View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6978_high_8 (Length: 562)

Name: NF6978_high_8
Description: NF6978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6978_high_8
NF6978_high_8
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (8-547)||(11212142-11212682)
chr3 (8-547)||(4408542-4409080)
chr3 (8-547)||(1789919-1790460)
chr3 (32-548)||(16386935-16387451)
chr3 (32-548)||(6496389-6496907)
chr3 (32-548)||(9987934-9988452)
chr3 (32-548)||(6216099-6216616)
chr3 (32-548)||(19782695-19783212)
chr3 (32-548)||(12243606-12244123)
chr3 (8-547)||(9386631-9387172)
chr3 (25-548)||(29467252-29467775)
chr3 (32-548)||(37870734-37871251)
chr3 (32-548)||(37879252-37879769)
chr3 (32-548)||(13378714-13379230)
chr3 (32-548)||(13389308-13389824)
chr3 (32-548)||(23761568-23762084)
chr3 (32-547)||(14317104-14317616)
chr3 (28-548)||(7800108-7800629)
chr3 (104-548)||(10632870-10633320)
chr3 (32-548)||(20679244-20679761)
chr3 (32-548)||(14469893-14470411)
chr3 (32-548)||(5623443-5623961)
chr3 (73-548)||(13126004-13126481)
chr3 (32-548)||(24389565-24390082)
chr3 (32-548)||(39376357-39376874)
chr3 (28-547)||(1057851-1058369)
chr3 (10-547)||(9001837-9002372)
chr3 (42-547)||(16666490-16666994)
chr3 (26-472)||(17905668-17906114)
chr3 (73-548)||(510217-510694)
chr3 (77-548)||(4748036-4748509)
chr3 (73-548)||(5543068-5543545)
chr3 (77-548)||(24664187-24664660)
chr3 (77-548)||(41687966-41688439)
chr3 (32-548)||(5871743-5872262)
chr3 (77-548)||(12292236-12292709)
chr3 (32-548)||(5514945-5515463)
chr3 (77-548)||(16425204-16425678)
chr3 (73-548)||(28320285-28320762)
chr3 (77-548)||(38198969-38199442)
chr3 (30-547)||(15222123-15222639)
chr3 (73-548)||(8778975-8779453)
chr3 (73-548)||(11278432-11278921)
chr3 (42-547)||(29939602-29940105)
chr3 (42-547)||(29988756-29989259)
chr3 (34-547)||(17010408-17010923)
chr3 (34-547)||(17021214-17021729)
chr3 (42-508)||(29897681-29898145)
chr3 (42-547)||(17963984-17964490)
chr3 (49-546)||(13143421-13143922)
chr3 (49-547)||(15837532-15838031)
chr3 (27-184)||(13075257-13075415)
chr3 (30-548)||(5197394-5197891)
chr3 (265-548)||(30992407-30992686)
chr3 (336-548)||(17219376-17219585)
chr3 (336-548)||(17250808-17251017)
chr3 (465-548)||(17902136-17902219)
chr3 (350-491)||(12393536-12393673)
chr3 (32-130)||(17219787-17219886)
chr3 (32-130)||(12389798-12389898)
chr3 (335-397)||(12389558-12389621)
chr3 (32-118)||(17251232-17251320)
chr3 (28-88)||(15657098-15657157)
chr3 (33-101)||(12393913-12393983)
chr3 (278-383)||(18137224-18137329)
chr3 (32-80)||(12954448-12954496)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (8-547)||(26871356-26871895)
chr2 (8-548)||(21127009-21127550)
chr2 (30-548)||(21167971-21168489)
chr2 (8-547)||(24421013-24421555)
chr2 (32-548)||(43086927-43087443)
chr2 (32-548)||(24333816-24334333)
chr2 (32-548)||(29248449-29248966)
chr2 (32-548)||(9903640-9904156)
chr2 (32-548)||(34796284-34796800)
chr2 (32-548)||(40244838-40245354)
chr2 (32-548)||(4214124-4214641)
chr2 (32-548)||(9768830-9769346)
chr2 (32-548)||(39176161-39176679)
chr2 (90-548)||(22939724-22940184)
chr2 (77-548)||(10271259-10271732)
chr2 (32-548)||(11401239-11401757)
chr2 (77-548)||(35257277-35257750)
chr2 (77-548)||(35267902-35268375)
chr2 (77-548)||(27225711-27226184)
chr2 (73-548)||(43349671-43350148)
chr2 (42-548)||(22768005-22768509)
chr2 (33-508)||(22747635-22748109)
chr2 (279-548)||(28727384-28727653)
chr2 (250-547)||(19308491-19308787)
chr2 (27-235)||(28727651-28727859)
chr2 (192-548)||(28707161-28707513)
chr2 (335-548)||(24719876-24720085)
chr2 (49-231)||(24810501-24810689)
chr2 (454-548)||(18943728-18943822)
chr2 (30-130)||(18942102-18942203)
chr2 (34-147)||(19308850-19308966)
chr2 (264-396)||(18943561-18943693)
chr2 (43-130)||(24719586-24719676)
chr2 (42-101)||(28707603-28707663)
chr2 (334-385)||(21148632-21148683)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (8-547)||(16309377-16309915)
chr4 (32-548)||(40462796-40463311)
chr4 (32-548)||(27820982-27821499)
chr4 (8-547)||(3377195-3377733)
chr4 (23-547)||(14842134-14842660)
chr4 (27-547)||(15202855-15203386)
chr4 (32-548)||(4993846-4994364)
chr4 (32-548)||(4997974-4998492)
chr4 (32-548)||(19950446-19950963)
chr4 (32-548)||(18758541-18759059)
chr4 (84-548)||(27192236-27192702)
chr4 (73-548)||(22000746-22001221)
chr4 (32-548)||(17922385-17922902)
chr4 (32-548)||(24023520-24024037)
chr4 (32-548)||(30932541-30933056)
chr4 (32-548)||(454850-455366)
chr4 (32-548)||(16260152-16260669)
chr4 (32-548)||(55751303-55751820)
chr4 (73-548)||(14845995-14846469)
chr4 (77-548)||(10746649-10747122)
chr4 (77-548)||(10960418-10960891)
chr4 (73-548)||(27660939-27661416)
chr4 (77-548)||(36022622-36023095)
chr4 (42-547)||(10294970-10295474)
chr4 (77-548)||(49511866-49512340)
chr4 (77-548)||(24644662-24645135)
chr4 (32-497)||(11540307-11540771)
chr4 (28-220)||(39516597-39516791)
chr4 (301-548)||(14909035-14909279)
chr4 (343-548)||(19606947-19607148)
chr4 (8-137)||(19575278-19575406)
chr4 (264-548)||(15010017-15010298)
chr4 (435-547)||(43246109-43246220)
chr4 (382-548)||(16848632-16848795)
chr4 (73-143)||(15010413-15010484)
chr4 (28-60)||(11519400-11519432)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (27-548)||(20786215-20786736)
chr5 (8-548)||(23402081-23402621)
chr5 (32-548)||(5294716-5295233)
chr5 (27-548)||(34778066-34778588)
chr5 (8-548)||(20557917-20558459)
chr5 (32-548)||(39358666-39359183)
chr5 (8-547)||(34058104-34058643)
chr5 (69-548)||(24933864-24934344)
chr5 (32-548)||(40396532-40397049)
chr5 (8-545)||(17450882-17451400)
chr5 (8-508)||(19470108-19470608)
chr5 (32-548)||(31839591-31840107)
chr5 (32-548)||(15997471-15997987)
chr5 (32-548)||(14562227-14562744)
chr5 (32-548)||(22152686-22153203)
chr5 (25-548)||(1115450-1115993)
chr5 (32-548)||(39495060-39495578)
chr5 (77-548)||(24814083-24814556)
chr5 (32-548)||(6981975-6982493)
chr5 (32-548)||(23302447-23302965)
chr5 (73-548)||(9342125-9342602)
chr5 (32-548)||(22682286-22682804)
chr5 (73-548)||(23702950-23703427)
chr5 (73-548)||(30231640-30232117)
chr5 (73-548)||(42048950-42049427)
chr5 (73-548)||(14451226-14451703)
chr5 (77-548)||(24821094-24821567)
chr5 (77-548)||(14036212-14036685)
chr5 (77-548)||(27046454-27046928)
chr5 (73-548)||(23368106-23368583)
chr5 (77-548)||(27466332-27466805)
chr5 (32-548)||(36586690-36587208)
chr5 (77-548)||(17613232-17613705)
chr5 (77-548)||(24573242-24573715)
chr5 (73-548)||(17725088-17725565)
chr5 (73-548)||(15746139-15746616)
chr5 (73-548)||(31354704-31355181)
chr5 (28-547)||(21418543-21419058)
chr5 (73-548)||(35221672-35222149)
chr5 (73-548)||(36693868-36694345)
chr5 (73-548)||(37734181-37734658)
chr5 (32-547)||(13527488-13528002)
chr5 (27-547)||(21672023-21672545)
chr5 (77-399)||(24592280-24592603)
chr5 (32-341)||(27607595-27607905)
chr5 (49-547)||(23482388-23482892)
chr5 (337-548)||(27616652-27616863)
chr5 (30-548)||(21612726-21613242)
chr5 (32-130)||(23433770-23433869)
chr5 (32-130)||(23445135-23445236)
chr5 (8-71)||(24932375-24932439)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (32-548)||(27377018-27377537)
chr6 (32-548)||(27467375-27467894)
chr6 (32-548)||(9118549-9119065)
chr6 (8-548)||(20035962-20036502)
chr6 (32-548)||(27497930-27498447)
chr6 (32-548)||(26037840-26038358)
chr6 (8-547)||(25798056-25798591)
chr6 (31-548)||(32968003-32968520)
chr6 (32-548)||(34813220-34813736)
chr6 (73-548)||(3665694-3666170)
chr6 (32-548)||(12859150-12859675)
chr6 (32-548)||(26869029-26869546)
chr6 (73-548)||(12722893-12723370)
chr6 (73-548)||(25791982-25792458)
chr6 (33-547)||(18830368-18830881)
chr6 (77-548)||(26029691-26030164)
chr6 (77-548)||(27346014-27346489)
chr6 (77-548)||(27406754-27407229)
chr6 (27-548)||(25730916-25731434)
chr6 (77-548)||(16953278-16953752)
chr6 (28-547)||(22290211-22290728)
chr6 (73-548)||(4635193-4635670)
chr6 (73-548)||(32307103-32307580)
chr6 (8-397)||(12369900-12370292)
chr6 (32-547)||(13917474-13917989)
chr6 (34-547)||(21123715-21124228)
chr6 (8-355)||(18921686-18922031)
chr6 (28-548)||(18547605-18548124)
chr6 (85-543)||(19457459-19457915)
chr6 (42-469)||(25682257-25682682)
chr6 (34-547)||(22380263-22380777)
chr6 (85-547)||(1655062-1655524)
chr6 (34-547)||(17051676-17052192)
chr6 (49-547)||(14065553-14066056)
chr6 (10-220)||(17783732-17783943)
chr6 (286-548)||(22809560-22809819)
chr6 (34-548)||(16880403-16880916)
chr6 (177-399)||(11239925-11240147)
chr6 (416-547)||(18921562-18921693)
chr6 (322-408)||(7665830-7665916)
chr6 (350-536)||(25630554-25630734)
chr6 (43-154)||(7665537-7665649)
chr6 (34-130)||(11239823-11239920)
chr6 (471-548)||(20138949-20139026)
chr6 (471-548)||(22193843-22193920)
chr6 (30-79)||(22809510-22809559)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (8-548)||(23465396-23465938)
chr8 (8-548)||(19229028-19229569)
chr8 (32-548)||(19132954-19133471)
chr8 (32-548)||(26115546-26116062)
chr8 (8-548)||(19422575-19423116)
chr8 (25-548)||(30320788-30321310)
chr8 (8-548)||(25680070-25680611)
chr8 (32-548)||(6155340-6155857)
chr8 (73-548)||(32083778-32084255)
chr8 (32-548)||(44485388-44485905)
chr8 (73-548)||(29080705-29081182)
chr8 (77-548)||(9345416-9345889)
chr8 (77-548)||(36297242-36297717)
chr8 (77-548)||(3354717-3355190)
chr8 (73-548)||(13694652-13695129)
chr8 (33-547)||(3837127-3837639)
chr8 (73-548)||(246122-246599)
chr8 (73-548)||(809242-809719)
chr8 (32-547)||(22152372-22152887)
chr8 (73-548)||(36082225-36082712)
chr8 (32-548)||(23787690-23788207)
chr8 (200-547)||(16741112-16741463)
chr8 (34-547)||(21292581-21293094)
chr8 (322-548)||(15786792-15787018)
chr8 (30-548)||(22667336-22667850)
chr8 (35-548)||(19933400-19933910)
chr8 (73-270)||(15787027-15787225)
chr8 (32-548)||(17263636-17264149)
chr8 (30-533)||(24649176-24649674)
chr8 (349-547)||(20377894-20378089)
chr8 (336-548)||(22467224-22467431)
chr8 (403-548)||(17294169-17294312)
chr8 (474-548)||(24490737-24490811)
chr8 (33-130)||(20378182-20378281)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (25-548)||(7683356-7683880)
chr1 (32-548)||(19183133-19183649)
chr1 (32-548)||(5645797-5646315)
chr1 (32-548)||(4171517-4172034)
chr1 (25-548)||(149768-150291)
chr1 (32-548)||(12734744-12735260)
chr1 (32-548)||(12619245-12619763)
chr1 (32-548)||(21867878-21868395)
chr1 (32-548)||(7511488-7512006)
chr1 (32-548)||(51651966-51652484)
chr1 (73-548)||(36242523-36243001)
chr1 (73-548)||(7695564-7696041)
chr1 (73-548)||(35644131-35644607)
chr1 (73-548)||(38099340-38099817)
chr1 (77-548)||(35396589-35397062)
chr1 (73-548)||(47614025-47614502)
chr1 (73-548)||(5837459-5837936)
chr1 (77-548)||(3175850-3176333)
chr1 (34-547)||(19165744-19166258)
chr1 (30-547)||(20879092-20879607)
chr1 (42-548)||(21211770-21212275)
chr1 (34-548)||(21130396-21130908)
chr1 (338-548)||(22447655-22447862)
chr1 (338-548)||(22452889-22453096)
chr1 (339-548)||(22126016-22126222)
chr1 (336-546)||(20933741-20933945)
chr1 (33-130)||(20933522-20933620)
chr1 (33-130)||(22125711-22125810)
chr1 (30-144)||(22460559-22460674)
chr1 (350-392)||(16325264-16325306)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (8-548)||(9163793-9164336)
chr7 (25-548)||(15883953-15884477)
chr7 (27-548)||(20983507-20984029)
chr7 (32-548)||(9437519-9438036)
chr7 (10-548)||(25207181-25207717)
chr7 (32-548)||(6873361-6873878)
chr7 (73-548)||(2711744-2712219)
chr7 (32-548)||(17956245-17956761)
chr7 (32-548)||(22093397-22093913)
chr7 (32-548)||(8621617-8622135)
chr7 (32-548)||(4216263-4216780)
chr7 (32-548)||(26396225-26396742)
chr7 (32-548)||(171143-171662)
chr7 (77-548)||(9089533-9090006)
chr7 (33-547)||(18432784-18433294)
chr7 (73-548)||(24738396-24738873)
chr7 (73-548)||(40048235-40048713)
chr7 (32-548)||(463117-463621)
chr7 (73-548)||(26691873-26692350)
chr7 (77-548)||(8008197-8008670)
chr7 (73-548)||(1991851-1992328)
chr7 (73-548)||(11009480-11009959)
chr7 (73-548)||(42870128-42870620)
chr7 (92-547)||(13180243-13180697)
chr7 (34-548)||(4420965-4421476)
chr7 (301-548)||(14138175-14138419)
chr7 (297-548)||(4823594-4823842)
chr7 (336-548)||(10651409-10651618)
chr7 (339-548)||(13661032-13661238)
chr7 (32-130)||(21695068-21695168)
chr7 (30-146)||(14137906-14138021)
chr7 (459-534)||(16159340-16159415)
chr7 (32-130)||(13660851-13660951)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (50-548)||(4868-5371)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (23-547)||(38968-39493)
scaffold0047 (73-548)||(42830-43305)
scaffold0047 (264-541)||(2977-3250)
scaffold0047 (32-130)||(2747-2848)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (8-548)||(38418-38959)
scaffold0133 (32-548)||(35389-35906)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (33-548)||(49025-49544)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (32-520)||(5-495)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (10-547)||(179717-180254)
scaffold0017 (92-547)||(49323-49776)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (30-547)||(5720-6236)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (73-548)||(43042-43519)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (43-474)||(31149-31582)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (32-516)||(2515-2998)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (28-547)||(5458-5977)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (176-491)||(195413-195729)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (28-547)||(6210-6729)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (28-547)||(54798-55317)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (42-547)||(131946-132450)
scaffold0012 (92-547)||(259-712)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (35-394)||(1-360)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (27-548)||(73839-74361)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (28-546)||(83-602)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (30-547)||(6287-6805)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (41-312)||(8261-8533)
scaffold0398 (41-312)||(6-278)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (92-513)||(109230-109650)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (32-394)||(69063-69426)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (47-474)||(10835-11262)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (27-291)||(6603-6868)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (27-277)||(1-251)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (49-546)||(161054-161555)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (85-543)||(13417-13872)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (85-547)||(5979-6439)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (85-544)||(20966-21424)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (10-257)||(1810-2057)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (85-547)||(11433-11895)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (173-547)||(11396-11767)
[»] scaffold1078 (1 HSPs)
scaffold1078 (34-388)||(1-357)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (85-547)||(8332-8825)
scaffold0099 (26-71)||(10345-10390)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (49-547)||(24723-25215)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (8-210)||(18425-18627)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (85-543)||(20627-21084)
scaffold0132 (85-543)||(33828-34285)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-257)||(220565-220788)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (74-548)||(13420-13890)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (35-539)||(30287-30791)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (30-548)||(10999-11514)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (28-337)||(62782-63093)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (43-548)||(10997-11501)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (35-262)||(30302-30528)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (34-547)||(161678-162192)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (30-548)||(3174-3691)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (250-548)||(12031-12325)
scaffold0324 (32-88)||(11809-11868)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (269-548)||(30870-31146)
scaffold0201 (192-232)||(31183-31223)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (336-548)||(2742-2951)
scaffold0004 (334-477)||(7961-8101)
scaffold0004 (32-130)||(8301-8401)
scaffold0004 (32-130)||(2439-2539)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (334-548)||(3525-3736)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (334-548)||(7372-7583)
scaffold0193 (32-118)||(7073-7161)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (336-548)||(22271-22479)
[»] scaffold1365 (2 HSPs)
scaffold1365 (264-548)||(720-999)
scaffold1365 (35-130)||(1075-1173)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (336-551)||(42374-42585)
scaffold0084 (30-130)||(42094-42198)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (336-548)||(2143-2351)
scaffold0379 (27-130)||(1836-1940)
[»] scaffold0594 (2 HSPs)
scaffold0594 (334-548)||(3133-3344)
scaffold0594 (32-130)||(3545-3643)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (336-548)||(2988-3196)
scaffold0183 (32-66)||(2685-2719)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (336-548)||(27775-27983)
[»] scaffold0537 (1 HSPs)
scaffold0537 (10-164)||(1471-1626)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (192-548)||(130724-131059)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (343-523)||(13196-13372)
scaffold0302 (32-130)||(13580-13683)
[»] scaffold1362 (1 HSPs)
scaffold1362 (8-102)||(1-94)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (49-231)||(2445-2633)
[»] scaffold2124 (2 HSPs)
scaffold2124 (350-548)||(809-1002)
scaffold2124 (71-130)||(536-597)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (354-541)||(73015-73198)
scaffold0037 (354-541)||(85205-85388)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (454-548)||(5927-6021)
scaffold0780 (334-399)||(6048-6113)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (33-145)||(1-114)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (336-399)||(788-851)
scaffold0315 (32-130)||(487-586)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (264-390)||(1355-1481)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (471-548)||(73625-73702)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (77-153)||(5617-5693)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (32-130)||(372-471)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11212682 - 11212142
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11212682 tagcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttattaaaacgtttgcaattcaaaaga 11212584  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212583 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 11212484  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11212483 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 11212384  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212383 agcaaagaataccgcttctgaagttttagagctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 11212284  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc-aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 505  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11212283 ctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatct 11212184  T
Q  506 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212183 ttgaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 11212142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Original strand, 4408542 - 4409080
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4408542 tagcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 4408640  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408641 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 4408740  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4408741 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaa 4408840  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 407  Q
    ||||| || ||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408841 gcaaagaatacaacttctgaagttttagtgctaacgtcaccttcagaagcacattttcctcaaaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttc 4408940  T
Q  408 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 507  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4408941 tgaatgaacttcagaaccaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 4409040  T
Q  508 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4409041 caacagataaaggctttgtaaatatatcagctcattgatg 4409080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1790460 - 1789919
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1790460 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 1790362  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1790361 acaaacaaacatagcattaatgacaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagat 1790262  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  1790261 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacattcggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaatgatcccactaggcttgctattcagaa 1790162  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 407  Q
     |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1790161 acaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttc 1790062  T
Q  408 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc---aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1790061 tgaattgacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatc 1789962  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  1789961 tttcaacagataaaggctttttaaatatattagcccactgatg 1789919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16387451 - 16386935
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16387451 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgttagttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatgac 16387352  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387351 aaattgggggcacgtgttagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 16387252  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||  || |||| |||||||||     
T  16387251 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcctcgctgatcagaagcaaggaataccgcttctgaagtt 16387152  T
Q  332 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16387151 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactgaactt 16387052  T
Q  432 cttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaata 531  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16387051 cttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaata 16386952  T
Q  532 tatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||    
T  16386951 tatcagcccattgatgt 16386935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6496907 - 6496389
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6496907 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 6496809  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6496808 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccgcgtcagagacttttcag 6496709  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6496708 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 6496609  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  6496608 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 6496509  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6496508 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 6496409  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6496408 atatatcagcccattgatgt 6496389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9988452 - 9987934
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988452 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttaattaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 9988354  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988353 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 9988254  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9988253 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 9988154  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  9988153 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 9988054  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9988053 cttcttattcagaagccagcaattttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaa 9987954  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9987953 atatatcagcccattgatgt 9987934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6216616 - 6216099
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6216616 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6216518  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6216517 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6216418  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  6216417 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 6216318  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6216317 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacgttttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 6216218  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6216217 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6216118  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6216117 tatatcagcccattgatgt 6216099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 19782695 - 19783212
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19782695 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 19782793  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19782794 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgcccttttggttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19782893  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  19782894 taaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 19782993  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19782994 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctggatagacttcagaaccaaac 19783093  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19783094 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatggatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19783193  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19783194 tatatcagcccattgatgt 19783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12244123 - 12243606
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12244123 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataaaagacaaacaaacatagcattaatga 12244025  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12244024 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagagacttttcag 12243925  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12243924 aaaacta-cctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 12243826  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  12243825 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaa 12243726  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12243725 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcatacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 12243626  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12243625 atatatcagcccattgatgt 12243606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9387172 - 9386631
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |     
T  9387172 tagcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgtagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaggg 9387074  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9387073 gacaaacaaacatagcattaatgacaaatagggggcgcgtgatagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 9386974  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9386973 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcaga 9386874  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    |||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9386873 agcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagttgctt 9386774  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaa--atttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9386773 ctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagacattttttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatt 9386674  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  9386673 tttcaacagataaaggtttagtaaatatatcagctcattgatg 9386631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29467775 - 29467252
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29467775 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 29467676  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29467675 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcactgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 29467576  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| || |||| ||    
T  29467575 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggtaactgccaacgttcccactagcc-aactattcagaagcaaagaataccgctt 29467477  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  29467476 ctgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgaaggactaaatgcttctgaatggactttagaa 29467377  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  29467376 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacgaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttcaacagataaaggttt 29467277  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29467276 tgtaaatatatcagcccattgatgt 29467252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 37870734 - 37871251
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37870734 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37870832  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  37870833 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37870932  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  37870933 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 37871032  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37871033 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 37871132  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37871133 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatccatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 37871232  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37871233 tatatcagcccattgatgt 37871251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 37879252 - 37879769
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37879252 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtatgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 37879350  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  37879351 acaaattgggggcgtatgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacacatagaccatgtcagagactcttca 37879450  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  37879451 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 37879550  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879551 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 37879650  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37879651 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatccatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 37879750  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37879751 tatatcagcccattgatgt 37879769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13379230 - 13378714
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13379230 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13379132  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13379131 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13379032  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  13379031 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 13378932  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13378931 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 13378832  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13378831 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 13378732  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13378731 atatcagcccattgatgt 13378714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13389824 - 13389308
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13389824 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 13389726  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13389725 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 13389626  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  13389625 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 13389526  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13389525 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 13389426  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13389425 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 13389326  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13389325 atatcagcccattgatgt 13389308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 23761568 - 23762084
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23761568 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgg 23761666  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23761667 caaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgcccggtttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23761766  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  23761767 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 23761866  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23761867 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 23761966  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23761967 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 23762066  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23762067 atatcagcccattgatgt 23762084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14317616 - 14317104
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  14317616 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttattt-aagtgtctttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 14317518  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14317517 caaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 14317418  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |  | ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  14317417 actaataacctt-ggttaatgggacatgtgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaagt 14317319  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14317318 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactaaact 14317219  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14317218 tcttatttagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaaatgcatgttc-aagttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 14317121  T
Q  531 atatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||    
T  14317120 atatcagcccattgatg 14317104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7800629 - 7800108
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7800629 aaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagtatta 7800531  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttt 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7800530 atgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaacctat 7800431  T
Q  227 tcagaaaa-ctaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  ||| || ||||||| | || |||| |||    
T  7800430 tcagaaaaactaacctttgggtaatgggacaactgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcca-gctgtttagaagcacagaataccgcttc 7800332  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7800331 tgaagttttagtgctgacatcattttcagaagcactttttcttcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaatggacttcagaac 7800232  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7800231 caaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 7800132  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7800131 gtaaatatatcagcccattgatgt 7800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10633320 - 10632870
Alignment:
Q  104 agagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactcca 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  10633320 agagacaaacaaacatagaattaatgacaaattgggggcgcgtgatagtatatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttttttgttatactcca 10633221  T
Q  200 atacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10633220 atacaaatagaccacgtcagagactttttagaaaactaacctttgagtaatgggacagctgtcacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgct 10633121  T
Q  300 attcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 399  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10633120 attcagaagcaaataataccttttctgaagtattagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggacca 10633021  T
Q  400 gatgcttctgaatagacttcagaacc--aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 497  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10633020 gatgcttctgaataaacttcagaaccaaaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaa 10632921  T
Q  498 acaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10632920 tcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10632870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20679761 - 20679244
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20679761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 20679663  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20679662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 20679563  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  20679562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 20679463  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  20679462 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttaagaataaacttcagaaccaaac 20679363  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20679362 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 20679263  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20679262 tatatcagcccattgatgt 20679244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 14469893 - 14470411
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14469893 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 14469991  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14469992 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14470091  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  14470092 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 14470191  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14470192 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 14470291  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14470292 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 14470391  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14470392 atatatcagcccattgatgt 14470411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5623961 - 5623443
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5623961 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 5623863  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5623862 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 5623763  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  5623762 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 5623663  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5623662 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 5623563  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5623562 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 5623463  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5623462 atatatcagcccattgatgt 5623443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 13126004 - 13126481
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13126004 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaacaaataaaa 13126103  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13126104 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 13126203  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13126204 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagat 13126303  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  13126304 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattccgaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 13126403  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13126404 tgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 13126481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24390082 - 24389565
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24390082 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 24389984  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24389983 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 24389884  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  24389883 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 24389784  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24389783 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 24389684  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24389683 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 24389584  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24389583 tatatcagcccattgatgt 24389565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 39376357 - 39376874
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39376357 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacacacatagcattaatga 39376455  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39376456 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcag 39376555  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  39376556 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 39376655  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39376656 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 39376755  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39376756 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 39376855  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  39376856 tatgtcagcccattgatgt 39376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Original strand, 1057851 - 1058369
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  1057851 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 1057949  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1057950 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgctctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagaaactt 1058049  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||  | ||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    
T  1058050 ttcagactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagcaaagaacacagcttc 1058148  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  1058149 tgaagttatagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcaaaac 1058247  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1058248 caaacttcttattcagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 1058346  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1058347 gtaaatatatcagcccattgatg 1058369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9002372 - 9001837
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9002372 gcagagaaggttggagaagaaattaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 9002274  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9002273 acaaacacacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 9002174  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9002173 agaccacgtcagaaacttttcagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactg-caacgatcccactagccttgctattcaga 9002076  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    || ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||    
T  9002075 agtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagatt 9001977  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 506  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9001976 ctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttagtcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctt 9001878  T
Q  507 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001877 tcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 9001837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16666994 - 16666490
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16666994 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 16666896  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | ||||    
T  16666895 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaacaagtcagaaacttttcagactaataac 16666796  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | ||||||||| |||||||    
T  16666795 c-ttggttaatgggacaggtgttacaaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaagttttagtgc 16666697  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16666696 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 16666598  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16666597 agaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 16666499  T
Q  539 ccattgatg 547  Q
    |||||||||    
T  16666498 ccattgatg 16666490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 17906114 - 17905668
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17906114 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 17906016  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17906015 taatgacaaattgggg-cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaact 17905917  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  17905916 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggaccgctgttacaaaagagtaactgtaaacgatcccactagccatgctattcaggagcaaagaataccgctt 17905817  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17905816 ctgaagttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 17905717  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17905716 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtg 17905668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 510694 - 510217
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  510694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 510595  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  510594 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 510495  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  510494 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 510395  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  510394 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 510295  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  510294 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 510217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 4748036 - 4748509
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  4748036 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 4748135  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4748136 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 4748235  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4748236 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 4748335  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  4748336 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 4748435  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4748436 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 4748509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5543545 - 5543068
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5543545 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 5543446  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5543445 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 5543346  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543345 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 5543246  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  5543245 acatcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttaagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 5543146  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5543145 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 5543068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 24664187 - 24664660
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24664187 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24664286  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24664287 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24664386  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24664387 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24664486  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24664487 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24664586  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24664587 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24664660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 41687966 - 41688439
