View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6961_low_4 (Length: 527)

Name: NF6961_low_4
Description: NF6961
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6961_low_4
NF6961_low_4
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-518)||(13833625-13834147)
chr7 (18-518)||(4949641-4950146)
chr7 (149-492)||(27436160-27436510)
chr7 (128-518)||(27974292-27974691)
chr7 (128-518)||(5207177-5207579)
chr7 (128-518)||(567249-567646)
chr7 (179-518)||(8812594-8812937)
chr7 (129-492)||(29024325-29024670)
chr7 (376-518)||(1900166-1900309)
chr7 (377-518)||(13491232-13491371)
chr7 (374-492)||(15186452-15186571)
chr7 (374-492)||(29082879-29082998)
chr7 (152-510)||(12586519-12586885)
chr7 (374-492)||(16146569-16146688)
chr7 (376-518)||(13268539-13268681)
chr7 (131-518)||(840315-840693)
chr7 (131-518)||(847491-847869)
chr7 (131-518)||(1205495-1205873)
chr7 (420-518)||(34136937-34137035)
chr7 (376-508)||(23884753-23884885)
chr7 (129-401)||(4829916-4830193)
chr7 (55-299)||(1959468-1959706)
chr7 (14-98)||(27436511-27436595)
chr7 (68-115)||(567181-567228)
chr7 (376-518)||(804909-805054)
chr7 (68-115)||(5207103-5207150)
chr7 (68-115)||(27974222-27974269)
chr7 (450-518)||(16270644-16270710)
chr7 (14-98)||(29024704-29024789)
chr7 (251-308)||(16270442-16270498)
chr7 (439-518)||(3430724-3430803)
chr7 (179-317)||(13268344-13268479)
chr7 (197-317)||(23884567-23884692)
chr7 (446-499)||(16228645-16228699)
chr7 (470-518)||(9463104-9463151)
chr7 (470-518)||(16400050-16400097)
chr7 (470-518)||(30376543-30376590)
chr7 (78-115)||(803203-803240)
chr7 (78-115)||(16292070-16292107)
chr7 (69-114)||(34136598-34136643)
chr7 (425-492)||(2549856-2549923)
chr7 (439-518)||(16293858-16293937)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (1-518)||(15950466-15950986)
chr2 (1-518)||(24287742-24288236)
chr2 (128-518)||(21857664-21858050)
chr2 (1-518)||(35140749-35141273)
chr2 (1-518)||(42571950-42572479)
chr2 (128-518)||(25493980-25494375)
chr2 (162-511)||(21112150-21112506)
chr2 (128-518)||(3764018-3764418)
chr2 (128-518)||(16275554-16275961)
chr2 (376-518)||(26730967-26731110)
chr2 (376-518)||(34541156-34541299)
chr2 (128-330)||(30691456-30691664)
chr2 (383-494)||(24701129-24701241)
chr2 (395-518)||(40388514-40388637)
chr2 (383-494)||(24692290-24692402)
chr2 (68-115)||(3763944-3763991)
chr2 (68-115)||(16275984-16276031)
chr2 (418-518)||(21767056-21767154)
chr2 (251-329)||(24701289-24701366)
chr2 (374-440)||(42386963-42387029)
chr2 (41-113)||(25494393-25494466)
chr2 (251-329)||(24692449-24692526)
chr2 (69-115)||(24692661-24692707)
chr2 (57-106)||(21857587-21857636)
chr2 (377-408)||(12377267-12377298)
chr2 (391-454)||(20278855-20278918)
chr2 (69-115)||(24701501-24701547)
chr2 (69-113)||(19990255-19990297)
chr2 (463-492)||(42386926-42386955)
chr2 (179-243)||(20278671-20278734)
chr2 (470-518)||(22942907-22942954)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-518)||(39843017-39843531)
chr8 (1-518)||(17680360-17680876)
chr8 (55-518)||(6665875-6666341)
chr8 (273-518)||(6673537-6673777)
chr8 (376-518)||(16761728-16761871)
chr8 (376-518)||(19837545-19837686)
chr8 (179-518)||(20735863-20736209)
chr8 (376-518)||(20740901-20741043)
chr8 (179-518)||(20744421-20744767)
chr8 (339-499)||(22104942-22105104)
chr8 (382-518)||(32001904-32002040)
chr8 (379-518)||(22160921-22161060)
chr8 (395-518)||(23917521-23917644)
chr8 (132-511)||(24709061-24709436)
chr8 (420-518)||(25857102-25857200)
chr8 (179-317)||(22160721-22160856)
chr8 (179-276)||(20741148-20741251)
chr8 (74-115)||(32002307-32002348)
chr8 (69-115)||(25856759-25856805)
chr8 (181-243)||(25856869-25856930)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-518)||(2387295-2387814)
chr1 (1-518)||(31542081-31542605)
chr1 (55-499)||(13470882-13471328)
chr1 (217-518)||(31554281-31554592)
chr1 (376-518)||(13452956-13453098)
chr1 (179-508)||(22430075-22430404)
chr1 (128-499)||(1957985-1958356)
chr1 (251-520)||(14817945-14818202)
chr1 (425-511)||(2341525-2341610)
chr1 (403-499)||(19370984-19371081)
chr1 (206-518)||(6202787-6203100)
chr1 (198-317)||(19371138-19371260)
chr1 (69-418)||(35071822-35072165)
chr1 (371-518)||(27168225-27168373)
chr1 (69-115)||(6202651-6202697)
chr1 (251-317)||(2341361-2341427)
chr1 (69-115)||(14817763-14817809)
chr1 (446-499)||(22473489-22473543)
chr1 (470-518)||(5635719-5635766)
chr1 (69-115)||(22430466-22430512)
chr1 (78-115)||(19371337-19371374)
chr1 (68-97)||(31554693-31554722)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (129-518)||(12103-12491)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (57-518)||(144300-144762)
scaffold0023 (290-518)||(131477-131706)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (68-518)||(6752-7217)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-497)||(25503921-25504426)
chr6 (128-518)||(28269987-28270386)
chr6 (128-518)||(28348737-28349136)
chr6 (128-518)||(28304954-28305355)
chr6 (68-518)||(16636282-16636740)
chr6 (128-518)||(27056372-27056773)
chr6 (187-518)||(22326025-22326361)
chr6 (179-518)||(620927-621270)
chr6 (376-518)||(27538305-27538448)
chr6 (179-518)||(27071864-27072204)
chr6 (376-518)||(25700474-25700616)
chr6 (179-499)||(19715822-19716143)
chr6 (374-518)||(18219274-18219418)
chr6 (376-508)||(20056100-20056231)
chr6 (374-492)||(18112836-18112955)
chr6 (179-499)||(20457035-20457358)
chr6 (374-518)||(23981842-23981986)
chr6 (376-518)||(3694321-3694465)
chr6 (425-518)||(27512121-27512213)
chr6 (420-492)||(22777010-22777082)
chr6 (214-317)||(27512302-27512407)
chr6 (425-518)||(16823023-16823115)
chr6 (68-115)||(27056280-27056327)
chr6 (445-497)||(18911256-18911308)
chr6 (251-313)||(20055967-20056028)
chr6 (376-492)||(28266931-28267047)
chr6 (376-492)||(28345680-28345796)
chr6 (186-286)||(22776802-22776905)
chr6 (470-518)||(9143000-9143047)
chr6 (69-115)||(18946917-18946963)
chr6 (69-115)||(27071751-27071797)
chr6 (186-243)||(20045665-20045720)
chr6 (434-518)||(20045908-20045988)
chr6 (76-112)||(27512506-27512542)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (68-518)||(1849-2300)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (1-518)||(41000421-41000945)
chr3 (1-518)||(41009203-41009727)
chr3 (1-518)||(8202970-8203499)
chr3 (128-518)||(9552601-9552993)
chr3 (217-520)||(15682786-15683093)
chr3 (179-518)||(14420436-14420777)
chr3 (1-447)||(17928027-17928472)
chr3 (68-518)||(25265673-25266126)
chr3 (128-492)||(10720282-10720658)
chr3 (187-508)||(8608327-8608652)
chr3 (376-518)||(15697794-15697936)
chr3 (376-518)||(12557195-12557336)
chr3 (186-518)||(30093459-30093798)
chr3 (198-518)||(11183583-11183903)
chr3 (180-518)||(14885413-14885754)
chr3 (376-499)||(14890876-14891000)
chr3 (376-518)||(18881266-18881408)
chr3 (179-508)||(12477128-12477456)
chr3 (374-518)||(7095802-7095946)
chr3 (69-518)||(15622593-15623041)
chr3 (179-518)||(23285736-23286071)
chr3 (69-499)||(70314-70729)
chr3 (55-510)||(3242822-3243272)
chr3 (251-508)||(8806485-8806741)
chr3 (344-508)||(15912056-15912220)
chr3 (376-508)||(21609933-21610065)
chr3 (376-518)||(18960552-18960683)
chr3 (395-518)||(13109591-13109714)
chr3 (376-518)||(15599553-15599688)
chr3 (179-518)||(6196558-6196889)
chr3 (425-518)||(8618616-8618708)
chr3 (425-518)||(15535066-15535158)
chr3 (425-518)||(46398513-46398605)
chr3 (68-115)||(10720212-10720259)
chr3 (445-499)||(17919962-17920016)
chr3 (418-518)||(6970197-6970295)
chr3 (179-317)||(33568206-33568341)
chr3 (197-329)||(21610113-21610250)
chr3 (128-436)||(27881251-27881564)
chr3 (439-518)||(30014230-30014309)
chr3 (376-518)||(41433823-41433968)
chr3 (69-115)||(12477020-12477066)
chr3 (69-115)||(14885303-14885349)
chr3 (439-518)||(3677659-3677738)
chr3 (463-499)||(4436511-4436547)
chr3 (439-518)||(20436660-20436739)
chr3 (470-518)||(46373802-46373849)
chr3 (274-329)||(14396298-14396353)
chr3 (446-492)||(24215391-24215438)
chr3 (69-115)||(8806886-8806932)
chr3 (68-98)||(15682664-15682694)
chr3 (186-247)||(8618870-8618929)
chr3 (69-114)||(14420843-14420888)
chr3 (78-115)||(20438484-20438521)
chr3 (69-114)||(23285626-23285671)
chr3 (13-114)||(27881584-27881684)
chr3 (78-115)||(41435649-41435686)
chr3 (463-499)||(5143701-5143737)
chr3 (470-518)||(5957518-5957565)
chr3 (425-492)||(11932154-11932221)
chr3 (376-408)||(26384530-26384562)
chr3 (187-243)||(46398287-46398341)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-518)||(24962713-24963236)
chr5 (57-518)||(21993842-21994291)
chr5 (128-518)||(20378632-20379025)
chr5 (128-518)||(28846073-28846460)
chr5 (257-518)||(21866131-21866389)
chr5 (128-518)||(12178647-12179047)
chr5 (128-518)||(33842911-33843311)
chr5 (128-518)||(26087416-26087816)
chr5 (128-518)||(11811500-11811901)
chr5 (69-518)||(22956632-22957078)
chr5 (272-511)||(23638203-23638439)
chr5 (272-511)||(23834451-23834687)
chr5 (261-518)||(27231843-27232101)
chr5 (181-518)||(29895244-29895576)
chr5 (69-518)||(25528337-25528780)
chr5 (179-472)||(20097251-20097550)
chr5 (376-518)||(36450393-36450535)
chr5 (131-518)||(26871190-26871568)
chr5 (1-85)||(28846480-28846563)
chr5 (13-277)||(23638462-23638728)
chr5 (251-518)||(7259793-7260060)
chr5 (13-115)||(12178512-12178616)
chr5 (13-277)||(23834159-23834427)
chr5 (425-518)||(1800288-1800380)
chr5 (425-518)||(12393443-12393535)
chr5 (425-518)||(21690733-21690825)
chr5 (414-518)||(29890230-29890334)
chr5 (376-499)||(358860-358983)
chr5 (443-518)||(20395672-20395746)
chr5 (68-115)||(11811413-11811460)
chr5 (68-115)||(26087336-26087383)
chr5 (68-115)||(27231641-27231688)
chr5 (68-115)||(33842837-33842884)
chr5 (69-115)||(7259625-7259671)
chr5 (57-114)||(21865921-21865978)
chr5 (179-329)||(36450583-36450730)
chr5 (467-510)||(37578782-37578825)
chr5 (69-115)||(29895640-29895686)
chr5 (470-518)||(15791307-15791354)
chr5 (470-518)||(36382575-36382622)
chr5 (470-518)||(37007247-37007294)
chr5 (186-243)||(7789240-7789295)
chr5 (186-243)||(12393225-12393280)
chr5 (206-247)||(21690984-21691024)
chr5 (78-115)||(34464032-34464069)
chr5 (425-492)||(3490920-3490987)
chr5 (470-518)||(5446797-5446844)
chr5 (470-518)||(7788983-7789030)
chr5 (470-518)||(11951010-11951057)
chr5 (76-112)||(21691131-21691167)
chr5 (470-518)||(31513825-31513872)
chr5 (439-518)||(34462205-34462284)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (13-518)||(74055-74566)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (128-518)||(21529217-21529586)
chr4 (128-518)||(8100633-8101020)
chr4 (217-492)||(26218314-26218595)
chr4 (382-518)||(3386336-3386471)
chr4 (374-518)||(14736116-14736260)
chr4 (376-518)||(1888796-1888938)
chr4 (179-518)||(20556056-20556393)
chr4 (1-111)||(21529079-21529189)
chr4 (251-518)||(16725868-16726133)
chr4 (179-511)||(14883695-14884022)
chr4 (179-518)||(15900530-15900867)
chr4 (376-518)||(3841888-3842030)
chr4 (1-85)||(8100529-8100612)
chr4 (430-493)||(9187022-9187085)
chr4 (425-518)||(18038434-18038526)
chr4 (425-518)||(22706146-22706238)
chr4 (187-309)||(15077321-15077447)
chr4 (214-317)||(18038616-18038721)
chr4 (179-518)||(15079619-15079961)
chr4 (128-313)||(3359573-3359761)
chr4 (395-495)||(17304043-17304144)
chr4 (251-317)||(3841764-3841828)
chr4 (69-115)||(14919898-14919944)
chr4 (69-112)||(16725687-16725730)
chr4 (69-115)||(3386030-3386076)
chr4 (425-492)||(10787570-10787637)
chr4 (69-115)||(9187384-9187430)
chr4 (472-518)||(23994001-23994047)
chr4 (68-98)||(26218194-26218224)
chr4 (69-114)||(20556457-20556502)
chr4 (206-247)||(22706397-22706437)
chr4 (76-112)||(3841582-3841618)
chr4 (179-243)||(9187258-9187321)
chr4 (76-112)||(22706531-22706567)
[»] scaffold2162 (2 HSPs)
scaffold2162 (128-518)||(5-407)
scaffold2162 (68-115)||(452-499)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (128-510)||(4881-5268)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (179-495)||(192297-192620)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (186-518)||(19394-19728)
scaffold0019 (69-115)||(18481-18527)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (179-518)||(17178-17520)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (210-518)||(30575-30886)
[»] scaffold0551 (3 HSPs)
scaffold0551 (187-518)||(5047-5385)
scaffold0551 (69-115)||(4929-4975)
scaffold0551 (69-115)||(11043-11089)
[»] scaffold1818 (1 HSPs)
scaffold1818 (376-518)||(92-234)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (69-494)||(31033-31463)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (182-508)||(10309-10630)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (376-518)||(8459-8601)
scaffold0357 (179-312)||(8665-8804)
scaffold0357 (69-115)||(8869-8915)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (251-508)||(31714-31970)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (376-518)||(2430-2574)
[»] scaffold0320 (2 HSPs)
scaffold0320 (376-508)||(4146-4278)
scaffold0320 (179-317)||(3947-4090)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (376-499)||(20756-20880)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (179-518)||(17784-18122)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (375-518)||(38679-38815)
[»] scaffold0478 (3 HSPs)
scaffold0478 (379-508)||(314-443)
scaffold0478 (74-115)||(2-43)
scaffold0478 (187-313)||(115-246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (186-518)||(98758-99089)
[»] scaffold0441 (2 HSPs)
scaffold0441 (376-518)||(9183-9326)
scaffold0441 (75-112)||(9585-9622)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (371-495)||(301177-301297)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (338-510)||(11374-11545)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (376-518)||(8134-8270)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (376-510)||(16685-16811)
scaffold0243 (69-112)||(17062-17105)
[»] scaffold0362 (2 HSPs)
scaffold0362 (376-508)||(1872-1998)
scaffold0362 (69-115)||(1580-1625)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (179-317)||(25380-25522)
[»] scaffold0435 (2 HSPs)
scaffold0435 (425-508)||(14601-14684)
scaffold0435 (75-115)||(14277-14317)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (179-309)||(3834-3968)
scaffold0393 (376-518)||(3626-3768)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (376-518)||(291-433)
scaffold0364 (179-243)||(96-159)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (425-518)||(23085-23177)
scaffold0068 (206-243)||(22886-22922)
scaffold0068 (76-112)||(22743-22779)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (69-309)||(37076-37319)
scaffold0104 (430-508)||(37438-37516)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (376-508)||(208-340)
[»] scaffold0866 (1 HSPs)
scaffold0866 (418-518)||(4586-4684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (430-518)||(299420-299507)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (178-317)||(33885-34029)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (371-518)||(185841-185989)
scaffold0014 (78-115)||(184177-184214)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (446-499)||(84320-84374)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (376-518)||(29511-29653)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (251-317)||(152039-152104)
[»] scaffold0782 (1 HSPs)
scaffold0782 (78-115)||(5901-5938)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (470-518)||(22701-22748)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13834147 - 13833625
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13834147 agacattgaacgactttactgatggattaaccttttgctagtagaaacaaaatatgaaacacatactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatg 13834048  T
Q  101 cttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-------gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaa 193  Q
    |||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13834047 cttatgcaaaaatagttttgttttttttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaa 13833948  T
Q  194 gacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  13833947 gacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaaagagtacaaaagctaaagcttagttaa-aatttttgaagttgtatctcttt 13833849  T
Q  294 gtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatg 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13833848 gtgttcattcttacaaagtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatg 13833750  T
Q  394 tatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13833749 tatgcatggttattataaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaggataacaacgccacttggtaaagactatggtttc 13833650  T
Q  494 aaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  13833649 aaattgtacctgtatcacgggttct 13833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 518
Target Start/End: Original strand, 4949641 - 4950146
Alignment:
Q  18 actgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnn 117  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | ||| |  || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  4949641 actgatggattgaccttttgtagataaagacacatgataagacacatactagaaactatgaatgcaaaatgaggcatgatatgcttatgcaaaaatagat 4949740  T
Q  118 nnnnnnnnnn----gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctt 213  Q
                  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  | ||||||    
T  4949741 ttttttttttttttgaaggacttatcaa-gtgaattgtaaacatggcagacgaacatgatttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaatagattcctt 4949838  T
Q  214 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttaca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4949839 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagttctaaacaaaagttaaagcttagttaagattttta-aagttgtatctcttggtgttcattcttaca 4949937  T
Q  309 aggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaag--tccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttat 406  Q
    |||||  ||  | ||||||||        ||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4949938 aggtcattattcgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagagtccttcaatttttgg-tggaaa-agttgtttatgaatgaatgcatgtatacatggttat 4950034  T
Q  407 gctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctg 505  Q
    |||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  4950035 gctaaaattcataaaatatatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgtttttaaa-tgtacctg 4950133  T
Q  506 tatcacaggttct 518  Q
    |||||| ||||||    
T  4950134 tatcacgggttct 4950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 149 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27436510 - 27436160
Alignment:
Q  149 tgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt- 247  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27436510 tgtaaacacagtagaggaacatggtttcattt-gaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtt 27436412  T
Q  248 ----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtc 343  Q
        || |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         || ||    
T  27436411 cttaacaaaagttaaagcttagttaagatttt--gaagctgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaat-ttatc 27436315  T
Q  344 taagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata------gaatacatgatgaggtta 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||| ||||||||    
T  27436314 taagtccttcaattttt-gatggaaaaagttattcatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgttaaagtacatatacatagaatacatggtgaggtta 27436216  T
Q  438 agtcc-acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27436215 agtcccacaatgttggagccaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 27436160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 27974292 - 27974691
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  27974292 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacattgtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 27974390  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||| |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27974391 gaacgaaaccaaggaaaaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatc 27974489  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-----ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagt 414  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27974490 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagt 27974587  T
Q  415 acatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacag 513  Q
      |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  27974588 ggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaacgtacctgtatcacgg 27974686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 5207177 - 5207579
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  5207177 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 5207275  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5207276 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 5207374  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa--------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 411  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5207375 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-a 5207472  T
Q  412 agtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    |||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5207473 agtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 5207571  T
Q  511 caggttct 518  Q
    | ||||||    
T  5207572 cgggttct 5207579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 567249 - 567646
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  567249 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 567347  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||| |   | |  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  567348 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatg 567446  T
Q  327 tttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa----------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtac 416  Q
    |||        ||||||||||||||||||          ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  567447 ttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaaaaaattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtgg 567544  T
Q  417 atagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 515  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  567545 atagaatacatggtgagggtaagttccacgacgttggagtcaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggt 567643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8812937 - 8812594
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  8812937 tttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 8812839  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata- 371  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |     
T  8812838 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaa 8812741  T
Q  372 --gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 469  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  8812740 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtaacaatg 8812642  T
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  8812641 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 8812594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29024670 - 29024325
Alignment:
Q  129 aaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  29024670 aaggacttatcaaagttaatttttaaacattgtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggt-cctttttcaaatgataag 29024573  T
Q  228 aacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaaga------ttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccat 316  Q
    |||||||||||||||| |||     || ||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29024572 aacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaaacttagttaagagattttttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccat 29024473  T
Q  317 acccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtac 416  Q
    | |||||||||||        ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  29024472 atccatgatgttt-acaaaaacttgtctaaatccttcaattttt-gatggaaaaagttgtttatgaatg----------------gttatgctaaagtac 29024391  T
Q  417 atagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29024390 at---------gatgaggttaagtccaca-tgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 29024325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 1900166 - 1900309
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  1900166 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 1900265  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900266 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 1900309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 518
Target Start/End: Original strand, 13491232 - 13491371
Alignment:
Q  377 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttg 476  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13491232 ttatgaatggatgcatgcatgcatgattatgctaaaatacatggaatacataatgaggttaagtccac-atgttggagtcaagggtaacaacgccatttg 13491330  T
Q  477 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  13491331 gtaaggactatggttttaaa-tatacctgtatcacgggttct 13491371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15186571 - 15186452
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15186571 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 15186472  T
Q  473 tttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15186471 tttggtaaggactatggttt 15186452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29082998 - 29082879
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29082998 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 29082899  T
Q  473 tttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29082898 tttggtaaggactatggttt 29082879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12586885 - 12586519
Alignment:
Q  152 aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttccttttt-caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt--- 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||       
T  12586885 aaacattatagaggaacatggtttcatttaaaa-attgtaaagatattgcaataggttccttttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaagaaaaagttct 12586787  T
Q  248 --acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccat--acccatgatgtttgnnnnnnncttgt 342  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||| |  | |  |||||||||       |||||    
T  12586786 taacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagtttgaatttcttggtgttcttccttacaaggtccgttcatctgtgatgtttg-taaaaacttgt 12586689  T
Q  343 ctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgagg--tt 436  Q
    |||| |||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| |    ||| ||||| |||||  ||    
T  12586688 ctaaatccttcga-tgtttgatggaaaaatttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gcacaaatggtgaaaacatggtgaggtttt 12586593  T
