View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6987_low_4 (Length: 238)

Name: NF6987_low_4
Description: NF6987
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6987_low_4
NF6987_low_4
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-230)||(15103-15341)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-198)||(17835431-17835628)
chr7 (1-198)||(10517335-10517532)
chr7 (1-230)||(39460883-39461120)
chr7 (1-198)||(47672606-47672803)
chr7 (1-202)||(15073746-15073946)
chr7 (1-198)||(27453140-27453337)
chr7 (1-202)||(42507545-42507745)
chr7 (1-198)||(47776689-47776886)
chr7 (1-198)||(36977953-36978150)
chr7 (1-198)||(37340659-37340856)
chr7 (1-198)||(9494317-9494513)
chr7 (1-198)||(34738721-34738918)
chr7 (1-198)||(14689579-14689776)
chr7 (32-165)||(556200-556333)
chr7 (32-163)||(5541096-5541227)
chr7 (32-151)||(48403743-48403862)
chr7 (32-151)||(41880876-41880995)
chr7 (32-144)||(17741023-17741135)
chr7 (32-151)||(35609984-35610103)
chr7 (32-163)||(46740103-46740234)
chr7 (46-163)||(16675186-16675303)
chr7 (46-163)||(17649554-17649671)
chr7 (32-151)||(45257374-45257492)
chr7 (32-151)||(9370958-9371073)
chr7 (32-111)||(17465329-17465408)
chr7 (32-111)||(17587806-17587885)
chr7 (42-93)||(41734559-41734610)
chr7 (114-151)||(17462862-17462899)
chr7 (114-151)||(17590315-17590352)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (1-198)||(42165517-42165714)
chr3 (1-230)||(4007804-4008041)
chr3 (1-198)||(3976061-3976258)
chr3 (1-198)||(47073728-47073925)
chr3 (1-198)||(44230068-44230265)
chr3 (1-198)||(50216399-50216596)
chr3 (1-198)||(50963309-50963505)
chr3 (1-196)||(20917540-20917735)
chr3 (1-196)||(20926502-20926697)
chr3 (1-198)||(30255523-30255720)
chr3 (1-198)||(49195968-49196165)
chr3 (1-198)||(42805783-42805980)
chr3 (3-198)||(42756510-42756703)
chr3 (20-198)||(48563301-48563479)
chr3 (1-198)||(48889098-48889286)
chr3 (1-154)||(597113-597266)
chr3 (1-134)||(3501477-3501610)
chr3 (32-163)||(16611463-16611594)
chr3 (32-163)||(22047659-22047790)
chr3 (32-165)||(17567618-17567751)
chr3 (32-163)||(41612753-41612884)
chr3 (32-151)||(52390964-52391083)
chr3 (1-90)||(51807324-51807413)
chr3 (32-163)||(20351030-20351161)
chr3 (32-151)||(2274482-2274601)
chr3 (32-151)||(29009245-29009364)
chr3 (32-163)||(36127822-36127953)
chr3 (32-151)||(42903758-42903877)
chr3 (32-151)||(46389347-46389466)
chr3 (32-151)||(50480352-50480471)
chr3 (32-151)||(54386509-54386628)
chr3 (32-151)||(49144031-49144149)
chr3 (32-151)||(34045762-34045880)
chr3 (32-151)||(46701593-46701712)
chr3 (42-144)||(4178199-4178301)
chr3 (34-144)||(31045169-31045279)
chr3 (42-144)||(4172201-4172303)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-198)||(39947955-39948152)
chr2 (1-202)||(28468996-28469196)
chr2 (1-198)||(45428946-45429142)
chr2 (1-202)||(17420922-17421122)
chr2 (16-194)||(21998560-21998737)
chr2 (1-198)||(32955880-32956072)
chr2 (1-134)||(25965175-25965308)
chr2 (32-163)||(29401160-29401291)
chr2 (1-98)||(7185384-7185481)
chr2 (32-163)||(25515366-25515496)
chr2 (32-163)||(36655906-36656037)
chr2 (32-157)||(45284558-45284683)
chr2 (32-157)||(45291921-45292046)
chr2 (32-163)||(10828581-10828712)
chr2 (32-151)||(20938282-20938401)
chr2 (55-198)||(45136824-45136956)
chr2 (32-151)||(3940297-3940416)
chr2 (32-151)||(5352351-5352470)
chr2 (32-151)||(15831514-15831633)
chr2 (32-151)||(30496515-30496634)
chr2 (32-151)||(43978906-43979025)
chr2 (32-151)||(43539306-43539425)
chr2 (125-202)||(22686858-22686934)
chr2 (1-48)||(45137103-45137150)
chr2 (34-120)||(31367427-31367513)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-198)||(43211860-43212057)
chr8 (1-198)||(5303742-5303939)
chr8 (1-187)||(39602070-39602256)
chr8 (1-198)||(39846507-39846704)
chr8 (1-198)||(39938737-39938934)
chr8 (1-198)||(43188404-43188601)
chr8 (1-198)||(15036249-15036446)
chr8 (1-202)||(489147-489347)
chr8 (1-198)||(34822538-34822735)
chr8 (1-163)||(39252366-39252528)
chr8 (1-202)||(42485047-42485256)
chr8 (1-202)||(45064596-45064786)
chr8 (1-163)||(40076806-40076968)
chr8 (32-198)||(2984508-2984674)
chr8 (1-198)||(41249610-41249791)
chr8 (26-155)||(37327163-37327292)
chr8 (32-163)||(35552051-35552182)
chr8 (32-163)||(20857671-20857802)
chr8 (32-163)||(24249868-24249999)
chr8 (32-158)||(45128135-45128261)
chr8 (32-151)||(25095-25214)
chr8 (32-151)||(1052910-1053029)
chr8 (32-151)||(23021889-23022008)
chr8 (32-151)||(26659832-26659951)
chr8 (60-163)||(34371450-34371553)
chr8 (32-163)||(5677456-5677587)
chr8 (1-50)||(25864609-25864658)
chr8 (34-144)||(22495305-22495415)
chr8 (166-198)||(39252522-39252554)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (2-198)||(31783249-31783445)
chr1 (1-198)||(35258394-35258591)
chr1 (1-198)||(45825231-45825429)
chr1 (1-198)||(51321069-51321266)
chr1 (1-202)||(19925097-19925297)
chr1 (1-202)||(30890416-30890616)
chr1 (1-198)||(19527064-19527261)
chr1 (1-198)||(49857467-49857661)
chr1 (1-198)||(23275625-23275822)
chr1 (1-198)||(52802486-52802683)
chr1 (1-230)||(47502670-47502895)
chr1 (32-163)||(21141413-21141544)
chr1 (32-163)||(50343525-50343656)
chr1 (32-163)||(97504-97635)
chr1 (32-151)||(2365622-2365741)
chr1 (32-151)||(19156401-19156520)
chr1 (32-163)||(47656256-47656386)
chr1 (32-163)||(2424924-2425053)
chr1 (32-163)||(22524521-22524650)
chr1 (32-151)||(3731949-3732068)
chr1 (32-151)||(13639591-13639710)
chr1 (32-143)||(17514272-17514383)
chr1 (32-151)||(26876043-26876162)
chr1 (42-156)||(38127045-38127160)
chr1 (32-120)||(8474171-8474259)
chr1 (34-103)||(23935581-23935650)
chr1 (1-38)||(29622105-29622142)
chr1 (75-134)||(16243106-16243165)
chr1 (73-120)||(25166976-25167023)
chr1 (42-120)||(25147698-25147776)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-202)||(8580023-8580223)
chr5 (1-198)||(17658677-17658874)
chr5 (1-198)||(19228193-19228390)
chr5 (1-198)||(42537504-42537701)
chr5 (2-202)||(28876999-28877198)
chr5 (1-198)||(38968452-38968650)
chr5 (1-198)||(7757679-7757876)
chr5 (1-198)||(8701745-8701942)
chr5 (1-202)||(28241317-28241517)
chr5 (1-198)||(42942008-42942204)
chr5 (1-198)||(512293-512490)
chr5 (2-144)||(14264-14406)
chr5 (32-163)||(5197359-5197490)
chr5 (32-165)||(40624468-40624601)
chr5 (32-151)||(19040685-19040804)
chr5 (32-160)||(20422335-20422463)
chr5 (32-144)||(27673228-27673340)
chr5 (32-151)||(30705522-30705641)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-198)||(21022410-21022606)
chr4 (1-198)||(51683557-51683754)
chr4 (1-198)||(37021604-37021801)
chr4 (1-198)||(50275089-50275286)
chr4 (1-202)||(30726259-30726459)
chr4 (1-202)||(40357798-40357998)
chr4 (1-198)||(48256092-48256289)
chr4 (1-202)||(1089102-1089302)
chr4 (1-198)||(55407308-55407505)
chr4 (1-202)||(1308632-1308832)
chr4 (1-198)||(50901835-50902031)
chr4 (2-155)||(67947-68100)
chr4 (1-155)||(46436599-46436753)
chr4 (32-198)||(11050044-11050210)
chr4 (32-163)||(21538008-21538139)
chr4 (32-163)||(50023099-50023230)
chr4 (34-187)||(14315772-14315925)
chr4 (32-163)||(10752983-10753114)
chr4 (32-163)||(10966752-10966883)
chr4 (32-163)||(50030217-50030348)
chr4 (32-144)||(41798570-41798682)
chr4 (32-151)||(9892836-9892955)
chr4 (34-163)||(14297523-14297652)
chr4 (34-163)||(41933179-41933308)
chr4 (32-163)||(3184342-3184473)
chr4 (32-163)||(3185440-3185571)
chr4 (32-163)||(3185648-3185779)
chr4 (32-151)||(6181358-6181477)
chr4 (32-151)||(49090806-49090925)
chr4 (32-151)||(49165419-49165538)
chr4 (42-155)||(30704419-30704532)
chr4 (32-163)||(44679631-44679762)
chr4 (34-163)||(11083562-11083691)
chr4 (32-151)||(31422083-31422203)
chr4 (32-152)||(50193864-50193985)
chr4 (42-144)||(4719953-4720055)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-198)||(6320084-6320281)
chr6 (1-198)||(31769060-31769257)
chr6 (1-198)||(24088303-24088500)
chr6 (32-163)||(24722314-24722445)
chr6 (32-144)||(21600990-21601102)
chr6 (32-163)||(3501555-3501686)
chr6 (33-163)||(26423384-26423514)
chr6 (32-151)||(6201534-6201653)
chr6 (32-151)||(11688501-11688620)
chr6 (32-151)||(22301566-22301685)
chr6 (32-151)||(30829220-30829339)
chr6 (32-151)||(27617101-27617220)
chr6 (44-187)||(3381182-3381313)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-202)||(246-446)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (1-153)||(7773-7925)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (33-163)||(18489-18619)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (53-155)||(10761-10863)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (32-163)||(4210-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (72-120)||(246180-246228)
scaffold0007 (34-144)||(251051-251161)


Alignment Details
Target: scaffold0180 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15341 - 15103
