View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6961_low_1 (Length: 861)

Name: NF6961_low_1
Description: NF6961
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6961_low_1
NF6961_low_1
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (16-492)||(2433-2909)
scaffold0260 (532-666)||(2949-3083)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (16-492)||(20340110-20340586)
chr1 (16-492)||(20461085-20461561)
chr1 (16-492)||(28151866-28152342)
chr1 (16-492)||(16207806-16208282)
chr1 (532-853)||(20460748-20461069)
chr1 (532-853)||(16208319-16208640)
chr1 (16-492)||(41793083-41793559)
chr1 (83-492)||(10962674-10963083)
chr1 (16-492)||(28584985-28585461)
chr1 (16-492)||(51638222-51638698)
chr1 (532-666)||(20340626-20340760)
chr1 (554-852)||(41793624-41793922)
chr1 (587-801)||(10962362-10962576)
chr1 (587-801)||(51637910-51638124)
chr1 (587-792)||(28584682-28584887)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (16-492)||(16626322-16626798)
chr3 (16-492)||(18530354-18530830)
chr3 (16-492)||(31033933-31034409)
chr3 (16-492)||(32292718-32293194)
chr3 (16-492)||(5652353-5652829)
chr3 (24-492)||(4625910-4626378)
chr3 (532-853)||(16626838-16627158)
chr3 (24-492)||(17993608-17994076)
chr3 (532-853)||(18529999-18530320)
chr3 (24-489)||(5713196-5713661)
chr3 (24-489)||(5724106-5724571)
chr3 (24-489)||(5767797-5768262)
chr3 (16-492)||(8295938-8296414)
chr3 (16-492)||(18051228-18051704)
chr3 (71-489)||(5756954-5757371)
chr3 (16-492)||(15740910-15741386)
chr3 (16-492)||(15892522-15892998)
chr3 (16-492)||(18330635-18331111)
chr3 (16-492)||(8301083-8301559)
chr3 (16-492)||(6192282-6192758)
chr3 (16-492)||(4721597-4722073)
chr3 (16-492)||(4796469-4796945)
chr3 (16-492)||(29148571-29149047)
chr3 (16-492)||(35880732-35881208)
chr3 (551-841)||(15893060-15893350)
chr3 (16-492)||(7073178-7073654)
chr3 (83-492)||(4416885-4417294)
chr3 (83-492)||(22387461-22387870)
chr3 (16-492)||(18292169-18292645)
chr3 (83-492)||(28115837-28116246)
chr3 (16-492)||(18276868-18277344)
chr3 (16-492)||(18307470-18307946)
chr3 (16-492)||(10396099-10396575)
chr3 (551-852)||(8301618-8301919)
chr3 (16-489)||(36996893-36997366)
chr3 (16-489)||(48465896-48466369)
chr3 (16-491)||(6542278-6542753)
chr3 (551-852)||(8295578-8295879)
chr3 (16-489)||(11110165-11110638)
chr3 (551-852)||(18050865-18051166)
chr3 (16-492)||(21674659-21675135)
chr3 (83-489)||(29664853-29665259)
chr3 (551-852)||(4797007-4797308)
chr3 (551-852)||(15741436-15741737)
chr3 (16-489)||(20576663-20577136)
chr3 (16-492)||(5609138-5609614)
chr3 (16-492)||(28021241-28021717)
chr3 (16-429)||(51782052-51782465)
chr3 (16-492)||(28339268-28339744)
chr3 (83-490)||(5466953-5467360)
chr3 (16-483)||(8211713-8212180)
chr3 (83-492)||(4346570-4346979)
chr3 (83-492)||(47023419-47023828)
chr3 (16-492)||(17984772-17985248)
chr3 (16-492)||(31964289-31964765)
chr3 (16-492)||(32439120-32439596)
chr3 (16-491)||(20066010-20066485)
chr3 (551-852)||(35880369-35880670)
chr3 (16-491)||(18242706-18243181)
chr3 (121-492)||(50133992-50134363)
chr3 (83-492)||(22870739-22871148)
chr3 (83-492)||(22885798-22886207)
chr3 (16-483)||(5013687-5014154)
chr3 (16-491)||(5596173-5596648)
chr3 (554-852)||(4721234-4721532)
chr3 (83-492)||(7996528-7996937)
chr3 (83-492)||(10643036-10643445)
chr3 (16-417)||(24328200-24328601)
chr3 (551-852)||(29149109-29149410)
chr3 (551-852)||(18330277-18330573)
chr3 (554-852)||(6191919-6192217)
chr3 (83-492)||(18225157-18225566)
chr3 (121-429)||(51797141-51797450)
chr3 (543-852)||(8211344-8211653)
chr3 (542-666)||(17994126-17994250)
chr3 (554-852)||(28116314-28116612)
chr3 (551-666)||(4625736-4625851)
chr3 (554-852)||(7072815-7073113)
chr3 (543-852)||(18277398-18277707)
chr3 (543-852)||(18292699-18293008)
chr3 (543-852)||(18308000-18308309)
chr3 (542-666)||(5652179-5652303)
chr3 (543-762)||(20065739-20065958)
chr3 (543-841)||(10395750-10396048)
chr3 (554-852)||(47023056-47023354)
chr3 (587-801)||(22871264-22871478)
chr3 (587-801)||(22886323-22886537)
chr3 (587-768)||(5466672-5466853)
chr3 (587-792)||(5596756-5596961)
chr3 (554-666)||(5713016-5713128)
chr3 (554-666)||(5723926-5724038)
chr3 (554-666)||(5757439-5757551)
chr3 (554-666)||(5768330-5768442)
chr3 (554-804)||(7996213-7996463)
chr3 (554-804)||(10642721-10642971)
chr3 (587-769)||(18224877-18225059)
chr3 (563-852)||(21674296-21674585)
chr3 (587-769)||(17985346-17985528)
chr3 (587-769)||(28020964-28021146)
chr3 (554-792)||(36997446-36997684)
chr3 (587-852)||(5013315-5013580)
chr3 (587-840)||(6542864-6543117)
chr3 (554-801)||(11110718-11110965)
chr3 (587-769)||(4347074-4347256)
chr3 (587-801)||(18242381-18242595)
chr3 (293-492)||(4893176-4893375)
chr3 (662-801)||(20577327-20577466)
chr3 (662-792)||(51781674-51781804)
chr3 (587-792)||(24327822-24328027)
chr3 (587-768)||(28338989-28339170)
chr3 (587-768)||(31964863-31965044)
chr3 (587-768)||(50134461-50134642)
chr3 (554-738)||(29665342-29665526)
chr3 (662-768)||(4416603-4416709)
chr3 (543-691)||(22387921-22388069)
chr3 (662-765)||(5609787-5609890)
chr3 (554-801)||(48465569-48465816)
chr3 (662-792)||(51796762-51796893)
chr3 (543-841)||(32438771-32439069)
chr3 (543-691)||(4892977-4893125)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (16-492)||(16449659-16450135)
chr7 (16-492)||(26484700-26485176)
chr7 (16-492)||(2775365-2775841)
chr7 (16-492)||(39210684-39211160)
chr7 (16-492)||(16041329-16041805)
chr7 (16-492)||(2108666-2109142)
chr7 (23-492)||(31088132-31088601)
chr7 (24-492)||(45733466-45733934)
chr7 (16-363)||(26682661-26683008)
chr7 (532-841)||(16040980-16041289)
chr7 (23-363)||(4200682-4201022)
chr7 (535-853)||(16450178-16450496)
chr7 (16-492)||(5127998-5128474)
chr7 (16-492)||(11424437-11424913)
chr7 (551-852)||(16518615-16518916)
chr7 (16-492)||(2154579-2155055)
chr7 (16-492)||(10916529-10917005)
chr7 (16-492)||(18540805-18541281)
chr7 (551-852)||(16503579-16503880)
chr7 (48-492)||(16518109-16518553)
chr7 (48-492)||(16503073-16503517)
chr7 (83-492)||(26274822-26275231)
chr7 (16-492)||(5147001-5147477)
chr7 (16-492)||(26435263-26435739)
chr7 (16-489)||(3445315-3445788)
chr7 (83-492)||(26319597-26320006)
chr7 (50-492)||(4144818-4145260)
chr7 (83-492)||(26669642-26670051)
chr7 (16-492)||(16736121-16736597)
chr7 (16-492)||(16751175-16751651)
chr7 (16-492)||(17523538-17524014)
chr7 (16-492)||(17529201-17529677)
chr7 (83-491)||(31564118-31564526)
chr7 (551-852)||(2154216-2154517)
chr7 (83-492)||(9618657-9619066)
chr7 (83-483)||(11441587-11441987)
chr7 (83-489)||(26537598-26538004)
chr7 (83-492)||(45387349-45387758)
chr7 (551-852)||(5127635-5127936)
chr7 (83-417)||(24592269-24592603)
chr7 (551-852)||(10917064-10917365)
chr7 (551-852)||(11424975-11425276)
chr7 (16-492)||(5159525-5160001)
chr7 (83-491)||(31124927-31125335)
chr7 (542-666)||(31088651-31088775)
chr7 (542-666)||(45733292-45733416)
chr7 (554-804)||(45387034-45387284)
chr7 (554-852)||(5147542-5147840)
chr7 (554-852)||(16736662-16736960)
chr7 (554-852)||(16751716-16752014)
chr7 (554-852)||(17523175-17523473)
chr7 (554-852)||(17529742-17530040)
chr7 (587-852)||(31124554-31124819)
chr7 (554-792)||(11441263-11441501)
chr7 (543-768)||(4145314-4145539)
chr7 (587-852)||(24592776-24593041)
chr7 (587-801)||(9618345-9618559)
chr7 (587-769)||(26275329-26275511)
chr7 (554-852)||(26434900-26435198)
chr7 (587-767)||(26320104-26320284)
chr7 (662-769)||(3445020-3445127)
chr7 (554-769)||(26485946-26486161)
chr7 (554-801)||(26538075-26538322)
chr7 (587-801)||(26670149-26670363)
chr7 (543-691)||(5159326-5159474)
chr7 (662-769)||(31564709-31564816)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (16-492)||(19456185-19456661)
chr2 (16-492)||(21702928-21703404)
chr2 (16-492)||(16163600-16164079)
chr2 (16-492)||(27118689-27119165)
chr2 (17-492)||(34303068-34303543)
chr2 (24-492)||(3784655-3785123)
chr2 (24-492)||(34157012-34157479)
chr2 (532-853)||(19456701-19457022)
chr2 (23-492)||(31891099-31891568)
chr2 (532-853)||(21703444-21703765)
chr2 (16-492)||(22925792-22926268)
chr2 (164-489)||(27392973-27393298)
chr2 (16-492)||(27434208-27434684)
chr2 (16-492)||(28882215-28882691)
chr2 (16-492)||(12655543-12656019)
chr2 (551-841)||(27434746-27435036)
chr2 (16-492)||(20837919-20838395)
chr2 (48-492)||(23128362-23128806)
chr2 (83-489)||(9349813-9350219)
chr2 (83-489)||(40233515-40233921)
chr2 (532-853)||(27392630-27392951)
chr2 (83-492)||(11635017-11635426)
chr2 (551-852)||(23128868-23129169)
chr2 (16-492)||(34286355-34286831)
chr2 (16-492)||(34291415-34291891)
chr2 (83-492)||(11641206-11641615)
chr2 (16-489)||(13936308-13936781)
chr2 (551-852)||(28881852-28882153)
chr2 (16-492)||(32049799-32050275)
chr2 (16-489)||(12586814-12587287)
chr2 (83-492)||(21677013-21677422)
chr2 (16-489)||(27777226-27777699)
chr2 (16-489)||(27816984-27817457)
chr2 (83-492)||(34861681-34862090)
chr2 (83-492)||(37685740-37686149)
chr2 (83-492)||(37701005-37701414)
chr2 (83-492)||(37925494-37925903)
chr2 (551-852)||(20837556-20837857)
chr2 (16-491)||(37375163-37375638)
chr2 (551-852)||(12655180-12655481)
chr2 (16-489)||(12716366-12716839)
chr2 (83-492)||(16829169-16829578)
chr2 (83-492)||(16891903-16892312)
chr2 (16-489)||(27803711-27804184)
chr2 (16-489)||(39051586-39052059)
chr2 (83-492)||(31876282-31876691)
chr2 (16-483)||(260517-260984)
chr2 (16-492)||(39890075-39890551)
chr2 (83-417)||(19416330-19416664)
chr2 (532-666)||(31891608-31891742)
chr2 (532-666)||(27118515-27118649)
chr2 (542-666)||(3784481-3784605)
chr2 (542-666)||(34156838-34156962)
chr2 (551-666)||(34303602-34303717)
chr2 (542-666)||(16163426-16163550)
chr2 (554-852)||(34279087-34279385)
chr2 (278-492)||(34279450-34279664)
chr2 (554-801)||(13936849-13937096)
chr2 (554-768)||(21677487-21677701)
chr2 (560-852)||(37374799-37375091)
chr2 (554-801)||(261070-261317)
chr2 (554-852)||(11635494-11635792)
chr2 (554-852)||(11641683-11641981)
chr2 (554-801)||(34286043-34286290)
chr2 (554-801)||(34291103-34291350)
chr2 (587-769)||(12716943-12717125)
chr2 (554-801)||(37925182-37925429)
chr2 (554-801)||(40233188-40233435)
chr2 (587-769)||(31876002-31876184)
chr2 (587-769)||(34861401-34861583)
chr2 (587-769)||(37686247-37686429)
chr2 (587-769)||(37701512-37701694)
chr2 (587-769)||(39889783-39889965)
chr2 (554-762)||(32049526-32049734)
chr2 (662-801)||(12586490-12586629)
chr2 (587-769)||(16829676-16829858)
chr2 (587-769)||(16891623-16891805)
chr2 (587-792)||(19416837-19417042)
chr2 (587-768)||(22926366-22926547)
chr2 (662-801)||(9350407-9350546)
chr2 (662-801)||(27776896-27777035)
chr2 (662-801)||(27803381-27803520)
chr2 (662-801)||(27816663-27816802)
chr2 (548-801)||(39052127-39052380)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (16-492)||(15284703-15285179)
chr4 (16-492)||(15227890-15228366)
chr4 (16-492)||(1900277-1900753)
chr4 (24-492)||(24460388-24460856)
chr4 (16-489)||(15391113-15391586)
chr4 (532-851)||(15285219-15285538)
chr4 (16-492)||(14235300-14235776)
chr4 (532-853)||(15227529-15227850)
chr4 (532-853)||(1899916-1900237)
chr4 (16-492)||(17014020-17014496)
chr4 (16-492)||(24592089-24592565)
chr4 (532-853)||(14235819-14236140)
chr4 (16-492)||(14665038-14665514)
chr4 (16-492)||(14763079-14763555)
chr4 (83-492)||(5005893-5006302)
chr4 (16-492)||(6569873-6570349)
chr4 (16-491)||(36344290-36344765)
chr4 (16-491)||(18800388-18800863)
chr4 (551-852)||(14664675-14664976)
chr4 (83-492)||(14098561-14098970)
chr4 (83-492)||(31126360-31126769)
chr4 (83-492)||(40105480-40105889)
chr4 (551-852)||(17013657-17013958)
chr4 (83-492)||(27163159-27163568)
chr4 (16-492)||(24112682-24113158)
chr4 (16-489)||(30753777-30754250)
chr4 (16-489)||(33673573-33674046)
chr4 (16-492)||(34188735-34189211)
chr4 (556-853)||(15391650-15391948)
chr4 (551-852)||(24592624-24592925)
chr4 (16-492)||(21969721-21970197)
chr4 (83-491)||(54833408-54833816)
chr4 (83-489)||(39850661-39851067)
chr4 (551-852)||(6569510-6569811)
chr4 (542-666)||(24460906-24461030)
chr4 (543-852)||(14763609-14763918)
chr4 (543-852)||(36344817-36345126)
chr4 (570-852)||(19372918-19373200)
chr4 (554-852)||(27163633-27163931)
chr4 (560-801)||(54833098-54833339)
chr4 (554-852)||(5005527-5005825)
chr4 (587-852)||(14098198-14098463)
chr4 (554-769)||(30753482-30753697)
chr4 (587-769)||(31126867-31127049)
chr4 (587-792)||(18800971-18801176)
chr4 (554-792)||(33674126-33674364)
chr4 (587-840)||(40105987-40106240)
chr4 (554-769)||(21969441-21969656)
chr4 (662-801)||(39850331-39850470)
chr4 (543-691)||(24112483-24112631)
chr4 (543-691)||(34189262-34189410)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (16-492)||(14143003-14143479)
chr6 (16-492)||(26787946-26788422)
chr6 (16-492)||(27196319-27196795)
chr6 (16-492)||(27252445-27252921)
chr6 (16-492)||(13521791-13522267)
chr6 (16-492)||(22456661-22457128)
chr6 (24-492)||(8892037-8892504)
chr6 (24-492)||(8903272-8903739)
chr6 (23-492)||(33373981-33374450)
chr6 (23-492)||(28162659-28163128)
chr6 (16-492)||(27290088-27290564)
chr6 (16-489)||(27272298-27272771)
chr6 (266-492)||(22477241-22477467)
chr6 (48-492)||(22934630-22935074)
chr6 (48-492)||(23857075-23857519)
chr6 (16-492)||(26989003-26989479)
chr6 (16-492)||(13298669-13299145)
chr6 (48-492)||(26918382-26918826)
chr6 (16-492)||(16749856-16750332)
chr6 (16-492)||(24304336-24304812)
chr6 (16-492)||(15424035-15424511)
chr6 (48-492)||(24863719-24864163)
chr6 (16-492)||(29549477-29549953)
chr6 (164-491)||(20160704-20161031)
chr6 (164-491)||(22171800-22172127)
chr6 (545-853)||(20160345-20160650)
chr6 (545-853)||(22172181-22172486)
chr6 (551-852)||(13299207-13299508)
chr6 (551-852)||(24863356-24863657)
chr6 (16-491)||(4773009-4773484)
chr6 (551-852)||(15424573-15424874)
chr6 (83-492)||(29573015-29573424)
chr6 (16-483)||(4545493-4545960)
chr6 (554-852)||(22935136-22935434)
chr6 (554-852)||(23857581-23857879)
chr6 (551-852)||(26988640-26988941)
chr6 (551-852)||(26999712-27000013)
chr6 (16-489)||(34463064-34463537)
chr6 (16-491)||(4757767-4758242)
chr6 (16-491)||(27007730-27008205)
chr6 (16-489)||(16674144-16674617)
chr6 (16-285)||(17092158-17092427)
chr6 (83-491)||(4525289-4525697)
chr6 (173-492)||(27000075-27000394)
chr6 (16-491)||(27359710-27360185)
chr6 (16-491)||(27450053-27450528)
chr6 (83-492)||(30557801-30558210)
chr6 (83-483)||(4723919-4724319)
chr6 (83-489)||(3696086-3696492)
chr6 (551-801)||(24304874-24305124)
chr6 (16-483)||(28207465-28207932)
chr6 (551-852)||(16749493-16749794)
chr6 (551-695)||(22477529-22477673)
chr6 (554-801)||(26918070-26918317)
chr6 (16-491)||(29501418-29501893)
chr6 (16-417)||(16943745-16944146)
chr6 (83-491)||(27044390-27044799)
chr6 (16-491)||(27485132-27485607)
chr6 (26-491)||(26116138-26116603)
chr6 (121-491)||(17025280-17025650)
chr6 (532-666)||(28162485-28162619)
chr6 (16-492)||(26777328-26777809)
chr6 (542-666)||(13522317-13522441)
chr6 (542-666)||(33374500-33374624)
chr6 (532-666)||(8892544-8892678)
chr6 (532-666)||(8903779-8903913)
chr6 (543-852)||(29549117-29549426)
chr6 (543-852)||(27044029-27044338)
chr6 (554-852)||(3695702-3696000)
chr6 (583-769)||(4525011-4525197)
chr6 (587-852)||(17024901-17025166)
chr6 (587-801)||(27484807-27485021)
chr6 (587-801)||(29501096-29501310)
chr6 (587-769)||(29572735-29572917)
chr6 (587-769)||(30558308-30558490)
chr6 (662-769)||(4757483-4757590)
chr6 (662-801)||(4772687-4772826)
chr6 (662-801)||(27007402-27007541)
chr6 (554-801)||(34463620-34463867)
chr6 (587-852)||(4546076-4546341)
chr6 (587-792)||(16944319-16944524)
chr6 (587-768)||(26777919-26778100)
chr6 (587-852)||(28207081-28207346)
chr6 (554-801)||(16673817-16674064)
chr6 (662-769)||(27360377-27360484)
chr6 (662-769)||(27450720-27450827)
chr6 (587-840)||(4724435-4724688)
chr6 (78-169)||(27019461-27019552)
chr6 (554-840)||(27629968-27630254)
chr6 (668-769)||(26116792-26116893)
chr6 (137-243)||(27629539-27629645)
chr6 (659-840)||(27272947-27273128)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (16-492)||(33877261-33877737)
chr5 (16-492)||(22888484-22888960)
chr5 (23-492)||(13184327-13184796)
chr5 (16-492)||(25199043-25199519)
chr5 (16-492)||(29888754-29889230)
chr5 (24-492)||(11325808-11326276)
chr5 (16-492)||(23892220-23892696)
chr5 (23-492)||(13440173-13440642)
chr5 (532-854)||(23891855-23892177)
chr5 (532-853)||(25198682-25199003)
chr5 (23-492)||(9548222-9548691)
chr5 (16-492)||(23752122-23752598)
chr5 (16-492)||(24687829-24688305)
chr5 (16-492)||(30934647-30935123)
chr5 (16-492)||(33777501-33777977)
chr5 (16-492)||(23717660-23718136)
chr5 (16-492)||(11549368-11549844)
chr5 (16-492)||(22998786-22999262)
chr5 (16-492)||(24970032-24970508)
chr5 (551-852)||(24688367-24688668)
chr5 (16-492)||(15658432-15658908)
chr5 (16-492)||(12132169-12132645)
chr5 (16-483)||(31431463-31431930)
chr5 (83-492)||(9317465-9317874)
chr5 (16-492)||(2511065-2511541)
chr5 (83-491)||(28649250-28649658)
chr5 (16-491)||(18500402-18500877)
chr5 (16-491)||(37671155-37671630)
chr5 (83-492)||(30152032-30152441)
chr5 (16-489)||(31826079-31826552)
chr5 (16-492)||(6874319-6874795)
chr5 (16-492)||(41674723-41675199)
chr5 (551-852)||(23752660-23752961)
chr5 (551-852)||(30934287-30934588)
chr5 (20-492)||(30168483-30168955)
chr5 (83-492)||(26480406-26480814)
chr5 (16-489)||(43078269-43078742)
chr5 (16-492)||(32599144-32599620)
chr5 (16-491)||(37358315-37358790)
chr5 (18-489)||(40473223-40473694)
chr5 (551-852)||(23718198-23718500)
chr5 (658-852)||(24951761-24951955)
chr5 (83-492)||(5637924-5638333)
chr5 (83-492)||(8665214-8665623)
chr5 (551-852)||(11549005-11549306)
chr5 (83-492)||(15758596-15759005)
chr5 (83-492)||(18375151-18375560)
chr5 (532-689)||(22888287-22888444)
chr5 (16-489)||(24681457-24681930)
chr5 (16-489)||(24723984-24724457)
chr5 (83-492)||(33516370-33516779)
chr5 (16-417)||(30029504-30029905)
chr5 (16-492)||(33292539-33293015)
chr5 (16-491)||(13324501-13324976)
chr5 (551-852)||(33777138-33777439)
chr5 (83-492)||(34616532-34616941)
chr5 (551-851)||(22999324-22999624)
chr5 (83-491)||(37770726-37771134)
chr5 (16-491)||(3789556-3790031)
chr5 (83-417)||(29966805-29967139)
chr5 (83-491)||(37754995-37755403)
chr5 (16-492)||(28959458-28959934)
chr5 (542-666)||(13184846-13184970)
chr5 (542-666)||(13440692-13440816)
chr5 (542-666)||(33877087-33877211)
chr5 (554-801)||(9548756-9549003)
chr5 (532-666)||(11325634-11325768)
chr5 (554-852)||(15658973-15659271)
chr5 (554-792)||(41674420-41674658)
chr5 (554-801)||(31431130-31431377)
chr5 (587-801)||(2510753-2510967)
chr5 (554-768)||(8665688-8665902)
chr5 (554-801)||(30168171-30168418)
chr5 (587-801)||(9317153-9317367)
chr5 (587-769)||(24681171-24681353)
chr5 (587-769)||(24723698-24723880)
chr5 (662-840)||(40473873-40474051)
chr5 (554-852)||(43077900-43078198)
chr5 (587-852)||(18375658-18375923)
chr5 (554-801)||(18500961-18501208)
chr5 (554-852)||(3789177-3789475)
chr5 (587-769)||(12131889-12132071)
chr5 (551-649)||(24969878-24969976)
chr5 (587-769)||(37771245-37771427)
chr5 (587-852)||(5637561-5637826)
chr5 (587-804)||(15759103-15759320)
chr5 (587-852)||(30151669-30151934)
chr5 (587-840)||(37358901-37359154)
chr5 (662-801)||(6874004-6874143)
chr5 (587-801)||(26480094-26480308)
chr5 (587-769)||(31826665-31826847)
chr5 (587-769)||(33516090-33516272)
chr5 (587-801)||(34616223-34616437)
chr5 (587-769)||(37671738-37671920)
chr5 (662-801)||(37754670-37754809)
chr5 (587-769)||(32599715-32599897)
chr5 (587-769)||(28960044-28960226)
chr5 (587-792)||(28648937-28649142)
chr5 (587-792)||(29967312-29967517)
chr5 (587-792)||(30029126-30029331)
chr5 (662-801)||(13325165-13325304)
chr5 (543-691)||(33292340-33292488)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (16-492)||(44563106-44563580)
chr8 (16-492)||(19658774-19659249)
chr8 (16-492)||(33244670-33245146)
chr8 (16-489)||(22080612-22081085)
chr8 (16-492)||(18710591-18711067)
chr8 (83-492)||(9354627-9355037)
chr8 (16-492)||(16283454-16283930)
chr8 (16-492)||(16277559-16278035)
chr8 (48-492)||(19688103-19688547)
chr8 (16-492)||(27608639-27609115)
chr8 (551-852)||(16283091-16283392)
chr8 (16-492)||(2136993-2137469)
chr8 (16-492)||(14557629-14558105)
chr8 (551-852)||(16277196-16277497)
chr8 (551-852)||(19687740-19688041)
chr8 (16-492)||(31489484-31489960)
chr8 (532-853)||(22081125-22081446)
chr8 (16-492)||(19674446-19674922)
chr8 (16-491)||(3329241-3329716)
chr8 (83-492)||(19208161-19208570)
chr8 (83-492)||(28361756-28362165)
chr8 (551-852)||(2137531-2137832)
chr8 (83-492)||(31354529-31354938)
chr8 (16-491)||(29829328-29829803)
chr8 (551-852)||(14557269-14557570)
chr8 (551-852)||(27609177-27609478)
chr8 (83-491)||(19286468-19286876)
chr8 (16-491)||(12092458-12092933)
chr8 (78-335)||(189256-189513)
chr8 (16-417)||(33258803-33259204)
chr8 (542-666)||(19659299-19659423)
chr8 (551-666)||(44562932-44563047)
chr8 (542-666)||(9354453-9354577)
chr8 (554-852)||(18710228-18710526)
chr8 (554-852)||(19674080-19674378)
chr8 (560-801)||(19286158-19286399)
chr8 (554-792)||(31490025-31490263)
chr8 (543-768)||(31354250-31354475)
chr8 (587-769)||(19208668-19208850)
chr8 (587-801)||(28362263-28362477)
chr8 (587-840)||(3329827-3330080)
chr8 (587-840)||(29828967-29829220)
chr8 (587-801)||(19518451-19518665)
chr8 (587-792)||(33258425-33258630)
chr8 (587-852)||(12093041-12093306)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (16-489)||(21569-22042)
scaffold0109 (532-853)||(21208-21529)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (532-853)||(20053-20374)
scaffold0124 (155-492)||(20393-20729)
scaffold0124 (16-417)||(30532-30933)
scaffold0124 (551-852)||(30095-30396)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (214-492)||(1-279)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (155-427)||(1832-2103)
scaffold0415 (16-429)||(6080-6495)
scaffold0415 (554-801)||(5682-5930)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (16-351)||(393-728)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (16-492)||(46760-47236)
scaffold0089 (18-492)||(39846-40320)
scaffold0089 (551-852)||(29405-29706)
scaffold0089 (16-492)||(29768-30244)
scaffold0089 (554-852)||(40385-40683)
scaffold0089 (551-852)||(47298-47599)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (16-492)||(27297-27773)
scaffold0143 (551-852)||(26934-27235)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (121-492)||(9-381)
scaffold0029 (551-852)||(443-744)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (16-492)||(9571-10047)
scaffold0336 (583-852)||(7874-8143)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (83-492)||(7081-7490)
scaffold0350 (587-769)||(7588-7770)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (16-492)||(8841-9317)
scaffold0159 (16-492)||(20020-20496)
scaffold0159 (587-765)||(9415-9593)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (16-492)||(25976-26453)
scaffold0144 (587-852)||(26551-26816)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (83-492)||(14772-15181)
scaffold0237 (587-852)||(15279-15544)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (16-483)||(7963-8430)
scaffold0038 (587-852)||(7579-7844)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (658-852)||(48568-48769)
scaffold0099 (101-411)||(46659-46981)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (137-243)||(343-449)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 2433 - 2909
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2433 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 2532  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 2632  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2633 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 2732  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2733 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 2832  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2833 gtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 20340110 - 20340586
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340110 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 20340209  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340210 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 20340309  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20340310 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 20340409  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20340410 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 20340509  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20340510 gtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20461561 - 20461085
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20461561 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttga 20461462  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20461461 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgat 20461362  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461361 tcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 20461262  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20461261 ttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 20461162  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20461161 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28152342 - 28151866
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152342 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 28152243  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28152242 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgat 28152143  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28152142 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 28152043  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  28152042 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 28151943  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151942 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 16207806 - 16208282
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16207806 catcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 16207905  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16207906 catagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 16208005  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16208006 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 16208105  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  16208106 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggtt 16208205  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16208206 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 41793083 - 41793559
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  41793083 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 41793182  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  41793183 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 41793282  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  41793283 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 41793382  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  41793383 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 41793482  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  41793483 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10963083 - 10962674
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  10963083 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 10962984  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  10962983 cacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 10962884  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  10962883 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 10962784  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10962783 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 10962684  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  10962683 taggcctagc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28585461 - 28584985
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  28585461 catcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 28585362  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  28585361 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 28585262  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  28585261 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 28585162  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  28585161 ctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 28585062  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28585061 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51638698 - 51638222
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  51638698 catcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 51638599  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  51638598 cacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 51638499  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  51638498 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 51638399  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||     
T  51638398 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtc 51638299  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51638298 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 10962576 - 10962362
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962576 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 10962477  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |    
T  10962476 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagc 10962377  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  10962376 tttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637910
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 51637925  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  51637924 tttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 16626322 - 16626798
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626322 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 16626421  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16626422 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgat 16626521  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626522 tcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 16626621  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16626622 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 16626721  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626722 gtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18530830 - 18530354
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18530830 catcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttgg 18530731  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530730 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 18530631  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530630 tcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 18530531  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18530530 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 18530431  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18530430 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 31033933 - 31034409
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31033933 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 31034032  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034033 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 31034132  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31034133 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 31034232  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  31034233 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 31034332  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034333 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32293194 - 32292718
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293194 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 32293095  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293094 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 32292995  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  32292994 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 32292895  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||    
T  32292894 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgatt 32292795  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292794 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5652829 - 5652353
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652829 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 5652730  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5652729 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgat 5652630  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5652629 tcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcc 5652530  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  5652529 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggtt 5652430  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5652429 gtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4626378 - 4625910
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4626378 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggctcggcataactc 4626279  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4626278 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 4626179  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  4626178 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 4626079  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626078 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 4625979  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4625978 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Original strand, 17993608 - 17994076
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||    
T  17993608 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagctt 17993707  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17993708 gatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 17993807  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  17993808 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 17993907  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993908 catgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 17994007  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17994008 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5713661 - 5713196