Q  437 aagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12586592 aggtccacaatgatggagtcaaggggtaaatacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatca 12586519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Original strand, 16146569 - 16146688
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16146569 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 16146668  T
Q  473 tttggtaaggactatggttt 492  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  16146669 tctggtaaggactatggttt 16146688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 13268539 - 13268681
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  13268539 tttatgaatgaatgcttgtatgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatt 13268638  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13268639 tggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 13268681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 840693 - 840315
Alignment:
Q  131 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 230  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  840693 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 840596  T
Q  231 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 325  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  840595 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 840497  T
Q  326 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 424  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  840496 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 840409  T
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  840408 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 840315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 847869 - 847491
Alignment:
Q  131 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 230  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  847869 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 847772  T
Q  231 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 325  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  847771 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 847673  T
Q  326 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 424  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  847672 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 847585  T
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  847584 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 847491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1205873 - 1205495
Alignment:
Q  131 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 230  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  1205873 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 1205776  T
Q  231 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 325  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  1205775 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 1205677  T
Q  326 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 424  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  1205676 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 1205589  T
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1205588 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 1205495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 420 - 518
Target Start/End: Original strand, 34136937 - 34137035
Alignment:
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  34136937 gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacaccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 34137035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 23884753 - 23884885
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||    
T  23884753 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagcttaaaggtaacaacgccatt 23884852  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23884853 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 23884885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 401
Target Start/End: Original strand, 4829916 - 4830193
Alignment:
Q  129 aaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 228  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4829916 aaggatttgtcaaagt-aattggaaacattatagaggaacgtgatttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaaga 4830013  T
Q  229 acgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccca- 321  Q
    ||||||||||||||| |||     |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |  |     
T  4830014 acgaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagctaaggcttagttaaga-tttttgaagtttgaatttcttggtgttcttcctttcaaggtccgttcatat 4830112  T
Q  322 -tgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatgga-aatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 401  Q
     |||||||||       ||||||||| |||||| | | ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830113 gtgatgtttgcaaaaaacttgtctaaatccttcga-tatttgataaacaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 4830193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 299
Target Start/End: Original strand, 1959468 - 1959706
Alignment:
Q  55 tgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaa 154  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||| |            ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1959468 tgagacacgaactagaaactatgaatgcaaaataatgcattgtatgtttatgcaaaaat-gtaggatttttccgaagggcctatcaaagtgaattgtaaa 1959566  T
Q  155 cattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----ac 249  Q
    ||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||  |||||| | ||||        ||| ||||||||||||||||||||  |||     ||    
T  1959567 cattgtagaggaacataacttta-tttgaaaattgtaaagatattgcaatcagttc--------aaaagtaagaacgaaaccaaggaagaagttcttaac 1959657  T
Q  250 gaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttc 299  Q
     |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1959658 aaaagctaaagtttaattaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttc 1959706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27436595 - 27436511
Alignment:
Q  14 ctttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 98  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27436595 ctttactgttggattgacctcttgtaggtaaaaacaaaatatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagtgatggatgata 27436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 567181 - 567228
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  567181 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 567228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 804909 - 805054
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggtt--aagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaac 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||    
T  804909 tttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaatggtgaaaacatggtgaggttttaggtccacaatgatggagtcaaagggtaaacac 805005  T
Q  469 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  805006 gccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 805054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 5207103 - 5207150
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5207103 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 5207150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 27974222 - 27974269
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27974222 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27974269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 518
Target Start/End: Original strand, 16270644 - 16270710
Alignment:
Q  450 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16270644 tggagtcaaggggtataacgccatttggtaaggactatggtttc--attgtacttgtatcacaggttct 16270710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29024789 - 29024704
Alignment:
Q  14 ctttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgata 98  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29024789 ctttaatgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaaaatatgaggcatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgata 29024704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 308
Target Start/End: Original strand, 16270442 - 16270498
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttaca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16270442 aaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttcttccttaca 16270498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Original strand, 3430724 - 3430803
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  3430724 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgccatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 3430803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Original strand, 13268344 - 13268479
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  13268344 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaagaaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 13268441  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  13268442 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 13268479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 317
Target Start/End: Original strand, 23884567 - 23884692
Alignment:
Q  197 gttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga--gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatct 289  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||     || |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |    
T  23884567 gttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggttttt-gagtttgtattt 23884664  T
Q  290 cttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23884665 cttggtgttccttcttacaagatccata 23884692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16228699 - 16228645
Alignment:
Q  446 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16228699 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 16228645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9463151 - 9463104
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9463151 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 9463104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 16400050 - 16400097
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16400050 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 16400097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 30376543 - 30376590
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  30376543 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 30376590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Original strand, 803203 - 803240
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  803203 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 803240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Original strand, 16292070 - 16292107
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16292070 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 16292107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 34136598 - 34136643
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 114  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34136598 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 34136643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2549923 - 2549856
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2549923 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 2549856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Original strand, 16293858 - 16293937
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16293858 gtccacattgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 16293937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 15950466 - 15950986
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgatag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  15950466 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcattatat 15950565  T
Q  100 gcttatgcaaaaat----agnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaag 194  Q
      ||||||||||||    |             ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  15950566 atttatgcaaaaatgtacaattttttttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaag 15950664  T
Q  195 acgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttgg 294  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15950665 atattgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaaagagtacaaaagctaaagcttagttaa-attttttgaagttgtatctctttg 15950763  T
Q  295 tgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgt 394  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15950764 tgtttattcttacaaagtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgt 15950862  T
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15950863 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaggataacaacgccacttggtaaagactatggtttca 15950962  T
Q  495 aattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  15950963 aaatgtacctgtatcacgggttct 15950986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24288236 - 24287742
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24288236 agacattgaacgactttactgatggattgaccctttgctggtagaaacaaaatatgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatgtg 24288137  T
Q  101 cttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgt 198  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24288136 cttatgcaaaaatagataaaaaaaattttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattatagaggaacatggtttcattttgaacattgtaaagacgt 24288037  T
Q  199 tgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgtt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24288036 tgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaacc---------------------aagcttagttaaga-tttttgaagttgtatatcttggtgtt 24287959  T
Q  299 cattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgc 398  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||        ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287958 cattcttacaaggtccatatctgtgatgtttacaaaaaacttgtcttagtccttcaa-tttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgc 24287860  T
Q  399 atggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 497  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  24287859 atggttatgct-aagaacatagaatacatggtggcgttaagttccacaatattggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtt--caag 24287763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 21857664 - 21858050
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21857664 gaaggacttatcaaagcgaaatgtaaacacagtac--gaatatggtttcattttgaatattgtaaagacgtcgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 21857761  T
Q  228 aacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21857762 aacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagctaaagctcagttaagattttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatgt 21857860  T
Q  328 ttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacat 427  Q
    ||        |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21857861 tt-acaaaaacttgactaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttgtttatgaatggatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacat 21857958  T
Q  428 gatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21857959 gatgaggttaagtcccataatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtaccggtgtcacgggttct 21858050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35141273 - 35140749
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35141273 agacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaagcaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 35141174  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgt 198  Q
    ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  |    
T  35141173 gcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagatat 35141075  T
Q  199 tgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt--gaagttgtatctct 291  Q
    |||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35141074 tgcaataggttctttttt-aaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagttaagattttttttgaagttgtatctct 35140976  T
Q  292 tggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgc 390  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  35140975 tggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgcctaagtccttcaattttt-gatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgc 35140878  T
Q  391 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatgg 489  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35140877 atgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgg 35140778  T
Q  490 tttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35140777 tttcaaattgtacctgtattacgggttct 35140749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 42571950 - 42572479
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgatag 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||     
T  42571950 agacattgaacgactttacggatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaagatgatgaatgatat 42572048  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn------gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaa 192  Q
      ||||||||||||                    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |    
T  42572049 atttatgcaaaaatgtaaaattttttttttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtga 42572147  T
Q  193 agacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtat 287  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42572148 agatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaaaatcgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtat 42572247  T
Q  288 ctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||| ||    
T  42572248 ctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttatgaataaa 42572346  T
Q  388 tgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatga-ggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggact 485  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  42572347 tgcatgtatgcatggttataataaagtacattgaatacatgaggatgtttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacatcatttggtaaggact 42572446  T
Q  486 atggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42572447 atggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 42572479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25494375 - 25493980
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagt-gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25494375 gaaggacttgtcaaagttgatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggtccttttttcaaaaggtaa 25494277  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494276 gaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 25494177  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag 420  Q
    ||||||||||       ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25494176 atgatgtttgcaaaaaacttgtcttagtccttcaa-tttttgatgaaaaaagatgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagtacatag 25494078  T
Q  421 aatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25494077 aatacatggtgagggcaagttccacaatgttggagctaagggtaacaacaccatctggtaaggactatggtttc-aagtgtacctgtatcacgggttct 25493980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 162 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21112506 - 21112150
Alignment:
Q  162 gaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac-----gaaagct 256  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |     ||||||     
T  21112506 gaggaacatggttttattttgaaaattgtaaagatgtcgcaaacgattcctttttcaacaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaatgaaagcg 21112407  T
Q  257 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt--ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttca 354  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||        ||||||||||||||| |    
T  21112406 aaagcttagttaagattttt-gaagttgtatctcttttggtgttcattcttacaaaatccatattcatgatgtttacaaaaaacttgtctaagtccttaa 21112308  T
Q  355 atttt--ttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttgg 452  Q
    |||||  | |||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21112307 attttaatggatggaaaaaaatatttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatagaaaacatggtgaagttaagtccacaatgttgg 21112208  T
Q  453 agtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21112207 agtcaagggtaacaacgtcatttggtaaggactatggtttcata-tgtacctgtatcac 21112150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 3764018 - 3764418
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  3764018 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 3764116  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3764117 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 3764215  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 413  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3764216 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 3764313  T
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 512  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  3764314 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 3764412  T
Q  513 ggttct 518  Q
    ||||||    
T  3764413 ggttct 3764418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16275961 - 16275554
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  16275961 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 16275863  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16275862 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 16275764  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat-------------tttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttat 406  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||              |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275763 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaatttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttat 16275665  T
Q  407 gctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctg 505  Q
    ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16275664 gct-aagtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctg 16275567  T
Q  506 tatcacaggttct 518  Q
    |||||| ||||||    
T  16275566 tatcacgggttct 16275554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 26730967 - 26731110
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  26730967 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 26731066  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26731067 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 26731110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 34541156 - 34541299
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  34541156 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 34541255  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34541256 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 34541299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 330
Target Start/End: Original strand, 30691456 - 30691664
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30691456 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 30691554  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttt-ttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30691555 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 30691654  T
Q  321 atgatgtttg 330  Q
    ||||||||||    
T  30691655 atgatgtttg 30691664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 383 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24701241 - 24701129
Alignment:
Q  383 atgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaag 481  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  24701241 atgaatgtatgtatgcatgcttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaag 24701142  T
Q  482 gactatggtttca 494  Q
    |||||||||||||    
T  24701141 gactatggtttca 24701129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 518
Target Start/End: Original strand, 40388514 - 40388637
Alignment:
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 494  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40388514 atgcatgattatgctaaaatacagagaatacatggtgaggttaggtccacaatgttggagttaggggtaacaacaccatttggtaaggactatggtttcc 40388613  T
Q  495 aattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    || ||||||| |||||| ||||||    
T  40388614 aaatgtacctatatcacgggttct 40388637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24692402 - 24692290
Alignment:
Q  383 atgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaag 481  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  24692402 atgaatgtatgtatgcatctttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacaccatttgataag 24692303  T
Q  482 gactatggtttca 494  Q
    |||||||||||||    
T  24692302 gactatggtttca 24692290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 3763944 - 3763991
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3763944 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 3763991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16276031 - 16275984
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16276031 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 16275984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 518
Target Start/End: Original strand, 21767056 - 21767154
Alignment:
Q  418 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 517  Q
    ||||| ||||| | ||||| | |||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21767056 tagaaaacatggtaaggttgaatccataaggttggagtcaagggta-caatgctatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 21767153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24701366 - 24701289
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 329  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  24701366 aaagctaaagtctagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt 24701289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42387029 - 42386963
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  42387029 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacaaggtgagggtaagt 42386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25494466 - 25494393
Alignment:
Q  41 gtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaat 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  25494466 gtagaaacaaaatatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaat 25494393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24692526 - 24692449
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 329  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  24692526 aaagctaaagtctagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggtccatatctttgatgttt 24692449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24692707 - 24692661
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24692707 gaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgcttatgcaaaaatag 24692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 106