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 15242  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta--- 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15241 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatat 15142  T
Q  198 ------ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 230  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15141 tgatttttttggttagtttaggttacaagaattatgatg 15103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17835431 - 17835628
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835431 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 17835530  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835531 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 17835628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10517335 - 10517532
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517335 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 10517434  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517435 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 10517532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39460883 - 39461120
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460883 gaatgtagttgttgcctattttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 39460982  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta--- 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39460983 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatat 39461082  T
Q  198 -----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 230  Q
         |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39461083 tgatgttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 39461120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47672803 - 47672606
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672803 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 47672704  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47672703 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 47672606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15073946 - 15073746
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073946 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 15073847  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15073846 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 15073748  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  15073747 tg 15073746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27453337 - 27453140
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453337 gaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 27453238  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453237 ttgataaaatgtctcattgacaattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 27453140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42507745 - 42507545
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507745 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 42507646  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42507645 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 42507547  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  42507546 tg 42507545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 47776689 - 47776886
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776689 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 47776788  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47776789 ttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtat 47776886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36977953 - 36978150
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977953 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 36978052  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36978053 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 36978150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37340659 - 37340856
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340659 gaatgtacttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 37340758  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37340759 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtat 37340856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9494513 - 9494317
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494513 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 9494414  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9494413 ttgatcaaatgcgtcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 9494317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 34738721 - 34738918
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34738721 gaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgt 34738820  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34738821 ttgataaaatgtctcgatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 34738918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14689776 - 14689579
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14689776 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctttgaatagtggcaaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgt 14689677  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14689676 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttatgttatggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtat 14689579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 556333 - 556200
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  556333 ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattt 556234  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  556233 attatttagttagtttatgttatgaaaattatat 556200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541096
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403862
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  48403843 attatttagttagtttaggt 48403862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880995
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  41880976 attatttagttagtttaggt 41880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17741135 - 17741023
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||    
T  17741135 ataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaattcccaaatgagaattatattg 17741036  T
Q  132 attatttagttag 144  Q
    |||||||||||||    
T  17741035 attatttagttag 17741023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609984
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  35610003 attatttagttagtttaggt 35609984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740103
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  46740134 attatttaattagtttaggtcatggatatgat 46740103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 163
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  46 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagc 145  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  146 ttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 163
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  46 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagc 145  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  146 ttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257492
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaa-aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  45257473 attatttagttagtttaggt 45257492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370958
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  9370977 attatttagttagtttaggt 9370958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465329
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587885
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17587885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 93
Target Start/End: Original strand, 41734559 - 41734610
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734559 tttgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462862
Alignment:
Q  114 tcaatgataattttattgattatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 151
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590352
Alignment:
Q  114 tcaatgataattttattgattatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17590352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42165517 - 42165714
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42165517 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgt 42165616  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165617 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 42165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4008041 - 4007804
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008041 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 4007942  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta--- 197  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||       
