View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6961_low_28 (Length: 219)

Name: NF6961_low_28
Description: NF6961
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6961_low_28
NF6961_low_28
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-219)||(15741397-15741615)
chr3 (24-219)||(4796991-4797186)
chr3 (24-219)||(4721356-4721551)
chr3 (24-219)||(35880491-35880686)
chr3 (24-219)||(6192041-6192236)
chr3 (24-219)||(18050987-18051182)
chr3 (24-219)||(7072937-7073132)
chr3 (24-219)||(28116295-28116490)
chr3 (24-219)||(8295700-8295895)
chr3 (24-219)||(7996287-7996482)
chr3 (24-219)||(10642795-10642990)
chr3 (24-219)||(18330399-18330589)
chr3 (24-219)||(29149093-29149288)
chr3 (24-219)||(15893044-15893239)
chr3 (24-215)||(20065775-20065966)
chr3 (24-219)||(8301602-8301797)
chr3 (24-218)||(11110699-11110893)
chr3 (1-219)||(10395861-10396088)
chr3 (24-219)||(21674418-21674613)
chr3 (24-219)||(47023178-47023373)
chr3 (24-219)||(20577200-20577395)
chr3 (24-219)||(6542812-6543007)
chr3 (24-219)||(29665323-29665518)
chr3 (24-219)||(36997427-36997622)
chr3 (24-219)||(8211466-8211661)
chr3 (24-219)||(17985294-17985489)
chr3 (24-219)||(24327884-24328079)
chr3 (24-219)||(4347022-4347217)
chr3 (24-219)||(4416641-4416836)
chr3 (24-219)||(22871212-22871407)
chr3 (24-219)||(22886271-22886466)
chr3 (24-219)||(28339027-28339222)
chr3 (24-219)||(31964811-31965006)
chr3 (24-219)||(50134409-50134604)
chr3 (24-219)||(51781736-51781931)
chr3 (24-219)||(51796825-51797020)
chr3 (24-218)||(28021004-28021198)
chr3 (24-219)||(5013437-5013632)
chr3 (24-219)||(5466710-5466905)
chr3 (24-219)||(5609660-5609855)
chr3 (24-219)||(18224916-18225111)
chr3 (24-219)||(18277390-18277585)
chr3 (24-219)||(18292691-18292886)
chr3 (24-219)||(18307992-18308187)
chr3 (24-219)||(48465640-48465835)
chr3 (31-219)||(18242452-18242640)
chr3 (28-219)||(5596708-5596899)
chr3 (37-219)||(16626854-16627036)
chr3 (24-113)||(5713058-5713147)
chr3 (24-113)||(5723968-5724057)
chr3 (24-113)||(5757420-5757509)
chr3 (24-113)||(5768311-5768400)
chr3 (37-219)||(18530122-18530304)
chr3 (24-180)||(4892977-4893133)
chr3 (24-180)||(22387913-22388069)
chr3 (24-180)||(32438921-32439077)
chr3 (37-113)||(17994132-17994208)
chr3 (38-113)||(4625778-4625853)
chr3 (37-113)||(5652221-5652297)
chr3 (1-29)||(4721558-4721586)
chr3 (1-29)||(6192243-6192271)
chr3 (1-29)||(18051189-18051217)
chr3 (1-29)||(18330596-18330624)
chr3 (1-29)||(35880693-35880721)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (24-219)||(26918141-26918336)
chr6 (24-219)||(26999834-27000029)
chr6 (24-219)||(26988762-26988957)
chr6 (24-219)||(15424557-15424752)
chr6 (24-219)||(16749615-16749810)
chr6 (24-219)||(24304858-24305053)
chr6 (24-219)||(13299191-13299386)
chr6 (24-219)||(24863478-24863673)
chr6 (24-219)||(3695824-3696019)
chr6 (24-219)||(22935117-22935312)
chr6 (24-219)||(23857562-23857757)
chr6 (24-219)||(34463601-34463796)
chr6 (24-219)||(17025023-17025218)
chr6 (24-219)||(27007473-27007668)
chr6 (24-219)||(27044151-27044346)
chr6 (24-219)||(29572774-29572969)
chr6 (24-219)||(16944267-16944462)
chr6 (24-219)||(26777867-26778062)
chr6 (24-219)||(27360250-27360445)
chr6 (24-219)||(27450593-27450788)
chr6 (31-219)||(27484878-27485066)
chr6 (24-219)||(4546024-4546219)
chr6 (24-219)||(4724383-4724578)
chr6 (24-219)||(4757522-4757717)
chr6 (24-219)||(4772758-4772953)
chr6 (24-219)||(28207203-28207398)
chr6 (24-219)||(29549239-29549434)
chr6 (24-219)||(30558256-30558451)
chr6 (24-219)||(16673888-16674083)
chr6 (24-219)||(26116659-26116854)
chr6 (24-219)||(4525050-4525245)
chr6 (28-219)||(29501167-29501358)
chr6 (25-183)||(22477514-22477672)
chr6 (28-113)||(20160571-20160656)
chr6 (28-113)||(22172175-22172260)
chr6 (37-113)||(13522323-13522399)
chr6 (37-113)||(28162527-28162603)
chr6 (37-113)||(33374506-33374582)
chr6 (37-113)||(8892560-8892636)
chr6 (37-113)||(8903795-8903871)
chr6 (32-116)||(27629957-27630041)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (24-219)||(2154338-2154533)
chr7 (24-219)||(5127757-5127952)
chr7 (24-219)||(11424959-11425154)
chr7 (24-219)||(10917048-10917243)
chr7 (24-219)||(16736643-16736838)
chr7 (24-219)||(16751697-16751892)
chr7 (24-219)||(17523297-17523492)
chr7 (24-219)||(17529723-17529918)
chr7 (24-219)||(45387108-45387303)
chr7 (24-219)||(11441325-11441520)
chr7 (24-219)||(5147523-5147718)
chr7 (24-219)||(16503563-16503758)
chr7 (24-219)||(16518599-16518794)
chr7 (24-219)||(26435022-26435217)
chr7 (24-219)||(24592724-24592919)
chr7 (24-219)||(26275277-26275472)
chr7 (24-219)||(26320052-26320247)
chr7 (24-219)||(31124676-31124871)
chr7 (24-219)||(3445059-3445254)
chr7 (24-219)||(26485927-26486122)
chr7 (24-219)||(31564582-31564777)
chr7 (24-219)||(9618416-9618611)
chr7 (24-219)||(26538056-26538251)
chr7 (24-219)||(4145306-4145501)
chr7 (24-219)||(26670097-26670292)
chr7 (43-219)||(16041091-16041267)
chr7 (45-211)||(16450199-16450365)
chr7 (24-180)||(5159326-5159482)
chr7 (37-113)||(31088657-31088733)
chr7 (37-113)||(45733334-45733410)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (24-219)||(23718182-23718377)
chr5 (24-219)||(23752644-23752839)
chr5 (24-219)||(11549127-11549322)
chr5 (24-219)||(22999308-22999503)
chr5 (24-219)||(33777260-33777455)
chr5 (24-219)||(9548737-9548932)
chr5 (24-219)||(41674482-41674677)
chr5 (24-219)||(24688351-24688546)
chr5 (24-219)||(15658954-15659149)
chr5 (24-219)||(30934409-30934604)
chr5 (24-219)||(8665669-8665864)
chr5 (24-219)||(18500942-18501137)
chr5 (24-219)||(24681210-24681405)
chr5 (24-219)||(24723737-24723932)
chr5 (24-219)||(31431201-31431396)
chr5 (24-219)||(5637683-5637878)
chr5 (24-219)||(9317224-9317419)
chr5 (24-219)||(12131928-12132123)
chr5 (24-219)||(28648999-28649194)
chr5 (24-219)||(31826613-31826808)
chr5 (24-219)||(37358849-37359044)
chr5 (24-219)||(43078022-43078217)
chr5 (24-219)||(6874075-6874270)
chr5 (24-219)||(26480165-26480360)
chr5 (24-219)||(29967260-29967455)
chr5 (24-219)||(30029188-30029383)
chr5 (24-219)||(30168242-30168437)
chr5 (24-219)||(37671686-37671881)
chr5 (24-219)||(2510824-2511019)
chr5 (24-219)||(3789299-3789494)
chr5 (24-219)||(13325038-13325233)
chr5 (24-219)||(18375606-18375801)
chr5 (24-219)||(37754741-37754936)
chr5 (24-219)||(15759051-15759246)
chr5 (24-219)||(28959992-28960187)
chr5 (24-219)||(30151791-30151986)
chr5 (24-219)||(33516129-33516324)
chr5 (28-218)||(32599667-32599857)
chr5 (24-219)||(34616294-34616489)
chr5 (24-219)||(37771193-37771388)
chr5 (37-219)||(23891979-23892161)
chr5 (24-219)||(40473746-40473941)
chr5 (47-218)||(25198806-25198977)
chr5 (24-149)||(24969867-24969992)
chr5 (37-178)||(22888287-22888428)
chr5 (151-219)||(24951883-24951951)
chr5 (24-180)||(33292340-33292496)
chr5 (37-113)||(13184852-13184928)
chr5 (37-113)||(13440698-13440774)
chr5 (37-113)||(33877129-33877205)
chr5 (37-113)||(11325676-11325752)
chr5 (1-29)||(11549329-11549357)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (24-219)||(427-622)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (24-219)||(16277318-16277513)
chr8 (24-219)||(2137515-2137710)
chr8 (24-219)||(27609161-27609356)
chr8 (24-219)||(14557391-14557586)
chr8 (24-219)||(19674202-19674397)
chr8 (24-219)||(19687862-19688057)
chr8 (24-219)||(19518399-19518594)
chr8 (24-219)||(3329775-3329970)
chr8 (24-219)||(19208616-19208811)
chr8 (24-219)||(29829077-29829272)
chr8 (24-219)||(16283213-16283408)
chr8 (24-219)||(18710350-18710545)
chr8 (24-219)||(31490006-31490201)
chr8 (24-219)||(33258487-33258682)
chr8 (24-219)||(19286229-19286424)
chr8 (24-219)||(31354288-31354483)
chr8 (24-219)||(28362211-28362406)
chr8 (24-219)||(12092989-12093184)
chr8 (37-139)||(19659305-19659407)
chr8 (37-139)||(44562948-44563050)
chr8 (37-113)||(9354495-9354571)
chr8 (28-212)||(22081132-22081316)
chr8 (1-29)||(16277520-16277548)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (24-219)||(23128852-23129047)
chr2 (24-219)||(28881974-28882169)
chr2 (24-219)||(13936830-13937025)
chr2 (24-219)||(34279209-34279404)
chr2 (24-219)||(11635475-11635670)
chr2 (24-219)||(11641664-11641859)
chr2 (24-219)||(12655302-12655497)
chr2 (24-219)||(32049558-32049753)
chr2 (24-219)||(20837678-20837873)
chr2 (24-219)||(34286114-34286309)
chr2 (24-219)||(34291174-34291369)
chr2 (24-219)||(21677468-21677663)
chr2 (24-219)||(261051-261246)
chr2 (24-219)||(12716891-12717086)
chr2 (24-219)||(27434730-27434925)
chr2 (24-219)||(37925253-37925448)
chr2 (24-219)||(12586561-12586756)
chr2 (24-219)||(27803452-27803647)
chr2 (24-219)||(39889822-39890017)
chr2 (24-219)||(40233259-40233454)
chr2 (24-219)||(9350280-9350475)
chr2 (24-219)||(27776967-27777162)
chr2 (24-219)||(27816734-27816929)
chr2 (24-219)||(31876041-31876236)
chr2 (24-219)||(34861440-34861635)
chr2 (24-219)||(37686195-37686390)
chr2 (24-219)||(37701460-37701655)
chr2 (24-219)||(19416785-19416980)
chr2 (24-219)||(22926314-22926509)
chr2 (24-219)||(16829624-16829819)
chr2 (24-219)||(16891662-16891857)
chr2 (24-219)||(37374921-37375116)
chr2 (24-219)||(39052114-39052309)
chr2 (37-219)||(21703460-21703642)
chr2 (37-219)||(19456717-19456899)
chr2 (37-139)||(31891624-31891726)
chr2 (37-113)||(3784523-3784599)
chr2 (37-113)||(27118557-27118633)
chr2 (37-113)||(34156880-34156956)
chr2 (38-113)||(34303600-34303675)
chr2 (28-113)||(27392859-27392944)
chr2 (37-113)||(16163468-16163544)
chr2 (1-29)||(12655504-12655532)
chr2 (1-29)||(20837880-20837908)
chr2 (1-29)||(28882176-28882204)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (24-219)||(27056-27251)
scaffold0143 (1-29)||(27258-27286)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (24-219)||(24592608-24592803)
chr4 (24-219)||(17013779-17013974)
chr4 (24-219)||(5005649-5005844)
chr4 (24-219)||(14664797-14664992)
chr4 (24-219)||(27163614-27163809)
chr4 (24-219)||(6569632-6569827)
chr4 (24-219)||(21969480-21969675)
chr4 (24-219)||(30753521-30753716)
chr4 (24-219)||(18800919-18801114)
chr4 (24-219)||(14098320-14098515)
chr4 (24-219)||(33674107-33674302)
chr4 (24-219)||(40105935-40106130)
chr4 (24-219)||(31126815-31127010)
chr4 (24-219)||(54833169-54833364)
chr4 (24-219)||(14763601-14763796)
chr4 (24-219)||(39850402-39850597)
chr4 (57-219)||(19373040-19373202)
chr4 (24-219)||(36344809-36345004)
chr4 (37-219)||(1900039-1900221)
chr4 (37-219)||(15227652-15227834)
chr4 (37-219)||(15285235-15285417)
chr4 (24-180)||(24112483-24112639)
chr4 (24-180)||(34189254-34189410)
chr4 (28-113)||(14235826-14235911)
chr4 (37-113)||(24460912-24460988)
chr4 (1-29)||(14664999-14665027)
chr4 (1-29)||(17013981-17014009)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (24-219)||(30217-30412)
scaffold0124 (37-219)||(20176-20358)
scaffold0124 (1-29)||(30419-30447)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (24-219)||(47282-47477)
scaffold0089 (24-219)||(40366-40561)
scaffold0089 (24-219)||(29527-29722)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (24-219)||(41793605-41793800)
chr1 (24-219)||(10962433-10962628)
chr1 (24-219)||(51637981-51638176)
chr1 (24-219)||(28584744-28584939)
chr1 (37-212)||(20460878-20461053)
chr1 (37-113)||(20340642-20340718)
chr1 (145-219)||(16208443-16208517)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (24-219)||(7536-7731)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (24-219)||(26499-26694)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (24-219)||(15227-15422)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (24-219)||(9363-9558)
scaffold0159 (24-191)||(19807-19974)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (24-219)||(7701-7896)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (33-219)||(5753-5940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (24-219)||(7996-8191)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (24-198)||(30-204)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (37-113)||(2965-3041)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-113)||(21437-21522)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15741397 - 15741615
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
15741397 tgttgttgttgttgaactggcaactgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaaga 15741496  T
101 aaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15741497 aaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacac 15741596  T
201 catccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||||||    
15741597 catccctacttccgtttct 15741615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 4796991 - 4797186
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4796991 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 4797090  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4797091 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 4797186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4721551 - 4721356
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
4721551 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcaca 4721452  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4721451 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 4721356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35880686 - 35880491
