View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6929_low_12 (Length: 244)

Name: NF6929_low_12
Description: NF6929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6929_low_12
NF6929_low_12
[»] chr2 (70 HSPs)
chr2 (3-237)||(32214851-32215085)
chr2 (1-235)||(18808943-18809177)
chr2 (1-235)||(23709460-23709694)
chr2 (1-235)||(23711941-23712175)
chr2 (1-235)||(39682313-39682547)
chr2 (1-235)||(6725995-6726229)
chr2 (1-235)||(23130862-23131096)
chr2 (1-235)||(23133329-23133563)
chr2 (1-235)||(26505379-26505613)
chr2 (1-235)||(26507857-26508091)
chr2 (1-235)||(34402450-34402684)
chr2 (1-232)||(21154988-21155219)
chr2 (1-235)||(571397-571631)
chr2 (1-235)||(23135590-23135824)
chr2 (1-235)||(24898123-24898358)
chr2 (1-235)||(24900606-24900841)
chr2 (1-235)||(24903083-24903318)
chr2 (1-235)||(24905560-24905795)
chr2 (1-235)||(24908035-24908270)
chr2 (1-235)||(24367774-24368008)
chr2 (1-235)||(28577099-28577333)
chr2 (1-235)||(32039426-32039660)
chr2 (1-235)||(22105412-22105647)
chr2 (3-235)||(45029784-45030016)
chr2 (1-235)||(38967374-38967608)
chr2 (57-233)||(43137301-43137477)
chr2 (56-235)||(24529511-24529691)
chr2 (3-150)||(24642784-24642933)
chr2 (73-238)||(22337115-22337281)
chr2 (73-238)||(23060513-23060679)
chr2 (73-238)||(23076442-23076608)
chr2 (73-238)||(22731189-22731355)
chr2 (58-238)||(19671830-19672010)
chr2 (73-238)||(22738135-22738300)
chr2 (73-238)||(23654341-23654507)
chr2 (73-238)||(23285865-23286027)
chr2 (73-238)||(23660023-23660188)
chr2 (139-238)||(38136-38235)
chr2 (73-235)||(298769-298933)
chr2 (4-73)||(20261381-20261450)
chr2 (58-238)||(23708558-23708738)
chr2 (90-238)||(23103369-23103516)
chr2 (157-232)||(24643034-24643109)
chr2 (43-112)||(22173799-22173868)
chr2 (177-238)||(23040249-23040310)
chr2 (73-219)||(7688-7835)
chr2 (88-238)||(20309108-20309257)
chr2 (117-233)||(28405981-28406099)
chr2 (162-238)||(8946657-8946734)
chr2 (4-72)||(10684694-10684764)
chr2 (1-72)||(23707250-23707323)
chr2 (1-72)||(24918196-24918269)
chr2 (141-238)||(23071972-23072070)
chr2 (1-51)||(25616365-25616415)
chr2 (56-219)||(23791292-23791458)
chr2 (67-143)||(22459511-22459587)
chr2 (77-234)||(25175854-25176010)
chr2 (1-72)||(24671081-24671154)
chr2 (185-234)||(7679589-7679638)
chr2 (56-219)||(20520130-20520295)
chr2 (177-237)||(22134266-22134326)
chr2 (56-96)||(29601478-29601518)
chr2 (86-219)||(32451896-32452031)
chr2 (185-223)||(18786971-18787009)
chr2 (1-72)||(24681500-24681573)
chr2 (110-231)||(25616192-25616314)
chr2 (56-157)||(24697543-24697644)
chr2 (1-36)||(24529475-24529510)
chr2 (177-217)||(23287384-23287424)
chr2 (177-217)||(26392403-26392443)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (3-231)||(16413246-16413474)
chr8 (1-235)||(14409372-14409606)
chr8 (1-235)||(1484402-1484636)
chr8 (1-235)||(5853220-5853454)
chr8 (1-235)||(20403227-20403461)
chr8 (1-235)||(22001753-22001987)
chr8 (1-235)||(15203159-15203393)
chr8 (1-235)||(20046123-20046357)
chr8 (1-235)||(4483281-4483514)
chr8 (1-235)||(4542301-4542535)
chr8 (1-235)||(19896265-19896503)
chr8 (1-235)||(14823774-14824009)
chr8 (1-231)||(45290622-45290853)
chr8 (56-235)||(41598188-41598367)
chr8 (1-241)||(19936931-19937174)
chr8 (1-222)||(15070571-15070794)
chr8 (43-235)||(25484245-25484430)
chr8 (58-219)||(19801367-19801527)
chr8 (56-237)||(26223917-26224098)
chr8 (73-238)||(16092297-16092463)
chr8 (73-241)||(6759255-6759421)
chr8 (58-238)||(18818348-18818530)
chr8 (3-122)||(24485974-24486093)
chr8 (85-238)||(7372778-7372932)
chr8 (73-237)||(28648999-28649164)
chr8 (73-238)||(20536208-20536374)
chr8 (1-112)||(32810054-32810165)
chr8 (73-238)||(22875065-22875230)
chr8 (72-238)||(23406379-23406548)
chr8 (90-238)||(21923900-21924049)
chr8 (88-238)||(21918969-21919121)
chr8 (73-238)||(22626736-22626901)
chr8 (93-235)||(26219717-26219858)
chr8 (93-235)||(26225268-26225409)
chr8 (73-238)||(18879191-18879352)
chr8 (56-231)||(13508022-13508199)
chr8 (56-231)||(13597554-13597731)
chr8 (67-238)||(17612059-17612231)
chr8 (88-238)||(31971257-31971407)
chr8 (56-219)||(20498581-20498746)
chr8 (139-238)||(45131019-45131117)
chr8 (77-238)||(38855212-38855372)
chr8 (117-234)||(21285601-21285719)
chr8 (124-238)||(21389458-21389571)
chr8 (124-238)||(21395988-21396101)
chr8 (124-238)||(21778784-21778897)
chr8 (124-238)||(21790481-21790594)
chr8 (124-238)||(6520368-6520483)
chr8 (1-52)||(38550039-38550090)
chr8 (139-238)||(16199666-16199765)
chr8 (185-238)||(17140916-17140969)
chr8 (185-238)||(21490995-21491048)
chr8 (56-219)||(37116366-37116532)
chr8 (124-238)||(5866280-5866395)
chr8 (188-238)||(21249384-21249434)
chr8 (188-238)||(21255222-21255272)
chr8 (73-237)||(23648554-23648719)
chr8 (1-51)||(32121912-32121962)
chr8 (56-219)||(17266930-17267096)
chr8 (1-236)||(18677993-18678221)
chr8 (73-219)||(17439461-17439609)
chr8 (177-234)||(26355757-26355815)
chr8 (185-234)||(23760912-23760961)
chr8 (117-226)||(21673716-21673826)
chr8 (110-236)||(32121734-32121861)
chr8 (185-223)||(983474-983512)
chr8 (1-72)||(1326965-1327042)
chr8 (3-52)||(27472347-27472395)
chr8 (1-61)||(16401958-16402020)
chr8 (1-52)||(20982655-20982710)
chr8 (26-72)||(35026849-35026895)
chr8 (178-217)||(22525579-22525618)
chr8 (26-72)||(2418860-2418906)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (3-237)||(30676640-30676874)
chr6 (3-237)||(34963371-34963605)
chr6 (1-235)||(12742317-12742551)
chr6 (1-235)||(22782227-22782461)
chr6 (1-235)||(24422547-24422781)
chr6 (1-235)||(33861794-33862028)
chr6 (1-235)||(33864278-33864512)
chr6 (1-235)||(8055029-8055263)
chr6 (1-235)||(18334520-18334754)
chr6 (1-235)||(19005046-19005280)
chr6 (1-235)||(19858847-19859081)
chr6 (1-235)||(1540839-1541073)
chr6 (1-235)||(2291108-2291342)
chr6 (1-235)||(26924568-26924802)
chr6 (1-235)||(25656629-25656863)
chr6 (1-235)||(25688502-25688736)
chr6 (21-235)||(1595549-1595763)
chr6 (43-235)||(25754809-25755001)
chr6 (43-235)||(20556864-20557054)
chr6 (56-219)||(18456735-18456898)
chr6 (57-235)||(3852001-3852179)
chr6 (61-232)||(16448514-16448686)
chr6 (86-219)||(18461895-18462028)
chr6 (73-238)||(25629310-25629476)
chr6 (76-238)||(29060540-29060703)
chr6 (73-237)||(18409782-18409947)
chr6 (73-238)||(19303496-19303661)
chr6 (73-238)||(20593773-20593939)
chr6 (73-238)||(20360915-20361081)
chr6 (73-238)||(16496244-16496410)
chr6 (58-238)||(22780166-22780348)
chr6 (90-238)||(17287768-17287917)
chr6 (73-238)||(20076700-20076862)
chr6 (88-238)||(20638253-20638404)
chr6 (73-223)||(25644335-25644487)
chr6 (56-236)||(19847932-19848114)
chr6 (73-219)||(18821801-18821946)
chr6 (4-73)||(12942363-12942432)
chr6 (58-238)||(20109140-20109322)
chr6 (1-72)||(28289263-28289334)
chr6 (56-238)||(8227448-8227632)
chr6 (1-68)||(18913994-18914061)
chr6 (1-68)||(18937252-18937319)
chr6 (177-238)||(25714417-25714478)
chr6 (73-238)||(35245586-35245749)
chr6 (4-72)||(15875469-15875537)
chr6 (1-52)||(31630575-31630626)
chr6 (185-238)||(27333286-27333339)
chr6 (185-238)||(27394026-27394079)
chr6 (77-238)||(23019408-23019567)
chr6 (117-234)||(19652199-19652316)
chr6 (185-238)||(1561303-1561356)
chr6 (185-238)||(28496539-28496592)
chr6 (185-238)||(29808950-29809003)
chr6 (77-223)||(9098473-9098620)
chr6 (185-238)||(16920698-16920751)
chr6 (191-238)||(22080799-22080846)
chr6 (1-51)||(23992604-23992657)
chr6 (185-238)||(22831503-22831556)
chr6 (3-39)||(17377778-17377814)
chr6 (124-223)||(19668386-19668488)
chr6 (177-219)||(11185524-11185567)
chr6 (1-36)||(19847896-19847931)
chr6 (126-236)||(23992429-23992540)
chr6 (90-211)||(15041522-15041644)
chr6 (56-219)||(23076749-23076915)
chr6 (185-234)||(19862978-19863027)
chr6 (185-234)||(19873120-19873169)
chr6 (185-234)||(31155465-31155514)
chr6 (186-226)||(4185890-4185930)
chr6 (186-226)||(4186379-4186419)
chr6 (186-226)||(4738626-4738666)
chr6 (197-241)||(19008799-19008843)
chr6 (177-217)||(33443068-33443108)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (3-235)||(3515007-3515239)
chr4 (1-237)||(19618100-19618336)
chr4 (1-235)||(18215202-18215436)
chr4 (1-235)||(15118280-15118514)
chr4 (1-235)||(12235-12469)
chr4 (1-235)||(52312510-52312744)
chr4 (1-241)||(19242693-19242934)
chr4 (1-235)||(44615288-44615522)
chr4 (7-237)||(14970641-14970871)
chr4 (1-235)||(18239347-18239581)
chr4 (1-235)||(50222267-50222501)
chr4 (1-235)||(1837437-1837671)
chr4 (1-231)||(15355252-15355483)
chr4 (1-235)||(44773011-44773249)
chr4 (43-235)||(51463838-51464030)
chr4 (43-235)||(23803235-23803427)
chr4 (56-235)||(44102214-44102393)
chr4 (43-235)||(12610950-12611135)
chr4 (20-235)||(7641139-7641344)
chr4 (67-235)||(44928873-44929042)
chr4 (56-238)||(15367690-15367873)
chr4 (56-238)||(15402703-15402886)
chr4 (56-238)||(15371202-15371385)
chr4 (56-238)||(15373483-15373666)
chr4 (56-219)||(21815568-21815731)
chr4 (56-238)||(15370018-15370200)
chr4 (59-238)||(16223532-16223712)
chr4 (61-232)||(20149832-20150004)
chr4 (58-238)||(7798774-7798956)
chr4 (73-236)||(22636437-22636601)
chr4 (73-238)||(7088877-7089043)
chr4 (73-233)||(14038653-14038814)
chr4 (73-235)||(16377478-16377639)
chr4 (93-235)||(54798729-54798872)
chr4 (73-238)||(12902757-12902923)
chr4 (117-235)||(14280316-14280434)
chr4 (73-238)||(7893703-7893869)
chr4 (126-238)||(52873375-52873488)
chr4 (62-236)||(22353835-22354010)
chr4 (73-238)||(16270191-16270356)
chr4 (73-238)||(44052829-44052995)
chr4 (73-238)||(6899891-6900056)
chr4 (75-238)||(16239927-16240090)
chr4 (93-235)||(8574844-8574985)
chr4 (56-219)||(13788-13953)
chr4 (73-231)||(23374314-23374473)
chr4 (4-73)||(15534343-15534412)
chr4 (56-223)||(52243131-52243302)
chr4 (4-72)||(36038033-36038101)
chr4 (153-238)||(3096293-3096379)
chr4 (58-223)||(43198492-43198661)
chr4 (4-72)||(14048740-14048808)
chr4 (1-72)||(15496999-15497070)
chr4 (1-71)||(52873106-52873176)
chr4 (4-72)||(49547705-49547773)
chr4 (129-238)||(39706299-39706409)
chr4 (1-52)||(362268-362319)
chr4 (139-238)||(14053323-14053422)
chr4 (1-72)||(14746545-14746618)
chr4 (75-164)||(15464888-15464977)
chr4 (185-238)||(15551817-15551870)
chr4 (113-234)||(12774011-12774132)
chr4 (185-238)||(17046487-17046540)
chr4 (124-223)||(12288214-12288316)
chr4 (20-72)||(19857607-19857659)
chr4 (185-234)||(8846360-8846409)
chr4 (56-219)||(53082089-53082254)
chr4 (86-219)||(6190481-6190616)
chr4 (58-146)||(8846465-8846553)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-236)||(10772-11007)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-236)||(21840766-21841001)
chr1 (1-235)||(23593662-23593897)
chr1 (1-235)||(13988866-13989100)
chr1 (1-235)||(21923219-21923453)
chr1 (1-235)||(21475015-21475249)
chr1 (1-235)||(29776688-29776922)
chr1 (1-235)||(29298137-29298370)
chr1 (1-237)||(16361915-16362152)
chr1 (1-235)||(31612313-31612547)
chr1 (1-235)||(22122995-22123230)
chr1 (1-235)||(16275291-16275526)
chr1 (1-241)||(15859936-15860177)
chr1 (56-235)||(21346961-21347141)
chr1 (56-241)||(21342090-21342276)
chr1 (43-238)||(45574812-45575008)
chr1 (56-238)||(13212844-13213027)
chr1 (56-235)||(21707167-21707346)
chr1 (56-235)||(21711709-21711888)
chr1 (56-235)||(433012-433190)
chr1 (61-232)||(40389157-40389329)
chr1 (73-237)||(50210168-50210333)
chr1 (73-235)||(34509783-34509946)
chr1 (73-238)||(27250684-27250850)
chr1 (73-238)||(22532269-22532435)
chr1 (73-238)||(21026680-21026846)
chr1 (56-219)||(21896193-21896358)
chr1 (59-219)||(21861510-21861672)
chr1 (137-238)||(20847173-20847275)
chr1 (73-237)||(22468651-22468816)
chr1 (56-219)||(35261018-35261180)
chr1 (113-231)||(21754052-21754170)
chr1 (67-223)||(16758664-16758822)
chr1 (117-234)||(22921868-22921986)
chr1 (58-234)||(33681011-33681188)
chr1 (56-238)||(14295493-14295672)
chr1 (1-50)||(22050817-22050866)
chr1 (75-237)||(20135188-20135351)
chr1 (177-237)||(20454613-20454673)
chr1 (19-72)||(43543214-43543267)
chr1 (124-234)||(20248283-20248394)
chr1 (56-219)||(41049973-41050138)
chr1 (77-234)||(22237631-22237788)
chr1 (185-234)||(21714546-21714595)
chr1 (177-223)||(52928029-52928076)
chr1 (1-39)||(27161567-27161605)
chr1 (185-222)||(20918620-20918657)
chr1 (73-162)||(22354527-22354616)
chr1 (185-238)||(38801456-38801508)
chr1 (60-157)||(50686695-50686792)
chr1 (67-151)||(12271642-12271725)
chr1 (177-219)||(21533932-21533974)
chr1 (185-234)||(21161720-21161769)
chr1 (56-107)||(16368224-16368276)
chr1 (185-237)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (3-235)||(4694-4926)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (1-236)||(13544024-13544259)
chr3 (1-231)||(12567564-12567794)
chr3 (1-235)||(17463178-17463412)
chr3 (1-235)||(45606835-45607069)
chr3 (1-235)||(7781275-7781509)
chr3 (1-235)||(8899094-8899328)
chr3 (1-235)||(9707535-9707769)
chr3 (1-235)||(34159326-34159560)
chr3 (1-235)||(55476491-55476725)
chr3 (1-235)||(6469062-6469296)
chr3 (1-235)||(10247651-10247885)
chr3 (1-235)||(16454209-16454443)
chr3 (1-235)||(28848539-28848773)
chr3 (1-233)||(16282739-16282971)
chr3 (1-235)||(13154183-13154418)
chr3 (1-235)||(38961819-38962053)
chr3 (1-233)||(41123892-41124121)
chr3 (9-235)||(13151726-13151953)
chr3 (32-235)||(17446614-17446816)
chr3 (1-235)||(8499518-8499754)
chr3 (1-235)||(15412429-15412665)
chr3 (43-235)||(50242822-50243014)
chr3 (56-235)||(17672626-17672805)
chr3 (56-235)||(29172565-29172745)
chr3 (56-235)||(12119707-12119887)
chr3 (43-238)||(43550448-43550644)
chr3 (56-219)||(53070636-53070799)
chr3 (1-235)||(27165250-27165486)
chr3 (3-235)||(53301434-53301669)
chr3 (73-238)||(14972854-14973020)
chr3 (104-235)||(15977515-15977646)
chr3 (58-238)||(26686887-26687069)
chr3 (73-235)||(40213676-40213838)
chr3 (58-238)||(43840932-43841114)
chr3 (73-238)||(17487856-17488022)
chr3 (73-238)||(17499338-17499504)
chr3 (73-238)||(25476340-25476506)
chr3 (124-235)||(55500942-55501053)
chr3 (93-235)||(36166598-36166739)
chr3 (73-238)||(13442274-13442440)
chr3 (73-238)||(18438534-18438700)
chr3 (73-238)||(23083316-23083482)
chr3 (57-220)||(42386428-42386593)
chr3 (88-238)||(12399209-12399360)
chr3 (88-238)||(20698405-20698556)
chr3 (93-224)||(21618460-21618590)
chr3 (73-234)||(14576788-14576949)
chr3 (56-238)||(24340660-24340844)
chr3 (73-238)||(11424718-11424880)
chr3 (132-235)||(10556985-10557088)
chr3 (73-235)||(24153164-24153326)
chr3 (136-235)||(44494809-44494908)
chr3 (58-219)||(52523666-52523831)
chr3 (137-235)||(17737236-17737337)
chr3 (92-225)||(14572602-14572735)
chr3 (4-72)||(54520985-54521053)
chr3 (4-70)||(29544773-29544839)
chr3 (56-220)||(23274705-23274871)
chr3 (4-65)||(12305315-12305376)
chr3 (56-238)||(37642202-37642386)
chr3 (58-234)||(16097332-16097509)
chr3 (58-157)||(2051138-2051238)
chr3 (1-72)||(15977696-15977767)
chr3 (56-119)||(17248224-17248287)
chr3 (124-238)||(13210333-13210448)
chr3 (77-234)||(15470928-15471085)
chr3 (58-234)||(16103784-16103960)
chr3 (1-72)||(11913978-11914051)
chr3 (67-164)||(22147474-22147571)
chr3 (113-231)||(32307684-32307802)
chr3 (183-235)||(45577948-45578000)
chr3 (185-235)||(28194693-28194743)
chr3 (1-51)||(46822445-46822495)
chr3 (185-234)||(12174327-12174376)
chr3 (124-238)||(14234487-14234602)
chr3 (1-52)||(10557091-10557142)
chr3 (185-234)||(49668144-49668193)
chr3 (110-236)||(46822267-46822394)
chr3 (185-234)||(9512924-9512973)
chr3 (185-234)||(9520899-9520948)
chr3 (75-219)||(43925977-43926123)
chr3 (177-231)||(1644733-1644787)
chr3 (110-223)||(30029855-30029968)
chr3 (124-236)||(12511059-12511172)
chr3 (185-234)||(15878119-15878168)
chr3 (26-63)||(15977663-15977700)
chr3 (1-30)||(17444744-17444773)
chr3 (177-217)||(13919350-13919390)
chr3 (185-237)||(14665398-14665450)
chr3 (185-237)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-235)||(20747-20981)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-235)||(37821-38055)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-235)||(94411-94645)
scaffold0023 (3-231)||(17370-17598)
scaffold0023 (76-235)||(44454-44614)
scaffold0023 (77-234)||(100378-100534)
scaffold0023 (185-238)||(119875-119928)
scaffold0023 (77-234)||(40135-40291)
scaffold0023 (177-234)||(101503-101561)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (1-235)||(456321-456555)
chr7 (1-235)||(15376641-15376875)
chr7 (1-235)||(16232520-16232754)
chr7 (1-235)||(20385051-20385285)
chr7 (1-235)||(21189523-21189757)
chr7 (1-235)||(32125491-32125725)
chr7 (1-235)||(41522917-41523151)
chr7 (1-235)||(41525379-41525613)
chr7 (1-234)||(11393215-11393448)
chr7 (1-235)||(14949050-14949284)
chr7 (1-235)||(18640272-18640506)
chr7 (1-235)||(27216860-27217094)
chr7 (3-235)||(24702238-24702470)
chr7 (2-235)||(11972496-11972729)
chr7 (3-235)||(16213684-16213916)
chr7 (1-235)||(16410059-16410293)
chr7 (1-238)||(18430709-18430946)
chr7 (3-235)||(24704688-24704917)
chr7 (1-235)||(13869346-13869582)
chr7 (56-235)||(44116509-44116688)
chr7 (43-238)||(13647325-13647521)
chr7 (1-235)||(26355909-26356156)
chr7 (1-235)||(26358361-26358608)
chr7 (57-235)||(3386333-3386511)
chr7 (86-231)||(24275175-24275320)
chr7 (56-235)||(17061898-17062077)
chr7 (56-231)||(38898359-38898535)
chr7 (58-235)||(20110556-20110723)
chr7 (56-219)||(12756654-12756817)
chr7 (73-235)||(3564319-3564482)
chr7 (109-235)||(13831373-13831499)
chr7 (1-142)||(15081875-15082019)
chr7 (116-235)||(48273392-48273512)
chr7 (73-238)||(12698831-12698998)
chr7 (73-238)||(38227481-38227646)
chr7 (56-238)||(2280056-2280238)
chr7 (73-238)||(9509189-9509355)
chr7 (73-235)||(18456368-18456530)
chr7 (1-90)||(13841157-13841246)
chr7 (67-238)||(26211995-26212168)
chr7 (124-238)||(10589039-10589154)
chr7 (4-73)||(11303409-11303478)
chr7 (5-84)||(18627717-18627796)
chr7 (73-223)||(15143993-15144143)
chr7 (4-72)||(16108620-16108688)
chr7 (1-72)||(14269990-14270061)
chr7 (117-238)||(22072913-22073036)
chr7 (56-238)||(16495402-16495581)
chr7 (139-238)||(16386268-16386369)
chr7 (1-72)||(8468803-8468874)
chr7 (56-238)||(19486681-19486865)
chr7 (116-238)||(67745-67868)
chr7 (4-72)||(23664884-23664952)
chr7 (58-216)||(12255730-12255892)
chr7 (124-238)||(34200786-34200901)
chr7 (124-238)||(47831807-47831922)
chr7 (4-72)||(29796771-29796841)
chr7 (4-72)||(29800590-29800660)
chr7 (88-236)||(40443393-40443541)
chr7 (1-72)||(8940335-8940408)
chr7 (1-72)||(38898156-38898229)
chr7 (126-234)||(44014182-44014291)
chr7 (56-223)||(1867932-1868101)
chr7 (185-238)||(28505366-28505419)
chr7 (77-234)||(18005650-18005806)
chr7 (77-234)||(16219677-16219834)
chr7 (185-234)||(811199-811248)
chr7 (185-238)||(15754955-15755008)
chr7 (124-238)||(11996033-11996148)
chr7 (67-151)||(15113031-15113114)
chr7 (56-219)||(20220127-20220290)
chr7 (56-238)||(10063760-10063939)
chr7 (56-215)||(15008436-15008597)
chr7 (77-223)||(16056343-16056488)
chr7 (67-151)||(15116568-15116651)
chr7 (188-238)||(27847901-27847951)
chr7 (3-52)||(45847691-45847739)
chr7 (185-232)||(18154909-18154956)
chr7 (133-234)||(14932749-14932851)
chr7 (133-234)||(15356184-15356286)
chr7 (133-234)||(15360298-15360400)
chr7 (133-223)||(12901338-12901431)
chr7 (192-223)||(14044761-14044792)
chr7 (192-223)||(14354791-14354822)
chr7 (177-219)||(18203831-18203873)
chr7 (185-234)||(19649557-19649606)
chr7 (185-237)||(2832509-2832561)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (1-235)||(264696-264930)
chr5 (1-235)||(39363384-39363618)
chr5 (1-235)||(10732868-10733102)
chr5 (1-235)||(20909012-20909246)
chr5 (1-235)||(29345980-29346214)
chr5 (1-235)||(32027393-32027627)
chr5 (1-235)||(42245293-42245527)
chr5 (1-235)||(29348453-29348687)
chr5 (1-235)||(29350926-29351160)
chr5 (1-235)||(39245136-39245370)
chr5 (1-235)||(29329934-29330165)
chr5 (1-235)||(20917880-20918110)
chr5 (1-235)||(38619434-38619670)
chr5 (1-234)||(23064512-23064747)
chr5 (56-235)||(36154766-36154942)
chr5 (58-235)||(11581184-11581361)
chr5 (56-235)||(20901991-20902172)
chr5 (56-235)||(2154596-2154776)
chr5 (61-232)||(18319021-18319193)