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  41687966 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 41688065  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41688066 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 41688165  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41688166 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 41688265  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  41688266 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 41688365  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41688366 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 41688439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5872262 - 5871743
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5872262 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5872164  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5872163 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5872064  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgtt-acaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||    
T  5872063 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 5871964  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| || ||||||||||    
T  5871963 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacatcagaaccaa 5871864  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5871863 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgta 5871764  T
Q  528 aatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5871763 aatatatcagcccattgatgt 5871743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12292709 - 12292236
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  12292709 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 12292610  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12292609 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 12292510  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12292509 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 12292410  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  12292409 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 12292310  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12292309 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 12292236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 5514945 - 5515463
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5514945 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 5515043  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5515044 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 5515143  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||    
T  5515144 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaag 5515243  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5515244 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 5515343  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5515344 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttttttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 5515443  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5515444 atatatcagcccattgatgt 5515463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16425678 - 16425204
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16425678 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16425579  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgtt-acaaaaagtaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16425578 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16425479  T
Q  275 tgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 374  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16425478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 16425379  T
Q  375 tcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 473  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  16425378 tcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgc 16425279  T
Q  474 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16425278 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 16425204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28320762 - 28320285
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  28320762 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 28320663  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28320662 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 28320563  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28320562 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 28320463  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  28320462 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 28320363  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28320362 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 28320285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 38198969 - 38199442
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  38198969 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 38199068  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38199069 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 38199168  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38199169 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 38199268  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  38199269 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 38199368  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38199369 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 38199442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 30 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15222639 - 15222123
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15222639 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgcgtgttt-ttctatgtgtttttagtgaaaacgattacaattcaaaaagggacaaacaaacaaagcattaa 15222541  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15222540 tgaaaaattggaggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattaccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagaaactttt 15222441  T
Q  228 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctg 326  Q
    ||||  | ||||| |||| |||||| |||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||| || || | |||||    
T  15222440 cagactaataacc-ttggttaatggaacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactgaccctgttattcagaagtaaagaatacagcttctg 15222342  T
Q  327 aagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 426  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  15222341 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaaactcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctgaataaacttcagaacca 15222243  T
Q  427 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 526  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15222242 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgt 15222144  T
Q  527 aaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15222143 aaatatatcagcccattgatg 15222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 8778975 - 8779453
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaa 171  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||| || ||||||    
T  8778975 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaaagcgaataaa 8779074  T
Q  172 a-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaag 270  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8779075 aacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaag 8779174  T
Q  271 taactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 370  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8779175 taacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatattcagaagcacattttcctcag 8779274  T
Q  371 aacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 469  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  8779275 aacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 8779374  T
Q  470 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8779375 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 8779453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11278921 - 11278432
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11278921 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11278822  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11278821 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 11278722  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11278721 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 11278622  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa------------tttttaa 458  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||            |||||||    
T  11278621 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttttaa 11278522  T
Q  459 tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11278521 tcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 11278432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29940105 - 29939602
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29940105 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29940008  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||     
T  29940007 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29939909  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||| |||||||    
T  29939908 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29939809  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29939808 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29939710  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29939709 agagtcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcagc 29939611  T
Q  539 ccattgatg 547  Q
    |||||||||    
T  29939610 ccattgatg 29939602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29989259 - 29988756
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29989259 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29989162  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||     
T  29989161 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29989063  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||| |||||||    
T  29989062 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29988963  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29988962 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29988864  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29988863 agagtcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcagc 29988765  T
Q  539 ccattgatg 547  Q
    |||||||||    
T  29988764 ccattgatg 29988756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 17010408 - 17010923
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17010408 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17010507  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17010508 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17010607  T
Q  230 gaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || ||  ||||  |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || | ||||||    
T  17010608 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagcttctga 17010705  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||    
T  17010706 agttttagtgctgatgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctaaacagacttcaaaaccaa 17010804  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17010805 actttttattcagagacaagc-aagttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagataaaggctttgta 17010903  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17010904 aatatatcagcccattgatg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 17021214 - 17021729
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  17021214 aagtgtaggttgtgaagtgagttgtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacatcattaatgac 17021313  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaa-gcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17021314 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaaagcttataaaatcattattgcccttttagtaatacactaatacaaatagaccacgtcatagacttttca 17021413  T
Q  230 gaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || ||  ||||  |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || | ||||||    
T  17021414 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgttcccactaacgctgctatgcagaagcaaataatacagcttctga 17021511  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||    
T  17021512 agttttagtgctgatgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctaaacagacttcaaaaccaa 17021610  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17021611 actttttattcagagacaagc-aagttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaattcaaatctttcaacagataaaggctttgta 17021709  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17021710 aatatatcagcccattgatg 17021729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 29898145 - 29897681
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  29898145 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggtgacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 29898048  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||     
T  29898047 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcaaagacttttcagactaataa- 29897949  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||| |||||||    
T  29897948 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaattctgctattcagaagtaaagaacatagcttctgaagttttagtgc 29897849  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29897848 tgatgtcatcttcagaagcatattttcctcaaaacctcatttaagagcttctgatagaccata-gcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttattc 29897750  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 508  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29897749 agagtcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttc 29897681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Original strand, 17963984 - 17964490
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaa--aagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | | ||||||   | | |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17963984 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttaaataaaacgatagaaattcatgtaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgg 17964082  T
Q  139 gggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaacta 237  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |     
T  17964083 gggcgcgtgaaagtaaatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagacacgtt 17964182  T
Q  238 acctttgggtaatgggacagctgtta-caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagt 336  Q
    ||  |  | || |||||||| ||| |  || |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||    
T  17964183 ac--taagttagtgggacagttgtaattaagaagtaacttccaacgtttccactaatcctgctattcagaagcaaagaacacagcttctgaagttttagt 17964280  T
Q  337 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagat-gcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17964281 gctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcataatctcagtgaagagcttctgatgga-ttgatagcttctgaacgaacttcagaaccaaacttctta 17964379  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  17964380 ttcagaggcaagc-aagctttaatcagacacaaaatgcatgttcaaaattttcttaataaaatcaaatctttcaacagttagaggttttgtaaatatatc 17964478  T
Q  536 agcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||    
T  17964479 agcccattgatg 17964490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 49 - 546
Target Start/End: Original strand, 13143421 - 13143922
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  13143421 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 13143520  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctt 242  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | | |  |||    
T  13143521 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcagaca-caatgctt 13143619  T
Q  243 tgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctga 341  Q
    ||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||  |||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||    
T  13143620 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctga 13143719  T
Q  342 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 441  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13143720 tgtcatctttagaagtgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcaga 13143818  T
Q  442 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13143819 gacaagcaagtttt-aatcagacacaaagagcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccg 13143917  T
Q  542 ttgat 546  Q
    |||||    
T  13143918 ttgat 13143922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 49 - 547
Target Start/End: Original strand, 15837532 - 15838031
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| |||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  15837532 agtgagttgtgtgtgtttggtatttatagtgtttttgagtaaaacgtttgcaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatgacaa-ttgggggcgc 15837630  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctt 242  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||     |    
T  15837631 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaaatcaccatagcccttttaagttatacaccaatacaaacaaaccacgtcagagacgtttcaaacaactgc---t 15837727  T
Q  243 tgggtaatgggacagctgttacaaaaag-taactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctga 341  Q
    | | || |||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| || || | |||||||||  | || ||||    
T  15837728 tagttagtgggacaggtgttacttaaaggtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaaccaaagaacacagcttctgaagttctggtactga 15837827  T
Q  342 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 441  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||| || | ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||    
T  15837828 cgtcatcatcagaagcacattttcgtcagaaccttagttaaaagcttctgacggaacata-gcttctgaacagatttcagactcaaacttcttattcaga 15837926  T
Q  442 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15837927 gacaagcaaatttt-aatcagacaaaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatccaatctttccacagttaaaggctttgtaaatatatcagccca 15838025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Original strand, 13075257 - 13075415
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13075257 gaaatgaaagtgtgagatgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcat 13075355  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13075356 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct 13075415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Original strand, 5197394 - 5197891
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  5197394 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 5197493  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    || || |||||||||| ||  |||| ||| |||   ||| ||| |||||||||||  |   || |||| |||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  5197494 gacaa-ttgggggcgcatgaaagtacgttcaaagctaaaaaaatcatcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagatcacgtcagaggcattt 5197592  T
Q  228 caga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    |||| ||||||    || | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  || ||   ||||    
T  5197593 cagacaaactac---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaagcaaggaatacaacttct 5197689  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 425  Q
    ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||                  | |||||||||||||    
T  5197690 gaagtttaagtgctgatg-catcttcaaaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctga------------------acagacttcagaacc 5197770  T
Q  426 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 525  Q
    ||||||||| ||| |   |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||      
T  5197771 aaacttcttgttcaggagcaagcaaattt--actcaaacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatgtttccacagttaaaggtttat 5197868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 265 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30992686 - 30992407
Alignment:
Q  265 aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacattt 363  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||| | ||  | | ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30992686 aaaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcacaaaacccagcttctggagt-tcagatgctgatgtcatcttcagaagcacattt 30992588  T
Q  364 tcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcaga 463  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||| || ||  | ||| |    ||||||||||  |||||||    
T  30992587 tcctcagaacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttcagaacctaaatttctgttcaggagtaagcaaattt--aatcaga 30992492  T
Q  464 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30992491 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaagacttagtaaatatatgagcccattgatgt 30992407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17219585 - 17219376
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||      
T  17219585 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggaccatacttctag 17219487  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   || ||||| ||| |||||||||||    
T  17219486 ttcaggagcaaacaga--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatgaaatatttccttagttaaagacttagtaaatatatc 17219389  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||    
T  17219388 agcccattgatgt 17219376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17251017 - 17250808
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  17251017 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaatctcagttaagagcttctgctggaccata-gtttctgaacagacttcaggaccaaacttctaa 17250919  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  17250918 ttcaggagcaaacaaa--tttaatcagacacaaattgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatc 17250821  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||    
T  17250820 agcccattgatgt 17250808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 465 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17902219 - 17902136
Alignment:
Q  465 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17902219 acaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17902136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 350 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 12393673 - 12393536
Alignment:
Q  350 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 449  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| ||    
T  12393673 tcagaatcacattttcctcagaaccttagtgaagagcttctaatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggcaatca 12393576  T
Q  450 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttt 491  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12393575 a--ttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttt 12393536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17219886 - 17219787
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  17219886 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaagcattaatga 17219787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12389898 - 12389798
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||    
T  12389898 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtatgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaggggaaaaacaaacacaacattaatg 12389799  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  12389798 a 12389798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12389621 - 12389558
Alignment:
Q  335 gtgctgacgtcatcttcagaagcaca-ttttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggac 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12389621 gtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttcctcagaacctcagttaagatcttctgatggac 12389558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17251320 - 17251232
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17251320 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgtgttttctctaagtgttttaagcaaaaacgtttgcaattcagaaagcgacaaacaaaca 17251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15657157 - 15657098
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa 88  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  15657157 aaataaaagtgttagttgtgaagtgagtagtgtgtgattg-tctaagtgtttttagtaaaa 15657098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12393983 - 12393913
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgt-tttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12393983 aaagtgtaggttgtgaagtgagaaatgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattca 12393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18137329 - 18137224
Alignment:
Q  278 caacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctca 377  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||    | |||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18137329 caacgtttccactaactatgctattcaggagcaaagaatttagcttctgaagttaaagtgttggcgtcatcttcagaagcacatttttctcagaatctca 18137230  T
Q  378 attaag 383  Q
     |||||    
T  18137229 gttaag 18137224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12954496 - 12954448
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt 80  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  12954496 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttt 12954448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Original strand, 26871356 - 26871895
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871356 tagcagagaaggttgaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 26871454  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871455 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcacgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 26871554  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26871555 tagaccacgtcagaaacttttcagagaactaccctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 26871654  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    || ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26871655 agtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttttgatggaccagatgctt 26871754  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26871755 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaattaaatctt 26871854  T
Q  507 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871855 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 26871895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21127550 - 21127009
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag 105  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  21127550 tagcagagaaggtttgaaatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttg-aagtgtttttataaaaaacgtttgcaattcaaatg 21127452  T
Q  106 agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127451 agacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 21127352  T
Q  206 atagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcag 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21127351 atagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcag 21127252  T
Q  306 aagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 405  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21127251 aagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgct 21127152  T
Q  406 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 505  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21127151 tctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatct 21127052  T
Q  506 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21127051 ttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 21127009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21168489 - 21167971
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21168489 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaat 21168391  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21168390 gacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 21168291  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  21168290 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaa 21168191  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168190 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaa 21168091  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21168090 ctccttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 21167991  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21167990 atatatcagcccattgatgt 21167971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24421555 - 24421013
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24421555 tagcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 24421457  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24421456 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaga 24421357  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24421356 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggaaagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 24421257  T
Q  307 agc-aaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 405  Q
    | | ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24421256 aacaaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgct 24421157  T
Q  406 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 503  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24421156 tctgaattgacttcagagccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaaatttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaat 24421057  T
Q  504 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24421056 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccactgatg 24421013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 43086927 - 43087443
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086927 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 43087025  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43087026 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 43087125  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  43087126 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 43087225  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43087226 tttagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 43087325  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43087326 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 43087425  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43087426 atatcagcccattgatgt 43087443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24334333 - 24333816
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24334333 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacaaagcattaatg 24334235  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334234 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24334135  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  24334134 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccacttctgaag 24334035  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334034 ttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaactaaac 24333935  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24333934 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 24333835  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24333834 tatatcagcccattgatgt 24333816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 29248449 - 29248966
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248449 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 29248547  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29248548 acaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatacttcaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 29248647  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29248648 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 29248747  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29248748 ttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 29248847  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248848 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 29248947  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29248948 tatatcagcccattgatgt 29248966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9904156 - 9903640
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9904156 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatga 9904058  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9904057 caaattaggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9903958  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||    
T  9903957 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaagt 9903858  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  9903857 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatattcttctgaataaacttcagacccaaact 9903758  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9903757 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 9903658  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9903657 atatcagcccattgatgt 9903640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34796800 - 34796284
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34796800 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatga 34796702  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34796701 caaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34796602  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  34796601 aaaactacattttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 34796502  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34796501 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaacaaact 34796402  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34796401 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 34796302  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34796301 atatcagcccattgatgt 34796284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 40244838 - 40245354
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40244838 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 40244936  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40244937 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 40245036  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  40245037 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 40245136  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40245137 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 40245236  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40245237 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 40245336  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40245337 atatcagcccattgatgt 40245354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 4214124 - 4214641
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4214124 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 4214222  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttt-tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4214223 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4214322  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  4214323 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 4214422  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4214423 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 4214522  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4214523 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4214622  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4214623 tatatcagcccattgatgt 4214641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9769346 - 9768830
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9769346 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 9769248  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9769247 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaaataaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 9769148  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  9769147 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacaattctgaagt 9769048  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9769047 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 9768948  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9768947 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 9768848  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9768847 atatcagcccattgatgt 9768830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39176679 - 39176161
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39176679 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39176581  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39176580 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39176481  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  39176480 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 39176381  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39176380 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 39176281  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39176280 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 39176181  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39176180 atatatcagcccattgatgt 39176161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 90 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22940184 - 22939724
Alignment:
Q  90 gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt- 188  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22940184 gtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttt 22940085  T
Q  189 -gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttccc 287  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22940084 tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttccc 22939985  T
Q  288 actaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagct 387  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22939984 actaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagct 22939885  T
Q  388 tctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattttt 487  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22939884 tctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttt 22939785  T
Q  488 ctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22939784 cttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 22939724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 10271259 - 10271732
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10271259 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10271358  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10271359 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactctttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10271458  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10271459 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10271558  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10271559 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10271658  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10271659 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10271732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11401757 - 11401239
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11401757 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 11401659  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11401658 caaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 11401559  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  11401558 gaaaactactttttgggtaatgggacggctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 11401459  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11401458 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 11401359  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11401358 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 11401259  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11401258 atatatcagcccattgatgt 11401239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 35257277 - 35257750
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35257277 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35257376  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35257377 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35257476  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35257477 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35257576  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35257577 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35257676  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35257677 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 35267902 - 35268375
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35267902 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35268001  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35268002 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35268101  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35268102 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35268201  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35268202 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35268301  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35268302 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 27225711 - 27226184
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  27225711 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggtgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 27225810  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27225811 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 27225910  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27225911 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27226010  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27226011 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 27226110  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27226111 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 27226184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 43349671 - 43350148
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || |||||| |||||||    
T  43349671 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacattaaaaagcgaataaaa 43349770  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43349771 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagagaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43349870  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43349871 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttctcaga 43349970  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  43349971 acctcagttaagagcttttgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 43350070  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43350071 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 43350148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 42 - 548
Target Start/End: Original strand, 22768005 - 22768509
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  22768005 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 22768102  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||     
T  22768103 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataagacatcattgccctttctattatactccaatacaaatacaccacgtcagagacttttcagacta-aaaa 22768201  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| || ||   || |||||| |||| ||    
T  22768202 ctttggttagtgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactagcgttgctattcagaagtaaagaacacaacttatgaagttttagcgc 22768301  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22768302 tgacgtcatcttcataagcatattttcctcagaacctcagttgagagcttttgatggacca-aagcttttgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 22768400  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22768401 agaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtacatggtcaaatttttcttgataaaatcaaatctttccaaagataaaggttttgtaaatatatcagc 22768499  T
Q  539 ccattgatgt 548  Q
    ||||||||||    
T  22768500 ccattgatgt 22768509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 33 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22748109 - 22747635
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22748109 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatga 22748011  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  22748010 cag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcataaatttttca 22747912  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||  | |||| ||||| |||||||| || |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| || || | |||||||    
T  22747911 gactaataac-tttggttaatgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcataagtaaagaacacagcttctgaa 22747813  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22747812 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaa 22747714  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 508  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22747713 cttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttc 22747635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 279 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28727653 - 28727384
Alignment:
Q  279 aacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaa 378  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  28727653 aacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgttgacatcatcttcaaaagcacattttcctcagaacttcag 28727554  T
Q  379 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgtt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28727553 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtt 28727454  T
Q  479 caaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28727453 caaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 28727384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 250 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19308787 - 19308491
Alignment:
Q  250 tgggacagctgttacaaa-aagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatc 348  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19308787 tgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgctgacgacatc 19308688  T
Q  349 ttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagc 448  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  19308687 ttcataagcacattttcctcggaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcggaaccaaactttttattcagaggcaagc 19308589  T
Q  449 aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19308588 aaa-tcttaatcaaacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatg 19308491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28727859 - 28727651
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28727859 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 28727761  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28727760 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcagtgtcctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 28727661  T
Q  226 ttcagaaaac 235  Q
    ||||||||||    
T  28727660 ttcagaaaac 28727651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28707513 - 28707161
Alignment:
Q  192 atactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccac 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||   || | || | |||||| ||||||  || ||| ||| |||||||| ||||    
T  28707513 atacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcgtttcagaa---taactgcttagttagtaggacaggtgttactgaagagtgacttccaacgtttccac 28707417  T
Q  290 taaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 389  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||| ||   |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  28707416 taacactgctatttagaagcaaataatacaacttctaaagtttaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagagtctcaattaagagcttc 28707317  T
Q  390 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 489  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28707316 tgatggaccaaa-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaattttttct 28707220  T
Q  490 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28707219 ttataaaatcaaatattttcacagataaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 28707161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 335 - 548
Target Start/End: Original strand, 24719876 - 24720085
Alignment:
Q  335 gtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctt 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24719876 gtgctgacgtcatctttagaagcacatattcctcagaatctcagttaagagcttctaatgaactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaacttctt 24719973  T
