View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6918_low_6 (Length: 603)

Name: NF6918_low_6
Description: NF6918
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6918_low_6
NF6918_low_6
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-589)||(12889021-12889609)
chr3 (1-589)||(16753931-16754519)
chr3 (1-589)||(43164987-43165575)
chr3 (1-589)||(48427759-48428347)
chr3 (1-589)||(20059284-20059872)
chr3 (1-589)||(13255002-13255590)
chr3 (1-589)||(15345475-15346063)
chr3 (1-589)||(5422160-5422748)
chr3 (1-589)||(6603048-6603635)
chr3 (1-589)||(15586622-15587210)
chr3 (1-589)||(16638085-16638673)
chr3 (1-589)||(53382248-53382836)
chr3 (1-589)||(10007912-10008500)
chr3 (1-589)||(10908522-10909110)
chr3 (1-589)||(3688255-3688843)
chr3 (1-589)||(26790643-26791231)
chr3 (1-589)||(15713286-15713874)
chr3 (1-589)||(15358395-15358983)
chr3 (1-589)||(15399748-15400335)
chr3 (1-589)||(24185502-24186090)
chr3 (5-572)||(15065400-15065967)
chr3 (1-589)||(16804177-16804765)
chr3 (1-589)||(16694476-16695064)
chr3 (106-589)||(14873903-14874386)
chr3 (107-589)||(15261942-15262424)
chr3 (107-563)||(14578744-14579200)
chr3 (56-589)||(12843388-12843921)
chr3 (277-589)||(17492163-17492475)
chr3 (392-575)||(26190937-26191120)
chr3 (12-279)||(23079258-23079525)
chr3 (181-512)||(47126343-47126674)
chr3 (136-512)||(13944423-13944799)
chr3 (181-512)||(10408367-10408698)
chr3 (181-577)||(12857894-12858290)
chr3 (149-491)||(15013136-15013476)
chr3 (142-491)||(14290892-14291241)
chr3 (8-512)||(28756718-28757222)
chr3 (168-578)||(31692571-31692981)
chr3 (8-243)||(11861032-11861246)
chr3 (181-495)||(17494062-17494377)
chr3 (202-512)||(12272737-12273047)
chr3 (168-578)||(31941236-31941646)
chr3 (136-464)||(8744744-8745072)
chr3 (166-578)||(10417429-10417841)
chr3 (168-494)||(12357913-12358239)
chr3 (181-414)||(17188871-17189104)
chr3 (445-589)||(18437452-18437596)
chr3 (181-512)||(24189703-24190034)
chr3 (166-512)||(16831912-16832258)
chr3 (181-493)||(12180762-12181074)
chr3 (181-469)||(12509882-12510170)
chr3 (207-491)||(16825706-16825990)
chr3 (181-464)||(11958580-11958863)
chr3 (200-512)||(15230002-15230314)
chr3 (200-512)||(15235870-15236182)
chr3 (292-491)||(14575406-14575605)
chr3 (166-512)||(16378318-16378664)
chr3 (168-539)||(18131733-18132103)
chr3 (107-233)||(19727428-19727554)
chr3 (51-387)||(16326978-16327314)
chr3 (1-162)||(23415020-23415181)
chr3 (181-349)||(11949324-11949492)
chr3 (166-334)||(13317918-13318086)
chr3 (373-539)||(11949499-11949665)
chr3 (1-46)||(5110639-5110684)
chr3 (445-589)||(11888027-11888172)
chr3 (367-495)||(13318087-13318215)
chr3 (445-530)||(13969783-13969868)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (1-589)||(27665663-27666251)
chr5 (1-589)||(16359127-16359715)
chr5 (1-589)||(34569119-34569707)
chr5 (1-589)||(41773467-41774055)
chr5 (1-589)||(27612981-27613569)
chr5 (4-589)||(40711405-40711990)
chr5 (1-589)||(19772585-19773173)
chr5 (1-589)||(27521031-27521619)
chr5 (1-589)||(22330060-22330648)
chr5 (1-589)||(14996912-14997500)
chr5 (1-589)||(22137293-22137881)
chr5 (1-589)||(29473246-29473834)
chr5 (1-589)||(27682573-27683161)
chr5 (1-589)||(37288669-37289257)
chr5 (1-589)||(22350544-22351132)
chr5 (1-589)||(18781739-18782327)
chr5 (10-589)||(21882399-21882978)
chr5 (195-589)||(20803222-20803616)
chr5 (61-589)||(25429046-25429574)
chr5 (238-581)||(21342824-21343167)
chr5 (107-589)||(26736006-26736488)
chr5 (56-578)||(23473831-23474353)
chr5 (5-361)||(23460824-23461180)
chr5 (10-313)||(23525952-23526255)
chr5 (277-577)||(21336743-21337043)
chr5 (142-353)||(21631713-21631924)
chr5 (149-458)||(21409890-21410199)
chr5 (181-589)||(21983530-21983938)
chr5 (139-578)||(28892253-28892692)
chr5 (107-273)||(21332265-21332431)
chr5 (181-521)||(14884344-14884684)
chr5 (166-563)||(20824086-20824483)
chr5 (52-461)||(25850807-25851216)
chr5 (139-578)||(20778531-20778970)
chr5 (181-491)||(21561378-21561688)
chr5 (135-577)||(22464569-22465011)
chr5 (181-563)||(23563521-23563903)
chr5 (310-491)||(20311573-20311754)
chr5 (200-469)||(22505406-22505675)
chr5 (181-469)||(23078258-23078546)
chr5 (350-434)||(23525867-23525951)
chr5 (136-578)||(17266642-17267084)
chr5 (8-461)||(20345017-20345470)
chr5 (8-140)||(20803671-20803803)
chr5 (51-102)||(22505773-22505824)
chr5 (183-224)||(20803613-20803654)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-589)||(16983564-16984152)
chr2 (1-589)||(9337906-9338494)
chr2 (1-589)||(9486540-9487128)
chr2 (1-589)||(24712358-24712946)
chr2 (1-589)||(22322873-22323461)
chr2 (1-589)||(44383101-44383689)
chr2 (1-589)||(17001324-17001912)
chr2 (1-589)||(27373593-27374181)
chr2 (1-589)||(10871174-10871762)
chr2 (1-589)||(24264694-24265282)
chr2 (1-589)||(24874281-24874869)
chr2 (9-589)||(24705021-24705601)
chr2 (5-589)||(24677811-24678395)
chr2 (8-563)||(11351249-11351804)
chr2 (175-589)||(27220340-27220754)
chr2 (190-589)||(21142761-21143160)
chr2 (1-589)||(23204638-23205226)
chr2 (5-589)||(24657193-24657777)
chr2 (80-589)||(21322876-21323385)
chr2 (5-500)||(23028996-23029491)
chr2 (10-589)||(23105267-23105847)
chr2 (61-589)||(23074187-23074715)
chr2 (165-470)||(45673707-45674012)
chr2 (233-589)||(41606155-41606504)
chr2 (61-589)||(22733365-22733893)
chr2 (13-360)||(22742509-22742856)
chr2 (61-353)||(23064973-23065265)
chr2 (56-560)||(24817426-24817930)
chr2 (1-249)||(23676582-23676830)
chr2 (2-196)||(21139513-21139707)
chr2 (149-491)||(19817269-19817611)
chr2 (200-512)||(23097748-23098060)
chr2 (140-491)||(30208590-30208941)
chr2 (200-512)||(23113124-23113436)
chr2 (1-129)||(23116590-23116718)
chr2 (200-491)||(19716747-19717038)
chr2 (168-495)||(23274011-23274338)
chr2 (1-193)||(22463012-22463204)
chr2 (136-512)||(12576754-12577130)
chr2 (181-435)||(20848067-20848321)
chr2 (367-539)||(23279150-23279322)
chr2 (550-589)||(11351800-11351839)
chr2 (200-248)||(19721310-19721358)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (1-589)||(20015697-20016285)
chr8 (1-589)||(17671456-17672044)
chr8 (4-589)||(19115159-19115744)
chr8 (1-589)||(19481506-19482094)
chr8 (1-589)||(18859336-18859924)
chr8 (1-589)||(22117609-22118197)
chr8 (1-589)||(22126393-22126981)
chr8 (1-589)||(30310578-30311166)
chr8 (5-589)||(19980726-19981310)
chr8 (1-589)||(22030862-22031450)
chr8 (1-589)||(32602904-32603492)
chr8 (1-589)||(22042586-22043174)
chr8 (1-589)||(15536142-15536730)
chr8 (5-589)||(21163976-21164560)
chr8 (109-589)||(22129159-22129639)
chr8 (61-589)||(21391355-21391883)
chr8 (61-589)||(21780681-21781209)
chr8 (55-589)||(21253704-21254238)
chr8 (107-589)||(22989804-22990286)
chr8 (107-589)||(22421433-22421914)
chr8 (211-589)||(21785999-21786377)
chr8 (211-589)||(22523305-22523683)
chr8 (124-589)||(22245990-22246455)
chr8 (177-589)||(22375064-22375475)
chr8 (124-420)||(22245572-22245868)
chr8 (181-506)||(21928270-21928595)
chr8 (181-512)||(22373705-22374036)
chr8 (8-469)||(16268665-16269126)
chr8 (181-512)||(28983747-28984078)
chr8 (145-589)||(20390845-20391289)
chr8 (181-512)||(28988966-28989297)
chr8 (181-491)||(19985037-19985347)
chr8 (181-578)||(22027894-22028291)
chr8 (181-464)||(29301040-29301323)
chr8 (166-491)||(22053720-22054045)
chr8 (181-512)||(31414146-31414477)
chr8 (61-215)||(18881151-18881305)
chr8 (219-461)||(27357423-27357665)
chr8 (450-589)||(21919987-21920126)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-589)||(14335078-14335666)
chr7 (1-589)||(8710287-8710875)
chr7 (1-589)||(18587171-18587759)
chr7 (1-589)||(44788351-44788939)
chr7 (1-589)||(18180427-18181013)
chr7 (1-589)||(15158057-15158645)
chr7 (1-589)||(13688723-13689311)
chr7 (1-589)||(11234213-11234801)
chr7 (1-589)||(11550102-11550690)
chr7 (1-589)||(12690184-12690771)
chr7 (1-589)||(17703455-17704043)
chr7 (1-589)||(9591050-9591634)
chr7 (173-589)||(14957236-14957652)
chr7 (245-589)||(8200730-8201074)
chr7 (299-589)||(10873372-10873662)
chr7 (107-488)||(15146029-15146410)
chr7 (67-564)||(14042402-14042899)
chr7 (67-564)||(14352432-14352929)
chr7 (1-304)||(16726441-16726744)
chr7 (1-231)||(11984032-11984262)
chr7 (142-562)||(15627233-15627653)
chr7 (427-589)||(14149862-14150024)
chr7 (136-512)||(18051066-18051442)
chr7 (181-512)||(19149771-19150102)
chr7 (181-512)||(20749170-20749501)
chr7 (1-127)||(14957652-14957778)
chr7 (168-539)||(13676184-13676555)
chr7 (181-512)||(26091956-26092287)
chr7 (200-563)||(15099780-15100143)
chr7 (181-512)||(16947630-16947961)
chr7 (208-464)||(13024153-13024409)
chr7 (200-512)||(14261423-14261734)
chr7 (8-512)||(49155061-49155565)
chr7 (8-463)||(26115575-26116030)
chr7 (181-512)||(40924975-40925306)
chr7 (463-589)||(16726845-16726971)
chr7 (8-437)||(13965653-13966082)
chr7 (73-485)||(12798551-12798963)
chr7 (181-469)||(21755215-21755503)
chr7 (181-469)||(12459431-12459719)
chr7 (181-512)||(14140439-14140770)
chr7 (181-469)||(11385587-11385875)
chr7 (1-81)||(10873652-10873731)
chr7 (181-512)||(15343191-15343522)
chr7 (166-399)||(12203943-12204176)
chr7 (181-469)||(14283532-14283820)
chr7 (533-581)||(15146416-15146464)
chr7 (51-115)||(12459785-12459849)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-589)||(29589575-29590163)
chr6 (1-589)||(28260333-28260921)
chr6 (1-589)||(28284995-28285583)
chr6 (1-589)||(28339082-28339670)
chr6 (1-589)||(28312187-28312775)
chr6 (1-589)||(24292918-24293506)
chr6 (1-589)||(2871938-2872527)
chr6 (1-589)||(16574447-16575035)
chr6 (1-589)||(16620345-16620933)
chr6 (1-589)||(25115109-25115697)
chr6 (1-589)||(5836364-5836952)
chr6 (5-589)||(27559109-27559693)
chr6 (184-589)||(27189993-27190398)
chr6 (184-589)||(27258842-27259247)
chr6 (5-589)||(22436426-22437010)
chr6 (10-589)||(19867244-19867823)
chr6 (92-589)||(16924867-16925364)
chr6 (10-581)||(18405089-18405660)
chr6 (107-589)||(23080980-23081462)
chr6 (1-279)||(22829522-22829800)
chr6 (351-589)||(22827841-22828079)
chr6 (148-589)||(18182650-18183091)
chr6 (1-189)||(27205579-27205767)
chr6 (1-189)||(27243461-27243649)
chr6 (56-448)||(23085016-23085408)
chr6 (142-491)||(30678301-30678650)
chr6 (1-206)||(25756751-25756956)
chr6 (181-521)||(19437627-19437967)
chr6 (373-589)||(20135531-20135747)
chr6 (373-589)||(22197122-22197338)
chr6 (181-512)||(19455657-19455988)
chr6 (168-512)||(18797324-18797668)
chr6 (200-512)||(21474234-21474546)
chr6 (181-512)||(25770478-25770809)
chr6 (166-578)||(15461904-15462316)
chr6 (466-589)||(16961082-16961206)
chr6 (181-589)||(10466164-10466572)
chr6 (181-469)||(34642902-34643190)
chr6 (181-491)||(19486610-19486918)
chr6 (293-512)||(21567419-21567638)
chr6 (181-463)||(24367083-24367365)
chr6 (168-512)||(24515717-24516061)
chr6 (181-338)||(19465976-19466133)
chr6 (181-469)||(14377232-14377520)
chr6 (51-115)||(10466034-10466098)
chr6 (296-387)||(20010885-20010976)
chr6 (8-101)||(24367445-24367538)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (1-589)||(12479293-12479881)
chr4 (1-589)||(17091880-17092468)
chr4 (1-589)||(19775524-19776112)
chr4 (1-589)||(23958440-23959028)
chr4 (1-589)||(8389105-8389693)
chr4 (1-589)||(16233723-16234311)
chr4 (1-589)||(27714029-27714617)
chr4 (1-589)||(8050354-8050942)
chr4 (1-589)||(14300710-14301298)
chr4 (1-589)||(19634829-19635417)
chr4 (9-589)||(40475733-40476313)
chr4 (1-589)||(14683260-14683848)
chr4 (55-589)||(18224231-18224765)
chr4 (1-589)||(16250581-16251169)
chr4 (5-589)||(15144627-15145212)
chr4 (56-589)||(14162163-14162696)
chr4 (55-589)||(15820-16354)
chr4 (131-441)||(16350415-16350725)
chr4 (1-347)||(13513285-13513631)
chr4 (123-589)||(14696794-14697260)
chr4 (277-589)||(14188199-14188511)
chr4 (328-589)||(16218923-16219184)
chr4 (328-589)||(16222243-16222504)
chr4 (437-589)||(16352697-16352849)
chr4 (181-512)||(15073129-15073460)
chr4 (1-248)||(18604550-18604797)
chr4 (181-464)||(29450708-29450991)
chr4 (136-578)||(51603918-51604360)
chr4 (56-286)||(16219184-16219414)
chr4 (56-286)||(16222504-16222734)
chr4 (181-512)||(3261965-3262296)
chr4 (181-463)||(44659037-44659319)
chr4 (136-353)||(53750596-53750813)
chr4 (8-469)||(11204230-11204691)
chr4 (142-512)||(14993499-14993869)
chr4 (166-469)||(27903198-27903501)
chr4 (181-469)||(20892844-20893132)
chr4 (200-387)||(16154677-16154864)
chr4 (8-258)||(7357291-7357541)
chr4 (200-387)||(16150531-16150718)
chr4 (454-589)||(22632393-22632528)
chr4 (292-469)||(15354322-15354499)
chr4 (448-589)||(14848543-14848684)
chr4 (319-512)||(15258697-15258890)
chr4 (200-322)||(15266736-15266858)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-589)||(21969-22557)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-589)||(16347658-16348246)
chr1 (1-589)||(51330555-51331143)
chr1 (1-589)||(21833010-21833598)
chr1 (1-589)||(33388092-33388680)
chr1 (1-589)||(41350731-41351319)
chr1 (1-589)||(19109076-19109664)
chr1 (1-589)||(24784920-24785508)
chr1 (1-589)||(17042078-17042666)
chr1 (1-443)||(21842066-21842508)
chr1 (52-458)||(20081490-20081896)
chr1 (10-387)||(22496328-22496705)
chr1 (55-578)||(16378813-16379336)
chr1 (1-329)||(21228619-21228947)
chr1 (1-220)||(22400397-22400616)
chr1 (10-353)||(21751991-21752334)
chr1 (439-589)||(21839658-21839808)
chr1 (388-589)||(21233181-21233382)
chr1 (400-587)||(22502751-22502938)
chr1 (5-236)||(22435800-22436031)
chr1 (61-268)||(22401621-22401828)
chr1 (357-589)||(21751645-21751877)
chr1 (181-491)||(21739279-21739589)
chr1 (181-512)||(31537240-31537571)
chr1 (181-512)||(52988557-52988888)
chr1 (142-512)||(22015949-22016319)
chr1 (184-539)||(19857063-19857418)
chr1 (181-464)||(38910069-38910352)
chr1 (181-512)||(48425689-48426020)
chr1 (135-578)||(20853957-20854400)
chr1 (200-469)||(20297240-20297509)
chr1 (145-512)||(21742759-21743126)
chr1 (181-512)||(24096858-24097189)
chr1 (8-463)||(37679914-37680369)
chr1 (168-512)||(20833130-20833474)
chr1 (356-512)||(429575-429731)
chr1 (181-353)||(20074952-20075124)
chr1 (445-587)||(22359751-22359893)
chr1 (55-194)||(21176531-21176670)
chr1 (292-464)||(12200382-12200554)
chr1 (445-587)||(21861880-21862022)
chr1 (168-413)||(18710300-18710545)
chr1 (142-242)||(21045328-21045428)
chr1 (478-589)||(20140791-20140902)
chr1 (123-189)||(22116876-22116942)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-589)||(10090-10678)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-589)||(3146-3734)
scaffold0044 (1-589)||(16882-17470)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-589)||(40877-41465)
scaffold0109 (1-589)||(13118-13706)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-589)||(11191-11779)
scaffold0028 (183-589)||(17659-18065)
scaffold0028 (315-589)||(53449-53723)
scaffold0028 (1-319)||(54996-55314)
scaffold0028 (1-185)||(21123-21307)
scaffold0028 (445-563)||(47952-48070)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-589)||(7980-8568)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (5-580)||(36229-36804)
scaffold0079 (445-589)||(28800-28944)
scaffold0079 (407-512)||(3517-3622)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-589)||(10233-10820)
scaffold0080 (1-589)||(12888-13475)
scaffold0080 (5-589)||(31606-32185)
scaffold0080 (5-589)||(37072-37651)
scaffold0080 (55-585)||(54363-54893)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (5-589)||(36818-37402)
scaffold0042 (56-588)||(26075-26607)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (5-589)||(10156-10740)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (78-589)||(17137-17648)
scaffold0017 (52-581)||(194883-195412)
scaffold0017 (154-491)||(24126-24463)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (5-589)||(34713-35296)
scaffold0022 (55-589)||(41354-41888)
scaffold0022 (55-589)||(75074-75608)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (1-589)||(11350-11938)
scaffold0177 (1-182)||(15035-15216)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (5-589)||(21326-21910)
scaffold0081 (5-589)||(36750-37334)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-406)||(7141-7546)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (112-589)||(29033-29510)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (52-581)||(50390-50919)
scaffold0102 (181-491)||(42518-42828)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (112-589)||(1137-1614)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-532)||(14203-14734)
scaffold0010 (143-589)||(4637-5083)
scaffold0010 (168-512)||(39494-39838)
scaffold0010 (292-512)||(44712-44932)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-500)||(474-973)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (10-561)||(18400-18951)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (10-588)||(10509-11087)
scaffold0476 (181-512)||(719-1050)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-443)||(7773-8217)
scaffold0130 (218-512)||(4100-4394)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (52-512)||(781-1241)
scaffold0993 (415-589)||(604-778)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (61-589)||(24766-25294)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-353)||(424266-424618)
scaffold0003 (184-398)||(203294-203508)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (10-589)||(4156-4735)
scaffold0621 (10-327)||(1-318)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (5-451)||(1-447)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (62-589)||(8672-9196)
scaffold0358 (392-589)||(17868-18065)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (61-589)||(7945-8473)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (61-589)||(110961-111489)
scaffold0040 (177-589)||(17600-18012)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (64-530)||(13865-14331)
scaffold0120 (64-268)||(11307-11510)
scaffold0120 (478-563)||(8770-8855)
scaffold0120 (202-247)||(25242-25287)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (107-577)||(23633-24103)
scaffold0011 (200-589)||(151289-151678)
scaffold0011 (202-254)||(73792-73844)
scaffold0011 (202-254)||(78173-78225)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (5-589)||(17347-17925)
scaffold0114 (166-589)||(39780-40203)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (61-588)||(23999-24526)
scaffold0243 (200-495)||(9965-10260)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-363)||(763-1125)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (5-487)||(10878-11360)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (5-470)||(2261-2726)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (55-589)||(55518-56052)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (56-578)||(6606-7128)
scaffold0270 (56-578)||(13736-14258)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (64-589)||(40564-41087)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (5-371)||(30572-30938)
scaffold0023 (277-589)||(151803-152115)
scaffold0023 (123-589)||(47099-47546)
scaffold0023 (409-589)||(1907-2087)
scaffold0023 (181-495)||(164575-164889)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (107-589)||(103949-104431)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (107-589)||(478-960)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (107-589)||(495742-496224)
scaffold0001 (56-457)||(441507-441907)
scaffold0001 (181-462)||(514527-514808)
scaffold0001 (508-560)||(441441-441493)
scaffold0001 (445-491)||(452651-452697)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-325)||(48651-48975)
scaffold0007 (310-521)||(83824-84035)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (67-578)||(14326-14837)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (123-589)||(13595-14061)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (12-350)||(1-339)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (107-589)||(216520-217002)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (144-578)||(5846-6280)
scaffold0074 (166-512)||(14922-15268)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (296-589)||(12385-12678)
scaffold0501 (10-234)||(1-225)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-392)||(8329-8712)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (136-560)||(15108-15532)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (56-560)||(23347-23851)
scaffold0018 (56-560)||(9400-9904)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (10-435)||(1865-2290)
scaffold0324 (366-589)||(12573-12795)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (5-322)||(15577-15894)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (1-248)||(1-248)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (56-455)||(57663-58062)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (211-577)||(4317-4683)
scaffold0575 (61-172)||(7796-7907)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (290-563)||(3349-3622)
scaffold0413 (63-217)||(3636-3790)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (55-349)||(14873-15167)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (5-314)||(2861-3170)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (107-475)||(15258-15614)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (142-561)||(4838-5257)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (412-589)||(8146-8323)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (55-341)||(3521-3807)
scaffold0278 (337-589)||(1174-1426)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (107-385)||(7839-8117)
scaffold0207 (10-103)||(4558-4651)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (439-589)||(9662-9812)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (392-589)||(15379-15576)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-252)||(171177-171428)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (414-589)||(551-726)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-248)||(229846-230093)
scaffold0009 (181-469)||(251464-251752)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (156-491)||(1819-2154)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (88-512)||(11759-12183)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (9-220)||(69424-69634)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (200-563)||(60487-60850)
scaffold0046 (142-338)||(70081-70277)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (10-227)||(30371-30588)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (181-563)||(29-411)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (149-463)||(41250-41563)
scaffold0035 (181-424)||(5692-5935)
scaffold0035 (375-512)||(5550-5687)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (166-578)||(94053-94465)
scaffold0029 (181-413)||(115460-115692)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (181-539)||(355-713)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (1-211)||(5098-5308)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (142-512)||(43554-43924)
scaffold0104 (311-512)||(25015-25216)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (436-589)||(1-154)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-189)||(1-189)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (181-589)||(29249-29657)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (181-512)||(11608-11939)
[»] scaffold0222 (3 HSPs)
scaffold0222 (181-539)||(20586-20944)
scaffold0222 (292-491)||(772-971)
scaffold0222 (181-242)||(661-722)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (129-495)||(29440-29806)
scaffold0067 (166-491)||(64761-65086)
scaffold0067 (166-491)||(49339-49664)
scaffold0067 (166-491)||(58373-58698)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (142-491)||(63654-64003)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (181-561)||(4263-4643)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (181-512)||(200642-200973)
scaffold0004 (168-578)||(325440-325850)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (181-589)||(1446-1854)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (1-194)||(14026-14219)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (464-589)||(27952-28077)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (181-589)||(28459-28867)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (200-512)||(98776-99088)
scaffold0020 (207-512)||(175787-176092)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (181-512)||(919-1250)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (200-563)||(110358-110721)
scaffold0031 (512-589)||(52430-52507)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (181-491)||(1485-1795)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (184-514)||(2668-2998)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (181-491)||(7564-7874)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (5-191)||(7655-7841)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (142-512)||(49904-50274)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (235-563)||(21413-21743)
scaffold0100 (142-238)||(16744-16840)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (181-469)||(1057-1345)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (409-589)||(6489-6669)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (181-469)||(303-591)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (168-495)||(6854-7181)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (160-563)||(5350-5753)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (181-512)||(41534-41865)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (135-469)||(5023-5357)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (200-437)||(12601-12838)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (168-469)||(1015-1316)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (184-512)||(263025-263353)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (166-589)||(5008-5431)
scaffold0348 (166-464)||(17643-17941)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (168-539)||(9388-9758)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (181-495)||(2126-2441)
scaffold0034 (166-469)||(70214-70517)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-160)||(1-160)
scaffold0008 (1-38)||(139604-139641)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (142-464)||(1568-1890)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (168-506)||(8623-8961)
scaffold0235 (168-506)||(18837-19175)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (292-578)||(53708-53994)
scaffold0076 (181-248)||(53597-53664)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (168-578)||(53780-54190)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (142-363)||(4439-4660)
scaffold0335 (427-512)||(4670-4755)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (181-469)||(5319-5607)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (168-512)||(8413-8757)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (356-512)||(819-975)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (181-512)||(9960-10291)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (200-464)||(36786-37050)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (181-512)||(65472-65803)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (200-511)||(11630-11939)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (181-464)||(29781-30064)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (181-397)||(67282-67498)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (200-424)||(1008-1232)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (292-464)||(3455-3627)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (292-495)||(25928-26131)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (218-512)||(49088-49382)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (168-469)||(5370-5671)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (207-495)||(20728-21014)
scaffold0261 (207-495)||(12548-12834)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (181-512)||(21921-22252)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (109-267)||(11072-11230)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (9-134)||(291-416)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (181-512)||(8-339)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (166-353)||(6416-6603)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (61-201)||(1-141)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (461-589)||(231-361)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (292-469)||(21693-21870)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (454-589)||(7106-7241)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (64-187)||(1156-1279)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (181-387)||(30500-30706)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (184-578)||(34070-34464)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (472-589)||(1198-1315)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (51-469)||(10819-11237)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (295-539)||(991-1227)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (450-589)||(20963-21102)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (445-589)||(114476-114620)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (446-560)||(5328-5442)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (420-505)||(8459-8544)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (181-260)||(2022-2101)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (111-174)||(1968-2031)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (111-174)||(4832-4895)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (168-258)||(9182-9272)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (450-560)||(175788-175898)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (200-258)||(19162-19220)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (202-247)||(2635-2680)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (445-578)||(923-1056)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (427-512)||(51611-51696)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 553; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12889609 - 12889021
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889609 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 12889510  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889509 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 12889410  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889409 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 12889310  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889309 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 12889210  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889209 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 12889110  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12889109 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 12889021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16753931 - 16754519
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16753931 tgtgtctggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttctcaat 16754030  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754031 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16754130  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16754131 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 16754230  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16754231 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16754330  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754331 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16754430  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754431 acatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 16754519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 43165575 - 43164987
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165575 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 43165476  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165475 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 43165376  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43165375 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 43165276  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165275 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 43165176  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165175 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 43165076  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43165075 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 43164987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48428347 - 48427759
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428347 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 48428248  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428247 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 48428148  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48428147 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 48428048  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428047 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 48427948  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48427947 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagcaagtcagt 48427848  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48427847 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 48427759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 20059284 - 20059872
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20059284 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 20059383  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059384 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 20059483  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20059484 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 20059583  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059584 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 20059683  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059684 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 20059783  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20059784 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 20059872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 13255590 - 13255002
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13255590 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagt 13255491  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255490 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 13255391  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255390 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 13255291  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255290 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 13255191  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255190 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 13255091  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13255090 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 13255002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 15345475 - 15346063
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345475 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 15345574  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345575 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15345674  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15345675 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 15345774  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15345775 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 15345874  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345875 tggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 15345974  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15345975 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 15346063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 5422160 - 5422748
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5422160 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcatagt 5422259  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5422260 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagagtgacgatcgtttgatcaaaggtacttgctatat 5422359  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422360 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 5422459  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422460 aatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 5422559  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422560 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 5422659  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5422660 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 5422748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6603635 - 6603048
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6603635 tgtgtccggtgtggtaagaaggatcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagctctcagt 6603536  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603535 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggacccagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 6603436  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6603435 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 6603336  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603335 aatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 6603236  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6603235 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcaat 6603137  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6603136 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 6603048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 15586622 - 15587210
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15586622 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 15586721  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586722 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15586821  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586822 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 15586921  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586922 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 15587021  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587022 tggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 15587121  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15587122 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 15587210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16638673 - 16638085
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16638673 tgtgcccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagaaggtcacattagttcacagt 16638574  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638573 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16638474  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16638473 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 16638374  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638373 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16638274  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638273 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16638174  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16638173 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16638085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 53382248 - 53382836
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53382248 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacactgtgtgctttaattgcaatgcagagggtcacattagttctcagt 53382347  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382348 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 53382447  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53382448 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 53382547  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382548 aatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 53382647  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382648 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 53382747  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382748 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 53382836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10008500 - 10007912
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10008500 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 10008401  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008400 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 10008301  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008300 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 10008201  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10008200 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaa 10008101  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008100 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 10008001  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10008000 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 10007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10909110 - 10908522
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10909110 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcccagt 10909011  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909010 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 10908911  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908910 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 10908811  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10908810 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaa 10908711  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908710 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 10908611  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10908610 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 10908522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3688843 - 3688255
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3688843 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgtaatcgtgcagacattgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagt 3688744  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688743 gtactcagcctaagagggtgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 3688644  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3688643 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 3688544  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688543 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 3688444  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688443 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 3688344  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688343 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 3688255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 26790643 - 26791231
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26790643 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 26790742  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790743 gtactcagcctaagacggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 26790842  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26790843 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatg 26790942  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26790943 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 26791042  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791043 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 26791142  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26791143 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 26791231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 15713286 - 15713874
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713286 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 15713385  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713386 gtacttagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15713485  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713486 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 15713585  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15713586 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 15713685  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713686 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 15713785  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15713786 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttgatgt 15713874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15358983 - 15358395
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15358983 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcatagt 15358884  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15358883 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatat 15358784  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358783 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 15358684  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358683 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 15358584  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358583 tggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 15358484  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358483 gcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggtatcttgatgt 15358395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 15399748 - 15400335
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15399748 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacat-agttcacagt 15399846  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399847 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15399946  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399947 taataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 15400046  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400047 aatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 15400146  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15400147 tggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagtaagtcagt 15400246  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400247 gcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 15400335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24186090 - 24185502
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  24186090 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagt 24185991  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185990 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 24185891  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24185890 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatg 24185791  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185790 aatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 24185691  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24185690 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagt 24185591  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  24185590 gtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 24185502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15065967 - 15065400
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| | ||  || ||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| |     
T  15065967 tccggtgtggtaagaagggtcatgcattaactgattgcaagcataatgatattgtgttcttcaattgcaaagaagagggtcatattggttctcagtgcaa 15065868  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15065867 gcagcctaagaaggcgccgactacaggtagggtttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaat 15065768  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15065767 aatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatg 15065668  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15065667 gagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgga 15065568  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||    
T  15065567 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagaaagtcagtgtat 15065468  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065467 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16804177 - 16804765
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  16804177 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaat 16804276  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  |||||||||| | |||| ||||| ||| | ||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16804277 gcaagcagcctaagaagtcgcctactacgggtcgagtttttgctctggatggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgttatat 16804376  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16804377 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatg 16804476  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16804477 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16804576  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  16804577 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttaccaagtcagt 16804676  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16804677 gtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 16804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16695064 - 16694476
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  16695064 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgacattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 16694965  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||  || || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694964 gcaagcagccgaagagggcgcctactacaggtcgagttttaactctggctggtactcatacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16694865  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16694864 taataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatatg 16694765  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694764 aatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16694665  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  16694664 tggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcaat 16694565  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16694564 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 16694476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 589
Target Start/End: Original strand, 14873903 - 14874386
Alignment:
Q  106 cagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaata 205  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14873903 cagcctaagaaggcgccgactattggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaata 14874002  T
Q  206 atactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14874003 atactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatgg 14874102  T
Q  306 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14874103 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggat 14874202  T
Q  406 ttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  |||    
T  14874203 ttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaagtcagtgtatt 14874302  T
Q  506 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14874303 tctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagttcttgtttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattgatgt 14874386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15262424 - 15261942
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || |||     
T  15262424 agcctaaaaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatag 15262325  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  15262324 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 15262225  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15262224 gagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatt 15262125  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  15262124 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtattt 15262025  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  15262024 ttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 15261942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 107 - 563
Target Start/End: Original strand, 14578744 - 14579200
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||| ||||    
T  14578744 agccgaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataa 14578843  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  |||||||||||    
T  14578844 tacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatgga 14578943  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14578944 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatt 14579043  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  14579044 tggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 14579143  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14579144 ctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaatttttatctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 56 - 589
Target Start/End: Original strand, 12843388 - 12843921
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| || || |   | ||||||| | |||  |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  12843388 ttgtgttctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaatcctaagaagtcgcaaactactgggagagttttagctttgactggtac 12843487  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12843488 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatt 12843587  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  12843588 gctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttg 12843687  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12843688 tgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactg 12843787  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  12843788 gttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcag 12843887  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | ||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  12843888 cagaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 12843921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 277 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17492475 - 17492163
Alignment:
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||    
T  17492475 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgt 17492376  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
     |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17492375 ttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttca 17492276  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
     |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  17492275 cattaattgttttagtaaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgat 17492176  T
Q  577 ggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| |||||||    
T  17492175 ggtattttgatgt 17492163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 392 - 575
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 23079258 - 23079525
Alignment:
Q  12 tggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcct 111  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||| || || | || |||||||||||| |||| ||  || | | | ||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  23079258 tggtaagaaggttcatgcactagctgagtgtaagcataaggacattgtgtgttttagttctaaagaacaaggtcatattggttcacagtgtacaaagcct 23079357  T
Q  112 aagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079358 aagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactc 23079457  T
Q  212 ctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23079458 ctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttg 23079525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47126674 - 47126343
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  47126674 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 47126575  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  47126574 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 47126475  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  47126474 gtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 47126375  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  47126374 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 47126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13944799 - 13944423
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  13944799 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 13944700  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13944699 gtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13944601  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||| ||||  || |||||    
T  13944600 gttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatgga 13944501  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | || ||||| |||||    
T  13944500 tgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 13944423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10408698 - 10408367
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  10408698 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 10408599  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  10408598 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctat 10408499  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  10408498 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatc 10408399  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  10408398 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 10408367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 577
Target Start/End: Original strand, 12857894 - 12858290
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||| || |||||| | | |||||  | |   ||||    
T  12857894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttgg 12857993  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
     ||| | | | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  12857994 ttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 12858093  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  12858094 gtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 12858193  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||  |||||    | ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12858194 aattgttttagtaagacggtacatttctcttctgttgaggaaaaaagtaaaactgagttcttgactactaagcagctgaaacaattagaacgtgatg 12858290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 491
Target Start/End: Original strand, 15013136 - 15013476
Alignment:
Q  149 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |  |||||||  ||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||| ||||     
T  15013136 ctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacattt 15013235  T
Q  249 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 348  Q
     ||||||| |   ||||||| | ||   |||||||||| | ||||   ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15013236 ttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactact 15013335  T
Q  349 tctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 448  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15013336 tctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag-ttttgcagtggacttagtat-tctgccgttgagtggaatggatgtgatactaggta 15013433  T
Q  449 tgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    ||||||  || ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  15013434 tgaactacttggagtttaactatgttcatataaattgttttag 15013476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 491
Target Start/End: Original strand, 14290892 - 14291241
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || || | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  14290892 gctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgcta 14290991  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14290992 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 14291091  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || |||   |||||||||||||||    
