View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6997_low_3 (Length: 668)

Name: NF6997_low_3
Description: NF6997
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6997_low_3
NF6997_low_3
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (151-660)||(6311097-6311613)
chr8 (154-658)||(30655448-30655959)
chr8 (154-658)||(36979184-36979689)
chr8 (154-658)||(18870345-18870849)
chr8 (154-659)||(4759857-4760366)
chr8 (154-658)||(18852951-18853457)
chr8 (190-658)||(33037592-33038063)
chr8 (145-658)||(10688924-10689442)
chr8 (153-526)||(7289831-7290211)
chr8 (175-526)||(25328184-25328540)
chr8 (154-658)||(1261741-1262238)
chr8 (175-521)||(39784734-39785086)
chr8 (8-154)||(38613611-38613757)
chr8 (314-639)||(31071035-31071362)
chr8 (314-641)||(26287866-26288183)
chr8 (314-641)||(26301123-26301440)
chr8 (314-641)||(26313117-26313434)
chr8 (175-521)||(35745213-35745566)
chr8 (175-471)||(10684224-10684528)
chr8 (579-660)||(7289750-7289831)
chr8 (579-658)||(25327979-25328058)
chr8 (579-658)||(25328105-25328184)
chr8 (349-432)||(26403240-26403327)
chr8 (315-641)||(7412305-7412629)
chr8 (349-641)||(4456028-4456317)
chr8 (349-641)||(19175562-19175851)
chr8 (349-432)||(23799587-23799674)
chr8 (580-643)||(39784665-39784728)
chr8 (573-641)||(4696416-4696482)
chr8 (349-429)||(4696609-4696693)
chr8 (352-432)||(6127224-6127308)
chr8 (351-410)||(9765852-9765914)
chr8 (573-641)||(5702288-5702354)
chr8 (349-429)||(19752407-19752491)
chr8 (349-432)||(5702493-5702580)
chr8 (573-638)||(9054231-9054294)
chr8 (580-630)||(10684116-10684168)
chr8 (573-641)||(19752202-19752268)
chr8 (577-641)||(23799384-23799446)
chr8 (580-630)||(35745572-35745624)
chr8 (152-228)||(19752609-19752683)
chr8 (573-641)||(26403035-26403103)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (171-658)||(30631227-30631719)
chr5 (273-658)||(31180138-31180526)
chr5 (153-526)||(1457067-1457446)
chr5 (154-526)||(43592080-43592459)
chr5 (154-526)||(27444771-27445150)
chr5 (154-526)||(27449615-27449994)
chr5 (154-526)||(43598525-43598904)
chr5 (154-526)||(43604017-43604396)
chr5 (154-526)||(43609509-43609888)
chr5 (175-526)||(15044512-15044865)
chr5 (154-658)||(24135659-24136159)
chr5 (175-521)||(28807485-28807837)
chr5 (154-658)||(38219208-38219708)
chr5 (311-658)||(35387624-35387972)
chr5 (175-521)||(37556533-37556887)
chr5 (175-521)||(37561355-37561709)
chr5 (154-542)||(38191983-38192369)
chr5 (175-521)||(2785197-2785550)
chr5 (175-471)||(31396953-31397256)
chr5 (175-471)||(31401810-31402113)
chr5 (193-521)||(33791158-33791491)
chr5 (579-660)||(1456986-1457067)
chr5 (579-660)||(27445150-27445231)
chr5 (579-660)||(27449994-27450075)
chr5 (579-660)||(43592459-43592540)
chr5 (579-660)||(43598904-43598985)
chr5 (579-660)||(43604396-43604477)
chr5 (579-660)||(43609888-43609969)
chr5 (193-466)||(33768021-33768299)
chr5 (579-660)||(15044865-15044947)
chr5 (349-641)||(15464532-15464823)
chr5 (349-659)||(36932138-36932447)
chr5 (349-430)||(9353344-9353429)
chr5 (349-641)||(14520230-14520519)
chr5 (349-432)||(10281751-10281838)
chr5 (154-219)||(31180079-31180142)
chr5 (349-432)||(19588746-19588833)
chr5 (350-432)||(11916982-11917068)
chr5 (573-658)||(24553318-24553401)
chr5 (580-630)||(28807429-28807479)
chr5 (349-432)||(3880299-3880386)
chr5 (349-432)||(17003970-17004057)
chr5 (574-640)||(11181641-11181705)
chr5 (352-430)||(12084187-12084269)
chr5 (573-639)||(28832480-28832544)
chr5 (573-641)||(9353140-9353206)
chr5 (573-641)||(11916780-11916846)
chr5 (349-429)||(28832259-28832343)
chr5 (573-640)||(31300404-31300469)
chr5 (154-210)||(35387474-35387527)
chr5 (580-630)||(2785556-2785608)
chr5 (581-641)||(7160712-7160770)
chr5 (573-641)||(17003767-17003833)
chr5 (573-641)||(19588968-19589034)
chr5 (580-630)||(31396843-31396895)
chr5 (580-630)||(31401700-31401752)
chr5 (580-630)||(33768365-33768417)
chr5 (580-630)||(33791497-33791549)
chr5 (349-429)||(42127423-42127507)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (152-658)||(7167049-7167558)
chr3 (154-658)||(28503647-28504145)
chr3 (154-658)||(2671370-2671876)
chr3 (154-659)||(8738846-8739354)
chr3 (154-658)||(9091085-9091592)
chr3 (153-655)||(8477170-8477674)
chr3 (311-658)||(40372580-40372929)
chr3 (175-526)||(22173100-22173456)
chr3 (390-658)||(28501480-28501750)
chr3 (175-511)||(18656256-18656598)
chr3 (314-639)||(1305914-1306239)
chr3 (315-641)||(26928396-26928721)
chr3 (175-525)||(2676993-2677351)
chr3 (175-525)||(2672837-2673195)
chr3 (315-658)||(32143287-32143629)
chr3 (175-471)||(8512037-8512342)
chr3 (175-471)||(8516917-8517222)
chr3 (201-525)||(24967957-24968286)
chr3 (579-660)||(22173019-22173100)
chr3 (175-471)||(32475306-32475608)
chr3 (315-616)||(27452924-27453224)
chr3 (175-395)||(10207755-10207981)
chr3 (175-471)||(32480163-32480466)
chr3 (315-658)||(27986236-27986567)
chr3 (154-257)||(40372986-40373085)
chr3 (349-641)||(27974749-27975039)
chr3 (349-430)||(8370488-8370573)
chr3 (349-432)||(18552883-18552970)
chr3 (350-432)||(36029094-36029180)
chr3 (349-641)||(16264350-16264638)
chr3 (349-430)||(21711223-21711308)
chr3 (481-641)||(33386472-33386628)
chr3 (352-432)||(1736305-1736389)
chr3 (349-429)||(33386669-33386753)
chr3 (314-373)||(1309819-1309878)
chr3 (349-432)||(3716002-3716089)
chr3 (349-432)||(30709790-30709877)
chr3 (349-432)||(40592782-40592869)
chr3 (580-643)||(18656614-18656677)
chr3 (573-641)||(4386774-4386840)
chr3 (573-641)||(36029316-36029382)
chr3 (573-641)||(40592579-40592645)
chr3 (349-432)||(48438214-48438301)
chr3 (349-430)||(6794715-6794800)
chr3 (349-432)||(40844652-40844738)
chr3 (573-638)||(47923704-47923767)
chr3 (349-429)||(1417493-1417577)
chr3 (573-641)||(1736101-1736167)
chr3 (573-641)||(3323488-3323554)
chr3 (573-641)||(3328154-3328220)
chr3 (573-641)||(8370286-8370352)
chr3 (573-641)||(21711445-21711511)
chr3 (573-641)||(24694963-24695029)
chr3 (573-641)||(26299211-26299277)
chr3 (349-432)||(25795781-25795868)
chr3 (349-432)||(26298988-26299075)
chr3 (349-432)||(47923906-47923993)
chr3 (573-639)||(8126853-8126917)
chr3 (579-641)||(23392106-23392166)
chr3 (580-630)||(2672783-2672835)
chr3 (580-630)||(2676939-2676991)
chr3 (349-429)||(3328359-3328443)
chr3 (573-641)||(6794512-6794578)
chr3 (580-630)||(8512398-8512450)
chr3 (580-630)||(8517278-8517330)
chr3 (573-614)||(10274605-10274646)
chr3 (580-630)||(24968288-24968340)
chr3 (573-641)||(35925701-35925767)
chr3 (349-429)||(37466291-37466375)
chr3 (573-641)||(39032352-39032417)
chr3 (582-641)||(23410529-23410586)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (154-658)||(24741748-24742253)
chr4 (154-658)||(29760449-29760954)
chr4 (153-526)||(51520257-51520637)
chr4 (175-526)||(9224312-9224668)
chr4 (175-526)||(9229099-9229455)
chr4 (175-526)||(3813846-3814202)
chr4 (153-466)||(56146677-56146996)
chr4 (175-525)||(45357203-45357558)
chr4 (175-521)||(18855549-18855900)
chr4 (175-525)||(45347723-45348079)
chr4 (175-511)||(5732486-5732828)
chr4 (314-658)||(28468325-28468660)
chr4 (315-658)||(31985424-31985764)
chr4 (579-657)||(51520637-51520715)
chr4 (579-660)||(18712590-18712671)
chr4 (579-660)||(9224231-9224312)
chr4 (579-660)||(9229018-9229099)
chr4 (579-658)||(3814202-3814281)
chr4 (349-641)||(16623101-16623390)
chr4 (349-641)||(5396479-5396768)
chr4 (349-432)||(10047379-10047466)
chr4 (349-432)||(39245994-39246081)
chr4 (580-643)||(45347658-45347721)
chr4 (349-430)||(36315241-36315326)
chr4 (349-430)||(36329450-36329535)
chr4 (349-432)||(38152449-38152536)
chr4 (580-643)||(5732844-5732907)
chr4 (354-432)||(6743425-6743507)
chr4 (500-641)||(16628680-16628815)
chr4 (573-638)||(5112460-5112523)
chr4 (350-431)||(5143260-5143345)
chr4 (573-641)||(3777772-3777838)
chr4 (349-429)||(5269204-5269288)
chr4 (349-432)||(3796529-3796616)
chr4 (580-643)||(45357138-45357201)
chr4 (350-431)||(5147678-5147763)
chr4 (580-630)||(18855906-18855956)
chr4 (350-430)||(3777550-3777634)
chr4 (573-641)||(5269008-5269074)
chr4 (573-641)||(10047604-10047670)
chr4 (573-641)||(25861841-25861907)
chr4 (573-641)||(36315038-36315104)
chr4 (573-641)||(36329247-36329313)
chr4 (353-432)||(16630690-16630773)
chr4 (349-432)||(24333809-24333896)
chr4 (573-638)||(6743226-6743289)
chr4 (349-431)||(54867184-54867269)
chr4 (574-641)||(38152246-38152311)
chr4 (573-640)||(42599383-42599448)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (152-658)||(11098711-11099219)
chr2 (154-658)||(14291295-14291801)
chr2 (154-658)||(9296186-9296691)
chr2 (175-492)||(44312563-44312885)
chr2 (175-525)||(32246607-32246966)
chr2 (175-526)||(39811894-39812250)
chr2 (314-641)||(3491716-3492043)
chr2 (154-562)||(25398305-25398711)
chr2 (154-562)||(25403443-25403849)
chr2 (175-521)||(19344243-19344596)
chr2 (175-521)||(19349101-19349454)
chr2 (315-658)||(40738810-40739140)
chr2 (387-562)||(25407663-25407838)
chr2 (579-660)||(39811812-39811894)
chr2 (349-432)||(21629944-21630030)
chr2 (349-432)||(8040060-8040147)
chr2 (573-641)||(25409854-25409922)
chr2 (352-432)||(13569331-13569415)
chr2 (349-430)||(28259189-28259274)
chr2 (349-433)||(20522220-20522308)
chr2 (349-641)||(36757570-36757859)
chr2 (349-432)||(10445454-10445541)
chr2 (349-432)||(17865203-17865290)
chr2 (349-432)||(34682344-34682431)
chr2 (580-643)||(32246968-32247031)
chr2 (350-432)||(34388859-34388945)
chr2 (573-641)||(39483156-39483222)
chr2 (349-432)||(14699018-14699104)
chr2 (481-642)||(23078278-23078433)
chr2 (349-432)||(31056044-31056131)
chr2 (349-432)||(33528631-33528718)
chr2 (350-432)||(10707262-10707348)
chr2 (573-639)||(21630168-21630232)
chr2 (573-641)||(41586358-41586425)
chr2 (352-432)||(8390160-8390244)
chr2 (573-641)||(14698817-14698883)
chr2 (573-641)||(17865428-17865494)
chr2 (573-641)||(20522445-20522511)
chr2 (573-641)||(33118358-33118424)
chr2 (573-641)||(33528432-33528498)
chr2 (573-641)||(34389074-34389140)
chr2 (349-427)||(42039684-42039766)
chr2 (573-641)||(10445275-10445341)
chr2 (573-641)||(28258985-28259051)
chr2 (573-640)||(2869501-2869566)
chr2 (579-642)||(29867780-29867840)
chr2 (573-641)||(31056266-31056334)
chr2 (349-432)||(39482931-39483018)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (154-658)||(20357331-20357837)
chr7 (152-658)||(2057763-2058281)
chr7 (154-658)||(1533228-1533730)
chr7 (175-526)||(24024232-24024589)
chr7 (175-527)||(12406155-12406512)
chr7 (175-526)||(12396735-12397091)
chr7 (175-526)||(31109489-31109844)
chr7 (175-521)||(19992135-19992487)
chr7 (175-435)||(4866553-4866819)
chr7 (311-658)||(21639770-21640118)
chr7 (154-641)||(21645818-21646299)
chr7 (175-521)||(21812149-21812501)
chr7 (314-658)||(18413606-18413948)
chr7 (311-658)||(18408726-18409072)
chr7 (175-471)||(24266162-24266466)
chr7 (175-471)||(24261283-24261587)
chr7 (175-471)||(16879894-16880197)
chr7 (175-471)||(16884750-16885053)
chr7 (579-660)||(12397091-12397172)
chr7 (581-658)||(4873310-4873387)
chr7 (579-660)||(31109407-31109489)
chr7 (579-660)||(24024151-24024232)
chr7 (581-653)||(12406513-12406585)
chr7 (349-432)||(29159803-29159890)
chr7 (350-431)||(21983285-21983370)
chr7 (349-432)||(46516320-46516407)
chr7 (349-432)||(49091661-49091748)
chr7 (349-426)||(47263678-47263757)
chr7 (349-432)||(55948-56034)
chr7 (350-431)||(21988909-21988992)
chr7 (349-430)||(44848696-44848781)
chr7 (349-429)||(9190021-9190105)
chr7 (349-429)||(20284089-20284173)
chr7 (573-641)||(20284312-20284378)
chr7 (573-641)||(23402821-23402887)
chr7 (349-430)||(2479337-2479421)
chr7 (349-432)||(2647706-2647793)
chr7 (573-640)||(4796477-4796542)
chr7 (349-432)||(33332460-33332547)
chr7 (573-658)||(2479559-2479642)
chr7 (573-638)||(21989131-21989194)
chr7 (349-429)||(2580390-2580474)
chr7 (573-641)||(2580613-2580678)
chr7 (573-641)||(2647505-2647571)
chr7 (573-641)||(44847933-44847999)
chr7 (573-641)||(46516113-46516179)
chr7 (580-630)||(21812092-21812143)
chr7 (349-430)||(35960816-35960901)
chr7 (154-229)||(2479148-2479221)
chr7 (573-641)||(3047477-3047543)
chr7 (573-641)||(9184982-9185048)
chr7 (349-429)||(9185178-9185262)
chr7 (580-630)||(24266054-24266106)
chr7 (150-229)||(47263485-47263562)
chr7 (573-641)||(47263889-47263955)
chr7 (573-616)||(9189840-9189881)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (190-658)||(24787148-24787624)
chr1 (175-525)||(25444996-25445352)
chr1 (175-526)||(41398060-41398415)
chr1 (175-521)||(39445322-39445673)
chr1 (154-658)||(24202556-24203054)
chr1 (175-521)||(44023785-44024135)
chr1 (175-521)||(1054923-1055274)
chr1 (251-526)||(41390488-41390760)
chr1 (314-658)||(19361220-19361564)
chr1 (314-658)||(19358631-19358975)
chr1 (193-471)||(43988424-43988709)
chr1 (314-601)||(19379916-19380204)
chr1 (475-658)||(19366095-19366276)
chr1 (579-660)||(41398415-41398497)
chr1 (579-660)||(41390760-41390842)
chr1 (175-253)||(41386571-41386650)
chr1 (349-640)||(3281708-3281995)
chr1 (349-432)||(47703946-47704033)
chr1 (349-430)||(26644909-26644994)
chr1 (349-432)||(9476261-9476348)
chr1 (349-432)||(19072928-19073015)
chr1 (349-432)||(19120818-19120905)
chr1 (349-432)||(13598398-13598485)
chr1 (349-432)||(16124526-16124613)
chr1 (349-432)||(27104382-27104469)
chr1 (349-432)||(29651811-29651898)
chr1 (349-430)||(37069770-37069855)
chr1 (349-658)||(13604413-13604720)
chr1 (573-641)||(47098633-47098699)
chr1 (573-641)||(47102647-47102713)
chr1 (349-432)||(775672-775759)
chr1 (580-643)||(1054854-1054917)
chr1 (580-643)||(25439738-25439801)
chr1 (580-643)||(25444931-25444994)
chr1 (580-643)||(39445679-39445742)
chr1 (580-643)||(44023716-44023779)
chr1 (573-641)||(29652036-29652102)
chr1 (349-429)||(47098837-47098921)
chr1 (573-640)||(13598623-13598688)
chr1 (573-640)||(27104211-27104275)
chr1 (451-525)||(25439803-25439877)
chr1 (154-210)||(19359079-19359132)
chr1 (576-641)||(21536378-21536441)
chr1 (349-430)||(21536581-21536666)
chr1 (573-641)||(32889661-32889727)
chr1 (580-630)||(43988314-43988366)
chr1 (573-616)||(16124347-16124388)
chr1 (576-635)||(22819657-22819714)
chr1 (581-640)||(37069998-37070055)
chr1 (573-641)||(40816622-40816690)
chr1 (573-641)||(47703741-47703809)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (154-658)||(5674554-5675057)
chr6 (175-526)||(22010602-22010958)
chr6 (175-526)||(11856795-11857154)
chr6 (175-526)||(14737482-14737838)
chr6 (175-526)||(14742342-14742697)
chr6 (175-526)||(28184325-28184684)
chr6 (175-521)||(6438324-6438674)
chr6 (175-525)||(28155477-28155832)
chr6 (175-521)||(6005239-6005592)
chr6 (175-525)||(16838566-16838923)
chr6 (193-525)||(33330351-33330690)
chr6 (175-525)||(33335848-33336207)
chr6 (579-660)||(11857154-11857235)
chr6 (579-660)||(22010521-22010602)
chr6 (579-658)||(14737403-14737482)
chr6 (579-658)||(14742263-14742342)
chr6 (315-658)||(22708984-22709316)
chr6 (193-386)||(5343322-5343519)
chr6 (154-299)||(30125940-30126084)
chr6 (349-430)||(5757490-5757575)
chr6 (349-427)||(21356036-21356118)
chr6 (579-649)||(28184684-28184757)
chr6 (349-430)||(31086485-31086570)
chr6 (349-432)||(5572251-5572338)
chr6 (349-431)||(4629954-4630040)
chr6 (349-431)||(10077176-10077262)
chr6 (580-643)||(28155412-28155475)
chr6 (349-432)||(22963700-22963786)
chr6 (349-432)||(23824607-23824693)
chr6 (580-643)||(6438680-6438743)
chr6 (573-641)||(5017304-5017370)
chr6 (573-641)||(31936798-31936864)
chr6 (349-432)||(31979513-31979600)
chr6 (349-429)||(5017482-5017566)
chr6 (573-641)||(5572051-5572117)
chr6 (573-641)||(5757286-5757352)
chr6 (580-630)||(6005598-6005650)
chr6 (580-630)||(16838925-16838977)
chr6 (573-641)||(22963922-22963988)
chr6 (573-641)||(23824405-23824471)
chr6 (573-641)||(24435780-24435845)
chr6 (349-410)||(31936587-31936651)
chr6 (573-641)||(31979735-31979801)
chr6 (580-630)||(33330297-33330349)
chr6 (580-630)||(33335794-33335846)
chr6 (573-641)||(21801150-21801218)
chr6 (361-432)||(21801354-21801429)
chr6 (154-229)||(31936398-31936470)
[»] scaffold0355 (5 HSPs)
scaffold0355 (175-526)||(9549-9902)
scaffold0355 (579-660)||(3672-3754)
scaffold0355 (175-323)||(1-143)
scaffold0355 (444-526)||(3754-3836)
scaffold0355 (579-614)||(9514-9549)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (175-526)||(34967-35323)
scaffold0135 (579-660)||(34886-34967)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (175-521)||(185-536)
scaffold0464 (580-643)||(542-605)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (154-658)||(23832-24331)
scaffold0188 (154-658)||(17739-18238)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (175-471)||(148916-149219)
scaffold0028 (580-630)||(148808-148860)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (175-471)||(2211-2514)
scaffold0259 (580-630)||(2103-2155)
[»] scaffold0197 (4 HSPs)
scaffold0197 (175-494)||(19102-19428)
scaffold0197 (175-471)||(14269-14573)
scaffold0197 (580-630)||(14161-14213)
scaffold0197 (581-630)||(19017-19068)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (153-381)||(300-528)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (175-415)||(181980-182228)
scaffold0009 (580-630)||(176829-176881)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (349-658)||(8208-8516)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (175-253)||(34132-34211)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (175-236)||(13171-13233)
[»] scaffold0087 (4 HSPs)
scaffold0087 (349-641)||(36640-36929)
scaffold0087 (349-430)||(43973-44058)
scaffold0087 (573-641)||(43769-43835)
scaffold0087 (154-229)||(44174-44247)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (350-430)||(85684-85768)
scaffold0036 (573-641)||(85906-85972)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (349-432)||(5683-5770)
scaffold0006 (349-658)||(133070-133377)
scaffold0006 (349-432)||(2492-2579)
scaffold0006 (573-640)||(5908-5973)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (349-432)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (349-429)||(45253-45337)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 151 - 660
Target Start/End: Original strand, 6311097 - 6311613
Alignment:
Q  151 ttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311097 ttctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 6311196  T
Q  251 aacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 347  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311197 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 6311296  T
Q  348 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6311297 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaact 6311396  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaagacagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa--gagaagtcactagagga 543  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6311397 ctagccttcaagctttacacaagacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaaaagagaagtcactagagga 6311496  T
Q  544 agctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6311497 agcttttgatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctt 6311596  T
Q  644 tggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||||||||    
T  6311597 tggttccctcctttgct 6311613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655959
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 30655543  T
Q  252 acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa----cacc 345  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  30655544 acaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc 30655643  T
Q  346 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  30655644 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 30655743  T
Q  443 gctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagag 541  Q
     |  ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30655744 acaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 30655842  T
Q  542 gaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655843 gaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 30655942  T
Q  642 attggttccctcctttg 658  Q
     ||||||||||||||||    
T  30655943 tttggttccctcctttg 30655959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 36979184 - 36979689
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  36979184 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 36979280  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36979281 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 36979379  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  36979380 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 36979479  T
Q  448 agctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    |||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36979480 agccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 36979578  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattgg 646  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36979579 tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccctttgg 36979677  T
Q  647 ttccctcctttg 658  Q
    |||||| |||||    
T  36979678 ttcccttctttg 36979689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 18870849 - 18870345
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  18870849 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaac 18870754  T
Q  254 aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaaga 352  Q
    |||||||   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18870753 aacaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaaga 18870655  T
Q  353 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg-ttgcaagaagctcta 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |  ||    
T  18870654 ttgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaata 18870555  T
Q  449 gctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagct 547  Q
    ||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870554 gcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagct 18870456  T
Q  548 ttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggt 647  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18870455 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggt 18870356  T
Q  648 tccctcctttg 658  Q
    |||||||||||    
T  18870355 tccctcctttg 18870345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 154 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 4760366 - 4759857
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  4760366 tgttgtgaatccggttgaaactcacatcaatgaaa--aacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaaca 4760270  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4760269 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacatcaagaa 4760170  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  4760169 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 4760070  T
Q  448 agctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    |||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4760069 agccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 4759971  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgt-ttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4759970 tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttg 4759871  T
Q  646 gttccctcctttgc 659  Q
    ||| ||||||||||    
T  4759870 gttacctcctttgc 4759857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 18853457 - 18852951
