ||||||||    
T  6605 attgttgta 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18722 - 18394
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||     
T  18722 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 18623  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |    
T  18622 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 18523  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||    |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  18522 actctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 18423  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18422 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 18310 - 18198
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| | ||    
T  18310 ccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatctctat 18211  T
Q  526 ctgacacaatact 538  Q
      |||||||||||    
T  18210 acgacacaatact 18198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 870
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatact 870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 538
Target Start/End: Original strand, 2121 - 2439
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||| |||    
T  2121 cactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtagtt 2220  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctct 419  Q
    ||| || ||||| ||||||||||        ||||||   ||||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| ||    | ||| ||||||||     
T  2221 gtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattaaatcgtcctctcc 2320  T
Q  420 gtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggat 519  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||    
T  2321 gactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcggat 2420  T
Q  520 cccgatctgacacaatact 538  Q
      | ||| |||||||||||    
T  2421 gtctatccgacacaatact 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Original strand, 7502 - 7824
Alignment:
Q  18 gtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 117  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||| || || |  |    
T  7502 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtt 7601  T
Q  118 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 217  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||| | ||| |||   ||||||||||| |     
T  7602 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcctaagac 7701  T
Q  218 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 317  Q
      | || || || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||     
T  7702 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7801  T
Q  318 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  7802 ttgtatgtgaactcgatcaacgg 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 556
Target Start/End: Original strand, 7877 - 8029
Alignment:
Q  404 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 503  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  7877 ctgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 7976  T
Q  504 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |||||||| || ||| | | |||||| || || || ||||||| | |||||||    
T  7977 gaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 8029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10905 - 10600
Alignment:
Q  33 ttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctct 132  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| |||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  10905 ttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactct 10806  T
Q  133 tctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgga 232  Q
    | |||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||  ||  |||| || ||||| | ||| || |  || ||||| ||||   |||| || || ||    
T  10805 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatcaa-ttggccttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 10707  T
Q  233 ctcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 332  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||| |||||| |     
T  10706 ctcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacact 10607  T
Q  333 atcaacg 339  Q
    |||||||    
T  10606 atcaacg 10600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 538
Target Start/End: Original strand, 704 - 1173
Alignment:
Q  69 ctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatct-tctcctga 167  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| | | || |    
T  704 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttctta 803  T
Q  168 atcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgac 267  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  804 -tcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgac 902  T
Q  268 catacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttg 367  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||| | |||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||        || |||    |||||||    
T  903 catacaaagcttcgaaaggagccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttg 1002  T
Q  368 ctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactta 467  Q
    ||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||   || || |||||||| | ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  1003 ctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttc 1102  T
Q  468 gttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |  ||||| ||| ||||||| |||| ||  ||  ||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  1103 gaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39072 - 38758
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||     
T  39072 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 38973  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| |||||  || || |||||||| | |   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  38972 cgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 38873  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||    
T  38872 acacaacgctctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 38773  T
Q  314 gttgttgtaagtaaa 328  Q
    |||||| ||||||||    
T  38772 gttgttataagtaaa 38758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 6316 - 5988
Alignment:
Q  220 cactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgtt 319  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| | |||  ||||||| ||    
T  6316 cactctcttctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttatt 6217  T
Q  320 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca--aaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 417  Q
    ||| || ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  | |||||  |||||||||||||||||||    || || |||||||    
T  6216 gtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctct 6117  T
Q  418 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 517  Q
    | | ||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||  ||| ||| ||||||| |||||| |    
T  6116 ccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcag 6017  T
Q  518 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  6016 atccctatccgacacaatactcgaaggaa 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 7075 - 6898
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| ||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  7075 caccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacct 6976  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  6975 caacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatact 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11506 - 11329
Alignment:
Q  361 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 460  Q
    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| ||    || || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  11506 caccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacct 11407  T
Q  461 caacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  11406 caacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatact 11329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 49614 - 49922
