View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6978_low_12 (Length: 530)

Name: NF6978_low_12
Description: NF6978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6978_low_12
NF6978_low_12
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (21-518)||(37261294-37261789)
chr5 (21-518)||(25542526-25543033)
chr5 (21-518)||(14192545-14193052)
chr5 (21-518)||(27881063-27881570)
chr5 (21-518)||(39883162-39883669)
chr5 (21-513)||(3689961-3690463)
chr5 (21-513)||(3876324-3876826)
chr5 (25-509)||(17871375-17871868)
chr5 (21-518)||(37372915-37373422)
chr5 (21-518)||(8428318-8428814)
chr5 (21-296)||(30346362-30346637)
chr5 (21-286)||(10025199-10025464)
chr5 (21-296)||(24629686-24629954)
chr5 (371-518)||(24629954-24630101)
chr5 (371-518)||(30346637-30346784)
chr5 (371-518)||(10025042-10025189)
chr5 (475-508)||(6089199-6089232)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (21-514)||(10038623-10039116)
chr3 (21-518)||(10110579-10111086)
chr3 (21-518)||(10000386-10000893)
chr3 (21-518)||(10968515-10969021)
chr3 (21-518)||(13530018-13530525)
chr3 (21-518)||(50410151-50410654)
chr3 (21-518)||(32750-33257)
chr3 (21-518)||(10237535-10238040)
chr3 (21-518)||(11368625-11369125)
chr3 (87-516)||(11362239-11362681)
chr3 (242-518)||(52918045-52918330)
chr3 (330-518)||(46913050-46913238)
chr3 (21-201)||(52918332-52918512)
chr3 (351-518)||(47692948-47693115)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-518)||(186534-187040)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (21-518)||(5828288-5828795)
chr7 (21-518)||(21069795-21070302)
chr7 (21-518)||(9000878-9001385)
chr7 (21-518)||(7036699-7037206)
chr7 (21-518)||(12780881-12781389)
chr7 (25-509)||(22843792-22844285)
chr7 (89-518)||(12785790-12786218)
chr7 (21-296)||(42232210-42232486)
chr7 (371-518)||(42232063-42232210)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (21-518)||(2201912-2202419)
chr6 (66-518)||(10187523-10187985)
chr6 (21-518)||(18344104-18344611)
chr6 (25-509)||(30881315-30881808)
chr6 (131-518)||(15333622-15334019)
chr6 (207-516)||(29639947-29640266)
chr6 (207-516)||(31510118-31510437)
chr6 (21-261)||(12517520-12517760)
chr6 (363-518)||(12517367-12517522)
chr6 (54-199)||(18814054-18814199)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (21-518)||(1860656-1861163)
chr4 (21-518)||(35855886-35856393)
chr4 (21-518)||(49710152-49710658)
chr4 (30-518)||(38518075-38518573)
chr4 (89-518)||(49786640-49787068)
chr4 (21-412)||(13337320-13337721)
chr4 (21-330)||(617957-618266)
chr4 (21-296)||(55558856-55559131)
chr4 (371-518)||(55559131-55559278)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (21-518)||(24268803-24269310)
chr2 (21-518)||(27509353-27509860)
chr2 (30-510)||(24245812-24246302)
chr2 (21-518)||(27192468-27192975)
chr2 (21-518)||(27842282-27842789)
chr2 (21-518)||(21395349-21395856)
chr2 (56-518)||(17683597-17684069)
chr2 (89-518)||(28665984-28666412)
chr2 (89-518)||(37824818-37825246)
chr2 (90-518)||(41919986-41920413)
chr2 (21-293)||(35609867-35610139)
chr2 (330-518)||(35609664-35609852)
chr2 (28-179)||(3642920-3643071)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (21-518)||(2452850-2453357)
chr1 (21-518)||(36207194-36207701)
chr1 (21-518)||(16042004-16042511)
chr1 (32-518)||(2329148-2329641)
chr1 (21-515)||(37389885-37390389)
chr1 (21-518)||(48775068-48775575)
chr1 (25-518)||(6310731-6311235)
chr1 (121-518)||(18148667-18149074)
chr1 (21-377)||(48233498-48233864)
chr1 (21-296)||(52500795-52501063)
chr1 (330-518)||(48238529-48238717)
chr1 (371-518)||(52500648-52500795)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (21-515)||(18988-19491)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (21-518)||(21113477-21113984)
chr8 (21-518)||(25218298-25218805)
chr8 (21-518)||(25208780-25209272)
chr8 (21-518)||(7821817-7822324)
chr8 (109-518)||(30307156-30307575)
chr8 (330-518)||(31978579-31978767)
chr8 (21-105)||(30325877-30325961)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (21-518)||(17610-18109)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (21-518)||(31912-32418)
scaffold0073 (294-518)||(19436-19670)
scaffold0073 (21-257)||(1-237)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (30-518)||(314-812)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (21-518)||(4993-5499)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (21-518)||(321069-321576)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (21-514)||(182794-183297)
scaffold0003 (21-516)||(165511-166019)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (89-514)||(983-1418)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (89-518)||(48748-49176)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (21-296)||(28452-28727)
scaffold0118 (371-518)||(28727-28874)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (88-326)||(39937-40175)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (302-518)||(16663-16889)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (21-173)||(14010-14162)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (406-518)||(30-142)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (442-518)||(1627-1703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 37261789 - 37261294
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37261789 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaa 37261690  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  37261689 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 37261590  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  37261589 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgcttatattggacacaacaa--c 37261492  T
Q  321 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37261491 cgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgag 37261392  T
Q  421 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37261391 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 37261294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 25542526 - 25543033
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25542526 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 25542625  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  25542626 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaag 25542725  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25542726 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaata 25542825  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25542826 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25542925  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25542926 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattat 25543025  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  25543026 gatgtcca 25543033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 14192545 - 14193052
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  14192545 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaa 14192644  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14192645 gatatgggcttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaag 14192744  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192745 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 14192844  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  14192845 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 14192944  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192945 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 14193044  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  14193045 gatgtcca 14193052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27881570 - 27881063
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27881570 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaa 27881471  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27881470 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaag 27881371  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27881370 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgacaatggtgaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatc 27881271  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27881270 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27881171  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  27881170 ttcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattat 27881071  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  27881070 gatgtcca 27881063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39883669 - 39883162
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39883669 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 39883570  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39883569 gatattggcttattgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 39883470  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39883469 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 39883370  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39883369 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 39883270  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  39883269 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattat 39883170  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  39883169 gatgtcca 39883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3690463 - 3689961
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690463 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3690364  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3690363 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3690264  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3690263 tggatactctcaattggagacggcaacgacacttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3690164  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  3690163 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3690064  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3690063 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3689964  T
Q  511 gat 513  Q
    |||    
T  3689963 gat 3689961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Original strand, 3876324 - 3876826
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876324 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3876423  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3876424 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3876523  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3876524 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3876623  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  3876624 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3876723  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3876724 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3876823  T