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18853457 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaacgaaacaaa----gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaac 18853363  T
Q  254 aacaaaacca---gccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 349  Q
    |||||||  |   |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18853362 aacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 18853264  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg-ttgcaagaagct 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |     
T  18853263 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaaca 18853164  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 544  Q
     ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18853163 atagcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 18853065  T
Q  545 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 644  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18853064 gctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttt 18852965  T
Q  645 ggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||    
T  18852964 ggttccctcctttg 18852951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 190 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037592
Alignment:
Q  190 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa--acaacaa-aaccagccctagactagtgtataacaaa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaa 33037965  T
Q  287 agcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 385  Q
    | ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037964 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 33037866  T
Q  386 tggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagatt 482  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  33037865 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagatt 33037767  T
Q  483 ctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactaccc 582  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33037766 ctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa-gagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactaccc 33037668  T
Q  583 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33037667 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccctttggttccctcctttg 33037592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 145 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 10689442 - 10688924
Alignment:
Q  145 ttttgcttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttc 244  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  10689442 ttttgattgtgttgtgttttcggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttc 10689346  T
Q  245 caagcaa--acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa 341  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10689345 caagcaacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaa 10689247  T
Q  342 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgca 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||    
T  10689246 caccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttaca 10689147  T
Q  439 agaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctt-tggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcac 536  Q
    |||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10689146 agaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacac 10689048  T
Q  537 tagaggaagctttaaatccttcc--aaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacac 634  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10689047 tagaggaagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacac 10688948  T
Q  635 tcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  10688947 tcaaccctttggttccctcctttg 10688924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 153 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7290211 - 7289831
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7290211 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaa 7290112  T
Q  252 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 347  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  7290111 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 7290012  T
Q  348 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7290011 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ct 7289913  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7289912 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25328540 - 25328184
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || || ||||| |    
T  25328540 tcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta-a 25328442  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttca 368  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328441 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttca 25328343  T
Q  369 gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca 466  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  25328342 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacaca 25328245  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25328244 tgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaa 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 1262238 - 1261741
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| ||||| |  ||  || |||||||||      
T  1262238 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaaca 1262144  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | ||||   ||||   |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1262143 acaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaagca--aacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 1262049  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |    
T  1262048 gattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaat 1261950  T
Q  448 agctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1261949 agcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 1261851  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattgg 646  Q
    |||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    |    
T  1261850 tttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagag 1261753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 39785086 - 39784734
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||||||||      
T  39785086 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaag 39784987  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39784986 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 39784888  T
Q  368 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttaca 464  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39784887 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttaca 39784791  T
Q  465 caag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    || | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39784790 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39784734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 38613611 - 38613757
Alignment:
Q  8 catcatcatcatctctggtcccaggtttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613611 catcatcatcttctctggtcccagctttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 38613710  T
Q  108 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatctgctgaattttgcttct 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38613711 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatcagctcgattttgcttct 38613757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 314 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071035
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  410 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 507  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactct 31071165  T
Q  508 cacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 607  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31071164 cacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaa 31071067  T
Q  608 cccaagagacactctcaacaaagacactcaac 639  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071066 cccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 314 - 641
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26288183
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||      | || |     |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaa-----tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtg-ttccccactctc 26288052  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26288053 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaac 26288150  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288151 tcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 314 - 641
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301440
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||      | || |     |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaa-----tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtg-ttccccactctc 26301309  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26301310 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaac 26301407  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301408 tcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 314 - 641
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313434
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||      | || |     |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaa-----tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtg-ttccccactctc 26313303  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26313304 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaac 26313401  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313402 tcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 35745213 - 35745566
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  35745213 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 35745312  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35745313 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 35745409  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||    
T  35745410 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagcttta 35745507  T
Q  463 cacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    |||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  35745508 cacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 35745566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10684528 - 10684224
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  10684528 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 10684429  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10684428 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 10684332  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  10684331 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 10684234  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  10684233 acacaagaca 10684224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 7289831 - 7289750
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289831 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 7289750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 579 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 25328058 - 25327979
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328058 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25327979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 579 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 25328184 - 25328105
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328184 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 641
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412629
Alignment:
Q  315 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 409  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  410 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 507  Q
    | ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||    || ||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| ||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aataacttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactct 7412500  T
Q  508 cacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccca 606  Q
    | |||  |||||||||  |||||||| ||  | ||||||||||  |||||| |||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  7412501 ctcaataatgaaccct--aagagaagacataaaaggaagcttttgatcctttcaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttccca 7412594  T
Q  607 acccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412595 acccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456317
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 4456125  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||  |||||||| || ||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  4456126 aatagctggcaagc-ttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaagg 4456222  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||| ||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  4456223 aagcttttgatccttctaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacagagacactcaaccc 4456317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175562
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 19175753  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      ||||   ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||| | || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||    
T  19175752 aatagcctgcaagc-ttacacaagaacaagacctaacttctacacatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagg 19175657  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    || ||||  ||||||||||  | |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19175656 aaacttttgatccttccaa-tagtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19175562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799587
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23799587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 39784728 - 39784665
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784728 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 4696482 - 4696416
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4696482 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 4696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127308
Alignment:
Q  352 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  351 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5702354 - 5702288
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5702354 ctcactacccaaggtgtttacaatattt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5702288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702493
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaag 5702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 9054294 - 9054231
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 638  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||    
T  9054294 ctcactacccaaggtgattataatgtttt--ccaacccaagagaatctcactacaaaaacactcaa 9054231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 10684168 - 10684116
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  10684168 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 19752268 - 19752202
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19752268 ctcactacccaaggtgtttacaatattt--cacaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 19752202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23799446 - 23799384
Alignment:
Q  577 ctacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23799446 ctactcaaggtgtttacaatgttc--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23799384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 35745572 - 35745624
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  35745572 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19752683 - 19752609
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaat 228  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  19752683 tctgttgtgaatccggtaaaaa-tcacaccaatgaaa-aaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaat 19752609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 26403103 - 26403035
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc--caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26403103 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 26403035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 658
Target Start/End: Original strand, 30631227 - 30631719
Alignment:
Q  171 aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa--acaacaaaaccagccct 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  30631227 aaactcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaacaacaacaaaac-agccct 30631325  T
Q  269 agactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttc 367  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30631326 agactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  368 agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacac 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacac 30631525  T
Q  466 aaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaacca 564  Q
    | || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30631526 atgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa-gagaagtcactagaggaagctttagatccttccaacta 30631624  T
Q  565 atgaactcctc-actacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631625 atgaactcctccactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 30631719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 273 - 658
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180526
Alignment:
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 371  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  372 aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga 469  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaaga 31180337  T
Q  470 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaa 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31180338 caaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaa 31180437  T
Q  570 ctcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31180438 ctcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 31180526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 153 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1457446 - 1457067
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1457446 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 1457347  T
Q  252 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1457346 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaagaacaaaacaccgag 1457247  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1457246 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 1457148  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1457147 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592459
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaagtcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa 43592179  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43592180 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43592279  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43592280 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 43592378  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43592379 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 27444771 - 27445150
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27444771 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27444870  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27444871 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27444970  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27444971 aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 27445069  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  27445070 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449994
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27449714  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  27449715 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 27449814  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27449815 aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 27449913  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  27449914 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598904
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43598624  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43598625 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43598724  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43598725 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 43598823  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43598824 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604396
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43604116  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43604117 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43604216  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43604217 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 43604315  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43604316 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609888
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43609608  T
Q  253 caaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  43609609 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag 43609708  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43609709 aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctc 43609807  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43609808 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 15044512 - 15044865
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  || |||||||||||    
T  15044512 tcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagac 15044609  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15044610 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagc 15044708  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  15044709 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatg 15044806  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15044807 aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 24135659 - 24136159
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| | | |  || |||||||||||    
T  24135659 tgttgtgaatccggataaaactcacaccaatgaaa---ataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaaga--gtctccaagcaaac 24135753  T
Q  254 aacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| | ||| | ||||  |  |  ||  |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  24135754 aacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacaagataa--tacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaaga 24135849  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| |||| ||||||        
T  24135850 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa- 24135948  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24135949 tagcttgcaagctt-acacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 24136047  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24136048 ctttagatccttccaatgg-tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttg 24136146  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  24136147 gttccctcctttg 24136159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28807837 - 28807485