T  14291092 aactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatt 14291191  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14291192 tttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttag 14291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28757222 - 28756718
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |    
T  28757222 ggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctga 28757123  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| | |    | |   || | ||| || ||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  28757122 gccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 28757023  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  28757022 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 28756923  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  28756922 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 28756823  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttc 507  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||||    
T  28756822 agtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttc 28756723  T
Q  508 tcttc 512  Q
    |||||    
T  28756722 tcttc 28756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 578
Target Start/End: Original strand, 31692571 - 31692981
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  31692571 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 31692670  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   | |||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  31692671 gcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 31692770  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||    
T  31692771 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataa 31692870  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactg 567  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || |||| |||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31692871 ccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtgttgcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattg 31692970  T
Q  568 gaacgcgatgg 578  Q
    || ||||||||    
T  31692971 gagcgcgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11861246 - 11861032
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||| |  ||    
T  11861246 ggtgtggtaagaagggtcatactttagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattccaaggaagagggtcatattggttctcagtgcaagca 11861147  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11861146 gcctaagagggcgccgactactggta---------------------cacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataat 11861068  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11861067 actcctttagttgctattattgatactggtgctacg 11861032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17494377 - 17494062
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  17494377 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgg 17494278  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| |||||||    
T  17494277 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtcta 17494178  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  17494177 tgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 17494078  T
Q  480 taattgttttagcaag 495  Q
     ||||| |||||||||    
T  17494077 caattgctttagcaag 17494062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272737
Alignment:
Q  202 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatga 301  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | || | ||  | |   |||||||| | | | ||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  302 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaat 401  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  402 ggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagta 501  Q
     ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | ||     
T  12272847 cgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtg 12272748  T
Q  502 catttctcttc 512  Q
    ||||| |||||    
T  12272747 catttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31941646 - 31941236
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||| | || |||    
T  31941646 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgt 31941547  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  31941546 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 31941447  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    | || ||||||||||||||  | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  31941446 gcccgttgtctatgtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 31941347  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactg 567  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31941346 ccgagttcatataaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattg 31941247  T
Q  568 gaacgcgatgg 578  Q
    || ||||||||    
T  31941246 gagcgcgatgg 31941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 464
Target Start/End: Original strand, 8744744 - 8745072
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  8744744 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 8744843  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8744844 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 8744942  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||    
T  8744943 gttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatgga 8745042  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  8745043 tgttatttttgggatgaattggttagagta 8745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 578
Target Start/End: Original strand, 10417429 - 10417841
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  10417429 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagt 10417528  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | |    
T  10417529 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaa 10417627  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  10417628 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 10417727  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
     |||   |||  |||||||||||||| |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||     
T  10417728 taactgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcag 10417827  T
Q  565 ctggaacgcgatgg 578  Q
     ||||||| |||||    
T  10417828 ttggaacgagatgg 10417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 494
Target Start/End: Original strand, 12357913 - 12358239
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  12357913 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 12358012  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  12358013 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 12358112  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||    
T  12358113 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataa 12358212  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaa 494  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  12358213 ccgagttcatatcaattgttttagcaa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17189104 - 17188871
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  17189104 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 17189005  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||    
T  17189004 gt-ttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatcta 17188906  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgt 414  Q
    |||||||| | ||||||||| | || |||||||||    
T  17188905 tgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 445 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437452
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 18437452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24190034 - 24189703
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  24190034 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 24189935  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||    
T  24189934 gt-ttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatcta 24189836  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||||| | ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||    
T  24189835 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatataaccgagttcatat 24189736  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     || || ||||||||| | || ||||| |||||    
T  24189735 caactgctttagcaagacggtgcatttttcttc 24189703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 512
Target Start/End: Original strand, 16831912 - 16832258
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  16831912 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16832011  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  16832012 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 16832110  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||| |||||||||||    
T  16832111 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagta 16832210  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  16832211 taaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 16832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12181074 - 12180762
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  12181074 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12180975  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||   | |||||| ||||||||    
T  12180974 gtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctat 12180875  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  12180874 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 12180775  T
Q  481 aattgttttagca 493  Q
    ||||| |||||||    
T  12180774 aattgctttagca 12180762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 12509882 - 12510170
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  12509882 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12509981  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  ||| |  || |||||||| || ||||||   |||| | | |||||    
T  12509982 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctat 12510081  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12510082 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 12510170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 491
Target Start/End: Original strand, 16825706 - 16825990
Alignment:
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  16825706 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 16825805  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||  ||||| | || |||||| | |||     
T  16825806 taaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatc 16825905  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  16825906 ttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 16825990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Original strand, 11958580 - 11958863
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  11958580 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 11958679  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  11958680 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 11958778  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    |||||||| | || ||||   | |||||||||||| |  | |||   ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  11958779 tgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15230314 - 15230002
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   |||||||| | | ||||   |||    
T  15230314 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 15230215  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  15230214 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaa 15230115  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | |    
T  15230114 gttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacgg 15230015  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    ||||||| |||||    
T  15230014 tacatttttcttc 15230002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15236182 - 15235870
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   |||||||| | | ||||   |||    
T  15236182 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 15236083  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  15236082 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaa 15235983  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | |    
T  15235982 gttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacgg 15235883  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    ||||||| |||||    
T  15235882 tacatttttcttc 15235870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 14575605 - 14575406
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14575605 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 14575506  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  | || ||||||||| |||||    
T  14575505 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttagattataaccgagctcgtattaattgctttag 14575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 512
Target Start/End: Original strand, 16378318 - 16378664
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||| |   |||||| |||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  16378318 aatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16378417  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||    
T  16378418 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttga 16378516  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  16378517 ggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 16378616  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||  |||| ||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  16378617 taaccgagttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttc 16378664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 539
Target Start/End: Original strand, 18131733 - 18132103
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  18131733 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18131831  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  18131832 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 18131931  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||  ||||||||||||||| | || | |||| | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||    
T  18131932 gtctgttgtctatgtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataa 18132031  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  18132032 ccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 18132103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19727554 - 19727428
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||     
T  19727554 agcctaagaaggcacagactactggaagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatag 19727455  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatac 233  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19727454 tacacctatagttgctattattcatac 19727428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 387
Target Start/End: Original strand, 16326978 - 16327314
Alignment:
Q  51 ggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgact 150  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| ||     |||  ||| | ||| || || ||||||    
T  16326978 ggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgact 16327077  T
Q  151 gggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgct 250  Q
    || || |||||    |||||||| ||  | || ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16327078 ggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 16327177  T
Q  251 ttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 349  Q
    | |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  16327178 tcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactactt 16327276  T
Q  350 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    |||| || ||||||   |||||| | ||||||||||||    
T  16327277 ctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggt 16327314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23415020 - 23415181
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || |    
T  23415020 tgtgtccggtgtgacaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaat 23415119  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagaca 162  Q
    | |  ||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||    
T  23415120 gcaagcagcctaagagggtgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagaca 23415181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 349
Target Start/End: Original strand, 11949324 - 11949492
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  11949324 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgg 11949423  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 349  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11949424 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 334
Target Start/End: Original strand, 13317918 - 13318086
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  13317918 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 13318017  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    |||  | |   ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318018 gtgcatataagttggg-cttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 373 - 539
Target Start/End: Original strand, 11949499 - 11949665
Alignment:
Q  373 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 472  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  11949499 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgag 11949598  T
Q  473 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  11949599 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5110639 - 5110684
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatc 46  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5110639 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatc 5110684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 589
Target Start/End: Original strand, 11888027 - 11888172
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct-cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 543  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || || ||| |||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11888027 ggtaagaactagttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgttgaagaagagagtggagcagagtttttg 11888126  T
Q  544 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||||||||||    
T  11888127 actactaagcagctgaaacagttagagcgggatggaatcttgatgt 11888172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 495
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318215
Alignment:
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13318186  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    |||  |||| ||| |||||||||| ||||    
T  13318187 accgagttcatataaattgttttaacaag 13318215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 530
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 530  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 27665663 - 27666251
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665663 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcatacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 27665762  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665763 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatat 27665862  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665863 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 27665962  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665963 aatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 27666062  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666063 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27666162  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27666163 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27666251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16359715 - 16359127
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359715 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 16359616  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359615 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16359516  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16359515 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 16359416  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359415 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16359316  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359315 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16359216  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16359215 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16359127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 34569707 - 34569119
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569707 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 34569608  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569607 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 34569508  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34569507 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 34569408  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569407 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 34569308  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569307 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 34569208  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34569207 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 34569119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41774055 - 41773467
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41774055 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 41773956  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773955 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 41773856  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773855 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 41773756  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41773755 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaa 41773656  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773655 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 41773556  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41773555 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 41773467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27613569 - 27612981
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27613569 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgtggtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagaggctcacattagttcacagt 27613470  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613469 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 27613370  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613369 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 27613270  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613269 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 27613170  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613169 tggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27613070  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27613069 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27612981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40711990 - 40711405
Alignment:
Q  4 gtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711990 gtccggtgtggtaagaagggtcgtgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 40711891  T
Q  104 ctcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40711890 ctcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaa 40711791  T
Q  204 taatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40711790 taatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaat 40711691  T
Q  304 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711690 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 40711591  T
Q  404 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711590 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 40711491  T
Q  504 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40711490 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 40711405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19773173 - 19772585
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773173 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 19773074  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19773073 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcttttgatcagaggtacttgctatat 19772974  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772973 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 19772874  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19772873 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 19772774  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772773 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 19772674  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19772673 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19772585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27521619 - 27521031
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27521619 tgtgtccggtgtggcaagaaagatcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 27521520  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521519 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 27521420  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27521419 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatg 27521320  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521319 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 27521220  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521219 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27521120  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27521119 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 22330060 - 22330648
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22330060 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcgcattagttcacagt 22330159  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330160 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 22330259  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330260 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22330359  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22330360 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 22330459  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330460 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 22330559  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22330560 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22330648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 14996912 - 14997500
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14996912 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 14997011  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997012 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 14997111  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997112 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 14997211  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14997212 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 14997311  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997312 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 14997411  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14997412 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttgatgt 14997500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22137881 - 22137293
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137881 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22137782  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22137781 gtactcagcctaagagggcgccgaatactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 22137682  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137681 taataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22137582  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22137581 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaaa 22137482  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137481 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 22137382  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22137381 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22137293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 29473246 - 29473834
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473246 tgtgttcgatgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 29473345  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473346 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 29473445  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473446 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 29473545  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29473546 aatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 29473645  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473646 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 29473745  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29473746 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttgatgt 29473834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 27682573 - 27683161
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27682573 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgctgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 27682672  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682673 gtactcatcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 27682772  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27682773 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatg 27682872  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27682873 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 27682972  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682973 tggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27683072  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  27683073 gtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggtatcttgatgt 27683161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 37288669 - 37289257
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288669 tgtgtccggtgtggcaagaaagttcacattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 37288768  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288769 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 37288868  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37288869 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatg 37288968  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37288969 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaa 37289068  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289069 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 37289168  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37289169 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 37289257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22351132 - 22350544
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351132 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagcttaatgcaagcgtacgaacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22351033  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22351032 gtactcatcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacggagaacgatgatcgcttgatcagaggtacttgctatat 22350933  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22350932 taataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatg 22350833  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22350832 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaa 22350733  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22350732 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagcaagtcagt 22350633  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350632 gcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 22350544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18782327 - 18781739
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || || || ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||| || |    
T  18782327 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagaggttcatattggttcccaat 18782228  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782227 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 18782128  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782127 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 18782028  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782027 aatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 18781928  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18781927 tggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 18781828  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18781827 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 18781739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21882978 - 21882399
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |  || | ||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||  ||||    
T  21882978 tgtggtaagaagggtcatgcaatagctgagtagaaacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagaaggtcacattggttctcagtgtaagcagc 21882879  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882878 ctaagaaggtgccgactactggtagggttttggctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatac 21882779  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21882778 tcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagag 21882679  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21882678 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttag 21882579  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  21882578 tttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcggtgtatttctc 21882479  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21882478 ctccgtctaggaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 21882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 195 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20803616 - 20803222
Alignment:
Q  195 ctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtct 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  20803616 ctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtct 20803517  T
Q  295 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803516 gatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 20803417  T
Q  395 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  20803416 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagcaa 20803317  T
Q  495 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20803316 gtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggtatcttgatgt 20803222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25429574 - 25429046
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25429574 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacaga 25429475  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25429474 catagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 25429375  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     |||| || | ||   |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25429374 tgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 25429275  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25429274 ttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttag 25429175  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25429174 agtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaa 25429075  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  25429074 gcagttagaacgtgatggtattttgatgt 25429046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 238 - 581
Target Start/End: Original strand, 21342824 - 21343167
Alignment:
Q  238 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342824 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 21342923  T
Q  338 cggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  21342924 cggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgt 21343023  T
Q  438 gattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag 537  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21343024 gattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagag 21343123  T
Q  538 tttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 581  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343124 ttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Original strand, 26736006 - 26736488
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  26736006 agcctaagaaggcgcagactactagtagagtttttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatag 26736105  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  26736106 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 26736205  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26736206 gagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatt 26736305  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  26736306 tggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 26736405  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||| || |||||||    
T  26736406 ctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaattagaacgtggtggaattttgatgt 26736488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23474353 - 23473831
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| ||| | ||| |||| || ||||   |||| |||| ||||| ||||||| | || ||||| || |||||||| |     
T  23474353 ttgtgtgtttcaattgcaatgaagaaggttatattggttcgcaatgtaagaagcccaagaaggcgcagactactaggagagtttttgcattgactggtat 23474254  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23474253 gcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttatt 23474154  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||  ||||   |||||||| | | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23474153 gctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttg 23474054  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | | ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  23474053 tgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactg 23473954  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23473953 gttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcag 23473854  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  23473853 ctgaagcaattagaacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23461180 - 23460824
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| |||||| |||||  | ||||||| ||||| | |   || |||||||| ||  ||||||| | ||||||| | ||| |||| ||||| |     
T  23461180 tccggtgtggcaagaagagtcatactttagctgaatgcaagcatggtgatattgtgtgtttcgattgcaaggaagagggtaatattggttcccagtgcaa 23461081  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23461080 acaacctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgactggtacttagaccgagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaat 23460981  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460980 aatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 23460881  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 361  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460880 aagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23526255 - 23525952
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||  ||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||    
T  23526255 tgtggtaagaagggtcatgcattagccaattgcaaccgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagc 23526156  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23526155 ctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgattggtactcaaaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatac 23526056  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23526055 tcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaatggagag 23525956  T
Q  310 atgg 313  Q
    ||||    
T  23525955 atgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 277 - 577
Target Start/End: Original strand, 21336743 - 21337043
Alignment:
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||||| |||||    
T  21336743 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgt 21336842  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || | |||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21336843 ctatgtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttca 21336942  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  21336943 tattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgat 21337042  T
Q  577 g 577  Q
    |    
T  21337043 g 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 353
Target Start/End: Original strand, 21631713 - 21631924
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21631713 gctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgcta 21631812  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631813 cgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 21631912  T
Q  342 gactacttctct 353  Q
    ||||||||||||    
T  21631913 gactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 149 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21410199 - 21409890
Alignment:
Q  149 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||| |||||| ||| || |||| || ||||||||||||||  ||||    
T  21410199 ctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattg 21410100  T
Q  249 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 348  Q
     |||||||||   |||||||||||    |||||||||| | ||||   ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  21410099 ttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagt 21410000  T
Q  349 tctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 448  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||| ||| |||||||| || || ||||    
T  21409999 tctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggta 21409900  T
Q  449 tgaactggtt 458  Q
    ||||||||||    
T  21409899 tgaactggtt 21409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 589
Target Start/End: Original strand, 21983530 - 21983938
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21983530 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21983629  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||    
T  21983630 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttat 21983729  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||     
T  21983730 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatc 21983829  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 580  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |  || || ||  ||   || ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  21983830 aattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaggaagagggtaaagctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggga 21983929  T
Q  581 tcttgatgt 589  Q
    |||| ||||    
T  21983930 tcttaatgt 21983938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 578
Target Start/End: Original strand, 28892253 - 28892692
Alignment:
Q  139 ttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28892253 ttcgctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtg 28892352  T
Q  239 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 337  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28892353 ctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtt 28892451  T
Q  338 cggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 437  Q
    | || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||| |||   || ||||||||    
T  28892452 cagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgt 28892551  T
Q  438 gattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag 537  Q
     ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  28892552 catcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagag 28892651  T
Q  538 tttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  28892652 tttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 28892692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Original strand, 21332265 - 21332431
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||     
T  21332265 agcctaagaaggtgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatag 21332364  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttct 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  21332365 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttct 21332431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 521
Target Start/End: Original strand, 14884344 - 14884684
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  14884344 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 14884443  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  14884444 gtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 14884543  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| |||     
T  14884544 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgggttcatatc 14884643  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 521  Q
    || || ||||| ||| | |||||||||||||| || |||||    
T  14884644 aactgctttagtaagacggtacatttctcttctgttgaaga 14884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 20824483 - 20824086
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  20824483 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagt 20824384  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  20824383 gtgcatataagttgggtct-gattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaa 20824285  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  20824284 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20824185  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
     ||||  ||   |||||||||||||| |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  20824184 taaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagca 20824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25851216 - 25850807
Alignment:
Q  52 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactg 151  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||    |||  ||| | ||| || ||||||||||    
T  25851216 gacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactg 25851117  T
Q  152 ggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctt 251  Q
    | || |||||    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25851116 gtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 25851017  T
Q  252 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 351  Q
    ||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  25851016 tattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttct 25850917  T
Q  352 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
    || || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||    
T  25850916 cttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatga 25850817  T
Q  452 actggttaga 461  Q
    | ||||||||    
T  25850816 attggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20778970 - 20778531
Alignment:
Q  139 ttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  20778970 ttcgctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 20778871  T
Q  239 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 338  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20778870 ctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttc 20778771  T
Q  339 ggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtg 438  Q
     |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || ||||||||     
T  20778770 agtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtt 20778671  T
Q  439 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 538  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||| | || || || ||||| |  ||||| || ||||| ||| |||    
T  20778670 attttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaagagagtggagcacagt 20778571  T
Q  539 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    || |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20778570 ttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20778531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Original strand, 21561378 - 21561688
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   || |    
T  21561378 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttag 21561477  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  21561478 gtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctat 21561577  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||| ||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||     
T  21561578 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatc 21561677  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    |||||||||||    
T  21561678 aattgttttag 21561688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22465011 - 22464569
Alignment:
Q  135 ggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatact 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    || ||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||    
T  22465011 ggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacact 22464912  T
Q  235 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22464911 ggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagg 22464812  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||    
T  22464811 gttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatgga 22464712  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 534  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| |||    
T  22464711 tgttattttcgggatgaattggttagagtacaaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagca 22464612  T
Q  535 gagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
    |||||| |  ||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||    
T  22464611 gagtttctaactactaaacaattgaagcagttggaacgggatg 22464569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 563
Target Start/End: Original strand, 23563521 - 23563903
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || || || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  23563521 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgg 23563620  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||| | ||||||||    
T  23563621 gtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctat 23563720  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  23563721 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 23563820  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  23563821 aattgctttagcaagacggtgcatttttcttctacagaagaagagagtggagcagagttgctatctactaaacagttgaagca 23563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311573
Alignment:
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | ||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 20311573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22505675 - 22505406
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||| ||||    
T  22505675 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatat 22505576  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||  | | |||||||      
T  22505575 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttgtg 22505476  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
     |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22505475 gtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 22505406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 23078258 - 23078546
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | || |||| || |   ||||    
T  23078258 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgg 23078357  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  23078358 gtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 23078457  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | || |||| | | ||| || ||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  23078458 gtttggtagagactttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 23078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 350 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23525951 - 23525867
Alignment:
Q  350 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23525951 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 578
Target Start/End: Original strand, 17266642 - 17267084
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||| |  |||||||| ||| | |||| ||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  17266642 gtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 17266741  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| ||| || ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17266742 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 17266840  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  || |||||    
T  17266841 gttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgga 17266940  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 534  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||| ||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||  |      
T  17266941 tgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttccgccgaagaagagagtgaagtt 17267040  T
Q  535 gagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    |||||||||  ||| |||||  |||||||  ||||||| |||||    
T  17267041 gagtttttgaatacgaagcaaatgaagcagttggaacgtgatgg 17267084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 20345470 - 20345017
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |    
T  20345470 ggtgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctga 20345371  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| |||    |||  ||| | ||| || ||||| ||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  20345370 gccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 20345271  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  20345270 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 20345171  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| ||   |||||| | ||| |||||||| | |||||||   | |||||    
T  20345170 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctttgtttggtagagattttgtggttgattt 20345071  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 461  Q
    ||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  20345070 agtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 20345017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20803803 - 20803671
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| ||| |||| | |||| |||| ||| |||| ||||| |  ||    
T  20803803 ggtgtggcaagaagggtcatactttagctgactgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaatggcaaggaagagagtcatattggttctcagtgcaagca 20803704  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggtttt 140  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  20803703 gcctaagagggtgctgactactggaagggtttt 20803671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22505824 - 22505773
Alignment:
Q  51 ggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgt 102  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22505824 ggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgt 22505773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20803654 - 20803613
Alignment:
Q  183 cagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctat 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20803654 cagaggtacttgttatattaataatacttctttagtttctat 20803613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16984152 - 16983564
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984152 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 16984053  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984052 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16983953  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16983952 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 16983853  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983852 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16983753  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983752 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16983653  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16983652 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9338494 - 9337906
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338494 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 9338395  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338394 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 9338295  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9338294 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 9338195  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338194 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 9338095  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338094 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 9337995  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9337994 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9337906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9487128 - 9486540
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487128 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 9487029  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487028 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 9486929  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9486928 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 9486829  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486828 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 9486729  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486728 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 9486629  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9486628 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9486540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24712946 - 24712358
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712946 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 24712847  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712846 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 24712747  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712746 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 24712647  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712646 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 24712547  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24712546 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaaatcagt 24712447  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24712446 acatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 24712358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 22322873 - 22323461
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322873 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttatagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22322972  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322973 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtaggatctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 22323072  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323073 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22323172  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323173 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 22323272  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323273 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 22323372  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22323373 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22323461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 44383101 - 44383689
