View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7018_low_2 (Length: 584)

Name: NF7018_low_2
Description: NF7018
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7018_low_2
NF7018_low_2
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (10-547)||(20649849-20650386)
chr8 (10-546)||(21194047-21194583)
chr8 (10-544)||(22437053-22437574)
chr8 (10-547)||(21847831-21848368)
chr8 (32-523)||(23902934-23903424)
chr8 (10-547)||(16414841-16415373)
chr8 (10-246)||(23154838-23155073)
chr8 (45-250)||(24931619-24931820)
chr8 (355-406)||(16268859-16268910)
chr8 (364-406)||(28984015-28984057)
chr8 (364-406)||(28989234-28989276)
chr8 (364-406)||(31414167-31414209)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (10-547)||(20527752-20528289)
chr1 (10-543)||(20927753-20928286)
chr1 (10-407)||(22133015-22133412)
chr1 (10-545)||(20828517-20829052)
chr1 (10-511)||(41215019-41215516)
chr1 (401-554)||(22129555-22129708)
chr1 (10-448)||(20171870-20172300)
chr1 (355-406)||(20074973-20075024)
chr1 (355-406)||(20297456-20297507)
chr1 (355-406)||(31537261-31537312)
chr1 (355-406)||(38910090-38910141)
chr1 (355-406)||(48425948-48425999)
chr1 (355-406)||(52988816-52988867)
chr1 (366-402)||(16379149-16379185)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (39-547)||(6150143-6150651)
chr3 (32-543)||(17200970-17201482)
chr3 (10-545)||(30149670-30150205)
chr3 (10-547)||(8271689-8272226)
chr3 (10-547)||(13964645-13965179)
chr3 (171-547)||(22150036-22150403)
chr3 (304-547)||(15943885-15944128)
chr3 (10-294)||(15948014-15948297)
chr3 (39-253)||(15612444-15612658)
chr3 (10-250)||(30140119-30140359)
chr3 (46-222)||(12795916-12796092)
chr3 (46-222)||(16258822-16258998)
chr3 (46-222)||(18915406-18915582)
chr3 (40-242)||(3295969-3296171)
chr3 (120-180)||(29680861-29680922)
chr3 (355-406)||(10408626-10408677)
chr3 (355-406)||(12509903-12509954)
chr3 (355-406)||(28756977-28757028)
chr3 (355-406)||(47126602-47126653)
chr3 (364-406)||(31692605-31692647)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (32-555)||(22739237-22739760)
chr2 (10-547)||(22280420-22280957)
chr2 (10-410)||(25130924-25131324)
chr2 (10-381)||(24567425-24567796)
chr2 (10-222)||(24829105-24829316)
chr2 (46-222)||(12638818-12638994)
chr2 (113-250)||(25878531-25878668)
chr2 (118-222)||(12644485-12644589)
chr2 (112-221)||(34821567-34821675)
chr2 (366-406)||(23113394-23113434)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (10-547)||(26109-26646)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (34-546)||(4442624-4443136)
chr7 (10-545)||(27104836-27105371)
chr7 (10-545)||(7826573-7827108)
chr7 (10-545)||(27172954-27173489)
chr7 (34-538)||(13458732-13459234)
chr7 (10-219)||(17926292-17926501)
chr7 (280-475)||(14207264-14207456)
chr7 (280-475)||(14215954-14216146)
chr7 (154-253)||(11284627-11284726)
chr7 (290-505)||(22034950-22035165)
chr7 (327-505)||(17142404-17142582)
chr7 (210-423)||(17131545-17131758)
chr7 (355-406)||(21755431-21755482)
chr7 (355-406)||(26115769-26115820)
chr7 (355-406)||(13965847-13965898)
chr7 (355-406)||(26091977-26092028)
chr7 (355-406)||(40924996-40925047)
chr7 (355-406)||(49155320-49155371)
chr7 (481-554)||(14218206-14218279)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (39-546)||(16100592-16101099)
chr6 (10-545)||(16379571-16380106)
chr6 (10-547)||(16647165-16647702)
chr6 (36-410)||(18401219-18401593)
chr6 (10-318)||(1646239-1646547)
chr6 (33-253)||(23025251-23025471)
chr6 (46-253)||(16234943-16235149)
chr6 (371-547)||(14149316-14149492)
chr6 (139-253)||(18578098-18578212)
chr6 (190-374)||(14133824-14133993)
chr6 (138-222)||(18836178-18836262)
chr6 (139-250)||(19985697-19985808)
chr6 (99-194)||(14131076-14131171)
chr6 (458-555)||(21412714-21412811)
chr6 (10-70)||(14131018-14131078)
chr6 (366-405)||(18182705-18182744)
chr6 (364-430)||(21474502-21474568)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (33-547)||(7893-8407)
scaffold0021 (45-547)||(90250-90752)
scaffold0021 (35-547)||(20930-21420)
scaffold0021 (35-547)||(30506-30996)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-547)||(131543-132080)
scaffold0008 (10-547)||(26490-27026)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (39-547)||(14999359-14999867)
chr4 (10-547)||(15290209-15290746)
chr4 (45-554)||(12339909-12340420)
chr4 (10-253)||(9292850-9293093)
chr4 (10-253)||(15139015-15139257)
chr4 (355-406)||(3261986-3262037)
chr4 (355-406)||(7357296-7357347)
chr4 (355-406)||(11204424-11204475)
chr4 (355-406)||(29450729-29450780)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (10-547)||(23676-24213)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (10-544)||(6061-6596)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (41-544)||(678-1181)
scaffold0467 (312-544)||(13388-13620)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (10-547)||(12679-13216)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-547)||(1006-1543)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (10-547)||(73651-74187)
scaffold0011 (10-547)||(78032-78568)
scaffold0011 (241-547)||(181934-182240)
scaffold0011 (35-413)||(175701-176079)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (36-547)||(24917-25429)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (10-547)||(23508282-23508810)
chr5 (10-547)||(24583808-24584336)
chr5 (10-325)||(21934643-21934958)
chr5 (39-222)||(23505202-23505383)
chr5 (355-406)||(14884365-14884416)
chr5 (355-406)||(20345225-20345276)
chr5 (355-406)||(22505622-22505673)
chr5 (355-431)||(25851015-25851091)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (10-525)||(5380-5895)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (10-544)||(34798-35332)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (10-547)||(4859-5397)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-547)||(926-1461)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (39-547)||(6914-7423)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (10-546)||(3958-4493)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (41-544)||(15654-16157)
scaffold0162 (10-222)||(10553-10765)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (65-511)||(2342-2785)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (126-520)||(3328-3722)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (290-546)||(25755-26012)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (10-250)||(3196-3436)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (10-267)||(2435-2692)
scaffold0462 (303-547)||(2703-2953)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (34-222)||(809-997)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (33-222)||(3331-3520)
scaffold0409 (33-222)||(11586-11775)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (10-250)||(93791-94031)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (10-253)||(17696-17938)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (11-204)||(202-395)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (40-253)||(46431-46643)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (39-245)||(249-455)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (39-245)||(53967-54173)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (39-222)||(51583-51766)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-228)||(8199-8417)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (39-222)||(10757-10941)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (46-222)||(23-198)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (159-520)||(20807-21168)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (206-520)||(77339-77653)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (139-253)||(2320-2434)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (139-253)||(24913-25027)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (390-544)||(9429-9583)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (408-546)||(96637-96775)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (196-288)||(2292-2384)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (10-130)||(4709-4829)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (366-405)||(15479-15518)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (355-406)||(29992-30043)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (355-406)||(67303-67354)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (355-406)||(41793-41844)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (355-406)||(39528-39579)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (355-406)||(514548-514599)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (364-406)||(4284-4326)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (388-421)||(29941-29974)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20650386 - 20649849
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  20650386 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcgtctaccggcttcgaaaaagtcac 20650287  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650286 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 20650187  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |  |||||||  || |||||  | |||||||    
T  20650186 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttatcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctggtcggggtgtcaataaccatcccccgcaaca 20650087  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650086 aaggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 20649987  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20649986 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcctggtacacttagta 20649887  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20649886 ctaatatgacccttctccccacaattgtagcaagtaat 20649849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21194583 - 21194047
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21194583 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaatttttctaccggctttgaaaaagttac 21194484  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21194483 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaaataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 21194384  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||  | |||||||    
T  21194383 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagccggggtgtcgataaccatcccccgcaaca 21194284  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  21194283 aaggagttacaaccaatttcaaacgcttaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccaatatcaataattccaatcaaatgagtgctattgat 21194184  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21194183 gaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaatgcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggta 21194084  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaa 546  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  21194083 ctgatatggcccttctctccacaattgtaacaagtaa 21194047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 10 - 544
Target Start/End: Original strand, 22437053 - 22437574
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| ||||| |||||    
T  22437053 acatcatgaacacttaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactt-------------tctaccggcttcgaaaatgttac 22437139  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22437140 acttttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacattcaatccatacaaaaaatcacatccatatgattcaatggaagacacacaagatctaac 22437239  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22437240 tcaaaatcaacattaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaagaagtagtcactgaaccactagtcggggtgtcgatgaccatccctcgcaaca 22437339  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22437340 acggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtaacatcagtatcaataatcgcaatcaaaggagtactattgat 22437439  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22437440 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacttcctccacattcaatgcaaacaccttttccaccgccttcttcggcttggtacacttagta 22437539  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  22437540 ctgatatgacccttctcaccacaattgtaacaagt 22437574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 21848368 - 21847831
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||| ||||||||| || ||||| || ||    
T  21848368 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcgttcaaaaacttcctatctaacttttctaccggtttagaaaaagtcac 21848269  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21848268 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21848169  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  21848168 tcaaaatcaacatcaacaaaattaacaggacacttagcacacataaacgaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 21848069  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21848068 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaagagtactattgat 21847969  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  21847968 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcatggtacacttggta 21847869  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  21847868 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 21847831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 32 - 523
Target Start/End: Original strand, 23902934 - 23903424
Alignment:
Q  32 accgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaata 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || || || |||||     
T  23902934 accgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttatactcttggttaagcagttaatg 23903033  T
Q  132 ctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatat 231  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23903034 ctaacaccaaaagacaacatccaatccatacaaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacatttccaaaat 23903133  T
Q  232 taacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  23903134 taacaggacacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatccctcgcgataacggagttacaaccaaattcaa 23903233  T
Q  332 atgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataaga 431  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  23903234 atgctcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattataatc-aaggagtactattgataaaacatatacctcatataaga 23903332  T
Q  432 ttatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccatt 523  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  23903333 ttatccggctgctccacctcttctgcattcaatgcaaacaccttttctgccaccttctttggcttggtacacttagcactgatatgaccatt 23903424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 16414841 - 16415373
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16414841 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 16414940  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |  |||||||||||||    
T  16414941 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaaa-----aatcacaagatccaac 16415035  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  16415036 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 16415135  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||| | || |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16415136 aaggagtcaaaatcaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaatggaatactattgat 16415235  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16415236 aaaacacatacctcggataaggttatccggttgctccacctcctccgcattcaaggcaaacacctttcccaccaccttcttcggcttggtacacttagta 16415335  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  16415336 ctaatatgacctttctctccataattgtagcaagtaat 16415373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23155073 - 23154838
