View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6919_low_4 (Length: 274)

Name: NF6919_low_4
Description: NF6919
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6919_low_4
NF6919_low_4
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (14-266)||(23492571-23492823)
chr3 (14-239)||(30153140-30153367)
chr3 (14-257)||(53771239-53771484)
chr3 (14-214)||(38168112-38168312)
chr3 (14-183)||(54685189-54685358)
chr3 (14-214)||(33342079-33342279)
chr3 (14-257)||(16261651-16261896)
chr3 (14-171)||(7854180-7854337)
chr3 (14-171)||(17955884-17956041)
chr3 (15-171)||(45581830-45581987)
chr3 (14-171)||(55513068-55513225)
chr3 (15-183)||(28558370-28558538)
chr3 (14-171)||(3992748-3992905)
chr3 (14-171)||(54038024-54038181)
chr3 (14-171)||(2844389-2844546)
chr3 (139-266)||(14842392-14842519)
chr3 (139-266)||(18911300-18911427)
chr3 (139-262)||(18896870-18896993)
chr3 (139-266)||(5228619-5228746)
chr3 (139-266)||(15468162-15468289)
chr3 (139-265)||(16821443-16821568)
chr3 (139-265)||(25059046-25059172)
chr3 (14-126)||(18970119-18970231)
chr3 (139-266)||(54651764-54651891)
chr3 (139-266)||(22275516-22275641)
chr3 (139-257)||(8268563-8268682)
chr3 (139-257)||(8275663-8275782)
chr3 (15-94)||(48421776-48421855)
chr3 (15-171)||(15550797-15550953)
chr3 (139-239)||(17912328-17912430)
chr3 (139-237)||(2449087-2449184)
chr3 (139-236)||(11986014-11986112)
chr3 (139-243)||(15615137-15615241)
chr3 (139-239)||(2050115-2050217)
chr3 (139-237)||(13954738-13954836)
chr3 (139-237)||(45861122-45861220)
chr3 (139-266)||(12264615-12264741)
chr3 (139-183)||(19260737-19260781)
chr3 (139-266)||(1467563-1467688)
chr3 (139-214)||(41270380-41270455)
chr3 (139-225)||(12030019-12030105)
chr3 (139-225)||(13839200-13839286)
chr3 (137-191)||(51961011-51961065)
chr3 (139-191)||(14285289-14285341)
chr3 (139-266)||(12812148-12812273)
chr3 (139-266)||(49232743-49232868)
chr3 (139-214)||(55316524-55316599)
chr3 (15-124)||(11402789-11402898)
chr3 (139-172)||(16933868-16933901)
chr3 (18-116)||(17393636-17393735)
chr3 (139-191)||(19947026-19947078)
chr3 (139-171)||(15857163-15857195)
chr3 (139-171)||(19232089-19232121)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (20-266)||(16105847-16106092)
chr5 (14-266)||(11342883-11343133)
chr5 (14-226)||(2032008-2032220)
chr5 (14-239)||(21205124-21205350)
chr5 (14-225)||(21650893-21651104)
chr5 (139-266)||(23514868-23514995)
chr5 (139-266)||(35790920-35791047)
chr5 (139-266)||(11211886-11212014)
chr5 (139-266)||(17471412-17471537)
chr5 (139-257)||(1219351-1219469)
chr5 (140-257)||(23328865-23328982)
chr5 (140-257)||(24616469-24616586)
chr5 (140-257)||(24712845-24712962)
chr5 (140-257)||(24745863-24745980)
chr5 (139-214)||(7425631-7425706)
chr5 (15-93)||(22662653-22662731)
chr5 (19-191)||(25005019-25005189)
chr5 (139-214)||(27010146-27010221)
chr5 (139-237)||(20623286-20623384)
chr5 (139-237)||(21233376-21233474)
chr5 (139-237)||(37053061-37053159)
chr5 (139-266)||(23981308-23981437)
chr5 (139-237)||(16536514-16536612)
chr5 (139-237)||(25900254-25900352)
chr5 (139-266)||(21932205-21932330)
chr5 (139-266)||(21938375-21938500)
chr5 (143-239)||(32951016-32951113)
chr5 (139-183)||(23507270-23507314)
chr5 (139-226)||(27182416-27182503)
chr5 (139-266)||(35582343-35582468)
chr5 (139-266)||(36989594-36989719)
chr5 (139-183)||(108716-108760)
chr5 (139-266)||(10777794-10777919)
chr5 (139-266)||(22882908-22883033)
chr5 (139-185)||(22053739-22053785)
chr5 (141-226)||(18530933-18531018)
chr5 (139-191)||(7529228-7529280)
chr5 (139-172)||(9730277-9730310)
chr5 (139-208)||(19500205-19500274)
chr5 (139-208)||(43443274-43443343)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (14-247)||(15861250-15861483)
chr1 (14-171)||(21860209-21860366)
chr1 (14-171)||(44034871-44035028)
chr1 (139-266)||(22228115-22228242)
chr1 (14-94)||(22367216-22367296)
chr1 (139-266)||(22232812-22232939)
chr1 (140-257)||(22035755-22035872)
chr1 (140-257)||(7640765-7640882)
chr1 (78-171)||(41218667-41218760)
chr1 (139-257)||(46523695-46523813)
chr1 (139-266)||(18059582-18059707)
chr1 (133-237)||(45051720-45051824)
chr1 (139-237)||(51452809-51452906)
chr1 (154-214)||(18598849-18598908)
chr1 (139-239)||(20931650-20931752)
chr1 (139-225)||(37844320-37844406)
chr1 (139-236)||(20913335-20913434)
chr1 (139-266)||(17004945-17005070)
chr1 (139-226)||(20893496-20893583)
chr1 (139-266)||(38054915-38055040)
chr1 (139-225)||(20445987-20446073)
chr1 (139-266)||(17148874-17149000)
chr1 (139-214)||(5072260-5072335)
chr1 (139-171)||(41394527-41394559)
chr1 (139-266)||(19962323-19962448)
chr1 (139-237)||(2116558-2116656)
chr1 (139-225)||(20531751-20531837)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (14-214)||(14951960-14952160)
chr4 (14-257)||(15272124-15272369)
chr4 (14-171)||(25119107-25119264)
chr4 (14-171)||(5682428-5682584)
chr4 (69-254)||(15135823-15136010)
chr4 (139-266)||(7131887-7132014)
chr4 (139-266)||(14996445-14996572)
chr4 (139-266)||(17145479-17145606)
chr4 (139-266)||(18169277-18169402)
chr4 (139-262)||(20001030-20001153)
chr4 (139-257)||(47357958-47358075)
chr4 (140-237)||(26339327-26339424)
chr4 (139-214)||(15287119-15287194)
chr4 (139-214)||(15294228-15294303)
chr4 (140-214)||(22351938-22352012)
chr4 (139-237)||(26680517-26680615)
chr4 (14-123)||(19559557-19559666)
chr4 (14-123)||(49071885-49071994)
chr4 (139-237)||(16608947-16609045)
chr4 (139-226)||(13246737-13246824)
chr4 (139-237)||(16327774-16327872)
chr4 (20-94)||(34177617-34177691)
chr4 (140-221)||(55376444-55376525)
chr4 (139-239)||(122194-122296)
chr4 (146-237)||(13048069-13048160)
chr4 (139-237)||(10488879-10488977)
chr4 (139-226)||(15674954-15675041)
chr4 (139-185)||(10104156-10104202)
chr4 (139-185)||(33241011-33241057)
chr4 (139-191)||(14500092-14500144)
chr4 (139-191)||(32460583-32460635)
chr4 (142-185)||(31132628-31132671)
chr4 (141-183)||(18248527-18248569)
chr4 (139-172)||(8045272-8045305)
chr4 (139-172)||(16523146-16523179)
chr4 (19-79)||(14500208-14500268)
chr4 (140-176)||(22738577-22738613)
chr4 (139-191)||(40885439-40885491)
chr4 (139-171)||(54118168-54118200)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (20-266)||(25213252-25213499)
chr2 (14-183)||(9652784-9652953)
chr2 (14-262)||(21273857-21274106)
chr2 (14-171)||(22274920-22275077)
chr2 (14-171)||(22284153-22284310)
chr2 (139-266)||(16935900-16936027)
chr2 (139-266)||(17006560-17006687)
chr2 (20-171)||(15633418-15633569)
chr2 (139-266)||(42177791-42177918)
chr2 (139-262)||(12641468-12641591)
chr2 (139-262)||(12635694-12635817)
chr2 (139-262)||(12728699-12728822)
chr2 (139-262)||(34824782-34824905)
chr2 (140-257)||(23774444-23774561)
chr2 (139-262)||(3798429-3798552)
chr2 (139-262)||(8944153-8944276)
chr2 (15-172)||(7321716-7321873)
chr2 (139-237)||(14906288-14906386)
chr2 (139-237)||(23820388-23820486)
chr2 (139-237)||(22863235-22863336)
chr2 (139-249)||(25265224-25265335)
chr2 (139-237)||(19689249-19689347)
chr2 (139-216)||(463043-463120)
chr2 (139-251)||(17396487-17396599)
chr2 (139-237)||(20015328-20015426)
chr2 (139-266)||(11231162-11231287)
chr2 (139-266)||(22513009-22513134)
chr2 (139-266)||(28775631-28775756)
chr2 (139-225)||(8891549-8891635)
chr2 (139-179)||(36982356-36982396)
chr2 (139-226)||(24341254-24341341)
chr2 (139-266)||(24685605-24685730)
chr2 (15-93)||(20279610-20279688)
chr2 (140-221)||(32466177-32466257)
chr2 (139-191)||(33128372-33128424)
chr2 (139-172)||(7507756-7507789)
chr2 (139-172)||(28031133-28031166)
chr2 (139-191)||(17204659-17204711)
chr2 (139-171)||(19794629-19794661)
chr2 (139-171)||(20627238-20627270)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (14-267)||(4991271-4991524)
chr6 (14-172)||(26089933-26090092)
chr6 (14-257)||(23995121-23995366)
chr6 (14-171)||(19983192-19983349)
chr6 (14-171)||(35015057-35015214)
chr6 (15-191)||(15742100-15742275)
chr6 (14-172)||(18002394-18002553)
chr6 (14-171)||(18583515-18583672)
chr6 (139-266)||(1657566-1657693)
chr6 (139-266)||(15862789-15862916)
chr6 (139-263)||(1556312-1556436)
chr6 (139-266)||(19610325-19610452)
chr6 (139-262)||(23978076-23978199)
chr6 (15-123)||(22585494-22585602)
chr6 (15-123)||(22590325-22590433)
chr6 (15-169)||(15889607-15889762)
chr6 (15-172)||(25640455-25640611)
chr6 (139-214)||(16232199-16232274)
chr6 (14-123)||(15004855-15004963)
chr6 (199-266)||(16240401-16240468)
chr6 (140-214)||(29869650-29869724)
chr6 (154-214)||(18086697-18086757)
chr6 (139-226)||(27751742-27751829)
chr6 (139-237)||(1649955-1650053)
chr6 (139-266)||(16376197-16376322)
chr6 (139-266)||(16383521-16383646)
chr6 (139-239)||(29666181-29666282)
chr6 (139-266)||(10489006-10489131)
chr6 (139-266)||(22225562-22225687)
chr6 (139-266)||(22251390-22251515)
chr6 (139-226)||(23148303-23148390)
chr6 (139-226)||(23153754-23153841)
chr6 (139-191)||(32276639-32276691)
chr6 (139-200)||(35009323-35009384)
chr6 (139-191)||(18823263-18823315)
chr6 (139-191)||(18839118-18839170)
chr6 (139-250)||(16555979-16556088)
chr6 (139-250)||(16632535-16632644)
chr6 (139-266)||(19299544-19299669)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (20-266)||(130760-131005)
scaffold0028 (139-266)||(89282-89410)
scaffold0028 (139-226)||(107653-107740)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (14-214)||(9839-10040)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (14-257)||(13198-13443)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (14-239)||(24385582-24385809)
chr8 (14-226)||(41506654-41506866)
chr8 (14-171)||(24716762-24716919)
chr8 (14-171)||(39115473-39115630)
chr8 (15-171)||(274642-274798)
chr8 (15-171)||(641051-641207)
chr8 (15-171)||(826857-827013)
chr8 (139-266)||(13662087-13662214)
chr8 (139-266)||(13720750-13720877)
chr8 (139-263)||(17345887-17346011)
chr8 (139-266)||(22006080-22006207)
chr8 (139-266)||(16195538-16195665)
chr8 (15-172)||(21259390-21259547)
chr8 (15-123)||(17502360-17502468)
chr8 (139-262)||(16872877-16873000)
chr8 (15-123)||(4234054-4234162)
chr8 (15-123)||(23218076-23218184)
chr8 (14-80)||(22321437-22321503)
chr8 (139-237)||(22907062-22907160)
chr8 (139-237)||(5238404-5238502)
chr8 (139-237)||(24661096-24661194)
chr8 (139-237)||(43685863-43685961)
chr8 (139-239)||(43373322-43373424)
chr8 (140-226)||(7000465-7000551)
chr8 (139-208)||(16674271-16674339)
chr8 (139-237)||(24928648-24928748)
chr8 (139-266)||(271184-271309)
chr8 (139-266)||(644611-644736)
chr8 (139-266)||(830346-830471)
chr8 (139-266)||(15318983-15319108)
chr8 (139-266)||(15499352-15499477)
chr8 (139-239)||(16193573-16193674)
chr8 (139-266)||(22088618-22088743)
chr8 (139-191)||(21494336-21494388)
chr8 (139-191)||(22886654-22886706)
chr8 (15-93)||(18118259-18118337)
chr8 (139-172)||(2545265-2545298)
chr8 (139-172)||(3431175-3431208)
chr8 (139-208)||(6774137-6774206)
chr8 (139-208)||(30121029-30121098)
chr8 (139-171)||(16404900-16404932)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (32-239)||(15516691-15516901)
chr7 (14-257)||(42056101-42056346)
chr7 (14-183)||(2029119-2029288)
chr7 (14-208)||(3049780-3049974)
chr7 (14-257)||(2189998-2190243)
chr7 (14-171)||(126613-126770)
chr7 (14-171)||(1936917-1937074)
chr7 (14-171)||(32493946-32494103)
chr7 (14-171)||(111169-111326)
chr7 (139-263)||(15759939-15760063)
chr7 (139-266)||(15950614-15950740)
chr7 (154-266)||(14250721-14250832)
chr7 (139-262)||(13758677-13758800)
chr7 (139-214)||(15927875-15927950)
chr7 (139-214)||(18979895-18979970)
chr7 (15-123)||(13352151-13352259)
chr7 (139-251)||(14113823-14113935)
chr7 (139-214)||(13572981-13573056)
chr7 (139-237)||(7293333-7293431)
chr7 (139-236)||(16212071-16212170)
chr7 (15-123)||(39291457-39291565)
chr7 (140-251)||(25292173-25292283)
chr7 (139-237)||(11516544-11516641)
chr7 (139-237)||(15441412-15441510)
chr7 (139-237)||(30261977-30262075)
chr7 (139-239)||(13321334-13321435)
chr7 (139-251)||(14423474-14423585)
chr7 (139-266)||(2437763-2437888)
chr7 (139-239)||(36052971-36053073)
chr7 (139-266)||(7823035-7823160)
chr7 (139-266)||(7830346-7830471)
chr7 (139-237)||(11580592-11580693)
chr7 (139-237)||(13036869-13036970)
chr7 (139-266)||(27176740-27176865)
chr7 (137-239)||(25124448-25124552)
chr7 (139-266)||(27101461-27101586)
chr7 (139-266)||(27108809-27108934)
chr7 (139-266)||(38783553-38783678)
chr7 (139-191)||(47480924-47480976)
chr7 (18-92)||(15977820-15977894)
chr7 (18-116)||(18151259-18151357)
chr7 (139-172)||(371417-371450)
chr7 (140-176)||(10000282-10000318)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (14-216)||(55779-55981)
scaffold0032 (68-266)||(107980-108179)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (13-239)||(6373-6601)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (14-214)||(835-1035)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (14-171)||(80062-80219)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (16-214)||(17261-17459)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (14-213)||(4304-4504)
scaffold0303 (14-94)||(5-85)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (15-239)||(12348-12574)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (14-171)||(5983-6140)
scaffold0686 (25-171)||(5777-5923)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (16-171)||(162078-162233)
scaffold0016 (16-171)||(166164-166319)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (14-171)||(31180-31337)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (14-171)||(41507-41664)
scaffold0078 (139-237)||(36914-37012)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-239)||(193327-193545)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (14-171)||(30292-30449)
scaffold0116 (139-257)||(338-456)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (30-170)||(42568-42708)
scaffold0132 (139-191)||(13824-13876)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (14-171)||(352-508)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (139-266)||(787-914)
scaffold0175 (14-103)||(15147-15236)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (139-266)||(33980-34107)
scaffold0012 (139-216)||(247321-247398)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (142-266)||(3271-3395)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (139-266)||(153829-153956)
scaffold0023 (139-172)||(48903-48936)
scaffold0023 (139-208)||(36399-36468)
scaffold0023 (139-172)||(61121-61154)
scaffold0023 (139-208)||(169789-169858)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (139-266)||(1336-1463)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (139-266)||(5034-5161)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (139-266)||(1398-1524)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (139-266)||(2700-2825)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (139-266)||(4029-4156)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (139-266)||(7279-7405)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (139-266)||(10570-10697)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (137-249)||(5912-6024)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (139-266)||(13883-14008)
scaffold0139 (139-266)||(20937-21062)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (15-149)||(44036-44170)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (140-214)||(6905-6979)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (15-94)||(305-384)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (15-94)||(1478-1557)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (139-214)||(64395-64470)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (139-235)||(12063-12160)
scaffold0162 (139-225)||(26286-26372)
scaffold0162 (139-191)||(8072-8125)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (154-214)||(154305-154365)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (139-262)||(10165-10288)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (139-239)||(146906-147008)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (139-237)||(5846-5943)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (139-237)||(22857-22955)