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  28807837 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 28807738  T
Q  273 tagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    ||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807737 tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 28807638  T
Q  368 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacac 465  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28807637 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacac 28807541  T
Q  466 aag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  28807540 atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 28807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 38219208 - 38219708
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  38219208 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 38219302  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  38219303 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 38219399  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  38219400 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 38219498  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38219499 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 38219597  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||        
T  38219598 ctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaga 38219695  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  38219696 gttccctcctttg 38219708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 311 - 658
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387972
Alignment:
Q  311 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  408 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccact 505  Q
    | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| | |   ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 35387821  T
Q  506 ctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccc 605  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35387822 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagttttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgttttttcc 35387919  T
Q  606 aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  35387920 aacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 35387972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 37556887 - 37556533
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||   |    
T  37556887 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37556788  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556787 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 37556688  T
Q  368 agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttaca 464  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  37556687 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttaca 37556590  T
Q  465 caag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    || | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37556589 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 37561709 - 37561355
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||   |    
T  37561709 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatg 37561610  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37561609 acttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 37561510  T
Q  368 agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttaca 464  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  37561509 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttaca 37561412  T
Q  465 caag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    || | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37561411 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37561355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 542
Target Start/End: Original strand, 38191983 - 38192369
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  38191983 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 38192077  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  38192078 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 38192174  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  38192175 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 38192273  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38192274 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagagg 38192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 2785197 - 2785550
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2785197 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2785296  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2785297 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 2785393  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||    
T  2785394 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagcttta 2785491  T
Q  463 cacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    | || | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  2785492 ctcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 2785550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31397256 - 31396953
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || || ||  ||    
T  31397256 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaag 31397157  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa---acaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31397156 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 31397060  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31397059 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 31396962  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  31396961 cacaagaca 31396953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31402113 - 31401810
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  31402113 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 31402014  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31402013 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 31401917  T
Q  367 cagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31401916 cagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 31401819  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  31401818 cacaagaca 31401810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 521
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791491
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33791257  T
Q  291 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 386  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33791258 catatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 33791354  T
Q  387 --gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagat 481  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  33791355 gggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga- 33791451  T
Q  482 tctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  33791452 cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 33791491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 1457067 - 1456986
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457067 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 1456986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 27445150 - 27445231
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445150 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 27445231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 27449994 - 27450075
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449994 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 27450075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 43592459 - 43592540
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592459 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43592540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 43598904 - 43598985
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598904 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43598985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 43604396 - 43604477
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604396 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43604477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 43609888 - 43609969
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609888 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 466
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768299
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||   ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33768120  T
Q  291 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 386  Q
    || | ||||||||||||||||  || ||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33768121 catatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 33768217  T
Q  387 --gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  33768218 gggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacaca 33768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 15044865 - 15044947
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044865 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 15044947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464823
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 15464630  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  15464631 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagg 15464728  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  15464729 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacgatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 15464823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932138
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 36932349  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  |||| |||||| ||| |||   | ||  |||||||| || |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  36932348 aatagcttgcaag-tttacataagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaacagaagacacaagagg 36932251  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||   || | | |||||||||||||||     
T  36932250 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcatcactataaagacactcaaccct 36932155  T
Q  643 ttggttccctcctttgc 659  Q
       ||||||||||||||    
T  36932154 aaagttccctcctttgc 36932138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353344
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520519
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 14520327  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || ||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  14520328 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaattatgaaccct-aaagagaagacacaaaagg 14520424  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| | ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  14520425 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 14520519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281838
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 31180079 - 31180142
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtg 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31180079 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--taacaatgatgtgtggagcaagagatagtg 31180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588833
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 19588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916982
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 11916982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24553401 - 24553318
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  24553401 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacccttaagttacctcctttg 24553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 28807479 - 28807429
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28807479 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880386
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 574 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 11181705 - 11181641
Alignment:
Q  574 tcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  11181705 tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 11181641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084187
Alignment:
Q  352 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 12084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 639
Target Start/End: Original strand, 28832480 - 28832544
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 639  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  28832480 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaac 28832544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 9353206 - 9353140
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  9353206 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccc 9353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 11916846 - 11916780
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||    
T  11916846 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccc 11916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 31300469 - 31300404
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  31300469 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 31300404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387527
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 35387527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 2785556 - 2785608
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2785556 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 7160770 - 7160712
Alignment:
Q  581 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  7160770 ccaaggtgattacaatgttt--cccaatccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 7160712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 17003833 - 17003767
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  17003833 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttccaaacccaagagaacctcactacaaagacattcaaccc 17003767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 19588968 - 19589034
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19588968 ctcactgcccaagatgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19589034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31396895 - 31396843
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31396895 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31401752 - 31401700
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31401752 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 33768365 - 33768417
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33768365 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 33791497 - 33791549
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33791497 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 658
Target Start/End: Original strand, 7167049 - 7167558
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7167049 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa 7167145  T
Q  252 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7167146 caacaacaaaac-agccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 7167244  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |     
T  7167245 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 7167344  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 544  Q
     ||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167345 atagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 7167443  T
Q  545 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-tttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7167444 gctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctt 7167543  T
Q  644 tggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||    
T  7167544 tggttccctcctttg 7167558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 28504145 - 28503647
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  28504145 tgttgtgaatccggtcttaactcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaaca 28504049  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 350  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  28504048 acaacaaaac-agcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aaggaagaacaaaacaccgagaa 28503959  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctcta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28503958 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactcta 28503859  T
Q  449 gctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagct 547  Q
    ||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503858 gccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagct 28503759  T
Q  548 ttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attgg 646  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28503758 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttgg 28503659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671370
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaac 2671781  T
Q  254 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 349  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2671780 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 2671682  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |      
T  2671681 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 2671582  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||| |  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2671581 tagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 2671483  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2671482 ctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttg 2671383  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  2671382 gttccctcctttg 2671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 154 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 8739354 - 8738846
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 252  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  8739354 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 8739259  T
Q  253 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8739258 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 8739160  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |     
T  8739159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 8739060  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 544  Q
     ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8739059 atagccttcaagctt-acacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaa 8738961  T
Q  545 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 644  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8738960 gctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccatt 8738861  T
Q  645 ggttccctcctttgc 659  Q
    |||||||||||||||    
T  8738860 ggttccctcctttgc 8738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 9091592 - 9091085
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa- 252  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  9091592 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 9091497  T
Q  253 --caacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
      |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9091496 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 9091398  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |     
T  9091397 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 9091298  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 544  Q
     ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9091297 atagccttcaagctt-acacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaa 9091199  T
Q  545 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 644  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9091198 gctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccttt 9091099  T
Q  645 ggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||    
T  9091098 ggttccctcctttg 9091085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 153 - 655
Target Start/End: Original strand, 8477170 - 8477674
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggt-tgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||    
T  8477170 ctgttgtgaatccggtataaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa-gtttcccaagcaa 8477265  T
Q  252 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgag 348  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |  ||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  8477266 caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccacaaagataa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaag 8477362  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |     
T  8477363 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 8477462  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaagacagac--cctagattctaccctttggtgtttcccc-actctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
     |||||  ||||||| |||||| | | |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8477463 atagcttgcaagctt-acacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 8477561  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8477562 aagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccct 8477661  T
Q  643 ttggttccctcct 655  Q
    |||||||||||||    
T  8477662 ttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 311 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372580
Alignment:
Q  311 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  409 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactc 506  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa-tagcttgcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactc 40372732  T
Q  507 tcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccca 606  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372731 tcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccca 40372632  T
Q  607 acccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40372631 acccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 40372580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22173456 - 22173100
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  22173456 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 22173357  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173356 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 22173258  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  22173257 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 22173159  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  22173158 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaa 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 390 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501480
Alignment:
Q  390 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  489 tttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtg 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtg 28501551  T
Q  589 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  28501550 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcctttg 28501480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 175 - 511