Q  435 attccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 534  Q
    ||||  |  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24719974 attcaaaagcaagtaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccacaggtaaaggcttagtaaatatat 24720071  T
Q  535 cagcccattgatgt 548  Q
    |||| |||||||||    
T  24720072 cagctcattgatgt 24720085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24810689 - 24810501
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24810689 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 24810590  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24810589 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcaga 24810501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 454 - 548
Target Start/End: Original strand, 18943728 - 18943822
Alignment:
Q  454 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18943728 tttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccactattaaaggcttagtaaatatatcagcctattgatgt 18943822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 18942102 - 18942203
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  18942102 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaatgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 18942201  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  18942202 ga 18942203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19308966 - 19308850
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19308966 aagtgtaggttttgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttaaagtaaaaacgttagcaattcagaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 19308867  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtg 147  Q
     |||||||| |||||||    
T  19308866 caaattgggagcgcgtg 19308850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 396
Target Start/End: Original strand, 18943561 - 18943693
Alignment:
Q  264 caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| || |||| | ||  | | ||||| ||| | || |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  18943561 caaaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattaaggagcataaaacccagcttctggagt-tcagatgctgatgtcatcttcataagaacatt 18943659  T
Q  363 ttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgga 396  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18943660 ttcctcagagcctcaattaagatcttctgatgga 18943693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Original strand, 24719586 - 24719676
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24719586 ttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctacgtatttttagtaaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacagcattaatga 24719676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28707663 - 28707603
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28707663 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttggctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattca 28707603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21148683 - 21148632
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagag 385  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21148683 agtgttgatgtcatctttagaagcgcattttcctcagaatctcaattaagag 21148632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Original strand, 16309377 - 16309915
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  16309377 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgatgtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaaggg 16309475  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16309476 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 16309575  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16309576 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 16309675  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 407  Q
    ||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16309676 gcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacctgatgcttc 16309775  T
Q  408 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 507  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16309776 tgaatggacttcagaaacaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 16309875  T
Q  508 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16309876 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 16309915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40463311 - 40462796
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40463311 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgac 40463212  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40463211 aaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaatttttcaga 40463112  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  40463111 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgcttctgaagtt 40463013  T
Q  332 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaactt 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40463012 ttagtcctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaaccaaactt 40462913  T
Q  432 cttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaata 531  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462912 cttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaata 40462813  T
Q  532 tatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||| |||||||||    
T  40462812 tatcagctcattgatgt 40462796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27821499 - 27820982
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821499 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcataagagacaaacaaacatagcattaatga 27821401  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27821400 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 27821301  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  27821300 aaaactaacttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 27821201  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821200 cttagtgctgacgtcatcttcagaatcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 27821101  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaattttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27821100 tcttattcagaggcaaccaattttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 27821001  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27821000 tatatcagcccattgatgt 27820982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Original strand, 3377195 - 3377733
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  3377195 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgttttttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 3377293  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3377294 gacaaacaaacatagcattaaggacaaatagggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaa 3377393  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3377394 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacaactattactaaaagtaactgctaacgatcccactaaccttgctattcaga 3377493  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    || ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3377494 agtaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagttgctt 3377593  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 506  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3377594 cttaacagacttcagaaccaaacttcttattcaaaggcaagcaaa-ttttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctt 3377692  T
Q  507 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3377693 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcaccccattgatg 3377733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14842660 - 14842134
Alignment:
Q  23 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842660 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 14842562  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaga 222  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14842561 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 14842462  T
Q  223 -cttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgt 321  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||     
T  14842461 acttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaataccgc 14842362  T
Q  322 ttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14842361 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaattgacttcag 14842262  T
Q  422 aaccaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaag 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14842261 aaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaaattttaatcagacacaaagtgcatgctcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaag 14842162  T
Q  520 gctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14842161 gctttgtcaatatatcagcccactgatg 14842134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15203386 - 15202855
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15203386 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaagagagacaaacaaacatagcatta 15203288  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203287 atgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 15203188  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||   |||    
T  15203187 ttttagagaactaacctttagttaatgggacaactgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaagtaaagaatacaacttc 15203088  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203087 tgaagttttagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 15202988  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaat----------ttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacaga 514  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15202987 caaacttcttattcagagacaagcaaatttttttttttttttaatcagacgcaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacaga 15202888  T
Q  515 taaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202887 taaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 15202855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4994364 - 4993846
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4994364 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4994266  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994265 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4994166  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994165 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 4994066  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  4994065 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttttgaataaacttcagaaccaaaaa 4993966  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||| | ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4993965 cttcttatccagaggccagcagtttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatatttcaacagataagggttttgtaa 4993866  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4993865 atatatcagcccattgatgt 4993846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 4997974 - 4998492
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4997974 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaagacaaacaaacatagcattaatga 4998072  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4998073 caaattgggggcgcgtgttggtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 4998172  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4998173 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 4998272  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  4998273 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttttgaataaacttcagaaccaaaaa 4998372  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||| | ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4998373 cttcttatccagaggccagcagtttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatatttcaacagataagggttttgtaa 4998472  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4998473 atatatcagcccattgatgt 4998492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19950963 - 19950446
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19950963 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatg 19950865  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19950864 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 19950765  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||  ||||||||    
T  19950764 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagagtaccacttctgaag 19950665  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19950664 ttttagtgctgacgtcatcttcggaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 19950565  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19950564 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19950465  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19950464 tatatcagcccattgatgt 19950446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18759059 - 18758541
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18759059 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaaaagagacgaacaaacatagcattaatga 18758961  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18758960 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaatgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 18758861  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  18758860 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagt 18758761  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18758760 attagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaatagacttcagaatcaaaaa 18758661  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18758660 cttcttattcagaagccagcaattttctaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaa 18758561  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18758560 atatatcagcccattgatgt 18758541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 548
Target Start/End: Original strand, 27192236 - 27192702
Alignment:
Q  84 taaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27192236 taaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccc 27192335  T
Q  184 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27192336 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgt 27192435  T
Q  284 tcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaag 383  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27192436 tcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaag 27192535  T
Q  384 agcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc--aa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  27192536 agcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttctaaa 27192635  T
Q  482 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27192636 ttttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27192702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 22000746 - 22001221
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22000746 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 22000845  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22000846 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 22000945  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000946 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 22001045  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  22001046 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 22001145  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001146 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 22001221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 17922385 - 17922902
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17922385 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 17922483  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17922484 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 17922583  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||    
T  17922584 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaag 17922683  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17922684 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaac 17922783  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17922784 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaattagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacatataaaggttttgtaaa 17922883  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17922884 tatatcagcccattgatgt 17922902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24024037 - 24023520
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24024037 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacacagcattaatg 24023939  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24023938 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 24023839  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||    
T  24023838 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaccgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaatactacttctgaag 24023739  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24023738 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 24023639  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24023638 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagatacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 24023539  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24023538 tatatcagcccattgatgt 24023520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30933056 - 30932541
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30933056 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 30932958  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30932957 caaattgggg-cgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 30932859  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  30932858 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 30932759  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30932758 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccacatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 30932659  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30932658 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 30932559  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30932558 atatcagcccattgatgt 30932541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 454850 - 455366
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  454850 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacacacaaacacagcattaatga 454948  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  454949 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacatcagagactcttcag 455048  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  455049 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacattcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 455148  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  455149 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 455248  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  455249 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 455348  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  455349 atatcagcccattgatgt 455366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 16260152 - 16260669
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16260152 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 16260250  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16260251 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 16260350  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  16260351 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 16260450  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16260451 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 16260550  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260551 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 16260650  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16260651 tatatcagcccattgatgt 16260669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 55751820 - 55751303
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55751820 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 55751722  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55751721 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 55751622  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  55751621 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 55751522  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55751521 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 55751422  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  55751421 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 55751322  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55751321 tatatcagcccattgatgt 55751303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14846469 - 14845995
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  14846469 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaa- 14846371  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14846370 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 14846271  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14846270 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaaacacatattcctcagaa 14846171  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  14846170 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 14846071  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14846070 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 14845995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10747122 - 10746649
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10747122 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10747023  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10747022 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10746923  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10746922 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10746823  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10746822 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10746723  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10746722 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10746649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 10960891 - 10960418
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10960891 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 10960792  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10960791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 10960692  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10960691 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 10960592  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10960591 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 10960492  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10960491 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 10960418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 27660939 - 27661416
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  27660939 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 27661038  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27661039 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 27661138  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661139 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 27661238  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  27661239 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 27661338  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27661339 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 27661416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 36022622 - 36023095
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36022622 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36022721  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36022722 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 36022821  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36022822 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 36022921  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  36022922 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 36023021  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36023022 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36023095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Original strand, 10294970 - 10295474
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10294970 gttgtgaagtgagtagtgtgtatttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaaattggg 10295068  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  10295069 ggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcagactaataac 10295168  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || || | ||||||||| |||||||    
T  10295169 c-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaactaaagaatacagcttctgaagttttagtgc 10295267  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10295268 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatagacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattc 10295366  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10295367 agaggcaagcaaa-tcttaatcagacacagagtgcatgttcaattttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 10295465  T
Q  539 ccattgatg 547  Q
    |||||||||    
T  10295466 ccattgatg 10295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 49511866 - 49512340
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  49511866 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 49511965  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49511966 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 49512065  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49512066 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 49512165  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 473  Q
    || |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  49512166 cagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatgc 49512265  T
Q  474 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49512266 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 49512340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 24644662 - 24645135
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  24644662 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 24644761  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24644762 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 24644861  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24644862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24644961  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24644962 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24645061  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24645062 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 24645135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 32 - 497
Target Start/End: Original strand, 11540307 - 11540771
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11540307 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaagaggacaaacaaacaaagcattaatt 11540405  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11540406 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 11540505  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||  | ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || || | |||||||    
T  11540506 gactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactaaccttgctatttagaagtaaagaacacagcttctgaa 11540604  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11540605 gttttagtcctgacgtcatctttagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaataaacttcagaaccaaa 11540703  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 497  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11540704 cttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaa 11540771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39516791 - 39516597
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa--cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  39516791 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcat 39516693  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcaga 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39516692 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcaga 39516597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 301 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14909279 - 14909035
Alignment:
Q  301 ttcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 400  Q
    |||||||||||| ||  | | |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  14909279 ttcagaagcaaagaattcagcttctgaagttaaagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttccacagaatctcagttaagagcttctgatggaccat 14909180  T
Q  401 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 500  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14909179 a-gcttctgaatagacttcagaatcaaacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaattca 14909083  T
Q  501 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14909082 aatctttccacagttaaaggtttagtaaatatatcagcccattgatgt 14909035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19607148 - 19606947
Alignment:
Q  343 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| || ||| | ||| |      
T  19607148 gtcatcttcagaagcacattttcttcaaaacctcaataaggagcttctgatggactata-gcttctaaat-gacttcagaacctaaattcatgttcagga 19607051  T
Q  443 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccat 542  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19607050 gcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccat 19606953  T
Q  543 tgatgt 548  Q
    ||||||    
T  19606952 tgatgt 19606947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 19575278 - 19575406
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19575278 tagcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 19575376  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19575377 acaaacaaacatagcattaatgacaaattg 19575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15010298 - 15010017
Alignment:
Q  264 caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |   | | ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15010298 caaaaagtaacttccaacgtttccactaactcttctattcaggagcaaagagtccagcttctgaagt-taagatgctgatgtcatcttcagaagcacatt 15010200  T
Q  363 ttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcag 462  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||| |   ||| ||| |||  ||||||    
T  15010199 ttcctcagaatcttagttaagagcttctgatggactata-gcttctgaacaaacttcatgacctaacttcttgttcaggagcaaccaacttt--aatcag 15010103  T
Q  463 acacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15010102 acacaaagtgcatgttcaatcttttttttataaaatcaaatcttttcacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 15010017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 435 - 547
Target Start/End: Original strand, 43246109 - 43246220
Alignment:
Q  435 attccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 534  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43246109 attcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatat 43246207  T
Q  535 cagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||    
T  43246208 cagcccattgatg 43246220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 382 - 548
Target Start/End: Original strand, 16848632 - 16848795
Alignment:
Q  382 agagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaa 481  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16848632 agagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcaggagcaaacaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaa 16848728  T
Q  482 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16848729 atttttctttataaaatcaaatatttcaactgttaaaggcttaataaatatatcagcccattgatgt 16848795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15010484 - 15010413
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga-gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| | | ||||||||    
T  15010484 agtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagaggacaaacaaacacaaaattaatgacatagtgggggcg 15010413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Original strand, 11519400 - 11519432
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgt 60  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11519400 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgt 11519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20786736 - 20786215
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786736 gaaatgaaagtgtgagtagtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 20786638  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786637 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 20786538  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  20786537 ttcagaaaactaacccttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttct 20786438  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20786437 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctgagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaacc 20786338  T
Q  426 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 525  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20786337 aaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttg 20786238  T
Q  526 taaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20786237 taaatatatcagcccattgatgt 20786215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23402621 - 23402081
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23402621 tagcagagaaggtttgagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 23402523  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402522 gacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 23402423  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23402422 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttactaaaagtaactgcaaacgatctcactagccttgctattcaga 23402323  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    |||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402322 agcaaagaataccgcttttgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 23402223  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 506  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23402222 ctgaatggactccagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctt 23402123  T
Q  507 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23402122 tcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23402081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 5294716 - 5295233
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294716 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 5294814  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5294815 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaaatcagagactcttca 5294914  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5294915 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaatgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 5295014  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5295015 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 5295114  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5295115 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 5295214  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5295215 tatatcagcccattgatgt 5295233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34778588 - 34778066
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34778588 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 34778490  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34778489 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 34778390  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||    
T  34778389 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaatagcgcttc 34778290  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  34778289 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttatgaatagacttcagaac 34778190  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  34778189 caaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 34778090  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34778089 gtaaatatatcagcccattgatgt 34778066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20558459 - 20557917
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  20558459 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaat 20558362  T
Q  105 gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20558361 gagacaaacaaacatagcattaatgacaaatttggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 20558262  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  20558261 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacatttgggtaatgagacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattc 20558162  T
Q  304 agaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatg 403  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20558161 agaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacttcagttaagagcttctgatggaccagatg 20558062  T
Q  404 cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20558061 cttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaat 20557962  T
Q  504 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20557961 ctttcaacagataaaggttttataaatatatcagcccattgatgt 20557917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 39359183 - 39358666
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39359183 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 39359085  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39359084 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 39358985  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39358984 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 39358885  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39358884 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 39358785  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    || |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39358784 tttttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 39358685  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39358684 tatatcagcccattgatgt 39358666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 34058643 - 34058104
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34058643 tagcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttgtgaggtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaaga 34058545  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34058544 gacaaacaaacatagcattaatgacaaatagagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 34058445  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  34058444 tagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggatagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctatttaga 34058345  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    |||||| || || | |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34058344 agcaaagaatacagcttctaaagttttagtgttgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcatttatgagcttctgatgaaccagatgctt 34058245  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34058244 ctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaaacaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctt 34058145  T
Q  507 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34058144 tcaacagataaaggctttgtaaatatatcaacccattgatg 34058104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 548
Target Start/End: Original strand, 24933864 - 24934344
Alignment:
Q  69 tttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 167  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24933864 tttaagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaa 24933963  T
Q  168 taaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933964 taaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa 24934063  T
Q  268 aagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcct 367  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24934064 aagtaactgcaaacgatcccactagccatgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcct 24934163  T
Q  368 cagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacaca 467  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24934164 cagaaccttagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacaca 24934263  T
Q  468 aagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24934264 aagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24934344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40397049 - 40396532
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40397049 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 40396951  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40396950 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtcaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 40396851  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  40396850 gaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatatcacttctgaag 40396751  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40396750 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagaacttctgatggaccagatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 40396651  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40396650 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 40396551  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40396550 tatatcagcccattgatgt 40396532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 545
Target Start/End: Original strand, 17450882 - 17451400
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17450882 tagcagagaagattaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaaaagag 17450980  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450981 acaaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgtcctttttgttatactccaatacaaat 17451080  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17451081 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaacttccaacgatcccactagccttgctattcagaa 17451180  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 407  Q
    ||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||                  |||||    
T  17451181 gcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcaccttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaaga------------------gcttc 17451262  T
Q  408 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatcttt 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17451263 tgaatggacttcagaaccaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttt 17451362  T
Q  508 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattga 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17451363 caacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattga 17451400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 19470608 - 19470108
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||    
T  19470608 tagcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgtaattcggaaga 19470510  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470509 gacaaacaa---tagcattaatgacaaattgggggcgcgtgctagtatgttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 19470413  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcaga 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19470412 tagaccacgtcagagactcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcaga 19470313  T
Q  307 agcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgctt 406  Q
    |||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19470312 agcaaagaataccgctcctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgctt 19470213  T
Q  407 ctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaat---ttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 503  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19470212 ctgaatggacatcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaattttttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaat 19470113  T
Q  504 ctttc 508  Q
    |||||    
T  19470112 ctttc 19470108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31840107 - 31839591
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31840107 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 31840009  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31840008 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 31839909  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  31839908 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 31839809  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31839808 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 31839709  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31839708 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 31839609  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31839608 atatcagcccattgatgt 31839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 15997471 - 15997987
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15997471 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtgtttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 15997569  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15997570 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 15997669  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  15997670 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 15997769  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15997770 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 15997869  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15997870 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 15997969  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15997970 atatcagcccattgatgt 15997987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 14562227 - 14562744
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14562227 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 14562325  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14562326 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 14562425  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  14562426 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 14562525  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14562526 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaacatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 14562625  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14562626 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 14562725  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14562726 tatatcagcccattgatgt 14562744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22153203 - 22152686
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22153203 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacatcattaatga 22153105  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22153104 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22153005  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  22153004 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 22152905  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22152904 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcataacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 22152805  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152804 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 22152705  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22152704 tatatcagcccattgatgt 22152686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Original strand, 1115450 - 1115993
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115450 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 1115549  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1115550 attaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaa 1115649  T
Q  223 cttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| |    
T  1115650 cttttcagaaaaccaacctttgggtaatgagacagctgttacacaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgct 1115748  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctg-------------------atggaccagatg 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                   |||||| | |||    
T  1115749 tctgaagttttagtgctgacgtcgtcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatggactaaatg 1115848  T
Q  404 cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  1115849 cttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacgaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaattaaat 1115948  T
Q  504 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1115949 ctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 1115993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 39495060 - 39495578