T  4007941 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtatat 4007842  T
Q  198 -----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 230  Q
         |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4007841 tgattttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 4007804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3976061 - 3976258
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976061 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 3976160  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976161 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtat 3976258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47073925 - 47073728
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47073925 gaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgt 47073826  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073825 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 47073728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44230068 - 44230265
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44230068 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgt 44230167  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230168 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 44230265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50216596 - 50216399
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50216596 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgt 50216497  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216496 ttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50216399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50963309 - 50963505
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50963309 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgt 50963408  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50963409 ttgataaaatgcctcagtgacaattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtat 50963505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20917735 - 20917540
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917735 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 20917636  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 196  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917635 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20917540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20926697 - 20926502
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926697 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 20926598  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 196  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926597 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30255720 - 30255523
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255720 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 30255621  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255620 ttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 30255523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49196165 - 49195968
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196165 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 49196066  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49196065 ttgatcaaatgcttcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtat 49195968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42805980 - 42805783
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42805980 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgt 42805881  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42805880 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaggtgtat 42805783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 42756510 - 42756703
Alignment:
Q  3 atgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttt 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756510 atgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttt 42756609  T
Q  103 gataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42756610 gatcaaatgcctcaatgaaaa--ttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 42756703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 48563301 - 48563479
Alignment:
Q  20 gttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatg 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48563301 gttgtttaaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatg 48563400  T
Q  120 ataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563401 aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48563479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 48889098 - 48889286
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889098 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 48889197  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889198 ttgatcaaaggcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg---------aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48889286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 597113 - 597266
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  597113 gaatgtagttgttgcccatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgt 597212  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttat 154  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597213 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagcttaggttat 597266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3501610 - 3501477
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501610 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 3501511  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 134  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3501510 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611594
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047659
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567618
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgatat 17567618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612884
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  41612853 attatctagttagtttagtttatggatatgat 41612884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390964
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  52390983 attatttagttagtttaggt 52390964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 51807324 - 51807413
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 90  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807324 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351161
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat-aaaatgcctcaatgataattttatt 130  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  131 gattatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274482
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2274501 attatttagttagtttaggt 2274482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009364
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  29009345 attatttagttagtttaggt 29009364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127953
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  36127922 attatttggttagtttaggctatggatatgat 36127953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903758
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  42903777 attatttagttagtttaggt 42903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389466
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  46389447 attatttagttagtttaggt 46389466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480352
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  50480371 attatttagttagtttaggt 50480352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386628
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  54386609 attatttagttagtttaggt 54386628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144031
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49144050 attatttagttagtttaggt 49144031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045880
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  34045861 attatttagttagtttaggt 34045880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701593
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  46701612 attatttagttagtttaggt 46701593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178301
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 141  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  142 tag 144  Q
    |||    
T  4178299 tag 4178301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31045279 - 31045169
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| ||    