Target Start/End: Original strand, 18656256 - 18656598
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  |    
T  18656256 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 18656354  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||    
T  18656355 tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 18656452  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttac 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||    
T  18656453 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcattcaagctttac 18656550  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 511  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18656551 acatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 18656598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 314 - 639
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306239
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     || || |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1306013 ctacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctc 1306110  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1306111 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaac 1306208  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaac 639  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306209 ccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928396
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaa 411  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  412 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctca 509  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 26928524  T
Q  510 caagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 609  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    |||| | |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26928523 caatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacc 26928428  T
Q  610 caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26928427 caagagatcctcactacaaagacactcaaccc 26928396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2677351 - 2676993
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2677351 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2677252  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2677251 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagtt 2677154  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2677153 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 2677056  T
Q  463 cacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  2677055 cacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 2676993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2673195 - 2672837
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2673195 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2673096  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2673095 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagtt 2672998  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2672997 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 2672900  T
Q  463 cacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| ||||    
T  2672899 cacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaa 2672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 315 - 658
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143629
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32143386 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 32143483  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  32143484 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaac 32143579  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||   || | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  32143580 ccaagagatcatcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 32143629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 8512037 - 8512342
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  8512037 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 8512136  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
     ||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8512137 cctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 8512234  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  8512235 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 8512332  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  8512333 acacaagaca 8512342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 8516917 - 8517222
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  8516917 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 8517016  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
     ||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8517017 cctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 8517114  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  8517115 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 8517212  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  8517213 acacaagaca 8517222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 525
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968286
Alignment:
Q  201 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaaga 298  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  299 gctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggaga 392  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  24968057 gctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggaga 24968153  T
Q  393 gagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccct 489  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||    
T  24968154 gagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccct 24968250  T
Q  490 ttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    |||||  || ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  24968251 ttggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaa 24968286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 22173100 - 22173019
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22173100 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctactttgct 22173019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 32475306 - 32475608
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||| | || ||||||  || |||||  |    
T  32475306 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaa 32475405  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32475406 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 32475502  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  32475503 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 32475599  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  32475600 cacaagaca 32475608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 616
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453224
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 410  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctc 27453120  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||    
T  27453121 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaac 27453216  T
Q  609 ccaagaga 616  Q
    ||||||||    
T  27453217 ccaagaga 27453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 395
Target Start/End: Original strand, 10207755 - 10207981
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||  ||| |||||  ||    
T  10207755 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 10207854  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10207855 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgacccagtt 10207952  T
Q  367 cagccaatatggcctaatctgggagagag 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10207953 cagccaatgtggcctaatctgggggagag 10207981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 32480163 - 32480466
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa--caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagccct 268  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||| | || ||||||  || |||||      
T  32480163 tcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagccta 32480262  T
Q  269 agactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 364  Q
    || ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32480263 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccag 32480359  T
Q  365 ttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  32480360 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 32480456  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  32480457 acacaagaca 32480466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986236
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 410  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||      | || ||     ||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| |||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaaa-----agcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctc 27986382  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
     ||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  27986381 tcaatatcaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaac 27986286  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  27986285 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 27986236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40373085 - 40372986
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  40373085 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 40372990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974749
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 27974941  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| |||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  27974940 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccattctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagg 27974844  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  27974843 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccgacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 27974749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370488
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8370488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552883
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 18552883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029180
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagaga--gcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 36029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264638
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 16264449  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
    |  ||||  |||||||  ||||||| ||   ||||  |||||| | || ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||    
T  16264450 t--agcttgcaagcttc-cacaagaacaagacctaatttctacacatttgtgttaccc-actctctcaatgatgaaccctaa--gagaagacacaaaagg 16264543  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  16264544 aagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcattacaaagacactcaaccc 16264638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711308
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21711308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 33386628 - 33386472
Alignment:
Q  481 ttctaccctttggtgtttccccactctcacaaga-tgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcacta 579  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||    |||| || ||||||    
T  33386628 ttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcacta 33386532  T
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  33386531 cccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 33386472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736305
Alignment:
Q  352 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 1736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 373
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716002
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 3716002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709790
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaag 30709790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592782
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaag 40592782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 18656614 - 18656677
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656614 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 4386840 - 4386774
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4386840 ctcactactcaaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 4386774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 36029316 - 36029382
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36029316 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36029382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 40592645 - 40592579
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40592645 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 40592579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438301
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 48438301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794715
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844738
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 40844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 47923767 - 47923704
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  47923767 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagattctcactacaaagacactcaa 47923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1736167 - 1736101
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  1736167 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaatagatcctcactacaaagacactcaaccc 1736101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 3323554 - 3323488
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    
T  3323554 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcactataaagacactcaaccc 3323488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 3328220 - 3328154
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  3328220 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaagctcactacaaagacattcaaccc 3328154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 8370352 - 8370286
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  8370352 ctcactacccaagatgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 8370286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 21711445 - 21711511
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21711445 ctcactactcaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21711511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 24695029 - 24694963
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24695029 ctcaccacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 24694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 26299211 - 26299277
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  26299211 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacattcaaccc 26299277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795868
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaag 25795868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299075
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 26299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923906
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaag 47923906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 639
Target Start/End: Original strand, 8126853 - 8126917
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 639  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  8126853 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaaaacctcactacaaagacactcaac 8126917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 641
Target Start/End: Original strand, 23392106 - 23392166
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23392106 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23392166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2672835 - 2672783
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2672835 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2676991 - 2676939
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2676991 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttca-gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 6794578 - 6794512
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| | |||| ||||||||||||    
T  6794578 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaactcaagagaacctcactacaatgacactcaaccc 6794512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 8512398 - 8512450
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8512398 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 8517278 - 8517330
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8517278 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 614
Target Start/End: Original strand, 10274605 - 10274646
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 614  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  10274605 ctcactacccaaggtgaatataatgtgtttcccaacccaaga 10274646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 24968288 - 24968340
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24968288 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 35925701 - 35925767
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  35925701 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacattcaaccc 35925767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 39032417 - 39032352
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  39032417 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttaccaacccaagaga-tctcactacaaagacactcaaccc 39032352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 582 - 641
Target Start/End: Original strand, 23410529 - 23410586
Alignment:
Q  582 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23410529 caaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23410586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24742253
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||      
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 24741843  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24741844 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 24741942  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  24741943 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 24742042  T
Q  448 agctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    |||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24742043 agccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 24742141  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattgg 646  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24742142 tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttgg 24742241  T
Q  647 ttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||    
T  24742242 ttccctcctttg 24742253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 29760449 - 29760954
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||      
T  29760449 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaaca 29760545  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaa 350  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29760546 acaacaaaacaa-ccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaa 29760643  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  29760644 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 29760743  T
Q  448 agctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||   ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  29760744 agcctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aagagaagacactagaggaag 29760840  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-tttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 644  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29760841 ctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaacccttt 29760940  T
Q  645 ggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||    
T  29760941 ggttccctcctttg 29760954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 153 - 526
Target Start/End: Original strand, 51520257 - 51520637
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51520257 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 51520356  T
Q  252 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 347  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  51520357 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 51520456  T
Q  348 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  51520457 gaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ct 51520555  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  51520556 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9224668 - 9224312
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9224668 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9224569  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224568 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 9224470  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  9224469 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 9224371  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9224370 aacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9229455 - 9229099
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9229455 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9229356  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9229355 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagc 9229257  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  9229256 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 9229158  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9229157 aacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 3813846 - 3814202
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  3813846 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctaga 3813945  T
Q  272 ctagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3813946 ctagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcag 3814045  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||     
T  3814046 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacat 3814143  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3814144 gaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 153 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 56146996 - 56146677
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  56146996 ctgttgtgaatccggttccaaattcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaa 56146897  T
Q  252 acaaca--aaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataag-caagaaaggaagaacaaaacaccga 347  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  56146896 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccga 56146797  T
Q  348 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  56146796 gaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ct 56146698  T
Q  446 ctagctatcaagctttacaca 466  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  56146697 ctagccttcaagctttacaca 56146677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45357558 - 45357203