Target Start/End: Original strand, 21857587 - 21857636
Alignment:
Q  57 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatg 106  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21857587 agacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatg 21857636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12377298 - 12377267
Alignment:
Q  377 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12377298 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 12377267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 454
Target Start/End: Original strand, 20278855 - 20278918
Alignment:
Q  391 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag 454  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20278855 atgtatgcatgattatgctacagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggag 20278918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24701547 - 24701501
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  24701547 gaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgtttatgcaaaaatag 24701501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19990297 - 19990255
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  19990297 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatg--acgcttatgcaaaaat 19990255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 42386955 - 42386926
Alignment:
Q  463 aacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386955 aacaacgccatttggtaaggactatggttt 42386926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Original strand, 20278671 - 20278734
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20278671 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaactaaggaaa 20278734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22942954 - 22942907
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  22942954 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 22942907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 39843017 - 39843531
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgatag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  39843017 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatat 39843116  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgt 198  Q
      |||||||||||| |            ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  |    
T  39843117 atttatgcaaaaat-gtacaatttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatat 39843214  T
Q  199 tgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgtt 298  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39843215 tgcaaaaggc-cctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacaaaaggtaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgtt 39843312  T
Q  299 cattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgc 398  Q
    || || ||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||    
T  39843313 cactcgtacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgc 39843411  T
Q  399 atggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 497  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  39843412 atggttatactaaagtacattgaatacatgaggaggttaagttccacaatgttggagtcgagggtaacaacaccacttggtaaggactatggtttcaaa- 39843510  T
Q  498 tgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  39843511 tgtacctgtatcacgggttct 39843531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 17680360 - 17680876
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgatag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17680360 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacaaactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatat 17680459  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnng-aaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacg 197  Q
      ||||||||||||                |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||      
T  17680460 atttatgcaaaaatgtacaattttttttttaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagata 17680558  T
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgt 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17680559 ttgcaaaaggt-cctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgt 17680656  T
Q  298 tcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatg 397  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||    
T  17680657 tcactcgtacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatg 17680755  T
Q  398 catggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa 496  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17680756 catggttatactaaagtacactgaatacatgaggaggttaagttccacaatgttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa 17680855  T
Q  497 ttgtacctgtatcacaggttct 518  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  17680856 -tgtacctgtatcacgggttct 17680876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 55 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6666341 - 6665875
Alignment:
Q  55 tgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa-tagnnnnnnnnnnnn------gaaggacttatcaaagtgaa 147  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||                  |||||| |||||||||||||    
T  6666341 tgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaatagataattctttttttttttgaaggatttatcaaagtgaa 6666242  T
Q  148 ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 247  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  |||   ||||||||||||||||||| |||    
T  6666241 atgtaaacattgtagaggaaaatggtttcattttaaacattgtaaggatgttgcaaacgattccttttttcaaa---aagaacgaaaccaaggaaaaagt 6666145  T
Q  248 -----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgt 342  Q
         || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||         | ||    
T  6666144 tcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaatttgcatctcttggtgttccttcttacaatgtccatatccgtgatgtttacaaaaat-tcgt 6666047  T
Q  343 ctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtcc 442  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  6666046 ctaagtccttcaatttt--gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagatagagtcc 6665949  T
Q  443 acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||    
T  6665948 ac-atgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttccaa-tgtgcatgtatcacgggttct 6665875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 273 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6673777 - 6673537
Alignment:
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 372  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||         | |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  6673777 tttttgaatttgcatctcttggtgttccttcttacaatgtccatatccgtgatgtttacaaaaat-tcgtctaagtccttcaatttt--gatggaaaaag 6673681  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6673680 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagatagagtccac-atgttggagtcaagggtaacaacgcca 6673582  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||    
T  6673581 tttggtaaggactatggtttccaa-tgtgcatgtatcacgggttct 6673537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16761871 - 16761728
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  16761871 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 16761772  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16761771 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 16761728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19837686 - 19837545
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  19837686 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgcttatgttaaagtacatagaataaatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaggtaacaatgccattt 19837587  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19837586 ggtgaggactacggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 19837545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20736209 - 20735863
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  20736209 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 20736111  T
Q  273 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattt---tttgatggaa 368  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||  || |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || |   |  ||   ||    
T  20736110 tttttgaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaaacacttatctaagtacttcgatattagtgagaaaaaa 20736012  T
Q  369 atagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaac 468  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  20736011 aaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggggaggttaagtccacaaagttggagccaagggtaacgac 20735913  T
Q  469 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20735912 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20741043 - 20740901
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||    
T  20741043 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaatttggagccaagggtaacgatgccattt 20740944  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20740943 ggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20740901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20744767 - 20744421
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  20744767 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 20744669  T
Q  273 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattt---tttgatggaa 368  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||  || |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || |   |  ||   ||    
T  20744668 tttttgaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaaacacttatctaagtacttcgatattagtgagaaaaaa 20744570  T
Q  369 atagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaac 468  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |     
T  20744569 aaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaatttggagccaagggtaacgat 20744471  T
Q  469 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20744470 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20744421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 339 - 499
Target Start/End: Original strand, 22104942 - 22105104
Alignment:
Q  339 ttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta-aagtacatagaatacatgatgagg-tt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||   ||| ||||| || || ||    
T  22104942 ttgtctaagtccttcaattttttgatggaaagagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacatggtggggttt 22105041  T
Q  437 aagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105042 aagtccataaagttggagttaagggtaaaaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 22105104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32002040 - 32001904
Alignment:
Q  382 aatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaa 480  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  32002040 aatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaacgcatggtgaggttaagcccacaaagttggagcttaagggtaacaacgccatttggtag 32001941  T
Q  481 ggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32001940 ggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 32001904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 518
Target Start/End: Original strand, 22160921 - 22161060
Alignment:
Q  379 atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttgg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  22160921 atgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttgg 22161020  T
Q  478 taaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    || | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22161021 taggtactacggtttcaaa-tgtacatgtatcacgggttct 22161060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23917644 - 23917521
Alignment:
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23917644 atgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggggaagttaagttccataatgttggagtcaattgtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 23917545  T
Q  494 aaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23917544 aaa-tgtacctgtatcacgggttct 23917521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 511
Target Start/End: Original strand, 24709061 - 24709436
Alignment:
Q  132 gacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacg 231  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || | || ||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||   |||||||    
T  24709061 gacttttcaaagtaaattgtagacattgcagaggaacatggttttaatt-gaaaattgtaaagatattgcaatcggttcccttttcaaaaaacaagaacg 24709159  T
Q  232 aaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 326  Q
    || ||||||||  | |     || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    |||||    
T  24709160 aagccaaggaagaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggcccatatatgtgatg 24709258  T
Q  327 ttt--gnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 424  Q
    |||          |||| ||||||||||||| | || |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     | ||||    
T  24709259 tttacaacaaaaacttgactaagtccttcaa-tattggatggaaa-aattatttatgaatgagtgcatgtatgcatgattatgctaaag-----aaaata 24709351  T
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| | | ||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  24709352 ggtg-tgaggttaagtccataatgttggagtaaagggaaaacacgtcgtatggtagggactacggtttcaca-tgtacctgaatcac 24709436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 518
Target Start/End: Original strand, 25857102 - 25857200
Alignment:
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25857102 gaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25857200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Original strand, 22160721 - 22160856
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  22160721 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcataacaaaagctaaagcttagttaag-gt 22160818  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  22160819 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 22160856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20741251 - 20741148
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||    
T  20741251 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttctaaacaaaagctaaagcttagttaagat 20741152  T
Q  273 tttt 276  Q
    ||||    
T  20741151 tttt 20741148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 32002348 - 32002307
Alignment:
Q  74 tatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32002348 tatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 32002307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 25856759 - 25856805
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25856759 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 25856805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 243
Target Start/End: Original strand, 25856869 - 25856930
Alignment:
Q  181 tgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25856869 tgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 25856930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2387814 - 2387295
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| ||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2387814 agacatcgaaccactttactgacggattaaccttttgatg--agaagacacaaggtaagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 2387717  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn----gaaggacttatcaaagtgaattg-taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaag 194  Q
    |||||||||||||||                 |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2387716 gcttatgcaaaaatatataaatttttatttttgaaggacttatcgaagttaatttctaaacattgtagaggaacatggtttcattttgaacattgtaaag 2387617  T
Q  195 acgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2387616 acgttgcaaacggttcctttttcaaaagctaagaacgaaaccaaggaaagagtacaaaagcttaagcttagttaagat-ttttgaagttgtatctcttgg 2387518  T
Q  295 tgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2387517 tgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaaacttgtttaagctcttcaa-tttttgatggaaaaatttgtttatgaatgaatgcatgt 2387419  T
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2387418 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagccaagggtaacaacgtcatttggtaaggactatggttt- 2387320  T
Q  494 aaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| || |||| || |||||||    
T  2387319 aaattgcacttgtaacaaaggttct 2387295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 31542605 - 31542081
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31542605 agacattggaccactttattgatggattgaccttttgtaggtagaagcaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 31542506  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacg 197  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||      
T  31542505 gcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagata 31542407  T
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctct 291  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31542406 ttgcaataggttc-tttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttttgaagttgtatctct 31542308  T
Q  292 tggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgc 390  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  31542307 tggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgcctaagtccttcaattttt-gatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgc 31542210  T
Q  391 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatgg 489  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31542209 atgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgg 31542110  T
Q  490 tttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31542109 tttcaaattgtacctgtattacaggttct 31542081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 13471328 - 13470882
Alignment:
Q  55 tgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnng---aaggacttatcaaagtgaattgt 151  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                |||||||| |||||||||| |||    
T  13471328 tgagacactgactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacatttttttttttttaaggacttgtcaaagtgaaatgt 13471229  T
Q  152 aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt--- 247  Q
    |||||| | || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       
T  13471228 aaacatggcagcggaacatggtttcattt-gaaaattgtaaagatattgacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttct 13471130  T
Q  248 ---acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtct 344  Q
       ||  ||| |||||||||| |       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        |||||||    
T  13471129 ttaacagaagttaaagcttagat-------tttgcagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaaacttgtct 13471037  T
Q  345 aagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tcca 443  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
T  13471036 aagtccttcaatttttt-atggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagaccaaagtacatagaatatatggtgagggtacgttcca 13470938  T
Q  444 caatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13470937 caatgttggagtcaaggataacaacgccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 13470882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 217 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 31554592 - 31554281
Alignment:
Q  217 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 310  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554592 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 31554493  T
Q  311 gtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtt 404  Q
    ||||||| || ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554492 gtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaattttttttgatggaaaaggtagtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtt 31554394  T
Q  405 atgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacc 503  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31554393 atgctaa-gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacc 31554296  T
Q  504 tgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||| ||||||    
T  31554295 tgtatcacgggttct 31554281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13453098 - 13452956
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13453098 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 13452999  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13452998 tggtaaggactaaggtttcaaa-tgtacctgcatcacaggttct 13452956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22430404 - 22430075
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac----gaaagctaaagcttagttaagattt 274  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  22430404 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagc-aagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaagaaagctaaagcttagttaagattt 22430306  T
Q  275 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 373  Q
    |  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| |||    
T  22430305 t--gaagttgtatattttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaataacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaagt 22430209  T
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcca 472  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |     
T  22430208 t-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaaaatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgtcc 22430110  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22430109 tttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 22430075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 1958356 - 1957985
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  1958356 gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgaaaaggaacattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taag 1958261  T
Q  228 aacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    |||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  1958260 aacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggtccgtatct 1958162  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 419  Q
     ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  1958161 ttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat-gtt--ttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatg 1958066  T
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1958065 gaatgtatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagagtaacagcgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 1957985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 520
Target Start/End: Original strand, 14817945 - 14818202
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| ||||| |||    
T  14817945 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatttcttggtgtttcttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaaatcc 14818043  T
Q  351 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgtt 450  Q
    ||| || ||  | || ||| |||| ||||||||||||||||||         ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  14818044 ttcgatatt--ggtgaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatga--------ttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaagtt 14818132  T
Q  451 ggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttctgc 520  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  14818133 ggagccaagggtaacgacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaagggttctgc 14818202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 511
Target Start/End: Original strand, 2341525 - 2341610
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2341525 catggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 2341610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 403 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19371081 - 19370984
Alignment:
Q  403 ttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19371081 ttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 19370984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 518
Target Start/End: Original strand, 6202787 - 6203100
Alignment:
Q  206 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttca 300  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  6202787 ggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttatgattttt-gaagttgtatttcttggtgttcc 6202884  T
Q  301 ttcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgca 399  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||| ||| || ||  |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6202885 ttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtcattcgatattagtga--gaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgca 6202980  T
Q  400 tggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 497  Q
    || |||||||| |  | |   ||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  6202981 tgattatgctacacaaacggtgaaaacacggtgatgttaggtccacaatgtcggagcttaagggtaacaacgccatttggtcgggactatggtttcaaa- 6203079  T
Q  498 tgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6203080 tgtacctgtatcacgggttct 6203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19371260 - 19371138
Alignment:
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt 292  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||     || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19371260 ttgcaaacggttccttcttcaaa-gataagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttctt 19371163  T
Q  293 ggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19371162 ggtgttccttcttacaaggaccata 19371138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35072165 - 35071822
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-nnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||    
T  35072165 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacttttttttttaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaa 35072068  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagct 262  Q
    ||| | || | |||||| ||||  |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |     || ||||||||| ||    
T  35072067 cattgtttta-tttgaaaattgagaagatgttgcaattggttcccttttcaaaa-gtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaaact 35071970  T
Q  263 tagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat-ttttt 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |    
T  35071969 tagttaag-gtttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagt 35071878  T
Q  362 gatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacat 418  Q
    ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35071877 gagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacat 35071822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27168373 - 27168225
Alignment:
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggttaa--gtccacaatgttggagtcaagggcaa 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| ||||||| |  | ||| || | |||||||||||| |     