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5713661 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 5713562  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5713561 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5713462  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5713461 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5713362  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5713361 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5713262  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5713261 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5724571 - 5724106
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5724571 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 5724472  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5724471 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5724372  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5724371 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5724272  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5724271 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5724172  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5724171 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 489
Target Start/End: Original strand, 5767797 - 5768262
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5767797 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 5767896  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5767897 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5767996  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5767997 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5768096  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5768097 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5768196  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5768197 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8296414 - 8295938
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8296414 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8296315  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  8296314 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 8296215  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  8296214 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 8296115  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  8296114 ctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggtt 8296015  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8296014 gtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18051704 - 18051228
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||   | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  18051704 catcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacatgatcatggctaaacagagaagctttg 18051605  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  18051604 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgat 18051505  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  18051504 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 18051405  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18051404 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 18051305  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18051304 gtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 489
Target Start/End: Original strand, 5756954 - 5757371
Alignment:
Q  71 cattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtc 170  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||    
T  5756954 cattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatc 5757052  T
Q  171 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||    
T  5757053 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5757152  T
Q  271 ttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatgg 370  Q
    ||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |    
T  5757153 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctg 5757252  T
Q  371 aacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggta 470  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||    
T  5757253 aaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggta 5757352  T
Q  471 tcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  5757353 tcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 15740910 - 15741386
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  15740910 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 15741009  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  15741010 cacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 15741109  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  15741110 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatcc 15741209  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  15741210 ctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 15741309  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741310 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 15892522 - 15892998
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  15892522 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 15892621  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  15892622 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 15892721  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  15892722 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 15892821  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15892822 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 15892921  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892922 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18331111 - 18330635
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||| ||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18331111 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18331012  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  18331011 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 18330912  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  18330911 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 18330812  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18330811 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 18330712  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18330711 gtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 8301083 - 8301559
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8301083 catcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8301182  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||    
T  8301183 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgat 8301282  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  8301283 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 8301382  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8301383 ctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 8301482  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301483 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6192758 - 6192282
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  6192758 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 6192659  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  6192658 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 6192559  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  6192558 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 6192459  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6192458 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 6192359  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6192358 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4722073 - 4721597
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  4722073 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 4721974  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||    
T  4721973 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgat 4721874  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||    
T  4721873 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcaccc 4721774  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4721773 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 4721674  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4721673 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 4796469 - 4796945
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  4796469 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 4796568  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  4796569 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 4796668  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  4796669 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 4796768  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4796769 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 4796868  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4796869 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 29148571 - 29149047
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29148571 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29148670  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  29148671 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 29148770  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  29148771 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 29148870  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  29148871 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 29148970  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148971 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 35881208 - 35880732
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  35881208 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 35881109  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  35881108 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 35881009  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  35881008 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 35880909  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  35880908 ctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggtt 35880809  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35880808 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 551 - 841
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 841  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7073654 - 7073178
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| | ||||  |  |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  7073654 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 7073555  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||    
T  7073554 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgat 7073455  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  7073454 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 7073355  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||     
T  7073354 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtc 7073255  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7073254 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4417294 - 4416885
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4417294 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 4417195  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||    
T  4417194 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 4417095  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  4417094 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 4416995  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4416994 aacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 4416895  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  4416894 taggcctagc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 22387461 - 22387870
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||| ||||||   | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22387461 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 22387560  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||    
T  22387561 cacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 22387660  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  22387661 cttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 22387760  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22387761 aacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaag 22387860  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  22387861 tcggtctagc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 18292169 - 18292645
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18292169 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18292268  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18292269 cacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18292368  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  18292369 ttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18292468  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  18292469 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 18292568  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18292569 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 28115837 - 28116246
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28115837 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 28115936  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||    
T  28115937 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgag 28116036  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  28116037 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 28116136  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28116137 aacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaag 28116236  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  28116237 taggtctagc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 18276868 - 18277344
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18276868 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18276967  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18276968 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18277067  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  18277068 ttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18277167  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  18277168 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 18277267  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18277268 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 18307470 - 18307946
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18307470 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18307569  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18307570 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18307669  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  18307670 ttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18307769  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  18307770 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 18307869  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307870 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10396575 - 10396099
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  10396575 catcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 10396476  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| |  |||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  10396475 cacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 10396376  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  10396375 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 10396276  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  10396275 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 10396176  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10396175 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 36996893 - 36997366
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  36996893 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 36996992  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  36996993 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 36997092  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  36997093 ttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 36997192  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  36997193 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 36997292  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997293 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 48466369 - 48465896
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  48466369 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 48466270  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  48466269 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 48466170  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  48466169 ttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 48466070  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  48466069 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 48465970  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48465969 gtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 6542278 - 6542753
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  6542278 catcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 6542377  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  6542378 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 6542477  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  6542478 ttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 6542577  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  6542578 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 6542677  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542678 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 11110165 - 11110638
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  11110165 catcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 11110264  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||    
T  11110265 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgat 11110364  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  11110365 ttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 11110464  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     
T  11110465 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtc 11110564  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11110565 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21675135 - 21674659
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  21675135 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 21675036  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  21675035 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 21674936  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  21674935 ttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 21674836  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  21674835 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 21674736  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21674735 gtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Original strand, 29664853 - 29665259
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  29664853 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 29664952  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  29664953 cacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 29665052  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||     
T  29665053 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggt 29665152  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29665153 aaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaag 29665252  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  29665253 ttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 20576663 - 20577136
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  20576663 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20576762  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20576763 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20576862  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20576863 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20576962  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  20576963 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 20577062  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20577063 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 5609138 - 5609614
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  5609138 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 5609237  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  5609238 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 5609337  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  5609338 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 5609437  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  5609438 ttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 5609537  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5609538 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28021717 - 28021241
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||| | ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  28021717 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 28021618  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  28021617 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 28021518  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  28021517 ttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 28021418  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  28021417 ctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 28021318  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28021317 gtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51782465 - 51782052
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  51782465 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 51782366  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  51782365 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 51782266  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  51782265 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 51782166  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  51782165 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 51782066  T
Q  416 gtgcagtgccctct 429  Q
    || || ||||||||    
T  51782065 gtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28339744 - 28339268
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  28339744 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 28339645  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  28339644 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 28339545  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  28339544 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 28339445  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  28339444 ctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 28339345  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28339344 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5467360 - 5466953
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5467360 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5467261  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || | ||| ||||| |  |||||    
T  5467260 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgag 5467161  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  5467160 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 5467061  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||||  |||||||||    
T  5467060 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaag 5466961  T
Q  483 taggtcta 490  Q
    | ||||||    
T  5466960 ttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 8212180 - 8211713
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8212180 catcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8212081  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |  ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  8212080 cacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 8211981  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  8211980 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 8211881  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||     
T  8211880 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtc 8211781  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8211780 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 4346570 - 4346979
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4346570 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 4346669  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  4346670 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4346769  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  4346770 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 4346869  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4346870 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 4346969  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  4346970 ttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 47023828 - 47023419
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  47023828 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 47023729  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  47023728 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 47023629  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  47023628 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 47023529  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  47023528 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 47023429  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  47023428 taggcctagc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985248
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| | ||||||  |  ||| || | || ||||||||||||||    |||||||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964765
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   ||||| || |||| |    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31964588  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31964589 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31964688  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31964689 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32439596 - 32439120
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   |||||||||| |||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | || |||    
T  32439596 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcctgg 32439497  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  32439496 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 32439397  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  32439396 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 32439297  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  32439296 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 32439197  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32439196 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 20066485 - 20066010
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   |||||||||| |||| | | |||||||| |||| |   |||||||||| |||||||   | ||||||    
T  20066485 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 20066386  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20066385 cacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 20066286  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20066285 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 20066186  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||| || ||     
T  20066185 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtc 20066086  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20066085 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 18243181 - 18242706
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18243181 catcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18243082  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18243081 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18242982  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  18242981 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18242882  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  18242881 ctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 18242782  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18242781 gtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 492
Target Start/End: Original strand, 50133992 - 50134363
Alignment:
Q  121 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 220  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||     
T  50133992 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggt 50134091  T
Q  221 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 320  Q
    || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  50134092 agcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 50134191  T
Q  321 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 420  Q
    | |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  50134192 cgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtaca 50134291  T
Q  421 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134292 atgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 22870739 - 22871148
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22870739 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 22870838  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  22870839 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 22870938  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  22870939 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 22871038  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22871039 aacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 22871138  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  22871139 ttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 22885798 - 22886207
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22885798 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 22885897  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  22885898 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 22885997  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  22885998 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 22886097  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22886098 aacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 22886197  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  22886198 ttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 5014154 - 5013687
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  5014154 catcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 5014055  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  5014054 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 5013955  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  5013954 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 5013855  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  5013854 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 5013755  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  5013754 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 5596173 - 5596648
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    | ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  5596173 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 5596272  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  5596273 cacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 5596372  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  5596373 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 5596472  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  5596473 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 5596572  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  5596573 gtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 7996937 - 7996528
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  7996937 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 7996838  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  7996837 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 7996738  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  7996737 cttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 7996638  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7996637 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 7996538  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  7996537 taggcctagc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10643445 - 10643036
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  10643445 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 10643346  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  10643345 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 10643246  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  10643245 cttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 10643146  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10643145 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 10643046  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  10643045 taggcctagc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24328601 - 24328200
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  24328601 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttg 24328502  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  24328501 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 24328402  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  24328401 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacaccc 24328302  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  24328301 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 24328202  T
Q  416 gt 417  Q
    ||    
T  24328201 gt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18225566 - 18225157
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |    