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||    
T  45357558 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45357459  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357458 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 45357360  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||     
T  45357359 ccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacat 45357262  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45357261 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 18855549 - 18855900
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  18855549 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 18855648  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18855649 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 18855748  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  18855749 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 18855845  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18855846 tgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 18855900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45348079 - 45347723
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||  || ||| |||||||    
T  45348079 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45347980  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347979 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 45347881  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||     
T  45347880 ccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-acctctagccttcaagctttacacat 45347782  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45347781 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 511
Target Start/End: Original strand, 5732486 - 5732828
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||  |    
T  5732486 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 5732584  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| ||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||    
T  5732585 tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagt 5732682  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttac 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  5732683 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttac 5732780  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 511  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5732781 acatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 5732828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 314 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468325
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa-gacagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||      | || ||    ||| |  ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgttacaa------gaaaaaa----tagtttgcaagc-ttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 28468473  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28468472 tcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaac 28468375  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    |||||||||||||    
T  28468374 ccaagagatcctcactacaaagacacttaaccctagagttccctcctttg 28468325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985424
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccac 31985666  T
Q  412 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctca 509  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  31985665 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgttt-cccactctca 31985569  T
Q  510 caagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 609  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||| |    |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  31985568 caatgtgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccca-tggtgaaat-ttcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacc 31985473  T
Q  610 caagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||  |||   ||||| |||||||||||    |||||||||||||    
T  31985472 caagagatcctcaatacaaaaacactcaaccctaaagttccctcctttg 31985424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 579 - 657
Target Start/End: Original strand, 51520637 - 51520715
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctccttt 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520637 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctccttt 51520715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 18712671 - 18712590
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712671 acccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 18712590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 9224312 - 9224231
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224312 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 9224231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 9229099 - 9229018
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229099 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 9229018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 579 - 658
Target Start/End: Original strand, 3814202 - 3814281
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3814202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccctcctttg 3814281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623101
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttgcaagaag 443  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||     
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa- 16623292  T
Q  444 ctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc-tttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagag 541  Q
       ||||||  |||| ||||| ||| |||   ||||  |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| | ||    
T  16623291 -attagctaataagc-ttacagaagaacaagacctaatttctacccattttgtg-tcacccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaa--cacaaaag 16623197  T
Q  542 gaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16623196 gaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16623101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396479
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||      
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaa-- 5396671  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || ||| || | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||     
T  5396670 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttactcactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaaga 5396574  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  || |||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5396573 aagcttttgattcttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5396479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047466
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10047466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246081
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 39246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 45347721 - 45347658
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347721 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315241
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36315241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329450
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36329450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 5732844 - 5732907
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732844 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  354 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 16628815 - 16628680
Alignment:
Q  500 cccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 599  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16628815 cccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaa--cacaaaaggaagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgtt 16628720  T
Q  600 tttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16628719 t--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16628680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Original strand, 5112460 - 5112523
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 638  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5112460 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 3777772 - 3777838
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3777772 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3777838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796529
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3796529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 45357201 - 45357138
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357201 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 18855906 - 18855956
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18855906 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 18855956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 430
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777634
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5269074 - 5269008
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5269074 ctcactatccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5269008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 10047604 - 10047670
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  10047604 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcattacaaagacactcaaccc 10047670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 25861907 - 25861841
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  25861907 ctcactactcaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 25861841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 36315104 - 36315038
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  36315104 ctcactacccaatgtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccc 36315038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 36329313 - 36329247
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  36329313 ctcactacccaatgtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccc 36329247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630690
Alignment:
Q  353 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 6743289 - 6743226
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 638  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  6743289 ctcattacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcgctacaaagacactcaa 6743226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 431
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 574 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 38152311 - 38152246
Alignment:
Q  574 tcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38152311 tcactacccaaggtgtttacaatattt--cccatcccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38152246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 42599448 - 42599383
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  42599448 ctcactacccaaggtgtttagaatgttt--cccaaccgaagagaacctcactacaaagacactcaacc 42599383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 11099219 - 11098711
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11099219 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa 11099123  T
Q  252 --acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11099122 caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaagaacaaaacaccaag 11099024  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |     
T  11099023 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 11098924  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 544  Q
     |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11098923 atagcttgcaagctt-acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 11098825  T
Q  545 gctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 644  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11098824 gctttagatccttccaactaatgtactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaacccttt 11098725  T
Q  645 ggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||    
T  11098724 ggttccctcctttg 11098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291801
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 14291390  T
Q  254 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 349  Q
    |||||   || ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14291391 aacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 14291489  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |      
T  14291490 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 14291589  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14291590 tagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 14291688  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14291689 ctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttg 14291788  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  14291789 gttccctcctttg 14291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296186
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaac 9296596  T
Q  254 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 349  Q
    |||||   || ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9296595 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaaga 9296497  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |      
T  9296496 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 9296397  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||||  |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9296396 tagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 9296298  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9296297 ctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccctttg 9296199  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  9296198 gttccctcctttg 9296186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 175 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44312885 - 44312563
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  44312885 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 44312786  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312785 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 44312687  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  44312686 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 44312588  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttg 492  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  44312587 aacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Original strand, 32246607 - 32246966
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||| ||||||    
T  32246607 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctaga 32246706  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa----ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||    
T  32246707 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgt 32246805  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttac 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  32246806 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttac 32246903  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32246904 acatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 32246966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39812250 - 39811894
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||      
T  39812250 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 39812151  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 369  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39812150 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcag 39812052  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||     
T  39812051 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacat 39811954  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39811953 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 314 - 641
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3492043
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 3491912  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||     |||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3491913 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtggaa--tctcactacccaaggtgtttacaatgttttttccaac 3492010  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3492011 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 562
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398711
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 25398399  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  25398400 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 25398496  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  25398497 agattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 25398595  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25398596 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 25398694  T
Q  546 ctttaaatccttccaac 562  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25398695 ctttagatccttccaac 25398711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 562
Target Start/End: Original strand, 25403443 - 25403849
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  25403443 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 25403537  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  25403538 acaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 25403634  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  25403635 agattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 25403733  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25403734 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 25403832  T
Q  546 ctttaaatccttccaac 562  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25403833 ctttagatccttccaac 25403849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 19344243 - 19344596
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||     
T  19344243 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19344342  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19344343 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19344440  T
Q  368 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttac 463  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||    
T  19344441 agccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttac 19344538  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    ||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19344539 acatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19344596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 19349101 - 19349454
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||     
T  19349101 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagc 19349200  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 367  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19349201 ctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19349298  T
Q  368 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttac 463  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||    
T  19349299 agccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttac 19349396  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    ||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19349397 acatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19349454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 658
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40739140
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaat 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggggagagcagctctccaatccact 40738908  T
Q  413 atga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcac 510  Q
    |||| |||||||||||||      | || |     |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40738909 atgatgaaagtgttacaa------gaaaaa-----tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcac 40738996  T
Q  511 aagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccc 610  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||    |||| | |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  40738997 aatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccc 40739092  T
Q  611 aagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  40739093 aagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 40739140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 387 - 562
Target Start/End: Original strand, 25407663 - 25407838
Alignment:
Q  387 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattct 484  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||| ||||    
T  25407663 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa-tagcttgcaagctt-acacaagaacaagtcctagtttct 25407760  T
Q  485 accctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaac 562  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25407761 acccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaac 25407838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 39811894 - 39811812
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39811894 acccaaggtgattacaatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 39811812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630030
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 21630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 25409854 - 25409922
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409854 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569415
Alignment:
Q  352 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259189
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522308
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 433  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagg 20522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757570
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  |||||      
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaa 36757760  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
       |||| |||||||| |||||||| || | ||||  |||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  36757759 a--agctttcaagctt-acacaagaacaaaacctaatttctacccatttgtgttaccc-actctctcaatgatgaaccctaaa-gagaagacacaaaagg 36757665  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36757664 aagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36757570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445454
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaag 10445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865290
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682344
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 34682344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 32246968 - 32247031
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246968 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388945
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 34388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 39483156 - 39483222
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  39483156 ctcactacccaaggtgtttacaatattt--cccaacccaagagatcctcacaacaaagacactcaaccc 39483222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699018
