View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6978_low_41 (Length: 306)

Name: NF6978_low_41
Description: NF6978
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6978_low_41
NF6978_low_41
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (39-297)||(18630846-18631105)
chr6 (15-251)||(32350829-32351067)
chr6 (98-243)||(29604317-29604463)
chr6 (40-211)||(22463342-22463514)
chr6 (131-243)||(25649907-25650019)
chr6 (113-243)||(22363497-22363628)
chr6 (164-243)||(11374209-11374288)
chr6 (15-148)||(33539612-33539747)
chr6 (153-243)||(25918432-25918522)
chr6 (164-243)||(29161868-29161947)
chr6 (100-243)||(21621879-21622023)
chr6 (172-243)||(15006013-15006084)
chr6 (164-231)||(31162241-31162308)
chr6 (133-231)||(16375134-16375232)
chr6 (165-231)||(17857741-17857807)
chr6 (151-243)||(5485675-5485766)
chr6 (164-230)||(23220448-23220513)
chr6 (164-206)||(16135054-16135096)
chr6 (164-202)||(18104827-18104865)
chr6 (165-197)||(14874841-14874873)
chr6 (164-203)||(4173032-4173071)
chr6 (168-203)||(19852973-19853008)
chr6 (164-206)||(21930667-21930709)
chr6 (168-206)||(34965681-34965719)
chr6 (171-203)||(18383047-18383079)
chr6 (168-204)||(22846904-22846940)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (15-297)||(23248-23529)
scaffold0021 (107-297)||(19073-19264)
scaffold0021 (107-297)||(28649-28840)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (89-297)||(29296601-29296810)
chr8 (15-252)||(24266752-24266991)
chr8 (15-252)||(24553781-24554020)
chr8 (164-297)||(23227377-23227511)
chr8 (74-252)||(7468999-7469179)
chr8 (74-243)||(38636930-38637100)
chr8 (100-293)||(15932034-15932224)
chr8 (88-297)||(26010148-26010346)
chr8 (131-297)||(17283962-17284124)
chr8 (164-243)||(17265633-17265712)
chr8 (164-243)||(19332983-19333062)
chr8 (133-213)||(25608794-25608875)
chr8 (164-230)||(24238291-24238357)
chr8 (164-206)||(18042914-18042956)
chr8 (164-206)||(22312439-22312481)
chr8 (164-206)||(11543284-11543326)
chr8 (168-206)||(33171032-33171070)
chr8 (164-206)||(45560571-45560613)
chr8 (168-204)||(37655004-37655040)
chr8 (164-206)||(22498654-22498696)
chr8 (168-206)||(23116175-23116213)
chr8 (168-201)||(24270964-24270997)
chr8 (168-204)||(25756725-25756761)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (40-297)||(1284-1546)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (32-297)||(24082813-24083083)
chr5 (15-252)||(5622641-5622880)
chr5 (48-297)||(6455377-6455631)
chr5 (32-297)||(29912756-29913026)
chr5 (15-252)||(26561000-26561238)
chr5 (74-241)||(33627655-33627823)
chr5 (97-243)||(21223998-21224143)
chr5 (168-297)||(18532161-18532290)
chr5 (131-243)||(14343085-14343197)
chr5 (168-297)||(22055125-22055254)
chr5 (164-237)||(21108292-21108365)
chr5 (164-206)||(11964721-11964763)
chr5 (164-206)||(20455450-20455492)
chr5 (164-197)||(24851820-24851853)
chr5 (168-204)||(24226825-24226861)
chr5 (168-204)||(37982199-37982235)
chr5 (164-198)||(17301586-17301620)
chr5 (168-204)||(3672761-3672797)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (39-294)||(42707458-42707714)
chr4 (85-243)||(18275572-18275730)
chr4 (74-297)||(38763485-38763707)
chr4 (164-297)||(7187268-7187402)
chr4 (74-252)||(12732898-12733078)
chr4 (15-148)||(18240944-18241078)
chr4 (168-297)||(15676248-15676377)
chr4 (168-297)||(31114478-31114607)
chr4 (168-273)||(10105523-10105629)
chr4 (169-243)||(19823802-19823876)
chr4 (164-212)||(17213199-17213247)
chr4 (164-206)||(19558103-19558145)
chr4 (164-230)||(54364926-54364992)
chr4 (151-237)||(10115707-10115795)
chr4 (164-206)||(24237659-24237701)
chr4 (168-206)||(41257711-41257749)
chr4 (164-206)||(5372051-5372093)
chr4 (168-206)||(10238812-10238850)
chr4 (151-197)||(11923442-11923488)
chr4 (164-206)||(49070598-49070640)
chr4 (164-197)||(13933541-13933574)
chr4 (168-204)||(47469693-47469729)
chr4 (168-204)||(50223519-50223555)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (15-233)||(2167-2385)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (15-252)||(21167928-21168167)
chr3 (32-239)||(6229858-6230065)
chr3 (17-297)||(14816906-14817190)
chr3 (32-297)||(4146901-4147171)
chr3 (46-236)||(17319814-17320006)
chr3 (74-297)||(18968794-18969021)
chr3 (73-297)||(4163449-4163678)
chr3 (89-296)||(34558573-34558777)
chr3 (85-252)||(25105236-25105405)
chr3 (74-252)||(43428801-43428981)
chr3 (97-297)||(17203368-17203565)
chr3 (103-243)||(15549270-15549411)
chr3 (113-243)||(12020703-12020834)
chr3 (131-243)||(8603430-8603542)
chr3 (164-243)||(17759793-17759871)
chr3 (164-243)||(19061113-19061191)
chr3 (157-227)||(17392099-17392171)
chr3 (130-243)||(27050476-27050588)
chr3 (164-206)||(5229430-5229472)
chr3 (156-198)||(21663499-21663541)
chr3 (168-206)||(41660383-41660421)
chr3 (151-203)||(17385638-17385690)
chr3 (168-204)||(38812350-38812386)
chr3 (164-197)||(10711366-10711399)
chr3 (168-204)||(12951819-12951855)
chr3 (169-197)||(16018474-16018502)
chr3 (164-204)||(38377166-38377206)
chr3 (168-204)||(47983668-47983704)
chr3 (168-204)||(47992955-47992991)
chr3 (168-204)||(48002242-48002278)
chr3 (168-204)||(48011528-48011564)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (39-297)||(31499910-31500174)
chr7 (19-297)||(34242325-34242600)
chr7 (40-243)||(4437612-4437816)
chr7 (88-297)||(16921205-16921411)
chr7 (40-243)||(4445013-4445217)
chr7 (15-243)||(33558452-33558681)
chr7 (88-297)||(48354045-48354252)
chr7 (88-297)||(9609947-9610153)
chr7 (88-297)||(9837519-9837725)
chr7 (85-243)||(14939534-14939693)
chr7 (85-243)||(15367127-15367286)
chr7 (97-243)||(17225204-17225351)
chr7 (97-243)||(16918329-16918476)
chr7 (164-243)||(16382288-16382367)
chr7 (164-228)||(21539528-21539592)
chr7 (164-243)||(45148320-45148399)
chr7 (162-230)||(19066362-19066430)
chr7 (164-231)||(15979429-15979496)
chr7 (164-206)||(4483499-4483541)
chr7 (164-206)||(21676386-21676428)
chr7 (164-206)||(28719225-28719267)
chr7 (164-206)||(8564931-8564973)
chr7 (164-198)||(17910748-17910782)
chr7 (168-206)||(20584240-20584278)
chr7 (168-204)||(9057990-9058026)
chr7 (168-206)||(9322420-9322458)
chr7 (167-212)||(3193397-3193442)
chr7 (164-200)||(17150779-17150815)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (15-297)||(24881305-24881591)
chr2 (15-297)||(25132885-25133167)
chr2 (164-256)||(19665382-19665475)
chr2 (168-297)||(24342740-24342869)
chr2 (164-243)||(6093582-6093661)
chr2 (151-241)||(40641635-40641725)
chr2 (97-212)||(9782199-9782314)
chr2 (164-229)||(45619390-45619455)
chr2 (164-243)||(20272132-20272211)
chr2 (164-230)||(24562225-24562291)
chr2 (252-297)||(19661036-19661081)
chr2 (168-204)||(43641597-43641633)
chr2 (164-206)||(18534599-18534640)
chr2 (168-205)||(22137184-22137221)
chr2 (168-204)||(19434827-19434863)
chr2 (178-206)||(24276655-24276683)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (74-297)||(46144473-46144701)
chr1 (74-297)||(49998583-49998811)
chr1 (40-237)||(40437503-40437701)
chr1 (105-297)||(17607641-17607829)
chr1 (74-243)||(52399382-52399545)
chr1 (131-243)||(17022311-17022423)
chr1 (132-243)||(33396076-33396188)
chr1 (164-206)||(20821725-20821767)
chr1 (168-206)||(41213023-41213061)
chr1 (168-204)||(37235319-37235355)
chr1 (168-206)||(5769570-5769608)
chr1 (168-201)||(5471741-5471774)
chr1 (168-204)||(8539310-8539346)
chr1 (168-204)||(8604549-8604585)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (15-252)||(3170-3409)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (88-297)||(29800-30006)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (88-297)||(198640-198846)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (88-297)||(98442-98648)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (88-294)||(68199-68402)
scaffold0009 (165-211)||(255777-255823)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (88-297)||(12142-12348)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (165-288)||(105965-106089)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (47-222)||(1036-1210)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (74-297)||(6437-6665)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (88-297)||(1356-1563)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (105-288)||(52009-52188)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (192-297)||(6543-6648)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (97-243)||(483-630)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (97-243)||(5475-5622)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (164-243)||(11351-11430)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (211-297)||(63867-63954)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (164-243)||(10710-10789)
scaffold0013 (168-203)||(34243-34278)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (164-243)||(1570-1649)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (168-243)||(50315-50390)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (164-230)||(9532-9598)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (165-231)||(326-392)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (164-231)||(12464-12531)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (164-206)||(44964-45006)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (164-206)||(4715-4757)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (168-206)||(85190-85228)
scaffold0004 (168-206)||(26328-26366)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (168-203)||(12358-12393)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (168-206)||(34819-34857)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (168-206)||(130657-130695)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (168-200)||(23832-23864)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (168-204)||(6004-6040)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (168-204)||(24970-25006)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (168-204)||(78191-78227)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 39 - 297
Target Start/End: Original strand, 18630846 - 18631105
Alignment:
Q  39 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga 138  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18630846 ttttacttggatggtgataaattgtgcaaagttgatgaactatggaatatagctaaagttgattaatgaatatatgttgatgaattatgatatttggtga 18630945  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 238  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18630946 tgattcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtactttt 18631045  T