chr5 (56-235)||(10775659-10775838)
chr5 (56-235)||(31061068-31061248)
chr5 (61-232)||(24067110-24067282)
chr5 (73-238)||(25421532-25421698)
chr5 (73-235)||(24529223-24529386)
chr5 (73-238)||(9077952-9078118)
chr5 (73-238)||(23390451-23390617)
chr5 (73-238)||(1096467-1096633)
chr5 (73-238)||(21729019-21729185)
chr5 (73-238)||(21808344-21808510)
chr5 (73-238)||(24493569-24493734)
chr5 (131-238)||(21997547-21997655)
chr5 (73-238)||(8286797-8286964)
chr5 (73-238)||(25431395-25431560)
chr5 (93-235)||(22412187-22412329)
chr5 (73-238)||(13025311-13025476)
chr5 (73-238)||(13095495-13095660)
chr5 (73-238)||(22075018-22075185)
chr5 (73-219)||(22144068-22144215)
chr5 (4-72)||(9776521-9776589)
chr5 (58-234)||(21565546-21565723)
chr5 (139-238)||(21292992-21293090)
chr5 (56-238)||(40725853-40726037)
chr5 (93-180)||(20766095-20766181)
chr5 (185-238)||(19660903-19660956)
chr5 (185-238)||(21329565-21329618)
chr5 (90-231)||(37723910-37724050)
chr5 (4-72)||(37804834-37804902)
chr5 (1-51)||(17517092-17517142)
chr5 (60-219)||(22178161-22178323)
chr5 (185-234)||(22959600-22959649)
chr5 (185-238)||(36314577-36314630)
chr5 (124-238)||(19668898-19669013)
chr5 (124-219)||(20026945-20027043)
chr5 (129-238)||(21502167-21502277)
chr5 (183-235)||(20806852-20806904)
chr5 (77-238)||(26011995-26012154)
chr5 (140-224)||(18418594-18418678)
chr5 (185-234)||(26704075-26704124)
chr5 (185-234)||(26973808-26973857)
chr5 (1-36)||(2154560-2154595)
chr5 (86-236)||(17517169-17517320)
chr5 (1-36)||(20901955-20901990)
chr5 (177-219)||(26740705-26740747)
chr5 (177-222)||(26732892-26732937)
chr5 (67-163)||(18356389-18356485)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-235)||(13947-14181)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-236)||(9241-9476)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-235)||(136680-136914)
scaffold0028 (1-235)||(139149-139383)
scaffold0028 (1-235)||(144087-144321)
scaffold0028 (1-235)||(134211-134445)
scaffold0028 (1-235)||(141618-141852)
scaffold0028 (113-234)||(132662-132784)
scaffold0028 (134-236)||(62200-62303)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (3-231)||(501088-501316)
scaffold0001 (56-235)||(85562-85742)
scaffold0001 (58-234)||(160688-160864)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (3-237)||(11286-11521)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-235)||(13392-13626)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-237)||(12194-12413)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-235)||(40400-40634)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (43-235)||(82072-82264)
scaffold0037 (58-223)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (56-235)||(158433-158612)
scaffold0003 (73-235)||(339905-340065)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (43-235)||(106-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (56-235)||(16784-16963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (43-235)||(12064-12250)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (56-240)||(9744-9929)
scaffold0145 (73-238)||(32942-33107)
scaffold0145 (73-238)||(38761-38926)
scaffold0145 (3-34)||(9932-9963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (56-232)||(4300-4476)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (43-232)||(1250-1440)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (56-221)||(29946-30111)
scaffold0149 (1-36)||(30112-30147)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (56-219)||(79267-79430)
scaffold0056 (73-237)||(17170-17337)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (56-235)||(4214-4393)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-235)||(38586-38820)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (56-219)||(20363-20524)
scaffold0031 (73-238)||(128751-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (56-235)||(2111-2291)
scaffold0247 (56-238)||(17964-18148)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (56-235)||(161072-161252)
scaffold0007 (56-156)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (73-235)||(22886-23048)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (73-238)||(3106-3271)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (73-236)||(39479-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (73-236)||(75170-75333)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (67-238)||(51913-52085)
scaffold0011 (88-238)||(167948-168099)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (73-238)||(16555-16721)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (73-238)||(13211-13377)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (88-238)||(1018-1169)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (73-231)||(26020-26179)
scaffold0122 (93-235)||(44682-44825)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (73-238)||(4508-4673)
scaffold0228 (73-238)||(12090-12255)
scaffold0228 (73-238)||(22042-22207)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (73-238)||(1851-2017)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (73-237)||(3141-3306)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (74-238)||(16113-16278)
scaffold0120 (73-238)||(32913-33077)
scaffold0120 (73-238)||(45928-46092)
scaffold0120 (176-238)||(17388-17450)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-112)||(6070-6181)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (73-238)||(6076-6245)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (124-238)||(28414-28529)
scaffold0046 (124-238)||(11292-11407)
scaffold0046 (185-238)||(1997-2050)
scaffold0046 (185-238)||(4552-4605)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (73-238)||(4849-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (73-238)||(3470-3636)
scaffold0292 (73-238)||(343-508)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (58-238)||(8472-8650)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (93-235)||(116430-116571)
scaffold0022 (3-72)||(53802-53873)
scaffold0022 (56-219)||(128907-129072)
scaffold0022 (56-107)||(78453-78505)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (73-238)||(25896-26061)
scaffold0026 (73-238)||(39858-40023)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (58-223)||(8481-8650)
scaffold0621 (77-238)||(6535-6695)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (90-238)||(8479-8628)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (56-223)||(27686-27855)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (88-238)||(1952-2103)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (148-238)||(4712-4803)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (73-238)||(39913-40078)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (73-174)||(3485-3586)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (73-220)||(24257-24406)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (56-219)||(13147-13313)
scaffold0357 (56-223)||(16037-16206)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (56-238)||(11464-11648)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (78-151)||(13092-13165)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (56-238)||(38193-38377)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (139-238)||(11464-11564)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (56-219)||(53486-53651)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (73-238)||(10381-10544)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (4-72)||(1591-1659)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (4-72)||(3186-3254)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (88-238)||(32067-32216)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (90-237)||(174767-174913)
scaffold0021 (177-238)||(121766-121827)
scaffold0021 (73-149)||(124675-124751)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (56-238)||(1011-1190)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (73-238)||(15420-15584)
scaffold0114 (1-66)||(27958-28023)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (58-174)||(13157-13274)
scaffold0175 (124-238)||(34123-34238)
scaffold0175 (183-238)||(273-328)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (56-164)||(225482-225590)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (139-238)||(13497-13596)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (56-219)||(12587-12751)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (77-234)||(133-290)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (56-129)||(12039-12112)
scaffold0503 (159-219)||(11982-12042)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (73-158)||(27911-27996)
scaffold0130 (202-237)||(27878-27913)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (58-223)||(10481-10647)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (77-234)||(19268-19424)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-72)||(10815-10886)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (58-234)||(45732-45909)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (73-238)||(20910-21077)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (129-238)||(15788-15898)
scaffold0020 (185-234)||(178898-178947)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (77-226)||(129917-130066)
scaffold0010 (56-219)||(60652-60818)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-72)||(645-718)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-72)||(4231-4304)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-72)||(1254-1327)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (177-238)||(1093-1155)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (56-157)||(7996-8098)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (124-238)||(16282-16395)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (177-238)||(6611-6673)
scaffold0333 (177-238)||(13991-14053)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-72)||(15083-15156)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (124-238)||(7266-7379)
scaffold0106 (1-72)||(15200-15273)
scaffold0106 (124-238)||(1289-1402)
scaffold0106 (185-235)||(15306-15356)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (88-217)||(4545-4675)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (177-238)||(4893-4954)
scaffold0395 (73-162)||(918-1006)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (124-235)||(15664-15776)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (185-238)||(6191-6244)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-72)||(35993-36065)
scaffold0100 (185-234)||(23951-24000)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (117-234)||(2805-2923)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (113-234)||(32102-32224)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (139-238)||(46995-47093)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (117-234)||(14696-14814)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (56-219)||(6220-6386)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (185-234)||(2713-2762)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (124-238)||(12766-12881)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (77-226)||(5655-5803)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (124-234)||(12943-13054)
scaffold0138 (57-146)||(18176-18265)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (56-223)||(25121-25289)
scaffold0123 (56-157)||(620-720)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (117-238)||(32538-32657)
scaffold0034 (73-219)||(51839-51985)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (177-234)||(1086-1144)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (185-235)||(5196-5246)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (88-238)||(1021-1170)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-72)||(6864-6937)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (124-238)||(51582-51695)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (56-157)||(97089-97190)
scaffold0006 (56-157)||(106367-106468)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (185-234)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (185-234)||(36454-36503)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (137-219)||(1051-1134)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (186-234)||(28839-28887)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (117-223)||(10542-10649)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (77-164)||(8090-8176)
scaffold0556 (185-226)||(6824-6865)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (88-174)||(6675-6761)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (56-219)||(267679-267844)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (73-215)||(38339-38483)
scaffold0139 (185-234)||(19980-20029)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (56-223)||(8011-8180)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (56-157)||(1735-1835)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (56-157)||(88-189)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (133-234)||(29558-29660)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (185-234)||(69794-69843)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 70)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Original strand, 32214851 - 32215085
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214851 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 32214950  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214951 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 32215050  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215051 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18809177 - 18808943
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18809177 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 18809078  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18809077 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18808978  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18808977 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23709460 - 23709694
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709460 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 23709559  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23709560 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23709659  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709660 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23711941 - 23712175
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23711941 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 23712040  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23712041 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23712140  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712141 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39682547 - 39682313
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39682547 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 39682448  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39682447 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39682348  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682347 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6726229 - 6725995
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6726229 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 6726130  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6726129 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 6726030  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726029 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23131096 - 23130862
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23131096 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 23130997  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23130996 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23130897  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130896 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23133563 - 23133329
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23133563 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 23133464  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23133463 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23133364  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133363 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26505613 - 26505379
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26505613 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 26505514  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26505513 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 26505414  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505413 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26508091 - 26507857
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26508091 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 26507992  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26507991 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 26507892  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507891 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34402450 - 34402684
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34402450 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 34402549  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34402550 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 34402649  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402650 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 21154988 - 21155219
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21154988 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 21155087  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21155088 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21155187  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155188 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 571631 - 571397
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  571631 tccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 571532  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  571531 aattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 571432  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571431 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23135824 - 23135590
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23135824 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttg 23135725  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23135724 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 23135625  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135624 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24898123 - 24898358
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24898123 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 24898222  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24898223 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 24898322  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898323 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24900606 - 24900841
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24900606 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 24900705  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24900706 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 24900805  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900806 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24903083 - 24903318
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24903083 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 24903182  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24903183 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 24903282  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903283 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24905560 - 24905795