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35880686 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 35880587  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35880586 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 35880491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6192236 - 6192041
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
6192236 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 6192137  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
6192136 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttct 6192041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18051182 - 18050987
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
18051182 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgca 18051083  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18051082 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 18050987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7073132 - 7072937
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
7073132 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 7073033  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7073032 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 7072937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 28116295 - 28116490
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
28116295 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 28116394  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28116395 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 28116490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8295895 - 8295700
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
8295895 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 8295796  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
8295795 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 8295700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7996482 - 7996287
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
7996482 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 7996383  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7996382 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 7996287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10642990 - 10642795
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
10642990 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 10642891  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10642890 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 10642795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18330589 - 18330399
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18330589 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg-----atgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 18330495  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18330494 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 18330399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 29149093 - 29149288
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
29149093 ctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcaca 29149192  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29149193 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 29149288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 15893044 - 15893239
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
15893044 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 15893143  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
15893144 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 15893239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20065966 - 20065775
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20065966 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 20065867  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
20065866 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgt 20065775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 8301602 - 8301797
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
8301602 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 8301701  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
8301702 tatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttct 8301797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Original strand, 11110699 - 11110893
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
11110699 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 11110798  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11110799 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttc 11110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10396088 - 10395861
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaact---------gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatg 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
10396088 tgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatg 10395989  T
92 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
10395988 gcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcc 10395889  T
192 agctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
10395888 agctgacaccatccccacttccgtttct 10395861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21674613 - 21674418
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
21674613 ctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcaca 21674514  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
21674513 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 21674418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47023373 - 47023178
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
47023373 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 47023274  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
47023273 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 47023178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 20577200 - 20577395
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
20577200 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 20577299  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
20577300 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 20577395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 6542812 - 6543007
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
6542812 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 6542911  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
6542912 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 6543007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 29665323 - 29665518
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
29665323 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 29665422  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29665423 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29665518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 36997427 - 36997622
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
36997427 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 36997526  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36997527 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 36997622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8211661 - 8211466
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 8211466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 17985294 - 17985489
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
17985294 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 17985393  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17985394 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 17985489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24328079 - 24327884
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
24328079 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 24327980  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24327979 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 24327884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 4347022 - 4347217
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4347121  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4347122 catgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 4347217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4416836 - 4416641
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4416836 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4416737  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4416736 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 4416641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 22871212 - 22871407
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
22871212 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22871311  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
22871312 tatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 22871407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 22886271 - 22886466
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
22886271 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22886370  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
22886371 tatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 22886466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28339222 - 28339027
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28339222 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28339123  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
28339122 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 28339027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 31964811 - 31965006
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31964811 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31964910  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
31964911 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 31965006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 50134409 - 50134604
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
50134409 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 50134508  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
50134509 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 50134604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51781931 - 51781736
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
51781931 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 51781832  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
51781831 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 51781736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51797020 - 51796825
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
51797020 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 51796921  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
51796920 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 51796825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28021198 - 28021004
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28021099  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
28021098 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttc 28021004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5013632 - 5013437
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
5013632 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5013533  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
5013532 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 5013437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5466905 - 5466710
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
5466905 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5466806  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
5466805 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 5466710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 5609660 - 5609855
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| || |    
5609660 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgtcata 5609759  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
5609760 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 5609855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18225111 - 18224916
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
18225111 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 18225012  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
18225011 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 18224916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18277390 - 18277585
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
18277390 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18277489  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18277490 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 18277585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18292691 - 18292886
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
18292691 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18292790  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18292791 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 18292886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18307992 - 18308187
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
18307992 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18308091  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18308092 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 18308187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48465835 - 48465640