T  31045279 aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaattgcatttat 31045180  T
Q  134 tatttagttag 144  Q
    |||||||||||    
T  31045179 tatttagttag 31045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172303
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 141  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  142 tag 144  Q
    |||    
T  4172301 tag 4172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39947955 - 39948152
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39947955 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 39948054  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948055 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 39948152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 28468996 - 28469196
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468996 gaatgtaattgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 28469095  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469096 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 28469194  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  28469195 tg 28469196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 45428946 - 45429142
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428946 gaatgtagttgttgcctacgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 45429045  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429046 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 45429142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17420922 - 17421122
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17420922 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtgt 17421021  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17421022 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 17421120  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  17421121 tg 17421122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 21998560 - 21998737
Alignment:
Q  16 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21998560 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 21998659  T
Q  116 aatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998660 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32956072 - 32955880
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32956072 gaatgtacttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgt 32955973  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32955972 ttgataaaatgcctcaatgacaat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgg-taagtgtat 32955880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25965175 - 25965308
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25965175 gaatgtagttgtttcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 25965274  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25965275 ttgataaaatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401160
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  29401191 attatttagttagtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 7185384 - 7185481
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185384 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25515496 - 25515366
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25515496 ataatgtggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattg 25515398  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25515397 attattgagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655906
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284683
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatgga 157  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45284658 attatttagttagtttagattatgga 45284683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292046
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatgga 157  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45292021 attatttagttagtttagattatgga 45292046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828581
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938401
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  20938382 attatttagttagtttaggt 20938401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136824
Alignment:
Q  55 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttat 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||| |||||||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttat-----------ttagtttaggttat 45136868  T
Q  155 ggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtat 45136824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940297
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3940316 attatttagttagtttaggt 3940297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352470
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  5352451 attatttagttagtttaggt 5352470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831633
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15831614 attatttagttagtttaggt 15831633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496515
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30496534 attatttagttagtttaggt 30496515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979025
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  43979006 attatttagttagtttaggt 43979025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539306
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  43539325 attatttagttagtttaggt 43539306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 22686858 - 22686934
Alignment:
Q  125 tttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 202  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686858 tttagtgattatttagttagtttag-ttatggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 22686934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 45137150 - 45137103
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaat 48  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45137150 gaatgtagttcttgcctatgttatttaaatcataatgtggccttgaat 45137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Original strand, 31367427 - 31367513
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||   | || |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31367427 aatgtggttttgaatggtgtcaaatcaacataatgatattaagtttcatattttgcacaaaaagtgtttgttaaaatgcctaaatga 31367513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43211860 - 43212057
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211860 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 43211959  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211960 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 43212057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5303939 - 5303742
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303939 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 5303840  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303839 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 5303742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 39602070 - 39602256
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602070 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 39602169  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39602170 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39846704 - 39846507
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39846704 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgt 39846605  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846604 ttgataaactgtctccatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 39846507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39938934 - 39938737
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  39938934 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtat 39938835  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39938834 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 39938737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43188404 - 43188601
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43188404 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgt 43188503  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43188504 ttgataaaatgtttcaatgacaattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 43188601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15036446 - 15036249
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036446 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 15036347  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatga-tgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15036346 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtat 15036249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 489347 - 489147