scaffold0141 (139-237)||(27112-27210)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (136-257)||(57305-57427)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (139-239)||(9183-9285)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (139-239)||(172210-172312)
scaffold0001 (139-239)||(177913-178015)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (144-206)||(23631-23693)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (139-217)||(1450-1528)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (213-266)||(17697-17750)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (139-239)||(17142-17241)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (140-216)||(25532-25608)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (139-239)||(1430-1532)
scaffold0266 (139-239)||(3438-3540)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-123)||(3785-3897)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (139-239)||(12418-12521)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (139-183)||(272330-272374)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (139-183)||(128083-128127)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (139-266)||(31616-31741)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (139-266)||(39410-39535)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (140-214)||(339-413)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (139-216)||(45338-45415)
scaffold0066 (139-216)||(54724-54801)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (139-191)||(18026-18078)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (139-191)||(34288-34340)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (139-183)||(36825-36869)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-214)||(1176-1251)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (139-226)||(123032-123119)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (139-225)||(51054-51140)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (139-239)||(55944-56045)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (139-191)||(5549-5601)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (139-191)||(41965-42017)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (139-183)||(42034-42078)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-66)||(6082-6133)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (139-172)||(5475-5508)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (140-176)||(12039-12075)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (139-191)||(49732-49784)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 23492571 - 23492823
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23492571 acatcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 23492670  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23492671 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa 23492770  T
Q  214 gcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23492771 gcttacccaaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 23492823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 30153140 - 30153367
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153140 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 30153239  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||  || |||| ||||    
T  30153240 gaacaagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttctctttagctcctaa 30153339  T
Q  214 gcttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30153340 gctcaccccaatcttgattcttcaagct 30153367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 53771239 - 53771484
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771239 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 53771338  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||    
T  53771339 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 53771438  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  53771439 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 53771484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 38168112 - 38168312
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38168112 acatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 38168211  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  38168212 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 38168311  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  38168312 g 38168312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54685358 - 54685189
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685358 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 54685259  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54685258 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatcataaagactaacccacttaccttggatgaagattaa 54685189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 33342079 - 33342279
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33342079 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 33342178  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  33342179 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 33342278  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  33342279 g 33342279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 16261651 - 16261896
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16261651 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattacgcata 16261750  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||   |||||| || |||| |||    
T  16261751 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctccta 16261850  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  16261851 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 16261896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 7854180 - 7854337
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854180 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 7854279  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7854280 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17956041 - 17955884
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956041 acatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcgattatgcata 17955942  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955941 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 45581830 - 45581987
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45581830 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatag 45581929  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaa-cccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45581930 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttacctta 45581987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 55513068 - 55513225
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55513068 acatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcata 55513167  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513168 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Original strand, 28558370 - 28558538
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28558370 catcaaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatgg 28558469  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28558470 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaa 28558538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 3992748 - 3992905
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3992748 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataattacttattctcataatcaattatgcata 3992847  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992848 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 54038181 - 54038024
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038181 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 54038082  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038081 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 54038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 2844389 - 2844546
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844389 acatcaaattaacatattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaattatgcata 2844488  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844489 gaataagagaaaaagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842392
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagc 14842420  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14842419 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 14842392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 18911300 - 18911427
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18911300 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 18911399  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18911400 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 18911427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18896993 - 18896870
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18896993 atgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 18896894  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18896893 tattctcttcaaaacccttgttct 18896870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 5228619 - 5228746
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228619 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 5228718  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5228719 tattctcttcaaaacctttgttcttctc 5228746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15468289 - 15468162
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468289 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15468190  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15468189 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 15468162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Original strand, 16821443 - 16821568
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16821443 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcttcaagt 16821541  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttct 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16821542 tattcccttcaaaacccttgttcttct 16821568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Original strand, 25059046 - 25059172
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25059046 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 25059145  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttct 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25059146 tattctcttcaaaacccttgttcttct 25059172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 18970119 - 18970231
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  18970119 acatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgcata 18970218  T
Q  114 gaacaagagaaaa 126  Q
    ||| |||||||||    
T  18970219 gaaaaagagaaaa 18970231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651891
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaagctcaccccaatttgattcatcaag 54651863  T
Q  238 ctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    || ||| || |||||||||| ||||||||    
T  54651864 ctcttctctccaaaaccctt-ttcttctc 54651891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 22275516 - 22275641
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22275516 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 22275614  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22275615 tattcccttc-aaatccttgttcttctc 22275641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8268682 - 8268563
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattga-ttcttcaag 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  8268682 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggatttcttcaag 8268583  T
Q  238 ctattcccttcaaaaccctt 257  Q
     | ||| || ||||||||||    
T  8268582 ttcttctctccaaaaccctt 8268563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8275782 - 8275663
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattga-ttcttcaag 237  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  8275782 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggatttcttcaag 8275683  T
Q  238 ctattcccttcaaaaccctt 257  Q
     | ||| || ||||||||||    
T  8275682 ttcttctctccaaaaccctt 8275663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 48421776 - 48421855
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48421776 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 15550797 - 15550953
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || |||||||||     
T  15550797 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataa 15550896  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||  |||||  |  ||||||  || |||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  15550897 aaagagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 15550953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912328
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||  ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaagctcactccaaccttgattcttcaa 17912331  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  17912330 gct 17912328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449087
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 2449087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986014
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaa 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatttgattcttcaa 11986014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615241
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||     
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaagt 15615236  T
Q  239 tattc 243  Q
    |||||    
T  15615237 tattc 15615241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050217
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaaactcactccaatcttgattcttcaa 2050214  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  2050215 gct 2050217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954738
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 13954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861220
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 45861220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12264741 - 12264615
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccc-aattgattcttcaag 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || |||  |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||    
T  12264741 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaaattgattcctcaag 12264643  T
Q  238 ctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||    
T  12264642 ct-ttcccttcaacactcttgttcttctc 12264615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260737
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 19260737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1467688 - 1467563
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  1467688 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 1467590  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  1467589 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 1467563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 41270380 - 41270455
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41270380 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 41270455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12030105 - 12030019
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  12030105 atgattatgataatgattaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 12030019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839286
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagagtaatccctacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 13839286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51961065 - 51961011
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  51961065 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 51961011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285341