Q  239 acatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18631046 acattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 18631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32351067 - 32350829
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32351067 atcacaaggtgttgtattttcctcttttacgtggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatg 32350968  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32350967 ttgatgaattgtgatattttggagatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttga 32350868  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg 251  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32350867 tcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtg 32350829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29604463 - 29604317
Alignment:
Q  98 tgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgca 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29604463 tgattaatgaatatatgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgca 29604364  T
Q  197 attgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29604363 attgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacatt 29604317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Original strand, 22463342 - 22463514
Alignment:
Q  40 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtga 138  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22463342 tttacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 22463441  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 211  Q
    ||| |||||   ||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22463442 tgactcttatttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25650019 - 25649907
Alignment:
Q  131 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  25650019 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattcgaggt 25649920  T
Q  231 gtacttttacatt 243  Q
    ||| |||||||||    
T  25649919 gtaattttacatt 25649907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Original strand, 22363497 - 22363628
Alignment:
Q  113 tgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 211  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  22363497 tgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagtt 22363596  T
Q  212 gaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22363597 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 22363628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 11374209 - 11374288
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11374209 ttgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 11374288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 33539612 - 33539747
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgatta--atgaataca 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  33539612 atcacaagatgttgtatttttca-ttttacttgaatgacgatgaattgcgcaaagttgatgaactatagaatatagatgaagttgattaatatgaataca 33539710  T
Q  113 tgttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaa 148  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33539711 tgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaa 33539747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25918522 - 25918432
Alignment:
Q  153 ataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25918522 ataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctacttttacatt 25918432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 29161868 - 29161947
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29161868 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtgtacttttacatt 29161947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21622023 - 21621879
Alignment:
Q  100 attaatgaatacatgttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 198  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  21622023 attaatgaatgtgtgttgatgaactgtgatagtttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaat 21621924  T
Q  199 tgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21621923 tgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggtttacttttacatt 21621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 243
Target Start/End: Original strand, 15006013 - 15006084
Alignment:
Q  172 gtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15006013 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15006084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 31162241 - 31162308
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  31162241 ttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 31162308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16375232 - 16375134
Alignment:
Q  133 tggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    ||||||||| |||||   |||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  16375232 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaaatgaaggtg 16375134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Original strand, 17857741 - 17857807
Alignment:
Q  165 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  17857741 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggaggtg 17857807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 243
Target Start/End: Original strand, 5485675 - 5485766
Alignment:
Q  151 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5485675 gaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggt-gaactaatcaatgtaaatggatgtgtacttttacatt 5485766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23220513 - 23220448
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  23220513 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgg-gttgatcaatataaatggaggt 23220448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16135096 - 16135054
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16135096 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttg 16135054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 202
Target Start/End: Original strand, 18104827 - 18104865
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18104827 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtt 18104865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 197
Target Start/End: Original strand, 14874841 - 14874873
Alignment:
Q  165 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874841 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 14874873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Original strand, 4173032 - 4173071
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4173032 ttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttg 4173071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19853008 - 19852973
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19853008 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21930709 - 21930667
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21930709 ttgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttg 21930667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34965719 - 34965681
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965719 ttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 34965681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 203
Target Start/End: Original strand, 18383047 - 18383079
Alignment:
Q  171 tgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18383047 tgtggatgtaattacttgataatgcaattgttg 18383079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22846940 - 22846904
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22846940 ttgtgtggacgtaaatacttgataattcaattgttgt 22846904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Original strand, 23248 - 23529
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  23248 atcacaaggtgttgtatttt-ccattttacttggaaggagataaattgtgcaaagttgatgaactatggaatatagttaaagttgattaatgaatatatg 23346  T
Q  115 ttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23347 ttgatgaagtatgatatttg-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaa 23445  T
Q  215 caatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23446 caatgtaactggaggtgtacttttagattgtgttgctgtgtataagttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 297
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19264
Alignment:
Q  107 aatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19073 aatatatgttgatgaagtatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 19172  T
Q  207 gagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19173 gagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 19264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 297
Target Start/End: Original strand, 28649 - 28840
Alignment:
Q  107 aatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649 aatatatgttgatgaagtatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 28748  T
Q  207 gagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28749 gagttgaacaatgtaactggatgtgtacttttacattgtgttggtgtgtataagttgagtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 28840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29296810 - 29296601
Alignment:
Q  89 agttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttg 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29296810 agttgaagttgattaatgaatacatgttgatgtactatgatatttggtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttg 29296711  T
Q  189 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29296710 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgagttgagtagttgcattatttggtctttgc 29296611  T
Q  288 tgatgtccat 297  Q
    | ||||||||    
T  29296610 ttatgtccat 29296601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24266991 - 24266752
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| ||||||  | ||||| ||||| ||| || | |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24266991 atcacaaggtgttgtattttctctttttacttggaaggttataagttgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatg 24266892  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24266891 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttga 24266792  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24266791 acaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 24266752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 24553781 - 24554020
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| | | |||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24553781 atcacaaggtgttgtattttcctgctttacttggatggtgataagttgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatg 24553880  T
Q  115 ttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24553881 ttgatgaattgtgatattttcgagatgactcttaattgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagttga 24553980  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24553981 tcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 24554020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 23227377 - 23227511