T  27168373 agttatttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaacggtgaaaacatggtgaggtttaaggcccataacgatggagtcaagggtat 27168277  T
Q  465 caacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  27168276 -aacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 27168225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 6202651 - 6202697
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6202651 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 6202697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Original strand, 2341361 - 2341427
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2341361 aaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggaccata 2341427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 14817763 - 14817809
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14817763 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 14817809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22473543 - 22473489
Alignment:
Q  446 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22473543 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 22473489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 5635719 - 5635766
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  5635719 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 5635766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22430512 - 22430466
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22430512 gaaattatgaatacaaaatgatgcatggtatgcttatgcaaaaatag 22430466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19371374 - 19371337
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19371374 aatgcaaaatggtgcatgatatgcttatgcaaaaatag 19371337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31554722 - 31554693
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554722 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgat 31554693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 129 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12103
Alignment:
Q  129 aaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491 aaggacttgtcaaagtgaattgtaaacacagtagaggaacatggtttcattttgaatattgtaaagtcgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 12392  T
Q  229 acgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagc-ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  12391 acgaaaccaaggaaagagtacaaaagctaaagctttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacatggtccatatccataacgt 12293  T
Q  328 ttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacat 427  Q
    |||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12292 ttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaagatgtttatgaatgaatacatgtatgcatggttatactaaagtacatagaatacat 12194  T
Q  428 gatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  12193 ggtgaggttaagttccacaatgttggagccaagggtaataacgccatttggtaaggactatggtttc-aagtgtacctgtattacgggttct 12103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 57 - 518
Target Start/End: Original strand, 144300 - 144762
Alignment:
Q  57 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnng-aaggacttatcaaagtgaattgtaaac 155  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||| |||||||||||||||||||    
T  144300 agacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagaattatattttttcaaggactaatcaaagtgaattgtaaac 144399  T
Q  156 attgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagc 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144400 attgtagtggaacatggcttcattttggacattgtaaagacgttgcaaacggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtactaaagc 144499  T
Q  256 taaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa 355  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||        ||||||||||||||||||    
T  144500 taaagcttagttaaga-tttttaaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatgcatgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaa 144597  T
Q  356 ttttttgatgg---aaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttg 451  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  144598 -tttttgatggaaaaaaaagttgtttataaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagaaaacggaatacatggtgagggtaagttccataatgttg 144696  T
Q  452 gagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  144697 gagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 144762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 290 - 518
Target Start/End: Original strand, 131477 - 131706
Alignment:
Q  290 cttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata---gttgtttatgaatga 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||    
T  131477 cttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttttt-atggaaaaaaaagttgtttatgaatga 131574  T
Q  387 atgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggact 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  131575 atgcatgtatgcatggttatgctaaagaacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggact 131674  T
Q  486 atggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  131675 atggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 131706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 68 - 518
Target Start/End: Original strand, 6752 - 7217
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6752 agaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgtaaaaatagacaattttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacgttgtagaggga 6851  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----------------acg 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||                 ||     
T  6852 catggtttcattttgaacattgtaaagacgttgcaa-cggttccctttttgaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtttttttttttttttttaaca 6950  T
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||        |||||| ||||||    
T  6951 aaagctaaagcttagttacgattttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatattcgtgatgtttacaaaaaacttgtcgaagtcc 7049  T
Q  351 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgt 449  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  7050 ttcaatttt-tgatggaaaaagatgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcgaaagtacatagaatacatgatgaggttaattcccataatgt 7148  T
Q  450 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7149 tggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 7217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 25503921 - 25504426
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25503921 agacattggaccactttactgatggattgaccctttgtaggtagaaacaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 25504020  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-----gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaag 194  Q
    ||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  25504021 gcttatgcaaaaatagataaaaaaataaaatttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaag 25504119  T
Q  195 acgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatc 288  Q
    |  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25504120 atattgcaataggttc-tttttcaaaagttaagaactaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatatttttgaagttgtatc 25504218  T
Q  289 tcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaat 388  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25504219 tcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttttttatgaatgaat 25504316  T
Q  389 gcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactat 487  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25504317 gcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatatatggtgaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactat 25504416  T
Q  488 ggtttcaaat 497  Q
    ||||| ||||    
T  25504417 ggtttaaaat 25504426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28270386 - 28269987
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28270386 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28270288  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28270287 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28270188  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnn-----cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 415  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28270187 atgatgtttgcaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 28270088  T
Q  416 catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 515  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28270087 catagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggt 28269990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28349136 - 28348737
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28349136 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28349038  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28349037 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28348938  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnn-----cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 415  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348937 atgatgtttgcaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 28348838  T
Q  416 catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 515  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28348837 catagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggt 28348740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28305355 - 28304954
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28305355 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28305257  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28305256 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28305157  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnn-------cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 413  Q
    ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28305156 atgatgtttgcaaaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 28305057  T
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacag 513  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28305056 tacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgg 28304959  T
Q  514 gttct 518  Q
    |||||    
T  28304958 gttct 28304954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16636740 - 16636282
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  16636740 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagattttttttt--gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaa 16636643  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa- 259  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||      ||  ||||||||     
T  16636642 catggtttcatat-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaagaagttctttaacagaagctaaaa 16636544  T
Q  260 gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa---- 355  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||||||||||        
T  16636543 gcttagttaagattttg-gaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaa 16636446  T
Q  356 --ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttgg 452  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16636445 aattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttgg 16636347  T
Q  453 agtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  16636346 agtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaacgtacctgtatcacgggttct 16636282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 27056372 - 27056773
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  27056372 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 27056470  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27056471 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 27056569  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaa 412  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27056570 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aa 27056667  T
Q  413 gtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27056668 gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 27056766  T
Q  512 aggttct 518  Q
     ||||||    
T  27056767 gggttct 27056773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22326361 - 22326025
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaag 281  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22326361 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaag 22326264  T
Q  282 ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttt-- 378  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||       
T  22326263 ttgtatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctatgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtttttatc 22326166  T
Q  379 -atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttg 476  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22326165 aatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatttg 22326066  T
Q  477 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22326065 gtagggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 22326025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Original strand, 620927 - 621270
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||     || |||||||||||||||||||| ||    
T  620927 tttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaag-tt 621024  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata- 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |     
T  621025 ttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaa 621123  T
Q  372 --gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 469  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  621124 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtaacaatg 621222  T
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  621223 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 621270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27538448 - 27538305
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  27538448 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 27538349  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27538348 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 27538305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Original strand, 27071864 - 27072204
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||| ||    
T  27071864 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaatcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtt 27071962  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   |||| |    
T  27071963 ttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat-g 27072060  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 471  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  27072061 tt--ttatgaatgaatgcgtgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagcctacaaagttggagcttaagggtaacaacgcc 27072158  T
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27072159 atttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 27072204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25700616 - 25700474
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  25700616 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtgacaacaccatt 25700517  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25700516 tggtaaggactaaggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25700474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19716143 - 19715822
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || ||| ||||||||||||||||||    
T  19716143 tttgaaaattgtgaagatgttgtaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaacctaaagcttagttaagat 19716045  T
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 372  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||    ||  |||      
T  19716044 tttt-gaagttgtatttcttggtgttctttcttacgaggtccacatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattag--tgagaattt 19715949  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  19715948 tttcttatgtatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaatgtggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaaacacgcca 19715849  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19715848 tttggtaaggactatggtttcaaattg 19715822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 374 - 518
Target Start/End: Original strand, 18219274 - 18219418
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18219274 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 18219373  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  18219374 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 18219418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 20056100 - 20056231
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20056100 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtgacaacgccattt 20056199  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20056200 ggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 20056231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 374 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18112955 - 18112836
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18112955 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaaatacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 18112856  T
Q  473 tttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18112855 tttggtaaggactatggttt 18112836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 499
Target Start/End: Original strand, 20457035 - 20457358
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||    
T  20457035 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 20457133  T
Q  273 tttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaat 370  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||||    
T  20457134 tttt-gaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtccgtatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat 20457231  T
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 469  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||    
T  20457232 -gtt--ttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgtatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagagtaacagcg 20457328  T
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20457329 ccatttggtaagcactatggtttcaaattg 20457358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 518
Target Start/End: Original strand, 23981842 - 23981986
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  23981842 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagagtaacaacgtca 23981941  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  23981942 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 23981986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3694465 - 3694321
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta--aagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |  |   || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3694465 tttatgcatgaatgcatgtatgcatgattgttttttcaattacagagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 3694366  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3694365 tttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 3694321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27512213 - 27512121
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27512213 catggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 27512121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 420 - 492
Target Start/End: Original strand, 22777010 - 22777082
Alignment:
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22777010 gaatgcatggtgaggttaagtccacagtgttggagtcaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 22777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27512407 - 27512302
Alignment:
Q  214 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27512407 tttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 27512310  T
Q  310 ggtccata 317  Q
    || |||||    
T  27512309 ggaccata 27512302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 16823023 - 16823115
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16823023 catggtgaggttgagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 16823115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 27056280 - 27056327
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27056280 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27056327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18911308 - 18911256
Alignment:
Q  445 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 497  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18911308 aatgatggagtcaagggtaacaacgccattgggtaaggactatggtttcaaat 18911256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 313
Target Start/End: Original strand, 20055967 - 20056028
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  20055967 aaagctaaaacttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttctaacaaggtc 20056028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 492
Target Start/End: Original strand, 28266931 - 28267047
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28266931 tttatggatggatacatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 28267029  T
Q  475 tggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28267030 tggtaaggactaaggttt 28267047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 492
Target Start/End: Original strand, 28345680 - 28345796
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28345680 tttatggatggatacatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 28345778  T
Q  475 tggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28345779 tggtaaggactaaggttt 28345796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 286
Target Start/End: Original strand, 22776802 - 22776905
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22776802 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gtttttgaa 22776899  T
Q  281 gttgta 286  Q
    ||||||    
T  22776900 gttgta 22776905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 9143000 - 9143047
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9143000 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 9143047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 18946917 - 18946963
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18946917 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 18946963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 27071751 - 27071797
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27071751 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 27071797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 20045665 - 20045720
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045665 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 20045720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 518
Target Start/End: Original strand, 20045908 - 20045988
Alignment:
Q  434 gttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20045908 gttaggtccacaatgtcggagcttaagggtaacaacgccattagg----gactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20045988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27512542 - 27512506
Alignment:
Q  76 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27512542 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 27512506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 68 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 1849
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  2300 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaatttttttttaaggacttgtcaaagtgaaatgtaaacacagtagaggaa 2201  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagct 262  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     || | || |||| ||    
T  2200 catggtttcattt-gaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacaaaaccaacgaaagagttcttaacaacagttaaaact 2102  T
Q  263 tagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttg 362  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||       | ||| |||||||||||||||||||    
T  2101 tagttaagatttt--gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaatgtccaaatctatgatgtttgcaaaaaacatgtataagtccttcaattttttg 2004  T
Q  363 atggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggc 462  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2003 atgaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatggtaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggt 1904  T
Q  463 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  1903 aacaacgccatttggtaaggactatggttttaaa-tgtacctgtatcacgggttct 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41000945 - 41000421
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41000945 agacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaagcaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 41000846  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacg 197  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||      
T  41000845 gcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagata 41000747  T
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt-tgaagttgtatctct 291  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41000746 ttggaataggttc-tttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttatgaagttgtatctct 41000648  T
Q  292 tggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgc 390  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  41000647 tggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgcctaagtccttcaattttt-gatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgc 41000550  T
Q  391 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatgg 489  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41000549 atgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgg 41000450  T
Q  490 tttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41000449 tttcaaattgtacctgtattacgggttct 41000421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41009727 - 41009203
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41009727 agacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaagcaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 41009628  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacg 197  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||      
T  41009627 gcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagata 41009529  T
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt-tgaagttgtatctct 291  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41009528 ttggaataggttc-tttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttatgaagttgtatctct 41009430  T
Q  292 tggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgc 390  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  41009429 tggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgcctaagtccttcaattttt-gatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgc 41009332  T