Q  511 gat 513  Q
    |||    
T  3876824 gat 3876826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Original strand, 17871375 - 17871868
Alignment:
Q  25 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17871375 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 17871474  T
Q  125 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 224  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  17871475 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 17871574  T
Q  225 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 324  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871575 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 17871673  T
Q  325 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 414  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  17871674 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 17871773  T
Q  415 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 509  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871774 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 37373422 - 37372915
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  37373422 gaatcacagtagttttaggtggtgattttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaa 37373323  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37373322 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37373223  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  37373222 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatc 37373123  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37373122 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37373023  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  37373022 ttcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattct 37372923  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  37372922 gatgtcca 37372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 8428318 - 8428814
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8428318 gaatggcagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 8428417  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8428418 gatatgggcttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 8428506  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8428507 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 8428606  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8428607 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttga 8428706  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  8428707 ttcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattct 8428806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 30346362 - 30346637
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30346362 gaatgacaatagttttaggtggtgatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 30346461  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30346462 gatatgtgcttattttaatgtgttaagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 30346561  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  30346562 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10025464 - 10025199
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10025464 gaatgacaatagttttaggtggtgatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10025365  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10025364 gatatgtgcttattttgatgtgttgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10025265  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatt 286  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  10025264 tggatactctgaattagagacggtaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatt 10025199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 24629686 - 24629954
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24629686 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 24629785  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  24629786 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 24629878  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  24629879 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630101
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 24630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346784
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 30346784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10025042
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 10025042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6089199
Alignment:
Q  475 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 6089199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10039116 - 10038623
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039116 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10039017  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10039016 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 10038917  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10038916 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgctttagatgagaatggtgaaacgaaggtataaattttcgaagatttgcttatatcagacacaacaaatc 10038817  T
Q  321 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 420  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10038816 tgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgag 10038717  T
Q  421 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038716 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 10038623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10111086 - 10110579
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10111086 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10110987  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10110986 gatatgagcttattttaatgtgttaatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10110887  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10110886 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatc 10110787  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10110786 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10110687  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10110686 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10110587  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  10110586 gatgtcca 10110579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10000893 - 10000386
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10000893 gaatgacaatagttttaggtggggatttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10000794  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  10000793 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaag 10000694  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10000693 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatc 10000594  T
Q  321 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||          | |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10000593 tgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttga 10000494  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10000493 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10000394  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  10000393 gatgtcca 10000386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 10968515 - 10969021
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968515 gaatgacagtagttttagatggtgatttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10968614  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968615 gatatgggtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 10968714  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10968715 tggacactctcaattggagatggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctg-agatttgctgatatcggacacaacaaatc 10968813  T
Q  321 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10968814 cgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaacttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10968913  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10968914 ttcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattct 10969013  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  10969014 gatgtcca 10969021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13530525 - 13530018
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13530525 gaatgacagtagttttagctggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaca 13530426  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13530425 gatatgggcttattgtaatgtgtagaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 13530326  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13530325 tatatactctcaattggagacggcaacgacgcatcaggtgagaatggtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatc 13530226  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13530225 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttca 13530126  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13530125 ttcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaatttt 13530026  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    | ||||||    
T  13530025 ggtgtcca 13530018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 50410654 - 50410151
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50410654 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaa 50410555  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50410554 gatattggcttattctaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 50410455  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50410454 tggatactctcaattagagacggtaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaag----aaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 50410359  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50410358 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgacccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 50410259  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410258 ttcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattct 50410159  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  50410158 gatgtcca 50410151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33257 - 32750
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33257 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 33158  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33157 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 33058  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33057 tggatactctcaattagagacggcaacaatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 32958  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32957 cgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 32858  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32857 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 32758  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  32757 gatgtcca 32750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10238040 - 10237535