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23227377 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 23227476  T
Q  263 agtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23227477 agtagttgcattattcggtcttttcttatgtccat 23227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7469179 - 7468999
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7469179 tgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 7469080  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7469079 tgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 7468999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 243
Target Start/End: Original strand, 38636930 - 38637100
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38636930 tgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttgatgatgactcttaattgaataatgacatattgattgtg 38637029  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38637030 tggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 38637100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15932224 - 15932034
Alignment:
Q  100 attaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatt 199  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15932224 attaatgaatgcatattgatgaattgtgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaaat 15932125  T
Q  200 gttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15932124 gttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgt-tgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgcttatgt 15932034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26010346 - 26010148
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||        |    
T  26010346 tagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatg--------t 26010255  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| |||||||||| |||||||||   | || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26010254 gataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtattgt-tgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgc 26010158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17284124 - 17283962
Alignment:
Q  131 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  17284124 tttggtggtgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggt 17284025  T
Q  231 gtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||| ||||| ||    ||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17284024 gtacttttacattatgttgttg----tgagttgtggagttgcattatttggtctttgct-atgtccat 17283962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17265712 - 17265633
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17265712 ttgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 17265633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 19332983 - 19333062
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19332983 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 19333062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25608875 - 25608794
Alignment:
Q  133 tggtgatgattcttaacagaataatgacatt-ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25608875 tggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25608794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24238357 - 24238291
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  24238357 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatataaatggaggt 24238291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 18042914 - 18042956
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18042914 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 18042956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22312481 - 22312439
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312481 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 22312439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11543326 - 11543284
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11543326 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttg 11543284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33171070 - 33171032
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33171070 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 33171032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 45560571 - 45560613
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45560571 ttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 45560613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 37655004 - 37655040
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37655004 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37655040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 22498654 - 22498696
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22498654 ttgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttg 22498696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 23116175 - 23116213
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116175 ttgtgtgtacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 23116213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24270997 - 24270964
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270997 ttgtatggatgtaaatacttgataatgcaattgt 24270964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25756761 - 25756725
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25756761 ttgtgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgt 25756725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1546 - 1284
Alignment:
Q  40 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 138  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1546 tttaattggattgtgataaattgtgcaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgactaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 1447  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 238  Q
    ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1446 tgactcttaattgaataatgacttcttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtactttt 1347  T
Q  239 acatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     |||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1346 gcattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24083083 - 24082813
Alignment:
Q  32 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  24083083 ttttccattttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttaattaatgattatatgttgatgaattgtgatat 24082984  T
Q  132 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24082983 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 24082884  T
Q  231 gtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||||   |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24082883 gtacttttacattgtgttgatgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgggtctttacttatgtccat 24082813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 5622641 - 5622880
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5622641 atcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatg 5622740  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5622741 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 5622840  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5622841 tcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtgt 5622880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6455631 - 6455377
Alignment:
Q  48 gatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattctt 146  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6455631 gatggtgataaattgtacaaagttgatgaactataaaatataattgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactctt 6455532  T
Q  147 aacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tg 245  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  |    
T  6455531 aattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtactcttacattgcg 6455432  T
Q  246 ttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6455431 ttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 6455377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29913026 - 29912756
Alignment:
Q  32 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29913026 ttttccattttacttggatgttgataaattatgcaaagttcatgaactataaaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatat 29912927  T
Q  132 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    || || || || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  29912926 tttggggacgactcttaatggaatgatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgtaggt 29912827  T
Q  231 gtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  29912826 gtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 29912756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 26561000 - 26561238
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26561000 atcacaaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactata-aatatagttgaagttgattaatgaatacatg 26561098  T
Q  115 ttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26561099 ttgatgaattgtgatatgttggtgatgactcttaattgaataacgacatgttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 26561198  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26561199 tcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 26561238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 33627655 - 33627823
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  33627655 tgaactatatgatatagttgaagttgattaataaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgactgtg 33627754  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca 241  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33627755 tggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 21223998 - 21224143
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21223998 ttgattaatgaatgagtgttgatgaattgtgatattttggtg--gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 21224095  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21224096 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacatt 21224143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532290
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 18532260  T
Q  267 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  18532261 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 18532290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 243
Target Start/End: Original strand, 14343085 - 14343197
Alignment:
Q  131 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |    