Q  391 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatgg 489  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41009331 atgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgg 41009232  T
Q  490 tttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41009231 tttcaaattgtacctgtattacgggttct 41009203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 8202970 - 8203499
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatagg 100  Q
    |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8202970 agacatcgaaccactttactgacgtattgaccttttgctgatggaaacaaaatatgagacacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatg 8203069  T
Q  101 cttatgcaaaaat-----agnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattg-taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaag 194  Q
    |||||||||||||     |             |||||| ||| |||| | ||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  8203070 cttatgcaaaaatgtacaattttttttttatcgaaggatttaccaaacttaatttataaacattttaaaggaacatggattcattttaaa-attgtaaag 8203168  T
Q  195 acgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg------aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatc 288  Q
    |  ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8203169 atattgcaataggttcttttttcaaaaggtaagaatgaaaccaaggaaaaagttcttaatcaaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatc 8203268  T
Q  289 tcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaa 387  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||        ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  8203269 tcttgatgttcattcttacacggtccatatccataatgtttgcaaaaaaacttgtgtaagtccttcaattttt-gatggagaaagttgtttgtgaatgaa 8203367  T
Q  388 tgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggacta 486  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8203368 tgcatgtatgcatgattatgctaaagtacatagagtacatggtgaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgtcatttggtaaggacta 8203467  T
Q  487 tggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8203468 tggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 8203499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 9552601 - 9552993
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  9552601 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggttc-tttttcaaaagttaag 9552698  T
Q  228 aacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccca 321  Q
    ||| |||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||      
T  9552699 aactaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatatttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaagttccatacctt 9552798  T
Q  322 tgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacataga 421  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9552799 tgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttttttatgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacataga 9552896  T
Q  422 atacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||    
T  9552897 atatatggtgaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaatgtacttgtaacaaaggttct 9552993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 217 - 520
Target Start/End: Original strand, 15682786 - 15683093
Alignment:
Q  217 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 310  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15682786 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcatccttacaag 15682885  T
Q  311 gtccatacccatgatgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct 409  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15682886 gtccatacccatgatgtttgcaaaaaaacttgtgtaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagtagtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct 15682984  T
Q  410 aaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatc 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15682985 aaagtacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatc 15683082  T
Q  510 acaggttctgc 520  Q
    || ||||||||    
T  15683083 acgggttctgc 15683093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14420777 - 14420436
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     || ||||||||||||||||||||||    
T  14420777 tttgaaaattgtgaagatgttgctattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 14420678  T
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 372  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||        |||||  || ||||||||||||| |||||||| ||    
T  14420677 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtacaaatccttcaattttt-gatggaaaaag 14420581  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14420580 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtgatgctaaagtacatagaatacatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaggtaacaacgcca 14420481  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14420480 tttggtaatgactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 14420436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17928472 - 17928027
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  17928472 agacatcgaaccactttactgacggattgaccttttgtaggtagaaacaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 17928373  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgtt 199  Q
    |||||||||||||               ||||||||||||||||      |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  17928372 gcttatgcaaaaaggaatttttttttttgaaggacttatcaaag------gtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtaaagatatt 17928280  T
Q  200 gcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga--gtac-----gaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt 292  Q
    ||||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||     |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17928279 gcaatatgtttccttttcacaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaaaagtacttaacgaaagcgaaagcttaattaagattttt-gaagttctatctctt 17928181  T
Q  293 ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17928180 ggtgttcattcttacaaggtccataaccgtgatgtttgcaaaaaatttgtctaaatccttcaagtttt-gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcat 17928082  T
Q  393 gtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaat 447  Q
    |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17928081 gtattcctagttatgttaaagtacatagaatacatgatgaggttaagttcacaat 17928027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25266126 - 25265673
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  25266126 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagattttttt----gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaa 25266031  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa- 259  Q
     |||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||      ||  ||||||||     
T  25266030 tatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaa 25265932  T
Q  260 gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaatttt 359  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  25265931 gcttagttaaaattttg-gaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttt 25265834  T
Q  360 ttg---atggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagt 455  Q
    ||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25265833 ttatttatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaa-gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagt 25265735  T
Q  456 caagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265734 caatggtaacaacgtcatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25265673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 492
Target Start/End: Original strand, 10720282 - 10720658
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  10720282 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 10720380  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  10720381 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 10720479  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaa 412  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10720480 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaaattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aa 10720577  T
Q  413 gtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720578 gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 10720658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8608652 - 8608327
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8608652 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 8608554  T
Q  281 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 379  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||         || |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||||    
T  8608553 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggacaatatctttgatgtttacaagaat-ttatctaagtccttcgatattagtgaggaaaaaagtt-ttta 8608456  T
Q  380 tgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  8608455 tgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggagcttaagggtaacaacgccaattggt 8608356  T
Q  479 aaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8608355 aaggactatggtttcaaa-tgtacctgtat 8608327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15697936 - 15697794
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15697936 tttatgcatgaatgcatgtatggatgattatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatt 15697837  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  15697836 tggtaaggactatggttt-aaaatatacctgtatcacgggttct 15697794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12557336 - 12557195
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12557336 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccccaatgttggagccaagggtaacaatgccattt 12557237  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  12557236 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctttatcactggttct 12557195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 518
Target Start/End: Original strand, 30093459 - 30093798
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagattttttga 279  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |      |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30093459 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaagaaaagctaaagcttagttaagattttt-ga 30093556  T
Q  280 agtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtt 377  Q
    |||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| ||||||||||||||| ||  ||| | ||| |||| ||    
T  30093557 agtttggatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcaatattagtga-gaaaaaagttttt 30093654  T
Q  378 t---atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccat 473  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30093655 atcaatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccat 30093754  T
Q  474 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30093755 ttggtagggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 30093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11183903 - 11183583
Alignment:
Q  198 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt 292  Q
    ||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11183903 ttgcaaatggttacctcttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttctt 11183806  T
Q  293 ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgca 391  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| || |||| |||||||||||||    
T  11183805 agtgttccttcttgcaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaaggtgtt-atgaatgaatgca 11183710  T
Q  392 tgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggt 490  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11183709 tgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggagcttaaggataacaatgccatttggtagggactatggt 11183610  T
Q  491 ttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11183609 ttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 11183583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 518
Target Start/End: Original strand, 14885413 - 14885754
Alignment:
Q  180 ttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattt 274  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||    
T  14885413 ttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcctttt-caaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagataaa-cttagttaagattt 14885510  T
Q  275 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 373  Q
    || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |      
T  14885511 tt-gaaattgcatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgtttacaagaaccttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaag 14885609  T
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcca 472  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  14885610 tttttatgaatgaaagaatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtaatgttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgcca 14885709  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  14885710 tttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 14885754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 376 - 499
Target Start/End: Original strand, 14890876 - 14891000
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  14890876 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacatcgccatt 14890975  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14890976 tggtaaggactatggtttcaaattg 14891000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 18881266 - 18881408
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18881266 tttatggatggatgcatgtgtgtatgattatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 18881365  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18881366 tggtaaggactatgg-ttcaaaatgtacctgcatcacgggttct 18881408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 508
Target Start/End: Original strand, 12477128 - 12477456
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac----gaaagctaaagcttagttaagattt 274  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  12477128 tttgaaaattgtgaagatgctgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgagaccaaggaaaaagttcttaagaaagctaaagcttagttaagattt 12477226  T
Q  275 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 373  Q
    |  |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||    
T  12477227 t--gaagttttattttttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagt 12477322  T
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgcca 472  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  12477323 t-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatgaaatgcatggtgaggttaagtccaaaatgttggaggcaaagggtaacaccgcca 12477421  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  12477422 tttggtaaggactatcgcttc-atttgtacctgtat 12477456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 374 - 518
Target Start/End: Original strand, 7095802 - 7095946
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7095802 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaattacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 7095901  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||    
T  7095902 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgcatcacgggttct 7095946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15623041 - 15622593
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagagga 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || ||||    
T  15623041 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-agga 15622944  T
Q  167 acatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagc 261  Q
    |||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||    
T  15622943 acattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaagctaaagc 15622847  T
Q  262 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt- 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||      
T  15622846 ttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccctatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattag 15622749  T
Q  361 tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaa 458  Q
    |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | |   ||| || || ||| |||| ||||||||||| |||| | ||    
T  15622748 tga--gaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacgtggtgatgttaggtccacaatgtcggagcttaa 15622652  T
Q  459 gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15622651 gggtaacaacgccatttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 15622593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Original strand, 23285736 - 23286071
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |     || ||||||||| |||||||||| ||    
T  23285736 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaaaattctttacaaaagctaaaacttagttaaggtt 23285834  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    ||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| ||    
T  23285835 ttt-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaag 23285926  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 471  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23285927 tt-tttacgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtaaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgcc 23286025  T
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  23286026 atttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 23286071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 70729 - 70314
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaac 168  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||            ||||||||| ||||||| | |||||||| |  || ||||||    
T  70729 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttt-gaaggacttgtcaaagtca-ttgtaaacttgata-aggaac 70633  T
Q  169 atggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagctt 263  Q
    || | || |||| ||| ||||| || | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||    
T  70632 attgttttattt-gaaaattgtgaaaatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaagctaaagctt 70536  T
Q  264 agttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tg 362  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||| ||    
T  70535 ggttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatatttgtg 70438  T
Q  363 atggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaaggg 461  Q
    | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||            |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  70437 a-gaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatg------------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaaggg 70352  T
Q  462 caacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70351 taacatcgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 70314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 510
Target Start/End: Original strand, 3242822 - 3243272
Alignment:
Q  55 tgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaat-gatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaa 153  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |            ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  3242822 tgagacacggactagaaactatgaatgaaaaaacgatgcatgatatgtttatgcaaaaatggacaattttttttgaagggcttgttaaagttaattgtaa 3242921  T
Q  154 acattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----a 248  Q
    |||||| | |||||||||| || |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||     |    
T  3242922 acattgcataggaacatggttttattt-gaaaattgtaaagatattgcaatcggttccattttcaaaagc-aagaaagaagccaaggaagaagttcttaa 3243019  T
Q  249 cgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagt 348  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||        |||||||||||    
T  3243020 caaaagcaaaagcttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggttcatacctttgatgtttacaaaaaacttgtctaagt 3243118  T
Q  349 ccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatg--atgaggttaagtccaca 445  Q
    ||||| |  | |||||| |||| |||| ||||| |        || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||| | |    
T  3243119 ccttcga--tattgatgagaaaaagttatttatca--------atctatgcatgattatgctaaagaacatagaaaacatggtgtgaagttaggtctata 3243208  T
Q  446 atgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3243209 atgatggagtcaagggtaaacacgccacatggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatca 3243272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 251 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 8806741 - 8806485
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||    
T  8806741 aaagcaaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttgatgttccttcttacaaagaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtcc 8806644  T
Q  351 ttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgt 449  Q
    ||| || ||  |||  |||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||     
T  8806643 ttcgatattagtgagagaaaaaagtttttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatga 8806544  T
Q  450 tggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8806543 tggagcttaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 8806485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 344 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15912220 - 15912056
Alignment:
Q  344 taagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatg--aggttaagt 440  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15912220 taagtccttcgatattttgatgagaaaaagtt--ttatgaatgaatg-atgtatgcatgattatgctaaaaaacatagaaaacatggtgtgaggttaagt 15912124  T
Q  441 ccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15912123 ccacaatgttggagcttaagggtaataacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 15912056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21610065 - 21609933
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||    
T  21610065 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagcttaaaggtaacaacgccatt 21609966  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21609965 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 21609933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 18960552 - 18960683
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||         ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  18960552 tttatgaatggatgcatgcatgcatgattatgctaaaatacata---------atgaggttaagtccaca-tgttggagttaaaggtaacaacgccattt 18960641  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18960642 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 18960683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 395 - 518
Target Start/End: Original strand, 13109591 - 13109714
Alignment:
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13109591 atgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggtagggactatggtttt 13109690  T
Q  494 aaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13109691 aaa-tgtacctgtatcacgggttct 13109714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 15599553 - 15599688
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |      | ||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  15599553 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttta------agtgttggagtcaagggtaaagacgtcattt 15599646  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15599647 ggtaaggactacggtttcaga-tgtacctgtatcacgggttct 15599688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6196889 - 6196558
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  6196889 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 6196791  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-- 371  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || |||||||| ||| |      
T  6196790 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccgtatctttgatgttt-acgaaaacttatctaagtccttcgatattttgatgaaaaaaaa 6196693  T
Q  372 ------gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaac 465  Q
          ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||                 ||| |||||||| ||||||||||||||||   || | |||    
T  6196692 aaaaaagttttttatggatgaatgcatgtatgcatgatcatgc-----------------atggtgaggttaggtccacaatgttggagcttagagtaac 6196610  T
Q  466 aacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6196609 aatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 6196558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8618708 - 8618616
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  8618708 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 8618616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 15535066 - 15535158
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15535066 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 15535158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 46398513 - 46398605
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  46398513 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 46398605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 10720212 - 10720259
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10720212 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 10720259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17920016 - 17919962
Alignment:
Q  445 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17920016 aatgttggagtcaagggtaacaacaccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 17919962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 518
Target Start/End: Original strand, 6970197 - 6970295
Alignment:
Q  418 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 517  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6970197 tagaaaacatggtgaggttgaatccataaggttggagtcaagggta-caatgttatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 6970294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33568341 - 33568206
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  33568341 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 33568244  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  33568243 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 33568206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21610250 - 21610113
Alignment:
Q  197 gttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga--gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatct 289  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||     || |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |    
T  21610250 gttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggttttt-gagtttgtattt 21610153  T
Q  290 cttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 329  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  21610152 cttggtgttccttcttacaagatccatatctttgatgttt 21610113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27881564 - 27881251
