View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6979_high_2 (Length: 469)

Name: NF6979_high_2
Description: NF6979
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6979_high_2
NF6979_high_2
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (16-465)||(22329772-22330221)
chr5 (16-465)||(19773012-19773461)
chr5 (16-465)||(16359554-16360003)
chr5 (16-465)||(22137720-22138169)
chr5 (16-465)||(34569546-34569995)
chr5 (17-465)||(14996624-14997072)
chr5 (16-465)||(27682285-27682734)
chr5 (16-465)||(29472958-29473407)
chr5 (16-465)||(41773894-41774343)
chr5 (17-465)||(22350972-22351420)
chr5 (16-465)||(37288381-37288830)
chr5 (16-465)||(27521458-27521907)
chr5 (16-465)||(27613408-27613857)
chr5 (16-465)||(40711832-40712281)
chr5 (16-465)||(27665388-27665824)
chr5 (16-465)||(18782166-18782618)
chr5 (17-345)||(23461024-23461355)
chr5 (36-431)||(20803669-20804067)
chr5 (16-405)||(25429473-25429864)
chr5 (250-465)||(23537097-23537312)
chr5 (16-345)||(21882826-21883159)
chr5 (20-251)||(23526107-23526338)
chr5 (203-345)||(22505900-22506045)
chr5 (203-345)||(23077907-23078052)
chr5 (16-71)||(26736006-26736061)
chr5 (197-417)||(14883921-14884144)
chr5 (18-71)||(21332265-21332318)
chr5 (302-346)||(21870279-21870323)
chr5 (302-346)||(21874559-21874603)
chr5 (364-417)||(16257966-16258019)
chr5 (300-405)||(21331931-21332036)
chr5 (364-417)||(22591685-22591738)
chr5 (364-417)||(22595240-22595293)
chr5 (16-120)||(21631629-21631733)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (16-465)||(11233925-11234374)
chr7 (16-465)||(12690610-12691059)
chr7 (16-465)||(11549814-11550263)
chr7 (16-465)||(15157769-15158218)
chr7 (16-465)||(13689150-13689599)
chr7 (16-465)||(8710714-8711163)
chr7 (16-465)||(18180852-18181300)
chr7 (16-465)||(14335505-14335954)
chr7 (51-465)||(14957652-14958066)
chr7 (16-465)||(18586883-18587332)
chr7 (16-465)||(44788063-44788512)
chr7 (110-465)||(10873664-10874019)
chr7 (18-465)||(11984103-11984553)
chr7 (16-459)||(9591473-9591919)
chr7 (16-465)||(17703164-17703616)
chr7 (16-465)||(16726150-16726602)
chr7 (63-146)||(12459785-12459868)
chr7 (302-345)||(14145060-14145103)
chr7 (17-123)||(15145977-15146083)
chr7 (206-417)||(40924552-40924766)
chr7 (302-345)||(11385236-11385279)
chr7 (311-346)||(12712469-12712504)
chr7 (303-346)||(13004865-13004908)
chr7 (302-345)||(16947279-16947322)
chr7 (63-170)||(49155458-49155565)
chr7 (300-345)||(14283181-14283226)
chr7 (302-411)||(49155700-49155809)
chr7 (203-251)||(12459925-12459973)
chr7 (302-346)||(12798310-12798354)
chr7 (206-246)||(26115499-26115539)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (23-465)||(15399460-15399901)
chr3 (16-465)||(24185929-24186378)
chr3 (16-465)||(12889448-12889897)
chr3 (16-465)||(43165414-43165863)
chr3 (16-465)||(5421872-5422321)
chr3 (16-465)||(15712998-15713447)
chr3 (16-465)||(48428186-48428635)
chr3 (16-465)||(15345187-15345636)
chr3 (16-465)||(16638512-16638961)
chr3 (16-465)||(16753643-16754092)
chr3 (16-465)||(20058996-20059445)
chr3 (16-465)||(10008339-10008788)
chr3 (16-465)||(26790355-26790804)
chr3 (16-465)||(10908949-10909398)
chr3 (16-465)||(6603474-6603923)
chr3 (16-465)||(53381961-53382409)
chr3 (16-465)||(13255429-13255878)
chr3 (16-465)||(3688682-3689131)
chr3 (16-465)||(15586334-15586783)
chr3 (134-465)||(5110351-5110682)
chr3 (191-465)||(6596969-6597243)
chr3 (217-465)||(15358992-15359240)
chr3 (16-465)||(16803886-16804338)
chr3 (17-190)||(15358823-15358996)
chr3 (16-465)||(23414729-23415181)
chr3 (83-465)||(16694970-16695355)
chr3 (45-459)||(11861121-11861538)
chr3 (95-431)||(12501751-12502090)
chr3 (17-405)||(23079016-23079407)
chr3 (17-345)||(15065811-15066142)
chr3 (206-405)||(17497620-17497822)
chr3 (206-465)||(10408907-10409169)
chr3 (203-462)||(14873527-14873789)
chr3 (17-71)||(14578744-14578798)
chr3 (206-405)||(14578420-14578622)
chr3 (17-72)||(14873903-14873958)
chr3 (16-71)||(15262369-15262424)
chr3 (404-465)||(5108481-5108542)
chr3 (300-345)||(16831576-16831621)
chr3 (206-417)||(47126883-47127097)
chr3 (302-345)||(16384420-16384463)
chr3 (16-71)||(19727499-19727554)
chr3 (364-417)||(2036888-2036941)
chr3 (364-417)||(2040629-2040682)
chr3 (364-417)||(14039846-14039899)
chr3 (302-346)||(16326754-16326798)
chr3 (23-183)||(31941659-31941819)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (16-465)||(21842347-21842796)
chr1 (16-465)||(21833437-21833886)
chr1 (16-465)||(33387804-33388253)
chr1 (17-465)||(22400456-22400904)
chr1 (16-465)||(51330267-51330716)
chr1 (16-465)||(19109503-19109953)
chr1 (16-465)||(16347369-16347819)
chr1 (16-465)||(41350444-41350892)
chr1 (16-419)||(24784675-24785081)
chr1 (17-465)||(21228328-21228779)
chr1 (16-465)||(17041788-17042239)
chr1 (302-465)||(16354018-16354181)
chr1 (23-459)||(22435521-22435950)
chr1 (17-405)||(20081208-20081599)
chr1 (16-409)||(22401727-22402123)
chr1 (17-123)||(22496373-22496479)
chr1 (203-429)||(21176689-21176918)
chr1 (17-229)||(21752183-21752395)
chr1 (203-246)||(20074703-20074746)
chr1 (300-405)||(16379516-16379621)
chr1 (292-345)||(21752462-21752514)
chr1 (300-336)||(20921861-20921897)
chr1 (206-246)||(24096609-24096649)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (16-465)||(14300422-14300871)
chr4 (16-465)||(14683687-14684136)
chr4 (16-465)||(17091592-17092041)
chr4 (17-465)||(40476161-40476609)
chr4 (16-465)||(19775236-19775685)
chr4 (16-465)||(27714456-27714905)
chr4 (16-465)||(8050066-8050515)
chr4 (16-465)||(12479720-12480169)
chr4 (16-465)||(19635256-19635705)
chr4 (16-465)||(23958867-23959316)
chr4 (16-465)||(8389532-8389981)
chr4 (16-465)||(16233435-16233884)
chr4 (16-459)||(13513470-13513916)
chr4 (131-465)||(18604259-18604596)
chr4 (145-464)||(18223914-18224236)
chr4 (206-459)||(16248122-16248378)
chr4 (16-186)||(16250572-16250742)
chr4 (18-123)||(15144677-15144782)
chr4 (250-459)||(16350188-16350397)
chr4 (63-465)||(29450237-29450642)
chr4 (17-122)||(14162591-14162696)
chr4 (17-123)||(15820-15926)
chr4 (17-345)||(7357388-7357719)
chr4 (203-346)||(20893338-20893484)
chr4 (16-122)||(16219308-16219414)
chr4 (16-122)||(16222628-16222734)
chr4 (264-345)||(14162841-14162922)
chr4 (206-246)||(15073669-15073709)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (17-465)||(22829234-22829682)
chr6 (16-465)||(2871650-2872099)
chr6 (16-465)||(29589287-29589736)
chr6 (16-465)||(24292630-24293079)
chr6 (16-465)||(27205606-27206055)
chr6 (16-465)||(27243173-27243622)
chr6 (16-465)||(16574874-16575323)
chr6 (16-465)||(16620057-16620506)
chr6 (17-459)||(25115537-25115981)
chr6 (16-465)||(5836076-5836525)
chr6 (16-465)||(28260045-28260494)
chr6 (16-465)||(28285422-28285871)
chr6 (16-465)||(28338794-28339243)
chr6 (16-465)||(28312614-28313063)
chr6 (16-345)||(25756580-25756912)
chr6 (17-405)||(22436854-22437245)
chr6 (16-465)||(27558814-27559266)
chr6 (203-344)||(21764983-21765127)
chr6 (18-285)||(18404969-18405239)
chr6 (17-168)||(19867672-19867823)
chr6 (16-86)||(16924867-16924937)
chr6 (63-146)||(10466015-10466098)
chr6 (302-345)||(21566956-21566999)
chr6 (16-71)||(23081407-23081462)
chr6 (203-251)||(10465910-10465958)
chr6 (302-346)||(14376880-14376924)
chr6 (302-346)||(18797963-18798007)
chr6 (206-246)||(21474774-21474814)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (16-465)||(9338333-9338782)
chr2 (16-465)||(9486967-9487416)
chr2 (16-465)||(24265121-24265570)
chr2 (16-465)||(16983991-16984440)
chr2 (16-465)||(24712785-24713234)
chr2 (16-465)||(44382813-44383262)
chr2 (17-465)||(24873993-24874441)
chr2 (16-465)||(10871601-10872050)
chr2 (16-465)||(22322585-22323034)
chr2 (16-465)||(27374020-27374469)
chr2 (16-465)||(17001751-17002200)
chr2 (17-297)||(21139392-21139672)
chr2 (49-465)||(23116299-23116718)
chr2 (16-459)||(24704728-24705174)
chr2 (16-465)||(22462721-22463173)
chr2 (16-285)||(23205065-23205337)
chr2 (16-285)||(23676669-23676941)
chr2 (16-465)||(24656898-24657350)
chr2 (16-251)||(11351168-11351403)
chr2 (16-335)||(24678238-24678560)
chr2 (20-339)||(23028828-23029149)
chr2 (17-405)||(23105027-23105419)
chr2 (17-405)||(22742266-22742657)
chr2 (77-405)||(23039877-23040208)
chr2 (308-408)||(16931598-16931698)
chr2 (23-405)||(22733074-22733459)
chr2 (203-416)||(21320292-21320508)
chr2 (17-98)||(21322876-21322957)
chr2 (16-105)||(23065164-23065253)
chr2 (16-105)||(23074614-23074703)
chr2 (205-285)||(23065353-23065436)
chr2 (205-285)||(23074803-23074886)
chr2 (18-122)||(24817426-24817530)
chr2 (302-465)||(20848626-20848789)
chr2 (309-345)||(19716377-19716413)
chr2 (309-345)||(19720940-19720976)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (17-465)||(10518-10965)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (17-465)||(41305-41753)
scaffold0109 (16-411)||(12881-13279)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (16-465)||(22396-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (16-465)||(7385-7834)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (16-465)||(20015409-20015858)
chr8 (16-465)||(22126105-22126554)
chr8 (16-465)||(17671168-17671617)
chr8 (16-465)||(18859763-18860212)
chr8 (16-465)||(22117321-22117770)
chr8 (16-465)||(19115586-19116035)
chr8 (16-465)||(19481219-19481667)
chr8 (16-465)||(22043013-22043465)
chr8 (16-465)||(32603331-32603783)
chr8 (16-465)||(30310287-30310739)
chr8 (16-465)||(15536569-15537021)
chr8 (16-279)||(22031289-22031554)
chr8 (17-405)||(19981154-19981545)
chr8 (16-345)||(18880920-18881252)
chr8 (17-459)||(21163679-21164132)
chr8 (16-405)||(21391064-21391456)
chr8 (16-405)||(21780390-21780782)
chr8 (16-123)||(21254131-21254238)
chr8 (383-465)||(17830113-17830195)
chr8 (300-345)||(22054336-22054381)
chr8 (206-369)||(21671891-21672057)
chr8 (302-345)||(22027543-22027586)
chr8 (16-71)||(22990231-22990286)
chr8 (206-465)||(28984287-28984549)
chr8 (206-246)||(16268589-16268629)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (17-465)||(8408-8856)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (16-465)||(3573-4022)
scaffold0044 (16-464)||(17309-17760)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (17-465)||(21147-21578)
scaffold0028 (17-465)||(11619-12050)
scaffold0028 (17-465)||(55154-55602)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (16-464)||(87-524)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (16-465)||(424457-424909)
scaffold0003 (302-345)||(203819-203862)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (17-465)||(48815-49263)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (16-459)||(189-635)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (16-465)||(13733-14187)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (18-465)||(1-450)
scaffold0008 (140-465)||(139313-139641)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (16-465)||(5147-5599)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (16-465)||(229555-230007)
scaffold0009 (209-246)||(251961-251998)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (16-459)||(14750-15196)
scaffold0177 (16-459)||(11065-11511)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (17-459)||(36648-37093)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (16-465)||(14573-15025)
scaffold0010 (63-161)||(180849-180947)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (16-464)||(473-924)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (252-465)||(107480-107693)
scaffold0029 (203-387)||(8550-8737)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (16-411)||(9996-10393)
scaffold0080 (16-411)||(12651-13048)
scaffold0080 (16-459)||(32028-32474)
scaffold0080 (16-237)||(37494-37715)
scaffold0080 (25-123)||(54795-54893)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (83-459)||(4-383)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (16-411)||(28-426)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (16-465)||(7482-7934)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (17-339)||(15408-15733)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (17-369)||(30437-30792)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (16-399)||(171267-171653)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (31-285)||(10041-10298)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (17-462)||(21754-22202)
scaffold0081 (17-462)||(37178-37626)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (16-459)||(16775-17221)
scaffold0017 (17-126)||(194883-194992)
scaffold0017 (252-345)||(194691-194784)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (17-462)||(7363-7811)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (17-462)||(36526-36974)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (17-369)||(74-429)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (16-405)||(17112-17504)
scaffold0114 (302-343)||(40496-40537)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (16-405)||(8559-8952)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (132-345)||(1-217)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (44-345)||(291-595)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (16-465)||(3013-3465)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (17-345)||(190-521)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (18-405)||(2140-2530)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (16-345)||(201-533)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (17-378)||(14234-14598)
scaffold0120 (23-390)||(11420-11789)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (16-335)||(10713-11035)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (18-405)||(50108-50498)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (17-396)||(30346-30728)
scaffold0023 (17-55)||(47099-47137)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (16-402)||(9096-9485)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (16-465)||(28631-29083)
[»] scaffold1459 (2 HSPs)
scaffold1459 (147-459)||(801-1116)
scaffold1459 (16-66)||(1137-1187)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (16-405)||(15060-15452)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (17-126)||(1132-1241)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (205-459)||(121885-122142)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (16-378)||(8372-8737)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (18-123)||(34763-34868)
scaffold0022 (17-123)||(41782-41888)
scaffold0022 (17-123)||(75502-75608)
scaffold0022 (311-405)||(42079-42173)
scaffold0022 (311-405)||(75799-75893)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (16-286)||(2145-2418)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (250-405)||(6886-7041)
scaffold0319 (16-117)||(1181-1282)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (16-405)||(40-432)
scaffold0490 (302-346)||(3303-3347)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (18-405)||(40270-40660)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (22-345)||(296-622)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (17-339)||(3701-4026)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (206-391)||(9220-9408)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (17-405)||(167-558)
scaffold0621 (17-405)||(4584-4975)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (23-122)||(23347-23446)
scaffold0018 (18-122)||(9400-9504)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-114)||(24769-24867)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-122)||(23582-23688)
scaffold0011 (73-146)||(153698-153771)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (17-229)||(18800-19012)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (206-405)||(23708-23910)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (16-227)||(69366-69576)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-122)||(216469-216575)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (17-122)||(1913-2018)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (17-122)||(4777-4882)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (203-345)||(1127-1272)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (23-122)||(15566-15665)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (16-122)||(7022-7128)
scaffold0270 (16-122)||(14152-14258)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (17-123)||(55518-55624)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (16-122)||(496169-496275)
scaffold0001 (23-122)||(441808-441907)
scaffold0001 (203-246)||(514278-514321)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (300-345)||(9610-9655)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (17-114)||(110964-111061)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (206-417)||(23674-23888)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (74-146)||(879-951)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (206-417)||(42074-42288)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (203-345)||(1310-1455)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (302-345)||(6080-6123)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (302-345)||(17307-17350)
scaffold0348 (308-345)||(4672-4709)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (278-405)||(19812-19939)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (302-345)||(263664-263707)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (206-339)||(9958-10094)
scaffold0575 (17-114)||(7807-7904)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (16-122)||(14315-14421)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (206-339)||(4384-4520)
scaffold0207 (17-71)||(7839-7893)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-122)||(57663-57769)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (308-345)||(2275-2312)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (302-346)||(30348-30392)
scaffold0088 (200-245)||(30267-30312)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (74-146)||(6012-6084)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (302-345)||(1671-1714)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (302-345)||(368-411)
scaffold0476 (18-123)||(10937-11042)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (63-146)||(11173-11256)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (83-146)||(309-372)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (302-345)||(49003-49046)
scaffold0067 (302-345)||(58037-58080)
scaffold0067 (302-345)||(64425-64468)
scaffold0067 (302-346)||(30062-30106)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (88-122)||(15028-15062)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (201-243)||(33300-33342)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (311-345)||(17686-17720)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (197-243)||(34667-34713)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (206-248)||(176326-176368)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (17-71)||(104377-104431)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (18-111)||(5059-5152)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (95-183)||(8450-8538)
scaffold0235 (95-183)||(18664-18752)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (302-346)||(21252-21296)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (302-346)||(50543-50587)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (311-419)||(66857-66965)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (302-346)||(62594-62638)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (302-346)||(116062-116106)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (206-246)||(51990-52030)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22330221 - 22329772
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22330221 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgcgaccctctccattgcagttaaaa 22330122  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22330121 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 22330022  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22330021 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 22329922  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22329921 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 22329822  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22329821 aaatctggaaaaactctcagctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 19773012 - 19773461
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  19773012 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 19773111  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19773112 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 19773211  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19773212 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcact 19773311  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19773312 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 19773411  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19773412 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19773461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 16359554 - 16360003
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  16359554 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 16359653  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359654 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 16359753  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16359754 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 16359853  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16359854 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 16359953  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16359954 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16360003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 22137720 - 22138169
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22137720 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtattcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaa 22137819  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22137820 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggc 22137919  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22137920 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcact 22138019  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22138020 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgacc 22138119  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22138120 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 34569546 - 34569995
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  34569546 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 34569645  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569646 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 34569745  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  34569746 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 34569845  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  34569846 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 34569945  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34569946 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 34569995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14997072 - 14996624
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  14997072 gtctgcgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagc 14996973  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14996972 acacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcc 14996873  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14996872 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactg 14996773  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||  ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14996772 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 14996673  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14996672 agtctggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 14996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27682734 - 27682285
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  27682734 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 27682635  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27682634 cacacaacgtccgtacgattgcaatcagctacagcatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 27682535  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27682534 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 27682435  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27682434 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgtagctattaacc 27682335  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27682334 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29473407 - 29472958
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29473407 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 29473308  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29473307 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacatcgaacacacttcttgatttcttcagggcagacattgcttttgtggc 29473208  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29473207 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcggggacact 29473108  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29473107 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 29473008  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29473007 aaatccggaaaaactcttagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 29472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 41773894 - 41774343
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  41773894 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 41773993  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41773994 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 41774093  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41774094 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctcagcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcact 41774193  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41774194 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 41774293  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41774294 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 41774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 22350972 - 22351420
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22350972 gtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 22351071  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  22351072 acacaatgttcgtacgcttgcattaagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttcatttcttcggggcagacattgcttttgtggcc 22351171  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22351172 tttcccaccacagttgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactg 22351271  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22351272 tacggcttatgacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 22351371  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22351372 aatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22351420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37288830 - 37288381
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37288830 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 37288731  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37288730 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatgtgaactttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggc 37288631  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  37288630 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggagcact 37288531  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  37288530 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgcagctattaacc 37288431  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37288430 aaatcctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 37288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 27521458 - 27521907
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  27521458 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 27521557  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27521558 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgatctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 27521657  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27521658 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcaggggcact 27521757  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27521758 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgcagctattaacc 27521857  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27521858 aaatcctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 27613408 - 27613857
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  27613408 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgagcctctccattgcaattaaag 27613507  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27613508 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctaccacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacattgctcttgtggc 27613607  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27613608 ccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccctttatcagcaggggcact 27613707  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27613708 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 27613807  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27613808 aaatcctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 40711832 - 40712281
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  40711832 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 40711931  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40711932 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacacgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 40712031  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40712032 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 40712131  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  40712132 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 40712231  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40712232 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 40712281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27665824 - 27665388
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  27665824 tgtctgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 27665725  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27665724 cacacaatgtctgtatgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 27665625  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27665624 ctttctcacca-------------caatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 27665538  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27665537 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 27665438  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27665437 aaatcctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 18782166 - 18782618
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||| |||||||||| || || ||     
T  18782166 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaacctcttcattacaattgaag 18782265  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  18782266 catacgatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacattttttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 18782365  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  18782366 ctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 18782465  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| |||||||| || ||||||  || || ||| ||||||| ||| || | |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  18782466 actataaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattc 18782565  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||| || |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18782566 actaaattagggaaaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 23461024 - 23461355
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||  |||| ||| | ||||||||| ||||| |  ||||    
T  23461024 gtctaagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggttgtttgcactgggaaccaatattaccctcttccttgcaatcgaaac 23461123  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   | ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||    
T  23461124 acacaatatcaccatgcttgcattcagctaaagtatgactcttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcc 23461223  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgacca-tcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||| |||||    
T  23461224 tttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctattttccct-tatcagcaggggc 23461322  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  23461323 actatagggcttagggcgactctgctggccctt 23461355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 431
Target Start/End: Original strand, 20803669 - 20804067
Alignment:
Q  36 caaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgctt 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||  |||| ||| |||| |||||| ||||  || || |||||||| ||  || ||||    
T  20803669 caaaaacccttccagtagtcagcaccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgactctcttccttgccattgaagcacacaatatcactatgctt 20803768  T
Q  136 gcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaa 235  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20803769 gcagtcagctaaagtatgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaa 20803868  T
Q  236 cacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 332  Q
    || |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  20803869 cagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagac 20803968  T
Q  333 tctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactc 431  Q
    | || || |||||   || |  ||| | ||||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  20803969 tttgttggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactc 20804067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Original strand, 25429473 - 25429864