T  14343085 tttggtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagat 14343184  T
Q  231 gtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||    
T  14343185 gtacttttacatt 14343197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055254
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | | | |||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatgtaagttgagta 22055224  T
Q  267 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22055225 attgcattgttgggtctttgct-atgtccat 22055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21108365 - 21108292
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21108365 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttt 21108292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11964763 - 11964721
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964763 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 11964721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 20455450 - 20455492
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20455450 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttg 20455492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Original strand, 24851820 - 24851853
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851820 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 24851853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 24226825 - 24226861
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24226825 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 24226861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37982235 - 37982199
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37982235 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37982199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Original strand, 17301586 - 17301620
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17301586 ttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaat 17301620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3672797 - 3672761
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3672797 ttgtgtggacgtaaacacttgataatgcaattgttgt 3672761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42707714 - 42707458
Alignment:
Q  39 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga 138  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42707714 ttttacttggataatgataaattgtgcaaggttgatgaactatgtaatatagttaaagttgattattggatatatgttgatgaattatgatatttggtga 42707615  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 238  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42707614 tgactcttgattgaataatgacatgctgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtactttt 42707515  T
Q  239 acatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtc 294  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42707514 acattgtgttggtgtatataagttgagtagttgcattattcggtatttgcttatgtc 42707458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18275730 - 18275572
Alignment:
Q  85 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaata 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18275730 atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatg 18275631  T
Q  185 cttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18275630 cttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 18275572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38763707 - 38763485
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaatta-tgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  38763707 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaatttgtgatatttggtgatgactcttaattgaataatggcatgttgattgtg 38763608  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtag-ttg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||| |||    
T  38763607 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagtttg 38763512  T
Q  271 cattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38763511 cattattgggtctttgcttatgtccat 38763485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 7187268 - 7187402
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattg 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7187268 ttgactgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattg 7187367  T
Q  263 agtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7187368 agtagttgcattattcgttctttgcttatgtccat 7187402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12733078 - 12732898
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||   |||||||    
T  12733078 tgaactataggatatagttgaagttgattgatgaatacatgttgattaattgtgacattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgacgattgtg 12732979  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12732978 tggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 12732898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 18240944 - 18241078
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| |  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18240944 atcacaaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtgataagttgtgtaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatg 18241043  T
Q  115 ttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaa 148  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18241044 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaa 18241078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676377
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | | |||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgtaagttgagta 15676347  T
Q  267 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15676348 tttgcattgttgggtctttgct-atgtccat 15676377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114478
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 31114508  T
Q  267 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  31114507 attacattgttgggtctttgct-atgtccat 31114478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105629
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 10105622  T
Q  267 gttgcat 273  Q
     ||||||    
T  10105623 attgcat 10105629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 243
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19823876
Alignment:
Q  169 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 19823876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 17213199 - 17213247
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17213199 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttg 17213247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19558145 - 19558103
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558145 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 19558103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Original strand, 54364926 - 54364992
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||    
T  54364926 ttgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 54364992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 10115707 - 10115795
Alignment:
Q  151 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagt--tgaacaatgtaactggaggtgtacttt 237  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10115707 gaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaatttatgaagaatgtaattggaggtgtacttt 10115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24237701 - 24237659
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237701 ttgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 24237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 41257711 - 41257749
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41257711 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 41257749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 5372051 - 5372093
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5372051 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttg 5372093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 10238812 - 10238850
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10238812 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttg 10238850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 11923442 - 11923488
Alignment:
Q  151 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11923442 gaattatgacttgttgattgtgtggatgtaagtacttgataatgcaa 11923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49070640 - 49070598
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  49070640 ttgattatgtggacgttaatacttgataatgcaattgttgttg 49070598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13933574 - 13933541
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13933574 ttgattgtgtgaatgtaaatacttgataatgcaa 13933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 47469693 - 47469729
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47469693 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgt 47469729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 50223519 - 50223555
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50223519 ttgtgtggacgtaaatacttaataatgcaattgttgt 50223555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 2167 - 2385
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2167 atcacaaggtgttgtatttt-ccattttacttggaaggtgataaattgtgcaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatg 2265  T
Q  115 ttgatgaattatgata-tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2266 ttgatgaattgtgataattttgtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 2365  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgta 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2366 acaatgtaactggaggtgta 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 21167928 - 21168167
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21167928 atcacaagatgttgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatg 21168027  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21168028 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 21168127  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21168128 tcaatgtaattggagatgtacttttacattgtgttggtgt 21168167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Original strand, 6229858 - 6230065
Alignment:
Q  32 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6229858 ttttccattttacttggatggtgataaattgtgcaaagttgatgaattatagaatatagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatat 6229957  T
Q  132 ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6229958 ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtg 6230057  T
Q  232 tactttta 239  Q
    ||||||||    
T  6230058 tactttta 6230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 14816906 - 14817190
Alignment:
Q  17 cacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgtt 116  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  14816906 cacaaggtgttgtatttttca-ttttacttggatggtgataaattgtgtaaagttgatgaactatagaacatagttgaagttgatttatgaatatatgtt 14817004  T
Q  117 gatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaac 215  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14817005 gatgaattgtgatattttggtgatgactcttaaatgaataatgacatgttgatcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaac 14817104  T
Q  216 aatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  14817105 aatataattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgcttatgtccat 14817190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Original strand, 4146901 - 4147171
Alignment:
Q  32 ttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat 131  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4146901 ttttccattttacttggatggtgatatattgtgtaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatat 4147000  T
Q  132 tt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4147001 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggt 4147100  T
Q  231 gtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    || |||||||||| ||||||  | |||||   | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4147101 gttcttttacattgtgttggcatatgtatatgtcgagtagtttgcattattgggtctttgcttatgtccat 4147171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 17319814 - 17320006
Alignment:
Q  46 tggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgatt-aatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgatt 143  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  17319814 tggatggtcataaattgtgcgaagtttttgaactataggatatagttgaagttgatttaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgact 17319913  T
Q  144 cttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactt 236  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17319914 cttaattgaataatgacattttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtactt 17320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18969021 - 18968794
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18969021 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 18968922  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagtagtt 269  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||  | |||||   ||||||||||    
T  18968921 tcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaatgtgtacttttacattgtgttggtatatgtatatgttgagtagtt 18968822  T
Q  270 gcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18968821 gcattattgggtctttgcttatgtccat 18968794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 297
Target Start/End: Original strand, 4163449 - 4163678
Alignment:
Q  73 atgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattcttaacagaataatgacattttgattgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||     
T  4163449 atgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgg 4163548  T
Q  172 gtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttgg--tgtgtatgaattgagta-g 267  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   | |||||      
T  4163549 gtggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggcatgtgtatatgtcgagtact 4163648  T
Q  268 ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4163649 ttgcattattgggtctttgcttatgtccat 4163678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34558777 - 34558573
Alignment:
Q  89 agttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttg 188  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  34558777 agttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtggatgtaaatgcttg 34558678  T
Q  189 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34558677 ataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttgc 34558582  T
Q  288 tgatgtcca 296  Q
    | |||||||    
T  34558581 ttatgtcca 34558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 252
Target Start/End: Original strand, 25105236 - 25105405
Alignment:
Q  85 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25105236 atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaat 25105335  T
Q  184 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25105336 acttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 25105405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Original strand, 43428801 - 43428981
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  43428801 tgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgcg 43428900  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43428901 tggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgt 43428981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17203565 - 17203368
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17203565 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 17203466  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtc 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    | | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17203465 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg----taagttgaggagttgcattatttggtctttgct-atgtc 17203371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15549411 - 15549270
Alignment:
Q  103 aatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 201  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15549411 aatgaatgtatgttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgt 15549312  T
Q  202 tgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15549311 tgttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15549270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12020834 - 12020703
Alignment:
Q  113 tgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 211  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||  ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  12020834 tgttgatgaattgtgatattttggcggtgtctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagtt 12020735  T
Q  212 gaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12020734 gtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 12020703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8603542 - 8603430
Alignment:
Q  131 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  8603542 tttggtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggt 8603443  T
Q  231 gtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||    
T  8603442 gtacttttacatt 8603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 17759793 - 17759871
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17759793 ttgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 17759871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 19061113 - 19061191
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19061113 ttgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 19061191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17392171 - 17392099
Alignment:
Q  157 tgacattttgattgtgtggatgtaaata--cttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactgga 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17392171 tgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatgga 17392099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27050588 - 27050476
Alignment:
Q  130 atttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggagg 229  Q
    |||||||||||| |||||   |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||   |||||||| ||||||    
T  27050588 atttggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggt-gaattactcaatgtaaatggagg 27050490  T
Q  230 tgtacttttacatt 243  Q
     |||||||||||||    
T  27050489 ggtacttttacatt 27050476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 5229430 - 5229472
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229430 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 5229472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21663541 - 21663499
Alignment:
Q  156 atgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21663541 atgactttttgattgtgtggatgtaaattcttgataatgcaat 21663499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41660421 - 41660383
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41660421 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 41660383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17385690 - 17385638
Alignment:
Q  151 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17385690 gaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttg 17385638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 38812350 - 38812386
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38812350 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 38812386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Original strand, 10711366 - 10711399
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10711366 ttgattgtgtggatctaaatacttgataatgcaa 10711399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12951855 - 12951819
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12951855 ttgtgtggaagtaaatactggataatgcaattgttgt 12951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 197
Target Start/End: Original strand, 16018474 - 16018502
Alignment:
Q  169 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16018474 tgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 16018502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Original strand, 38377166 - 38377206
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38377166 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgt 38377206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47983704 - 47983668
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47983704 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 47983668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47992991 - 47992955
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47992991 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 47992955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 48002278 - 48002242
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48002278 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 48002242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 48011564 - 48011528
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48011564 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgt 48011528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31500174 - 31499910
Alignment:
Q  39 ttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtg 137  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  31500174 ttttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgctgatgaattgtgatattttggtg 31500075  T