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23155073 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccagcttcgaaaacgttac 23154974  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23154973 actcttagtcaaacagttaatgctaaccccaaaagacaacaaccaatccat-cccaaaatcacatccatatgcttcaacggaagatacacaagatcaaac 23154875  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttag 246  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  23154874 tcaaaatcaacattaccataattaacatgacacttag 23154838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24931820 - 24931619
Alignment:
Q  45 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaag 144  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24931820 ttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaag 24931721  T
Q  145 ataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacactt 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24931720 ctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgga----aaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacactt 24931625  T
Q  245 agcaca 250  Q
    ||||||    
T  24931624 agcaca 24931619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16268910 - 16268859
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16268910 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 16268859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Original strand, 28984015 - 28984057
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28984015 gagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 28984057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Original strand, 28989234 - 28989276
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28989234 gagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 28989276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31414209 - 31414167
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31414209 gagtagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtactatt 31414167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 20527752 - 20528289
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  20527752 acatcataaacacagaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgcttcgcggtcaagaacttcccatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20527851  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20527852 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccatatcaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaac 20527951  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||  | |||||||    
T  20527952 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagtcggggtgtcaataaccattccccgcaaca 20528051  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20528052 aaggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccaggatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 20528151  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20528152 aaaacacatacctcggataagattatgcggctgttccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgctgccttcttcggcttggtacacttagta 20528251  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20528252 ctaatatgacctttctctccacaattgtaacaagtaat 20528289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 543
Target Start/End: Original strand, 20927753 - 20928286
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  20927753 acatcataaacacacaagctttaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaatgtcac 20927852  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20927853 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaacaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 20927952  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | || ||||    
T  20927953 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgtaaca 20928052  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20928053 aaggagttataaccaatttcaaacgatcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 20928152  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20928153 aaaacacatacctcaaataagattatccggctgctccacctcctctgcattcaaagcaaacacctttcctgccgccttcttcggcttggtacacttagta 20928252  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaag 543  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  20928253 ctaatatgacctttctctccacaattgtaacaag 20928286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22133412 - 22133015
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133412 acatcataaacacacaagctccaccgtccaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggcttcgaaaacgttac 22133313  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133312 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 22133213  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22133212 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcgcacacaaaacaagtagtcaccgaaccattagccggggtgtcgatgaccatccctcgcaaca 22133113  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattg 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22133112 acggagttagaaccaatttcaaatgctcaacacaactaaccgaggtaaaagaatgagtagcaccggtatcaataattgcaatcaaaggattactattg 22133015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20829052 - 20828517
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  20829052 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20828953  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20828952 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 20828853  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  20828852 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 20828753  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828752 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 20828653  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  20828652 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 20828553  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  20828552 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 20828517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41215516 - 41215019
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  41215516 acatcataaacacacaagcctcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttat 41215417  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  41215416 actattcgttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcaataccaaaaatcacatccatatgctaaaacggaagacaaacaagatccaac 41215317  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    ||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  41215316 tcaaaattaatgttaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaggaagtagtcaccga----ctagccggggtgtcgataaccatccctcgcaaca 41215221  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  41215220 acggagttacaaccaaattcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatccaaggagtactgctgat 41215121  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41215120 aaaacacatacatcggataagattatccggttgctccacttcctcggcattcaatgcaaacacctttcccgtcgccttctttggcttggtacacatatta 41215021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 401 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22129708 - 22129555
Alignment:
Q  401 actattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggta 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22129708 actattgataaaacaaatacctcgggtaagattatctggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttcctgccgccttcttcggcttggta 22129609  T
Q  501 cacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaatattcttc 554  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22129608 cacttagtactaatatgacccttctctccacaattgtagcaagtaatatccttc 22129555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 448
Target Start/End: Original strand, 20171870 - 20172300
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||||||||||  || |  ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||         ||||| ||||| || || ||||     
T  20171870 acatcataaacacactagcttcaccatccaaaaatttcttcacttgctccgcagtcaaaaacttccca---------tctactggcttcgagaatgttat 20171960  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||| || |||||| | |||||   ||| | ||||||  ||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |  |||||| |  || ||||||||||||    
T  20171961 acttttggtcaaaaaattaatgtcaacactaaaagacgacatccagtccttaccgaaaatcacatccatattcaccaacggcaagcaaacaagatccaac 20172060  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||| | |||||| |||   |  ||||| | ||||| |||  ||| |||||    
T  20172061 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacaaactaaggaagttgccaccgagccatcggtcggggtatcgatgaacattcctctcaaca 20172160  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    || |||||| ||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| | ||||||   ||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  20172161 acagagttaaaaccaaactcaaacgttcaacacaactaagcgagatgaaagaatacgtagcactagtatcaacaatttcaatcaaatgagtactattgat 20172260  T
Q  410 -aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccac 448  Q
     ||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||    
T  20172261 aaaaacacatacctcaaatgagattatccggctgctccac 20172300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20075024 - 20074973
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20075024 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 20074973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 20297456 - 20297507
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20297456 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 20297507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31537312 - 31537261
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31537312 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 31537261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38910141 - 38910090
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38910141 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 38910090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 48425948 - 48425999
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48425948 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 48425999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 52988816 - 52988867
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52988816 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 52988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 402
Target Start/End: Original strand, 16379149 - 16379185
Alignment:
Q  366 gtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtac 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16379149 gtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtac 16379185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6150651 - 6150143
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6150651 aaagacttcttcacctgctctacgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 6150552  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6150551 caaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 6150452  T
Q  239 acacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctca 338  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6150451 acacttagcacacataaaagaagtagtaaccgaacctctagccggggtgtcaataaccattccccgcaacaagggagttacaaccaatttcaaacgctca 6150352  T
Q  339 acaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttg 438  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6150351 acacaactaaccgatataaaagaatgagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaatgagtactattgataaaacacatacctcggataagattatccg 6150252  T
Q  439 gctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgta 538  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6150251 gttgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccaccgccttcttcggcttggtacacttagtactaatatgacccttctctccacaattgta 6150152  T
Q  539 gcaagtaat 547  Q
    |||||||||    
T  6150151 gcaagtaat 6150143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 32 - 543
Target Start/End: Original strand, 17200970 - 17201482
Alignment:
Q  32 accgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaata 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| || || |||||     
T  17200970 accgttcaaagacttcttcacttgctacgcggtcaagaacttcctacttaactcgtctaccggttttgaaaatactacactcttagttaaccaattaatg 17201069  T
Q  132 ctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatat 231  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17201070 ctaaccccaaaagatatcaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattacctaaat 17201169  T
Q  232 taacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaa 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17201170 taacaggacaattagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccgctagcacgggtgtcgatgaccatccctcgcaacaaaggagttacaaccaatttcaa 17201269  T
Q  332 atgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat-aaaacacatacctcggataag 430  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17201270 acgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcactagtatcaataattgcaatcaatggagtactattgataaaaacacatacatcagataag 17201369  T
Q  431 attatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttcca 530  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  17201370 attatctggatgctccatttcctccgcattcaatgcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttagtactgatatgacccttctctcca 17201469  T
Q  531 caattgtagcaag 543  Q
    |||||||| ||||    
T  17201470 caattgtaacaag 17201482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Original strand, 30149670 - 30150205
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  30149670 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30149769  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30149770 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30149869  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  30149870 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 30149969  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149970 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 30150069  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  30150070 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 30150169  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  30150170 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 30150205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8272226 - 8271689
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  8272226 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 8272127  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8272126 actcctagtcaaacaattaatgcgaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8272027  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  8272026 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 8271927  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271926 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 8271827  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8271826 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggta 8271727  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  8271726 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 8271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13965179 - 13964645
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  13965179 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccacggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13965080  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13965079 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13964980  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||  | |||||||    