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
48465835 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 48465736  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
48465735 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 48465640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18242640 - 18242452
Alignment:
31 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
18242640 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 18242541  T
131 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
18242540 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 18242452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Original strand, 5596708 - 5596899
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 127  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
5596708 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatg 5596807  T
128 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5596808 ggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 5596899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 16626854 - 16627036
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||    
16626854 gcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacg 16626953  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
16626954 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 16627036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5713147 - 5713058
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
5713147 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5724057 - 5723968
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
5724057 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 5757420 - 5757509
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
5757420 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 5768311 - 5768400
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
5768311 ctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5768400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18530304 - 18530122
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
18530304 gcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 18530205  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||| || || |||||||||||||| ||||||    
18530204 gaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttct 18530122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4893133 - 4892977
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
4893133 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 4893034  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
4893033 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Original strand, 22387913 - 22388069
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||  ||    
22387913 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgca 22388012  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
22388013 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32439077 - 32438921
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
32439077 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 32438978  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
32438977 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 32438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 17994132 - 17994208
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
17994132 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 17994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625778
Alignment:
38 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 4625778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5652297 - 5652221
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
5652297 gcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5652221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 4721586 - 4721558
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
4721586 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 4721558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 6192271 - 6192243
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
6192271 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 6192243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 18051217 - 18051189
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
18051217 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 18051189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 18330624 - 18330596
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
18330624 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 18330596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 35880721 - 35880693
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
35880721 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 35880693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26918336 - 26918141
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26918336 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 26918237  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26918236 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 26918141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27000029 - 26999834
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27000029 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 26999930  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26999929 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 26999834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26988957 - 26988762
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26988957 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 26988858  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26988857 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 26988762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 15424557 - 15424752
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15424557 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 15424656  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15424657 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 15424752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16749810 - 16749615
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16749810 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 16749711  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16749710 tatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 16749615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 24304858 - 24305053
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
24304858 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 24304957  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24304958 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 24305053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 13299191 - 13299386
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
13299191 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 13299290  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
13299291 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttct 13299386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24863673 - 24863478
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
24863673 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 24863574  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24863573 tatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttct 24863478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3696019 - 3695824
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
3696019 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 3695920  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3695919 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 3695824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 22935117 - 22935312
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
22935117 ctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgca 22935216  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
22935217 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttct 22935312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 23857562 - 23857757
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
23857562 ctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgca 23857661  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
23857662 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttct 23857757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 34463601 - 34463796
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
34463601 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 34463700  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34463701 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 34463796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17025218 - 17025023
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
17025218 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 17025119  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
17025118 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 17025023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27007668 - 27007473
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
27007668 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcata 27007569  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27007568 tataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27007473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27044346 - 27044151
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 27044247  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27044246 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27044151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29572969 - 29572774
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
29572969 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29572870  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29572869 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29572774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16944267 - 16944462
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
16944267 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 16944366  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16944367 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 16944462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26777867 - 26778062
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
26777867 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 26777966  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26777967 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26778062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27360250 - 27360445
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
27360250 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 27360349  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27360350 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27360445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27450593 - 27450788
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
27450593 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 27450692  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27450693 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27450788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27485066 - 27484878
Alignment:
31 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
27485066 gcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggt 27484967  T
131 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27484966 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27484878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 4546024 - 4546219
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4546024 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4546123  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
4546124 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttct 4546219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 4724383 - 4724578
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4724383 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4724482  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
4724483 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttct 4724578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4757717 - 4757522
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
4757717 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 4757618  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
4757617 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 4757522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4772953 - 4772758
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
4772953 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 4772854  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
4772853 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 4772758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28207398 - 28207203
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28207398 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28207299  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