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacat-tgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    |||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| ||  |||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  27881564 gaaggatttgtcaaagcgaatagtaagcatcgtagatgaacatggtttcattt-gaaaatctgtaaggatattgcgatcggttctattttcaaaaggtaa 27881466  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatctctt--ggtgttcattcttacaaggtccatac 318  Q
    ||| |||||||| | |  |||     || ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  27881465 gaatgaaaccaatggagaagttctcaacaaaagcaaaagcttggtcaagatgtttttgaagttatatgtcttttggtgttcattcttacaaggtctattc 27881366  T
Q  319 ccatgatgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtaca 417  Q
    |  ||||||||         |||| |||||||||||||| ||| |||||||| |  | || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   |    
T  27881365 ctttgatgtttacaaaaaaacttggctaagtccttcaatattt-gatggaaaaaaatattcatgattgaatgcatgtgtgcatgattatgctaaag---a 27881270  T
Q  418 tagaatacatgatgaggtt 436  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  27881269 tagaaaatatgatgaggtt 27881251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30014309 - 30014230
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  30014309 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgccatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 30014230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41433968 - 41433823
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggtt--aagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaac 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||    
T  41433968 tttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaatggtgaaaacatggtgaggttttaggtccacaatgatggagtcaaagggtaaacac 41433872  T
Q  469 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    | |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  41433871 gtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 41433823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 12477020 - 12477066
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12477020 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 12477066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 14885303 - 14885349
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14885303 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 14885349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3677738 - 3677659
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  3677738 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 3677659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 4436547 - 4436511
Alignment:
Q  463 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4436547 aacaacgccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 4436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20436739 - 20436660
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20436739 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 20436660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 46373849 - 46373802
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  46373849 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 46373802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 329
Target Start/End: Original strand, 14396298 - 14396353
Alignment:
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 329  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  14396298 ttttgaagttgtatttctcggtgttcctttttacaaggtccatacctctgatgttt 14396353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 492
Target Start/End: Original strand, 24215391 - 24215438
Alignment:
Q  446 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24215391 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttt 24215438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8806932 - 8806886
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  8806932 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgtcatgcttatgcaaaaatag 8806886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 98
Target Start/End: Original strand, 15682664 - 15682694
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15682664 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 15682694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8618929 - 8618870
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 247  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8618929 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 8618870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14420888 - 14420843
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 114  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14420888 gaaattatgaatgaaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 14420843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20438521 - 20438484
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20438521 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 20438484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 23285626 - 23285671
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 114  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285626 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 23285671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27881684 - 27881584
Alignment:
Q  13 actttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  27881684 actttactgacggattggacttttgtagacagaaacagagtatgagatacggactagaaactatgaatgc-acatgatgcatgaaatgcttatgtaaaaa 27881586  T
Q  113 ta 114  Q
    ||    
T  27881585 ta 27881584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41435686 - 41435649
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41435686 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 41435649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 499
Target Start/End: Original strand, 5143701 - 5143737
Alignment:
Q  463 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5143701 aacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 5143737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 5957518 - 5957565
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  5957518 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtattacgggttct 5957565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 11932154 - 11932221
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11932154 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 11932221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 408
Target Start/End: Original strand, 26384530 - 26384562
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26384530 tttatgaatgtatgcatgtatgcatggttatgc 26384562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 46398287 - 46398341
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46398287 ttgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 46398341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 24962713 - 24963236
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaa-ctatgaatgcaaaatgatgcatgatag 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24962713 agacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaagcaaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatat 24962812  T
Q  100 gcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgt 198  Q
    ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  |    
T  24962813 gcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagatat 24962911  T
Q  199 tgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctctt 292  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24962912 tgcaataggttc-tttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttttgaagttgtatctctt 24963010  T
Q  293 ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgca 391  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  24963011 ggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaacttgcctaagtccttcaattttt-gatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgca 24963108  T
Q  392 tgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtc-cacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggt 490  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24963109 tgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagtttcacgatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggt 24963208  T
Q  491 ttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  24963209 ttcaaattgtacctgtattacgggttct 24963236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 57 - 518
Target Start/End: Original strand, 21993842 - 21994291
Alignment:
Q  57 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaaca 156  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |             |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21993842 agacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatg-aaaaagataataatttttttgaaggacttatcaaagcgaaatgtaaaca 21993940  T
Q  157 ttgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagct 256  Q
      |||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21993941 cagtac--gaatatggtttcattttgaatattgtaaagacgtcgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagct 21994038  T
Q  257 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat 356  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||| |||||||||||||     
T  21994039 aaagctcagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatgttt-acaaaaacttgactaagtccttcaa- 21994135  T
Q  357 tttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagt 455  Q
    ||||||||||||| ||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21994136 tttttgatggaaaaagttgt-------tggatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtcccataatgttggagt 21994228  T
Q  456 caagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21994229 caagggtaacaacgccatttggtaaagactatggtttcaaattgtaccggtgtcacgggttct 21994291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20379025 - 20378632
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  20379025 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttc-tttttcgaaaggtaa 20378928  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 320  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20378927 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 20378828  T
Q  321 atgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 419  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378827 atgatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaattttt-gatggaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 20378729  T
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20378728 gaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccattcggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20378632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28846460 - 28846073
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28846460 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggt-cctttttcaaaaggtaa 28846363  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||    
T  28846362 gaacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagctaaagctcagttaagat-ttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatg 28846264  T
Q  327 tttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaataca 426  Q
    ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  28846263 tttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatgtttatactaaagttcattgaataca 28846165  T
Q  427 tgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28846164 tgaggaggttaagttctacaatgttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 28846073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 257 - 518
Target Start/End: Original strand, 21866131 - 21866389
Alignment:
Q  257 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||        |||||||||||||||||||    
T  21866131 aaagcttagttaagatttttttaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagatccatatccctgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaat 21866229  T
Q  357 tttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagt 455  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||     
T  21866230 ttt--gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagaacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttgaagc 21866327  T
Q  456 caagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21866328 caagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 21866389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 12178647 - 12179047
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  12178647 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 12178745  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12178746 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 12178844  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 413  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12178845 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 12178942  T
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 512  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12178943 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 12179041  T
Q  513 ggttct 518  Q
    ||||||    
T  12179042 ggttct 12179047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 33842911 - 33843311
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  33842911 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 33843009  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  33843010 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 33843108  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 413  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33843109 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaagttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 33843206  T
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 512  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33843207 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 33843305  T
Q  513 ggttct 518  Q
    ||||||    
T  33843306 ggttct 33843311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 26087416 - 26087816
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  26087416 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 26087514  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26087515 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 26087613  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 413  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26087614 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 26087711  T
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 512  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26087712 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 26087810  T
Q  513 ggttct 518  Q
    ||||||    
T  26087811 ggttct 26087816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 11811500 - 11811901
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  11811500 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 11811598  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11811599 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 11811697  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaa 412  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11811698 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aa 11811795  T
Q  413 gtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11811796 gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 11811894  T
Q  512 aggttct 518  Q
     ||||||    
T  11811895 gggttct 11811901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 518
Target Start/End: Original strand, 22956632 - 22957078
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaac 168  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||            ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || ||||||    
T  22956632 gaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaatagacacattttcttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaac 22956729  T
Q  169 atggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagctt 263  Q
    || | || |||| ||| ||||| || | |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||    
T  22956730 attgttttattt-gaaaattgtgaaaatgttgcaattggttccctttccaag-ggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 22956827  T
Q  264 agttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tg 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || ||  ||    
T  22956828 agttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttagaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtgcttcgatattagtg 22956925  T
Q  363 atggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggc 462  Q
    | | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22956926 a-gaaaaaagtt-tttctgaacgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaagttggagtcaagggt 22957023  T
Q  463 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22957024 aaagacgccatttggtaaggactattgtttcaaa-tgtacctgtatcacaggttct 22957078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 272 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23638439 - 23638203
Alignment:
Q  272 ttttttgaagttgtatctctt-ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 370  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  23638439 ttttttgaagttggatctctttggtgttcattcttgtaaggtccatatccacgatgtttgcaaaaa-cttgtctaagtccttccattttt-gatagaaaa 23638342  T
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 470  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||     
T  23638341 cgttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagtctaaagtatatagaatacatgatgaggttaagtccac-atgttggagtcaaaggtaacaacgt 23638243  T
Q  471 catttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  23638242 catttggtaaggactacggtctcaaa-tgtagctgtatcac 23638203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 272 - 511
Target Start/End: Original strand, 23834451 - 23834687
Alignment:
Q  272 ttttttgaagttgtatctctt-ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 370  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  23834451 ttttttgaagttggatctctttggtgttcattcttgtaaggtccatatccacgatgtttgcaaaaa-cttgtctaagtccttccattttt-gatagaaaa 23834548  T
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 470  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||     
T  23834549 cgttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagtctaaagtatatagaatacatgatgaggttaagtccac-atgttggagtcaaaggtaacaacgt 23834647  T
Q  471 catttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  23834648 catttggtaaggactacggtctcaaa-tgtagctgtatcac 23834687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 518
Target Start/End: Original strand, 27231843 - 27232101
Alignment:
Q  261 cttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat---t 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||        ||||||||||||||||||    |    
T  27231843 cttagttaagattttg-gaagttgtatttcttgatgttcattcttacaagatccatatctgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaat 27231940  T
Q  358 ttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtc 456  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  27231941 ttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtcatgctaa-gtggatagaatacatggtgagggtgagttccacaatgttggagtc 27232039  T
Q  457 aagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  27232040 tatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttaaaaacgtacctgtatcacgggttct 27232101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 29895576 - 29895244
Alignment:
Q  181 tgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttt 275  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||| ||||    
T  29895576 tgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttt 29895478  T
Q  276 ttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagtt 374  Q
    | |||||||||      ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| ||||    
T  29895477 t-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaagtt 29895388  T
Q  375 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag--tcaagggcaacaacgcca 472  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  29895387 -tttatgaatgaatgcatgtttgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagctttaagggtaacaacgcca 29895289  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29895288 tttagtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 29895244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25528780 - 25528337
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaac 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||            ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || || |||    
T  25528780 gaaattatgaatgcaatatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagccacatttttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgataaag-aac 25528683  T
Q  169 atggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagctt 263  Q
    || | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |      |||||||||||||    
T  25528682 attgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaa-agttcttagcaaaagctaaagctt 25528586  T
Q  264 agttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttga 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |     
T  25528585 agttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatatta-gc 25528489  T
Q  364 tggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggca 463  Q
      |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||   |||| |    
T  25528488 gagaaa-agtt-tttgtgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaggtccacaaagttggagcttagggta 25528391  T
Q  464 acaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  25528390 acaacgccatttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 25528337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 472
Target Start/End: Original strand, 20097251 - 20097550
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  20097251 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 20097349  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| ||||||||||||||| ||  ||| | ||| ||    
T  20097350 ttt-gaagttgtatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcaatattagtga-gaaaaaag 20097446  T
Q  373 ttgttt---atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaac 468  Q
    || ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20097447 tttttatcaatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaac 20097546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 36450535 - 36450393
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  36450535 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatt 36450436  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36450435 tggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 36450393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 26871568 - 26871190
Alignment:
Q  131 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 230  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | | || |||  || |||||   |||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  26871568 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttagtt-gaaatttataaaggtattgcaaacggctccctcttcaaa-ggtaagaac 26871471  T
Q  231 gaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 325  Q
    ||||||||||||| ||| |      |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  26871470 gaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagttgaagcttagttaagattttt-gaagttttatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 26871372  T
Q  326 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 424  Q
    ||||        ||| |||||||||||  || ||  |||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||         | ||||     
T  26871371 gttt-acaaaaacttatctaagtcctttgatattggtga--gaaaaaggt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgcg--------tggaatg 26871284  T
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26871283 catggtgatgttaagtccacaatgttggagctgaaggataacgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 26871190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28846563 - 28846480
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  28846563 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaa 28846480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23638728 - 23638462
Alignment:
Q  13 actttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||    
T  23638728 actttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacagaatatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgat----ttatgcaaaa 23638633  T
Q  112 -atagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa-ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggtt 209  Q
      ||             ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| || |    
T  23638632 tgtacaattttttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacattgtagataaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-t 23638535  T
Q  210 cctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt 277  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||     || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23638534 cctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagcttagttaagatttttt 23638462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 518
Target Start/End: Original strand, 7259793 - 7260060
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 350  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||    
T  7259793 aaagttaaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtcc 7259890  T
Q  351 ttcaattttt-tgatggaaata--gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta---aagtacatagaatacatgatgaggttaagtccac 444  Q
    ||| || ||  |||  |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||   ||  ||   ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7259891 ttcgatattaatgagagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcgtgtatgcatgattacgctacgcaa--acggtgaaaacatggtgatgttaagtccac 7259987  T
Q  445 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  7259988 aatgttggagtcaagggtaaaaatgccagttggtagggactatggtttcaga-tgtacctgtatcacgggttct 7260060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 12178512 - 12178616
Alignment:
Q  13 actttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaa-tatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaa 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12178512 actttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaaaaatatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaa 12178611  T
Q  111 aatag 115  Q
    |||||    
T  12178612 aatag 12178616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 23834159 - 23834427
Alignment:
Q  13 actttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||    