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39495060 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 39495158  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39495159 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 39495258  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  39495259 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 39495358  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39495359 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 39495458  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39495459 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 39495558  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39495559 atatatcagcccattgatgt 39495578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24814556 - 24814083
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  24814556 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 24814457  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24814456 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 24814357  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814356 gccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24814257  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24814256 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 24814157  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24814156 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24814083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6982493 - 6981975
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6982493 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 6982395  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6982394 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6982295  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  6982294 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 6982195  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6982194 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 6982095  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6982094 cttcttattcagaggcaatcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 6981995  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6981994 atatatcagcccattgatgt 6981975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23302965 - 23302447
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23302965 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 23302867  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23302866 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 23302767  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  23302766 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 23302667  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23302666 ttttagtgttgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 23302567  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23302566 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 23302467  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23302466 atatatcagcccattgatgt 23302447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9342602 - 9342125
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9342602 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 9342503  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9342502 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 9342403  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342402 aactgccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 9342303  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  9342302 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaa 9342203  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9342202 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9342125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22682804 - 22682286
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22682804 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 22682706  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22682705 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22682606  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    ||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  22682605 aaaactgctttttggataatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 22682506  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22682505 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 22682406  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22682405 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 22682306  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22682305 atatatcagcccattgatgt 22682286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23703427 - 23702950
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  23703427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23703328  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23703327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23703228  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23703227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 23703128  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  23703127 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 23703028  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23703027 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23702950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 30231640 - 30232117
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  30231640 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 30231739  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30231740 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 30231839  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30231840 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 30231939  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  30231940 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 30232039  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30232040 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 30232117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42049427 - 42048950
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42049427 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 42049328  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42049327 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 42049228  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42049227 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 42049128  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  42049127 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 42049028  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42049027 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 42048950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 14451226 - 14451703
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14451226 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 14451325  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14451326 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 14451425  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14451426 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 14451525  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||     
T  14451526 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaatttttcaatcagacacaaaa 14451625  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14451626 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 14451703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 24821094 - 24821567
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24821094 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24821193  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24821194 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24821293  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24821294 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24821393  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24821394 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 24821493  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24821494 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24821567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14036685 - 14036212
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14036685 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 14036586  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14036585 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 14036486  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036485 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 14036386  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  14036385 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 14036286  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14036285 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 14036212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 27046454 - 27046928
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27046454 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27046553  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27046554 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27046653  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046654 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27046753  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 473  Q
    || |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||    
T  27046754 cagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatgc 27046853  T
Q  474 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27046854 atgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27046928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23368583 - 23368106
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  23368583 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 23368484  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23368483 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 23368384  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23368383 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 23368284  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  23368283 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 23368184  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23368183 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27466805 - 27466332
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27466805 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 27466706  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27466705 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 27466606  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27466605 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcattttcagaagcacattttcctcagaacct 27466506  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27466505 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 27466406  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27466405 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 27466332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 36586690 - 36587208
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36586690 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 36586788  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36586789 caaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 36586888  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  || |||||    
T  36586889 gaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttttgaag 36586988  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36586989 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 36587088  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36587089 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 36587188  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36587189 atatatcagcccattgatgt 36587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17613705 - 17613232
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  17613705 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 17613606  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17613605 cattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 17613506  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613505 tccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 17613406  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  17613405 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 17613306  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17613305 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17613232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24573715 - 24573242
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24573715 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24573616  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24573615 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24573516  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24573515 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24573416  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24573415 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 24573316  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24573315 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24573242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17725565 - 17725088
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  17725565 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtcaaaaagcgaataaaa 17725466  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17725465 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 17725366  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17725365 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 17725266  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  17725265 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 17725166  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17725165 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 17725088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15746616 - 15746139
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  15746616 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacagacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 15746517  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15746516 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 15746417  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15746416 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 15746317  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||     
T  15746316 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacccaaaa 15746217  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15746216 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 15746139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31355181 - 31354704
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  31355181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 31355082  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31355081 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 31354982  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31354981 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 31354882  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  31354881 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 31354782  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31354781 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 31354704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Original strand, 21418543 - 21419058
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21418543 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgttttaagtaaaaacgattgcaattcaaaaaggagacaaacaaacaaagcat 21418641  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21418642 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatt 21418741  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    |||||||  | ||||||||   ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||   ||    
T  21418742 tttcagactaataaccttt-attaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacaactt 21418840  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  21418841 ctgaagtgttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcatcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagattctgaataaacttcagaa 21418939  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21418940 ccaaacttcttattcagaggcaag-aaaatcttaat----cacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctt 21419034  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21419035 tgtaaatatatcagcccattgatg 21419058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35222149 - 35221672
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  35222149 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 35222050  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35222049 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 35221950  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35221949 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 35221850  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  35221849 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttatttagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 35221750  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35221749 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 35221672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36694345 - 36693868
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36694345 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36694246  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36694245 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36694146  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36694145 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaggcacattttcctcaga 36694046  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  36694045 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 36693946  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36693945 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36693868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 37734181 - 37734658
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  |||||| |||||||    
T  37734181 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaattacgtcaaaaagcgaataaaa 37734280  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37734281 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 37734380  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37734381 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 37734480  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  37734481 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaactttagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 37734580  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37734581 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 37734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 32 - 547
Target Start/End: Original strand, 13527488 - 13528002
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13527488 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgaaattcataaggggacgaacaaacatagcattaatga 13527587  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13527588 caaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaaacttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaaattttca 13527687  T
Q  230 gaaaactaac--ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctg 326  Q
    ||   |||||  | |||| ||||||||||| ||||||  | | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||   |||||    
T  13527688 ga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagacgcaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttctg 13527784  T
Q  327 aagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  13527785 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctaaacagacttcagaacca 13527883  T
Q  427 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 526  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13527884 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaat-tttcaacagttaaaggctttgt 13527981  T
Q  527 aaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13527982 aaatatatcagcccattgatg 13528002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 21672545 - 21672023
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  21672545 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcagaaaaggggacaaacaaacatagc 21672447  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21672446 attaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagag 21672347  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccg 320  Q
    |||| |||||     |||||| || || ||| |||| ||||||  | | ||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||| ||| || || |    
T  21672346 acttatcagacttacaacctt-ggttagtggcacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcttcaactaaccctgttattcagaagtaaagaacacag 21672248  T
Q  321 tttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttca 420  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  21672247 cttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcgcattttcctcataacctcagttaagagcttctaatggaccata-gcttctgaataaacttca 21672149  T
Q  421 gaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 520  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21672148 gaaccaaacttcttaatcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaagg 21672050  T
Q  521 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21672049 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 21672023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 77 - 399
Target Start/End: Original strand, 24592280 - 24592603
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24592280 tttttattaaaacgtttgtaattcagaatggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 24592379  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24592380 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgttagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 24592479  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592480 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 24592579  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacca 399  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  24592580 cagttaagagcttctgatgaacca 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 341
Target Start/End: Original strand, 27607595 - 27607905
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27607595 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 27607693  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  27607694 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttta 27607793  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  27607794 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttccaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcaaaagcaaagaataccgcttctgaag 27607893  T
Q  330 tcttagtgctga 341  Q
    | ||||||||||    
T  27607894 ttttagtgctga 27607905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 547
Target Start/End: Original strand, 23482388 - 23482892
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggc 142  Q
    |||||||  |||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  23482388 agtgagttatgtgtgtttggtttatatagtgttttgagtaaaaacgttagcaattcagaaaggggacaaacaaacacagtattaatgacaaattgagggc 23482487  T
Q  143 gcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacc 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||     
T  23482488 gcgtgttagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagatcacgtcggagacttttcagacaa--aact 23482585  T
Q  241 t-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
      |||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||| || |    ||||||||| |||||||    
T  23482586 gcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacatttccactaactctgctgttcagaagtaaagaatagaacttctgaagttttagtgc 23482685  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  23482686 tgacgtcaccttcagaagcgcattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaa-gcttctgaacaaacatcagaaccaaaattcttattc 23482784  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     ||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23482785 agaagcaaggaaatctt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatcttttaacagttaaaggctttgtaaatatatcagc 23482883  T
Q  539 ccattgatg 547  Q
    |||||||||    
T  23482884 ccattgatg 23482892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 337 - 548
Target Start/End: Original strand, 27616652 - 27616863
Alignment:
Q  337 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27616652 gctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttat 27616751  T
Q  437 tccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 536  Q
    || ||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27616752 tcagaggcaagcagtttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatca 27616851  T
Q  537 gcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||    
T  27616852 gcccattgatgt 27616863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21613242 - 21612726
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  21613242 atgaaagtgtaggttttaaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 21613143  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttt 226  Q
    ||| || ||||||||||| | |||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  21613142 tgacaa-ttgggggcgcgagatagtac-tttcaaagctaaaaaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagcgtt 21613045  T
Q  227 tcagaaaactaacctttgggtaa-tgggacagctgttacaaaaag--taactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    |||||    ||||   |  || | |||||||| ||||||   |||  ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||  | | ||    
T  21613044 tcagag---taactgctaagttagtgggacaggtgttacttgaagggtaacttccaacgtttccactaatcctgctattcaggagcaaagaattcagctt 21612948  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    |||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  21612947 ctgaagttaaagtgctgacatcatcttcagaagcccattttcctcagaatctcagttaaaagcttctgatggaccata-gcttctgagaagacttcagaa 21612849  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||  ||| |   ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  21612848 ccaaacttctagttcaggagcaagcaaa--ttcaatcagacacaaggtgcatgttcaaatttttctttataaattcaaatctttccagagttaaaggctt 21612751  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21612750 agtaaatatatcagcccattgatgt 21612726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23433869 - 23433770
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23433869 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 23433770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23445236 - 23445135
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  23445236 gaaagtgtaggttgtgaattgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacaacattaat 23445137  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  23445136 ga 23445135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 24932375 - 24932439
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 71  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24932375 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 24932439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 27377018 - 27377537
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27377018 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27377117  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27377118 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27377217  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27377218 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 27377317  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27377318 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaaaa 27377417  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27377418 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaaccgataaaggttttgtaa 27377517  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27377518 atatatcagcccattgatgt 27377537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 27467375 - 27467894
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27467375 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttttattaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatga 27467474  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27467475 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttatcag 27467574  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27467575 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaataataccgtttctgaagt 27467674  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27467675 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaaaa 27467774  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27467775 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaaccgataaaggttttgtaa 27467874  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27467875 atatatcagcccattgatgt 27467894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9119065 - 9118549
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9119065 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 9118967  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9118966 caaattgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 9118867  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  9118866 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgtcaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 9118767  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9118766 cttagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 9118667  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9118666 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttcaacagataaaggttttgtaaat 9118567  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9118566 atatcagcccattgatgt 9118549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20036502 - 20035962
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  20036502 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtctgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaat 20036405  T
Q  105 gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20036404 gagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtaca 20036305  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattca 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  20036304 aatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactaacca-gctattca 20036206  T
Q  305 gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgc 404  Q
     ||||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20036205 aaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaggcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgc 20036106  T
Q  405 ttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20036105 ttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatc 20036006  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20036005 tttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 20035962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 27497930 - 27498447
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27497930 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttgttaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 27498029  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27498030 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaattgcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 27498129  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||     
T  27498130 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagta 27498229  T
Q  332 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27498230 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagtcaagagtttctgatggaccagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaact 27498329  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27498330 tcttattcagaagccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcaagttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataagggttttgtaaat 27498429  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27498430 atatcagcccattgatgt 27498447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 26037840 - 26038358
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26037840 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaatcgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagtattaatga 26037938  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26037939 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaagtgcagataaaacatcattgccctttttgtcatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 26038038  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26038039 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 26038138  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  26038139 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaactttagaaccaaaaa 26038238  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26038239 cttcttattcagaggccagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 26038338  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26038339 atatatcagcccattgatgt 26038358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 547
Target Start/End: Original strand, 25798056 - 25798591
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25798056 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgattttatcaaaacgtttgcaattcagaagag 25798154  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25798155 acaaacaaacatagcattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagttcaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 25798254  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||          | ||| |||    
T  25798255 agaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgt---ca----------tcttctgaa 25798341  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttc 407  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25798342 gcaaagaataccgcttctgaagtattagtgctgacgttatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttt 25798441  T
Q  408 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25798442 tgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaatttttttttttttttaatcagacgcaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaa 25798541  T
Q  498 acaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25798542 tcaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 25798591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 32968520 - 32968003
Alignment:
Q  31 tgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  32968520 tgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatc 32968422  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32968421 acaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 32968322  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  32968321 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 32968222  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32968221 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 32968122  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32968121 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 32968022  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32968021 tatatcagcccattgatgt 32968003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 34813736 - 34813220
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34813736 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 34813638  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34813637 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacattattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 34813538  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  34813537 aaaactaccttttggataatgggacagctgttacatgaagtaactgccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 34813438  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34813437 tttagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgattctgaataaacttcagaaccaaact 34813338  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34813337 tcttattcagaagcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 34813238  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34813237 atatcagcccattgatgt 34813220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 3665694 - 3666170
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3665694 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 3665793  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3665794 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 3665893  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3665894 actgccaacgttcccgctaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 3665993  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 471  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3665994 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaat 3666093  T
Q  472 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3666094 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 3666170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 12859150 - 12859675
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12859150 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12859248  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccc---------tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12859249 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgcccccttttttttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 12859348  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgt 321  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |      
T  12859349 actcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacac 12859448  T
Q  322 ttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  12859449 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcag 12859548  T
Q  422 aaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12859549 aaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttattaataaaatcaaatctttcaacagataaaggt 12859648  T
Q  522 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12859649 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 12859675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 26869029 - 26869546
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26869029 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 26869127  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26869128 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 26869227  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  26869228 aaacctaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 26869327  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26869328 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaac 26869427  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26869428 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 26869527  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26869528 tatatcagcccattgatgt 26869546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12723370 - 12722893
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12723370 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 12723271  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12723270 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 12723171  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723170 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 12723071  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  12723070 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 12722971  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12722970 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 12722893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 25791982 - 25792458
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25791982 agtgttttttttaaaacgtttgtaattcagaggggactaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 25792081  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25792082 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 25792181  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25792182 actgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 25792281  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 471  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  25792282 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaat 25792381  T
Q  472 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25792382 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25792458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 33 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18830881 - 18830368
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18830881 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaagagggaacaaacaaacatagcattaatga 18830783  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18830782 caaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcag 18830683  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||| || || | ||||||||    
T  18830682 actaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctatttagtagtaaagaatacagcttctgaag 18830584  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  18830583 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttatgatggacca-aagcttctgaataaatttcagaaccaagc 18830485  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18830484 ttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaa 18830386  T
Q  530 tatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18830385 tatatcagcccattgatg 18830368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 26029691 - 26030164
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  26029691 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 26029790  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26029791 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 26029890  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26029891 accaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 26029990  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||    
T  26029991 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaataca 26030090  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26030091 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 26030164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 27346014 - 27346489
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27346014 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27346113  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27346114 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27346213  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27346214 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27346313  T
Q  376 ca-attaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||  |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||    
T  27346314 cagtttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatg 27346413  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27346414 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgcaaatatatcagcccattgatgt 27346489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 27406754 - 27407229
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  27406754 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 27406853  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27406854 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 27406953  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27406954 gccagcgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 27407053  T
Q  376 ca-attaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||  |||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||    
T  27407054 cagtttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagccatttttcaatcagacacaaaatg 27407153  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27407154 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgcaaatatatcagcccattgatgt 27407229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25731434 - 25730916
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25731434 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacatagcatt 25731336  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25731335 aatgacag-ttgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatactt 25731237  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||  |  ||| ||||| || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || | |||    
T  25731236 ttcagactaaaaac-tttggttagttggacaggtgttactaaaatgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagcttc 25731138  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  25731137 tgaagttttagtgctgacgtgatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctggtggaccata-gcttctgaacacacttcagaac 25731039  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  25731038 caaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaggtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggtttt 25730940  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25730939 gtaaatatatcagcccattgatgt 25730916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 16953278 - 16953752
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  16953278 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 16953377  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgtt-acaaaaagtaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16953378 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaac 16953477  T
Q  275 tgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 374  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16953478 taccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacc 16953577  T
Q  375 tcaattaagagcttctgatggaccaga-tgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgc 473  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  16953578 tcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgc 16953677  T
Q  474 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16953678 atgttcaagtttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtcaatatatcagcccattgatgt 16953752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Original strand, 22290211 - 22290728
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  22290211 aaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaatttaaaaggggacaaacaaacaaagcatt 22290309  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  22290310 aatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgccctttttgttctactccaatacaaatagacaacgtcggagattt 22290409  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||  | ||||||| || ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  22290410 ttcagactaataacctt-ggttaatgggacaggtgtttctaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagcttc 22290508  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  22290509 tgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctg-ataaacttcagaac 22290606  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22290607 caaacttcttattcataggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 22290705  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22290706 gtaaatatatcagcccattgatg 22290728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 4635193 - 4635670
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  4635193 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 4635292  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4635293 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 4635392  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635393 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 4635492  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  4635493 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaagcttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 4635592  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4635593 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 4635670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 32307580 - 32307103
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  32307580 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 32307481  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32307480 acatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 32307381  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307380 aacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 32307281  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  32307280 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 32307181  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32307180 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 32307103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 397