28207298 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttct 28207203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29549434 - 29549239
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29549239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 30558256 - 30558451
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
30558256 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 30558355  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
30558356 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 30558451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16674083 - 16673888
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
16674083 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 16673984  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
16673983 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 16673888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26116659 - 26116854
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||| |    
26116659 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgagaatacggcata 26116758  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26116759 tatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26116854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4525245 - 4525050
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4525146  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4525145 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 4525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29501358 - 29501167
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 127  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
29501358 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatg 29501259  T
128 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29501258 ggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29501167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Original strand, 22477514 - 22477672
Alignment:
25 tgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||    
22477514 tgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcat 22477613  T
125 atgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattga 183  Q
    | ||||| ||| |||  | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
22477614 acgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattga 22477672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20160656 - 20160571
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
20160656 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 20160571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 22172175 - 22172260
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
22172175 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 22172260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 13522323 - 13522399
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
13522323 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13522399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28162603 - 28162527
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
28162603 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaga 28162527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 33374506 - 33374582
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
33374506 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 8892560 - 8892636
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
8892560 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 8892636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 8903795 - 8903871
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
8903795 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgaga 8903871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 27629957 - 27630041
Alignment:
32 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaata 116  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
27629957 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaata 27630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2154533 - 2154338
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2154533 ctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 2154434  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2154433 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 2154338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5127952 - 5127757
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5127952 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 5127853  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5127852 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 5127757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 11424959 - 11425154
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
11424959 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 11425058  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11425059 tatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 11425154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 10917048 - 10917243
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
10917048 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 10917147  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10917148 tatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 10917243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16736643 - 16736838
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16736643 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 16736742  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
16736743 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 16736838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16751697 - 16751892
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16751697 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 16751796  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
16751797 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 16751892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17523492 - 17523297
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17523492 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 17523393  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
17523392 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 17523297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 17529723 - 17529918
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17529723 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 17529822  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
17529823 tatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 17529918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45387303 - 45387108
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
45387303 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 45387204  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
45387203 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 45387108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11441520 - 11441325
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
11441520 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 11441421  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11441420 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 11441325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 5147523 - 5147718
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
5147523 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 5147622  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5147623 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 5147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16503563 - 16503758
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16503563 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16503662  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
16503663 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 16503758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16518599 - 16518794
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16518599 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16518698  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
16518699 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 16518794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26435217 - 26435022
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
26435217 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 26435118  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
26435117 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttct 26435022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 24592724 - 24592919
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
24592724 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 24592823  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24592824 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 24592919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26275277 - 26275472
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
26275277 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26275376  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26275377 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26275472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26320052 - 26320247
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
26320052 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26320151  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26320152 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26320247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31124871 - 31124676
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31124871 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31124772  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31124771 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 31124676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3445254 - 3445059
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
3445254 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 3445155  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3445154 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 3445059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26485927 - 26486122
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
26485927 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 26486026  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26486027 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26486122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 31564582 - 31564777
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
31564582 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 31564681  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31564682 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 31564777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9618611 - 9618416
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
9618611 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9618512  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
9618511 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 9618416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26538056 - 26538251
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
26538056 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 26538155  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
26538156 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 26538251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 4145306 - 4145501
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
4145306 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4145405  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
4145406 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 4145501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26670097 - 26670292
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
26670097 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26670196  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26670197 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26670292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041091
Alignment:
43 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagaca 142  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||  |    
16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
143 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 16041091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450365
Alignment:
45 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatt 144  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||  |      
16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
145 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 211  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctactt 16450365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5159482 - 5159326
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
5159482 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 5159383  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
5159382 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 31088657 - 31088733