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489347 gaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 489248  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  489247 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 489149  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  489148 tg 489147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34822735 - 34822538
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34822735 gaatgtagttgttgcctatgttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgt 34822636  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34822635 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtat 34822538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 39252366 - 39252528
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252366 gaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 39252465  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252466 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 39252528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42485256 - 42485047
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485256 gaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 42485157  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg---------gaaatgatataaatgatgttaattatagtttggtta 191  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42485156 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggtta 42485058  T
Q  192 agtgtattttg 202  Q
    ||| |||||||    
T  42485057 agtttattttg 42485047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 45064596 - 45064786
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||    
T  45064596 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcttaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaattt----------ttgcacacaaagtgt 45064685  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064686 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 45064784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40076968 - 40076806
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40076968 gaatgtagctgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgt 40076869  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  40076868 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttacagaaatgat 40076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 2984508 - 2984674
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  2984508 ataatgtggttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaacgacaattatattg 2984607  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2984608 attatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtat 2984674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41249791 - 41249610
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  41249791 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac--------- 41249701  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
           | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41249700 -------attgccgcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 41249610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Original strand, 37327163 - 37327292
Alignment:
Q  26 taaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataatt 125  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37327163 taaatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaatt 37327262  T
Q  126 ttattgattatttagttagcttaggttatg 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37327263 ttattgattatttagttagtttaggttatg 37327292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552182
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857802
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 24249868 - 24249999
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24249868 ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgagaattatattg 24249967  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24249968 attatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 158
Target Start/End: Original strand, 45128135 - 45128261
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  45128135 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattg 45128234  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaa 158  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  45128235 attattgagttagtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25095
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  25114 attatttagttagtttaggt 25095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053029
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  1053010 attatttagttagtttaggt 1053029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021889
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  23021908 attatttagttagtttaggt 23021889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659951
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26659932 attatttagttagtttaggt 26659951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371450
Alignment:
Q  60 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaa 159  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggata 34371454  T
Q  160 tgat 163  Q
    ||||    
T  34371453 tgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25864658 - 25864609
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 50  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864658 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Original strand, 22495305 - 22495415
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||    
T  22495305 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgat 22495404  T
Q  134 tatttagttag 144  Q
    |||||| ||||    
T  22495405 tatttacttag 22495415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Original strand, 39252522 - 39252554
Alignment:
Q  166 aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39252522 aaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtat 39252554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31783445 - 31783249
Alignment:
Q  2 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783445 aatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 31783346  T
Q  102 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783345 tgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 31783249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35258591 - 35258394
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258591 gaatttagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 35258492  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35258491 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 35258394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 45825231 - 45825429
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttt-gcacacaaagtg 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45825231 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtg 45825330  T
Q  100 tttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825331 tttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 45825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51321069 - 51321266
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51321069 gaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgt 51321168  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321169 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 51321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19925097 - 19925297
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19925097 gaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 19925196  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19925197 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 19925295  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  19925296 tg 19925297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30890416 - 30890616
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890416 gaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 30890515  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30890516 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 30890614  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  30890615 tg 30890616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19527261 - 19527064
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19527261 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgt 19527162  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19527161 ttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaatttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtat 19527064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49857661 - 49857467