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 14285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 12812148 - 12812273
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  | |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  12812148 atgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 12812246  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  12812247 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 12812273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 49232743 - 49232868
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| |  || | |||| |||||||||  |||||    
T  49232743 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct-cataggtcacccaaattgattccccaagc 49232841  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  49232842 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 49232868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 55316524 - 55316599
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  55316524 atgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 55316599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 11402789 - 11402898
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||  |||||  ||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  11402789 catcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttattcaaataagcacttgtgcatag 11402888  T
Q  115 aacaagagaa 124  Q
    ||| ||||||    
T  11402889 aactagagaa 11402898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933868
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16933868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 17393636 - 17393735
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctca--taatcaattatgcataga 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  17393636 caaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcataataatcactta-tctcaattaagcaattatgcataga 17393734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947078
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 19947078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232121
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 16105847 - 16106092
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16105847 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 16105946  T
Q  119 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16105947 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct-agctta 16106045  T
Q  219 ccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  16106046 ccccaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctc 16106092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 11342883 - 11343133
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342883 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 11342982  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||||||| || |    
T  11342983 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcct-a 11343081  T
Q  214 gcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  11343082 ggtcaccccacttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctc 11343133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 2032008 - 2032220
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2032008 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 2032107  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||    
T  2032108 gaacaagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T
Q  214 gcttaccccaatt 226  Q
    ||| |||||||||    
T  2032208 gctcaccccaatt 2032220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 21205124 - 21205350
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205124 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21205223  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  | ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  21205224 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa-tcccttatcttagatgaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 21205322  T
Q  214 gcttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21205323 gctcactccaatcttgattcttcaagct 21205350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 21650893 - 21651104
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  21650893 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaactatgcaca 21650992  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    |||||||| |||| ||||    
T  21650993 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaa 21651092  T
Q  214 gcttaccccaat 225  Q
    ||| || |||||    
T  21651093 gctcactccaat 21651104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 23514868 - 23514995
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  23514868 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagt 23514967  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23514968 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 23514995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35791047 - 35790920
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35791047 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 35790948  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | ||| || ||||||| || ||||||||    
T  35790947 tcttctctccaaaaccttttttcttctc 35790920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11212014 - 11211886
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11212014 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattttgattcttcaa 11211916  T
Q  237 gctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211915 gctattcccttcaaaacccttgttcttctc 11211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17471537 - 17471412
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17471537 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 17471439  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17471438 tattcccttc-aaatccttgttcttctc 17471412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1219469 - 1219351
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  1219469 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 1219370  T
Q  239 tattcccttcaaaaccctt 257  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  1219369 tcttctctccaaaaccctt 1219351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 23328865 - 23328982
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  23328865 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 23328964  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  23328965 cttctctccaaaaccctt 23328982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 24616469 - 24616586
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24616469 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24616568  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24616569 cttctctccaaaaccctt 24616586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 24712845 - 24712962
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24712845 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24712944  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24712945 cttctctccaaaaccctt 24712962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 24745863 - 24745980
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24745863 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24745962  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24745963 cttctctccaaaaccctt 24745980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 7425631 - 7425706
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7425631 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 7425706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22662731 - 22662653
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662731 catcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 25005019 - 25005189
Alignment:
Q  19 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaaca 118  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | | || |||| |||| ||||    
T  25005019 aaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcatacaaca 25005118  T
Q  119 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    |  |||||  | | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||    
T  25005119 attgaaaa--actaaactaaatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaact 25005189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 27010146 - 27010221
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27010146 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 27010221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623384
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 20623384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233376
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 21233376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053159
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 37053159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23981437 - 23981308
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  23981437 atgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttca 23981338  T
Q  236 agctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    || | | | ||||  ||||||||||||||||    
T  23981337 agatctcctcttc-taacccttgttcttctc 23981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536612
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16536612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900254
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 25900254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21932330 - 21932205
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  21932330 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 21932232  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  21932231 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 21932205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21938500 - 21938375
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  21938500 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 21938402  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  21938401 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 21938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 239
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951113
Alignment:
Q  143 ttatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaagct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaagct 32951113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507314
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 23507314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182416
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 27182416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 35582343 - 35582468
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  35582343 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 35582441  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  35582442 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 35582468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36989719 - 36989594
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  36989719 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 36989621  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  36989620 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 36989594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108716
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaa 108716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10777919 - 10777794
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| || || ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||| ||||||    
T  10777919 atgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccacttgattcctcaagc 10777821  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | | ||||||||  | ||||||||||||    
T  10777820 t-tccccttcaactctcttgttcttctc 10777794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22883033 - 22882908
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||   |||||    
T  22883033 atgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgatttcccaagc 22882935  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  22882934 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 22882908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053739
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 22053739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530933
Alignment:
Q  141 gattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 18530933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 7529228 - 7529280
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7529228 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 7529280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730277
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 9730277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Original strand, 19500205 - 19500274
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  19500205 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 19500274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43443343 - 43443274
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  43443343 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 43443274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15861483 - 15861250
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15861483 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 15861384  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  15861383 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15861284  T
Q  214 gcttaccccaattgattcttcaagctattccctt 247  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15861283 acttatcccaattgattcctcaagctattccctt 15861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 21860209 - 21860366
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860209 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 21860308  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860309 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44035028 - 44034871
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035028 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 44034929  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034928 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 22228115 - 22228242
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  22228115 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagt 22228214  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22228215 tattcccttcaaaacccttgttattctc 22228242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 22367216 - 22367296
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367216 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 22232812 - 22232939
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  22232812 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcataaacttaccccaattgattcatcaaga 22232911  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22232912 tattcacttcaaaacccttgttattctc 22232939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 22035755 - 22035872
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22035755 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 22035854  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  22035855 cttctctccaaaaccctt 22035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7640882 - 7640765
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  7640882 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 7640783  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  7640782 cttctctccaaaaccctt 7640765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 171
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218760
Alignment:
Q  78 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttacctta 41218760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Original strand, 46523695 - 46523813
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| | | |||||||||||     