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
31088657 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 31088733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45733410 - 45733334
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
45733410 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 45733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 23718182 - 23718377
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23718182 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 23718281  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23718282 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 23718377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 23752644 - 23752839
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23752644 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 23752743  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23752744 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 23752839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11549322 - 11549127
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
11549322 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcaca 11549223  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11549222 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 11549127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 22999308 - 22999503
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22999308 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 22999407  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22999408 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 22999503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33777455 - 33777260
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33777455 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 33777356  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
33777355 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttct 33777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 9548737 - 9548932
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
9548737 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 9548836  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9548837 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 9548932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41674677 - 41674482
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
41674677 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcaca 41674578  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
41674577 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 41674482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 24688351 - 24688546
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
24688351 ctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgca 24688450  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
24688451 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 24688546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 15658954 - 15659149
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15658954 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15659053  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15659054 tatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 15659149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30934604 - 30934409
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
30934604 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 30934505  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
30934504 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttct 30934409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 8665669 - 8665864
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
8665669 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 8665768  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
8665769 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 8665864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18500942 - 18501137
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
18500942 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 18501041  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18501042 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 18501137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24681405 - 24681210
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
24681405 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 24681306  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24681305 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 24681210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24723932 - 24723737
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
24723932 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 24723833  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24723832 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 24723737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31431396 - 31431201
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31431396 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31431297  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
31431296 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 31431201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5637878 - 5637683
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
5637878 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5637779  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5637778 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 5637683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9317419 - 9317224
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
9317419 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9317320  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9317319 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 9317224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12132123 - 12131928
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
12132123 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 12132024  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12132023 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 12131928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28649194 - 28648999
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
28649194 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 28649095  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28649094 tatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 31826613 - 31826808
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31826613 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31826712  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31826713 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 31826808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 37358849 - 37359044
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37358849 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37358948  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37358949 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37359044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43078217 - 43078022
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
43078217 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 43078118  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
43078117 tatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttct 43078022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6874270 - 6874075
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
6874270 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 6874171  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
6874170 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 6874075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26480360 - 26480165
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
26480360 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26480261  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
26480260 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 26480165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 29967260 - 29967455
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
29967260 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29967359  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29967360 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29967455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30029383 - 30029188
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
30029383 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 30029284  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
30029283 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 30029188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30168437 - 30168242
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
30168437 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 30168338  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
30168337 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 30168242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 37671686 - 37671881
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37671686 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37671785  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
37671786 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttct 37671881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2511019 - 2510824
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
2511019 ctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 2510920  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
2510919 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttct 2510824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3789494 - 3789299
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
3789494 ctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 3789395  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3789394 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 3789299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 13325038 - 13325233
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |    
13325038 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcata 13325137  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13325138 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttct 13325233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18375606 - 18375801
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
18375606 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 18375705  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
18375706 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 18375801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37754936 - 37754741
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37754936 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37754837  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37754836 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37754741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 15759051 - 15759246
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
15759051 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 15759150  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
15759151 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttct 15759246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 28959992 - 28960187
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28959992 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28960091  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28960092 tatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 28960187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30151986 - 30151791
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
30151986 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 30151887  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
30151886 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 30151791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33516324 - 33516129
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
33516324 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 33516225  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
33516224 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 33516129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 32599667 - 32599857
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 127  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
32599667 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatg 32599766  T
128 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
32599767 ggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttc 32599857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34616489 - 34616294
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34616390  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34616389 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 34616294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 37771193 - 37771388
