View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6962_low_4 (Length: 663)

Name: NF6962_low_4
Description: NF6962
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6962_low_4
NF6962_low_4
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-606)||(8522397-8523002)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (5-600)||(11117435-11118036)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (5-600)||(25523231-25523829)
chr6 (313-599)||(24140436-24140722)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (5-606)||(34240757-34241358)
chr5 (5-606)||(42117027-42117631)
chr5 (5-604)||(34232986-34233585)
chr5 (5-607)||(42122778-42123380)
chr5 (5-606)||(42128173-42128773)
chr5 (7-516)||(41617939-41618448)
chr5 (7-516)||(41572300-41572809)
chr5 (203-587)||(41713768-41714152)
chr5 (5-145)||(41714175-41714315)
chr5 (367-543)||(41444005-41444181)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (8-618)||(11994579-11995193)
chr2 (8-618)||(12247737-12248350)
chr2 (408-600)||(32682113-32682311)
chr2 (5-110)||(32682381-32682486)
chr2 (26-250)||(9423281-9423506)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 518; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Original strand, 8522397 - 8523002
Alignment:
Q  1 tctcctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522397 tctcctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacat 8522496  T
Q  101 ccgtatccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8522497 ccgtatccaattgccactggtttccatccaaattcaaacttctcttcactgcaaaagttgttggctgaaggtgcagaatgttgttcaggtccacacattt 8522596  T
Q  201 ttgacaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522597 ttgacaagggtaatccacataaatccaagtttccttcataagaatcatttgtaaatgtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgatt 8522696  T
Q  301 attggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522697 attggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaatcacatcggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtat 8522796  T
Q  401 gtcaagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatct 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  8522797 gtcaagtttcctatggatttgggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataatctttggaatct 8522896  T
Q  501 ctccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatc 600  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8522897 cgccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagttgtttggaattttcactagtttcattttgttcccttttgtcgccacaatcacagaatc 8522996  T
Q  601 atagta 606  Q
    ||||||    
T  8522997 atagta 8523002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 600
Target Start/End: Original strand, 11117435 - 11118036
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  11117435 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcttattccaatcacaaatccacatgcat 11117534  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaa--aa----tgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |  ||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  11117535 atccaattgccactgctttccatccaaatccaaatttctcttcattccaagaggaagagttgttggctgaaggtggagaatgttgttcaggtccacattt 11117634  T
Q  199 ttttgacaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacga 298  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |     
T  11117635 ctttgacaagggtaatccacataaccctgaatttccttcataggaatcatttgtaaatgtattgaattgctttccttgaggtatttctcccactagatgg 11117734  T
Q  299 ttattggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagt 398  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||  |   | ||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11117735 ttatttgaaatatctaagacttcaagaaagcccaaattggttaattctgcaggaatcacactggttaacatatttgatgaaagatccaaagattccaagt 11117834  T
Q  399 atgtcaagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaat 498  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | || |||    
T  11117835 atgccaagtttcctatggagttgggaatatgaccagtaagtctgttacgggaaagattaagccctttgagtgcatgaagctctccaatagcatttgtaat 11117934  T
Q  499 ctctccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaa 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||    
T  11117935 ctctccttcaaatttgtttcttgacaaatcaatacttactaactttattggaattttcaccagtgtcattttgttcccttttatttccacagtcacagaa 11118034  T
Q  599 tc 600  Q
    ||    
T  11118035 tc 11118036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 5 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25523829 - 25523231