T  46523695 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 46523794  T
Q  239 tattcccttcaaaaccctt 257  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  46523795 tcttctctccaaaaccctt 46523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18059707 - 18059582
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  18059707 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 18059609  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  18059608 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 18059582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 45051720 - 45051824
Alignment:
Q  133 aatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattct 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | ||||||    
T  45051720 aatcacatgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattct 45051819  T
Q  233 tcaag 237  Q
    |||||    
T  45051820 tcaag 45051824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452906
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 51452906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18598908 - 18598849
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598908 actaacccccttaccttagaagaagattaaccc-aactcttgcttcaattcagctcctaag 18598849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931752
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||||||||||| || ||||  |||||| |||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaagctcactccaatcttgattattcaa 20931749  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  20931750 gct 20931752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844320
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 37844320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913434
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 20913434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 17004945 - 17005070
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  17004945 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 17005043  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  17005044 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 17005070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893496
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 20893496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38055040 - 38054915
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  38055040 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 38054942  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  38054941 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 38054915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 20445987 - 20446073
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || |||||    
T  20445987 atgattatgataaagactaactcccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaat 20446073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 17148874 - 17149000
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  17148874 atgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcctatg-tcaccccacttgattcctcaag 17148972  T
Q  238 ctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||    
T  17148973 ct-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 17149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5072335 - 5072260
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||    
T  5072335 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaag 5072260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19962448 - 19962323
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||||| ||  |||||    
T  19962448 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcgcccaaattgaatccccaagc 19962350  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  19962349 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 19962323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 2116558 - 2116656
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| ||||  ||||||| ||| | | |||||||||||    
T  2116558 atgattatgataatcactaacccctttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcataagctttcccaattggattcttcaag 2116656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 20531751 - 20531837
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || |||||    
T  20531751 atgattatgataaagactaatttccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttatctcctaagctcactccaat 20531837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 14951960 - 14952160
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951960 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 14952059  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14952060 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaa 14952159  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  14952160 g 14952160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15272369 - 15272124
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272369 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 15272270  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||    
T  15272269 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 15272170  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  15272169 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 15272124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25119264 - 25119107
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25119264 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 25119165  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25119164 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttacctta 25119107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5682584 - 5682428
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682584 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 5682485  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5682484 gaacaagaggaaaa-aattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttacctta 5682428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135823
Alignment:
Q  69 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  168 cttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaacc 254  Q
    ||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15135910 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaacc 15135823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7132014 - 7131887
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7132014 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 7131915  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7131914 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 7131887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 14996445 - 14996572
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14996445 atgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaagc 14996544  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14996545 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 14996572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17145606 - 17145479
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17145606 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 17145507  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17145506 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 17145479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 18169277 - 18169402
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18169277 atgattatgataataactaacccccttacctt-gaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcctcaagc 18169374  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18169375 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 18169402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 20001030 - 20001153
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  20001030 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 20001129  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  20001130 tcttctctccaaaaccctttttct 20001153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Original strand, 47357958 - 47358075
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47357958 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa-ctcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattccttaagc 47358056  T
Q  239 tattcccttcaaaaccctt 257  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  47358057 tcttctctccaaaaccctt 47358075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 26339327 - 26339424
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  26339327 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 26339424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15287194 - 15287119
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15287194 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15287119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15294303 - 15294228
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15294303 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15294228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22352012 - 22351938
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22352012 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 22351938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680615
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 26680615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 19559557 - 19559666
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  19559557 acatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcata 19559656  T
Q  114 gaacaagaga 123  Q
    ||| ||||||    
T  19559657 gaaaaagaga 19559666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 49071885 - 49071994
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  49071885 acatcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcata 49071984  T
Q  114 gaacaagaga 123  Q
    ||| ||||||    
T  49071985 gaaaaagaga 49071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16608947
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16608947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246824
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 13246824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327774
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatgaagattaggccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16327774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34177691 - 34177617
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34177691 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattc 34177617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376444
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccc 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccc 55376444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 122194 - 122296
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||    |||||||| ||||  |||||| || ||||  ||||||||||||    
T  122194 atgattatgataaagactaatccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaagctcactccaatcttgattcttcaa 122293  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  122294 gct 122296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13048160 - 13048069
Alignment:
Q  146 tgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| | || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  13048160 tgataaagactaacccccttaacttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttaactcctaagcttacccaattggattcttcaag 13048069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 10488879 - 10488977
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  10488879 atgattaagataaagaccaaccaccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 10488977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674954
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 15674954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104156
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 10104156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241057
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 33241057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14500144 - 14500092
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14500144 atgattatgatgaagcctaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 14500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32460635 - 32460583
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  32460635 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 32460583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132671
Alignment:
Q  142 attatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 31132671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248569
Alignment:
Q  141 gattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaa 18248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045305
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 8045305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523179
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 16523179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14500268 - 14500208
Alignment:
Q  19 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 79  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14500268 aaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 14500208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738613
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatga 22738613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885439
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 40885439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 25213252 - 25213499
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25213252 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 25213351  T
Q  119 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta-acccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25213352 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcctaatctt 25213451  T
Q  218 accccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25213452 accccaatt-attcctcaatctattctcttcaaaacccttgttcttctc 25213499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9652953 - 9652784
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9652953 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 9652854  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652853 gaacaagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 9652784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21274106 - 21273857
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274106 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21274007  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || ||||  ||    
T  21274006 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcata 21273908  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  21273907 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctttttct 21273857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 22274920 - 22275077
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274920 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 22275019  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275020 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 22284153 - 22284310
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22284153 acattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatgataatcacttattctcataatcaaatatgcata 22284252  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284253 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 16935900 - 16936027
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16935900 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 16935999  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16936000 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 16936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 17006560 - 17006687