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaag 14699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 23078433 - 23078278
Alignment:
Q  481 ttctaccctttggtgtttccc-cactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcacta 579  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||  | |||| || ||||||    
T  23078433 ttctacccatttgtgttacccacactctca-atgatgaaccctaa--gagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatga-tgaaatc-tcacta 23078339  T
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||    
T  23078338 cccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagattctcatcacaaagacactcaaccca 23078278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528631
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 33528631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707262
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10707262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 639
Target Start/End: Original strand, 21630168 - 21630232
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 639  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  21630168 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 21630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 41586425 - 41586358
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaa-tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41586425 ctcactacccaaggtgtttacaactgtttt--ccaacccaagagaagctctcaccaaagacactcaaccc 41586358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390160
Alignment:
Q  352 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaag 8390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 14698883 - 14698817
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  14698883 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccgagagatcctcactacaaagacactcaaccc 14698817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 17865428 - 17865494
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  17865428 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcttcactacaaagacactcaaccc 17865494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 20522445 - 20522511
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20522445 ctcactacccaagttgtttacaatgctt--cccaacccaagagatactcactacaaagacactcaaccc 20522511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 33118358 - 33118424
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  33118358 ctcactacccaaggtgtttacaatg--ttccccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 33118424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 33528498 - 33528432
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  33528498 ctcactacccaatgtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 33528432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 34389074 - 34389140
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||    
T  34389074 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacacaaccc 34389140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039684
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 427  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac 42039684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 10445341 - 10445275
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  10445341 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccgagagaacctcactacaaagacattcaaccc 10445275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 28259051 - 28258985
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    
T  28259051 ctcactacccaagatgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccc 28258985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 2869566 - 2869501
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  2869566 ctcactacccaatgtgtttacaatgtttt--ccaactcaagagaacctcactacaaagacactcaacc 2869501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 29867840 - 29867780
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaccctcaaccca 29867780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 31056266 - 31056334
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc--caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31056266 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 31056334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483018
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaag 39483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 20357837 - 20357331
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  20357837 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 20357742  T
Q  254 aacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag 348  Q
    |||||   || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaag 20357644  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |      
T  20357643 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 20357544  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20357543 tagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 20357444  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20357443 ctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttg 20357344  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  20357343 gttccctcctttg 20357331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 152 - 658
Target Start/End: Original strand, 2057763 - 2058281
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2057763 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaa 2057859  T
Q  252 acaacaa---aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaa----caagataagcaagaaa-ggaagaacaaaac 342  Q
    |||||||   || | |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2057860 acaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaac 2057959  T
Q  343 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaa 439  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  2057960 accaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 2058059  T
Q  440 gaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctt-tggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcact 537  Q
    ||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2058060 gaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacact 2058158  T
Q  538 agaggaagctttaaatccttcc--aaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacact 635  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2058159 agaggaagctttagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacact 2058258  T
Q  636 caacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  2058259 caaccctttggttccctcctttg 2058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533228
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||      
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaaca 1533636  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 350  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  1533635 acaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataa 1533539  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  1533538 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 1533439  T
Q  448 agctatcaagctttacacaagacagac--cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||||  ||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1533438 agcttgcaagctt-acacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 1533340  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1533339 ctttagatccttccaatgg-tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttg 1533241  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  1533240 gttccctcctttg 1533228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24024589 - 24024232
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||   |||    
T  24024589 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgac 24024490  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaag-aaaggaagaac-aaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 369  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24024489 tagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 24024390  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||  ||||||||||||||     
T  24024389 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgttacaaga--ctctagccttcaagctttacacat 24024292  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24024291 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaa 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 527
Target Start/End: Original strand, 12406155 - 12406512
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12406155 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12406254  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406255 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 12406353  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  12406354 caatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 12406452  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaag 527  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12406453 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 12406512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 12396735 - 12397091
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12396735 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12396834  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396835 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 12396933  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||||||||| |    
T  12396934 caatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagcctttaatctttacacatg 12397032  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12397033 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaa 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31109844 - 31109489
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||| ||    
T  31109844 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-ac 31109746  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31109745 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 31109647  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||||     
T  31109646 ccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttgcacat 31109549  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31109548 gaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 19992135 - 19992487
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  19992135 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 19992234  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19992235 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 19992334  T
Q  370 ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  19992335 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 19992432  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  19992433 tgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 19992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 175 - 435
Target Start/End: Original strand, 4866553 - 4866819
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  4866553 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagac 4866652  T
Q  273 tagtgtataac-aaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866653 tagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 4866751  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866752 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 311 - 658
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21640118
Alignment:
Q  311 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  408 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccact 505  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21639870 ccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccact 21639967  T
Q  506 ctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccc 605  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21639968 ctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttccc 21640065  T
Q  606 aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21640066 aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 21640118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 154 - 641
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21646299
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |  ||  || |||||||||      
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaaca 21645912  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | ||||   ||||   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21645913 acaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaa-acaaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 21646008  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    |    
T  21646009 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaa-aaat 21646107  T
Q  448 agctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21646108 agcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaaga 21646206  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646207 tttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21812501 - 21812149
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |    
T  21812501 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagc 21812402  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21812401 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 21812302  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatc-aagctttacac 465  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| | || |||||||||||    
T  21812301 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggttccaaga--ctctagcttgtcaaagctttacac 21812205  T
Q  466 aag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21812204 atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 21812149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 314 - 658
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413948
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaa 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggagagagcagctctccaatccac 18413704  T
Q  412 tatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctca 509  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18413705 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctca 18413802  T
Q  510 caagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 609  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18413803 caatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacattgtttttcccaacc 18413899  T
Q  610 caagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18413900 caagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18413948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 311 - 658
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18409072
Alignment:
Q  311 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaat 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  408 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccact 505  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    || ||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 18408922  T
Q  506 ctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttccc 605  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18408923 ctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatccttttaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttccc 18409019  T
Q  606 aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18409020 aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18409072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24266466 - 24266162
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  24266466 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 24266367  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24266366 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 24266270  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  24266269 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 24266172  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  24266171 acacaagaca 24266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24261587 - 24261283
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  24261587 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 24261488  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24261487 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 24261391  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  24261390 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 24261293  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  24261292 acacaagaca 24261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 16879894 - 16880197
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  16879894 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 16879993  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16879994 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 16880090  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16880091 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 16880188  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  16880189 cacaagaca 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Original strand, 16884750 - 16885053
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  16884750 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 16884849  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16884850 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 16884946  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16884947 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 16885044  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  16885045 cacaagaca 16885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 12397091 - 12397172
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397091 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 12397172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 581 - 658
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873387
Alignment:
Q  581 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 4873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 31109489 - 31109407
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat-tggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31109489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgct 31109407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 24024232 - 24024151
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024232 acccacggtgattacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 24024151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 581 - 653
Target Start/End: Original strand, 12406513 - 12406585
Alignment:
Q  581 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406513 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 12406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159890
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29159890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516320
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 46516320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091748
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 49091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 426
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 426  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56034
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 56034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 431
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848696
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 20284312 - 20284378
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  20284312 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 20284378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23402887 - 23402821
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23402887 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23402821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647706
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2647706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 4796542 - 4796477
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  4796542 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 4796477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332460
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 33332460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 658
Target Start/End: Original strand, 2479559 - 2479642
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  2479559 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 2479642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Original strand, 21989131 - 21989194
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  21989131 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 21989194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 2580613 - 2580678
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  2580613 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaacctcac-acaaagacactcaaccc 2580678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 2647571 - 2647505
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  2647571 ctcactacccaaggtgcttaccatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 2647505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 44847999 - 44847933
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  44847999 ctcactatccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 44847933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 46516179 - 46516113
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  46516179 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaactcaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 46516113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 21812143 - 21812092
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21812143 cccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 2479148 - 2479221
Alignment:
Q  154 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2479148 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 2479221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 3047477 - 3047543
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3047477 ctcactacccaagatgattatagtgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 3047543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 9185048 - 9184982
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||  | ||||||| |||||||||    
T  9185048 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaaccttactacaaagatactcaaccc 9184982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24266106 - 24266054
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24266106 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 47263485 - 47263562
Alignment:
Q  150 cttctgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  47263485 cttctgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgcgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 47263562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 47263889 - 47263955
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47263889 ctcactacccaaggtatttacaatgttt--cccaaccgaagagattctcactacaaagacactcaaccc 47263955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 9189881 - 9189840