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25523829 ctcttaggctgaccgccaaatatcatcacaagccatctaggctttccaactaaaaacatacaatatccaatgcctattccaatcagaaatccacatccat 25523730  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaat---gttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttt 201  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |   ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||    
T  25523729 atccaattaccaccggtatccatccaaatccaaatttctcttcactccaaaagtttttgttgggtgaaggtggagaatgttgttcaagtccacatctctt 25523630  T
Q  202 tgacaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgatta 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| | | | |||    
T  25523629 tgacaagggaaatccacataaccccaagtttccttcataggaatcatttgtaaatgtgttgaattgctttcctctaggtatttctcccaccaaatggtta 25523530  T
Q  302 ttggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatg 401  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25523529 ttggaaagattcatgacttcaagaaagtttaaattggttaattccgcaggaatcacaccggttaacatattcagggaaagatccagagattccaagtatg 25523430  T
Q  402 tcaagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctc 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  25523429 tcaagtttcctatggatttgggaatatgaccggtaagtctgttgtgggaaaggttaagccctttgagtgcatgaagctctccaatagcatttggaatctc 25523330  T
Q  502 tccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatc 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |  ||||||||||||| ||| ||||||   | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25523329 tccttcaaatttgtttcttgaaaaatcaatagatacaaactttattggaattttcaccaatttcatttgaatcccttttgttgccacagtcacagaatc 25523231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 313 - 599
Target Start/End: Original strand, 24140436 - 24140722
Alignment:
Q  313 caagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtcaagtttcct 412  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  24140436 caagacttcaagactgttcatattggttaattccgaaggaatcacgccggttaacatatttgatgaaagattcaaagattccaagtatgtcaactttccg 24140535  T
Q  413 atggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctccttcaaatt 512  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24140536 atggattggggaatatgaccagtaagtctgttatgggaaaggttaatccctttgagtgcatgaagctctccgatagcatttggaatctctccttcaaatt 24140635  T
Q  513 tgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaat 599  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  24140636 tgtttcttgacatatcgatacttacaaacttttttggaattttcaccagtgtcattttggtcccttttgttgccacagtcacagaat 24140722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 5 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 34241358 - 34240757
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34241358 ctcttaggatgaccaccaaatatcatcacaaaccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaaggcctattccaaacacaaatccacatccat 34241259  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  34241258 aaccaattgccactggtttccatccaaagccaaatttctcttcactccaaaagttgttggctgaaggtggagaatgttgttccggtccacatttctttga 34241159  T
Q  205 caagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattg 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34241158 caagggtaatccacataaccccaagttccctttataagaatcatttgtaaatgtattgaattgctttccttgaggtatttctcccacaagatggttattg 34241059  T
Q  305 gaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||   ||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  34241058 gaaagatccaagacttcaagactgttcaaattggttaattctgcaggaatcataccagtgagcatatttgacgagagatccaacgattccaagtttgtca 34240959  T
Q  405 agtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcc 504  Q
    |||||  ||||||||  |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || || ||| | | ||||||  ||||    
T  34240958 agttttgtatggattgaggaataggaccagtgagtctgttatgtgaaaggttaagccctttgagtgcgtgaagttctcctatatcatttggaattcctcc 34240859  T
Q  505 ttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcatag 604  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||   | |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34240858 attaaacttgtttcttgagaaatcaatacttacaaacattgttggaattttcgtcagtgtcattttgatgccttttgtcgtcacagtcacagaatcatag 34240759  T
Q  605 ta 606  Q
    ||    
T  34240758 ta 34240757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 606
Target Start/End: Original strand, 42117027 - 42117631
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42117027 ctcttaggctgaccaccaaatatcatcacaatccatctaggctttccaattaaaaacataaaatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccat 42117126  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaa---aatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttt 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || ||    