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857661 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 49857562  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| ||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49857561 ttgatcaaatgcctca---aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 49857467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23275822 - 23275625
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg-tggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275822 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 23275723  T
Q  100 tttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23275722 tttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtat 23275625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52802486 - 52802683
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52802486 gaatgtagttgttgcttatgttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgt 52802585  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802586 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 52802683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 47502670 - 47502895
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502670 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 47502769  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgta--- 197  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  47502770 ttggtaaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttag---aggtt---------atagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatat 47502857  T
Q  198 -----ttttggttagtttaggttacaagaatgatgatg 230  Q
         |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47502858 tgattttttagttagtttaggttacaagaattatgatg 47502895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141544
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343525
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97504
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365741
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2365722 attatttagttagtttaggt 2365741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156520
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19156501 attatttagttagtttaggt 19156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  47656356 attatttagttag-tttggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2425053 - 2424924
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2425053 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattg 2424956  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2424955 attatttatttagtttaggttatggatatgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 22524521 - 22524650
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22524521 ataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22524618  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  22524619 attatttagttagtttagatcatggatatgat 22524650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731949
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3731968 attatttagttagtttaggt 3731949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639591
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  13639610 attatttagttagtttaggt 13639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17514383 - 17514272
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||    
T  17514383 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaataaaaattatattg 17514284  T
Q  132 attatttagtta 143  Q
    ||||||||||||    
T  17514283 attatttagtta 17514272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876162
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26876143 attatttagttagtttaggt 26876162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38127160 - 38127045
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttag 140  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38127160 tttgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttag 38127061  T
Q  141 ttagcttaggttatgg 156  Q
    |||| |||||||||||    
T  38127060 ttagtttaggttatgg 38127045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 120
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23935650 - 23935581
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg 103  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23935650 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatggtaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttg 23935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 29622142 - 29622105
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgt 38  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29622142 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16243165 - 16243106
Alignment:
Q  75 tgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgatt 134  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  16243165 tgttttatcttttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctaaatgaatatttcattgatt 16243106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167023
Alignment:
Q  73 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatga 25167023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 25147698 - 25147776
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 120  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  25147698 tttgaatggtgtccaattaacacaatgccaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttgttaaaatacctaaatga 25147776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8580223 - 8580023
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580223 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 8580124  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580123 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 8580025  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  8580024 tg 8580023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17658677 - 17658874
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17658677 gaatgtagttgtggcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgt 17658776  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658777 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 17658874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19228390 - 19228193
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228390 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 19228291  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19228290 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 19228193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42537504 - 42537701
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537504 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 42537603  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537604 ttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 42537701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 28876999 - 28877198
Alignment:
Q  2 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 101  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28876999 aatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 28877098  T
Q  102 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 201  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877099 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttag-tttggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 28877197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38968452 - 38968650
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968452 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 38968551  T
Q  100 tttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968552 tttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 38968650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 7757679 - 7757876
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7757679 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgt 7757778  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7757779 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaattatagtttggttaagtgtat 7757876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8701942 - 8701745
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701942 gaatgtagtagttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 8701843  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8701842 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtat 8701745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28241517 - 28241317
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241517 gaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 28241418  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28241417 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 28241319  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  28241318 tg 28241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42942204 - 42942008