T  18225566 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttctt 18225467  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  18225466 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 18225367  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  18225366 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 18225267  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || |    
T  18225266 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaagg 18225167  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  18225166 taggcctagc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51797450 - 51797141
Alignment:
Q  121 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 220  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  51797450 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 51797351  T
Q  221 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 320  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  51797350 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 51797251  T
Q  321 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgc 419  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  51797250 catcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtac 51797151  T
Q  420 agtgccctct 429  Q
    | ||||||||    
T  51797150 aatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 551 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  651 ataactgggcagcatt 666  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 543 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctt 762  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 841  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  654 actgggcagcatt 666  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  654 actgggcagcatt 666  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 666
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  654 actgggcagcatt 666  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 666
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  654 actgggcagcatt 666  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 804  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 804  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 563 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  563 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 662  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  663 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 762  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  763 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 554 - 792
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5013580 - 5013315
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  5013580 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 5013481  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  5013480 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 5013381  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013380 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Original strand, 6542864 - 6543117
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542864 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 6542963  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  6542964 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 6543063  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543064 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 4347074 - 4347256
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  | | ||||| ||||||   |  ||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4347074 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagcca 4347173  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4347174 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242381
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18242396  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  18242395 tttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893176
Alignment:
Q  293 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 392  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  393 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 24328027 - 24327822
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24328027 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24327928  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  24327927 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 24327828  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  24327827 tttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28339170 - 28338989
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  28339170 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 28339071  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  28339070 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Original strand, 31964863 - 31965044
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  31964863 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 31964962  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  31964963 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Original strand, 50134461 - 50134642
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  50134461 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 50134560  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  50134561 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 738
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 738  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 662 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  762 ttgatgc 768  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 765
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  762 ttga 765  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 48465816 - 48465569
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||  | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  48465816 acgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 48465717  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  48465716 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 48465617  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465616 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 760  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  761 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 543 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 841  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 16449659 - 16450135
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449659 catcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 16449758  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449759 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 16449858  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449859 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 16449958  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16449959 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 16450058  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450059 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26485176 - 26484700
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26485176 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 26485077  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26485076 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 26484977  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  26484976 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 26484877  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  26484876 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 26484777  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484776 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2775841 - 2775365
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775841 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 2775742  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775741 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 2775642  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  2775641 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatcc 2775542  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  2775541 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 2775442  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775441 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 39210684 - 39211160
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210684 catcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 39210783  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210784 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 39210883  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  39210884 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 39210983  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  39210984 ttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgatt 39211083  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211084 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16041805 - 16041329
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||     
T  16041805 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtgattaaacagagaggcttga 16041706  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041705 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 16041606  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16041605 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 16041506  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16041505 ttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 16041406  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16041405 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 2108666 - 2109142
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108666 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 2108765  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108766 cataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 2108865  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  2108866 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 2108965  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  2108966 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 2109065  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109066 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 31088132 - 31088601
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  | |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088132 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 31088231  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31088232 cgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaag 31088331  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  31088332 aggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgaca 31088431  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088432 tcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 31088531  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31088532 gccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 45733934 - 45733466
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45733934 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 45733835  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45733834 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 45733735  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  45733734 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 45733635  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733634 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 45733535  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45733534 ccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 363
Target Start/End: Original strand, 26682661 - 26683008
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682661 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 26682760  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682761 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 26682860  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  26682861 ttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatcc 26682960  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 363  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682961 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 532 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  832 agtccccatg 841  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4201022 - 4200682
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201022 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 4200923  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200922 tgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaag 4200823  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| |||    
T  4200822 agggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgaca 4200723  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200722 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 535 - 853
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  535 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgca 634  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  635 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 734  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  735 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 834  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  835 ccccatgatgtccatctca 853  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5128474 - 5127998
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  5128474 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 5128375  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  5128374 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 5128275  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  5128274 ttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatcc 5128175  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5128174 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggtt 5128075  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5128074 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 11424437 - 11424913
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  11424437 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 11424536  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  11424537 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 11424636  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  11424637 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 11424736  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11424737 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 11424836  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11424837 gtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2155055 - 2154579
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  2155055 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 2154956  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  2154955 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 2154856  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  2154855 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatcc 2154756  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2154755 ctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 2154656  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  2154655 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 10916529 - 10917005
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||      
T  10916529 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagcttta 10916628  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  10916629 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 10916728  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  10916729 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 10916828  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10916829 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 10916928  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10916929 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18541281 - 18540805
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  18541281 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 18541182  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18541181 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 18541082  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  18541081 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 18540982  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  18540981 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgatt 18540882  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18540881 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Original strand, 16518109 - 16518553
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  16518109 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 16518208  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16518209 tgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 16518308  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16518309 ttattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 16518408  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  16518409 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 16518508  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16518509 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Original strand, 16503073 - 16503517
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  16503073 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 16503172  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16503173 tgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 16503272  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16503273 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 16503372  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  16503373 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 16503472  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16503473 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 26274822 - 26275231
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26274822 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26274921  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  26274922 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26275021  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  26275022 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 26275121  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26275122 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 26275221  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  26275222 taggcctagc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 5147001 - 5147477
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  5147001 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 5147100  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  5147101 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgat 5147200  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  5147201 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 5147300  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  5147301 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 5147400  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5147401 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26435739 - 26435263
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| |||||| ||  ||| || | || | |||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  26435739 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 26435640  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  26435639 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 26435540  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  26435539 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 26435440  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  26435439 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 26435340  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26435339 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3445788 - 3445315
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  3445788 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 3445689  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  3445688 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgat 3445589  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  3445588 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 3445489  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3445488 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 3445389  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445388 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 26319597 - 26320006
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26319597 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26319696  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  26319697 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26319796  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  26319797 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 26319896  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26319897 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 26319996  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  26319997 taggcctagc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 492
Target Start/End: Original strand, 4144818 - 4145260
Alignment:
Q  50 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 149  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  4144818 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 4144917  T
Q  150 caacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagtt 249  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  4144918 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 4145017  T
Q  250 gttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 349  Q
     |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  4145018 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 4145117  T
Q  350 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 449  Q
    ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |    
T  4145118 tcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagca 4145217  T
Q  450 actcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4145218 actcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 26669642 - 26670051
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26669642 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26669741  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  26669742 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26669841  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||    
T  26669842 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggc 26669941  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26669942 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 26670041  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  26670042 taggcctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 16736121 - 16736597
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  16736121 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 16736220  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  16736221 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 16736320  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16736321 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16736420  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16736421 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 16736520  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16736521 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 16751175 - 16751651
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  16751175 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 16751274  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  16751275 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 16751374  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16751375 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16751474  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16751475 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 16751574  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16751575 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17524014 - 17523538
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  17524014 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 17523915  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  17523914 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 17523815  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  17523814 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 17523715  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17523714 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 17523615  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17523614 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 17529201 - 17529677
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  17529201 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 17529300  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || ||||    
T  17529301 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgat 17529400  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  17529401 tcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 17529500  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17529501 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 17529600  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17529601 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Original strand, 31564118 - 31564526
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31564118 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 31564217  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  31564218 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 31564317  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  31564318 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 31564417  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31564418 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 31564517  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  31564518 ttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9619066 - 9618657
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9619066 ttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 9618967  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  9618966 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 9618867  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  9618866 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 9618767  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  9618766 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 9618667  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  9618666 taggcctagc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11441987 - 11441587
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11441987 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 11441888  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  11441887 cacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 11441788  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  11441787 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 11441688  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||    
T  11441687 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaag 11441588  T
Q  483 t 483  Q
    |    
T  11441587 t 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Original strand, 26537598 - 26538004
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26537598 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 26537697  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  26537698 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 26537797  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  26537798 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 26537897  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26537898 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaag 26537997  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  26537998 ttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 45387758 - 45387349
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  45387758 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 45387659  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  45387658 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 45387559  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  45387558 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 45387459  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  45387458 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 45387359  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  45387358 taggcctagc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 417
Target Start/End: Original strand, 24592269 - 24592603
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  24592269 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 24592368  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  24592369 cacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 24592468  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  24592469 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 24592568  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 417  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592569 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5160001 - 5159525
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  5160001 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 5159902  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| |||||| || ||||| ||||| | ||    
T  5159901 cacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaattatattcacggcagcatcat 5159802  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  5159801 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 5159702  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  5159701 cttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 5159602  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5159601 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31125335 - 31124927
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31125335 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcct 31125236  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  31125235 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31125136  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  31125135 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 31125036  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31125035 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 31124936  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  31124935 ttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 554 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 804  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124554
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagc 31124620  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124619 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 543 - 768
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 24592776 - 24593041
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592776 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24592875  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  24592876 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 24592975  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592976 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9618559 - 9618345
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9618559 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9618460  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  9618459 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 9618360  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  9618359 tttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 26275329 - 26275511
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26275329 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26275428  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26275429 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 767
Target Start/End: Original strand, 26320104 - 26320284
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26320104 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26320203  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 767  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  26320204 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  762 ttgatgca 769  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 554 - 769
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  754 gtacctctttgatgca 769  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Original strand, 26670149 - 26670363
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  26670149 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcta 26670248  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26670249 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26670348  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  26670349 tttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 769
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  762 ttgatgca 769  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 19456185 - 19456661
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19456185 catcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 19456284  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19456285 catagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgat 19456384  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19456385 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattc 19456484  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19456485 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 19456584  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456585 gtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 21702928 - 21703404