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | || | ||||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  25429473 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcattgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 25429572  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||  |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  | || |  ||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  25429573 catactatatcatcatgtttgccctcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctatttacatcc-caggacaagcattgctcttgtggc 25429671  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| |||||| | || |||||| | | ||| ||  ||| ||| |||||    
T  25429672 ctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatcctctatttgcccttattagcaggggc 25429771  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  25429772 actgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 25429864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23537312 - 23537097
Alignment:
Q  250 agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcc 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||  |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||   |    
T  23537312 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagtc 23537213  T
Q  350 tccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaa 449  Q
    | || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  23537212 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccga 23537113  T
Q  450 tcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||||| |||||    
T  23537112 tcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Original strand, 21882826 - 21883159
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||| || || ||     
T  21882826 tgtctgtgtaccagccaaagccaaaaccctaccagtagtcggcaccttcttaggctgcttacactgagaaccaatgtgaccttcttcattacaattgaag 21882925  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccaca-ccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtgg 214  Q
    |||||||||||  || | ||  | |||||||    |||||||||||| ||||| | | | |||  |||| |  ||  | || ||  | ||||||||||||    
T  21882926 cacacaatgtcattatgtttctactcagctattgcatgacccttcttaccacatctgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtgg 21883025  T
Q  215 cctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcggggg 311  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||| | || || ||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||    
T  21883026 cctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcagggg 21883125  T
Q  312 cactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21883126 cactatagggcttagggcgactctgctggccctt 21883159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 23526107 - 23526338
Alignment:
Q  20 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacaca 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23526107 tgagtaccaatcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcaca 23526206  T
Q  120 caatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 219  Q
    |||| ||  |||| |||||||  ||||    |||||||||||| ||||| | || |||  | || |  ||   ||| ||  | |||||||||||||||||    
T  23526207 caatatcattacggttgcaattggctaatgcatgacccttcttaccacatctgaaacatctttttacctctctaggacaagcattgctcttgtggccttt 23526306  T
Q  220 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 251  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23526307 ctcaccacaattaaaacagacaatctcagcag 23526338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Original strand, 22505900 - 22506045
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    | ||||||  || ||||||| | |||| ||||   |||||| || || |||     
T  22505900 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 22505999  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22506000 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtccctt 22506045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23078052 - 23077907
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||  || |||| || | |||| ||||   |||||| || ||||||     
T  23078052 ttgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctt 23077953  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23077952 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtccctt 23077907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26736061 - 26736006
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26736061 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctactagtagtctgcgccttcttaggct 26736006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14884144 - 14883921
Alignment:
Q  197 cagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtt 293  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| || | |||| ||||  ||||| | || |    
T  14884144 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgct 14884045  T
Q  294 tccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttc 393  Q
    | ||| | ||||  || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || |||||    
T  14884044 ttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttc 14883945  T
Q  394 gtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14883944 atagattctgcacctattaaccaa 14883921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21332318 - 21332265
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||    
T  21332318 tctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcaccttcttaggct 21332265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21870323 - 21870279
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21870323 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 21870279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21874603 - 21874559
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21874603 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 21874559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16258019 - 16257966
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  16258019 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 16257966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21332036 - 21331931
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||| | || |||||  | |||||||| || || ||    
T  21332036 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatcctcctcataaat 21331937  T
Q  400 cctgca 405  Q
    ||||||    
T  21331936 cctgca 21331931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22591738 - 22591685
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  22591738 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 22591685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22595293 - 22595240
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  22595293 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 22595240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21631733 - 21631629
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| ||||| | ||| |||||||||   | ||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  21631733 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaacactttcccactagtctgagccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatatgaccttcttcattgcagttgaaa 21631634  T
Q  116 cacac 120  Q
    |||||    
T  21631633 cacac 21631629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11234374 - 11233925
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11234374 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 11234275  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11234274 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggc 11234175  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11234174 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcact 11234075  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234074 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 11233975  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11233974 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 12690610 - 12691059
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12690610 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaa 12690709  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||     
T  12690710 tacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtgga 12690809  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12690810 ctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcact 12690909  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12690910 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 12691009  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12691010 aaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 12691059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11550263 - 11549814
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  11550263 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctctccattgcagttaaaa 11550164  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11550163 cacacaatgtccttacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggc 11550064  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11550063 ctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcact 11549964  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11549963 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 11549864  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11549863 aaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 11549814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15158218 - 15157769
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  15158218 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 15158119  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15158118 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 15158019  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15158018 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 15157919  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15157918 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 15157819  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15157818 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 13689150 - 13689599
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||     
T  13689150 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctatccgttgcaattaaag 13689249  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13689250 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 13689349  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13689350 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagtaggggcact 13689449  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13689450 gtacggcttaggacgactctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 13689549  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13689550 aagtctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 13689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 8710714 - 8711163
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||     
T  8710714 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccgttgcaattaaag 8710813  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  8710814 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgcttttgtggc 8710913  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  8710914 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 8711013  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8711014 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 8711113  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8711114 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 8711163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 18180852 - 18181300
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  18180852 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 18180951  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  18180952 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctttcgtggc 18181051  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18181052 ctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcact 18181151  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18181152 gtacggcttaggaagactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 18181251  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18181252 aaatccggaaaaactctcagttgttaat-cccaatcgccctcttgatgtc 18181300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 14335505 - 14335954
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  14335505 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 14335604  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14335605 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 14335704  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  14335705 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcatt 14335804  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14335805 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 14335904  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14335905 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 14335954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 51 - 465
Target Start/End: Original strand, 14957652 - 14958066
Alignment:
Q  51 tagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaat 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14957652 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaat 14957751  T
Q  151 atgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14957752 atgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggta 14957851  T
Q  251 gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcct 350  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  14957852 gtatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgccct 14957951  T
Q  351 ccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaat 450  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14957952 tcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaat 14958051  T
Q  451 cgccctcttgatgtc 465  Q
    | ||||||| |||||    
T  14958052 caccctcttaatgtc 14958066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18587332 - 18586883
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  18587332 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctactagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 18587233  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18587232 caaacaatgtccgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 18587133  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  18587132 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcatt 18587033  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18587032 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 18586933  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18586932 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 18586883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44788512 - 44788063
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  44788512 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 44788413  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44788412 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 44788313  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  44788312 ctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagtaggggcact 44788213  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44788212 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 44788113  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44788112 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 44788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 110 - 465
Target Start/End: Original strand, 10873664 - 10874019
Alignment:
Q  110 ttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctct 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10873664 ttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctct 10873763  T
Q  210 tgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcggg 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  10873764 tgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcggg 10873863  T
Q  310 ggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagcta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||     
T  10873864 ggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctg 10873963  T
Q  410 ttgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10873964 ttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 10874019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 465
Target Start/End: Original strand, 11984103 - 11984553
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||||||||||| || | ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  11984103 tctgagtaccagccagaccaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgaaattgaagca 11984202  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||||    
T  11984203 cacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcagtacaaacattgctcttgtggcct 11984302  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcac 314  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||   ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  11984303 ttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcac 11984402  T
Q  315 tgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgac 414  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11984403 tatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcttcgtagatcctacaactgttaac 11984502  T
Q  415 caaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||  ||||||||||  |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  11984503 caaatcaggaaaaactcggatttgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 11984553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 9591473 - 9591919
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  || ||||||| |||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || ||     
T  9591473 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacctgtagtaggctccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaag 9591572  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  9591573 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggc 9591672  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  | || || ||  ||||| | |||||    
T  9591673 ctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggc 9591772  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  9591773 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattc 9591872  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||    
T  9591873 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17703616 - 17703164
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||  ||| |||||| |||||  | || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||     
T  17703616 tgtctgagtaccagccaaagcaaaaactcgacccatagtaggcgacctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaag 17703517  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  17703516 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 17703417  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||  |||||    
T  17703416 ctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggc 17703317  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  17703316 actataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctacagctgttc 17703217  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  |  |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17703216 accaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16726602 - 16726150
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||  ||| |||||| |||||  | || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||     
T  16726602 tgtctgagtaccagccaaagcaaaaactcgacccatagtaggcgacctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaag 16726503  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  16726502 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 16726403  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||  |||||    
T  16726402 ctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggc 16726303  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||  | ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  16726302 actttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctacagctgttc 16726203  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  |  |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16726202 accaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 12459785 - 12459868
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||  |||||| || |||||||    
T  12459785 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagcta 12459868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Original strand, 14145060 - 14145103
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14145060 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 14145103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15146083 - 15145977
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||   | || |  |||| ||||||||| || || | |||||||||||    
T  15146083 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctactagtagtccgcaccttcttaggctatttgcattgcgaaccaatgtgaccttcctcctcgcagttaaaac 15145984  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  15145983 acacaat 15145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40924766 - 40924552
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| || | |||| ||||  ||||||| || || ||| | |    
T  40924766 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 40924667  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  40924666 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 40924567  T
Q  403 gcagctattgaccaa 417  Q
    ||| ||||| |||||    
T  40924566 gcacctattaaccaa 40924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11385279 - 11385236
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11385279 tcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtccctt 11385236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12712504 - 12712469
Alignment:
Q  311 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12712504 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttg 12712469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 346
Target Start/End: Original strand, 13004865 - 13004908
Alignment:
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13004865 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttg 13004908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16947322 - 16947279
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16947322 tcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 16947279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Original strand, 49155458 - 49155565
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttctt 162  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||     
T  49155458 tcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactatgacccttctg 49155557  T
Q  163 gccacacc 170  Q
     |||||||    
T  49155558 accacacc 49155565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14283226 - 14283181
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  14283226 tatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtccctt 14283181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Original strand, 49155700 - 49155809
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcc 401  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| |    
T  49155700 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattc 49155799  T
Q  402 tgcagctatt 411  Q
    |||| |||||    
T  49155800 tgcatctatt 49155809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 251
Target Start/End: Original strand, 12459925 - 12459973
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  12459925 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcag 12459973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12798354 - 12798310
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12798354 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 12798310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26115539 - 26115499
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26115539 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctc 26115499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15399901 - 15399460
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15399901 gtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaacta-tgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaa 15399803  T
Q  123 tgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctc 222  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  15399802 tgtccgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttccc 15399703  T
Q  223 accacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15399702 accacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggc 15399603  T
Q  323 ttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  15399602 ttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagatcctgcagctattgaccaaattct 15399503  T
Q  423 gaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15399502 gaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 24185929 - 24186378
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24185929 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaa 24186028  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  24186029 cacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggc 24186128  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  24186129 ctttcacaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgtgggcact 24186228  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24186229 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 24186328  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24186329 aattctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 12889448 - 12889897
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  12889448 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 12889547  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889548 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 12889647  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12889648 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 12889747  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12889748 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 12889847  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12889848 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12889897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 43165414 - 43165863
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  43165414 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 43165513  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165514 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 43165613  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  43165614 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 43165713  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  43165714 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 43165813  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43165814 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 43165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5422321 - 5421872
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5422321 tgtctgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 5422222  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5422221 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttactcttgtggc 5422122  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  5422121 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 5422022  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  5422021 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 5421922  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5421921 aaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 5421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15713447 - 15712998
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15713447 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 15713348  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15713347 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggc 15713248  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  15713247 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcagcgggggcact 15713148  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15713147 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 15713048  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15713047 aaatccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 15712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 48428186 - 48428635
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  48428186 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 48428285  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428286 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 48428385  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  48428386 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 48428485  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  48428486 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 48428585  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48428586 aaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 48428635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15345636 - 15345187
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  15345636 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 15345537  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15345536 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 15345437  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  15345436 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 15345337  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15345336 gtacggcttaggaggactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 15345237  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15345236 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 16638512 - 16638961
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||     
T  16638512 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccttctccgttgcaattaaag 16638611  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16638612 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcttcagggcagacgttgctcttgtggc 16638711  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16638712 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 16638811  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16638812 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 16638911  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16638912 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16754092 - 16753643
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  16754092 tgtctgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacattgagaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 16753993  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16753992 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccagacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 16753893  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16753892 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcact 16753793  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  16753792 gtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 16753693  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16753692 aaatctagaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 16753643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20059445 - 20058996
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  20059445 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 20059346  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20059345 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 20059246  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20059245 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 20059146  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20059145 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 20059046  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20059045 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 20058996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 10008339 - 10008788
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  10008339 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 10008438  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10008439 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 10008538  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10008539 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 10008638  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  10008639 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaact 10008738  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10008739 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26790804 - 26790355
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  26790804 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccgtcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 26790705  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26790704 cacacaacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggtagacgttgctcttgtggc 26790605  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  26790604 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcattgggggcact 26790505  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26790504 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 26790405  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26790404 aaatcctgaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 26790355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 10908949 - 10909398