T  13964979 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaa---gtagtcaccgaaccgctagccggggtatcaataaccattccacgcaaca 13964883  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    |  ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964882 aacgagttacaaccaaatccaaactttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 13964783  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13964782 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccgcctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggta 13964683  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13964682 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 13964645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 171 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 22150403 - 22150036
Alignment:
Q  171 acatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccg 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22150403 acatccatatgcttcaacggaagacaaacaagacccaactcaaaattaacataaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccg 22150304  T
Q  271 aaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagc 370  Q
    |||| ||||| ||||| |  || ||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||| || ||||    
T  22150303 aaccgctagccggggtatcaataaccgttccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacagctaaccaagataaaagaatgactagc 22150204  T
Q  371 accaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaac 470  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22150203 accagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagattatctggttgctccacctcctcagcattcaaagcaaac 22150104  T
Q  471 acctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||         ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22150103 acttttcccgccgccttcttcggcttgg---------tactaatgtgacccttctctccacaattgtagcaagtaat 22150036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 304 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15944128 - 15943885
Alignment:
Q  304 gcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtact 403  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15944128 gcaacaaagaagttacaaccaaattcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtact 15944029  T
Q  404 attgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacac 503  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15944028 attgataaaacacatacctcgtataagattatccggctgctccacctcctccgcatttaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacac 15943929  T
Q  504 ttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15943928 ttagtactaatatgacccttctctccgcaattgtaacaagtaat 15943885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15948297 - 15948014
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15948297 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaatctcttatctaactcttctaccggcttagaaaactttac 15948198  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15948197 actcttagtcaa-caattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttaaacggaagacaaacaagatccaac 15948099  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15948098 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgttgatga 15948014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 253
Target Start/End: Original strand, 15612444 - 15612658
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  15612444 aaagacttcttcacttgccccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcctagtcaaacaattaatgctaaccc 15612543  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15612544 caaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 15612643  T
Q  239 acacttagcacacac 253  Q
    |||||||||||||||    
T  15612644 acacttagcacacac 15612658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 30140119 - 30140359
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  30140119 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30140218  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30140219 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30140318  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcaca 250  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  30140319 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttaacaca 30140359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 12795916 - 12796092
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  12795916 tcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaacggcttagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 12796015  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796016 taacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacat 12796092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 16258822 - 16258998
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  16258822 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 16258921  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16258922 taacaaccaatccataccaaaaataacatccatattcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 16258998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 18915406 - 18915582
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||     
T  18915406 tcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaacgttacactcttagtaaaacaattaatgataacaccaaaagc 18915505  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  18915506 taacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagccaaacaagatccaactcaaagtcaacat 18915582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3296171 - 3295969
Alignment:
Q  40 aagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaacccc 139  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | | |||||  || | || || |||| ||| || || ||||| |||||  ||||||     
T  3296171 aagacttcttcagtttctccgcggtcaagaacttcccacctaccacatctactagcgtagagaatgttatacttttggttaaacagttaatgttaaccca 3296072  T
Q  140 aaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagga 239  Q
    |||||||| |||| | ||||| || || ||||||| ||||| |  |||||| |  || || | |||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  3296071 aaaagatagcatccagtccattccgaatatcacattcatatgcaccaacggcaagcaaactaaatccaattcaaaatcaacgttgccaaaattaatagga 3295972  T
Q  240 cac 242  Q
    |||    
T  3295971 cac 3295969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29680922 - 29680861
Alignment:
Q  120 aaacatttaatactaacccc-aaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatat 180  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29680922 aaacaattaatattaacccccaaaagataacatctaatccattccaaaaatcacatccatat 29680861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 10408626 - 10408677
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10408626 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 10408677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12509954 - 12509903
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12509954 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 12509903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 28756977 - 28757028
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28756977 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 28757028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 47126602 - 47126653
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47126602 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 47126653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31692647 - 31692605
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31692647 gagtagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtactatt 31692605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22739760 - 22739237
Alignment:
Q  32 accgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaata 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  22739760 accgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtctagaacttcctatctaactcttccaccggcttcgaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatg 22739661  T
Q  132 ctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatat 231  Q
    ||||||||||||  ||| | | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22739660 ctaaccccaaaaattaataaccattccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattacaaaaat 22739561  T
Q  232 taacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22739560 taacaggacacttagcacacataaaagaagtagttaccgaaccgctagccgaggtgtcgataaccatcccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaa 22739461  T
Q  332 atgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataaga 431  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  22739460 acgcacaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctctgataaat 22739361  T
Q  432 ttatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccac 531  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  22739360 ttatccggctgctccacttcctccgcattcaaagcaaacacctttcctgccgccttcttcggcttggtacacttagtactaatatgacccttctctccac 22739261  T
Q  532 aattgtagcaagtaatattcttcg 555  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  22739260 aattgtagcaagtaacatccttcg 22739237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 22280420 - 22280957
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22280420 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaagatctcttcacttgttccgcggtcaagaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 22280519  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22280520 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 22280619  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  22280620 tcaaaatcaacattacctaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 22280719  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22280720 aaggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaatgaatgactagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 22280819  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22280820 aaaacacatacctctgataagattatcctgctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggctttgtacacttagta 22280919  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22280920 ctaatatgacatttctctccacaattgtaacaagtaat 22280957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 410
Target Start/End: Original strand, 25130924 - 25131324
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  25130924 acatcataaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaacgttat 25131023  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25131024 actcttggttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 25131123  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||    
T  25131124 tcaaaatcaatattaccaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatccctcgcgaca 25131223  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    |||||||||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25131224 acggagttacaaccaaattcagacgttaaacacaactaaccgagatagaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaatgagtactattgat 25131323  T
Q  410 a 410  Q
    |    
T  25131324 a 25131324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24567796 - 24567425
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24567796 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 24567697  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  24567696 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttccatggaagacacacaagatccaac 24567597  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||  |||||||  || | |||  |  ||||||    
T  24567596 tcaaaatcaacagtaccaaaatcaacaggacacttagcacacataaaagaagttgtcatcgaaccgctagtcggggtgtcaataatcattccctgcaaca 24567497  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaa 381  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  24567496 aaggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcactagtatcaa 24567425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24829316 - 24829105
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24829316 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaacgttac 24829217  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24829216 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaacggaagaca-aaaagatccaac 24829118  T
Q  210 tcaaaatcaacat 222  Q
    |||||||||||||    
T  24829117 tcaaaatcaacat 24829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12638994 - 12638818
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||  |||| || |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  12638994 tcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttacaaaaagtcacactcctagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagc 12638895  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12638894 taacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactcaaaatcaacat 12638818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25878668 - 25878531
Alignment:
Q  113 cttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactca 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25878668 cttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaattcataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactca 25878569  T
Q  213 aaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcaca 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25878568 aaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacaca 25878531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12644589 - 12644485
Alignment:
Q  118 tcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatc 217  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12644589 tcaaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactcaaaatc 12644490  T
Q  218 aacat 222  Q
    |||||    
T  12644489 aacat 12644485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 34821567 - 34821675
Alignment:
Q  112 tcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactc 211  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34821567 tcttagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaa-tcgcatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactc 34821665  T
Q  212 aaaatcaaca 221  Q
    ||||||||||    
T  34821666 aaaatcaaca 34821675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 23113394 - 23113434
Alignment:
Q  366 gtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23113394 gtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 23113434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 26109 - 26646
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  26109 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 26208  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26209 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 26308  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  26309 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 26408  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26409 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 26508  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26509 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggta 26608  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  26609 ctaatatgacccttctctcgacaattgtagcaagtaat 26646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 546
Target Start/End: Original strand, 4442624 - 4443136
Alignment:
Q  34 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatact 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||    
T  4442624 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcccacctaagtcatctaccagcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgct 4442723  T
Q  134 aaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatatta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  4442724 aaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaactcaaaatcaatgttaccaaaatta 4442823  T
Q  234 acaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaat 333  Q
     || ||||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4442824 gcatgacacctagcacacactaaggaagtagttaccgaaccactagccggggtgtcaatgaccatccctcgcaacaacggagttacaaccaaattcaaac 4442923  T