Q  138 atgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 237  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31500074 atgactcttaattgaatattgacatgttgattgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttt 31499975  T
Q  238 tacatt-tgttggtg---tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||||| ||||||||   |||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31499974 tacattgtgttggtgtattgtatatgttgagtagtttgcattatttagtctttgcttatgtccat 31499910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 34242325 - 34242600
Alignment:
Q  19 caagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttga 118  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||  | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34242325 caagatgttgtatttttca-ttttaccttgatggcgatgaattgtgcaaaattgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttga 34242423  T
Q  119 tgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34242424 tgaattatgatctttggtgatgactcttatttgaataatgacatgttaattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaat 34242523  T
Q  219 gtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  34242524 gtaattggaggtgtacatttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagtttgcattattgggtctttgtttatgtccat 34242600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4437816 - 4437612
Alignment:
Q  40 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4437816 tttacttggatggtgataaattgtgcaaggtgaatgaattatagaatatagttgaagttgattactgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 4437717  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 238  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4437716 tgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 4437617  T
Q  239 acatt 243  Q
    |||||    
T  4437616 acatt 4437612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Original strand, 16921205 - 16921411
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  16921205 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatagtgtggatgtaaatgctt 16921304  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16921305 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtaattgcattatttggtctttg 16921400  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  16921401 cttatgtccat 16921411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4445217 - 4445013
Alignment:
Q  40 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4445217 tttacttggatggtgataaattgtgcaaggtgaatgaatgatagcatttagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtga 4445118  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtactttt 238  Q
    ||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4445117 tgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtactttt 4445018  T
Q  239 acatt 243  Q
    |||||    
T  4445017 acatt 4445013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33558681 - 33558452
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||| |||||  || |||||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33558681 atcacaagatgttgtattttcctcttttacttggagggtgacaaaatgtgcaaaatggttgaactatataatatagttgaagttgattaatgaatacttg 33558582  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33558581 ttgttgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataacgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 33558482  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33558481 tcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 33558452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48354252 - 48354045
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  48354252 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 48354153  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtcttt 285  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  48354152 gataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagtttgcattattgggtcttt 48354057  T
Q  286 gctgatgtccat 297  Q
    ||| ||||||||    
T  48354056 gcttatgtccat 48354045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9610153 - 9609947
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  9610153 tagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgatt 9610054  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9610053 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 9609958  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  9609957 cttatgtccat 9609947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9837725 - 9837519
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  9837725 tagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgatt 9837626  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9837625 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 9837530  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  9837529 cttatgtccat 9837519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14939693 - 14939534
Alignment:
Q  85 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 183  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14939693 atatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaat 14939594  T
Q  184 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14939593 gcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 14939534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15367286 - 15367127
Alignment:
Q  85 atatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaat 183  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15367286 atatagttgaagtgtatcaatgaatacgtgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaat 15367187  T
Q  184 acttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367186 gcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 15367127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 17225204 - 17225351
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17225204 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 17225303  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17225304 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacatt 17225351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16918476 - 16918329
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16918476 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgc 16918377  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16918376 aattgttgttgaagttgtaaaatgtaattggaggtgtaattttacatt 16918329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16382367 - 16382288
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16382367 ttgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 16382288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 21539528 - 21539592
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggag 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21539528 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaaatggag 21539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45148399 - 45148320
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45148399 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtgtacttttacatt 45148320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19066430 - 19066362
Alignment:
Q  162 ttttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||    
T  19066430 ttttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgttcaatataaatggaggt 19066362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 15979429 - 15979496
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  15979429 ttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 15979496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4483541 - 4483499
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483541 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 4483499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 21676386 - 21676428
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676386 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 21676428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28719267 - 28719225
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28719267 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttg 28719225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 8564931 - 8564973
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8564931 ttgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 8564973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17910782 - 17910748
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910782 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 17910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 20584240 - 20584278
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584240 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 20584278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 9057990 - 9058026
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9057990 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 9058026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 9322420 - 9322458
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322420 ttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 9322458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 3193397 - 3193442
Alignment:
Q  167 attgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3193397 attgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttg 3193442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Original strand, 17150779 - 17150815
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattg 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17150779 ttgattgtatggatgtaaatagttgataatgcaattg 17150815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24881591 - 24881305
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24881591 atcacaaggtgttgtatttt-ccattttacttggatattgataaattgtgtaaggttgatgaactatagaacatagttgaagttgattaatgattatatg 24881493  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24881492 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttgaatgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttga 24881393  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttgg----tgtgtatgaattgagtagtt-gcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24881392 acaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtgtatg--ttgagtagttggcattattgggtctttgcttatgtccat 24881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25133167 - 25132885