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17006560 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 17006659  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17006660 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 17006687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 15633418 - 15633569
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 119  Q
    |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633418 aattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 15633517  T
Q  120 gagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15633518 gagaaaaagaattaactaagtgattatgataaagactaacctccttacctta 15633569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42177918 - 42177791
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42177918 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccctaatcttaccccaattgattcctcaagc 42177819  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42177818 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 42177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12641591 - 12641468
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12641591 atgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12641492  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12641491 tcttctctccaaaaccctttttct 12641468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12635817 - 12635694
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12635817 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12635718  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12635717 tcttctctccaaaaccctttttct 12635694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 12728699 - 12728822
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12728699 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12728798  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12728799 tcttctctccaaaaccctttttct 12728822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 34824782 - 34824905
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  34824782 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 34824881  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  34824882 tcttctctccaaaaccctttttct 34824905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 23774444 - 23774561
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  23774444 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 23774543  T
Q  240 attcccttcaaaaccctt 257  Q
     ||| || ||||||||||    
T  23774544 cttctctccaaaaccctt 23774561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3798552 - 3798429
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||||||     
T  3798552 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcataagcttacccaattggattcttcaagt 3798453  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  3798452 tcttctctccaaaaccctttttct 3798429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 8944153 - 8944276
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  8944153 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 8944252  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | | | || |||||||||| ||||    
T  8944253 tctactctccaaaaccctttttct 8944276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 7321716 - 7321873
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||  |||||||||    
T  7321716 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattcaaataagcacgtatgcatag 7321815  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
     | ||||||  |  ||||||  || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7321816 gaaaagagagtagaaattaactaagtgattataatgaattctaacccccttaccttag 7321873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906288
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 14906288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820486
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 23820486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863336
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||| ||||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaagctcaccccaatccttgattcttca 22863334  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  22863335 ag 22863336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265224
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaag 25265236  T
Q  238 ctattcccttca 249  Q
    || ||| |||||    
T  25265235 ctcttctcttca 25265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689249
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 19689249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463120
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 463120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396487
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||     
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaagt 17396500  T
Q  239 tattcccttcaaa 251  Q
    | ||| |||||||    
T  17396499 tcttctcttcaaa 17396487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015426
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagttttcccaattggattcttcaag 20015426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11231287 - 11231162
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  11231287 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 11231189  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  11231188 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 11231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22513134 - 22513009
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  22513134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 22513036  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  22513035 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 22513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28775756 - 28775631
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  28775756 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 28775658  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  28775657 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 28775631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 8891549 - 8891635
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| || | ||||||| || |||||    
T  8891549 atgattatgataaagactaacccctttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagttcctaagctcactccaat 8891635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982356
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaaga 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaga 36982356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341254
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaagctcactccaatt 24341254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24685730 - 24685605
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  24685730 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 24685632  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||    
T  24685631 t-ttcccttcaacacttttgttcttctc 24685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Original strand, 20279610 - 20279688
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  20279610 catcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagttcaccataatcacttatt 20279688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466257
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccc 221  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaacccc-ttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccc 32466257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128424
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 33128424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507756
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 7507756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031133
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 28031133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 17204659 - 17204711
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||    
T  17204659 atgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaaact 17204711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627238
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 267
Target Start/End: Original strand, 4991271 - 4991524
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991271 acatcaaat-aacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 4991369  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta-acccaaactcttgcttcaattcagctgct 211  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||||||||||| ||    
T  4991370 aaatcaagagaaaaagaattaaacaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcct 4991469  T
Q  212 aagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctca 267  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4991470 aatcttaccccaatt-attcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctca 4991524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 26089933 - 26090092
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089933 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 26090032  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090033 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 26090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23995121 - 23995366
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995121 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 23995220  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||    
T  23995221 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 23995320  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  23995321 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 23995366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19983349 - 19983192
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983349 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 19983250  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983249 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35015214 - 35015057
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015214 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 35015115  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015114 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15742275 - 15742100
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15742275 catcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat-g 15742177  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  15742176 aacaagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 15742100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18002553 - 18002394
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18002553 acatcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatgcccataatcaattatgcata 18002454  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002453 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 18002394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 18583515 - 18583672
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18583515 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatgatgcata 18583614  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18583615 gaacaggagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657566
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1657594  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1657593 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 1657566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862916
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15862888  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15862889 tattctcttcaaaactcttgttcttctc 15862916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Original strand, 1556312 - 1556436
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1556312 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1556411  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttctt 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  1556412 tattctcttcaaaacccttgttctt 1556436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 19610325 - 19610452
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19610325 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 19610424  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||    
T  19610425 tcttctctccaaaaccctttttcttctc 19610452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 23978076 - 23978199
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  23978076 atgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 23978175  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  23978176 tcttctctccaaaaccctttttct 23978199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22585602 - 22585494
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  22585602 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22585503  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  22585502 aaaaagaga 22585494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22590433 - 22590325
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  22590433 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22590334  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  22590333 aaaaagaga 22590325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15889762 - 15889607
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| || ||||||||||    
T  15889762 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacacttatgcatag 15889663  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatga-taaagactaacccccttacct 169  Q
    || |||||| ||  ||||||  || ||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  15889662 aaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacct 15889607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25640611 - 25640455
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  25640611 catcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 25640513  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    || ||||||  |  |||||   || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25640512 aaaaagagagtagaaattacctaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25640455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 16232199 - 16232274
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232199 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 16232274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15004963 - 15004855
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| || |||||||||    
T  15004963 acatcaaatta-catactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcacttatgcata 15004865  T
Q  114 gaacaagaga 123  Q
    ||| ||||||    
T  15004864 gaaaaagaga 15004855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Original strand, 16240401 - 16240468
Alignment:
Q  199 caattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16240401 caattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 16240468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29869724 - 29869650
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29869724 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 29869650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18086757 - 18086697
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086757 actaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 18086697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751829
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatt 27751829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1649955
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 1649955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16376322 - 16376197
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  16376322 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 16376224  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  16376223 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 16376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16383646 - 16383521
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  16383646 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 16383548  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  16383547 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666282