Q  334 gctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagatt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4442924 gctcaacacaactaaccgaggtagaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagatt 4443023  T
Q  434 atttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaa 533  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||  ||||||    
T  4443024 atccggctgctccacttcctccacatacaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttagaactgatatgacctttctcaccacaa 4443123  T
Q  534 ttgtagcaagtaa 546  Q
    ||||| |||||||    
T  4443124 ttgtaacaagtaa 4443136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27105371 - 27104836
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27105371 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 27105272  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27105271 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27105172  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  27105171 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 27105072  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105071 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 27104972  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  27104971 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 27104872  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  27104871 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 27104836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Original strand, 7826573 - 7827108
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  7826573 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 7826672  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7826673 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 7826772  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  7826773 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 7826872  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826873 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 7826972  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  7826973 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 7827072  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  7827073 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 7827108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Original strand, 27172954 - 27173489
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  27172954 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 27173053  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27173054 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27173153  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  27173154 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 27173253  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||   |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173254 aaggagttacaaccaaacccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 27173353  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  27173354 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 27173453  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  27173454 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 27173489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 34 - 538
Target Start/End: Original strand, 13458732 - 13459234
Alignment:
Q  34 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatact 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||    
T  13458732 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcagtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 13458831  T
Q  134 aaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatatta 233  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13458832 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatggttcaacggcatacacacaaaatccaactcaaaatcaacattaccaaaatta 13458931  T
Q  234 acaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaat 333  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  13458932 acaggacacttagcacact--aaagaagtagtcacctaaccactagccggggtgttgatgaccatccctcgcaacaacagagttacaactaaattcaaat 13459029  T
Q  334 gctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagatt 433  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13459030 gctcaacacaactaaccgaaataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggagaagatt 13459129  T
Q  434 atttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaa 533  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||    
T  13459130 atccgtctgctccacttcctccgcattcaatgcaaacacttttcccgtcaccttcttcaacttggtacacttagtactgatatgacccttctcgccacaa 13459229  T
Q  534 ttgta 538  Q
    |||||    
T  13459230 ttgta 13459234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 17926292 - 17926501
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||| ||||| ||||     
T  17926292 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaggacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttccctcctacctcagctaccggcttcgaaaatgttat 17926391  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17926392 actcttgattaaacaattaatgctaacaccaaaagacaacattcaatccataccagagatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaggatccaac 17926491  T
Q  210 tcaaaatcaa 219  Q
    ||||||||||    
T  17926492 tcaaaatcaa 17926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 280 - 475
Target Start/End: Original strand, 14207264 - 14207456
Alignment:
Q  280 ctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatc 379  Q
    ||||||| | |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||   |||  | ||||||| ||| |||     
T  14207264 ctggggtatcgatgaccattccacgcgacaacggagttacaaccaaattcaaacgttcaacacaactaaccgagaccaaa--atgagtagcgccagtatt 14207361  T
Q  380 aataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctt 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  14207362 aataattgcaattaaaggagtactattgataaaacacatacctc-aataagattatatggctgctccacttactccgcattcaaagcgaacacctt 14207456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 280 - 475
Target Start/End: Original strand, 14215954 - 14216146
Alignment:
Q  280 ctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatc 379  Q
    ||||||| | |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||   |||  | ||||||| ||| |||     
T  14215954 ctggggtatcgatgaccattccacgcgacaacggagttacaaccaaattcaaacgttcaacacaactaaccgagaccaaa--atgagtagcgccagtatt 14216051  T
Q  380 aataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctt 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  14216052 aataattgcaattaaaggagtactattgataaaacacatacctc-aataagattatatggctgctccacttactccgcattcaaagcgaacacctt 14216146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 11284627 - 11284726
Alignment:
Q  154 aatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacac 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11284627 aatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaaaatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 11284726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 505
Target Start/End: Original strand, 22034950 - 22035165
Alignment:
Q  290 gatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgca 389  Q
    |||||||||  ||| ||| || ||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||| |||| | |||||| | ||||||| | |||||| | |||||    
T  22034950 gatgaccatccctctcaagaatggagttaaaaccaaattcaaaggttcaacacaactaagcgagatgaaagaatgcgtagcacaagtatcaacatttgca 22035049  T
Q  390 atcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttct 489  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||  ||||    |||||||    
T  22035050 atcaaatgagtactattgataaaacacatacctcatattaaattatccggctgctccacgtcctcaacattcaatgcaaaaactcttcccatggccttct 22035149  T
Q  490 tcggcttggtacactt 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  22035150 tcggcttggtacactt 22035165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17142582 - 17142404
Alignment:
Q  327 ttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcgga 426  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||   ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||| ||||  |    
T  17142582 ttcaaacgttcaacacaactaagcgagataaaagaatgaaaagcacccgaatcaataattgcaatcaattgaatactgatgataaaacacatccctcaaa 17142483  T
Q  427 taagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacactt 505  Q
    | | |||||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  17142482 ttaaattattcgtctgcttcacctcttctgcattcaatgcaaagacctttcctcccgccttcttcggtttggtacactt 17142404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 423
Target Start/End: Original strand, 17131545 - 17131758
Alignment:
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||| || ||  ||||||||||||| | | | |  ||||| | |||||||||   || |||||    
T  17131545 tcaaaatccacatttccaaaattaacaagacacttaacacaaaccaaggaagtagtcaccgagctattggtcggggtatcgatgaccatccatctcaaca 17131644  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
     |||||| | ||| |  |||||| | ||  || |||||| |||  |||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  17131645 tcggagtcataacaatattcaaacgttccgcacaactaagcgatataaaagaatgggtagcacccgtatcaataattacaatcaatggagtactgttgtt 17131744  T
Q  410 aaaacacatacctc 423  Q
    ||||||||||||||    
T  17131745 aaaacacatacctc 17131758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 21755431 - 21755482
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21755431 taaaacaatgagtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactatt 21755482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26115820 - 26115769
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26115820 taaaacaatgagtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactatt 26115769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13965898 - 13965847
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13965898 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 13965847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26092028 - 26091977
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26092028 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 26091977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40925047 - 40924996
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40925047 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 40924996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 49155320 - 49155371
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49155320 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 49155371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 554
Target Start/End: Original strand, 14218206 - 14218279
Alignment:
Q  481 ccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaatattcttc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || |||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  14218206 ccgccttcttcggcttggtacacttagtactgatatggcctgcctctccacagttgaaacaagtaatatccttc 14218279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 39 - 546
Target Start/End: Original strand, 16100592 - 16101099
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  16100592 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaggaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatggtaaccc 16100691  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16100692 taaaagctaacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacgcaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 16100791  T
Q  239 acacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctca 338  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16100792 acacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaaacgctca 16100891  T
Q  339 acaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttg 438  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  16100892 acacaactaaccgagataaaaaaatgagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacaaatacttcggataagattatccg 16100991  T
Q  439 gctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgta 538  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16100992 gttgctccacctcttccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttagtactaatatgacccttctctccacaattgta 16101091  T
Q  539 gcaagtaa 546  Q
    ||||||||    
T  16101092 gcaagtaa 16101099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 10 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16380106 - 16379571
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  16380106 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 16380007  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16380006 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16379907  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  16379906 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 16379807  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379806 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 16379707  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  16379706 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctcggcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 16379607  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagta 545  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16379606 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagta 16379571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16647702 - 16647165
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  16647702 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcatatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 16647603  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16647602 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16647503  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||  | |||||||    
T  16647502 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgtcaataaccattccacgcaaca 16647403  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    |  ||||||||||||| | |||| | | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647402 aatgagttacaaccaaatccaaacgtttaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 16647303  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16647302 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggta 16647203  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16647202 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 16647165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 410
Target Start/End: Original strand, 18401219 - 18401593
Alignment:
Q  36 tccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  18401219 tccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgataa 18401318  T
Q  136 ccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaac 235  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18401319 cccaaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagacacaagatccaactcaaaatcaacattaccgaaattaac 18401418  T
Q  236 aggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgc 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||   ||||||  || |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  18401419 aggacacttagcacacataaaagaagtagtcactgaaccgctagtcagggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttccaaccaatttcaaacgt 18401518  T
Q  336 tcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgata 410  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18401519 tcaacacaactaaccgagataaaagtatcagtaacaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgata 18401593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1646547 - 1646239
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||| || ||    