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 616  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  9189881 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 9189840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 190 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787148
Alignment:
Q  190 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-----acaacaaaac-cagccctagactagtgtataac 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||     |||||||||  ||||||||||||  |||| | |    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  284 aaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 381  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 24787428  T
Q  382 aatctgggag--agagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagacccta 478  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| |||||||||| || | ||||    
T  24787427 aatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatccta 24787328  T
Q  479 gattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcact 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24787327 gattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcact 24787228  T
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24787227 gcccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25445352 - 25444996
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  25445352 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 25445253  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25445252 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 25445153  T
Q  370 ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25445152 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 25445055  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25445054 tgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25444996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 41398060 - 41398415
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-----aaccagccct 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     || |||||||    
T  41398060 tcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccct 41398159  T
Q  269 agactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagt 365  Q
    | ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41398160 a-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagg 41398253  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttac 463  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||    
T  41398254 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttac 41398351  T
Q  464 acaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41398352 acatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 39445322 - 39445673
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  39445322 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 39445421  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39445422 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 39445521  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  39445522 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 39445618  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39445619 tgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39445673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202556
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaac 24202960  T
Q  254 aacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 350  Q
    |||||  || |||||||| ||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24202959 aacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa 24202864  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |    
T  24202863 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaat 24202765  T
Q  448 agctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagc 546  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24202764 agcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 24202666  T
Q  547 tttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattgg 646  Q
    |||| ||||||||||    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |    
T  24202665 tttagatccttccaa-tggtgagat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctaaag 24202568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 44024135 - 44023785
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  44024135 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 44024036  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44024035 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagc 44023936  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaa 467  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||     
T  44023935 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacat 44023839  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44023838 gaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 44023785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1055274 - 1054923
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| || ||||||||  |    
T  1055274 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 1055175  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1055174 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 1055075  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1055074 ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 1054978  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1054977 tgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 1054923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 251 - 526
Target Start/End: Original strand, 41390488 - 41390760
Alignment:
Q  251 aacaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaag--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccga 347  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||    
T  41390488 aacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatcga 41390580  T
Q  348 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 445  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  41390581 gaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ct 41390678  T
Q  446 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41390679 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 314 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361220
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  410 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 507  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19361368  T
Q  508 cacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 607  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19361367 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaa 19361271  T
Q  608 cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19361270 cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19361220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 314 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358631
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  410 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 507  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa-tagcttgcaagctt-acacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19358779  T
Q  508 cacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 607  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19358778 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaa 19358682  T
Q  608 cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19358681 cccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988424
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagca 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| || || ||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 43988610  T
Q  291 cacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 387  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43988609 cactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctg 43988510  T
Q  388 gg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 471  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988509 ggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 43988424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 314 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379916
Alignment:
Q  314 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  410 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 507  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19380008  T
Q  508 cacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttt 601  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19380007 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt 19379916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 19366276 - 19366095
Alignment:
Q  475 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcct 574  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| | ||    
T  19366276 cctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaaat-ct 19366179  T
Q  575 cactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19366178 cactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19366095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 41398415 - 41398497
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41398415 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 41398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 41390760 - 41390842
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41390760 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgct 41390842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 253
Target Start/End: Original strand, 41386571 - 41386650
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41386571 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 640
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281995
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 3281805  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||    
T  3281806 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagg 3281901  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  3281902 aagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 3281995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644909
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073015
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19073015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120905
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124526
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16124526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104382
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 27104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069855
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604413
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||      
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaa 13604621  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaaga-tgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||| ||| |||||||| ||   ||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  13604620 a-tagcttgcaaactt-acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaagg 13604525  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||     
T  13604524 aagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagatactcaaccct 13604429  T
Q  643 ttggttccctcctttg 658  Q
       |||||||||||||    
T  13604428 aaagttccctcctttg 13604413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 47098699 - 47098633
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47098699 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcgctacaaagacactcaaccc 47098633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 47102713 - 47102647
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47102713 ctcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 47102647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 1054917 - 1054854
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054917 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 25439801 - 25439738
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439801 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 25444994 - 25444931
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25444994 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 39445679 - 39445742
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445679 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 44023779 - 44023716
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023779 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 29652036 - 29652102
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  29652036 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccc 29652102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Original strand, 13598623 - 13598688
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  13598623 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 13598688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27104275 - 27104211
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  27104275 ctcactacccaaggtgcttataatg--tttcccaacccaagagac-ctcactacaaagacactcaacc 27104211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25439877 - 25439803
Alignment:
Q  451 tatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25439877 tatcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25439803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19359079
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 19359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21536441 - 21536378
Alignment:
Q  576 actacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21536441 actacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536581
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 32889661 - 32889727
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |  ||| | |||||||||||||||||    
T  32889661 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaaaaacctcactacaaagacactcaaccc 32889727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 43988366 - 43988314
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  43988366 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16124388 - 16124347
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 616  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16124388 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 16124347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 635
Target Start/End: Original strand, 22819657 - 22819714
Alignment:
Q  576 actacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacact 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  22819657 actacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcactacaaagacact 22819714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 581 - 640
Target Start/End: Original strand, 37069998 - 37070055
Alignment:
Q  581 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  37069998 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 37070055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 40816690 - 40816622
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc--caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40816690 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 40816622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 47703809 - 47703741
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc--caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47703809 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 47703741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674554
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | || ||||||||      
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaa-gtttcccaagcaaca 5674962  T
Q  252 acaacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaa 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |    
T  5674961 acaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaaga 5674865  T
Q  351 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctct 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |    
T  5674864 gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 5674765  T
Q  448 agctatcaagctttacacaagacagac--cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    ||||  ||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5674764 agcttgcaagctt-acacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 5674666  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5674665 ctttagatccttccaatgg-tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttg 5674567  T
Q  646 gttccctcctttg 658  Q
    |||||||||||||    
T  5674566 gttccctcctttg 5674554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22010958 - 22010602
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||    
T  22010958 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 22010859  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010858 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 22010760  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  22010759 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 22010661  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22010660 aacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 11856795 - 11857154
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  11856795 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 11856894  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaac---aaaacaccgagaagattgttgacccagttc 367  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||| |  |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11856895 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttc 11856993  T
Q  368 agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacac 465  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  11856994 agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacac 11857092  T
Q  466 aag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11857093 atgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14737838 - 14737482
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  14737838 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 14737739  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14737738 tagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcag 14737640  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| |     
T  14737639 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatat 14737542  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14737541 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14742697 - 14742342
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  14742697 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagac 14742598  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742597 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 14742499  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | |    
T  14742498 caatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatg 14742401  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14742400 aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Original strand, 28184325 - 28184684
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaa--tggtttccaagcaaacaacaa--aaccagcccta 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  28184325 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 28184424  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagtt 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184425 gactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagtt 28184523  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttaca 464  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||  ||||||||||||    
T  28184524 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaca--ctctagccttcaagctttaca 28184621  T
Q  465 caag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  28184622 catgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 6438324 - 6438674
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagact 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  6438324 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagct 6438423  T
Q  274 agtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagc 370  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6438424 agtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagc 6438523  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaa 467  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||     
T  6438524 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacat 6438620  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6438621 gaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 6438674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28155832 - 28155477
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||  || |||||   |||    
T  28155832 tcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcctatgac 28155733  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28155732 ttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 28155633  T
Q  370 ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa 467  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||     
T  28155632 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tttagctttcaagctttacacat 28155535  T
Q  468 g-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28155534 gaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 28155477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 6005239 - 6005592
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  6005239 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 6005338  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6005339 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 6005435  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||    
T  6005436 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagcttta 6005533  T
Q  463 cacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
    |||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  6005534 cacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 6005592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Original strand, 16838566 - 16838923
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  | ||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  16838566 tcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 16838665  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16838666 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 16838762  T
Q  367 cagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16838763 cagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttta 16838860  T
Q  463 cacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    |||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  16838861 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 16838923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330351
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagc- 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || ||| |||||| ||||| |     
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 33330591  T
