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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF6914_low_7 (Length: 560)
Name: NF6914_low_7
Description: NF6914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6914_low_7 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 527; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 552
Target Start/End: Original strand, 4911570 - 4912104
Alignment:
| Q |
18 |
aaaatatttttcgggagattaatcatttcccataaaatattgaattggttcaattggatacttaacttataaatggtaagatctactttcatttcaatta |
117 |
Q |
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| T |
4911570 |
aaaatatttttcgggagattaatcatttcccataaaatattgaattggttcaattggatacttaacttataaatggtaagatctactttcatttcaatta |
4911669 |
T |
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| Q |
118 |
tttactaagatgaaatgctcattatctagttacttagttattacaaagttcttcaaatctttagccaaatcactaatggaaaacattcttgaaacacctt |
217 |
Q |
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| T |
4911670 |
tttactaagatgaaatgctcattatctagttacttagttattacaaagttcttcaaatctttagccaaatcactaatggaaaacattcttgaaacacctt |
4911769 |
T |
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| Q |
218 |
gagaagcaataaaatatacacaaatcagtataacgaaaccaaaccctacaccaatgagaattaacccaaagaattactgctaacccaatgacaactgtaa |
317 |
Q |
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| T |
4911770 |
gagaagcaataaaatatacacaaatcaacataacgaaaccaaaccctacaccaatgagaattaacccaaagaattactgctaacccaatgacaactgtaa |
4911869 |
T |
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| Q |
318 |
cataagatgcaacacaactccaatagaaggactccatatcaattgcggtctgatgttgcgttgtcgatgctggtggaaaaatggaggtatgattgcaggt |
417 |
Q |
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| T |
4911870 |
cataagatgcaacacaactccaatagaaggactccatatcaattgcggtctgatgttgcgttgtcgatgctggtggaaaaatggaggtatgattgcaggt |
4911969 |
T |
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| Q |
418 |
tatattgataacagatccacaaagatctgaattacctctatagttgttctcatcaaagtttgcaaactgcattgtggttggaactctaccagagaatttg |
517 |
Q |
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| T |
4911970 |
tatattgataacagatccacaaagatctgaattacctctatagttgttctcatcaaagtttgcaaactgcattgtggttggaactctaccagagaatttg |
4912069 |
T |
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| Q |
518 |
ttatatgagacattgaatatagctaaagagtataa |
552 |
Q |
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| T |
4912070 |
ttatatgagacattgaatatagctaaagagtataa |
4912104 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 552
Target Start/End: Original strand, 32744628 - 32745112
Alignment:
| Q |
69 |
aattggatacttaacttataaatggtaagatct-actttcatttcaattatttactaagatgaaatgctcattatctagttacttagttattacaaagtt |
167 |
Q |
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| T |
32744628 |
aattggatacctaacttataaatggcaagatcttactttcacttcaattatttactcagatggaatactcattatctagttacttagttattacaaagtt |
32744727 |
T |
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| Q |
168 |
cttcaaatctttagccaaatcactaatggaaaacattcttgaaacaccttgagaagcaataaaatatacacaaatcagtataacgaaaccaaaccctaca |
267 |
Q |
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| T |
32744728 |
cttccaatctttagctatatcattaatggaaaacattcttgaaacaccttgtgaagcaataaaatatacacaaatcaacataatggaaccatgccctaca |
32744827 |
T |
|
| Q |
268 |
ccaatgagaattaacccaaagaattactgctaacccaatgacaactgtaacataagatgcaacacaactccaatagaaggactccatatcaattgcggtc |
367 |
Q |
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| T |
32744828 |
ccaatgagaattaacccaaagaattactgctaacccaatgataactgaaacataagatgcagcacaactccaatagaaggactcgatatcaattgcagtc |
32744927 |
T |
|
| Q |
368 |
tgatgttgcgttgtcgatgctggtggaaaaatggaggtatgattgcaggttatattgataacagatccacaaagatctgaattacctctatagttgttct |
467 |
Q |
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| T |
32744928 |
tgatgttgcgttgtcgatgctggtggaaatatggaggtatgattgcagattatattgataacagatccacaaagatctgaattacctctatagttgttct |
32745027 |
T |
|
| Q |
468 |
catcaaagtttgcaaactgcattgtggttggaactctaccagagaatttgttatatgagacattgaatatagctaaagagtataa |
552 |
Q |
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| T |
32745028 |
catcaaagtttgcaaactgcattgtggttggaattgtaccagaaaatttgttgtatgagacattgaatatggctaaagagtataa |
32745112 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 155 - 552
Target Start/End: Original strand, 2125145 - 2125542
Alignment:
| Q |
155 |
ttattacaaagttcttcaaatctttagccaaatcactaatggaaaacattcttgaaacaccttgagaagcaataaaatatacacaaatcagtataacgaa |
254 |
Q |
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| T |
2125145 |
ttattacgaagtttttccaatctttagcaatgtcactaatggaaagcattcttaaaacaccttgagaagcaataaaatatacacatatcaacataataga |
2125244 |
T |
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| Q |
255 |
accaaaccctacaccaatgagaattaacccaaagaat---tactgctaacccaatgacaactgtaacataagatgcaacacaactccaatagaaggactc |
351 |
Q |
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| T |
2125245 |
accaagccatgcaccaatgagaattaacccaaagaataattattgccaacccaatgacaagtgtgacataagatgcagcaaaaccccaatagaaggactc |
2125344 |
T |
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| Q |
352 |
catatcaattgcggtctgatgttgcgttgtcgatgctggtggaaaaatggaggtatgattgcaggttatattgataacagatccacaaagatctgaatta |
451 |
Q |
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| T |
2125345 |
catatccattgcagtctgattttgcattgtctccaatgttgagaaaatgg---tatcattgcagcttatattgagaacagatccacaaagatctgaatta |
2125441 |
T |
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| Q |
452 |
cctctatagttgttctcatcaaagtttgcaaactgcattgtggttggaactctaccagagaatttgttatatgagacattgaatatagctaaagagtata |
551 |
Q |
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| T |
2125442 |
cctctatagttattctcatcaaaatttgcaaactgcattgtggttggaattttcccagacaatttgttgtatgagacattgaatatggctaaagagtata |
2125541 |
T |
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