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  10908949 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgggaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 10909048  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10909049 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 10909148  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10909149 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 10909248  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  10909249 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaact 10909348  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10909349 aagtcctgaaaaactctaagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10909398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 6603474 - 6603923
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  6603474 tgtctgggtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagagctaatgtgaccctctccattgcaattaaag 6603573  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6603574 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgatccttcttaccacaccggacacagttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 6603673  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  6603674 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 6603773  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| || |||    
T  6603774 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaacc 6603873  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6603874 aaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6603923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 53382409 - 53381961
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  53382409 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctgcattgcaattaaag 53382310  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53382309 cacacagtgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacagacgttgctcttgtggc 53382210  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||    
T  53382209 ctttctcgccacagttgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag-gggggcact 53382111  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||  || |||||||||||||| || |||    
T  53382110 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcctgcagctgttaacc 53382011  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  53382010 aaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 53381961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 13255429 - 13255878
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  13255429 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 13255528  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  13255529 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaagcgttgctcttgtggc 13255628  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  13255629 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 13255728  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13255729 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 13255828  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13255829 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 13255878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 3688682 - 3689131
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  3688682 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaag 3688781  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  3688782 cacacaatgtctgcacgattacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggc 3688881  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3688882 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcact 3688981  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3688982 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 3689081  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3689082 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15586783 - 15586334
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  15586783 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 15586684  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  15586683 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggc 15586584  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15586583 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctccgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 15586484  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15586483 gtacggcttaggacgactttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcctgcagctattaacc 15586384  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15586383 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15586334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 134 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5110682 - 5110351
Alignment:
Q  134 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 233  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5110682 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttaatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattga 5110583  T
Q  234 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5110582 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcggggacactgtacggcttaggacgact 5110483  T
Q  334 ctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactcta 433  Q
    ||  ||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||     
T  5110482 ctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctc 5110383  T
Q  434 agctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5110382 agctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 191 - 465
Target Start/End: Original strand, 6596969 - 6597243
Alignment:
Q  191 tcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatctttt 290  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6596969 tcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttct 6597068  T
Q  291 gtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctc 390  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||    
T  6597069 gtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 6597168  T
Q  391 ttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
     || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6597169 ctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6597243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 217 - 465
Target Start/End: Original strand, 15358992 - 15359240
Alignment:
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15358992 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactg 15359091  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15359092 tacggcttagggcgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 15359191  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15359192 aatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16804338 - 16803886
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||  ||| | ||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||  | || ||     
T  16804338 tgtctgagtaccatccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgacttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaag 16804239  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  16804238 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggc 16804139  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  16804138 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 16804039  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || || || |||||||||||     
T  16804038 actatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctatta 16803939  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  16803938 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtattcgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 15358823 - 15358996
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15358823 gtctgcgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 15358922  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcc 190  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358923 acacaatgtctgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcc 15358996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23415181 - 23414729
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  || |||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  23415181 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaag 23415082  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||| || || || ||||||||||    
T  23415081 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgtcacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggc 23414982  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  23414981 ctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 23414882  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| |||||||  || ||||||  || || ||| ||||||| ||| |  |||||  | |||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  23414881 actataaggcttagggcgactctattggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaggtattc 23414782  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  || |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23414781 actaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 465
Target Start/End: Original strand, 16694970 - 16695355
Alignment:
Q  83 gaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttct 182  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16694970 gaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatgtcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttct 16695069  T
Q  183 tgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatc 279  Q
    |||| ||| | || || || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16695070 tgatctccaccggacaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 16695169  T
Q  280 gaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagca 379  Q
    ||||||  | ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||  || || ||| || |||| ||| || |||||     
T  16695170 gaccattctctgtttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttggtcttccactcatttacaaccttgtaatgagcc 16695269  T
Q  380 atggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
     | |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16695270 ttagtatcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 459
Target Start/End: Original strand, 11861121 - 11861538
Alignment:
Q  45 taccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagc 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | || || |||||||| ||  || |||||||||||||    
T  11861121 taccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttccttggaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagc 11861220  T
Q  145 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 244  Q
    || | ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11861221 taaagtatgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatc 11861320  T
Q  245 tctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 341  Q
    || ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |    
T  11861321 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggc 11861420  T
Q  342 ccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttg 441  Q
    ||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||| || || || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||  | ||||||    
T  11861421 ccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttg 11861520  T
Q  442 atatccaatcgccctctt 459  Q
     ||||| || ||||||||    
T  11861521 gtatccgattgccctctt 11861538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 431
Target Start/End: Original strand, 12501751 - 12502090
Alignment:
Q  95 ccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcag 194  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||   | |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||    
T  12501751 ccctcttccttgcaattgaaacacacaatatcaccatgcttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcag 12501850  T
Q  195 ggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttg 291  Q
    | || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||   |||||||||||||||| || ||  | ||||||||| | ||    
T  12501851 gacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctg 12501950  T
Q  292 tttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctct 391  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||     
T  12501951 ttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcc 12502050  T
Q  392 tcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactc 431  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  12502051 tcatagattctacagctattcaccaaatctgaaaaaactc 12502090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23079407 - 23079016
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||| | ||| ||  |  ||||||    
T  23079407 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctttgtacactgtgaaccaatatgaccttgttctttagaactaaaac 23079308  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||    |||| ||||||| ||| | || | |||  |||| |  ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079307 acacaatgtccttatgcttacactcagctagtgcatgaaccttcttaccatagcgaaaacatctctttacctcccccggacaaacattgctcttgtggcc 23079208  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||   ||||||||||| | || || ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  23079207 tttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggca 23079108  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  23079107 ctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 23079016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 15065811 - 15066142
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||      
T  15065811 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctacctgtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttctttgcaattgaaga 15065910  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  || |||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||| |||  | || |  || || || || || ||||||||||||||    
T  15065911 acacaatatcattatgcttgcaatcagttaatgcatgacccttcttaccacaccggaaacatctttttacctcttctggacaaacattgctcttgtggcc 15066010  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||   ||||||||||||| | || || ||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||| |    
T  15066011 tttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggaa 15066110  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15066111 ctatagggcttagggcgactctgctggccctt 15066142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Original strand, 17497620 - 17497822
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    ||| | ||||||||||| ||||| ||  |||    
T  17497620 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgaccatcttctgtttgcccttat 17497719  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||||||||    
T  17497720 cagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcctagatcct 17497819  T
Q  403 gca 405  Q
    |||    
T  17497820 gca 17497822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 465
Target Start/End: Original strand, 10408907 - 10409169
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| || | |||| ||||  ||||||| ||||| ||  | |    
T  10408907 ctcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgt 10409006  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||  |||  ||||| || |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  10409007 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 10409106  T
Q  403 gcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||| ||||| ||||| |  | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  10409107 gcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14873789 - 14873527
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| | ||||||||| | ||||| ||      
T  14873789 ttgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgccct 14873690  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
    |||||||  ||||| | || |||||||| |||||||| || |||||   || || | | ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || ||    
T  14873689 tatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatatat 14873590  T
Q  400 cctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgat 462  Q
    |||||| || || ||||| |  |  |||||||  | || ||| |||||||| |||||||||||    
T  14873589 cctgcaactgttcaccaactcagagaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgat 14873527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14578798 - 14578744
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  14578798 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttcggct 14578744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14578622 - 14578420
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||| |||| |||||  | ||||| ||  |||    
T  14578622 ctcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttat 14578523  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    | || || ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || || || |||||    
T  14578522 cggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttggccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaatcct 14578423  T
Q  403 gca 405  Q
    |||    
T  14578422 gca 14578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14873958 - 14873903
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctg 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14873958 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccaatagtcggcgccttcttaggctg 14873903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 15262369 - 15262424
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||    
T  15262369 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgcctttttaggct 15262424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5108542 - 5108481
Alignment:
Q  404 cagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5108542 cagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5108481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16831621 - 16831576
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16831621 tatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtccctt 16831576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Original strand, 47126883 - 47127097
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| || | |||| ||||  ||||| | || || ||| | |    
T  47126883 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 47126982  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  47126983 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 47127082  T
Q  403 gcagctattgaccaa 417  Q
    ||| ||||| |||||    
T  47127083 gcacctattaaccaa 47127097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16384463 - 16384420
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16384463 tcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgtccctt 16384420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 19727499 - 19727554
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||    
T  19727499 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactcttccagtagtctgtgccttcttaggct 19727554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2036941 - 2036888
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  2036941 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 2036888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2040682 - 2040629
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  2040682 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 2040629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 417
Target Start/End: Original strand, 14039846 - 14039899
Alignment:
Q  364 aatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaa 417  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  14039846 aatcttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaa 14039899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16326798 - 16326754
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16326798 tcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttg 16326754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 31941659 - 31941819
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||    || |||| ||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  31941659 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcaattataacaaacaa 31941758  T
Q  123 tgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttctt 183  Q
      ||   ||||||||| ||||||| | | || |||||||  ||||||| || |||||||||    
T  31941759 catcaccacgcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttctt 31941819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 21842347 - 21842796
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21842347 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 21842446  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21842447 cacacaatgtccgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacatcggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggc 21842546  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21842547 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcact 21842646  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21842647 gtacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 21842746  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21842747 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21842796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 21833437 - 21833886
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  21833437 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctacgagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 21833536  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21833537 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 21833636  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21833637 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcgggggcact 21833736  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  21833737 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgcagctattaacc 21833836  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21833837 aaatcctgaaaaactcttagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 21833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33388253 - 33387804
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  33388253 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 33388154  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  33388153 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctccgggcaaacgttgcttttgtggc 33388054  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  33388053 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 33387954  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33387953 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 33387854  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33387853 aaattcggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 33387804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 22400456 - 22400904
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22400456 gtctgagtaccagtcaatgcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 22400555  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  22400556 acacgatgtccgtacgcttgcaatccgctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcagggcagacattacttttatggcc 22400655  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22400656 tttccctccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactg 22400755  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22400756 tacagcttaggacgactctgctctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 22400855  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22400856 aatccagaaaaactctaagctgttggcatccaatcgcccttttgatgtc 22400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 51330716 - 51330267
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  51330716 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 51330617  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51330616 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 51330517  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51330516 ctctctctccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 51330417  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51330416 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 51330317  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51330316 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 51330267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 19109503 - 19109953
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109503 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 19109602  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |    
T  19109603 cacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgctttagtgac 19109702  T
Q  216 ctttctcaccacaattg--aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  19109703 ctttcacacaacaattgaaaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggca 19109802  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19109803 ctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattga 19109902  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19109903 ccaaatccgg-aaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16347819 - 16347369
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  16347819 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaag 16347720  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16347719 cacacaatgtctgcacgattacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggc 16347620  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  16347619 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcact 16347520  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16347519 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 16347420  T
Q  416 -aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
     ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16347419 aaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41350892 - 41350444
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||||     
T  41350892 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaag 41350793  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  41350792 cacacaatgtctgcacgattgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggc 41350693  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  41350692 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcact 41350593  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| |||| |||  | ||||||||||| |||| |||||||||||  |||    
T  41350592 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaacc 41350494  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  41350493 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 41350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24785081 - 24784675
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  24785081 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaaa 24784982  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||    
T  24784981 cacacaatatcattacgcttgcagtcagctaccgtatgacccttcttgccacaccgggcacatttctttatctcctctggacaaacattgctcttgtggc 24784882  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| | |||    
T  24784881 ctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggc 24784782  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || ||||||||  ||||||| || |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  || ||||||| || ||||| || ||||| ||     
T  24784781 actatagggcttagggagactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcctcatagattctacagctgttc 24784682  T
Q  413 accaaat 419  Q
    |||||||    
T  24784681 accaaat 24784675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21228779 - 21228328
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || || |    
T  21228779 gtctgagtaccagccaaagcaaaaactcgacccgttgtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagc 21228680  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  || | || || || |||||||||||    
T  21228679 acacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatttgacccttcttgccacacctgacacatttcttgatctctacaagacaaacattactcttgtggcc 21228580  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  21228579 tttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttacccttatcagcaggggca 21228480  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||   || |  ||| ||||||| ||| || |||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  21228479 ctatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattaa 21228380  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    | ||||  || |||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21228379 ctaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17042239 - 17041788
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| |||||  ||| |||||| |||||  | ||||  ||||| || |||||||||||||| || || ||     
T  17042239 tgtctgagtaccagctagtgcaaaaactcgacccgtagtaggcgtcctcttcggctgcttgcactgggaacttatatgaccctcttcattacaattgaag 17042140  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | || || ||||||||||    
T  17042139 cacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggataaacattactcttgtggc 17042040  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| | |||||| | ||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || || ||  ||||||| |||||    
T  17042039 ctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggc 17041941  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  17041940 actataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttc 17041841  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  || |||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17041840 accaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16354181 - 16354018
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16354181 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 16354082  T
Q  402 tgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16354081 tgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22435950 - 22435521
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  22435950 gtaccagccagagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaa 22435851  T
Q  123 tgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctc 222  Q
    | ||  || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  22435850 tatcactatgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacatcggaaacatttctttacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctc 22435751  T
Q  223 accacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggc 322  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||| | | | |||||       |||| ||| ||||||  | ||||| ||  ||||||  |||||||| || |||    
T  22435750 accacaattgaaatagacaatcttcgcaggagcatccttct-------cctatcattgaccattctctgttttcccttatcagtaggggcactatagggc 22435658  T
Q  323 ttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttg 422  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| || ||| | || ||||| |  |    
T  22435657 ttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctacagttgttcaccaactcgg 22435558  T
Q  423 gaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||||   | |||||| |||||||||||||||||    
T  22435557 gaaaaacttggatctgttggtatccaatcgccctctt 22435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20081599 - 20081208
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| || || |    
T  20081599 gtctgagtactagtcaacgcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggccgcgtacactgcgaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagc 20081500  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||| ||   ||||||||||||| ||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  | ||||||||||||||    
T  20081499 acacaatgtcattacgcttacactcagatagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcc 20081400  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||     
T  20081399 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcg 20081300  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    || || |||||| | ||||||||||| || ||   || || ||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| || |||||    
T  20081299 ctataaggcttaaggcgactctgctggccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatactgca 20081208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 409
Target Start/End: Original strand, 22401727 - 22402123
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | ||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  22401727 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 22401826  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||| ||||||| ||||| || | |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  22401827 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgatccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggc 22401926  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  22401927 ctttctcaccacaagtaaaacagaaaatttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 22402026  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagcta 409  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| || |||||||| || |||||  | |||||||| || || ||||||||||||    
T  22402027 actgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcagcta 22402123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22496479 - 22496373
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  22496479 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaactaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 22496380  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  22496379 acacaat 22496373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 429
Target Start/End: Original strand, 21176689 - 21176918
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||      