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24905560 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 24905659  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24905660 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 24905759  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905760 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24908035 - 24908270
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24908035 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 24908134  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24908135 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 24908234  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908235 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24368008 - 24367774
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24368008 tccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 24367909  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24367908 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24367809  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367808 ctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28577333 - 28577099
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28577333 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 28577234  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  28577233 aattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaag 28577134  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577133 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 32039426 - 32039660
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32039426 tccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 32039525  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  32039526 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaag 32039625  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039626 ctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22105647 - 22105412
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22105647 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 22105548  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  22105547 aattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 22105448  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105447 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030016
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38967608 - 38967374
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38967608 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattg 38967510  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  38967509 aattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaa 38967410  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967409 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137301
Alignment:
Q  57 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  157 gctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 233  Q
    | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529691
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 24642784 - 24642933
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24642784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 24642883  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642884 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337115
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060513
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076442
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731355
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671830
Alignment:
Q  58 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  158 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     || ||||| |||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738300
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  173 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654507
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285865
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660023
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298933
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  173 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20261450 - 20261381
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261450 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708738
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||| | ||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708658 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103516
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgt 188  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  189 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  157 gctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 112
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040310
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  173 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309108
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| | ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  187 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  162 ttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 10684694 - 10684764
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684694 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23707250 - 23707323
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23707250 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24918269 - 24918196
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918269 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  141 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 25616415 - 25616365
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25616415 tccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791292
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791359 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 143  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175854
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24671154 - 24671081
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24671154 tccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679589
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134326
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Original strand, 32451896 - 32452031
Alignment:
Q  86 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgtt 183  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| |    
T  32451896 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 32451994  T
Q  184 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451995 gtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24681573 - 24681500
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24681573 tccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616192
Alignment:
Q  110 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 208  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || || | |||| ||||||||||| |||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  209 gtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 24529475 - 24529510
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529475 tccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 16413246 - 16413474
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413246 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 16413345  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16413346 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 16413445  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413446 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14409372 - 14409606
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14409372 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 14409471  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409472 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 14409571  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409572 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1484636 - 1484402
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1484636 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 1484537  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1484536 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1484437  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484436 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5853220 - 5853454
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5853220 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 5853319  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5853320 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 5853419  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853420 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20403461 - 20403227
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20403461 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 20403362  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403361 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20403262  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403261 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22001987 - 22001753
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22001987 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 22001888  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22001887 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 22001788  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001787 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15203159 - 15203393
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15203159 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 15203258  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203259 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15203358  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203359 ctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20046123 - 20046357
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20046123 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 20046222  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20046223 aattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20046322  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046323 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4483514 - 4483281
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4483514 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 4483415  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4483414 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaag 4483316  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483315 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4542301 - 4542535
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4542301 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 4542400  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4542401 aactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaag 4542500  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542501 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19896503 - 19896265
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19896503 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt 19896404  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  19896403 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaac 19896304  T
Q  197 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896303 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14824009 - 14823774
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14824009 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 14823910  T
Q  99 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14823909 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactt 14823810  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823809 tgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45290622 - 45290853
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  45290622 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattg 45290721  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  45290722 aattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaa 45290821  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290822 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598188
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19936931 - 19937174
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |    
T  19936931 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgat 19937030  T
Q  99 tgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact 197  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  19937031 tgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact 19937130  T
Q  198 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937131 aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15070794 - 15070571
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||    
T  15070794 tccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaatt 15070695  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15070694 agattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaacta 15070595  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15070594 agctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484430
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 219
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  58 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  158 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223917
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092463
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759255
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818530
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 24485974 - 24486093
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24485974 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24486073  T
Q  103 ttatatgtgaataattgaga 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24486074 ttatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372778
Alignment:
Q  85 atatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgtt 183  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  184 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649164
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536208
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32810165 - 32810054
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32810165 tccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 32810066  T
Q  101 aattatatgtga 112  Q
    ||||||||||||    
T  32810065 aattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875065
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406379
Alignment:
Q  72 ttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 169  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  170 actgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924049
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgt 188  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  189 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919121
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgt 185  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626736
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879352
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508199
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||| || || || ||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597731
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctg-tgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||| |||||| | || |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597654 atgatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 166  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  167 tatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971257
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||  ||||  |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855372
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389571
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396101
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778897
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790594
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520368
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6520384 gattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 38550039 - 38550090
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550039 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140916
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21490995
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23648719 - 23648554
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 171  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  23648719 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatc 23648621  T
Q  172 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||| | ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648620 tgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 32121962 - 32121912
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121962 tccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267096
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  | | |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267029 atgaaccg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 18677993 - 18678221
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgcattactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  18677993 tccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgcattactt 18678083  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
    ||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || || | ||||||||||||||    
T  18678084 gagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaacta 18678183  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678184 agttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439609
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 170  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 17439558  T
Q  171 ctg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439559 ctgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 26355757 - 26355815
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355757 tgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 23760912 - 23760961
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23760912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673716
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  215 ctaagttgatga 226  Q
    ||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121734
Alignment:
Q  110 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 208  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || || | |||||||||||||||| |||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  209 gtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121761 gtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 983474 - 983512
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983474 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 1326965 - 1327042
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttata------tgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1326965 tccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 27472347 - 27472395
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472347 catgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16401958 - 16402020
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttga 61  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||    
T  16401958 tccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 20982655 - 20982710