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatttgattcttcaag 29666280  T
Q  238 ct 239  Q
    ||    
T  29666281 ct 29666282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 10489006 - 10489131
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  10489006 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 10489104  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  10489105 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 10489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22225687 - 22225562
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  22225687 atgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 22225589  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||    
T  22225588 t-ttccattcaacactcttgttcttctc 22225562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22251515 - 22251390
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  22251515 atgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 22251417  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||    
T  22251416 t-ttccattcaacactcttgttcttctc 22251390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148390
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 23148390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153841
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 23153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276639
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 32276639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009323
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttca 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| | ||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttca 35009323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823263
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 18823263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839118
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 18839118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16556088 - 16555979
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  16556088 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 16555990  T
Q  239 tattcccttcaa 250  Q
    | ||||||||||    
T  16555989 t-ttcccttcaa 16555979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16632644 - 16632535
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  16632644 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 16632546  T
Q  239 tattcccttcaa 250  Q
    | ||||||||||    
T  16632545 t-ttcccttcaa 16632535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 19299544 - 19299669
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||||| ||  |||||    
T  19299544 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcgcccaaattgaatccccaagc 19299642  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  19299643 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 19299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 130760 - 131005
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  130760 aattaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 130859  T
Q  119 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |    
T  130860 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtca 130958  T
Q  219 ccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  130959 ccccaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctc 131005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89282
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttca 89311  T
Q  236 agctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    || | |  |||||  ||||||||||||||||    
T  89310 agttct--ccttctcaacccttgttcttctc 89282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107653
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || ||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaatt 107653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10040 - 9839
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa-ttatgcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10040 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatttatgcat 9941  T
Q  113 agaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||    
T  9940 agaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 9841  T
Q  213 ag 214  Q
    ||    
T  9840 ag 9839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13443 - 13198
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13443 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 13344  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||    
T  13343 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 13244  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  13243 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 13198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24385809 - 24385582
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385809 acatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattatgcata 24385710  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||    
T  24385709 gaacaagagaaaaggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T
Q  214 gcttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24385609 gctcactccaatcttgattcttcaagct 24385582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41506866 - 41506654
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41506866 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 41506767  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||  |||    
T  41506766 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcttaa 41506667  T
Q  214 gcttaccccaatt 226  Q
    ||| |||||||||    
T  41506666 gctcaccccaatt 41506654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24716919 - 24716762
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716919 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 24716820  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716819 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 39115473 - 39115630
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39115473 acatcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 39115572  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  39115573 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttacctta 39115630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 274642 - 274798
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  274642 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 274741  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274742 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 641207 - 641051
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  641207 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 641108  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641107 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 827013 - 826857
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  827013 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 826914  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826913 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13662214 - 13662087
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13662214 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 13662115  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13662114 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 13662087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13720877 - 13720750
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13720877 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 13720778  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13720777 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 13720750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17346011
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagt 17345986  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttctt 263  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  17345987 tattctctccaaaacccttgttctt 17346011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22006207 - 22006080
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22006207 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 22006108  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22006107 tattctcttcaaaacctttgttcttctc 22006080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 16195538 - 16195665
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  16195538 atgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactcctaatcttaccccatttgatttctcaagc 16195637  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16195638 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 16195665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21259547 - 21259390
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  21259547 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 21259448  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    || ||||||  |  ||||||  || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21259447 aaaaagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 21259390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 17502360 - 17502468
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  17502360 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 17502459  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  17502460 aaaaagaga 17502468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16873000 - 16872877
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  16873000 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 16872901  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  16872900 tcttctctccaaaaccctttttct 16872877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 4234054 - 4234162
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  4234054 catcaaattaacatactcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 4234153  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  4234154 aaaaagaga 4234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 23218076 - 23218184
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  23218076 catcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 23218175  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  23218176 aaaaagaga 23218184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22321503 - 22321437
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321503 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907062
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 22907062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238502
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 5238502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661096
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 24661096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685961
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 43685961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373322
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 43373325  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  43373324 gct 43373322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000465
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatt 7000465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16674339 - 16674271
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16674339 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactc-aactcttgcttcaattcagct 16674271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24928748 - 24928648
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    |||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  24928748 atgattatgataaagactaaccccattaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 24928649  T
Q  237 g 237  Q
    |    
T  24928648 g 24928648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 271309 - 271184
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  271309 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 271211  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  271210 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 271184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 644611 - 644736
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  644611 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 644709  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  644710 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 644736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 830346 - 830471
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  830346 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 830444  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  830445 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15319108 - 15318983
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  15319108 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 15319010  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||    
T  15319009 t-tttccttcaacactcttgttcttctc 15318983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15499477 - 15499352
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  15499477 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 15499379  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||    
T  15499378 t-tttccttcaacactcttgttcttctc 15499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16193674 - 16193573
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||    
T  16193674 atgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagatgaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattctttaa 16193576  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  16193575 gct 16193573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22088743 - 22088618
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  22088743 atgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 22088645  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  22088644 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 22088618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21494388 - 21494336
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21494388 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 21494336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886706
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 22886706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18118337 - 18118259
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  18118337 catcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagttcacaataatcacttatt 18118259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545298
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 2545298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431175
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 3431175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6774206 - 6774137
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  6774206 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 6774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Original strand, 30121029 - 30121098
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| | | ||| ||| |||||||||||||    
T  30121029 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagct 30121098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404900
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15516901 - 15516691
Alignment:
Q  32 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15516901 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaa 15516802  T
Q  131 ttaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttga 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||    
T  15516801 ttaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttaccccaatcttga 15516702  T
Q  229 ttcttcaagct 239  Q
    |||||||||||    