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21702928 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtggttaaacagagaggcttgg 21703027  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21703028 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 21703127  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703128 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 21703227  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21703228 tttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggtt 21703327  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21703328 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16164079 - 16163600
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagagg---ct 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16164079 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggaggct 16163980  T
Q  113 tggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 212  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16163979 tggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgt 16163880  T
Q  213 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16163879 gattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagca 16163780  T
Q  313 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 412  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16163779 tccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctg 16163680  T
Q  413 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16163679 gttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27119165 - 27118689
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119165 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 27119066  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27119065 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgat 27118966  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27118965 tcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcc 27118866  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27118865 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 27118766  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27118765 gtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 492
Target Start/End: Original strand, 34303068 - 34303543
Alignment:
Q  17 atcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggc 116  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  34303068 atcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatcattgtcaaacaaggaggcttggc 34303167  T
Q  117 ataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatt 216  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||    
T  34303168 atagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgttt 34303267  T
Q  217 cggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcct 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34303268 cggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcct 34303367  T
Q  317 tcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttg 416  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34303368 tcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttg 34303467  T
Q  417 tgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34303468 tgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3785123 - 3784655
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3785123 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 3785024  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3785023 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 3784924  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  3784923 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 3784824  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784823 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 3784724  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3784723 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34157479 - 34157012
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34157479 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 34157380  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34157379 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 34157280  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  34157279 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 34157181  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157180 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 34157081  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34157080 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 31891099 - 31891568
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891099 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 31891198  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31891199 cgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaag 31891298  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||    
T  31891299 aggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgaca 31891398  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891399 tcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 31891498  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31891499 gccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 22925792 - 22926268
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22925792 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 22925891  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22925892 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 22925991  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  22925992 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 22926091  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  22926092 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 22926191  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926192 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 164 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27392973
Alignment:
Q  164 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 263  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  264 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 363  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  364 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| | |    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatc 27392999  T
Q  464 attggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27392998 attggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 27434208 - 27434684
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27434208 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27434307  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  27434308 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 27434407  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  27434408 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 27434507  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27434508 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 27434607  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434608 gtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28882691 - 28882215
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  28882691 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 28882592  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  28882591 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 28882492  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  28882491 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 28882392  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28882391 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 28882292  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28882291 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12656019 - 12655543
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |   || || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  12656019 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 12655920  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||    
T  12655919 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgat 12655820  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  12655819 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 12655720  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12655719 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 12655620  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655619 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 551 - 841
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 841  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20838395 - 20837919
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  20838395 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20838296  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||    
T  20838295 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgat 20838196  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  20838195 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 20838096  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20838095 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 20837996  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837995 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Original strand, 23128362 - 23128806
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||||||  | |||| ||||||    
T  23128362 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagt 23128461  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  23128462 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 23128561  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23128562 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaa 23128661  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  23128662 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 23128761  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128762 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Original strand, 9349813 - 9350219
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  9349813 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcct 9349912  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  9349913 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 9350012  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||     
T  9350013 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggt 9350112  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    || || |  |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  9350113 aaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaag 9350212  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  9350213 ttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40233921 - 40233515
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  40233921 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 40233822  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  40233821 cacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 40233722  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  40233721 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggc 40233622  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  40233621 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaag 40233522  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  40233521 ttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 11635017 - 11635426
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  11635017 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 11635116  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||    
T  11635117 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaag 11635216  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  11635217 cttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 11635316  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11635317 aacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 11635416  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  11635417 taggtctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34286831 - 34286355
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  34286831 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 34286732  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  34286731 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcatgat 34286632  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  34286631 ttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 34286532  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  34286531 ctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 34286432  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34286431 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34291891 - 34291415
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  34291891 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 34291792  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  34291791 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcatgat 34291692  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  34291691 ttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 34291592  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  34291591 ctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 34291492  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34291491 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 11641206 - 11641615
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  11641206 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 11641305  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||    
T  11641306 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaag 11641405  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  11641406 cttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 11641505  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  11641506 aacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaag 11641605  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  11641606 taggtctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 13936308 - 13936781
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| |||  | ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  13936308 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 13936407  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  13936408 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 13936507  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || ||    
T  13936508 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacaccc 13936607  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  13936608 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 13936707  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13936708 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32050275 - 32049799
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  32050275 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttg 32050176  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||    
T  32050175 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgat 32050076  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  32050075 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 32049976  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |||    
T  32049975 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagtt 32049876  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32049875 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12587287 - 12586814
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  12587287 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 12587188  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  12587187 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 12587088  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  12587087 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 12586988  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  12586987 ttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 12586888  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12586887 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 21677013 - 21677422
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  21677013 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 21677112  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  21677113 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 21677212  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  21677213 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 21677312  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21677313 aacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 21677412  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  21677413 taggcctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27777699 - 27777226
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27777699 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27777600  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27777599 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27777500  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  27777499 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27777400  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  27777399 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 27777300  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27777299 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27817457 - 27816984
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27817457 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27817358  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27817357 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27817258  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  27817257 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27817158  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  27817157 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 27817058  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27817057 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34862090 - 34861681
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |    
T  34862090 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttctt 34861991  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  34861990 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 34861891  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  34861890 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 34861791  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34861790 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 34861691  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  34861690 taggcctagc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 37685740 - 37686149
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37685740 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37685839  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  37685840 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37685939  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  37685940 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 37686039  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37686040 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 37686139  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  37686140 taggcctagc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 37701005 - 37701414
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37701005 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37701104  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  37701105 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37701204  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  37701205 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 37701304  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37701305 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 37701404  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  37701405 taggcctagc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37925903 - 37925494
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  37925903 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37925804  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  37925803 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37925704  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  37925703 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 37925604  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37925603 aacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaag 37925504  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  37925503 taggcctagc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 37375638 - 37375163
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  37375638 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgttcatggctgaacagagaagctttg 37375539  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |  ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  37375538 cacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 37375439  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  37375438 ttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 37375339  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  37375338 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 37375239  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  37375238 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 12716366 - 12716839
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  12716366 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 12716465  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  12716466 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 12716565  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  12716566 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 12716665  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  12716666 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 12716765  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12716766 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 16829169 - 16829578
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  16829169 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 16829268  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  16829269 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 16829368  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||    
T  16829369 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggc 16829468  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16829469 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 16829568  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  16829569 taggcctagc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16892312 - 16891903
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  16892312 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 16892213  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  16892212 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 16892113  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||    
T  16892112 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggc 16892013  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16892012 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 16891913  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  16891912 taggcctagc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27804184 - 27803711
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27804184 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27804085  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27804084 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27803985  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  27803984 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27803885  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  27803884 ctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 27803785  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27803784 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 39051586 - 39052059
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   | |||||| |||| |    
T  39051586 catcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgatcagagaagctttg 39051685  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  39051686 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 39051785  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  39051786 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 39051885  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  39051886 ctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 39051985  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39051986 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31876691 - 31876282
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  31876691 ttggcatgatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 31876592  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  31876591 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31876492  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  31876491 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 31876392  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||    
T  31876391 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaag 31876292  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  31876291 taggcctagc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Original strand, 260517 - 260984
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||| |||   |||||||| |||| |    
T  260517 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcgtggctgaacagagaagctttg 260616  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  260617 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgat 260716  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  260717 ttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 260816  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  260817 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 260916  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  260917 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39890551 - 39890075
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  39890551 catcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 39890452  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  39890451 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 39890352  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || ||    
T  39890351 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacaccc 39890252  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  39890251 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 39890152  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39890151 gtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 417
Target Start/End: Original strand, 19416330 - 19416664
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  19416330 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 19416429  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  19416430 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 19416529  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  19416530 tttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 19416629  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 417  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416630 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 551 - 666
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  651 ataactgggcagcatt 666  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279450
Alignment:
Q  278 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 377  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  378 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 477  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  478 aaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 768
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  754 gtacctctttgatgc 768  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 560 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37374799
Alignment:
Q  560 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 659  Q
    ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 37374992  T
Q  660 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 759  Q
      || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37374991 ttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 37374892  T
Q  760 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374891 cttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 31876184 - 31876002
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31876184 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31876085  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  31876084 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 34861583 - 34861401
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34861583 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 34861484  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  34861483 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 37686247 - 37686429
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37686247 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37686346  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37686347 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 37701512 - 37701694
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37701512 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37701611  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37701612 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889783
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  754 gtacctctt 762  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 16829676 - 16829858
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16829775  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829776 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 16891805 - 16891623
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16891706  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891705 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Original strand, 19416837 - 19417042
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19416837 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagcca 19416936  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19416937 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19417036  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  19417037 tttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Original strand, 22926366 - 22926547
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  22926366 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 22926465  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  22926466 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 801
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  548 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 647  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  648 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 747  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  748 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 15284703 - 15285179
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15284703 catcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 15284802  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15284803 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgat 15284902  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284903 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 15285002  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15285003 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 15285102  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15285103 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15228366 - 15227890
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15228366 catcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 15228267  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15228266 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgat 15228167  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15228166 tcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 15228067  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15228066 ttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggtt 15227967  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15227966 gtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 1900753 - 1900277
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1900753 catcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggtcatggtcaaacaaagaggcttgg 1900654  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1900653 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 1900554  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  1900553 tcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatcc 1900454  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  1900453 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggtt 1900354  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1900353 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Original strand, 24460388 - 24460856
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24460388 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 24460487  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24460488 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 24460587  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24460588 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 24460687  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460688 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 24460787  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24460788 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 15391113 - 15391586
