View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6951_low_3 (Length: 392)

Name: NF6951_low_3
Description: NF6951
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6951_low_3
NF6951_low_3
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-347)||(3409472-3409818)
chr6 (1-347)||(2377939-2378284)
chr6 (126-347)||(29518857-29519078)
chr6 (1-349)||(10073989-10074336)
chr6 (181-347)||(29518495-29518661)
chr6 (181-347)||(32741171-32741337)
chr6 (181-372)||(35210196-35210385)
chr6 (157-347)||(2578443-2578634)
chr6 (181-337)||(3409251-3409407)
chr6 (156-358)||(10074352-10074553)
chr6 (181-371)||(3058218-3058409)
chr6 (156-360)||(16454872-16455078)
chr6 (180-358)||(3415449-3415629)
chr6 (181-347)||(14748342-14748504)
chr6 (191-347)||(2377756-2377912)
chr6 (189-360)||(2579860-2580030)
chr6 (182-347)||(1846741-1846906)
chr6 (160-361)||(2579478-2579678)
chr6 (164-360)||(2578822-2579016)
chr6 (181-337)||(26544041-26544197)
chr6 (181-359)||(1127352-1127530)
chr6 (191-372)||(16454577-16454757)
chr6 (191-338)||(16107680-16107827)
chr6 (157-372)||(2579086-2579297)
chr6 (195-347)||(2843560-2843713)
chr6 (156-359)||(10073604-10073804)
chr6 (191-369)||(5832007-5832182)
chr6 (126-346)||(16107998-16108208)
chr6 (192-344)||(6999799-6999951)
chr6 (189-360)||(593694-593867)
chr6 (192-332)||(1950200-1950340)
chr6 (194-297)||(32460630-32460733)
chr6 (189-343)||(10911565-10911720)
chr6 (195-314)||(9062383-9062501)
chr6 (189-360)||(12071678-12071849)
chr6 (156-308)||(8481893-8482045)
chr6 (189-360)||(12085021-12085191)
chr6 (189-359)||(12092470-12092640)
chr6 (184-341)||(5958613-5958766)
chr6 (156-321)||(6071098-6071264)
chr6 (189-370)||(31714671-31714849)
chr6 (156-262)||(35210456-35210551)
chr6 (193-358)||(17135058-17135223)
chr6 (1-96)||(29518688-29518784)
chr6 (157-305)||(2975521-2975668)
chr6 (126-248)||(33605913-33606034)
chr6 (196-372)||(30618594-30618766)
chr6 (257-301)||(22605301-22605345)
chr6 (293-340)||(3409405-3409452)
chr6 (257-308)||(11637760-11637811)
chr6 (226-272)||(14789279-14789325)
chr6 (257-301)||(21130103-21130147)
chr6 (1-77)||(2579387-2579465)
chr6 (1-88)||(26544234-26544321)
chr6 (281-339)||(10902438-10902496)
chr6 (1-77)||(2578730-2578808)
chr6 (1-77)||(16107865-16107943)
chr6 (314-372)||(2975296-2975353)
chr6 (265-307)||(11638053-11638095)
chr6 (323-373)||(35210554-35210603)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (1-366)||(22304380-22304747)
chr3 (49-330)||(4823515-4823796)
chr3 (102-371)||(37990615-37990884)
chr3 (1-347)||(41359765-41360109)
chr3 (97-341)||(15773099-15773346)
chr3 (157-372)||(54017792-54018008)
chr3 (86-346)||(11661846-11662108)
chr3 (191-357)||(37990967-37991133)
chr3 (191-345)||(43346793-43346947)
chr3 (191-347)||(35946524-35946680)
chr3 (189-372)||(15772854-15773036)
chr3 (189-372)||(42342363-42342546)
chr3 (189-359)||(29644890-29645060)
chr3 (140-347)||(29644581-29644791)
chr3 (156-345)||(42342092-42342283)
chr3 (189-359)||(12114550-12114720)
chr3 (189-347)||(32589704-32589861)
chr3 (189-347)||(33803252-33803410)
chr3 (180-339)||(39934963-39935124)
chr3 (157-347)||(21832345-21832532)
chr3 (189-347)||(54018198-54018356)
chr3 (181-338)||(39389062-39389219)
chr3 (156-339)||(22303963-22304141)
chr3 (189-347)||(25739425-25739583)
chr3 (191-344)||(32462903-32463057)
chr3 (191-372)||(52634678-52634857)
chr3 (156-347)||(32462558-32462752)
chr3 (181-347)||(50612447-50612618)
chr3 (189-348)||(31190017-31190168)
chr3 (189-347)||(53577364-53577522)
chr3 (191-347)||(25755396-25755552)
chr3 (189-371)||(1634291-1634473)
chr3 (127-321)||(3135099-3135293)
chr3 (189-344)||(45395656-45395811)
chr3 (191-347)||(3135454-3135617)
chr3 (157-340)||(9240118-9240300)
chr3 (191-348)||(45901715-45901873)
chr3 (190-347)||(53117975-53118131)
chr3 (189-349)||(39914252-39914412)
chr3 (189-348)||(8327904-8328067)
chr3 (156-244)||(22304213-22304301)
chr3 (181-347)||(37726496-37726654)
chr3 (191-339)||(49336694-49336843)
chr3 (181-348)||(51886553-51886714)
chr3 (247-371)||(22303634-22303759)
chr3 (191-371)||(33175635-33175820)
chr3 (189-347)||(44160547-44160702)
chr3 (1-168)||(22303759-22303927)
chr3 (170-321)||(47964544-47964694)
chr3 (199-371)||(42584800-42584970)
chr3 (263-371)||(41359467-41359575)
chr3 (178-296)||(3384317-3384435)
chr3 (215-313)||(33362327-33362425)
chr3 (189-359)||(39336219-39336387)
chr3 (259-372)||(54017523-54017636)
chr3 (189-347)||(47964915-47965073)
chr3 (192-281)||(7767380-7767469)
chr3 (298-372)||(22304302-22304377)
chr3 (191-307)||(11661537-11661638)
chr3 (192-297)||(46546375-46546480)
chr3 (189-245)||(43346650-43346706)
chr3 (231-317)||(39336000-39336086)
chr3 (231-336)||(12749211-12749316)
chr3 (239-299)||(52634990-52635050)
chr3 (293-346)||(8328374-8328427)
chr3 (192-321)||(25317161-25317290)
chr3 (191-307)||(25991405-25991521)
chr3 (256-307)||(53596027-53596078)
chr3 (256-307)||(53596342-53596393)
chr3 (244-301)||(17731950-17732007)
chr3 (244-301)||(19033181-19033238)
chr3 (269-347)||(43978865-43978947)
chr3 (256-307)||(53596542-53596593)
chr3 (271-347)||(7766783-7766857)
chr3 (256-303)||(48127859-48127906)
chr3 (316-360)||(9239940-9239984)
chr3 (189-221)||(12747878-12747910)
chr3 (257-301)||(16871005-16871049)
chr3 (257-301)||(17735037-17735081)
chr3 (257-301)||(19036306-19036350)
chr3 (1-66)||(53577550-53577616)
chr3 (151-213)||(2299937-2300000)
chr3 (256-301)||(16143505-16143550)
chr3 (260-301)||(16869843-16869884)
chr3 (194-255)||(36986040-36986101)
chr3 (194-255)||(37011479-37011540)
chr3 (320-372)||(41360112-41360164)
chr3 (252-288)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-359)||(3669872-3670229)
chr8 (1-339)||(1013879-1014217)
chr8 (1-372)||(9309166-9309536)
chr8 (180-347)||(3669678-3669845)
chr8 (179-359)||(30441071-30441255)
chr8 (191-345)||(3038292-3038446)
chr8 (167-357)||(34835185-34835377)
chr8 (156-357)||(34835439-34835643)
chr8 (156-357)||(34835705-34835909)
chr8 (156-345)||(40518550-40518738)
chr8 (191-339)||(34834878-34835026)
chr8 (181-371)||(20870550-20870741)
chr8 (123-340)||(45121663-45121881)
chr8 (157-347)||(8918764-8918956)
chr8 (189-337)||(45122067-45122215)
chr8 (181-339)||(1014253-1014411)
chr8 (191-372)||(30359273-30359455)
chr8 (140-343)||(30359558-30359763)
chr8 (189-359)||(45121898-45122068)
chr8 (162-347)||(45122604-45122782)
chr8 (157-349)||(6731872-6732055)
chr8 (167-343)||(9482608-9482784)
chr8 (191-350)||(25561812-25561972)
chr8 (189-347)||(6876862-6877021)
chr8 (189-348)||(9608745-9608904)
chr8 (191-346)||(33113368-33113523)
chr8 (191-347)||(40518071-40518229)
chr8 (157-347)||(45122972-45123164)
chr8 (191-347)||(37544490-37544646)
chr8 (192-347)||(147454-147609)
chr8 (214-360)||(9483174-9483320)
chr8 (191-347)||(1513915-1514071)
chr8 (196-344)||(70277-70425)
chr8 (140-343)||(18371665-18371863)
chr8 (183-341)||(40579512-40579670)
chr8 (189-347)||(5915872-5916025)
chr8 (189-345)||(5420651-5420807)
chr8 (189-344)||(41972158-41972316)
chr8 (199-372)||(18371969-18372142)
chr8 (140-261)||(18372342-18372463)
chr8 (156-337)||(147794-147968)
chr8 (160-347)||(6651476-6651652)
chr8 (189-347)||(9308977-9309139)
chr8 (192-373)||(32640506-32640682)
chr8 (140-261)||(18372785-18372905)
chr8 (140-293)||(18372988-18373139)
chr8 (193-346)||(18380020-18380171)
chr8 (183-347)||(32305478-32305635)
chr8 (189-337)||(4154678-4154824)
chr8 (189-340)||(9507777-9507933)
chr8 (212-326)||(9609108-9609222)
chr8 (144-233)||(18372485-18372574)
chr8 (181-267)||(41416251-41416335)
chr8 (192-302)||(43274824-43274934)
chr8 (156-358)||(4154270-4154472)
chr8 (267-360)||(41129066-41129159)
chr8 (191-307)||(8794113-8794229)
chr8 (189-359)||(9620666-9620834)
chr8 (264-347)||(40579269-40579352)
chr8 (189-338)||(12283873-12284021)
chr8 (271-347)||(8919144-8919220)
chr8 (191-297)||(18372656-18372758)
chr8 (192-279)||(3037776-3037865)
chr8 (193-338)||(43398077-43398225)
chr8 (199-262)||(25561729-25561792)
chr8 (194-294)||(20130454-20130553)
chr8 (189-321)||(5274775-5274907)
chr8 (266-359)||(20995404-20995497)
chr8 (192-356)||(40991756-40991920)
chr8 (283-347)||(43274635-43274699)
chr8 (300-372)||(3037943-3038016)
chr8 (270-327)||(16524446-16524503)
chr8 (225-281)||(18373236-18373292)
chr8 (140-215)||(43274699-43274776)
chr8 (243-330)||(40417733-40417820)
chr8 (289-343)||(18372288-18372342)
chr8 (260-297)||(12156708-12156745)
chr8 (189-246)||(20995502-20995559)
chr8 (189-266)||(33831978-33832055)
chr8 (2-78)||(147637-147715)
chr8 (247-288)||(11442911-11442952)
chr8 (189-221)||(18645713-18645745)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (1-347)||(44290458-44290796)
chr1 (2-369)||(48588465-48588833)
chr1 (1-347)||(26661522-26661871)
chr1 (179-372)||(44290799-44290993)
chr1 (126-358)||(41157311-41157545)
chr1 (1-268)||(3537226-3537492)
chr1 (151-338)||(37556071-37556260)
chr1 (181-347)||(41759475-41759641)
chr1 (181-358)||(3537589-3537765)
chr1 (189-347)||(41142372-41142531)
chr1 (157-348)||(34364891-34365084)
chr1 (158-358)||(22077484-22077683)
chr1 (189-371)||(41156991-41157175)
chr1 (181-343)||(3550712-3550871)
chr1 (162-347)||(11977251-11977438)
chr1 (189-372)||(31767137-31767319)
chr1 (191-344)||(17294579-17294733)
chr1 (180-372)||(45493950-45494146)
chr1 (189-372)||(34364507-34364689)
chr1 (189-347)||(29798199-29798357)
chr1 (1-221)||(50051777-50051997)
chr1 (191-347)||(34649440-34649596)
chr1 (181-372)||(50052000-50052189)
chr1 (189-347)||(5319965-5320123)
chr1 (197-347)||(14318875-14319025)
chr1 (193-372)||(9955911-9956091)
chr1 (190-339)||(40082408-40082556)
chr1 (181-371)||(32168674-32168853)
chr1 (183-315)||(32594748-32594880)
chr1 (189-371)||(45084382-45084557)
chr1 (189-375)||(3875304-3875489)
chr1 (189-360)||(37850588-37850758)
chr1 (186-332)||(38804370-38804516)
chr1 (191-324)||(26661921-26662054)
chr1 (192-338)||(37555733-37555878)
chr1 (189-372)||(66448-66630)
chr1 (189-340)||(24600321-24600472)
chr1 (189-347)||(39066201-39066358)
chr1 (157-356)||(22077101-22077311)
chr1 (157-336)||(66100-66278)
chr1 (195-371)||(5575110-5575284)
chr1 (156-337)||(30630648-30630828)
chr1 (189-372)||(41184382-41184583)
chr1 (189-371)||(24131965-24132143)
chr1 (180-309)||(44043810-44043944)
chr1 (190-341)||(22793279-22793431)
chr1 (199-372)||(5528729-5528902)
chr1 (189-358)||(22077818-22077986)
chr1 (189-369)||(19283434-19283613)
chr1 (191-337)||(45839629-45839779)
chr1 (189-373)||(21378034-21378199)
chr1 (260-347)||(11977015-11977102)
chr1 (1-120)||(48588340-48588459)
chr1 (189-337)||(44685456-44685605)
chr1 (189-360)||(1188574-1188746)
chr1 (259-347)||(50051689-50051776)
chr1 (189-360)||(1187349-1187522)
chr1 (260-371)||(47380143-47380254)
chr1 (204-346)||(44091909-44092051)
chr1 (171-248)||(50469180-50469256)
chr1 (231-307)||(10351202-10351278)
chr1 (216-336)||(4956218-4956340)
chr1 (140-241)||(47379891-47379990)
chr1 (189-236)||(35154150-35154197)
chr1 (189-255)||(4878803-4878869)
chr1 (156-338)||(24448245-24448426)
chr1 (238-283)||(41184152-41184197)
chr1 (288-347)||(4266798-4266855)
chr1 (189-349)||(5996870-5997029)
chr1 (244-304)||(35154046-35154106)
chr1 (3-93)||(11977134-11977224)
chr1 (181-254)||(4266875-4266948)
chr1 (230-346)||(9499020-9499136)
chr1 (271-307)||(12466365-12466401)
chr1 (198-257)||(30630912-30630972)
chr1 (262-308)||(9956212-9956258)
chr1 (282-359)||(30697310-30697387)
chr1 (329-371)||(45084576-45084617)
chr1 (83-174)||(3537495-3537587)
chr1 (271-307)||(31973375-31973411)
chr1 (126-174)||(41184198-41184246)
chr1 (189-325)||(50556451-50556587)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (1-347)||(5542625-5542971)
chr2 (1-340)||(14745300-14745639)
chr2 (157-345)||(37106156-37106344)
chr2 (180-347)||(36178605-36178772)
chr2 (181-372)||(41283450-41283641)
chr2 (181-347)||(14745667-14745833)
chr2 (1-346)||(29676713-29677065)
chr2 (185-347)||(37105920-37106082)
chr2 (179-343)||(5543002-5543166)
chr2 (161-341)||(15880233-15880415)
chr2 (117-296)||(36178320-36178498)
chr2 (191-372)||(6421387-6421567)
chr2 (189-344)||(962598-962753)
chr2 (157-344)||(40679632-40679818)
chr2 (189-372)||(42514649-42514831)
chr2 (156-347)||(6422084-6422268)
chr2 (157-357)||(7598577-7598769)
chr2 (196-347)||(15511495-15511646)
chr2 (189-347)||(35580724-35580881)
chr2 (156-345)||(28531316-28531504)
chr2 (207-347)||(36178171-36178311)
chr2 (191-372)||(6712978-6713160)
chr2 (191-340)||(36005887-36006035)
chr2 (189-372)||(38796592-38796778)
chr2 (194-371)||(33731653-33731831)
chr2 (156-347)||(40733482-40733675)
chr2 (189-371)||(37632575-37632755)
chr2 (156-347)||(40733848-40734040)
chr2 (181-337)||(1769884-1770040)
chr2 (193-328)||(28254258-28254391)
chr2 (200-357)||(40163362-40163520)
chr2 (202-371)||(23346250-23346417)
chr2 (189-348)||(7598228-7598387)
chr2 (109-371)||(3673003-3673249)
chr2 (191-333)||(5367457-5367599)
chr2 (169-297)||(31468800-31468926)
chr2 (157-267)||(38796298-38796410)
chr2 (251-370)||(6421793-6421911)
chr2 (189-296)||(16542449-16542556)
chr2 (197-347)||(29676543-29676687)
chr2 (189-337)||(12529038-12529186)
chr2 (189-371)||(16590888-16591065)
chr2 (159-372)||(30313147-30313359)
chr2 (126-246)||(36785664-36785786)
chr2 (156-306)||(30323430-30323581)
chr2 (192-277)||(31899496-31899581)
chr2 (156-307)||(33561491-33561641)
chr2 (156-359)||(29873525-29873729)
chr2 (261-370)||(3672773-3672882)
chr2 (191-347)||(29874023-29874179)
chr2 (197-301)||(37895107-37895211)
chr2 (192-305)||(31259658-31259774)
chr2 (157-307)||(37894732-37894881)
chr2 (251-343)||(6421688-6421780)
chr2 (242-334)||(36784273-36784365)
chr2 (170-297)||(33953821-33953947)
chr2 (156-296)||(41678419-41678559)
chr2 (192-347)||(9231252-9231407)
chr2 (190-320)||(31385738-31385868)
chr2 (205-294)||(28254165-28254254)
chr2 (157-251)||(42514981-42515078)
chr2 (192-345)||(3594180-3594333)
chr2 (279-360)||(31899090-31899170)
chr2 (253-343)||(35580443-35580534)
chr2 (192-296)||(12910231-12910335)
chr2 (191-237)||(6421306-6421352)
chr2 (189-330)||(33954279-33954419)
chr2 (231-307)||(30312831-30312907)
chr2 (243-302)||(25390313-25390372)
chr2 (256-307)||(28226404-28226455)
chr2 (231-288)||(2336666-2336723)
chr2 (259-307)||(8904498-8904546)
chr2 (260-307)||(28226726-28226772)
chr2 (293-371)||(2109988-2110066)
chr2 (1-66)||(36178513-36178579)
chr2 (156-211)||(40734243-40734300)
chr2 (256-305)||(13792536-13792585)
chr2 (189-225)||(3672719-3672755)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (13-369)||(6500648-6501002)
chr5 (181-372)||(6500443-6500633)
chr5 (97-360)||(3295002-3295266)
chr5 (189-371)||(40296292-40296473)
chr5 (126-373)||(624134-624380)
chr5 (181-371)||(27502013-27502202)
chr5 (181-343)||(18603124-18603286)
chr5 (181-347)||(32487386-32487551)
chr5 (182-347)||(41170627-41170792)
chr5 (186-346)||(36492218-36492378)
chr5 (162-371)||(26074122-26074330)
chr5 (157-358)||(13415750-13415951)
chr5 (192-372)||(25327938-25328118)
chr5 (156-369)||(26074577-26074792)
chr5 (189-347)||(15370099-15370257)
chr5 (192-347)||(3295345-3295498)
chr5 (191-371)||(42405574-42405752)
chr5 (189-369)||(41632782-41632961)
chr5 (180-347)||(9498655-9498821)
chr5 (191-373)||(1028491-1028673)
chr5 (191-359)||(6224198-6224366)
chr5 (196-347)||(11416977-11417128)
chr5 (189-371)||(36568545-36568725)
chr5 (190-347)||(299490-299647)
chr5 (199-343)||(34753029-34753173)
chr5 (189-347)||(12662652-12662810)
chr5 (191-340)||(26075168-26075318)