T  21176689 ttgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccct 21176788  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || |||||    
T  21176789 tatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagat 21176888  T
Q  400 cctgcagctattgaccaaatttggaaaaac 429  Q
     || || ||||| |||||||  ||||||||    
T  21176889 tctacaactattcaccaaatcaggaaaaac 21176918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 21752183 - 21752395
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||   | |||| ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||    
T  21752183 gtctgagtactagtcaatgcaaaaactctaccagtagtctgcaccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcgttgcaattgaaac 21752282  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |  ||| |||  ||  | |||||||| |||||    
T  21752283 acacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccagtacaagcattgctcttttggcc 21752382  T
Q  217 tttctcaccacaa 229  Q
    |||||||||||||    
T  21752383 tttctcaccacaa 21752395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20074746 - 20074703
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20074746 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacacacaatctc 20074703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 405
Target Start/End: Original strand, 16379516 - 16379621
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | | || ||| ||||||| ||| || |||||  | |||||||| || || ||    
T  16379516 tatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcataaat 16379615  T
Q  400 cctgca 405  Q
    ||||||    
T  16379616 cctgca 16379621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 345
Target Start/End: Original strand, 21752462 - 21752514
Alignment:
Q  292 tttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21752462 tttccct-tatcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctgaccctt 21752514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 336
Target Start/End: Original strand, 20921861 - 20921897
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20921861 tatcagcgggagcactgtaaggcttaggacgactctg 20921897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24096649 - 24096609
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24096649 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 24096609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14300871 - 14300422
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  14300871 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctacctgtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 14300772  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14300771 caaacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcaaggcagacgttgcttttgtggc 14300672  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14300671 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 14300572  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14300571 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 14300472  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14300471 aaatcttgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 14300422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 14683687 - 14684136
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14683687 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaa 14683786  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||    
T  14683787 cacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacatagcttttgtggc 14683886  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14683887 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcact 14683986  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14683987 gtatggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcaactattgacc 14684086  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14684087 aaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 14684136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17092041 - 17091592
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  17092041 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 17091942  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091941 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 17091842  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  17091841 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 17091742  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  17091741 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 17091642  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17091641 aaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 17091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 40476161 - 40476609
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40476161 gtctgcgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggccgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcagttaaaac 40476260  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40476261 acacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacactgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcc 40476360  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40476361 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactg 40476460  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40476461 tacggcttaggacgactccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 40476560  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40476561 aatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 40476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19775685 - 19775236
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  19775685 tgtctgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 19775586  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19775585 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 19775486  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19775485 ctttctcaccacaattgaatcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 19775386  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19775385 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 19775286  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19775285 aaatcctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 19775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 27714456 - 27714905
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  27714456 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttagactgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 27714555  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27714556 cacacaatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 27714655  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27714656 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 27714755  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27714756 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 27714855  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27714856 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27714905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8050515 - 8050066
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  8050515 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 8050416  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050415 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 8050316  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8050315 ccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 8050216  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8050215 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 8050116  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8050115 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 8050066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 12479720 - 12480169
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  12479720 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 12479819  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12479820 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttatggc 12479919  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12479920 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 12480019  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12480020 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 12480119  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12480120 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 12480169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 19635256 - 19635705
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19635256 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 19635355  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  19635356 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggc 19635455  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19635456 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcact 19635555  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19635556 gtacggcttaggacaactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactattaacc 19635655  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19635656 aaatccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 19635705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 23958867 - 23959316
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  23958867 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 23958966  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23958967 cacacaatatctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 23959066  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23959067 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 23959166  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23959167 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 23959266  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23959267 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 23959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 8389532 - 8389981
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  8389532 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 8389631  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8389632 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 8389731  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  8389732 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcact 8389831  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  8389832 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 8389931  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8389932 aaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 8389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16233884 - 16233435
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  16233884 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 16233785  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16233784 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 16233685  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16233684 ctttctcaccacaattgaagtacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcact 16233585  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16233584 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcttcttcgtagatcctgcagctattaacc 16233485  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16233484 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 13513470 - 13513916
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || ||     
T  13513470 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgaccagtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaag 13513569  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  13513570 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggc 13513669  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  | || || ||  ||||| | |||||    
T  13513670 ctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggc 13513769  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  13513770 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattc 13513869  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||    
T  13513870 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18604596 - 18604259
Alignment:
Q  131 cgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaat 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  18604596 cgcttgcaatcagctacaataagaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagt 18604497  T
Q  231 tgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttagg 327  Q
    | ||||| | ||||||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || || ||  ||||||| |||||| | || ||||||||    
T  18604496 taaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagg 18604397  T
Q  328 acgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaa 427  Q
     ||||||||||| |||||   || |||||| || |||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || |||    
T  18604396 gcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaa 18604297  T
Q  428 actctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18604296 actcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18224236 - 18223914
Alignment:
Q  145 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18224236 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatc 18224137  T
Q  245 tctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 341  Q
    || ||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18224136 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggc 18224037  T
Q  342 ccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttg 441  Q
    |||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||||   | ||||||    
T  18224036 ccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaactgggatctgttg 18223937  T
Q  442 atatccaatcgccctcttgatgt 464  Q
     ||||| |||||| |||| ||||    
T  18223936 gtatccgatcgccatcttcatgt 18223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16248378 - 16248122
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||   || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||  ||  |||    
T  16248378 ctcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgttggcccttat 16248279  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |  ||| ||||||| ||| || |||||  | |||||||| |  ||||||||    
T  16248278 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctccttatagatcct 16248179  T
Q  403 gcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||  | |||||| ||||  |||||||||||    
T  16248178 gcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16250742 - 16250572
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| | |||  | || |  ||||  || |||||||||||||| || || ||     
T  16250742 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcgactgcttgcattgggaacctatatgaccctcttcattacaattgaag 16250643  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgat 186  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16250642 cacacaatatcattacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgat 16250572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15144782 - 15144677
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15144782 tctgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagca 15144683  T
Q  118 cacaat 123  Q
    ||||||    
T  15144682 cacaat 15144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16350397 - 16350188
Alignment:
Q  250 agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcc 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  16350397 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 16350298  T
Q  350 tccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaa 449  Q
    | || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| || ||||| || ||| | || |||||||  ||||||||||  | |||||| |||||||    
T  16350297 ttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaa 16350198  T
Q  450 tcgccctctt 459  Q
    | ||||||||    
T  16350197 ttgccctctt 16350188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29450642 - 29450237
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttctt 162  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||||||     
T  29450642 tcttcggctcaggacactgtgaactgatgtgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctg 29450543  T
Q  163 gccacaccggacacacttcttg--atttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catcct 257  Q
     ||||||| || ||||||| |   || |||||    || || || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||      
T  29450542 accacacctgaaacacttcctatcatctcctcca--caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctc 29450445  T
Q  258 tcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctc 357  Q
    || ||||||| | |||| ||||  ||||||| || || ||| | ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||    
T  29450444 tcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctc 29450345  T
Q  358 gttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctc 457  Q
      ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| || ||  |||| ||||| ||||| |  | ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||     
T  29450344 actcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattttgcacctattaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagccctt 29450245  T
Q  458 ttgatgtc 465  Q
    ||||||||    
T  29450244 ttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 14162591 - 14162696
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  14162591 gtctgggtacccgtcaatgcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggctgtttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 14162690  T
Q  117 acacaa 122  Q
    ||||||    
T  14162691 acacaa 14162696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15926 - 15820
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||   | || | |||||| || ||||| || |||||||||||||| |    
T  15926 gtctgagtaccagtcaatgcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaagcttcttgcattgtgaacttatatgaccttcctcattgcagttaaagc 15827  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  15826 acacaat 15820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 7357388 - 7357719
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||    ||| |||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |    
T  7357388 gtctgtgtaccagtcaatgcaaacaccttcccactagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagc 7357487  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    | ||||||||   ||||||||| ||||||| | | ||||||||||  ||||||| ||  |||||| |    || | |    | || ||||||||||||||    
T  7357488 agacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctcttgtggcc 7357587  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| || | |||| ||||  ||||||| || || ||| | ||||| || |||    
T  7357588 tttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagca 7357687  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  7357688 atgtaaggcttaggacgattctgttgtccctt 7357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 346
Target Start/End: Original strand, 20893338 - 20893484
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||| | |||| ||||   |||||| || || |||     
T  20893338 ttgctcttgttgcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 20893437  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20893438 tgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttg 20893484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 16219308 - 16219414
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||| |||||   | || |  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  16219308 tgtctaagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtcggcgctttctcaggcttcttgcattgcgaaccaatatgaccttcttcattgcaattaaag 16219407  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  16219408 cacacaa 16219414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 16222628 - 16222734
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||| |||||   | || |  |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  16222628 tgtctaagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtcggcgctttctcaggcttcttgcattgcgaaccaatatgaccttcttcattgcaattaaag 16222727  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  16222728 cacacaa 16222734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 14162841 - 14162922
Alignment:
Q  264 taggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||| |||||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14162841 tagggcgcctatcctcgaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtccctt 14162922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 15073669 - 15073709
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15073669 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctc 15073709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22829682 - 22829234
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22829682 gtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacacggtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 22829583  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22829582 acacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcc 22829483  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22829482 ttttccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttccctttatcagcaggggcactg 22829383  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22829382 tacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 22829283  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22829282 aatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2872099 - 2871650
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  2872099 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggtgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 2872000  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2871999 cacacaatgtccgtacaattgcagtcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 2871900  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2871899 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 2871800  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2871799 gtacagcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacc 2871700  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2871699 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 2871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29589736 - 29589287
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  29589736 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 29589637  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589636 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 29589537  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||    
T  29589536 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagtgggggcact 29589437  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  29589436 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 29589337  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29589336 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 29589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24293079 - 24292630
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  24293079 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 24292980  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24292979 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 24292880  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24292879 ctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcact 24292780  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24292779 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaacc 24292680  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24292679 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24292630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 27205606 - 27206055
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| || ||     
T  27205606 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaag 27205705  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27205706 cacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 27205805  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27205806 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcact 27205905  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27205906 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 27206005  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || | | |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27206006 aagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27243622 - 27243173
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| || ||     
T  27243622 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaag 27243523  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27243522 cacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggc 27243423  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  27243422 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcact 27243323  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27243322 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 27243223  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || | | |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27243222 aagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27243173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 16574874 - 16575323
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  16574874 tgtctgagtccccgtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 16574973  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16574974 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 16575073  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16575074 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 16575173  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16575174 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 16575273  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16575274 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16620506 - 16620057
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  16620506 tgtctgagtccccgtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 16620407  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16620406 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 16620307  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16620306 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 16620207  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16620206 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 16620107  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16620106 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 25115537 - 25115981
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25115537 gtctgagtaccagtcaaggcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 25115636  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25115637 acacaatatccgtacgattgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcc 25115736  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25115737 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactg 25115836  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25115837 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 25115936  T
Q  417 aat-ttggaaaaactct-aagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||   |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||    
T  25115937 aatccgggaaaaactctccagttgttggtatccaattgccctctt 25115981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5836525 - 5836076
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5836525 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcgttgcagttaaaa 5836426  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || || ||||| | |||||    
T  5836425 cacacaatgtccttacgcttgcaatcggctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttctggacaaacattgctttcgtggc 5836326  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5836325 ctttcccaccacagttgaaacacacaatctcagcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcact 5836226  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5836225 atacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcctgcagctattaacc 5836126  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||    
T  5836125 aaatccggaaaaactctaatctattggtacccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28260494 - 28260045
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28260494 tgtctgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaag 28260395  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  28260394 cacacaatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggc 28260295  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28260294 ctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 28260195  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28260194 gtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 28260095  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28260094 aagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28260045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 28285422 - 28285871
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28285422 tgtctgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaag 28285521  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  28285522 cacacaatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggc 28285621  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28285622 ctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 28285721  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28285722 gtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 28285821  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28285822 aagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28339243 - 28338794
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28339243 tgtctgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaag 28339144  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  28339143 cacacaatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggc 28339044  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  28339043 ctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 28338944  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28338943 gtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 28338844  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28338843 aagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28338794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 28312614 - 28313063
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  28312614 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcaattaaag 28312713  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  28312714 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctactacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcctcggaacaggcgttgctcttgtggc 28312813  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  28312814 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 28312913  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28312914 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 28313013  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  28313014 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 28313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25756912 - 25756580
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||| |||||||| || ||     
T  25756912 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgtttgcattgggaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaag 25756813  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||  | || |||| ||||||||    
T  25756812 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccgcaccggacacatttctttatctcttctggaaaaacattgcacttgtggc 25756713  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||| |  ||||    
T  25756712 ctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaactagggc 25756613  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  25756612 actatagggcttagggcgactctgctggccctt 25756580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 22436854 - 22437245
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||||| || || || |    
T  22436854 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagc 22436953  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | ||||||||||||||    
T  22436954 acacaatgtcattacgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctcacccggacaagcattgctcttgtggcc 22437053  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||  |  ||||||| |||||     
T  22437054 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctatttggccttatcagcaggggcg 22437153  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||  | ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  22437154 ctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 22437245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27559266 - 27558814
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||| || ||||| |||||     
T  27559266 tgtctgagtaccagctagagcaaaaactcaacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaag 27559167  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||| ||||| | | ||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||  | ||||||||||    
T  27559166 cacacgatgtcagcatgcttgcagtcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggc 27559067  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||   ||| ||| |||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  27559066 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 27558967  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||     
T  27558966 actatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcagctattc 27558867  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
     |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27558866 tccaaatctggaaaaactcggatttgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 27558814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 344