T  42117127 atccaattgccactgctttccatccaaatccaaatttctcttcactgcaaaagctgttgttggctgaaattggagaatgatgttcaggtccacaaatctt 42117226  T
Q  202 tgacaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgatta 301  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| |||    | |||||||||| |||||| ||| | |||    
T  42117227 tgacaacggaaatccacataaacccaagtttcctttgtaggaatcatttggaaatgtatcgaagtgcggctcttgaggtatttttcccactagatggtta 42117326  T
Q  302 ttggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatg 401  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||  | ||||||||||||   ||| ||   |||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||    
T  42117327 ttggaaagattcaagacttgaagaaagtctaaattggttaattctgcagggatcataccggtaagcatatttgacgagagatccaatgattccaagtttg 42117426  T
Q  402 tcaagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctc 501  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||| | | |||||||||    
T  42117427 acaagtttcccatggatttgggaatatgaccggtgagtctgttatgggaaaggttaagccctttgagtgcatggaggtctccaatagcatttggaatctc 42117526  T
Q  502 tccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatca 601  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42117527 tccctcaaatttgttttttgacaaatcaataattacaaaaatgtttggaattttcaccaatgtcattttgctcccttttgtcgacacaatcacagaatca 42117626  T
Q  602 tagta 606  Q
    |||||    
T  42117627 tagta 42117631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 5 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 34233585 - 34232986
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34233585 ctcttaggatgaccaccaaatatcatcacaaaccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaaggcctattccaaacacaaatccacatccat 34233486  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  34233485 aaccaattgccactggtttccatccaaagccaaatttctcttcactccaaaagttgttggctgaaggtggagaatgttgttccggtccacatttctttga 34233386  T
Q  205 caagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattg 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34233385 caagggtaatccacataaccccaagttccctttataagaatcatttgtaaatgtattgaattgctttccttgaggtatttctcccacaagatggttattg 34233286  T
Q  305 gaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||   ||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  34233285 gaaagatccaagacttcaagactgttcaaattggttaattctgcaggaatcataccagtgagcatatttgacgagagatccaacgattccaagtttgtca 34233186  T
Q  405 agtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcc 504  Q
    |||||  ||||||||  |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || || ||| | | ||||||  ||||    
T  34233185 agttttgtatggattgaggaataggaccagtgagtctgttatgtgaaaggttaagccctttgagtgcgtgaagttctcctatatcatttggaattcctcc 34233086  T
Q  505 ttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcatag 604  Q
     | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||| | |||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  34233085 attaaacttgtttcttgagaaatcaatacttacaaagtttattggaatttttaccaatgtcatattgatccctttgtttgccacagtcacagaatcatag 34232986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 5 - 607
Target Start/End: Original strand, 42122778 - 42123380
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42122778 ctcttaggcggaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcatattccaatcacaaatccacatccat 42122877  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttga 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42122878 atccaatcgccactggtttccatccaaatctaaatttctcttcactccaagagttcttggctgaaggtggagaatgttgttcaggtccacatttttttga 42122977  T
Q  205 caagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattg 304  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  42122978 caagggtaatccacataaccctgaatttccttcataggaatcatttgtaaatgtattgaactgctttccttgaggtatttctcccacaagatggttattt 42123077  T
Q  305 gaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtca 404  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |   | |||||||| |||   ||||||  || | || | ||||||||| || ||||||||  ||||||||| || ||    
T  42123078 gaaatatctaagacttcaagaaagcccaaattggttagttctgcaggaatcacatcagtgagcatatttgatgagagatccaaccattccaagtttgaca 42123177  T
Q  405 agtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcc 504  Q
    ||| ||| || ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||    
T  42123178 agtatccaattgattggggaataggaccattgagtctgttatgggaaaggttaagccctatgagtgcatgtagctttccaatagcatttggaatctctcc 42123277  T
Q  505 ttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcatag 604  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||| ||    