T  15516701 ttcttcaagct 15516691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42056346 - 42056101
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056346 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 42056247  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||    
T  42056246 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 42056147  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  42056146 agctcacccaatcttgattactcaagctcttctctccaaaaccctt 42056101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 2029119 - 2029288
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029119 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2029218  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2029219 gaacaagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 2029288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Original strand, 3049780 - 3049974
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049780 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 3049879  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| ||||    
T  3049880 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagct 3049974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2190243 - 2189998
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190243 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2190144  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || | || |||    
T  2190143 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaaccgccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttaactccta 2190044  T
Q  213 agcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    |||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  2190043 agctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 2189998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 126613 - 126770
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126613 acatcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 126712  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126713 gaacaatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1937074 - 1936917
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937074 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 1936975  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1936974 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttacctta 1936917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32494103 - 32493946
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32494103 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 32494004  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32494003 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 111326 - 111169
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  111326 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattttcataatcaattatgcata 111227  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  111226 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15760063 - 15759939
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15760063 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15759964  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttctt 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15759963 tattctcttcaaaacccttgttctt 15759939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15950740 - 15950614
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15950740 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 15950642  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15950641 tatttccttcaaaacccttgttcttctc 15950614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14250832 - 14250721
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaac 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14250832 actaacccccttaccttagaagaagat-aactcaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac 14250734  T
Q  254 ccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||||||    
T  14250733 ccttgttcttctc 14250721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 13758677 - 13758800
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  13758677 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 13758776  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  13758777 tcttctctccaaaaccctttttct 13758800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 15927875 - 15927950
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15927875 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15927950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18979970 - 18979895
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18979970 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 18979895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 13352151 - 13352259
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  13352151 catcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatgcatag 13352250  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  13352251 aaaaagaga 13352259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113823
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagcttacccaattggattcttcaagt 14113836  T
Q  239 tattcccttcaaa 251  Q
    | ||| |||||||    
T  14113835 tcttctcttcaaa 14113823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 13572981 - 13573056
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572981 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 13573056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293431
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 7293431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212170
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 16212170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39291565 - 39291457
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||    
T  39291565 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattcaaataagtacttatgcatag 39291466  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  39291465 aaaaagaga 39291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292173
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctta-cccaattgattcctcaagtt 25292185  T
Q  240 attcccttcaaa 251  Q
     ||| |||||||    
T  25292184 cttctcttcaaa 25292173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516641
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 11516641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441412
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 15441412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30261977
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 30261977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321435
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaag 13321433  T
Q  238 ct 239  Q
    ||    
T  13321434 ct 13321435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14423585 - 14423474
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  14423585 atgattatgataa-gactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagcttacccaattggattcttcaagt 14423487  T
Q  239 tattcccttcaaa 251  Q
    | ||| |||||||    
T  14423486 tcttctcttcaaa 14423474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 2437763 - 2437888
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  2437763 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 2437861  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || | ||||||||||    
T  2437862 t-ttcccttcaacactcctgttcttctc 2437888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053073
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 36053070  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  36053071 gct 36053073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 7823035 - 7823160
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  7823035 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 7823133  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  7823134 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 7823160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 7830346 - 7830471
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  7830346 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 7830444  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  7830445 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 7830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580592
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttgattcttca 11580594  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  11580593 ag 11580592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036869
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagcttactccaatccttgattcttca 13036871  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  13036870 ag 13036869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 27176740 - 27176865
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  27176740 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 27176838  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  27176839 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 27176865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 25124448 - 25124552
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||    
T  25124448 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttc 25124547  T
Q  235 aagct 239  Q
    |||||    
T  25124548 aagct 25124552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27101586 - 27101461
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  27101586 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 27101488  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  27101487 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 27101461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27108934 - 27108809
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  27108934 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 27108836  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  27108835 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 27108809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38783678 - 38783553
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  38783678 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 38783580  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  38783579 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 38783553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480924
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 47480924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15977894 - 15977820
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttat 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15977894 caaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcacttat 15977820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18151357 - 18151259
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 116  Q
    ||||||||||||   || |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  18151357 caaattaacatacctaatcatatcactacaacatgagcacgaatttcaacggttaagttcacaataatcacttattcaaataagaatttatgcatagaa 18151259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371450
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000282
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 176  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatga 10000282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 55779 - 55981
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55779 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 55878  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |   ||||||||| |||| ||||    
T  55879 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaa 55978  T
Q  214 gct 216  Q
    |||    
T  55979 gct 55981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 107980
Alignment:
Q  68 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac-aagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaaccccctta 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  167 ccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  108079 ccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcacgctattctcttcaaaacccttgttcttctc 107980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6601 - 6373
Alignment:
Q  13 gacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6601 gacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacctattatcataatcaattatgcat 6502  T
Q  113 agaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||   ||||||||| |||| |||    
T  6501 agaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctccta 6402  T
Q  213 agcttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||    
T  6401 agctcactccaatcttgattcttcaagct 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1035 - 835
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1035 acatcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 936  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  935 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 836  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  835 g 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 80062 - 80219
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80062 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 80161  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80162 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17459 - 17261
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17459 atcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaattattctcataatcaattatgcataga 17360  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  17359 acaagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaacccgcttaccttagatggagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4304
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4504 acatcaaattaacatatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 4405  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgcta 212  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  4404 gaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctccta 4305  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4304 a 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 85 - 5
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12574 - 12348
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12574 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataataacttattcccataatcaattatgcatag 12475  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    |||||||| |||| |||||    
T  12474 aacaaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattcatcccaacttagacttcaatttagctcctaag 12375  T
Q  215 cttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    || |  ||||  |||||||||||||||    
T  12374 ctcaatccaatcttgattcttcaagct 12348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6140 - 5983
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 6041  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6040 gaacaagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5777
Alignment:
Q  25 acatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  125 aaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 162233 - 162078
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162233 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 162134  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  162133 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 166319 - 166164
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166319 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 166220  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  166219 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31337 - 31180
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31337 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 31238  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31237 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 31180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 41507 - 41664