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| |   |||| |||||||||||| | || || |||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25133167 atcacaaggtgttgtattttcctcctttacttggatggtgataagttatgaaaagtggttgaacaatagaatatagttgaagttgattaatgaatacctg 25133068  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||| |||     |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25133067 atgatgaattgtgatattttggtgatgactct-----gaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25132973  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-ttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  25132972 tcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtcttcgcttatgtccat 25132885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19665475 - 19665382
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19665475 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttggtgtgtat 19665382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342869
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagta 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtaagttgagta 24342839  T
Q  267 gttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  24342840 attgcattgttaggtctttgct-atgtccat 24342869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6093661 - 6093582
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6093661 ttgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttttacatt 6093582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 40641635 - 40641725
Alignment:
Q  151 gaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca 241  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  40641635 gaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttaca 40641725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 9782199 - 9782314
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgca 196  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9782199 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataattggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgca 9782298  T
Q  197 attgttgttggagttg 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  9782299 attgttgttgaagttg 9782314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Original strand, 45619390 - 45619455
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggagg 229  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  45619390 ttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaaatggagg 45619455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20272211 - 20272132
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  20272211 ttgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtgtacttttacatt 20272132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Original strand, 24562225 - 24562291
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||    
T  24562225 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 24562291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19661081 - 19661036
Alignment:
Q  252 tgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19661081 tgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgcttatgtccat 19661036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43641633 - 43641597
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43641633 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 43641597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18534640 - 18534599
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18534640 ttgattgtgtggacgtaa-tacttgataatgcaattgttgttg 18534599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137221
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgtt 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22137184 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaaatgttgtt 22137221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 19434827 - 19434863
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19434827 ttgtgtggacgtaaatacttgataattcaattgttgt 19434863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24276683 - 24276655
Alignment:
Q  178 gtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24276683 gtaaatacttgataatgcaattgttgttg 24276655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46144701 - 46144473
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46144701 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 46144602  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  46144601 tggatgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 46144502  T
Q  269 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  46144501 tgcattattgagtctttgcttatgtccat 46144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Original strand, 49998583 - 49998811
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  49998583 tgaactatatgatatagttggagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 49998682  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  49998683 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 49998782  T
Q  269 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  49998783 tgcattatcgagtctttgcttatgtccat 49998811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 237
Target Start/End: Original strand, 40437503 - 40437701
Alignment:
Q  40 tttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtga 138  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  40437503 tttacttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgttgattaattgtgacattttggtga 40437602  T
Q  139 tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttt 237  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40437603 tgactcttaattggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtacttt 40437701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17607829 - 17607641
Alignment:
Q  105 tgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17607829 tgaatacatgttgatgaattatgatcatta-taatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 17607731  T
Q  205 tggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    ||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17607730 tgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg--tcgtatg--ttgcgtagttgcattatttggtctttgcttatgtccat 17607641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52399545 - 52399382
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||        ||| || |||||||||    
T  52399545 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgttgactcttaat-------tgatatgttgattgtg 52399453  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52399452 tggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacatt 52399382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17022423 - 17022311
Alignment:
Q  131 tttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  17022423 tttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggagat 17022324  T
Q  231 gtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||    
T  17022323 gtacttttacatt 17022311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33396188 - 33396076
Alignment:
Q  132 ttggtgatgattcttaacagaataatgacatt-ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33396188 ttggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33396089  T
Q  231 gtacttttacatt 243  Q
    |||||||||||||    
T  33396088 gtacttttacatt 33396076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20821767 - 20821725
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20821767 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 20821725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 41213023 - 41213061
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213023 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 41213061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 37235319 - 37235355
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37235319 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37235355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 5769570 - 5769608
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5769570 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 5769608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 201
Target Start/End: Original strand, 5471741 - 5471774
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5471741 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgt 5471774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 8539310 - 8539346
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8539310 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgt 8539346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 8604549 - 8604585
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8604549 ttgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgt 8604585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 3170 - 3409
Alignment:
Q  15 atcacaagatgttttatttttccgttttatttggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatg 114  Q
    |||||||| |||| |||||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  3170 atcacaaggtgttgtattttcctcttttacttagatggtgataaattgtgcaaagtcgataaactatagaatatagttgaagttgattaatcaatacgtg 3269  T
Q  115 ttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttga 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3270 ttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttga 3369  T
Q  214 acaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgt 252  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3370 acaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttggtgt 3409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30006 - 29800
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30006 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgacctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 29907  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29906 ggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtatttgcattatttggtctttg 29811  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  29810 cttatgtccat 29800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Original strand, 198640 - 198846
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  198640 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttt 198739  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || || |||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  198740 gataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgt-tgaatg--ttgagtagttgcattatttggtatttgc 198836  T
Q  288 tgatgtccat 297  Q
    | ||||||||    
T  198837 ttatgtccat 198846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Original strand, 98442 - 98648