Target Start/End: Original strand, 21764983 - 21765127
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgacca-tcttttgtttccct 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |  || ||||    
T  21764983 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaattgccct 21765082  T
Q  299 gtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccct 344  Q
     ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21765083 -tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccct 21765127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18405239 - 18404969
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  18405239 tctgtgtactagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcgacgccttcttaggcttcttgcactgagaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagca 18405140  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
     || || |||  | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||||||    
T  18405139 tactatatcctcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccaggacaagcattactcttgtggcct 18405040  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  18405039 ttctcaccacaagtgaaacagacaatctttgcaggagcatccttcttgttaggccgcctatcttcgaccat 18404969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 19867672 - 19867823
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  19867672 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 19867771  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccaca 168  Q
    ||||||| ||  || | ||||| |||||||    |||||||||||| |||||    
T  19867772 acacaatatcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccaca 19867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16924937 - 16924867
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaac 86  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16924937 tgtctgtgtacccgtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaac 16924867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10466098 - 10466015
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||  |||||| || |||||||    
T  10466098 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagcta 10466015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21566999 - 21566956
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21566999 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 21566956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 23081407 - 23081462
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23081407 tgtctgagtatcagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaggct 23081462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10465958 - 10465910
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  10465958 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcag 10465910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14376924 - 14376880
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14376924 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 14376880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 18797963 - 18798007
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18797963 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 18798007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 21474774 - 21474814
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21474774 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 21474814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 9338333 - 9338782
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  9338333 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 9338432  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338433 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 9338532  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9338533 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 9338632  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9338633 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 9338732  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9338733 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 9486967 - 9487416
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  9486967 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 9487066  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487067 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 9487166  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9487167 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 9487266  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9487267 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 9487366  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9487367 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 24265121 - 24265570
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  24265121 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 24265220  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24265221 cacacaacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 24265320  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  24265321 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcaggggcact 24265420  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24265421 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 24265520  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24265521 aagtctgaaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 24265570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 16983991 - 16984440
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  16983991 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 16984090  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984091 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 16984190  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16984191 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 16984290  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  16984291 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 16984390  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16984391 aaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 16984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 24712785 - 24713234
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  24712785 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 24712884  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24712885 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 24712984  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24712985 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 24713084  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24713085 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 24713184  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24713185 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44383262 - 44382813
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  44383262 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctacccgtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 44383163  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44383162 cacacaacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcattgctcttgtggc 44383063  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  44383062 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccccttgtcagcgggggcact 44382963  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  44382962 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaacc 44382863  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44382862 aaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 44382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24874441 - 24873993
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24874441 gtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatttgaccctctccattgcagttaaaac 24874342  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24874341 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttaatttcttcatggcagacattgcttttgtggcc 24874242  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24874241 tttcccaccacagttgaaacacacaatctcagtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactg 24874142  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  24874141 tacggcttagaacgactctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactatttacca 24874042  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24874041 aatctggaaaaactctaagctgttgatacccaatcgcccttttgatgtc 24873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 10871601 - 10872050
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  10871601 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 10871700  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871701 caaacaatgtctgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 10871800  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10871801 ctttctcaccacaattgaaacacacaagctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 10871900  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10871901 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 10872000  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10872001 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22323034 - 22322585
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  22323034 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagatcctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 22322935  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22322934 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctataacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggc 22322835  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22322834 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctccgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 22322735  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22322734 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 22322635  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22322634 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 27374020 - 27374469
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  27374020 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 27374119  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27374120 caaacaatgtctgtacgattgcaatcagctaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 27374219  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  27374220 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 27374319  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27374320 gtacggcttaggacgactctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 27374419  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27374420 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 17001751 - 17002200
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  17001751 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaag 17001850  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17001851 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 17001950  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17001951 ctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagcaggggcact 17002050  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  17002051 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 17002150  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17002151 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17002200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21139672 - 21139392
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21139672 gtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctattaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 21139573  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21139572 acacaatgtcttcacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacggttcttgatctcttcacgacagacattgcttttgtggcc 21139473  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccc 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21139472 ttttccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23116718 - 23116299
Alignment:
Q  49 agtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctaca 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  23116718 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttgcaatcagctacg 23116619  T
Q  149 atatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct- 247  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||     
T  23116618 atatgacccctcttgctacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctg 23116519  T
Q  248 --gcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
      | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || || ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||    
T  23116518 aaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctt 23116419  T
Q  346 gtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatat 445  Q
       || |||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||||  || ||||| |||    
T  23116418 agtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtat 23116319  T
Q  446 ccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |||||||||||||||||    
T  23116318 ccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24705174 - 24704728
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  ||||  ||||||||||||||||| || || ||     
T  24705174 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaag 24705075  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||    
T  24705074 cacacaatgtcattacgcttgcaatcagctaaagtgtgacccttcttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggc 24704975  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  24704974 ctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcctatgtttgcccttatcagcaggggc 24704875  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |  ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| || ||||||||     
T  24704874 actatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattc 24704775  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||| ||||  |||||||||||    
T  24704774 accaaatctggaaaaacacgtatctgttggtatctgatcgccctctt 24704728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22463173 - 22462721
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  22463173 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccatagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaag 22463074  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  22463073 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacgatatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 22462974  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  | ||||  ||  ||| ||  |||||    
T  22462973 ctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccacctatcatcgaccattctctgttcgcccttattagaaggggc 22462874  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| || |||| ||| || |||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  22462873 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagattctgcagctattc 22462774  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  |  |||||||  |  ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22462773 actaaatcagcgaaaactcggatttgttggtatctgatcgccctcttgatgtc 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 23205065 - 23205337
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  23205065 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 23205164  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  23205165 cacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 23205264  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23205265 ctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 23676669 - 23676941
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  23676669 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 23676768  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  23676769 cacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 23676868  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23676869 ctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23676941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24657350 - 24656898
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||| || ||||  ||||||    
T  24657350 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgccattaaaa 24657251  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||| || ||   | | |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||  | ||||||||||    
T  24657250 cacacgatatcaccatgtttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggc 24657151  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||   ||||||| |||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||  |||||    
T  24657150 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggc 24657051  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  24657050 actatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattc 24656951  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24656950 atcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11351403 - 11351168
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||| ||||| || ||     
T  11351403 tgtctgtgtaccagccagagcaaaaaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgcttggactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaag 11351304  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |  ||||  || || || |||||||||||||    
T  11351303 cacacaatatcactatgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacctcctttggacaaacattgctcttgtggc 11351204  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11351203 ctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcag 11351168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 24678238 - 24678560
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||| || ||     
T  24678238 tgtctgtgtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgactctcttcaatgcaattgaag 24678337  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | |||||||||||||    
T  24678338 cacacaatgtcattacgcttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacaacggaaacatctcttaacctctcccggacaagcattgctcttgtggc 24678437  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  24678438 ctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 24678537  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactct 335  Q
     || || |||||||| |||||||    
T  24678538 gctatagggcttagggcgactct 24678560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23029149 - 23028828
Alignment:
Q  20 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacaca 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  23029149 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 23029050  T
Q  120 caatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 219  Q
    |||| ||  || | |||||||||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| |  ||  |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  23029049 caatatcattatgtttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctccaggacaagcattgctcttgtggccttt 23028950  T
Q  220 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  23028949 ctcaccacaa-taaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcacta 23028851  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctg 339  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  23028850 tagggcttagggcgactctgctg 23028828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23105419 - 23105027
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgacc-ctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||     
T  23105419 gtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgacctctcttcattgcaattgaag 23105320  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  || | ||| ||  | || ||||||||||    
T  23105319 cacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtcttaaggacaagcattactcttgtggc 23105220  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||  |||||| | |||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||    
T  23105219 ccttctcaccacaagagaaacaaataatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggtgc 23105120  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||   || |  ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23105119 actgtaaggcttagggcggctctgctggcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 23105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22742657 - 22742266
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  22742657 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactttaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 22742558  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  || | ||||| |||||||    |||||||||||| || || |||| |||  | || |  ||  | || ||  | |||||||||||||     
T  22742557 acacaatgtcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccgcatcggaaacatctatttacctctcccggacaagcattgctcttgtggca 22742458  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||   | ||| ||||||||||| | || || ||| | || |||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  22742457 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggca 22742358  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||| | ||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22742357 ctataaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcctgca 22742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23040208 - 23039877
Alignment:
Q  77 cactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacac 176  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  23040208 cactgtgaaccaatgtgacgctcttcattgcagttaaaacatactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacatcggaaac 23040109  T
Q  177 acttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcct 273  Q
    |  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| || ||    
T  23040108 atctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtct 23040009  T
Q  274 aacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatag 373  Q
    | | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||   || || ||| ||||||||||| ||     
T  23040008 accttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaa 23039909  T
Q  374 tgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  23039908 tgagccttaatatcctcctcgtagatcctgca 23039877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 408
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931698
Alignment:
Q  308 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagc 16931697  T
Q  408 t 408  Q
    |    
T  16931698 t 16931698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22733459 - 22733074
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| |   | |||| ||||| |||||||||||||||||| || || || || ||      
T  22733459 gtaccagtcaaagtaaaaactctaccagtagtcggcaccttcttaggtttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactt 22733360  T
Q  123 tgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctc 222  Q
    | ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| |||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  22733359 tatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacattgtaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctc 22733260  T
Q  223 accacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtac 319  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||  | ||| | ||||||||  | | ||| ||  ||||||| |||||||||||     
T  22733259 accacaagtaaaacagacaatttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaa 22733160  T
Q  320 ggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  22733159 agcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22733074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21320508 - 21320292
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||| ||      
T  21320508 ttgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattctttgtttgccct 21320409  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
    ||||||| ||||  || || |||||||| | ||||||||| ||| |   || || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || || || ||    
T  21320408 tatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaat 21320309  T
Q  400 cctgcagctattgacca 416  Q
     ||||||||||| ||||    
T  21320308 tctgcagctattcacca 21320292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21322957 - 21322876
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccct 98  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  21322957 gtctgagtaccggtcaatgcaaaaactctaccagtagttggcgccttcttaggttgcgtacattgtgaaccaatgtgaccct 21322876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 23065164 - 23065253
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcatt 105  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23065164 tgtctgtgtaccagtgaaagaaaaaactctgccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcatt 23065253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 23074614 - 23074703
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcatt 105  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23074614 tgtctgtgtaccagtgaaagaaaaaactctgccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcatt 23074703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 23065353 - 23065436
Alignment:
Q  205 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  23065353 gctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23065436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Original strand, 23074803 - 23074886
Alignment:
Q  205 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  23074803 gctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23074886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24817530 - 24817426
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || | ||| ||| ||||| |||||||||   | || | ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  24817530 tctgtgtaccagtcaaagcaaacactctcctagtggtctgcgccttcttaggcttcttgcattgtgaaccaatatgaccttcctcattgcagttaaaaca 24817431  T
Q  118 cacaa 122  Q
    |||||    
T  24817430 cacaa 24817426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Original strand, 20848626 - 20848789
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcc 401  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |    
T  20848626 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattc 20848725  T
Q  402 tgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| || || ||||| |  | ||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20848726 tgcacctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19716413 - 19716377
Alignment:
Q  309 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19716413 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19716377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19720976 - 19720940
Alignment:
Q  309 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19720976 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19720940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 10518 - 10965
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10518 gtctgcgtaccagtcaaaacaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccattgcagttaaaac 10617  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10618 acataatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcc 10717  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10718 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactg 10817  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10818 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 10917  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10918 aatccgg-aaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 10965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 41305 - 41753
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41305 gtctgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 41404  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  41405 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgctctcttcaggacaaacattgcttttgtggcc 41504  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  41505 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttattagcaggggcaatg 41604  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41605 tacggcttaggacaactctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattctcttcatagatcctgcagctattgacca 41704  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41705 aattcggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 41753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13279 - 12881
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||  |||||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||     
T  13279 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccatagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaag 13180  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  13179 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 13080  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||  | || || ||  |||| || |||||    
T  13079 ctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggc 12980  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctatt 411  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| | ||||  || | |||| || |||||||| || |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12979 actataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctatt 12881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 22396 - 22845
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  22396 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 22495  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22496 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggc 22595  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22596 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 22695  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22696 gtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 22795  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22796 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 7385 - 7834
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  7385 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 7484  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7485 caaacaatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggc 7584  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  7585 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcact 7684  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7685 gtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaacc 7784  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7785 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20015858 - 20015409
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  20015858 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 20015759  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20015758 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttactcttgtggc 20015659  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20015658 ccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 20015559  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015558 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 20015459  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015458 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 20015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22126554 - 22126105
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  22126554 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgactttctccattgcagttaaaa 22126455  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  22126454 cacacaatgtctgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcaaggaagacgttgcttttgtggc 22126355  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22126354 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcact 22126255  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22126254 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 22126155  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22126154 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17671617 - 17671168
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  17671617 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 17671518  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  17671517 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccagacacacttcttgatttcctccgggcagacattgcttttgtggc 17671418  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  17671417 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcact 17671318  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17671317 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 17671218  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17671217 aaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 18859763 - 18860212
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18859763 tgtctgagtaccactcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaa 18859862  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  18859863 cacacaatgtctgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggc 18859962  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18859963 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctttatcagcgggggcact 18860062  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  18860063 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctattaacc 18860162  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18860163 aaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22117770 - 22117321