chr5 (156-359)||(24489194-24489394)
chr5 (189-348)||(35150007-35150165)
chr5 (156-321)||(26074807-26074975)
chr5 (181-347)||(623810-623976)
chr5 (215-360)||(15370428-15370573)
chr5 (201-343)||(33747783-33747925)
chr5 (186-324)||(29549278-29549416)
chr5 (181-327)||(5723811-5723957)
chr5 (157-339)||(38427525-38427697)
chr5 (189-339)||(26590918-26591068)
chr5 (191-345)||(300961-301107)
chr5 (156-321)||(36521922-36522086)
chr5 (191-347)||(35167838-35167994)
chr5 (192-358)||(2411010-2411176)
chr5 (192-347)||(35914852-35915007)
chr5 (156-307)||(36522277-36522427)
chr5 (1-135)||(9498496-9498628)
chr5 (181-264)||(7768842-7768925)
chr5 (156-307)||(31509589-31509742)
chr5 (275-357)||(26900007-26900089)
chr5 (191-284)||(42508614-42508707)
chr5 (191-269)||(26074320-26074398)
chr5 (192-326)||(41635212-41635346)
chr5 (191-346)||(13786002-13786157)
chr5 (203-314)||(31509745-31509857)
chr5 (256-307)||(13042606-13042657)
chr5 (276-347)||(38427306-38427377)
chr5 (191-270)||(39309686-39309764)
chr5 (247-348)||(13785631-13785732)
chr5 (273-325)||(795254-795306)
chr5 (260-327)||(9498343-9498410)
chr5 (1-84)||(32487578-32487661)
chr5 (246-325)||(36527117-36527196)
chr5 (191-284)||(42524719-42524811)
chr5 (247-307)||(32445943-32446003)
chr5 (256-303)||(13112604-13112651)
chr5 (161-224)||(13785732-13785794)
chr5 (192-249)||(6225047-6225104)
chr5 (181-229)||(5660290-5660338)
chr5 (226-314)||(19275566-19275653)
chr5 (269-307)||(13042784-13042822)
chr5 (269-307)||(13112782-13112820)
chr5 (189-231)||(35150747-35150789)
chr5 (189-231)||(35151038-35151080)
chr5 (247-345)||(42435486-42435583)
chr5 (75-128)||(795196-795249)
chr5 (291-343)||(24489583-24489635)
chr5 (157-201)||(15370380-15370426)
chr5 (1-73)||(26075058-26075131)
chr5 (256-307)||(36389016-36389067)
chr5 (271-301)||(5963765-5963795)
chr5 (243-321)||(9510546-9510624)
chr5 (181-238)||(22298956-22299014)
chr5 (287-323)||(795152-795189)
chr5 (279-343)||(5660340-5660405)
chr5 (260-301)||(34103625-34103666)
chr5 (294-347)||(35150810-35150863)
chr5 (257-301)||(41341523-41341567)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (97-347)||(37533011-37533259)
chr7 (2-344)||(14681323-14681663)
chr7 (189-372)||(1085592-1085774)
chr7 (70-308)||(22566702-22566940)
chr7 (102-318)||(7553937-7554154)
chr7 (189-371)||(7517580-7517762)
chr7 (183-372)||(29157559-29157748)
chr7 (157-347)||(30244236-30244428)
chr7 (181-372)||(37533340-37533530)
chr7 (189-347)||(23377-23535)
chr7 (157-373)||(30245043-30245256)
chr7 (196-373)||(11845198-11845374)
chr7 (191-347)||(6054562-6054718)
chr7 (191-359)||(45433243-45433411)
chr7 (189-347)||(40094774-40094932)
chr7 (189-369)||(22567017-22567196)
chr7 (189-339)||(36939741-36939891)
chr7 (102-347)||(45434548-45434794)
chr7 (191-336)||(45754718-45754862)
chr7 (197-337)||(19122740-19122879)
chr7 (189-347)||(24177435-24177593)
chr7 (195-345)||(34218036-34218186)
chr7 (189-371)||(118277-118459)
chr7 (191-360)||(47129097-47129265)
chr7 (189-372)||(8128416-8128599)
chr7 (189-370)||(36622960-36623140)
chr7 (194-347)||(30032572-30032725)
chr7 (192-345)||(9901648-9901799)
chr7 (189-309)||(16569196-16569316)
chr7 (189-309)||(16596346-16596466)
chr7 (189-343)||(40230295-40230449)
chr7 (162-315)||(1085280-1085436)
chr7 (192-324)||(24838724-24838857)
chr7 (192-344)||(20599317-20599471)
chr7 (189-338)||(36534795-36534942)
chr7 (189-347)||(41854635-41854792)
chr7 (210-345)||(37167808-37167937)
chr7 (231-347)||(30253534-30253646)
chr7 (235-371)||(28300229-28300366)
chr7 (157-259)||(30244667-30244771)
chr7 (160-262)||(30255308-30255412)
chr7 (192-341)||(41910592-41910749)
chr7 (270-373)||(47129450-47129551)
chr7 (189-310)||(43241495-43241616)
chr7 (160-262)||(30245463-30245567)
chr7 (189-277)||(28301613-28301701)
chr7 (272-346)||(28300569-28300644)
chr7 (189-257)||(36109007-36109075)
chr7 (277-345)||(37532753-37532821)
chr7 (290-371)||(30244453-30244533)
chr7 (290-371)||(30253671-30253751)
chr7 (194-294)||(44361517-44361616)
chr7 (111-186)||(37532822-37532896)
chr7 (140-307)||(37345868-37346036)
chr7 (157-239)||(40094502-40094583)
chr7 (256-307)||(21416181-21416232)
chr7 (290-372)||(30245256-30245337)
chr7 (299-371)||(7517767-7517839)
chr7 (299-371)||(7518033-7518105)
chr7 (258-306)||(23569043-23569091)
chr7 (1-87)||(37532897-37532984)
chr7 (189-307)||(4124128-4124246)
chr7 (183-226)||(14681281-14681324)
chr7 (257-336)||(40094424-40094503)
chr7 (1-78)||(37533259-37533337)
chr7 (272-334)||(45755010-45755072)
chr7 (256-301)||(21619091-21619136)
chr7 (49-97)||(45697753-45697801)
chr7 (244-347)||(37393114-37393216)
chr7 (191-241)||(36967335-36967385)
chr7 (231-347)||(15902342-15902457)
chr7 (257-301)||(27391815-27391859)
chr7 (1-81)||(45433424-45433505)
chr7 (284-338)||(4719305-4719359)
chr7 (325-371)||(7517982-7518028)
chr7 (1-78)||(28300473-28300550)
chr7 (256-296)||(27598052-27598092)
chr7 (16-77)||(48243356-48243419)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (15-309)||(5181-5477)
scaffold0078 (189-340)||(4982-5133)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (2-347)||(18932747-18933102)
chr4 (156-370)||(36629205-36629418)
chr4 (179-369)||(50630731-50630921)
chr4 (189-372)||(25483336-25483518)
chr4 (181-347)||(41370349-41370515)
chr4 (181-356)||(55933113-55933288)
chr4 (126-360)||(44620595-44620830)
chr4 (189-372)||(10245920-10246102)
chr4 (126-346)||(39404334-39404555)
chr4 (189-344)||(54017596-54017751)
chr4 (158-372)||(22027935-22028150)
chr4 (161-337)||(54108888-54109060)
chr4 (189-372)||(3340807-3340989)
chr4 (189-346)||(1731646-1731803)
chr4 (191-360)||(39792845-39793014)
chr4 (186-347)||(50002423-50002584)
chr4 (189-359)||(36608647-36608817)
chr4 (191-372)||(39404020-39404201)
chr4 (189-337)||(52884695-52884844)
chr4 (159-337)||(52884856-52885038)
chr4 (189-372)||(22028341-22028527)
chr4 (191-346)||(34646648-34646803)
chr4 (181-327)||(49880152-49880297)
chr4 (192-346)||(50459724-50459878)
chr4 (199-347)||(54343006-54343147)
chr4 (198-347)||(44620362-44620511)
chr4 (191-347)||(36572021-36572177)
chr4 (189-356)||(22183253-22183420)
chr4 (189-330)||(4955332-4955473)
chr4 (157-342)||(20826186-20826370)
chr4 (198-347)||(44621011-44621160)
chr4 (208-372)||(54936215-54936377)
chr4 (189-348)||(49076828-49076986)
chr4 (195-372)||(20825842-20826019)
chr4 (102-298)||(2740984-2741180)
chr4 (157-348)||(3244448-3244638)
chr4 (190-357)||(16888804-16888971)
chr4 (189-340)||(32941128-32941279)
chr4 (152-347)||(49076449-49076643)
chr4 (192-348)||(49302907-49303065)
chr4 (188-347)||(54108537-54108694)
chr4 (189-360)||(2740700-2740869)
chr4 (146-347)||(3341083-3341286)
chr4 (190-346)||(16889535-16889691)
chr4 (204-318)||(45496820-45496934)
chr4 (189-344)||(4390102-4390257)
chr4 (165-360)||(43174480-43174677)
chr4 (157-346)||(45489331-45489522)
chr4 (243-347)||(23817679-23817783)
chr4 (191-307)||(41707503-41707618)
chr4 (189-372)||(54741153-54741334)
chr4 (181-312)||(6975489-6975620)
chr4 (189-344)||(34004586-34004739)
chr4 (191-335)||(19504707-19504842)
chr4 (2-121)||(41370543-41370662)
chr4 (189-344)||(51768061-51768216)
chr4 (189-344)||(3700365-3700512)
chr4 (235-345)||(18879852-18879962)
chr4 (229-347)||(43827480-43827597)
chr4 (240-341)||(31691203-31691306)
chr4 (126-255)||(44621361-44621492)
chr4 (202-297)||(54017750-54017845)
chr4 (191-326)||(40067045-40067181)
chr4 (189-347)||(28034229-28034387)
chr4 (69-278)||(10246240-10246436)
chr4 (210-347)||(48111696-48111833)
chr4 (211-347)||(3271806-3271947)
chr4 (194-358)||(760194-760356)
chr4 (231-330)||(15841383-15841482)
chr4 (181-241)||(50788087-50788147)
chr4 (197-255)||(44620304-44620362)
chr4 (189-321)||(23556890-23557022)
chr4 (195-347)||(45489712-45489864)
chr4 (281-347)||(43174233-43174299)
chr4 (256-307)||(11197293-11197344)
chr4 (192-307)||(34544107-34544225)
chr4 (214-345)||(39698944-39699077)
chr4 (173-255)||(44620926-44621011)
chr4 (252-372)||(11783527-11783646)
chr4 (302-372)||(23817430-23817498)
chr4 (160-226)||(41370673-41370738)
chr4 (269-343)||(41370738-41370812)
chr4 (189-277)||(11348396-11348484)
chr4 (195-307)||(15841023-15841134)
chr4 (126-185)||(16889315-16889375)
chr4 (256-307)||(10396198-10396249)
chr4 (256-307)||(10396483-10396534)
chr4 (256-308)||(922485-922537)
chr4 (257-296)||(1868119-1868158)
chr4 (1-91)||(3340992-3341083)
chr4 (299-338)||(19895406-19895445)
chr4 (1-67)||(45496736-45496803)
chr4 (247-305)||(11706584-11706641)
chr4 (255-301)||(51681604-51681650)
chr4 (303-360)||(11702284-11702341)
chr4 (243-303)||(2891864-2891924)
chr4 (189-237)||(45050601-45050649)
chr4 (267-343)||(50787996-50788072)
chr4 (1-77)||(2740876-2740953)
chr4 (256-307)||(11197003-11197054)
chr4 (181-212)||(18933103-18933134)
chr4 (244-287)||(45484774-45484817)
chr4 (317-372)||(45496678-45496733)
chr4 (3-78)||(20826024-20826101)
chr4 (233-307)||(31249896-31249970)
chr4 (265-307)||(41707279-41707321)
chr4 (189-230)||(11706636-11706677)
chr4 (300-337)||(19895533-19895570)
chr4 (252-285)||(29802604-29802637)
chr4 (317-357)||(1731581-1731621)
chr4 (278-374)||(11348236-11348330)
chr4 (271-307)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (1-347)||(147-487)
scaffold0702 (191-347)||(514-670)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (157-373)||(1081-1298)
scaffold0391 (236-307)||(1731-1802)
scaffold0391 (156-240)||(3092-3178)
scaffold0391 (1-81)||(1380-1462)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (102-338)||(5689-5931)
scaffold0734 (189-338)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (157-305)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (189-347)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (191-266)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (191-321)||(39459-39588)
scaffold0113 (156-314)||(39805-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (183-267)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (227-267)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 3409472 - 3409818
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409472 gtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggtcgttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 3409571  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 200  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409572 ggatggcaatacaggcaaagtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 3409671  T
Q  201 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3409672 ttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtg 3409771  T
Q  301 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409772 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 2377939 - 2378284
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2377939 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgcag 2378038  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    ||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2378039 gaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtga 2378136  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2378137 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggt 2378236  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378237 gtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 126 - 347
Target Start/End: Original strand, 29518857 - 29519078
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 225  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518857 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 29518956  T
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29518957 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 29519056  T
Q  326 agcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29519057 agcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10074336 - 10073989
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgtgca 10074237  T
Q  100 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 198  Q
      |||||||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  10074236 acaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtg 10074140  T
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10074139 agttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtgg 10074040  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 349  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074039 tgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210385
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaacag 35210385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2578634 - 2578443
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578634 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 2578536  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578535 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10074553 - 10074352
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074553 tgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10074455  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10074454 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcc 10074355  T
Q  356 cct 358  Q
    |||    
T  10074354 cct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Original strand, 16454872 - 16455078
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16454872 tgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaat 16454971  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16454972 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagct 16455071  T
Q  354 cccctca 360  Q
    |||||||    
T  16455072 cccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 358
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  280 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579860
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca 2579860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 347
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  182 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 281  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  282 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2579678 - 2579478
Alignment:
Q  160 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  2579678 ggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcc 2579580  T
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  2579579 cataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctc 2579480  T
Q  360 ac 361  Q
    ||    
T  2579479 ac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578822
Alignment:
Q  164 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  264 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 359
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454757
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 16454757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 157 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2579297 - 2579086
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |    
T  2579297 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----a 2579202  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 354  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  2579201 ggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctc 2579103  T
Q  355 ccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2579102 ccctca-tgacccaacag 2579086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 195 - 347