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238040 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10237941  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10237940 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataagattggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10237841  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  | |||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10237840 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcgga-gggaatggtgaaataacggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatc 10237742  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10237741 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10237642  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10237641 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaagagta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10237543  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  10237542 gatgtcca 10237535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11369125 - 11368625
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369125 gaatgacagtagttttaagtggtgatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 11369026  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  11369025 gatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaag 11368926  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||         ||||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11368925 tggataccctcaattggagaggacaac---------gatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatc 11368835  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgct-atttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttg 409  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  11368834 cgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttg 11368735  T
Q  410 attcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaaatt 508  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |    
T  11368734 attcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagt 11368635  T
Q  509 ctgatgtcca 518  Q
    ||||||||||    
T  11368634 ctgatgtcca 11368625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 87 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11362681 - 11362239
Alignment:
Q  87 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  11362681 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacc 11362582  T
Q  187 tgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaa 284  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |||    
T  11362581 tgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaa 11362482  T
Q  285 tttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatt 374  Q
    || |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  11362481 ttcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatt 11362382  T
Q  375 tttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtattt 473  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||    
T  11362381 tttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagattttttt 11362282  T
Q  474 aagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtc 516  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11362281 aagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtc 11362239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 52918330 - 52918045
Alignment:
Q  242 ggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------t 331  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |          |    
T  52918330 ggcaacgacgcttcggatgggaatggtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagact 52918232  T
Q  332 ttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatga 431  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  52918231 tcgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacga 52918132  T
Q  432 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918131 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 52918045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 46913238 - 46913050
Alignment:
Q  330 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 429  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  46913238 ctttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 46913139  T
Q  430 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46913138 gaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtcca 46913050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52918512 - 52918332
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918512 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 52918413  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaaga 201  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  52918412 gatacgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692948
Alignment:
Q  351 tgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgatt 450  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  451 ccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtcca 47692948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 187040 - 186534
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  187040 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaa 186941  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  186940 gatatgggcttattgtaatgttttaaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 186841  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  186840 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatc 186741  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  186740 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttga 186641  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  186640 ttcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaattct 186542  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  186541 gatgtcca 186534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 5828288 - 5828795
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5828288 gaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 5828387  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5828388 gatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5828487  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828488 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5828587  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5828588 ttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttga 5828687  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5828688 ctcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattat 5828787  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  5828788 gatgtcca 5828795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 21069795 - 21070302
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21069795 gaatcacagtagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 21069894  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  21069895 gatatgggtttattgtaatgtatcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaag 21069994  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21069995 tggatactctcaattggagacggcaacgacgtttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatc 21070094  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21070095 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21070194  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  21070195 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattta 21070294  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  21070295 gatgtcca 21070302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 9000878 - 9001385
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9000878 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 9000977  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9000978 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaag 9001077  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9001078 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatc 9001177  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  9001178 cgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttga 9001277  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9001278 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 9001377  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  9001378 gatgtcca 9001385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7037206 - 7036699
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7037206 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7037107  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  7037106 gatataggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 7037007  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  7037006 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatc 7036907  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7036906 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7036807  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7036806 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7036707  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  7036706 gatgtcca 7036699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 12780881 - 12781389
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12780881 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 12780980  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  12780981 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 12781080  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12781081 tggatactctcaattggagacgacaatgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatc 12781180  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12781181 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 12781280  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattc 509  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12781281 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattc 12781380  T
Q  510 tgatgtcca 518  Q
    |||||||||    
T  12781381 tgatgtcca 12781389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22844285 - 22843792
Alignment:
Q  25 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22844285 gacaaaagttttaggtggtgatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 22844186  T