Target Start/End: Original strand, 12369900 - 12370292
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt--ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12369900 tagcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagcgagtagtgtgtgttttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaa 12369999  T
Q  105 gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12370000 gagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaaacaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 12370099  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattca 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12370100 aatagaccacgttagagacttttcagaaaactatcctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattca 12370199  T
Q  305 gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggac 397  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12370200 gaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggac 12370292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 32 - 547
Target Start/End: Original strand, 13917474 - 13917989
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13917474 gaaagtgtgatttgtgaagtaagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaggggacaaacaaacatagcattaatga 13917572  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13917573 caaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcatataagtcatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 13917672  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt-aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    | |  | ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||   || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||    
T  13917673 aaactaataacctt-ggttaatgggacaggtgttactaaaacagaattggcaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaatacagcttctga 13917771  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  13917772 agttttagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgga-caaaagcttctgaataaacttcagaaccaa 13917870  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13917871 acttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatcattcaacagttaaaggctttgta 13917969  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13917970 aatatatcagcccattgatg 13917989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 21123715 - 21124228
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21123715 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21123814  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21123815 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 21123914  T
Q  231 aaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    | ||  ||||  |||| || |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  21123915 acaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgacaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaag 21124012  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21124013 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagagtattttcctcagaacctcagttaagtgcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaac 21124111  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21124112 ttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattattcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaa 21124210  T
Q  530 tatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21124211 tatatcagcccattgatg 21124228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18922031 - 18921686
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||    
T  18922031 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaag-gag 18921934  T
Q  108 acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18921933 acaaacaaacataacattaatgacaaattgagggcgcgtgttagtaagtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactctaatacaaat 18921834  T
Q  208 agaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaa 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18921833 agaccaagtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaa 18921734  T
Q  308 gcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaa 355  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18921733 gcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaa 18921686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 548
Target Start/End: Original strand, 18547605 - 18548124
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  18547605 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 18547704  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  18547705 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatggaccacgtcagaaa-tt 18547803  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||     |||||| || |||||||||||  |||||  | | | ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||| || ||   |||    
T  18547804 ttcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggagttactgagacgcaactgccaacgattccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttc 18547902  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  18547903 tgaagttttggtgctcacgtcatcttcagaagcacattttcctgagaacctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcagaac 18548001  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18548002 caaacttcttattcagaggcacgcaaatctt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaattttttttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttt 18548100  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  18548101 gtaaatatatcagccttttgatgt 18548124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 85 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19457915 - 19457459
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaac-atcattgccc 183  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||  ||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  19457915 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaacgacaaat-gggggcgtgtgaaagtacatttaaaagcttataaaaatatcattgccc 19457817  T
Q  184 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa-aagtaactgccaac 281  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  19457816 ttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaac 19457719  T
Q  282 gttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatta 381  Q
     || ||||||| | ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19457718 atttccactaatcctgccattcaaaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtta 19457619  T
Q  382 agagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaa 481  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19457618 agagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaga-tcttaatcagacaaaaagtgcatgttcaa 19457521  T
Q  482 atttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 543  Q
    ||| ||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457520 attcttcttaataaagtcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 19457459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25682682 - 25682257
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  25682682 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagggaacaaacaaacataacattaatgacag-ttggg 25682585  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||     
T  25682584 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagtatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagatacttttcagacta-aaaa 25682486  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgc 338  Q
    ||| || || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || | ||||||||| |||||||    
T  25682485 cttaggttagttggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactatccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgc 25682386  T
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25682385 tgacgtaatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacacacttcagaaccaaacttcttattc 25682287  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 469  Q
      || |||||||| | |||||||||||||||    
T  25682286 aaaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaa 25682257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 22380263 - 22380777
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||     
T  22380263 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 22380362  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22380363 aaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaa-gcttataaaatcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttca 22380461  T
Q  230 gaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || ||  |||   |||| || |||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||  |||  |||| ||||||| || || | ||||||    
T  22380462 gacaa--aactgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcatcgtttccactaactctgccgttcataagcaaagaatacagcttctga 22380559  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  22380560 agtcttagtgctgatgtcatcttcataagcatattttccttagagtcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccac 22380658  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  22380659 acttcctattcagaggcaagcaaatctt-aatcagatacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggttttgtg 22380757  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22380758 aatatatcagaccattgatg 22380777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 547
Target Start/End: Original strand, 1655062 - 1655524
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  1655062 aaaacgtttgcgattcagaggagacaaacaaacacggcattaatgacag-ttgggggcgcgtgatagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 1655160  T
Q  184 ttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaa 280  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||   |||| || |||||||| ||||||  || ||||||| ||||    
T  1655161 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagaggcttttcagacaa--aactgcttggttagtgggacaggtgttactgaatagtaactaccaa 1655258  T
Q  281 cgttcccactaaccttgctattca-gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaat 379  Q
    |||| ||||||||  | || || | ||| |||| || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |    
T  1655259 cgtttccactaacactactgtttaagaatcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcatattttcctcagaatttcagt 1655358  T
Q  380 taagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc 479  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1655359 taagagcttcagatggaccata-gcttctgaacagacttcagtcccaaacttcctattcagaggcaagcaaatttt-aatcagatacaaagtgcatgttc 1655456  T
Q  480 aaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1655457 aaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 1655524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 17051676 - 17052192
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaa-gtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | || ||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||    
T  17051676 aagtgtaagttgtgaagtgagtggtgtgcgtttttgtaaaagtgtttaaagtaaaaacgttaccaattcaggaaggggacaagcaaacacagcattaatg 17051775  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
    | ||||||||||||||||  ||||  || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  17051776 acaaattgggggcgcgtgaaagtacattcaaact-aaataaaatcatcattgcccttttagttatacgccaataccaatagaccatgtcagaggtttttc 17051874  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    ||  |  |  |  |  | || |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||   | ||||||||| ||| | ||||| | ||||||    
T  17051875 aggcacgttgc--taagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactcctaacgtttccactaatactactattcagaggcagagaaaacagcttctga 17051972  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt-aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 426  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||   |||||||| | |||||||||||||    
T  17051973 agttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagtttaagagcttctgatagatcaatagcttctgattggacttcagaacca 17052072  T
Q  427 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 526  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  17052073 aacttattattcagaggcaagcaagcttt-agtcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttagaggttttgt 17052171  T
Q  527 aaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17052172 aaatatatcagcccattgatg 17052192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14066056 - 14065553
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttg---ttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    |||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  14066056 agtgagtagtgtgtgtttggtatttatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaaagagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggagcg 14065957  T
Q  144 cgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcag-agacttttcagaaaactaacc 240  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||        
T  14065956 cgtgatagtacgttt-aaagcaaaaataatcatcattgccctttttagttatacgccaatacaactaaaccacgtcagaaaacttttcagaaaact---g 14065861  T
Q  241 tttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcc-aacgttcccactaaccttgc-tattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tg 337  Q
     |  | || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |   ||| |||||||||||| | | | ||| ||||||||| | || ||    
T  14065860 ctaagttagtgggacaggtgttactaaaagtaactgccaaacgattccacttattctgcttattcagaagcacaaagatccgcttctgaagt-tcagatg 14065762  T
Q  338 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttat 436  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  14065761 ctaatgtcaacatcagaagcatattttcctcagaatctcaataaagagcttctgatgggcta-ttgcttctgaaccaacttcagaacctaaacttcttat 14065663  T
Q  437 tccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 536  Q
    || |   ||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  14065662 tcaggagcaagc-aactgttattcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaattgttaaaggttttgtaaatatatca 14065564  T
Q  537 gcccattgatg 547  Q
    |||||||||||    
T  14065563 gcccattgatg 14065553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 17783732 - 17783943
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag-aga 108  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17783732 gcagagaaagtttaga-gaaaagaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggaga 17783830  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca-aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17783831 caaacaaacaaagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaat 17783930  T
Q  208 agaccacgtcaga 220  Q
    |||||||||||||    
T  17783931 agaccacgtcaga 17783943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 286 - 548
Target Start/End: Original strand, 22809560 - 22809819
Alignment:
Q  286 ccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagag 385  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||  | |  ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22809560 ccactaactttgctattcaggagcaaagaattcagcgtctgaagttaaagtgctgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagag 22809659  T
Q  386 cttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaattt 485  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | |||||  ||| |    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22809660 cttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaacttatcttctagttcaggaggaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaattt 22809756  T
Q  486 ttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22809757 ttctttataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 22809819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 548
Target Start/End: Original strand, 16880403 - 16880916
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||| | |||||||||     
T  16880403 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttgttagtaaaaatgtttgcaactcggaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 16880502  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt--gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    || ||||||||||||| |||||  || ||| || || ||  ||||||||||| ||    || |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16880503 aa-ttgggggcgcgtgatagtaaattcaaa-gctaaaaagtcatcattgcccgttaaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcgtttca 16880600  T
Q  230 gaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgcta-ttcagaagcaaataaaaccgtttctg 326  Q
    ||    ||||   || | || |||| | | ||||||  || ||||||| |||||||| |||||| |  | ||  |||||||||||  || ||   |||||    
T  16880601 gag---taactgcttagttagtgggtctggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactatcactacttgttcagaagcaaggaatacatcttctg 16880697  T
Q  327 aagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 426  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  16880698 aagtttaagtgctgacatcatcatcagaagcacattttcttcagaatcttagttaagagcttctgatggaccaaa-gcttatgaacggacttcagaacca 16880796  T
Q  427 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 526  Q
    |||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  16880797 aacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatattcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacacttaaaggcttagt 16880894  T
Q  527 aaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16880895 aaatatatcagcccattgatgt 16880916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 399
Target Start/End: Original strand, 11239925 - 11240147
Alignment:
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctt--tgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaa 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  |  ||| ||||||||||| |||||| || | ||||    
T  11239925 attgcccttttagttatactccaatacgaatagaccacgtcagagacttttcaga---ctaacaatattggttaatgggacaggtgttactaagacgtaa 11240021  T
Q  274 ctgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaac 373  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11240022 ctgccaatgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaac 11240121  T
Q  374 ctcaattaagagcttctgatggacca 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11240122 ctcaattaagagcttctgatgaacca 11240147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 416 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 18921693 - 18921562
Alignment:
Q  416 cttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagat 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18921693 cttcagaacaaaacttcttattcaaagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagat 18921594  T
Q  516 aaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921593 aaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 18921562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 322 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7665916 - 7665830
Alignment:
Q  322 ttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7665916 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccatacgcttct 7665830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 536
Target Start/End: Original strand, 25630554 - 25630734
Alignment:
Q  350 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 449  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||| |   ||||||||| |  |||||||| | || ||| ||||| |||  |||||    
T  25630554 tcagaagcacattttcctcataatctcagtgaagagcttttgatggactatg-gcttctgaaaa--cttcagaatccaaattcctattcagaggaaagca 25630650  T
Q  450 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatca 536  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || || |||||||||    
T  25630651 c---tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacaattaaagggttagtgaatatatca 25630734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 7665537 - 7665649
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7665537 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaatgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggg 7665635  T
Q  141 gcgcgtgttagtat 154  Q
    ||||||||| ||||    
T  7665636 gcgcgtgtttgtat 7665649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 11239823 - 11239920
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  11239823 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaggtgttttgagtaaagcgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 11239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20139026 - 20138949
Alignment:
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20139026 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 20138949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 548
Target Start/End: Original strand, 22193843 - 22193920
Alignment:
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22193843 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 22193920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 22809510 - 22809559
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttt 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22809510 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtattttgtctaagtgttt 22809559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 23465938 - 23465396
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  23465938 tagcagagaaggtttgagatgaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaatg 23465840  T
Q  106 agacaaacaaacatagcattaatga-aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23465839 agacaaacaaacatagcattaatgacaaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 23465740  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattca 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23465739 aatagaccatgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattca 23465640  T
Q  305 gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgc 404  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23465639 gaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgatgtcaccttcagaagcacattttcctcagaaccttagttaagagcttctgatggaccagatgc 23465540  T
Q  405 ttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23465539 ttctgaatggactccagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatc 23465440  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465439 tttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 23465396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Original strand, 19229028 - 19229569
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaag 105  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19229028 tagcagagaaggtttgaaatgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaag 19229127  T
Q  106 agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19229128 agacaaacaaacatagcattaatgacaaattaggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaa 19229227  T
Q  206 atagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcag 305  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  19229228 atagaccacgtcagaaatttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcca-gctattcag 19229326  T
Q  306 aagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 405  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19229327 aagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgct 19229426  T
Q  406 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 505  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19229427 tctaaatggacttcagaaccaagcttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatct 19229526  T
Q  506 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19229527 ttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 19229569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 19132954 - 19133471
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19132954 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacataacattaatg 19133052  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19133053 acaaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 19133152  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  19133153 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 19133252  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19133253 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 19133352  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19133353 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 19133452  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19133453 tatatcagcccattgatgt 19133471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 26115546 - 26116062
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26115546 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 26115644  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26115645 acaaattgggg-cgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 26115743  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  26115744 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaatatcgcttctgaag 26115843  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26115844 tcttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcatttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 26115943  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115944 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 26116043  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  26116044 tatatcagctcattgatgt 26116062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Original strand, 19422575 - 19423116
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  19422575 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagggagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaat 19422672  T
Q  105 gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19422673 gagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 19422772  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattc 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||    
T  19422773 aatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaaagtaactgcaaacgatcccactagcca-gctattc 19422871  T
Q  304 agaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatg 403  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19422872 agaagcaaagaatgccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagagacacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatg 19422971  T
Q  404 cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaat 503  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19422972 cttttgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaat 19423071  T
Q  504 ctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19423072 ctttcaacagataaaggtttagtaaatatatcagcccattgatgt 19423116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30321310 - 30320788
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30321310 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 30321211  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 223  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30321210 ttaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 30321111  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| ||    
T  30321110 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agccattcagaagcaaagaataccgctt 30321012  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  30321011 atgaagttttagtgccgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttatgaatggacttcagaa 30320912  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30320911 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaat-aaaataaatctttcaacagataaaggttt 30320813  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30320812 tgtaaatatatcagcccattgatgt 30320788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25680611 - 25680070
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag 105  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  25680611 tagcagagaaggtttgagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacttttgcaattcaaaag 25680513  T
Q  106 agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25680512 agacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgagtgttaatacgtttaaaagctaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaa 25680413  T
Q  206 atagaccacgtcagagacttttcagaaaa-ctaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattca 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25680412 atagaccacatcagaaacttttcagaaaaactaacatttgggtaatgggacagctgttacaaaa-gtaactgccaacgatcccactagccttgctattca 25680314  T
Q  305 gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgc 404  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||  |||    
T  25680313 gaagcaaaaaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaaggccttctaatgaaccaagtgc 25680214  T
Q  405 ttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25680213 ttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatc 25680114  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25680113 tttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25680070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 6155340 - 6155857
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6155340 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 6155438  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6155439 caaattggaggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 6155538  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  6155539 aaaactatcttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 6155638  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6155639 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 6155738  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6155739 ttcttactcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6155838  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6155839 tatatcagcccattgatgt 6155857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 32084255 - 32083778
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  32084255 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 32084156  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32084155 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 32084056  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32084055 aactgccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 32083956  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  32083955 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaa 32083856  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32083855 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 32083778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 44485388 - 44485905
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44485388 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 44485486  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44485487 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtacaaataaaccacgtcagagactcttcag 44485586  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  44485587 aaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaacttccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 44485686  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44485687 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 44485786  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44485787 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaattttttttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 44485886  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44485887 tatatcagcccattgatgt 44485905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 29080705 - 29081182
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29080705 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 29080804  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29080805 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 29080904  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29080905 aactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 29081004  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  29081005 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccagacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 29081104  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29081105 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 29081182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 9345416 - 9345889
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  9345416 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 9345515  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9345516 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 9345615  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345616 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 9345715  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  9345716 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 9345815  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9345816 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9345889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 36297242 - 36297717
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  36297242 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 36297341  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36297342 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactg 36297441  T
Q  277 ccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc 376  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36297442 ccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc 36297541  T
Q  377 aattaagagcttctgatggacc--agatgcttctg-aatagacttcagaacc-aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    | |||||||||||||||| |||  | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  36297542 agttaagagcttctgatgaaccaaaaatgctcctgaaataaacttcagaaccaaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 36297641  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36297642 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3355190 - 3354717
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatc 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  3355190 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatc 3355091  T
Q  177 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3355090 attgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactattttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaact 3354991  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3354990 accaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 3354891  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3354890 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 3354791  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3354790 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 3354717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13695129 - 13694652
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  13695129 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 13695030  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13695029 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 13694930  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13694929 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttacctcaga 13694830  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  13694829 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 13694730  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13694729 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 13694652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 33 - 547
Target Start/End: Original strand, 3837127 - 3837639
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3837127 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataagggacaaacaaacatagcattaatgac 3837225  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3837226 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctctttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcaga 3837325  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
      | ||||| |||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  3837326 ctaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagt 3837424  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3837425 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagtaaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcagaaccaaact 3837523  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3837524 tcttattcagaggcaagcaaa-tcttaaccagacacaaagtgcatgttcaaattttacttgataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaat 3837622  T
Q  531 atatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||    
T  3837623 atatcagcccattgatg 3837639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 246122 - 246599
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  246122 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 246221  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  246222 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 246321  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  246322 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 246421  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  246422 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 246521  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  246522 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 246599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 809242 - 809719
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  809242 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 809341  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  809342 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactctttagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 809441  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  809442 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 809541  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  809542 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 809641  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  809642 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 809719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 32 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 22152887 - 22152372
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22152887 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 22152788  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152787 caaattgggggtgcgtgtaagtaagtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 22152688  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||     |||||| || ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| || || | |||||||    
T  22152687 gacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgagacgtaactgccaacgtttccaataaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaa 22152589  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22152588 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagatcttctgatggaccaga-gcttctgaataaacttcagaaccaaa 22152490  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22152489 cttcttattcagaggcaagcgaa-tctcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttcataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaa 22152391  T
Q  529 atatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22152390 atatatcagcccattgatg 22152372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 36082225 - 36082712
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  36082225 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 36082324  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36082325 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 36082424  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36082425 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 36082524  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||          |||||||||    
T  36082525 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttaatc 36082624  T
Q  461 agacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36082625 agacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 36082712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 23787690 - 23788207
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23787690 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatg 23787789  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
    | ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23787790 acaaatttggggcgtgtgtaagtacgtttaaaagcttataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttc 23787889  T
Q  229 agaaaactaac--ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    |||   |||||  | |||| ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||   ||||    
T  23787890 aga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaacttct 23787986  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  23787987 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagtagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaacc 23788085  T
Q  426 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 525  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23788086 aaacttcttattcagaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaaattttcttgataatatcaaatctttcaacagttaaaggctttg 23788184  T
Q  526 taaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23788185 taaatatatcagcccattgatgt 23788207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 200 - 547
Target Start/End: Original strand, 16741112 - 16741463
Alignment:
Q  200 atacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgct 299  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16741112 atacagatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttggataatgggacagctattacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgct 16741211  T
Q  300 attcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 399  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16741212 attcagaaacaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca 16741311  T
Q  400 gatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----tttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 495  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741312 gatgcttctgaattgacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagcaaaaatttttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 16741411  T
Q  496 aaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16741412 aatcaaatctttcaacaaataaaggctttgtaaatatatcagcccactgatg 16741463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Original strand, 21292581 - 21293094
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21292581 aagtgtagcttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatgaca 21292680  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
    |||| |||| |||||  |||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21292681 aattaggggtgcgtgaaagtacgtttaaa-gctattaaaatcatcattgccctttaaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcatttcag 21292779  T
Q  231 aaa-actaacctttgggtaatgggacagctgttacaa-aaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc-tga 327  Q
    | | |||     || | |  |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | | ||| | |    
T  21292780 agagactgc---ttagttggtgggacaggtgttactagaaagtaacttccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaattcagcttcctaa 21292876  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  21292877 agttttaatgctgatgtcatcttcagaagcatattttcctcagaatctcagttaagagcctctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaactaa 21292975  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21292976 acttcttattcagaggcaagcaagtttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgta 21293074  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  21293075 aatatatcagcatattgatg 21293094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 322 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15787018 - 15786792
Alignment:
Q  322 ttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15787018 ttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccaaatgcttctgaataaacttcag 15786919  T
Q  422 aaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15786918 aaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggt 15786819  T
Q  522 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15786818 tttgtaaatatatcagcccattgatgt 15786792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Original strand, 22667336 - 22667850
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22667336 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaat 22667435  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    || || |||||| ||| || ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||     || |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  22667436 gataa-ttggggacgcatgatagtatgttcaaa-gcaaa-aaagcatcattgccctccaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaagcgttt 22667532  T
Q  228 cagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttaca-aaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    |||||   ||||   || | || |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  || ||   ||||    
T  22667533 cagaa---taactgcttagttagtgggacagatgttactgaaaagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcagaagcaaggaatacaacttct 22667629  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctga-atagacttcagaac 424  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| || |||    
T  22667630 gaagtttaagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatggaccata-gcttttgataaagactacataac 22667728  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||| ||| |    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||| ||     
T  22667729 caaacttcttgttcaggagtaagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttccatagttaaaggttta 22667826  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22667827 gtgaatatatcagcccattgatgt 22667850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 548
Target Start/End: Original strand, 19933400 - 19933910
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||| ||||| | ||||||||||| |    
T  19933400 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagacggggacagacaaatacagcattaatgaca 19933499  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    | ||||||||||||| |||||  || ||| ||||| ||| |||||||||||  |   || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19933500 a-ttgggggcgcgtgatagtacattcaaa-gcaaa-aaatcatcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggcttttcaga 19933596  T
Q  232 aaactaacc-tttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgcta-ttcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
        ||||  ||| | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||  | ||  ||||||| |||| || ||   |||||||    
T  19933597 g---taactgttttgttagtgggacaggtgttactgaatagtaacttccaacgtttccactaacactacttgttcagaaacaaagaatacatcttctgaa 19933693  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  19933694 gtttaagtgctgacgtcatcttcataagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatagaccata-gcttctgagtagacttcagaaccaaa 19933792  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||  ||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19933793 cttctagttcaggagcaagcaagttt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaa 19933890  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19933891 atatatcagcccattgatgt 19933910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15787225 - 15787027
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15787225 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 15787126  T
Q  173 catcattgccct-ttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaag 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15787125 catcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaag 15787027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 17263636 - 17264149
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattca--aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||    
T  17263636 gaaaatgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaattgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaagggacaaacaaacacatcattaat 17263735  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    || | |  ||||||||| | |||||  || ||| || || ||| |||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||    
T  17263736 gacata--gggggcgcgagatagtacattcaaa-gctaa-aaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataagccacgtcagaagttttt 17263831  T
Q  228 cagaaaactaacctttgggtaa-tgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgcta-ttcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||   || |||| | |  || | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||   | ||  ||||| |||||| ||  | | | |    