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383101 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 44383200  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383201 gtactcagcctaagagggcgctgactacgggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 44383300  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44383301 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatg 44383400  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383401 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 44383500  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383501 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 44383600  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44383601 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 44383689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17001912 - 17001324
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17001912 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagt 17001813  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001812 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 17001713  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17001712 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatg 17001613  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001612 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 17001513  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001512 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 17001413  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17001412 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17001324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27374181 - 27373593
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27374181 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 27374082  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27374081 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatat 27373982  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373981 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 27373882  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27373881 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 27373782  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373781 tggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27373682  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27373681 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 27373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10871762 - 10871174
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10871762 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagt 10871663  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871662 gtacccagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 10871563  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871562 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 10871463  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10871462 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 10871363  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871362 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 10871263  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871262 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 10871174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24265282 - 24264694
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24265282 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacgttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 24265183  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265182 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 24265083  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265082 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 24264983  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24264982 agtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaa 24264883  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264882 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 24264783  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24264782 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttctatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 24264694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 24874281 - 24874869
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24874281 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcaaattagttcacagt 24874380  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24874381 gtactcagcctaagagggcgctgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 24874480  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874481 taataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 24874580  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874581 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 24874680  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874681 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagcaagtcagt 24874780  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874781 gcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 24874869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 589
Target Start/End: Original strand, 24705021 - 24705601
Alignment:
Q  9 gtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcag 108  Q
    |||||| |||||||||||   | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| |  |||    
T  24705021 gtgtggcaagaagggtcacactttagctgattgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacataggttctcagtgcaagcag 24705120  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24705121 cctaagaaggcgccgactactagtagggtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataata 24705220  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24705221 ctcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcaga 24705320  T
Q  309 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705321 gatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 24705420  T
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24705421 gtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttct 24705520  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24705521 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24705601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24678395 - 24677811
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||  |||| ||||| |     
T  24678395 tccgttgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcattgaagagagtcacataggttctcagtgcaa 24678296  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24678295 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaat 24678196  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24678195 aatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatg 24678096  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24678095 gagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgga 24677996  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||  ||    
T  24677995 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagcaagtcagtgtat 24677896  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24677895 ttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggtattttgatgt 24677811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 563
Target Start/End: Original strand, 11351249 - 11351804
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||  |  ||    
T  11351249 ggtgtggcaagaagggtcatacattagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtccaagca 11351348  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351349 gcctaagagggtgccgactactggtagggtttttgctctggctggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataat 11351448  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11351449 actcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggag 11351548  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351549 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 11351648  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttc 507  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11351649 agtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttc 11351748  T
Q  508 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11351749 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 175 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27220754 - 27220340
Alignment:
Q  175 cgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctg 274  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27220754 cgttngataagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctg 27220655  T
Q  275 ctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtccttt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220654 ctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtccttt 27220555  T
Q  375 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220554 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgtt 27220455  T
Q  475 cttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220454 cttattaattgttttagcaagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcg 27220355  T
Q  575 atggtatcttgatgt 589  Q
    | |||||||||||||    
T  27220354 acggtatcttgatgt 27220340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 190 - 589
Target Start/End: Original strand, 21142761 - 21143160
Alignment:
Q  190 acttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21142761 acttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatt 21142860  T
Q  290 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142861 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 21142960  T
Q  390 tgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142961 tgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 21143060  T
Q  490 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143061 agcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 21143160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 23205226 - 23204638
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  23205226 tgtgtccagtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcccaat 23205127  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23205126 gcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatat 23205027  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23205026 taataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatatg 23204927  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  23204926 aatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgtaa 23204827  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23204826 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 23204727  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23204726 gtatttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagttcttatctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttgatgt 23204638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 24657193 - 24657777
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| |||||||||||     ||||||||||||| | |   || || ||||| |||||| |||| |  |||||||| ||| |||| || || |     
T  24657193 tccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacatggtgatatcgtgtgttttaatggcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaa 24657292  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657293 gcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 24657392  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24657393 aatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatatgaatg 24657492  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657493 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 24657592  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||  ||    
T  24657593 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagtcagtcagtgtat 24657692  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24657693 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24657777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 80 - 589
Target Start/End: Original strand, 21322876 - 21323385
Alignment:
Q  80 agggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgttt 179  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||  |    
T  21322876 agggtcacattggttcacaatgtacgcaacctaagaaggcgccaactactggtagagtttttgcattgaccggtactcagaccgagaatgaggatcgcct 21322975  T
Q  180 gatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttg 279  Q
     ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21322976 aatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttg 21323075  T
Q  280 ggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323076 ggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 21323175  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||    
T  21323176 tgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatat 21323275  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 579  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323276 gaactgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 21323375  T
Q  580 atcttgatgt 589  Q
    || |||||||    
T  21323376 attttgatgt 21323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Original strand, 23028996 - 23029491
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  23028996 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaa 23029095  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  23029096 gcaacctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcaaaccaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaat 23029195  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23029196 aatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatg 23029295  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23029296 gagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgga 23029395  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23029396 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagt 23029491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 589
Target Start/End: Original strand, 23105267 - 23105847
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagag-ggtcacattagttcacagtgtactcag 108  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||    
T  23105267 tgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagaggtcacattggttcacagtgtaagcag 23105366  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23105367 cctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataata 23105466  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 308  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23105467 cacctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggaga 23105566  T
Q  309 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23105567 aatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggattta 23105666  T
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  ||||||    
T  23105667 gtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttct 23105766  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  23105767 cttctgatgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 23105847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 23074715 - 23074187
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| || ||||    
T  23074715 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccgactactggcagagttttttctttcactggtacacaga 23074616  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23074615 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 23074516  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23074515 tgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 23074416  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23074415 ttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttag 23074316  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23074315 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttatctaccaagcagctgaa 23074216  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  23074215 gcagttagaacgtgatggtattttgatgt 23074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 165 - 470
Target Start/End: Original strand, 45673707 - 45674012
Alignment:
Q  165 gaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45673707 gaatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgat 45673806  T
Q  265 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673807 tgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 45673906  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45673907 gatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 45674006  T
Q  465 caacca 470  Q
    ||||||    
T  45674007 caacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 41606155 - 41606504
Alignment:
Q  233 ctggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41606155 ctggtgctacgcat-gctttat-gctttcgat-gtgtttctgctttgtgtct-gagt-gtctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaa 41606248  T
Q  333 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41606249 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatg 41606347  T
Q  433 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606348 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 41606447  T
Q  533 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41606448 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 41606504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Original strand, 22733365 - 22733893
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   | ||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||  |||    
T  22733365 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaacctaagaaggtgccgactactggtagagtttttactttgactggtacataga 22733464  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22733465 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttt 22733564  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22733565 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 22733664  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
     | | |||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22733665 ataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttag 22733764  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733765 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 22733864  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||    ||||| |||||||| |||||||    
T  22733865 gcagtaagaacgtgatggtattttgatgt 22733893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Original strand, 22742509 - 22742856
Alignment:
Q  13 ggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccta 112  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||    
T  22742509 ggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagcagccta 22742608  T
Q  113 agagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcc 212  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22742609 agaaggcgccgactactggtaaagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcc 22742708  T
Q  213 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22742709 tttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatg 22742808  T
Q  313 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742809 gttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23065265 - 23064973
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| || ||||    
T  23065265 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccgactactggcagagttttttctttcactggtacacaga 23065166  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23065165 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 23065066  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
     ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065065 tgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 560
Target Start/End: Original strand, 24817426 - 24817930
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||| ||||||| || |   ||||||||| ||||| ||| ||| | || || || ||||||||||| ||    
T  24817426 ttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgcagaccactaggagagtgtttgctttgactggtac 24817525  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24817526 acagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttatt 24817625  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24817626 gctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctag 24817725  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24817726 tgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactg 24817825  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||     
T  24817826 gttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaa 24817925  T
Q  556 ctgaa 560  Q
    |||||    
T  24817926 ctgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23676830 - 23676582
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  23676830 tgtgtccagtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcccaat 23676731  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23676730 gcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatat 23676631  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23676630 taataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgc 23676582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 21139513 - 21139707
Alignment:
Q  2 gtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtg 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139513 gtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtgaagacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtg 21139612  T
Q  102 tactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgct 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21139613 tactcagcctaatagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgct 21139707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19817611 - 19817269
Alignment:
Q  149 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||| |||||| ||| || ||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  19817611 ctggtactcagacatcgaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattg 19817512  T
Q  249 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 348  Q
    ||||||||||   |||||||||||    || ||||||| | ||||   || ||||||  | ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  19817511 ctttattgctgcggattgtgtttcgaaattaggtcttgttatgtcatctacgaatgggcaaatggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactact 19817412  T
Q  349 tctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 448  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  19817411 tctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggta 19817312  T
Q  449 tgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    |||||||||| || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  19817311 tgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgttttag 19817269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Original strand, 23097748 - 23098060
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| | | |  |||| ||    
T  23097748 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacat 23097847  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  23097848 gaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 23097947  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  23097948 gtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagcaagacgg 23098047  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    | ||||| |||||    
T  23098048 tgcatttttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 491
Target Start/End: Original strand, 30208590 - 30208941
Alignment:
Q  140 tcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgc 239  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| || |  ||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  30208590 tcgctttagctggtactcagacagtgaatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgc 30208689  T
Q  240 tacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcg 339  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||||||||||    |||||||||| | ||||   |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  30208690 tacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcg 30208789  T
Q  340 gtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtga 439  Q
    ||||||| || ||| || || || || ||||||||||| ||||||| | | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||    
T  30208790 gtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagattttgcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatggatgtga 30208889  T
Q  440 ttctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | || ||||||||||  || || |  ||| | |||| |||||||||||||||    
T  30208890 tactaggtatgaactaattggaatttaactatgttcatattaattgttttag 30208941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23113436 - 23113124
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||   |||    
T  23113436 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtat 23113337  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  23113336 gagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaa 23113237  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||| ||| |      
T  23113236 gttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttagtaagacga 23113137  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    ||||||| |||||    
T  23113136 tacatttttcttc 23113124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 23116590 - 23116718
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23116590 tgtgtccggtgtagcaagaggggtcatatcgtagctgattgcaagcataaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacattagttcacagt 23116689  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactact 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116690 gtactcagcctaagagggcgccgactact 23116718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 491
Target Start/End: Original strand, 19716747 - 19717038
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | | | | |||||| |    
T  19716747 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgattt 19716846  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  19716847 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 19716946  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  19716947 gtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 19717038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23274338 - 23274011
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  23274338 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 23274239  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  23274238 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 23274139  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||    
T  23274138 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataa 23274039  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  23274038 ccgagttcatatcaattgttttagcaag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22463012 - 22463204
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || |    
T  22463012 tgtgtccagtgtggcaagaagggtcatatcgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaat 22463111  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtactt 193  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22463112 gcaagcagccgaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtactt 22463204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12577130 - 12576754
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||    
T  12577130 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactg 12577031  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12577030 gtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 12576932  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    ||||  ||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  12576931 gttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatgga 12576832  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | || ||||| |||||    
T  12576831 tgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 12576754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20848321 - 20848067
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  20848321 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 20848222  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  20848221 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 20848122  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 435  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  20848121 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23279322 - 23279150
Alignment:
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |    
T  23279322 tgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtata 23279223  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    |||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279222 accgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 550 - 589
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351839
Alignment:
Q  550 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 11351839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Original strand, 19721310 - 19721358
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19721310 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 19721358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 20015697 - 20016285
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015697 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 20015796  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015797 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 20015896  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015897 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 20015996  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015997 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 20016096  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016097 tgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 20016196  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20016197 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 20016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 17671456 - 17672044
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671456 tgtgtctggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 17671555  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671556 gtactcagcctaagagggcgccaactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 17671655  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17671656 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 17671755  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671756 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 17671855  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671856 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 17671955  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17671956 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17672044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19115744 - 19115159
Alignment:
Q  4 gtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115744 gtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 19115645  T
Q  104 ctcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaa 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115644 ctcagccaaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaa 19115545  T
Q  204 taatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115544 taatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaat 19115445  T
Q  304 ggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115444 ggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgg 19115345  T
Q  404 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115344 atttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtaca 19115245  T
Q  504 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19115244 tttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19115159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 19481506 - 19482094
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19481506 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgtgcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagt 19481605  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481606 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 19481705  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19481706 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 19481805  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19481806 aacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaa 19481905  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481906 tggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 19482005  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482006 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 19482094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18859924 - 18859336
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859924 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 18859825  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18859824 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgagtggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 18859725  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859724 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 18859625  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859624 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 18859525  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859524 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 18859425  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859424 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 18859336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 22117609 - 22118197
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117609 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22117708  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22117709 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatat 22117808  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117809 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22117908  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22117909 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 22118008  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22118009 tggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagcaagtcagt 22118108  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22118109 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22118197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 22126393 - 22126981
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22126393 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacagacattgtgtgttttaactgcaatggagaaagtcacattagttcacagt 22126492  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126493 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 22126592  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126593 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22126692  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22126693 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 22126792  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126793 tggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 22126892  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22126893 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 22126981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 30310578 - 30311166
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || |    
T  30310578 tgtgtctggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaat 30310677  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||  ||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310678 gtaagcagccgaagaaggcgcctactacgggtcgagtttttgctctagctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 30310777  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310778 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 30310877  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310878 aatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 30310977  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30310978 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 30311077  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30311078 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 30311166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19981310 - 19980726
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  19981310 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaa 19981211  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||    
T  19981210 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagagttttcactttgactggtactcagaccgagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgat 19981111  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19981110 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatg 19981011  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19981010 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgga 19980911  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||  ||    
T  19980910 tttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagttagtgtat 19980811  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19980810 ttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggtattttgatgt 19980726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22031450 - 22030862
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| |||| || |    
T  22031450 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagaaggtcatattggttcccaat 22031351  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22031350 gcaagcagcctaagagggcgcctactacaggtcgagtttttgctatggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatat 22031251  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031250 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 22031151  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22031150 aatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaa 22031051  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22031050 tggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 22030951  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
       |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22030950 gtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22030862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32603492 - 32602904
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |  || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||| ||||    
T  32603492 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattctgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataggttcccagt 32603393  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| |||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603392 gcaagcagccgaagaggacgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 32603293  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603292 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 32603193  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32603192 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaa 32603093  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32603092 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 32602993  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32602992 gtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 32602904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22043174 - 22042586
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  22043174 tgtgttcggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 22043075  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22043074 gcaagcagcctaagagggcgcctactacaggtcgagtttttgctctggctgctactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 22042975  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22042974 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatg 22042875  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042874 attggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 22042775  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  22042774 tggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagttagt 22042675  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22042674 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22042586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15536730 - 15536142
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |  || | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  15536730 tgtgtccggtgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatactgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 15536631  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536630 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctcttgctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15536531  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15536530 taatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatg 15536431  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15536430 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaa 15536331  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15536330 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagt 15536231  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15536230 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 15536142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 21163976 - 21164560
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || || |     
T  21163976 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactggctgattgcaactgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcaatgcaa 21164075  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||    
T  21164076 gcaacctaagaaggcgccaactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgat 21164175  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21164176 catactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatg 21164275  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21164276 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgga 21164375  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  21164376 cttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtat 21164475  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21164476 ttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgatattttgatgt 21164560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 109 - 589
Target Start/End: Original strand, 22129159 - 22129639
Alignment:
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22129159 cctaagagggcgcctactacgggtcaagtttttgctctggctggtactcagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctagattaataata 22129258  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 308  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22129259 ctgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaca 22129358  T
Q  309 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129359 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 22129458  T
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22129459 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttct 22129558  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22129559 cttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 22129639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Original strand, 21391355 - 21391883
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  21391355 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacacaga 21391454  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21391455 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttctta 21391554  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  21391555 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgt 21391654  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21391655 ttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttgg 21391754  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    | |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||||| ||  ||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391755 aatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 21391854  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  21391855 gcagttagaacgtgatggtatcttgatgt 21391883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Original strand, 21780681 - 21781209
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  21780681 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacacaga 21780780  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21780781 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttctta 21780880  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  21780881 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgt 21780980  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21780981 ttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttgg 21781080  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    | |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||||| ||  ||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21781081 aatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 21781180  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  21781181 gcagttagaacgtgatggtatcttgatgt 21781209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21254238 - 21253704
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| |||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21254238 attgtttgctttaactgcaatgaatagggtcacatcggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagtgtttttgctttgactggta 21254139  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21254138 cacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttat 21254039  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21254038 tgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 21253939  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21253938 gtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatgagct 21253839  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    |||| || |||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||  |  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21253838 ggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagca 21253739  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  21253738 gctgaagcagttggaacgtgatggcattttgatgt 21253704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22990286 - 22989804
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | |     
T  22990286 agcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacag 22990187  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | ||||||| |||    |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  22990186 tacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 22990087  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22990086 gagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgact 22989987  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  22989986 tggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 22989887  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| |  |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  22989886 ctcttctgctgaagaggaaagtgacgcatagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttgatgt 22989804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Original strand, 22421433 - 22421914
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  || || || |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  22421433 agcctaagaaggcgcagactactgagagagtgtttgctt-gactggtacttagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatag 22421531  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  22421532 tacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 22421631  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  22421632 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgact 22421731  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  22421732 tggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 22421831  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  22421832 ctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatggaattttgatgt 22421914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 211 - 589
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786377
Alignment:
Q  211 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  311 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21786198  T
Q  411 ttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 510  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||||| ||  ||| ||||    
T  21786199 ttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactct 21786298  T
Q  511 tccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  21786299 tctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 21786377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 211 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22523683 - 22523305
Alignment:
Q  211 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  22523683 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 22523584  T
Q  311 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  22523583 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggt 22523484  T
Q  411 ttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 510  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||    
T  22523483 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttctct 22523384  T
Q  511 tccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || |  ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| || |||||||    
T  22523383 tctgctgaagaagaaagtagcgcaaagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaattttgatgt 22523305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 589
Target Start/End: Original strand, 22245990 - 22246455
Alignment:
Q  124 actactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgcta 223  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||| ||  ||    
T  22245990 actagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttata 22246089  T
Q  224 ttattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaac 323  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22246090 ttattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaac 22246189  T
Q  324 tccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  22246190 tccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttg 22246289  T
Q  424 agtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagagg 523  Q
    ||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  |  |||| ||||| |  |||||||    
T  22246290 agtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaagtcgatgtatttttcttctgctgaagagg 22246389  T
Q  524 aaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  22246390 aaagtggtgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 22246455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 177 - 589
Target Start/End: Original strand, 22375064 - 22375475
Alignment:
Q  177 tttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgct 276  Q
    |||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||       
T  22375064 tttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaag 22375163  T
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  22375164 ttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgt 22375262  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22375263 ctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttca 22375362  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||     
T  22375363 tattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcagaattcttgtctactaagtagctgaatcaattagaacgtgaa 22375462  T
Q  577 ggtatcttgatgt 589  Q
    || || |||||||    
T  22375463 ggaattttgatgt 22375475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 124 - 420
Target Start/End: Original strand, 22245572 - 22245868
Alignment:
Q  124 actactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgcta 223  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||| ||  ||    
T  22245572 actagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttata 22245671  T
Q  224 ttattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaac 323  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22245672 ttattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaac 22245771  T
Q  324 tccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  22245772 tccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21928595 - 21928270
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21928595 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21928496  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| | ||||||||    
T  21928495 gtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctat 21928396  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||| | ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||    
T  21928395 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatatt 21928296  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  21928295 aattgctttagtaagacggtacattt 21928270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22374036 - 22373705
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  22374036 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22373937  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  22373936 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 22373837  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||| | | || |||||| | ||| | || ||| | || | ||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  22373836 gtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 22373737  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  22373736 aattgttttagtaagacggtacatttttcttc 22373705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 469
Target Start/End: Original strand, 16268665 - 16269126
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| |||||||||||    ||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |    
T  16268665 ggtgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctga 16268764  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| |||    |||  ||| |  || || ||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  16268765 gccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 16268864  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  16268865 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 16268964  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |   | |||||    
T  16268965 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgattt 16269064  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16269065 agtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataacc 16269126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28984078 - 28983747
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  28984078 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28983979  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  28983978 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28983879  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  28983878 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 28983779  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  28983778 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 28983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20391289 - 20390845
Alignment:
Q  145 ttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgc 244  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  20391289 ttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacac 20391190  T
Q  245 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 344  Q
    |||| || |||||| |  ||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20391189 attgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 20391090  T
Q  345 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 444  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |     
T  20391089 tacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatcttt 20390990  T
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||||| ||| |  | ||||| ||||| |  || || || |||   || ||||| |||     
T  20390989 gggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgcatttttcttctgctgaggaagagagtaaagctgagttcttga 20390890  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20390889 ctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatcttaatgt 20390845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28989297 - 28988966
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  28989297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28989198  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  28989197 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28989098  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  28989097 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 28988998  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  28988997 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 28988966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19985347 - 19985037
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  19985347 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 19985248  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  19985247 gtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19985148  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |  | ||||    ||||||||| ||  | || || |||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  19985147 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgtcgttgacgaatatggatgtaatctttgggataaactggttagagtataaccgtgttcatatt 19985048  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    |||||||||||    
T  19985047 aattgttttag 19985037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 578
Target Start/End: Original strand, 22027894 - 22028291
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  22027894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 22027993  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  22027994 gtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctat 22028093  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  22028094 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatata 22028193  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||| ||  |||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  22028194 aattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgttgaagaagagggtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 22028291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Original strand, 29301040 - 29301323
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  29301040 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 29301139  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    ||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||  ||||| ||||||||    
T  29301140 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctat 29301239  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||||||| | || ||||   | |||||||||||| | || ||    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  29301240 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 29301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 22054045 - 22053720
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  22054045 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 22053946  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||    
T  22053945 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 22053847  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||||   |||||||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  22053846 ggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 22053747  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  22053746 taaccgggttcatatcaattgctttag 22053720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 31414146 - 31414477
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||   || |||| || |   ||||    