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41507 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 41606  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41607 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 41664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36914
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 36914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 193545 - 193327
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193545 acatcaaattaacatattcaaacatatctct---------gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 193455  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||    
T  193454 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 193355  T
Q  214 gcttaccccaa--ttgattcttcaagct 239  Q
    ||| || ||||  || ||||||||||||    
T  193354 gctcactccaatcttaattcttcaagct 193327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 30292 - 30449
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30292 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 30391  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30392 gaacaagagaaaaataattaactaaatgattatgatgaaaaataacccccttacctta 30449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Original strand, 338 - 456
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  338 atgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 437  T
Q  239 tattcccttcaaaaccctt 257  Q
    | | | || ||||||||||    
T  438 tctcctctccaaaaccctt 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 42568 - 42708
Alignment:
Q  30 ttcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42568 ttcaaccatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 42667  T
Q  130 attaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42668 attaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 42708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13876
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 13876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 352
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  508 acatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 409  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  408 gaacaagag-aaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttacctta 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 787
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 815  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  814 tattcccttcaaaatccttgttcttctc 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 15147 - 15236
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15147 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 33980
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaattgattcctcaagc 34008  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34007 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 33980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247321
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 247321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 266
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3395
Alignment:
Q  142 attatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctat 241  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3271 attatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctat 3370  T
Q  242 tcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3371 tcccttcaaaacccttgttcttctc 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 153956 - 153829
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  153956 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 153857  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  153856 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 153829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48936
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 48936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Original strand, 36399 - 36468
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  36399 atgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagct 36468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61121
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 169858 - 169789
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| || || || ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  169858 atgattatgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagct 169789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1336
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1463 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 1364  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1363 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5161 - 5034
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161 atgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagc 5062  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5061 tattcccttaaaaacccttgttcttctc 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1398
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1524 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1425  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  1424 tattctcttc-aaaccctttttcttctc 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 2700 - 2825
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2700 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 2798  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2799 tattcccttc-aaatccttgttcttctc 2825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4156
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4029 atgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 4128  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4129 tattgccttcaaaacccttgtccttctc 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7405 - 7279
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7405 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcctcaagc 7307  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7306 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 7279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10697 - 10570
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  10697 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagc 10598  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10597 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6024 - 5912
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6024 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactctaattgattcctcaa 5925  T
Q  237 gctattcccttca 249  Q
    ||||||| |||||    
T  5924 gctattctcttca 5912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14008 - 13883
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14008 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 13910  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13909 t-ttcccttcaaaactcttgttcttctc 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21062 - 20937
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21062 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 20964  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20963 t-ttcccttcaaaactcttgttcttctc 20937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44170 - 44036
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  44170 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcacttatgcatag 44071  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgat 149  Q
     | |||||| ||  ||||||  || ||||||||||    
T  44070 caaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 44036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 6905 - 6979
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6905 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 6979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 305 - 384
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  305 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1557 - 1478
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1557 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattc 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 64470 - 64395
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64470 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 64395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 235
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12160
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttca 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaagcttaccccaatttgattcttca 12160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26286
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8072
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaaccccc-ttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaact 8072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 154365 - 154305
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  154365 actaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 154305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10165
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaattgattcctcaagc 10189  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttct 262  Q
    | | | ||  ||||||||||||||    
T  10188 tttcctctctaaaacccttgttct 10165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 146906 - 147008
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 147005  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  147006 gct 147008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5943
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctta-cccaattgattcctcaag 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22955
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 22955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27210
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 27210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 57427 - 57305
Alignment:
Q  136 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccca-attgattcttc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||    
T  57427 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaagctcacccaatcttgattcctc 57328  T
Q  235 aagctattcccttcaaaaccctt 257  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  57327 aagctcttctctccaaaaccctt 57305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9285
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 9282  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  9283 gct 9285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172312
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 172309  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  172310 gct 172312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 177913 - 178015
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 178012  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  178013 gct 178015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23693 - 23631
Alignment:
Q  144 tatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcag 206  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693 tatgataataactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcag 23631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1450
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17750 - 17697
Alignment:
Q  213 agcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17750 agcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17142
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25608
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagct 25608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1532
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 1529  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  1530 gct 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3438
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 3441  T
Q  237 gct 239  Q
    |||    
T  3440 gct 3438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3897 - 3785
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatct----ctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  3897 catcaaattaacatactcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgc 3798  T
Q  111 atagaacaagaga 123  Q
    |||||| ||||||    
T  3797 atagaaaaagaga 3785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12521
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatttttgattcttca 12517  T
Q  236 agct 239  Q
    ||||    
T  12518 agct 12521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272374
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 272374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128083
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 128083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 31616 - 31741
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  31616 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 31714  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  31715 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 31741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 39410 - 39535
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  39410 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 39508  T
Q  239 tattcccttcaaaacccttgttcttctc 266  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||    
T  39509 t-ttcccttcaacactcttgttcttctc 39535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 339 - 413
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaag 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45415
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagct 45415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54801
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagct 54801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18078
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 18078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34288
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36825
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaataaagattaa 36825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1176
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 214  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1251 atgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123032
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 123032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51140 - 51054
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 225  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  51140 atgattatgataaagactaatctccttacctaagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 51054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55944
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||   |||| |||| | || ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaagttcaccccaatttgattcttcaag 55946  T
Q  238 ct 239  Q
    ||    
T  55945 ct 55944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5601
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42017
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 42017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Original strand, 42034 - 42078
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  42034 atgattatgataaagaccaacccccttaccttagataaatattaa 42078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 6082 - 6133
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 66  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6082 catcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaa 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5475
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12039
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 176  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatga 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49784 - 49732
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  49784 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 49732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University