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| || || |||||  |  |||||||| | || || |||||||  || |||||  ||||||||||||  || |||||     
T  49614 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttccta 49713  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||||||||||||  |||| || | |||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  ||  ||||||    
T  49714 cgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgagtccta 49813  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    | | | | || |  || |||||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  49814 aaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 49913  T
Q  314 gttgttgta 322  Q
     || |||||    
T  49914 attattgta 49922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 591
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19300
Alignment:
Q  412 tcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 511  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  512 cctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 591  Q
     || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| || ||| || ||||| |||||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaact 19300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 591
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34724
Alignment:
Q  471 cccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgct 570  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||  | ||||||| ||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  571 caatgtagatctcagccaact 591  Q
     ||| || ||||| |||||||    
T  34704 taatataaatctctgccaact 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 4872 - 5199
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  4872 ggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 4971  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  4972 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 5071  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||||  |||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  |||||    
T  5072 caccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 5171  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5172 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 5199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5395
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||  |||| ||||  |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||    
T  5262 tgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctag 5361  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  5362 aagtgaacctcgaatctctatccgacacaatact 5395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 337
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1443
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||  |||  |||||||  || || || |    
T  1127 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctac 1226  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     |||||||||||| ||||| || | |||||| ||||  |||| ||| | || |||| |||||||||| || ||||||| |||       || ||||||||    
T  1227 gcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttca-ctttttcttaatcgtcttaaccttctcagtagtttgttgtc-----tctggtcctaa 1320  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
     |   || |||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||    
T  1321 aaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatg 1420  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    || | ||| || ||||| |||||    
T  1421 ttatagtacgtgaactctatcaa 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 556
Target Start/End: Original strand, 1520 - 1662
Alignment:
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |    
T  1520 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaac 1619  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    |  |||| | |||||| ||||| || ||||||| | |||||||    
T  1620 taagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1104
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||     
T  1354 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 1255  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    || ||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| |    
T  1254 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttattatcttgaccttctccgtagtctaatgaaccaaatccggtccca 1155  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctcc 264  Q
    ||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||    
T  1154 acataacactttctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctcc 1104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 7422 - 6899
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || ||  ||| || | | ||||||| |||||||||||| ||  | ||||||| ||   ||||||| |    
T  7422 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctac 7323  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc-ctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| || |||| ||||||| || || || ||||  |  || || |  |||||||| |    
T  7322 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctga-tcatcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtccca 7224  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||| | ||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| | |||  ||||    
T  7223 acacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccataccaatacttgaatggtaact 7124  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtc 413  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| || |      ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||   || || |||    
T  7123 gttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtc 7024  T
Q  414 ctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacc 513  Q
    | ||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||  || ||  ||||||| ||||    
T  7023 cactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacc 6924  T
Q  514 tcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||    
T  6923 tcggatctctatccgacacaatact 6899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 18971 - 19287
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | || ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||||| | |    
T  18971 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatac 19070  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  || |  |||| ||||| |||||| ||||| | ||| || |  |  || || ||    
T  19071 gcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaa 19170  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  19171 catcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 19270  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactc 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  19271 ttgttgtaagtaaactc 19287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 23133 - 23449
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | || ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||||| | |    
T  23133 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatac 23232  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  || |  |||| ||||| |||||| ||||| | ||| || |  |  || || ||    
T  23233 gcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaa 23332  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactg 314  Q
    ||   |||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||  ||||     
T  23333 catcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 23432  T
Q  315 ttgttgtaagtaaactc 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  23433 ttgttgtaagtaaactc 23449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28953 - 28625
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||  || || |||||| || | || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  28953 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 28854  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctga-atcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| ||| || || || |||||||||||||   ||||  || ||||||||  |||| |  || || |  |  ||||| |    