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  294 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10073804 - 10073604
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073804 tgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10073708  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 355  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  10073707 gatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcc 10073608  T
Q  356 cctc 359  Q
    ||||    
T  10073607 cctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Original strand, 16107998 - 16108208
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16107998 agcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaa 16108097  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 323  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16108098 agagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgtt 16108185  T
Q  324 ctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  16108186 ataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  289 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 332  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  294 tgtg 297  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgt 314  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071678
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca 12071678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 308
Target Start/End: Original strand, 8481893 - 8482045
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||    
T  8481893 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 308  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  184 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  284 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Original strand, 6071098 - 6071264
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  6071098 tgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 6071196  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071197 atgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 370  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 35210456 - 35210551
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35210456 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagag 35210544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 29518688 - 29518784
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgt 96  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518688 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 29518784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 305
Target Start/End: Original strand, 2975521 - 2975668
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2975521 gatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 305  Q
     |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975618 tgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Original strand, 33605913 - 33606034
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 225  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33605913 agcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaa 33606011  T
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataa 248  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606012 agtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618594
Alignment:
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc-gtgacccaacag 30618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2579465 - 2579387
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2579465 gtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 26544234 - 26544321
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtgg 88  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  26544234 gtattagagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccggtatttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2578808 - 2578730
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2578808 gtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16107865 - 16107943
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16107865 gtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa 16107943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 372
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975353
Alignment:
Q  314 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaacag 2975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  265 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 373
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210603
Alignment:
Q  323 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacaga 35210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 22304380 - 22304747
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22304380 gtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggctccttgttca 22304479  T
Q  100 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304480 ggaacgacgatacaagcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 22304578  T
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304579 agctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 22304678  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304679 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 330
Target Start/End: Original strand, 4823515 - 4823796
Alignment:
Q  49 ttgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagca 147  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4823515 ttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaatggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggagca 4823613  T
Q  148 cgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4823614 cgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttata 4823713  T
Q  248 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823714 agtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37990884 - 37990615
Alignment:
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtga 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  37990884 aacggcgatacatgcaaagt-aaaagcttccgct-tgaggggggcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtga 37990787  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990786 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 37990687  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990686 gtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41360109 - 41359765
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag--caagtggctccttgtgc 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41360109 gtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccg--gcagccggtcgttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctccttgtgc 41360012  T
Q  99 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagt 195  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  41360011 aagaacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagt 41359913  T
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41359912 gtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatg 41359817  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359816 tggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 341
Target Start/End: Original strand, 15773099 - 15773346
Alignment:
Q  97 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 194  Q
    |||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15773099 gcagcaacagcgatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaag 15773197  T
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15773198 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagt 15773297  T
Q  295 gtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773298 gtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 157 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54018008 - 54017792
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018008 gatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54017909  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 354  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  54017908 ggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctc 54017809  T
Q  355 ccctcactgacccaacag 372  Q
    ||| || |||||||||||    
T  54017808 ccc-cagtgacccaacag 54017792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 346
Target Start/End: Original strand, 11661846 - 11662108
Alignment:
Q  86 tggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11661846 tggctccttgtgcagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttg 11661945  T
Q  186 --gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-tt 282  Q
      || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11661946 ttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggttt 11662045  T
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662046 ttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990967
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccc 37990967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773036
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaacag 15773036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342363
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaacag 42342363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29644791 - 29644581
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 236  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29644791 ggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttg 29644692  T
Q  237 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  29644691 aacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgt 29644592  T
Q  337 ggacggtcccc 347  Q
    ||| |||||||    
T  29644591 ggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42342283 - 42342092
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  42342283 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaag 42342184  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342183 aggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 277  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  278 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21832532 - 21832345
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832532 gatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 21832434  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832433 actcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22304141 - 22303963
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  22304141 tgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaag 22304049  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304048 cggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634857
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 52634857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32462752 - 32462558
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32462752 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaa 32462653  T
Q  253 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462652 gatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  276 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  127 gcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 225  Q
    |||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  284 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 9240118 - 9240300
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9240118 gatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagg 9240216  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240217 acccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 349
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 349  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 22304213 - 22304301
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304213 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  291 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 348
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  346 cctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  288 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22303927 - 22303759
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22303927 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttcttgtgca 22303828  T
Q  100 ggaacggcgatacaggc-aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 168  Q
    | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22303827 gcaacggcgattcaggcaaaagtaaaaagcttccgct-ttaggggaacacgttgaattgatggactcaca 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  170 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 269  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  270 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  263 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 362  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  363 gacccaaca 371  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  178 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 277  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  278 aggttttgggtaagagtgt 296  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  215 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 359  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017523
Alignment:
Q  259 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccctaactcccct 54017537  T
Q  359 cactgacccaacag 372  Q
    |  |||||||||||    
T  54017536 ctatgacccaacag 54017523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304377
Alignment:
Q  298 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacag 22304377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  291 gagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  292 agtgtg 297  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 317  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  331 cgatgt 336  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  239 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 321
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  291 gagtgtggtgtctctct 307  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  269 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 303  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239984
Alignment:
Q  316 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 9239984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 53577550 - 53577616
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 66  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  53577550 gtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Original strand, 2299937 - 2300000
Alignment:
Q  151 taaagtgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299937 taaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360112
Alignment:
Q  320 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| || |||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacag 41360112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  252 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3669872 - 3670229
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3669872 gtatcagagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggctccttgtgcag 3669971  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3669972 gaacggcgatacatgcaaagt-aagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtga 3670070  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3670071 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggt 3670170  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670171 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1014217 - 1013879