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37771193 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37771292  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
37771293 tatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 37771388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23892161 - 23891979
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
23892161 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacg 23892062  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
23892061 gaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttct 23891979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 40473746 - 40473941
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
40473746 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 40473845  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40473846 tgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 40473941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198806
Alignment:
47 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttg 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||    
25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
147 ggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttc 218  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||    
25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttc 25198806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24969992 - 24969867
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
24969992 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 24969893  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggc 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
24969892 tatgggtacgacggaggcatttgggc 24969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22888428 - 22888287
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
22888428 gcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 22888329  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 178  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
22888328 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951883
Alignment:
151 gcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 24951883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33292496 - 33292340
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
33292496 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 33292397  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
33292396 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 13184852 - 13184928
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
13184852 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13184928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 13440698 - 13440774
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
13440698 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13440774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33877205 - 33877129
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
33877205 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33877129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11325752 - 11325676
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
11325752 gcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 11325676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 11549357 - 11549329
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
11549357 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 11549329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 427 - 622
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
427 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 526  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
527 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttct 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16277513 - 16277318
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16277513 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 16277414  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16277413 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 16277318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 2137515 - 2137710
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
2137515 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 2137614  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2137615 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 2137710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27609161 - 27609356
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
27609161 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacaca 27609260  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27609261 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 27609356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14557586 - 14557391
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
14557586 ctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcaca 14557487  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14557486 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 14557391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19674397 - 19674202
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
19674397 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 19674298  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
19674297 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttct 19674202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19688057 - 19687862
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
19688057 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgca 19687958  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
19687957 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttct 19687862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 19518399 - 19518594
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
19518399 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 19518498  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19518499 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 19518594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 3329775 - 3329970
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
3329775 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcata 3329874  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3329875 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 3329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 19208616 - 19208811
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
19208616 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19208715  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19208716 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 19208811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29829272 - 29829077
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
29829272 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 29829173  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29829172 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 29829077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16283408 - 16283213
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
16283408 ctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16283309  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
16283308 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 16283213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18710545 - 18710350
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
18710545 ctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18710446  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
18710445 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 18710350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 31490006 - 31490201
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
31490006 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 31490105  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
31490106 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 31490201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33258682 - 33258487
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
33258682 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 33258583  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33258582 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 33258487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286229
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 19286229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31354483 - 31354288
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31354483 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31354384  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
31354383 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 31354288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 28362211 - 28362406
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28362211 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28362310  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
28362311 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 28362406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 12092989 - 12093184
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
12092989 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 12093088  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
12093089 tatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttct 12093184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Original strand, 19659305 - 19659407
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
19659305 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 19659404  T
137 gag 139  Q
    |||    
19659405 gag 19659407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44563050 - 44562948
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
44563050 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 44562951  T
137 gag 139  Q
    |||    
44562950 gag 44562948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9354571 - 9354495
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
9354571 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 9354495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 22081132 - 22081316
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatg 127  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||      
22081132 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtact 22081231  T
128 ggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttc 212  Q
    | || | |||||  |  || || |||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||    
22081232 gatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttc 22081316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 16277548 - 16277520
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
16277548 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 16277520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 23128852 - 23129047
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
23128852 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 23128951  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23128952 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 23129047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28882169 - 28881974
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28882169 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 28882070  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
28882069 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 28881974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 13936830 - 13937025
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13936830 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 13936929  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13936930 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 13937025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34279404 - 34279209
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34279404 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 34279305  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
34279304 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 34279209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 11635475 - 11635670
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
11635475 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 11635574  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
11635575 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttct 11635670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 11641664 - 11641859
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
11641664 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 11641763  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
11641764 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttct 11641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12655497 - 12655302
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
12655497 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 12655398  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
12655397 tatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttct 12655302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32049753 - 32049558