T  23834159 actttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacagaatatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgat----ttatgcaaaa 23834254  T
Q  112 ---atagnnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa-ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacgg 207  Q
       | |             ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| ||    
T  23834255 tgtacaattttttttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacattgtagataaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg 23834353  T
Q  208 ttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt 277  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||     || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23834354 -tcctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagcttagttaagatttttt 23834427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1800380 - 1800288
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  1800380 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 1800288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 12393443 - 12393535
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12393443 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 12393535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21690825 - 21690733
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  21690825 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 21690733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 518
Target Start/End: Original strand, 29890230 - 29890334
Alignment:
Q  414 tacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 512  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  29890230 tacagagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagttaaggataacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaatgtacctgcatcacg 29890328  T
Q  513 ggttct 518  Q
    ||||||    
T  29890329 ggttct 29890334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 499
Target Start/End: Original strand, 358860 - 358983
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  358860 tttatggatggatgcatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaagttcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 358958  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  358959 tggtaaggactaaggttttaaattg 358983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 518
Target Start/End: Original strand, 20395672 - 20395746
Alignment:
Q  443 acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20395672 acaatgttggagtcaaaggtaacaatgccatttggtaaggactacggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20395746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 11811413 - 11811460
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11811413 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 11811460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 26087336 - 26087383
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26087336 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 26087383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 27231641 - 27231688
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27231641 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27231688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 33842837 - 33842884
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33842837 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 33842884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 7259625 - 7259671
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7259625 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 7259671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 114
Target Start/End: Original strand, 21865921 - 21865978
Alignment:
Q  57 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 114  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21865921 agacacgaactagaaactatgaacgcaaaatgatgcatgatatgcttacgcaaaaata 21865978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36450730 - 36450583
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  36450730 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccatttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 36450633  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 329  Q
    |||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  36450632 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatcattgatgttt 36450583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 467 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 37578825 - 37578782
Alignment:
Q  467 acgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37578825 acgccatttggtaaggactatggtttcattttgtacctgtatca 37578782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29895686 - 29895640
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29895686 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 29895640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 15791307 - 15791354
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15791307 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 15791354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 36382575 - 36382622
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  36382575 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 36382622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 37007247 - 37007294
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  37007247 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 37007294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7789295 - 7789240
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7789295 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 7789240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 12393225 - 12393280
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12393225 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 12393280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21691024 - 21690984
Alignment:
Q  206 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21691024 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 21690984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 34464069 - 34464032
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34464069 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 34464032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 3490920 - 3490987
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3490920 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 3490987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 5446797 - 5446844
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  5446797 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 5446844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7789030 - 7788983
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  7789030 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 7788983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Original strand, 11951010 - 11951057
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  11951010 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 11951057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21691167 - 21691131
Alignment:
Q  76 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21691167 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 21691131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 31513872 - 31513825
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  31513872 ccatttggtaaggactatggtttc-gtttgtacctgtatcacgggttct 31513825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34462284 - 34462205
Alignment:
Q  439 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  34462284 gtccacattgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 34462205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 518
Target Start/End: Original strand, 74055 - 74566
Alignment:
Q  13 actttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  74055 actttactgacggattgaccttttgtaggtagaaacaaaatacgagacacggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 74154  T
Q  112 atagnnnnnnnnnnnn------gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaac 205  Q
    || |                  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||      
T  74155 atggacaaatttttttttttatgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacatggcaaaggaacatggtttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaata 74253  T
Q  206 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  74254 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccgaaaaaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatctcttggtgttca 74352  T
Q  301 ttcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgcatgtatgca 399  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||||       |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  74353 ttcttaaaaggtctat--ccatgatgtttgcaaaaa-cttgtccaagtccttcaattttt-gatggaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgca 74448  T
Q  400 tggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  74449 tggttatgctaaagaatatagattacatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaaatataacaatgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tg 74547  T
Q  500 tacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||    
T  74548 tacctgtatcacaggttct 74566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 21529217 - 21529586
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529217 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 21529316  T
Q  228 aacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgt 327  Q
    ||| |||||||                      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21529317 aacaaaaccaat---------------------cttagttaagattttt-gaagttgtatatcttggtgttcattcttacaaggtccatatccataatgt 21529394  T
Q  328 ttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttat--gaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatac 425  Q
    |||       ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  | | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21529395 ttgcaaaaaacttatctaagtccttcaattttt-gatggaaaaatatatatatacgaatgaatgcatgtatgcatggttatactaaagtacattgaatac 21529493  T
Q  426 atgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21529494 atgaggaggttaagttccacaatgttggagccgagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 21529586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Original strand, 8100633 - 8101020
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8100633 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggt-cctttttcaaaaggtaa 8100730  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||    
T  8100731 gaacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagctaaagctcagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatg 8100829  T
Q  327 tttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaataca 426  Q
    ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  8100830 tttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatgtttatactaaagttcattgaataca 8100928  T
Q  427 tgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8100929 tgaggaggttaagttctacaatgttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 8101020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 217 - 492
Target Start/End: Original strand, 26218314 - 26218595
Alignment:
Q  217 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagg 311  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218314 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagg 26218413  T
Q  312 tccatacccatgatgtttgnnnnnnn---cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 408  Q
    |||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26218414 tccatacccatgatgtttgcaaaaaaaaacttgtgtaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagtagtttatggatgaatgcatgtatgcatggttatgc 26218512  T
Q  409 taaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26218513 taaagtacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgaaggtaacaacgtcatttggtaaggactatggttt 26218595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 382 - 518
Target Start/End: Original strand, 3386336 - 3386471
Alignment:
Q  382 aatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaag 481  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386336 aatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagttcacaatgttggagccaagggcaacaacgccatttggtaag 3386435  T
Q  482 gactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3386436 gactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 3386471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 374 - 518
Target Start/End: Original strand, 14736116 - 14736260
Alignment:
Q  374 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14736116 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 14736215  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  14736216 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 14736260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 1888796 - 1888938
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1888796 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatataatacatgatgagggtaagtttcacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 1888895  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1888896 tggtaaggattatggttt-aaaatgtacctgcatcacgggttct 1888938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20556393 - 20556056
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||| ||    
T  20556393 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtt 20556295  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaatttttt---gatggaaat 370  Q
    ||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||     ||   |||     
T  20556294 ttt-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaaa 20556203  T
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20556202 agtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcgaatgcatggtgaggtcaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacg 20556104  T
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20556103 ccatttggtagggactacggtttcaaa-tgtacttgtatcacgggttct 20556056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 21529079 - 21529189
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatagg 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21529079 agacattgaactacattactgatggattgaccttttgttggtggaaacaaaatatgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatg 21529178  T
Q  101 cttatgcaaaa 111  Q
    |||||||||||    
T  21529179 cttatgcaaaa 21529189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 518
Target Start/End: Original strand, 16725868 - 16726133
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattctt-acaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  || |  ||||||||        ||| || |||||    
T  16725868 aaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttctttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaagaacttatccaagtc 16725965  T
Q  350 cttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatg 448  Q
    |||| || ||  |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  16725966 cttcgatattagtgagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaaggatatggaatatatggtgaggttaagtccaccata 16726064  T
Q  449 ttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  16726065 ttggagccaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 16726133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14884022 - 14883695
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||      || |||||||||||||||||||||||    
T  14884022 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaacca-ggaaaaagctattaacaaaagctaaagcttagttaagatt 14883925  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| ||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| ||    
T  14883924 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgaggttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaag 14883828  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 471  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||     |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  14883827 tt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcat-----ggttaagtccacaaagttggagcttaagggtaacgacgcc 14883734  T
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 511  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14883733 atttagtaagaactatggtttc-agttgtacctgtatcac 14883695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Original strand, 15900530 - 15900867
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |      |||||||||||||||||||||||    
T  15900530 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggctcccttttcaaaag-taagaacgaaaccgaggaaaaagttcttaataaaagctaaagcttagttaagatt 15900628  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| ||    
T  15900629 ttt-gaagttgtatttcttagtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaag 15900726  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 471  Q
    || ||||||||| ||||||||    |||| |||| |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||    
T  15900727 tt-tttatgaataaatgcatg----catgattatactaaagaacatggaatgcatggagaggttaagtccacaatgttggagcttaaaggtaaaaacgcc 15900821  T
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15900822 atttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 15900867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 3841888 - 3842030
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  3841888 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagtcaagggtaacaatgccaatt 3841987  T
Q  476 ggtaaggac-tatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  3841988 ggtagggacttatggtttc-agttgtacctgtatcacgggttct 3842030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 8100529 - 8100612
Alignment:
Q  1 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  8100529 agacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaa 8100612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 9187085 - 9187022
Alignment:
Q  430 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9187085 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 9187022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18038526 - 18038434
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18038526 catggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 18038434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22706238 - 22706146
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  22706238 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 22706146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 309
Target Start/End: Original strand, 15077321 - 15077447
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15077321 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttt-tgaa 15077418  T
Q  281 gttgtatctcttggtgttcattcttacaa 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15077419 gttgtatttcttggtgttccttcttacaa 15077447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18038721 - 18038616
Alignment:
Q  214 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18038721 tttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 18038624  T
Q  310 ggtccata 317  Q
    || |||||    
T  18038623 ggaccata 18038616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Original strand, 15079619 - 15079961
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |        || ||||||||||||||||||||||    
T  15079619 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 15079717  T
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata 371  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |  |||||| |        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| |    
T  15079718 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaaaaccatatctttgatgtct-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaa 15079815  T
Q  372 gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag--aatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 469  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | || |  || ||||| ||| |||| ||| | |||| |||||||||||  ||  | |    
T  15079816 gtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgccacacaa-atggtgaaaacatggtgatgttaggtctataatgatggagtcaaggaaaaacatg 15079913  T
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15079914 ccatttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 15079961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3359761 - 3359573
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttc-aaaaggtaa 226  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||  |||||| |||||||||    
T  3359761 gaaggatttgtcaaagtga-ttggaaacattatagaagaacattgtttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggtttttttttccaaaaggtaa 3359664  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 313  Q
    || |||| |||||| || |||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  3359663 gagcgaacccaagggaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat-ttttgaagttgtatttcttggcgttctttcttgcaaggtc 3359573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17304144 - 17304043
Alignment:
Q  395 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaa-gtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 493  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | |  ||  ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  17304144 atgcatggttatgctaaaggacatagaatacatagtgaggttaaggtccaaaatgttggagtcgaagataaatacgtcatttgataatgactatggtttc 17304045  T
Q  494 aa 495  Q
    ||    
T  17304044 aa 17304043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Original strand, 3841764 - 3841828
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  3841764 aaagctaaagcttagttaagatttt--gaagttgtatttcttgatgttccttcttacaaggaccata 3841828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14919944 - 14919898
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14919944 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 14919898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Original strand, 16725687 - 16725730
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16725687 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 16725730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 3386030 - 3386076
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3386030 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 3386076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10787637 - 10787570
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 492  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10787637 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttt 10787570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9187430 - 9187384
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9187430 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 9187384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 518
Target Start/End: Original strand, 23994001 - 23994047
Alignment:
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  23994001 atttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 23994047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 98
Target Start/End: Original strand, 26218194 - 26218224
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218194 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 26218224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20556502 - 20556457
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 114  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20556502 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 20556457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22706437 - 22706397
Alignment:
Q  206 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22706437 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 22706397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Original strand, 3841582 - 3841618
Alignment:
Q  76 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3841582 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 3841618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9187321 - 9187258
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9187321 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 9187258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22706567 - 22706531
Alignment:
Q  76 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22706567 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 22706531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold2162
Description:

Target: scaffold2162; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 5
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 226  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  407 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 309  T
Q  227 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 319  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  308 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 210  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa--------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 411  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||        |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttttgatgaaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 111  T
Q  412 agtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
     ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  110 -gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 13  T
Q  511 caggttct 518  Q
    | ||||||    
T  12 cgggttct 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 452
Alignment:
Q  68 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  499 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 510
Target Start/End: Original strand, 4881 - 5268
Alignment:
Q  128 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 227  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  ||||||| |  |||| |  |||||||||||  ||| |||||    
T  4881 gaaggatttgtcaaagt-aattggaaacattatagaggaatatggtttcattt-gaaagttgtaaatatattgcgataggttccttttttcaaaagtaag 4978  T
Q  228 aacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatac--c 319  Q
    |||||||||||||||| |||     || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |  |||||| |||| | |  |    
T  4979 aacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaacctaaagcttagttaagattttt-gaagtttgaatttcttggtgttcttctttacaaagtccgttcatc 5077  T
Q  320 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 419  Q
      |||||||||        |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5078 tgtgatgtttgcaaaaaatttgtctaaatccttcgatattt-gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctatagtacata 5176  T