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1014217 gtatcagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcag 1014118  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014117 gaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 1014019  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  1014018 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgtt 1013919  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013918 gtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 9309166 - 9309536
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9309166 gtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggctccttgtgca 9309265  T
Q  100 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgt 197  Q
    | ||| | ||||||    |||| |||| |||| | |    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  9309266 gcaacagtgatacaaagcaagtaaaaaacttctgttgg--ggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgt 9309363  T
Q  198 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9309364 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtg 9309463  T
Q  298 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  9309464 gtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 9309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  280 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 179 - 359
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441255
Alignment:
Q  179 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  275 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Original strand, 34835185 - 34835377
Alignment:
Q  167 cacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 264  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835185 cacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 34835284  T
Q  265 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835285 actcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 357
Target Start/End: Original strand, 34835439 - 34835643
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835439 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835538  T
Q  253 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835539 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835638  T
Q  353 tcccc 357  Q
    |||||    
T  34835639 tcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 357
Target Start/End: Original strand, 34835705 - 34835909
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835705 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835804  T
Q  253 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835805 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835904  T
Q  353 tcccc 357  Q
    |||||    
T  34835905 tcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Original strand, 40518550 - 40518738
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518550 tgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag 40518648  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518649 gacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  279 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45121881 - 45121663
Alignment:
Q  123 aaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggat 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45121881 aaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggat 45121783  T
Q  221 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 320  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  45121782 aaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggtt 45121683  T
Q  321 gttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45121682 gttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8918956 - 8918764
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918956 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 8918857  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918856 ggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359455
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaacag 30359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 343
Target Start/End: Original strand, 30359558 - 30359763
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 237  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30359558 ggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttga 30359657  T
Q  238 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30359658 acaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtg 30359757  T
Q  338 gacggt 343  Q
    ||||||    
T  30359758 gacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Original strand, 45122604 - 45122782
Alignment:
Q  162 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122604 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 45122696  T
Q  262 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122697 taaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 349
Target Start/End: Original strand, 6731872 - 6732055
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||     
T  6731872 gatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagaga 6731962  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 349  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731963 acccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9482784 - 9482608
Alignment:
Q  167 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 266  Q
    ||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482784 cacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 9482685  T
Q  267 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482684 ccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 350  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 45122972 - 45123164
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  45122972 gatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaaga 45123069  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123070 tgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 214 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  214 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  314 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 196 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18371863 - 18371665
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371863 ggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18371764  T
Q  240 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18371763 a----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 183 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 282  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 345
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371969
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaacag 18371969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18372463 - 18372342
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372463 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372364  T
Q  240 accttataagtaagaggaccca 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18372363 accttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 147794 - 147968
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         
T  147794 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa----- 147888  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147889 ----cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 347
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  160 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 259  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  287 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640506
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| ||||| ||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctca-tgaccaaacaga 32640506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18372905 - 18372785
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372905 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372807  T
Q  240 accttataagtaagaggaccca 261  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18372806 accttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18373139 - 18372988
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373139 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaa 18373040  T
Q  239 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373039 caccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 347
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 340
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 283  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  284 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  212 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 311  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  312 tgtgtggttgttcta 326  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18372574 - 18372485
Alignment:
Q  144 agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372574 agcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  292 agtgtggtgtc 302  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4154472 - 4154270
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4154472 tgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 353  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || ||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagact 4154275  T
Q  354 cccct 358  Q
    |||||    
T  4154274 cccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 360
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  267 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  291 gagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  264 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 338
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  291 gagtgtg 297  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 279  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  266 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 290  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 356  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037943
Alignment:
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacag 3037943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  270 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 327  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  225 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43274776 - 43274699
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274776 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  243 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 147637 - 147715
Alignment:
Q  2 tatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 78  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  147637 tatcagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaag 147715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 288
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44290796 - 44290458
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||||    
T  44290796 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacggtggtacaa--------tggctccttgtgcag 44290705  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290704 gaacgacgatacaggcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 44290606  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44290605 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggt 44290506  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290505 gtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48588833 - 48588465
Alignment:
Q  2 tatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588833 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtcattgtgcagaaagctgcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 48588734  T
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 200  Q
    |||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588733 aacgacgatacatgcaaaat-aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 48588635  T
Q  201 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 300  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48588634 ttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtg 48588535  T
Q  301 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  48588534 tctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaa 48588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26661871 - 26661522
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26661871 gtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggctccttgtgca 26661772  T
Q  100 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtg 196  Q
    | |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||    
T  26661771 gcaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtg 26661673  T
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661672 tgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgt 26661573  T
Q  297 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661572 ggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 179 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290799
Alignment:
Q  179 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  279 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacag 44290799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 126 - 358
Target Start/End: Original strand, 41157311 - 41157545
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157311 agcttccgctctg-ggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 41157409  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 323  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157410 agagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgtt 41157509  T
Q  324 ctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157510 ctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3537492 - 3537226
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtg--gctccttgtg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||     |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3537492 gtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggcagttagtc-----gcagaaagcaagcaacggcggtacaagcagcaagtgtggctccttgtg 3537398  T
Q  98 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 196  Q
    |||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537397 caggaacgacgatacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 3537298  T
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537297 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 151 - 338
Target Start/End: Original strand, 37556071 - 37556260
Alignment:
Q  151 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttata 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37556071 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata 37556170  T
Q  248 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556171 agtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  289 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 157 - 348
Target Start/End: Original strand, 34364891 - 34365084
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364891 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaga 34364990  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34364991 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22077683 - 22077484