T  1646547 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaattcttctaccggcttagaaaaagtcac 1646448  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1646447 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagaaaaacaagatccaac 1646348  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  1646347 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 1646248  T
Q  310 acggagtta 318  Q
    | |||||||    
T  1646247 aaggagtta 1646239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23025471 - 23025251
Alignment:
Q  33 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  23025471 ccgtccaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttacactcttggttaaacaattaatgc 23025372  T
Q  133 taaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23025371 taaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacgcacaagatccaactcaaaatcaatgttaccaaaatt 23025272  T
Q  233 aacaggacacttagcacacac 253  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  23025271 aacaagacacttagcacacac 23025251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 253
Target Start/End: Original strand, 16234943 - 16235149
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  16234943 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 16235042  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacactta 245  Q
    ||||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16235043 taacaaccaatccaaaacaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaa-attaacaggacactta 16235141  T
Q  246 gcacacac 253  Q
    ||||||||    
T  16235142 gcacacac 16235149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 547
Target Start/End: Original strand, 14149316 - 14149492
Alignment:
Q  371 accaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaac 470  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14149316 accagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatcgataaaacacatacctcggataagattatccagttgttccacttcctccgcattcaatgcaaac 14149415  T
Q  471 acctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14149416 accttccctgccgccttcttcggcttggtacaattagtactgatatgacccttctcaccacaattgtaacaagtaat 14149492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 18578098 - 18578212
Alignment:
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18578098 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 18578197  T
Q  239 acacttagcacacac 253  Q
    |||||||||||||||    
T  18578198 acacttagcacacac 18578212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 374
Target Start/End: Original strand, 14133824 - 14133993
Alignment:
Q  190 gaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgtt 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||               ||||||||     
T  14133824 gaagacacacaagatccagctcaaaatcaaccttaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagt---------------tggggtgtc 14133908  T
Q  290 gatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcacca 374  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14133909 aatgaccatccctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcacca 14133993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18836262 - 18836178
Alignment:
Q  138 ccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18836262 ccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacagacaagatccaactcaaaatcaacat 18836178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19985808 - 19985697
Alignment:
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    ||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19985808 caaaagaaaacaaccaattcatacaaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaggatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 19985709  T
Q  239 acacttagcaca 250  Q
    ||||||| ||||    
T  19985708 acacttaacaca 19985697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 14131076 - 14131171
Alignment:
Q  99 gaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaaga 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  14131076 gaaaacgtgacactcttggtcaaacaattaatacaaactccaaaagataacatccaatccataccaaagatcacatccatatgtttcaatggaaga 14131171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 458 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21412811 - 21412714
Alignment:
Q  458 attcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaatattcttcg 555  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  21412811 attcaaagcaaacactgttcccgccgccttcttcgacttgatacacttagtactaatataacccttctctccacaattgtatcaagtaacatccttcg 21412714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 70
Target Start/End: Original strand, 14131018 - 14131078
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaa 70  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14131018 acatcataaacacacaagcttcaccgtcgaaagacttcttcacttgctccgcggtctagaa 14131078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18182744 - 18182705
Alignment:
Q  366 gtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactat 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18182744 gtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactat 18182705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 430
Target Start/End: Original strand, 21474502 - 21474568
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataag 430  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||    
T  21474502 gagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaaatacctctgataag 21474568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 33 - 547
Target Start/End: Original strand, 7893 - 8407
Alignment:
Q  33 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |    
T  7893 ccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaatgttacacttctggtcaaacaattaatgc 7992  T
Q  133 taaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatatt 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7993 taaccccaaaagagaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaacttaaaatcaacatcaccaaaatt 8092  T
Q  233 aacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaa 332  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | || ||||| || |||||||||| |||||||    
T  8093 gacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccggaacaaaggggttacaaccattttcaaa 8192  T
Q  333 tgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagat 432  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8193 cgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagat 8292  T
Q  433 tatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccaca 532  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |    
T  8293 tattcggctgctccacttcttccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggattggtacacttagtactaatatgacccttctctccaga 8392  T
Q  533 attgtagcaagtaat 547  Q
    |||||||||||||||    
T  8393 attgtagcaagtaat 8407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 45 - 547
Target Start/End: Original strand, 90250 - 90752
Alignment:
Q  45 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaag 144  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  90250 ttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctatcggcttagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaag 90349  T
Q  145 ataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacactt 244  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  90350 ctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatacgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacactt 90449  T
Q  245 agcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaa 344  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||  || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  90450 agcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgccagccggggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaa 90549  T
Q  345 ctaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgct 444  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||    
T  90550 ctaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagattatccggttgct 90649  T
Q  445 ccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  90650 ccacctcctccgcattcaaagcatacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttagtactaatataacctttctctccacaattgtatcaagt 90749  T
Q  545 aat 547  Q
    |||    
T  90750 aat 90752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 35 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 21420 - 20930
Alignment:
Q  35 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatacta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||    
T  21420 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 21321  T
Q  135 accccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaa 234  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||                     ||||||| |||||    
T  21320 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacacaca---------------------ttaccaaaattaa 21242  T
Q  235 caggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatg 334  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |  |||||| |    
T  21241 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatccctcgcaacaacagagttacaac-atgttcaaacg 21143  T
Q  335 ctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagatta 434  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21142 gtcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccactatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagatta 21043  T
Q  435 tttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaat 534  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  | |||||    
T  21042 tccggctgctccacttcctccgcaatcaaagcaaacacctttcctgccgccttctttggcttggtacacttagtactgatatgtcctttctcacaacaat 20943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 35 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30996 - 30506
Alignment:
Q  35 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatacta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||    
T  30996 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 30897  T
Q  135 accccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaa 234  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||                     ||||||| |||||    
T  30896 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacacaca---------------------ttaccaaaattaa 30818  T
Q  235 caggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatg 334  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |  |||||| |    
T  30817 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatccctcgcaacaacagagttacaac-atgttcaaacg 30719  T
Q  335 ctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagatta 434  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30718 gtcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccactatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagatta 30619  T
Q  435 tttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaat 534  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  | |||||    
T  30618 tccggctgctccacttcctccgcaatcaaagcaaacacctttcctgccgccttctttggcttggtacacttagtactgatatgtcctttctcacaacaat 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 132080 - 131543
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  132080 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 131981  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  131980 actcctagtcaaacaatttattctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 131881  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  131880 ttaaaattaacattaccaaaattaataggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 131781  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  131780 aaggagttacaaccaatttcaaacgatcaacacaactaaccgagataaaataatgagtagcacaagtatcaataattgcaatcaaaggagttctattgat 131681  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  131680 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttagta 131581  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  131580 ctaatatgacccttctctccacaattgtagcaagtaat 131543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 26490 - 27026
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26490 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 26589  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26590 actcttagtcaaacaattactgctaaccccaaaagctaacaaccaatctataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 26689  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| | |||||||    
T  26690 tc-aaattaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccataccacgcaaca 26788  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||| ||||||||   ||||   | |||| ||||||  ||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789 aaggagtaacaaccaaaaacaaacaataaacacaactaaaagagataaaagaataagtagcaacagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 26888  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26889 aaaacacatacctcggataagattatccggttgctccacttcctccgcattcaaagcaaacaccttttccgcccccttcttcggcttggtaaacttagta 26988  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26989 ctaatatgacctttctctccacaattgtagcaagtaat 27026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 39 - 547
Target Start/End: Original strand, 14999359 - 14999867
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14999359 aaagacttcttcacttgctccgcggccaagaacctcttatctaacccttctaccggcttacaaaacgttacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 14999458  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14999459 caaaagctaataacaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaacagg 14999558  T
Q  239 acacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctca 338  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||| |||||||||||||| | |||| | |||    
T  14999559 acacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttacaaccaaatccaaacgttca 14999658  T
Q  339 acaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttg 438  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14999659 acacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacgcatacctcggataagattatctg 14999758  T
Q  439 gctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgta 538  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14999759 gctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggtactaatatgacccttctctccacaattgta 14999858  T
Q  539 gcaagtaat 547  Q
     ||||||||    
T  14999859 acaagtaat 14999867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15290746 - 15290209
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatct-accgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgtta 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| || |    
T  15290746 acatcataaacacacaag-tctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtca 15290648  T
Q  109 cactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaa 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15290647 cactcctagtcaaacaattaacgctaaccccaaaagcgaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaa 15290548  T
Q  209 ctcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | ||||||    
T  15290547 ctcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaac 15290448  T
Q  309 aacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattga 408  Q
    || |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290447 aaaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccactatcaataattgcaatcaaaggagtactattga 15290348  T
Q  409 taaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||  |    
T  15290347 taaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacttcctccgcgttcaaagaaaacacctttctcgccgccttcttcggttgggtacacttggt 15290248  T
Q  509 actaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15290247 actaatatgacccttctctccataattgtagcaagtaat 15290209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12340420 - 12339909