T  31414146 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgg 31414245  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  31414246 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 31414345  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||| |   || ||||||||| |  | ||||   |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  31414346 gtttggtagagactttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatc 31414445  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  31414446 aattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 31414477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 18881151 - 18881305
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  18881151 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacaga 18881250  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactccttt 215  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  18881251 cagagaacggggatcgcttgatcaaaggtacttgttatattgataatacaccttt 18881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357423
Alignment:
Q  219 tgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||     
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  319 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctac 418  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||| |    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgc 27357466  T
Q  419 ctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 461  Q
    | |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  27357465 cgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 27357423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 450 - 589
Target Start/End: Original strand, 21919987 - 21920126
Alignment:
Q  450 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 549  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919987 gaactggttggaatagaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctact 21920086  T
Q  550 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  21920087 aagcagctgaagcagttagaacgtgacggtattttgatgt 21920126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14335666 - 14335078
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14335666 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 14335567  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335566 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 14335467  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335466 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 14335367  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335366 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 14335267  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335266 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 14335167  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14335166 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 14335078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8710875 - 8710287
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8710875 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggaaagggtcacattagttcacagt 8710776  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710775 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 8710676  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710675 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 8710576  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8710575 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 8710476  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710475 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 8710376  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8710375 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8710287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 18587171 - 18587759
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587171 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacggacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 18587270  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587271 gtactcagcctaagagggcgccgactactagtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 18587370  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587371 taataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 18587470  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18587471 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 18587570  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587571 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 18587670  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18587671 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 18587759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 44788351 - 44788939
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44788351 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 44788450  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788451 gtacttagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 44788550  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44788551 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatg 44788650  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788651 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 44788750  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788751 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 44788850  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44788851 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 44788939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18181013 - 18180427
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181013 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 18180914  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180913 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 18180814  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18180813 taataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatg 18180714  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180713 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 18180614  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18180613 tggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagcaagtcagt 18180514  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18180513 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 18180427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 15158057 - 15158645
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15158057 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 15158156  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158157 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 15158256  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158257 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 15158356  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15158357 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaa 15158456  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158457 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 15158556  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15158557 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 15158645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 13689311 - 13688723
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13689311 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggatagggtcacattagttcacagt 13689212  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689211 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 13689112  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689111 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 13689012  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13689011 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 13688912  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688911 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 13688812  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13688811 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 13688723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 11234213 - 11234801
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234213 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 11234312  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234313 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 11234412  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11234413 taataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatg 11234512  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11234513 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 11234612  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234613 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 11234712  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11234713 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 11234801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 11550102 - 11550690
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  11550102 tgtgtctggtgtggcaagaagggtcatattgtagttgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggacatattagttcatagt 11550201  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550202 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 11550301  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11550302 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatg 11550401  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550402 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 11550501  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11550502 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagt 11550601  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11550602 gtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 11550690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12690771 - 12690184
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12690771 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtattttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagt 12690672  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690671 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 12690572  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690571 taataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 12690473  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690472 agttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 12690373  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12690372 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagt 12690273  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  12690272 gtatttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 12690184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 17703455 - 17704043
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  17703455 tgtgtccgatgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaat 17703554  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| |||||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17703555 gcaagcagccgaagaggtcgcctactatgggtcgagtttttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatat 17703654  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703655 taataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 17703754  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703755 aatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 17703854  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17703855 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 17703954  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17703955 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 17704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9591634 - 9591050
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  9591634 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattatagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 9591535  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591534 gcaagcagccgaagagggagcctactacaggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 9591435  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9591434 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatg 9591335  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9591334 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaa 9591235  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |    
T  9591234 tggatttagtt----tacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagcaagtcaat 9591139  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9591138 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 9591050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 173 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14957652 - 14957236
Alignment:
Q  173 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957652 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttc 14957553  T
Q  273 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  14957552 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcct 14957453  T
Q  373 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14957452 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatg 14957353  T
Q  473 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 572  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14957352 ttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacg 14957253  T
Q  573 cgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||| |||||||    
T  14957252 tgatggtattttgatgt 14957236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 245 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8201074 - 8200730
Alignment:
Q  245 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201074 attgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 8200975  T
Q  345 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8200974 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttg 8200875  T
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8200874 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 8200775  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8200774 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8200730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 299 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873372
Alignment:
Q  299 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  399 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtca 10873463  T
Q  499 gtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873462 gtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 10873372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 107 - 488
Target Start/End: Original strand, 15146029 - 15146410
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||     
T  15146029 agcctaagaaggtgcggactactagtagagtttttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatag 15146128  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15146129 aacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatgga 15146228  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||     
T  15146229 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattgata 15146328  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 488  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15146329 tggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14042899 - 14042402
Alignment:
Q  67 aattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagaga 166  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  14042899 aattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacaaactactgggagagtttttgcattgactggtactcagaccgaga 14042800  T
Q  167 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattg 266  Q
     ||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  14042799 gtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattg 14042700  T
Q  267 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaa 366  Q
    || |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | |    
T  14042699 tgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaaga 14042600  T
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| ||||    
T  14042599 tgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaataca 14042500  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14042499 accatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 67 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14352929 - 14352432
Alignment:
Q  67 aattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagaga 166  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  14352929 aattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacaaactactgggagagtttttgcattgactggtactcagaccgaga 14352830  T
Q  167 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattg 266  Q
     ||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  14352829 gtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattg 14352730  T
Q  267 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaa 366  Q
    || |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | |    
T  14352729 tgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaaga 14352630  T
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| ||||    
T  14352629 tgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaataca 14352530  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14352529 accatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 16726441 - 16726744
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  16726441 tgtgtccgatgtggcaaaaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaat 16726540  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| |||||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16726541 gcaagcagccgaagaggtcgcctactatgggtcgagtttttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatat 16726640  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726641 taataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 16726740  T
Q  301 aatg 304  Q
    ||||    
T  16726741 aatg 16726744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11984262 - 11984032
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  11984262 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaatttcaatgaagagggtcatattggttcccaat 11984163  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11984162 gcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttggtctggctggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 11984063  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11984062 taataatactcctttagttgctattattgat 11984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 142 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15627653 - 15627233
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||| | |||||| ||||   || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  15627653 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgata 15627554  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| | ||   |||||||||||| ||||   ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15627553 cgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggt 15627454  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
    |||||||||| | || ||| | |  ||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||     
T  15627453 gactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatc 15627354  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttt 541  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||||| |    
T  15627353 cttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttct 15627254  T
Q  542 tgtctactaagcagctgaagc 562  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  15627253 taactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 589
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14150024
Alignment:
Q  427 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  527 gtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14149962 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttgatgt 14150024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 512
Target Start/End: Original strand, 18051066 - 18051442
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  18051066 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 18051165  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18051166 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 18051264  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  18051265 gttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatgga 18051364  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | || ||||| |||||    
T  18051365 tgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 18051442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19150102 - 19149771
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   || |    
T  19150102 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 19150003  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  19150002 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19149903  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  19149902 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 19149803  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  19149802 aattgctttagtaagacgatacatttttcttc 19149771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20749501 - 20749170
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   || |    
T  20749501 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 20749402  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  20749401 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 20749302  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  20749301 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 20749202  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  20749201 aattgctttagtaagacgatacatttttcttc 20749170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14957778 - 14957652
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14957778 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagt 14957679  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgacta 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14957678 gtactcagcctaagagggcgccgacta 14957652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13676555 - 13676184
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  13676555 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 13676456  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  13676455 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 13676356  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  13676355 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 13676256  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  13676255 ccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 26091956 - 26092287
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  26091956 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 26092055  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  26092056 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 26092155  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  26092156 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 26092255  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26092256 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 26092287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 563
Target Start/End: Original strand, 15099780 - 15100143
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  15099780 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatat 15099879  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||| | || ||||||    
T  15099880 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaa 15099979  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | |    
T  15099980 gtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagacgg 15100079  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    | ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  15100080 tgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 15100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 16947630 - 16947961
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  16947630 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 16947729  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  16947730 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 16947829  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||| | | || ||||||||  | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  16947830 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatc 16947929  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  16947930 aattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 16947961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13024409 - 13024153
Alignment:
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  13024409 actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggag 13024310  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||    | || ||    
T  13024309 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgactt 13024210  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  13024209 agtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Original strand, 14261423 - 14261734
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | ||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  14261423 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatat 14261522  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||  |||||    
T  14261523 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga-attgaa 14261621  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  14261622 gtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagtaagacgg 14261721  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    | ||||| |||||    
T  14261722 tgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 49155565 - 49155061
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |  || |||||||| || ||||| || |||||||||||| || |    
T  49155565 ggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctga 49155466  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| | |    | |  ||| | ||| || ||||||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  49155465 gccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 49155366  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  49155365 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaagggg 49155266  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | |||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  49155265 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 49155166  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttc 507  Q
     ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||||    
T  49155165 ggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttc 49155066  T
Q  508 tcttc 512  Q
    |||||    
T  49155065 tcttc 49155061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 463
Target Start/End: Original strand, 26115575 - 26116030
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |    
T  26115575 ggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctga 26115674  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
     || |||| | |    |||  ||| | ||| || ||||||||||| || || ||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  26115675 accgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagt 26115774  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  26115775 actcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 26115874  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  26115875 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 26115974  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  26115975 agtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 40924975 - 40925306
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  40924975 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 40925074  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | || ||    
T  40925075 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 40925174  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| |||     
T  40925175 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatc 40925274  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40925275 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 40925306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 463 - 589
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726971
Alignment:
Q  463 tacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 562  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  563 aactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttgatgt 16726971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 437
Target Start/End: Original strand, 13965653 - 13966082
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |    
T  13965653 ggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctga 13965752  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| |||    |||  ||| | ||| || || |||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  13965753 gccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 13965852  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  13965853 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 13965952  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||   | |||||    
T  13965953 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgattt 13966052  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgt 437  Q
    ||||||||| || |||   |||||||||||    
T  13966053 agtttgtctgccgttgtcgggtatggatgt 13966082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 485
Target Start/End: Original strand, 12798551 - 12798963
Alignment:
Q  73 aatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgagg 172  Q
    |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||   |||   ||| | |||||| || |||||||| || || |||| ||||||||    
T  12798551 aatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgagg 12798650  T
Q  173 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttc 272  Q
    | ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  |     
T  12798651 accgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcata 12798750  T
Q  273 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct 372  Q
    |   |||||||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||  | ||| | |  ||||      
T  12798751 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctg 12798850  T
Q  373 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 472  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  12798851 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtg 12798950  T
Q  473 ttcttattaattg 485  Q
    ||| |||||||||    
T  12798951 ttcatattaattg 12798963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21755503 - 21755215
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  21755503 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 21755404  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  21755403 gtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctat 21755304  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | ||||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21755303 gtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtataacc 21755215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12459719 - 12459431
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  12459719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12459620  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| || |||||    
T  12459619 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctat 12459520  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12459519 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 12459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14140770 - 14140439
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  14140770 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 14140671  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  14140670 gt-ttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 14140572  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||    
T  14140571 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatat 14140472  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     || |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  14140471 caactgttttagtaagacggtacatttttcttc 14140439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 11385587 - 11385875
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  11385587 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 11385686  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    |||| |||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  11385687 gtct-gattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 11385785  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11385786 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 11385875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10873731 - 10873652
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagag 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10873731 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattg-aatggagag 10873652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15343522 - 15343191
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  15343522 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 15343423  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  15343422 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 15343324  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||  | ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||| |||    
T  15343323 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagtataacagagttcatat 15343224  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  15343223 caattgctttagtaagacggtacatttttcttc 15343191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 399
Target Start/End: Original strand, 12203943 - 12204176
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | ||||    
T  12203943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgatt 12204042  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 365  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||     
T  12204043 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgag 12204142  T
Q  366 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
     ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  12204143 ttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaa 12204176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 14283532 - 14283820
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  14283532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 14283631  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  14283632 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 14283730  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14283731 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 14283820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 533 - 581
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  533 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12459849 - 12459785
Alignment:
Q  51 ggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 115  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12459849 ggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaaga 12459785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 29589575 - 29590163
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589575 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 29589674  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589675 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 29589774  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29589775 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 29589874  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589875 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 29589974  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589975 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 29590074  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29590075 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 29590163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 28260333 - 28260921
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28260333 tgtgtccggtgtggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagt 28260432  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260433 gtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgagactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 28260532  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28260533 taataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 28260632  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260633 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 28260732  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260733 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 28260832  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28260833 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28260921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28285583 - 28284995
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28285583 tgtgtccggtgtggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagt 28285484  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285483 gtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgagactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 28285384  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28285383 taataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 28285284  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285283 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 28285184  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285183 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 28285084  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28285083 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28284995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 28339082 - 28339670
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28339082 tgtgtccggtgtggtaagagaggtcatgttgtagctgattgcaatcgcacggacattgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagt 28339181  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339182 gtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgagactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 28339281  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28339282 taataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 28339381  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339382 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 28339481  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339482 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 28339581  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28339582 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 28339670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28312775 - 28312187
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28312775 tgtgcccggtgtggcaagaaaggtcatgtagtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagaaggtcacattagttctcagt 28312676  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312675 gtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 28312576  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28312575 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 28312476  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312475 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 28312376  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312375 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 28312276  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312275 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 28312187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 24292918 - 24293506
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292918 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 24293017  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293018 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 24293117  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293118 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 24293217  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24293218 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaa 24293317  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24293318 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagcaagtcagt 24293417  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24293418 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggtatcttgatgt 24293506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 2871938 - 2872527
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871938 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgactgcaattgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 2872037  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872038 gtactcagcctaagagggcaccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 2872137  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872138 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 2872237  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2872238 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 2872337  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872338 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 2872437  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag-tttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2872438 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttttatctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggtatcttgatgt 2872527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16575035 - 16574447
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16575035 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 16574936  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574935 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgacggggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16574836  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574835 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 16574736  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16574735 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 16574636  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16574635 tggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagt 16574536  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16574535 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 16574447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16620345 - 16620933
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16620345 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 16620444  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620445 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgacggggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16620544  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620545 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 16620644  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16620645 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 16620744  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16620745 tggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagt 16620844  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16620845 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 16620933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25115697 - 25115109
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115697 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaatcgtacggatattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 25115598  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115597 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgccttgactggtactcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 25115498  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25115497 taataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatg 25115398  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115397 aatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 25115298  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115297 tggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 25115198  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115197 gcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagtttttatccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 25115109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 5836364 - 5836952
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5836364 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagccgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaacgaagagggtcacattagttcacagt 5836463  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836464 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtttttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 5836563  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5836564 taataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatg 5836663  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5836664 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaa 5836763  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  5836764 tggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagcaagtcagt 5836863  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5836864 gtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 5836952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 27559109 - 27559693
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| |||||||||||     ||||||| ||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |     
T  27559109 tccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaagcatgctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaa 27559208  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27559209 gcagcctaagagggcgcctactacgggttgagtttttgctctagctggtactcagacagagaatgaggatggtttgatcagaggtacttgttatattaat 27559308  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559309 aatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 27559408  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559409 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 27559508  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  27559509 tttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtat 27559608  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27559609 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 27559693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 184 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27189993
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  284 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 383  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatt 27190199  T
Q  384 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaat 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27190198 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaat 27190099  T
Q  484 tgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatct 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190098 tgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatct 27189999  T
Q  584 tgatgt 589  Q
    ||||||    
T  27189998 tgatgt 27189993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 184 - 589
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259247
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  284 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 383  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatt 27259041  T
Q  384 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaat 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27259042 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaat 27259141  T
Q  484 tgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatct 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259142 tgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatct 27259241  T
Q  584 tgatgt 589  Q
    ||||||    
T  27259242 tgatgt 27259247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22437010 - 22436426
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |     
T  22437010 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagatggtcacattggttctcagtgcaa 22436911  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||    
T  22436910 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgat 22436811  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22436810 aatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatg 22436711  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22436710 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattga 22436611  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    | | |||||  | ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22436610 tatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtat 22436511  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22436510 ttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 22436426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19867823 - 19867244
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||    
T  19867823 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagcagc 19867724  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  19867723 ctaagaaggcgccgactactagtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatac 19867624  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  19867623 tcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaagag 19867524  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19867523 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttag 19867424  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19867423 tttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctc 19867324  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19867323 ctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggtattttgatgt 19867244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 589
Target Start/End: Original strand, 16924867 - 16925364
Alignment:
Q  92 gttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  16924867 gttcacagtgtactcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgacgggtacacagacagagagcgaggatcgcttgatcagaggtac 16924966  T
Q  192 ttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttg 291  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16924967 ttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttg 16925066  T
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16925067 tctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtg 16925166  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  16925167 attttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttag 16925266  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  16925267 caagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggtattttgatgt 16925364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 581
Target Start/End: Original strand, 18405089 - 18405660
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |  ||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   |||    
T  18405089 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgaggatatagtatgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttctcagtgcaagaagc 18405188  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  18405189 ctaagaaggcgtcgactactggtagagtttttgctttgactagtacacagatagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 18405288  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18405289 acctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagag 18405388  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |    
T  18405389 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttgg 18405488  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| || |||||  |||||||    
T  18405489 tttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagtaaatcagtgtatttctc 18405588  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 581  Q
    ||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405589 ttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 23081462 - 23080980
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||     
T  23081462 agcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactgatactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatag 23081363  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  |||| ||||||    
T  23081362 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatgga 23081263  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |    
T  23081262 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgact 23081163  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  23081162 tggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 23081063  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  23081062 ctcttcttctgaagaggaaagtggcgcaaaattttggtctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 23080980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22829522 - 22829800
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22829522 tgtgtctggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcaccgt 22829621  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22829622 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacggagaacggggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 22829721  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829722 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcgttattgctttcgattgtgtttctgctttg 22829800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 351 - 589
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828079
Alignment:
Q  351 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatg 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  451 aactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctacta 550  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctacta 22828040  T
Q  551 agcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828041 agcaggtgaagcaactggaacgcgatgatatcttgatgt 22828079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 148 - 589
Target Start/End: Original strand, 18182650 - 18183091
Alignment:
Q  148 actgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 247  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18182650 actggtacacagacagataatgaggatcatttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatt 18182749  T
Q  248 gctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 347  Q
     | |||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182750 tccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 18182849  T
Q  348 ttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggt 447  Q
    |||||| || ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||    
T  18182850 ttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggt 18182949  T
Q  448 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 547  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||  | || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  18182950 atgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtcagtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtcta 18183049  T
Q  548 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||    
T  18183050 ctaagtagctgaagcaattaggacgtgatggaattttgatgt 18183091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27205767 - 27205579
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27205767 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagt 27205668  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27205667 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 27205579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27243461 - 27243649
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27243461 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagt 27243560  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243561 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 27243649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 448
Target Start/End: Original strand, 23085016 - 23085408
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||| |||| ||||| |   |||||| || ||||| ||||||||| || || || ||||||||| | |     
T  23085016 ttgtgtgttttaattgaaatgaagaggttcatattggttcgcagtgcaagaagcctatgaaggcgcagactactggaagagtgtttgctttgactagtat 23085115  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23085116 gcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttatt 23085215  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    | | | |||| || ||||   |||||||||  | ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23085216 gttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctag 23085315  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 448  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23085316 tgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 491
Target Start/End: Original strand, 30678301 - 30678650
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |   |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  30678301 gctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgcta 30678400  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    ||| ||| |||||||||   ||||||| ||||   |||||||||| | ||||   |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30678401 cgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggt 30678500  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||     
T  30678501 tactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaata 30678600  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30678601 cttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttag 30678650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 25756751 - 25756956
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| || |    
T  25756751 tgtgtccggtgcggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaggagggtcatattggttcccaat 25756850  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25756851 gcaaacagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatat 25756950  T
Q  201 taataa 206  Q
    ||||||    
T  25756951 taataa 25756956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19437967 - 19437627
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||     
T  19437967 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttga 19437868  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||| |||    
T  19437867 gtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttat 19437768  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||| | | || |||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| |||     
T  19437767 gtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatc 19437668  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaaga 521  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| || |||||    
T  19437667 aattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgtggaaga 19437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 373 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135531
Alignment:
Q  373 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 472  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 20135648  T
Q  473 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 572  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  20135647 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaaca 20135548  T
Q  573 cgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| || |||||||    
T  20135547 tgatggaattttgatgt 20135531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 373 - 589