Alignment:
Q  158 atggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077683 atggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 22077585  T
Q  258 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22077584 cccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccc 22077485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157175
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  162 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767137
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaacag 31767137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 344
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493950
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  275 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaacag 45493950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364689
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaacag 34364689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50051997 - 50051777
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50051997 gtatcagagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtggttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtgcag 50051898  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||  || |||||||| | | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50051897 gaacggcgatactggcaaagt-aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtga 50051799  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50051798 gttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052000
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 50052000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 347
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  297 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 372
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956091
Alignment:
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc-gtgacccaacag 9956091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168674
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875304
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagatt 375  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctca-tgacctaacagatt 3875304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  186 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66448
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctca-tgacccaacag 66448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22077311 - 22077101
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacacctt 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||    
T  22077311 gatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaatacctt 22077213  T
Q  245 ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077212 ataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 22077113  T
Q  345 ccctaggctccc 356  Q
    ||| ||||||||    
T  22077112 ccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 66278 - 66100
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66278 gatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaaga 66180  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 336  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66179 ggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30630828 - 30630648
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30630828 tgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagag 30630730  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630729 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184382
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 279  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  280 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 370  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  371 ag 372  Q
    ||    
T  41184383 ag 41184382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  274 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 341
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528729
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
     |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||  ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaacag 5528729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378034
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaacaga 21378034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48588459 - 48588340
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||    
T  48588459 gtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctccttgtgcag 48588360  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48588359 gaacggcgatacaggcaaag 48588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 360  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  259 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187349
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctca 360  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380143
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  360 actgacccaaca 371  Q
    | ||||||||||    
T  47380154 attgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 346
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  204 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 303  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  304 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469180
Alignment:
Q  171 tgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 336
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  216 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 313  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  314 tgtggttgttctagcctcgatgt 336  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47379990 - 47379891
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 239  Q
    |||||||||| | || || |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  47379990 ggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttgat--gcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaac 47379893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Original strand, 24448245 - 24448426
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  24448245 tgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagag 24448343  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    | | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  24448344 ggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  238 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 349  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 11977134 - 11977224
Alignment:
Q  3 atcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcct 93  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11977134 atcagagcc-cggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  230 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 329  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  330 tcgatgtggacggtccc 346  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  198 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 257  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  262 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 308  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 359
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  282 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 371
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  329 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3537587 - 3537495
Alignment:
Q  83 aagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| || || ||||||||||  || |||||||| | | |  |||||||||||||||||||    
T  3537587 aagtggctccttgtgcaagaacgacgacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41184246 - 41184198
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 174  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41184246 agcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 325  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5542971 - 5542625
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5542971 gtatcagagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctccttgtgcag 5542872  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggga-gcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542871 gaacagcgatacaggcaaagttaga-gcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 5542773  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5542772 gttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggt 5542673  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542672 gtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14745639 - 14745300
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14745639 gtatcagagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatcgttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggctccttgtgcag 14745540  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14745539 gaacggcgatacagacaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgtga 14745442  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14745441 gttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggc 14745342  T
Q  300 gtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745341 gtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 157 - 345
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  280 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283450
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaacag 41283450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 29676713 - 29677065
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||   ||| ||||| || | ||| |||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29676713 gtatcagagccccggttcaacgaagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtgca 29676812  T
Q  100 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgt 197  Q
    | |||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||    
T  29676813 gcaacggaaatacaagcaa-gtaaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgt 29676911  T
Q  198 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  29676912 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaaga 29677011  T
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677012 gtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 347
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  185 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  285 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  179 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  279 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 161 - 341
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  161 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  259 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 117 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36178498 - 36178320
Alignment:
Q  117 aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 216  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36178498 aaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacattaaagtgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttc 36178400  T
Q  217 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178399 ggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421567
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 6421567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40679818 - 40679632
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40679818 gatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagaga 40679720  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679719 acccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514831
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 42514831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 6422084 - 6422268
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6422084 tgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagag 6422176  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422177 gacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 357
Target Start/End: Original strand, 7598577 - 7598769
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598577 gatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 7598676  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 356  Q
    ||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7598677 acccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctccc 7598768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 196 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28531504 - 28531316
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28531504 tgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagag 28531406  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531405 gtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  207 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  307 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713160
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaacag 6713160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796592
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  289 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc--cctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccctccaaggctcccc-caatgacccaacag 38796592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 371
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731831
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  294 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 40733482 - 40733675
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733482 tgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaag 40733581  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733582 aggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 40733848 - 40734040
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733848 tgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaag 40733947  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733948 agggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 328  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  202 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  302 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 3673003 - 3673249
Alignment:
Q  109 atacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaag-gggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttata 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3673003 atacatgcaaagt-aaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttata 3673101  T
Q  206 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 305  Q
    |||||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  3673102 tgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctct 3673184  T
Q  306 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673185 cttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  169 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 266  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  267 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38796410 - 38796298
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796410 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T
Q  255 ggacccataaacc 267  Q
    ||||| |||||||    
T  38796310 ggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 370