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  15391113 catcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgattatggtcaaacaaggaggcttgg 15391212  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15391213 catagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctcgatcatgttcacagcagcgtgat 15391312  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15391313 tcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatcc 15391412  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15391413 ttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggtt 15391512  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391513 gtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 532 - 851
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  832 agtccccatgatgtccatct 851  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 14235300 - 14235776
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| || ||| |||||  ||  ||||| || |||  |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  14235300 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcatggtcatggtcaaacaaggaagcttgg 14235399  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14235400 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgat 14235499  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14235500 tcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatcc 14235599  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14235600 ctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggtt 14235699  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14235700 gtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17014496 - 17014020
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  17014496 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 17014397  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  17014396 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 17014297  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  17014296 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 17014197  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17014196 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 17014097  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17014096 gtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 24592089 - 24592565
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| |||||   |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  24592089 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 24592188  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  24592189 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 24592288  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  24592289 tgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 24592388  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24592389 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 24592488  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24592489 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14665514 - 14665038
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  14665514 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 14665415  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  14665414 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 14665315  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  14665314 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 14665215  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14665214 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 14665115  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14665114 gtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 14763079 - 14763555
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  14763079 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 14763178  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  14763179 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 14763278  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  14763279 ttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 14763378  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  14763379 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 14763478  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14763479 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5006302 - 5005893
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5006302 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5006203  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  |||||    
T  5006202 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgag 5006103  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  5006102 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 5006003  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5006002 aacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 5005903  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  5005902 taggcctagc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6570349 - 6569873
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| |||||| ||  ||| || | || ||||||| |||||||   |||||||| |||| |    
T  6570349 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcataatcatggctgaacagagaagctttg 6570250  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  6570249 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 6570150  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  6570149 ttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 6570050  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  6570049 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 6569950  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6569949 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 36344290 - 36344765
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  36344290 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 36344389  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  36344390 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 36344489  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  36344490 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 36344589  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  36344590 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 36344689  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  36344690 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 18800388 - 18800863
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18800388 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18800487  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18800488 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18800587  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  18800588 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18800687  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  18800688 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 18800787  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800788 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14098970 - 14098561
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  14098970 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 14098871  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  14098870 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 14098771  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||    
T  14098770 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggc 14098671  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  14098670 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 14098571  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  14098570 taggtctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 31126360 - 31126769
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  31126360 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 31126459  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  31126460 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 31126559  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  31126560 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 31126659  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31126660 aacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaag 31126759  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  31126760 taggcctagc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 40105480 - 40105889
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  40105480 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 40105579  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  40105580 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 40105679  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  40105680 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 40105779  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  40105780 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaag 40105879  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  40105880 taggcctagc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 27163159 - 27163568
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27163159 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 27163258  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  27163259 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 27163358  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  27163359 tttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 27163458  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27163459 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 27163558  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  27163559 taggcctagc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24113158 - 24112682
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||| |||| | | |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  24113158 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 24113059  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24113058 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 24112959  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  24112958 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 24112859  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24112858 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24112759  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24112758 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30754250 - 30753777
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  30754250 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 30754151  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  30754150 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 30754051  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  30754050 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 30753951  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  30753950 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 30753851  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30753850 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 33673573 - 33674046
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  33673573 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 33673672  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  33673673 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 33673772  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  33673773 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 33673872  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  33673873 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 33673972  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33673973 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 34188735 - 34189211
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||| | || | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  34188735 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaacaaagcttgg 34188834  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34188835 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 34188934  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  34188935 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 34189034  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  34189035 ctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 34189134  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34189135 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 556 - 853
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  556 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 655  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  656 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 754  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  755 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 853  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21970197 - 21969721
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |    
T  21970197 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttg 21970098  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||    
T  21970097 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgat 21969998  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  21969997 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 21969898  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || ||     
T  21969897 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtc 21969798  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21969797 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 54833816 - 54833408
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  54833816 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 54833717  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  54833716 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 54833617  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  54833616 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 54833517  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  54833516 aacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaag 54833417  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  54833416 ttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 39851067 - 39850661
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  39851067 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 39850968  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||    
T  39850967 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgag 39850868  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||     
T  39850867 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggt 39850768  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39850767 aaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaag 39850668  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  39850667 ttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 570 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  570 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 669  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  670 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  770 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 560 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  560 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 659  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  660 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 759  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  760 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  754 gtacctctttgatgca 769  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 554 - 792
Target Start/End: Original strand, 33674126 - 33674364
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  33674126 acgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 33674225  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  33674226 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 33674325  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674326 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Original strand, 40105987 - 40106240
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40105987 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 40106086  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  40106087 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 40106186  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106187 tttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 554 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  754 gtacctctttgatgca 769  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 14143003 - 14143479
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143003 catcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 14143102  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143103 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 14143202  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14143203 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 14143302  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  14143303 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 14143402  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143403 gcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26788422 - 26787946
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788422 catcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 26788323  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788322 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 26788223  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  26788222 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 26788123  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  26788122 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 26788023  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26788022 gcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27196795 - 27196319
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196795 catcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 27196696  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196695 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 27196596  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27196595 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 27196496  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  27196495 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 27196396  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196395 gcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 27252445 - 27252921
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252445 catcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 27252544  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252545 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 27252644  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27252645 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatcc 27252744  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  27252745 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgatt 27252844  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252845 gcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 13521791 - 13522267
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13521791 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggcttgg 13521890  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13521891 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 13521990  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  13521991 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatcc 13522090  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13522091 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 13522190  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522191 gtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 22456661 - 22457128
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  22456661 catcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaagaagctttg 22456760  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22456761 catagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgat 22456851  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22456852 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatcc 22456951  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22456952 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 22457051  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457052 gtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Original strand, 8892037 - 8892504
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8892037 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 8892136  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8892137 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 8892236  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8892237 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 8892335  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892336 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 8892435  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8892436 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Original strand, 8903272 - 8903739
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8903272 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 8903371  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8903372 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 8903471  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8903472 ggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacat 8903570  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903571 catgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 8903670  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8903671 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 33373981 - 33374450
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33373981 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcgtggtcaaacagagaggcttggcataacc 33374080  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33374081 cgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaag 33374180  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  33374181 agggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgaca 33374280  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374281 tcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 33374380  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33374381 gccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28163128 - 28162659
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28163128 ctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacc 28163029  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28163028 cgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaag 28162929  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||    
T  28162928 aggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgaca 28162829  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162828 tcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 28162729  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28162728 gccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 27290088 - 27290564
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27290088 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27290187  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  27290188 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgat 27290287  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  27290288 tcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatcc 27290387  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27290388 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 27290487  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27290488 gtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 27272298 - 27272771
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||| |||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27272298 catcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27272397  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  27272398 cacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgat 27272497  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  27272498 ttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 27272597  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27272598 ctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtt 27272697  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27272698 gtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 266 - 492
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477467
Alignment:
Q  266 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 365  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  366 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcat 465  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  466 tggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Original strand, 22934630 - 22935074
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||    
T  22934630 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagt 22934729  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22934730 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 22934829  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22934830 ttattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 22934929  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| ||    
T  22934930 aatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaag 22935029  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22935030 caactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Original strand, 23857075 - 23857519
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||    
T  23857075 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagt 23857174  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  23857175 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 23857274  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23857275 ttattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 23857374  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| ||    
T  23857375 aatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaag 23857474  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23857475 caactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26989479 - 26989003
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  26989479 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 26989380  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  26989379 cacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 26989280  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  26989279 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcaccc 26989180  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26989179 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 26989080  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26989079 gtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 13298669 - 13299145
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    | ||||||||| |||||   |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  13298669 catcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 13298768  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  13298769 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 13298868  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| |||||||||    
T  13298869 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatcc 13298968  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13298969 ctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 13299068  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299069 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26918826 - 26918382
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  26918826 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 26918727  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||      
T  26918726 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggaca 26918627  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  26918626 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 26918527  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  26918526 aatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 26918427  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26918426 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16750332 - 16749856
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  16750332 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 16750233  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  16750232 caccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 16750133  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  16750132 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 16750033  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16750032 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 16749933  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16749932 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 24304336 - 24304812
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  24304336 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatggtcatggctgaacagagaagctttg 24304435  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  24304436 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 24304535  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| ||    
T  24304536 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcaccc 24304635  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24304636 ctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 24304735  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24304736 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 15424035 - 15424511
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| | |||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  15424035 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 15424134  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||    
T  15424135 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgat 15424234  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  15424235 ttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 15424334  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  15424335 ctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtt 15424434  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424435 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24864163 - 24863719
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||||| || ||| | ||||||||| || || |||||||||||    
T  24864163 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagt 24864064  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  24864063 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 24863964  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  24863963 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 24863864  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||    
T  24863863 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaag 24863764  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24863763 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29549953 - 29549477
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29549953 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29549854  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||    
T  29549853 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgat 29549754  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  29549753 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29549654  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  29549653 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 29549554  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29549553 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 164 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160704
Alignment:
Q  164 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 263  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  264 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 363  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  364 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 463  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 20160732  T
Q  464 attggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20160731 atcggtatcggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 164 - 491
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172127
Alignment:
Q  164 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 263  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  264 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 363  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  364 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagc 463  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataac 22172099  T
Q  464 attggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22172100 atcggtatcggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 545 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  545 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  645 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 744  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  745 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 844  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  845 tccatctca 853  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 545 - 853
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  545 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  645 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 744  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  745 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 844  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  845 tccatctca 853  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 4773484 - 4773009