Q  125 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 224  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  22844185 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattgga 22844086  T
Q  225 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 324  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22844085 tactcttaattagagaaggcaacgtcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgtt 22843987  T
Q  325 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 414  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  22843986 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattct 22843887  T
Q  415 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 509  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22843886 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 518
Target Start/End: Original strand, 12785790 - 12786218
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  12785790 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 12785878  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  12785879 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 12785978  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12785979 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 12786078  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12786079 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 12786178  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12786179 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 12786218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42232486 - 42232210
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagtttt-atgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42232486 gaatgacaatagtttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaa 42232387  T
Q  120 agatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcat 219  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42232386 agatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaa 42232287  T
Q  220 gtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  42232286 gtggatactctgaattggagacggcaacaacggttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42232063
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 42232063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 2201912 - 2202419
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2201912 gaatgacagtagttttaggtggtgacttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaa 2202011  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2202012 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 2202111  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2202112 tggatactctcaattggagaaggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatc 2202211  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  2202212 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 2202311  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2202312 ttcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2202411  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  2202412 gatgtcca 2202419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 66 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10187985 - 10187523
Alignment:
Q  66 ttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgag 165  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10187985 ttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgag 10187886  T
Q  166 attaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaat 265  Q
    ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10187885 attgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaat 10187786  T
Q  266 ggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgata 355  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10187785 ggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 10187686  T
Q  356 accttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccagg 455  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10187685 accttggtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccagg 10187586  T
Q  456 tgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10187585 tgaagagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 10187523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18344611 - 18344104
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18344611 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaaa 18344512  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18344511 gatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 18344412  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344411 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 18344312  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||| ||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18344311 cgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 18344212  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18344211 ttcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaatttt 18344112  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  18344111 gatgtcca 18344104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30881808 - 30881315
Alignment:
Q  25 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30881808 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 30881709  T
Q  125 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 224  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30881708 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 30881609  T
Q  225 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 324  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881608 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 30881510  T
Q  325 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 414  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  30881509 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 30881410  T
Q  415 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 509  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881409 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15334019 - 15333622
Alignment:
Q  131 tattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactct 230  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15334019 tattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 15333920  T
Q  231 caattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt- 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||     
T  15333919 caattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtc 15333820  T
Q  330 ---------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 420  Q
             ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15333819 actaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgag 15333720  T
Q  421 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15333719 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtcca 15333622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 207 - 516
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29640266
Alignment:
Q  207 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 306  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatc 29640046  T
Q  307 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 396  Q
       ||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29640047 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactc 29640146  T
Q  397 gcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 496  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  29640147 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 29640246  T
Q  497 cgggtgaaaattctgatgtc 516  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29640247 cgggtgaaaattctgatgtc 29640266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 207 - 516
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510437
Alignment:
Q  207 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 306  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgtttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatc 31510217  T
Q  307 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 396  Q
       ||||||||||| |||||||||          ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31510218 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataaccttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactc 31510317  T
Q  397 gcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 496  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  31510318 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 31510417  T
Q  497 cgggtgaaaattctgatgtc 516  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31510418 cgggtgaaaattctgatgtc 31510437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12517760 - 12517520
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  12517760 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 12517661  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12517660 gatatgggcttattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 12517561  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatga 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12517560 tggatactctcaattggagacgacaacgacacttcggatga 12517520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517367
Alignment:
Q  363 tgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  463 aaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtcca 12517367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18814199 - 18814054
Alignment:
Q  54 agatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttac 153  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18814199 agatattgcatgttgtccgaaaaggaacgagacatgatattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttac 18814100  T
Q  154 tgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  18814099 tgttaatatgagattgggtgcatcgttggtacctgtagagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1861163 - 1860656
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1861163 gaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 1861064  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1861063 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 1860964  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860963 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 1860864  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1860863 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 1860764  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1860763 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattct 1860664  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  1860663 gatgtcca 1860656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35856393 - 35855886