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197338
Alignment:
Q  373 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacg 472  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 22197221  T
Q  473 ttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 572  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  22197222 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaaca 22197321  T
Q  573 cgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| || |||||||    
T  22197322 tgatggaattttgatgt 22197338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19455988 - 19455657
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  19455988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19455889  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||| | ||||||||    
T  19455888 gtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctat 19455789  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  19455788 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 19455689  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    
T  19455688 aattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 19455657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18797668 - 18797324
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  18797668 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgt 18797569  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaa 366  Q
    |  | |   |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||      
T  18797568 gcatataagttgggt-ttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagg 18797470  T
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    | |||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  18797469 tttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 18797370  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    |||  |||| ||| || || ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18797369 accgagttcatataaactgctttagcaagacagtgcatttttcttc 18797324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21474546 - 21474234
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||    
T  21474546 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 21474447  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  21474446 gaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 21474347  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| | || ||| |  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  21474346 gttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagtaagacgg 21474247  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    ||||||| |||||    
T  21474246 tacatttttcttc 21474234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25770809 - 25770478
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| || |||| | | ||||||| || |   ||||    
T  25770809 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgg 25770710  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  25770709 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 25770610  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||  | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  25770609 gtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 25770510  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||| |||||    
T  25770509 aattattttagtaagacaatacatttttcttc 25770478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15462316 - 15461904
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  15462316 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 15462217  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  15462216 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaa 15462118  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||    
T  15462117 ggtgtccgttatctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaata 15462018  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
     ||||  |||  |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||     
T  15462017 taaccgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcag 15461918  T
Q  565 ctggaacgcgatgg 578  Q
     ||||||| |||||    
T  15461917 ttggaacgagatgg 15461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Original strand, 16961082 - 16961206
Alignment:
Q  466 aaccacgttcttat-taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16961082 aaccatgttcttatctaatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaa 16961181  T
Q  565 ctggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| |||||||| |||||||    
T  16961182 ctggaacgtgatggtatattgatgt 16961206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 589
Target Start/End: Original strand, 10466164 - 10466572
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  10466164 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 10466263  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  || |||||    
T  10466264 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctat 10466363  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  10466364 gtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatatc 10466463  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 580  Q
    || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| ||| |||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| ||||| |    
T  10466464 aactgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaagttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctggaacgtgatggaa 10466563  T
Q  581 tcttgatgt 589  Q
    | |||||||    
T  10466564 ttttgatgt 10466572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 34642902 - 34643190
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||  |||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    |||    
T  34642902 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgg 34643001  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||    
T  34643002 gt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatcta 34643100  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||  || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  34643101 tgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtataacc 34643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Original strand, 19486610 - 19486918
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19486610 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 19486709  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| |   ||||   ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||    
T  19486710 gtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctat 19486809  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | ||  |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||     
T  19486810 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatg 19486907  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    |||||||||||    
T  19486908 aattgttttag 19486918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 293 - 512
Target Start/End: Original strand, 21567419 - 21567638
Alignment:
Q  293 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 392  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21567419 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21567518  T
Q  393 ttttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagc 492  Q
    |||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||     
T  21567519 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagt 21567618  T
Q  493 aagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| | || ||||| |||||    
T  21567619 aagacggtgcatttttcttc 21567638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24367365 - 24367083
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  24367365 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgg 24367266  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||  ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  24367265 gtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 24367166  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
     |||||| | |||||||  || |||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24367165 ctttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 512
Target Start/End: Original strand, 24515717 - 24516061
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | || |||    
T  24515717 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 24515816  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| || ||| | |  |    
T  24515817 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggt 24515916  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || |||||  | ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  24515917 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtataa 24516016  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  24516017 ccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 24516061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19466133 - 19465976
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  19466133 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19466034  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 338  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466033 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 14377232 - 14377520
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  14377232 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 14377331  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  14377332 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 14377431  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | || || ||| | || ||||||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||    
T  14377432 gtttggtagagacttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaactagttagagtataacc 14377520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 10466034 - 10466098
Alignment:
Q  51 ggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaaga 115  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10466034 ggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaaga 10466098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 387
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010976
Alignment:
Q  296 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggt 20010976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24367538 - 24367445
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtg 101  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| ||   ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24367538 ggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtg 24367445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12479881 - 12479293
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12479881 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 12479782  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479781 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 12479682  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479681 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 12479582  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479581 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 12479482  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479481 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 12479382  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12479381 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 12479293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 17091880 - 17092468
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091880 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 17091979  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091980 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 17092079  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17092080 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatg 17092179  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092180 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 17092279  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092280 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 17092379  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17092380 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 17092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 19775524 - 19776112
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775524 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 19775623  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775624 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatat 19775723  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775724 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 19775823  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19775824 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 19775923  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775924 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 19776023  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19776024 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttgatgt 19776112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 23959028 - 23958440
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959028 tgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagatattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 23958929  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958928 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatat 23958829  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958828 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 23958729  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23958728 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 23958629  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958628 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 23958529  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23958528 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 23958440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8389693 - 8389105
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389693 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 8389594  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389593 gtacccagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 8389494  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389493 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 8389394  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389393 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 8389294  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389293 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 8389194  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8389193 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 8389105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16233723 - 16234311
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16233723 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtggctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 16233822  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233823 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagagtgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16233922  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233923 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 16234022  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234023 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16234122  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234123 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16234222  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16234223 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 16234311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27714617 - 27714029
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714617 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 27714518  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714517 gtactcagtctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 27714418  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714417 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 27714318  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27714317 aatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 27714218  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714217 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 27714118  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27714117 atatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 27714029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 8050354 - 8050942
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050354 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 8050453  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050454 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 8050553  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050554 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 8050653  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8050654 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 8050753  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050754 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 8050853  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8050854 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggtatcttgatgt 8050942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 14300710 - 14301298
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14300710 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagt 14300809  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300810 gtactcagcctaagagggcgccgactacaggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 14300909  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300910 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 14301009  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14301010 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaa 14301109  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301110 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 14301209  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14301210 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 14301298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19635417 - 19634829
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635417 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 19635318  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19635317 gtactcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 19635218  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635217 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 19635118  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19635117 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaa 19635018  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635017 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 19634918  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19634917 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 19634829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40476313 - 40475733
Alignment:
Q  9 gtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcag 108  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40476313 gtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcgg 40476214  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476213 cctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 40476114  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476113 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 40476014  T
Q  309 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476013 gatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattta 40475914  T
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40475913 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagcaagtcagtgcatttct 40475814  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40475813 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttgtatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 40475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14683848 - 14683260
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||    
T  14683848 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcatagt 14683749  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683748 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacaaaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 14683649  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683648 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 14683549  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683548 aatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 14683449  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14683448 tggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcatgtcagt 14683349  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  14683348 gtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 14683260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Original strand, 18224231 - 18224765
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||  | || |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |    
T  18224231 attgtatgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcctaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggta 18224330  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18224331 cttagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggatcttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttat 18224430  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224431 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 18224530  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  18224531 gtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaatt 18224630  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18224631 ggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagca 18224730  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18224731 gctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 18224765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16250581 - 16251169
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||| || |    
T  16250581 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagttgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataggttcccaat 16250680  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16250681 gcaagcagtcgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgacgattgtttgataagaggtacttgctatat 16250780  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16250781 taataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatg 16250880  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250881 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16250980  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16250981 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 16251080  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16251081 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 16251169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 15144627 - 15145212
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| |||||||     
T  15144627 tccgatgtggtaagaagggccatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaa 15144726  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||    
T  15144727 gctgcctaagaaggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgat 15144826  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15144827 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatg 15144926  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144927 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 15145026  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag-caagtcagtaca 503  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  15145027 tttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagtcaagtcagtgta 15145125  T
Q  504 tttctcttccgtcgaagaggaaagt-ggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15145126 tttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 15145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 56 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14162696 - 14162163
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  14162696 ttgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaaacagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgcattgacgggtac 14162597  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  14162596 ccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttatt 14162497  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14162496 gctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttg 14162397  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  14162396 tgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactg 14162297  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| || || ||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||     
T  14162296 gttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagcaagtcggtgtccttctcctctgttgaagaagaaagcggagtagagttcttgtctaccaagcaa 14162197  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  14162196 ctgaagcaactagaacgtgatggaattttgatgt 14162163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Original strand, 15820 - 16354
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||| || |||||||| || |   ||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  15820 attgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataagttcacaatgcaagaagcttaagaaggcgcagactactgggagagtttttgcattgactggta 15919  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15920 ctcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttat 16019  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16020 tgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 16119  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16120 gtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaact 16219  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  16220 ggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaaca 16319  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  16320 gctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 131 - 441
Target Start/End: Original strand, 16350415 - 16350725
Alignment:
Q  131 gtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 230  Q
    |||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350415 gtagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattga 16350514  T
Q  231 tactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagct 330  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350515 tactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagct 16350614  T
Q  331 aagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggta 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16350615 aagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggta 16350714  T
Q  431 tggatgtgatt 441  Q
    |||||||||||    
T  16350715 tggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13513631 - 13513285
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  13513631 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattatagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 13513532  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513531 gcaagcagcctaagagggtgcctactactggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 13513432  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13513431 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatg 13513332  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513331 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 123 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14697260 - 14696794
Alignment:
Q  123 gactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgct 222  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||  || ||| |||||||||| |||||    
T  14697260 gactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgct 14697161  T
Q  223 attattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14697160 attattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaa 14697061  T
Q  323 ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctaccttt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14697060 ctccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttaccttt 14696961  T
Q  423 gagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagag 522  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||    
T  14696960 gagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagag 14696861  T
Q  523 gaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  14696860 gaaagtggcgcaaaattcttttctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 14696794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 277 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14188511 - 14188199
Alignment:
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14188511 ttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgt 14188412  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14188411 ctttgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttct 14188312  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
    ||| || ||||||||||| || ||    | ||| || |  ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14188311 tatcaactgttttagcaattcggtgtcctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagat 14188212  T
Q  577 ggtatcttgatgt 589  Q
    || || |||||||    
T  14188211 ggaattttgatgt 14188199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 328 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16218923
Alignment:
Q  328 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 427  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  428 gtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 527  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16218985  T
Q  528 tggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  16218984 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 16218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 328 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222243
Alignment:
Q  328 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtg 427  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  428 gtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaag 527  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaag 16222305  T
Q  528 tggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  16222304 tggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 16222243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 437 - 589
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352849
Alignment:
Q  437 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 536  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  537 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 16352849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15073460 - 15073129
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||    |   ||||    
T  15073460 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttgg 15073361  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
     ||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||    
T  15073360 ctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctat 15073261  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  15073260 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 15073161  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  15073160 aattgttttagtaagacggtacatttttcttc 15073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 18604550 - 18604797
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || |  |||||||| ||| |||| || |    
T  18604550 tgtgtccggtgtggcaaaaagggtcttattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaacgaggagggtcatattggttcccaat 18604649  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  | ||| ||||||| ||| |||||  || | ||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18604650 gcaagcggccgaagagggagcctactacaagtcgagtttttgctctggctggtactcagagagagaatgaggatcatttgattagaggtacttgctatat 18604749  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604750 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Original strand, 29450708 - 29450991
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  29450708 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29450807  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  29450808 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 29450907  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  29450908 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 578
Target Start/End: Original strand, 51603918 - 51604360
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  51603918 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 51604017  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51604018 gtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 51604116  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||    
T  51604117 gttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatgga 51604216  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 534  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |      
T  51604217 tgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagtt 51604316  T
Q  535 gagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||  |||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  51604317 gaaattttatctacaaagcagatgaagcaattagaacgtgatgg 51604360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16219414 - 16219184
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| || || |   ||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  16219414 ttgtgtgctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctgagaaagcgccgactactgggagagtttttgctttgactggtac 16219315  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  16219314 ttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttatt 16219215  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 286  Q
    ||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16219214 gctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16222734 - 16222504
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| || || |   ||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  16222734 ttgtgtgctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctgagaaagcgccgactactgggagagtttttgctttgactggtac 16222635  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  16222634 ttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttatt 16222535  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 286  Q
    ||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16222534 gctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 3261965 - 3262296
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  3261965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 3262064  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  3262065 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 3262164  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  3262165 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 3262264  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  3262265 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 3262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 463
Target Start/End: Original strand, 44659037 - 44659319
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  44659037 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 44659136  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  44659137 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 44659236  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  44659237 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 353
Target Start/End: Original strand, 53750596 - 53750813
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||    
T  53750596 gtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 53750695  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  53750696 gtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 53750794  T
Q  335 gttcggtgactacttctct 353  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  53750795 gttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 469
Target Start/End: Original strand, 11204230 - 11204691
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||| | ||||| |||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |    
T  11204230 ggtgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctga 11204329  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| || | |||    |||  ||| | ||| || ||||||||||| || || ||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  11204330 gccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 11204429  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   || ||| | ||| | |||| |||||| || |    
T  11204430 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaagggg 11204529  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   ||||||   |||||||||||| | |||||||   | |||||    
T  11204530 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttgtggttgattt 11204629  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11204630 agtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataacc 11204691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 512
Target Start/End: Original strand, 14993499 - 14993869
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  14993499 gctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctc 14993598  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
      ||||  || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  14993599 ttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcact 14993698  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  | |||||| |||| ||||  |||||| ||||||||    
T  14993699 aactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggaggctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatt 14993798  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  14993799 tttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27903501 - 27903198
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  27903501 aatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 27903402  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  27903401 gtgcatataagttgggtct-gattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 27903303  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  27903302 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagta 27903203  T
Q  465 caacc 469  Q
     ||||    
T  27903202 taacc 27903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20893132 - 20892844
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  20893132 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 20893033  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||   | |||| | ||||    
T  20893032 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatcta 20892934  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||| | |||||||   | ||| |||||||  | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20892933 tgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtataacc 20892844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16154864 - 16154677
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||| | | | ||||||||||    
T  16154864 ttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatat 16154765  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  16154764 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16154677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7357541 - 7357291
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  7357541 ggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctga 7357442  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| |||| |||    |||| ||| | ||| || || |||||||| || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  7357441 gccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 7357342  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7357341 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 7357291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16150718 - 16150531
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16150718 ttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatat 16150619  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  16150618 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggt 16150531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632393
Alignment:
Q  454 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 553  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  554 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 22632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Original strand, 15354322 - 15354499
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | |    
T  15354322 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagag 15354421  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    | ||| || | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||    
T  15354422 actttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagtataacc 15354499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 589
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848684
Alignment:
Q  448 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 547  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || || ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  548 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 14848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15258890 - 15258697
Alignment:
Q  319 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctac 418  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||| | | ||  | |||||| |||    
T  15258890 gaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgtttac 15258791  T
Q  419 ctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    | ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    
T  15258790 cgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 15258697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15266858 - 15266736
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||| || |||| | | ||||||| || |   |||||||| | | | ||||||||    
T  15266858 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 15266759  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaa 322  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||    
T  15266758 gaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 537; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22557 - 21969
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22557 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22458  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 22358  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22357 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 22258  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 22158  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 22058  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22057 gcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 21969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 537; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 16347658 - 16348246
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16347658 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgtaatcgtgcagacattgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagt 16347757  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347758 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 16347857  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16347858 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 16347957  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347958 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 16348057  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348058 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 16348157  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348158 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 16348246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 51330555 - 51331143
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51330555 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 51330654  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330655 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 51330754  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51330755 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 51330854  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330855 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 51330954  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330955 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 51331054  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331055 gcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 51331143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21833598 - 21833010
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21833598 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagt 21833499  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833498 gtactcagcctaagagggcgccgactactcgtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 21833399  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833398 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 21833299  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  21833298 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaa 21833199  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833198 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 21833099  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21833098 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 21833010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 33388092 - 33388680
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388092 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 33388191  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagagg-tacttgctata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33388192 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtt-gatcagagggtacttgctata 33388290  T
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 33388490  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388491 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 33388590  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33388591 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttgatgt 33388680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 41350731 - 41351319
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41350731 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgtgcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagt 41350830  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350831 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 41350930  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41350931 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatg 41351030  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41351031 aacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaa 41351130  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351131 tggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 41351230  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351231 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 41351319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19109664 - 19109076
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19109664 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacattagttcacagt 19109565  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19109564 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 19109465  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19109464 taataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatg 19109365  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19109364 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaaa 19109265  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109264 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 19109165  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19109164 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 19109076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 24784920 - 24785508
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||| ||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  24784920 tgtgcccggtgtggcaagaagggtcatacggtagctgactgcaagcgtaatgatattgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcagt 24785019  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785020 gcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 24785119  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24785120 taataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatg 24785219  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785220 aatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 24785319  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24785320 tggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaaatcagt 24785419  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24785420 gtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 24785508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 17042078 - 17042666
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17042078 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagagaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataagttcccagt 17042177  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| |||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||  |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17042178 gcaagcagccgaagaggacgcctactacgggtcgagtttttgcactagctggtactcagacagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatat 17042277  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17042278 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggccttgatttgtctgatatg 17042377  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042378 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 17042477  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17042478 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 17042577  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  17042578 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagtattttgatgt 17042666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21842508 - 21842066
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21842508 tgtgtccgatgtggcaagaaaggtcatattgtagccgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcatagt 21842409  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21842408 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 21842309  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21842308 taataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatg 21842209  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842208 aatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 21842109  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21842108 tggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 52 - 458
Target Start/End: Original strand, 20081490 - 20081896
Alignment:
Q  52 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  20081490 gacattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcgcagtgtacgcggcctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgcgttgacta 20081589  T
Q  152 ggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctt 251  Q
    | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20081590 gtactcagaccgagaataaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttt 20081689  T
Q  252 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081690 tattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 20081789  T
Q  352 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081790 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 20081889  T
Q  452 actggtt 458  Q
    |||||||    
T  20081890 actggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 387
Target Start/End: Original strand, 22496328 - 22496705
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  22496328 tgtggtaagaagggtcacgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattagttcgcagtgtaagcagc 22496427  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  22496428 ctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatac 22496527  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22496528 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagag 22496627  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496628 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 55 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16379336 - 16378813
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||   |||| |||| ||| | |||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  16379336 attgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcacattgtttcgcaatgtaagaagccaaagaaggctcagactactggtagagtgtttgctttgactggta 16379237  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16379236 cgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttat 16379137  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||| | ||||||| ||||   ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16379136 tgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 16379037  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |    
T  16379036 gtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaatt 16378937  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  || || || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16378936 ggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttgtctactaagca 16378837  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    |||||||||| | ||||| |||||    
T  16378836 gctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 21228619 - 21228947
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  21228619 tgtgtcaggtgtggcaagaagggtcaaattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 21228718  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||||||||||||||| || || ||| | ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228719 gcaagcagcctaagagggcgcctacaacgggtcgagtttttgctttggctggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 21228818  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21228819 taatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatg 21228918  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228919 aatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22400616 - 22400397
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22400616 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagcggattgcaagcgtacggacatcgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 22400517  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22400516 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgcattgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 22400417  T
Q  201 taataatactcctttagttg 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22400416 taataatactcctttagttg 22400397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21752334 - 21751991
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || |||||||| || |||||||| |  || ||||||||| |||||||||| |   |||    
T  21752334 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgtttcaattgcaacgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagc 21752235  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  21752234 ctaagaaggtgcagactactggtagagtttttgcattgactagtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 21752135  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  21752134 acctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagag 21752035  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752034 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839658
Alignment:
Q  439 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  539 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 21839658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 388 - 589
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233382
Alignment:
Q  388 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  488 ttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 587  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttgat 21233380  T
Q  588 gt 589  Q
    ||    
T  21233381 gt 21233382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 400 - 587
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502938
Alignment:
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 587  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttgat 22502938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 22435800 - 22436031
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  22435800 tccgatgtggcaagaagggtcatacattagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtgcaa 22435899  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22435900 gcaacctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctctggctggtacagagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaat 22435999  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactgg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436000 aatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22401828 - 22401621
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  22401828 tgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacaga 22401729  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22401728 cagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 22401629  T
Q  261 cgattgtg 268  Q
     |||||||    
T  22401628 agattgtg 22401621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21751877 - 21751645
Alignment:
Q  357 atgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactgg 456  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  21751877 atgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcg 21751778  T
Q  457 ttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagc 556  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||  ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21751777 ttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagc 21751678  T
Q  557 tgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21751677 tgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 21751645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Original strand, 21739279 - 21739589
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21739279 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21739378  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  21739379 gtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 21739478  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  21739479 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 21739578  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    ||||| |||||    
T  21739579 aattgctttag 21739589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 31537240 - 31537571
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  31537240 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 31537339  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  31537340 gtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 31537439  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| |||     
T  31537440 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatc 31537539  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  31537540 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 31537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 52988888 - 52988557