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  4773484 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 4773385  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||| ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  4773384 cacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 4773285  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  4773284 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 4773185  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  4773184 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 4773085  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4773084 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29573424 - 29573015
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29573424 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29573325  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  29573324 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 29573225  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  29573224 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 29573125  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  29573124 aacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 29573025  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  29573024 ttggtctagc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Original strand, 4545493 - 4545960
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  4545493 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 4545592  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  4545593 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 4545692  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  4545693 ttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 4545792  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  4545793 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 4545892  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4545893 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 34463064 - 34463537
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  34463064 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 34463163  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  34463164 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 34463263  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  34463264 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 34463363  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||     
T  34463364 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtc 34463463  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34463464 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 4758242 - 4757767
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  4758242 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 4758143  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  4758142 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 4758043  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  4758042 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 4757943  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  4757942 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 4757843  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757842 gtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27008205 - 27007730
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27008205 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27008106  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27008105 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27008006  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  27008005 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27007906  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  27007905 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 27007806  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27007805 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16674617 - 16674144
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   || ||||| |||| |    
T  16674617 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaatagagaagctttg 16674518  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  16674517 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 16674418  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16674417 ttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16674318  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  16674317 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 16674218  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16674217 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 17092158 - 17092427
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| || |||  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  17092158 catcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctatgatcatggtcaaacaaagaggcttga 17092257  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17092258 catagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggt 17092357  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 285  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092358 ttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 4525697 - 4525289
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4525697 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 4525598  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  4525597 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4525498  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| ||||||    
T  4525497 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggc 4525398  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4525397 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 4525298  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  4525297 ttggtctag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000075
Alignment:
Q  173 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 272  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  273 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 372  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  373 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 472  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  473 ggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 27359710 - 27360185
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  27359710 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 27359809  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27359810 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27359909  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  27359910 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 27360009  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  27360010 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 27360109  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27360110 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 27450053 - 27450528
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  27450053 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 27450152  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27450153 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27450252  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  27450253 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 27450352  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  27450353 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 27450452  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27450453 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 30557801 - 30558210
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  30557801 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 30557900  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  30557901 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 30558000  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||    
T  30558001 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggc 30558100  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  30558101 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 30558200  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  30558201 taggcctagc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 483
Target Start/End: Original strand, 4723919 - 4724319
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4723919 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 4724018  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  4724019 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4724118  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  4724119 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 4724218  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4724219 aacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 4724318  T
Q  483 t 483  Q
    |    
T  4724319 t 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3696492 - 3696086
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  3696492 ttggcatgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcat 3696393  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  3696392 cacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 3696293  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  3696292 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 3696193  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3696192 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 3696093  T
Q  483 taggtct 489  Q
    | |||||    
T  3696092 ttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 551 - 801
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 28207932 - 28207465
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||  || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| |||| |    
T  28207932 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctttg 28207833  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  28207832 catagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 28207733  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  28207732 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 28207633  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||     
T  28207632 ctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtc 28207533  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28207532 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 551 - 695
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 695  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 29501893 - 29501418
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29501893 catcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29501794  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  29501793 cacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 29501694  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  29501693 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29501594  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  29501593 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 29501494  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||    
T  29501493 gtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Original strand, 16943745 - 16944146
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  16943745 catcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 16943844  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||    
T  16943845 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgat 16943944  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  16943945 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 16944044  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  16944045 ctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 16944144  T
Q  416 gt 417  Q
    ||    
T  16944145 gt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27044799 - 27044390
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27044799 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 27044700  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  27044699 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 27044600  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggagg 381  Q
     || || || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||    
T  27044599 tttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggagg 27044500  T
Q  382 caacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaa 481  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  27044499 caacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaa 27044400  T
Q  482 gtaggtctag 491  Q
    || |||||||    
T  27044399 gttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27485607 - 27485132
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  27485607 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 27485508  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  27485507 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 27485408  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  27485407 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 27485308  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27485307 ctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 27485208  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27485207 gtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 491
Target Start/End: Original strand, 26116138 - 26116603
Alignment:
Q  26 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 125  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  26116138 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 26116237  T
Q  126 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 225  Q
    | ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  26116238 tatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 26116337  T
Q  226 attgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatca 325  Q
    |||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||    
T  26116338 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 26116437  T
Q  326 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 425  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |    
T  26116438 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgac 26116537  T
Q  426 ctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    ||||  | |||| |||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26116538 ctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17025650 - 17025280
Alignment:
Q  121 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 220  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  17025650 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 17025551  T
Q  221 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 320  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |    
T  17025550 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 17025451  T
Q  321 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 420  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  17025450 catcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgca 17025351  T
Q  421 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    ||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025350 gtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 26777328 - 26777809
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  26777328 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 26777427  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtg-----gtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagc 210  Q
    || | ||||| ||| || |     | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| ||    
T  26777428 cacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggc 26777527  T
Q  211 gtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtag 310  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  26777528 atgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataa 26777627  T
Q  311 catccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtc 410  Q
    || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26777628 cacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtc 26777727  T
Q  411 tggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  26777728 tagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 842  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  843 tgtccatctc 852  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  583 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 682  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  683 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27485021 - 27484807
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27485021 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 27484922  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  27484921 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 27484822  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  27484821 tttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 29572917 - 29572735
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29572917 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29572818  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  29572817 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  762 ttgatgca 769  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 34463620 - 34463867
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  34463620 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 34463719  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34463720 tttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34463819  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463820 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 4546076 - 4546341
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4546076 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4546175  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  4546176 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 4546275  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546276 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Original strand, 16944319 - 16944524
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16944319 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 16944418  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  16944419 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 16944518  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  16944519 tttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 768
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28207346 - 28207081
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28207346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 28207247  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  28207246 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 28207147  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207146 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 16674064 - 16673817
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  16674064 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 16673965  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16673964 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16673865  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673864 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 769
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  762 ttgatgca 769  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 769
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  762 ttgatgca 769  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Original strand, 4724435 - 4724688
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4724435 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4724534  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  4724535 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 4724634  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724635 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27019552 - 27019461
Alignment:
Q  78 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagt 169  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  27019552 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 554 - 840
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 769
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  668 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 767  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  768 ca 769  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 243
Target Start/End: Original strand, 27629539 - 27629645
Alignment:
Q  137 accagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || ||||    
T  27629539 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaagga 27629638  T
Q  237 catgagg 243  Q
    |||||||    
T  27629639 catgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 840
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  659 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 758  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  759 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33877737 - 33877261
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33877737 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggcttgg 33877638  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877637 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 33877538  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  33877537 ttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatcc 33877438  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33877437 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 33877338  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877337 gtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22888960 - 22888484
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22888960 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgatcatggtcaaacaaagaggtttgg 22888861  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22888860 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 22888761  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22888760 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 22888661  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22888660 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 22888561  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22888560 gtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 13184327 - 13184796
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184327 ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 13184426  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13184427 tgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaag 13184526  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  13184527 aggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgaca 13184626  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184627 tcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 13184726  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13184727 gccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25199519 - 25199043
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25199519 catcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttgg 25199420  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25199419 catagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 25199320  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25199319 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatcc 25199220  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25199219 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 25199120  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25199119 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 29888754 - 29889230
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  29888754 catcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcacggttaaacagagaagctttg 29888853  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888854 catagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 29888953  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  29888954 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatcc 29889053  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29889054 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtg 29889153  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889154 gtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11326276 - 11325808
Alignment:
Q  24 tctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11326276 tctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactc 11326177  T
Q  124 gatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11326176 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaaga 11326077  T
Q  224 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 323  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11326076 gggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacat 11325977  T
Q  324 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325976 catgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 11325877  T
Q  424 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11325876 ccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23892696 - 23892220
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||| ||||||  |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  23892696 catcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcatgatcatggttaaacagagaagctttg 23892597  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23892596 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgat 23892497  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| |||||||     
T  23892496 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatct 23892397  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23892396 ttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 23892297  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23892296 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 13440173 - 13440642
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13440173 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagaaaggcttggcataact 13440272  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13440273 cgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaag 13440372  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  13440373 aggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgaca 13440472  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440473 tcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 13440572  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13440573 gccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 532 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctcat 854  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 9548222 - 9548691
Alignment:
Q  23 ctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548222 ctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatcatggtcaaacagagaggcttggcataact 9548321  T
Q  123 tgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaag 222  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  9548322 cgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaag 9548421  T
Q  223 aggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaaca 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||    
T  9548422 aggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgaca 9548521  T
Q  323 tcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagt 422  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  9548522 tcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaat 9548621  T
Q  423 gccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548622 gccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 23752122 - 23752598
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| |||||   |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  23752122 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 23752221  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  23752222 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 23752321  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  23752322 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 23752421  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23752422 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 23752521  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23752522 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 24687829 - 24688305
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || ||||  ||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  24687829 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 24687928  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  24687929 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 24688028  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  24688029 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 24688128  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24688129 ctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 24688228  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24688229 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30935123 - 30934647
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||   | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  30935123 catcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 30935024  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||    
T  30935023 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgat 30934924  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  30934923 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 30934824  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30934823 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 30934724  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30934723 gtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33777977 - 33777501
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   || ||||| |||| |    
T  33777977 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaatagagaagctttg 33777878  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||    
T  33777877 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgat 33777778  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  33777777 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 33777678  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33777677 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 33777578  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33777577 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 23717660 - 23718136
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  23717660 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 23717759  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  23717760 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 23717859  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  23717860 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 23717959  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23717960 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 23718059  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23718060 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11549844 - 11549368
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  11549844 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 11549745  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  11549744 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgat 11549645  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  11549644 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 11549545  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11549544 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 11549445  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549444 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 22998786 - 22999262
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  22998786 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 22998885  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || |    
T  22998886 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggt 22998985  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  22998986 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 22999085  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22999086 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 22999185  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22999186 gtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24970508 - 24970032
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  24970508 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 24970409  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||    
T  24970408 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgat 24970309  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  24970308 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 24970209  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24970208 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 24970109  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24970108 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 15658432 - 15658908
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  15658432 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagcttcg 15658531  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||    
T  15658532 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgat 15658631  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  15658632 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 15658731  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  15658732 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 15658831  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15658832 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12132645 - 12132169