T  42123278 ttcaaatttgtttcttgacatatcaatacttacaaacttttttggaattttaacgagtgtcattttggttccttttgttgccacggtcacagaatcagag 42123377  T
Q  605 tag 607  Q
    |||    
T  42123378 tag 42123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 606
Target Start/End: Original strand, 42128173 - 42128773
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42128173 ctcttaggctgaccaccaaatatcataacaagccatctagacttttcaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccat 42128272  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctga-aggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||| |  | |  ||| ||||  ||||||||||||||  | ||||    
T  42128273 atccaatcgccactggtttccatccaaatctaaatttctcttcactccaagagttgttgtcaaagaattgtggaat--tgttcaggtccacaattctttg 42128370  T
Q  204 acaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattatt 303  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  42128371 acaagggaaatccacataaccccaagtttccttcataggaatcatttgtaaatgtattgaattgcggtccttgaggtatttctcccactagatggttatt 42128470  T
Q  304 ggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtc 403  Q
     |||||||| ||||||||||||      | |||| |||||||   ||||||  || | || | || |||||| || ||||||||  ||||||||| ||||    
T  42128471 tgaaagatctaagacttcaagaaaacccaaattgcttaattctgcaggaatcacatcagtgagcacatttgatgagagatccaaccattccaagtttgtc 42128570  T
Q  404 aagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctc 503  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| | | | |||||| ||||    
T  42128571 aagtttcccatggattttggaatagggccaatgagtttgttatgggaaaggttgagtcctattagtgcatgaagctcaccaaaatcatttggaatatctc 42128670  T
Q  504 cttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcata 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42128671 cttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatatttggaattttcaccaatgtccttttgttcccttttgtcgccacaatcatagaatcata 42128770  T
Q  604 gta 606  Q
    |||    
T  42128771 gta 42128773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 41618448 - 41617939
Alignment:
Q  7 cttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgtat 106  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  41618448 cttaggttgacctccaaccatcatcacaagccatctaggctttccaattaacaacacaaaacatccaaggcctattccaataaccattccacatccatat 41618349  T
Q  107 ccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttgaca 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| || | | | |||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  41618348 ccaatagccactggtttccatccaaatccaaatttctcttcactccaaaggttgttgggtggaagcggagaatgttgttcaggttcacatttctttgaca 41618249  T
Q  207 agggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattgga 306  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||    
T  41618248 agggaaatccgcataatcccaagtttccttcatatgagtcattggaaaatgtattgaactgttttccttgaggtatttctcccactagatggttatgaga 41618149  T
Q  307 aagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtcaag 406  Q
    ||||| ||| ||| ||| || ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||    
T  41618148 aagattcaatactccaataccgttcagattgattaattctgaaggaattacaccagtgagtatatttgacgaaagatccaatgattccatgtttgacaag 41618049  T
Q  407 tttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcctt 506  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| |   ||||||||||||    
T  41618048 tttcctacggattgaggaataggaccggtgagtctgttatgggaaaggttaagccctttgagtgagtgaagctccccaataacattcagaatctctcctt 41617949  T
Q  507 caaatttgtt 516  Q
    |||| |||||    
T  41617948 caaaattgtt 41617939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 41572809 - 41572300
Alignment:
Q  7 cttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgtat 106  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | || |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  41572809 cttaggttgacctccaaccatcatcacaagccatctaggctttccggttaacaacacaaaacatccaaggcctattccaataaccattccacatccatat 41572710  T
Q  107 ccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttgaca 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| || | | | |||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  41572709 ccaatagccactggtttccatccaaatccaaatttctcttcactccaaaggttgttgggtggaagcggagaatgttgttcaggttcacatttctttgaca 41572610  T
Q  207 agggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattgga 306  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||    
T  41572609 agggaaatccgcataatcccaagtttccttcatatgagtcattggaaaatgtattgaactgttttccttgaggtatttctcccactagatggttatgaga 41572510  T
Q  307 aagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtcaag 406  Q