T  17263832 ca---aagtaacttctaagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaacatttccactaatactacttgttcaggagcaaagaattcagctac 17263928  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  17263929 tgaagttaaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggac 17264027  T
Q  425 caaacttcttattc-cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    |||||||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17264028 caaacttctagttcatgag-caagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaggttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggctt 17264124  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||    
T  17264125 agtaaatataccagtccattgatgt 17264149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 533
Target Start/End: Original strand, 24649176 - 24649674
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  24649176 atgaaagtgtaggttgttaagtgtgtagtgtgtgatttgtcaaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 24649275  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    || |  ||||||||||| | |||||  || ||| || || ||| |||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  24649276 gacat-ttgggggcgcgagatagtacattcaaa-gctaa-aaatcatcattgccctcttaagtcatacaccaatacaaataaaccacgtcagaagctttt 24649372  T
Q  228 cagaa-aactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgct-attcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    ||||  |||| |   |  | || |||||||  |||||| || ||| ||| |||||||| |||||||   | || ||||| ||||||| ||  | | ||||    
T  24649373 cagagtaactga---taagttagtgggacatgtgttactaagagttacttccaacgtttccactaatactacttattcataagcaaagaattcagcttct 24649469  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 425  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  24649470 gaagttaaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaatctcagttacgagcttctgatggacca-tggcttctgaacagacttcagaacc 24649568  T
Q  426 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 525  Q
    |||||||| |||  |   ||| || |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||      
T  24649569 aaacttctaattaaggagcaaacaga--tttaatcaaacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagttaaaggcttat 24649666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 349 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20378089 - 20377894
Alignment:
Q  349 ttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgaga-caag 447  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||  ||| ||||    
T  20378089 ttcagaagcacattttcctcagaatcacaattaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacacacttcaggaccaaacttctagttca-agagcaag 20377992  T
Q  448 caaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20377991 caaattt--aatcatacacaaagttcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacaattaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatg 20377894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22467431 - 22467224
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| | || ||||||| |||||| | | | ||||||| | ||||||||||| || ||| ||    
T  22467431 tgctgacgtcatcctcagaagtacatttttctcagaatctcagtgaatagcttctaatggactata-gtttctgaaca-acttcagaacctaaattccta 22467334  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||    
T  22467333 ttcagagataagca---ttttaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttactgaatatatc 22467237  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    | |||||||||||    
T  22467236 atcccattgatgt 22467224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 403 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17294312 - 17294169
Alignment:
Q  403 gcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaa 502  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17294312 gcttctgaacagacctcagaaccaaacttcttgttcaacagcaagcaaa--tttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaa 17294215  T
Q  503 tctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  17294214 tctttcaacatttaaagacttagtaaatatatccgtccattgatgt 17294169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 474 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24490811 - 24490737
Alignment:
Q  474 atgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24490811 atgttcgaatttttctttataaaatcaaatctttcttcagttaagggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24490737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20378281 - 20378182
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||| | | ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  20378281 aaagtgtaggttgtgtagtgagtagtgtgtgatttgtctaagagttttgaataaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 20378182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Original strand, 7683356 - 7683880
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7683356 atgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgattgcaattcaaatgagacaaacaaacatagca 7683454  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7683455 ttaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 7683554  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||    
T  7683555 tcttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcataagcaaagaataccgctt 7683654  T
Q  324 ctg-aagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 422  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7683655 ctgaaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttatgatggaccagatgcttctgaatggacttcaga 7683754  T
Q  423 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 522  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7683755 accaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtacatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtt 7683854  T
Q  523 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  7683855 ttgtgaatatatcagcccattgatgt 7683880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 19183133 - 19183649
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19183133 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatga 19183231  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19183232 caaattgggggcgtgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctatttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttcag 19183331  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  19183332 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagt 19183431  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19183432 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 19183531  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19183532 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 19183631  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19183632 atatcagcccattgatgt 19183649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5646315 - 5645797
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt--agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5646315 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaagtaaaacgtttgtaattcagaagagacaaacaaacatagcattaat 5646217  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5646216 gacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 5646117  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  5646116 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaa 5646017  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5646016 gttttagcgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 5645917  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5645916 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 5645817  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5645816 atatatcagcccattgatgt 5645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 4171517 - 4172034
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4171517 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 4171615  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4171616 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcgttgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 4171715  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  4171716 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccacgctattcagaagcaaagaataccacttctgaag 4171815  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4171816 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 4171915  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4171916 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4172015  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4172016 tatatcagcccattgatgt 4172034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 150291 - 149768
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150291 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 150192  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  150191 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaac 150092  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| || |||| ||    
T  150091 ttttcagaaaaataacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaggttattgccaacgttcccactagccaa-ctattcagaagcaaagaataccgctt 149993  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  149992 ctgaagttttagtgctaacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatggacttcagaa 149893  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  149892 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttt 149793  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  149792 tgtaaatatatcagcccattgatgt 149768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 12734744 - 12735260
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12734744 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 12734842  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12734843 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 12734942  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  12734943 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagt 12735042  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12735043 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 12735142  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12735143 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 12735242  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12735243 atatcagcccattgatgt 12735260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 12619763 - 12619245
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12619763 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 12619665  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgtta--tactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12619664 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgtttattactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 12619565  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||    
T  12619564 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaaagttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 12619465  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12619464 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 12619365  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12619364 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 12619265  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12619264 atatatcagcccattgatgt 12619245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 21867878 - 21868395
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21867878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgttttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatg 21867976  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21867977 acaaattgggggcgcttgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 21868076  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  21868077 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 21868176  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21868177 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 21868276  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21868277 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 21868376  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21868377 tatatcagcccattgatgt 21868395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 7511488 - 7512006
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7511488 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 7511586  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7511587 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 7511686  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  7511687 aaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 7511786  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7511787 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 7511886  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7511887 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 7511986  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7511987 atatatcagcccattgatgt 7512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 51652484 - 51651966
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51652484 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaccgtttgcaattcaatagagacaaacaaacataacattaatga 51652386  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51652385 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 51652286  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||    
T  51652285 aaaactgctttttgggtaatgggacagctgtttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaag 51652186  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51652185 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaa 51652086  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51652085 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaa 51651986  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51651985 atatatcagcccattgatgt 51651966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36243001 - 36242523
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36243001 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 36242902  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36242901 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 36242802  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36242801 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 36242702  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc--agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 469  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  36242701 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 36242602  T
Q  470 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36242601 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 36242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 7696041 - 7695564
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  7696041 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 7695942  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7695941 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 7695842  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7695841 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 7695742  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  7695741 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 7695642  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7695641 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 7695564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35644607 - 35644131
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35644607 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 35644508  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35644507 catcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagta 35644408  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35644407 acttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 35644308  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagt 471  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  35644307 cctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaat 35644208  T
Q  472 gcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35644207 gcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35644131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 38099340 - 38099817
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  38099340 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaatttggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 38099439  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38099440 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 38099539  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38099540 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 38099639  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  38099640 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 38099739  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38099740 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 38099817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35397062 - 35396589
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  35397062 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 35396963  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35396962 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 35396863  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35396862 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 35396763  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35396762 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgca 35396663  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35396662 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 35396589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 47614502 - 47614025
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  47614502 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 47614403  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47614402 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 47614303  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47614302 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 47614203  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  47614202 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 47614103  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47614102 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 47614025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 5837459 - 5837936
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  5837459 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 5837558  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5837559 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 5837658  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837659 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 5837758  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  5837759 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttatttagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 5837858  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5837859 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 5837936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 3175850 - 3176333
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  3175850 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 3175949  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3175950 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 3176049  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3176050 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 3176149  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa----------tttttaatcagac 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||          |||||||||||||    
T  3176150 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttttttttttttttaatcagac 3176249  T
Q  465 acaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3176250 acaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 3176333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19166258 - 19165744
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt-agtaaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||     
T  19166258 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttatgagtaaaacgtttgcaatacagaatgggacaaacaaacacagcattaatgac 19166159  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19166158 aaattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcgtataaaatcatcattgcacttttaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 19166059  T
Q  230 gaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    || ||  ||||  |||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || || | |||||||    
T  19166058 gacaa--aaccgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaataactgccaacgttcccactaactctactattcagaagcaaagaatacagcttctgaa 19165961  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| || |||| |||||||||||    
T  19165960 gttttagtgttgacgtcatcttcagaagcgtattttcctcagaacctcagttaagtgcttctgatggacca-aaccttctaaacagacatcagaaccaaa 19165862  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    ||||||||||  |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19165861 cttcttattcataagcaagtaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaa 19165763  T
Q  529 atatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19165762 atatatcagcccattgatg 19165744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20879607 - 20879092
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20879607 atgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgtttttaactaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaa 20879508  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttt 226  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||    
T  20879507 tgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagcttgaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatatac---gtcagaaacttt 20879411  T
Q  227 tcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttct 325  Q
    |||||     |||||| || ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| ||| || ||   ||||    
T  20879410 tcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcctccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttct 20879312  T
Q  326 gaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||    
T  20879311 gaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgtaccata-gcttctgaatatacttcaaaacc 20879213  T
Q  426 aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttg 525  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20879212 aaacttcttattcagaagcaagcaaa-tcttaatcagacacatggtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacaattaaaggctttg 20879114  T
Q  526 taaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20879113 taaatatatcagcccattgatg 20879092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21212275 - 21211770
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21212275 gttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgacaaattggg 21212176  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaact 236  Q
    ||||||||  ||||  |||||| ||   ||||| |||||||||||  |   || |||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| | |||||    
T  21212175 ggcgcgtgaaagtacatttaaa-gcttttaaaatcatcattgcccgctaaagtcatacaccaatacaaagaggccacgtcagaggcgtttcaaacaaact 21212077  T
Q  237 aacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag 335  Q
         || | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| || || | || |||||| ||||    
T  21212076 gc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcataagcaaagaatacagcttttgaagttttag 21211980  T
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21211979 tactgacatcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttg 21211881  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||  |    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| || || ||||||||    
T  21211880 ttgaggaggaagaaaa--tttaatcagacacatagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacatttaaaggtttagtgaatatatc 21211783  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||| ||||||||    
T  21211782 agcctattgatgt 21211770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 21130908 - 21130396
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | |||||||||||||||| | ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  21130908 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgaataaaacgtttgcaattaagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 21130809  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    |||||||||||| |||  |||| |||  |||||   | ||| |||||||||||  |   || |||| || |||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  21130808 aaattgggggcgtgtgaaagtacgtt--aaagcttttgaaatcatcattgcccgctaaagtcatacacctatacaaataagccacgtcagaggcgtttca 21130711  T
Q  230 ga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || |||||     || | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  || || | || |||    
T  21130710 gacaaactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacattgctattcagaagcaaggaatacagcttgtga 21130614  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21130613 agttttagtactgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaatctcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctgaacagacttcaaaaccaa 21130515  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||| ||  |   ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||| || ||     
T  21130514 acttcttgtttaggagcaagcaaa--tttaatcagacacatagtgcatgttcaaatttttccttataaaatcaaatttttccacagttaaaggtttagtg 21130417  T
Q  528 aatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21130416 aatatatcagcccattaatgt 21130396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 338 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22447862 - 22447655
Alignment:
Q  338 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 437  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||  ||    
T  22447862 ctgatgtcatcttcagaagtacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatggactata-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttctagtt 22447764  T
Q  438 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 537  Q
    | |   ||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22447763 caggagcaagcaaa--tttagtcagacaaaaagtgcacgttcaaatttttctttattaaatcaaatttttccactgttaaaggcttagtaaatatatcag 22447666  T
Q  538 cccattgatgt 548  Q
      |||||||||    
T  22447665 ttcattgatgt 22447655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 338 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22453096 - 22452889
Alignment:
Q  338 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 437  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||  ||    
T  22453096 ctgatgtcatcttcagaagtacattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatggactata-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttctagtt 22452998  T
Q  438 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 537  Q
    | |   ||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22452997 caggagcaagcaaa--tttagtcagacaaaaagtgcacgttcaaatttttctttattaaatcaaatttttccactgttaaaggcttagtaaatatatcag 22452900  T
Q  538 cccattgatgt 548  Q
      |||||||||    
T  22452899 ttcattgatgt 22452889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 339 - 548
Target Start/End: Original strand, 22126016 - 22126222
Alignment:
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||   ||  ||| |||  |||    
T  22126016 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaggatctcagttaagagcttttgatggaccata-gcttctgaacagacttctagacataacctctagttc 22126114  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||     
T  22126115 aggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaccaaatctttccacagttaaaggtttcgtaaatatatcaga 22126212  T
Q  539 ccattgatgt 548  Q
    || |||||||    
T  22126213 ccgttgatgt 22126222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 546
Target Start/End: Original strand, 20933741 - 20933945
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |      
T  20933741 tgctgacgtcatctgcagaaacacattttcctcagaatctcagttaagagcttttgatggatcata-gcttctgaacagacttcaggacctaacttatag 20933839  T
Q  436 ttccgaga-caagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 534  Q
    |||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20933840 ttca-agagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgtt---atttttctttataaaatcaaatatctccacagttaaaggcttagtaaatatat 20933933  T
Q  535 cagcccattgat 546  Q
    ||||||||||||    
T  20933934 cagcccattgat 20933945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Original strand, 20933522 - 20933620
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||||    
T  20933522 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaatacaacattaatga 20933620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Original strand, 22125711 - 22125810
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  22125711 aaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 22125810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22460674 - 22460559
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| |  |||||    
T  22460674 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtctaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaatattaa 22460575  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgc 144  Q
    || | ||||||||||||    
T  22460574 tg-acaattgggggcgc 22460559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16325306 - 16325264
Alignment:
Q  350 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctga 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16325306 tcagaagcacattttcctcagaacctcagtgaagagcttctga 16325264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Original strand, 9163793 - 9164336
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgttttt---agtaaaacgtttgcaattcaa 102  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  9163793 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttg-tttaagtgtttttataaaaaaaacgtttgcaattcaa 9163890  T
Q  103 aagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaata 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9163891 atgagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagta 9163990  T
Q  203 caaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctatt 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  9163991 caaatagaccacgtcagaaacttttcaaaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgcaaacgatcccactagccatgctatt 9164090  T
Q  303 cagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagat 402  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9164091 cagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagat 9164190  T
Q  403 gcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaa 502  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9164191 gcttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaaattttcaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttcttaataaaatcaaa 9164290  T
Q  503 tctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9164291 tctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9164336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15884477 - 15883953
Alignment:
Q  25 atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 123  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884477 atgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttgtcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagca 15884378  T
Q  124 ttaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884377 ttaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagaaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagac 15884278  T
Q  224 ttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  15884277 ttttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacttaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaaaaataccgctt 15884178  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15884177 ctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatggacttcagaa 15884078  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  15884077 ccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttt 15883978  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15883977 tgtaaatatatcagcccattgatgt 15883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 548
Target Start/End: Original strand, 20983507 - 20984029
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20983507 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 20983605  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20983606 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 20983705  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  20983706 tttcagaaaactaacttttgggtaatgggacagctgttaccaagagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttc 20983805  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  20983806 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaggacctcagttaagagcttctgatggactaaatgcttctgaatagacttcaaaac 20983905  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20983906 caaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggtttt 20984005  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20984006 gtaaatatatcagcccattgatgt 20984029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 9437519 - 9438036
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9437519 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttgcaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 9437617  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9437618 acaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccaagtcagagactcttca 9437717  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9437718 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaag 9437817  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9437818 ttttagtgctgacgtcatctttagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 9437917  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    | ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9437918 tccttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 9438017  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9438018 tatatcagcccattgatgt 9438036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25207717 - 25207181
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaag-atgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207717 gcagagaaggtttaggacgaaatgaaagtgtgagttttgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 25207619  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207618 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggctcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 25207519  T
Q  209 gaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaag 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  25207518 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatgggacagctgttactaaaagtaactgccaacgatcccactagcctttctattcagaag 25207419  T
Q  309 caaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttct 408  Q
     ||| || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25207418 taaaaaatacagcttctgaagttttagtgctgaggtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca-ttgcttct 25207320  T
Q  409 gaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttc 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25207319 gaatagacttcagatccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttc 25207221  T
Q  509 aacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25207220 aacagataatggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 25207181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6873878 - 6873361
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6873878 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaacgtttacaattcagaagagacaaacaaacatagcattaatg 6873780  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6873779 acaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaaataaaacatcattgccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttca 6873680  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaag 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||    
T  6873679 gaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctatttagaagcaaagaataccacttctgaag 6873580  T
Q  330 tcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873579 ttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 6873480  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6873479 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 6873380  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6873379 tatatcagcccattgatgt 6873361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2712219 - 2711744
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2712219 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgttaaaaagcaagtaaaa 2712120  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2712119 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 2712020  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2712019 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttctggtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 2711920  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  2711919 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctaaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 2711820  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2711819 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 2711744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17956761 - 17956245
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17956761 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 17956663  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17956662 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagagactcttcag 17956563  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  17956562 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgttattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 17956463  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17956462 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 17956363  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17956362 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 17956263  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17956262 atatcagcccattgatgt 17956245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 22093397 - 22093913
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22093397 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 22093495  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22093496 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaatgaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 22093595  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  22093596 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 22093695  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22093696 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaact 22093795  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22093796 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 22093895  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22093896 atatcagcccattgatgt 22093913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 8621617 - 8622135
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8621617 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 8621715  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttt--tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8621716 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttc 8621815  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |  |||||||    
T  8621816 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 8621915  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8621916 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaa 8622015  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaa 528  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8622016 cttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaa 8622115  T
Q  529 atatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8622116 atatatcagcccattgatgt 8622135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 4216263 - 4216780
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  4216263 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtaatgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcaaaagggataaacaaacacagcattaatga 4216361  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4216362 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 4216461  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  4216462 aaaactaccttttgggtaatggaacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 4216561  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4216562 tttagtgctgacgtcatcttcagaaacacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaac 4216661  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4216662 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaa 4216761  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4216762 tatatcagcccattgatgt 4216780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26396742 - 26396225
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtt-tgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26396742 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaaatgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcaatagagacaaacaaacatagcattaatga 26396644  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26396643 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 26396544  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  26396543 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 26396444  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26396443 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 26396344  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26396343 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 26396244  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26396243 tatatcagcccattgatgt 26396225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 171143 - 171662
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  171143 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaataaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatga 171241  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagca--aataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttc 228  Q
     |||||||||| |||||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  171242 caaattgggggtgcgtgtaagtatgttaaaaaaaacgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaacagaccacgtcagagactcttc 171341  T
Q  229 agaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  |||||||    
T  171342 agaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaa 171441  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  171442 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaa 171541  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  171542 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgta 171641  T
Q  528 aatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  171642 aatatatcagcccattgatgt 171662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Original strand, 9089533 - 9090006
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  9089533 tttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacaacattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaaacat 9089632  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9089633 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaact 9089732  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9089733 gccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 9089832  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9089833 cagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaaatgca 9089932  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9089933 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 9090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 33 - 547
Target Start/End: Original strand, 18432784 - 18433294
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  18432784 aaagtgcatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 18432882  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18432883 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataattcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 18432982  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtc 331  Q
      | ||||| |||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||     
T  18432983 ctaataacc-ttggttaatgggacaggtg-tctaacaagtaactgccaacgatcccactaaccttgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagtt 18433080  T
Q  332 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18433081 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctaatggacca-aagcttctgaataaactttagaaccaaactt 18433179  T
Q  432 cttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaata 531  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18433180 cttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagttcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaata 18433278  T
Q  532 tatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||    
T  18433279 tatcagcccattgatg 18433294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 24738396 - 24738873
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24738396 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 24738495  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctg-ttacaaaaagt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24738496 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgtttacataaagt 24738595  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24738596 aactaccaacgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 24738695  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  24738696 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 24738795  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24738796 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 24738873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40048713 - 40048235
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40048713 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaa 40048614  T
Q  173 -catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaag 270  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40048613 acatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaag 40048514  T
Q  271 taactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048513 taactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 40048414  T
Q  371 aacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaa 469  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  40048413 aacctcagttaagagcttctgattaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaa 40048314  T
Q  470 gtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40048313 atgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 40048235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 463621 - 463117
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  463621 gaaagtgtttgttgtgaagtgagaagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 463523  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  463522 caaattgggggcgcgtgatagtatgttaaaaagcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 463423  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  463422 aaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaaaaataccacttctgaagt 463323  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaact 430  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || |  |||       |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  463322 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctc-----agaactaccaatg-------tgcttctgaataaacttcagaaccaaact 463235  T
Q  431 tcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaat 530  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  463234 tcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaat 463135  T
Q  531 atatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||    
T  463134 atatcagcccattgatgt 463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26692350 - 26691873