Alignment:
Q  45 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  ||||| || || |||| |||||| || || || || ||  |||| |||||||    
T  12340420 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctacctcctccaatggcttagataatgttatactcttggttaagcaattgatgttaacaccaaaag 12340321  T
Q  145 ataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacactt 244  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||    
T  12340320 acaacatctagtccataccaaaaatcacgtccatgtgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaagtcaacattaccagagttaacatgacactt 12340221  T
Q  245 agcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaa 344  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||    
T  12340220 agcgcacaccaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggtgtcgatgaccctccctcgcaacaacggagtcacaaccaaattcaaacgttcaacacaa 12340121  T
Q  345 ctaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat--aaaacacatacctcggataagattatttggctg 442  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  12340120 ctaaccgagataaaagaatgagtaggaccaatatcaataatcgcaatcaaaggagtactattgataaaaaatacatacctcggatgagattatcttgttg 12340021  T
Q  443 ctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaa 542  Q
     || || || || ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   || ||| || ||||| |||    
T  12340020 ttcgacctcatccgcattcaaatcaaacaccttacccgacgccttcttcggtttggtacacttagtactgatatgacctgactctccgcagttgtaacaa 12339921  T
Q  543 gtaatattcttc 554  Q
    ||||||| ||||    
T  12339920 gtaatatccttc 12339909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Original strand, 9292850 - 9293093
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| | ||| || ||    
T  9292850 acatcatgaacacacaagtttcaccgtccaaaaacttcttcacttgctccgtggtcaagaacttcctatccaactctcctaccagcttcggaaaagtcac 9292949  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9292950 actcttagtcaaacaattaatgctaacctcaaaagctaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 9293049  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacac 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9293050 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 9293093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15139257 - 15139015
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  15139257 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttctttacttgctccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagtcac 15139158  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15139157 actcctagtcaaacaattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaattacatccataagcttcaacggaagaca-acaagatccaac 15139059  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacac 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15139058 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 15139015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3262037 - 3261986
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3262037 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 3261986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 7357296 - 7357347
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7357296 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 7357347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11204475 - 11204424
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11204475 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 11204424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29450780 - 29450729
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29450780 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 29450729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 23676 - 24213
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  23676 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23775  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23776 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 23875  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  23876 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 23975  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 24075  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24076 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctctgcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 24175  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24176 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 24213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 10 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6596 - 6061
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||     
T  6596 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttattcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttat 6497  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6496 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaacacacacaagatccaac 6397  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaata-ttaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaac 308  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  6396 tcaaaatcaacattaccaaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcactgaaccactagccggggtgtcgatgaccattcctcgcaat 6297  T
Q  309 aacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattga 408  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6296 aacggagtcacaaccaaattcaaacgctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaattattgcaatcaaagtagtactattga 6197  T
Q  409 taaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatt 508  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6196 taaaacacatacctcagataagattatccggctgctccacttcctccgcattcaatgcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttagt 6097  T
Q  509 actaatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6096 actgatatgacccttcttaccacaattgtaacaagt 6061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 41 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1181 - 678
Alignment:
Q  41 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaacccca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1181 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttttaccggcttagaaaacgttacactcttagtcaaacaattaatgctaacccca 1082  T
Q  141 aaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggac 240  Q
     ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1081 gaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcagtattaccaaaattaacaggac 982  T
Q  241 acttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaac 340  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  |  || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||     
T  981 acttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcaataaccatcccctgcgacaaaggagttacaaccaatttcaaacgttcaat 882  T
Q  341 aaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggc 440  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  881 acaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcagataagattatccggc 782  T
Q  441 tgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagc 540  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  781 tgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggtttggtacacttggtactaatatgacctttctctccacaattataac 682  T
Q  541 aagt 544  Q
    ||||    
T  681 aagt 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 312 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13620 - 13388
Alignment:
Q  312 ggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataa 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620 ggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataa 13521  T
Q  412 aacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattact 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  13520 aacacatacctctgataagattatccggctgctccacctcttccgcattcaaagcaaacacctttcccgccgccttcttcggtttggtacacttggtact 13421  T
Q  512 aatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  13420 aatatgacctttctctccacaattataacaagt 13388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 12679
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  13216 acatcataaacacataagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13117  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13116 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaattcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13017  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  13016 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcactaaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 12917  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| |  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12916 aaggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagtattagtatctccattatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 12817  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  12816 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaatcacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggta 12717  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  12716 ctaatatgaactttctctccagaattgtaacaagtaat 12679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1543 - 1006
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||| | ||| || ||    
T  1543 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaaccgttctatcggcttaggaaaagtcac 1444  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1443 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaac 1344  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||   ||||| ||| |||||  | |||||||    
T  1343 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaacgctagccaaggtgtcgataaccattccccgcaaca 1244  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1243 aaggagttacgaccaatttcaaacgttcaacacaactaatcgagataaaagaatgagtagcaccagtatctataattgcaatcaaaggagtactattgat 1144  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1143 aaaacacatacctcggataagattatccagctgctccacttcctccgcattcaaagcaaacacctttcccaccgccttcttcggcttggtacacttagta 1044  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1043 ctaatgtgacccttctctccacaattgtagcaagtaat 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 74187 - 73651
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||  ||||||||| ||||| |||||    
T  74187 acatcataaacacacaagctc-accatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 74089  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  74088 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 73989  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | ||||| |    
T  73988 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaata 73889  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73888 gaggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaacaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 73789  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  73788 aaaacacatacctcatataagattatccggttgctccacctcctcgacattcaaagcaaacacctttcccaccgccttcttcggcttggtacacttagta 73689  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  73688 ctaatatgacccttctctccgcaattgtagcaagtaat 73651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 78568 - 78032
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||  ||||||||| ||||| |||||    
T  78568 acatcataaacacacaagctc-accatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 78470  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  78469 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 78370  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | ||||| |    
T  78369 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaata 78270  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78269 gaggagttacaaccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaacaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 78170  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  78169 aaaacacatacctcatataagattatccggttgctccacctcctcgacattcaaagcaaacacctttcccaccgccttcttcggcttggtacacttagta 78070  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  78069 ctaatatgacccttctctccgcaattgtagcaagtaat 78032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 241 - 547
Target Start/End: Original strand, 181934 - 182240
Alignment:
Q  241 acttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaac 340  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | ||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  181934 acttagcagacataaatgaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaaaaaggagttacaacgaatttcaaacgttcaac 182033  T
Q  341 aaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggc 440  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  182034 acaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatccggc 182133  T
Q  441 tgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagc 540  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  182134 tgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcacgccgccttcttcggcttggtacacttagtactaatctgacccttctctccacaattgtagc 182233  T
Q  541 aagtaat 547  Q
    |||||||    
T  182234 aagtaat 182240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 176079 - 175701
Alignment:
Q  35 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatacta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||| |||||  |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| |||    
T  176079 gtccaaagacttcttcacttgctccaaggtcaacaacttcccacctacctcatctactagcttagagaaagttatactcttggttaaacaattaatgcta 175980  T
Q  135 accccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaa 234  Q
    || | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  175979 acactaaaagacaacatccagtccataccaaaaatcacatccatgtgctttaacggaagaaacacaagaaccaactcaaaatcaacattaccaaagttaa 175880  T
Q  235 caggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatg 334  Q
    | |||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  175879 cgggacacttagaacacctcaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggtatcgatgaccattcctcacaataacggagtcacaaccaaattcaaacg 175780  T
Q  335 ctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaa 413  Q
     | |||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175779 tttaacacaactaacggagatgaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaa 175701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 36 - 547
Target Start/End: Original strand, 24917 - 25429
Alignment:
Q  36 tccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24917 tccaaggacttcttcacttgctttgcagtcaagaacttcctatctaactcttcaaccggctttgaaaaagttacactcttcgtcaaacaattaatgctaa 25016  T
Q  136 ccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaac 235  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25017 ccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaat 25116  T
Q  236 aggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgc 335  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25117 aggacatttagcacccataaaagaagtagtcaccgatccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaaacgc 25216  T
Q  336 tcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat-aaaacacatacctcggataagatta 434  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25217 tcaacataactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaattaaaggagtactattgataaaaacacatacctcggataagatta 25316  T
Q  435 tttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaat 534  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25317 tccggttgctccagttcctccgcattcaaagcaaacgcctttcttgccgccttctccggctttgtacacttagtactaatatgacccttctctccacaat 25416  T
Q  535 tgtagcaagtaat 547  Q
    |||||||||||||    
T  25417 tgtagcaagtaat 25429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 23508282 - 23508810