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35856393 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 35856294  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35856293 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 35856194  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35856193 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 35856094  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35856093 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 35855994  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35855993 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 35855894  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  35855893 gatgtcca 35855886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 49710658 - 49710152
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  49710658 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaa 49710559  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49710558 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaag 49710459  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49710458 tggatactctcaattggacacggcaacgatgcttcggatgaaaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 49710359  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    | |||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49710358 c-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 49710260  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49710259 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 49710160  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  49710159 gatgtcca 49710152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38518573 - 38518075
Alignment:
Q  30 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 129  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||  |||||| ||   |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38518573 tagttttaggtggtgattttaggcagatattaactgttgtctgaggaggaacgagaccggatattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggc 38518474  T
Q  130 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 229  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38518473 ttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactc 38518374  T
Q  230 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38518373 tcaattggagacggcaacgatgctttgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgt 38518274  T
Q  330 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttga 419  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  38518273 cacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattga 38518174  T
Q  420 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38518173 gcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 38518075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 89 - 518
Target Start/End: Original strand, 49786640 - 49787068
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  49786640 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 49786728  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  49786729 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 49786828  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49786829 tgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49786928  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49786929 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacct 49787028  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49787029 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49787068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13337721 - 13337320
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13337721 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 13337622  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13337621 gatatgatattattgtaatgtgttgaggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 13337522  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13337521 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 13337422  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||| ||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  13337421 cgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 13337322  T
Q  411 tt 412  Q
    ||    
T  13337321 tt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 617957 - 618266
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617957 gaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 618056  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  618057 gatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaag 618156  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  618157 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 618256  T
Q  321 cgttgatgtc 330  Q
    |||| |||||    
T  618257 cgttcatgtc 618266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 55558856 - 55559131
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55558856 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 55558955  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55558956 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 55559055  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  55559056 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559278
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 55559278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 24268803 - 24269310
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24268803 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 24268902  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24268903 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 24269002  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269003 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 24269102  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24269103 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 24269202  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24269203 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 24269302  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  24269303 gatgtcca 24269310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27509860 - 27509353
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509860 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27509761  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27509760 gatatgggcttattgtaatgtattgaggcttactgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 27509661  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27509660 tagatactctcaattggagacagcaacgacgcttcagatgagaatggtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaatt 27509561  T
Q  321 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  27509560 cgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 27509461  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509460 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 27509361  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
     |||||||    
T  27509360 aatgtcca 27509353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24246302 - 24245812
Alignment:
Q  30 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaa-ggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246302 tagttttaggtggtgatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 24246203  T
Q  129 cttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatact 228  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24246202 cttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagatt-ggtgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattct 24246104  T
Q  229 ctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24246103 ctcaattggagacggcaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatg 24246004  T
Q  329 t----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttg 418  Q
    |          | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24246003 tcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttg 24245904  T
Q  419 agcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245903 agcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27192975 - 27192468
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192975 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27192876  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27192875 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27192776  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192775 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27192676  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27192675 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27192576  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  27192575 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaattttt 27192476  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  27192475 gatgtcca 27192468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27842789 - 27842282
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842789 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27842690  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27842689 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27842590  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842589 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27842490  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27842489 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27842390  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  27842389 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaattttt 27842290  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  27842289 gatgtcca 27842282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21395856 - 21395349
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21395856 gaatgaccgtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaa 21395757  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  21395756 gttatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaag 21395657  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21395656 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 21395557  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21395556 cgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21395457  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21395456 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 21395357  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  21395356 gatgtcca 21395349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 56 - 518