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  251 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  351 gctcccctcactgacccaac 370  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  289 aagagtgt 296  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 347
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  297 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 372
Target Start/End: Original strand, 30313147 - 30313359
Alignment:
Q  159 tggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313147 tggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagg 30313244  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 356  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||  ||||| |    
T  30313245 acccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctc 30313344  T
Q  357 ctcactgacccaacag 372  Q
    |||  |||||||||||    
T  30313345 ctc-gtgacccaacag 30313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36785786 - 36785664
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785786 agcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 36785687  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36785686 atagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 306
Target Start/End: Original strand, 30323430 - 30323581
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||    
T  30323430 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgag 30323528  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 306  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323529 aggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33561641 - 33561491
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33561641 tgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagag 33561543  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561542 gacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29873729 - 29873525
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |    
T  29873729 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 353  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggct 29873531  T
Q  354 cccctc 359  Q
    ||||||    
T  29873530 cccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 370
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672882
Alignment:
Q  261 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  361 ctgacccaac 370  Q
     |||||||||    
T  3672873 gtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  297 ggtgt 301  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  289 aagagtgtggtgtctct 305  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37894881 - 37894732
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  37894881 gatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaag 37894783  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894782 actcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 343
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  251 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  242 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  170 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 269  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  33953947 ttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctg 33953849  T
Q  270 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953848 ttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41678559 - 41678419
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41678559 tgatggactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgag 41678461  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678460 aggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 320
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 320  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  205 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 42514981 - 42515078
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514981 gatggactcacatttgagggggagtgttg-tgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  279 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  253 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 296
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  292 agtgt 296  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  243 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 302  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  259 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 371
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36178579 - 36178513
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  36178579 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 36178513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 40734243 - 40734300
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734243 tgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 305  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 6500648 - 6501002
Alignment:
Q  13 cggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatac 112  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  6500648 cggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggctccttatgtaggaacgccgatac 6500747  T
Q  113 aggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 211  Q
    || |||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6500748 ag-caaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc- 6500844  T
Q  212 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6500845 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttact 6500944  T
Q  312 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6500945 tgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaa 6501002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500633
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaacag 6500633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3295266 - 3295002
Alignment:
Q  97 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgca 192  Q
    |||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  3295266 gcagcaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgca 3295169  T
Q  193 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3295168 agtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatga 3295070  T
Q  293 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295069 gtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 624134 - 624380
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 225  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  624134 agcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaat 624232  T
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  624233 agtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttct 624332  T
Q  326 agcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||  | ||||||||||||    
T  624333 agcctcgatgtggacggttccccgagctccccctagtgacccaacaga 624380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 347
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  182 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 281  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  282 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  186 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074122
Alignment:
Q  162 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  262 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctc 26074132  T
Q  362 tgacccaaca 371  Q
    ||||||||||    
T  26074131 tgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 157 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13415951 - 13415750
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415951 gatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 13415853  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 354  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||    
T  13415852 ggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctc 13415754  T
Q  355 ccct 358  Q
    ||||    
T  13415753 ccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328118
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaacag 25328118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 369
Target Start/End: Original strand, 26074577 - 26074792
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | |||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagct 26074776  T
Q  354 cccctcactgacccaa 369  Q
    |||||| |||||||||    
T  26074777 cccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  180 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  280 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028491
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaacaga 1028491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 196 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 347
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 289  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24489394 - 24489194
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  24489394 tgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga- 24489297  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||    
T  24489296 -acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcc 24489198  T
Q  356 cctc 359  Q
    ||||    
T  24489197 cctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26074975 - 26074807
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26074975 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtagg 26074876  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074875 aggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 360
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  215 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 314  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  315 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  201 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  301 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  186 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 324  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 327  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 339
Target Start/End: Original strand, 38427525 - 38427697
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38427525 gatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagg 38427614  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427615 acccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 345
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36522086 - 36521922
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||||    
T  36522086 tgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagag 36521988  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521987 gacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 358
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36522427 - 36522277
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  36522427 tgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagag 36522329  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522328 gaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9498628 - 9498496
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9498628 gtatcagagccccg-ttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgtgcag 9498530  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgct 135  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9498529 gaacggtgatacatgcaaagt-aagagcttccgct 9498496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Original strand, 31509589 - 31509742
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31509589 tgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgag 31509687  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509688 aggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  275 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 284  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 326  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 314
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  203 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  302 ctctcttgcttgt 314  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  276 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 270
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  347 ct 348  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  273 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 327  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 32487578 - 32487661
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaa 84  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32487578 gtatcagagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagccgatcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  246 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 325  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 284  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 307
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 303
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13785794 - 13785732
Alignment:
Q  161 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785794 gactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 249  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  226 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 314  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  269 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  269 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 345
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 795249 - 795196
Alignment:
Q  75 caagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagc 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  795249 caagcagcaagtggctccttgtgcagcaacggtgatacagacaaagtaaaaagc 795196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 343
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 201
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26075131 - 26075058
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggt 73  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26075131 gtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 301
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  243 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 238  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  287 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  279 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 343  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  260 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  294 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 97 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37533259 - 37533011
Alignment:
Q  97 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 196  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533259 gcagcaacggcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtg 37533161  T
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37533160 tgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgt 37533062  T
Q  297 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533061 ggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681663
Alignment:
Q  2 tatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 101  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctccttatgcagg 14681422  T