T  28853 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtccca 28754  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||  ||||| || ||  |||||||| || ||||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  28753 acactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 28654  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28653 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 28625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40944 - 40616
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||  || || |||||| || | || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  40944 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 40845  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctga-atcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
     ||| |||||||| |||||||||| ||| || || || |||||||||||||   ||||  || ||||||||  |||| |  || || |  |  ||||| |    
T  40844 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttttctatagtctgatgaactatatatggtccca 40745  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    |||  ||||| || ||  |||||||| || ||||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||  ||||    
T  40744 acactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 40645  T
Q  314 gttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40644 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 40616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 639
Alignment:
Q  95 aaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttct 194  Q
    |||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||      
T  884 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgc 785  T
Q  195 tgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattc 294  Q
    || ||||  || |||||||| |   | || || || ||||||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  784 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 685  T
Q  295 cgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 340  Q
    | ||||||| | || |||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  684 caatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacgg 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8190
Alignment:
Q  234 tcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 333  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |    
T  8293 tcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactcta 8194  T
Q  334 tcaa 337  Q
    ||||    
T  8193 tcaa 8190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 316 - 261
Alignment:
Q  234 tcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 289  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316 tcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 546
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25627
Alignment:
Q  383 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 482  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  483 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||  | |||||| ||||| || |||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaa 25627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 556
Target Start/End: Original strand, 6390 - 6712
Alignment:
Q  234 tcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 333  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |    
T  6390 tcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcatagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactcta 6489  T
Q  334 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggt 433  Q
    |||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||   |||||| |||||||| | ||| | |||  |    
T  6490 tcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctat 6589  T
Q  434 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacaca 533  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||   | |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  6590 ttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 6689  T
Q  534 atactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||  | ||||||| | |||||||    
T  6690 atggtcgaaggaacaccatgcaa 6712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 342
Target Start/End: Original strand, 136269 - 136359
Alignment:
Q  252 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  136269 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 136359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 5092 - 4959
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||    
T  5092 tgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctag 4993  T
Q  505 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4992 aagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 4959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 46566 - 46675
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||||| ||||    
T  46566 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtaagtgaact 46665  T
Q  331 caatcaacgg 340  Q
    | ||||||||    
T  46666 cgatcaacgg 46675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 86664 - 86366
Alignment:
Q  39 gcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtc 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || | || || ||||| ||||| | |||  |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  86664 gcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtc 86565  T
Q  139 tactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaa 238  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||    |||| ||||||||| || ||||| | ||| | ||  || ||||| |  |   || |||| ||||||||| |    
T  86564 tactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcata 86465  T
Q  239 ccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaa 337  Q
    |||||| ||| | || || || |||||||||||||| || || |||||| ||||| | || |||| |||  ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  86464 ccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccattgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaa 86366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 3638 - 3422
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||    
T  3638 acacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccca 3539  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatctaacaatctgctcaat 574  Q
    ||||  |||| ||||| | ||||||  |  | ||||| || ||||| | || ||| ||||| || ||||||| | ||||||| || ||||||| || |||    
T  3538 aagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaat 3439  T
Q  575 gtagatctcagccaact 591  Q
     || ||||| |||||||    
T  3438 atatatctctgccaact 3422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3802 - 3740
Alignment:
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 178  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3802 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4275
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||     
T  4012 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttccta 4111  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 213  Q
    | ||| ||||| || ||||| |||| |||||  ||||| |||||||| ||    |||||||| || || |||||||| |  |  || |  |||||||| |    
T  4112 cgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgataaactaaatccggtccca 4211  T
Q  214 acaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 277  Q
    |||   |||| ||||  |||||||||||| |||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4212 acactacactttctcttgactcaaaccaatatataggagtcctgcaccttcgaccatacaaagc 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 30
Alignment:
Q  16 gagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcct 115  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||| |     
T  165 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacg 66  T
Q  116 cttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgc 151  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||    
T  65 cttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15800