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  26692350 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaa 26692251  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26692250 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 26692151  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26692150 aactaccaacgttcccactaaccaagcttttcagaagcaaagaataactcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacatttttctcaga 26692051  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  26692050 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 26691951  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26691950 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 26691873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 77 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8008670 - 8008197
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-cat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  8008670 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaaacat 8008571  T
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8008570 cattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagtaact 8008471  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8008470 tccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 8008371  T
Q  376 caattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8008370 caattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaattttttaatcagacacaaaatgca 8008271  T
Q  475 tgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8008270 tgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 8008197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 1991851 - 1992328
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  1991851 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 1991950  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1991951 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 1992050  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1992051 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 1992150  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||     
T  1992151 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcgagcaatttttcaatcagacacaaaa 1992250  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1992251 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 1992328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 11009480 - 11009959
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  11009480 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgttaaaaagcgaataaaa 11009579  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11009580 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 11009679  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11009680 aacttccaccgttcccactaaccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 11009779  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatg-ga--ccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  11009780 acctcaattaagagcttctgatgagaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaa 11009879  T
Q  469 agtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11009880 aatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 11009959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Original strand, 42870128 - 42870620
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  42870128 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 42870227  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42870228 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaataaaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgagacagctgttacataaagt 42870327  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42870328 aacttccaccgttctcactaaccaagttattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 42870427  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaa---------------tttt 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||               ||||    
T  42870428 acctcaattaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttttttttttttttttt 42870527  T
Q  456 taatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42870528 taatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaagtcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatgtcagcccattgatgt 42870620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 92 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13180697 - 13180243
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-g 189  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  |    
T  13180697 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaag 13180598  T
Q  190 ttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttccca 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | | |  | |||| || |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13180597 ttatacaccaatacaaatagaccatgtcagaggtttttcagaca-caatgcattggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgtcaacgttccca 13180499  T
Q  289 ctaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 388  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || || | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13180498 ctaactctgctattcagaagcaaagaatacagcttct-aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttaaaacctcagttaagagctt 13180400  T
Q  389 ctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 488  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13180399 ctgatggaccaaa-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaatctt-aatcagacacaaagtccatgttcaaatttttc 13180302  T
Q  489 tttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13180301 ttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatattagtccattgatg 13180243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4421476 - 4420965
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  4421476 aagtgtaggttgtgaagtaagtagtgtgtgttttgtcaaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 4421377  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttt-tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||   ||||| |||||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||| |||| | |||||    
T  4421376 aaattgggggcgcgtgaaagtacgtttaa--gcttttaaaatcatcatagccctttaatgtcatacaccaatacacataggccacgttagagtcatttca 4421279  T
Q  230 ga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || ||||||    || | || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||  | | ||||||    
T  4421278 gagaaactac---ttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaacttccaacgtttccactaacactgttattcagaggcaaagaattcagcttctga 4421182  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||    
T  4421181 agttttagtgctgacgtcatcttcagaggcatattttcctcagagtctcagttaagagcttctgatggatcata-gcttctggacagacttcagaaccaa 4421083  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| || |||    
T  4421082 acttcttattcagaggcaagcaa--ttttaatcagacacatagtgcatgttc-aatttttctttatgaaatcaaatctttcgacagttaaaggtttagta 4420986  T
Q  528 aatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4420985 aatatatcagcccattgatgt 4420965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 301 - 548
Target Start/End: Original strand, 14138175 - 14138419
Alignment:
Q  301 ttcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccag 400  Q
    |||||||||||| || ||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||     
T  14138175 ttcagaagcaaagaatacatcttctgaagtttaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcataatctcagttaagagcttctgatggaccat 14138274  T
Q  401 atgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaaca 500  Q
    | | |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14138275 a-gattctgaatagacttaaaaaccaaacttctagttcaggagcaagcaagttt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatca 14138371  T
Q  501 aatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14138372 aatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 14138419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 297 - 548
Target Start/End: Original strand, 4823594 - 4823842
Alignment:
Q  297 gctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatgga 396  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  4823594 gctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatcttagttaagagcttctgatgga 4823693  T
Q  397 ccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc-cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataa 495  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4823694 ccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctagttcatgag-caagcaa--gtttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatatttctttataa 4823789  T
Q  496 aaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    || |||||||||| |||   |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4823790 aatcaaatctttccacaatcaaagacttagtaaatatatcatctcattgatgt 4823842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Original strand, 10651409 - 10651618
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||    
T  10651409 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcattttagagcttctgatggaccata-gcttctgaac-gacttcaggacctaaattccta 10651506  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  10651507 ttcaggagcaagcaaatttt-aatcactcacaaagtgcatgttcaattttttctttataaaatcaaatctttctacagttaaaggcttactaaatatatc 10651605  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    | | |||||||||    
T  10651606 aactcattgatgt 10651618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 339 - 548
Target Start/End: Original strand, 13661032 - 13661238
Alignment:
Q  339 tgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattc 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||    
T  13661032 tgacgtcatcctcagaagcacattttcctatgaatctcagttaagagcttatgatggaccata-gcttctgaacagacttcaggacctaacttctagttc 13661130  T
Q  439 cgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagc 538  Q
     |   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||    
T  13661131 aggagcaaacaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaaaatattagc 13661228  T
Q  539 ccattgatgt 548  Q
    ||||||||||    
T  13661229 ccattgatgt 13661238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 21695068 - 21695168
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||    
T  21695068 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaataaacacatcattaatg 21695167  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  21695168 a 21695168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 14137906 - 14138021
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaa 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||  || ||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||    
T  14137906 atgaacgtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttatctaagtg--ttgagtaaaaaggtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaa 14138003  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgt 146  Q
    || | ||||||||||||||    
T  14138004 tg-acaattgggggcgcgt 14138021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16159415 - 16159340
Alignment:
Q  459 tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatat 534  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| | ||||| |||||||    
T  16159415 tcagatacaaaatgaatgtttaaatttttctttataaaatcaaacctttcaatagttaaacgttttgtgaatatat 16159340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 13660851 - 13660951
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  13660851 gaaagtgtgggttgtgaagtgggtaatgtgtgatttgtataagtgttttgagcaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacaaaacattaatg 13660950  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  13660951 a 13660951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5371 - 4868
Alignment:
Q  50 gtgagtagtgtgtgtttgttt-taagtgtttttagtaaaac-----gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5371 gtgagtagtgtgtgtttgtttataagtgttttta-taaaacaaaatgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacatattgggggcg 5273  T
Q  144 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaaccttt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5272 cgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaattaaccttt 5173  T
Q  244 gggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5172 gggtaatgggacagctgttacaaagagtaactgccaacgttcccactagccttgcttttcagaagcaaagaataccgcttctgaagctttagtgctgacg 5073  T
Q  344 tcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgaga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5072 tcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagg 4973  T
Q  444 caagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 543  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4972 caagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccatt 4873  T
Q  544 gatgt 548  Q
    |||||    
T  4872 gatgt 4868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39493 - 38968
Alignment:
Q  23 agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39493 agatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagc 39395  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaga 222  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  39394 attaatgacaaattgggggcgtgtgttagtacatttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacagatagaccacgtcagaaa 39295  T
Q  223 cttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| |    
T  39294 cttttcagaaaactaacatttggataatgggacagttgttacaaaaagtaactgccaacgatcccactagccttgctattcagaaacaaagaataccgct 39195  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 422  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39194 tctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaattgacttcaga 39095  T
Q  423 accaaacttcttattccgagacaagc--aaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39094 accaaacttcttattcagagacaagcaaaaaattttaatcagacacaaagtgcatgctcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagataaagg 38995  T
Q  521 ctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  38994 ctttgtcaatatatcagcccactgatg 38968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 43305 - 42830
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43305 agtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatgacaaattaggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcaaataaaa 43206  T
Q  173 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43205 catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagta 43106  T
Q  273 actgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa 372  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43105 actaccaacgttcccactaaccatgctattcagaagcaaagaataccacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaaacacatattcctcagaa 43006  T
Q  373 cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtg 472  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  43005 cctcagttaagagcttctgatgaaccaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatg 42906  T
Q  473 catgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42905 catgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 42830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 264 - 541
Target Start/End: Original strand, 2977 - 3250
Alignment:
Q  264 caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattt 363  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||  | || ||||| |||||| ||  | | |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2977 caaaaagtaacttccaacgttttcactaactctactgttcaggagcaaagaatccagcttctgaagttaaggtgctgacatcatcttcagaagcacattt 3076  T
Q  364 tcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcaga 463  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || | | | |||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||  ||||| |    
T  3077 tcctcagaatctcagttaagagcttctgatgaactata-gattctgaact-acttcagaacctaacttcttattcaaaagcaagcaaattt--aatcaaa 3172  T
Q  464 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3173 cacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctctccacagttaaaggcttagtaaatatataagccca 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 2747 - 2848
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  | | |||||||||||| | |||||||    
T  2747 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgattttgtctaaatgtttttagtaaaaacgtttgcaagtcatgaggggacaaacaaacacaacattaat 2846  T
Q  129 ga 130  Q
    ||    
T  2847 ga 2848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 38959 - 38418
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtt--aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa 104  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  38959 tagcagagaaggtttgaag-tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaacgtttgcaattcaaat 38862  T
Q  105 gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaataca 204  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38861 gagacaaacaaacgtagcactaatgacaaattaggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccagtaca 38762  T
Q  205 aatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattca 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||    
T  38761 aatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggatagctgttacaaaaagtaactgcttacgatcccactagccatgctattca 38662  T
Q  305 gaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgc 404  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  38661 gaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcatctgatggaccaaatgc 38562  T
Q  405 ttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatc 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  38561 ttctgaatggacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaattcttcttaataaaatcaaatc 38462  T
Q  505 tttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38461 tttcaacagataaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 38418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 548
Target Start/End: Original strand, 35389 - 35906
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35389 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaagggacaaacaaacacagcattaatga 35487  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35488 caaattgggggcgcgtgtaagtatgttaaaaagcgaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcag 35587  T
Q  231 aaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || | |  |||||||||    
T  35588 aaaactactttttgggtaatgggacagctgttacataaagtaactgccaacgttcccactaaccaaactattcagaagcaaagaataacacttctgaagt 35687  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaac 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35688 tttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgctcctgaataaacttcagaaccaaac 35787  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaa 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35788 ttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaatgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaa 35887  T
Q  530 tatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35888 tatatcagcccattgatgt 35906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49544 - 49025
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  49544 aaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttggtaaaacgtttgcaattcagaagggacaaacaaacatagcattaatgac 49446  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt----gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49445 aaattgggggggcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttttttgttatagtccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 49346  T
Q  228 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || | ||||||    
T  49345 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaatcaaagaatacggcttctga 49246  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49245 agctttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccga 49146  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49145 acttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaaagttttgta 49046  T
Q  528 aatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49045 aatatatcagcccattgatgt 49025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 495 - 5
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  495 gaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttattaaaacgtttgcaattcagaacagacaaacaaacatagcattaatgac 396  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  395 aaattgggggcgcgtgatagtatatttaatatcaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagatacttttcaga 296  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  295 aaactaacctttgggtaatgggacagttgttacataaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaatgataccttttctgaagta 196  T
Q  332 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc--aaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  195 ttagtgctgacgtcatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggatcagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaaac 96  T
Q  430 ttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 520  Q
    ||||||||| ||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  95 ttcttattcagaggccaacaatttttcaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagataaagg 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 179717 - 180254
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag 107  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  179717 gcagagaaggttggagaagaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttactaaaaacgtttgcaattcaaaaggg 179815  T
Q  108 -acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  179816 gacaaacaaacagagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaatcatcattgtcctttttgttatactccaatacaaa 179915  T
Q  207 tagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcag 305  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  | ||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  179916 tagaccacgtcagaaactttttagactaataatc-ttggttaatgggacaggtgttactaaaacgtaactaccaacgatcccactagccttgctattcag 180014  T
Q  306 aagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgct 405  Q
    ||| ||| || || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  180015 aagtaaagaacacagcttctgaagttttagtgctgacgtaatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagct 180113  T
Q  406 tctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatct 505  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  180114 tctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatct 180212  T
Q  506 ttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180213 ttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 180254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 92 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 49776 - 49323
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaata-aaacatcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  49776 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacaaaattaaagacaa-ttgggggcacgtgagagtacgtttaaaagcttatagaaacatcattgcccttttagt 49678  T
Q  191 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccac 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | |  | |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49677 tatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcagata-caatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccac 49579  T
Q  290 taaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 389  Q
    ||||  ||||||| ||||||| | || || | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  49578 taactctgctatttagaagcatagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatctttagaagtacattttcctcagaacctcggtaaagagcttc 49479  T
Q  390 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 489  Q
    |||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49478 tgatggaccaaa-gcatctgaacatacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaaatctt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 49381  T
Q  490 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49380 taataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatattagcccattgatg 49323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 30 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 5720
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaa 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6236 atgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaa 6138  T
Q  128 tgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactttt 227  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6137 tgacaaattgggggcgtgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactttt 6038  T
Q  228 cagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctg 326  Q
    ||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || || | |||||    
T  6037 cagactaataacc-ttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgccaacgatcccactaacgctgctattcagaagtaaagaacacagcttctg 5939  T
Q  327 aagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacca 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  5938 aagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aaacttctgaataaacttcagaacca 5840  T
Q  427 aacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgt 526  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5839 aacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgt 5741  T
Q  527 aaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  5740 aaatatattagcacattgatg 5720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 73 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 43519 - 43042
Alignment:
Q  73 agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||    
T  43519 agtgtttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtcaaaaagcgaataaaa 43420  T
Q  173 -catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagt 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43419 acatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactcttcagaaaactaccttttgggtaatgggacagctgttacataaagt 43320  T
Q  272 aactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43319 aactgccaacgttcccactagccaagctattcagaagcaaagaataacacttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaga 43220  T
Q  372 acctcaattaagagcttctgatggacc-agatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  43219 acctcagttaagagcttctgatgaaccaaaatgcttctgaataaacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaatttttcaatcagacacaaaa 43120  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43119 tgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagacaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatgt 43042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 43 - 474
Target Start/End: Original strand, 31149 - 31582
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggggg 141  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31149 ttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgttttaagtgttttaattaaaacgtttgcaattcagaacaaaaaaacaaacatagcattaatgacaaattgaggg 31248  T
Q  142 cgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31249 cgcgtgttagtatgtttaaaaccaagtaaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct 31348  T
Q  242 ttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctga 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  31349 ttgggtaatgggacagctgtaacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaaagataccttttctgaagtattagtgctga 31448  T
Q  342 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttattccg 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31449 cgtcatcttcagaagcaaattttcctcagaacctcagtcaagagtttctgatggaccagctgcttctgaataaacttcagaaccaaaacttcttattcag 31548  T
Q  441 agacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31549 aagccagcaatttttcaatcagacacaaagtgca 31582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 32 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2515
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2998 gaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaaaga 2900  T
Q  131 aaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccct-ttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2899 caaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcatataaaacatcattgcccttttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttta 2800  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||  | ||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||   |||||||    
T  2799 gactaataaac-ttggttaatgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaacgatcccactaaccctactattcagaagtaaagaatacaacttctgaa 2701  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaa 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  2700 gttttagtgctgacgtcatcttcagaaggacattttcctcagaacatcagttaagagcttctgatggatca-atgcttctgaatagtctttagaactaaa 2602  T
Q  429 cttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagata 516  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2601 cttcttactcagagacaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttcaacagata 2515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 5977 - 5458
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  5977 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 5878  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5877 atgacaaattgggggcgcatgtaagtatgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 5778  T
Q  226 ttcagaaaactaac--ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||||   |||||  | |||| || |||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||   |    
T  5777 ttcaga---ctaacaacattggttagtgggacaggtgttactaagatgtaactgccaacgtttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacaact 5681  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 422  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5680 tctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-atgcttctgaacagacttcaga 5582  T
Q  423 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 522  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  5581 accaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgtatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctctcaacagttaaaggct 5483  T
Q  523 ttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5482 ttgtaaatatatcagcccattgatg 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 176 - 491
Target Start/End: Original strand, 195413 - 195729
Alignment:
Q  176 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195413 cattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaact 195512  T
Q  276 gccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 375  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195513 gccaacgatcccactagccttgctattcagaagcaaagaataccgcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacct 195612  T
Q  376 caattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaa-atttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  195613 cagttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcagagacaagaaatttttttaatcagacacaaagtgca 195712  T
Q  475 tgttcaaatttttcttt 491  Q
    |||||||||||||||||    
T  195713 tgttcaaatttttcttt 195729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Original strand, 6210 - 6729
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||    
T  6210 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgtttgcgatccataaggggacaaacaaacatagcatta 6309  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6310 ataaaaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcttataaattcatcattgcccttttagtaatactccaatacaaatagaccacgtcatagactt 6409  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||  |  |||||| || || ||||| || |||||| || | ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||| || || | |||    
T  6410 ttcagactaacaacctt-ggttagtgggataggtgttactaagacgtaactgccaacgtttccactaatcctgctattcagaactaaagaacacagcttc 6508  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaac 424  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  6509 tgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcagaac 6607  T
Q  425 caaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggcttt 524  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||| ||    
T  6608 caaacttcttattcagaggcaaacaaa-tcttaatcagacacaaagtgaatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctatcaaaagttaaaggcatt 6706  T
Q  525 gtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6707 gtaaatatatcagcccattgatg 6729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 55317 - 54798
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  55317 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagggtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcatta 55218  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55217 atgacaaattaggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacatatagaccacgtcagaaactt 55118  T
Q  226 ttcagaaaactaac--ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||||   |||||  | |||| ||||||||||| ||||||  | | | ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| || || | |    
T  55117 ttcaga---ctaacaacattggttaatgggacaggtgttactgagatgcaactgccaacgattccactaaccctactattcagaagtaaagaacacagct 55021  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 422  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  55020 tctgaagttttaatgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacagacttcaga 54922  T
Q  423 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 522  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  54921 accaaacttcttattcggagggaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaattgttaaaggct 54823  T
Q  523 ttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  54822 ttgtaaatatatcaggccattgatg 54798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 547
Target Start/End: Original strand, 131946 - 132450
Alignment:
Q  42 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaag-agacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  131946 gttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggagacaaacaaacatagcattaatgacag-ttggg 132043  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaa 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  132044 ggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcatataaaacatcatgaccctttttcgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcagactaataa 132143  T
Q  239 cctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtg 337  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || || | ||||||||| ||||||    
T  132144 c-tttggttaatgggacaggtgttactaagacgtaactgcgaacgatcccactaactctgctattcagaagtaaagaacacagcttctgaagttttagtg 132242  T
Q  338 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 437  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  132243 ccgacgttatcttgagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttctgatggacca-aagcttctgaacaaacttcagaaccaaacttcttatt 132341  T
Q  438 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 537  Q
    | ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  132342 cagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatattcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagataaaggttttgtaaatatatcaa 132440  T
Q  538 cccattgatg 547  Q
    ||||||||||    
T  132441 cccattgatg 132450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 92 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 259
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  712 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaaagacaa-tggggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaaaacatcatttcccttttagt 614  T
Q  191 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttaca-aaaagtaactgccaacgttcccac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   | |  | |||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  613 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcacacg-caatgcattggttaatgggacaggtgtcactgaaaagtaattgccaacgttcccac 515  T
Q  290 taaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 389  Q
    ||||  ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  514 taactctgctattcagaagcaaagaatacaacttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagtaaagagcttc 415  T
Q  390 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 489  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  414 tgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttct 317  T
Q  490 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  316 taataaaatcaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagctcattgatg 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 35 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 360 - 1
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  360 agtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaa 261  T
Q  134 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaa 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  260 aatgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagacaacgtcagaaacttttcagaaa 161  T
Q  234 actaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtctt 333  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  160 aataacctttgggtaatgggacaattgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagcc-agctattcagaagcaaagaatactgcttctgaagtttt 62  T
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 27 - 548
Target Start/End: Original strand, 73839 - 74361
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag---acaaacaaacatagc 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  73839 gaaaagaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgttg--tttaagtgttttttgtaaaaacgattgcaattcagaagaggggacaaacaaacatagc 73936  T
Q  123 attaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagag 221  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73937 attaatgacaaattaggggcgcgtgaaagtacattgaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatacaccacgtcagag 74036  T
Q  222 acttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccg 320  Q
    ||||||||||     |||||| || ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||| ||| || || |    
T  74037 acttttcagacttacaacctt-ggttaatgggacaggtgttactgatacgtaactgccaacgcttccattaaccctgttattcagaagtaaagaacacag 74135  T
Q  321 tttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttca 420  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  74136 cttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatggaccata-acttctgaataaacttca 74234  T
Q  421 gaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaagg 520  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  74235 gaaccaaacttcttaatcagaggcaagcaaa-ttttaattagacacaaagtgcatcttcaagtttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaagg 74333  T
Q  521 ctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  74334 ctttgtaaatatatcagcccattgatgt 74361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 83
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||    
T  602 aaatgaaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcacaaggggacaaacaaacacaacatta 503  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  502 atgacaaattgggggcgcgtgtaagctagtttaaaagcatataaaatcatcattgccctttttgttatactccaatacgaatagaccacgtcagaaactt 403  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||     |||||| || ||||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||| || ||   |||    
T  402 ttcagacttacaacctt-ggttaatggggcaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacaacttc 304  T
Q  325 tgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaa-gcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  303 tgaagatttagtgctgacgtcatcttcagaaagcacatttttctcagaactttagttaagagcttctgatggaccaaa-gcttctgaataaacttcagaa 205  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  204 ccaaacttcttattcagaggcaagcaaatctt-aatcagacacaaagttcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatctttcaacagttaaaggatt 106  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgat 546  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  105 tttaaatatatcagcccattgat 83  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 547
Target Start/End: Original strand, 6287 - 6805
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| |||| |||||||||    
T  6287 atgaaagtgtgagttatgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacggttgcaattcagaaaggggacaagcaaagatagcatta 6385  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6386 atgacaaattgggggcgcgtgaaagtacatttaaaagcatataaagtcatcattgccctttttgttatactccaatacaagtacaccacgtcagagactt 6485  T
Q  226 ttcagaaaactaac--ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||   |||| ||  | |||| |||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||   | ||||||||| || |||||||||| ||| || || | |    
T  6486 ttca---aacttacagccttggttaatgg-acaggtgttactgaaacgtaactgccaatccttccactaaccctgttattcagaagtaaagaacacagct 6581  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaa-cctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcag 421  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  6582 tctaaagttttagtgctgatgtcatcctcagaagcacattttcctcagaatcctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaataaacttcag 6680  T
Q  422 aaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggc 521  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  6681 aaccaaacttcttattcaaaggcaagcaaatctt-aatcagacccaaagtgcatgttcaaatttttcttgataaaatcaaatcattcaacagttaaaggc 6779  T
Q  522 tttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6780 tttgtaaatatatcagcccattgatg 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8261
Alignment:
Q  41 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8533 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 8434  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8433 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 8334  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8333 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaa 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 6
Alignment:
Q  41 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtt-ttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278 agttgtgaagtgagtagtgtgtgtttttgcttaagtgtatttatcaaaacgttcgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgacaaattggg 179  T
Q  140 ggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178 ggcgcgtgttagtacgtttaaaagcagataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaac 79  T
Q  240 ctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  78 ctttgggtaatgagacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactagccttgctattcagaagcaaa 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 92 - 513
Target Start/End: Original strand, 109230 - 109650
Alignment:
Q  92 ttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  109230 ttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgaaagtatgttaaaaagcgaataaaaacatcattgccctttttgt 109329  T
Q  191 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaa-aagtaactgccaacgttccca 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  109330 tatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagacaaaata--cattggttagtgggacaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttcca 109427  T
Q  289 ctaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 388  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| || || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  109428 ctaatcctgccattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtactgacgtcatcttcagaagcgcattttcctcagaaccttagttaagagctt 109527  T
Q  389 ctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 488  Q
    || |||||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109528 ctcatggacca-aagcttctgaacaaacaacagaaccaaacttcttattcagaggcaagcaaa-tcttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttc 109625  T
Q  489 tttataaaaacaaatctttcaacag 513  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  109626 ttaataaaatcaaatctttcaacag 109650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 69426 - 69063
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  69426 gaaagtgtgagttgcgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagagtttttagtaaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaaggattaatg 69328  T
Q  130 aaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69327 acaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataagtcatcattgcccttttttttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaacttttca 69228  T
Q  230 gaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaa 328  Q
    ||  | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||||||    
T  69227 gactaataacctt-gggtaatgggacaggtgttactaaaacgtaactgccaacgatcccactaaccctgctattcagaagtaaagaatacagcttctgaa 69129  T
Q  329 gtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatg 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  69128 gttttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcagttaagagcttctgatg 69063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 47 - 474
Target Start/End: Original strand, 10835 - 11262
Alignment:
Q  47 gaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10835 gaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtatttagtaaaaacgattgcaattcataaggggataaacaaacatagcattaatgacaaattgtgggcgc 10933  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaaccttt 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | ||    
T  10934 gtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttagttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaca-ctgtacatt 11032  T
Q  244 gggtaatgggacagctgttacaaa-aagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgac 342  Q
     | || ||| | || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||    
T  11033 agttagtggaaaaggtgttactaagaagtaactgccaacgtttccactaactttgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgac 11132  T
Q  343 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 442  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |    
T  11133 gtaatcttcagaagcatattttcctcagaacctcagttaagagcttctgttggacca-aagcttctgaacatacttcagaaccaaacttcttattcagtg 11231  T
Q  443 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgca 474  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11232 gcaagcaaa-ttttaatcagacacaaagtgca 11262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6868
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgt-ttgttttaagtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603 gaaatgaaagtgtttgttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgactta-gtgtttttaagtaaaccgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcat 6701  T
Q  125 taatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6702 taatgacaaattgggggcgcgtgttagtacatttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagact 6801  T
Q  225 tttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccacta 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6802 tttcagaaaactaccctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccacta 6868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 1
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  251 gaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttatcaaaaatgtttgcaattcaaatgagacaaacaaacatagcatt 153  T
Q  126 aatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  152 aatgacaaattgggggtgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 53  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaagtaactgc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagttgttacaaaaagtaactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 49 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 161555 - 161054
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||     
T  161555 agtgagtagtgtgtgtttggtttatatagtgttttaaaaaaaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacactgcattaatgacaaattaggggcgt 161456  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctt 242  Q
    |||  | ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | | |  |||    
T  161455 gtgaaaatacatttaaaagcttataaagtcatcattgcccttttaagttatacaccaatacaaatagagcacgtcagaggtttttcagaca-caatgctt 161357  T
Q  243 tgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctga 341  Q
    ||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||  |||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||    
T  161356 tggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactaccaacgcctccactaaccctgccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctga 161257  T
Q  342 cgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccga 441  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  161256 tgtcatctttagaagtgcattttcctcagaacctccgttaagagcttctgatggacca-aggcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcaga 161158  T
Q  442 gacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  161157 gacaagcaagtttt-aatcagacacaaagagcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccg 161059  T
Q  542 ttgat 546  Q
    |||||    
T  161058 ttgat 161054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 543
Target Start/End: Original strand, 13417 - 13872