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  23508282 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23508381  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23508382 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 23508481  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  23508482 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacacacataaaagaagtagtcaccaaaccgctagccggggtgttaataaccattccccgcaaca 23508581  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508582 aaggagttacagccaatttcaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 23508681  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23508682 aaaacacatacctcggataagattatccgactgctcc---------gcattcaaagcaaacacctttcccgctgccttcttcggcttggtacacttagta 23508772  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  23508773 ctaatatgactcttctctccacaattgtagcaagtaat 23508810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 24583808 - 24584336
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  24583808 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggttaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 24583907  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24583908 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 24584007  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  24584008 tcaaaatcaatatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 24584107  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584108 aaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 24584207  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||         ||    
T  24584208 aaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctccgcattcaaagcaaacacctttcccgctgccttcttcggcttgg---------ta 24584298  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24584299 ctaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 24584336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21934958 - 21934643
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  21934958 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 21934859  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21934858 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21934759  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||  || |||||  | |||||||    
T  21934758 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccagggtgtcaataaccattccacgcaaca 21934659  T
Q  310 acggagttacaaccaa 325  Q
    | ||||||||||||||    
T  21934658 aaggagttacaaccaa 21934643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 23505202 - 23505383
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23505202 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccgacttcgaaaa-gtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 23505300  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    |||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23505301 caaaagctaacaatcaatccatac-aaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacat 23505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14884416 - 14884365
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14884416 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 14884365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 20345225 - 20345276
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20345225 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 20345276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 22505622 - 22505673
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22505622 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 22505673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 431
Target Start/End: Original strand, 25851015 - 25851091
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataaga 431  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||||  |||||| |||||||    
T  25851015 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataaga 25851091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5895 - 5380
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5895 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaactttctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 5796  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||     
T  5795 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatcaaat 5696  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  5695 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaactgctagcaggggtgtcaataaccattccccgcaaca 5596  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5595 aaggagttataaccaatttcaaacgctcaacataactaaccaagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 5496  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5495 aaaacacataccacgaataagattatccggttgctccgcctcctccgcattcaaagcaaacacttttcccgccgccttcttcggcttggtacacttagta 5396  T
Q  510 ctaatatgaccattct 525  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5395 ctaatttgacctttct 5380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 544
Target Start/End: Original strand, 34798 - 35332
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  34798 acatcataaacacacaagcttcaccatccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaatttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 34897  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34898 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 34997  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  34998 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccacgcaaca 35097  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35098 aaggagttacaaccaaatacaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 35197  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  35198 aaaacacatacctcggataagattatccggctgttccacctcttctgcattcaaagcaaacactttccccaccgccttctttggcttggtacaattggta 35297  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  35298 ctaatatgacccttctctccacaattatagcaagt 35332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 5397 - 4859
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| |||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5397 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 5298  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5297 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 5198  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactag-ctggggtgttgatgaccatatctcgcaac 308  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||  || |||||  | ||||||    
T  5197 acaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccgggggtgtcaataaccattccacgcaac 5098  T
Q  309 aacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattga 408  Q
    || |||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5097 aaaggagttacaaccaaatccaaacgttcaacacaactagccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcgataattgcaatcaaaggagtattattga 4998  T
Q  409 taaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  4997 taaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacctcctctgcgttcaaagcaaacacctttcccgccgccttctttggcttggtacacttggt 4898  T
Q  509 actaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4897 actaatatgacccttctctccacaattgtaacaagtaat 4859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 547
Target Start/End: Original strand, 926 - 1461
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| ||||  || ||    
T  926 acatcataaacacacaagcttctccgtccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattcttctatcggcttagaaa--gtcac 1023  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1024 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagaaacaagatccaac 1123  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||    
T  1124 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaaca 1223  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1224 aaggagttacaaccaaaaacaaacgttcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgaaatcaaaagagtactattgat 1323  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1324 aaaacacatacctcggataagattatccagctgctccagctcctccgcattcaaagcaaacacctttgccgctgccttcttcggcttggtacacttagta 1423  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1424 ctaatatgacctttctctccacaattgtaacaagtaat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 39 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 7423 - 6914
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7423 aaagatttctccacttgcttcgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaataagtcacactcctagtcaaacaattaatactaaccc 7324  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  7323 caaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaactgg 7224  T
Q  239 acacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctca 338  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  7223 acatttagcacacataaag-aagtagtcactgaaccgctagccggggtgtcaataaccattccccgcaacaaaggagttacaaccaatttcaaacgatca 7125  T
Q  339 acaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttg 438  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7124 acgcaactaaccgagataaaagaataagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatccg 7025  T
Q  439 gctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattacta--atatgaccattctttccacaattg 536  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||     
T  7024 gctgctccacctcctctacattcaaagtaaacacctttcccgccgccttcttcggcttggtacacttggtactaatatatgacccttctctccacaatta 6925  T
Q  537 tagcaagtaat 547  Q
    |||||||||||    
T  6924 tagcaagtaat 6914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 4493 - 3958
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  4493 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgttcagcggtcatgaacttcctatctaactcctctaccggcttagaaaaagttac 4394  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 4294  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaaca 309  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||  | |||||||    
T  4293 tcaaagtcaacattaccaaaattaacagggcatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtatcaataaccattccccgcaaca 4194  T
Q  310 acggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgat 409  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4193 aaggagttacaaccaatttcaaacgctcaacacaattaatcgagataaaagaatgagtagcaccagtatcgataattgcaatcaacggagtactattgat 4094  T
Q  410 aaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttatta 509  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4093 -aaacacatagctcagataagattatctagctactccacctcctccgcgttcaaagaagacacttttcccgccgccttcttcggcttggtacacttagta 3995  T
Q  510 ctaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaa 546  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  3994 ctgatatgacccttctcaccacaattgtaacaagtaa 3958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 544
Target Start/End: Original strand, 15654 - 16157
Alignment:
Q  41 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaacccca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  15654 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgctagcccca 15753  T
Q  141 aaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggac 240  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15754 aaagctaacaaccaatccataccaaaactcacatccatatgcttcaacggaaggcaaacaagatccaactcaaaatcagcattaccaaaattaacaggac 15853  T
Q  241 acttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaac 340  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||   ||||||  || |||||  |   |||||| |||||||||||||| | |||| | |||||    
T  15854 atttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagacagggtgtcaataaccattccaaacaacaaaggagttacaaccaaatacaaacgttcaac 15953  T
Q  341 aaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggc 440  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15954 acaactaaccgagataaaagaataagtaacaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatgcggt 16053  T
Q  441 tgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagc 540  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||| || |    
T  16054 tgctccacctcctctgaattcaaagcaaacacttttcccgttaccttattcggcttggtacacttggtactaatatggcccttctctccacaattataac 16153  T
Q  541 aagt 544  Q
    ||||    
T  16154 aagt 16157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10765 - 10553
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  10765 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaaaatttcttcacttgttccgcgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 10666  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10665 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaatcaatccataccaaaaattacatccatattcttcaacggaagacatacaagatccaac 10566  T
Q  210 tcaaaatcaacat 222  Q
    |||||||||||||    
T  10565 tcaaaatcaacat 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 65 - 511
Target Start/End: Original strand, 2342 - 2785
Alignment:
Q  65 caagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccatacca 164  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  2342 caagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccagaagacaacatccaatccatacca 2441  T
Q  165 aaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtag 264  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  2442 aaaatcacacccatatgctttaacg-aagacacacaagatccaactcaaaatcaaaattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaggaagtag 2540  T
Q  265 tcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaag 364  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  2541 tcaccgaacaactagtcggggtgtcgatgaccatccctcgcaaaaacggagttacaaccaaattcaaacgc--aacacaactaaccgagataaaagaatg 2638  T
Q  365 agtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaa 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  2639 agtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtattattgataaaacacatacctcggataagattatccgactgctccacttcctctgcattcaat 2738  T
Q  465 gcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattact 511  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2739 gcaaacacttttcccgccgccttcttcagcttggtacacttattact 2785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 126 - 520
Target Start/End: Original strand, 3328 - 3722
Alignment:
Q  126 ttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattac 225  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3328 ttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatgtgcttcaacgaaagacacacaagatccaactctaaatcaacactac 3427  T
Q  226 caatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaa 325  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||||| |  ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||    
T  3428 caaaacgaacaagacacttagcacaccctaacgaagtagtcactgagccactggtcggggtgtcgatgaccatccctcgcaacaacagagttccaaacaa 3527  T
Q  326 tttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcgg 425  Q
     |||||| | | |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  3528 attcaaacgttgaacacaactaaccgagatgaaagaatgagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacatgttcctcag 3627  T
Q  426 ataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgacc 520  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||   |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3628 ataagattatctggttgctccacttcatccgcattcggtgcaaacactttttcctccgccttcttcggcttggtacacttagtactgaaatgacc 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 290 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26012 - 25755
Alignment:
Q  290 gatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaa-gagtagcaccaatatcaataattgc 388  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26012 gatgaccatcccacgcaacaacggagttacaatcaatttcaaacgctcaacgcaactaaccgagataaaaaaaatgagtagcactaatatcaataattgc 25913  T