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | ||  |||||||||| || |||||  |||||||||| |  |  |||||     
T  15613 aggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttccta 15712  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 201  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  15713 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaa 15800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 509
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16271
Alignment:
Q  70 tcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 169  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||| |  |  ||||| | ||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  170 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgacca 269  Q
    ||| ||||| || || ||||||| ||| ||||  ||  ||||||| |   | || || ||  ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  270 tacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 369  Q
     | ||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16131  T
Q  370 ccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 469  Q
    | |  |||||| |||||||||| ||||| |    |||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||     
T  16132 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 16231  T
Q  470 tcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagta 509  Q
     || |||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  16232 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagta 16271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7220 - 7078
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||   | || || |    
T  7220 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctac 7121  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcat 157  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  7120 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19838 - 19645
Alignment:
Q  363 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 462  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| ||| || | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  19838 ccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctca 19739  T
Q  463 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 556  Q
    ||||||  || |||||  ||| |||||| | ||| ||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  19738 acttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5225 - 5189
Alignment:
Q  1 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5225 gcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 546
Target Start/End: Original strand, 4428 - 4524
Alignment:
Q  450 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  4428 gaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 546
Target Start/End: Original strand, 11558 - 11654
Alignment:
Q  450 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  11558 gaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1633
Alignment:
Q  426 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 525  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| |  | ||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||    
T  1745 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctat 1646  T
Q  526 ctgacacaatact 538  Q
    |||||||||||||    
T  1645 ctgacacaatact 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 4912
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcc 114  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||| ||| || || |||| |||| | |  |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| || |    
T  5186 ggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 5087  T
Q  115 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 214  Q
     ||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| ||||| || |  || || |  |  ||| | ||    
T  5086 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtctgatgaactaaatatggttccaa 4987  T
Q  215 caaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 289  Q
    ||   |||| |||||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4986 caccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 28088 - 28231
Alignment:
Q  14 aggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctc 113  Q
    |||| |||||||| |  ||||||  ||||| ||||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||| |||||| ||     
T  28088 aggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttcta 28187  T
Q  114 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcat 157  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  28188 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32996
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |  |||||| || | |||||||||| ||| ||| |||| || |    
T  33107 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtga 33008  T
Q  511 acctcggatccc 522  Q
    ||||||||||||    
T  33007 acctcggatccc 32996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Original strand, 1603 - 1709
Alignment:
Q  231 gactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 330  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||| |||| || ||||| || ||||    
T  1603 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaact 1702  T
Q  331 caatcaa 337  Q
    | |||||    
T  1703 ctatcaa 1709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81493
Alignment:
Q  438 ggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 537  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  538 t 538  Q
    |    
T  81493 t 81493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 146237 - 146177
Alignment:
Q  283 acggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaa 343  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  146237 acggtgccattcctatgcttgaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaattaatggtaa 146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Original strand, 12 - 91
Alignment:
Q  234 tcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaact 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  12 tcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataact 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19029 - 18858
Alignment:
Q  375 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccca 474  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||   ||||||  | ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||  |  |    
T  19029 acacaaactctcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaactta 18930  T
Q  475 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 546  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  18929 aagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 18858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2536
Alignment:
Q  411 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 510  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| | | |||||||||||| ||||||  | ||||| |    
T  2663 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 2564  T
Q  511 acctcggatcccgatctgacacaatact 538  Q
    |||| ||||| | ||| || ||||||||    
T  2563 accttggatctctatccgatacaatact 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 516
Target Start/End: Original strand, 4942 - 5053
Alignment:
Q  405 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 504  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||| | | | |||||||||||| ||||||| | |    
T  4942 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttg 5041  T
Q  505 aagtaaacctcg 516  Q
    ||||||||||||    
T  5042 aagtaaacctcg 5053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 1299 - 1385
Alignment:
Q  15 ggagtcaacttcctacacttcaaggcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatctccaacttgaaactca 101  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  1299 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 163
Target Start/End: Original strand, 391 - 461
Alignment:
Q  93 tgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctc 163  Q
    ||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  391 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University