Q  420 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5177 gaatacatggtgaggttaagttcacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcattttgtacctgtatca 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 495
Target Start/End: Original strand, 192297 - 192620
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  192297 tttgaaaattgtgaagatgttgcaatttgttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 192395  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatg--atgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 370  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |  |||  |||||||        ||||||||| |||||| || ||| |||| |||     
T  192396 ttt-gaagttgcatttcttggtgttctttcttacaaggtccgttcatatgtgatgtttggaaaaaaacttgtctaaatccttcgatcttt-gatgcaaaa 192493  T
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  |||    
T  192494 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacttagaatacatggtgaggttaaatccacaatgttggagtttaagggtaaagacg 192593  T
Q  470 ccattt-ggtaaggactatggtttcaa 495  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  192594 ccatttgggtaaggactatggtttcaa 192620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 518
Target Start/End: Original strand, 19394 - 19728
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19394 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaa-ggtaagaacaaaaccaaggaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgga- 19491  T
Q  281 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 379  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||||    
T  19492 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtt-ttta 19588  T
Q  380 tgaatgaatgcatgtatgcatggtt-atgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  19589 tgaatgaatgcatgtatgcatgatttatgctaaagaacatggaatgtatggtgaagttaagtccacaaagttggagtcaagggtaaagacgccatttggt 19688  T
Q  479 aaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19689 aaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 19728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 18481 - 18527
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18481 gaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaatag 18527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17520 - 17178
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||| ||||    
T  17520 tttgaaaaatgtgaagatgttgcaattggttccctttccaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttatgatt 17422  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 372  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||||||        ||| |||||| ||||| || ||  |||   ||| |     
T  17421 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaagatcatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagcccttcgatattaatgagaaaaaaaa 17324  T
Q  373 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 471  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  17323 gtttttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgcc 17224  T
Q  472 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17223 atttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacaggttct 17178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30886 - 30575
Alignment:
Q  210 cctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcatt 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||    
T  30886 cctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagtttggatttcttggtgttcctt 30789  T
Q  303 cttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 401  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30788 cttacaaggaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtt-ttcatgaatgaatgcatgtatgcatg 30692  T
Q  402 gttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgt 500  Q
     ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30691 attatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgatttcaaa-tgt 30593  T
Q  501 acctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  30592 acctgtatcacgggttct 30575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 518
Target Start/End: Original strand, 5047 - 5385
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    |||| |||| |||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || |||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  5047 ttgtgaagatgttgcaattgattcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagattttta-aa 5144  T
Q  281 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt---tgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| ||    | |    
T  5145 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatcattgatgttt-acaggaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaagaaagttt 5243  T
Q  377 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttg 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  5244 ttatgaatgaatgcatgtatgcataattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggataacgacgccatttg 5343  T
Q  477 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  5344 gtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 4929 - 4975
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4929 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11089
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11043 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 11089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1818 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1818
Description:

Target: scaffold1818; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 92 - 234
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  92 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgaatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 191  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  192 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31463 - 31033
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || |||||    
T  31463 gaaattatgaatgtaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaa 31366  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagc 261  Q
    ||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||      || |||| | ||||    
T  31365 cattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-tgagaacgaaaccaaggaaaaagttctttaacaaaagttgaagc 31268  T
Q  262 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt- 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||      
T  31267 ttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattag 31170  T
Q  361 tgatggaaata---gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tc 456  Q
    |||   ||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  31169 tgagaaaaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccgcaatgttggagctt 31071  T
Q  457 aagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 494  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070 aaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 31033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10309
Alignment:
Q  182 gaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt 276  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||||||||||||||||||||    
T  10630 gaacattgttaagatgttgtaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaaggtaaagcttagttaagattttt 10532  T
Q  277 tgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttg 375  Q
     |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||        ||  |||||||||||| || ||  |||  ||| |  ||     
T  10531 -gaagttgtatttcttggtgttcctttttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaactcatctaagtccttcgatattagtga--gaattttttt 10436  T
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  10435 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctaatg------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 10342  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10341 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 10309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8601 - 8459
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8601 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagttcacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 8502  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8501 tggtagggactatggtttcaaa-tctacctgtatcacgggttct 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8665
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  8804 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 8706  T
Q  273 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggt 312  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||||||||    
T  8705 tttttgaagtttggatttctgggtgttcttccttacaaggt 8665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8869
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8915 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 508
Target Start/End: Original strand, 31714 - 31970
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttag-ttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtc 349  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||        ||  |||||||    
T  31714 aaagctaaagctttggttaagattttt-gaaattgtatttcttggtgttccttctcacaaggtccatatctttgatgtttgcaagaactttacctaagtc 31812  T
Q  350 cttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatg 448  Q
    |||| |||||  ||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31813 cttcgattttagtga-gaaaaaagtt-tttacgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatgctgaggttaagtccacaatg 31910  T
Q  449 ttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  31911 ttggagcttaagggtaacaacgacatttggtaaggactatgatttc-atttgtacctgtat 31970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 2430 - 2574
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata--catgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 472  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2430 tttatggatgaatgcatgcatgcatgataatgctaaagtacatagaatatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacgacgcca 2529  T
Q  473 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2530 tttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtattacgggttct 2574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 4146 - 4278
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  4146 tttatgaatgaatgtatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 4245  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4246 tggtagggactatggtttc-atttgtacctgtat 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Original strand, 3947 - 4090
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      |  ||||||| || ||||||||||     
T  3947 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaaaaaaaagctacagtttagttaaga- 4044  T
Q  273 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4045 tttttgaagtttggatttcttggtgttccttcttacagggtccata 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 499
Target Start/End: Original strand, 20756 - 20880
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  20756 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagcgtaacaacgccatt 20855  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    | ||| |||||||||||||||||||    
T  20856 ttgtagggactatggtttcaaattg 20880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18122 - 17784
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 273  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  18122 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 18025  T
Q  274 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat-tttttg---atggaaa 369  Q
    |||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||   |   |||    
T  18024 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaaa 17932  T
Q  370 tagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaac 468  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||    
T  17931 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcaaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaac 17833  T
Q  469 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17832 gccatttggtagggacaatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 375 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38815 - 38679
Alignment:
Q  375 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  38815 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattttgc--------atagaatacatggtgaggttaagttccacagtgttggagtcaaaggtaacaacgccat 38724  T
Q  474 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38723 ttggtaaggactatggtttcaaattttacctgtatcacgggttct 38679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0478
Description:

Target: scaffold0478; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 379 - 508
Target Start/End: Original strand, 314 - 443
Alignment:
Q  379 atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttgg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  314 atgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcgaatggatggtgaggtcaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatttgg 413  T
Q  478 taaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  414 taaggactatggtttc-atttgtacctgtat 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Original strand, 2 - 43
Alignment:
Q  74 tatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 43  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 115 - 246
Alignment:
Q  187 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  115 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcataacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaa 212  T
Q  281 g-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 313  Q
    | ||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  213 gtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtc 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 99089 - 98758
Alignment:
Q  186 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 280  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||     || |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  99089 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaac-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagattagttaagattttt-gaa 98992  T
Q  281 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 379  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| || | || |    
T  98991 attgtatttcttggtattccttcttacaaggtccatatgtttgatgttt-accagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaaggt-ttaa 98896  T
Q  380 tgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggta 479  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||| || ||||||||||    
T  98895 taaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaacgcatggtgaggttaagcccacaaagttggagccaaagataacgacaccatttggta 98796  T
Q  480 aggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  98795 aggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 98758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9183
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgca-tggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccat 473  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9326 tttatgaatgaatgcatgtatgaaatgattatgccaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggcaacaacgccat 9227  T
Q  474 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  9226 ttggtagggactatggtttc-atttgtacttgtatcacgggttct 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9622 - 9585
Alignment:
Q  75 atgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9622 atgaatgcaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaa 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 301297 - 301177
Alignment:
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  301297 agttgtttatgaatgaatgcatgtatga----tattgctaaagaacatagaacacatggtgaggttaaatccacaatattggagtcaagggtaacaacgc 301202  T
Q  471 catttggtaaggactatggtttcaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  301201 catttggtaaggactatggtttcaa 301177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 338 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11545 - 11374
Alignment:
Q  338 cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggtt 436  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||  ||| ||||| |||||||    
T  11545 cttgtctaaatccttcgatgttt-gatggcaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacagtgaaaacatggtgaggtt 11447  T
Q  437 aagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    |||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11446 aagctcataatgttggagtcaagggtaaaaacgcaatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatca 11374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8270 - 8134
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||     | ||||  |||||| ||||||    
T  8270 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgt-----ttaaggataacaacaccattt 8176  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8175 ggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 376 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16811 - 16685
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  16811 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaag-------tgttggagtcaagggtaaagtcgccattt 16719  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 510  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16718 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 16685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17105 - 17062
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17105 gaaattatgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 17062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 1872 - 1998
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||    
T  1872 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaatg------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaagagcgccatt 1965  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1966 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 1580 - 1625
Alignment:
Q  69 gaaactatgaa-tgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1580 gaaactatgaaatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatag 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Original strand, 25380 - 25522
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |      || ||||||||||||||||||||||    
T  25380 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 25478  T
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25479 ttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccata 25522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 425 - 508
Target Start/End: Original strand, 14601 - 14684
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14601 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc-aattgtacctgtat 14684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 14277 - 14317
Alignment:
Q  75 atgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14277 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 14317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3968 - 3834
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 272  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||    
T  3968 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 3870  T
Q  273 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 309  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3869 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 3834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3768 - 3626
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag--aatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccat 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | || |  || ||||| ||| |||| ||| | |||| |||||||||||  ||  | |||||    
T  3768 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgccacacaa-atggtgaaaacatggtgatgttaggtctataatgatggagtcaaggaaaaacatgccat 3670  T
Q  474 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  3669 ttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 3626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 291 - 433
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  | |   ||| | ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  291 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctgcacaaacggtgaaaaaatggtgatgttaggtccacaatgtcggagtcaagggtaacaacgccatt 390  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  391 tggtaaggactatggtttcata-tgtacctgtattacgggttct 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Original strand, 96 - 159
Alignment:
Q  179 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  96 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 425 - 518
Target Start/End: Original strand, 23085 - 23177
Alignment:
Q  425 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  23085 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 23177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 243
Target Start/End: Original strand, 22886 - 22922
Alignment:
Q  206 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22886 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 22922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Original strand, 22743 - 22779
Alignment:
Q  76 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22743 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 22779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Original strand, 37076 - 37319
Alignment:
Q  69 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnnn-gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||| ||||||| ||||||| || |  || |||||    
T  37076 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacattttttatttgaaggacttgtcaaagt-aattgtagacttgataaaggaa 37174  T
Q  168 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagc 261  Q
    ||| | || |||| |||  |||| |||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || |||||||||||    
T  37175 cattgttttattt-gaaatttgtgaagatgttgcaattagttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagc 37272  T
Q  262 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37273 ttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 37319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 508
Target Start/End: Original strand, 37438 - 37516
Alignment:
Q  430 tgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  37438 tgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaaaaacgccatttggtaaggactacgatttc-atttgtacctgtat 37516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 376 - 508
Target Start/End: Original strand, 208 - 340
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 474  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |   ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  208 tttatgaatgaaagcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacatgctgatgttaggtccacaatgtcgaagtcaagggtaacaacgccatt 307  T
Q  475 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 508  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  308 tggtaagaactatggtttc-atttgtacctgtat 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0866 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0866
Description:

Target: scaffold0866; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 518
Target Start/End: Original strand, 4586 - 4684
Alignment:
Q  418 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 517  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4586 tagaaaacatggtgaggttgagtccataaagttggagtcaaggg-tacaatgctatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 4683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 430 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 299507 - 299420
Alignment:
Q  430 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  299507 tgaggttaacttcacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 299420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Original strand, 33885 - 34029
Alignment:
Q  178 ttttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaaga 271  Q
    ||||||| || || || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||      || ||||||| |||||||||||||    
T  33885 ttttgaaaatcgtgaaaacgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaaggaaaccaaggaaaaagttctttaacaaaagctatagcttagttaaga 33983  T
Q  272 ttttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33984 ttttt-gaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggtccata 34029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Original strand, 185841 - 185989
Alignment:
Q  371 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggttaa--gtccacaatgttggagtcaagggcaa 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| ||||||| |  | ||| || | |||||||||||| |     
T  185841 agttatttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaacggtgaaaacatggtgaggtttaaggcccataacgatggagtcaagggtat 185937  T
Q  465 caacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  185938 -aacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 185989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Original strand, 184177 - 184214
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  184177 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 184214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 84374 - 84320
Alignment:
Q  446 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  84374 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 84320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 518
Target Start/End: Original strand, 29511 - 29653
Alignment:
Q  376 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 475  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||  | ||| || ||  | |||||||    
T  29511 tttatgaatgtatgcatgtatgaatgaatatgctaaagaacggagaaaacatggtgtggtgaggtccataatgttgtggccaatggtaaacatgccattt 29610  T
Q  476 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||    
T  29611 ggtaaggactatgattttcaaatgtacatgtatcacgggttct 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 152104 - 152039
Alignment:
Q  251 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 317  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  152104 aaagctaaagtttagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgctcctttttacaaggtccata 152039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0782 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0782
Description:

Target: scaffold0782; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5938 - 5901
Alignment:
Q  78 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5938 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 5901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22748 - 22701
Alignment:
Q  470 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 518  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  22748 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 22701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University