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtata----tatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  20982655 tccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  26 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22525618 - 22525579
Alignment:
Q  178 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525618 gttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  26 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Original strand, 30676640 - 30676874
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676640 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 30676739  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676740 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 30676839  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676840 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34963605 - 34963371
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963605 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 34963506  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963505 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagtt 34963406  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963405 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12742551 - 12742317
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12742551 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 12742452  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12742451 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 12742352  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742351 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22782461 - 22782227
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22782461 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 22782362  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22782361 aattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 22782262  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782261 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24422781 - 24422547
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24422781 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 24422682  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24422681 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 24422582  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422581 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33862028 - 33861794
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33862028 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 33861929  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33861928 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 33861829  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861828 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33864512 - 33864278
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33864512 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 33864413  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864412 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 33864313  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864312 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8055263 - 8055029
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8055263 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 8055164  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8055163 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaag 8055064  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055063 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18334520 - 18334754
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18334520 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 18334619  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18334620 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18334719  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334720 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19005280 - 19005046
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19005280 tccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 19005181  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005180 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 19005081  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005080 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19858847 - 19859081
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19858847 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 19858946  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19858947 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 19859046  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859047 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1540839 - 1541073
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1540839 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttg 1540938  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1540939 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1541038  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541039 ctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2291108 - 2291342
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2291108 tccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 2291207  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2291208 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 2291307  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291308 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26924568 - 26924802
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26924568 tccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 26924667  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26924668 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 26924767  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924768 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25656863 - 25656629
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25656863 tccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttg 25656764  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25656763 aattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaag 25656664  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656663 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25688736 - 25688502
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25688736 tccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttg 25688637  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  25688636 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaag 25688537  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688536 ctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595549
Alignment:
Q  21 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  121 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  221 tgatgaagatgatga 235  Q
    |||| ||||||||||    
T  1595563 tgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754809
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557054
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852179
Alignment:
Q  57 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  157 gctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448686
Alignment:
Q  61 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  160 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  86 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629476
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060540
Alignment:
Q  76 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 174  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  175 tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409947
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303661
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 19303594  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593773
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361081
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496244
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780348
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287917
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgt 188  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  189 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076700
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638404
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  173 g-ctgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 236
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848114
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
     |||||||  ||||  ||| || || || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 171  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  172 tgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12942432 - 12942363
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942432 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 28289263 - 28289334
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289263 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227632
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18914061 - 18913994
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914061 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18937319 - 18937252
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937319 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245586
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  173 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15875537 - 15875469
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875537 atgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 31630575 - 31630626
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630575 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333339
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394079
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019408
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  176 gtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     ||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652199
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496592
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809003
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc- 174  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| |||||||     
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  175 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920751
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  191 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 23992657 - 23992604
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992657 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22831556 - 22831503
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22831556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 17377778 - 17377814
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377778 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  220 ttga 223  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11185567 - 11185524
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185567 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 19847896 - 19847931
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847896 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992429
Alignment:
Q  126 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 224  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || || | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  225 gaagatgatgat 236  Q
     |||||| ||||    
T  23992440 taagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Original strand, 15041522 - 15041644
Alignment:
Q  90 tgcattacttga-attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttg 187  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || |  | |||    
T  15041522 tgcattacttgagattttat-tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattg 15041620  T
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15041621 ttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076749
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  || ||  |||||||| |  || ||||||||||||| ||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatc 23076817  T
Q  155 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
      | | | |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076816 tggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 4185890 - 4185930
Alignment:
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185890 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4186419 - 4186379
Alignment:
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4186419 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  197 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3515239 - 3515007
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515239 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 3515140  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3515139 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagct 3515040  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515039 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 19618100 - 19618336
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618100 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 19618199  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19618200 aattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 19618299  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618300 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18215202 - 18215436
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18215202 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 18215301  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18215302 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 18215401  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215402 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15118280 - 15118514
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15118280 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 15118379  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15118380 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15118479  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118480 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12235 - 12469
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12235 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 12334  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12335 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 12434  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12435 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52312744 - 52312510
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52312744 tccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 52312645  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52312644 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 52312545  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312544 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19242934 - 19242693
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242934 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattactt 19242835  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19242834 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaa 19242735  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242734 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44615522 - 44615288
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44615522 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 44615423  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44615422 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 44615323  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615322 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 14970641 - 14970871
Alignment:
Q  7 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14970641 attgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattat 14970740  T
Q  107 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14970741 atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcat 14970840  T
Q  207 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970841 gagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18239347 - 18239581
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18239347 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttg 18239446  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18239447 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaag 18239546  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239547 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 50222267 - 50222501
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50222267 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 50222366  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50222367 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaag 50222466  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222467 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1837437 - 1837671
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  1837437 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttg 1837536  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1837537 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 1837636  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837637 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15355252 - 15355483
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15355252 tccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattg 15355351  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15355352 aattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaa 15355451  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355452 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 44773011 - 44773249
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44773011 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 44773110  T
Q  97 cttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaac 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44773111 cttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaac 44773210  T
Q  197 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773211 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464030
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803427
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102214
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610950
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 7641139 - 7641344
Alignment:
Q  20 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 119  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7641139 tatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattg 7641238  T
Q  120 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641239 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7641328  T
Q  220 ttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||| ||||||||||    
T  7641329 ttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929042
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  167 tatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367690
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402703
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371202
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373483
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370018
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223532
Alignment:
Q  59 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  158 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149832
Alignment:
Q  61 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  160 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798774
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088877
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038653
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 233  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377639
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttat 191  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902757
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  217 aagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893703
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873488
Alignment:
Q  126 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  225 gaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353835
Alignment:
Q  62 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  162 ttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |  |  |  ||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270356
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052829
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899891
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240090
Alignment:
Q  75 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 173  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  174 ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374473
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15534412 - 15534343
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534412 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||  |||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36038101 - 36038033
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038101 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  153 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  157 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |  |  ||||| ||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14048808 - 14048740
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048808 atgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 15496999 - 15497070
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15496999 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 52873106 - 52873176
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873106 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 49547705 - 49547773
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547705 atgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706409
Alignment:
Q  129 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  227 agatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  39706398 agatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 362319 - 362268
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362319 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 14746545 - 14746618
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14746545 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 164
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  75 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 164  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551817
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  113 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  211 cggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17046540 - 17046487
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17046540 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  220 ttga 223  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  20 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8846409 - 8846360
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8846409 ttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6190616 - 6190481
Alignment:
Q  86 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgtt 183  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| |    
T  6190616 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 6190518  T
Q  184 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190517 gtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10772
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11007 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactta 10908  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10907 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 10808  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10807 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21841001 - 21840766
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21841001 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactta 21840902  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21840901 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 21840802  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840801 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23593662 - 23593897
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593662 tccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattactt 23593761  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23593762 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 23593861  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593862 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13989100 - 13988866
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13989100 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 13989001  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13989000 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 13988901  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988900 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21923219 - 21923453
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21923219 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 21923318  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21923319 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21923418  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923419 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21475015 - 21475249
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21475015 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 21475114  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21475115 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21475214  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475215 ctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29776922 - 29776688
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29776922 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29776823  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29776822 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29776723  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776722 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29298370 - 29298137
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298370 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29298271  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298270 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29298172  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298171 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16362152 - 16361915
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362152 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattactt 16362053  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16362052 gaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaa 16361953  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361952 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31612547 - 31612313
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31612547 tccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 31612448  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612447 aattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaag 31612348  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612347 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22122995 - 22123230
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22122995 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 22123094  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttg-ttgttatttaactaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  22123095 aattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaa 22123194  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123195 gctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16275291 - 16275526
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16275291 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattg 16275390  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16275391 aattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaa 16275490  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275491 gttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15859936 - 15860177
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||    
T  15859936 tccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattg 15860035  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 199  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15860036 aattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaa 15860135  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  15860136 gctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346961
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342090
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45575008
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213027
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707167
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711709
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433012
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     || ||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgc-ctg-tgttgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389157
Alignment:
Q  61 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  160 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210333
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509783
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250850
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532269
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026680
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 219
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  59 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  158 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  137 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  236 tgt 238  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468816
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754052
Alignment:
Q  113 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 210  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  211 cggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  165 tgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    || |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681011
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295672
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || || ||| | ||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 22050817 - 22050866
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050817 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135188
Alignment:
Q  75 tgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 173  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  174 c-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    | | || || | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454673
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  19 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  222 gatgaagatgatg 234  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  155 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||   | |||| ||||||| || ||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237631
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 52928029 - 52928076
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928029 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27161567 - 27161605
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161567 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 162  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 38801456 - 38801508
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801456 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  60 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Original strand, 21533932 - 21533974
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533932 tgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21161769 - 21161720
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21161769 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 107
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4926 - 4694
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 4827  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4826 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 4727  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4726 gcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13544259 - 13544024
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544259 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 13544160  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544159 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 13544060  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544059 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12567794 - 12567564
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567794 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 12567695  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12567694 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaag 12567595  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567594 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17463412 - 17463178
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17463412 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 17463313  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463312 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 17463213  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463212 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45606835 - 45607069
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45606835 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 45606934  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45606935 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 45607034  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607035 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 7781275 - 7781509
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7781275 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 7781374  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7781375 aattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 7781474  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781475 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8899328 - 8899094
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8899328 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 8899229  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8899228 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 8899129  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899128 ctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9707535 - 9707769
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9707535 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 9707634  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9707635 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaag 9707734  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707735 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34159560 - 34159326
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34159560 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 34159461  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34159460 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 34159361  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159360 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55476725 - 55476491
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  55476725 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 55476626  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55476625 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 55476526  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476525 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6469062 - 6469296
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6469062 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttc 6469161  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6469162 aattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 6469261  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469262 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10247651 - 10247885
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10247651 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 10247750  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10247751 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaag 10247850  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247851 ctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16454209 - 16454443
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16454209 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 16454308  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16454309 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16454408  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454409 ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28848539 - 28848773
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28848539 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttg 28848638  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28848639 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 28848738  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848739 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16282739 - 16282971
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16282739 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 16282838  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16282839 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16282938  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282939 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13154183 - 13154418
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13154183 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 13154282  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13154283 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaa 13154382  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154383 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 38961819 - 38962053
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38961819 tccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 38961918  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38961919 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 38962018  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38962019 ctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41124121 - 41123892
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41124121 tccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 41124022  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  41124021 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgt---tgttatttaactaag 41123925  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123924 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 13151726 - 13151953