Target Start/End: Original strand, 17683597 - 17684069
Alignment:
Q  56 atattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactg 155  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  17683597 atattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattg 17683696  T
Q  156 ttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683697 ttaatatgagattgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 17683796  T
Q  256 ggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaat 345  Q
     ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||    
T  17683797 agatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgat 17683896  T
Q  346 ttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcac 445  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17683897 ttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcac 17683996  T
Q  446 tgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17683997 tgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 17684069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 518
Target Start/End: Original strand, 28665984 - 28666412
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  28665984 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 28666072  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  28666073 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 28666172  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  28666173 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 28666272  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28666273 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 28666372  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  28666373 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 28666412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 518
Target Start/End: Original strand, 37824818 - 37825246
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  37824818 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 37824906  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  37824907 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 37825006  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || | |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37825007 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttc 37825106  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37825107 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 37825206  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  37825207 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 37825246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 90 - 518
Target Start/End: Original strand, 41919986 - 41920413
Alignment:
Q  90 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgc 189  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||| ||||| ||     
T  41919986 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgt 41920074  T
Q  190 agagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttcc 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |     
T  41920075 agagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 41920174  T
Q  290 gaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttcc 379  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41920175 gaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcc 41920274  T
Q  380 aagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctc 479  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  41920275 aagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagataaagagtatttaacctc 41920374  T
Q  480 tgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41920375 tgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 41920413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35610139 - 35609867
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35610139 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaa 35610040  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35610039 gatatggacttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 35609940  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaag 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  35609939 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaag 35609867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 330 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35609852 - 35609664
Alignment:
Q  330 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 429  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||     
T  35609852 ctttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagtatgttaac 35609753  T
Q  430 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35609752 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtcca 35609664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3643071 - 3642920
Alignment:
Q  28 aatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643071 aatagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 3642972  T
Q  128 gcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatctt 179  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3642971 gcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 2452850 - 2453357
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2452850 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaa 2452949  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  2452950 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaag 2453049  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2453050 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatc 2453149  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  2453150 cgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttta 2453249  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2453250 ttgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2453349  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  2453350 gatgtcca 2453357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 36207701 - 36207194
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36207701 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaa 36207602  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36207601 gatatgagtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaag 36207502  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36207501 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaattgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatc 36207402  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36207401 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattga 36207302  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36207301 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattat 36207202  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  36207201 gatgtcca 36207194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16042511 - 16042004
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16042511 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 16042412  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16042411 gatattggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 16042312  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16042311 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 16042212  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16042211 cgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 16042112  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16042111 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 16042012  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  16042011 gatgtcca 16042004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2329641 - 2329148
Alignment:
Q  32 gttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggctt 131  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2329641 gttttaggtggtgatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggctt 2329542  T
Q  132 attgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctc 231  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2329541 attgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctc 2329442  T
Q  232 aattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtct 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2329441 aattagagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtca 2329342  T
Q  332 tt-------gtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcata 424  Q
     |       ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  2329341 cttatagacgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatg 2329242  T
Q  425 ttaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329241 ttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 2329148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Original strand, 37389885 - 37390389
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37389885 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 37389984  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37389985 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37390084  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37390085 tggatattctcaattggagacggcaaagatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 37390184  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37390185 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37390284  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37390285 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 37390384  T
Q  511 gatgt 515  Q
    |||||    
T  37390385 gatgt 37390389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 48775068 - 48775575
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775068 gaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48775167  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  48775168 tatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggtgcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaag 48775267  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48775268 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatt 48775367  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    | |||||||          |||||| |||||  ||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  48775368 ctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataacattggtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 48775467  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||    
T  48775468 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtct 48775567  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  48775568 gatgtcca 48775575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 518