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg--agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    || ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||  |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14681423 aa-ggcgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaa 14681520  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14681521 gttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggt 14681620  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681621 gtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085592
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaacag 1085592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22566940 - 22566702
Alignment:
Q  70 cggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacac 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||     
T  22566940 cggtacaagaagcaagtggctccttgtgcagcaacgacaatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacat 22566842  T
Q  170 ttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 267  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566841 ttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 22566742  T
Q  268 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566741 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 318
Target Start/End: Original strand, 7553937 - 7554154
Alignment:
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 199  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7553937 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 7554035  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554036 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggt 7554135  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtgg 318  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7554136 gtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 183 - 372
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157748
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  283 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaacag 29157748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Original strand, 30244236 - 30244428
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244236 gatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaaga 30244335  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244336 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533340
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-gtgacccaacag 37533340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 373
Target Start/End: Original strand, 30245043 - 30245256
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245043 gatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245142  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 354  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||    
T  30245143 cgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctc 30245238  T
Q  355 ccctcactgacccaacaga 373  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  30245239 ccctc-gtgacccaacaga 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845374
Alignment:
Q  196 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  296 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 373  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc-cagtgacccaacaga 11845374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567017
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaa 22567017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 339  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 347
Target Start/End: Original strand, 45434548 - 45434794
Alignment:
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 200  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||    
T  45434548 aacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaag 45434647  T
Q  201 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45434648 ttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 45434747  T
Q  301 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434748 tctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 336
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  297 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 195 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  289 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 360
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129265
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca 47129265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128416
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaacag 8128416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 370  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 347
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  294 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1085436 - 1085280
Alignment:
Q  162 actcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  1085436 actcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaac 1085337  T
Q  259 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085336 ccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 324  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 344
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 345
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  210 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  310 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 347
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  331 cgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 235 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  235 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  334 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 259
Target Start/End: Original strand, 30244667 - 30244771
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30244667 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T
Q  255 ggacc 259  Q
    |||||    
T  30244767 ggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 262
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  160 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  258 cccat 262  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  284 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 341  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 373
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129551
Alignment:
Q  270 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T
Q  370 caga 373  Q
    ||||    
T  47129548 caga 47129551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgc 310  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 262
Target Start/End: Original strand, 30245463 - 30245567
Alignment:
Q  160 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30245463 ggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30245562  T
Q  258 cccat 262  Q
    |||||    
T  30245563 cccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  272 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 257  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  277 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 371
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 371
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37532896 - 37532822
Alignment:
Q  111 acaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgg 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532896 acaggcaaagtaaaaagcttccgctata-ggggaacacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 307
Target Start/End: Original strand, 37345868 - 37346036
Alignment:
Q  140 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 237  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| |    
T  37345868 ggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaa 37345966  T
Q  238 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345967 acattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40094583 - 40094502
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 239  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094583 gatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 372
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245337
Alignment:
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaacag 30245337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  258 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37532984 - 37532897
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtg 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||    
T  37532984 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctct 307  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 336  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37533337 - 37533259
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  37533337 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaag 37533259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  272 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 334  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 97
Target Start/End: Original strand, 45697753 - 45697801
Alignment:
Q  49 ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 97  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45697753 ttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgtg 45697801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  344 cccc 347  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 347
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  331 cgatgtggacggtcccc 347  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 45433424 - 45433505
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 81  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45433424 gtatcagagcc-cggttcgacaaagggtacgaccgaggcagctggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggttcaagtag 45433505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  284 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 371
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  325 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 371  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28300550 - 28300473
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc-attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 78  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  28300550 gtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 28300473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  16 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 77  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5477
Alignment:
Q  15 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 114  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5181 gttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggtcgttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 5280  T
Q  115 gcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccc 211  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  5281 gcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttcc 5379  T
Q  212 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5380 acatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 340
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18932747
Alignment:
Q  2 tatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggtggttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 18933003  T
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 200  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||  |||||| |||| | | ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18933002 aacggcgatacaggtaaaat-aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgag 18932905  T
Q  201 ttatatgtcccacatcgg-----------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932904 ttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggta 18932805  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932804 agagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 156 - 370
Target Start/End: Original strand, 36629205 - 36629418
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36629205 tgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagag 36629303  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  36629304 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcc 36629403  T
Q  356 cctcactgacccaac 370  Q
    ||||| |||||||||    
T  36629404 cctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630731
Alignment:
Q  179 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  279 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483518
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaacag 25483518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 181 - 347
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 126 - 360
Target Start/End: Original strand, 44620595 - 44620830
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620595 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaa 44620694  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 323  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620695 atagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T
Q  324 ctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620794 atatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246102
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacag 10246102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Original strand, 39404334 - 39404555
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    ||||||||||  | || ||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404334 agcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 39404432  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 323  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404433 agagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 39404532  T
Q  324 ctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39404533 ctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027935
Alignment:
Q  158 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 355  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcc 22027951  T
Q  356 cctcactgacccaacag 372  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22027950 cctca-tgacccaacag 22027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 337
Target Start/End: Original strand, 54108888 - 54109060
Alignment:
Q  161 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108888 gactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 54108984  T
Q  261 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54108985 ataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340989
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaacag 3340989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 347
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  186 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  286 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 359  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 372
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404201
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacag 39404201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 159 - 337
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  159 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028341
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 286  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  287 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacag 22028341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 181 - 327