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
32049753 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 32049654  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32049653 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 32049558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20837873 - 20837678
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
20837873 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 20837774  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
20837773 tatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttct 20837678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34286309 - 34286114
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
34286309 ctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 34286210  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34286209 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttct 34286114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34291369 - 34291174
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
34291369 ctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 34291270  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
34291269 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttct 34291174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 21677468 - 21677663
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
21677468 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 21677567  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
21677568 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 21677663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 261051 - 261246
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
261051 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 261150  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
261151 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 12716891 - 12717086
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
12716891 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 12716990  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12716991 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 12717086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27434730 - 27434925
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
27434730 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 27434829  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
27434830 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 27434925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37925448 - 37925253
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37925448 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37925349  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37925348 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37925253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12586756 - 12586561
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
12586756 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 12586657  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12586656 tatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 12586561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27803647 - 27803452
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
27803647 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27803548  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27803547 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27803452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39890017 - 39889822
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
39890017 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 39889918  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39889917 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 39889822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40233454 - 40233259
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
40233454 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 40233355  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40233354 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 40233259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 9350280 - 9350475
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
9350280 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 9350379  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9350380 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 9350475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27777162 - 27776967
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
27777162 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27777063  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27777062 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27776967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27816929 - 27816734
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||      
27816929 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatg 27816830  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27816829 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 27816734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31876236 - 31876041
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
31876236 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31876137  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31876136 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 31876041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34861635 - 34861440
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
34861635 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34861536  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34861535 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 34861440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 37686195 - 37686390
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37686195 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37686294  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37686295 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37686390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 37701460 - 37701655
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
37701460 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 37701559  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37701560 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37701655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 19416785 - 19416980
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
19416785 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19416884  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19416885 tatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 19416980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 22926314 - 22926509
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
22926314 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 22926413  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
22926414 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 22926509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 16829624 - 16829819
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
16829624 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 16829723  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
16829724 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 16829819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16891857 - 16891662
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
16891857 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 16891758  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
16891757 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttct 16891662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37375116 - 37374921
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
37375116 ctgttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 37375017  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37375016 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 37374921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 39052114 - 39052309
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |    
39052114 ctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcata 39052213  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
39052214 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 39052309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 21703460 - 21703642
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
21703460 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 21703559  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
21703560 gaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 21703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 19456717 - 19456899
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| ||||    
19456717 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacg 19456816  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||    
19456817 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttct 19456899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Original strand, 31891624 - 31891726
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
31891624 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 31891723  T
137 gag 139  Q
    |||    
31891724 gag 31891726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3784599 - 3784523
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
3784599 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27118633 - 27118557
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
27118633 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 27118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34156956 - 34156880
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
34156956 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34156880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303675
Alignment:
38 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34303675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27392944 - 27392859
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
27392944 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgaga 27392859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16163544 - 16163468
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
16163544 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 16163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 12655532 - 12655504
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
12655532 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 12655504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 20837908 - 20837880
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
20837908 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 20837880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 28882204 - 28882176
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
28882204 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 28882176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27251 - 27056
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
27251 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 27152  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27151 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 27056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 27286 - 27258
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
27286 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 27258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 24592608 - 24592803
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24592608 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 24592707  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24592708 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 24592803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17013974 - 17013779
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
17013974 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 17013875  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17013874 tatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttct 17013779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5005844 - 5005649
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
5005844 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 5005745  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
5005744 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 5005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14664992 - 14664797
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
14664992 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgca 14664893  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
14664892 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttct 14664797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27163614 - 27163809
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
27163614 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 27163713  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
27163714 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 27163809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6569827 - 6569632