Target Start/End: Original strand, 6310731 - 6311235
Alignment:
Q  25 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||||  |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6310731 gacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagata 6310830  T
Q  125 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 224  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6310831 tgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtgga 6310930  T
Q  225 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 324  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6310931 tagtctccattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgtt 6311030  T
Q  325 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 414  Q
    |||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6311031 gatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 6311130  T
Q  415 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattctgat 513  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6311131 gttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgat 6311230  T
Q  514 gtcca 518  Q
    |||||    
T  6311231 gtcca 6311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 121 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18148667
Alignment:
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaataacgcttcgaaggagaatggtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 18148875  T
Q  321 cgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     |||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18148874 tgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18148775  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18148774 ttcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattct 18148675  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
     |||||||    
T  18148674 tatgtcca 18148667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48233864 - 48233498
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233864 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48233765  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  48233764 gatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 48233665  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    || |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48233664 tgaatactctcaacttgagacgacaacgacgcttcagatgagaatggggaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatc 48233565  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctattttt 377  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  48233564 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52501063 - 52500795
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52501063 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 52500964  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  52500963 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 52500871  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  52500870 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 330 - 518
Target Start/End: Original strand, 48238529 - 48238717
Alignment:
Q  330 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 429  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  48238529 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 48238628  T
Q  430 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48238629 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtcca 48238717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500648
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 52500648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 18988
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491 gaatgacaatagttttaggtggtaatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 19392  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  19391 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaag 19293  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19292 gggatactttgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaata 19193  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19192 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 19093  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19092 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattct 18993  T
Q  511 gatgt 515  Q
    |||||    
T  18992 gatgt 18988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 21113477 - 21113984
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21113477 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 21113576  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21113577 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 21113676  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21113677 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatc 21113776  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21113777 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 21113876  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21113877 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 21113976  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  21113977 gatgtcca 21113984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 25218298 - 25218805
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25218298 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25218397  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25218398 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 25218497  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25218498 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 25218597  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25218598 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25218697  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25218698 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 25218797  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  25218798 gatgtcca 25218805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 25208780 - 25209272
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25208780 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25208879  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  25208880 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaag 25208979  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25208980 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatc 25209079  T
Q  321 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 420  Q
    ||||||||||  |   |||  | | || |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25209080 cgttgatgtcact---tat--agactttaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 25209174  T
Q  421 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  25209175 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtcca 25209272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7822324 - 7821817
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  |  |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7822324 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7822225  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  7822224 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaag 7822125  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7822124 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 7822025  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7822024 cgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7821925  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7821924 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7821825  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  7821824 gatgtcca 7821817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 109 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30307156
Alignment:
Q  109 caattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  209 aattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcgg 308  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcgg 30307376  T
Q  309 acacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgc 398  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307375 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgc 30307276  T
Q  399 gccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcg 498  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||    
T  30307275 accaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcg 30307176  T
Q  499 ggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30307175 ggtgaaaattctgatgtcca 30307156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 330 - 518
Target Start/End: Original strand, 31978579 - 31978767
Alignment:
Q  330 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 429  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||     
T  31978579 ctttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaac 31978678  T
Q  430 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31978679 aaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtcca 31978767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30325961 - 30325877
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctc 105  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  30325961 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctc 30325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 17610 - 18109
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610 gaatgacaagagttttatgtggtgatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 17709  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17710 gatatgggctt-ttgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaag 17808  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809 tggatactctcaattggagacagcaacgaagcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 17908  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||       |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17909 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18001  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18002 tttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattat 18101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32418 - 31912
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32418 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 32319  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32318 gatatgtgcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 32219  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32218 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 32119  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  32118 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaagggg-atacttgcaccaacgcttga 32020  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32019 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 31920  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  31919 gatgtcca 31912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 294 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19436