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22117770 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 22117671  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22117670 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggc 22117571  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22117570 ctttcccaccacgattgaaacacacaatctctatagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagtgggggcact 22117471  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22117470 gtacggcttaggacgactttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 22117371  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22117370 aaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 19115586 - 19116035
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  19115586 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctctttggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaag 19115685  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19115686 cacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggc 19115785  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19115786 ctttctcgccacaattgaagcacacaacctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcact 19115885  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19115886 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaacc 19115985  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19115986 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19116035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19481667 - 19481219
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||||     
T  19481667 tgtctgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaag 19481568  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  19481567 cacacaatgtctgcacgattgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggc 19481468  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  19481467 ctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcact 19481368  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| |||| |||  | ||||||||||| |||| |||||||||||  |||    
T  19481367 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaacc 19481269  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |   |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  19481268 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 19481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 22043013 - 22043465
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  22043013 tgtctgagtagcagccagagcaaaaactcgacctgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaag 22043112  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || || ||||||||||    
T  22043113 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccgaacacatttcttgatctcttctggacaaacattactcttgtggc 22043212  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||   || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  | ||||  |||||    
T  22043213 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttgtcagtaggggc 22043312  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || || |||||||| |||||     
T  22043313 actataaggcttagggtgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcatctatta 22043412  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  || |||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22043413 accaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 32603331 - 32603783
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||| |||||| |||||  | ||||  ||||  || |||||||||||||| || || ||     
T  32603331 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgtcctcttcggctgcttgcactgggaacctatatgaccctcttcattacaattgaag 32603430  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || || || ||||||||||    
T  32603431 cacagaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggc 32603530  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || ||  ||||||| |||||    
T  32603531 ctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggc 32603630  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  32603631 actataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttc 32603730  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  || |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32603731 accaaatcagggaaaactcggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30310739 - 30310287
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |||||  ||||| |||| |||||  |||| |  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  30310739 tgtctgagtaccagctagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccttcttcggctgcttacattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaag 30310640  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  30310639 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 30310540  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  30310539 ctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 30310440  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  30310439 actataaggtttagggcgactctgctgacccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaactattc 30310340  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  || |||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30310339 actaaatcagggaaaactcggagttgttggtatctgatcgccctcttgatgtc 30310287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 15536569 - 15537021
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || ||     
T  15536569 tgtctgagtaccagcaagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaag 15536668  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| || || || ||||||||||    
T  15536669 cacacagtatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggc 15536768  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||  || |||||||| ||||| | ||||||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || || ||  |||| || |||||    
T  15536769 cttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcggcaggggc 15536868  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  |  |||| || ||||||||||||||||||||     
T  15536869 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcctcgtagatcctgcagctattc 15536968  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15536969 actaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 22031289 - 22031554
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||| |||||||| || || ||     
T  22031289 tgtctgagtaccagccatagcaaaaactcgacctgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccttcttcattacaattgaag 22031388  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| || || |||||||| ||||    
T  22031389 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctctttaggacaaacattgctcttatggc 22031488  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatc 279  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22031489 cttt-tcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 22031554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 19981154 - 19981545
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||| || || || |    
T  19981154 gtctgagtaccagtcaaagtgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagc 19981253  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttc-ctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||  || | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  | || |  || ||| || ||  | |||||||||||||    
T  19981254 acacaatgtcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatcttttcacctctctc-ggacaagcattgctcttgtggc 19981352  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | | ||| ||  ||||||| |||||    
T  19981353 ctttctcaccacaattaaagaagacaatctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctctatttgcccttatcagcaggggc 19981452  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
     || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||| | ||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19981453 gctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 19981545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18881252 - 18880920
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  18881252 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 18881153  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  18881152 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagtgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggc 18881053  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||  |||||    
T  18881052 ctttctcaccacaagtaaaacagacaatttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggc 18880953  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18880952 actgtaaggcttagggcgactctgctgaccctt 18880920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21164132 - 21163679
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||  | || |  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  21164132 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagttggcgccttcttaggttgcttgcattgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 21164033  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcct--------cagggcagacgttgctc 208  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||| |    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| || || |        || | ||  | ||||||    
T  21164032 acacaatgtcattacagttgcaatcagccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctttatctctccatgacaagcattgctc 21163933  T
Q  209 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcag 305  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||    
T  21163932 ttgtggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcag 21163833  T
Q  306 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  21163832 caggggcactatagggcttagggcgactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 21163733  T
Q  406 gctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
     || || ||||| |  |  |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  21163732 actgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21163679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21391456 - 21391064
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  21391456 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 21391357  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  21391356 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggc 21391257  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| | ||||||||  | | ||| ||  ||||| |  ||||    
T  21391256 ctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggc 21391157  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |||||| ||||| ||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21391156 actataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21391064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21780782 - 21780390
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||     
T  21780782 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaag 21780683  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  21780682 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggc 21780583  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| | ||||||||  | | ||| ||  ||||| |  ||||    
T  21780582 ctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggc 21780483  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || |||||| ||||| ||||| || |||||  | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21780482 actataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21780390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 21254131 - 21254238
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||     
T  21254131 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacactaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccgatgtgaccctattcattgcagttaaag 21254230  T
Q  116 cacacaat 123  Q
    || |||||    
T  21254231 caaacaat 21254238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17830195 - 17830113
Alignment:
Q  383 gtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17830195 gtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtc 17830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Original strand, 22054336 - 22054381
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22054336 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtccctt 22054381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 369
Target Start/End: Original strand, 21671891 - 21672057
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||  |||||| |||| |||||  | ||||| ||  |||    
T  21671891 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctaccattctctgtttacccttat 21671990  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatctt 369  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||    
T  21671991 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatctt 21672057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22027586 - 22027543
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22027586 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 22027543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 22990231 - 22990286
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  22990231 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaggct 22990286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 465
Target Start/End: Original strand, 28984287 - 28984549
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttg-tttccctgta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   ||| ||||||  || |||| || | |||| ||||  ||||| | || ||||||| |     
T  28984287 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttccct-tg 28984385  T
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcc 401  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| |||||| || |||||  |||| || ||||| || ||||    
T  28984386 tccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcc 28984485  T
Q  402 tgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    | || || || ||||| |  | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  28984486 tacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaatggctcttttgatgtc 28984549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16268629 - 16268589
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16268629 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctc 16268589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 8408 - 8856
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  8408 gtctgagtaccagtcaaagcaataaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcatcattgtagttaaaac 8507  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8508 acacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcc 8607  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  8608 tctcccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagttggggcactg 8707  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8708 tacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgacca 8807  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8808 aatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 3573 - 4022
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3573 tgtctgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaa 3672  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3673 cacacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaataggacctttcttaccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggc 3772  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3773 ctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcact 3872  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  3873 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgcagctattaacc 3972  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3973 aaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 4022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 464
Target Start/End: Original strand, 17309 - 17760
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||| ||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  17309 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggttgtttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaag 17408  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || || || ||||||||||    
T  17409 cacacaatatcattacgctaaaaatcagctactatatgacccttattgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattactcttgtggc 17508  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  17509 ctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgtttgcccttatcagcaggggc 17608  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||| | | || |||||  |||||||||| || || || |||||||||||     
T  17609 actatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctatta 17708  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgt 464  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  17709 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 21147 - 21578
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21147 gtctgcgtaccattcaaagcaaagaccctactagtagtcggcgtcctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 21246  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21247 acacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcc 21346  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||                 | |||||||||    
T  21347 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactg 21429  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21430 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 21529  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21530 aatccggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 11619 - 12050
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11619 gtctgcgtaccattcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaac 11718  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11719 acacaatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgcgacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcc 11818  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||                 | |||||||||    
T  11819 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactg 11901  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11902 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 12001  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12002 aatccggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 55154 - 55602
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55154 gtctgagttccagtcaaagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaac 55253  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    | |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  55254 atacaatgtcctgacgcttgcaatcagatactatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggcc 55353  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||  ||||||| ||||| |||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55354 ttttccaccacagttgaagcacacaatttcagaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactg 55453  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||| ||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  55454 tacggcttaggacgactctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaacca 55553  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||  |||||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  55554 aatccggaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 55602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 464
Target Start/End: Original strand, 87 - 524
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  87 tgtctgagtaccaatcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaa 186  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  187 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaaaatgacccttcttgccacaccggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggc 286  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcact 315  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||             
T  287 ctttcccaccataattgaaacacacaatttcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttcccttcatcagc--------- 377  T
Q  316 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacc 415  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  378 --acggcttaggacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctacagatattgacc 475  T
Q  416 aaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgt 464  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  476 aaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgt 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 424457 - 424909
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  424457 tgtctgagtacaagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactgatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 424556  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  424557 cacacaatgtcctcacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacatcggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggc 424656  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    | |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  424657 ctttcacaccacagttgaagcacacaatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatattttgtttccctttatcagcaggggc 424756  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  424757 attgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatta 424856  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  424857 accaaatccagaaaaactctaatctgttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Original strand, 203819 - 203862
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203819 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 203862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 465
Target Start/End: Original strand, 48815 - 49263
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48815 gtctgagtcccagtcaaaggaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatttgtccctcttcattgcagttaaaac 48914  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  48915 atacaatgtcttgacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacattggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggcc 49014  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactg 316  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | ||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  49015 tttcccaccatagttgaaacacaaaatttcagaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattctctgtttccctttatcagtaggggcattg 49114  T
Q  317 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgacca 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  49115 tacggtttaggacgactctgctgtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaacca 49214  T
Q  417 aatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||  | |||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  49215 aatccgtaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 49263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 635 - 189
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||  | || ||     
T  635 tgtctgagtaccagccagagaaaaaactcgacccgtagtaggcgccctctttggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaag 536  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  535 cacacaatatcatttcgcttgcaatcatctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcctcaggacaaacattgctcttgtggc 436  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||  ||||||| |||||    
T  435 ctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaggggc 336  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    | | || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  335 aatataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcttcatagattctacaactattc 236  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||||||  ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||||||    
T  235 accaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14187 - 13733
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  14187 tgtctgagtaccagccatagcaaaaacttgacctgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaag 14088  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||    
T  14087 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatacgacccttcttgccacacctgacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggc 13988  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||| | |||||    
T  13987 ctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcatcaggggc 13888  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| |||||||| || |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  13887 actatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagatcctgcagctattc 13788  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgtt--gatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |||| ||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  13787 actaaatctggaaaaactcgaatctgttgcggtatccaatcgccctcttaatgtc 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 465
Target Start/End: Original strand, 1 - 450
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  1 tctgagtaccagccaaagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagca 100  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||||    
T  101 cacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcct 200  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcac 314  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  201 ttctcaccacaattgaagcaagtaatctcaactggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcac 300  T
Q  315 tgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgac 414  Q
    | || |||||| ||||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||||||| || |||||  | || || || |||||||||||||||||||| ||    
T  301 tataaggctta-gacgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttcttcctcgtagatcctgcagctattcac 399  T
Q  415 caaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
     ||||  || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  400 taaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 139641 - 139313
Alignment:
Q  140 tcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  139641 tcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaag 139542  T
Q  240 caatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 336  Q
     |||||| ||   || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  139541 taatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 139442  T
Q  337 ctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagc 436  Q
    ||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  || |||| ||  |||    
T  139441 ctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagc 139342  T
Q  437 tgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  139341 tgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 5147 - 5599
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| | ||| |||||  | |||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  5147 tgtctgggtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggtgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaac 5246  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||    
T  5247 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttatggc 5346  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  |||||||  ||||    
T  5347 ccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaagggc 5446  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||     
T  5447 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcatcatagattctgcagctattc 5546  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  5547 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 230007 - 229555
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |  || |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  230007 tgtctgagtaccagccagagcaaaaattcgtcccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaag 229908  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||    
T  229907 cacacaatatcattaagcttgcaatcagctattatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggc 229808  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  229807 ctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 229708  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||  ||||   || |||||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || || || |||||||||||     
T  229707 actatagggcttagggcgactctgctggtccttagtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctatta 229608  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    |||||||  ||||||||||  | |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  229607 accaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Original strand, 251961 - 251998
Alignment:
Q  209 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctc 251998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 15196 - 14750
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||   || ||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  15196 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtagacgtcctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaat 15097  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||    
T  15096 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggc 14997  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  14996 ctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 14897  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| |  ||||| || || |||||     
T  14896 actatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattc 14797  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||||||  ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||||||    
T  14796 accaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 14750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11511 - 11065
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||   || ||||||||||||  | || |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  11511 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtagacgtcctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaat 11412  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||||||||    
T  11411 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggc 11312  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  11311 ctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 11212  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || ||||||||   ||| || || |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| |  ||||| || || |||||     
T  11211 actatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattc 11112  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    |||||||  ||||||||||  |  |||||||| ||||| ||||||||    
T  11111 accaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 36648 - 37093
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||  | || |  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36648 gtctgtgtaccagccaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaaactgcttgcattgagaaccaatatgaccctcttccttgcaattaaagc 36747  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||    
T  36748 acacaatatcactacgcttgcaatcagctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcc 36847  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  36848 tttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggca 36947  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    || || ||||||||  |||||||||| |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| || ||||| || ||| | || |    
T  36948 ctatagggcttagggagactctgctggcccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttca 37047  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||  ||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  37048 ccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 14573 - 15025
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| |||||||||||||| || || ||     
T  14573 tgtctaagtatcagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaag 14672  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || || || ||||||||||    
T  14673 catacgatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgactcttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggc 14772  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  14773 cattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 14872  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||  || |||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  14873 actataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattc 14972  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14973 actaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 180947 - 180849
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttct 161  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  180947 tcttaggttgagtgcactgcgaactaatgtgaccctcatcaccacagttaaaacaaacaatatctccacgcttgcaatcagccaacacatgacccttct 180849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 924 - 473
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| ||| ||||||||||| || || || ||     
T  924 tgtctgagtaccatccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttacaattgaag 825  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || |||||||||     
T  824 cacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggt 725  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  724 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 625  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||   |||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  624 actataaggcttagggcgactctgcttgtccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagatcctgcagttattc 525  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgt 464  Q
    || ||||  || |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  524 actaaataagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107480
Alignment:
Q  252 catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctc 351  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  352 cctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatc 451  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatc 107494  T
Q  452 gccctcttgatgtc 465  Q
     |||||||||||||    
T  107493 tccctcttgatgtc 107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 387