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942204 gaatgtagttgttgcctatgctgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 42942105  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42942104 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtat 42942008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 512490 - 512293
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  512490 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgt 512391  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  512390 ttgatcaaatacctcaatgaaaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtat 512293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14264
Alignment:
Q  2 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14406 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 14307  T
Q  102 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttag 14264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197490
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40624601 - 40624468
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  40624601 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccttaataacaattttattg 40624502  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgatat 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  40624501 attatttagttagtttagattatgaaaattatat 40624468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040685
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19040704 attatttagttagtttaggt 19040685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 160
Target Start/End: Original strand, 20422335 - 20422463
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  20422335 ataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgacaattattttg 20422434  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaat 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20422435 attatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673228
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  132 attatttagttag 144  Q
    |||||||||||||    
T  27673240 attatttagttag 27673228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705641
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30705622 attatttagttagtttaggt 30705641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21022606 - 21022410
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022606 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 21022507  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022506 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 21022410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 51683557 - 51683754
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683557 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 51683656  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683657 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 51683754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37021801 - 37021604
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37021801 gaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgt 37021702  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021701 ttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 37021604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50275089 - 50275286
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50275089 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgt 50275188  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50275189 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtat 50275286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30726459 - 30726259
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726459 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 30726360  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30726359 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatactttggttaagtttattt 30726261  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  30726260 tg 30726259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40357998 - 40357798
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40357998 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgt 40357899  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357898 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 40357800  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  40357799 tg 40357798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48256289 - 48256092
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256289 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 48256190  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256189 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 48256092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1089302 - 1089102
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089302 gaatgtagatgttgcatatgtagtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 1089203  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1089202 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 1089104  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  1089103 tg 1089102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 55407505 - 55407308
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55407505 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgt 55407406  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55407405 ttgatcgaatgcctcattgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttcgttaagtgtat 55407308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1308832 - 1308632
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308832 gaatgtagatgttgcatatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 1308733  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1308732 tcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 1308634  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  1308633 tg 1308632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50901835 - 50902031
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50901835 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgt 50901934  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50901935 ttgataaaatgtttcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50902031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 67947 - 68100
Alignment:
Q  2 aatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67947 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtt 68046  T
Q  102 tgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg 155  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68047 tgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatg 68100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 46436599 - 46436753
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436599 gaatgtagttgttgcttatgctgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 46436698  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatg 155  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46436699 ttgatcaaatgcctcaatggcaattttattgattatttagttagtttaggttatg 46436753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050044
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtat 11050044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21538139 - 21538008
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21538139 ataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 21538040  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21538039 attatttagttagtttaggttatggaaatgat 21538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023099
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 14315772 - 14315925
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14315772 aatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgat 14315871  T
Q  134 tatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14315872 tattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttg 14315925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10753114 - 10752983
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753114 ataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 10753015  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10753014 attatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10966883 - 10966752
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966883 ataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattg 10966784  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10966783 attatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030217
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798570
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  132 attatttagttag 144  Q
    |||||||||||||    
T  41798582 attatttagttag 41798570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892836