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  52988888 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 52988789  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  52988788 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 52988689  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  52988688 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 52988589  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  52988588 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 52988557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 512
Target Start/End: Original strand, 22015949 - 22016319
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  22015949 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgata 22016048  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22016049 ctcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 22016148  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||    
T  22016149 aactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatt 22016248  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    
T  22016249 tttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 184 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19857418 - 19857063
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||| |   |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | || |||| || |   ||||||     
T  19857418 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggta 19857319  T
Q  284 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 383  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | |  ||||| |||||||||||    
T  19857318 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtt 19857219  T
Q  384 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaat 483  Q
    |||| | || |||||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| |||    
T  19857218 tggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaat 19857119  T
Q  484 tgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  19857118 tgttttagcaagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 19857063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Original strand, 38910069 - 38910352
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  38910069 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 38910168  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  38910169 gtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 38910268  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  38910269 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 48426020 - 48425689
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  48426020 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 48425921  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  48425920 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 48425821  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  48425820 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatc 48425721  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  48425720 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 48425689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 578
Target Start/End: Original strand, 20853957 - 20854400
Alignment:
Q  135 ggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatact 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    || ||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||    
T  20853957 ggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacact 20854056  T
Q  235 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20854057 ggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagg 20854156  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||    
T  20854157 gttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatgga 20854256  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 534  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||| |||    
T  20854257 tgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggagca 20854356  T
Q  535 gagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    |||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20854357 gagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20854400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20297509 - 20297240
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  20297509 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 20297410  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   |||||| | | |||||||||| | |||||||      
T  20297409 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagagattttgtg 20297310  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
     | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20297309 gttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtataacc 20297240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 512
Target Start/End: Original strand, 21742759 - 21743126
Alignment:
Q  145 ttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgc 244  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |    
T  21742759 ttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactc 21742858  T
Q  245 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtga 343  Q
    |||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21742859 attgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaa 21742957  T
Q  344 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 443  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||| ||||||||||| |    
T  21742958 ctacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtgatttt 21743057  T
Q  444 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     || ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  21743058 tgggatgaactggttagagtataaccattttcatattaactgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21743126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 24096858 - 24097189
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  24096858 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 24096957  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  24096958 gtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 24097057  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||| | | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  24097058 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtataaccgagttcatatc 24097157  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  24097158 aattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 24097189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 37680369 - 37679914
Alignment:
Q  8 ggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca 107  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |    
T  37680369 ggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctga 37680270  T
Q  108 gcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataat 207  Q
    ||| | || | |    | |  ||| | ||| || ||||||||||| || |||||    ||||||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |    
T  37680269 gccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 37680170  T
Q  208 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  37680169 actcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaagggg 37680070  T
Q  308 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  37680069 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 37679970  T
Q  408 agtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37679969 agtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 512
Target Start/End: Original strand, 20833130 - 20833474
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | || |||    
T  20833130 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 20833229  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
      || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  |    
T  20833230 tcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggt 20833329  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  20833330 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 20833429  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  20833430 ccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 512
Target Start/End: Original strand, 429575 - 429731
Alignment:
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  429575 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 429674  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| || |||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  429675 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 429731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 353
Target Start/End: Original strand, 20074952 - 20075124
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  20074952 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20075051  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20075052 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 587
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359893
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||  || ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 587  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| |||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttgat 22359893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21176670 - 21176531
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || || |  |||||||||||| |||| ||||| | | | || || ||| || |||| |    
T  21176670 attgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaggacgcctactacggatcgagtctttgctctggctggta 21176571  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21176570 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 21176531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 12200554 - 12200382
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | |||||||||||| | |    
T  12200554 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagag 12200455  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12200454 attttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 445 - 587
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862022
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| || |    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 587  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttgat 21862022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18710545 - 18710300
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  18710545 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18710446  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   ||| |||| | | | ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  18710445 gcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 18710346  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 413  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||    
T  18710345 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttg 18710300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Original strand, 21045328 - 21045428
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21045328 gctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 21045427  T
Q  242 c 242  Q
    |    
T  21045428 c 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 478 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20140902 - 20140791
Alignment:
Q  478 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  20140902 attaattgctttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatg 20140803  T
Q  578 gtatcttgatgt 589  Q
    |||| |||||||    
T  20140802 gtattttgatgt 20140791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22116942 - 22116876
Alignment:
Q  123 gactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 189  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22116942 gactactgggagagtttttgctttgaatggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggt 22116876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 505; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10678 - 10090
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10678 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattatgtgttttaactgcaatggaaagggtcacattagttcacagt 10579  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10578 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgttttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 10479  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10478 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 10379  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 10279  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10278 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagcaagtcagt 10179  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10178 gcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggtatcttgatgt 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3734 - 3146
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3734 tgtgttcggtgtggtaagaaaggtcctattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 3635  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3634 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 3535  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3534 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatg 3435  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3434 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 3335  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3334 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 3235  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3234 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17470 - 16882
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||   | ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  17470 tgtgtccggtgtggcaataagggtcatatagtagctgatttttagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaat 17371  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  || |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17370 gcaaacaacctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatat 17271  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17270 taataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 17171  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17170 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaa 17071  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17070 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 16971  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16970 gtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggtattttgatgt 16882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 497; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41465 - 40877
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41465 tgtgtctggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 41366  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41365 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 41266  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41265 taataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 41166  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41165 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 41066  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41065 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagcaagtcagt 40966  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40965 gcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 40877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 13118 - 13706
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  13118 tgtgtctggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaat 13217  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13218 gcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 13317  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13318 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatg 13417  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  13418 aatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaa 13517  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13518 tggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagt 13617  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13618 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 13706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11779 - 11191
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11779 tgtgtccggtgtcgcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 11680  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11679 gtactcagcctaagagggtgccgactactggtagggtctttgctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 11580  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11579 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatg 11480  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11479 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 11380  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11379 tggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 11280  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11279 gcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggtatcttgatgt 11191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17659
Alignment:
Q  183 cagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  283 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 17866  T
Q  383 ttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaa 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865 ttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaa 17766  T
Q  483 ttgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatc 582  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17765 ttgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggtatc 17666  T
Q  583 ttgatgt 589  Q
    |||||||    
T  17665 ttgatgt 17659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 315 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53449
Alignment:
Q  315 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  415 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 514  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccg 53524  T
Q  515 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53523 tcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 53449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 55314 - 54996
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||  ||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  55314 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatagtatctgattgcaagcgtcaggacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacatattagttctcagt 55215  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55214 gtactcagcctaagagggcgccaactactggtagggtctttgctttgactggaactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 55115  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55114 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatg 55015  T
Q  301 aatggagagatggttgtcg 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55014 aatggagagatggttgtcg 54996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21307 - 21123
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21307 tgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgaatgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 21208  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcag 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21207 gtactcagcctaagaggacgccgactactagtagggtctttgctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcag 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 563
Target Start/End: Original strand, 47952 - 48070
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||      
T  47952 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggagcagagttcttaa 48051  T
Q  545 ctactaagcagctgaagca 563  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  48052 ctactaaacagttgaagca 48070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8568 - 7980
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||||| || |||||||||||||    
T  8568 tgtgtccagtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaaggacattgtgtgttttaactacaatgatgagggacatattagttcacagt 8469  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8468 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttattgctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 8369  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8368 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatg 8269  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 8169  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8168 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagt 8069  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8068 gtatttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttgatgt 7980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 36804 - 36229
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || || |     
T  36804 tccggtgtggcaagaagggtcatacgttagctgattgcaagcgtagtgatattgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatattggttctcaatgcaa 36705  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36704 gcagtttaagagggcgccgactactggtagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcacttgatcagaggtacttgttatattaat 36605  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36604 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 36505  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36504 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 36405  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36404 tctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtat 36305  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36304 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 445 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28800
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 28800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3517
Alignment:
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||  ||||||||| | || |||||    
T  3622 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcattt 3523  T
Q  507 ctcttc 512  Q
     |||||    
T  3522 ttcttc 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 10233 - 10820
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  10233 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagg-tcacattggttcacaat 10331  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10332 gcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatat 10431  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10432 taataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 10531  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10532 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaa 10631  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10632 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagt 10731  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10732 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 10820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 12888 - 13475
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  12888 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagg-tcacattggttcacaat 12986  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12987 gcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatat 13086  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13087 taataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 13186  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13187 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaa 13286  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13287 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagt 13386  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13387 gtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatgt 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32185 - 31606
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | ||  || |||||||| ||  || |||| | ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  32185 tccggtgtggtaagaagagtcatgcattagctgattgcaaacataatgatattgtgtgtttcgatcgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaa 32086  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  32085 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgct----cagaggtacttgctatattaat 31990  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31989 aatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatg 31890  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31889 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatgga 31790  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   |    
T  31789 tttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagt-gtt 31691  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  31690 ttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttgatgt 31606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 37651 - 37072
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| | ||  || |||||||| ||  || |||| | ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  37651 tccggtgtggtaagaagagtcatgcattagctgattgcaaacataatgatattgtgtgtttcgatcgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaa 37552  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  37551 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgct----cagaggtacttgctatattaat 37456  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37455 aatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatg 37356  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37355 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatgga 37256  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   |    
T  37255 tttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagt-gtt 37157  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  37156 ttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttgatgt 37072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 55 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 54893 - 54363
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| ||||||| ||||| |||| || || |||||||||||      
T  54893 attgtgtgttttaattgcaatgaagagggtcacattggttcgtagtgtaagaagcctaagaaggcgccggctactagtagagtatttgctttgactggtt 54794  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54793 cacagaaagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttat 54694  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||||  ||||||| | ||   |||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54693 tgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 54594  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  54593 gtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaact 54494  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54493 ggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagca 54394  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 585  Q
    | |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54393 gttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 36818 - 37402
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   | || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |     
T  36818 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactggccgattgcaaccgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaa 36917  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||    
T  36918 gcaacctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgactagtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgat 37017  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37018 catactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatg 37117  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  37118 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatgga 37217  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  37218 cttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtat 37317  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37318 ttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 37402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 56 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26607 - 26075
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| | || | ||| |   ||| ||||| ||||||||| | ||| || || || ||||| ||||| ||    
T  26607 ttgtgtgttttaattgcaatgaagaaggtcatattggctcgctgtgcaagaagcataagaaggcgccgacgagtgggagagtgtttgcttttactggtac 26508  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  26507 gcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttatt 26408  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    | | | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26407 gttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctag 26308  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||| | | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  26307 tgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactg 26208  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  26207 gttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagtttttgactactaagcag 26108  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 588  Q
    || |||||  | || || ||||| |||||||||    
T  26107 ctaaagcagttagagcgtgatggaatcttgatg 26075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 10156 - 10740
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||||||||| || | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |     
T  10156 tccggtgtggcaagaagggtcatacattagctgattgtaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtgcaa 10255  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10256 gcagcctaagagggcgccgactactggtagagtttttgctttggctaggacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaat 10355  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  10356 aatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatg 10455  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10456 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatgga 10555  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  10556 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagtcagtgtat 10655  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10656 ttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggtatattgatgt 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 589
Target Start/End: Original strand, 17137 - 17648
Alignment:
Q  78 agagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgt 177  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |  |||| |||||||||||||||||||||||     
T  17137 agagggtcatattgggtcccagtgtaagcagcctaagagggcgccgactacgggtagagttttttctctagctggtactcagacagagaatgaggatcgc 17236  T
Q  178 ttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17237 ttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactt 17336  T
Q  278 tgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17337 tgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatc 17436  T
Q  378 tatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctt 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  17437 tatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcat 17536  T
Q  478 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17537 atcaattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatg 17636  T
Q  578 gtatcttgatgt 589  Q
    |||| |||||||    
T  17637 gtattttgatgt 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 581
Target Start/End: Original strand, 194883 - 195412
Alignment:
Q  52 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  194883 gacattgtgtgctttaattgcaataaggagggtcacattggttcgtagtgtacgcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgcgttgaccg 194982  T
Q  152 ggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctt 251  Q
      ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  194983 atactcagaccaagaatgaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 195082  T
Q  252 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195083 tattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 195182  T
Q  352 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  195183 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatga 195282  T
Q  452 actggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaa 551  Q
    |||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  195283 actgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaa 195382  T
Q  552 gcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 581  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195383 gcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 24463 - 24126
Alignment:
Q  154 actcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcttta 253  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||| || |  ||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  24463 actcagaaagcgaatgaggatcatctgataagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgtttta 24364  T
Q  254 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
    ||| | | |||||||||||    |||| ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24363 ttgttgttgattgtgtttcgaaattggatcttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctct 24264  T
Q  354 cgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaac 453  Q
     |||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  |||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24263 agtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaac 24164  T
Q  454 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    ||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24163 tggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttag 24126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 34713 - 35296
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||||| | ||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| |||||||     
T  34713 tccgatgtggtaagaagggccatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaa 34812  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||    
T  34813 gctgcctaagaaggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgat 34912  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34913 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatg 35012  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35013 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 35112  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  35113 tttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtat 35211  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35212 ttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 35296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41888 - 41354
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  41888 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgcta 41789  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41788 ctcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttat 41689  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||| | ||||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41688 tgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 41589  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| |    
T  41588 gtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatt 41489  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41488 tgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagca 41389  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  41388 gctgaagcaattagaatgtgatggaatcttgatgt 41354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 75608 - 75074
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  75608 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgcta 75509  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  75508 ctcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttat 75409  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||| | ||||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75408 tgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 75309  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||| |    
T  75308 gtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatt 75209  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  75208 tgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagca 75109  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  75108 gctgaagcaattagaatgtgatggaatcttgatgt 75074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 589
Target Start/End: Original strand, 11350 - 11938
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  11350 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaat 11449  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  |||||||||||| || | ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11450 gcaagcagcctaagaggacgtctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagattgaggatcgtttgattagaggtacttgttatat 11549  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550 taataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 11649  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11650 aatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaa 11749  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11750 tgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 11849  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11850 gtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttatctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggtattttgatgt 11938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15035 - 15216
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  15035 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaat 15134  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgat 182  Q
    | |  |||||||||||| || | ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135 gcaagcagcctaagaggacgtctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgat 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21910 - 21326
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |     
T  21910 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaa 21811  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  21810 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagactttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaat 21711  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  21710 aatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatg 21611  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21610 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgga 21511  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  21510 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtat 21411  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21410 ttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattgatgt 21326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 37334 - 36750
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |     
T  37334 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaa 37235  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37234 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagactttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaat 37135  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  37134 aatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatg 37035  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37034 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatgga 36935  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  36934 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtat 36835  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36834 ttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattgatgt 36750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7546 - 7141
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7546 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgtacagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 7447  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7446 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 7347  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7346 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatg 7247  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7246 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgattttgaaa 7147  T
Q  401 tggatt 406  Q
    ||||||    
T  7146 tggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 589
Target Start/End: Original strand, 29033 - 29510
Alignment:
Q  112 aagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactc 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29033 aagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacttgttatattaataatactc 29132  T
Q  212 ctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29133 ctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagat 29232  T
Q  312 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtt 29332  T
Q  412 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 511  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29333 tgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctctt 29432  T
Q  512 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29433 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggtattttgatgt 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 581
Target Start/End: Original strand, 50390 - 50919
Alignment:
Q  52 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactg 151  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  50390 gacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcacaatgtacgaagcctaaaaaggcgccgactactggaagagtttttgcgttgactg 50489  T
Q  152 ggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctt 251  Q
    | |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50490 gtactcagatcgagaatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 50589  T
Q  252 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 351  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50590 tattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 50689  T
Q  352 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50690 ctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatga 50789  T
Q  452 actggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaa 551  Q
    |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50790 actggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaa 50889  T
Q  552 gcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 581  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50890 gcagctgaagcaactagaacgcgatggtat 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 42828 - 42518
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||   | |||||||  | |   ||||    
T  42828 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgg 42729  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  42728 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 42629  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  42628 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatt 42529  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    ||||| |||||    
T  42528 aattgctttag 42518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 589
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1614
Alignment:
Q  112 aagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||   | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1137 aagagggcgccgactactggtagggtttttgctctagctggtacacagacagagaatgaggatctcctaatcagaggaacttgttatattaataatactc 1236  T
Q  212 ctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1237 ctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagat 1336  T
Q  312 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1337 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtt 1436  T
Q  412 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1437 tgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctctt 1536  T
Q  512 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1537 ccatcgaagaggaaagtggtgtagagtttctatctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggtattttgatgt 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14734 - 14203
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  || || || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  14734 tgtgtccggtgtggcaagaagagtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 14635  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctgatacttagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 14535  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14534 taataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtatg 14435  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14434 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 14335  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14334 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagt 14235  T
Q  501 acatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 532  Q
      |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14234 gtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 143 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 5083 - 4637
Alignment:
Q  143 ctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 242  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5083 ctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T
Q  243 gcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 342  Q
     ||||| |||||| || | ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4983 acattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagta 4884  T
Q  343 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 442  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  4883 actacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcc 4784  T
Q  443 tgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||| || ||||| ||||| || ||    
T  4783 tgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattctt 4684  T
Q  543 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  4683 gtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatggaattttgatgt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 512
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39838
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||    
T  39494 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 39593  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    |  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |    
T  39594 gcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggt 39693  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||    
T  39694 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataa 39793  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  39794 tcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 39838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 292 - 512
Target Start/End: Original strand, 44712 - 44932
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  44712 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 44811  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||    
T  44812 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttag 44911  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttc 512  Q
    |||| | || ||||| |||||    
T  44912 caagacggtgcatttttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 474 - 973
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |  || ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  474 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagatgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaat 573  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  574 gcaagcagccaaagagggcgcctactacgggtcgagttttttctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatac 673  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaa 873  T
Q  401 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  874 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagcaagtcagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 18951 - 18400
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||   |||    
T  18951 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgctgtgtaagaagc 18852  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  18851 ctaagaaggcgcagactattggtagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 18752  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18751 acctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagag 18652  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |    
T  18651 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttgg 18552  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  18551 tttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctc 18452  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 561  Q
    ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18451 ttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11087 - 10509
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||   |||    
T  11087 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagc 10988  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| || ||  |||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  10987 ctaagaaggtgcatactactagtagagtttccgcattgactggtactcagatagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 10888  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10887 acctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagag 10788  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10787 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttag 10688  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  10687 tttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctc 10588  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 588  Q
    ||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||    
T  10587 ttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacctgatggaattttgatg 10509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 719 - 1050
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||    
T  719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 818  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||| | ||||    
T  819 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatcta 917  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||    
T  918 tgtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatat 1017  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     || |  ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1018 aaactactttagcaagacagtgcatttttcttc 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Original strand, 7773 - 8217
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  7773 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattatagctgattgcaaaagtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaat 7872  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7873 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatat 7972  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7973 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 8072  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact--tctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8073 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttga 8172  T
Q  399 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8173 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 512
Target Start/End: Original strand, 4100 - 4394
Alignment:
Q  218 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| ||||||||    
T  4100 ttgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgt 4199  T
Q  318 cgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtcta 417  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||||  ||||||||||||||| | || | |||| | ||  |||| ||| ||    
T  4200 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatatgaagtagaaatagtatgttta 4299  T
Q  418 cctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || |  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  4300 ccgttaaagggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtacacttttcttc 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 52 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1241 - 781
Alignment:
Q  52 gacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1241 gacattgtgtgctttaattgcaattaggagggtcacattggttcacagtgtaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgactg 1142  T
Q  152 ggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctt 251  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1141 gtactcagactgagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 1042  T
Q  252 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1041 tattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 942  T
Q  352 ctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
     ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  941 gtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatga 842  T
Q  452 actggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  841 actggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 604
Alignment:
Q  415 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 514  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  515 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Original strand, 24766 - 25294
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  24766 tgctttaactgcaatgaggagcgtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactacttgtagagtttttgctttgactggtacacaga 24865  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24866 cagagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgctatattgacaatacgcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 24965  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   |  |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  24966 tgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgt 25065  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25066 ttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttag 25165  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25166 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 25265  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  ||||| | ||||| || |||||||    
T  25266 gcagttggaatgtgatggcattttgatgt 25294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 424618 - 424266
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  424618 tgtgtccgatgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtgaggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacatcagttcacagt 424519  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  424518 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgacttgtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 424419  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  424418 taataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatg 424319  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424318 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 203508 - 203294
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   ||||||     
T  203508 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt- 203410  T
Q  284 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 382  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||    
T  203409 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgt 203310  T
Q  383 ttggtcgtgattttga 398  Q
    ||||| | ||||||||    
T  203309 ttggtagagattttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4156
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | ||| | |   || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||   |||    
T  4735 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtccaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagc 4636  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  4635 ctaagaaggcgcaggctactggtagagttttcacattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 4536  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4535 acctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagag 4436  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |    
T  4435 atggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttgg 4336  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  4335 tttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctc 4236  T
Q  510 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||    
T  4235 ttctgctgaagaggaaagtggcacagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacatgatggaatcttgatgt 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 318 - 1
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | ||| | |   || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||   |||    
T  318 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtccaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagc 219  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||    
T  218 ctaagaaggcgcaggctactggtagagttttcacattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtac 119  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  118 acctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagag 19  T
Q  310 atggttgtcgaaactcca 327  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18 atggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 1
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| |||||||||||     ||| ||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |     
T  447 tccggtgtggcaagaagggtcacacattagttgattgcaagcatgctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaa 348  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||||| |||||| ||| | ||| | ||||| ||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  347 gcagcctaagaaggcgcctactgcgggtcgagtttttgctctggctggtacttagaaagagaatgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaat 248  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 148  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  147 gagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatgga 48  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 451  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47 tttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 62 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9196 - 8672
Alignment:
Q  62 gctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagac 161  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  9196 gctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgtaagcagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacagac 9097  T
Q  162 agagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 261  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||      
T  9096 agagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatt---ttattgcttat 9000  T
Q  262 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 361  Q
     |||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8999 tattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtt 8900  T
Q  362 tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 461  Q
    | | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8899 taagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttgga 8800  T
Q  462 gtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 561  Q
     |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  8799 atacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcagtcgaag 8700  T
Q  562 caactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  8699 tagttggaacgtgatggcattttgatgt 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 392 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17868
Alignment:
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcagtcgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 17868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8473 - 7945