Target Start/End: Original strand, 8550 - 8737
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   || ||||||||||| || || ||| | ||||||||| | ||||| ||      
T  8550 ttgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgccct 8649  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatc 387  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  8650 tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatc 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10393 - 9996
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||  |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||||| || || ||     
T  10393 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccatagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaag 10295  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  10294 cacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 10195  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | || || ||  |||||||  ||||    
T  10194 ctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggc 10095  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctatt 411  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || | |||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10094 actataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctatt 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12651
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||  |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||||| || || ||     
T  13048 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccatagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaag 12950  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  12949 cacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 12850  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||  | || || ||  |||||||  ||||    
T  12849 ctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggc 12750  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctatt 411  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || | |||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12749 actataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctatt 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Original strand, 32028 - 32474
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  32028 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaa 32127  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || | |||||||||||||    ||||| |||||| |||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  | |||||||||||||    
T  32128 cacacaatatcattatgtttgcaatcagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggc 32227  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||||    
T  32228 ctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaagggc 32327  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
     || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || || || ||||| || ||     
T  32328 gctatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttc 32427  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||| || |  |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  32428 accaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 32474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 37494 - 37715
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||| ||||  |  |||    
T  37494 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaa 37593  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  || | |||||||||||||    ||||| |||||| |||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  | |||||||||||||    
T  37594 cacacaatatcattatgtttgcaatcagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggc 37693  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaaca 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  37694 ctttctcgccacaattaaaaca 37715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 54795 - 54893
Alignment:
Q  25 accagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaat 123  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| |||||||||   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54795 accagtcaaagcaaatactctactagtagccggcgccttcttaggcttcttacactacgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacacacaat 54893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 459
Target Start/End: Original strand, 4 - 383
Alignment:
Q  83 gaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttct 182  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||  |||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||    
T  4 gaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcaactaatgtatgacctttcttgccacgccgaaaacttttct 103  T
Q  183 tgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatc 279  Q
    | |  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  104 tcacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 203  T
Q  280 gaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagca 379  Q
    ||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||   || || ||| ||||||| ||| || |||||     
T  204 gaccattctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagct 303  T
Q  380 atggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
     |||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  304 ttggtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctctt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Original strand, 28 - 426
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | |||  ||||  |||||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||     
T  28 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccatagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaag 127  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  128 cacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 227  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||  | || || ||  |||| || |||||    
T  228 ctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggc 327  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctatt 411  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| | ||||  || | |||| || |||||||| || |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  328 actataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctatt 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7934 - 7482
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||  | || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||     
T  7934 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaag 7835  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| ||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  7834 cacacaatatcattacttttgcaatcagctataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggc 7735  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   || | |||| ||||| || |||||| | ||||||||  | | ||| ||| ||||||| |||||    
T  7734 ctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagtagccttattctttggccgcctatcgtcgaccattctctatttgcctttatcagcaggggc 7635  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| | ||     
T  7634 actataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctacagatgttc 7535  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || ||||  |  | |||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7534 actaaatcagcgacaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15733 - 15408
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||  ||||  || |||||||| |||||||| || || |    
T  15733 gtctgtgtaccagccaaagcaaaaactctaccagtagttggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagc 15634  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| || || |  ||||||||||||||    
T  15633 acacaatgtcattgtgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcc 15534  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  15533 tttctcaccacaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggca 15434  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctg 339  Q
    || || |||||||| | |||||||||    
T  15433 ctatagggcttagggcaactctgctg 15408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Original strand, 30437 - 30792
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||| || || | |||||||||||    
T  30437 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctccgtacactgtgaaccaatatgaccttcctcttcgcagttaaaac 30536  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  | |||||||||||| |    
T  30537 acacaatgtccttatgcttacactcagctagtgtatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggtc 30636  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||| | ||||||||  | ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30637 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggca 30736  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatctt 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  || || ||| |||||||||||    
T  30737 ctgtacggcttaggatgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatctt 30792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 399
Target Start/End: Original strand, 171267 - 171653
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||| || || |  ||||  || |||||||||||||| ||||| ||     
T  171267 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttcggctgcgtgcattgggaaccgatatgaccctcttcattacagttgaag 171366  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||    
T  171367 cacgcaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggc 171466  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||   ||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  171467 ctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaactggagcatccttcttctttggccgcctatcaacgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggc 171566  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagat 399  Q
     || || |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||| ||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||||||    
T  171567 gctatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagat 171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10041
Alignment:
Q  31 caaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgta 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||    
T  10298 caaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcacta 10199  T
Q  131 cgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaat 230  Q
     |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10198 tgcttacaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctagacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaat 10099  T
Q  231 tgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat 285  Q
    ||||||| ||||||||    | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10098 tgaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccat 10041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Original strand, 21754 - 22202
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  21754 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaagtctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 21853  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  || | |||||||||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  21854 acacaatatcattatggttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcc 21953  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| ||||||||||| | ||||| ||  ||  ||| ||||||    
T  21954 tttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggca 22053  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    || || |||||| |||||||| |||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || |||||||| || || |    
T  22054 ctatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttca 22153  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgat 462  Q
    |||| || |  |||||||  | |||||| |||||||| || ||||||||    
T  22154 ccaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgat 22202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Original strand, 37178 - 37626
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  37178 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaagtctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 37277  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  || | |||||||||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  37278 acacaatatcattatggttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcc 37377  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || || ||| ||||||||||| | ||||| ||  ||  ||| ||||||    
T  37378 tttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggca 37477  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    || || |||||| |||||||| |||| |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || |||||||| || || |    
T  37478 ctatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttca 37577  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgat 462  Q
    |||| || |  |||||||  | |||||| |||||||| || ||||||||    
T  37578 ccaacttggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgat 37626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 17221 - 16775
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||  | || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  || | ||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  17221 tgtctgagtaccagctagagaaaaaactctacccgtagtcggcgccctcttaggctgcttacactgggacccaatatgaccctcttctttgcagttgaaa 17122  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||| || ||   | ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||| || || ||  ||||||||||||    
T  17121 cacacgatatcaccatgcttgcagtcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacagtgctcttgtggc 17022  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||   ||||||| |||||||||||  |  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  17021 ctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 16922  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| | ||||||||| |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  16921 actatatggcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttc 16822  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||| ||||||||||   | |||||| ||||| |||||||||||    
T  16821 accaaatctggaaaaactgggatctgttggtatccgatcgccctctt 16775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 194992 - 194883
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  194992 gtctgagtatcggtcaacgcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcgtacactacgaaccaatgtgaccctccttattgcaattaaagc 194893  T
Q  117 acacaatgtc 126  Q
    ||||||||||    
T  194892 acacaatgtc 194883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 194784 - 194691
Alignment:
Q  252 catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  194784 catccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt 194691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7811 - 7363
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||   |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  7811 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcaccgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 7712  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||  || | ||||| ||| |||    |||||||||||| ||||| |||| | |  |||| |  || || || || |  ||||||||||||||    
T  7711 acacaatatcattaagtttgcactcatctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaatatctctttacctcttccggacaaatattgctcttgtggcc 7612  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  7611 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggca 7512  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||   || || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || || || |||||||| || || |    
T  7511 ctgtaaggcttagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaatcctgcaactgttca 7412  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgat 462  Q
    |||| |  |  |||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||    
T  7411 ccaactcggagaaaactcggatctgttggtaaccaattgccctcttgat 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36974 - 36526
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |    
T  36974 gtctgagtactagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagc 36875  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| || |    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||  || ||   ||| ||  | |||||||| |||||    
T  36874 acacaatgtcattacggttgcaatcggccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctgtatctctctaggacaagcattgctcttatggcc 36775  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | || || ||| | ||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  36774 tttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgtttgcccttatcagcaggggca 36675  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattga 413  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||  ||||||||||| || |||||  |||||||||| || || || ||||| || || |    
T  36674 ctatagggcttagggcgactctgctggcccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttca 36575  T
Q  414 ccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgat 462  Q
    |||| |  |  |||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  36574 ccaactcggagaaaactcagatctgttggtatccaattgccctcttgat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Original strand, 74 - 429
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || || | |||||||| ||    
T  74 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcaccttcttaggcttcgtacactgtgaactaatatgaccttcctcttcgcagttaagac 173  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||||||  || |||| || |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  |||| |  ||  |  | ||  | ||||||||||||||    
T  174 acacaatgtctttatgcttacactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccagacaagcattgctcttgtggcc 273  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  274 tttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggca 373  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatctt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||  || || ||| |||||||||||    
T  374 ctgtacggcttaggacgactctattgtcccctggtcttccgctcattcacaatctt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17504 - 17112
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17504 tgtctgtgtaccagttaaagcaaacactctaccagtagtcggcgcctgcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaag 17405  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || ||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  17404 catacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggc 17305  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  17304 ccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 17205  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||| || |||||||| |||||||| || |||||  | | || ||| ||||||||||| || | ||   |||||||||| || |||||||||||    
T  17204 actataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 17112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Original strand, 40496 - 40537
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 343  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40496 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtccc 40537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8952
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagta-cactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||   |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8559 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaacactctaccagtagtcggcgccttcttaggctttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaa 8658  T
Q  115 acacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtgg 214  Q
     || ||||| ||   | | ||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||| || | |||  ||||| | |||  ||| ||  | || |||||||||    
T  8659 gcatacaatatcatcatgtttgcactcagctagagcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccctaggacaagcattactcttgtgg 8758  T
Q  215 cctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcggggg 311  Q
    || ||||||||||||   ||||| |||||||| | || |   ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||    
T  8759 cccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcagggg 8858  T
Q  312 cactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | | || ||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  || |||||||||||    
T  8859 cactgtaaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatccttctcatagatcctgca 8952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 345
Target Start/End: Original strand, 1 - 217
Alignment:
Q  132 gcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaatt 231  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1 gcttgcaatcagctaaagtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaat 100  T
Q  232 gaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttagga 328  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  | | ||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||     
T  101 gaaacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttaggg 200  T
Q  329 cgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||||||| |||||    
T  201 cgactctgctggccctt 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 345
Target Start/End: Original strand, 291 - 595
Alignment:
Q  44 ctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcag 143  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || ||||||||||||    
T  291 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaactaatatgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcag 390  T
Q  144 ctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 243  Q
    |||    |||||||||||| |||||| ||| |||  | || |  || |  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  391 ctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctctttcggaaaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 490  T
Q  244 ctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 340  Q
    ||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  491 ctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctgg 590  T
Q  341 ccctt 345  Q
    |||||    
T  591 ccctt 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Original strand, 3013 - 3465
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||  | || |  |||| ||| |||||||| || ||||| |||||     
T  3013 tgtctaagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctattaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaag 3112  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||| ||||| | | | |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||| ||  |  | ||||||||||    
T  3113 cacacgatgtcagcatgtttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacacttctccacctcctcaggacaagcagtactcttgtggc 3212  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||| ||||   ||||||| |||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  3213 ctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 3312  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| |  || || ||| || ||||     
T  3313 actataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctccttataaattctgtagttattc 3412  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  3413 accaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 190 - 521
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||| || || || |    
T  190 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagc 289  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcaggg-cagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||||||||||  || | ||||| |||||||    |||||||||||| ||| | |||| |||  | || |  || ||| || ||  | |||||||||||||    
T  290 acacaatgtcattatgtttgcactcagctagtgaatgacccttcttaccaaatcggaaacatcttttaacctc-tcacggacaagcattgctcttgtggc 388  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | || |||||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  389 ctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 488  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
     || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  489 gctataaggcttagggcgactctgctggccctt 521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Original strand, 2140 - 2530
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||   | |||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2140 tctgagtactagtcaatgcaaaaactctaccagtagtctgcgcattcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaaaca 2239  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
    |||||| |||  | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||| | || |  ||| || | ||  | |||||||||||||||    
T  2240 cacaatatcctcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctattaacatccccatgacaagcattgctcttgtggcct 2339  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccat-cttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| | ||   |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| || |  ||||||| |||||||  |||||    
T  2340 ttctcaccacaagtatagcacacaatctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaaccattctctattttccct-tatcagcaagggca 2438  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||  | ||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2439 ctgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 2530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 533 - 201
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  || |||||||||   | || | || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  533 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggtaccttcttaggcttcttgcattatgcaccaatgtgacgctcttcattgcagttaaaa 434  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||||   |||  ||| ||  | || ||||||||||    
T  433 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcggaaacatctcttggcatcccaaggacaagcattactcttgtggc 334  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  333 ctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 234  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  233 actgtaaggcttagggcgactcttctgaccctt 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Original strand, 14234 - 14598
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14234 gtctgagtaccagtcagagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaac 14333  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    | || || ||   | |||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| || | |||  |||| |  ||| || | ||  | || ||||| |||||    
T  14334 atactatatcaacatgcttacactcagctagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttaacatccccaagacaagcattactcttatggcc 14433  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  | ||||| ||  ||||||| | ||||    
T  14434 tttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggca 14533  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagc 378  Q
    || || |||||||| |||||||| || |||||   || || ||| ||||||||||| || |||||    
T  14534 ctataaggcttagggcgactctgttgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagc 14598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 390
Target Start/End: Original strand, 11420 - 11789
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||   | ||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  11420 gtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcaccttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtg-ccctcttcattgcaattaaaacatacta 11518  T
Q  123 tgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctc 222  Q
    | ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| || | ||  | || |||||||||||||||||    
T  11519 tatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaagacaagcattactcttgtggcctttctc 11618  T
Q  223 accacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtac 319  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||| ||  ||||||  || ||||||||     
T  11619 accacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggagcactgtaa 11718  T
Q  320 ggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctc 390  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  | | || ||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||    
T  11719 ggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttggtatcctc 11789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11035 - 10713
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  11035 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaag 10936  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || ||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  | || ||||||||||    
T  10935 catacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctgttggtatccctaggacaagcattactcttgtggc 10836  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||||||||   | |||||||||||||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  10835 ccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 10736  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactct 335  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
T  10735 actgtaaggcttagggcgactct 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 50498 - 50108
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  50498 tctgagtaccagtcaacgcaaaaactcttccagtagtcggcgcctttttaggcttcgtacattgtgaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagca 50399  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||   | || |||||||| ||||| || | |||  ||||    ||  | || ||  | ||||| |||||||||    
T  50398 cacaatgtcattacgcttacactcagctagtgtgtgtcccttcttcccacagcgaaaacatctctttccctctcccggacaagcattgcttttgtggcct 50299  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcac 314  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  50298 ttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgc 50199  T
Q  315 tgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    | || ||||||||  |||||||||  ||| |  ||| || ||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  50198 tataaggcttagggagactctgctagcccatagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 50108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30728 - 30346
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||  ||  | ||||  |||| ||||| ||||||||||||||| || || |    
T  30728 gtctgagtaccagtcaaagcgaaaactctactagtagtcggcgccttcttagattgcttgcactgagaaccaatgtaaccctcttcattgcaattgaagc 30629  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    |||||| |||  || | |||||||||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | ||||||||||||||    
T  30628 acacaaggtcattatgtttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctcctggacaagcattgctcttgtggcc 30529  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | || ||  || | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||| |    
T  30528 tttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggta 30429  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgta 396  Q
    || || ||| |||| ||||||||||| || ||   || || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  30428 ctatagggcctagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcgta 30346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 47137 - 47099
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtc 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47137 gtctgagtaccagtcaatgcaaaaactctaccagtagtc 47099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 402
Target Start/End: Original strand, 9096 - 9485
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9096 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaag 9195  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |  ||||| ||   | | ||||| ||| |||    |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  9196 cgtacaatatcatcatgtttgcactcaactagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggc 9295  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||   ||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||| | |||||    
T  9296 ccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcaccaggggc 9395  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    ||| || || ||||  |||||||| || |||||  | | || ||| ||||||||||  || ||||   |||||||||| || ||||||||    
T  9396 actataaggattagcgcgactctgttgacccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcct 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29083 - 28631
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||  |||||||||| || ||  | || |  |||| ||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  29083 tgtctgagtaccagccagagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctctttggttgcttgcattgggaaccaatatgaccctctactttgcagttgaaa 28984  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    ||| |||| ||   | ||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||| ||| || || |||||||||||||    
T  28983 cacgcaatatcaccatgcttgcattcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggc 28884  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||   |||||||||||||||| || ||  | ||||||||  | ||||| ||  ||||| | |||||    
T  28883 ctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcaggaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggc 28784  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattg 412  Q
    ||| || |||||||| | || |||||| |||||   || |  ||| || |||| ||| || |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||     
T  28783 actatatggcttagggcaacactgctggcccttagtcttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttc 28684  T
Q  413 accaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctcttgatgtc 465  Q
    || |||| |||||||| ||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  28683 actaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1116 - 801
Alignment:
Q  147 caatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  1116 caatatgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctggacaaacaatgctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctc 1017  T
Q  247 tgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 343  Q
     | ||   |||||||||||||||| || ||  | || |||||| | ||| | |   ||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || |||    