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| || | |||||| ||||   |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  13417 aaaacgattgcaattcagaggagacaaacaaacacaacattaatgacaa-tcgggggcacgtgaacgtacatttaaaagcttataaaatcatcatttccc 13515  T
Q  184 tttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacg 282  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |   ||   |||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  13516 ttttagttatacaccaatacagatagaccacgtcagaggtttatcagacac--aatgcttggttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactcccaacg 13613  T
Q  283 ttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaa 382  Q
     | ||||||| | | |  |||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13614 attccactaatcctaccgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctccattaa 13713  T
Q  383 gagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaa 482  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13714 gagcttctgatggacca-aggcttctgaaaaaacttcagaaccaaacttcttattcggagacaagcaagttttga-tcagacacaaagtgcatgttcaaa 13811  T
Q  483 tttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 543  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812 tttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 13872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 85 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 5979
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||  |||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  6439 aaaacgtttgcaattcaaaagggacaaacaaacacagcattaatgacaact-gggggcgcgtgaaagtacgtttaaa-gcttataaaatcatcattgccc 6342  T
Q  184 ttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaa 280  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||   || | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6341 ttttaagttatacaccaatacaaacagaccacgtcagagccttttcagacag--aactgcttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 6244  T
Q  281 cgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt 380  Q
    |||| ||||||||  | || |||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  6243 cgtttccactaacactactgttcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatgtcaccttcagaagcatattttcctcagaatcttagtt 6144  T
Q  381 aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttca 480  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6143 aagagcttctgatggaccata-gcttcttaacagacttcagaaccatacttcttattcagagtcaaacacatttt-aatcagacacaaagtgcatgttca 6046  T
Q  481 aatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 aatttttcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggttttgtaaatatatcagcccattgatg 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 544
Target Start/End: Original strand, 20966 - 21424
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  20966 aaaacgtttgcaattcaaaggagacaaacaaacacaacattaatgacaa-ttgggggcgcgtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccc 21064  T
Q  184 tttt-tgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaa 280  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||| ||| ||  |||   || | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21065 ttttatgttatacaccaatacaaacggaccacgtcaaaggctttttagacaa--aactggttagttagtgggacaggtgttactaaaaagtaactgccaa 21162  T
Q  281 cgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaatt 380  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  21163 cgtttccactaacactgctgttcagaagcaaagaattcagcttctgaagttttagtgctgacgtcatcttcagatgcacattttcctcagaatctcagtt 21262  T
Q  381 aagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttca 480  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21263 aagagcttctgatggatca-ttgcttctgaatcgacttcagaaccaaacttcttattcagaggcaaacaaa-ttttaatcagacacaaaatgcatgttca 21360  T
Q  481 aatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattg 544  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||  || || |||||||||||||||||    
T  21361 tatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaagttttagtgaatatatcagcccattg 21424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1810
Alignment:
Q  10 gcagagaaggtt-aagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057 gcagagaaggttgaagacgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt-aagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga 1959  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 208  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1958 caaacaaacatagcattaaagacaagttgggggcgcgtgttagtacgtttaaaatcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaata 1859  T
Q  209 gaccacgtcagagacttttcagaaaactaacctttgggtaatgggacag 257  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  1858 gaccacgtcagaaacttttcagataaataacctttggttaatgggacag 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 547
Target Start/End: Original strand, 11433 - 11895
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgc 181  Q
    ||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||  |||  ||||| |||||||||    
T  11433 aaaacgtatgcaattcagaaaggggacaaaaaaacacagcattaatgacaaattgggggcgtgtgaaagtacgtttaa--gcatttaaaatcatcattgc 11530  T
Q  182 ccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttaca-aaaagtaactgcc 278  Q
    ||| |   ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||  |||   || | || | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11531 cctctaaagttatacactaatacaaacagaccacgttagagacgtttcagacaa--aactgcttagttagttggacaggtgttactgaaaagtaactgcc 11628  T
Q  279 aacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaa 378  Q
    |||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  11629 aacgtctccactaacactgctgttcagaagcaaataatttaggttctgaagttttagtgcttacgtcatcttcagatgcacattttcctcagaatctcag 11728  T
Q  379 ttaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11729 ttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaatagacttcataaccaaacttcttattcaaaggcaggcaaatttt-aatcagacataaagtgcatgtt 11826  T
Q  479 caaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11827 caaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 11895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 173 - 547
Target Start/End: Original strand, 11396 - 11767
Alignment:
Q  173 catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaa-actaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaaag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||     || | || |||||||| ||||||  |||     
T  11396 catcattgccctttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagatgcgtttcagagagactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaaaa 11492  T
Q  271 taactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcag 370  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11493 taacttccaacgtttccactaaccctgctattcagaagcaaagaatacagcttctgaagttttagtgctgatatcatcttcagaagcgcattttcctcag 11592  T
Q  371 aacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaag 470  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  11593 aacctcagttaagagcttctgaaggacca-aagcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttattcagaggaaagcaaa-ttctaatcagacacaaaa 11690  T
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatg 547  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11691 tgcatgttcaaatttttcttaatcaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagcaaattgatg 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1078 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1078
Description:

Target: scaffold1078; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 1
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |    
T  357 aagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagtattaatgaca 258  T
Q  133 aattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  257 aattgggggcgcgtgtaagtacatttaaaagcttataaaatcatcattgcccttttagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcag- 159  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagt 330  Q
    | || |  | |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||   |||||||||    
T  158 acacaatgcattggttaatgggacaggtgtcactaaaaagtaactgccaacgttcccactaactctgctattcagaagcaaagactacaacttctgaagt 59  T
Q  331 cttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagctt 388  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  58 tttagtgttgacgtcatcttcagaaccacattttcctcagaacctcagttaagagctt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8825 - 8332
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaa-gagacaaacaaacat-agcattaatgaaaaa--ttgggggcgcgtgttagt-atgtttaaaagcaaataaaacatcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8825 aaaacgtttgcaattcaaattgagacaaacaaacattagcattaatgaacaaagttgggggggcgtgttagttatgtttaaaagcaaataaaacatcatt 8726  T
Q  180 gcccttttt--gttatact-ccaatacaaa-tagaccacgtcagagac-ttttcagaaaactaacc-tttgggtaatgggacagct-gttacaaaaagt- 271  Q
    |||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  8725 gcccttttttgtttatactcccagtacaaactagaccacgtcagaaactttttcagaaaactaaccttttgggtaatgggacagctagttacaaaaagta 8626  T
Q  272 aactgccaacg-ttcccactaaccttgctattc-agaagc-aaataaaaccgtttctg-aag-tcttag-tgctgacgtcatc-ttcagaagcaca-ttt 363  Q
    |||||| |||| | ||||||| || |||||||| |||||| ||| || |||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8625 aactgcaaacgatccccactagccatgctattctagaagcaaaagaataccgcttctgtaagtttttagttgctgacgtcatctttcagaagcacatttt 8526  T
Q  364 tcctcagaa--cctcaattaagagcttctga-tggacc-agatgcttctgaatagacttcagaacc-aaacttcttattccgagacaagcaaatttttaa 458  Q
    |||||||||  | | | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  8525 tcctcagaaacctttagttaagagcttctgattggaccaaaatgcttctgaatggacttcagaaccaaaacttcttattcagaggcaagcaaattttcaa 8426  T
Q  459 tcagacacaaagtgcatgttc-aaatttttctt-tataaaaacaaa-tctttcaacag-ataaaggctttgt-aaatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8425 tcagacacaaagtgcatgttctaaatttttcttaaataaaatcaaattctttcaacagtataaaggttttgtaaaatatatcagcccattgatg 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10345
Alignment:
Q  26 tgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 71  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10390 tgaaatgagagtgtgagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtttt 10345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 547
Target Start/End: Original strand, 24723 - 25215
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaatt-gggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24723 agtgagttgtgtgtgtttggtatatatagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaggagacaaacaaacacagcattaatgacaaatttgggggcgc 24822  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa---catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacc 240  Q
    |||  |||| ||||||  || || ||||   |||||||||||| ||  |||| || |  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        
T  24823 gtgaaagtacgtttaa--gccaagaaaaaatcatcattgccctcttaagttacacgctgatacaaataggccatgtcagagacgtttcagacaactgc-- 24918  T
Q  241 tttgggtaatgggacagctgttacaaaaa-gtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgct 339  Q
     || | || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||| || || | |||||||||  |||| ||    
T  24919 -ttagttagtgggacaggtgttacaaaaatgtaacttccaacgtttccactaacactgcttttcagaaccaaagaacacagcttctgaagttctagtact 25017  T
Q  340 gacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattcc 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  25018 gacgacatcttcagaagcacattttcctcag--------ttaaaagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaactttctattca 25108  T
Q  440 gagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcc 539  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25109 gaggcaagcaaatttt-aatcagatacaaagtgcatgtacaaatttttcttaataaaatcaaatctttcaacagttaaaggctttgtaaatatatcagca 25207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 18425 - 18627
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggtta-agatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425 tagcagagaaggttggagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaaatgagtagtgtgtgtttgttt-aactgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaaga 18523  T
Q  107 gacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 206  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18524 tacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaa 18623  T
Q  207 taga 210  Q
    ||||    
T  18624 taga 18627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21084 - 20627
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  21084 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatgacag-ttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 20986  T
Q  184 ttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaa 280  Q
    | |   || |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||     ||||  | |||||||| ||||||  || ||||||| ||||    
T  20985 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcagagttgtttcagagaaactgc---ttggtcagtgggacaggtgttactgaagagtaactaccaa 20889  T
Q  281 cgttcccactaaccttgctatt-cagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaat 379  Q
     ||| |  |||||  |||| || || ||||||| ||  | | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |    
T  20888 agtttcttctaacactgctgtttcataagcaaagaattcagcttctgaagttttagagctgacgtcatctttagaggcatattttcctcagaaactcagt 20789  T
Q  380 taagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc 479  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20788 taagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagacccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttc 20691  T
Q  480 aaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 543  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20690 aaatttttcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34285 - 33828
Alignment:
Q  85 aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccc 183  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||||    
T  34285 aaaacgtttacaattcagaggagacaaacaaacacagcactaatgacag-ttgggggcgcgtgatagtacatttaaaagcttataaactcatcattgccc 34187  T
Q  184 ttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaa 280  Q
    | |   || |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||     ||||  | |||||||| ||||||  || ||||||| ||||    
T  34186 tctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcagagttgtttcagagaaactgc---ttggtcagtgggacaggtgttactgaagagtaactaccaa 34090  T
Q  281 cgttcccactaaccttgctatt-cagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaat 379  Q
     ||| |  |||||  |||| || || ||||||| ||  | | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| |    
T  34089 agtttcttctaacactgctgtttcataagcaaagaattcagcttctgaagttttagagctgacgtcatctttagaggcatattttcctcagaaactcagt 33990  T
Q  380 taagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttc 479  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33989 taagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagacccaaacttcttattcagaggcaagcaaatttt-aatcagacacaaagtgcatgttc 33892  T
Q  480 aaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccatt 543  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33891 aaatttttcttaataaaatcaaatctttcaatagttaaaggctttgtaaatatatcagcccatt 33828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 257
Target Start/End: Original strand, 220565 - 220788
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  220565 aaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgac 220663  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  220664 aaattgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatataaatcatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagatttttcaga 220763  T
Q  232 aaactaacctttgggtaatgggacag 257  Q
      | ||||| |||| |||||||||||    
T  220764 ctaataacc-ttggttaatgggacag 220788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 548
Target Start/End: Original strand, 13420 - 13890
Alignment:
Q  74 gtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||| |||     
T  13420 gtgttttgagtaaaacgtttgcaattcagaagtggacaaacaaacacaacattattgacaa-ttgggggggcgtgatagtacgttcaaa-gcaaa-aaat 13516  T
Q  173 catcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaaactaacct-ttgggtaatgggacagctgttacaaaa-a 269  Q
    |||||||||||  |   || |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||   ||||   || | || |||||||| ||||||  || |    
T  13517 catcattgcccactaaagtcatacaccaatacaaatagaccacgtcagacgagtttcagaa---taactgcttagttagtgggacaggtgttactgaaga 13613  T
Q  270 gtaactgccaacgttcccactaaccttgct-attcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 368  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||  || ||   |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13614 gtaacttccaacgtttccactaacactgcttattcagaagcaaggaatacaacttctgacgtttaagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 13713  T
Q  369 agaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaa 468  Q
    | || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||  ||||||||||||    
T  13714 ataatcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttctttttcaggagcaagcaaattt--aatcagacacaa 13810  T
Q  469 agtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13811 agtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatatccacagttaaaggtttagtgaatatatcagcccattgatgt 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30791 - 30287
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaa--gagacaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||     
T  30791 agtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacattaatgac 30692  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaac-atcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttca 229  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||| ||| ||   |||||  ||||||||||  |   || |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  30691 aaattgggggcgcatgaaagtacgttcaaa-gcttttaaaattatcattgcccgctaaagtcatacaccaatacaaataggccacgtcagaggcgtttca 30593  T
Q  230 ga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    || |||||     || | || ||| |||| |||| |  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||||    
T  30592 gacaaactgc---ttagttagtggtacaggtgttgctgaagagtaacttccaacgtttccactaaccctgctatttagaagcaagaaataccgcttctga 30496  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  30495 agttttagtactgatgtcatcttcagaagcacattttcatcagaatctcagttgagagcttctaatggaccata-gcttctgaatagatttcagaaccaa 30397  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    ||||||| ||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||| ||  |     
T  30396 acttcttgttcaggagcaagcaaa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccactgttaaaggtttaatg 30299  T
Q  528 aatatatcagcc 539  Q
    ||||||||||||    
T  30298 aatatatcagcc 30287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Original strand, 10999 - 11514
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt-gttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||    
T  10999 atgaaagtgtaggttgtgaggtgagtagtgtgtgttttgtcttaagtgttttgagtaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaatatta 11098  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| || |  |||||||| | |||||  ||||||   |||  || |||||||||||  ||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||  |||    
T  11099 atgacaatt--ggggcgcgagatagtacatttaaagttaaa--aatcatcattgcccacttaagtcatacaccaatataaataaaccacgtcagaagctt 11194  T
Q  226 ttcagaa-aactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgct-attcagaagcaaataaaaccgtt 322  Q
    ||||||  |||||    |  | || ||||| || |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||    |||    
T  11195 ttcagagtaactac---taagttagtgggaaaggtgttactaaagagtaacctccaacgtttccactaactctgcttattcagaagcaaagaattaagtt 11291  T
Q  323 tctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcaga 422  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  11292 tctgaagttaaagtgccgacgtcatcttcagaagcacattttcctcaaaaactcagttaagagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcaga 11390  T
Q  423 accaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggct 522  Q
    |||||||||||  ||| |   |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  11391 accaaacttctagttcaggagcaagcaaattt--aatcagagacaaagtacatgttcaaatttttctttataaaatcaaatcttttcacagttaaaggct 11488  T
Q  523 ttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11489 tagtaaatatatcagcccattgatgt 11514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Original strand, 62782 - 63093
Alignment:
Q  28 aaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagaga-caaacaaacatagcatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||    
T  62782 aaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcataagggggcaaataaacatagcatta 62881  T
Q  127 atgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaa-catcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62882 atgacaaattgggggcgcgtgtaagtacgtttaaaagcataaaaaatcatcattgccctttttgttattctccaatacaaatagaccacgtcagaaactt 62981  T
Q  226 ttcagaaaactaacctttgggtaatgggacagctgttac-aaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttc 324  Q
    ||||||     |||| |||| |||||| |||| ||||||  | | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||    
T  62982 ttcagacttacaacc-ttggttaatggaacaggtgttactgagacgtaactgccaacgcttccactaaccctgctattcagaagtaaagaacacagcttc 63080  T
Q  325 tgaagtcttagtg 337  Q
    |||||| ||||||    
T  63081 tgaagttttagtg 63093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 11501 - 10997
Alignment:
Q  43 ttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||     ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  11501 ttgtgaagcgagtagtgtgtgttttgccaaagtgttttgagtaaaaatgtttgcaattcaaaaggggacaaacaaacacatcattaatgacaaattaggg 11402  T
Q  141 gcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaa 238  Q
    |||||||  |||| ||| |||     | ||| ||||| |||||  |   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||      
T  11401 gcgcgtgaaagtacgttcaaagctttaaaaatcatcaatgcccactaaagtcgtacaccaatacgaatagaccacgtcagaggcatttcagacaaactgc 11302  T
Q  239 cctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtg 337  Q
       || | || |||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||  || ||   || |||||| |||||     
T  11301 ---ttagttagtggggcaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaacactgctattcataagcaatgaatacatcttttgaagttttagtt 11205  T
Q  338 ctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttatt 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11204 ctgacttcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacagacttcagaaccaaacttcttgtt 11106  T
Q  438 ccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcag 537  Q
    | |   ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||    
T  11105 caggagcaagcaaatct--aattagacacaaagtgcatgttcaattttttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggtttagtgaatatatcag 11008  T
Q  538 cccattgatgt 548  Q
    | |||||||||    
T  11007 ctcattgatgt 10997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 30302 - 30528
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30302 agtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtctttagtaaaacgattgcaattcaaaaggggacaaacaaacaaagcattaatgacaa 30400  T
Q  134 attgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgccctttttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||      
T  30401 attgggggcgcgtgttagtacgtttaaaagcatatatttcatcattgccctttttgttatactccaatccacatagaccacgtcagagatttttcagact 30500  T
Q  234 actaacctttgggtaatgggacagctgtt 262  Q
    | ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  30501 aataacc-ttggttaatgggacaggtgtt 30528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 162192 - 161678
Alignment:
Q  34 aagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatgaa 131  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  162192 aagtgtaggttgtgaagtgagtggtgtgtgttttgtctaagtgtttttagtaaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatgac 162093  T
Q  132 aaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcag 230  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||     | ||| | |||||||||| |   || |||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  162092 aaatttggggcgcgtgaaagtatgtttaaagctttaaaaatcgtcattgccctctaaagtcatacaccaatataaataggccacgtcagagccgtttcag 161993  T
Q  231 a-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgcta-ttcagaagcaaataaaaccgtttctga 327  Q
    | |||||     || | || ||||| || ||||||  || ||||||| |||||||| |||||||   | ||  |||||||||||| |   |   ||||||    
T  161992 acaaactgc---ttagttagtgggataggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccactaatactacttgttcagaagcaaaaacttcaacttctga 161896  T
Q  328 agtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaa 427  Q
    |||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |  ||| |||| |||| |||||||  |    
T  161895 agttcaattgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgaaggaccataa-cttttgaacagacctcagaactta 161797  T
Q  428 acttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgta 527  Q
    |||| | |||| |   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  161796 acttttaattcaggagcaagcaagcttt-aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatcttttaacagataaaggcttagta 161698  T
Q  528 aatatatcagcccattgatg 547  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  161697 aatatatcagcccattgatg 161678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 548
Target Start/End: Original strand, 3174 - 3691
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaat 128  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||    
T  3174 atgaatgtgtaggttgtgaagtgagtaatgtgtgttttgtctaagtgttttaagtaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaat 3273  T
Q  129 gaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaa--aagcaaataaaacatcattgcccttttt-gttatactccaatacaaatagaccacgtcagagactt 225  Q
    || || ||||||| |||||  |||| ||| ||  ||  ||| ||| |||||||||||  |   || |||| || ||||||||||| |||  ||||| | |    
T  3274 gacaa-ttgggggtgcgtgaaagtacgttcaagcaaaaaaaaaaatcatcattgcccactaaagtcatacaccgatacaaatagatcacaccagagtcgt 3372  T
Q  226 ttcagaa-aactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgttt 323  Q
    || |||| ||||     || | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| | ||||||  || || | ||    
T  3373 ttaagaacaactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaactaccaatgtttcccctaacactgctatttaaaagcaaggaatacagctt 3469  T
Q  324 ctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaa 423  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3470 atgaagtttaagtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcaaaatcttagttaagagcttctgatggaccata-gcttctgaatagacttcagaa 3568  T
Q  424 ccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
    ||||||||||   || |   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  3569 ccaaacttctagctcaggagcaagcaaa--tttaatcagacataaagtgcatgttcaaatatttctttataaaatcaaatctttccacagttaaaggttt 3666  T
Q  524 tgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
     || |||||||||| ||||||||||    
T  3667 agtgaatatatcagtccattgatgt 3691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 548
Target Start/End: Original strand, 12031 - 12325
Alignment:
Q  250 tgggacagctgttacaaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatct 349  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  || ||| |  |  | |||||||||    ||||||| |||||||    
T  12031 tgggacaggtgttaccaaa-gtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaagagaaaagagtatagcttctgaagttaaggtgctgatgtcatct 12129  T
Q  350 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 449  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |   ||| ||    
T  12130 ttagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccata-gcttctgaacatacttcaggacctaacttcttgttcaggagcaaaca 12228  T
Q  450 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12229 aa--tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaaattttctttataaaatcaaatctttccatagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 11809 - 11868
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttt---taagtgtttttagtaaaa 88  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||    
T  11809 gaaagtgtaggttgtgatgtgagtagtgtgtgtgtttttgtctaagtgtttttagtaaaa 11868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31146 - 30870
Alignment:
Q  269 agtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctc 368  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||  || || | || |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  31146 agtaacttccaacgtttccactaacactgcaattcagaagtaagaaatacagcttttgaagtttaagtgctgtcgtcatcttcaaaagcacattttccta 31047  T
Q  369 agaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccg-agacaagcaaatttttaatcagacaca 467  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31046 agaatctcagttaagagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcagaaccaaacttcttgttcaggaga-aagcaaattt--aatcagacaca 30951  T
Q  468 aagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||  |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  30950 aagtgcatgttcaaatttttctttataacatcaaacctttccacaattaaaggtttagtgaatatatcagcccattgatgt 30870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31223 - 31183
Alignment:
Q  192 atactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcagaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31223 atacaccaatacaaatagaccacgtcagagtcgtttcagaa 31183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Original strand, 2742 - 2951
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |      
T  2742 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttctgatggaccataa-cttctgaacagacttcaggacctaacttatag 2840  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  2841 ttcaggagcaagcaa--tttaaatcagacacaaagtgcatgttcaagtttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatc 2938  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    ||| |||||||||    
T  2939 agctcattgatgt 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8101 - 7961
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttct 433  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  8101 agtgctgatgtcctcttcagaagcacattttgctcagaatctcagttaagggcttttgatagaccata-gcttctaaacagacttcaggaccaaacttct 8003  T
Q  434 tattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgt 477  Q
      ||| |   ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  8002 agttcaggagcaagcaaa--tttaatcaaacacaaagtgcatgt 7961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8401 - 8301
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  8401 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgatttatctaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatg 8302  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  8301 a 8301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 2439 - 2539
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||    
T  2439 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagcgtgtgatttgtctaagtgttttgagaaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatg 2538  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  2539 a 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 334 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3736 - 3525
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttct 433  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3736 agtgctgatgtcatcttcagaaacgcattttcctcagaatctcaattaagagcttctgatgtaccata-gcttctgaacatacttcaggaccaaacttct 3638  T
Q  434 tattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatata 533  Q
      ||| |   ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  3637 agttcaggagcaaacacattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatata 3540  T
Q  534 tcagcccattgatgt 548  Q
    ||| |||||||||||    
T  3539 tcaacccattgatgt 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 334 - 548
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7583
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7372 agtgctgacgtcatcttcagaaaaacattttcctcagaatcttagttaagagcttctgatggaccatg-gcttctaaacagacttcagaaccaaacttct 7470  T
Q  434 tattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatata 533  Q
      ||| |  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  7471 agttcaggaacaagctaattt--aatcagacacaaagtgcatgtttaaatttttcttaataaaatcgaatctttccacagttaaaggtttagtaaatata 7568  T
Q  534 tcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||    
T  7569 tcagcccattgatgt 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 7073 - 7161
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttag-taaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaaca 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  7073 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgttttttctaagtgttttgagcaaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaaca 7161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22479 - 22271
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||    
T  22479 tgctgatgccatcttcagaggcacattttcctcagaacctcaataaagagcttctaatggaccata-gcttctgaac-gacttcaggacctaaattccta 22382  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||  |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||    
T  22381 ttaaggagcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacatttaaatgcttagtaaatatatc 22284  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||    
T  22283 agcccattgatgt 22271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold1365
Description:

Target: scaffold1365; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 264 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 720
Alignment:
Q  264 caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |   |   ||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  999 caaaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcaaagagtccaacttctgaact-tcagatgctgacgtcatcttcagaaacacatt 901  T
Q  363 ttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatg-cttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatca 461  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |  || ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||  |  | ||||   |||||||||    
T  900 ttcctcagaatctcagttaagagcttatgatggacta--tgacttctgaact-acttcaggacctaacttcttattcataagcgagca---ttttaatca 807  T
Q  462 gacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  806 gacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatctttccacaattaaaggcttagttaatatatcagcccattgatgt 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1365; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1075
Alignment:
Q  35 agtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtg-tttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  1173 agtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgattttgtctaagtgtttttagtaaaaacgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 336 - 551
Target Start/End: Original strand, 42374 - 42585
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||  || ||  |     
T  42374 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcaggacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttcagaacgtaaatttatg 42471  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  42472 ttcaggagcaagcaaattt--aatgagacacaaagtgcatgttcaaatttttccttataaaatcaaatctttccacagttaaacgcttagtaaatatatc 42569  T
Q  536 agcccattgatgtcca 551  Q
    | ||||||||||||||    
T  42570 atcccattgatgtcca 42585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 42094 - 42198
Alignment:
Q  30 atgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| | ||||    
T  42094 atgaaagtgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgaatagtaaaacgtttgcaattcagaaggggaaaaacaaacacaacatt 42193  T
Q  126 aatga 130  Q
    |||||    
T  42194 aatga 42198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Original strand, 2143 - 2351
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | | |||||||||  ||||||| |||| || ||| |     
T  2143 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaataaagatcttctgatggattata-gcttctgaac-gacttcataacctaaattcctg 2240  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||| |   |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  2241 ttcaggagcaagcaaattt--aatcagaaacaaagtgcatgttcaaatttttatttataaaatcaaatctttccattgttaaaggcttagtaaatatatc 2338  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||    
T  2339 agcccattgatgt 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 1836 - 1940
Alignment:
Q  27 gaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcatt 125  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||    
T  1836 gaaatgaaagtgtatgttatgaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgtttttagtaaaacgattgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacatt 1935  T
Q  126 aatga 130  Q
    |||||    
T  1936 aatga 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3344 - 3133
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttct 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| | ||||||||| | ||||||| |  ||||||||    
T  3344 agtgctgacgtcatcttcaaaagcacattttcctcagaatcttagttaagagcttctaatagaccata-gcttctgaacaaacttcaggattaaacttct 3246  T
Q  434 tattcc-gagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatat 532  Q
      |||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  3245 agttcatgag-caagaaaatttat--tcagacacaaagtgcatgttcaaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatat 3149  T
Q  533 atcagcccattgatgt 548  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3148 atcagtccattgatgt 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3643 - 3545
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagt-aaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  3643 gaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgaattgtgtaagtgttttgagtaaaaacgtttgcaatttagaagggac-aacaaacacaacattaatga 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Original strand, 2988 - 3196
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||| |  |||||||| | | ||||||||| | || |||||||| |||||||||    
T  2988 tgctgacatcatcctcagaagcacattttcctttgaatctcagtaaagagttgttgatggactata-gcttctgaaca-acatcagaacctaacttctta 3085  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    ||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  3086 tttagaggcaagcaaattt--aatcagacacaaagtgcatattcaaatttttctttataaaattaaatctttccacacttaaaggcttagtaaatatatc 3183  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||    
T  3184 agcccattgatgt 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 66
Target Start/End: Original strand, 2685 - 2719
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 66  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2685 gaaagtgtatgttgtgaagtgagtagtgtgtgttt 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 336 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27775
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttctta 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||| |||||| || ||| |     
T  27983 tgctgatgtcatcttcagaagcacattttccttagaacctcaataaagagcttctgatggactata-gcttctgaac-gacttaagaacctaaattcctg 27886  T
Q  436 ttccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatc 535  Q
    | | |   |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  27885 tccaggagcaagcagattt--aatcagacataaagtgcatgttcaaacttttctttataaaatcaaatctttccgcagttaaaggcttagtaaatatatc 27788  T
Q  536 agcccattgatgt 548  Q
    | |||||||||||    
T  27787 aacccattgatgt 27775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1471
Alignment:
Q  10 gcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagag-a 108  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  1626 gcagagaaagtttagagaaaatgaaagtgtaggttgtgaagtgagtagtgtgtgtattgtcaaagtgttttaagtaaaacgattgcaattcaaaagggga 1527  T
Q  109 caaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagtatgtttaaaagc 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1526 caaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagtaagtttaaaagc 1471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 131059 - 130724
Alignment:
Q  192 atactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga-aaactaacctttgggtaatgggacagctgttacaaaa-agtaactgccaacgttcccac 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||     || | || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  131059 atacaccaatacaaatagaccatgtcagaggcatttcagacaaactgc---ttagttagtgggacaggtgttactgaagagtaacttccaacgtttccac 130963  T
Q  290 taaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttc 389  Q
    ||||| | ||||||||||||||  || ||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  130962 taaccctactattcagaagcaaggaacacaacttcttaaattttagtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatctcagttaagagcttc 130863  T
Q  390 tgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttct 489  Q
    |||                  | |||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  130862 tga------------------acagacttcagaaccaaacttcttgttcaggagcaagcaaatttat--ttatacacaaagtgcatgttcaaatttttct 130783  T
Q  490 ttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||||    
T  130782 ttataaaatcaaatatttccacagttaatggtttagtggatatatcagcccattgatgt 130724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13372 - 13196
Alignment:
Q  343 gtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgag 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||||| || ||| | ||| |      
T  13372 gtcatcttcataagcacattttcctcagaacctcaataaagagcttttgattgactata-gcttctgaac-gacttcagaacctaaattcctgttcagga 13275  T
Q  443 acaagcaaatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctt 523  Q
     |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  13274 gcaagcaaattt--aatgagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaatcaaatatttccacagttaaaggctt 13196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13580
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttt---tagtaaaacgtttgcaattc--aaaagagacaaacaaacatagcatta 126  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||| | |||||    
T  13683 gaaattgtaggttgttaagtgagtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtagtaaaacgattgcaattcagaaaggggacaaacaaacacaacatta 13584  T
Q  127 atga 130  Q
    ||||    
T  13583 atga 13580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1362 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1362
Description:

Target: scaffold1362; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 94 - 1
Alignment:
Q  8 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattcaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  94 tagcagagaaggttaagatgaaatgaaagtgtgagttgtgaagtgagttgtgtgtgtttg-tttaagtgtttttatcaaaacgtttgcaattcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2633 - 2445
Alignment:
Q  49 agtgagtagtgtgtgtttgtttta---agtgttttta-gtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgc 144  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| | | |||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2633 agtgagttgtgtgtgtttggtttatatagtgttttgatgaaaaacgattacaattcagaggagacaaacaaacatagcattaatgacaaattgggggcgc 2534  T
Q  145 gtgttagtatgtttaaaagcaaataaa-acatcattgcccttt-ttgttatactccaatacaaatagaccacgtcagagacttttcaga 231  Q
    |||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2533 gtgaaagtacgtttaaaagcttataaagtcatcattgccctttcaagttatacaccaatacaaatagaccacgtcagaggtttttcaga 2445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2124 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold2124
Description:

Target: scaffold2124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 548
Target Start/End: Original strand, 809 - 1002
Alignment:
Q  350 tcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagca 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | | ||||||||| | |||| ||| || || ||| ||||  ||| |||| |    
T  809 tcagaagcacattttcctcagaacctcagtgaagagcttctaatggactata-gcttctgaaca-acttgagagcctaaattcctatttagaggcaagta 906  T
Q  450 aatttttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  907 ---ttttaatcatacacaaagtgcatgttcaaatttttcatcataaaatcaaatcactccacaattaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 130
Target Start/End: Original strand, 536 - 597
Alignment:
Q  71 taagtgtttttagtaaaac-gtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  536 taagtgtttttagtaaaaaagtttgcaattcagaaggggacaaacaaacataacattaatga 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 541
Target Start/End: Original strand, 73015 - 73198
Alignment:
Q  354 aagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatt 453  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||  || |||  |    
T  73015 aagcacattttcctcaaaacctcattgaaaagcttttgatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggaaatcaa--t 73110  T
Q  454 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  73111 tttaatcagatacaaaatgcatgttcgaatttttctttataaattcaaatctttcaacaattaaaggctttgtgaatatatcagccca 73198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 541
Target Start/End: Original strand, 85205 - 85388
Alignment:
Q  354 aagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggaccagatgcttctgaatagacttcagaaccaaacttcttattccgagacaagcaaatt 453  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||| | | ||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||  || |||  |    
T  85205 aagcacattttcctcaaaacctcattgaaaagcttttgatggactata-gcttctgaaca-acttcagaacctaaattcctattcagaggaaatcaa--t 85300  T
Q  454 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagccca 541  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  85301 tttaatcagatacaaaatgcatgttcgaatttttctttataaattcaaatctttcaacaattaaaggctttgtgaatatatcagccca 85388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 454 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6021 - 5927
Alignment:
Q  454 tttaatcagacacaaagtgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6021 tttaatcagacacaaagtgcgtgttccaatttttcttaataaaatcaaatctttccacagttaaaggcttagtaaatatatcagcccattgatgt 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6113 - 6048
Alignment:
Q  334 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  6113 agtgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatgtcatataagagcttctgatggacca 6048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 1
Alignment:
Q  33 aaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaa-cgtttgcaattcaaaagag-acaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  114 aaagtgttggttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgtct-aagtgtttttagtaaaaacgattgcaattcataaggggacaaacaaacatagcattaatga 16  T
Q  131 aaaattgggggcgcg 145  Q
     ||||||||||||||    
T  15 caaattgggggcgcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 399
Target Start/End: Original strand, 788 - 851
Alignment:
Q  336 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaacctcaattaagagcttctgatggacca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  788 tgctgacgtcatcttcagaagcacattttcctcagaatttcagttaagagcttctgatggacca 851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 487 - 586
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  487 gaaagtgtaggttgtgaagtgcgtagtgtgtgatttgtctaagtgttttgagtaaaatgtttgcaattcagaaggggacaaacaaacacaacattaatga 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1481 - 1355
Alignment:
Q  264 caaaaagtaactgccaacgttcccactaaccttgctattcagaagcaaataaaaccgtttctgaagtcttag-tgctgacgtcatcttcagaagcacatt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||| | ||  | | ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  1481 caaaaagtaacttccaacgtttccactaactctgctattcaggagcataaaacccagcttctggagt-tcagatgctgatgtcatcttcagaaggacatt 1383  T
Q  363 ttcctcagaacctcaattaagagcttct 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1382 ttcctcagaacctcagttaagagcttct 1355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 548
Target Start/End: Original strand, 73625 - 73702
Alignment:
Q  471 tgcatgttcaaatttttctttataaaaacaaatctttcaacagataaaggctttgtaaatatatcagcccattgatgt 548  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  73625 tgcatgttcaaatttttcctaataaaatcaaatcttttaatagttaaaggttttgtgaatatatcagcccattgatgt 73702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 5617 - 5693
Alignment:
Q  77 tttttagtaaaacgtttgcaattcaaaagagacaaacaaacatagcattaatgaaaaattgggggcgcgtgttagta 153  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5617 tttttattaaaacgtttgtaattcagaggggacaaacaaacacagcattaatgacaaattgggggcgcgtgtaagta 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 372
Alignment:
Q  32 gaaagtgtaagttgtgaagtgagtagtgtgtgtttgttttaagtgtttttagtaaaacgtttgcaattca-aaagagacaaacaaacatagcattaatga 130  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  471 gaaagtgtaggtagtgaagtgagttgtgtgtgatttgtccaagtgttttgagtaaaacatttgcaattcagaaggggacaaacaaacacagcattaatga 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University