Alignment:
Q  9 tgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13151726 tgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13151825  T
Q  109 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151826 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatg 13151925  T
Q  208 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151926 agtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446816
Alignment:
Q  32 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  132 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T
Q  232 atga 235  Q
    ||||    
T  17446813 atga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8499754 - 8499518
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8499754 tccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaatt 8499655  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  8499654 agattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaacta 8499555  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8499554 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15412665 - 15412429
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  15412665 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaatt 15412566  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15412565 agattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaacta 15412466  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15412465 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242822
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672626
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172745
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119887
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550644
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27165486 - 27165250
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  27165486 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatactt 27165387  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaact 197  Q
     |||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||    
T  27165386 aaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaact 27165288  T
Q  198 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165287 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 53301434 - 53301669
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  53301434 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttga 53301533  T
Q  102 attatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaacta 198  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  53301534 attatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaacta 53301632  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301633 agttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972854
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  104 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  204 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686887
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213838
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  173 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840932
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  157 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487856
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499338
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476506
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  173 -gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500942
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  224 tgaagatgatga 235  Q
    | ||||||||||    
T  55500953 ttaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442274
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438534
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083482
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  57 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  156 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 220  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399209
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698556
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576949
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340844
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| |||| | | ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  24340760 atgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424880
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556985
Alignment:
Q  132 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  232 atga 235  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153326
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  173 -gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
      || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  136 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 219
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  157 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |  ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  137 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  234 ga 235  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572602
Alignment:
Q  92 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgtta 190  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  191 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 54521053 - 54520985
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521053 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 29544773 - 29544839
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544773 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 220  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12305376 - 12305315
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305376 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642386
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  37642302 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097332
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  157 g 157  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15977767 - 15977696
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977767 tccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 119
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470928
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  176 gtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103784
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 11913978 - 11914051
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11913978 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307684
Alignment:
Q  113 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  211 cggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45578000
Alignment:
Q  183 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 46822495 - 46822445
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822495 tccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174376
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234487
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| |||||||||||||    
T  14234503 gattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 10557142 - 10557091
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557142 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 49668144 - 49668193
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49668144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822267
Alignment:
Q  110 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 208  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || || | |||||||||||||||| |||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  209 gtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9512973 - 9512924
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9512973 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9520948 - 9520899
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9520948 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  75 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  173 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 1644733 - 1644787
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644733 tgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029855
Alignment:
Q  110 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 208  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || || | |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  209 gtcggtctaagttga 223  Q
    ||| |||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511059
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || || | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  223 atgaagatgatgat 236  Q
    || |||||| ||||    
T  12511072 attaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  26 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 17444744 - 17444773
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatat 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444744 tccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20981 - 20747
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20981 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 20882  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20881 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20782  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20781 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38055 - 37821
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38055 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 37956  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37955 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 37856  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37855 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 94645 - 94411
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  94645 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 94546  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  94545 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 94446  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94445 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 17370 - 17598
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17370 catgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaa 17469  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17470 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagct 17569  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17570 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  76 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  175 tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100378
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119875
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40291
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  176 gtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 101561 - 101503
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101561 tgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 456555 - 456321
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  456555 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 456456  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  456455 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 456356  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456355 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15376641 - 15376875
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15376641 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 15376740  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15376741 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 15376840  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376841 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16232754 - 16232520
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16232754 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 16232655  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16232654 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16232555  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232554 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20385051 - 20385285
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20385051 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 20385150  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20385151 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20385250  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385251 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21189523 - 21189757
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189523 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 21189622  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21189623 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 21189722  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189723 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32125725 - 32125491
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32125725 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 32125626  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32125625 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 32125526  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125525 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41523151 - 41522917
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41523151 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 41523052  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523051 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 41522952  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522951 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41525613 - 41525379
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41525613 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 41525514  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41525513 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 41525414  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525413 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11393215 - 11393448
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11393215 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 11393314  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11393315 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 11393414  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393415 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14949050 - 14949284
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14949050 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 14949149  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14949150 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 14949249  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949250 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18640506 - 18640272
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18640506 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 18640407  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18640406 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18640307  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640306 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27217094 - 27216860
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27217094 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 27216995  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27216994 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 27216895  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216894 ctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24702470 - 24702238
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702470 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24702371  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24702370 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24702271  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702270 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11972729 - 11972496
Alignment:
Q  2 ccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11972729 ccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttga 11972630  T
Q  102 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972629 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagc 11972530  T
Q  202 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972529 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16213916 - 16213684
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213916 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaa 16213817  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213816 ttatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 16213717  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213716 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16410293 - 16410059
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  16410293 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttg 16410194  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410193 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 16410094  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410093 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18430946 - 18430709
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18430946 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 18430847  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430846 aattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 18430747  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430746 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24704917 - 24704688
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24704917 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24704818  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24704817 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24704721  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704720 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13869582 - 13869346
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  13869582 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaatt 13869483  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13869482 agattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaacta 13869383  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13869382 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116509
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647325
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26355909 - 26356156
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26355909 tccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 26356008  T
Q  99 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgttgttgttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || |||||||||||||    
T  26356009 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttg 26356108  T
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26356109 ttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26358361 - 26358608
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26358361 tccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattact 26358460  T
Q  99 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgttgttgttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || |||||||||||||    
T  26358461 tgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttg 26358560  T
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26358561 ttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386333
Alignment:
Q  57 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  157 gctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  86 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062077
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110556
Alignment:
Q  58 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  158 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564482
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  109 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  209 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15081875 - 15082019
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15081875 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaat 15081974  T
Q  99 tgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081975 tgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  116 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698831
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 171  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  172 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227481
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280238
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509189
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456530
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 13841246 - 13841157
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841246 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26211995
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 166  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  167 tatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 238  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589039
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  223 atgaagatgatgatgt 238  Q
      ||||||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 11303478 - 11303409
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303478 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18627796 - 18627717
Alignment:
Q  5 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627796 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 223
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  173 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144093 gagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 16108620 - 16108688
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108620 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 14269990 - 14270061
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14269990 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495402
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  156 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16495485 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386369
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  237 gt 238  Q
    ||    
T  16386368 gt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8468874 - 8468803
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468874 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486865
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  19486781 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  116 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  214 tctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 23664884 - 23664952
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664884 atgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  157 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 216  Q
    |  |   |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47831922 - 47831807
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831922 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 47831824  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| |||||||||||||    
T  47831823 gattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29796841 - 29796771
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796841 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29800660 - 29800590
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800660 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443393
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  187 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8940408 - 8940335
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940408 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 38898156 - 38898229
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38898156 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  126 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  224 tgaagatgatg 234  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatc 1868029  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505419
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005650
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 176  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  177 -tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219834
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996148
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  11996132 gttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220290
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220223 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063939
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || || || |||| | || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008597
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatact-gctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 215  Q
    |||  ||| |||| ||||||  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008534 atgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 151  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847951
Alignment:
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 45847691 - 45847739
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 52  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847691 catgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154956
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932851
Alignment:
Q  133 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T
Q  232 atg 234  Q
    |||    
T  14932849 atg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356286
Alignment:
Q  133 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T
Q  232 atg 234  Q
    |||    
T  15356284 atg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360400
Alignment:
Q  133 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T
Q  232 atg 234  Q
    |||    
T  15360398 atg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  133 ttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18203873 - 18203831
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203873 tgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 264696 - 264930
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  264696 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 264795  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  264796 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 264895  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264896 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39363618 - 39363384
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39363618 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 39363519  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39363518 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39363419  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363418 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10732868 - 10733102
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10732868 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttg 10732967  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10732968 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 10733067  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733068 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20909246 - 20909012
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20909246 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 20909147  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  20909146 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaag 20909047  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909046 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29346214 - 29345980
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29346214 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29346115  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  29346114 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaag 29346015  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346014 ctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32027627 - 32027393
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32027627 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 32027528  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32027527 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaag 32027428  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027427 ttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 42245293 - 42245527
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42245293 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 42245392  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42245393 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 42245492  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245493 ttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29348687 - 29348453
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29348687 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29348588  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  29348587 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaag 29348488  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348487 ctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29351160 - 29350926
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29351160 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29351061  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  29351060 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaag 29350961  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350960 ctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39245370 - 39245136
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39245370 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttg 39245271  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245270 aattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 39245171  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245170 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29330165 - 29329934
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29330165 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 29330069  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29330068 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 29329969  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329968 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20917880 - 20918110
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20917880 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttg 20917979  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20917980 aattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 20918075  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918076 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38619670 - 38619434
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||    
T  38619670 tccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaatt 38619571  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38619570 agattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaacta 38619471  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38619470 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23064747 - 23064512
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattactt 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  23064747 tccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaatt 23064648  T
Q  100 gaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 198  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23064647 agattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaacta 23064548  T
Q  199 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064547 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154942
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctg---tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581361
Alignment:
Q  58 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  158 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902172
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154776
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319193
Alignment:
Q  61 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  160 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775838
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061068
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067110
Alignment:
Q  61 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  160 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421532
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529223
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077952
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390617
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096467
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729185
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808510
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493569
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 238
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  131 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  230 tgatgatgt 238  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286964
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 171  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  172 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431395
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412187
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttat 191  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025311
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095495
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075018
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 238  Q
     | | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  173 gc-tgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9776589 - 9776521
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776589 atgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565546
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293090
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725853
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| ||  |||| |||||| ||  |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  40725937 atgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 180
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 180  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660956
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329618
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723910
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgt-tg 187  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 37804834 - 37804902
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804834 atgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 17517092 - 17517142
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517092 tccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  60 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 156  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  157 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959649
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314577
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668898
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | || ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19668914 gatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactg-ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502277
Alignment:
Q  129 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  227 agatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  21502266 agatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806904
Alignment:
Q  183 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012154
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  140 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 2154560 - 2154595
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154560 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 236
Target Start/End: Original strand, 17517169 - 17517320
Alignment:
Q  86 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg 184  Q
    ||| ||||||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || || |     
T  17517169 tatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgcta 17517268  T
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 20901955 - 20901990
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901955 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 163  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14181 - 13947
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14181 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 14082  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  14081 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaag 13982  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13981 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9476 - 9241
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9476 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactta 9377  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9376 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 9277  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9276 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 136914 - 136680
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  136914 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 136815  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  136814 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 136715  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136714 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 139383 - 139149
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  139383 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 139284  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  139283 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 139184  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139183 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 144321 - 144087
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  144321 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 144222  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  144221 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 144122  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144121 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 134445 - 134211
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  134445 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 134346  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  134345 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 134246  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134245 ctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 141852 - 141618