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 346
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  292 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  199 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  198 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  298 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Original strand, 20826186 - 20826370
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20826186 gatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagaga 20826284  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 342  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826285 acccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  198 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  298 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936377
Alignment:
Q  208 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  308 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 54936377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826019
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| |||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacag 20826019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 298
Target Start/End: Original strand, 2740984 - 2741180
Alignment:
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggag--cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||  || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  2740984 aacggcgatacgagcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtga 2741081  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741082 gttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 157 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3244638 - 3244448
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 256  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3244638 gatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagg 3244540  T
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244539 acccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 340  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49076643 - 49076449
Alignment:
Q  152 aaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076643 aaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataag 49076544  T
Q  250 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076543 taagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 348  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  188 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  287 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 360
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341286
Alignment:
Q  146 cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  344 cccc 347  Q
    ||||    
T  3341283 cccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  190 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  204 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  304 ctcttgcttgtgtgg 318  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174677
Alignment:
Q  165 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 261  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  262 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45489522 - 45489331
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45489522 gatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaag 45489423  T
Q  254 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 346  Q
    || || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489422 agaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  243 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 342  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  343 tcccc 347  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  291 gagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741153
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaacag 54741153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 280  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 335  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Original strand, 41370543 - 41370662
Alignment:
Q  2 tatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 101  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41370543 tatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtcgttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagctccttgtgcagg 41370642  T
Q  102 aacggcgatacaggcaaagt 121  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  41370643 aacggcgatacaggtaaagt 41370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 344  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  235 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  335 gtggacggtcc 345  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  229 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 328  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  329 ctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  240 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  338 gacg 341  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 255
Target Start/End: Original strand, 44621361 - 44621492
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 223  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44621361 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaa 44621460  T
Q  224 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621461 acagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  202 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 289  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  290 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 326  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 278
Target Start/End: Original strand, 10246240 - 10246436
Alignment:
Q  69 gcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 168  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||              |||||||     
T  10246240 gcggtacaagcaacaagtggcttcttgtgcagcaatggctatacatgcaaagtaaaaagcttccactcta-ggggagc--------------gactcacg 10246324  T
Q  169 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 266  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10246325 cttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaac 10246424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  210 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 309  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  310 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 347
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  211 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 306  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  307 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 358
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  194 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  294 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 358  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  231 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 330  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 255
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  197 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  281 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 307
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  192 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 288  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  214 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  312 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 345  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  173 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783527
Alignment:
Q  252 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  352 ctcccctcactgacccaacag 372  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaacag 11783527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817430
Alignment:
Q  302 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaacag 23817430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  160 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  269 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 277  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  195 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 294  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  295 gtggtgtctctct 307  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16889375 - 16889315
Alignment:
Q  126 agcttccgctctaaggggagcacg-ttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 185  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889375 agcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 296
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  257 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 3340992 - 3341083
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 91  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||    
T  3340992 gtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggctc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 338
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  299 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 45496736 - 45496803
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaac 67  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  45496736 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaac 45496803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  247 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 305  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 301
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 301  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  303 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  243 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  267 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 343  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 2740876 - 2740953
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 77  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2740876 gtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaa 2740953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  181 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 287
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  244 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 287  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 372
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496733
Alignment:
Q  317 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaacag 45496733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Original strand, 20826024 - 20826101
Alignment:
Q  3 atcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 78  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20826024 atcagagccccaattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaag 20826101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  233 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  265 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 337
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  252 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  317 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 357  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11348330 - 11348236
Alignment:
Q  278 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagat 374  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| | |  ||||||||| |||||| ||||||    
T  11348330 aggtttttggtaagagtgtg-tgtctctctcacttatgtggttgttcaagtctcgatgtgaaaggtcctcca-actcccctcagtgacccgacagat 11348236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  271 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 147
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  487 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgcag 388  T
Q  101 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 199  Q
    ||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  387 gaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtga 290  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  289 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtggt 195  T
Q  300 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194 gtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  291 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 157 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1298 - 1081
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  1298 gatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaa 1199  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  1198 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctc 1099  T
Q  355 ccctcactgacccaacaga 373  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  1098 ccc-cagtgacccaacaga 1081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  236 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 3092
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3178 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1380
Alignment:
Q  1 gtatcagagcctcggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1462 gtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaagtag 1380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 338
Target Start/End: Original strand, 5689 - 5931
Alignment:
Q  102 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 199  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5689 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 5787  T
Q  200 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagt 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||    
T  5788 gttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagt 5887  T
Q  295 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5888 gtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 338
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  288 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17648 - 17496
Alignment:
Q  157 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17648 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaaga 17549  T
Q  255 ggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17548 ggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  189 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 288  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  289 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 347  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  191 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  291 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 321  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 39805 - 39963
Alignment:
Q  156 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| |||     
T  39805 tgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagat 39904  T
Q  256 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 314  Q
    ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39905 gagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 267
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  183 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 267  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  227 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University