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  9892855 attatttagttagtttaggt 9892836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Original strand, 14297523 - 14297652
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  14297523 aatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtattgat 14297622  T
Q  134 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14297623 tattgagttagtttaggttatggaaatgat 14297652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41933308 - 41933179
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  41933308 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgat 41933209  T
Q  134 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  41933208 tattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184473
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3184442 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185440
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3185471 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3185440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185648
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
     |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3185679 tttatttagttagtttgggttatggatatgat 3185648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181358
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6181377 attatttagttagtttaggt 6181358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090925
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49090906 attatttagttagtttaggt 49090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165538
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  49165519 attatttagttagtttaggt 49165538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704532
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 141  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  142 tagcttaggttatg 155  Q
    ||| ||||||||||    
T  30704519 tagtttaggttatg 30704532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679631
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  44679662 attatttagttagtttaggttatagatatgat 44679631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11083691 - 11083562
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| || ||||    
T  11083691 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgtactgat 11083592  T
Q  134 tatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11083591 tattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422203
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-ataaaatgcctcaatgataattttatt 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  131 gattatttagttagcttaggt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttaggt 31422203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 152
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193985
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttatt 130  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  131 gattatttagttagcttaggtt 152  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttaggtt 50193985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4720055 - 4719953
Alignment:
Q  42 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagt 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |    
T  4720055 tttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttact 4719956  T
Q  142 tag 144  Q
    |||    
T  4719955 tag 4719953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6320281 - 6320084
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6320281 gaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgt 6320182  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320181 ttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 6320084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31769060 - 31769257
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769060 gaatgtagttgttgcttatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 31769159  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769160 ttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 31769257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24088500 - 24088303
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24088500 gaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgt 24088401  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 198  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  24088400 ttgatcaaatgtctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtat 24088303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722445
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601102
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  132 attatttagttag 144  Q
    |||||||||||||    
T  21601090 attatttagttag 21601102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501686
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423514
Alignment:
Q  33 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattga 132  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  133 ttatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  26423484 ttatttagttagtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201653
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6201634 attatttagttagtttaggt 6201653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688620
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  11688601 attatttagttagtttaggt 11688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301685
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  22301666 attatttagttagtttaggt 22301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829220
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30829239 attatttagttagtttaggt 30829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617220
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  132 attatttagttagcttaggt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  27617201 attatttagttagtttaggt 27617220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 187
Target Start/End: Original strand, 3381182 - 3381313
Alignment:
Q  44 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagtta 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||| |||    
T  3381182 tgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaa------------tgattatttaatta 3381269  T
Q  144 gcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttg 187  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3381270 gtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttg 3381313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 246
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  446 gaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgt 347  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattaattatttagttagttta-gttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 248  T
Q  201 tg 202  Q
    ||    
T  247 tg 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 7773 - 7925
Alignment:
Q  1 gaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7773 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtat 7872  T
Q  101 ttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggtta 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7873 ttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattttttagttagtttaggtta 7925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18489
Alignment:
Q  33 taatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  133 ttatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 155
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10863
Alignment:
Q  53 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagcttaggtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttaggtt 10860  T
Q  153 atg 155  Q
    |||    
T  10861 atg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4210
Alignment:
Q  32 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattg 131  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  132 attatttagttagcttaggttatggaaatgat 163  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  4241 attattgagttagtttagggtatgaaaatgat 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 120
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  72 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 251161 - 251051
Alignment:
Q  34 aatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgat 133  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| |||||||   ||||| ||||  ||||||    
T  251161 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatgctcaaatgaaaattgcattgat 251062  T
Q  134 tatttagttag 144  Q
    |||||| ||||    
T  251061 tatttacttag 251051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University