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||| ||| || || |||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  12132645 catcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 12132546  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  12132545 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 12132446  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  12132445 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 12132346  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  12132345 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 12132246  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12132245 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31431930 - 31431463
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  31431930 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 31431831  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31431830 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31431731  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  31431730 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 31431631  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  31431630 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 31431531  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31431530 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9317874 - 9317465
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  9317874 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 9317775  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  9317774 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 9317675  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  9317674 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 9317575  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  9317574 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 9317475  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  9317474 taggcctagc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2511541 - 2511065
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  2511541 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 2511442  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  2511441 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 2511342  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  2511341 ttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 2511242  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2511241 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 2511142  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2511141 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 28649658 - 28649250
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28649658 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 28649559  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  28649558 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 28649459  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  28649458 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 28649359  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  28649358 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 28649259  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  28649258 ttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 18500402 - 18500877
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  18500402 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 18500501  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  18500502 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 18500601  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  18500602 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 18500701  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  18500702 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 18500801  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18500802 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 37671155 - 37671630
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  37671155 catcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 37671254  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||| |   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  37671255 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 37671354  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  37671355 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 37671454  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  37671455 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtc 37671554  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37671555 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30152441 - 30152032
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30152441 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 30152342  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  30152341 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 30152242  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  30152241 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggc 30152142  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30152141 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 30152042  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  30152041 taggcctagc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 31826079 - 31826552
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  31826079 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 31826178  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  31826179 cacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 31826278  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  31826279 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 31826378  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31826379 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31826478  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31826479 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6874795 - 6874319
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  6874795 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttg 6874696  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  6874695 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 6874596  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  6874595 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 6874496  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6874495 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 6874396  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6874395 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41675199 - 41674723
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  41675199 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 41675100  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  41675099 cacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 41675000  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  41674999 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 41674900  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  41674899 ctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 41674800  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41674799 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30168955 - 30168483
Alignment:
Q  20 aagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcata 119  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||| || || |||| |  | || || ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |    
T  30168955 aagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcatgatcatgattgaacagagaagctttgcaca 30168856  T
Q  120 acttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgg 219  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  30168855 gcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgg 30168756  T
Q  220 aagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttca 319  Q
     || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||     
T  30168755 tagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcg 30168656  T
Q  320 acatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgc 419  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |    
T  30168655 acatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtac 30168556  T
Q  420 agtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    | ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30168555 aatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26480814 - 26480406
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  26480814 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26480716  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  26480715 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26480616  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  26480615 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 26480516  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26480515 aacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 26480416  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  26480415 taggcctagc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 43078742 - 43078269
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  43078742 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 43078643  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  43078642 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 43078543  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  43078542 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 43078443  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  43078442 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 43078343  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43078342 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 32599144 - 32599620
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  32599144 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 32599243  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  32599244 cacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 32599343  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  32599344 tcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 32599443  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  32599444 ctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 32599543  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32599544 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 37358315 - 37358790
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  37358315 catcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 37358414  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  37358415 cacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 37358514  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  37358515 ttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 37358614  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  37358615 ctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 37358714  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37358715 gtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 489
Target Start/End: Original strand, 40473223 - 40473694
Alignment:
Q  18 tcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggca 117  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || || |||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |||    
T  40473223 tcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatggtcatggctgaacagagaagctttgca 40473322  T
Q  118 taacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattc 217  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||     
T  40473323 cagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattt 40473422  T
Q  218 ggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 317  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || |    
T  40473423 gggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccct 40473522  T
Q  318 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 417  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  40473523 cgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgt 40473622  T
Q  418 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473623 gcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 849  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  850 ctc 852  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 658 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  658 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 757  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  758 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5638333 - 5637924
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  5638333 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 5638234  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  5638233 cacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 5638134  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  5638133 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 5638034  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5638033 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 5637934  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  5637933 taggcctagc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 8665214 - 8665623
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  8665214 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 8665313  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  8665314 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 8665413  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  8665414 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 8665513  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8665514 aacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 8665613  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  8665614 taggcctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 15758596 - 15759005
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15758596 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 15758695  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  15758696 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 15758795  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  15758796 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 15758895  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15758896 aacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 15758995  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  15758996 taggcctagc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 18375151 - 18375560
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18375151 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 18375250  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  18375251 cacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 18375350  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  18375351 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 18375450  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18375451 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaag 18375550  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  18375551 taggtctagc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 532 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 689  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24681930 - 24681457
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  24681930 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 24681831  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  24681830 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 24681731  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  24681730 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 24681631  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24681630 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24681531  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681530 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24724457 - 24723984
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| |    
T  24724457 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttg 24724358  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  24724357 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 24724258  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  24724257 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 24724158  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  24724157 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 24724058  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24724057 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33516779 - 33516370
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  33516779 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 33516680  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  33516679 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 33516580  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||    
T  33516579 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggc 33516480  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  33516479 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaag 33516380  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  33516379 taggcctagc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30029905 - 30029504
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  30029905 catcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 30029806  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  30029805 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 30029706  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  30029705 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 30029606  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  30029605 ctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 30029506  T
Q  416 gt 417  Q
    ||    
T  30029505 gt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33293015 - 33292539
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||   ||| |||||| | || | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  33293015 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 33292916  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  33292915 cacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcatcatgat 33292816  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  33292815 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 33292716  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  33292715 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 33292616  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33292615 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 13324501 - 13324976
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  13324501 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 13324600  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  13324601 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 13324700  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  13324701 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 13324800  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||     
T  13324801 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtc 13324900  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13324901 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34616941 - 34616532
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  34616941 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 34616842  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  34616841 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 34616742  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  34616741 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 34616642  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  34616641 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 34616542  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    | ||||||||    
T  34616541 ttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 551 - 851
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  851 t 851  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Original strand, 37770726 - 37771134
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  37770726 ttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcct 37770825  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  37770826 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 37770925  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  37770926 cttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 37771025  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  37771026 aacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 37771125  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  37771126 ttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 3790031 - 3789556
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  3790031 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 3789932  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  3789931 cacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 3789832  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  3789831 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 3789732  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  3789731 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 3789632  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3789631 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 417
Target Start/End: Original strand, 29966805 - 29967139
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  29966805 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29966904  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  29966905 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 29967004  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  29967005 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 29967104  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 417  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967105 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 37755403 - 37754995
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  37755403 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 37755304  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||    
T  37755303 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 37755204  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  37755203 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 37755104  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  37755103 aacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaag 37755004  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  37755003 ttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 28959458 - 28959934
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     ||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  28959458 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttg 28959557  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||    
T  28959558 cacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgat 28959657  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || ||    
T  28959658 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 28959757  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  28959758 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 28959857  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28959858 gtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 554 - 768
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  754 gtacctctttgatgc 768  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9317367 - 9317153
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9317367 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9317268  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  9317267 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 9317168  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  9317167 tttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 662 - 840
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 12132071 - 12131889
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12132071 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 12131972  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  12131971 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 551 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 649  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 37771245 - 37771427
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || |||||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771245 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37771344  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37771345 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5637826 - 5637561
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5637826 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 5637727  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  5637726 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 5637627  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637626 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 804
Target Start/End: Original strand, 15759103 - 15759320
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15759103 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 15759202  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15759203 ttgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 15759302  T
Q  787 tttctcgaatacaataat 804  Q
    |||||| || ||||||||    
T  15759303 tttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 30151934 - 30151669
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  30151934 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 30151835  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  30151834 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 30151735  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151734 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Original strand, 37358901 - 37359154
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37358901 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37359000  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  37359001 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 37359100  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359101 tttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 26480308 - 26480094
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26480308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26480209  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26480208 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26480109  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  26480108 tttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 31826665 - 31826847
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31826764  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31826765 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 37671738 - 37671920
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37671738 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37671837  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37671838 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 28960044 - 28960226
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  28960044 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccg 28960143  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  28960144 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 28649142 - 28648937
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  28649142 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagcca 28649043  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28649042 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28648943  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  28648942 tttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Original strand, 29967312 - 29967517
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29967312 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29967411  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29967412 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29967511  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  29967512 tttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 30029331 - 30029126
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30029331 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 30029232  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  30029231 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 30029132  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  30029131 tttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 801
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  662 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 761  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  762 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 543 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 691  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44563580 - 44563106
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563580 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 44563481  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44563480 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgat 44563382  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44563381 tcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcc 44563283  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44563282 ttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggtt 44563183  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44563182 gtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 19658774 - 19659249
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658774 catcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 19658873  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19658874 cataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgat 19658973  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19658974 tcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcc 19659072  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19659073 ttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggtt 19659172  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19659173 gtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33245146 - 33244670
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33245146 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 33245047  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33245046 cataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggt 33244947  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33244946 tcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcc 33244847  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33244846 ttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggtt 33244747  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244746 gtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Original strand, 22080612 - 22081085
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22080612 catcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggcttgg 22080711  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22080712 catagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctcgatcatgttcacagcagcgtgat 22080811  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22080812 tcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatcc 22080911  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22080912 ttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggtt 22081011  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22081012 gtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18711067 - 18710591
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711067 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 18710968  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710967 cataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 18710868  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  18710867 ttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 18710768  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||    
T  18710767 ctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagtt 18710668  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710667 gtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9355037 - 9354627
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9355037 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 9354938  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9354937 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag 9354838  T
Q  283 ctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggagg 381  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  9354837 ttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggagg 9354738  T
Q  382 caacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaa 481  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  9354737 cgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaag 9354638  T
Q  482 gtaggtctagc 492  Q
    |||||||||||    
T  9354637 gtaggtctagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16283930 - 16283454
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  16283930 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtatgatcatggctaaacagagaagctttg 16283831  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  16283830 catagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgat 16283731  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  16283730 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 16283631  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16283630 ttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 16283531  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16283530 gtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16278035 - 16277559
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    |||||| |||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  16278035 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 16277936  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||    