Alignment:
Q  294 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaaga 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  384 aaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgat 483  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  484 tctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 19436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 1
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || || ||  |||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  237 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaa 138  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
     |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  137 tatattggcttattgtaatgttttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 38  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 518
Target Start/End: Original strand, 314 - 812
Alignment:
Q  30 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  314 tagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggc 413  T
Q  130 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 229  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  414 ttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactc 513  T
Q  230 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  514 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgt 613  T
Q  330 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttga 419  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  614 cacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 713  T
Q  420 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  714 gcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtcca 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 4993 - 5499
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4993 gaatgacaatagttttagatggtgattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaa 5092  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5093 gatatgtgcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5192  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 tggatactctgacttggagacgacaacagcgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5292  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5293 tattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgcta-ttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 5391  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5392 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 5491  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  5492 gatgtcca 5499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Original strand, 321069 - 321576
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  321069 gaatgacaagagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaac 321168  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  321169 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacttttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 321268  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  321269 tggatattctcaatttgagacggcaattatgcttcggttgataatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatc 321368  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  321369 cgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttga 321468  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  321469 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 321568  T
Q  511 gatgtcca 518  Q
    ||||||||    
T  321569 gatgtcca 321576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 183297 - 182794
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  183297 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 183198  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  183197 gatatggccttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 183098  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  183097 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 182998  T
Q  321 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 410  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  182997 cgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatatcattggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 182898  T
Q  411 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 510  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  182897 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatct 182798  T
Q  511 gatg 514  Q
    ||||    
T  182797 gatg 182794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 166019 - 165511
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166019 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 165920  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  165919 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaag 165820  T
Q  221 tgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaa 318  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  165819 tggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaa 165720  T
Q  319 tccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacactt 408  Q
    | |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  165719 ttcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgctt 165620  T
Q  409 gattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaat 507  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  165619 gattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaag 165520  T
Q  508 tctgatgtc 516  Q
    |||||||||    
T  165519 tctgatgtc 165511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 89 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 983
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  1418 gatattatttatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatg 1319  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1318 tatagcaggaagaaatttctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgacaacgactcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 1219  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1218 tgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttc 1119  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1118 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtgaagagaaagagtatttaagct 1019  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 514  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1018 ctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatg 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 518
Target Start/End: Original strand, 48748 - 49176
Alignment:
Q  89 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  48748 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 48836  T
Q  189 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  48837 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 48936  T
Q  289 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 378  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  48937 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49036  T
Q  379 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49037 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 49136  T
Q  479 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49137 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28727
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gaatgacaatagtttaaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 28551  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 220  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28552 gatatgtgcttattttaatgagttgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 28651  T
Q  221 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 296  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  28652 tggatactctgaattgaagacagcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 518
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28874
Alignment:
Q  371 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  471 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtcca 28874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 88 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40175 - 39937
Alignment:
Q  88 ggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgt 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  40175 ggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatcttcggtacct 40076  T
Q  188 gcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaattt 287  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||     
T  40075 acagagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaataaaggtagaaattc 39976  T
Q  288 ccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 326  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39975 ttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 302 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16663
Alignment:
Q  302 atatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 16790  T
Q  392 tactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttg 491  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||| ||| || |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||     
T  16789 tactcgcaccaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttt 16690  T
Q  492 tcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    || |||| | |||||||||||||||||    
T  16689 tcaatcgagcgaaaattctgatgtcca 16663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 14010 - 14162
Alignment:
Q  21 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 120  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14010 gaatgataatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 14109  T
Q  121 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtg 173  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14110 tatatgggcttattttaatatgttgaggcttactattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 406 - 518
Target Start/End: Original strand, 30 - 142
Alignment:
Q  406 cttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30 cttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgggtgaaa 129  T
Q  506 attctgatgtcca 518  Q
    |||||||| ||||    
T  130 attctgatttcca 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1627
Alignment:
Q  442 tcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1703 tcactgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University