Q  290 acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 385  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33330590 acactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33330493  T
Q  386 t--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctaga 480  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33330492 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga 33330395  T
Q  481 ttctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
     ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33330394 -tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 33330351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33336207 - 33335848
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||| | ||||||||  || |||||  ||    
T  33336207 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcctaag 33336108  T
Q  271 actagtgtataacaaaagc-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
     ||| ||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  33336107 cctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagt 33336010  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  33336009 tcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 33335912  T
Q  462 acacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaa 525  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33335911 acacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 33335848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Original strand, 11857154 - 11857235
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857154 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 11857235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 22010602 - 22010521
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010602 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 22010521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 579 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14737482 - 14737403
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737482 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 14737403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 579 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14742342 - 14742263
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14742342 acccaaagtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggttccctcctttg 14742263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 658
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709316
Alignment:
Q  315 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  411 atatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctc 508  Q
     ||||| ||||||||||||| |       | ||    |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgttacaaga-------aaaa----tagcttgcaagctt-acacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctc 22709170  T
Q  509 acaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||    |||| | ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  22709171 acaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagtttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaac 22709266  T
Q  609 ccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 658  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  22709267 ccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 22709316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 386
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343519
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctagactagtgtataacaaaagc- 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  || |||  ||||| ||||| |     
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaacc 5343421  T
Q  290 acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 385  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5343422 acactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 5343518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30126084 - 30125940
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||    
T  30126084 tgttgtgaatccggttgaaaatcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 30125989  T
Q  254 ---aacaaaaccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagag 299  Q
       ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30125988 tacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757490
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 427
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356118
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 427  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 21356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 649
Target Start/End: Original strand, 28184684 - 28184757
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgttttt---cccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttc 649  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28184684 acccaaggtgattactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttgttc 28184757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572251
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5572251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 431
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 431  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 28155475 - 28155412
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155475 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963786
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 22963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824607
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23824607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 6438680 - 6438743
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438680 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5017370 - 5017304
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5017370 ctcattacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5017304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 31936798 - 31936864
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31936798 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaatagatcctcactacaaagacactcaaccc 31936864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979600
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaag 31979600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5572117 - 5572051
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  | | | |||||||||| ||||||    
T  5572117 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatccccactacaaagacacccaaccc 5572051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 5757352 - 5757286
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||||    
T  5757352 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctaaatacaaagacactcaaccc 5757286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 6005598 - 6005650
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  6005598 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Original strand, 16838925 - 16838977
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16838925 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 22963922 - 22963988
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  22963922 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcttcactacaaagacactcaaccc 22963988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23824471 - 23824405
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  23824471 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcttcactacaaagacactcaaccc 23824405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 24435845 - 24435780
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24435845 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaactcaagagaacctcac-acaaagacactcaaccc 24435780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggaga--gagcagctctccaatcca 410  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 31979735 - 31979801
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31979735 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaaaagaacctcactacaaagacactcaaccc 31979801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33330349 - 33330297
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33330349 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33335846 - 33335794
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33335846 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21801218 - 21801150
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc--caagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21801218 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 21801150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801354
Alignment:
Q  361 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagag--agcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaag 21801354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 31936398 - 31936470
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 229  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  31936398 tgttgtgaatccggttaaaa-tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatg 31936470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9549
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||      
T  9902 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaag 9803  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 371  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 ctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagcc 9704  T
Q  372 aatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag- 468  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| |     
T  9703 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatga 9606  T
Q  469 acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9605 acaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 3754 - 3672
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3754 acccaaggtgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 1
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctaga 271  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||      
T  143 tcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaag 50  T
Q  272 ctagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 323  Q
    |||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  49 ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3836 - 3754
Alignment:
Q  444 ctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
    |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3836 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 9549 - 9514
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9549 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 175 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35323 - 34967
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaaca--aaaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  35323 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 35224  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35223 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagc 35125  T
Q  371 caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 468  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  35124 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatg 35026  T
Q  469 -acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 526  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35025 aacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 34967 - 34886
Alignment:
Q  579 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 34886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 175 - 521
Target Start/End: Original strand, 185 - 536
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaccagccctagac 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  185 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 284  T
Q  273 tagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcag 369  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  285 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 384  T
Q  370 ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 466  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  385 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacaca 481  T
Q  467 ag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 521  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  482 tgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 643
Target Start/End: Original strand, 542 - 605
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  542 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24331 - 23832
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  24331 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 24237  T
Q  252 acaacaaaa-ccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||   ||||   ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  24236 acaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaaga-aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 24141  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  24140 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 24042  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24041 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 23943  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||        
T  23942 ctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctaga 23845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 18238 - 17739
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||| | |  ||  || |||||||||      
T  18238 tgttgtgaatccggttaaaactcaaaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaca 18144  T
Q  252 acaacaaaa-ccagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgaga 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  18143 acaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaa 18048  T
Q  350 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  18047 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 17949  T
Q  447 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaag 545  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17948 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 17850  T
Q  546 ctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattg 645  Q
    ||||| ||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||        
T  17849 ctttagatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctaga 17752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 149219 - 148916
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  149219 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 149120  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  149119 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 149023  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  149022 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 148925  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  148924 cacaagaca 148916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 148860 - 148808
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  148860 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2211
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  2514 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 2415  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2414 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 2318  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2317 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 2220  T
Q  463 cacaagaca 471  Q
    |||||||||    
T  2219 cacaagaca 2211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2155 - 2103
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2155 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19428 - 19102
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaa--aaccagccctag 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||  || |||||  ||    
T  19428 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 19329  T
Q  271 actagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 366  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19328 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagtt 19232  T
Q  367 cagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttta 462  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  19231 cagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttta 19134  T
Q  463 cacaagac-agaccctagattctaccctttggt 494  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  19133 cacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggt 19102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14269
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  14573 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 14474  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14473 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 14377  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagcttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  14376 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagcttt 14279  T
Q  462 acacaagaca 471  Q
    ||||||||||    
T  14278 acacaagaca 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 14213 - 14161
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14213 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 581 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 19068 - 19017
Alignment:
Q  581 ccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19068 ccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 300
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaa- 251  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  528 ctgttgtgaatccatttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaac 432  T
Q  252 -acaacaaaac-cagccctagactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag 348  Q
     |||||||||  |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  431 aacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaag 333  T
Q  349 aagattgttgacccagttcagccaatatggcct 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  332 aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 182228 - 181980
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaa-caacaa--aaccagcccta 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||||| || ||||||  || |||||  |    
T  182228 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaa 182129  T
Q  270 gactagtgtataacaaaagcacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 365  Q
    | ||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  182128 gcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagt 182032  T
Q  366 tcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg 415  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  182031 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 176881 - 176829
Alignment:
Q  580 cccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacccaagagacactctcaacaaag 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  176881 cccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8208
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 8418  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  ||||||   || |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  8417 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacgtatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagg 8320  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    ||||||| |||||||||||    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||     
T  8319 aagcttttaatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 8224  T
Q  643 ttggttccctcctttg 658  Q
       |||||||||||||    
T  8223 aaagttccctcctttg 8208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 175 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34211 - 34132
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaac 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34211 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13233
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13171 tcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36640
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 36830  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaagacagaccctagatt-ctaccctttggtgtttccccactctcacaaga-tgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
    |  ||||  ||||||| ||||||||   |  |  |||| |||||| || ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  36829 t--agcttgcaagctt-acacaagaacaagacatgatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaagg 36735  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36734 aagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43973
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 43835 - 43769
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  43835 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccc 43769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44247 - 44174
Alignment:
Q  154 tgttgtga-ttccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44247 tgttgtgagttccggttgataatcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaaagga-agtggtaatcaatg 44174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 430
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85768
Alignment:
Q  350 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 430  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 641
Target Start/End: Original strand, 85906 - 85972
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 641  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  85906 ctcactacccaaagtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 85972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133070
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 444  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||      
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaaa 133278  T
Q  445 tctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaaga-tgaaccctaaaagagaagtcactagagg 542  Q
      |||||  ||| ||| |||||||| ||   ||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  133277 a-tagcttgcaaactt-acacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacaaaagg 133182  T
Q  543 aagctttaaatccttccaaccaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 642  Q
    |||||||  ||||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||     
T  133181 aagcttttgatccttccaatgg-tgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccct 133086  T
Q  643 ttggttccctcctttg 658  Q
       |||||||||||||    
T  133085 aaagttccctcctttg 133070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 640
Target Start/End: Original strand, 5908 - 5973
Alignment:
Q  573 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 640  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  5908 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 5973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 432
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10816
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 432  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 10816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 429
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  349 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 429  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University