    ||||| ||| ||| ||| || ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||    
T  41572509 aagattcaatactccaataccgttcagattgattaattctgaaggaattacaccagtgagtatatttgacgaaagatccaatgattccatgtttgacaag 41572410  T
Q  407 tttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcctt 506  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||| |   ||||||||||||    
T  41572409 tttcctacggattgaggaataggaccggtgagtctgttatgggaaaggttaagccctttgagtgagtgaagctccccaataacattcagaatctctcctt 41572310  T
Q  507 caaatttgtt 516  Q
    |||| |||||    
T  41572309 caaaattgtt 41572300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 203 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 41714152 - 41713768
Alignment:
Q  203 gacaagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattat 302  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  41714152 gacaagggaaatccacataaccccaagtttccttcataggaatcatttgtaaatgtattgaactgctttccttgaggtatttctcccacaagatggttat 41714053  T
Q  303 tggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgt 402  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||| |  | ||||||   ||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||| | |    
T  41714052 tagaaagatccaagacttcaagaaagtccaaattggttaactttacaggaatccgaccagtgagcatatttgacgagagatccaatgattccaagtttat 41713953  T
Q  403 caagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctct 502  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  41713952 caagtttcccatggattggggaatgtgaccagtgagtttgttatatgaaaggttaagccctttgagatcatgaagctctccaataacatctggaatctcc 41713853  T
Q  503 ccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgcca 587  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  41713852 ccatcaaatttatttcttgaaaaatcaatacttgcaaagatttttggaattttcacaagtggggttttgtttccttttgtcgcca 41713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41714315 - 41714175
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41714315 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccgatcaaaaacatgtaatacccaatgcctattccaatcacaaatccacatccat 41714216  T
Q  105 atccaattgccactggtttccatccaaatccaaatttctct 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41714215 atccaattgccactgctttccatccaaatccaaatttctct 41714175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 367 - 543
Target Start/End: Original strand, 41444005 - 41444181
Alignment:
Q  367 catatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtcaagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatg 466  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| | || | |||| ||||| | |||||  |||||   ||| |||||| | || ||||||||||| || ||||||    
T  41444005 catatttgaggagagatccattgattcgatgtttatcaaatttccaaaggattgaggaatcgcaccagtaagtttattgtgggaaaggttgagtcctatg 41444104  T
Q  467 attgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagat 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41444105 attgcatgaagctcaccaataacatttggaatgtctccttcaaatttgtttcctgaaaaatcaatacttacaaagat 41444181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11995193 - 11994579
Alignment:
Q  8 ttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgtatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11995193 ttaggctgaccaccaaatatcatcacaagccatctaggctttccaattaaaaacatacaatatccgaggcctattccaatcacaaatccacatccatatc 11995094  T
Q  108 caattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttg---gctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||   | |||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  11995093 caattgccactggtttccatccaaatccaaatttctcttcactcgaaaagctgttgttgggtgaaggtggagaacgttgttcaggtccgcacttctttga 11994994  T
Q  205 caagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattg-aattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattatt 303  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || | | || || |||||  |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  11994993 caagggaaattcacataactccaagtttcctacatatgaatcatttgaaaatgtctcggaactgttttcctcgaggtatttctcccactagatggttatt 11994894  T
Q  304 ggaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtc 403  Q
    |||||  || || ||| |||||  |   | |||||||||||     |||||  || | || | ||||||||| || |||||||   ||||||||| ||||    
T  11994893 ggaaaagtctaaaactgcaagaaagcccaaattggttaattttgctggaatcacatcagtgagcatatttgatgagagatccagccattccaagtttgtc 11994794  T
Q  404 aagtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctc 503  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  11994793 aagtttcccatggatttgggaataggaccaatgagtctgttatgggaaaggttaagccctataagtgcttgaagctcatcaataacatttggaatctctc 11994694  T