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
6569827 ctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcata 6569728  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
6569727 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 6569632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21969675 - 21969480
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
21969675 ctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 21969576  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
21969575 tatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 21969480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30753716 - 30753521
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
30753716 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 30753617  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
30753616 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttct 30753521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 18800919 - 18801114
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
18800919 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcata 18801018  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
18801019 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttct 18801114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14098515 - 14098320
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
14098515 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 14098416  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14098415 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 14098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 33674107 - 33674302
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||      
33674107 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 33674206  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33674207 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 33674302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 40105935 - 40106130
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
40105935 ctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 40106034  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40106035 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 40106130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 31126815 - 31127010
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
31126815 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 31126914  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
31126915 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttct 31127010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833169
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 54833169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 14763601 - 14763796
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
14763601 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 14763700  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14763701 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 14763796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39850597 - 39850402
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||      
39850597 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatg 39850498  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
39850497 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttct 39850402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373040
Alignment:
57 ttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattg 156  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
157 ataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 19373040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 36344809 - 36345004
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcaca 36344908  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36344909 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 36345004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1900221 - 1900039
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
1900221 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 1900122  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
1900121 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 1900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15227834 - 15227652
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
15227834 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 15227735  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||    
15227734 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttct 15227652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 15285235 - 15285417
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | |    
15285235 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatg 15285334  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||| |||||| ||||||    
15285335 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttct 15285417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24112639 - 24112483
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
24112639 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 24112540  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
24112539 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Original strand, 34189254 - 34189410
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
34189254 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 34189353  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 180  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
34189354 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 14235826 - 14235911
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
14235826 tgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgaga 14235911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 24460912 - 24460988
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
24460912 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 24460988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 14665027 - 14664999
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
14665027 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 14664999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 17014009 - 17013981
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
17014009 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 17013981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30412 - 30217
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
30412 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgca 30313  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
30312 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 30217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20176
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttct 20176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 30447 - 30419
Alignment:
1 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
30447 tgttgttgttgttgaactggcaactgttg 30419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 47282 - 47477
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47282 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 47381  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
47382 tatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttct 47477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 40366 - 40561
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
40366 ctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 40465  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
40466 tatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 40561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29722 - 29527
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
29722 ctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 29623  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
29622 tacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttct 29527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 41793605 - 41793800
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
41793605 ctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcata 41793704  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
41793705 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttct 41793800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10962628 - 10962433
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
10962628 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 10962529  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10962528 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 10962433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51638176 - 51637981
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
51638176 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 51638077  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
51638076 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 51637981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28584939 - 28584744
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
28584939 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28584840  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28584839 tacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 28584744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460878
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| | ||    
20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
137 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttc 212  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttc 20460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 20340642 - 20340718
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
20340642 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 20340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 16208443 - 16208517
Alignment:
145 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||||    
16208443 tgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttct 16208517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 7536 - 7731
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
7536 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 7635  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7636 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 26499 - 26694
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
26499 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 26598  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26599 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttct 26694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 15227 - 15422
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||| |    
15227 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcata 15326  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
15327 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 9363 - 9558
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
9363 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 9462  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
9463 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttct 9558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19974 - 19807
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
19974 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 19875  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
19874 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7896 - 7701
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
7896 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 7797  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
7796 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttct 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5940 - 5753
Alignment:
33 aattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaat-ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
5940 aattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggta 5841  T
132 tgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca-tggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5840 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttct 5753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7996
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
8191 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 8092  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttct 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
8091 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttct 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 30 - 204
Alignment:
24 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
30 ctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 129  T
124 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgac 198  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
130 tatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3041
Alignment:
37 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
2965 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21522 - 21437
Alignment:
28 tgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
21522 tgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgaga 21437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University