T  16277935 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgat 16277836  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  16277835 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 16277736  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16277735 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 16277636  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277635 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19688547 - 19688103
Alignment:
Q  48 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  19688547 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 19688448  T
Q  148 tgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaag 247  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  19688447 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 19688348  T
Q  248 ttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatgga 347  Q
    || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19688347 ttattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaa 19688248  T
Q  348 aatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggag 447  Q
    ||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||    
T  19688247 aatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaag 19688148  T
Q  448 taactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688147 caactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 27608639 - 27609115
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   || || || |||| |    
T  27608639 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaatagggaagctttg 27608738  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  27608739 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgat 27608838  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||    
T  27608839 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatcc 27608938  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27608939 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 27609038  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27609039 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 2136993 - 2137469
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  2136993 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 2137092  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||    
T  2137093 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgat 2137192  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  2137193 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 2137292  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2137293 ctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 2137392  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137393 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14558105 - 14557629
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    |||||||| |||| |    
T  14558105 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatgactgaacagagaagctttg 14558006  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||    
T  14558005 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgat 14557906  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  14557905 ttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 14557806  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  14557805 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggtt 14557706  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14557705 gtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 31489484 - 31489960
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| |||  ||||  ||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  31489484 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 31489583  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31489584 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31489683  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31489684 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31489783  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31489784 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31489883  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31489884 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19674922 - 19674446
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  19674922 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 19674823  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  19674822 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 19674723  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |     
T  19674722 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacct 19674623  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  19674622 ctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagtt 19674523  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19674522 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 3329241 - 3329716
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||     |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  3329241 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 3329340  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||    
T  3329341 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgat 3329440  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  3329441 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 3329540  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||     
T  3329541 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtc 3329640  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3329641 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 19208161 - 19208570
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  19208161 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 19208260  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  19208261 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 19208360  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  19208361 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 19208460  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19208461 aacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 19208560  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  19208561 taggcctagc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 28361756 - 28362165
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  28361756 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 28361855  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  28361856 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 28361955  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  28361956 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 28362055  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28362056 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 28362155  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  28362156 taggcctagc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31354938 - 31354529
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  31354938 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcct 31354839  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  31354838 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31354739  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  31354738 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 31354639  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31354638 aaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaag 31354539  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  31354538 taggcctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 29829803 - 29829328
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  29829803 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 29829704  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  29829703 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 29829604  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  29829603 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 29829504  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  29829503 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtg 29829404  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29829403 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19286876 - 19286468
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19286876 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 19286777  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  19286776 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 19286677  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
     || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  19286676 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 19286577  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  19286576 aacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaag 19286477  T
Q  483 taggtctag 491  Q
    | |||||||    
T  19286476 ttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 491
Target Start/End: Original strand, 12092458 - 12092933
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||  || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| |||| |    
T  12092458 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctttg 12092557  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  12092558 catagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 12092657  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  12092658 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 12092757  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  12092758 ctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 12092857  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 491  Q
    || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12092858 gtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 189513 - 189256
Alignment:
Q  78 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagc 177  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  189513 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 189414  T
Q  178 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggttt 277  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |      
T  189413 ttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 189314  T
Q  278 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 335  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189313 ataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33259204 - 33258803
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  33259204 catcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttg 33259105  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||    
T  33259104 cacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgat 33259005  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  33259004 ttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 33258905  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  33258904 ctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtt 33258805  T
Q  416 gt 417  Q
    ||    
T  33258804 gt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 551 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  651 ataactgggcagcatt 666  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  542 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 641  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  642 acgacggaaataactgggcagcatt 666  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 560 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  560 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 659  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  660 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 759  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  760 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 554 - 792
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 792  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 543 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  543 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 642  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  643 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 742  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  743 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 768  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 19208668 - 19208850
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19208668 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 19208767  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| ||||||    
T  19208768 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttcttcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Original strand, 28362263 - 28362477
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  28362263 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 28362362  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  28362363 tggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 28362462  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  28362463 tttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Original strand, 3329827 - 3330080
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||    
T  3329827 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagcca 3329926  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  3329927 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 3330026  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330027 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 29829220 - 29828967
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29829220 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29829121  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29829120 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29829021  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 840  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829020 tttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 587 - 801
Target Start/End: Original strand, 19518451 - 19518665
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  19518451 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtca 19518550  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19518551 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19518650  T
Q  787 tttctcgaatacaat 801  Q
    |||||| || |||||    
T  19518651 tttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 33258630 - 33258425
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33258630 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 33258531  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  33258530 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 33258431  T
Q  787 tttctc 792  Q
    ||||||    
T  33258430 tttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 12093041 - 12093306
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12093041 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagcca 12093140  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  12093141 tagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 12093240  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093241 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22042 - 21569
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22042 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggcttgg 21943  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21942 catagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgat 21843  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21842 tcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatcc 21743  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21742 ttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggtt 21643  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 489  Q
    |||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21642 gtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 532 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  532 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 631  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  632 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 731  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  732 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  832 agtccccatgatgtccatctca 853  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 155 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20729 - 20393
Alignment:
Q  155 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttct 254  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20729 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 20630  T
Q  255 caaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 354  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629 caaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 20531  T
Q  355 cttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcg 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20530 cttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactca 20431  T
Q  455 gcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20430 gcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30933 - 30532
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  30933 catcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 30834  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  30833 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 30734  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  30733 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 30634  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  30633 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 30534  T
Q  416 gt 417  Q
    ||    
T  30533 gt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 214 - 492
Target Start/End: Original strand, 1 - 279
Alignment:
Q  214 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  314 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  414 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 155 - 427
Target Start/End: Original strand, 1832 - 2103
Alignment:
Q  155 ttacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttct 254  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1832 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 1931  T
Q  255 caaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 354  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932 caaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 2030  T
Q  355 cttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031 cttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6495 - 6080
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  6495 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 6396  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  6395 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 6296  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatc 314  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || |    
T  6295 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacc 6196  T
Q  315 cttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 413  Q
    | || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  6195 cctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 6096  T
Q  414 ttgtgcagtgccctct 429  Q
    | || || ||||||||    
T  6095 tcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5682
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaat-ggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaat 652  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||       
T  5930 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggc 5831  T
Q  653 aactgggcagcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtta 751  Q
    |  || |  ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  5830 atttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccatta 5732  T
Q  752 ccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 801  Q
    || || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5731 ccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 172; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Original strand, 393 - 728
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||| || |||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  393 catcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggagacttgg 492  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  493 catagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgat 592  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  593 tcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatcc 692  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 351  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  693 ttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 46760 - 47236
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |    
T  46760 catcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttg 46859  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  46860 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 46959  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||    
T  46960 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcaccc 47059  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47060 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 47159  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47160 gtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 492
Target Start/End: Original strand, 39846 - 40320
Alignment:
Q  18 tcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggca 117  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| |||    
T  39846 tcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgca 39945  T
Q  118 taacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattc 217  Q
     | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || |||||     
T  39946 cagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattt 40045  T
Q  218 ggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || |    
T  40046 ggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccct 40145  T
Q  318 caacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 417  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40146 cgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 40245  T
Q  418 gcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40246 acaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30244 - 29768
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| |||| |  |  ||| || |||| ||||| |||||||||   |||||||| |||| |    
T  30244 catcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgtgatcatggctgaacagagaagctttg 30145  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||    
T  30144 cacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgat 30045  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  30044 ttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 29945  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29944 ctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 29845  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29844 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  554 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 653  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  654 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 753  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  754 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27773 - 27297
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| |    
T  27773 catcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaatagagaagctttg 27674  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  27673 cacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgat 27574  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
T  27573 ttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcaccc 27474  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27473 ctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggtt 27374  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27373 gtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 492
Target Start/End: Original strand, 9 - 381
Alignment:
Q  121 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  9 cttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttgga 108  T
Q  221 agaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaa 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |    
T  109 agaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcga 208  T
Q  321 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 420  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  209 catcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtaca 308  T
Q  421 gtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
     ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  309 atgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 852
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  551 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  651 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 750  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  751 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10047 - 9571
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||| ||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||| |||||| |    
T  10047 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagaaaggctttg 9948  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  9947 cacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 9848  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  9847 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 9748  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  9747 ctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtc 9648  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9647 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 583 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  583 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 682  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  683 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 782  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  783 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 7081 - 7490
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  7081 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 7180  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  7181 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 7280  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  7281 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 7380  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7381 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaag 7480  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    |||| |||||    
T  7481 taggcctagc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 587 - 769
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7770
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7588 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 7687  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 769  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  7688 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 8841 - 9317
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8841 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8940  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  8941 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 9040  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  9041 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 9140  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  9141 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 9240  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9241 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20020
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || | ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20197  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20196 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 20097  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20096 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 765
Target Start/End: Original strand, 9415 - 9593
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  9415 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 9514  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 765  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  9515 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 492
Target Start/End: Original strand, 25976 - 26453
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||    | ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |    
T  25976 catcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 26075  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||    
T  26076 cacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgat 26175  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  26176 ttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 26275  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggt 414  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  26276 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagt 26375  T
Q  415 tgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 492  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26376 tgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 26551 - 26816
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26551 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26650  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  26651 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 26750  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26751 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 492
Target Start/End: Original strand, 14772 - 15181
Alignment:
Q  83 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcct 182  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14772 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 14871  T
Q  183 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgag 282  Q
    || | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||    
T  14872 cacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 14971  T
Q  283 cttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggc 382  Q
    ||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||    
T  14972 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggc 15071  T
Q  383 aacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaag 482  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15072 aacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaag 15171  T
Q  483 taggtctagc 492  Q
    ||||||||||    
T  15172 taggtctagc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 8430 - 7963
Alignment:
Q  16 catcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttgg 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||||  || || ||  ||| || | || ||| |||||||||||   |||||||| |||| |    
T  8430 catcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcatgatcatggctgaacagagaagctttg 8331  T
Q  116 cataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 215  Q
    |||| |||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  8330 catagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 8231  T
Q  216 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 315  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||    
T  8230 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacaccc 8131  T
Q  316 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 415  Q
     || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||     
T  8130 ctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtc 8031  T
Q  416 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 483  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8030 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 587 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 7844 - 7579
Alignment:
Q  587 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 686  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7844 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 7745  T
Q  687 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 786  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  7744 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 7645  T
Q  787 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 852  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7644 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 658 - 852
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  658 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 751  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  752 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 850  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  851 tc 852  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 411
Target Start/End: Original strand, 46659 - 46981
Alignment:
Q  101 aacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatca 197  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||    
T  46659 aacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattca 46758  T
Q  198 tgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatg 295  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || ||     
T  46759 tatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgata 46858  T
Q  296 tacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggatt 390  Q
    ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| |||||||||||||     
T  46859 tacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatc 46958  T
Q  391 aggtggaggc--ttgccctgtct 411  Q
    |||||| |||  |||||||||||    
T  46959 aggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 343
Alignment:
Q  137 accagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || ||||    
T  449 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaagga 350  T
Q  237 catgagg 243  Q
    |||||||    
T  349 catgagg 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University