Q  504 cttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcata 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11994693 cttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattactaagatgtttggaattttaacccatgtcattttgttcccttttgacgccacaatcacagaatcata 11994594  T
Q  604 gtaggttgcaattga 618  Q
    ||||| |||||||||    
T  11994593 gtagggtgcaattga 11994579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 618
Target Start/End: Original strand, 12247737 - 12248350
Alignment:
Q  8 ttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgtatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12247737 ttaggctgaccaccaaatatcatcacaagccatctaggctttccaattaaaaacatacaatatccgaggcctattccaatcacaaatccacatccatatc 12247836  T
Q  108 caattgccactggtttccatccaaatccaaatttctctttactgcaaaaaatgttggc---tgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttga 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  || |||||  |||||     |||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  12247837 caattgccaccggtttccatccaaatccaaatttcgcgtcgctccaaaagctgttgttaagtgaaggttgagaatattgttcaggtccacacttctttga 12247936  T
Q  205 caagggtaatccacataactccaagtttccttcataggaatcatttgtaaaagtattgaattgctttccctgaggtatttctcccacaagacgattattg 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || | ||| || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  12247937 caagggaaatccacataactccaagtttcctacatatgaatcatttgaaaatgtctcgaactgttttcctcgaggtatttctcccactagatggttattg 12248036  T
Q  305 gaaagatccaagacttcaagactgttaagattggttaattccaaaggaattgcaccggttaacatatttgaggaaagatccaaagattccaagtatgtca 404  Q
    ||||  || || ||| |||||  |   | |||||||||||     |||||  || | || | ||||||||| || |||||||   ||||||||| |||||    
T  12248037 gaaaagtctaaaactgcaagaaagcccaaattggttaattttgctggaatcacatcagtgagcatatttgatgagagatccagccattccaagtttgtca 12248136  T
Q  405 agtttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgattgcatgaagctcaccaataacgtctggaatctctcc 504  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12248137 agtttcccatggatttgggaataggaccaatgagtctgttatgggaaaggttaagccctataagtgcttgaagctcatcaataacatttggaatctctcc 12248236  T
Q  505 ttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatcatag 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12248237 ttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattactaagatgtttggaattttaacccatgtcattttgttcccttttgatgccacaatcacagaatcatag 12248336  T
Q  605 taggttgcaattga 618  Q
    |||| |||||||||    
T  12248337 tagggtgcaattga 12248350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 408 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 32682311 - 32682113
Alignment:
Q  408 ttcctatggatttcggaatatgacctgtaagtctgttatgggaaaggttaagccctatgatt------gcatgaagctcaccaataacgtctggaatctc 501  Q
    |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  32682311 ttcccatggattggggaatatgatcggtgagtctgttatgggaaaggttaagccctctgattctgagtgcatgaagctccccaatagcatttggaatctc 32682212  T
Q  502 tccttcaaatttgtttcttgacaaatcaataattacaaagatgtttggaattttcacaaatgtcattttgttaccttttgtcgccacaatcacagaatc 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  32682211 tccttcaaatctgtttcttgacaaatcaatacttacaaagtttcttggaattttcactagtgtcattttgctcccttttgtccccatagtcacagaatc 32682113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32682486 - 32682381
Alignment:
Q  5 ctcttaggctgaccaccaaatatcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgt 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32682486 ctcttaggatgaccaccaattatcatcacaagccatctaggctttccaattaaaaacataaagtatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccat 32682387  T
Q  105 atccaa 110  Q
    ||||||    
T  32682386 atccaa 32682381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9423506 - 9423281
Alignment:
Q  26 atcatgacaagccatctaggctttccaattaaaaacatataatatccaatgcctattccaatcacaaatccacatccgtatccaattgccactggtttcc 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9423506 atcatcacaggccatctaggctttccaattaacagcatacaacatccaaggccttttccaagcaccattccacatccatatccaattgccactgatttcc 9423407  T
Q  126 atccaaatccaaatttctctttactgcaa---aaaatgttggctgaaggtgtagaatgttgttcaggtccacacatttttgacaagggtaatccacataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||  |  || ||||||| ||||  |||||    
T  9423406 atccaaatccaaatttctcttcattgcaatataatttgttgggtgaagttgtagaatttcgtttaggtccacatttcatttacaagggaaatc--cataa 9423309  T
Q  223 ctccaagtttccttcataggaatcattt 250  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||    
T  9423308 cccccagtttccttcataaaaatcattt 9423281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University