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  141852 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 141753  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  141752 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 141653  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141652 ctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  113 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 210  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  211 cggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62200
Alignment:
Q  134 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatg 62205  T
Q  232 atgat 236  Q
    |||||    
T  62204 atgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 501316 - 501088
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501316 catgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 501217  T
Q  103 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501216 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 501117  T
Q  203 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501116 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85742
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160688
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11521 - 11286
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11521 catgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 11422  T
Q  102 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagc 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  11421 atcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagt 11322  T
Q  202 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11321 tgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13626 - 13392
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13626 tccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttg 13527  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13526 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 13427  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13426 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12413
Alignment:
Q  18 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  118 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  218 agttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40634 - 40400
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40634 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttg 40535  T
Q  101 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40534 aattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 40435  T
Q  201 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40434 ctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82072
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  157 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    | || ||| | |||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158612
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340065
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 106
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16784
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12064
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  143 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9744
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 240  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32942
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38761
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 9963 - 9932
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9963 catgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4300
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1440
Alignment:
Q  43 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  142 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 30147 - 30112
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17337
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 170  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  171 ctgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4214
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 38586 - 38820
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  38586 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttga 38685  T
Q  102 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaa 199  Q
    ||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  38686 attatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaa 38784  T
Q  200 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38785 ggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  156 tgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128751
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  173 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
      | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2291
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18148
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || || || ||| ||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161252
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  155 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 156
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  155 at 156  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22886
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  173 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3271
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39479
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 39544  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75333
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51913
Alignment:
Q  67 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 166  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  167 tatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168099
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16721
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  173 gct-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13211
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1169
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttat 191  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  192 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4508
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12090
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22042
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1851
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3306
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16113
Alignment:
Q  74 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 173  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  174 c-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33077
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45928
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  176 gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6181 - 6070
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  6181 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttg 6082  T
Q  101 aattatatgtga 112  Q
    ||||||||||||    
T  6081 aattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6245
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  173 gc---tg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28414
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  223 atgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1997
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4849
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3470
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 343
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 238
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8650
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  157 gctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||| |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgc--ctatgttgctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  93 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 192  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  193 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 53802 - 53873
Alignment:
Q  3 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53802 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  155 atg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  |  |||| | ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25896
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39858
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  173 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6535
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8479
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgt 188  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| | ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  189 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  56 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  155 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||||| ||||| |||||  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1952
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| | ||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  148 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39913
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  173 gc 174  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 171  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  172 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 220  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  56 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  154 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  56 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  155 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    ||| || ||||| |||||  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11464
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  78 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38377
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||| || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10544
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatact 10476  T
Q  173 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1591
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1659 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3186
Alignment:
Q  4 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3254 atgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32067
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||| ||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174767
Alignment:
Q  90 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-g 187  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  188 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121766
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 149  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1190
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  156 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || ||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1107 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15584
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  173 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28023 - 27958
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28023 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13157
Alignment:
Q  58 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc 174  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  34139 gttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 273
Alignment:
Q  183 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  155 atgctgtttt 164  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13497
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  155 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 133
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 129  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  159 tgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 158  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  202 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19268
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 10815 - 10886
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10815 tccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45909
Alignment:
Q  58 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 156  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  157 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    | || ||| | ||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20910
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 172  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  173 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    | || ||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15898
Alignment:
Q  129 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15886  T
Q  227 agatgatgatgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  15887 agatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129917
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  176 gtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  155 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||  |||| |||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 645
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  718 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 4231 - 4304
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4231 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 1254 - 1327
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1254 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1155
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1093 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16282
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  16298 gttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6673 - 6611
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6673 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14053 - 13991
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14053 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15156 - 15083
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15156 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7266
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 7283  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  7282 gttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 15200 - 15273
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15200 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1289
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1306  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||||||||||||||    
T  1305 gttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || |||||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  187 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4954
Alignment:
Q  177 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 162  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  222 gatgaagatgatga 235  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6244
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 35993 - 36065
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  35993 tccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 23951 - 24000
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23951 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  113 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 210  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  211 cggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46995
Alignment:
Q  139 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  155 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    ||  |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12881 - 12766
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12881 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagtt 12783  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||  ||||||||||    
T  12782 gatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5655
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 175  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  176 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
     ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12943
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  222 gatgaagatgatg 234  Q
    || || |||||||    
T  12955 gaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  57 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 146  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  56 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 155  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatca 25192  T
Q  156 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    ||  |||||||  |||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  215 ctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 171  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  172 tgc---tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||   |||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatgtgctgt--ttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1144 - 1086
Alignment:
Q  177 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1144 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1170
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  187 g-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 238  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 6864 - 6937
Alignment:
Q  1 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6864 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51582
Alignment:
Q  124 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 221  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51599  T
Q  222 gatgaagatgatgatgt 238  Q
    | |||| ||||||||||    
T  51598 gttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  137 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  117 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 214  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  215 ctaagttga 223  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  77 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 164  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6824
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6865 ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  88 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 174  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 219  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  73 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 170  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  171 ctg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 215  Q
    ||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8180
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatc 8108  T
Q  155 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 223  Q
    |||  ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109 atgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1835
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1735 atttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 1832  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  1833 atg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  56 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 154  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  155 atg 157  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  133 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || |  | ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  232 atg 234  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  185 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University