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  98442 tagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatctttggtgacgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 98541  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  98542 gataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 98637  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  98638 cttatgtccat 98648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 68402 - 68199
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  68402 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgattaatgacatgttgattgtgtggacgtaaatgctt 68303  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  68302 gataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttgagtagttgcattatttggtctttg 68207  T
Q  287 ctgatgtc 294  Q
    || |||||    
T  68206 cttatgtc 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 255777 - 255823
Alignment:
Q  165 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagtt 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  255777 tgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 255823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12348 - 12142
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatactt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12348 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttagtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 12249  T
Q  188 gataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttg 286  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   | ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248 gataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgttg--ttatatg--ttgagtagttgtattatttggtctttg 12153  T
Q  287 ctgatgtccat 297  Q
    || ||||||||    
T  12152 cttatgtccat 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 165 - 288
Target Start/End: Original strand, 105965 - 106089
Alignment:
Q  165 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  105965 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttgatgtgtatgaattga 106064  T
Q  264 gtagttgcattattcggtctttgct 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  106065 gtagttgcattattcggtctttgct 106089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 1036 - 1210
Alignment:
Q  47 ggatggtgatgaattgtgcaaagttaatgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttgg-tgatgattct 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  ||    
T  1036 ggatggtgataaattgtgcaaagtggttgaactatagagtatagttgaagttgattaatgaatacatgatgatgaattgtgatattttgatgatga--ct 1133  T
Q  146 taacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaa 222  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1134 taattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6437
Alignment:
Q  74 tgaactatagaatatagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatat-ttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtg 172  Q
    |||||||||  ||||| ||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||     
T  6665 tgaactatatgatatacttggagtggattaatatatacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgta 6566  T
Q  173 tggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttaca-tttgttggtg--tgtatgaattgagtag-t 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||   |||||||| |    
T  6565 tggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaagttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtt 6466  T
Q  269 tgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  6465 tgcattattgagtctttgcttatgtccat 6437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Original strand, 1356 - 1563
Alignment:
Q  88 tagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatact 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  1356 tagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgca 1455  T
Q  187 tgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtcttt 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||  || ||||||||||||||| ||||| |    
T  1456 tgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgttg--ttgtatg--ttaagtagttgcattatttggtctat 1551  T
Q  286 gctgatgtccat 297  Q
     || ||||||||    
T  1552 acttatgtccat 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52188 - 52009
Alignment:
Q  105 tgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52188 tgaatacatgttgatgaattataatccttg-tcatgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgt 52090  T
Q  205 tggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatttgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgct 288  Q
    || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | || |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52089 tgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttttacattgtgtagt-tgtacg--ttgagtagttgcattatttggtctttgct 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 297
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6648
Alignment:
Q  192 atgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6543 atgcaattgttgt-ggagttgtacaatgtaactggaagtgtacttttacattgtgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctta 6641  T
Q  291 tgtccat 297  Q
    |||||||    
T  6642 tgtccat 6648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 483
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtga-tgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||  || |||||||    
T  630 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaatggtgatatttggtgaatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgc 531  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  530 aattgttgttggagttttacaaagtaattggaggtgtacttttacatt 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5622 - 5475
Alignment:
Q  97 ttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatattt-ggtgatgattcttaacagaataatgacattttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgc 195  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||   || |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5622 ttgattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgc 5523  T
Q  196 aattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5522 aattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacatt 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11430 - 11351
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11430 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtgtacttttacatt 11351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 297
Target Start/End: Original strand, 63867 - 63954
Alignment:
Q  211 tgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt-tgttggtgtgtatgaattgagtagttgcattattcggtctttgctgatgtccat 297  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  63867 tgaaaaatgtaactggatgagtacttttacattgtgttggtgtatatgaattgagtagttgcattattctgtctttgcttatgtccat 63954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 10710 - 10789
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10710 ttgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatgtacttttacatt 10789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34278 - 34243
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34278 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 34243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 1570 - 1649
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1570 ttgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtgtacttttacatt 1649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50315
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacatt 243  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacatt 50315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9598 - 9532
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||    
T  9598 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtcgatcaatataaatggaggt 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 326
Alignment:
Q  165 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  392 tgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaaatggaggtg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12531 - 12464
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtg 231  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  12531 ttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaaatggaggtg 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 44964 - 45006
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44964 ttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttg 45006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4757 - 4715
Alignment:
Q  164 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757 ttgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttg 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 85228 - 85190
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85228 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 85190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26366 - 26328
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26366 ttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgttg 26328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 203
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12393
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttg 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12358 ttgtgtggatgtgaatacttgataatgcaattgttg 12393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 34819 - 34857
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34819 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttg 34857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 130695 - 130657
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130695 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg 130657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 200
Target Start/End: Original strand, 23832 - 23864
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23832 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattg 23864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6040
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6004 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgt 6040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 24970 - 25006
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24970 ttgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgt 25006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 204
Target Start/End: Original strand, 78191 - 78227
Alignment:
Q  168 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgt 204  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  78191 ttgtgtggacgtaaattcttgataatgcaattgttgt 78227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University