Q  389 aatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttc 488  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25912 aatcaaatgagtactattgataaaacacatacctcggataagattatccggctgctccacttcttctgctttcaaagcaaacacctttcccgccgccttc 25813  T
Q  489 ttcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaa 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  25812 ttcggcttggtacacttagtactaatatgacctttctctccacaattgtaacaagtaa 25755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 3196 - 3436
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||     
T  3196 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggttaagaacttcctatctagctcttctaccggcttcgaaaacgttaa 3295  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3296 actcttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaatggaagacacacaagatccaac 3395  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcaca 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3396 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaccaca 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 2435 - 2692
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2435 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaactttctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 2534  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  2535 actcttagtgaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaaaacacacaagatctaac 2634  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtca 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2635 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcgcacataaaagaagtagtca 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 303 - 547
Target Start/End: Original strand, 2703 - 2953
Alignment:
Q  303 cgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggag--- 399  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||         
T  2703 cgcaacaaaggagttacagccaatttcaaaagctcaacacaactaaccgagataaaagaatgagtagcaccggtatcaataattgcaatcaaaggtacta 2802  T
Q  400 ---tactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggctt 496  Q
       |||||||   | |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2803 tgctactattcgcacaacacagacctcggataagattatccggttgctccacttcctccgcattcaaagcaaacacctttctcgccgccttcttcggctt 2902  T
Q  497 ggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaat 547  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2903 ggtacacttagtactaatatgacccttctctccacaattgtagcaagtaat 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Original strand, 809 - 997
Alignment:
Q  34 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatact 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  809 cgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccagcttcgaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgct 908  T
Q  134 aaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  909 aaccccaaaagataacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3520 - 3331
Alignment:
Q  33 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  3520 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatga 3421  T
Q  133 taaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3420 taaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11775 - 11586
Alignment:
Q  33 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  11775 ccgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatga 11676  T
Q  133 taaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11675 taaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 94031 - 93791
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| | | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  94031 acatcatgaacacacaagctttgccatctaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggctttgaaaaagtcac 93932  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  93931 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 93832  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcaca 250  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  93831 tccaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttaacaca 93791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17938 - 17696
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  17938 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctacggtcaaaaacttcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 17839  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17838 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagattcaac 17739  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacac 253  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17738 t-aaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacac 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 202
Alignment:
Q  11 catcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttaca 110  Q
    ||||||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  395 catcataaacacacaagcttctccgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaatgttaca 296  T
Q  111 ctcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagat 204  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  295 ctcttaatcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagat 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 46643 - 46431
Alignment:
Q  40 aagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaacccc 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  46643 aagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttattcaaaaaattaatgctaacccc 46544  T
Q  140 aaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagga 239  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  46543 aaaagctaacaactaatccatacc-aaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccgaaatttacagga 46445  T
Q  240 cacttagcacacac 253  Q
    ||||||||| ||||    
T  46444 cacttagcaaacac 46431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 249 - 455
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  249 aaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 348  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  349 caaaacctaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaacttaaaatcaacattatcaaaattaacagg 448  T
Q  239 acactta 245  Q
    |||||||    
T  449 acactta 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 53967
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  54173 aaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 54074  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54073 caaaaactaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaacttaaaatcaacattatcaaaattaacagg 53974  T
Q  239 acactta 245  Q
    |||||||    
T  53973 acactta 53967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 51583 - 51766
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  51583 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctacccaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgctaacca 51682  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  51683 caaaagctaacaaccaatccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagataaacaagatccaattcaaaatcaacat 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8199
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    ||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  8417 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 8318  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaac 209  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8317 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataaaatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8218  T
Q  210 tcaaaatcaacattaccaa 228  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8217 tcaaaatcaacatcaccaa 8199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10941 - 10757
Alignment:
Q  39 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccc 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10941 aaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaacgttacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 10842  T
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaact-caaaatcaacat 222  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10841 caaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaactccaaaatcaacat 10757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 23 - 198
Alignment:
Q  46 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttacactcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaaga 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  23 tcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtaacaatcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 122  T
Q  146 taacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 222  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  123 taacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaa-atccaactcaaaatcaacat 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 20807
Alignment:
Q  159 ataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaac 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| | |||| ||||||||||||||   |||      
T  21168 ataccgaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatacaactcaaaatcgacgctaccaaaactaacgggacacttagcacaactaaagg 21069  T
Q  259 aagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgcaacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaa 358  Q
    ||||||||||||| ||| | |  ||||| | ||||||| || |||   | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||||  ||||   ||    
T  21068 aagtagtcaccgacccattggtcggggtatcgatgaccttacctcctgataacggagttactaccaaattcaaacgatcaacacaactagtcgagaagaa 20969  T
Q  359 agaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgca 458  Q
    |||| |||||| || | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||     
T  20968 agaatgagtagaactagtatcaacaattacaatcaaaggagcactattgatgaaacacatacctcggataagattatccagcaactccacttcctctgcg 20869  T
Q  459 ttcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttattactaatatgacc 520  Q
    ||||| || || ||  | |  |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  20868 ttcaatgcgaaaactctccacgccgcctttttcggcttggttcacttggtactgatatgacc 20807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 520
Target Start/End: Original strand, 77339 - 77653
Alignment:
Q  206 caactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgttgatgaccatatctcgc 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | | ||| | ||| |||||| |||||||||  ||       
T  77339 caactcaaaatcaacgttaccaaaattaacaggaaacttagcacaaactaaggaagtagtcatcaagccattggctagggtgtcgatgaccatcccttta 77438  T
Q  306 aacaacggagttacaaccaatttcaaatgctcaacaaaactaaccgaggtaaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactat 405  Q
    || ||| |||||| |||||| |||||| | |||||| |||||| |||| | |||||| | ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  77439 aaaaacagagttaaaaccaaattcaaacgttcaacataactaagcgagatgaaagaatgcgtagcaccagtatcaacaattccaaacaaaggagtactat 77538  T
Q  406 tgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacactt 505  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  | |  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  77539 tgataaaatacatatctcggattagattatctggttgctccacctcctcagcgttcaatgcaaaaactctccacgccgctttcttcagcttggtacactt 77638  T
Q  506 attactaatatgacc 520  Q
      |||| ||||||||    
T  77639 ggtactgatatgacc 77653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 2320 - 2434
Alignment:
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2320 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 2419  T
Q  239 acacttagcacacac 253  Q
    |||||||||||||||    
T  2420 acacttagcacacac 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25027 - 24913
Alignment:
Q  139 caaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatacttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacagg 238  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25027 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgggagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 24928  T
Q  239 acacttagcacacac 253  Q
    |||||||||||||||    
T  24927 acacttagcacacac 24913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 390 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 9583 - 9429
Alignment:
Q  390 atcaaaggagtactattgataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttct 489  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9583 atcaaatgagtactattgataaaacacatacctcggataagattatccggctgttccacctctttttcattcaaagcaaacaccttccccgccgccttct 9484  T
Q  490 tcggcttggtacacttattactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagt 544  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  9483 tcggcttggtacaattggtactaatatgatccttctccccacaattgtagcaagt 9429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 408 - 546
Target Start/End: Original strand, 96637 - 96775
Alignment:
Q  408 ataaaacacatacctcggataagattatttggctgctccacttcctctgcattcaaagcaaacacctttccggccgccttcttcggcttggtacacttat 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  96637 ataaaacacatacctcggataagataatccggctgctccacttcctccgtattcaaagaaaacatttttcccgccgccttcttcggcttggtacacttag 96736  T
Q  508 tactaatatgaccattctttccacaattgtagcaagtaa 546  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  96737 tactgatatgacccttctctccacaattgtagcaagtaa 96775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2384 - 2292
Alignment:
Q  196 acacaagatccaactcaaaatcaacattaccaatattaacaggacacttagcacacacaaaacaagtagtcaccgaaccactagctggggtgt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2384 acacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 4709 - 4829
Alignment:
Q  10 acatcataaacacataagatctaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggctttgaaaacgttac 109  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  4709 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaatgatttcttcacttactccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 4808  T
Q  110 actcttagtcaaacatttaat 130  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  4809 actcctagtcaaacaattaat 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 405
Target Start/End: Original strand, 15479 - 15518
Alignment:
Q  366 gtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactat 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15479 gtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactat 15518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 29992 - 30043
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29992 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 30043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 67354 - 67303
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  67354 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 67303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Original strand, 41793 - 41844
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41793 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 41844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39579 - 39528
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39579 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 39528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 514599 - 514548
Alignment:
Q  355 taaaagaaagagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  514599 taaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 514548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4326 - 4284
Alignment:
Q  364 gagtagcaccaatatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4326 gagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatt 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29974 - 29941
Alignment:
Q  388 caatcaaaggagtactattgataaaacacatacc 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29974 caatcaaaagagtactattgataaaacacatacc 29941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University