T  1016 agtaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgtgtgcgcttatcagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggccc 917  T
Q  344 ttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgat 443  Q
    ||   || || ||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||| |    
T  916 ttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcatcatagattctacagctattcaccaaatatggaaaaactcggatctgttggt 817  T
Q  444 atccaatcgccctctt 459  Q
    |||||| |||||||||    
T  816 atccaaacgccctctt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1137
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctctt 66  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187 tgtctgtgtaccagctagagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctctt 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Original strand, 15060 - 15452
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15060 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagccgacgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaag 15159  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || ||||| |    | | ||||| |||||||    || ||||||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  | || | ||||||||    
T  15160 catacaatattatcatgtttgcactcagctagtgcataacccttcttcccacatcggaaacatctattggtatccctaggacaagcattacccttgtggc 15259  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||   ||| | |||||||||   | |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  15260 ccttctcaccacaagaaaaaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggc 15359  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||| || |||||||| |||||||| || |||||  | | || ||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| || |||||||||||    
T  15360 actataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 15452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 1132 - 1241
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  1132 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttacactgtgaaccaatgtgaccctcctaattgcaattaaagc 1231  T
Q  117 acacaatgtc 126  Q
    ||||||||||    
T  1232 acacaatgtc 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 122142 - 121885
Alignment:
Q  205 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgta 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||  ||    
T  122142 gctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccctta 122043  T
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt-gtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatc 400  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || ||||| ||| | || ||| || |||| ||| || |||||  |||||||||| || |||||     
T  122042 tcagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgt-ccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagatt 121944  T
Q  401 ctgcagctattgaccaaatttggaaaaactctaagctgttgatatccaatcgccctctt 459  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||||||  | |||||| ||||| || ||||||||    
T  121943 ctgcagctattcaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctctt 121885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 8372 - 8737
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8372 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttccactgtgaaccaatgtgaccttcttcatcgcaattaaag 8471  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |  |||  ||| ||  | || ||||||||||    
T  8472 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacacctcttaacatccctaggacaagcattactcttgtggc 8571  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    |||||| ||||||| | || || ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  | ||||| ||  |||| ||  | ||    
T  8572 ctttctgaccacaagtaaagcagacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgaccattctctgtttgcccttatcggcaagagc 8671  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagc 378  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | | || ||| ||||||||||| || |||||    
T  8672 actgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagc 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34868 - 34763
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  34868 tctgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagca 34769  T
Q  118 cacaat 123  Q
    ||||||    
T  34768 cacaat 34763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 41782 - 41888
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  41782 gtctgagtagcagtcaaagcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 41881  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  41882 acacaat 41888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 75502 - 75608
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  75502 gtctgagtagcagtcaaagcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 75601  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  75602 acacaat 75608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 405
Target Start/End: Original strand, 42079 - 42173
Alignment:
Q  311 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |  | ||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| || |||||||||||    
T  42079 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgca 42173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 405
Target Start/End: Original strand, 75799 - 75893
Alignment:
Q  311 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |  | ||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| || |||||||||||    
T  75799 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgca 75893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2418 - 2145
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | || || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  2418 tgtctgtgtaccagtcagagcaaaaactctaccagtagccggcaccttcttaggctacttacactatgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaag 2319  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || ||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  2318 catacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggc 2219  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctct---gcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatc 286  Q
    | || |||||||||   ||||| |||||||||   | ||||||||||||||| || || ||| | |||||||||    
T  2218 ccttgtcaccacaagaaaaacaaacaatctctacaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatc 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 405
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7041
Alignment:
Q  250 agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcc 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  6886 agcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtc 6985  T
Q  350 tccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    | || ||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  6986 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcctgca 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 1181 - 1282
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||   | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1181 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctaccattagtcggcgccttcttaggcttcatgcacaatgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 1280  T
Q  116 ca 117  Q
    ||    
T  1281 ca 1282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Original strand, 40 - 432
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||| | |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| |||||||| || || ||     
T  40 tgtctgtgtactagtcaaagcaaatactataccagtagtcggcgtcttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaag 139  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    || || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  | || ||||||||||    
T  140 catactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaggacaagcattactcttgtggc 239  T
Q  216 ctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggc 312  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || || ||| | ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  240 ccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggc 339  T
Q  313 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||  | | || ||| ||||||||||| || ||||   ||||||| || || |||||||||||    
T  340 actgtaaggcttagggagactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcatagatcctgca 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3347
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3303 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttg 3347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40660 - 40270
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |  | || |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40660 tctgtgtacgagtcaaagcaaaaactctaccagtagccgacaccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaaca 40561  T
Q  118 cacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcct 217  Q
     || || ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| |  | |||  |||| |  ||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  40560 tactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcaaaaacatctcttaacatccccaggacaagcattgctcttgtggcct 40461  T
Q  218 ttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgacca-tcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||||||||||| |  |  |  ||||||| ||||   |||| |||||  | || |||||| |||| |||| ||| |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  40460 ttctcaccacaagtatagaattcaatctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgttttccct-tatcagcaggggca 40362  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||  | ||| ||||||||||| || ||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40361 ctgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 40270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Original strand, 296 - 622
Alignment:
Q  22 agtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacaca 121  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||| | |||  ||||| ||||||||||  | || |  |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  296 agtaccagccagagcaaaaactcgacccgcagtaggcgccttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacg 395  T
Q  122 atgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttct 221  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||| | ||  |  | ||||||||||||||||    
T  396 atgtcagcatgcttgcaatcaactaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacactccttcacctcctcacgacaagcagtactcttgtggcctttct 495  T
Q  222 caccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgta 318  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  |||   ||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| | ||||| ||  ||||| | |||| ||| ||    
T  496 caccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaacatcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcaacaggggaactata 595  T
Q  319 cggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||    
T  596 aggcttagggcgactctgctggccctt 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 339
Target Start/End: Original strand, 3701 - 4026
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  3701 gtctgagtaccagtcaatgcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 3800  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   |   ||||| |||||||    |||||| ||||| ||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||| |    
T  3801 acacaatatcatcatttttgcactcagctagtgcatgacctttcttaccacaacgaaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggtc 3900  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    |||| ||||| || |  | || ||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  | ||||| ||  ||||||| || |||    
T  3901 tttcacaccataagtatagcagacaatttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagca 4000  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctg 339  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  4001 ctgtaagacttaggacgactctgctg 4026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9408 - 9220
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||  |  |||| ||  |||    
T  9408 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgaccattctcggtttgcccttat 9309  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctct 391  Q
    |||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||   || |  ||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  9308 cagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctct 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 167 - 558
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  167 gtctgagtaccagtcaatgtgaaaactctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 266  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   | | ||| | |||||||    |||||||||||| ||||| || |  ||  |||| |  ||  |||| ||  | || |||||||||||    
T  267 acacaatatcatcatgtttggactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcc 366  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||  |  |||| ||  ||||||| || |||    
T  367 tttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagca 466  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| | | |  ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  467 ctgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 4584 - 4975
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  4584 gtctgagtaccagtcaatgtgaaaactctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 4683  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   | | ||| | |||||||    |||||||||||| ||||| || |  ||  |||| |  ||  |||| ||  | || |||||||||||    
T  4684 acacaatatcatcatgtttggactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcc 4783  T
Q  217 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggca 313  Q
    ||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||  |  |||| ||  ||||||| || |||    
T  4784 tttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagca 4883  T
Q  314 ctgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| | | |  ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  4884 ctgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23446 - 23347
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||   | || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23446 gtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcgttgcagttaaaacacacaa 23347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9504 - 9400
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || | ||| ||| ||||| |||||||||   | || | ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  9504 tctgtgtaccagtcaaagcaaacactctcctagtggtctgcgccttcttaggcttcttgcattgtgaaccaatatgaccttcctcattgcagttaaaaca 9405  T
Q  118 cacaa 122  Q
    |||||    
T  9404 cacaa 9400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24867 - 24769
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24867 tgtctgtgtaccagtcaaagcaaaaactctacaagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgacgctcctcattgcagttaaa 24769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23688 - 23582
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23688 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcctcattgcagttaaaa 23589  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    || ||||    
T  23588 catacaa 23582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Original strand, 153698 - 153771
Alignment:
Q  73 agtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||   |||||| ||||||||||    
T  153698 agtacactgcgaactaatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcagcta 153771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 18800 - 19012
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||   |||||   |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  18800 gtctgagtaccagtcaatgcaaaaactctaccaatagtctgcgccttcttaggcttcttacacagcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagc 18899  T
Q  117 acacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcc 216  Q
    ||||||| ||   | | ||||| |||||||    |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |  ||| | || ||  | || |||||||||||    
T  18900 acacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttcacatccccgggacaagcattactcttgtggcc 18999  T
Q  217 tttctcaccacaa 229  Q
    |||||||||||||    
T  19000 tttctcaccacaa 19012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23910 - 23708
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||   | ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||  | ||||| ||  |||    
T  23910 ctcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctctgtttgcccttat 23811  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | | |  ||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| || || |||||    
T  23810 cagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcataaatcct 23711  T
Q  403 gca 405  Q
    |||    
T  23710 gca 23708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 69576 - 69366
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||   | ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || ||     
T  69576 tgtctgtgtaccagccaaagccaaaaccctaccagtagtcggcaccttcttaggctacttgcactgagaaccaatgtgaccctcttctttgcaattgaag 69477  T
Q  116 cacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggc 215  Q
    |||||||| |   || |||||||||||||||    |||||||||||| |||||| ||| |||  | || |  || || || ||  | |||||||||||||    
T  69476 cacacaatat-attatgcttgcaatcagctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctcttccggacaagcattgctcttgtggc 69378  T
Q  216 ctttctcaccac 227  Q
    ||||||||||||    
T  69377 ctttctcaccac 69366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 216575 - 216469
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||   | || |  || | ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  216575 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcattgcgacccaatatgaccttcttcattgcagttaaaa 216476  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  216475 cacacaa 216469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2018 - 1913
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||   | || |  |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2018 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttacgcttcttgcattgcgaaccaatatgaccttcctcattgcagttaaaac 1919  T
Q  117 acacaa 122  Q
    ||||||    
T  1918 acacaa 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4882 - 4777
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||   | || |  |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  4882 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttacgcttcttgcattgcgaaccaatatgaccttcctcattgcagttaaaac 4783  T
Q  117 acacaa 122  Q
    ||||||    
T  4782 acacaa 4777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 1127
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||   |||||| || || |||     
T  1272 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 1173  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1172 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 15566 - 15665
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15566 gtaccagtcaaagcaaaaactcttccagtagtctgagccttcttaggcttcttacattacgaaccaatatgaccttcttcattgcagttaaaacatacaa 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 7022 - 7128
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| || |||||||| || |||    
T  7022 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgtgccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcctcattgcaattgaaa 7121  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  7122 cacacaa 7128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 14152 - 14258
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| || |||||||| || |||    
T  14152 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgtgccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcctcattgcaattgaaa 14251  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  14252 cacacaa 14258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 55624 - 55518
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaac 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||   | || | |||||| || ||||| || |||||||||||||| |    
T  55624 gtctgagtaccagtcaatgcaaaaactctcccagtagtctgcgccttcttaagcttcttgcattgtgaacttatatgaccttcctcattgcagttaaagc 55525  T
Q  117 acacaat 123  Q
    |||||||    
T  55524 acacaat 55518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 496169 - 496275
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||   |||| | ||||| ||| | ||| || |||||||||||||||    
T  496169 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactctccgagtagtctgcgccttcttaggcttcttacattgtgaaccaatataaccttcctcattgcagttaaaa 496268  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    || ||||    
T  496269 catacaa 496275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 441808 - 441907
Alignment:
Q  23 gtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||| | ||||| |||||||||   | || |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441808 gtaccagtcaaagcaaaaactctccatgtagcctgcgccttcttaggcttcttgcattgcgaaccaatatgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 441907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 514321 - 514278
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  514321 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctc 514278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9655 - 9610
Alignment:
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9655 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 9610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 111061 - 110964
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaa 114  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  111061 gtctgagtttcagtcaaagcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaa 110964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23888 - 23674
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| || | |||| ||||  ||||||| || || ||| | |    
T  23888 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 23789  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||    
T  23788 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtcttcttcatagattct 23689  T
Q  403 gcagctattgaccaa 417  Q
    ||| ||||| |||||    
T  23688 gcacctattaaccaa 23674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 951 - 879
Alignment:
Q  74 gtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  951 gtacactgtgaactgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaatatcaccacgcttgcaatcagcta 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Original strand, 42074 - 42288
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| || | |||| ||||  ||||||| || || ||| | |    
T  42074 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 42173  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcct 402  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  42174 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 42273  T
Q  403 gcagctattgaccaa 417  Q
    ||| ||||| |||||    
T  42274 gcacctattaaccaa 42288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1310
Alignment:
Q  203 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| || | |||| ||||   ||| || ||||| ||      
T  1455 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttccct 1356  T
Q  300 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1355 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtccctt 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6123 - 6080
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6123 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17307
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17350 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 17307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4672
Alignment:
Q  308 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4709 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Original strand, 19812 - 19939
Alignment:
Q  278 tcgaccatcttttgtttccctgtatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgag 377  Q
    ||||||||| | ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||  | | || ||| ||||||||||| || ||||    
T  19812 tcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgag 19911  T
Q  378 caatggtatcctcttcgtagatcctgca 405  Q
       |||||||||| || |||||||||||    
T  19912 tcttggtatcctcctcatagatcctgca 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Original strand, 263664 - 263707
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  263664 tcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtccctt 263707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 339
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10094
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| |||| |||||  |||| |||||  ||||||| ||  |||    
T  9958 ctcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgtttacccttat 10057  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 339  Q
     ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10058 tagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctg 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7904
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||   | ||||  |||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  7807 gtctgagtaccaatcaaagcaaaaactctactagtagtctgtgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaa 7904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14421 - 14315
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || || |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  14421 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgcaccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcttcattgcaattgaaa 14322  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    || ||||    
T  14321 catacaa 14315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4520 - 4384
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttttgtttccctgtat 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  | |||||  |  |||    
T  4520 ctcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttatccttat 4421  T
Q  303 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 339  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4420 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctg 4384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7893 - 7839
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7893 gtctgagtaccagtcaatgcgaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggct 7839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 57769 - 57663
Alignment:
Q  16 tgtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||   |||| |  |||| ||| ||||| |||||||| || || |||    
T  57769 tgtctgcgtaccagtcaaagcaaaaactctcctagtagtctgcgccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcttcattacaattgaaa 57670  T
Q  116 cacacaa 122  Q
    |||||||    
T  57669 cacacaa 57663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 345
Target Start/End: Original strand, 2275 - 2312
Alignment:
Q  308 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2275 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 30348 - 30392
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30348 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttg 30392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Original strand, 30267 - 30312
Alignment:
Q  200 acgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  30267 acgttgcttttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatct 30312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Original strand, 6012 - 6084
Alignment:
Q  74 gtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    ||||||| ||||||||| || || || || ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  6012 gtacactgtgaactaatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaatgtccccacgcttgcaatcagcta 6084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1671
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1714 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttccctt 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 368
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  411 tcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Original strand, 10937 - 11042
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaaca 117  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||  || || |||||||||   ||||||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  10937 tctgagtaccagtcaatgcggaaactctactagtagtatgcaccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagca 11036  T
Q  118 cacaat 123  Q
    ||||||    
T  11037 cacaat 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 11173 - 11256
Alignment:
Q  63 tcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | || |||||||||  |||||| || |||||||    
T  11173 tcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagcta 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 309
Alignment:
Q  83 gaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagcta 146  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  372 gaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcagcta 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49046 - 49003
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49046 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 49003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 58080 - 58037
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58080 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 58037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 64468 - 64425
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64468 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 64425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 30062 - 30106
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 30106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15062 - 15028
Alignment:
Q  88 aatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15062 aatgtaaccctcttcattgcagttaaaacacacaa 15028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33342 - 33300
Alignment:
Q  201 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  33342 cgttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaat 33300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 345
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17720
Alignment:
Q  311 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtccctt 17720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 243
Target Start/End: Original strand, 34667 - 34713
Alignment:
Q  197 cagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 243  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34667 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaat 34713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Original strand, 176326 - 176368
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctg 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  176326 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctg 176368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 104377 - 104431
Alignment:
Q  17 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggct 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  104377 gtctgagtaccagtcaaagcaaaaaatctcccaatagtctgcgccttcttaggct 104431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 5059
Alignment:
Q  18 tctgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactttgaactaatgtgaccctcttcattgcagtt 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||| | ||| |||||||||   | |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  5152 tctgcgtaccagtcaaagcaaaaaccttcccaccagtctgggccttcttaggcttcttgcactttgaactaatatgactttcttccttgcagtt 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8538 - 8450
Alignment:
Q  95 ccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttctt 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||| | | || |||||||  ||||||| || |||||||||    
T  8538 ccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttctt 8450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18752 - 18664
Alignment:
Q  95 ccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttctt 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||| | | || |||||||  ||||||| || |||||||||    
T  18752 ccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttctt 18664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 21252 - 21296
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21252 tcagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttg 21296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 50543 - 50587
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50543 tcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttg 50587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 66965 - 66857
Alignment:
Q  311 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgtcctccctctcgttcacaatcttatagtgagcaatggtatcctcttcgtagatcctgcagctat 410  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||  ||||| || |||||  |||| || || || || ||||||||||| |    
T  66965 gcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgt 66866  T
Q  411 tgaccaaat 419  Q
    | |||||||    
T  66865 ttaccaaat 66857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 62638 - 62594
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  62638 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttg 62594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 346
Target Start/End: Original strand, 116062 - 116106
Alignment:
Q  302 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 346  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttg 116106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 51990 - 52030
Alignment:
Q  206 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  51990 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctc 52030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University