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  8473 tgctttaattgcgatgaagaaggtcacattggttcacagtggaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacaga 8374  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8373 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttt 8274  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8273 tgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 8174  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8173 ttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttag 8074  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8073 agtacaaccatgttcacattaattgttttagtaattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtcaattaagcagctgaa 7974  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  7973 gcagttagaacgtgatggtattttgatgt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 61 - 589
Target Start/End: Original strand, 110961 - 111489
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  110961 tgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgaaactcaga 111060  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  111061 ctgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctat 111160  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  111161 tgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgt 111260  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    || | ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  111261 ttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttag 111360  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  111361 agtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 111460  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  111461 gcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 111489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 177 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18012 - 17600
Alignment:
Q  177 tttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgct 276  Q
    |||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  |||       
T  18012 tttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaag 17913  T
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    |||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||    
T  17912 ttgggtcttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 17813  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  17812 ctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttca 17713  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
    |||||||||||||   ||||| ||  |||| |||||    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  17712 tattaattgttttgttaagtcggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgat 17613  T
Q  577 ggtatcttgatgt 589  Q
    || || |||||||    
T  17612 ggaattttgatgt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 64 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 14331 - 13865
Alignment:
Q  64 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacag 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  14331 tttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctctgactggtactcagactg 14232  T
Q  164 agaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 263  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14231 agaacgaggatcgcttggtcagaggtacatgttatataaatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttga 14132  T
Q  264 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 363  Q
    ||||| | ||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14131 ttgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgttta 14032  T
Q  364 aaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14031 agatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagt 13932  T
Q  464 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 530  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13931 acaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11510 - 11307
Alignment:
Q  64 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacag 163  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |   ||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  11510 tttaattgcaatgaagaggg-cacattggttcccagtgcaagaagcctaagaaggtgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacatagacag 11412  T
Q  164 agaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 263  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11411 agaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttga 11312  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  11311 ttgtg 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 478 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8855 - 8770
Alignment:
Q  478 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8855 attaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  202 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 247  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 107 - 577
Target Start/End: Original strand, 23633 - 24103
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |||     
T  23633 agcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatag 23732  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  23733 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 23832  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23833 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatt 23932  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23933 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtatattt 24032  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
     ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24033 ttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 151678 - 151289
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | | | | ||| ||||    
T  151678 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatat 151579  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | ||  |||||    
T  151578 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaa 151479  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  151478 gtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacgg 151379  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  | ||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| ||||| ||||    
T  151378 tgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagttcctatctacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatcttaatgt 151289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73844
Alignment:
Q  202 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 73844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78225
Alignment:
Q  202 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 78225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 589
Target Start/End: Original strand, 17347 - 17925
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |     
T  17347 tccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaa 17446  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17447 gaagcctaagcaggcgccgactactggtagagtgtttgctttaactggtacacagacagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaat 17546  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||  ||||||| | ||   |||||||||    || ||||||||||||    
T  17547 aatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatg 17646  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17647 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcc-ttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgga 17745  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacat 504  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||  ||    
T  17746 tttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagtaagtcagtgtat 17840  T
Q  505 ttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||    
T  17841 ttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttgatgt 17925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40203 - 39780
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||      
T  40203 aatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaa 40104  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||  |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || ||||| |    
T  40103 gtgcatataagttgggg-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaa 40005  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || ||||| |||||||||||    
T  40004 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagta 39905  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
     ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||  ||||| ||  ||| ||  ||||| |||||||| || ||| |||| |||    
T  39904 taaccgagttcatataaattgctttagtaagacggtgcatttttcttccgatgaagaagagggtgatgtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaa 39805  T
Q  565 ctggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || ||||| ||||| || |||||||    
T  39804 ctagaacgtgatggaattttgatgt 39780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 61 - 588
Target Start/End: Original strand, 23999 - 24526
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||| || || |   ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  23999 tgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagttttagcattaactggtactcaga 24098  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    | |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  24099 ctgagaacaaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctat 24198  T
Q  261 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 360  Q
     ||||||| | ||   || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  24199 tgattgtgctactaagttaggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgt 24298  T
Q  361 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttag 460  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24299 ttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttag 24398  T
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24399 agtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 24498  T
Q  561 gcaactggaacgcgatggtatcttgatg 588  Q
    |||  | ||||| ||||| || ||||||    
T  24499 gcagttagaacgtgatggaattttgatg 24526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 495
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10260
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || | || || |   |||||||| | | | ||||||||    
T  9965 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 10064  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||||||| || | || ||||||    
T  10065 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaa 10164  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  10165 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 763 - 1125
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||| |||| || |    
T  763 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaacgaagagggtcatattggttcccaat 862  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  863 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggatggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 962  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  963 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacatg 1062  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063 aatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 487
Target Start/End: Original strand, 10878 - 11360
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |     
T  10878 tccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactacaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaa 10977  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10978 gaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattgat 11077  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   |||||||||||||||    
T  11078 aatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatg 11177  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11178 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatgga 11277  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 487  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  11278 tttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 470
Target Start/End: Original strand, 2261 - 2726
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||     
T  2261 tccgatgtgggaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactacaatgaagagggtcacattggttcatagtgtaa 2360  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
      ||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2361 gtagcctaagaaggtgccggctactggtagagtttttgctctgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaat 2460  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||| | ||   |||||||||| | |||||||||||||||    
T  2461 aatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatg 2560  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgga 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  2561 gagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagataga 2660  T
Q  405 tttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 470  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  2661 tttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaacca 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 55 - 589
Target Start/End: Original strand, 55518 - 56052
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||||| || |||||||| || |   ||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  55518 attgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataagttcacaatgcaagaagcttaagaaggcgcagactactgggagagtttttgcattgactggta 55617  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  55618 ctcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttat 55717  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 354  Q
    |||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55718 tgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctt 55817  T
Q  355 gtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaact 454  Q
    || || || | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  55818 gtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaact 55917  T
Q  455 ggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagca 554  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  55918 ggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaaca 56017  T
Q  555 gctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  56018 gctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 56052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 56 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7128 - 6606
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |||| || ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  7128 ttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtac 7029  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7028 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttatt 6929  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6928 gctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttg 6829  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  6828 tgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactg 6729  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  6728 gttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcag 6629  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  6628 ctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 56 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14258 - 13736
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |||| || ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  14258 ttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctttgactggtac 14159  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14158 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttatt 14059  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14058 gctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttg 13959  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  13958 tgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactg 13859  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  13858 gttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcag 13759  T
Q  556 ctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||||| | ||||| |||||    
T  13758 ctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 64 - 589
Target Start/End: Original strand, 40564 - 41087
Alignment:
Q  64 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacag 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| || | || |||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||    
T  40564 tttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggtgtcggctactggtagagtttttgctttgactcgtacacagaaag 40663  T
Q  164 agaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 263  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40664 agaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttga 40763  T
Q  264 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 363  Q
    ||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  40764 ttgtgctactaagttgggtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttta 40863  T
Q  364 aaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagt 463  Q
    | ||||||||  |||||||||| || ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  40864 atatgtcctt--tctatgtttgatcctgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagt 40961  T
Q  464 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40962 acaaccatgttcacattaaatgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacatttgaagta 41061  T
Q  564 actggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
      | ||||| |||||||| |||||||    
T  41062 gttagaacgtgatggtattttgatgt 41087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 371
Target Start/End: Original strand, 30572 - 30938
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |     
T  30572 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgattgcaaacataatgaccttgtgtgcttcaattgcaatgaagagggttacattggttctcagtgcaa 30671  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     ||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | || |||||| ||    
T  30672 gcaatctaagaaggcgccgactactagtagagttttcgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgat 30771  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30772 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatg 30871  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30872 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 277 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 152115 - 151803
Alignment:
Q  277 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 376  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||    
T  152115 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 152016  T
Q  377 ctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttct 476  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||     
T  152015 ctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttca 151916  T
Q  477 tattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgat 576  Q
     |||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  151915 cattaattgttatagtaagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgat 151816  T
Q  577 ggtatcttgatgt 589  Q
    || || |||||||    
T  151815 ggcattttgatgt 151803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 123 - 589
Target Start/End: Original strand, 47099 - 47546
Alignment:
Q  123 gactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgct 222  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||    
T  47099 gactactggtagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttact 47198  T
Q  223 attattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47199 attattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaa 47298  T
Q  323 ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctaccttt 422  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47299 ctccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctaccttt 47397  T
Q  423 gagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagag 522  Q
    || |                  ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |  ||||||    
T  47398 gaat------------------ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaagtcaatgtatttctcttctgctgaagag 47479  T
Q  523 gaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  47480 gaaagtggcgcagagttttagtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 47546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 589
Target Start/End: Original strand, 1907 - 2087
Alignment:
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| |    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattttt 2006  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| |  ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  2007 cttctgctgaagaagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttgatgt 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 495
Target Start/End: Original strand, 164575 - 164889
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | || |||| || |   ||||    
T  164575 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgg 164674  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||  ||||||||    
T  164675 gtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctat 164774  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || ||| |  | |||||||| ||| |||| ||||  || || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  164775 gtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 164874  T
Q  481 aattgttttagcaag 495  Q
    |||||||||||||||    
T  164875 aattgttttagcaag 164889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 104431 - 103949
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || ||| || |||     
T  104431 agcctaagaaggcgcagactattgggagattttttgctttgactggtactcagactgggaacgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatag 104332  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || | ||||  |||||||||||    
T  104331 tacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatgga 104232  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  104231 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgact 104132  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||    
T  104131 tggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaagtcggtgtattt 104032  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  104031 ctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 103949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Original strand, 478 - 960
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  478 agcctaagaaggtaccggctactggtagagtttttgctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataa 577  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  578 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatgga 677  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  678 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgata 777  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  ||||    
T  778 tggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtattt 877  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||    |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  878 ctcttctactgaagaggaaagtggcgaaaagtttttatctacaaagcagctgaagcagttagaacgtgatggcattttgatgt 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 496224 - 495742
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||     
T  496224 agcctaagaaggcgcagactactcggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatag 496125  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||    |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  496124 tagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 496025  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  496024 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattgatt 495925  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  495924 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtttattt 495825  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     |||||    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  495824 ttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 495742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 441907 - 441507
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || || |   ||||||||| ||||| | ||||  | || ||||| ||||||||||| ||    
T  441907 ttgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcaggctacatggagagtttttgctttgactggtac 441808  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  441807 -catacagagaatgaggatcgattgattagaagtacatgttattttgacagtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttatt 441709  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  441708 gctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctag 441609  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||| | || ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  441608 tgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtatgaattg 441509  T
Q  456 gt 457  Q
    ||    
T  441508 gt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 462
Target Start/End: Original strand, 514527 - 514808
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  514527 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 514626  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  514627 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 514726  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagag 462  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  514727 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 508 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 441493 - 441441
Alignment:
Q  508 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  441493 tcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 491
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452697
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttag 452697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48975 - 48651
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  48975 tgtgtccaatgtggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtcaagacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacaaattagttctcagt 48876  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48875 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttcctttgactgggactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 48776  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48775 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatg 48676  T
Q  301 aatggagagatggttgtcgaaactc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48675 aatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 310 - 521
Target Start/End: Original strand, 83824 - 84035
Alignment:
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 83923  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 509  Q
    | ||  | || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||  |||  ||| | ||||  |||||||||||||| ||| |||| | ||| ||    
T  83924 tctgcttgccgttaagtgggatggatgtgaaactaggaatgaactggttgaagtttaactatgttcacattaattgttttagaaagacagtgcgtttttc 84023  T
Q  510 ttccgtcgaaga 521  Q
    ||| ||||||||    
T  84024 ttctgtcgaaga 84035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 67 - 578
Target Start/End: Original strand, 14326 - 14837
Alignment:
Q  67 aattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagaga 166  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||   ||||||||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  14326 aattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggtgcagactactgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagaga 14425  T
Q  167 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||    
T  14426 atgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattg 14525  T
Q  267 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaa 366  Q
    || | ||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |    
T  14526 tgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaaga 14625  T
Q  367 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtaca 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  14626 tgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtaca 14725  T
Q  467 accacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaact 566  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  14726 accatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaatt 14825  T
Q  567 ggaacgcgatgg 578  Q
     ||||| |||||    
T  14826 agaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 123 - 589
Target Start/End: Original strand, 13595 - 14061
Alignment:
Q  123 gactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgct 222  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| |||||||||| |||||    
T  13595 gactagtggtagagtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgct 13694  T
Q  223 attattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 322  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13695 attattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaa 13794  T
Q  323 ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctaccttt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  13795 ctccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttaccttt 13894  T
Q  423 gagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagag 522  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||    
T  13895 gagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagag 13994  T
Q  523 gaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||    
T  13995 gaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagctattagaacgtgatggaattttgatgt 14061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 339 - 1
Alignment:
Q  12 tggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcct 111  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||    
T  339 tggtaagaagggtcattcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcct 240  T
Q  112 aagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  239 aagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactc 140  T
Q  212 ctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  139 ctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagat 40  T
Q  312 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39 ggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 107 - 589
Target Start/End: Original strand, 216520 - 217002
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  || |||     
T  216520 agcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatag 216619  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||  |||    || ||||||| | ||||  |||||||||||    
T  216620 tactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 216719  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  216720 gagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattgatt 216819  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  216820 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattt 216919  T
Q  507 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||||| |  |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||    
T  216920 ttcttctgctgaagcggaaagtggcgcaaaattcttgtctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgggattttgatgt 217002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 144 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6280 - 5846
Alignment:
Q  144 tttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 243  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6280 tttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacg 6181  T
Q  244 cattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtga 343  Q
    ||||| |||| |||| |  |||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180 cattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtga 6081  T
Q  344 ctacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattct 443  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  6080 ctacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcct 5981  T
Q  444 gggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||     
T  5980 gggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttctta 5881  T
Q  544 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5880 tctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 14922
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 15169  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| | |    
T  15168 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaa 15070  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  15069 ggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 14970  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  14969 taaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 296 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12385
Alignment:
Q  296 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  396 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    ||| || ||| | |||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaag 12479  T
Q  496 tcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12478 tcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttgatgt 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 225 - 1
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| || || | ||  |||||||||||  |||| ||| | |  || ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  225 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgtaagcataaagacattgtgtgtcttaactgcgaagaggaaggtcatattagttcacagtgtacgaagc 126  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  125 ctaagaaggtgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatac 26  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatact 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25 tcctttagttgctattattgatact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8329
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactca-g 108  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |   || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   | |    
T  8712 tgtggaaagaagggtcatgctctagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaag 8613  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612 cctaagaaggcgccgactactggtagagtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataata 8513  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggaga 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||   ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8512 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggaga 8413  T
Q  309 gatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 392  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8412 aatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 136 - 560
Target Start/End: Original strand, 15108 - 15532
Alignment:
Q  136 gttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 235  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15108 gtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactg 15207  T
Q  236 gtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15208 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 15307  T
Q  336 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 435  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| | || |||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15308 ttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggat 15407  T
Q  436 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 535  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  15408 gtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcag 15507  T
Q  536 agtttttgtctactaagcagctgaa 560  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  15508 agttcttgtctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 560
Target Start/End: Original strand, 23347 - 23851
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || || |   ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  23347 ttgtgtgttttaactgcaacgaagagggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtac 23446  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
      || || ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  23447 gaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttatt 23546  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||| ||| ||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23547 gctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttg 23646  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23647 tgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactg 23746  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||||| ||  |||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23747 gttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagttcttgtcaactaagcag 23846  T
Q  556 ctgaa 560  Q
    |||||    
T  23847 ctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 560
Target Start/End: Original strand, 9400 - 9904
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||| ||||||| || |   ||||||||| ||||| ||| ||| | || || || ||||||||||| ||    
T  9400 ttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgcagaccactaggagagtgtttgctttgactggtac 9499  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9500 acagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttatt 9599  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    ||| | ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9600 gctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctag 9699  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  9700 tgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactg 9799  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 555  Q
    ||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||     
T  9800 gttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaa 9899  T
Q  556 ctgaa 560  Q
    |||||    
T  9900 ctgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2290 - 1865
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |  ||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |   |||    
T  2290 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgaggatattgtgtgttttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagc 2191  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    ||||||  |||| |||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||| |||    
T  2190 ctaagaatgcgcagactactggtagagtttttgcattgactagtactcagaatgagaacgaggatcgcttgatcagaagtacttgttattttgatagtac 2091  T
Q  210 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagag 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  2090 acctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagag 1991  T
Q  310 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |    
T  1990 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatgg 1891  T
Q  410 tttgtctacctttgagtggtatggat 435  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  1890 tttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 366 - 589
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12795
Alignment:
Q  366 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtac 465  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  466 aaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaac 565  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |  ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||      
T  12673 aaccatgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagag-ttctatctactaagcagctgaagcagt 12771  T
Q  566 tggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||    
T  12772 tagaacgtgatggaatcttgatgt 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 15577 - 15894
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||| |     
T  15577 tccggtgtggcaagaagggtcatacattagctgattgcaagcacaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgatgagggtcatatcggttctcagtgcaa 15676  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15677 gcagcctaagagggcgccaactactggtagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaat 15776  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15777 aatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 15876  T
Q  305 gagagatggttgtcgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15877 gagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 1
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcattttgtagctgattgcaagcgtacggacattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagt 149  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  148 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgattggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatat 49  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48 taataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 455
Target Start/End: Original strand, 57663 - 58062
Alignment:
Q  56 ttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggac 155  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||   ||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||| ||    
T  57663 ttgtgtgtttcaattgtaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcgcagactactaggagagtttttgctttgactggtac 57762  T
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  57763 gcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatt 57862  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    | | | ||||||| ||||   || ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  57863 gttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttg 57962  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  57963 tgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaactg 58062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 211 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 4683 - 4317
Alignment:
Q  211 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4683 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 4584  T
Q  311 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| | | |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||    
T  4583 tggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgatttggt 4484  T
Q  411 ttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 510  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  4483 ttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctct 4384  T
Q  511 tccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 577  Q
    || |  |||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  4383 tctgctgaagaggaaagttgcgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7907 - 7796
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  7907 tgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacagactactagtagagtttttgctttgattggtactcaga 7808  T
Q  161 cagagaatgagg 172  Q
    | ||||||||||    
T  7807 ctgagaatgagg 7796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 290 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3349
Alignment:
Q  290 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  3622 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcg 3523  T
Q  390 tgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 489  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  3522 tgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgtttt 3423  T
Q  490 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3422 agtaagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3790 - 3636
Alignment:
Q  63 ctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagaca 162  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||||     
T  3790 ctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactacttgtagagtttttgcattgactggtattcagact 3691  T
Q  163 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttag 217  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  3690 gagaactaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgataatacacctttag 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 55 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15167 - 14873
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||| || |||||||||| || || ||||||||||| |    
T  15167 attgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgtcggctactggtagagtctttgctttgactggta 15068  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15067 cacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 14968  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 349  Q
    |||||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14967 tgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3170 - 2861
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||||||||| |||||||||||     ||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| || || |     
T  3170 tccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacatgctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaa 3071  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaat 204  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3070 gcagcctaatagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtacttagacagagattgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaat 2971  T
Q  205 aatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2970 aatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 2871  T
Q  305 gagagatggt 314  Q
    ||||||||||    
T  2870 gagagatggt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15614 - 15258
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  || |||     
T  15614 agcctaagaaggctcagactactggaagagtttttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatag 15515  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||             | |||||  ||||||| |||    
T  15514 tactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttcta------------agttgtcaaatatgaaagga 15427  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15426 gagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttgaaattgatt 15327  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttc 475  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttc 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 5257 - 4838
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||| |||| || ||||| |||||||| || ||  || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5257 gctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgcta 5158  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||   |||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5157 cgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggt 5058  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
    |||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||     
T  5057 gactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatc 4958  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttt 541  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| |    
T  4957 cttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttcaataagtcggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggagcaaagttat 4858  T
Q  542 tgtctactaagcagctgaag 561  Q
    || |||||||||||||||||    
T  4857 tgactactaagcagctgaag 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 412 - 589
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8323
Alignment:
Q  412 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  512 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttgatgt 8323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3807 - 3521
Alignment:
Q  55 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  3807 attgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgcattgactggta 3708  T
Q  155 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttat 254  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3707 ctcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttat 3608  T
Q  255 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    |||| | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3607 tgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 337 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1174
Alignment:
Q  337 tcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatg 436  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  437 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 536  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | |||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtaga 1227  T
Q  537 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  1226 gtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttgatgt 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8117
Alignment:
Q  107 agcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 206  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||     
T  7839 agcctaagaaggcgcagactactggtagagttttcgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatag 7938  T
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    ||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  7939 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgggtcttgctatgtctaatattaatgga 8038  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8039 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 4558 - 4651
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgta 103  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |   || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||    
T  4558 tgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgta 4651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 439 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9662
Alignment:
Q  439 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  539 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 392 - 589
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15576
Alignment:
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 15576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 171428 - 171177
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || || |||| ||||||||| ||  |||| || |    
T  171428 tgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgcgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatatcggttcccaat 171329  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  171328 gcacgcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatat 171229  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcttt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  171228 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctatgcattgcttt 171177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 414 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 551
Alignment:
Q  414 tctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttcc 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  514 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 229846 - 230093
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| || |    
T  229846 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatataatagctgattgcaagcttaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaat 229945  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| ||||||||||| ||||| ||  |  |||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229946 gcaagcagccgaagagggcgcctactacgggacgaatttttgctctggctggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 230045  T
Q  201 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230046 taataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 251752 - 251464
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  251752 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 251653  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  251652 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 251553  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | || |||| | | ||| |||||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  251552 gtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 251464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 2154 - 1819
Alignment:
Q  156 tcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |  ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2154 tcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttatt 2055  T
Q  256 gctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcg 355  Q
    | |   ||||||| | ||   |||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2054 gttgctgattgtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttag 1955  T
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | || | ||||| ||  | || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  1954 tatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatggatgtgatactaggtataaactg 1855  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    ||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  1854 gttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12183 - 11759
Alignment:
Q  88 attagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagag 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||   ||| | ||| || || |||||||| || || || | ||||||||| ||  | |||||||    
T  12183 attagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 12084  T
Q  188 gtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttga 287  Q
    ||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| |     
T  12083 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 11984  T
Q  288 tttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 387  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11983 tatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 11884  T
Q  388 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 487  Q
     |  | |||||  | ||| | |||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |    
T  11883 agatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgct 11784  T
Q  488 ttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||    
T  11783 ttagtaagacggtacatttttcttc 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 69424 - 69634
Alignment:
Q  9 gtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcag 108  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||   | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |   ||    
T  69424 gtgtggtaagaagggtcatgcattagctgattgcaagcataat-atattgtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcacattggttctcagtgcaagtag 69522  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69523 cctaagaaggtgccgactactggtagggttttggctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataata 69622  T
Q  209 ctcctttagttg 220  Q
    ||||||||||||    
T  69623 ctcctttagttg 69634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 60850 - 60487
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  60850 ttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatat 60751  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  60750 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 60651  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | |    
T  60650 gtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacgg 60551  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    | ||||| ||||| |  ||||| |||||||  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  60550 tgcatttttcttctgctgaagaagaaagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 70277 - 70081
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || || | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  70277 gctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgcta 70178  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 338  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70177 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30588 - 30371
Alignment:
Q  10 tgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagc 109  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| || || | || |||||||||||| ||||| ||| | |  || ||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  30588 tgtggtaagaagggtcatacactagctgagtgtaagcataaggacattgtgtgttttaactgcgaagaggaaggtcatattggttcacagtgtacggagc 30489  T
Q  110 ctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  30488 ctaagaaggcgccgactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatac 30389  T
Q  210 tcctttagttgctattat 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30388 tcctttagttgctattat 30371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 563
Target Start/End: Original strand, 29 - 411
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 128  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||| | ||||||||    
T  129 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctat 228  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||    
T  229 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatatt 328  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  329 aattgctttagcaaaacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 463
Target Start/End: Original strand, 41250 - 41563
Alignment:
Q  149 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41250 ctggtactcagacagcgaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattg 41349  T
Q  249 ctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactact 348  Q
     |||||||||   |||||||||||    |||||||||| | ||||   ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41350 ttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactact 41449  T
Q  349 tctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggta 448  Q
    ||| |  |||| ||||| | ||| ||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || || |    
T  41450 tctttattatgcttgaagtatcc-ttgtcgatgtttggtatagattttgtagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggca 41548  T
Q  449 tgaactggttagagt 463  Q
    |||||||||| ||||    
T  41549 tgaactggttggagt 41563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5692
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | ||||  | |   ||||    
T  5935 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgg 5836  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||    
T  5835 gtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctat 5736  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttga 424  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  5735 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5550
Alignment:
Q  375 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtt 474  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggtt 5588  T
Q  475 cttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5587 catatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 578
Target Start/End: Original strand, 94053 - 94465
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  94053 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 94152  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaa 365  Q
    |||  | |   ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |     
T  94153 gtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaag 94252  T
Q  366 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtac 465  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| |||||||| ||     
T  94253 gtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatat 94352  T
Q  466 aaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaac 565  Q
    ||||  ||   |||||||||||||| |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||      
T  94353 aaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagtttctaactactaaacagttgaagcagt 94452  T
Q  566 tggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||| |||||    
T  94453 tggaacgagatgg 94465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 115692 - 115460
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |    | |    
T  115692 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactag 115593  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||    
T  115592 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatcta 115494  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 413  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  115493 tgtttggtagggattttgaagtagatttagtttg 115460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 181 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 355
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  713 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 614  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  613 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 514  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  513 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatc 414  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  413 aattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 5098
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  5308 tgtgtctggtgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtggttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaat 5209  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 200  Q
    | |  ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208 gcaagcagccgaagagggcacctactacgggtcgagtttttgctctggctggtacccagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatat 5109  T
Q  201 taataatactc 211  Q
    |||||||||||    
T  5108 taataatactc 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 512
Target Start/End: Original strand, 43554 - 43924
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43554 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 43653  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  43654 ctcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagt 43753  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  | |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| |||    
T  43754 aactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatt 43853  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||  ||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  43854 tttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagtaagacagtgcatttttcttc 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25015
Alignment:
Q  311 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagt 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||| |||| | ||||||||  |  | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  411 ttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctct 510  Q
    |||| |||| ||||  || |||||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttct 25017  T
Q  511 tc 512  Q
    ||    
T  25016 tc 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 436 - 589
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  436 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 535  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  536 agtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattgatgt 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 1
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  189 tgtgtctggtgtggtaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaat 90  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 189  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89 gcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29657 - 29249
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||  | |||||||  | |   ||||    
T  29657 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgg 29558  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||    
T  29557 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctat 29458  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||  | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  29457 gtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatt 29358  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 580  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| ||||  || || || || ||||  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||| |    
T  29357 aattgttttagtaagatggtacatttttcttatgttgaggaagagagtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaa 29258  T
Q  581 tcttgatgt 589  Q
    |||||||||    
T  29257 tcttgatgt 29249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11939 - 11608
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  11939 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 11840  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  11839 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 11740  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| |||     
T  11739 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatc 11640  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  11639 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20944 - 20586
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  20944 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 20845  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| |   | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  20844 gtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctat 20745  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| |||     
T  20744 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatc 20645  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  20644 aattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaacaagaaagtggagcagagtt 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 292 - 491
Target Start/End: Original strand, 772 - 971
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || | |    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagag 871  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | |||||| | || |||||| || | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  872 actttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Original strand, 661 - 722
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 242  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctac 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 29806 - 29440
Alignment:
Q  129 tggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt 228  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  29806 tggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattata 29707  T
Q  229 gatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 328  Q
    |||||||||||||| || || || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  29706 gatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccag 29607  T
Q  329 ctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtgg 428  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  ||| |||| |||| ||||  ||    
T  29606 ctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacggg 29507  T
Q  429 tatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| ||||    
T  29506 tatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaag 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 491
Target Start/End: Original strand, 64761 - 65086
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  64761 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 64860  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||  | |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  64861 gtgcgtataagttgaat-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaa 64959  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  64960 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 65059  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  65060 taaccgagttcatatcaattgctttag 65086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 491
Target Start/End: Original strand, 49339 - 49664
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  49339 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaat 49438  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||  | |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  49439 gtgcgtataagttgaat-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaa 49537  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  49538 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 49637  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  49638 taaccgagttcatatcaattgctttag 49664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 491
Target Start/End: Original strand, 58373 - 58698
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  58373 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaat 58472  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||  | |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  58473 gtgcgtataagttgaat-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaa 58571  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  58572 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 58671  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  58672 taaccgagttcatatcaattgctttag 58698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 491
Target Start/End: Original strand, 63654 - 64003
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  63654 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgtta 63753  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  63754 ctcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 63853  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   |||||||||||||||    
T  63854 aactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatt 63953  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  63954 tttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 64003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 561
Target Start/End: Original strand, 4263 - 4643
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  4263 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4362  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    ||||   | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||    
T  4363 gtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctat 4462  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||| ||||||| || || || |||||||||||||| || ||||  |||| |||     
T  4463 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatc 4562  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 561  Q
    || |||||||| ||| | |||||||||||||| |  || || ||||||   || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4563 aactgttttagtaagacggtacatttctcttctgctgaggaagaaagtaaagctgagttcttgactactaagcagctgaag 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 200642 - 200973
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||    
T  200642 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 200741  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||    
T  200742 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctat 200841  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||     
T  200842 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatc 200941  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| |||||    
T  200942 aattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 325850 - 325440
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  325850 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 325751  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | ||    
T  325750 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagat 325651  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||  ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  325650 gtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 325551  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactg 567  Q
    ||  |||| ||| |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  ||    
T  325550 ccgagttcatatcaattattttagaaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttg 325451  T
Q  568 gaacgcgatgg 578  Q
    || ||||||||    
T  325450 gagcgcgatgg 325440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 589
Target Start/End: Original strand, 1446 - 1854
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  ||||||  | |   ||||    
T  1446 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 1545  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||    
T  1546 gtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtcta 1644  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||    
T  1645 tgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatat 1744  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 579  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| ||||| |  || || ||| |||  |  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||     
T  1745 taattgttttagtaagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatgga 1844  T
Q  580 atcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||    
T  1845 atcttaatgt 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14219
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  14026 tgtgtcaggtgtggcaagaagggtcgtatagtagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaat 14125  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 194  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14126 gcaagcagcctaagagggcgcctactacaggtcaagtttttgctatggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 464 - 589
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28077
Alignment:
Q  464 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  564 actggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttgatgt 28077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 589
Target Start/End: Original strand, 28459 - 28867
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  ||||||  | |   ||||    
T  28459 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 28558  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||    
T  28559 gtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtcta 28657  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||  |||| |||    
T  28658 tgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatataaccgtgttcatat 28757  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 579  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||| ||||| |  || || ||| |||  |  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||     
T  28758 taattgttttagtaagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttgactactaaacagatgaagcaattggaacgtgatgga 28857  T
Q  580 atcttgatgt 589  Q
    ||||| ||||    
T  28858 atcttaatgt 28867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 512
Target Start/End: Original strand, 98776 - 99088
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || | || |||| || |   |||||||| | | | ||| ||||    
T  98776 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatat 98875  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||    
T  98876 gaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaa 98975  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  98976 gtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacgg 99075  T
Q  500 tacatttctcttc 512  Q
    | ||||| |||||    
T  99076 tgcatttttcttc 99088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 176092 - 175787
Alignment:
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||||||||    
T  176092 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatgga 175993  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||     
T  175992 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatc 175893  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| | || |  |||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||    
T  175892 ttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagaataatcgtgttcatatcaattgttttagtaagacgatacattt 175793  T
Q  507 ctcttc 512  Q
     |||||    
T  175792 ttcttc 175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 919
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  1250 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1151  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  1150 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 1051  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  1050 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 951  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| |||||    
T  950 aattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 110721 - 110358
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||    
T  110721 ttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtctgatat 110622  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  110621 gaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 110522  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     |  |  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | |    
T  110521 gtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacgg 110422  T
Q  500 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    | ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  110421 tgcatttttcttctgcagaagaagagagtggagccgagttcctatctactaaacagttgaagca 110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 512 - 589
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52507
Alignment:
Q  512 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttgatgt 52507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1795
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  1485 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 1584  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  1585 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 1684  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  1685 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 1784  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    ||||| |||||    
T  1785 aattgctttag 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2668
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||| | | | |||||  | |   |||||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  284 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 383  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  384 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaat 483  Q
    |||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  2798 tggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaat 2699  T
Q  484 tgttttagcaagtcagtacatttctcttccg 514  Q
    || ||||| ||| | || ||||| |||||||    
T  2698 tgctttagtaagacggtgcatttttcttccg 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 7874 - 7564
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  7874 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 7775  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  7774 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 7675  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  7674 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatc 7575  T
Q  481 aattgttttag 491  Q
    ||||| |||||    
T  7574 aattgctttag 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 7655 - 7841
Alignment:
Q  5 tccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||| ||| ||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |     
T  7655 tccgatgtggtaagaagggtcatgcactagatgagtgcaaacttaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcggtgcaa 7754  T
Q  105 tcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtac 191  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  7755 gcagcctaagaaggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatagcctgatcaaaggtac 7841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 50274 - 49904
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||  | || ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50274 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 50175  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||| || | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  50174 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagt 50075  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||| |||    
T  50074 aactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatt 49975  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     | || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  49974 tttgggatgaaatggttagagtataaccaagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 49904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 563
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21743
Alignment:
Q  235 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||   ||||| |||| | ||||   |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatgga 21612  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttaga-gt-acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 532  Q
    | | || || ||||||| ||| || || || | ||||| |||  |||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||  |    
T  21613 tctaatacttggtatgagctgcttggatgtaataaccatgtttatattaactgttttagtaagacggtacatttttcttctgctgaagaagagagtgaag 21712  T
Q  533 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 563  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21713 ctgagttcttgactactaagcagcttaagca 21743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 16744 - 16840
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 238  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||||||||| || |   |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744 gctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1345
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||  || |||| | | |||||||    |   ||||    
T  1057 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgg 1156  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||    
T  1157 gtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtcta 1255  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||| | || |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1256 tgtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 409 - 589
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6669
Alignment:
Q  409 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 508  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  509 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||| |  |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 303
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  591 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 492  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  491 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 392  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  391 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 7181 - 6854
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  7181 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 7082  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  7081 gcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 6982  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  6981 gtccgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 6882  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  6881 ccgagttcatatcaattgttttagcaag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 5753 - 5350
Alignment:
Q  160 acagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctt 259  Q
    |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |     
T  5753 acagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttg 5654  T
Q  260 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatg 359  Q
    | | || ||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||  | ||    
T  5653 ttgtttatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttg 5554  T
Q  360 tttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtta 459  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | || |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||    
T  5553 tttgacttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggtta 5454  T
Q  460 gagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctga 559  Q
    ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || || |  || ||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  5453 gagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtacatttttcttctgttgaagaagagagcgaagctgagttcttgcctactaaacagttga 5354  T
Q  560 agca 563  Q
    ||||    
T  5353 agca 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41865 - 41534
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||    
T  41865 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 41766  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | || ||    
T  41765 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 41666  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| |||     
T  41665 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatc 41566  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41565 aactgctttagtaagacggtacatttctcttc 41534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5357 - 5023
Alignment:
Q  135 ggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatact 234  Q
    |||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  5357 ggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatact 5258  T
Q  235 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 334  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5257 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgagg 5158  T
Q  335 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 434  Q
     ||| || |||| |||||| || ||| | |  ||||| ||||| ||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||    
T  5157 tttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatgga 5058  T
Q  435 tgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  5057 tgtaatttttgggatgaactggttagagtataacc 5023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12838 - 12601
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  12838 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 12739  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  12738 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 12639  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 437  Q
    ||  || | |||||| | || ||||  |||||||||||    
T  12638 atcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgt 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 469
Target Start/End: Original strand, 1015 - 1316
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  1015 tgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 1114  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  1115 gcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 1214  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||   | |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  1215 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataa 1314  T
Q  468 cc 469  Q
    ||    
T  1315 cc 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 263353 - 263025
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  263353 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 263255  T
Q  284 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 382  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||    
T  263254 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgt 263155  T
Q  383 ttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaa 482  Q
    ||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||    
T  263154 ttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaa 263055  T
Q  483 ttgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  263054 ttgctttagtaagacggtacatttttcttc 263025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 589
Target Start/End: Original strand, 5008 - 5431
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  5008 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaa 5107  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||| |    
T  5108 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaa 5206  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  5207 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 5306  T
Q  465 caaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 564  Q
     ||||  |||| ||| | ||| ||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| |||    
T  5307 taaccgagttcatatcagttgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagtggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaa 5406  T
Q  565 ctggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    || ||||| ||||| || |||||||    
T  5407 cttgaacgtgatggaattttgatgt 5431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 464
Target Start/End: Original strand, 17643 - 17941
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||||  |||| || |||||||| ||      
T  17643 aatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaa 17742  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  17743 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaa 17841  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
       |||  ||| ||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || || || |||||||||||    
T  17842 ggagtcagttgactatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaattggttagagta 17941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 539
Target Start/End: Original strand, 9388 - 9758
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  9388 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 9487  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
      || |   |||||||| | | | |||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  9488 acttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 9587  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  || || | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| |  | |||||||||||||| || ||    
T  9588 gtccgttgtctatgtttggtagagacattaaagtcgacttagtttgtttaccgttga-cgggatggatgttattttttggatgaactggttagaatataa 9686  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  9687 ccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagaaagtggagcagagtt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 495
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2441
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||  || |   ||||    
T  2126 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgg 2225  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    |||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | | |||| | ||||||||    
T  2226 gtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctat 2325  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtga-ttctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    ||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||  ||||  | ||||||||| | || || | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  2326 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatat 2425  T
Q  480 taattgttttagcaag 495  Q
     ||||| |||||||||    
T  2426 caattgctttagcaag 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 70517 - 70214
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  70517 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaat 70418  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 364  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  70417 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 70319  T
Q  365 aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
      ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  70318 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagta 70219  T
Q  465 caacc 469  Q
     ||||    
T  70218 taacc 70214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 160 - 1
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  160 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaagcgaaatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaat 61  T
Q  101 gtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||||    
T  60 gcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctttggctggtactcaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 139604 - 139641
Alignment:
Q  1 tgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctga 38  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  139604 tgtgtccggtgtggcaagaagggtcatattgtagctga 139641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1890 - 1568
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || || || | ||||||||| ||  | |||| ||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1890 gctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 1791  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  1790 ctcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagt 1691  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgatt 441  Q
     ||||||||| |  | |||||||  | |||  |||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || || |  ||||||||||| |||    
T  1690 aactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatt 1591  T
Q  442 ctgggtatgaactggttagagta 464  Q
     | || |||||||||||||||||    
T  1590 tttgggatgaactggttagagta 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 506
Target Start/End: Original strand, 8623 - 8961
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| || || || |||||| |||| |||    
T  8623 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 8722  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   || ||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  8723 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 8822  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||||| || ||| | || || |||| ||||||||| ||    
T  8823 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataa 8922  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  8923 ccgggttcatatcaattgttttagcaagacagtgcattt 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 506
Target Start/End: Original strand, 18837 - 19175
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| || || || |||||| |||| |||    
T  18837 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 18936  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   || ||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  18937 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggt 19036  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || ||||| || ||| | || || |||| ||||||||| ||    
T  19037 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatggacgttatttttgggataaactagttagagtataa 19136  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 506  Q
    ||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  19137 ccgggttcatatcaattgttttagcaagacagtgcattt 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 578
Target Start/End: Original strand, 53708 - 53994
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 53807  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    | |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  53808 actttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 53907  T
Q  492 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
     ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  53908 taagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 53994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Original strand, 53597 - 53664
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 248  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  53597 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattg 53664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 54190 - 53780
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||| | || |||    
T  54190 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgt 54091  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   ||| |||| | | | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  |    
T  54090 gcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggt 53991  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||    
T  53990 gtccgttgtctatgtttggtagagacttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataa 53891  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactg 567  Q
    ||  |||| |||  |||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  ||    
T  53890 ccgagttcatatctattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagatagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttg 53791  T
Q  568 gaacgcgatgg 578  Q
    || ||||||||    
T  53790 gagcgcgatgg 53780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 363
Target Start/End: Original strand, 4439 - 4660
Alignment:
Q  142 gctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 241  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  4439 gctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgcta 4538  T
Q  242 cgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 341  Q
    | ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||  | | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4539 ctcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 4638  T
Q  342 gactacttctctcgtatgtttg 363  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  4639 aactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 512
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4755
Alignment:
Q  427 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 469
Target Start/End: Original strand, 5319 - 5607
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  5319 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5418  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| |||| |||    
T  5419 gtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttat 5518  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||| | || |||    |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  5519 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataacc 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8757 - 8413
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  8757 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 8658  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    |  | |   |||||| | | | | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  8657 gcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 8558  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||   |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||    
T  8557 gtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataa 8458  T
Q  468 ccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||  |||| ||| ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  8457 ccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 8413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 356 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 819
Alignment:
Q  356 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 455  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  975 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 876  T
Q  456 gttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||| || |||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||    
T  875 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgttacagtaagtcggtgtatttctcttc 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10291
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  9960 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 10059  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||    
T  10060 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatcta 10158  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||    
T  10159 tgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatat 10258  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  10259 caattgctttagtaagacggtacatttttcttc 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 37050 - 36786
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  |     |||||||| | | | ||||||||    
T  37050 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatat 36951  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  36950 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 36851  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||| ||||||||    
T  36850 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagta 36786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 65472 - 65803
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||  | |   ||||    
T  65472 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgg 65571  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||| | || |    
T  65572 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatcca 65670  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||||| | ||||||||| | || ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || |  |||| |||    
T  65671 tgtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataatcgagttcatat 65770  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  65771 caattgctttagtaagacggtacatttttcttc 65803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11939 - 11630
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| |||| ||| | |||    
T  11939 ttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtct-gatt-gtcaggtat 11842  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11841 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaa 11742  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 499  Q
     | ||| | || ||| | |  |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  11741 gttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacag 11642  T
Q  500 tacatttctctt 511  Q
    | ||||| ||||    
T  11641 tgcatttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 30064 - 29781
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||    
T  30064 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29965  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  29964 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 29865  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||    
T  29864 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 397
Target Start/End: Original strand, 67282 - 67498
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||  | |   ||||    
T  67282 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgg 67381  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||   |||||| | ||||    
T  67382 gt-ttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatcta 67480  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttg 397  Q
    |||||||| | |||||||    
T  67481 tgtttggtagagattttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 424
Target Start/End: Original strand, 1008 - 1232
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 299  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  1008 ttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatat 1107  T
Q  300 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 399  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  1108 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 1207  T
Q  400 atggatttagtttgtctacctttga 424  Q
     | || ||||||||| |||| ||||    
T  1208 gtcgacttagtttgtttaccgttga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 464
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3627
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  3455 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggg 3554  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 464  Q
    |||||||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||||||||||  | || ||||| |||||||||||    
T  3555 attttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26131 - 25928
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  26131 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 26032  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 491  Q
    |||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| ||||||||||     
T  26031 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtttgtataaattgttttaa 25932  T
Q  492 caag 495  Q
    ||||    
T  25931 caag 25928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 512
Target Start/End: Original strand, 49088 - 49382
Alignment:
Q  218 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 317  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49088 ttgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 49187  T
Q  318 cgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtcta 417  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| | | |     
T  49188 tgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatatttg 49287  T
Q  418 cctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  49288 ccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 469
Target Start/End: Original strand, 5370 - 5671
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  5370 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 5469  T
Q  268 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 367  Q
    | || |   |||||||| | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  |    
T  5470 gcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 5569  T
Q  368 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 467  Q
    |||  ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||    
T  5570 gtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatggatattatttttgggatgaactggttagagtataa 5669  T
Q  468 cc 469  Q
    ||    
T  5670 cc 5671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 495
Target Start/End: Original strand, 20728 - 21014
Alignment:
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||     
T  20728 tactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggg 20827  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||      
T  20828 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacc 20927  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    |||||||| |||| ||  ||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  20928 tagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 21014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 495
Target Start/End: Original strand, 12548 - 12834
Alignment:
Q  207 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 306  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||| ||| | | | ||  ||||||| |||    
T  12548 tactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaagga 12647  T
Q  307 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 406  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||      
T  12648 gaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacc 12747  T
Q  407 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 495  Q
    |||||||| |||| ||  ||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  12748 tagtttgtttaccgtt--gtctcttggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22252 - 21921
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||    
T  22252 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgg 22153  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  22152 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 22053  T
Q  381 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 480  Q
    ||||||| | ||||||||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||     
T  22052 gtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatc 21953  T
Q  481 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  21952 aattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11230 - 11072
Alignment:
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataata 208  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||| ||    
T  11230 cctaagaaggctcagaatactggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagta 11131  T
Q  209 ctcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 267  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  11130 ctcatttaattgttattattgatactggtactactcattgttttattgctattgattgt 11072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 416 - 291
Alignment:
Q  9 gtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcag 108  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    
T  416 gtgtggtaagaagggtcatgcattagctgattgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcatattagttctcagtgcaagcag 317  T
Q  109 cctaagagggcgccgactactggtag 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  316 cctaagaaggcgccgactactggtag 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 512
Target Start/End: Original strand, 8 - 339
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||     
T  8 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttga 107  T
Q  281 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcta 379  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| || ||||||   |||||| | ||||    
T  108 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatcta 206  T
Q  380 tgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttat 479  Q
    |||||| | | || ||||   |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||| |||    
T  207 tgtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatat 306  T
Q  480 taattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
     || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  307 caactgctttagtaagacggtacatttttcttc 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6603
Alignment:
Q  166 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |    ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  6416 aatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 6515  T
Q  266 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 353  Q
    ||| || |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6516 gtgcttataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 141 - 1
Alignment:
Q  61 tgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcaga 160  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| | |||||||||||||||  || || ||||||||| | || ||||    
T  141 tgcttcaattgtaatgaagatggtcacattggttcccagtgcaagaagcctaagaagacgccgactactggtatagtatttgctttgactagtacacaga 42  T
Q  161 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatatt 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 461 - 589
Target Start/End: Original strand, 231 - 361
Alignment:
Q  461 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttt--tgtctactaagcagctg 558  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  559 aagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttgatgt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21870 - 21693
Alignment:
Q  292 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 391  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||| ||| | |    
T  21870 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtaggg 21771  T
Q  392 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 469  Q
    |||||||  | || ||||||||| ||||  |||  || |||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||    
T  21770 attttgaggtagacttagtttgtttaccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtataacc 21693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 589
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7241
Alignment:
Q  454 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 553  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7106 tggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctactaagc 7205  T
Q  554 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  7206 agctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 7241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1279 - 1156
Alignment:
Q  64 tttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacag 163  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |   ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1279 tttaactgcaatgaagagggtcacattggttcattgtgcatgaagcctaagaaggcgccgactaatggtagagtttttgctttgactggtacacagacag 1180  T
Q  164 agaatgaggatcgtttgatcagag 187  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||    
T  1179 agaacgaggatcgcttgattagag 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 387
Target Start/End: Original strand, 30500 - 30706
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 280  Q
    |||||||||||||| |   |||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| | | || ||||  | |   ||||    
T  30500 atcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgg 30599  T
Q  281 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 380  Q
    || | | | | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  30600 gtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 30699  T
Q  381 gtttggt 387  Q
    |||||||    
T  30700 gtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 34464 - 34070
Alignment:
Q  184 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 283  Q
    ||||||||||| |   |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || | ||| | |   |||||||    
T  34464 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtc 34365  T
Q  284 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 383  Q
      | | | ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||    
T  34364 cggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtt 34265  T
Q  384 tggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaat 483  Q
    ||||   || |||||| | ||  |||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||    
T  34264 tggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatcgagttcatatcaat 34165  T
Q  484 tgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    |  ||||||||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  34164 tactttagcaagacggtgcatttttcttctactgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagcagttggaacgtgatgg 34070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 472 - 589
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1315
Alignment:
Q  472 gttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaac 571  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  1198 gttcatattatttgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctaaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttagaac 1297  T
Q  572 gcgatggtatcttgatgt 589  Q
    | |||||||| |||||||    
T  1298 gtgatggtattttgatgt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11237 - 10819
Alignment:
Q  51 ggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgact 150  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||   |||    || | ||| || || ||||||    
T  11237 ggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgact 11138  T
Q  151 gggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgct 250  Q
    || || |||||    |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  11137 ggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtt 11038  T
Q  251 ttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 349  Q
    | |||  ||| ||  |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11037 tcatttttttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactactt 10939  T
Q  350 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 449  Q
    |||| || ||||||   |||||| | |||||||||||| | || ||||   | |||||||||||  | || |||   ||||||||||| ||| | || ||    
T  10938 ctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaat 10839  T
Q  450 gaactggttagagtacaacc 469  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  10838 gaattggttagagtataacc 10819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1227 - 991
Alignment:
Q  295 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 394  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||        |||||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | || |    
T  1227 gatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagact 1136  T
Q  395 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 494  Q
    ||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||    
T  1135 ttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagcaa 1036  T
Q  495 gtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 539  Q
    | | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  1035 gacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21102 - 20963
Alignment:
Q  450 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 549  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21102 gaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctact 21003  T
Q  550 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  || ||||| |||||||    
T  21002 aagcagctgaaacagttggaacatgacggtattttgatgt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 589
Target Start/End: Original strand, 114476 - 114620
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  ||  ||||||||     
T  114476 ggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagtttttga 114575  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 589  Q
    |||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||    
T  114576 ctactaagcagctgaagcagttagagcgtgatggaatcttgatgt 114620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 560
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  446 gtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 545  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  546 tactaagcagctgaa 560  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 505
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8544
Alignment:
Q  420 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 505  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacatt 8544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 260
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2101
Alignment:
Q  181 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 260  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  2022 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgcttt 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Original strand, 1968 - 2031
Alignment:
Q  111 taagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggat 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1968 taagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagactgagaatgaggat 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Original strand, 4832 - 4895
Alignment:
Q  111 taagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactgggactcagacagagaatgaggat 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4832 taagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagactgagaatgaggat 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 258
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9272
Alignment:
Q  168 tgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 258  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  9182 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 9272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 560
Target Start/End: Original strand, 175788 - 175898
Alignment:
Q  450 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 549  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  175788 gaactggttgaagtataaccatgttcattataattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgttgaagaagagagtggagcagggttcttgactact 175887  T
Q  550 aagcagctgaa 560  Q
    |||||||||||    
T  175888 aagcagctgaa 175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 19162 - 19220
Alignment:
Q  200 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 258  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19162 ttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 19220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  202 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 247  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 578
Target Start/End: Original strand, 923 - 1056
Alignment:
Q  445 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 544  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||| ||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |    
T  923 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttttgcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcctat 1022  T
Q  545 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 578  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  1023 ctactaaacagttgaagcagctggagcgtgatgg 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 51696 - 51611
Alignment:
Q  427 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 512  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  51696 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttc 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University